View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1946_low_95 (Length: 307)

Name: NF1946_low_95
Description: NF1946
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1946_low_95
NF1946_low_95
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-182)||(20187471-20187650)
chr8 (1-182)||(20206540-20206719)
chr8 (1-182)||(35393467-35393646)
chr8 (1-180)||(38098730-38098907)
chr8 (1-182)||(11020402-11020581)
chr8 (1-170)||(483103-483270)
chr8 (1-182)||(8352379-8352558)
chr8 (1-170)||(30655012-30655179)
chr8 (1-182)||(36781651-36781830)
chr8 (1-182)||(33411044-33411224)
chr8 (1-182)||(39780311-39780491)
chr8 (1-170)||(24757714-24757880)
chr8 (1-182)||(25487170-25487349)
chr8 (1-181)||(29997494-29997672)
chr8 (24-170)||(30699985-30700129)
chr8 (1-170)||(26416245-26416412)
chr8 (1-182)||(12986670-12986847)
chr8 (20-182)||(27719241-27719401)
chr8 (1-180)||(45084246-45084414)
chr8 (12-180)||(5458261-5458426)
chr8 (1-181)||(31097515-31097684)
chr8 (1-179)||(1104891-1105066)
chr8 (59-174)||(32834596-32834709)
chr8 (71-182)||(20818954-20819063)
chr8 (39-150)||(18574822-18574934)
chr8 (83-170)||(13174249-13174334)
chr8 (34-150)||(20524971-20525086)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (1-182)||(44291052-44291231)
chr7 (1-170)||(3887682-3887849)
chr7 (1-182)||(9741179-9741358)
chr7 (1-181)||(5544257-5544435)
chr7 (1-182)||(12848440-12848619)
chr7 (1-182)||(31587871-31588050)
chr7 (1-170)||(31621948-31622115)
chr7 (1-180)||(40431228-40431405)
chr7 (1-182)||(12726171-12726350)
chr7 (1-182)||(18676709-18676888)
chr7 (1-182)||(41118730-41118909)
chr7 (1-182)||(47455050-47455229)
chr7 (1-181)||(47020422-47020600)
chr7 (1-182)||(44508503-44508683)
chr7 (1-180)||(42076336-42076513)
chr7 (1-170)||(44061820-44061987)
chr7 (1-170)||(40186659-40186826)
chr7 (1-170)||(38743182-38743343)
chr7 (1-150)||(9870355-9870504)
chr7 (1-180)||(42697408-42697576)
chr7 (1-180)||(3112028-3112205)
chr7 (1-112)||(25105043-25105154)
chr7 (57-170)||(30888401-30888512)
chr7 (99-171)||(40190120-40190189)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-182)||(43973182-43973361)
chr3 (1-182)||(1546135-1546314)
chr3 (1-181)||(44377782-44377960)
chr3 (1-170)||(8828567-8828734)
chr3 (1-182)||(20607642-20607821)
chr3 (1-182)||(35846746-35846925)
chr3 (1-182)||(51754422-51754601)
chr3 (1-181)||(30357251-30357429)
chr3 (1-182)||(10471305-10471484)
chr3 (1-182)||(24348802-24348981)
chr3 (1-170)||(55274098-55274265)
chr3 (1-180)||(22497241-22497418)
chr3 (1-182)||(38252518-38252697)
chr3 (1-182)||(51167128-51167307)
chr3 (1-181)||(2445961-2446139)
chr3 (1-180)||(43218757-43218934)
chr3 (1-180)||(53018982-53019159)
chr3 (6-180)||(48458387-48458559)
chr3 (1-182)||(5273531-5273710)
chr3 (1-182)||(10049066-10049245)
chr3 (1-182)||(37126582-37126761)
chr3 (1-182)||(37821061-37821239)
chr3 (1-170)||(49804812-49804979)
chr3 (12-180)||(17338441-17338607)
chr3 (1-182)||(46528089-46528276)
chr3 (1-168)||(23150752-23150917)
chr3 (12-182)||(10659525-10659693)
chr3 (1-182)||(13286929-13287108)
chr3 (1-181)||(27449491-27449669)
chr3 (1-169)||(41114055-41114221)
chr3 (1-182)||(12227701-12227881)
chr3 (1-182)||(3019201-3019379)
chr3 (1-169)||(9745956-9746121)
chr3 (1-182)||(26975426-26975596)
chr3 (1-170)||(24405782-24405957)
chr3 (1-182)||(31655044-31655223)
chr3 (1-182)||(47697767-47697951)
chr3 (1-182)||(8068473-8068652)
chr3 (1-182)||(26229371-26229542)
chr3 (1-181)||(28555119-28555296)
chr3 (1-180)||(41454247-41454424)
chr3 (56-180)||(26717973-26718095)
chr3 (23-170)||(998291-998436)
chr3 (39-172)||(35513049-35513180)
chr3 (83-170)||(501750-501835)
chr3 (75-145)||(33591124-33591194)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-181)||(42675607-42675785)
chr5 (1-181)||(8836480-8836657)
chr5 (1-181)||(10691859-10692037)
chr5 (1-182)||(3390780-3390959)
chr5 (1-182)||(33591643-33591822)
chr5 (1-180)||(36484549-36484726)
chr5 (1-181)||(18185762-18185939)
chr5 (1-172)||(29296196-29296366)
chr5 (1-182)||(6230223-6230402)
chr5 (1-170)||(41743309-41743476)
chr5 (1-170)||(42221737-42221904)
chr5 (1-181)||(35065993-35066170)
chr5 (1-181)||(8335319-8335497)
chr5 (1-181)||(25031424-25031602)
chr5 (1-181)||(15472610-15472793)
chr5 (1-170)||(27771208-27771375)
chr5 (13-182)||(28349033-28349200)
chr5 (1-182)||(23191833-23192011)
chr5 (209-307)||(705611-705709)
chr5 (1-170)||(1420980-1421138)
chr5 (6-180)||(8782637-8782809)
chr5 (6-180)||(33570032-33570195)
chr5 (83-180)||(8935917-8936012)
chr5 (39-131)||(25472276-25472368)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (1-171)||(45884569-45884737)
chr4 (1-180)||(2491833-2492010)
chr4 (1-182)||(22169109-22169288)
chr4 (1-170)||(36225042-36225209)
chr4 (1-170)||(50621674-50621841)
chr4 (1-180)||(11005561-11005738)
chr4 (1-182)||(28867624-28867803)
chr4 (1-182)||(39677614-39677793)
chr4 (12-180)||(49332052-49332218)
chr4 (1-180)||(54202332-54202509)
chr4 (1-182)||(3875574-3875753)
chr4 (1-182)||(17445569-17445748)
chr4 (1-182)||(33961710-33961889)
chr4 (1-181)||(36432396-36432573)
chr4 (1-180)||(56162475-56162652)
chr4 (1-171)||(41764599-41764766)
chr4 (1-170)||(7327605-7327772)
chr4 (1-182)||(24744899-24745078)
chr4 (1-174)||(29923609-29923780)
chr4 (1-170)||(36308912-36309079)
chr4 (1-180)||(27767545-27767721)
chr4 (1-182)||(3931897-3932077)
chr4 (1-170)||(3874479-3874646)
chr4 (1-170)||(20492515-20492682)
chr4 (1-181)||(55282382-55282559)
chr4 (1-180)||(26488353-26488531)
chr4 (1-182)||(7554349-7554528)
chr4 (1-179)||(35949420-35949587)
chr4 (6-170)||(11308778-11308940)
chr4 (1-170)||(43957777-43957935)
chr4 (1-172)||(29933451-29933611)
chr4 (6-180)||(11381834-11382005)
chr4 (1-170)||(44878054-44878221)
chr4 (14-182)||(28573703-28573856)
chr4 (56-170)||(55541836-55541948)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (1-182)||(21866931-21867110)
chr2 (1-170)||(2357349-2357516)
chr2 (1-182)||(11124281-11124460)
chr2 (1-182)||(14287399-14287578)
chr2 (1-182)||(25336524-25336703)
chr2 (1-180)||(12242744-12242923)
chr2 (1-182)||(30787091-30787270)
chr2 (1-181)||(2372040-2372218)
chr2 (1-169)||(26479800-26479966)
chr2 (1-180)||(2380239-2380416)
chr2 (1-182)||(20115061-20115240)
chr2 (1-180)||(19390519-19390696)
chr2 (1-182)||(17977694-17977874)
chr2 (12-182)||(33965404-33965572)
chr2 (12-182)||(11978762-11978930)
chr2 (24-181)||(4049460-4049614)
chr2 (1-182)||(8113687-8113870)
chr2 (1-182)||(41568654-41568833)
chr2 (1-182)||(6034411-6034591)
chr2 (1-182)||(31547229-31547401)
chr2 (1-170)||(39430207-39430374)
chr2 (68-170)||(1222638-1222738)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (1-182)||(30159012-30159191)
chr1 (1-170)||(47534011-47534178)
chr1 (1-181)||(28226291-28226469)
chr1 (1-181)||(37094100-37094278)
chr1 (1-180)||(25828677-25828854)
chr1 (1-180)||(46674745-46674922)
chr1 (7-182)||(50490801-50490974)
chr1 (1-182)||(6978901-6979080)
chr1 (1-182)||(15475928-15476107)
chr1 (1-182)||(28068777-28068956)
chr1 (1-182)||(42885266-42885445)
chr1 (1-170)||(15907250-15907417)
chr1 (1-181)||(8895622-8895799)
chr1 (1-180)||(40359667-40359844)
chr1 (1-148)||(45502301-45502448)
chr1 (1-170)||(30361166-30361333)
chr1 (4-181)||(48542503-48542678)
chr1 (1-182)||(52469381-52469560)
chr1 (1-181)||(3770504-3770682)
chr1 (1-182)||(44233974-44234155)
chr1 (1-180)||(13556077-13556254)
chr1 (12-170)||(31760661-31760817)
chr1 (1-182)||(3046761-3046940)
chr1 (1-179)||(18604860-18605036)
chr1 (1-171)||(49456848-49457016)
chr1 (1-170)||(17580831-17580998)
chr1 (1-182)||(44054765-44054944)
chr1 (1-181)||(4490089-4490267)
chr1 (1-182)||(3994815-3994996)
chr1 (20-182)||(26770092-26770252)
chr1 (17-171)||(46234296-46234448)
chr1 (1-182)||(24180508-24180688)
chr1 (1-182)||(35719709-35719889)
chr1 (1-180)||(3416306-3416474)
chr1 (12-170)||(43106489-43106652)
chr1 (6-180)||(17926144-17926315)
chr1 (1-180)||(25729878-25730045)
chr1 (6-171)||(49740095-49740258)
chr1 (1-124)||(29033613-29033736)
chr1 (52-182)||(20599594-20599722)
chr1 (1-73)||(11493585-11493657)
chr1 (1-73)||(11335565-11335637)
chr1 (99-182)||(11335634-11335715)
chr1 (99-182)||(11493654-11493735)
chr1 (37-180)||(8969466-8969607)
chr1 (37-180)||(7042840-7042982)
chr1 (109-180)||(12320252-12320321)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (1-182)||(4169664-4169843)
chr6 (1-182)||(4210393-4210572)
chr6 (1-182)||(18676656-18676835)
chr6 (1-170)||(742804-742971)
chr6 (1-182)||(10790491-10790670)
chr6 (1-182)||(33489792-33489971)
chr6 (1-180)||(8933758-8933935)
chr6 (1-182)||(8658987-8659169)
chr6 (1-170)||(33131086-33131253)
chr6 (1-180)||(32938354-32938531)
chr6 (12-180)||(5545373-5545540)
chr6 (1-182)||(17595817-17595996)
chr6 (1-181)||(8062790-8062968)
chr6 (1-182)||(29516665-29516844)
chr6 (1-181)||(34475144-34475322)
chr6 (1-182)||(28914082-28914257)
chr6 (1-117)||(29863881-29863997)
chr6 (12-170)||(12713050-12713206)
chr6 (39-170)||(9224609-9224738)
chr6 (1-169)||(8313704-8313876)
chr6 (39-180)||(11590248-11590387)
chr6 (45-170)||(9576041-9576164)
chr6 (37-180)||(2559732-2559872)
chr6 (39-119)||(25144075-25144155)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-182)||(105654-105833)
[»] scaffold0562 (2 HSPs)
scaffold0562 (1-182)||(6393-6572)
scaffold0562 (1-170)||(5298-5465)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (1-182)||(892-1072)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-170)||(42630-42794)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (1-180)||(27769-27937)
[»] scaffold0548 (1 HSPs)
scaffold0548 (6-170)||(5268-5430)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (1-172)||(11120-11289)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-117)||(19578-19694)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (106-182)||(20394-20468)
[»] scaffold0896 (1 HSPs)
scaffold0896 (24-57)||(53-86)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20187650 - 20187471
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20187650 tatagtacagaacaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaa 20187551  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20187550 agatgggtttttaaaaatttacatgaagatgacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 20187471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20206719 - 20206540
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20206719 tatagtacagaacaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaa 20206620  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20206619 agatgggtttttaaaaatttacatgaagatgacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 20206540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 35393467 - 35393646
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35393467 tatagtacagatcaataacaaagattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 35393566  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35393567 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 35393646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 38098730 - 38098907
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38098730 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 38098829  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38098830 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 38098907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11020581 - 11020402
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11020581 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 11020482  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  11020481 agatgggtttttaaaaatttatatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 11020402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 483103 - 483270
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  483103 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 483202  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  483203 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattt 483270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8352558 - 8352379
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8352558 tatagtacaaatcaataacaaaaatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggggaagggttcagaatgatcataaa 8352459  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8352458 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8352379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30655179 - 30655012
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30655179 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 30655080  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    | || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30655079 aaataggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 30655012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36781830 - 36781651
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36781830 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 36781731  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36781730 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 36781651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33411224 - 33411044
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33411224 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcaaaatgatcataaa 33411125  T
Q  101 agatggattttt-aaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33411124 agatgggtttttaaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33411044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39780491 - 39780311
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39780491 tatagtacagatcaataacaaaaatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaa 39780392  T
Q  101 agat-ggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39780391 agatggggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 39780311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 24757714 - 24757880
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24757714 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagagttcagaatgatcataaa 24757813  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24757814 a-atgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattt 24757880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 25487170 - 25487349
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25487170 tatagtacatatcaataaaaaagatgttgattcagatcttggctgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 25487269  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25487270 agatggatttttagaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 25487349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29997672 - 29997494
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29997672 tatagtacagatcaataacaaaaatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaa 29997573  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29997572 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaaggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 29997494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Original strand, 30699985 - 30700129
Alignment:
Q  24 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30699985 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgaatttttaaaaatttaca 30700084  T
Q  124 taaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30700085 caaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 30700129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 26416245 - 26416412
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26416245 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaa 26416344  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26416345 agatgggtttttagaaatttacatgaagaggaccattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 26416412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12986847 - 12986670
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  12986847 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggtttcacatctatgataatttgtggatgaaa--tggtaagggttcagaatgatcataaa 12986750  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12986749 agatgagtttttaaaaatttacacgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 12986670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27719401 - 27719241
Alignment:
Q  20 aaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27719401 aaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatt 27719302  T
Q  120 tacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27719301 tacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 27719241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45084414 - 45084246
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084414 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 45084324  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45084323 agatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 45084246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5458426 - 5458261
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5458426 tcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtga-aattcagaatgatcataaaagatgggtttt 5458328  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5458327 tagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 5458261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31097684 - 31097515
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||         |||||||    
T  31097684 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggt---------tcataaa 31097594  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31097593 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaagacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 31097515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1104891 - 1105066
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1104891 tatagtacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggtgagagttcagaattatcataaa 1104989  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataac 179  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1104990 agatgggtttttagtaatttacatgaagaaagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaac 1105066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32834709 - 32834596
Alignment:
Q  59 atttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaatt 158  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  32834709 atttgtggatgaaaggggataagggttcagaataatcataaaaaatggatttttaaaaatttacatgaagatgacaattttggtattat--tgtaaaatt 32834612  T
Q  159 ttaaataaatttaggt 174  Q
    ||||||||||||||||    
T  32834611 ttaaataaatttaggt 32834596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20819063 - 20818954
Alignment:
Q  71 aagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20819063 aagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 20818966  T
Q  171 aggtataacttg 182  Q
     ||| |||||||    
T  20818965 gggtgtaacttg 20818954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18574934 - 18574822
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg-gatttttaaaaatttacataaagaggacaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| ||  |||| | | |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  18574934 ttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtgagggttcaaaatgataatggaagaagagttttttacaaatttacatgaagagggtaatt 18574835  T
Q  138 ttgatattattgt 150  Q
    ||| |||||||||    
T  18574834 ttggtattattgt 18574822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13174334 - 13174249
Alignment:
Q  83 gttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||| | ||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  13174334 gttcataatgatcatgaaaaaagggtttttaaaaatttacttgaagaggctaatttcggtattat--tgtaaaattttaagtaaattt 13174249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20525086 - 20524971
Alignment:
Q  34 agatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggac 133  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||||| ||| |||  ||||| | |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||| |||    
T  20525086 agatattgattgcacatccatgatgatttttgggtgaaaagggataaaggttcaaagtgataatgaaagaagg-ttttaaaaaatttacatgaagaagac 20524988  T
Q  134 aattttgatattattgt 150  Q
    ||||| | |||||||||    
T  20524987 aatttcggtattattgt 20524971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44291231 - 44291052
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44291231 tatagtacagaacaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaa 44291132  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44291131 agatgggtttttaaaaatttacatgaagatgacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 44291052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3887849 - 3887682
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3887849 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 3887750  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3887749 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 3887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 9741179 - 9741358
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9741179 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 9741278  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9741279 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 9741358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 5544257 - 5544435
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5544257 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 5544356  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5544357 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttaatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 5544435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12848619 - 12848440
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12848619 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 12848520  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12848519 agatgggtttttaaaaatttatatgaagagggtaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 12848440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 31587871 - 31588050
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31587871 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 31587970  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31587971 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 31588050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31622115 - 31621948
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31622115 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaa 31622016  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31622015 agatgaatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 31621948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 40431228 - 40431405
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40431228 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 40431327  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  40431328 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 40431405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 12726171 - 12726350
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12726171 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 12726270  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  12726271 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggtaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 12726350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 18676709 - 18676888
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18676709 tatagtacatatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 18676808  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18676809 agatggatttttaaaaatttacatgaagatggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 18676888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 41118730 - 41118909
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41118730 tatagtacacatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaattatcataaa 41118829  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41118830 agatggatttttaaaaatttacatgaagaaggcaattttggtattat--tgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 41118909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47455229 - 47455050
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47455229 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 47455130  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47455129 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 47455050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 47020422 - 47020600
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47020422 tatagtacagatcaataacaaaggtgttgattcagatattggttgcacatctatgatggtttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 47020521  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47020522 agatgagtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 47020600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44508683 - 44508503
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44508683 tatagtacagatcaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 44508584  T
Q  101 agatggattttt-aaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44508583 agatgggtttttaaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 44508503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42076513 - 42076336
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  42076513 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtaacggttcagaatgatcataaa 42076414  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  42076413 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 42076336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44061987 - 44061820
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44061987 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 44061888  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44061887 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 44061820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 40186659 - 40186826
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40186659 tatagtacagatcaataacaaaaatgttgattcagatgttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 40186758  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  40186759 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcacttttggtattat--tataaaattttaaataaattt 40186826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 38743182 - 38743343
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38743182 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaatgatcataaa 38743281  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||||| |||      ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38743282 agatggatttttaaaatttt------agagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 38743343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 9870355 - 9870504
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  9870355 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggatgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagtgttcagaatgataataaa 9870454  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgt 150  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9870455 agatgggtttttagaaatttacatgaagaggacaattttgttattattgt 9870504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42697576 - 42697408
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42697576 tatattacagatcaataacaaagatgttgattcagatatttgttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 42697486  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42697485 agatgaatttttaaaaatttacataaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 42697408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 3112028 - 3112205
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  3112028 tatagtacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaagggggtgaaggttcataatgatcataaa 3112127  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||| | ||||||  ||||||||| |||| |  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3112128 agataggtttttagtaatttacatgaagatggtaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 3112205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25105154 - 25105043
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  25105154 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattgatttcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataaaggttcagaataatcataaa 25105055  T
Q  101 agatggattttt 112  Q
    |||||| |||||    
T  25105054 agatgggttttt 25105043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 30888401 - 30888512
Alignment:
Q  57 tgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaa 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  30888401 tgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaatatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaa 30888498  T
Q  157 ttttaaataaattt 170  Q
    ||||||||||||||    
T  30888499 ttttaaataaattt 30888512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 171
Target Start/End: Original strand, 40190120 - 40190189
Alignment:
Q  99 aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  40190120 aaagatgggtttttagaaatttatatgaagagggcaattttgatattattgt---aaattttaaataaattta 40190189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 43973182 - 43973361
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43973182 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 43973281  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43973282 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtataacttg 43973361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 1546135 - 1546314
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1546135 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 1546234  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1546235 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 1546314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44377960 - 44377782
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44377960 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 44377861  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44377860 agatggatttttaaaaatttacatgaagagagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 44377782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 8828567 - 8828734
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8828567 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 8828666  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8828667 agatgggtttttaaaaatttacatgacgaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 8828734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 20607642 - 20607821
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20607642 tatagtacatatcaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 20607741  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20607742 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20607821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35846925 - 35846746
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35846925 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 35846826  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35846825 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 35846746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 51754601 - 51754422
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51754601 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 51754502  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51754501 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 51754422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30357429 - 30357251
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30357429 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttacatatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 30357330  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30357329 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 30357251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 10471305 - 10471484
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10471305 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaatgatcataaa 10471404  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10471405 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 10471484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24348981 - 24348802
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24348981 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 24348882  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24348881 agatgggtttttaaaaatttacatgaagatggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 24348802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 55274098 - 55274265
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55274098 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaa 55274197  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  55274198 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 55274265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22497418 - 22497241
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22497418 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 22497319  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22497318 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 22497241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38252697 - 38252518
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38252697 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctacggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 38252598  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38252597 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 38252518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 51167128 - 51167307
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51167128 tatagtacagatcaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcataatgatcataaa 51167227  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51167228 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 51167307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2446139 - 2445961
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2446139 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaatggggtaagggttcagaatgatcataaa 2446040  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    | |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2446039 atatgggtttttaaaaattcacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 2445961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43218934 - 43218757
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43218934 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 43218835  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  43218834 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 43218757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 53019159 - 53018982
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53019159 tatattacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 53019060  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  53019059 agatgggtttttaaacatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 53018982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48458559 - 48458387
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48458559 tacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaaagatg 48458460  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48458459 ggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 48458387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 5273531 - 5273710
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273531 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 5273630  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5273631 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaatttcggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 5273710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 10049066 - 10049245
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10049066 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcataatgatcataaa 10049165  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10049166 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 10049245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 37126582 - 37126761
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37126582 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgtatatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 37126681  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37126682 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 37126761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37821239 - 37821061
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  37821239 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-gaggtacgggttcagaatgatcataaa 37821141  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37821140 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 37821061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 49804812 - 49804979
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49804812 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 49804911  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49804912 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattt 49804979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 17338441 - 17338607
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17338441 tcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttt 17338540  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  17338541 taaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 17338607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 46528276 - 46528089
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagg--------gggtaagagttcagaatg 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||||||||||    
T  46528276 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggggtaagggttcagaatg 46528177  T
Q  93 atcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46528176 atcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 46528089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23150917 - 23150752
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23150917 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggtttagaatgatcataaa 23150818  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  23150817 agatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tataaaattttaaataaat 23150752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10659693 - 10659525
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10659693 tcaataacaaagatgttgattaagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaacgatggatttt 10659594  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10659593 taaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtttaacttg 10659525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13287108 - 13286929
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  13287108 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattctaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaattatcataaa 13287009  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13287008 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 13286929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27449669 - 27449491
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27449669 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtaatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 27449570  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27449569 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggaaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaactt 27449491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 41114055 - 41114221
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41114055 tatagtacagaacaataacaaagatgttgatttagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 41114154  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatt 169  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41114155 agataaatttttaaaaatttacatgaagaggataattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatt 41114221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 12227701 - 12227881
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaa-gggggtaagagttcagaatgatcataa 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12227701 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaaggggggtaagggttcagaataatcataa 12227800  T
Q  100 aagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12227801 aagatgggtttttaaaaatttacgtgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 12227881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3019379 - 3019201
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  3019379 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-gggataagggttcagaatgattataaa 3019281  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3019280 agatgagtttttaaaaatttacatgaagatgacaattttaatattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 3019201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9746121 - 9745956
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9746121 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 9746022  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatt 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  9746021 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttagtattattgt---aaaatttaaataaatt 9745956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 26975426 - 26975596
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26975426 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 26975525  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975526 agatggatttttaaaaatttac---------acaattttgatattat--agtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 26975596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24405957 - 24405782
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagg--------gggtaagagttcagaatg 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||||||||||    
T  24405957 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggggtaagggttcagaatg 24405858  T
Q  93 atcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24405857 atcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 24405782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31655223 - 31655044
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  31655223 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagggttcagaatgatcataaa 31655124  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31655123 agatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgttaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 31655044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47697951 - 47697767
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatga-----aagggggtaagagttcagaatgatc 95  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||| ||||||| |||||    
T  47697951 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggaagggggtaagggttcagattgatc 47697852  T
Q  96 ataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47697851 ataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 47697767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 8068473 - 8068652
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8068473 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaataatcataaa 8068572  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    | |||  |||| | |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8068573 atatgagttttaagaaatttacatgaagagggcaatcttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8068652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26229542 - 26229371
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||        |||||||    
T  26229542 tatagtacagatcaataactaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggtt--------tcataaa 26229451  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26229450 agatgggtttttaaacatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 26229371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 28555119 - 28555296
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  28555119 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-gaggtaagggttcagaatgatcataaa 28555217  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    ||||   |||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28555218 agataagtttttagaaatttacatgaagaagacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 28555296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41454424 - 41454247
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  41454424 tatagtacaaattaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatttatggtgatttttggatgaaagggggtgaaggttcagaatgatcataaa 41454325  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41454324 agatgggtttttagtaatttacatgaaaaagacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 41454247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Original strand, 26717973 - 26718095
Alignment:
Q  56 gtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaa 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26717973 gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaa 26718070  T
Q  156 attttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  26718071 attttaaataaatttgggtgtaact 26718095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Original strand, 998291 - 998436
Alignment:
Q  23 gatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttac 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  998291 gatgttgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaacatgggtttttagaaatttac 998390  T
Q  123 ataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    || |||| | |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  998391 atgaagatggcaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattt 998436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Original strand, 35513049 - 35513180
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattt 138  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  35513049 ttggtagcacatctatgatgatttttggatgaaagggggtgaaggttcagaatgataatgaaagaagggtttttaaaaatctacatgaagagggcaattt 35513148  T
Q  139 tgatattattgtgtaaaattttaaataaatttag 172  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35513149 tgatattat--tgtaaaattttaaataaatttag 35513180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 501835 - 501750
Alignment:
Q  83 gttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  501835 gttcagaatgatcataaaagatgagtttttagaaatttacatgaagagaacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33591194 - 33591124
Alignment:
Q  75 gggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatatt 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  33591194 gggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtatt 33591124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 42675607 - 42675785
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42675607 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 42675706  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42675707 agatgaatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 42675785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8836480 - 8836657
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8836480 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaa-gggggtaagggttcagaatgatcataaa 8836578  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8836579 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 8836657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 10691859 - 10692037
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10691859 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatcgggtaagggttcagaatgatcataaa 10691958  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10691959 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 10692037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 3390780 - 3390959
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3390780 tatagtaaagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 3390879  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3390880 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3390959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 33591643 - 33591822
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33591643 tatagtactgatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaggattcagaatgatcataaa 33591742  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33591743 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 33591822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 36484549 - 36484726
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36484549 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 36484648  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36484649 agatggatttttaaaaatttacatgaaaaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttaggtgtaact 36484726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18185939 - 18185762
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18185939 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggtaagagttcaaaatgatcataaa 18185841  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18185840 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 18185762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29296366 - 29296196
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagata-ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataa 99  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29296366 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagataattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaagagttcagaatgatcataa 29296267  T
Q  100 aagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttag 172  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29296266 aagatgagtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttag 29296196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6230402 - 6230223
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6230402 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 6230303  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    | |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6230302 atatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttaatattat--tgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 6230223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 41743309 - 41743476
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  41743309 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcaaaatgatcataaa 41743408  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41743409 agatgaatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 41743476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42221904 - 42221737
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42221904 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacacctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 42221805  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42221804 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagtgcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 42221737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 35065993 - 35066170
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35065993 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 35066092  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35066093 a-atgggtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 35066170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8335497 - 8335319
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8335497 tatattacagatcaataacatagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggaaagggttcagaatgatcataaa 8335398  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8335397 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaagtgtaactt 8335319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25031602 - 25031424
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25031602 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcatatctacggtgatttgtggatgaaagggggtaaggattcagaatgatcataaa 25031503  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25031502 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagtgcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 25031424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15472610 - 15472793
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatga-----aagggggtaagagttcagaatgatc 95  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15472610 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggaagggggtaagggttcagattgatc 15472709  T
Q  96 ataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15472710 ataaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaagacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 15472793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27771208 - 27771375
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27771208 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagagttcagaatgatcataaa 27771307  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  27771308 agatgggtttttagaaatttacatgaagatgacaattttggtattat--tgttaaattttaaataaattt 27771375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28349200 - 28349033
Alignment:
Q  13 caataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggattttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28349200 caataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgaggtaagggttcagaatcatcataaaagatgggttttt 28349101  T
Q  113 aaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28349100 agaaatttacatgaagatgacaattttggtattat--tgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 28349033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 23191833 - 23192011
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23191833 tatagtacagatca-taacaaagatgttgattcagatcttgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 23191931  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||  | |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23191932 agatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttagtattat--tataaaattttaaacaaatttgggtgtaacttg 23192011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 307
Target Start/End: Original strand, 705611 - 705709
Alignment:
Q  209 atttacaaaaggcaatcaattttcatttagtcacattttgaattttaagattagcgataatccagtacactagaccagcagcacataagattggaaact 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  705611 atttacaaaaggcaatcaattttcatttagtcacattttgaattttaagattagcgataatccagtacactagaccagcagcacataagattggaaact 705709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1421138 - 1420980
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1421138 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 1421048  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1421047 agatgggtttttaaaattttacatgaaaagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 1420980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 8782637 - 8782809
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  8782637 tacagatcaatggcaaagatgttgattcaaatcttggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatgatcatgaaagatg 8782736  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    | |||||| |||||||||| || | |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8782737 ggtttttagaaatttacatgaacaagacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 8782809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 33570032 - 33570195
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33570032 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcaca---------atttgtggataaaagggggtgagaattcagaatgatcataaaaggtg 33570122  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    | |||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33570123 ggtttttagaaatttacatgaacatgacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 33570195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 8935917 - 8936012
Alignment:
Q  83 gttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8935917 gttcagaatgataatgaaagaatggtttttagaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 8936012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 25472276 - 25472368
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagagg 131  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||| || ||||||    
T  25472276 ttggtttcacatttatgatggtttgtaggtgaaaggggatgaaagttcagaatgatcatgaaaaatgggtttttagaattttaaatgaagagg 25472368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 45884737 - 45884569
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45884737 tatagtagagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 45884638  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45884637 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattta 45884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2492010 - 2491833
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2492010 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 2491911  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2491910 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgttaaattttaaataaatttgggtgtaact 2491833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22169288 - 22169109
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22169288 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 22169189  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22169188 agatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattcgggtgtaacttg 22169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36225042 - 36225209
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36225042 tatagtacagatcaataataaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagagttcagaatgatcataaa 36225141  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36225142 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 36225209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50621841 - 50621674
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50621841 tatagtacagatcaataacaaagattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 50621742  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50621741 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 50621674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11005561 - 11005738
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11005561 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 11005660  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11005661 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgttaaattttaaataaatttgggtgtaact 11005738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 28867624 - 28867803
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28867624 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 28867723  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28867724 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaagtgtaacttg 28867803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 39677614 - 39677793
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39677614 tatagtacaaatcaataataaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 39677713  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39677714 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggtaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 39677793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 49332052 - 49332218
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49332052 tcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatggatttt 49332151  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  49332152 taaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 49332218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54202509 - 54202332
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54202509 tatagtacagatcaataataaatatgttgattcagatattggttgcaaatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 54202410  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  54202409 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 54202332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 3875574 - 3875753
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3875574 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgggataagggttcagaatgatcataaa 3875673  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3875674 atatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3875753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 17445569 - 17445748
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17445569 tatagtacatgtcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 17445668  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17445669 agatgggtttttagaaatttacatgaagaggataattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17445748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 33961710 - 33961889
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  33961710 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacacctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcagaaa 33961809  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33961810 agatgagtttttaaaaatttacatgaagatggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 33961889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 36432396 - 36432573
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36432396 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggagtaagggttcagaatgatcataaa 36432495  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36432496 agatgg-tttttaaaaatttacatgaagagggcaattttgacgttat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 36432573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 56162652 - 56162475
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  56162652 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcatatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 56162553  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  56162552 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 56162475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 41764599 - 41764766
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41764599 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggataaaaggaggtaagagttcagaatgatcataaa 41764698  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41764699 agataagtttttaaaaatttacatgaaga-gacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattta 41764766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 7327605 - 7327772
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  7327605 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaagattcagaatgatcataaa 7327704  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7327705 agatgagtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 7327772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 24744899 - 24745078
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24744899 tatagtacagattaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgattataaa 24744998  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  24744999 agatggatttttaaaaatttatatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattgtaaataaatttgggtgtaacttg 24745078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29923780 - 29923609
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29923780 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 29923681  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggt 174  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29923680 agataggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggt 29923609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 36308912 - 36309079
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  36308912 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggagtaagggttcagaatgatcataaa 36309011  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36309012 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 36309079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27767545 - 27767721
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  27767545 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggtaagggttcagaacgatcataaa 27767643  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27767644 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 27767721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 3931897 - 3932077
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3931897 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 3931996  T
Q  101 agatg-gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3931997 agatgaggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 3932077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 3874479 - 3874646
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3874479 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctttggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 3874578  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  3874579 agatgggtttttagaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--agtacaattttaaataaattt 3874646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20492682 - 20492515
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  20492682 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattagttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaatgttttagaatgatcataaa 20492583  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20492582 agatgagtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 20492515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 55282382 - 55282559
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  55282382 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-gaggtaagggttcagaatgatcataaa 55282480  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    | |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55282481 atatgggtttttaaaaaattacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaactt 55282559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26488531 - 26488353
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaag--ggggtaagagttcagaatgatcata 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26488531 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaagggggggtaagggttcagaatgatcata 26488432  T
Q  99 aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  26488431 aaagatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattattgt---aaatttgaaataaatttgggtgtaact 26488353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 7554349 - 7554528
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7554349 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtggtttatgaatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 7554448  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  7554449 agatgggtttttaaaaatttacatgaagatggcaattttggtattat--tgtaaaatttgaaataaatttgggtgtaacttg 7554528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 35949420 - 35949587
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35949420 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatatttgttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 35949510  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataac 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35949511 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaac 35949587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11308940 - 11308778
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11308940 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatgatcataaaagatg 11308841  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    | |||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11308840 ggtttttagaaatttacatgaacagggcaattttggtataat--tgtaaaattttaaataaattt 11308778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 43957777 - 43957935
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43957777 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 43957867  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43957868 agatgggtttttaaaattttacatgaaaagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 43957935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 29933451 - 29933611
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29933451 tatagtacagatcaataacagagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagagggtaagggttcagaataatcataaa 29933541  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29933542 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttag 29933611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 11381834 - 11382005
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  11381834 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaa-ggggtgagaatttagaatgatcataaaagatg 11381932  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
      |||||| |||||||| | || ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11381933 agtttttagaaatttacttgaacagagcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttggatataact 11382005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44878221 - 44878054
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  44878221 tatagtacaaatcaatgacaaagatgttgattcagatcttagttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtgaaggttcagaacgatcataaa 44878122  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  44878121 agatgagtttctagaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaatttttaaataaattt 44878054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 28573703 - 28573856
Alignment:
Q  14 aataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggattttta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||             ||||||  ||||||    
T  28573703 aataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagggggtaagggttc-------------aagatgagttttta 28573789  T
Q  114 aaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28573790 aaaatttacatgaagagggcaattttgatatta--ctgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 28573856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55541948 - 55541836
Alignment:
Q  56 gtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaa 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||    
T  55541948 gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttaaaattttacatgaagagagcaattttggtattat--tgtaaa 55541851  T
Q  156 attttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||||    
T  55541850 attttaaataaattt 55541836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 21866931 - 21867110
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21866931 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 21867030  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21867031 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 21867110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2357516 - 2357349
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2357516 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 2357417  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2357416 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattt 2357349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 11124281 - 11124460
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11124281 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 11124380  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11124381 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11124460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 14287399 - 14287578
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14287399 tatagtacagatcaataacaaatatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaatgatcataaa 14287498  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14287499 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 14287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25336703 - 25336524
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  25336703 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaaaggttcagaataatcataaa 25336604  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25336603 agatagatttttaaaaatttacatgaaaaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 25336524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12242923 - 12242744
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaa--gggggtaagagttcagaatgatcata 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12242923 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatgatgatttgtggatgaaatggggggtaagggttcagaatgatcata 12242824  T
Q  99 aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12242823 aaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 12242744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 30787091 - 30787270
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30787091 tatagtacagatcaataacaaagatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 30787190  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30787191 agatgggtttttaaaaatttacatgaatagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 30787270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 2372040 - 2372218
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2372040 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 2372139  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2372140 agatggatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttagtattat--tgtaaaagtttaaataaatttagatgtaactt 2372218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 26479800 - 26479966
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26479800 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 26479899  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatt 169  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26479900 agattggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatt 26479966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2380239 - 2380416
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2380239 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 2380338  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  2380339 agattgatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaaatttaaataaatttgggtgtaact 2380416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20115240 - 20115061
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20115240 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagagggtaaaggttcagaatgatcataaa 20115141  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20115140 agatgggttttaaaaaatttacatgaagaggaaaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20115061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 19390519 - 19390696
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  19390519 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaacgatcataaa 19390618  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19390619 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 19390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 17977694 - 17977874
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17977694 tatagtacagatcaataacaaagttgttgattcagatattggttgcacatctattgtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 17977793  T
Q  101 agat-ggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17977794 agatggggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17977874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 33965404 - 33965572
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33965404 tcaataacagagatgttgattcagatattggttgcacatttatggtgatttgtggatgaaagagggcaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttt 33965503  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33965504 taaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33965572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11978930 - 11978762
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11978930 tcaataataaagatgttgattcaaatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagagttcagaatgatcataaaaaatgggtttt 11978831  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11978830 taaaaatttacagaaagatgacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 11978762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4049614 - 4049460
Alignment:
Q  24 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4049614 atgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaaagatgg-tttttaaaaatttaca 4049516  T
Q  124 taaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4049515 tgaagaagacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 4049460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8113870 - 8113687
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaaga----gttcagaatgatca 96  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  8113870 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgacttgtggatgaaagggggtaagtaagggttcagaatgatca 8113771  T
Q  97 taaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8113770 taaaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--agtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8113687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 41568654 - 41568833
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41568654 tatagtacatatcaataacaaagatgatgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcaaaatgatcataaa 41568753  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41568754 agatgagtttttagaaatttacatgaagaggataattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 41568833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6034591 - 6034411
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6034591 tatagtacagatcaataacaaaaatgttgattcagatattagttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaa 6034492  T
Q  101 agat-ggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6034491 agatggggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttagtattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6034411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 31547229 - 31547401
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31547229 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagata-------cacatatatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaatgatcataaa 31547321  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31547322 agatgaatttttaaaaatttacatgaagatgacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtctaacttg 31547401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 39430207 - 39430374
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39430207 tatagtacagatcaataacaaatatattgatttaaatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaatgatcataaa 39430306  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    | |||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39430307 atatgagtttttagaaatttacatgaagagaacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 39430374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 170
Target Start/End: Original strand, 1222638 - 1222738
Alignment:
Q  68 tgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaa 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1222638 tgaaaggggataagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaaatttacatgaagagagcaattttagtattat--tgtaaaattctaaataaa 1222735  T
Q  168 ttt 170  Q
    |||    
T  1222736 ttt 1222738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30159191 - 30159012
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30159191 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggggataagagttcagaatgatcataaa 30159092  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30159091 agatgagtttttaaaaatttacatgaagatgacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 30159012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47534178 - 47534011
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47534178 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 47534079  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47534078 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 47534011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 28226291 - 28226469
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28226291 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaataatcataaa 28226390  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28226391 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 28226469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 37094100 - 37094278
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37094100 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaa 37094199  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37094200 agaggggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 37094278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25828854 - 25828677
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25828854 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 25828755  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25828754 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 25828677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46674922 - 46674745
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46674922 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 46674823  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46674822 agatgggattttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaact 46674745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50490974 - 50490801
Alignment:
Q  7 acagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatgg 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50490974 acagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgg 50490875  T
Q  107 atttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50490874 gtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 50490801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6979080 - 6978901
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6979080 tatagtacagatcaataacaaaaatgttgattcagatattggttgcacatctatgttgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 6978981  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6978980 agatgagtttttaaaaatttacatgaagaaggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6978901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15475928 - 15476107
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15475928 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgataataaa 15476027  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15476028 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaatttttgtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 15476107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 28068777 - 28068956
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28068777 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 28068876  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28068877 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaagtttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttatgtgtaacttg 28068956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42885445 - 42885266
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42885445 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtgtatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 42885346  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42885345 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaatttttgtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 42885266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15907417 - 15907250
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15907417 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattgattgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataaa 15907318  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15907317 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 15907250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8895799 - 8895622
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8895799 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatg-tgatttgtggatgaaagggggtaagagttcataatgatcataaa 8895701  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8895700 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 8895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40359844 - 40359667
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  40359844 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaggaggtaagggttcagaacgatcataaa 40359745  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40359744 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 40359667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 45502301 - 45502448
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45502301 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 45502400  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattatt 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  45502401 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattatt 45502448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30361333 - 30361166
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30361333 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaggggggtaagggttcagaatgatcataaa 30361234  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30361233 agatggatttttagaaatttacatgaagagagcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 30361166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 48542503 - 48542678
Alignment:
Q  4 agtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaaga 103  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48542503 agtacagatcaataacaaatatgttgattcagatatttgttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaaga 48542602  T
Q  104 tggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  48542603 tgtgtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 48542678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 52469381 - 52469560
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  52469381 tatagtacagatcaataacaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttgtggaagaaagggggtaatggttcataatgatcataaa 52469480  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  52469481 agatgagtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 52469560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3770682 - 3770504
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3770682 tatagtacagatcaataacaaagatattgatttatatattggttgcgcatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 3770583  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3770582 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaaggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaactt 3770504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44233974 - 44234155
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44233974 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgttgatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 44234073  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  44234074 agatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtatattattgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 44234155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13556254 - 13556077
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13556254 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacaactatggtgatttgtggacgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 13556155  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13556154 agatgggtttttaaaaattgacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 13556077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 31760661 - 31760817
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31760661 tcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttt 31760760  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31760761 tagaaatttacatgaagaggacaatttttatattat--tgtaaaattttaaataaattt 31760817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3046940 - 3046761
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  3046940 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtaatttgtggatgaaaggatataagggttcagaatgatcataaa 3046841  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3046840 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttaatattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 3046761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18605036 - 18604860
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18605036 tatagtacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtgagggttcagaatgatcataaa 18604937  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataac 179  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18604936 agatgggtttttagtaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaac 18604860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 49457016 - 49456848
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49457016 tatagtacagatcaataataaagatgttgattcagatattggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaagatggtaagggttcagaatgatcataaa 49456917  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49456916 agatgaatttttaaaaatttacatgaagaggataattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattta 49456848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 17580831 - 17580998
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17580831 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcatatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 17580930  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||| | |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17580931 agataggtttttagaaaattacatgaagagaacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 17580998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 44054765 - 44054944
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44054765 tatagtacagatcaataacaaagatgttgatttaaatcttggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcaaaatgatcataaa 44054864  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44054865 agatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 44054944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 4490089 - 4490267
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  4490089 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcaaatcttggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagagagtaagggttcagaatgatcataaa 4490188  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4490189 agatgagtttttagaaatttacatgaagaggacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaactt 4490267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 3994815 - 3994996
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataaca---aagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcat 97  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3994815 tatagtacagatcaataacaacaaagatgttgattcagatattggttgtacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagtgttcagaatgatcat 3994914  T
Q  98 aaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3994915 aaaagatgggtttttaaaaattttcatgaagatgacaa-tttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 3994996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 26770092 - 26770252
Alignment:
Q  20 aaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatt 119  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26770092 aaaggtgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggtttttagaaatt 26770191  T
Q  120 tacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26770192 tacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 26770252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 46234296 - 46234448
Alignment:
Q  17 aacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46234296 aacaaagatgttgattcagatattggttgtacatctatggtgatttgtgaatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgagtttttaaaa 46234395  T
Q  117 atttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46234396 atttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaattttaaataaattta 46234448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 24180508 - 24180688
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  24180508 tatagtacaaatcaataacaaaaatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggtgtaagggttcagaatgatcataaa 24180607  T
Q  101 agat-ggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24180608 agatggggtttttaaaaatttacatgaaaagggcaattttggtattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 24180688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35719889 - 35719709
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  35719889 tatagtacaaattaataacaaaaatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggtgtaagggttcagaatgatcataaa 35719790  T
Q  101 agat-ggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35719789 agatggggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 35719709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3416474 - 3416306
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3416474 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcataatgatcataaa 3416384  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3416383 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcgattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttggatataact 3416306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 43106489 - 43106652
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatt-- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||      
T  43106489 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgtatatctatggtgattttttgatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagataggtttt 43106588  T
Q  110 -----tttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
         ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43106589 taaaatttaaaaatttacatgaagaggacacttttgatattat--tgtaaaattttaaataaattt 43106652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Original strand, 17926144 - 17926315
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  17926144 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaa-agggaaaaaattcagaatgatcataaaagatg 17926242  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    | |||||| |||||||||  || | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17926243 ggtttttagaaatttacacgaacatgacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 17926315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 25729878 - 25730045
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||        |||||||    
T  25729878 tatagtatagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggtaag-gtt--------tcataaa 25729967  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25729968 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 25730045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 49740258 - 49740095
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| ||||||    
T  49740258 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatagtgatttgtggatgaaaggaggtgaaaattcagaatgattatataagatg 49740159  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattta 171  Q
    | |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49740158 ggtttttagaaatttacatgaacatgacaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaattta 49740095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 29033613 - 29033736
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29033613 tatagtacagatcaataagaaagatgttgatttagatattggttgcacatctatggtgatttatggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 29033712  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacat 124  Q
    | ||   |||||||||||||||||    
T  29033713 aaataagtttttaaaaatttacat 29033736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 20599594 - 20599722
Alignment:
Q  52 tatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtg 151  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||  ||    
T  20599594 tatggtgatttgtgtatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaatataagtttttaaaaatttacatgaagagaacaattttagtattat--tg 20599691  T
Q  152 taaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20599692 taaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20599722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 11493585 - 11493657
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaag 73  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11493585 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 11493657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 11335565 - 11335637
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaag 73  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11335565 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaag 11335637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Original strand, 11335634 - 11335715
Alignment:
Q  99 aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11335634 aaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11335715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Original strand, 11493654 - 11493735
Alignment:
Q  99 aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11493654 aaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 11493735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8969607 - 8969466
Alignment:
Q  37 tattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaat 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||    |||| ||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  8969607 tattgattgcatatctatggtggtttgtgcgagaaaaggggtgagggttcagaatgataatgaaagaaggatttttagaaatttacatgaagagggaaat 8969508  T
Q  137 tttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8969507 tttagtattat--tgtaaaattttaaataaatttgagtataact 8969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 7042840 - 7042982
Alignment:
Q  37 tattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaag-ggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaa 135  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||| | |||||  ||||| || ||||| |||||| || |||||  | |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  7042840 tattgattgcatatccatggtggtttgtgggtgaaaaaggggtgagggttcaaaatgataatgaaagaatggtttttagaaatttacatgaagagggcaa 7042939  T
Q  136 ttttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||    
T  7042940 ttttggtattattgt--aagattttaaataaatttaggtgtaact 7042982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Original strand, 12320252 - 12320321
Alignment:
Q  109 ttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12320252 ttttaaaaatttacattgagaagacaattttgatattat--tgtaaaattttaagtaaatttaagtgtaact 12320321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4169843 - 4169664
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4169843 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 4169744  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4169743 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 4169664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4210572 - 4210393
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4210572 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 4210473  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4210472 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 4210393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 18676656 - 18676835
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18676656 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaa-ggggtaagggttcagaatgatcataaa 18676754  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18676755 agatgaatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattattat-aaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 18676835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 742804 - 742971
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  742804 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 742903  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  742904 agatggatttttaaaaatttacacgaagagagcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 742971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10790670 - 10790491
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10790670 tatagtacagatcaataacaaagattttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggtgtaagggttcagaatgatcataaa 10790571  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10790570 agatgaatttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 10790491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33489971 - 33489792
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33489971 tatagtatagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 33489872  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33489871 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 33489792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8933758 - 8933935
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8933758 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaacgatcataaa 8933857  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8933858 agatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--agtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 8933935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8659169 - 8658987
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcata-- 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||      
T  8659169 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcaaaatgatcataat 8659070  T
Q  99 -aaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8659069 taaagatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 8658987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 33131086 - 33131253
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33131086 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcaaatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 33131185  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33131186 agatggatttttaaaaatttacatgaagaggacaattttagtattat--tgtaaaaatttaaataaattt 33131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 32938354 - 32938531
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32938354 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcatatattggttgcacatctatggtgatttgtcgatgaaaggggataagggttcagaatgatcataaa 32938453  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32938454 agatgggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 32938531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5545540 - 5545373
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtga-tttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5545540 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgaatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaaagatgggttt 5545441  T
Q  111 ttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5545440 ttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 5545373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 17595817 - 17595996
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17595817 tatagtacatatcaatgacaaaaatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 17595916  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17595917 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 17595996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8062968 - 8062790
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8062968 tatagtacagatcaataacaaatatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaaaggggtaagggttcagaatgatcataaa 8062869  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8062868 agatgggtttttagaaaattacatgaagaggacaattttggtattat--tataaaattttaaataaatttgggtgtaactt 8062790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29516844 - 29516665
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  29516844 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatcttagttgcgcatctatggtgatttgtagatgaaaggaggtaagagtccaaaatgatcataaa 29516745  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29516744 agatgaatttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttagatgtaacttg 29516665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34475322 - 34475144
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34475322 tatagtacagatcaataacaaatatgttgatttagatattggttgcacatctatggtcatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 34475223  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataactt 181  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  34475222 agatgagtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattgtaaataaatttagatgtaactt 34475144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 28914082 - 28914257
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28914082 tatagtacatatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatc----gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 28914177  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28914178 agattggtttttaaaaatttacatgaagagagtaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 28914257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 29863881 - 29863997
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29863881 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaa 29863980  T
Q  101 agatggatttttaaaaa 117  Q
    | |||| ||||||||||    
T  29863981 aaatgggtttttaaaaa 29863997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 12713050 - 12713206
Alignment:
Q  12 tcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttt 111  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12713050 tcaatgacaaagaagtttattcagattttggttgcacatctatggtgagttgtggatgaaaaggggcgagggttcagaatgatcataaaagatggggttt 12713149  T
Q  112 taaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12713150 tagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattt 12713206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9224738 - 9224609
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9224738 ttggtagcacatctatggtgatttctagatgaaagggggtgagggttcaaaatgataatgaaagaagggttttaaaaaatttacatgaagaggacaattt 9224639  T
Q  139 tgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  9224638 tgatattgt--tgtaaaattttaaataaattt 9224609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 8313704 - 8313876
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattca------gatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgat 94  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||      ||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||    
T  8313704 tatagtacagatcaatgaaaaagatgttgattcaatctttgattttggttacacatatatggtgatttattgatgaaagggggtgagggttcggaatgat 8313803  T
Q  95 cataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatt 169  Q
     || ||| |  | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  8313804 aatgaaataaaggtttttacaaatttacatgaagaggacaattatgatattat--tgtaaaattttatataaatt 8313876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11590387 - 11590248
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||  |  |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |||||    
T  11590387 ttggttgcacatctatggtgatttatggacgaaatggggcgatggttcagaatgataatgaaagaaggatttttagaaatttacatgaagagtgtaattt 11590288  T
Q  139 tgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11590287 tggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 11590248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9576164 - 9576041
Alignment:
Q  45 gcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatat 144  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| | |||  |||||||  |||    
T  9576164 gcacgtctatgatgatttgtggatgaagtggggtgagggttcagaatgataatgaaagaagggtttttagaaatttacatgatgagagcaattttagtat 9576065  T
Q  145 tattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  9576064 tat--tgtaaaattttaaataaattt 9576041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2559872 - 2559732
Alignment:
Q  37 tattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatttacataaagaggacaat 136  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| | ||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  2559872 tattgattgcatatccatggtggtttgtgggtgaaaaggggtgagggttcaaaatgataatgaaagaag-atttttagaaattgacatgaagagggcaat 2559774  T
Q  137 tttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2559773 tttggtattattat--aaaattttaaataaattttggtgtaact 2559732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Original strand, 25144075 - 25144155
Alignment:
Q  39 ttggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatggatttttaaaaatt 119  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||| | || |||||| |||||    
T  25144075 ttggttgcacatctatggtggtctgtggatgaaagggggtgagaactcataatgataataaaaaaggggtttttagaaatt 25144155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 105654 - 105833
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  105654 tatagtacacatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaattatcataaa 105753  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  105754 agatggatttttaaaaatttacatgaagaaggcaattttggtattat--tgttaaattttaaataaatttaggtgtaacttg 105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 6393 - 6572
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6393 tatagtacaaatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatgggataagggttcagaatgatcataaa 6492  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6493 atatgggtttttaaaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 6572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 5298 - 5465
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5298 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctttggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 5397  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  5398 agatgggtttttagaaatttacatgaagaggacaattttggtattat--agtacaattttaaataaattt 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 892 - 1072
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  892 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttacacatctatggtgatttgtggataaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 991  T
Q  101 agatg-gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  992 agatgaggtttttagaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaattttggtgtaacttg 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 42630 - 42794
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42630 tatagtacagatcaataacaaagatgttaattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaatggggtaagggttcaaaatgatcataaa 42729  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||     |||||||||||||||||||||    
T  42730 agatggagtttttaaaatttacatgaagagggcaattttggtat-----tgtaaaattttaaataaattt 42794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27769 - 27937
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27769 tatagtacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgc---------gtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcataaa 27859  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataact 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27860 agatgggtttttaaaaatttacatgaagagggcaattttggtattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaact 27937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0548 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0548
Description:

Target: scaffold0548; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5430 - 5268
Alignment:
Q  6 tacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaaagatg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5430 tacagatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatatatggtgatttgtggatgaaagggggtgagaattcagaatgatcataaaagatg 5331  T
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaattt 170  Q
    | |||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5330 ggtttttagaaatttacatgaacagggcaattttggtataat--tgtaaaattttaaataaattt 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11289 - 11120
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  11289 tatagtacatatcaatgacaaagatgttgattcagatcttggttgcacatctatggtgatttttggatgaaaggggatgagggttcagaatgatcataaa 11190  T
Q  101 agatggatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttag 172  Q
    |||||| ||||||  ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11189 agatgggtttttagtaatatacatgaagagggcaattttgttattat--tgtaaaattttaaataaatttag 11120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 19578 - 19694
Alignment:
Q  1 tatagtacagttcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtagatgaaagggggtaagagttcagaatgatcataaa 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19578 tataatacagatcaataacaaagatgttgattcagatattggttgcacatctatggtgatttgtggatgaaagggggtaagggttcagaatgatcgtaaa 19677  T
Q  101 agatggatttttaaaaa 117  Q
    | |||| ||||||||||    
T  19678 aaatgggtttttaaaaa 19694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20468
Alignment:
Q  106 gatttttaaaaatttacataaagaggacaattttgatattattgtgtaaaattttaaataaatttaggtataacttg 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20394 gatttttaaaaatttacattaagagggcaattttgatattat--tgtaaaattttaaataaatttgggtgtaacttg 20468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0896 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 57
Target Start/End: Original strand, 53 - 86
Alignment:
Q  24 atgttgattcagatattggttgcacatctatggt 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53 atgttgattcagatattggttgcacatctatggt 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University