View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19473_low_2 (Length: 1006)

Name: NF19473_low_2
Description: NF19473
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19473_low_2
NF19473_low_2
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-988)||(32706963-32707958)
chr7 (1-156)||(18731019-18731174)
chr7 (3-158)||(31715631-31715786)
chr7 (3-159)||(23437149-23437305)
chr7 (3-154)||(8769515-8769666)
chr7 (1-159)||(35085736-35085894)
chr7 (1-153)||(43140701-43140852)
chr7 (3-157)||(10625317-10625471)
chr7 (1-153)||(44448143-44448295)
chr7 (5-157)||(47250781-47250933)
chr7 (3-158)||(9034548-9034703)
chr7 (3-154)||(34568585-34568736)
chr7 (3-157)||(11678702-11678856)
chr7 (2-156)||(23472788-23472942)
chr7 (1-158)||(9230908-9231065)
chr7 (1-157)||(2357066-2357222)
chr7 (3-157)||(35085973-35086127)
chr7 (3-150)||(21522226-21522371)
chr7 (3-159)||(23472590-23472746)
chr7 (5-157)||(31715857-31716008)
chr7 (1-155)||(26920148-26920302)
chr7 (3-153)||(39118013-39118163)
chr7 (1-158)||(5238449-5238606)
chr7 (3-156)||(11678936-11679088)
chr7 (3-156)||(44486165-44486318)
chr7 (15-159)||(2357300-2357444)
chr7 (1-153)||(21522449-21522599)
chr7 (6-144)||(41758691-41758829)
chr7 (6-159)||(8769279-8769432)
chr7 (3-159)||(32706729-32706885)
chr7 (1-143)||(47250570-47250712)
chr7 (5-154)||(38842035-38842182)
chr7 (1-158)||(43726473-43726630)
chr7 (9-157)||(24119713-24119861)
chr7 (5-157)||(47251132-47251283)
chr7 (5-159)||(473415-473569)
chr7 (3-157)||(36507042-36507196)
chr7 (3-116)||(9230716-9230829)
chr7 (3-154)||(44447916-44448066)
chr7 (1-159)||(34568814-34568977)
chr7 (1-159)||(38842253-38842410)
chr7 (3-156)||(31623657-31623810)
chr7 (1-156)||(47305127-47305282)
chr7 (1-157)||(473191-473344)
chr7 (3-156)||(44485565-44485718)
chr7 (3-159)||(43726241-43726395)
chr7 (1-155)||(48704040-48704193)
chr7 (3-156)||(22338272-22338426)
chr7 (3-153)||(28349614-28349763)
chr7 (3-156)||(37143764-37143916)
chr7 (2-112)||(23437384-23437494)
chr7 (1-158)||(37143994-37144151)
chr7 (6-157)||(22338509-22338663)
chr7 (1-111)||(47250942-47251052)
chr7 (3-133)||(47305360-47305490)
chr7 (1-120)||(36506848-36506967)
chr7 (1-59)||(10625180-10625238)
chr7 (3-67)||(24119938-24120002)
chr7 (31-157)||(43050383-43050510)
chr7 (77-159)||(15326869-15326951)
chr7 (93-143)||(19543503-19543553)
chr7 (85-158)||(10625104-10625177)
chr7 (3-111)||(48703854-48703962)
chr7 (13-143)||(40739963-40740094)
chr7 (93-157)||(24446296-24446360)
chr7 (93-144)||(36720491-36720542)
chr7 (93-144)||(43704957-43705008)
chr7 (93-143)||(45457099-45457149)
chr7 (4-73)||(15327096-15327165)
chr7 (13-153)||(38676061-38676201)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (3-158)||(52914950-52915105)
chr4 (1-156)||(32384653-32384808)
chr4 (1-145)||(25218095-25218239)
chr4 (1-157)||(29864175-29864331)
chr4 (1-157)||(40067347-40067503)
chr4 (3-153)||(1157439-1157589)
chr4 (1-156)||(10014465-10014619)
chr4 (1-156)||(10021606-10021760)
chr4 (1-156)||(33626095-33626250)
chr4 (3-157)||(21217846-21218000)
chr4 (1-158)||(9010503-9010660)
chr4 (3-156)||(27347597-27347750)
chr4 (3-152)||(33625868-33626017)
chr4 (4-157)||(54136090-54136243)
chr4 (5-158)||(52915178-52915333)
chr4 (1-156)||(21218078-21218233)
chr4 (3-154)||(29864408-29864559)
chr4 (1-159)||(43316877-43317034)
chr4 (3-152)||(33882182-33882331)
chr4 (1-157)||(12381285-12381441)
chr4 (1-153)||(45911582-45911734)
chr4 (3-158)||(43317112-43317267)
chr4 (1-156)||(44710403-44710558)
chr4 (1-144)||(53645463-53645606)
chr4 (3-157)||(9010738-9010892)
chr4 (3-157)||(45911807-45911961)
chr4 (3-153)||(46621160-46621310)
chr4 (3-156)||(25593324-25593477)
chr4 (3-156)||(40067581-40067734)
chr4 (3-152)||(46620931-46621080)
chr4 (3-159)||(25058830-25058986)
chr4 (1-157)||(44432855-44433011)
chr4 (3-134)||(25218317-25218448)
chr4 (1-156)||(45683117-45683272)
chr4 (3-153)||(2738883-2739033)
chr4 (8-138)||(4965889-4966019)
chr4 (3-156)||(18862673-18862827)
chr4 (1-158)||(27347828-27347985)
chr4 (3-156)||(34958832-34958984)
chr4 (3-156)||(45683350-45683503)
chr4 (3-153)||(8246979-8247129)
chr4 (3-153)||(29970196-29970345)
chr4 (1-157)||(22830795-22830952)
chr4 (4-153)||(37515687-37515836)
chr4 (1-157)||(46200483-46200640)
chr4 (3-156)||(46535523-46535675)
chr4 (3-159)||(38866395-38866551)
chr4 (3-153)||(34959064-34959214)
chr4 (1-153)||(1157206-1157361)
chr4 (1-154)||(8751289-8751442)
chr4 (1-106)||(54191638-54191743)
chr4 (3-155)||(21051360-21051512)
chr4 (3-155)||(54191818-54191969)
chr4 (1-156)||(1205608-1205763)
chr4 (6-153)||(4793835-4793981)
chr4 (1-156)||(8246769-8246922)
chr4 (3-158)||(32385045-32385199)
chr4 (1-159)||(4966099-4966257)
chr4 (3-145)||(24504173-24504315)
chr4 (1-159)||(43969758-43969916)
chr4 (1-155)||(46535753-46535907)
chr4 (15-157)||(48209947-48210089)
chr4 (3-152)||(44710636-44710785)
chr4 (3-156)||(46200718-46200871)
chr4 (3-153)||(22831030-22831181)
chr4 (6-156)||(24503939-24504090)
chr4 (3-153)||(1205381-1205530)
chr4 (12-153)||(25977771-25977913)
chr4 (1-153)||(38866630-38866783)
chr4 (15-155)||(28570666-28570806)
chr4 (3-111)||(44428616-44428724)
chr4 (1-155)||(11242700-11242849)
chr4 (6-158)||(10014700-10014851)
chr4 (6-158)||(10021841-10021992)
chr4 (14-159)||(11102218-11102364)
chr4 (1-111)||(21051578-21051688)
chr4 (13-153)||(15985469-15985610)
chr4 (15-157)||(44169978-44170121)
chr4 (11-156)||(9657667-9657812)
chr4 (1-157)||(9657878-9658034)
chr4 (3-124)||(21885057-21885178)
chr4 (3-157)||(54136324-54136474)
chr4 (1-103)||(42779573-42779675)
chr4 (14-159)||(44170223-44170370)
chr4 (1-73)||(29970423-29970495)
chr4 (3-82)||(43969599-43969679)
chr4 (75-157)||(44428512-44428594)
chr4 (1-32)||(4793723-4793754)
chr4 (99-154)||(43969556-43969611)
chr4 (93-143)||(28504590-28504640)
chr4 (93-143)||(41610528-41610578)
chr4 (93-143)||(46307569-46307619)
chr4 (115-156)||(10017815-10017856)
[»] chr2 (105 HSPs)
chr2 (3-159)||(13354410-13354566)
chr2 (3-157)||(31450665-31450819)
chr2 (3-157)||(41377354-41377507)
chr2 (1-157)||(5961668-5961824)
chr2 (1-157)||(28203091-28203247)
chr2 (1-156)||(20908742-20908897)
chr2 (3-156)||(4104392-4104545)
chr2 (1-157)||(13354176-13354332)
chr2 (3-159)||(21470292-21470448)
chr2 (3-154)||(43183585-43183736)
chr2 (1-155)||(16260872-16261025)
chr2 (3-157)||(25642501-25642655)
chr2 (3-152)||(16655610-16655759)
chr2 (1-157)||(16736100-16736256)
chr2 (3-158)||(27132509-27132664)
chr2 (1-156)||(31450897-31451052)
chr2 (3-155)||(38275688-38275842)
chr2 (1-156)||(41377585-41377740)
chr2 (3-157)||(27476600-27476754)
chr2 (1-159)||(34820510-34820668)
chr2 (3-153)||(37744621-37744771)
chr2 (3-156)||(27883468-27883621)
chr2 (5-158)||(39454449-39454602)
chr2 (3-156)||(41659745-41659898)
chr2 (3-155)||(12303786-12303938)
chr2 (1-156)||(4104159-4104314)
chr2 (1-156)||(27132741-27132896)
chr2 (1-156)||(28202860-28203015)
chr2 (1-151)||(25642273-25642423)
chr2 (1-155)||(36442365-36442519)
chr2 (1-158)||(12304385-12304542)
chr2 (3-156)||(17856199-17856352)
chr2 (5-158)||(18565064-18565217)
chr2 (8-153)||(28631512-28631657)
chr2 (1-158)||(32933589-32933746)
chr2 (3-156)||(32933824-32933977)
chr2 (3-152)||(34820283-34820432)
chr2 (1-153)||(39912630-39912783)
chr2 (1-145)||(21470526-21470669)
chr2 (6-158)||(43183819-43183971)
chr2 (9-156)||(37412817-37412964)
chr2 (3-157)||(16261103-16261257)
chr2 (3-157)||(20908510-20908664)
chr2 (1-158)||(16655837-16655994)
chr2 (3-156)||(16736331-16736484)
chr2 (1-154)||(34127796-34127948)
chr2 (3-157)||(44612716-44612871)
chr2 (2-158)||(5921618-5921774)
chr2 (1-156)||(4120764-4120918)
chr2 (3-154)||(37412595-37412746)
chr2 (3-145)||(28631285-28631427)
chr2 (2-156)||(36211350-36211504)
chr2 (5-158)||(35408756-35408909)
chr2 (5-158)||(39150060-39150213)
chr2 (1-156)||(10833265-10833421)
chr2 (3-153)||(27476369-27476520)
chr2 (3-158)||(45389129-45389284)
chr2 (3-153)||(4120996-4121146)
chr2 (3-157)||(15137037-15137191)
chr2 (1-145)||(12304016-12304160)
chr2 (13-159)||(39912869-39913017)
chr2 (1-157)||(40694194-40694350)
chr2 (6-153)||(38275480-38275627)
chr2 (1-158)||(17856419-17856577)
chr2 (3-133)||(40694408-40694538)
chr2 (1-159)||(44915737-44915894)
chr2 (3-159)||(27883690-27883850)
chr2 (3-157)||(33819629-33819781)
chr2 (1-157)||(27246214-27246370)
chr2 (3-152)||(34127570-34127718)
chr2 (3-159)||(36442130-36442287)
chr2 (5-153)||(32503772-32503920)
chr2 (1-133)||(39149867-39149999)
chr2 (17-158)||(14877481-14877620)
chr2 (43-153)||(18565276-18565386)
chr2 (1-159)||(39454673-39454822)
chr2 (9-153)||(27913897-27914041)
chr2 (1-143)||(15829733-15829875)
chr2 (1-159)||(33819394-33819551)
chr2 (3-117)||(44915972-44916086)
chr2 (1-157)||(27914124-27914280)
chr2 (1-153)||(32503549-32503701)
chr2 (69-156)||(36211698-36211785)
chr2 (5-111)||(36211576-36211682)
chr2 (5-153)||(41659971-41660119)
chr2 (5-137)||(16350306-16350438)
chr2 (1-137)||(11943723-11943855)
chr2 (27-138)||(34484303-34484414)
chr2 (45-154)||(37744451-37744560)
chr2 (69-156)||(20297410-20297497)
chr2 (3-73)||(27246066-27246136)
chr2 (1-153)||(16350080-16350232)
chr2 (77-153)||(1580148-1580224)
chr2 (13-156)||(3603504-3603648)
chr2 (5-158)||(5720140-5720293)
chr2 (93-159)||(44610859-44610924)
chr2 (93-153)||(34484238-34484298)
chr2 (93-143)||(677915-677965)
chr2 (70-156)||(23992206-23992292)
chr2 (79-156)||(38073790-38073867)
chr2 (93-159)||(2822301-2822367)
chr2 (93-143)||(15136364-15136414)
chr2 (93-143)||(26424819-26424869)
chr2 (93-143)||(31557104-31557154)
chr2 (93-143)||(34618517-34618567)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (1-156)||(9173901-9174056)
chr6 (3-159)||(33545055-33545211)
chr6 (1-157)||(35132600-35132756)
chr6 (3-157)||(33329205-33329359)
chr6 (3-155)||(6220289-6220441)
chr6 (1-153)||(25551567-25551719)
chr6 (3-158)||(3338475-3338630)
chr6 (3-153)||(24604878-24605027)
chr6 (1-153)||(33544825-33544977)
chr6 (1-133)||(35119042-35119174)
chr6 (1-156)||(3289141-3289296)
chr6 (1-156)||(14336902-14337057)
chr6 (3-154)||(29009956-29010107)
chr6 (3-157)||(3288929-3289083)
chr6 (2-156)||(12903221-12903375)
chr6 (3-157)||(25551346-25551500)
chr6 (3-153)||(31029527-31029677)
chr6 (1-156)||(7537836-7537992)
chr6 (1-145)||(24605105-24605248)
chr6 (1-133)||(33346501-33346633)
chr6 (3-157)||(3338710-3338862)
chr6 (1-156)||(31029755-31029910)
chr6 (1-159)||(2949293-2949446)
chr6 (3-145)||(1158599-1158743)
chr6 (1-143)||(11524778-11524921)
chr6 (6-160)||(19135682-19135836)
chr6 (1-153)||(6220059-6220211)
chr6 (3-157)||(14337135-14337288)
chr6 (3-156)||(1860719-1860871)
chr6 (3-157)||(11524999-11525152)
chr6 (1-145)||(13156070-13156209)
chr6 (1-145)||(13160926-13161065)
chr6 (3-157)||(35132834-35132977)
chr6 (6-144)||(24548477-24548615)
chr6 (3-157)||(29010187-29010341)
chr6 (3-111)||(2949524-2949632)
chr6 (1-159)||(1158822-1158978)
chr6 (1-134)||(2315601-2315734)
chr6 (3-153)||(13155842-13155992)
chr6 (3-153)||(13160698-13160848)
chr6 (2-156)||(24548241-24548395)
chr6 (69-155)||(11524706-11524792)
chr6 (3-111)||(33972439-33972547)
chr6 (19-157)||(2814560-2814698)
chr6 (3-153)||(31754207-31754357)
chr6 (1-78)||(33329437-33329514)
chr6 (3-158)||(17544686-17544840)
chr6 (48-156)||(32283026-32283134)
chr6 (93-157)||(33548180-33548244)
chr6 (20-134)||(29999653-29999767)
chr6 (3-128)||(12903444-12903569)
chr6 (1-59)||(29999510-29999568)
chr6 (1-67)||(33972293-33972361)
chr6 (93-153)||(33971931-33971991)
chr6 (70-157)||(17245624-17245711)
chr6 (93-144)||(3618793-3618844)
chr6 (70-156)||(6229687-6229772)
chr6 (752-825)||(7779848-7779921)
chr6 (80-153)||(17544457-17544529)
[»] scaffold0809 (2 HSPs)
scaffold0809 (3-159)||(4551-4707)
scaffold0809 (1-153)||(4341-4493)
[»] chr8 (88 HSPs)
chr8 (9-153)||(1826030-1826174)
chr8 (9-153)||(1860475-1860619)
chr8 (1-159)||(23244746-23244904)
chr8 (3-159)||(24456885-24457041)
chr8 (3-159)||(37393710-37393866)
chr8 (1-157)||(3869180-3869336)
chr8 (3-158)||(37393475-37393630)
chr8 (1-158)||(35223998-35224155)
chr8 (3-156)||(40040162-40040315)
chr8 (3-159)||(11198438-11198594)
chr8 (1-154)||(119119-119271)
chr8 (1-158)||(5416810-5416967)
chr8 (6-159)||(18017787-18017940)
chr8 (3-156)||(31230846-31230999)
chr8 (3-151)||(14920644-14920792)
chr8 (1-153)||(18018017-18018169)
chr8 (1-156)||(18621978-18622133)
chr8 (3-158)||(6843493-6843650)
chr8 (3-159)||(30650187-30650343)
chr8 (1-145)||(31230624-31230768)
chr8 (1-156)||(21515431-21515586)
chr8 (3-158)||(35223772-35223927)
chr8 (1-156)||(39911917-39912072)
chr8 (3-157)||(8653935-8654089)
chr8 (3-158)||(30872781-30872940)
chr8 (1-158)||(7041860-7042012)
chr8 (5-156)||(40032426-40032578)
chr8 (5-156)||(18914486-18914637)
chr8 (3-153)||(26736128-26736278)
chr8 (1-160)||(29027203-29027358)
chr8 (1-155)||(39240031-39240185)
chr8 (3-144)||(40094487-40094628)
chr8 (1-153)||(9495254-9495406)
chr8 (3-158)||(11639050-11639204)
chr8 (2-157)||(14920410-14920565)
chr8 (1-159)||(12873279-12873435)
chr8 (3-153)||(23244518-23244668)
chr8 (4-154)||(30568510-30568660)
chr8 (3-132)||(7041653-7041782)
chr8 (1-153)||(8654167-8654319)
chr8 (3-157)||(33542383-33542537)
chr8 (1-159)||(758575-758733)
chr8 (3-153)||(39240252-39240402)
chr8 (1-153)||(16645776-16645931)
chr8 (1-158)||(36343960-36344116)
chr8 (6-159)||(44254862-44255015)
chr8 (3-153)||(758347-758497)
chr8 (3-153)||(29026971-29027125)
chr8 (1-157)||(1825809-1825964)
chr8 (1-157)||(1860254-1860409)
chr8 (3-154)||(5417046-5417197)
chr8 (9-145)||(39912158-39912294)
chr8 (1-157)||(44255093-44255249)
chr8 (1-156)||(119347-119502)
chr8 (6-156)||(28206766-28206916)
chr8 (1-158)||(18914262-18914415)
chr8 (3-117)||(33542617-33542731)
chr8 (5-158)||(30873013-30873166)
chr8 (1-137)||(26736356-26736492)
chr8 (13-159)||(28206996-28207142)
chr8 (3-137)||(410595-410729)
chr8 (9-154)||(3868946-3869094)
chr8 (75-157)||(24456733-24456815)
chr8 (1-159)||(40094706-40094864)
chr8 (5-158)||(12873055-12873208)
chr8 (37-158)||(21512411-21512531)
chr8 (12-101)||(44678426-44678515)
chr8 (3-145)||(5525882-5526022)
chr8 (4-159)||(35485868-35486023)
chr8 (48-156)||(40032706-40032815)
chr8 (45-153)||(6844715-6844823)
chr8 (77-157)||(44678316-44678396)
chr8 (1-120)||(410405-410524)
chr8 (1-73)||(11639281-11639353)
chr8 (3-83)||(40040395-40040475)
chr8 (3-154)||(26217072-26217222)
chr8 (75-154)||(44678518-44678596)
chr8 (3-101)||(30568331-30568429)
chr8 (5-82)||(9495106-9495183)
chr8 (1-68)||(19302273-19302340)
chr8 (3-102)||(32733765-32733864)
chr8 (1-103)||(26217300-26217402)
chr8 (9-150)||(35486102-35486243)
chr8 (3-38)||(16645663-16645698)
chr8 (113-157)||(11639378-11639422)
chr8 (93-144)||(7117111-7117162)
chr8 (93-144)||(43633135-43633186)
chr8 (3-153)||(36344194-36344344)
[»] chr3 (126 HSPs)
chr3 (1-157)||(44069354-44069510)
chr3 (3-158)||(4846829-4846984)
chr3 (1-158)||(34521264-34521421)
chr3 (3-156)||(54107669-54107822)
chr3 (3-154)||(10756720-10756871)
chr3 (1-159)||(15862406-15862564)
chr3 (3-157)||(26332318-26332472)
chr3 (3-153)||(34629985-34630135)
chr3 (3-157)||(7950274-7950428)
chr3 (1-159)||(43899305-43899463)
chr3 (3-153)||(54081287-54081436)
chr3 (1-158)||(45171066-45171223)
chr3 (1-157)||(28688221-28688377)
chr3 (3-155)||(45171300-45171452)
chr3 (1-144)||(7742996-7743139)
chr3 (1-156)||(31513863-31514018)
chr3 (19-158)||(41208649-41208788)
chr3 (3-157)||(54081516-54081671)
chr3 (3-153)||(40410715-40410865)
chr3 (3-157)||(41997818-41997972)
chr3 (3-157)||(45871696-45871850)
chr3 (3-157)||(54108353-54108507)
chr3 (1-158)||(12123088-12123245)
chr3 (4-153)||(21169669-21169818)
chr3 (1-158)||(35753662-35753819)
chr3 (1-160)||(26332549-26332712)
chr3 (3-159)||(41208398-41208554)
chr3 (1-156)||(7937794-7937949)
chr3 (3-158)||(12123312-12123467)
chr3 (3-158)||(31514096-31514250)
chr3 (1-151)||(53841257-53841407)
chr3 (3-156)||(15862182-15862335)
chr3 (3-156)||(44069123-44069276)
chr3 (3-156)||(50819450-50819603)
chr3 (3-156)||(50856261-50856414)
chr3 (1-153)||(14353279-14353430)
chr3 (1-157)||(19124188-19124344)
chr3 (5-153)||(34521492-34521640)
chr3 (1-156)||(8846076-8846231)
chr3 (4-158)||(40926009-40926163)
chr3 (3-156)||(8846309-8846462)
chr3 (4-152)||(7274877-7275024)
chr3 (3-159)||(40639350-40639506)
chr3 (3-159)||(50819217-50819373)
chr3 (3-159)||(50856491-50856647)
chr3 (3-145)||(17273788-17273930)
chr3 (1-159)||(28691345-28691502)
chr3 (3-156)||(47891513-47891666)
chr3 (1-156)||(40969255-40969410)
chr3 (5-157)||(52606128-52606279)
chr3 (3-157)||(5348801-5348955)
chr3 (3-157)||(17102383-17102537)
chr3 (3-157)||(28691113-28691267)
chr3 (3-153)||(37133280-37133430)
chr3 (3-156)||(27940272-27940425)
chr3 (21-152)||(22354946-22355077)
chr3 (11-154)||(40926252-40926394)
chr3 (5-155)||(19124407-19124556)
chr3 (3-129)||(28688017-28688143)
chr3 (3-157)||(52268337-52268490)
chr3 (1-153)||(2829410-2829563)
chr3 (3-128)||(17102610-17102735)
chr3 (4-153)||(29248542-29248691)
chr3 (47-156)||(52609639-52609748)
chr3 (41-156)||(43899111-43899226)
chr3 (20-158)||(46766863-46767002)
chr3 (1-158)||(5348577-5348734)
chr3 (3-133)||(27254007-27254137)
chr3 (31-153)||(35580210-35580332)
chr3 (1-153)||(2078703-2078855)
chr3 (1-153)||(10756938-10757091)
chr3 (3-144)||(53678445-53678586)
chr3 (1-153)||(17274007-17274159)
chr3 (3-158)||(40969487-40969642)
chr3 (1-145)||(45871920-45872064)
chr3 (1-157)||(54247271-54247417)
chr3 (3-158)||(2829641-2829795)
chr3 (3-158)||(9028189-9028344)
chr3 (1-156)||(9028422-9028577)
chr3 (1-155)||(29248320-29248472)
chr3 (3-118)||(53841065-53841180)
chr3 (10-160)||(14353042-14353192)
chr3 (1-111)||(22444417-22444527)
chr3 (20-154)||(51170631-51170765)
chr3 (3-154)||(33773023-33773175)
chr3 (1-156)||(53678664-53678818)
chr3 (46-159)||(38911494-38911607)
chr3 (1-153)||(40639120-40639272)
chr3 (3-159)||(46766619-46766776)
chr3 (3-152)||(49222040-49222180)
chr3 (3-111)||(35753477-35753584)
chr3 (5-159)||(41998054-41998203)
chr3 (1-159)||(47891744-47891902)
chr3 (1-56)||(52606349-52606404)
chr3 (4-150)||(7742781-7742927)
chr3 (4-156)||(588384-588537)
chr3 (30-156)||(51883859-51883985)
chr3 (70-151)||(35753408-35753489)
chr3 (3-159)||(51885597-51885753)
chr3 (4-157)||(7274652-7274795)
chr3 (5-134)||(49222262-49222389)
chr3 (49-154)||(53310001-53310106)
chr3 (86-154)||(7937645-7937713)
chr3 (3-154)||(2078483-2078636)
chr3 (70-156)||(13866964-13867050)
chr3 (29-158)||(20963547-20963677)
chr3 (18-159)||(37133463-37133604)
chr3 (77-159)||(51311825-51311907)
chr3 (9-153)||(21918500-21918643)
chr3 (49-145)||(33812735-33812831)
chr3 (41-159)||(43839959-43840076)
chr3 (70-154)||(49529120-49529204)
chr3 (3-38)||(22444304-22444339)
chr3 (1-83)||(52268176-52268259)
chr3 (1-83)||(4846669-4846750)
chr3 (93-143)||(13355188-13355238)
chr3 (3-61)||(43527218-43527276)
chr3 (79-156)||(33812852-33812929)
chr3 (99-156)||(43527023-43527080)
chr3 (9-64)||(21169904-21169959)
chr3 (93-144)||(31049073-31049124)
chr3 (106-137)||(38911432-38911463)
chr3 (1-32)||(51885488-51885519)
chr3 (93-143)||(47872529-47872579)
chr3 (3-53)||(51311693-51311743)
chr3 (31-155)||(43844359-43844484)
[»] chr5 (81 HSPs)
chr5 (3-158)||(7399075-7399230)
chr5 (1-159)||(35263491-35263649)
chr5 (1-156)||(10656325-10656480)
chr5 (1-158)||(16353385-16353542)
chr5 (3-159)||(12593689-12593845)
chr5 (9-152)||(15267479-15267622)
chr5 (3-157)||(10656093-10656247)
chr5 (1-157)||(3878480-3878636)
chr5 (3-155)||(7210678-7210830)
chr5 (3-159)||(12694919-12695075)
chr5 (1-157)||(38416365-38416521)
chr5 (3-159)||(40589287-40589443)
chr5 (3-159)||(40589890-40590046)
chr5 (1-156)||(334296-334451)
chr5 (5-156)||(9692919-9693069)
chr5 (1-156)||(31656589-31656744)
chr5 (3-154)||(36751904-36752055)
chr5 (7-156)||(28392006-28392156)
chr5 (1-156)||(31908928-31909085)
chr5 (7-157)||(35263731-35263881)
chr5 (4-153)||(5624382-5624531)
chr5 (7-156)||(42710587-42710736)
chr5 (3-157)||(29023936-29024087)
chr5 (3-157)||(5087806-5087960)
chr5 (1-151)||(7210461-7210611)
chr5 (3-153)||(19205176-19205326)
chr5 (3-144)||(31656370-31656511)
chr5 (14-158)||(33699273-33699417)
chr5 (1-144)||(7399309-7399452)
chr5 (1-152)||(39706282-39706433)
chr5 (20-155)||(42710351-42710486)
chr5 (3-154)||(43570004-43570155)
chr5 (12-154)||(32272082-32272224)
chr5 (2-156)||(40589657-40589811)
chr5 (1-158)||(36752133-36752289)
chr5 (3-156)||(40589054-40589207)
chr5 (9-153)||(9693157-9693301)
chr5 (1-153)||(25923121-25923273)
chr5 (1-153)||(41859908-41860062)
chr5 (28-158)||(5088386-5088516)
chr5 (1-155)||(8418417-8418569)
chr5 (3-149)||(26289027-26289173)
chr5 (3-155)||(5152848-5153000)
chr5 (3-155)||(40774339-40774490)
chr5 (1-156)||(17861039-17861193)
chr5 (6-158)||(39706053-39706201)
chr5 (1-143)||(15476490-15476632)
chr5 (1-159)||(19204941-19205098)
chr5 (3-153)||(31909163-31909313)
chr5 (3-153)||(41372391-41372541)
chr5 (1-158)||(12593454-12593611)
chr5 (14-159)||(18514285-18514430)
chr5 (1-157)||(40774568-40774724)
chr5 (3-156)||(16353151-16353307)
chr5 (6-136)||(33762922-33763055)
chr5 (1-157)||(14143511-14143663)
chr5 (3-156)||(33763143-33763293)
chr5 (5-159)||(38416140-38416294)
chr5 (3-159)||(17861271-17861419)
chr5 (45-153)||(15476269-15476377)
chr5 (3-131)||(25923352-25923480)
chr5 (1-156)||(28391768-28391924)
chr5 (6-153)||(15670387-15670534)
chr5 (1-158)||(5152614-5152771)
chr5 (5-159)||(14051886-14052040)
chr5 (80-157)||(5460187-5460264)
chr5 (20-151)||(8418206-8418336)
chr5 (7-157)||(26289257-26289407)
chr5 (69-159)||(21750807-21750897)
chr5 (2-159)||(15267239-15267393)
chr5 (45-143)||(17736522-17736620)
chr5 (96-153)||(5460272-5460329)
chr5 (7-157)||(14143742-14143892)
chr5 (1-36)||(5088038-5088073)
chr5 (3-53)||(41859780-41859830)
chr5 (122-159)||(26288988-26289025)
chr5 (9-64)||(5624617-5624672)
chr5 (3-38)||(21750906-21750941)
chr5 (63-157)||(3879305-3879399)
chr5 (93-159)||(37192467-37192533)
chr5 (6-59)||(3878717-3878770)
[»] chr1 (131 HSPs)
chr1 (1-159)||(23281241-23281399)
chr1 (1-157)||(5463349-5463505)
chr1 (1-157)||(10923594-10923750)
chr1 (3-159)||(25088013-25088169)
chr1 (5-153)||(29256835-29256983)
chr1 (3-158)||(16267923-16268077)
chr1 (1-158)||(30611218-30611375)
chr1 (3-156)||(51691874-51692027)
chr1 (1-145)||(10654260-10654404)
chr1 (1-153)||(42607525-42607677)
chr1 (3-158)||(34028954-34029109)
chr1 (1-159)||(33753222-33753380)
chr1 (1-154)||(21035987-21036140)
chr1 (1-158)||(34028719-34028876)
chr1 (1-154)||(35986234-35986387)
chr1 (1-150)||(50574748-50574897)
chr1 (2-157)||(28970418-28970573)
chr1 (1-159)||(37199152-37199310)
chr1 (1-158)||(6181847-6182004)
chr1 (1-158)||(9881550-9881706)
chr1 (3-156)||(22584351-22584504)
chr1 (1-158)||(32564181-32564337)
chr1 (14-159)||(45305654-45305798)
chr1 (1-154)||(51692102-51692254)
chr1 (1-153)||(49291214-49291366)
chr1 (3-158)||(30792438-30792593)
chr1 (3-153)||(6181619-6181769)
chr1 (1-155)||(16267716-16267870)
chr1 (3-145)||(24590237-24590379)
chr1 (3-157)||(33753449-33753602)
chr1 (3-157)||(37198931-37199085)
chr1 (3-153)||(50118350-50118500)
chr1 (3-156)||(13944744-13944897)
chr1 (9-154)||(18793693-18793838)
chr1 (4-156)||(24590459-24590611)
chr1 (1-153)||(24655589-24655741)
chr1 (1-157)||(52412829-52412985)
chr1 (3-154)||(11787742-11787893)
chr1 (1-156)||(14775966-14776121)
chr1 (1-159)||(14118527-14118685)
chr1 (3-157)||(14775744-14775898)
chr1 (6-159)||(24655822-24655975)
chr1 (9-145)||(52412609-52412745)
chr1 (11-158)||(10654028-10654174)
chr1 (1-159)||(30293010-30293168)
chr1 (3-153)||(30293246-30293395)
chr1 (3-157)||(36657734-36657888)
chr1 (3-157)||(46738957-46739110)
chr1 (1-155)||(50921061-50921215)
chr1 (3-157)||(51810136-51810290)
chr1 (1-158)||(19986353-19986510)
chr1 (3-155)||(30611453-30611606)
chr1 (1-157)||(34279471-34279628)
chr1 (2-147)||(51810370-51810515)
chr1 (3-159)||(4045096-4045252)
chr1 (1-157)||(4045330-4045486)
chr1 (20-156)||(22584602-22584738)
chr1 (1-169)||(29257054-29257222)
chr1 (3-155)||(42607735-42607887)
chr1 (1-157)||(46949755-46949911)
chr1 (1-158)||(25088247-25088403)
chr1 (5-157)||(32563958-32564110)
chr1 (3-154)||(11394893-11395044)
chr1 (3-159)||(18793925-18794082)
chr1 (1-159)||(20260610-20260768)
chr1 (1-111)||(28112795-28112905)
chr1 (1-106)||(13831253-13831358)
chr1 (1-158)||(13944509-13944666)
chr1 (3-156)||(34279240-34279393)
chr1 (3-111)||(5118096-5118204)
chr1 (1-157)||(11787972-11788127)
chr1 (1-133)||(21384960-21385091)
chr1 (7-159)||(21385173-21385325)
chr1 (7-143)||(50574527-50574663)
chr1 (3-133)||(5463140-5463271)
chr1 (3-153)||(10923365-10923516)
chr1 (3-158)||(44222190-44222345)
chr1 (3-153)||(1831897-1832047)
chr1 (3-153)||(34621868-34622018)
chr1 (1-159)||(1831661-1831815)
chr1 (44-157)||(50921365-50921478)
chr1 (3-158)||(4550833-4550988)
chr1 (1-153)||(40533928-40534080)
chr1 (17-159)||(4054545-4054688)
chr1 (3-155)||(36657501-36657654)
chr1 (3-157)||(27209168-27209322)
chr1 (1-153)||(36884725-36884870)
chr1 (3-133)||(49291016-49291146)
chr1 (3-96)||(9119525-9119618)
chr1 (3-119)||(46949969-46950085)
chr1 (26-132)||(32517629-32517735)
chr1 (1-89)||(30792671-30792759)
chr1 (2-157)||(40703097-40703252)
chr1 (3-153)||(45305412-45305563)
chr1 (10-111)||(11797220-11797321)
chr1 (46-159)||(36077268-36077381)
chr1 (70-154)||(5117995-5118079)
chr1 (3-145)||(2125442-2125577)
chr1 (50-153)||(19885985-19886088)
chr1 (5-158)||(9119290-9119443)
chr1 (1-155)||(3569377-3569532)
chr1 (3-153)||(32517746-32517894)
chr1 (3-137)||(40534158-40534292)
chr1 (5-157)||(40702867-40703016)
chr1 (1-157)||(27209380-27209536)
chr1 (70-159)||(28112718-28112807)
chr1 (3-83)||(50921293-50921373)
chr1 (70-153)||(19886214-19886297)
chr1 (9-159)||(48702120-48702269)
chr1 (1-59)||(34621718-34621776)
chr1 (79-152)||(11394697-11394769)
chr1 (70-155)||(11797147-11797232)
chr1 (3-154)||(31125938-31126082)
chr1 (3-103)||(36884937-36885037)
chr1 (5-111)||(19886122-19886226)
chr1 (1-120)||(31126160-31126279)
chr1 (6-133)||(21036218-21036345)
chr1 (751-818)||(29726183-29726250)
chr1 (75-157)||(19269359-19269441)
chr1 (5-82)||(2125293-2125369)
chr1 (48-144)||(20260440-20260536)
chr1 (774-826)||(33060597-33060649)
chr1 (93-135)||(6241274-6241316)
chr1 (93-143)||(6714698-6714748)
chr1 (93-143)||(32193530-32193580)
chr1 (97-159)||(33784299-33784361)
chr1 (93-143)||(34023569-34023619)
chr1 (93-143)||(37708574-37708624)
chr1 (93-143)||(46448736-46448786)
chr1 (3-52)||(11394765-11394814)
chr1 (93-158)||(29021580-29021645)
[»] scaffold0236 (2 HSPs)
scaffold0236 (1-157)||(11445-11601)
scaffold0236 (3-138)||(11231-11366)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-156)||(40583-40738)
scaffold0051 (3-158)||(40350-40505)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (1-156)||(45067-45222)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (6-156)||(11723-11873)
scaffold0168 (3-159)||(11485-11641)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (3-153)||(13774-13924)
scaffold0188 (1-157)||(13541-13696)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-158)||(177296-177453)
[»] scaffold0045 (4 HSPs)
scaffold0045 (3-154)||(65972-66123)
scaffold0045 (3-154)||(73304-73455)
scaffold0045 (5-145)||(65750-65890)
scaffold0045 (5-145)||(73082-73222)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-156)||(93188-93345)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (3-156)||(90805-90958)
scaffold0016 (3-106)||(91741-91844)
[»] scaffold1436 (2 HSPs)
scaffold1436 (1-111)||(1706-1815)
scaffold1436 (6-158)||(1474-1625)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (3-111)||(11713-11821)
scaffold0444 (75-157)||(11638-11720)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (75-153)||(25970-26048)
scaffold0193 (3-54)||(26038-26089)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (70-151)||(10920-11001)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (93-143)||(6231-6281)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (93-159)||(57019-57085)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 826; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 826; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 988
Target Start/End: Original strand, 32706963 - 32707958
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32706963 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaac-aacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 32707061  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaattaggacgaactaaatatagtttatagacat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  32707062 aagggaccaaagcgatactatctaaataattaagggactaaaaatacaatttagcctaacatttattaattaggatgaattaaatatactttatagacat 32707161  T
Q  201 gtcatgtcacaatacacaagattttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaataggaataaggatgatttggcgcgcagtttgggtggaagaat 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  32707162 gtcaagtcacaatacacaagattttgttatgttttaattttaagataaacaaaataaattggaataaggatgatttggc----agtttgggtggaagaat 32707257  T
Q  301 taaggaatttagtgataaggaaattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacccttagttat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32707258 taaggaatttagtgataaggaaattacgattttctaaactggatattagaattagggatagagagaataaataagcttttggaaacatacctttagttat 32707357  T
Q  401 ttaaaaaatgctaacaattatatttgaatatcctactttcttaatactcattcaacacttcattttatctctatctcttgttatattcctttctttacat 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32707358 ttaaaaaatgttaacaattatatttgaatatcctactttcttaacactcattcaacatttcattttatctctatctcttattatattcctttctttacat 32707457  T
Q  501 gtagaatgaatttgtatgtacatataaagcattttcttttttagaatttgaaagactaggtggtcggttgccctacacatgaagttattggacatacaag 600  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707458 gtagaatgaatttggatgtacatatagagcattttcttttttagaatttggaagact-ggtggtcggttgccctacacatgaagttattggacatacaag 32707556  T
Q  601 actggttggccaccctgcaaaggaaattaaatatgagaaaccaaagctaactaaaactaatagtaaaataaacaaaagagccacatatggaggggtgca- 699  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32707557 actgtttggccaccctgcaaaggaaattaaatatgagaaaccaaagctaactaaaactaatagtaaaataaacaaaagagccacatatggaggggtgcac 32707656  T
Q  700 -------------cctaaactcataactctattgttttaataattaagacaataagcacttgaatgatgttggttcaatataaactccatatttattttt 786  Q
                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32707657 ctaaaccttaaatcctaaactcataactctattgtttcaataattaagacaataatcacttgaatgatgttggttcaatataaactacatatttattttt 32707756  T
Q  787 cgttgttttaaccaaattgatatcaattaagttattattccagtcgcgatcactttctaattttagcaaaataaaattttaaacattgcatgattagtac 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707757 cgttgttttaaccaaattgatatcaattaagatattattccagtcacgatcactttctaattttagcaaaataaaattttaaacattgcatgattagtac 32707856  T
Q  887 tctaggtacatagaaagtgaaggatgattagttagcacaaaactatagtaaacacgtaacaaaattcacgatatcagttgcttctaaactaagatgctaa 986  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707857 tctaggtacatagaaagtgaaggatgattagttagcacaaaactatagtaaacacgtaacaaaattcacgatatcagttgcttctaaactaagatgctaa 32707956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18731174 - 18731019
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18731174 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 18731075  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18731074 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18731019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31715786 - 31715631
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31715786 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 31715687  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31715686 ggggtcaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatacaatttagccta 31715631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23437305 - 23437149
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23437305 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatatgtaaccgagagaggttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 23437206  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  23437205 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttagcctaa 23437149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 8769515 - 8769666
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8769515 atgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 8769614  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8769615 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttag 8769666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35085894 - 35085736
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35085894 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 35085795  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35085794 aaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35085736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43140852 - 43140701
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  43140852 agatgaagaaaacgtaacgtttt-gaattaaaactaacagaaatgaccaaaatatgtaacagagaggagttaagagaccaaaataaatcaaattttaatt 43140754  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43140753 aagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatgcaattta 43140701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 10625317 - 10625471
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  10625317 atgaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 10625416  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10625417 aggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10625471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 44448143 - 44448295
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||    
T  44448143 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaatt 44448242  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44448243 aagggaccaaagcgatactacttaaataattaaaggactaaaaatccaattta 44448295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 47250781 - 47250933
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  47250781 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 47250880  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47250881 gaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 47250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 9034548 - 9034703
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  9034548 atgaagaaaatctaacgtttttgatttaaaactaacgaaaaggaccaaaatctgtaacagagggaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 9034647  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9034648 gagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagccta 9034703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34568736 - 34568585
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  34568736 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 34568637  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34568636 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggacaaaaaatacaatttag 34568585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11678856 - 11678702
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11678856 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 11678757  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11678756 gggaccaaagtgatattatctaaatatttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 11678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 23472788 - 23472942
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23472788 gatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 23472887  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23472888 agggaccaaagcgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 23472942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 9230908 - 9231065
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | ||||||    
T  9230908 agatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagtgaccaaaataaatcaaatcttaatt 9231007  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9231008 aagggaccaaaacgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatacaacttagccta 9231065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2357222 - 2357066
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  2357222 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaatt 2357123  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  2357122 aagggaccaaagtgatactatttaaatagttaagagatcaaaaatgcaatttagcct 2357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 35085973 - 35086127
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||| ||||    
T  35085973 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggtccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaaattttagttaa 35086072  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35086073 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 35086127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21522371 - 21522226
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||  || ||||||||||    
T  21522371 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaa--gaattttaattaa 21522274  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 150  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  21522273 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaat 21522226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23472746 - 23472590
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||  |||||| ||||||||||    
T  23472746 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaaagaaccaaaatgaatcgaattttaattaa 23472647  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
      || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23472646 aagaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 23472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 31715857 - 31716008
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  31715857 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacg-aaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttataggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 31715955  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31715956 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31716008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 26920148 - 26920302
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26920148 agatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 26920247  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26920248 aagggaccaaagcgatacaaccgaaatagataagggattaaaaatgcaatttagc 26920302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39118163 - 39118013
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||  |||||||||    
T  39118163 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttagggaatcaaaataaatcgaaatttaattaa 39118064  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39118063 gggatcaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39118013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5238606 - 5238449
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  5238606 agatgaagaaaacttaacgtttttgaagtaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 5238507  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  5238506 aagggaccaaagcgatactacctaaacagttaatggatcaaaaatgcaatttagccta 5238449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 11678936 - 11679088
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  11678936 atgaagaaaaactaacctttttgaat-aaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaa 11679034  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11679035 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 11679088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 44486165 - 44486318
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||  | | ||||||||    
T  44486165 atgaagaaaatctaacgttttggaatttaaactaacagaaaggaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaattaaatattaattaa 44486264  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44486265 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44486318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Original strand, 2357300 - 2357444
Alignment:
Q  15 taacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||  |||| ||    
T  2357300 taacatttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagttaagggcccaaaacg 2357399  T
Q  115 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2357400 atactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagtctaa 2357444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 21522449 - 21522599
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21522449 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgt-taacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaatt 21522546  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21522547 aagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaacacaattta 21522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41758829 - 41758691
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41758829 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggg 41758730  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41758729 accaaaacgatactatttaaatagttaagggacaaaaaa 41758691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8769432 - 8769279
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  8769432 aagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattcaggg 8769333  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8769332 accaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 8769279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32706885 - 32706729
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32706885 atgaagaaaacctaacgtttttgaattagaactaacggaaaggactaaaatgtgtaattgagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 32706786  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||   ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32706785 gggtcaaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 32706729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47250712 - 47250570
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  47250712 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaatggggagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 47250613  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  47250612 aagggaccaaaatgatactacctaaataattaagggacaaaaa 47250570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38842182 - 38842035
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38842182 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggatcaaaataaatcgaattttaattaagg 38842084  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || ||||  || | |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38842083 ga-caaaatgacattatcaaaatagttaaggaaccaaaattacaatttag 38842035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 43726473 - 43726630
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  43726473 agatgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 43726572  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| |  ||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43726573 aaggaactaaaacaataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 43726630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24119861 - 24119713
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  24119861 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagagaagttaagggatcaaaagaaatcaaattttaattaagagacc 24119762  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||    
T  24119761 aaagtgatactatctaaatagttaagaaaccaaaaatgtaatttagcct 24119713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 47251132 - 47251283
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||     
T  47251132 gaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gagaaaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaaga 47251230  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47251231 gaccaaagcaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcct 47251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 473415 - 473569
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||      
T  473415 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaattgagagaagttaagggacgaaaataaatcaaattttaattaaaa 473514  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||| |||||    
T  473515 gaccaaagcgatactacctaaatagttaaagaattaacaatgcaatttaacctaa 473569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 36507042 - 36507196
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  36507042 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaa 36507141  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  36507142 gggaccaaatcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaacataatttagcct 36507196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9230829 - 9230716
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9230829 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 9230730  T
Q  103 gggatcaaagcgat 116  Q
    |||| |||||||||    
T  9230729 gggaccaaagcgat 9230716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44448066 - 44447916
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  44448066 atgaagaaagtctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggccaaaatgtgtaaaagagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 44447967  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
     ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  44447966 -ggaccaaaacaatactatctaaatagttaacggaccaaaaatgcaatttag 44447916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 34568814 - 34568977
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaa-cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||    
T  34568814 agatgaagaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggacaaaaataaatcaaattttaat 34568913  T
Q  100 taagggatcaaagcgatac----tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||    ||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  34568914 taagggatcaaagtgatactacataaataaatagtaaagagaccaaaaatataatttagcctaa 34568977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 38842253 - 38842410
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |  ||| ||||  | ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  38842253 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaatatgtgtaacgggtagaagttagag-accaaaataaatcgaattttagtt 38842351  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  38842352 aagggaccaaagcgatgctacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaatttagtctaa 38842410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 31623657 - 31623810
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||| | ||||| || |    
T  31623657 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttatgggaccaaaataaatcaaattttacttga 31623756  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||  |||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31623757 gggtccaaaacgatactacctgaataattaaggtactaaaaatgcaatttagcc 31623810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47305282 - 47305127
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  |||| |  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  47305282 agatgaagaaaacctaacgtctttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 47305184  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47305183 taagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 47305127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 473344 - 473191
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||   ||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  473344 agatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaaggac---aatgtgtaacagagaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagtt 473248  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  473247 aagggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagcgatcaaaaatgcaatttagcct 473191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 44485565 - 44485718
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| |||| || | ||||||||    
T  44485565 atgatgaaaacctaatgttttggaatttaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaattgaatattaattaa 44485664  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  44485665 aggaccaaagcgataatacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcc 44485718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43726395 - 43726241
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  43726395 atgaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaatgaaaag-atcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaat-aaatcaaattttaattaa 43726298  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43726297 gggaccaaagcgagactacttaaataattaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 43726241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 48704040 - 48704193
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  48704040 agatgaaaaaactctaacgtgtttgaattaaa-ctaacataaaggaccaaa-tgtgtatcggacagaaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaat 48704137  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  48704138 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatatcatttagc 48704193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22338426 - 22338272
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| || | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  22338426 atgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 22338327  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22338326 aggtaccaaagcaatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 22338272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 28349614 - 28349763
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||   ||||||| ||||  | ||||||||||    
T  28349614 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaa-agagaaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaa 28349712  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  28349713 gggaccaaaacaatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 28349763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37143916 - 37143764
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | |||||   ||||||  ||||| | ||||||||||    
T  37143916 atgaagaaaatctgatgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagaaaagttaagataccaaat-aaatcaaattttaattaa 37143818  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37143817 gggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcc 37143764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 23437384 - 23437494
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| | ||||   |||||||| ||||| | |||||||||    
T  23437384 gatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgggaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttacgagaccaaaataaatcaaattttaatta 23437483  T
Q  102 agggatcaaag 112  Q
    ||||| |||||    
T  23437484 agggaccaaag 23437494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 37143994 - 37144151
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || |||||| |||||  ||||||   ||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  37143994 agatgaagaaaacctaacgtatttaaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaat 37144092  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  37144093 taagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 37144151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 22338509 - 22338663
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gtta--atggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||  |   ||||||| ||||  | ||||||||||    
T  22338509 aagaaaccctaacatttttgaattaaaattaatgtaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaagttacgacataccaaaataaatgaaattttaattaa 22338608  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22338609 gggacgaaagcgatactaattaattagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 22338663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 47251052 - 47250942
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag-agacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  47251052 agatgaagaaaatttaacgtttttga-ttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaat 47250954  T
Q  100 taagggatcaaa 111  Q
    ||||||| ||||    
T  47250953 taagggaccaaa 47250942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 47305360 - 47305490
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  ||| || |||||   ||||||| ||||  | ||||||||||    
T  47305360 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatggagtgaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaa 47305459  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  47305460 gggagcaaaacgatactaattaaatagttaa 47305490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36506967 - 36506848
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    |  | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||    
T  36506967 agatgaagaaaacccaacatttttaaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaaggatggaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatt 36506868  T
Q  101 aagggatcaaagcgatacta 120  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  36506867 aagagatcaaaacgatacta 36506848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 10625238 - 10625180
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  10625238 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaa 10625180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 24119938 - 24120002
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 67  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24119938 atgaagaaaatctaacattttttaattaaaattaacagaaagaaccaaaatatgtaacagagaga 24120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43050510 - 43050383
Alignment:
Q  31 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 129  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||  || || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| | ||| ||  |||||||    
T  43050510 aaactaacggaaagcaccaaaatatgtaacaaagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttaattaggggaccaaaccaatattaattaaatag 43050411  T
Q  130 ttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  43050410 ttaagggaccaaaaagacaaattagcct 43050383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15326951 - 15326869
Alignment:
Q  77 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  15326951 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaaaaactaaaaatgcaatttagcctaa 15326869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19543553 - 19543503
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  19543553 ttttaattaagggatcaaagcgatactaaataaatagttaagggacgaaaa 19543503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10625177 - 10625104
Alignment:
Q  85 aaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  10625177 aaatcgaattttagttaagggaccaacacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 10625104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 48703962 - 48703854
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||   | |   ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48703962 atgaataaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaagttgtaacagagagaaaattaaaaaccaaaataaatcgaattttaattaa 48703863  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    | |||||||    
T  48703862 gtgatcaaa 48703854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 40739963 - 40740094
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||| |   ||||   |||||||   | ||  |||||||||||||| ||||    
T  40739963 cctaacgtttttgaattaaatttaacgaaaaggaccaaaatatataacggagataaacttaaaataccaaaacggaacgtattttaattaagggaccaaa 40740062  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  40740063 gcgatactaaataaataattaagggactaaaa 40740094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 24446296 - 24446360
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  24446296 ttttaattgtgggatcaaagcgatagtaattaaatagttaagggacaaaaataacaatttagcct 24446360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36720542 - 36720491
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  36720542 ttttagttaagggaccaaagcgataccaactaaatacttaagggactaaaaa 36720491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43705008 - 43704957
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43705008 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43704957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 45457099 - 45457149
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  45457099 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 45457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 15327096 - 15327165
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa 73  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  15327096 tgaagaaaacctaacgttttagaattaaaatacacggaaatgaccaaaatatataacggagagatgttaa 15327165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38676201 - 38676061
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||    
T  38676201 cctaacgttttt-aattaaatttaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaaagttaagagaccaaaataaatcaaaatttagttaagggaccaaa 38676103  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| |  |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38676102 ccgaaatcaattaaatagttaagggaccaaaaatataattta 38676061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52915105 - 52914950
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  52915105 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 52915006  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52915005 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 52914950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32384808 - 32384653
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  32384808 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaggttaaagaaccaaaataaatcgaattttaatt 32384709  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32384708 agaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 32384653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25218239 - 25218095
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25218239 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaatt 25218140  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  25218139 aagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaat 25218095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29864331 - 29864175
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29864331 agatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacagaaaggaccaacatgtgtaacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 29864232  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  29864231 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 29864175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40067503 - 40067347
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40067503 agatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 40067404  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40067403 agaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcct 40067347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 1157439 - 1157589
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1157439 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 1157538  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1157539 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 1157589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10014619 - 10014465
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10014619 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaatt 10014521  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10014520 aagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10014465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10021760 - 10021606
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10021760 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaatt 10021662  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10021661 aagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10021606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 33626095 - 33626250
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  33626095 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtt 33626194  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33626195 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 33626250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21218000 - 21217846
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21218000 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 21217901  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21217900 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 21217846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9010660 - 9010503
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9010660 agatgaagcaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 9010561  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9010560 aagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9010503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27347750 - 27347597
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27347750 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 27347651  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27347650 aggaccaaagcgatactatctaaatagtcaagggaccaaaaatataatttagcc 27347597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33626017 - 33625868
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33626017 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33625918  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33625917 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33625868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54136243 - 54136090
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  54136243 tgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaag 54136144  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54136143 ggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54136090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 52915178 - 52915333
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |    
T  52915178 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaag 52915277  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac--taaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  52915278 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaaaatgcaatttagccta 52915333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21218078 - 21218233
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21218078 agatgaaaaatatctaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 21218177  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21218178 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 21218233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 29864408 - 29864559
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29864408 atgaataaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 29864507  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29864508 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 29864559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43317034 - 43316877
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||    
T  43317034 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagataagttaagggaccaaaataaataaaattttaatt 43316935  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43316934 aagggaccaaagcgatactaccttaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcctaa 43316877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Original strand, 33882182 - 33882331
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  33882182 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaagactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 33882281  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33882282 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 33882331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 12381285 - 12381441
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12381285 agatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 12381384  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  12381385 aagggatgaaagcgatattgcctaaatagtttagggaccaaaaatacaattaagcct 12381441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45911734 - 45911582
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  45911734 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 45911635  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  45911634 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaatgaaccaaaaatgcaattta 45911582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 43317112 - 43317267
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43317112 atgaaggaaacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 43317211  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  43317212 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaggagactaaaaatgcaatttagccta 43317267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44710558 - 44710403
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||  ||    
T  44710558 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaatttttgtt 44710459  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44710458 aagagaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 53645606 - 53645463
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  53645606 agataaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaatt 53645507  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53645506 aagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggacaaaaaa 53645463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 9010738 - 9010892
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9010738 atgaagaaaaccttatgtttttgaattaaaactaacggaagtaaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 9010837  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9010838 gggaccaaagagatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 9010892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 45911807 - 45911961
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45911807 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagataagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 45911906  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45911907 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 45911961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 46621160 - 46621310
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  46621160 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaa 46621259  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46621260 aggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 46621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 25593324 - 25593477
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25593324 atgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 25593423  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25593424 gggaccaaaacaatactccctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagcc 25593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 40067581 - 40067734
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||    
T  40067581 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaa 40067680  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40067681 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcc 40067734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 46621080 - 46620931
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46621080 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 46620981  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46620980 gggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 46620931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25058986 - 25058830
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25058986 atgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggagcaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaa 25058887  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  25058886 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatttaacctaa 25058830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44432855 - 44433011
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  44432855 agatgaagaaaatctgacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtt 44432954  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  44432955 aagggaccaaagtgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 44433011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 25218317 - 25218448
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25218317 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa 25218416  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaag 134  Q
     ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  25218417 aggaccaaaacgatactacctaaatagttaag 25218448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45683272 - 45683117
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| ||    
T  45683272 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttactt 45683173  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||    
T  45683172 aaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagatcaaaaatgtaatttagcc 45683117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2739033 - 2738883
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2739033 atgaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 2738934  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2738933 aggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 2738883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 4966019 - 4965889
Alignment:
Q  8 gaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  4966019 gaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagggag 4965920  T
Q  108 caaagcgatactatctaaatagttaagggac 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4965919 caaagcgatactacctaaatagttaaaggac 4965889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 18862673 - 18862827
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18862673 atgaagaaatcctaacgttttttaattaaaactaacggaatggacaaaaaggtgtaacagagagcaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 18862772  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18862773 aaggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 18862827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 27347828 - 27347985
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27347828 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 27347927  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  27347928 aagggaccaaatcgatactacctaaatagttaaggaacataaaatgcaattaagccta 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34958984 - 34958832
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  34958984 atgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaattgtgtaacagagataagttaa-ggaacaaaataaatcaaattttaattaa 34958886  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34958885 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 34958832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 45683350 - 45683503
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  45683350 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttaa 45683449  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || | |||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45683450 ggaaccaaagcaatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatacaatttagcc 45683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 8246979 - 8247129
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8246979 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacagaaatgacgaaaatgtttaagggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 8247078  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8247079 gggaccaaagaaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 8247129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29970345 - 29970196
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  29970345 atgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggataagaccaaaatgtgtaacggagataagttaatg-accaaaataaatcaaattttaattaa 29970247  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29970246 gggatcaaagcgatactacctaaatagttatgggaccaaaaatgcaattta 29970196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22830952 - 22830795
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  22830952 agatgaagaaaccctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 22830853  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22830852 taagggaccaaagctatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattcagcct 22830795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 37515687 - 37515836
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37515687 tgaagaaagtctaacgttttttaattaaaactaatggaattgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaag 37515786  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37515787 ggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaataaaattta 37515836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 46200640 - 46200483
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  46200640 agatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaat 46200541  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46200540 taagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 46200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46535675 - 46535523
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |  ||| |||   ||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  46535675 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgaacgaga-agaaactaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaa 46535577  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46535576 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 46535523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38866551 - 38866395
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  38866551 atgaagaaaacctgaggtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaa 38866452  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38866451 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 38866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 34959064 - 34959214
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34959064 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaaattaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaa 34959163  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  34959164 ggaaccaaagcgataatacctaaatagttaagggaccaaaattgcaattta 34959214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1157361 - 1157206
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg---ttaatggaccaaaagaaatcgagtttta 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||  | |||||    
T  1157361 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagtacttaagggaccaaaataaattaaatttta 1157262  T
Q  98 attaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1157261 attaaggaaccaaagcgatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 1157206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8751442 - 8751289
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  8751442 agatgaagaaaatctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagtt 8751343  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| ||||   |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  8751342 aagggaccaaaattatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttag 8751289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 54191743 - 54191638
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54191743 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 54191644  T
Q  101 aaggga 106  Q
    ||||||    
T  54191643 aaggga 54191638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21051512 - 21051360
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21051512 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaatttaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcaaattttagttaa 21051413  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21051412 gagatcaaagcgatgctacctaaataattaagggacaaaaaatgtaatttagc 21051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 54191818 - 54191969
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||   ||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54191818 atgaagaaaatctaacattttttaattgaaactaagg-aaaggaccaaaatgtgtaatggggagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaa 54191916  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54191917 gggaccaaaacgatgctatctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagc 54191969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 1205608 - 1205763
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| || ||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1205608 agataaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaaggtaagggacaaaaataaatcgaattttaatt 1205707  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1205708 aagggagaaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1205763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 4793835 - 4793981
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4793835 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaaggg 4793934  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | |||| |||||||| |||||||  ||||||   ||||||||||||||    
T  4793935 accaaaacgatactacctaaata-ataaggggtcaaaaatacaattta 4793981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8246922 - 8246769
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  8246922 agatgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaatt 8246824  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  8246823 aagggaccaaaatgatattatctaaataattaa-ggaccaaaaatacaatttagcc 8246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 32385045 - 32385199
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  32385045 atgaagaaaacctaacattttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagttaa 32385144  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32385145 gggat-aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32385199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 4966099 - 4966257
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||  |||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  4966099 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataatggagagaagttaagagacaaaaataaatcgaattttaatt 4966198  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||    
T  4966199 aaggaatcaaaacgataccacctaaatagttaaggggcaagaaatgcaatttaccctaa 4966257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 24504173 - 24504315
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24504173 atgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24504272  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
     |||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  24504273 aggactaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaat 24504315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 43969758 - 43969916
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||     
T  43969758 agataaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtataacaaaaagaagttaagggaccaaagtaaatcgaattttaatc 43969857  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  43969858 aagggatcaaaacgatactacataaatagttaacgaaccaaaaataaaatttagcctaa 43969916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 46535753 - 46535907
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||| ||||| ||||||| | |||| || ||||||||    
T  46535753 agatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtataccagaaagaagttaaaggaccaagataaatagaattttaatt 46535852  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |  ||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46535853 agaggaccaaaacaatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatacaatttagc 46535907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48210089 - 48209947
Alignment:
Q  15 taacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  48210089 taacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagggagagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 48209990  T
Q  115 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  48209989 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 48209947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Original strand, 44710636 - 44710785
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44710636 atgaagaaaatctaacttttttgaattaaaaccaacgaaaaggactaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 44710735  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    || | |||| ||||||||  |||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  44710736 ggaaccaaaacgatactacataaatacttaagggatcaaaaatgcaattt 44710785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 46200718 - 46200871
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || ||||||||||    
T  46200718 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 46200817  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  46200818 gggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 46200871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 22831030 - 22831181
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  22831030 atgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 22831129  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22831130 agggaccaaagcgatactagcaaaatagttaagggaccaaaaatccaattta 22831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24504090 - 24503939
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaa-ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  24504090 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaggaccaagatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaag 24503991  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     | |||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24503990 aaccaaaacaatactacctaaataattaagggattaaaaatgcaatttagcc 24503939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1205530 - 1205381
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||   || || | |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1205530 atgaagaaaacccaatgttttttaattaaaactaacggcaatgatcgaaatgtgtaacagagaaa-gttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 1205432  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  1205431 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaagtgcaattta 1205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25977913 - 25977771
Alignment:
Q  12 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || ||||    
T  25977913 acctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattgagagaccaaa 25977814  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaaggga-ctaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25977813 gcgatagtacctagatagttaagggaccaaaaaatacaattta 25977771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 38866630 - 38866783
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatgga-ccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||| |||||||    
T  38866630 agatgaagaaaagctaatgttttttatttaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaaataaatcgaattttaat 38866729  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||  | | ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38866730 tagagtaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaatcaaaaatacaattta 38866783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 28570666 - 28570806
Alignment:
Q  15 taacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  28570666 taacttttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtg 28570765  T
Q  115 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| | ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  28570766 ataccacctaaatagttaagtgatcaaaaatgcaatttagc 28570806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 44428724 - 44428616
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  44428724 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaa 44428625  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  44428624 gggaccaaa 44428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 11242700 - 11242849
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    ||||||||| |||| || |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  11242700 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaggaa-ataa----ccaaaatatataacggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatc 11242794  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11242795 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagc 11242849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 10014700 - 10014851
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  10014700 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 10014798  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10014799 accaatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10014851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 10021841 - 10021992
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  10021841 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagagatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 10021939  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | |||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10021940 accaatacgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaacttagccta 10021992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 11102218 - 11102364
Alignment:
Q  14 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaag 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| ||||     
T  11102218 ctaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaac 11102317  T
Q  113 cgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11102318 caatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 11102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 21051578 - 21051688
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21051578 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaataaagagaagttaagggaccaaaataaatctaattttaatt 21051677  T
Q  101 aagggatcaaa 111  Q
    |||||| ||||    
T  21051678 aagggaccaaa 21051688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15985610 - 15985469
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag-agacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| | | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  15985610 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtattagagaaaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaa 15985511  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     |||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15985510 acgatactagcaaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 15985469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44170121 - 44169978
Alignment:
Q  15 taacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   || |||| ||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  44170121 taacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagatactaaaataaatcaaattttaatcaagggaccaaagc 44170022  T
Q  114 gatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44170021 gatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44169978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9657812 - 9657667
Alignment:
Q  11 aacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  ||||||  |||||   | ||||| ||||| | |||||||||||||| ||    
T  9657812 aacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatatcaaaataaatcaaattttaattaagggacca 9657714  T
Q  110 aagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9657713 aaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 9657878 - 9658034
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||  | |||||||    
T  9657878 agatgaagataacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaat 9657976  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9657977 taggggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatataatttagcct 9658034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Original strand, 21885057 - 21885178
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  21885057 atgaagaaaatcaaatgtttttgaattaaaagtaacggaaaggaccaaaatgtttaacggatagaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 21885156  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatcta 124  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  21885157 gtgaccaaagcgatactatcta 21885178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 54136324 - 54136474
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     ||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  54136324 atgaaaaaaccctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgcaacagaa----gttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 54136419  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     |||||||| | || ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  54136420 aggatcaaaacaattctacctaaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagcct 54136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 42779675 - 42779573
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| |  |||| |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  42779675 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaagataaattaacggattaaaataaatcgaattttaatt 42779576  T
Q  101 aag 103  Q
    |||    
T  42779575 aag 42779573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 44170223 - 44170370
Alignment:
Q  14 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa--tatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaa 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | || |||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  44170223 ctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaaaatatgta-cggatagaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggatcaa 44170321  T
Q  111 agcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  44170322 agcaatactaattaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagtctaa 44170370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 29970423 - 29970495
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa 73  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29970423 agatgaagaaaacttaacgattttgaattaaaactaacggaaagctccaaaatgtgtaacagagagaagttaa 29970495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43969679 - 43969599
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaa-cataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  43969679 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaccaatggaaaaggaccaaaatatgtaacagatagaagttaagggaccaaa 43969599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44428594 - 44428512
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  44428594 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 44428512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 4793754 - 4793723
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793754 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 4793723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43969611 - 43969556
Alignment:
Q  99 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43969611 ttaagggaccaaagcaatactacataaataattaagggaccaaaaatacaatttag 43969556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28504640 - 28504590
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  28504640 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 28504590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 41610528 - 41610578
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  41610528 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 41610578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46307619 - 46307569
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  46307619 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 46307569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10017856 - 10017815
Alignment:
Q  115 atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10017856 atactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 10017815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 105)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 13354410 - 13354566
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13354410 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaatatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 13354509  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13354510 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaattacaatttagcctaa 13354566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31450819 - 31450665
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  31450819 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 31450720  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31450719 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 31450665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41377507 - 41377354
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41377507 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 41377408  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41377407 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatacaatttagcct 41377354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5961824 - 5961668
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5961824 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaatttttaatt 5961725  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5961724 atgggatcaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcct 5961668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 28203091 - 28203247
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28203091 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 28203190  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28203191 aagggaccaaagcgatacgacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 28203247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20908742 - 20908897
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20908742 agatgaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 20908841  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20908842 agaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 20908897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 4104392 - 4104545
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4104392 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 4104491  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4104492 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 4104545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13354332 - 13354176
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13354332 agatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 13354233  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13354232 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccgaaaattcaatttagcct 13354176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21470448 - 21470292
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21470448 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttgagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 21470349  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  21470348 gggaccaaagtgatactgcctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcctaa 21470292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43183736 - 43183585
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43183736 atgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttatgggaccaaaataaatctaattttaattaa 43183637  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43183636 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgtaatttag 43183585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16261025 - 16260872
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16261025 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtttaacggagagaagttaaaggaccaaaa-aaatcgaattttagtt 16260927  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16260926 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgctatttagc 16260872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 25642501 - 25642655
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25642501 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 25642600  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25642601 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatacaatttagcct 25642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16655759 - 16655610
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16655759 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 16655660  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
     ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16655659 aggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 16655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16736256 - 16736100
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16736256 agatgaagaaaacctaacgttttcaaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 16736157  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16736156 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 16736100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27132664 - 27132509
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27132664 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactatcggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 27132565  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27132564 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 27132509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31450897 - 31451052
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  31450897 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttagtt 31450996  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  31450997 aagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 31451052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 38275688 - 38275842
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg--ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38275688 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagagttacgggaccaaaataaatcgaattttaatt 38275787  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38275788 aagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagc 38275842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 41377585 - 41377740
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  41377585 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 41377684  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41377685 acgggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 41377740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 27476600 - 27476754
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27476600 atgaagaaaatctaacgttcttgatttaaaactaacggaaaggaccataatatgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 27476699  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27476700 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcct 27476754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 34820510 - 34820668
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  34820510 agatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtt 34820609  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34820610 aagggaccaaagcgagactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaacctaa 34820668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 37744621 - 37744771
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37744621 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatctataagagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37744720  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  37744721 gggaccaaagcgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaattta 37744771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27883621 - 27883468
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27883621 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaa 27883522  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27883521 gggaccaaagcgatattacttaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 27883468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39454602 - 39454449
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39454602 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaagg 39454503  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39454502 gaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 39454449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41659898 - 41659745
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  41659898 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggcccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 41659799  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41659798 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggacaaaaaatataatttagcc 41659745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12303938 - 12303786
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12303938 atgaagaaaacctaatgtttttgaaataaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagatgagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 12303839  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12303838 gtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 12303786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4104314 - 4104159
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||    
T  4104314 agatgaaggaaacccaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacagagagaagttaagataccaaaataaatcgaattttaatt 4104215  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4104214 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 4104159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 27132741 - 27132896
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27132741 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatatgtaacggatagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaatt 27132840  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27132841 aaaggaccaaatcgacactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 27132896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28203015 - 28202860
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  28203015 agatgaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggatagaagttaaaggaccaatataaatcgaattttaatt 28202916  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28202915 aagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 28202860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25642423 - 25642273
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | | |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25642423 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaaggatcaaaatgtgtaacagataaaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 25642324  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642323 aaggaaccaaagcgatactacttaaatagttaagggactaaaaatacaatt 25642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 36442365 - 36442519
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||    
T  36442365 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgactaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggatcaaaataaattaaattttaatt 36442464  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36442465 aaaggatcaaagcaatactatctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagc 36442519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 12304385 - 12304542
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  12304385 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 12304484  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12304485 aaaggaccaaagcgatactacctaaattgttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 12304542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17856352 - 17856199
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17856352 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacaaggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 17856253  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  17856252 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccgaaaatgaaatttagcc 17856199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18565217 - 18565064
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18565217 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 18565118  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  18565117 gactaaagcgatactgcctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 18565064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Original strand, 28631512 - 28631657
Alignment:
Q  8 gaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||     
T  28631512 gaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaagagag 28631611  T
Q  108 caaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28631612 caaagcgatactacccaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 28631657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32933746 - 32933589
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| ||    
T  32933746 agatgaagaaaacctgacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagtt 32933647  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32933646 aagggatcaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 32933589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 32933824 - 32933977
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  32933824 atgaacaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttatttaa 32933923  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32933924 aggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 32933977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34820432 - 34820283
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  34820432 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaattaa 34820333  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    || | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34820332 ggaaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34820283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 39912783 - 39912630
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  39912783 agatgaaaaaaccctaatatttttgaattaaaactaacgtaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaaagttaacggaccaaaataaattgaattttaat 39912684  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39912683 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 39912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 21470526 - 21470669
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21470526 agatggagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 21470625  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21470626 aaggga-ccaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaat 21470669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 43183819 - 43183971
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  43183819 aagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 43183918  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  43183919 accaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 43183971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 37412817 - 37412964
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  37412817 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 37412916  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || |||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  37412917 aatgcgatactacttaaatagttaaggggccaaaaatgcaatttagcc 37412964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 16261103 - 16261257
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||| | ||||| ||||    
T  16261103 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccaaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagctaagggacaaaaataaatcaaattttagttaa 16261202  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16261203 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 16261257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20908664 - 20908510
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | || |||| ||||||| ||||| ||||    
T  20908664 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaactaaaataaatcgaattttagttaa 20908565  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20908564 aggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 20908510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16655837 - 16655994
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  16655837 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactagtggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtt 16655936  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16655937 aaaggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 16655994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 16736331 - 16736484
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16736331 atgaagaaaacctaacgtttctgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaa 16736430  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||  | |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16736431 gggactacagcgatacaacctaaacagttaagggaccaaaagtgcaatttagcc 16736484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 34127796 - 34127948
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||    
T  34127796 agatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaa-tgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaactttagtt 34127894  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34127895 aagggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggtccaaaaatacaatttag 34127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 44612716 - 44612871
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44612716 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 44612815  T
Q  103 gggatcaaagcgatactat--ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  44612816 gggaccaaagcgatactatacgtaaatagttaa-ggaccaaacatgcaatttagcct 44612871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 5921618 - 5921774
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| | || |||| ||||||| |||||||||    
T  5921618 gatgaagaaaatccaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaggaacaaaaaaaaatcgaattttaatta 5921717  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5921718 agagaccaaagcgatactatataaatagttaagggatcaaaaacacaatttagccta 5921774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4120918 - 4120764
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  4120918 agatgaagaaa-cctaagatttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatatgtaacggagagaaattaaaggaccaaaataaatcgaattttgatt 4120820  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4120819 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcc 4120764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37412746 - 37412595
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| || ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37412746 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtaacggaaagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37412647  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37412646 gagaccaaagcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 37412595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28631427 - 28631285
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  28631427 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactatcggaaatgaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa 28631328  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28631327 gggaccaaagcgatgctacctaaatagttaagggaccaaaaat 28631285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36211504 - 36211350
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  36211504 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacgaacagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatta 36211405  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| |||| | |||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  36211404 agggaccaaaacaatacaacctaaacagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 36211350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 35408756 - 35408909
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  35408756 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagg 35408855  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     | |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  35408856 aaccaaagcgatactaattaaatagttaatggaccaaaaacataatttagccta 35408909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 39150060 - 39150213
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39150060 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacaggaaggactaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagg 39150159  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     |  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  39150160 tacaaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagccta 39150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10833265 - 10833421
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10833265 agatgaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactaatcgaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaat 10833364  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10833365 tgagggactaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatgcaattcagcc 10833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27476520 - 27476369
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27476520 atgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggataggaccaaaaatgtgtaaaggagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 27476421  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  27476420 agggaacaaagcgatactacctaaatagtctagggaccaaaaatacaattta 27476369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45389284 - 45389129
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  45389284 atgaagaaaacctaatatttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagaaaagttaatggaccaaaataaatcaaattttaattaa 45389185  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  45389184 gggaccaaaacgacactacctaaatagttcagggaccaaaaatgcaatttagccta 45389129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 4120996 - 4121146
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| || |||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4120996 atgaagaaaacctgacgtttttgacttaaaactaacgaaaatgaacaaagtgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 4121095  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4121096 aggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4121146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 15137037 - 15137191
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  15137037 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtgcaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 15137136  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||    
T  15137137 gggaccaaatcggtactacctaaatagttatgtgaccaaaaatgtaatttagcct 15137191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12304016 - 12304160
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  12304016 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 12304115  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12304116 aaaggacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 12304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 39912869 - 39913017
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  39912869 cctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaggtgtaacagagagaaagttaagggaccaaaataaatctaattttaattaagggaccaaa 39912968  T
Q  112 gcgatactatct-aaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39912969 gtgatactacctaaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 39913017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40694350 - 40694194
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| | ||||||| || ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| | ||||||    
T  40694350 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaagtaatggaaatggccaaaatgtgcaactgagagaagttaagggactaaaataaatcgaatgttaatt 40694251  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40694250 aagggactaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcct 40694194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38275627 - 38275480
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  38275627 aagaaaatctaacgtctttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagggaagttaaagaaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 38275528  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | |||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38275527 accaaagcaatactacataaatagttaagggatcaaaaatacaattta 38275480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 17856419 - 17856577
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgt-ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||  || ||||| | ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||    
T  17856419 agatgaagaaaacctaacgtatttttaattaaaactaacggaaataactaaaatgtataacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaat 17856518  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17856519 taagggaccaaaccaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 17856577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 40694408 - 40694538
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40694408 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatctaattttaattaa 40694507  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40694508 aggaccaaagcgatactacctaaataattaa 40694538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44915894 - 44915737
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||    
T  44915894 agatgaagaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaatt 44915796  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44915795 aagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaacctaa 44915737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 27883690 - 27883850
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27883690 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagtcaccaaaataaatcaaattttaattaa 27883789  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaa----atagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27883790 gggaccaaagcgatactacctaaatatatagttaagggatcgaaaatgcaatttagcctaa 27883850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 33819629 - 33819781
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  33819629 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatagccaaaatatgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaa 33819727  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  33819728 aggaccaaagtgatactacctaaacagttatgagac-aaaaatacaatttagcct 33819781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 27246214 - 27246370
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||  ||||||   ||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  27246214 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataaccgaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaat 27246312  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27246313 taagggaccaaagcgatcctaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27246370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34127718 - 34127570
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||  || ||| |||||  ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  34127718 atgaagaaaac-taacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggatagaagttaagcgacaaaaataaattgaattttaattaa 34127620  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34127619 gggaccaaaacgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 34127570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36442287 - 36442130
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||    
T  36442287 atgaagaaaatctaacgtttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaatgaaccaaaataaatcaaatttttatta 36442188  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36442187 atagaccaaaacgatactacctaaatagtgaagggaacaaaaatacaatttagcctaa 36442130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 32503772 - 32503920
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32503772 gaagaaaatctaacgttttcgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaag 32503871  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  32503872 gaccaaatcaatactacctaaatagttaaaggactaagaatgcaattta 32503920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39149999 - 39149867
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  39149999 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttagtt 39149900  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    || |||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  39149899 aaaggactaaagtgatactatttaaatagttaa 39149867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14877620 - 14877481
Alignment:
Q  17 acgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  14877620 acgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaa--gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaatcgat 14877523  T
Q  117 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  14877522 actacctaaatagttttgggaccaaaaatgcaatttagccta 14877481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 18565276 - 18565386
Alignment:
Q  43 aggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18565276 aggaccaaaatatgtaacagggaaaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaagggacccaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaa 18565375  T
Q  143 aatacaattta 153  Q
    ||| |||||||    
T  18565376 aatgcaattta 18565386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 39454673 - 39454822
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  39454673 agatgaagaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacg---------aaaatgtgtaacagagagaaattaagggacaaaaataaatcgaattttaatt 39454763  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  39454764 aaggaatcaaagcgatactacctgaatagtcaagggaccaaaaatgcaatttagtctaa 39454822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27914041 - 27913897
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||  | ||||||| ||||||      
T  27914041 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacataaaagaccaaaatatgtaacggagagaagttaagatagcaaaataaattaaattttaataaagggact 27913942  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  27913941 aaagcgatactaattaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 27913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15829875 - 15829733
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  15829875 agatgaagaaaatttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaagatgtgtaacggatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 15829776  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  15829775 aagggaccaaagtgatactacctaaatagctaagagaccaaaa 15829733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33819551 - 33819394
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  33819551 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatctgtaacgaagaaaagttaagggacc-aaataaatcaaattttaatt 33819453  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||| || |||| || ||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||    
T  33819452 aagagaccaaaacggtactacctaaatagttaatggaccaaaagtgcaatttaacctaa 33819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 44915972 - 44916086
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | ||||||||||    
T  44915972 atgaagaaaacctcacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatgaaattttaattaa 44916071  T
Q  103 gggatcaaagcgata 117  Q
    |||| |||| |||||    
T  44916072 gggaccaaaacgata 44916086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 27914124 - 27914280
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||    |||||| ||||| | ||||||     
T  27914124 agatgaacaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaa-agagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaac 27914222  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27914223 taaggaaccaaaacgatactaattaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagcct 27914280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32503701 - 32503549
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   ||| || |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  32503701 agatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaattaaaggaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagtt 32503602  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| | |||| |||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||||||||    
T  32503601 aaggaagcaaaacgatactacctaaataattaatcgatcaaaaatacaattta 32503549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Original strand, 36211698 - 36211785
Alignment:
Q  69 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36211698 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacgaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttagcc 36211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 36211576 - 36211682
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  36211576 gaagaaaacctaacatttttgaattaaagctaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaagg 36211675  T
Q  105 gatcaaa 111  Q
    || ||||    
T  36211676 gaccaaa 36211682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 41659971 - 41660119
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||    
T  41659971 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaagcagaga-aagttaagataccaaaataaattaaattttaattaag 41660069  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     || ||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  41660070 agaccaaagtgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 41660119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 16350306 - 16350438
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  16350306 gaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacatgaatgactaaaatgtgcaacagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttagttaagg 16350405  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    || |||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  16350406 gaccaaaacaataataattaaatagttaaggga 16350438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 11943723 - 11943855
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  ||    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  11943723 agatgaagaaaatctaacttttatgaattaaaactgacggaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaatt 11943818  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    || | | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11943819 aaagtaccaaagcgatactacctaaatagttcaggga 11943855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 138
Target Start/End: Original strand, 34484303 - 34484414
Alignment:
Q  27 attaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaa 126  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  34484303 attaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagataccaaagcgatactacctaaa 34484402  T
Q  127 tagttaagggac 138  Q
    || |||||||||    
T  34484403 taattaagggac 34484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37744560 - 37744451
Alignment:
Q  45 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37744560 gaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 37744461  T
Q  145 tacaatttag 154  Q
    |  |||||||    
T  37744460 tgtaatttag 37744451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20297497 - 20297410
Alignment:
Q  69 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  20297497 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctgaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 20297410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27246136 - 27246066
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa 73  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  27246136 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaa 27246066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16350232 - 16350080
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||| |||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  16350232 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaacaaatggaaatgaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 16350134  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  16350133 taagggaccaatacgatactaattaaatagtcaagagaccaaaaatgcaattta 16350080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 1580148 - 1580224
Alignment:
Q  77 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  1580148 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggaaccaaaaacataattta 1580224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3603648 - 3603504
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagaga-gacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||   ||||||| | | | | ||||||| |||||| ||||    
T  3603648 cctaacgtttttgaattaaatttaacggaaaggactaaaatatgtaacagagataaacttaaaataccaaaacataacaaattttaatcaagggaccaaa 3603549  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  3603548 gcgatactaaataaatagttaagggacgaaaataacaattaagcc 3603504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5720293 - 5720140
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||     
T  5720293 gaagaagacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgaaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaa 5720195  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | | |||| | ||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  5720194 gaaccaaaacaatattaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 5720140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44610924 - 44610859
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  44610924 ttttaattaaggga-caaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 44610859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34484298 - 34484238
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  34484298 ttttaattaagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaattta 34484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 677915 - 677965
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  677915 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 677965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 23992206 - 23992292
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23992206 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttcagggaccaaaaagacaatttagcc 23992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Original strand, 38073790 - 38073867
Alignment:
Q  79 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  38073790 caaaataaatcgaattttaattaaagaattaaaacgatactatctaaatagttaaatgatcaaaaatataatttagcc 38073867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2822367 - 2822301
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2822367 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaaaacatttaagcctaa 2822301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15136414 - 15136364
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  15136414 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 15136364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 26424819 - 26424869
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  26424819 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 26424869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31557154 - 31557104
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  31557154 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 31557104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 34618517 - 34618567
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34618517 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9174056 - 9173901
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9174056 agatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 9173957  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9173956 agaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 9173901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 33545055 - 33545211
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33545055 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33545154  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  33545155 gggatcaaagtgatactacctaaatagttaatgcaccaaaaatataatttagcctaa 33545211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35132756 - 35132600
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  35132756 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggaccaaaataaatctaattttaatt 35132657  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35132656 atgggaccaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 35132600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33329359 - 33329205
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33329359 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacggggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33329260  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  33329259 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcct 33329205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 6220289 - 6220441
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  6220289 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattga 6220388  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6220389 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggattaaaaatgcaatttagc 6220441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 25551567 - 25551719
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25551567 agatcaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggacctaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 25551666  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25551667 aggggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 25551719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3338630 - 3338475
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3338630 atgaagaaaacgtaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgagcaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 3338531  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3338530 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagccta 3338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24605027 - 24604878
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24605027 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaacgtgtaacagagagaagt-aagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24604929  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24604928 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 24604878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33544977 - 33544825
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33544977 agatgaagaaaacctaacctttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 33544878  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33544877 aagggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33544825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 35119042 - 35119174
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35119042 agatgaagataacctaacgtttttgaattaaaattaacagaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaaattaatggaccaaaataaatcgaattttaatt 35119141  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35119142 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 35119174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 3289141 - 3289296
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  3289141 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaacaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 3289240  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  3289241 aaggcaccaaagcgatattacctaaatagtttagggaccaaaaatgcaatttagcc 3289296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14337057 - 14336902
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14337057 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtataacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 14336958  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  14336957 aaaggaccaaagcgatactagctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcc 14336902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29010107 - 29009956
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  29010107 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaagggaccgaaataattcgaattttaattaa 29010008  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29010007 gggaccaaagcgatactacgtaaatagttaagggaccaaaaattcaatttag 29009956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3289083 - 3288929
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  3289083 atgaaaaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgtaatggagagaagttaggggaccaaaataaatcgaattttagttaa 3288984  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  3288983 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagcct 3288929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12903375 - 12903221
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  12903375 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaatta 12903276  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  12903275 agggaccaaagcgatactatctaaataattaaagaaccaaaaatacaatttagcc 12903221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25551500 - 25551346
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||| | ||| ||||||    
T  25551500 atgaagaaaacataatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaagggactaaaataaatcaaatttcaattaa 25551401  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25551400 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 25551346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31029677 - 31029527
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  31029677 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacgcagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 31029578  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  31029577 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 31029527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7537836 - 7537992
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  7537836 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaaccgagagaagttatgggaccaaaataaatcaaattttaatt 7537935  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac-taaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  7537936 aagggacaaaagcgataccacttaaatagttaagggacaaaaaaatgcaatttagcc 7537992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 24605105 - 24605248
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24605105 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacgaaaatgac-aaaatgtgtaacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaatt 24605203  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24605204 aagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 24605248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33346633 - 33346501
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33346633 agatgaagagaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 33346534  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33346533 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 33346501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 3338710 - 3338862
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3338710 atgaagaaaacctaaccttttcgaattaaaactaacgaaa--gaccaaaatgtgtaacagatagaagttaaagaaccaaaataaatcgaattttaattaa 3338807  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3338808 gggatcaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaataaaatttagcct 3338862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31029755 - 31029910
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  31029755 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgatcaaaatgtgtaacagagaaaagataaaggaccaaaataaatcgaattttagtt 31029854  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31029855 aagggactaaaacaatactatttaaatggttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 31029910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2949446 - 2949293
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||     |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2949446 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactactggaaaggaccaaaatgtgtaacaaag-----ttaatggaccaaaataaatcgaattttaatt 2949352  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  2949351 aagggaccaaagtgatactacttaaatagttaacggacaaaaaatgcaatttagcctaa 2949293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1158743 - 1158599
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacat--aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1158743 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacacggaaaggaccaacatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 1158644  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  1158643 aaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaat 1158599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11524921 - 11524778
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgttttt-gaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  11524921 agatgaagaaaatctaacattttttgaattaaaaccaacagaaaggactaaaatgtgtaacggagagaggttaagggaccaaaataaattgaattttaat 11524822  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11524821 taagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 11524778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 19135682 - 19135836
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||| || |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  19135682 aagaaaaccgaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaacatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagag 19135781  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 160  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19135782 atcaaaacgatactacctaaatacttaatggaccaaaaatgcaatttagcctaac 19135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6220211 - 6220059
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  6220211 agatgaggaaaatttaacgtttttgaatgaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 6220112  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| ||  ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6220111 aagagacgaaagcgatattaattaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 6220059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 14337135 - 14337288
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||| ||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  14337135 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggaaagaatttaagggaccaaaataaatcaaattttaactaa 14337234  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14337235 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 14337288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 1860719 - 1860871
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  1860719 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaagactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaacccaaataaatcgaattttaattaa 1860818  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1860819 gggaccaaagagatac-acctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 1860871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 11524999 - 11525152
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  || | |||||  |||||||| |||| || |||||| |||    
T  11524999 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaggaaa-gttaagagaccaaaataaattgaattttaaataa 11525097  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11525098 gggaccaaaccgatactacctaaattgttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 11525152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13156070 - 13156209
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13156070 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaatt 13156169  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| ||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13156170 aagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaat 13156209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13160926 - 13161065
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13160926 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacgaagaaaaattaagggatcaaaataaatcgaattttaatt 13161025  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| ||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13161026 aagggacca-----atactacctaaatagttaagggacaaaaaat 13161065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 35132834 - 35132977
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||           | ||||||    
T  35132834 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaa-----------taaattaa 35132922  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35132923 gggaccaaagcggtactacctaaatagttaagggaccgaaaatacaatttagcct 35132977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 24548477 - 24548615
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  24548477 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaagg 24548576  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    | ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  24548577 accaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaa 24548615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 29010187 - 29010341
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||  ||  || ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  29010187 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaattaacagaatggaccaaaatgtgtaatggatggaagttaaggggccaaaataaatcgaattttagttaa 29010286  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| || ||||||||||  |||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  29010287 gggaccacagcgatactacataaatagtcaaggaaccaaaaatgcaatttagcct 29010341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 2949524 - 2949632
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  2949524 atgaagaaaacctaacgttgttgaattaaaactaaccataaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaa 2949623  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  2949624 gggaccaaa 2949632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 1158822 - 1158978
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  1158822 agatgaagaaaacgaaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtataacggagataa-ttaagggaccaaaataaatcaaattt-aatt 1158919  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  1158920 aagggaccaaagcgatactacttaaatagttaaggtaccaaaaatgcaagttagcctaa 1158978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2315734 - 2315601
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  2315734 agatgaagaaaaccaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 2315636  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaag 134  Q
    |||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  2315635 taagcgaccaaagcgatactaattaaatagttaag 2315601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13155992 - 13155842
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13155992 atgaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaa 13155893  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13155892 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13155842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13160848 - 13160698
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||| |  |||||| |||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13160848 atgaagaaaacctaacgaatttgaattaaaacaaacggaaatggtcaaaatgtgtaacggaaagaagttaagcgactaaaataaatcgaattttaattaa 13160749  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13160748 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataattta 13160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24548395 - 24548241
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||| |    
T  24548395 gatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaact 24548297  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24548296 aaggctcaaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 24548241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11524792 - 11524706
Alignment:
Q  69 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11524792 gttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagc 11524706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 33972439 - 33972547
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  33972439 atgaagaaaattcaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 33972538  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  33972539 gggaccaaa 33972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 2814560 - 2814698
Alignment:
Q  19 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 118  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||||    
T  2814560 gtttttgaattaaaactaacggaaagaatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagaaaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcgatac 2814659  T
Q  119 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  2814660 taattaaatagttaagagaccaaaaacataatttggcct 2814698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31754357 - 31754207
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||  |||| |||| || ||||||||||    
T  31754357 atgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaatggaaaggtccaaaataagtaacggagagaagttaagagattaaaataaatagaattttaattaa 31754258  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | || |||| |||| |||| |||  |||||||| || ||||||| ||||||    
T  31754257 gagaccaaaacgattctatataatcagttaaggaacaaaaaatataattta 31754207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 33329437 - 33329514
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggac 78  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  33329437 agattaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatgtgcaacagagagaagttaaaggac 33329514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 17544686 - 17544840
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| |  | ||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  17544686 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaggatcaaaatatgtaacgataga-aaatcaagataccaaaataaatcaaattttaatta 17544784  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||| ||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17544785 agggaccaaagtgatattagcaaaatagttacgggac-aaaaatgcaatttaaccta 17544840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32283134 - 32283026
Alignment:
Q  48 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 147  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||     
T  32283134 caaaatgtgtaacggagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatat 32283035  T
Q  148 aatttagcc 156  Q
    |||||||||    
T  32283034 aatttagcc 32283026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 33548180 - 33548244
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33548180 ttttaattaaggggccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaattcaatttagcct 33548244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 29999653 - 29999767
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29999653 tttttgaattaaaagtaacagaaaggactaaaatgtgtaacagatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattacgggactaaagcgatact 29999752  T
Q  120 atctaaatagttaag 134  Q
    |  ||||||||||||    
T  29999753 aattaaatagttaag 29999767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 12903444 - 12903569
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | | || |||||| ||||| | | ||||| || |||| ||||||||||    
T  12903444 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtattacggagagaagttaaggaatcaaaataattcgaattttaattaa 12903543  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaata 128  Q
     ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  12903544 aggaccaaagggatactacctaaata 12903569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 29999568 - 29999510
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  29999568 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatatgtaa 29999510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33972361 - 33972293
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaa--cgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagaga 67  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33972361 agatgaagaagacctaaaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggactaaaatgtgtaacagagaga 33972293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33971991 - 33971931
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33971991 ttttaattaagggataaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 33971931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Original strand, 17245624 - 17245711
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17245624 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 17245711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3618844 - 3618793
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3618844 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 3618793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 6229687 - 6229772
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  6229687 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagtta-gggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcc 6229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 752 - 825
Target Start/End: Original strand, 7779848 - 7779921
Alignment:
Q  752 gatgttggttcaatataaactccatatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagttattatt 825  Q
    |||||||||| ||||  | || |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7779848 gatgttggtttaatacgagctacatatttattttccatagttttaatcaaattgatatcagttaagtcattatt 7779921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17544529 - 17544457
Alignment:
Q  80 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17544529 aaaataaatcaaattttaattaaaggaccaaagcgatattagcaaaatagttaagggac-aaaaatgcaattta 17544457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 4551 - 4707
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  4551 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctgtgacagagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 4650  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4651 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4493 - 4341
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||| ||||| | ||| ||||    
T  4493 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagtgaagttaagagaccaaaataaatcaaatttcaatt 4394  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4393 aaggaaccaaagtgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 4341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 88)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 1826030 - 1826174
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  1826030 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1826129  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1826130 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1826174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 1860475 - 1860619
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  1860475 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 1860574  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1860575 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 1860619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 23244746 - 23244904
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |    
T  23244746 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaact 23244845  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23244846 aagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatctaacctaa 23244904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 24456885 - 24457041
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24456885 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 24456984  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24456985 gggaccaaggcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 24457041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 37393710 - 37393866
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37393710 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 37393809  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37393810 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagtctaa 37393866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3869180 - 3869336
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  3869180 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaaaaaatcgaattttaatt 3869279  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3869280 aagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 3869336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37393630 - 37393475
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  37393630 atgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatgtaattgagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 37393531  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37393530 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttaaccta 37393475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 35223998 - 35224155
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  35223998 agatgaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtt 35224097  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35224098 aagggaccaaaacgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35224155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40040315 - 40040162
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  40040315 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagggccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaacaaaataaatcgaattttaattaa 40040216  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40040215 ggtaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 11198438 - 11198594
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  11198438 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaa 11198537  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11198538 gggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11198594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 119271 - 119119
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  119271 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaatc 119173  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  119172 aagggaccaaagtaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 119119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5416967 - 5416810
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||    
T  5416967 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaagaccaaaatcaatcgaattttaatt 5416868  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5416867 agaggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 5416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18017940 - 18017787
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  18017940 aagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaattaagtg 18017841  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18017840 accaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaatatgcaatttagcctaa 18017787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 31230846 - 31230999
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  31230846 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaattaa 31230945  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31230946 gggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31230999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 14920644 - 14920792
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14920644 atgaagaaaacctaacgttttcgaattaaaagtaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 14920743  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14920744 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 14920792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 18018017 - 18018169
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  18018017 agatgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 18018116  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18018117 aagggagcaaagcaatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 18018169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 18621978 - 18622133
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  18621978 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaagagcaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 18622077  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  18622078 aagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagagaccaaaagtgcaatttagcc 18622133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6843650 - 6843493
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt--taatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  6843650 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttataagggaccaaaataaatcaaattttaatt 6843551  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  6843550 aagggatcatagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 6843493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30650343 - 30650187
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  30650343 atgaagaaaacctaaggttttttaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 30650244  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30650243 gggaccaaagtgatactacctaaatagttagaggactaaaaatgcaatttagcctaa 30650187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31230768 - 31230624
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31230768 agatgaagaaaatataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 31230669  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31230668 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 31230624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21515431 - 21515586
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21515431 agatgaagacaacgtaacgtttttgaattaaagctaacggaaatgaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 21515530  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21515531 aagggaccaaagcgatactacgtaaatagttaaaagactaaaaatgtaatttagcc 21515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35223927 - 35223772
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||    
T  35223927 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtcaa 35223828  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35223827 gggaccaaagcgatactacctaaatagtaaagggaccaaaaatgcaatttagccta 35223772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39912072 - 39911917
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  39912072 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatatataacggagagaagttaaaggaccaaaataaaccgaattttaatt 39911973  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  39911972 aagcgaccaaagagataatatctaaataattaagggacaaaaaatgcaaattagcc 39911917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8654089 - 8653935
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  8654089 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacaaatgaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 8653990  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8653989 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaatttagcct 8653935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30872940 - 30872781
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttg----aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  30872940 atgaagaaaacctaacgttttttttttaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgttacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaa 30872841  T
Q  99 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30872840 ttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 30872781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 7041860 - 7042012
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |     | ||    
T  7041860 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaa-----attt 7041954  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7041955 aagggaccaaagcgatactatataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7042012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40032578 - 40032426
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaag 103  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  40032578 gaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagacagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatttaag 40032479  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40032478 agaccaaagcgatactacctaaataattaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 40032426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 18914486 - 18914637
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  18914486 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 18914585  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||  | |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18914586 gacaagagcgatgctacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcc 18914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26736278 - 26736128
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||  | ||||||  ||    
T  26736278 atgaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaggtaagggaccaaaataaattaaattttaaaaaa 26736179  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26736178 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 26736128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 29027203 - 29027358
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29027203 agatgacgaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaa----ccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 29027298  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 160  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29027299 aagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatataatttagcctaac 29027358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39240185 - 39240031
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||    
T  39240185 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaatt 39240086  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39240085 aagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 39240031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40094628 - 40094487
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||||    
T  40094628 atgaagaaaatctaacgttcttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttaattaa 40094529  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40094528 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaa 40094487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 9495254 - 9495406
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  |||||||    
T  9495254 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgagtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaactttaatt 9495353  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9495354 aacggaccaaagcaatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 9495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11639204 - 11639050
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  11639204 atgaacaaaacctaacgtttt-gaattaaaacttacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaa 11639106  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11639105 gggaccaaagcgacgctacctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttagccta 11639050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14920565 - 14920410
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14920565 gatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 14920466  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |  || |||| | |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  14920465 aatgaccaaaacaatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaattaagcct 14920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 12873279 - 12873435
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||  |||||| |||||   ||||||| |||||   ||||||||    
T  12873279 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaaaaaatgaccaaaatgtgtaag-gagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaatt 12873376  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12873377 aagggaccaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 12873435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23244668 - 23244518
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23244668 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaacgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 23244569  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     | | |||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||| |||||||    
T  23244568 agaaccaaagcgatactacataaatggttagtggaccaaaaatgcaattta 23244518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Original strand, 30568510 - 30568660
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||    
T  30568510 tgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagaaaaattaagggaccaaaataaatcaaattttaaataag 30568609  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30568610 ggaccaaatcgatactaactaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 30568660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7041782 - 7041653
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7041782 atgaagaaaacctaatgtttttcaattaaaactttcgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7041683  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagtta 132  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7041682 gggaccaaagcgatactacctaaatagtta 7041653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 8654167 - 8654319
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  8654167 agatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaagtaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggagcaaaataaatcaaattttaatt 8654266  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || ||| |||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8654267 aaaggaccaaaacaatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 8654319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33542537 - 33542383
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||||    
T  33542537 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaaggagagaga-gttaaaataccaaaataaatcagattttaatta 33542439  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33542438 agggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttagcct 33542383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 758575 - 758733
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  758575 agatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgactaaaatgtgtagcagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 758674  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     | ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  758675 taaggaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcctaa 758733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 39240252 - 39240402
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||||||    
T  39240252 atgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaattaa 39240351  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  39240352 gagaccaaaacgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaattta 39240402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 16645776 - 16645931
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacaga---gagacgttaatggaccaaaagaaatcgagtttta 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||| ||   |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16645776 agatgaagaaaacctaatctttttgaattaaaactaatggaaaggaacaaaatgtgtaactgatgagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaatttta 16645875  T
Q  98 attaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16645876 attaagggaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 16645931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36344116 - 36343960
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  36344116 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatgtgtaacatagaaaagttaaaggaccaaaattaatcgaattttaatt 36344017  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||   |||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  36344016 aagggaccaaaataatactacctaaataattaa-gaaccaaaaatacaatttagccta 36343960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44255015 - 44254862
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  44255015 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaaacactaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaggg 44254916  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||    
T  44254915 accaaagcgatactacttaaatagttaaggatccaaaaatgcaatttagtctaa 44254862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 758497 - 758347
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  758497 atgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaatttaattttaattaa 758398  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  758397 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggggccaaaaatgcaattta 758347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29027125 - 29026971
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |  ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29027125 atgaagaaaacctaacgttttagaattaaaactaacagaaatgaccaaattgtgtaacgggtagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 29027026  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaa----tagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  29027025 gggaccaaaatgatactacctaaatagctagttaagggaccaaaaatgcaattta 29026971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1825964 - 1825809
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||| | ||||||||    
T  1825964 agatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaa-taatcaaattttaatt 1825866  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| ||||||| |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1825865 aagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1860409 - 1860254
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||| | ||||||||    
T  1860409 agatgaaggaaatctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaa-taatcaaattttaatt 1860311  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| ||||||| |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860310 aagagatcaaaacgatgctccttaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 1860254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 5417046 - 5417197
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagaga-gacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| || ||| |||| || ||||| | ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  5417046 atgaagaaaacctaacgtttttgaaataaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaac-gagaagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttagtta 5417144  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5417145 agggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcagtttag 5417197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Original strand, 39912158 - 39912294
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |    
T  39912158 aaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagggacc 39912257  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39912258 aaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 39912294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44255093 - 44255249
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| || ||||||||    
T  44255093 agatgaagaaaatgtaacatttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagagaccaaaataaattgaattttaatt 44255192  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| |||| | || | | |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  44255193 aagggaccaaaacaatcccacctaaatagttaaaggatcaaaaatacattttagcct 44255249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 119347 - 119502
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| | | |||| ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||    
T  119347 agatgaagaaaacctattatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccggtgagaagttaagggaccaaaataaagcaaattttaatt 119446  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  119447 aagggactaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaacaatgcaatttagcc 119502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28206916 - 28206766
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac-agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |  ||||   ||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  28206916 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggatcaaaatgtgtaacgataga-aaattaagataccaaaatacatcaaattttaattaagg 28206818  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  28206817 gaccaaagcgatactagcaaaatagttatgggaccaaaaattcaatttagcc 28206766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18914415 - 18914262
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcg-agttttaat 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  18914415 agatgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttttaat 18914316  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||| | | |||||||||||| |     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18914315 taaagaaccaaagcgatacttt-----tagttaggggaccaaaaatacaatttagccta 18914262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 33542617 - 33542731
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  33542617 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagaaatcaaaataaatcaaattttaattaa 33542716  T
Q  103 gggatcaaagcgata 117  Q
      || ||||||||||    
T  33542717 atgaccaaagcgata 33542731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 30873013 - 30873166
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  30873013 gaagaaaacctaacgtttttgaactaaaactaacgaaaatgactaaaatgtgtaacggatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagg 30873112  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     ||||||   |||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30873113 aatcaaactaatactaccaaaataattaagggacaaaaaatgcaatttagccta 30873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 26736356 - 26736492
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  26736356 agatgaagaaactcaaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtatcgaagagaagttaaaggaccacaataaatcgaattttaatt 26736455  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26736456 aaaggaccaaatcaatactatctaaatagttaaggga 26736492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 28206996 - 28207142
Alignment:
Q  13 cctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  28206996 cctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatttgtaac-gatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaaggggtcaaa 28207094  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28207095 gcgatactagcaaaataattaagggatcaaaaatgcaatttagcctaa 28207142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 410595 - 410729
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  410595 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacaaacgaaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaaggtaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 410694  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    || | |||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  410695 ggaaccaaaacgatactaataaaatagttaaggga 410729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3869094 - 3868946
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatat---gtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3869094 aaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtactgtaacggagagaagttaagagactaaaataaatcgaattttaattaaggg 3868995  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    | ||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  3868994 accaaagtgatactacataaatagttaagggatcaaaagtgcaatttag 3868946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24456815 - 24456733
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24456815 ggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 24456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 40094706 - 40094864
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  40094706 agatgaggaaaatttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaaagtgtaacggagagaagttaagggacaaaaataaatcgaattttaatt 40094805  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    || ||| |||| |  |||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  40094806 aaaggaccaaaacagtactaattaaatagttaagggaccaaaaatgtaattttgcctaa 40094864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12873208 - 12873055
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||  | |||||||||| |    
T  12873208 gaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagaaaccaaaataaattaaattttaattaaag 12873109  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  12873108 gaccaaagtgatactaattaaatagttaagggattaaaatcataatttagccta 12873055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21512531 - 21512411
Alignment:
Q  37 acataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggg 136  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  21512531 acataaaggaccaaaatgtgtagcggagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaattaatggactaaagcgatact-cctaaatagttaaggg 21512433  T
Q  137 actaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21512432 acgaaaaatacaatttagccta 21512411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 101
Target Start/End: Original strand, 44678426 - 44678515
Alignment:
Q  12 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44678426 acctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaacgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatta 44678515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5526022 - 5525882
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||| | |||  |||| | || || |||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5526022 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaatggccaaaatgtataa--gagataagtaaagggactaaaataaatcaaattttaattaa 5525925  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
     ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5525924 aggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggactaaaaat 5525882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35486023 - 35485868
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | | ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| | | |||||||||||    
T  35486023 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtttgacaaagagaagttaatataccaaaataaaacaaattttaattaag 35485924  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||  ||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  35485923 ggactaaagcgatattaattgaatagttaagggatcaaaaacataatttagcctaa 35485868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 40032706 - 40032815
Alignment:
Q  48 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac-taaaaata 146  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||  |||||||    
T  40032706 caaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagggatcaaaatgatactacataaatagctaagggacaaaaaaata 40032805  T
Q  147 caatttagcc 156  Q
    ||||||||||    
T  40032806 caatttagcc 40032815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Original strand, 6844715 - 6844823
Alignment:
Q  45 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  6844715 gaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaagataaatcgatttttaattaagagatcaaagcgatgctacctaaatagttaagagaccaaaaa 6844814  T
Q  145 tacaattta 153  Q
    | |||||||    
T  6844815 tgcaattta 6844823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44678396 - 44678316
Alignment:
Q  77 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44678396 accaaaataaatcgaattttagttaagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 44678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 410524 - 410405
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  410524 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 410426  T
Q  100 taagggatcaaagcgatacta 120  Q
    |||| || ||| |||||||||    
T  410425 taagagaccaacgcgatacta 410405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 11639281 - 11639353
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa 73  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11639281 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaa 11639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 40040395 - 40040475
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 83  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40040395 atgaagaacacctaacatttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaa 40040475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26217222 - 26217072
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  26217222 atgaagaaaatccaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaa-tgtgtaacaaagaggagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaa 26217124  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
     ||  ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26217123 agggccaaaatgatactacttaaatagttaagggaccaaaaaaataatttag 26217072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 154
Target Start/End: Original strand, 44678518 - 44678596
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44678518 ggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggaac-aaaaatacaatttag 44678596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30568429 - 30568331
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30568429 atgaagaaaatatgacgtttttgaattaaaacaaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 30568331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9495183 - 9495106
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  9495183 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttataagagagagaagttaagagaccaaa 9495106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19302340 - 19302273
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac 68  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  19302340 agatgaagaaacccaaacgtttttgaattaaaactaacgcaaaagaccacaatgtgtaacagagagac 19302273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 32733864 - 32733765
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32733864 atgaagaaaacataacatttttgaattaaaattaacggaaaggagcaaaatgtgtaacgtatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 32733765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 26217300 - 26217402
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||| | ||||||||    
T  26217300 agatgaagaaaaccgaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgacgaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggtacaaaataaatcaaattttaatt 26217399  T
Q  101 aag 103  Q
    |||    
T  26217400 aag 26217402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 35486102 - 35486243
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||  ||||||  |||||   || |||| ||||  | ||||||||||||||     
T  35486102 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggagcacaaggtgtaag-gagagaaagttaagatactaaaataaattaaattttaattaagggac 35486200  T
Q  108 caaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 150  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  35486201 caaagcgatactaattaaatagttaggggaccaaaaatgcaat 35486243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 16645698 - 16645663
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16645698 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 16645663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 11639378 - 11639422
Alignment:
Q  113 cgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11639378 cgatactacctaaatagttaagggacgaaaaatgcaatttagcct 11639422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Original strand, 7117111 - 7117162
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  7117111 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 7117162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43633186 - 43633135
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  43633186 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaa 43633135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 36344194 - 36344344
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||   ||  ||||||||| ||| || || | | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  36344194 atgaagaaaatttaatgtttttgaatcaaaattaaaggaattgaccaaaatgtgtgacggaaataagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaa 36344293  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
      || |||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  36344294 aagaccaaagcaatactacctaaatagttaaaggataaaaaatgcaattta 36344344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 126)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44069354 - 44069510
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44069354 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatagaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 44069453  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44069454 agaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 44069510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 4846829 - 4846984
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4846829 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatggccaaaatgtgtaacagagagaagttatgagaccaaaataaatcgaattttaattaa 4846928  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4846929 gggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 4846984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34521421 - 34521264
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34521421 agatgaaaaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 34521322  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34521321 aagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34521264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54107822 - 54107669
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54107822 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 54107723  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  54107722 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 54107669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10756871 - 10756720
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  10756871 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagcaacaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 10756772  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10756771 gggaccaaagcgatactacctaaatagctaagggaccaaaaatacaatttag 10756720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15862406 - 15862564
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||     
T  15862406 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaata 15862505  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15862506 aagggacaaaagagatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgcaatttagcctaa 15862564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26332472 - 26332318
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  26332472 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaaatttaattaa 26332373  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  26332372 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagcct 26332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34630135 - 34629985
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34630135 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaa 34630036  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34630035 gggaccaaaacgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatataattta 34629985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7950428 - 7950274
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7950428 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagaaaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7950329  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | || |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7950328 gagaccaaaacaatactacataaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcct 7950274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 43899305 - 43899463
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43899305 agatgaagaaaacctaacgttgtttaattaaaactaacggtaaggaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 43899404  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  43899405 aggggaccaaagcgatattacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 43899463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54081436 - 54081287
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  54081436 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacagaaaagaccaaaatatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa 54081337  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54081336 -ggaccaaagcgatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 54081287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45171223 - 45171066
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45171223 agatgaagaaaacataacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacttagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 45171124  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45171123 aaggggccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccagaaatacaatttagccta 45171066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 28688221 - 28688377
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  28688221 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaacgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 28688320  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  28688321 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgtaatttagcct 28688377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 45171300 - 45171452
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  || |||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45171300 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggaaagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 45171399  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45171400 tggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagc 45171452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 7742996 - 7743139
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||   |||||||| ||||| | ||||||||    
T  7742996 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttatgagaccaaaataaatcaaattttaatt 7743095  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7743096 aagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 7743139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31514018 - 31513863
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31514018 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaactggaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaatt 31513919  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31513918 aaagaatcaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcc 31513863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 41208649 - 41208788
Alignment:
Q  19 gtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 118  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  41208649 gtttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagatgttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 41208748  T
Q  119 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41208749 tacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 41208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 54081516 - 54081671
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa-tatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  54081516 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacgaaaatgaccaaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaatta 54081615  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54081616 agggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 54081671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40410865 - 40410715
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40410865 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 40410766  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40410765 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 40410715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41997972 - 41997818
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  41997972 atgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaattaaattttaattaa 41997873  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41997872 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 41997818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45871850 - 45871696
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45871850 atgaagaaaacctaacgatttttaattaaaactaacggaaatgacccaaatgtataacagagagaatttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 45871751  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45871750 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 45871696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 54108353 - 54108507
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54108353 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 54108452  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54108453 gggaccaaagcgatactagctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 54108507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12123245 - 12123088
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  12123245 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaatt 12123146  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12123145 aagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 12123088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21169818 - 21169669
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  21169818 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaag 21169719  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21169718 ggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 21169669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 35753662 - 35753819
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  35753662 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatatgtgatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaatttaaatt 35753761  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||    
T  35753762 aatggaccaaagcgatactacctaaatagttaaggtaccaaaaatgtaatttaaccta 35753819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 26332549 - 26332712
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaat-----ggaccaaaagaaatcgagttt 95  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||| |||    
T  26332549 agatgatgaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagttaagggaccaaaataaatcgaattt 26332648  T
Q  96 taattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  26332649 taattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcctaac 26332712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41208554 - 41208398
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  41208554 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaatctaacggaaatgaccaaaatgtgcaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 41208455  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41208454 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 41208398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7937794 - 7937949
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  7937794 agatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataattcgaattttaatt 7937893  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  7937894 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgaaatttagcc 7937949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 12123312 - 12123467
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12123312 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 12123411  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  12123412 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttaaccta 12123467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 31514096 - 31514250
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | |||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  31514096 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaagctaacggaaag-accaaactgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 31514194  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31514195 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagccta 31514250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 53841257 - 53841407
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53841257 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 53841356  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    | | || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53841357 acgagaccaaagcaatactagctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 53841407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15862335 - 15862182
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15862335 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 15862236  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||    
T  15862235 aggaccaaagcgatactacctaaataattaagggacctaaaatggaatttagcc 15862182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44069276 - 44069123
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  44069276 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttagttaa 44069177  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44069176 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 44069123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 50819450 - 50819603
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50819450 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50819549  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50819550 gggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50819603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 50856414 - 50856261
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50856414 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggacgaaaatgtgtaacacatagaagtaaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50856315  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  50856314 gggaccaaagcgatactaccttaacagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 50856261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14353279 - 14353430
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  14353279 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacggagagaagttaaaggaccaagataaatcgaattttattt 14353377  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353378 aagggaccaatgcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 14353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19124344 - 19124188
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||  || ||||| | ||||| ||||||||    
T  19124344 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagatcaaaatagatcgaattttaatt 19124245  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | |||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19124244 aggggaccaaagcaatattacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19124188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 34521492 - 34521640
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| || |||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34521492 gaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgtgtaacggaaagaaattaagagaccaaaataaatcgaattttaattaagg 34521591  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34521592 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 34521640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8846231 - 8846076
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||    
T  8846231 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaattaatcgaattttagtt 8846132  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846131 aagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40926163 - 40926009
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  40926163 tgaagaaaacctaacgtttttcaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggatcaaaataaatcaaattttaattaag 40926064  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  40926063 agatcaaagcgatactacataaatagttaaaagaccaaaaatgcaatttaaccta 40926009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 8846309 - 8846462
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||| || ||||| ||||    
T  8846309 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaaaagaccaaaataaatggaattttagttaa 8846408  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8846409 gtgaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 8846462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 152
Target Start/End: Original strand, 7274877 - 7275024
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7274877 tgaagaaaacacaacgtttttgaattaaaactaaaagaaatgaccaaaatgtgtaaca-agagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaag 7274975  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  7274976 ggaccaaagtgatactacctaaatagttaacggaccaaaaatgcaattt 7275024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 40639350 - 40639506
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||| | ||||||||||    
T  40639350 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttaagataccaatataaatcaaattttaattaa 40639449  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  40639450 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggaccaaaaacataatttagcctaa 40639506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 50819373 - 50819217
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50819373 atgaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50819274  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50819273 gcgacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50819217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 50856491 - 50856647
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50856491 atgaagaaaacttaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 50856590  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  50856591 gcgacgaaagcgatgctacgtaaatagttaagggaccaaaaatgcaattaagcctaa 50856647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17273930 - 17273788
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17273930 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgtaatgaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 17273831  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    || |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  17273830 ggaatcaaaacgatacggcctaaatagttaagggaccaaaaat 17273788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 28691345 - 28691502
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | ||||||||    
T  28691345 agatgaagaaaacttaacatttt-gaattaaaactaacagaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaatgatcaaaataaatcaaattttaatt 28691443  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28691444 tagggacaaaagcgatactacctaaataattaagggacaaaaaatacaatttaacctaa 28691502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47891666 - 47891513
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  47891666 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaatagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 47891567  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| | | |||||||||    
T  47891566 gggaccaaagcgatactaattaaattgttaagggaccaaatacataatttagcc 47891513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40969410 - 40969255
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  40969410 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaatgaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 40969312  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40969311 taagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 40969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 52606279 - 52606128
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  52606279 gaagaaaacctaacgttttttatttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 52606180  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  52606179 gaccaaaacgatactacataaatagttaagggac-caaaatgcaatttagcct 52606128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 5348801 - 5348955
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||     
T  5348801 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacacacggaaaggaccaaaatatgtaacggagaaaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattac 5348900  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5348901 gggaccaaagcgatactaattaaatagttaaaggacaaaaaacataatttagcct 5348955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17102537 - 17102383
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17102537 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgcccaaaatatgtaacagggagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 17102438  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||  ||| | ||| || ||||||| |||||  || |||||| |||||||||||    
T  17102437 gggaagaaaacaatattacctaaataattaagaaaccaaaaatgcaatttagcct 17102383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28691267 - 28691113
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  28691267 atgaaaaaaatctaacgtttttaaattaaaattaacataaaggatcaaaatgtgtaatgcagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 28691168  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28691167 gggaacaaagcaataccacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 28691113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37133430 - 37133280
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  37133430 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacttacgaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 37133331  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  37133330 gggaccaaagcgatactaattaaatagctaagggaccaaaaacataattta 37133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27940425 - 27940272
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27940425 atgaagaaaacctaatgtttttgaattgaacctaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtttagggaccaaaataaatcaaatttaaattaa 27940326  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  27940325 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgaaatttagcc 27940272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22355077 - 22354946
Alignment:
Q  21 ttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatacta 120  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | | |||| ||||||||    
T  22355077 ttttgaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgtaacacagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaaacgatacta 22354978  T
Q  121 tctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354977 cctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 22354946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Original strand, 40926252 - 40926394
Alignment:
Q  11 aacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaa 110  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||    
T  40926252 aacctaacgtttttcaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagtgaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaatggaccaa 40926350  T
Q  111 agcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40926351 agtgatactacctaaatagttaggggactaaaaatgcaatttag 40926394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Original strand, 19124407 - 19124556
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| | || ||  |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19124407 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacagagaaaagtcaagagaccaaaataaatcaaattttaattaagg 19124506  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  19124507 gaccaaaacgatactacctaaatagttaa-ggaccaaaaatataatttagc 19124556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28688143 - 28688017
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  28688143 atgaagaatacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaccggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 28688044  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatag 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28688043 gggatcaaagtgatactacctaaatag 28688017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 52268337 - 52268490
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||| |||| || ||||||||||    
T  52268337 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaaag-accaaaataaattgaattttaattaa 52268435  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  52268436 aggaccaaaacgatactaactaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttagcct 52268490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2829563 - 2829410
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaa-tggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    ||||||| ||||| | | |||||    
T  2829563 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactagcagaaaagaccaaaatgtttaacagagagaagttaagaaaaccaaaataaatcaaatgttaat 2829464  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2829463 taagagaccaaaacaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 2829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 17102610 - 17102735
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17102610 atgaaaaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatctataagagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttatttaa 17102709  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaata 128  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17102710 tggaccaaagcgatactacctaaata 17102735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 29248542 - 29248691
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||     
T  29248542 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaattgaccaaattgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaatagatcaaattttaattaaa 29248641  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  29248642 ggactaaagtaatactatctaaatagttaagggagcataaatacaattta 29248691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Original strand, 52609639 - 52609748
Alignment:
Q  47 ccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaata 146  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  52609639 ccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatagtacctaaatagttaagggaccaaaaatg 52609738  T
Q  147 caatttagcc 156  Q
     |||||||||    
T  52609739 gaatttagcc 52609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43899226 - 43899111
Alignment:
Q  41 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggacta 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||| |||| |    
T  43899226 aaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatgttacctaaatagttaaaggacca 43899127  T
Q  141 aaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43899126 aaaatgcaatttagcc 43899111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 46766863 - 46767002
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatac 118  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||   || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  46766863 ttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaagttaagatacaaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatac 46766962  T
Q  119 tatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46766963 tagcaaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagccta 46767002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5348734 - 5348577
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  5348734 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 5348636  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5348635 tgagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggactaaaaatgcaatttaaccta 5348577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27254137 - 27254007
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  | |||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27254137 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaataatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaaataaatcaaattttaattaa 27254038  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27254037 gggaccaaagcgatactgcctaaatagttaa 27254007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Original strand, 35580210 - 35580332
Alignment:
Q  31 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagt 130  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35580210 aaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaatcgatactacctaaatagt 35580309  T
Q  131 taagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  35580310 taagggaccaaaaatgcaattta 35580332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 2078703 - 2078855
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  2078703 agatgaagaaaatttaacgtgtttgaattaaaactaacagaaaagactaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 2078801  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2078802 taagggaccaaagcgatattaattaaatagttaagggactaaaaatacaattta 2078855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 10756938 - 10757091
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaac-ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||| |||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || |||||||    
T  10756938 agatgaagaaaaatctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagatcaaaatgtgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaat 10757037  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10757038 taagggaccaaaacgatactgcctaaatagttaaaggacaaaaaatacaattta 10757091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 53678586 - 53678445
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   || |||| ||||| | ||||||||||    
T  53678586 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagatactaaaataaatcaaattttaattaa 53678487  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  53678486 aggaccaaagcgatactatttaaataattaagggaccaaaaa 53678445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 17274007 - 17274159
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||   ||||  ||||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  17274007 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaaataacggaatgaaccaaaatgtgtaacgatgagaaattaagagaccaaaataattcgaattttaatt 17274106  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||  || ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17274107 aaaagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaattta 17274159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 40969487 - 40969642
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  40969487 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaaggaccaaaatgtgtaagaagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 40969585  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  40969586 agagactaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 40969642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 45871920 - 45872064
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  45871920 agatgaaggaaatccaacgctttttaattaaaactaacggaaaggacccaaatgtataacggagagaatttaaggaaccaaaataaatcgaattttaatt 45872019  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45872020 aagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 45872064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54247417 - 54247271
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||     
T  54247417 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaca---------aaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatc 54247327  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54247326 aatggaccaaagcgatactatttaaatagttaaggga-taaaaatgcaatttagcct 54247271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 2829641 - 2829795
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  2829641 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatatgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 2829740  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
      || |||| | ||| ||  ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  2829741 aagaccaaatcaataatacataaatagttaa-ggatcaaaaatgcaatttagccta 2829795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9028344 - 9028189
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||| |||  ||  |||||  || ||||| ||||| | |||||| | |    
T  9028344 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaataccaaaatgtgtagcaggaaggagttaagagaacaaaataaatcaaattttaactta 9028245  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9028244 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagccta 9028189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 9028422 - 9028577
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  9028422 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaaaactaaaatgtataacgaagagaagttaaaggaccaaaataaattgaattttaatt 9028521  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||| |||| | |||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  9028522 aaaggaccaaaacaatactagcttaatagttaatgaaccaaaaatgcaatttagcc 9028577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29248472 - 29248320
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||  | ||||||||    
T  29248472 agatgaagaaaa--taacgtttttgaattaaaactaatgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaaccaaaataaattaaattttaatt 29248375  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||||  ||| |||||| | ||||||||||||   ||||||||| || ||||||    
T  29248374 aagggactaaaacgataccacctaaatagttaaataactaaaaatgcactttagc 29248320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 53841180 - 53841065
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  53841180 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaggatcaaaatgtgcaacagagataagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaa 53841081  T
Q  103 gggatcaaagcgatac 118  Q
    | || |||||||||||    
T  53841080 gcgaccaaagcgatac 53841065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14353192 - 14353042
Alignment:
Q  10 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | ||||||| ||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||    
T  14353192 aaacctaacatttttgaattaaaactgacggaaatggccaaaatgtgtcacagaggaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaagggacca 14353093  T
Q  110 aagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaac 160  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  14353092 aagcgatactacctaaataattaagggatcaaaaatgcaatttaacctaac 14353042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 22444417 - 22444527
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22444417 agatgaagaaaatctaatgttttcgaattaaaactaaacaaaaggaccaaaatatgtaacagagagaagttaaggaaccgaaataaatcgaattttaatt 22444516  T
Q  101 aagggatcaaa 111  Q
    |||||| ||||    
T  22444517 aagggaccaaa 22444527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 51170631 - 51170765
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 119  Q
    ||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  51170631 ttttttaattaaaactaattgaaaagactaaaatgtgtaacatagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaatgatcaaaacgatact 51170730  T
Q  120 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  51170731 acctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 51170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 33773023 - 33773175
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||   ||||   ||||||| ||||| | ||||||| |    
T  33773023 atgaagaaactctaacgtttttaaattaaaaccaacggaaacgaccaaaatatggaacagagagaaaattaagataccaaaataaatcaaattttaatca 33773122  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33773123 agggatcaaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacacaatttag 33773175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 53678664 - 53678818
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  53678664 agatgaagaaaacctaacgtttttgaactaaaaccaacggaaagaaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 53678762  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  53678763 taagggaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga-taaaaacgcaatttagcc 53678818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 38911494 - 38911607
Alignment:
Q  46 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| |||| |||| ||||||    
T  38911494 accaaaatgtgtaacagagaaaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaaacaatattacctaaataattaaaggacaaaaaat 38911593  T
Q  146 acaatttagcctaa 159  Q
    ||||||||||||||    
T  38911594 acaatttagcctaa 38911607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40639272 - 40639120
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  40639272 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatttgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 40639174  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40639173 taagggaccaaaacgatactaattaaatagttaaagaactaaaaatgcaattta 40639120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46766776 - 46766619
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || || | |||||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  46766776 atgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggatagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 46766677  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| |||| ||||| || | ||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||    
T  46766676 agggaccaaaacgatattagcaaaatagtaaaaggaccaaaaatgcaatttaacctaa 46766619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 49222180 - 49222040
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  49222180 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaact---------gaccaaaatgtgtaacagagagaagttgaagaaccgaaataaatcgaattttaattaa 49222090  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
      || | |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49222089 aagaccgaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattt 49222040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 35753584 - 35753477
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35753584 atgaagaaaac-taacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtcacgtagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 35753486  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  35753485 gggaccaaa 35753477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 41998054 - 41998203
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaagga-----ccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||| |||||  |||||| ||||  ||| ||||          |||||||    
T  41998054 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgtaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaggggatcaaa----------ttttaat 41998143  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41998144 taagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 41998203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 47891744 - 47891902
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||    |||||| ||||  | |||||||    
T  47891744 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaggagaga-aagttaagatgccaaaataaattaaattttaat 47891842  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||||    
T  47891843 taagggaccaaagcaatactaattaaatagttaaaggaacaaaaatggaatttaacctaa 47891902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 52606349 - 52606404
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52606349 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatg 52606404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7742927 - 7742781
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| || |||||||||| | |||  || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  7742927 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaaagaccaaaatgtgcaacagagagaagataagagaacaaaataaatcaaattttaattaag 7742828  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 150  Q
      | ||||   ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7742827 taaccaaaataatgttacctaaatagttaagggactaaaaatgcaat 7742781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 588384 - 588537
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  588384 tgaagaaaccctaacattttttaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaacaaatcaaattttaattaa 588483  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || | | |||||||| ||  ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||    
T  588484 ggaaccgaagcgatattaattaaatagttaagatatcaaaaatgcaatttagcc 588537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 51883985 - 51883859
Alignment:
Q  30 aaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaata 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||   ||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  51883985 aaaactaacataaaagaccaaaatgtgtaaga-agagaaagttaagataccaaaataaattaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaata 51883887  T
Q  129 gttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51883886 gttaagggattaaaaatgcaatttagcc 51883859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35753489 - 35753408
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35753489 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagaaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatt 35753408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 51885597 - 51885753
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||  ||||| | | |||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  51885597 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactgacggaaagggtcaaaatatgtaagaagaga-aagctaagataccaaaataaatcaaattttaatta 51885695  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  51885696 aaggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttaacctaa 51885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7274795 - 7274652
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||   ||| || |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||          |||||||||||    
T  7274795 tgaagaaaatctaatgtttttgaattaaagctaatggaaatgaacaaaatctgtaacggagagaagttaagggatcaaa----------ttttaattaag 7274706  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7274705 agaccaaagcgatactacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 7274652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 49222262 - 49222389
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| | ||| | ||| ||||| ||| | ||| |  ||||| |||||    
T  49222262 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatgaaaatgaccaaaatatgtgacatatagaaggtaagggacc-aaatagatc-aaatttaactaagg 49222359  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaag 134  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49222360 gaccaaaacgatactatctaaatagttaag 49222389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 53310001 - 53310106
Alignment:
Q  49 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaataca 148  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||    
T  53310001 aaaatgtgtaatggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagagaccaaagtgatactacctaaataattaggagactaaaaatgca 53310100  T
Q  149 atttag 154  Q
    ||||||    
T  53310101 atttag 53310106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7937713 - 7937645
Alignment:
Q  86 aatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  7937713 aatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagcaaccaaaaatgcaatttag 7937645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2078636 - 2078483
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||  ||||| | |||||   | ||||| ||||| | ||||| |||    
T  2078636 atgaagaaaacctaacgtttttgaatcaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaagaagaga-aagttaagatatcaaaataaatcaaattttattta 2078538  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaa--atagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||||| || ||||||||||  |||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  2078537 agggaccagagcgatactaattaaatatagttaagggattaaaaacataatttag 2078483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 13866964 - 13867050
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13866964 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 13867050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 20963547 - 20963677
Alignment:
Q  29 taaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||    
T  20963547 taaaactaacggaaaggactaaaagaagtaacagagagaaacttaaaggaccaaaataaatcaaattttagttagaggatcaaaccgatactaattaaat 20963646  T
Q  128 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  20963647 agttaagggaccaaaaaggcaattaagccta 20963677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 37133463 - 37133604
Alignment:
Q  18 cgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgat 116  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||   ||||||| |||||   |||||| ||||||| |||| | ||    
T  37133463 cgtttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatgtgtaaggagataga-gttaagataccaaaataaatcatattttaagtaagggaccaaaacaat 37133561  T
Q  117 actatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  37133562 actaattaaataattaaaggaccaaaaatataatttagcctaa 37133604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Original strand, 51311825 - 51311907
Alignment:
Q  77 accaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||    
T  51311825 accaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaagcgatactaattaaatagttaacagaccaaaaatgtaatttagcctaa 51311907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21918643 - 21918500
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  |||| |  |||||   || |||| ||||| | |||||||| |||||     
T  21918643 aaaacttaacgtttttgaattaaaactaacg-aaaggatcaaaatgtgtaag-gagataaagttaagatacaaaaaaaaatcaaattttaatttagggac 21918546  T
Q  108 caaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21918545 caaagtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 21918500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33812831 - 33812735
Alignment:
Q  49 aaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33812831 aaaatgtgtaacggatagaagttaaaggatcaaaataaatcaaattttaattaaagaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 33812735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43840076 - 43839959
Alignment:
Q  41 aaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggact 139  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||  || || ||||||||| ||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||      
T  43840076 aaaggaccaaaacgtgtaacggagagaaatttaagggaccaaaataaatcaatttttagttagaggatcaaaccgatactaattaaatagttaaggga-- 43839979  T
Q  140 aaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  43839978 aaaaaaacaatttagcctaa 43839959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 49529120 - 49529204
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49529120 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 49529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 22444339 - 22444304
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444339 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 22444304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 52268259 - 52268176
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttt-tgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 83  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  52268259 agatgaagaaaaactaacgttttataaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaagtgagagaagttaagggaccaaaa 52268176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4846750 - 4846669
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 83  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  4846750 agatgaagaaaattcaacgtttttgaattaaa-ctaatggaaaggaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaa 4846669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13355238 - 13355188
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13355238 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 13355188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 43527218 - 43527276
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaaca 61  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  43527218 atgaagaaaacataatgttcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaca 43527276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Original strand, 33812852 - 33812929
Alignment:
Q  79 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  33812852 caaaataaatcaaattttaattaagggactaaagcgatactacctaaatatttaagagaccaaaaatgaaatttagcc 33812929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43527080 - 43527023
Alignment:
Q  99 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  43527080 ttaagggaccaaatcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 43527023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 21169904 - 21169959
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag 64  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21169904 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagag 21169959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Original strand, 31049073 - 31049124
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31049073 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaaa 31049124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38911463 - 38911432
Alignment:
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38911463 atcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 38911432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 51885519 - 51885488
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51885519 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa 51885488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47872579 - 47872529
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  47872579 ttttagttaagggagcaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaa 47872529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 51311743 - 51311693
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaat 53  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51311743 atgaagaaactctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaat 51311693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Original strand, 43844359 - 43844484
Alignment:
Q  31 aaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgtt-aatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatag 129  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||  || || |||| |||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  43844359 aaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaatttaaaggacaaaaataaatcaatttttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatag 43844458  T
Q  130 ttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||    
T  43844459 ttaaaggaccaaaaaaataatttagc 43844484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 3e-51; HSPs: 81)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7399230 - 7399075
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7399230 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaataacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 7399131  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7399130 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 7399075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35263649 - 35263491
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  35263649 agatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagtt 35263550  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35263549 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 35263491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10656325 - 10656480
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||| ||    
T  10656325 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttactt 10656424  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10656425 aaaggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagcc 10656480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 16353385 - 16353542
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16353385 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 16353484  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  16353485 aggggaccaaagcgatactacttaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 16353542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 12593689 - 12593845
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12593689 atgaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 12593788  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  12593789 aggaccaaagcaatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgtaatttaacctaa 12593845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 15267479 - 15267622
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  15267479 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttagttaagggacc 15267578  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  15267579 aaagcgatactacctaaatagttaaaggatcaaaaatgcaattt 15267622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10656247 - 10656093
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| ||||    
T  10656247 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagataagttaaaggagcaaaataaatcaaattttagttaa 10656148  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10656147 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 10656093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3878636 - 3878480
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3878636 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgcaatagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 3878537  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3878536 aaacgaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagcct 3878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 7210678 - 7210830
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7210678 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacataaagaagttaaaagaccaaaataaatcgaattttaattaa 7210777  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  7210778 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagtgaccaagaatgcaatttagc 7210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 12694919 - 12695075
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12694919 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaataaccaaaatgtgtaatggaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 12695018  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12695019 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttggcctaa 12695075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 38416365 - 38416521
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| || ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  38416365 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacggaaagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaatt 38416464  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38416465 aagtgagcaaagcgatactacctaaataattaagagaccaaaaatacaatttagcct 38416521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 40589287 - 40589443
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40589287 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 40589386  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40589387 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 40589890 - 40590046
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40589890 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaatggaaaggaccagaatatgtaacggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 40589989  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  40589990 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttagcctaa 40590046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 334451 - 334296
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  334451 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatgggaaggaccaaaatgtgtaaaggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 334352  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  334351 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagcc 334296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9693069 - 9692919
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9693069 gaagaaaacctaacgttattgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagg 9692970  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9692969 gaccaaagcgatactacctaaatagtt-agggaccaaaaatacaatttagcc 9692919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31656589 - 31656744
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31656589 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaatt 31656688  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31656689 aagggaccaaagcgatactgcctaataagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 31656744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36752055 - 36751904
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  36752055 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtttaacagagagaagttaagggactaaaataaatcaaattttaattaa 36751956  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36751955 gggaccaaatcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatacaatttag 36751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 28392006 - 28392156
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacg-ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28392006 agaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaaggttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaggg 28392105  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  28392106 accaaagcgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatagaatttagcc 28392156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31909085 - 31908928
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  31909085 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattgaaactaacggaaatgaccaaaatgtgcaatagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 31908986  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaa--atagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31908985 aagggatcaaagcgatactacctaaatatagttaaggcaccaaaaatacaatttagcc 31908928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 35263731 - 35263881
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  35263731 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaatttaatggaccaaaataaatcgaattttagttaaggga 35263830  T
Q  107 tcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35263831 ccaaagtcatactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagcct 35263881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5624531 - 5624382
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  5624531 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaattgataacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaag 5624432  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5624431 ggaccaaaacgatactacctaaatagttaagagaccaaaaatacaattta 5624382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 42710587 - 42710736
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  42710587 agaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttataacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggga 42710686  T
Q  107 tcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42710687 ccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 42710736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29024087 - 29023936
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||| ||||||||||    
T  29024087 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaaattaagggaccaaaa---atcgaattttaattaa 29023991  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29023990 ggaaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 29023936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5087960 - 5087806
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||    
T  5087960 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacgggaagaagttaaggaaccaaaataaattgaattttagttaa 5087861  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  5087860 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaattcaatttcgcct 5087806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7210611 - 7210461
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  7210611 agatgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatc 7210512  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  7210511 aagggaccaaaacgatagtacctaaatatttaagggaccaaaaatgcaatt 7210461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 19205176 - 19205326
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  19205176 atgaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaaggggtcaaaataaatcgaattttagttaa 19205275  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  19205276 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaattta 19205326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31656511 - 31656370
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31656511 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtatcagagagaagttaaaggatcaaaataaatcgaattttaattaa 31656412  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31656411 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 31656370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33699417 - 33699273
Alignment:
Q  14 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |||| |    
T  33699417 ctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaaccgaattttagttaaaggaccaaaac 33699318  T
Q  114 gatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  33699317 gatactacctaaatagttaagggaccataaatgcaatttagccta 33699273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 7399309 - 7399452
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  7399309 agatgaagaaatcctaacttgtttgaataaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 7399408  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  7399409 aagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggacaaaaaa 7399452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 39706282 - 39706433
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39706282 agatgaagaaaatccaacgtttttgaattgaaactaacaaaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 39706381  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    |||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39706382 aagggaccaaaagaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattt 39706433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42710486 - 42710351
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |  |||||||||||    
T  42710486 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatgtgtaacatagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaattaaagaactaaagcgatact 42710387  T
Q  120 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  42710386 accgaaatagttaaatgactaaaaatgcaatttagc 42710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 43570004 - 43570155
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||    
T  43570004 atgaagaaaacttaacgtttttgaatcaaaactaatcgaaatgatcaaaatgtgtaacggagagaagttaatgggacaaaataaatcaaattttaattaa 43570103  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43570104 gggaacaaagcgatgctatctaaatagttaagggacaaaaaatacaatttag 43570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Original strand, 32272082 - 32272224
Alignment:
Q  12 acctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaa 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32272082 acctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaatgaacaaaatatataacatagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaa 32272181  T
Q  112 gcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  32272182 gcgatattatctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttag 32272224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40589811 - 40589657
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  40589811 gatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaattt 40589712  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
     | || ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589711 ggagaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 36752133 - 36752289
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36752133 agatgaagaaaacctaacttttttaaattaaaaccaatgaaaaggaccaaaatgtgcaacaaagagaagttaatggaccaaaataaatcgaattttaatt 36752232  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36752233 aa-ggattgaagcgatactacataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 36752289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40589207 - 40589054
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||      
T  40589207 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagtcaagggaccaaaataaatcgaattttaatttg 40589108  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | || ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40589107 gagaccaaagtgaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40589054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 9693157 - 9693301
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  9693157 aaaaccaaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaatataaatcgatttttaattaagggacc 9693256  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9693257 aaatcgatactacctaaatcgttaagggaccaaaaatgcaattta 9693301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25923273 - 25923121
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| | |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  25923273 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaatggtaaaaatgtataacggagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 25923174  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25923173 aaaggaccaaaccgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatacaattta 25923121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 41859908 - 41860062
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||||||    
T  41859908 agatgaagaaaacctaacctttttgaattaatactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggatcaaaataaattgaattttaatt 41860007  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactat--ctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  41860008 aagggaccaaagtgatactatacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattta 41860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 5088386 - 5088516
Alignment:
Q  28 ttaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaat 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  5088386 ttaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacaaaaagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattagaggaccaaagcgatactacctaaat 5088485  T
Q  128 agttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5088486 agttaagagaccaaaaatacaatttagccta 5088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 8418417 - 8418569
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  8418417 agataaagaaaaccta-cgttttt-aattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtataacagagaaaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaatt 8418514  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8418515 aacggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 8418569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26289173 - 26289027
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  26289173 atgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacggaaaggacgaaaatgtgtgacatatagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttaattaa 26289074  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 149  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26289073 gggacgaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaa 26289027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 5152848 - 5153000
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  5152848 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaaattaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 5152947  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5152948 gggaccaaagcgatactaaataaatagttaagggaccaaaaacataatttagc 5153000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40774490 - 40774339
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40774490 atgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagagagaagttaagggaccaaaataaatcga-ttttaattaa 40774392  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40774391 gggactaaaacaatactacctaaatagttaagggacaaaaaatgaaatttagc 40774339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17861193 - 17861039
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17861193 agatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaatggaccaaaatgtgtaccgaagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaatt 17861095  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||| | | || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  17861094 aagggaccaaagcaacattacctaaatagttaaaggaccaaaaatataatttagcc 17861039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39706201 - 39706053
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  39706201 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatatctaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaagg 39706102  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | |||||||    ||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39706101 accaaagcg----tacataaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 39706053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 15476490 - 15476632
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  15476490 agatgaaggaaaactaacatttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaatt 15476589  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15476590 aagggaccaaagcgatactacctaaataattaagggactaaaa 15476632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19205098 - 19204941
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||     |||  ||| | ||||||||    
T  19205098 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaccagagagaagttaa-ggtatttaagccatcaaattttaatt 19205000  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19204999 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 19204941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 31909163 - 31909313
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  31909163 atgaagaaaacctaacattttttaattaaaattaacgaaaatgaccaaaatatgtaaaagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 31909262  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  31909263 gggacgaaaacgatactacctaaacagttaagggaccaaaaatgcaattta 31909313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 41372391 - 41372541
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  41372391 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 41372490  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  41372491 gggaccaaaacgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 41372541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12593611 - 12593454
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||| | ||||||| ||||| ||    
T  12593611 agatgaagaaaatctaacgtttttgacttaaaactaaaggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaaggaaccaatataaatcgaattttagtt 12593512  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12593511 aagggactgaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttagccta 12593454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18514430 - 18514285
Alignment:
Q  14 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||| |||| || |||||     
T  18514430 ctaacgtttttgaattaaaactaatggaaacgaccaaaatgtgtaacatagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaactaagcgaccaaagg 18514331  T
Q  114 gatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18514330 gatacttcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18514285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 40774568 - 40774724
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||  |||||  | || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40774568 agatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtgacgtagagaaataaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 40774667  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||    
T  40774668 aagggactaaagcgatactagctaaataattaaggaatcaaaaatgcaatttagcct 40774724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16353307 - 16353151
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16353307 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccgaaatgagtaacatagaaaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 16353208  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaa---tagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16353207 gggaccaaatcgatactacctaaatagtagttaagggaccaaaaatgtaatttagcc 16353151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33763055 - 33762922
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgt--taatggaccaaaagaaatcgagttttaa-ttaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  33763055 aagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacagagagaagttataagggatcaaaataaatcgaattttaatttaa 33762956  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggg 136  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33762955 gggaccaaagcgatactacctaaataattaaggg 33762922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14143663 - 14143511
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||    
T  14143663 agatgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggactaaaataaatc-aattttaatt 14143566  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14143565 aa-aaaccaaaacgatactatctaaatagttaagggac-aaaaatataatttagcct 14143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 33763143 - 33763293
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||| |  |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  33763143 atgaagaaaa--taacgtttttgaattaaaaccaaaggaaatgtacaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccgaaataaatcgaattttaattaa 33763240  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33763241 ggaaccaaagcgatacta-ctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 33763293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38416294 - 38416140
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||| |||||| |||||   | ||||| |||| || ||||||||||||    
T  38416294 gaagaaaacccaatatttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaaccgagagaagttaagaaaacaaaataaattgaattttaattaagg 38416195  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  38416194 gaccaaagcgatactacctaaataattaagagattaaaaatgcaatttagcctaa 38416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 17861271 - 17861419
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| |||      |||||||||    
T  17861271 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttacaggaccaaaataaa------tttaattaa 17861364  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17861365 -ggaccaaagtgatactacctaaataatt-agggaccaaaaatacaatttagcctaa 17861419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15476377 - 15476269
Alignment:
Q  45 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15476377 gaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagagaccaaaataaataaaattttaattaagggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaa 15476278  T
Q  145 tacaattta 153  Q
    || ||||||    
T  15476277 tataattta 15476269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 25923352 - 25923480
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| || ||||||||||    
T  25923352 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaaattaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 25923451  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagtt 131  Q
    |||| |||| | ||||||  |||||||||    
T  25923452 gggaccaaaacaatactacataaatagtt 25923480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28391924 - 28391768
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||    
T  28391924 agatgaaaaaaccctaacatttttgaattaaaactaactaaaaggaccaaaatgtgtaatggagagaaagttaagggatcaaaataaatcgaactttaat 28391825  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28391824 taagggaccaaagtaatactgcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattgagcc 28391768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 15670387 - 15670534
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||       
T  15670387 aagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaacatgtgtaatgcagagaagttaagggaccaaaataaataaaattttaattaaata 15670486  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15670487 accaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 15670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5152771 - 5152614
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  5152771 agatcaagaaaacctaaagtttttgaattaaaactaacaaaaaggaccaaaatgtgtaagaagataga-gttaagataccaaaataaatcaaattttaat 5152673  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||  |||||  ||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5152672 taaggggccaaagtcatactaattacatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 5152614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14052040 - 14051886
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||      
T  14052040 gaagaaagcctaacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacggagaaaagttcaggaaccaaaataaatcgaattttaattaaaa 14051941  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     | |||| | ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14051940 aaccaaaacaatattacctaaatagttaagagaccaaaaatacaatttaacctaa 14051886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5460264 - 5460187
Alignment:
Q  80 aaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5460264 aaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactgtctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcct 5460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8418336 - 8418206
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  8418336 tttttgaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagagaagttaa-gaaccaaaataaatcgaattttaattaagtgaccaaaacgatact 8418238  T
Q  120 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  8418237 acctaaataattaatggaccaaaaatgcaatt 8418206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 26289257 - 26289407
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| || ||  |||||| ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  26289257 agaaaacctaacgtttttgaattaaaaaccaacgaaaaggacaaaaatgtgcaatggagagaagttaa-ggatcaaaatgaatcgaattttaattaaggg 26289355  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  26289356 accaaaacgatactatttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatctagcct 26289407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21750897 - 21750807
Alignment:
Q  69 gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21750897 gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaaggcaatttagcctaa 21750807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15267393 - 15267239
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  15267393 gatgaagaaaatctaacattt--gaattaaaactaatagaaatgagcaaaatgtgtaattgagagaagttaaggggccaaaataaatcaaattttaatta 15267296  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | ||| |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15267295 aaggaccaaaacgatactacct-aatagttaagggaccaaaaatgcaatttaacctaa 15267239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 143
Target Start/End: Original strand, 17736522 - 17736620
Alignment:
Q  45 gaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17736522 gaccaacatgtgtaacagagagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaatggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 17736620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Original strand, 5460272 - 5460329
Alignment:
Q  96 taattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5460272 taattaagggaccaaagcgatactatctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 5460329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 14143742 - 14143892
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 106  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||  | ||||||| ||| ||    
T  14143742 agaaaccctaatattttttaattaaaattaacaaaagtgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattaaattttaatgaagaga 14143841  T
Q  107 tcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     |||||  ||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14143842 ccaaagtaatactacttaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 14143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 5088038 - 5088073
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacta 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5088038 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaacta 5088073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41859830 - 41859780
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaat 53  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  41859830 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaat 41859780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26289025 - 26288988
Alignment:
Q  122 ctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26289025 ctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcctaa 26288988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 5624617 - 5624672
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagag 64  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  5624617 aaaatctaacttttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatgtgtaacagag 5624672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 21750941 - 21750906
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 38  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21750941 atgaaggaaacctaacgtttttgaattaaaactaac 21750906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 157
Target Start/End: Original strand, 3879305 - 3879399
Alignment:
Q  63 agagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||| ||| | | |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3879305 agagaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaaataatgaaccaaagtcatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 3879399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Original strand, 37192467 - 37192533
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  37192467 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 37192533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Original strand, 3878717 - 3878770
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa 59  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  3878717 aagaaaacctaaggttttttaattaaaattaacagaaatgaccaaaatgtgtaa 3878770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 103; Significance: 1e-50; HSPs: 131)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 23281241 - 23281399
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23281241 agatgaaaaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttatgggaccaaaataaatcgaattttaatt 23281340  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23281341 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 23281399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5463349 - 5463505
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5463349 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagagaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 5463448  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5463449 aacggaccaaagcgatactagctaaatagttaagggactaaaaatgcattttagcct 5463505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 10923594 - 10923750
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10923594 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacgaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 10923693  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10923694 aagggaccaaagcgataccacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 10923750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25088169 - 25088013
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  25088169 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 25088070  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25088069 aggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 25088013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29256983 - 29256835
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29256983 gaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagg 29256884  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29256883 gaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataattta 29256835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 16267923 - 16268077
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16267923 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaagaaccaaaatgtgtaacggagagaagttaa-ggaccaaaataaatcaaattttaattaa 16268021  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16268022 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 16268077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30611375 - 30611218
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  30611375 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaatagaaatgaccaaattatgtaacagagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaatt 30611276  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  30611275 aagggatcaaagtgataatatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttaaccta 30611218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 51692027 - 51691874
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  51692027 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatagagagaagttaatggaccaaaatagatcgaattttaattaa 51691928  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51691927 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 51691874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 10654260 - 10654404
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10654260 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagtt 10654359  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10654360 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 10654404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42607677 - 42607525
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  42607677 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttaaatt 42607578  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42607577 aagggaccaaaacgatattatctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 42607525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 34028954 - 34029109
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34028954 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttagttaa 34029053  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34029054 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34029109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33753380 - 33753222
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33753380 agatgaagaaaagctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagacaaaaatgtgtaactgggagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaatt 33753281  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33753280 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 33753222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21036140 - 21035987
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  21036140 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaacttaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 21036041  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  21036040 aatggaccaaagtgatactatctaaatagttaaggaatcaaaaatgcaatttag 21035987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34028876 - 34028719
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||    
T  34028876 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaatagaagttaagggaccaaaataaattgaattttagtt 34028777  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34028776 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 34028719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35986387 - 35986234
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  35986387 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtatcggcgagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 35986288  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  35986287 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaacaaaaatgcaatttag 35986234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 50574748 - 50574897
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  50574748 agatgaagaaaacctaacgttttttaattaaaactaaccgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 50574847  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaat 150  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50574848 aagggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaat 50574897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28970573 - 28970418
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28970573 gatgaagaaaacctaatgttttttaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagagagaagttcatggaccaaaataaatcgaattttaatta 28970474  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  28970473 aaggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttagcct 28970418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 37199152 - 37199310
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  37199152 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccagaataaatcgaattttaatt 37199251  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  37199252 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaaggaaccaaaaatgcaatttaacctaa 37199310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6181847 - 6182004
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6181847 agatgaagaaaaccttacgtttttgaattaaaactaattgaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 6181946  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || |||  ||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6181947 aaaggactaaagcgatactacataaatagttatgagaccaaaaatacaatttagccta 6182004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9881706 - 9881550
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9881706 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaatggaaaagaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 9881608  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9881607 tagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagccta 9881550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22584504 - 22584351
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22584504 atgaagaaaacctaacgtttttgatttaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 22584405  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||    
T  22584404 gggaccaatgtgatactacctaaatagttaagagacaaaaaatgcaatatagcc 22584351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 32564181 - 32564337
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32564181 agatgaagaaaacctaatatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 32564279  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32564280 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggactaaaaatgcaatttagccta 32564337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 45305654 - 45305798
Alignment:
Q  14 ctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagc 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  45305654 ctaacgttttttaattaaaactaacgtaaatgaccaaaatgtgtaacagagaga-gttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagt 45305752  T
Q  114 gatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45305753 gatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 45305798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 51692102 - 51692254
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51692102 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaac-gagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 51692200  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  51692201 aatggaccaaaacgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 51692254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 49291214 - 49291366
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49291214 agatgaagaaaatctaacgtttttgaatcaaaactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacatagagaaattaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 49291313  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  49291314 aagggaccaaaacgatactatctaaatagttaagggacgaaaaatgcaattta 49291366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30792593 - 30792438
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  30792593 atgaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacataaatgaccaaaatgtgtaacagagaaaagataagggaccaaaataaatcgaattttatttaa 30792494  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  30792493 gggatcaaagcgacagtacctaaatagttaggggaccaaaaatgcaatttagccta 30792438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6181769 - 6181619
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6181769 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaa 6181670  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  6181669 ggaaccaaagcgatactaactaaataattaagggatcaaaaatgcaattta 6181619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16267870 - 16267716
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  16267870 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaaccaacggtaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 16267771  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16267770 aagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 16267716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24590379 - 24590237
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24590379 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggactaaaatgtgtaacatagacaaattaatagaccaaaataaatcgaattttaattaa 24590280  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  24590279 gggaccaaagcgatactacttaaatagttaagtgactaaaaat 24590237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 33753449 - 33753602
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33753449 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 33753548  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33753549 gggaccaaaacgatactacctaaatagttatgggac-caaaatacaatttagcct 33753602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37199085 - 37198931
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  37199085 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagaccaaaatgtgtaacagatagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 37198986  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  37198985 gggaccaaagcgatattgcctaaatagttaagaaaccaaaaatacaatttagcct 37198931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 50118500 - 50118350
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| || |||||||    
T  50118500 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaatgatcaaaatgtgtaacagagagaaattaagagaccaaaataaatcgaattgtaattaa 50118401  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50118400 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatacaattta 50118350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 13944744 - 13944897
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  13944744 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatttgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattctaattaa 13944843  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13944844 gggatcaaaacgatactacctaaatgattaagggaccaaaaatacaatttagcc 13944897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18793838 - 18793693
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  18793838 aaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacc 18793739  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  18793738 aaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatgaaatttag 18793693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 24590459 - 24590611
Alignment:
Q  4 tgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaag 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||||||||||     
T  24590459 tgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaaa 24590558  T
Q  104 ggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24590559 ggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttagcc 24590611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24655741 - 24655589
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||    
T  24655741 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacagaaaggcccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagagaccaaaatgaatcgaattttaatt 24655642  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  24655641 aagagaccaaagcgatactacctaaatacttaagggaccaaatatgcaattta 24655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 52412829 - 52412985
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  52412829 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaatt 52412928  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  52412929 aagggaccaaagtgataccacctaaatagttaagggaccaaaaatgtaatttagcct 52412985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11787893 - 11787742
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| || || | ||||||||||    
T  11787893 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaagttaagggaccaaaataattcaaattttaattaa 11787794  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  11787793 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaattcaatttag 11787742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14775966 - 14776121
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  14775966 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagggagaatttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 14776065  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14776066 aagggaacaaaacgatactacctaaatagttaagtgaccaaaaatgcaatttagcc 14776121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14118685 - 14118527
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  14118685 agataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaagactaaaatgtgtaacggagaaaagttaaagtaccaaaataaatcgaattttaatt 14118586  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14118585 aaggaaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 14118527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14775898 - 14775744
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  14775898 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacagagataagttaagggagcaaaataaatcgaattttaattaa 14775799  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     | | |||| | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14775798 agaagcaaaacaatactacctaaataattaagggaacaaaaatacaatttagcct 14775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 24655822 - 24655975
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | |    
T  24655822 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaccggaaggaccaaaatgtgtaacggatagaagttaatggctcaaaataaatcgaattttaattacgag 24655921  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24655922 accaaagcgatactacttaaatagttaagagactaaaaatgcaatttagcctaa 24655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52412745 - 52412609
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatc 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  52412745 aaaacctaacgttttggaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacc 52412646  T
Q  109 aaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52412645 aaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaat 52412609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10654174 - 10654028
Alignment:
Q  11 aacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||    
T  10654174 aacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaacggacagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaa 10654075  T
Q  111 agcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10654074 agcg-tactacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 10654028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30293168 - 30293010
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||     
T  30293168 agataaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtataacatagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaata 30293069  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  30293068 aagagaccaaagcgatactacctaaatagttaatggaccaaaaatgcaatttaacctaa 30293010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 30293246 - 30293395
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30293246 atgaaaaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaaataccaaaatgtgtaacatagagaagttaa-ggaccaaaataaatcgaattttaattaa 30293344  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30293345 aggatcaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaattta 30293395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 36657734 - 36657888
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36657734 atgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaatagacagaagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 36657833  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36657834 gggaccaaagcgatactgcataaatagttaagggaccaaaaatacaattttgcct 36657888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Original strand, 46738957 - 46739110
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  46738957 atgaagaaaatctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgactaaaatgtgtaacagagagaagttaagcgaccaaagtaaatcgaattttaattaa 46739056  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46739057 gggaccaaagtgatactacctaaatagttaggggac-aaaaatacaatttagcct 46739110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50921215 - 50921061
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||| |||||||||||||  | || ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  50921215 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaaaaactaaaatgtgtaacagagagaaatcaagggaccaaaataaatcggattttaatt 50921116  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50921115 aagggaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagc 50921061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51810290 - 51810136
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51810290 atgaaaaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 51810191  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  51810190 aggaccaaagtgatactacctaaatagttaagagactaaaaatgcaattttgcct 51810136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 19986353 - 19986510
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  19986353 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaaaggaccaaaataaatcaaattttattt 19986452  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  19986453 aagagaccaaagtgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttatccta 19986510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 30611453 - 30611606
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggacc-aaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||| | | ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  30611453 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagaaaagataagggaccaaaaataaatcgaattttaattt 30611552  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30611553 agggaccaaagcgatacaacctaaatagttaagggatcaaaaatacaatttagc 30611606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 34279471 - 34279628
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaa-ctaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  34279471 agatgaaaaaaatataacgtttttaaataaaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaat 34279570  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34279571 taagggaccaaaatgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 34279628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 51810370 - 51810515
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||||     
T  51810370 gatgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacaagaaggaccaaaatgtgtaacagagagaaattaagggaccaaaataaatcaatttttaattc 51810469  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatac 147  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51810470 aggaacaaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatac 51810515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4045252 - 4045096
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  4045252 atgaagaacacctaacgtttttgaattaaaatcaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaatttaagggatcaaaataaattgaattttaattaa 4045153  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4045152 gggaccaaaacgatactacctaaatagttaaggggctaaaaatacaatttaacctaa 4045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 4045330 - 4045486
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  4045330 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggactaaaatgtgtagcagagaaaagttaaaggactaaaataaatcgaattttaatt 4045429  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  4045430 aagagaccaaagtgatactacttaaatagttaagggaccaaacatgcaatttagcct 4045486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 22584602 - 22584738
Alignment:
Q  20 tttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatact 119  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  22584602 ttttttaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaaacgatact 22584701  T
Q  120 atctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22584702 acctaattagttaagggaccaaaaatataatttagcc 22584738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 29257054 - 29257222
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29257054 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatggaccaaaataaattgaattttaatt 29257153  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaacgtttattaa 169  Q
    | ||||  |||   |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||  ||||||||    
T  29257154 aggggacaaaattaatactagctaaatagttaagagaccaaaaatgcaattaaacctaaattttattaa 29257222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 42607735 - 42607887
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  42607735 atgaagaaaatctaacctttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatttgtaacagagagtaattaaaggaccgaaataaatcaaattttaattaa 42607834  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    | || |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  42607835 gagaccaaaacgatactatctaaataattaagggatcaaaaatacaatttagc 42607887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 46949911 - 46949755
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46949911 agatgaagaaaacttgacgtttttgaattaaaactaacggaaaggatcaaaatgtgtaacgaatagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 46949812  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  46949811 aagggaccaaaacgatactacctaaatagttaatgaattaaaaatgcaatttagcct 46949755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 25088247 - 25088403
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||    
T  25088247 agatgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacatggagaagttaagggaccgaactaaatcgaattttagtt 25088346  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  25088347 aa-ggaccaaaacgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatataatttaaccta 25088403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32564110 - 32563958
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  32564110 gaagaaaacataatgtttttgaattaaaattaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagaaagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaagg 32564011  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32564010 gaccaaagtgatacagcctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 32563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 11394893 - 11395044
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11394893 atgaagaaaatctaacatttttgaattaaaactaacggaaataaccataatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttaattaa 11394992  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11394993 gggatcaaaacaaaactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttag 11395044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Original strand, 18793925 - 18794082
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18793925 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaacc-aaatgtgtaacgaaaagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 18794023  T
Q  103 gggatcaaagcg--atactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18794024 gggaccaaagcgatatactacttaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 18794082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20260610 - 20260768
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||   ||||||| |||||   |||||||    
T  20260610 agatgaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacaaaaatgaccaaaatatgtaaggagagaga-gttaagataccaaaataaatcagattttaat 20260708  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20260709 taagggaccaaaacgatactaattaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 20260768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28112905 - 28112795
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28112905 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgatcaaaatgtgtaatagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 28112806  T
Q  101 aagggatcaaa 111  Q
    |||||||||||    
T  28112805 aagggatcaaa 28112795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 13831253 - 13831358
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13831253 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 13831352  T
Q  101 aaggga 106  Q
    ||||||    
T  13831353 aaggga 13831358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13944666 - 13944509
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  13944666 agatgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtttaatggagagaagttaagggaccaatataaatcaaattttaatt 13944567  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  13944566 aagggaccaaaacgatactagctaaatagttaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 13944509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34279393 - 34279240
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||  | ||| |||||  |||||||| |||| || ||||||||||    
T  34279393 atgaagaaaacctaacgcttttgaattaaaactaacgaaaagaaccaaaatgcgtaacgaaaagaagttaagagaccaaaataaattgaattttaattaa 34279294  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  34279293 gggaccaaagcgttactacctaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagcc 34279240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 5118204 - 5118096
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5118204 atgaagaaaacctaatgtttttgaattaaaactaacagaaatgaccaaaatgtataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 5118105  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  5118104 gggaccaaa 5118096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 11787972 - 11788127
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11787972 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacagaaag-agcaaaatgtgtaatggagataagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 11788070  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  11788071 aagggaccaaagcgatactgcttaaataattaaaagaccaaaaatgcaatttagcct 11788127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21385091 - 21384960
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  21385091 agatgaagaaaatctatcgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaatggagagaagttaa-agaccaaaataaatcgaattttaatt 21384993  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  21384992 aagggataaaagcgatactacataaatagttaa 21384960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 21385173 - 21385325
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  21385173 agaaaacctaacgtttttgaattaaaatcaacggaaatgaccaaaatgtgttacatagagaagttaagggatcaaaataaattaaattttaattaaggga 21385272  T
Q  107 tcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21385273 ccaaagcgatactacttaaatagttaagggattaaaagtgcaatttagcctaa 21385325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50574663 - 50574527
Alignment:
Q  7 agaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggga 106  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  50574663 agaaaaccgaaagttattgagttaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaataga 50574564  T
Q  107 tcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50574563 ccaaagcgatactacctaaatagttaagggacaaaaa 50574527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5463271 - 5463140
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttg-aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5463271 atgaagaaaacctaacgtttttttaattaaaactgacggaaaggaccaaaatatgtacctgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatta 5463172  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    || || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  5463171 agagaccaaagcgatattatctaaataattaa 5463140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10923516 - 10923365
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaa-actaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||| | ||||| |||    
T  10923516 atgaagaaaacataacgtttttgaattaaatactaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacggagaaaagttaagggatcaaaataaatcaaattttactta 10923417  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  10923416 agggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaatataattta 10923365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44222345 - 44222190
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  44222345 atgaataaaatctaatgtttttgaattaaaactaacagaaagaatcaaaatgtgtaacggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaa 44222246  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  44222245 gggaccaaagcgatattacataaataattaaaggaccaaaaatgcaatttaaccta 44222190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 1831897 - 1832047
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  1831897 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccataatatataacggagaaaagttaagagacgaaaataaatcgaattttaattaa 1831996  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
     |||  ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1831997 aggactaaaacgatactacatatatagttaagggaccaaaaatacaattta 1832047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 34621868 - 34622018
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  34621868 atgaagaaaatttaacgtttttgaattaaaactaactgaaatgaccaaaatgtgtaacggaaagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 34621967  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  34621968 gggatcaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataattta 34622018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1831815 - 1831661
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1831815 agatgaagaaaacctaacgttttt----taaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaaagaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaatt 1831720  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||  || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  1831719 aaaagaccaaagtgatactacctaaatagttaagagaccgaaaattcaatttagcctaa 1831661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Original strand, 50921365 - 50921478
Alignment:
Q  44 ggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50921365 ggaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttacttaagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaa 50921464  T
Q  144 atacaatttagcct 157  Q
    ||  ||||||||||    
T  50921465 atgtaatttagcct 50921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Original strand, 4550833 - 4550988
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||    
T  4550833 atgaagaaaacctaacgtttttgaatttaacctaacggaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatta 4550931  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  4550932 agggaccaaagcgatactaattaaatagttaagagaccaaaaatgcaatttagccta 4550988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 40534080 - 40533928
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||| | |||||   | | ||| ||||| | ||||||||    
T  40534080 agataaagaaaacctaacgtttttaaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagaaaagttaagatagcgaaataaatcaaattttaatt 40533981  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40533980 aagggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagactaaaaatgcaattta 40533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4054688 - 4054545
Alignment:
Q  17 acgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatg-gaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||   ||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | || ||| |||    
T  4054688 acgtttttgaattaaaactaacgtaaaagactaaaatgtgtaacggagagaaagtaaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaagaattaaatcga 4054589  T
Q  116 tactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  4054588 tactatctaaatagttaaggggataaaaatacaatttagtctaa 4054545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36657654 - 36657501
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaac--agagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  36657654 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaagga-caaaatatgtaacggagagaggagttaagggatcaaaataaatcaaattttaatt 36657556  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||||| | ||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  36657555 aagggacccaagagatgcaaactaaatagttaggggacgaaaaatgcaatttagc 36657501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27209322 - 27209168
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27209322 atgaagaaaacctaacggttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaacgaagataagttaagataccaaaataaatcaaattttaattaa 27209223  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27209222 gggaccaaagtgatattaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 27209168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36884870 - 36884725
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36884870 agatgaagaaaacctaacgtttttgaat-------aacggaaaggaccaaaatatgtaatggagggaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaatt 36884778  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  36884777 aagagaccaaagcgatactacctaaatagttaaaggaacaaaaatacaattta 36884725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 49291146 - 49291016
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||   ||||| ||||| | || |||| ||||| | ||||||||||    
T  49291146 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgacgaaaatgtgtaatgaagagaagttaaggaacaaaaataaatcaaattttaattaa 49291047  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49291046 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaa 49291016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 9119525 - 9119618
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagtttt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9119525 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaactgaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaatttt 9119618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 46949969 - 46950085
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46949969 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaa 46950068  T
Q  103 gggatcaaagcgatact 119  Q
     ||| ||| | ||||||    
T  46950069 aggagcaatgtgatact 46950085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32517735 - 32517629
Alignment:
Q  26 aattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaa 125  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32517735 aattaaaactaacaaaaataaccaaaatgtgtaacagagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatactacctaa 32517636  T
Q  126 atagtta 132  Q
    |||||||    
T  32517635 atagtta 32517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 30792671 - 30792759
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatc 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  30792671 agatgaagtaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatatgtaacggagagaagttaagggaccaaaataaatc 30792759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 40703097 - 40703252
Alignment:
Q  2 gatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||  |||||    |||||| ||||| | |||||| |    
T  40703097 gatgaagaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaggaccaaaatgtgtaag-gagagaaagttaagatgccaaaataaatcaaattttaact 40703195  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  40703196 aagggaccaaagcgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatgcaattttgcct 40703252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45305563 - 45305412
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatta 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  45305563 atgaagaaacactaacgtttttgaattaaaagtaacggaaaagaccaaaaggtataacagagagaaagttaaaggaccaaaataaatcgaatcttaatta 45305464  T
Q  102 agggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    | ||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  45305463 aaggaccaaagcaatactacctaaatagttaactgaccaaaaatgcaattta 45305412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11797321 - 11797220
Alignment:
Q  10 aaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatca 109  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  11797321 aaacctaacattcttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtataacggagagaggttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaagggacca 11797222  T
Q  110 aa 111  Q
    ||    
T  11797221 aa 11797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36077381 - 36077268
Alignment:
Q  46 accaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  36077381 accaaaatttgtaacgaagagaacttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggaccaaagtgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 36077282  T
Q  146 acaatttagcctaa 159  Q
     |||||||||||||    
T  36077281 gcaatttagcctaa 36077268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5118079 - 5117995
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5118079 ttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagcgatattacctaaatagttaagggaccaaaaatacaatttag 5117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 2125442 - 2125577
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||       |||| |    
T  2125442 atgaataaaacctaacgttttttaattaaaactaacagaaaggaccaaaatgt-taacgaagagaagttaagggaccaaaataaatc------aaattta 2125534  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2125535 gggaccaaagcgatactacctaaataattaagggaccaaaaat 2125577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19886088 - 19885985
Alignment:
Q  50 aaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaa 149  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||    
T  19886088 aaatgtgtaacagagagaagttaagagaccaaaataaatcgaattttaattaaggaaccaaagcgatactacaaaaatagttaagggaccaaaaatgcaa 19885989  T
Q  150 ttta 153  Q
    ||||    
T  19885988 ttta 19885985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9119443 - 9119290
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||  | |||||| | |||   | ||| ||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  9119443 gaagaaaatctaacgtttttgaattgaaactaacggaaataaacaaaatgtataatgtatagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaagg 9119344  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  9119343 gaccaaagcgatactacctaagtagttaagggataaaaaatataatttaaccta 9119290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3569532 - 3569377
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||||| | ||| | |||||||    
T  3569532 agatggagaaatcctaacgtttttgaattaaaactaacggaaattaccaaaatgtgtaacagagagaaaattaagataccaaaatatatcaaattttaat 3569433  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    ||||| | |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  3569432 taaggaaccaaaacgatactaattaaataattaagggaccaaaaacataatttagc 3569377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 32517746 - 32517894
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  32517746 atgatgaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaaatgagagaagttgagggatcaaaataaatcaaattttaattaa 32517845  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
       | ||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  32517846 --aaccaaagtgatactacctaaatagataagggatcaaaaatgcaattta 32517894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Original strand, 40534158 - 40534292
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||  |||| | |||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  40534158 atgaagaaaacttaacattttttaattaaaactaacagaaagggtcaaaatgtgtaatggagaaaagttaagataccgaaataaatcaaattttaattaa 40534257  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaaggga 137  Q
    | || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40534258 gagaccaaagcgatactaattaaatagttaaggga 40534292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40703016 - 40702867
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  40703016 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaacgaaaaagatcaaaatgtgtaactcagagaagttaagataccaaaataaatcaaattttaatttagg 40702917  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    || |   | |||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40702916 gacc---gtgatactaattaaatagttaagggaccaaaaacataatttagcct 40702867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 27209380 - 27209536
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa-cagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| || ||  ||||| | |||||   ||||||| ||||| | |||||||    
T  27209380 agatgaagaagacctaacgttttttaattaaaattaacggaaaggaccaaaatgtgcaaggagaga-aagttaagataccaaaataaatcaaattttaat 27209478  T
Q  100 taagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||| ||| |||| ||||||||  ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27209479 taaaggaccaaaacgatactaattaaattgtcaagggaccaaaaatgcaatttagcct 27209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28112807 - 28112718
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| ||| ||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28112807 ttaagggatcaaaataaattgaattttaattaaggaaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 28112718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 50921293 - 50921373
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaa 83  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  50921293 atgaataaaacctaacgtttttgaattaaaactaattgaaatgaccaaaatgtgtaactgagagaagttaagggaccaaaa 50921373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Original strand, 19886214 - 19886297
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  19886214 ttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaaggaccaaagtgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatacaattta 19886297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 48702120 - 48702269
Alignment:
Q  9 aaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagac-gttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggat 107  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||| || |||  |||||   ||||||| ||||| | |||||||||| |||     
T  48702120 aaaatctaatgtttttgaattaaaaccaacg-aaatgaccaaaatgtgtaac-gatagaaagttaaaataccaaaataaatccaattttaattaaaggac 48702217  T
Q  108 caaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48702218 caaaacgatactaacaaaataattaagggactaaaaatgcaatttagcctaa 48702269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 34621776 - 34621718
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  34621776 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatcgaaaggaccaaaatgtgtaa 34621718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11394769 - 11394697
Alignment:
Q  79 caaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattt 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  11394769 caaaagaaatcgaattttaattaagggaccaaagcgatattacctaaatagttaagagac-aaaaatgcaattt 11394697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11797232 - 11797147
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagc 155  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  11797232 ttaagggaccaaaataaattgaattttaattaagggacaaaagcgatactacctaaataattaaaggaccaaaaatgcaatttagc 11797147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31126082 - 31125938
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31126082 atgaagaaaatctaacattttttaattaaaattaacggaaatgatcaaaatgtgtaatggagagaagttaaggaatcaaaataaatcgaattttaattaa 31125983  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
           ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  31125982 -------aagcgatactacctaaatagttaagggatcaaaaatgcaatttag 31125938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 36884937 - 36885037
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36884937 atgaagtaaacctaacattttttaattaaaattaacggaaatgacaaaaatgtgtaacagagataagttaaggaaccaaaataaatcgaattttaattaa 36885036  T
Q  103 g 103  Q
    |    
T  36885037 g 36885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 111
Target Start/End: Original strand, 19886122 - 19886226
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| |||   ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  19886122 gaagaaaacataacgtttttaaattaaaactaacggaaatgacaaaaatgtgt--gagagagaagttaaaggaccaaaataaatcgaattttaattaaag 19886219  T
Q  105 gatcaaa 111  Q
    || ||||    
T  19886220 gaccaaa 19886226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 31126160 - 31126279
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||| ||| | ||||| |||| |||| ||||| | ||||||||    
T  31126160 agataaagaaaaactaacgtttttgaattaaaactaacgaaaagaactaaaatgtgtgacatagaaaagttaagggactaaaataaatcaaattttaatt 31126259  T
Q  101 aagggatcaaagcgatacta 120  Q
    || | | |||||| ||||||    
T  31126260 aatgtaccaaagcaatacta 31126279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 133
Target Start/End: Original strand, 21036218 - 21036345
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||||||||| | |||||  |||||||| ||||| | |||||||||| |     
T  21036218 aagaaaccctaaagttcttgaattaaaactaacggaaatgatcaaacaatgtaacagagaaaagttaagagaccaaaataaatcaaattttaattaaaga 21036317  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaa 133  Q
    | ||||| |||  || ||||||||||||    
T  21036318 accaaagtgatggtacctaaatagttaa 21036345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 29726250 - 29726183
Alignment:
Q  751 tgatgttggttcaatataaactccatatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagt 818  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  29726250 tgatgtcggttcaatacaaactacatatttattttctgttgttttaatcaaactgctatcaattaagt 29726183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19269441 - 19269359
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19269441 ggaccaaaataaaccgaattttaactaagagaccaaagtgatactggataaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcct 19269359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2125369 - 2125293
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaa 82  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  2125369 gaagaaaacctaacatttttgaattaaaattaatataaa-gatcaaaatgtgtaacggagagaagttaaggaaccaaa 2125293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20260536 - 20260440
Alignment:
Q  48 caaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaa 144  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  20260536 caaaatgtgtaacggagagaagttaaaataccaaaataaatcaaattttaattaagggaccaaaatgatactaattaaatagttaagagaccaaaaa 20260440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 774 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 33060649 - 33060597
Alignment:
Q  774 catatttatttttcgttgttttaaccaaattgatatcaattaagttattattc 826  Q
    ||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33060649 catatttatcttttgtcgttttgatcaaattgatatcaattaagttattattc 33060597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6241316 - 6241274
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagg 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6241316 ttttaattaagggaccaaagcgatactaaataaatagttaagg 6241274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 6714698 - 6714748
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  6714698 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 6714748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32193580 - 32193530
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||    
T  32193580 ttttaattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggattaaaa 32193530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33784361 - 33784299
Alignment:
Q  97 aattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  33784361 aattaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaaacacatttaagcctaa 33784299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 34023569 - 34023619
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  34023569 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 34023619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 37708574 - 37708624
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  37708574 ttttagttaagggatcaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaa 37708624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 46448736 - 46448786
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  46448736 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggactaaaa 46448786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 11394814 - 11394765
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaa 52  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||    
T  11394814 atgaagaaaacctaacgtttcttaattaaaactaacggaaaggatcaaaa 11394765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29021645 - 29021580
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  29021645 ttttagttaagggaccaaagcgataccaaataaatagttaagggaccaaaaacacatttaagccta 29021580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 101; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 11445 - 11601
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  11445 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaattgaattttaatt 11544  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11545 aagggaccaaagcgatactacctaaatagttaagggataaaaaatgcaatttagcct 11601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11366 - 11231
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11366 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 11267  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggac 138  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11266 gggacgaaagcaatactacctaaatagttaagggac 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 40583 - 40738
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  40583 agatgaagaaaatctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacggagagaagttaatgaaccaaaataaatcgaattttaatt 40682  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40683 aagggaccaaagcaatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 40738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40505 - 40350
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||  ||||   |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||    
T  40505 atgaagaaaacttaacgtttttgaattaaaactaacggaaagaaccaaaatctgtaacgtagagtaattaagggaccgaaataaatcaaattttaattaa 40406  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40405 gggactaaagcgatactatctaaataattaagggaccaaaaatacaatttagccta 40350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 45067 - 45222
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||||    
T  45067 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacgaaaatgaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccacaataaatcaatttttaatt 45166  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45167 aagggagcaaagcgataatacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatttagcc 45222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 95; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 11723 - 11873
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  11723 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaataaccaaaatatataacagagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaaagg 11822  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11823 accaaagcgatactacctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcc 11873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11641 - 11485
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  11641 atgaggaaaatctaacgtttttaaattaaaactaacgaaaaagaccaaaatatgcaacggagagaagttaagggactaaaataaatcgaattttaattaa 11542  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11541 gggaccaaagcgatactttctaaatagttaagggaccaaaaatgcaatttagcctaa 11485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 83; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 13774 - 13924
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13774 atgaagaaaacccaacgtttttgaattaaaatcaacggaaataaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcgaattttaattaa 13873  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13874 gggaccaaagcgatactacctaaatagttaggggaccaaaaatacaattta 13924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13696 - 13541
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||| |    
T  13696 agatggagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaatggaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaagggaccaaaataaatcggattttaact 13597  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    |||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  13596 aagggaccaaagcaattctaactaaatagttaa-ggaccaaaaatgcaatttagcct 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 177296 - 177453
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  177296 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaacaaaatgtgtaacatagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaatt 177395  T
Q  101 aagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    |||||||| |   |||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  177396 aagggatcgatctgataatacctaaataattaagggaccaaaaatgcaatttagccta 177453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 65972 - 66123
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||||||||    
T  65972 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaa 66071  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || |  ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  66072 ggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 66123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 73304 - 73455
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||||||||    
T  73304 atgaagaaaacctaacatttttgaattaaaactaataaaaaggaccaaaatatgtaacaaagagaagttaagggactaaaataaattgaattttaattaa 73403  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttag 154  Q
    || |  ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  73404 ggaactaaaacgatactacctaaatagttaagcgaccaaaaatgtaatttag 73455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 65890 - 65750
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||     
T  65890 gaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaaga 65791  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  65790 gaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaat 65750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 73222 - 73082
Alignment:
Q  5 gaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||     
T  73222 gaagaaaacctaacgttttggaattaaaactaacggaaatgaccaaaatgtgtaatggagagaagttaagggatcaaaataaatcgaattttaattaaga 73123  T
Q  105 gatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaat 145  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  73122 gaccaaagcaatattacctaaatagttaagagaccaaaaat 73082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 93345 - 93188
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgt-aacagagag-acgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaa 98  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||   ||||||| ||||| | ||||||    
T  93345 agatgaaaaaaccctaacgtttttgaattaaaactaacgtaaaggaccaaaatgtgtaaacagagagaaagttaagataccaaaataaatcaaattttaa 93246  T
Q  99 ttaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  93245 ttaagtgactaaaacgatactaattaaatagttaagggaccaaaaatacaatttagcc 93188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 90958 - 90805
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  90958 atgaagaaaacctaataattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaatttcaattaa 90859  T
Q  103 gggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcc 156  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  90858 gggacaaaagcgatactacctaaatagttaagggactaaaaatgcaatgtagcc 90805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 91741 - 91844
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || ||| ||| |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||    
T  91741 atgaagaaaacctaatgattttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgcaagagaaagaagttaagttaccaaaataaatcaaattttaattaa 91840  T
Q  103 ggga 106  Q
    ||||    
T  91841 ggga 91844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1436
Description:

Target: scaffold1436; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 1706 - 1815
Alignment:
Q  1 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaatt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1706 agatgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaattaaccgaaatgaccaaaatgtgtaacagagagaagttaatggatcaaaataaatcga-ttttaatt 1804  T
Q  101 aagggatcaaa 111  Q
    |||||| ||||    
T  1805 aagggaccaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1436; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1625 - 1474
Alignment:
Q  6 aagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaaggg 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  1625 aagaaaagctaacgtgtttgaattaaaactaacggaaatgaccaaa-tgtgtaacaaagagaagttaagggatcaaaataaatcaaattttaattaaggg 1527  T
Q  106 atcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagccta 158  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  1526 accaatgcgatactacctaaatagttaagtgacaaaaaatgcaacttagccta 1474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11713
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaatatgtaacagagagacgttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | ||    
T  11821 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacggaaaggaccaaaatgtgtaacaaagagaagttaagggaccaaaataaatcaaattttagtcaa 11722  T
Q  103 gggatcaaa 111  Q
    |||| ||||    
T  11721 gggaccaaa 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11720 - 11638
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcct 157  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  11720 ggaccaaaataaatcaaattttagttaagggaccaaagcgataatacctaaatagttaaggtatcaaaaatgcaatttagcct 11638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26048 - 25970
Alignment:
Q  75 ggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaattta 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| | ||| |||| | |||||||    
T  26048 ggaccaaaataaatcgagttttaattaagggatcaaagtgataccaactacatagttaggagaccaaaagtgcaattta 25970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26089 - 26038
Alignment:
Q  3 atgaagaaaacctaacgtttttgaattaaaactaacataaaggaccaaaata 54  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26089 atgatgaaaacctaacgtttttgaattaaaactaaaggaaaggaccaaaata 26038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Original strand, 10920 - 11001
Alignment:
Q  70 ttaatggaccaaaagaaatcgagttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatt 151  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10920 ttaagggaccaaaataaatcaaattttagttaggggaccaaaccgatactaattaaatagttaagggaccaaaaagacaatt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6281
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaa 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  6231 ttttaattatgggatcaaagcgatactaattaaatagttaagagacgaaaa 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 57085 - 57019
Alignment:
Q  93 ttttaattaagggatcaaagcgatactatctaaatagttaagggactaaaaatacaatttagcctaa 159  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  57085 ttttagttaagggaccaaagcgataccaattaaatagttaagggaccaaaagaacaattaagcctaa 57019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University