View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19482_low_6 (Length: 404)

Name: NF19482_low_6
Description: NF19482
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19482_low_6
NF19482_low_6
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (13-383)||(41977731-41978101)
chr2 (13-387)||(21160098-21160472)
chr2 (13-378)||(27257526-27257891)
chr2 (13-368)||(29223865-29224221)
chr2 (13-368)||(29337164-29337520)
chr2 (13-368)||(13229997-13230352)
chr2 (13-377)||(23924687-23925051)
chr2 (16-387)||(36667533-36667898)
chr2 (13-387)||(32523062-32523435)
chr2 (13-377)||(36039917-36040282)
chr2 (13-334)||(42700628-42700949)
chr2 (13-378)||(43991666-43992021)
chr2 (13-387)||(14700774-14701150)
chr2 (13-383)||(9786759-9787131)
chr2 (13-387)||(28457532-28457906)
chr2 (13-261)||(36557217-36557466)
chr2 (13-296)||(31758500-31758784)
chr2 (16-384)||(24662786-24663157)
chr2 (96-285)||(40200173-40200363)
chr2 (13-90)||(8679450-8679527)
chr2 (324-387)||(36557488-36557551)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (13-387)||(37251560-37251934)
chr5 (13-377)||(16904264-16904629)
chr5 (13-378)||(27166753-27167118)
chr5 (13-365)||(33434757-33435109)
chr5 (13-377)||(9404566-9404931)
chr5 (13-377)||(11722931-11723296)
chr5 (13-387)||(34869400-34869775)
chr5 (13-377)||(11766897-11767261)
chr5 (13-377)||(34456439-34456802)
chr5 (13-365)||(7315358-7315711)
chr5 (13-377)||(30606731-30607096)
chr5 (13-378)||(6270031-6270397)
chr5 (13-315)||(14344666-14344968)
chr5 (13-377)||(24835877-24836229)
chr5 (70-377)||(31846122-31846429)
chr5 (13-264)||(32226914-32227165)
chr5 (143-377)||(7315107-7315342)
chr5 (19-234)||(519315-519530)
chr5 (16-387)||(39655694-39656067)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (13-387)||(8995917-8996291)
chr1 (13-377)||(38121587-38121952)
chr1 (13-377)||(39000836-39001201)
chr1 (13-368)||(33491853-33492209)
chr1 (13-378)||(11738453-11738818)
chr1 (13-377)||(12167871-12168236)
chr1 (13-378)||(40999759-41000124)
chr1 (13-378)||(431996-432361)
chr1 (13-378)||(9667351-9667716)
chr1 (13-378)||(16832438-16832803)
chr1 (13-384)||(44504923-44505296)
chr1 (13-338)||(49249245-49249571)
chr1 (13-385)||(36083892-36084265)
chr1 (13-367)||(13217703-13218055)
chr1 (13-319)||(16130714-16131012)
chr1 (13-334)||(15161612-15161934)
chr1 (16-387)||(9268768-9269139)
chr1 (326-380)||(15161242-15161296)
chr1 (110-387)||(6244334-6244605)
chr1 (292-387)||(13830420-13830515)
chr1 (233-352)||(13249135-13249254)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (13-384)||(22909253-22909624)
chr7 (13-387)||(2797218-2797592)
chr7 (13-387)||(1274720-1275094)
chr7 (13-377)||(10345960-10346325)
chr7 (13-377)||(31157931-31158296)
chr7 (32-377)||(19471864-19472209)
chr7 (13-378)||(31878741-31879106)
chr7 (13-368)||(8107543-8107899)
chr7 (13-377)||(6172658-6173022)
chr7 (13-377)||(2631538-2631903)
chr7 (13-377)||(23795236-23795601)
chr7 (13-377)||(22321456-22321820)
chr7 (13-378)||(45500366-45500731)
chr7 (13-378)||(12090115-12090481)
chr7 (13-378)||(12190984-12191348)
chr7 (36-378)||(12184007-12184348)
chr7 (16-387)||(2477791-2478164)
chr7 (24-387)||(3544544-3544909)
chr7 (13-387)||(24482877-24483252)
chr7 (13-378)||(31664167-31664515)
chr7 (13-223)||(22820401-22820611)
chr7 (16-385)||(29032452-29032811)
chr7 (13-197)||(31882433-31882617)
chr7 (210-378)||(22818553-22818721)
chr7 (16-162)||(1954285-1954431)
chr7 (200-378)||(1954098-1954267)
chr7 (13-92)||(22825036-22825115)
chr7 (23-96)||(4705043-4705116)
chr7 (16-64)||(27951126-27951174)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (13-387)||(13510096-13510470)
chr8 (13-387)||(13599626-13600000)
chr8 (13-377)||(9067822-9068187)
chr8 (13-377)||(3298944-3299308)
chr8 (13-377)||(8742938-8743303)
chr8 (13-377)||(11308642-11309007)
chr8 (13-377)||(28925798-28926163)
chr8 (13-377)||(28370235-28370600)
chr8 (13-383)||(22242898-22243269)
chr8 (13-368)||(27348177-27348533)
chr8 (40-384)||(22180737-22181081)
chr8 (13-368)||(41576986-41577342)
chr8 (13-387)||(22233505-22233880)
chr8 (13-377)||(34006428-34006791)
chr8 (13-387)||(22222330-22222694)
chr8 (16-378)||(4861609-4861971)
chr8 (13-387)||(12538290-12538670)
chr8 (16-387)||(16958683-16959055)
chr8 (13-387)||(22228672-22229036)
chr8 (16-299)||(17993087-17993370)
chr8 (13-296)||(21692669-21692953)
chr8 (13-270)||(36736861-36737117)
chr8 (29-308)||(13848999-13849278)
chr8 (201-377)||(16580227-16580404)
chr8 (13-147)||(22227163-22227297)
chr8 (297-378)||(24040857-24040937)
chr8 (329-387)||(17993027-17993085)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (13-387)||(11859-12233)
scaffold0298 (13-387)||(15629-16003)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (13-387)||(13173479-13173853)
chr6 (13-387)||(34913821-34914195)
chr6 (13-387)||(25977081-25977456)
chr6 (13-387)||(13182012-13182386)
chr6 (13-377)||(3539189-3539554)
chr6 (13-387)||(14270804-14271179)
chr6 (13-377)||(9932460-9932825)
chr6 (13-377)||(26515083-26515448)
chr6 (13-377)||(34006644-34007009)
chr6 (13-378)||(24160911-24161276)
chr6 (13-377)||(24879007-24879372)
chr6 (13-378)||(32806418-32806783)
chr6 (13-378)||(21596183-21596548)
chr6 (13-387)||(1454928-1455298)
chr6 (13-387)||(1466620-1466990)
chr6 (13-341)||(16698088-16698416)
chr6 (13-387)||(5988657-5989032)
chr6 (16-368)||(21631333-21631687)
chr6 (16-387)||(15642549-15642923)
chr6 (16-387)||(9518104-9518473)
chr6 (201-384)||(32821935-32822119)
chr6 (110-385)||(26604474-26604750)
chr6 (214-387)||(6867907-6868082)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (13-387)||(1232146-1232520)
chr3 (13-377)||(9989538-9989902)
chr3 (13-378)||(48167849-48168214)
chr3 (13-377)||(7652877-7653242)
chr3 (13-377)||(10385725-10386090)
chr3 (13-377)||(22097809-22098173)
chr3 (13-368)||(37471342-37471697)
chr3 (13-378)||(27850206-27850571)
chr3 (13-377)||(4742658-4743020)
chr3 (13-378)||(20837235-20837600)
chr3 (13-378)||(36469091-36469456)
chr3 (13-377)||(52307740-52308105)
chr3 (13-341)||(37022867-37023197)
chr3 (17-378)||(45527788-45528150)
chr3 (13-377)||(3588542-3588907)
chr3 (13-302)||(20962911-20963200)
chr3 (13-384)||(49434231-49434604)
chr3 (16-387)||(23194055-23194423)
chr3 (13-387)||(33248121-33248496)
chr3 (73-387)||(26335239-26335555)
chr3 (13-260)||(23411748-23411984)
chr3 (16-383)||(2357297-2357664)
chr3 (13-212)||(8625931-8626130)
chr3 (207-377)||(8615645-8615816)
chr3 (13-124)||(22098376-22098487)
chr3 (16-180)||(27104326-27104495)
chr3 (294-377)||(23385538-23385622)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-387)||(12325-12701)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (13-378)||(21677322-21677688)
chr4 (13-377)||(4838791-4839156)
chr4 (13-377)||(5273217-5273582)
chr4 (13-378)||(52618644-52619009)
chr4 (13-378)||(19247483-19247848)
chr4 (13-377)||(22047823-22048188)
chr4 (13-387)||(26069860-26070234)
chr4 (13-368)||(323589-323945)
chr4 (13-378)||(42532541-42532908)
chr4 (13-378)||(1188106-1188471)
chr4 (13-362)||(35416351-35416700)
chr4 (13-378)||(40995202-40995570)
chr4 (13-378)||(46691692-46692057)
chr4 (13-387)||(55326909-55327279)
chr4 (13-378)||(26373286-26373650)
chr4 (13-387)||(30218042-30218420)
chr4 (16-387)||(33110360-33110732)
chr4 (13-385)||(20948880-20949253)
chr4 (13-387)||(53895512-53895885)
chr4 (13-296)||(9417088-9417372)
chr4 (13-156)||(21668560-21668703)
chr4 (13-115)||(42271781-42271883)
chr4 (13-62)||(33239375-33239424)
chr4 (110-180)||(8895205-8895276)
chr4 (326-387)||(6640110-6640170)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (13-377)||(28554-28919)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (13-383)||(639-1009)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (13-377)||(8884-9249)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (13-378)||(116223-116588)
scaffold0019 (13-176)||(169063-169226)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (13-377)||(25305-25670)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (13-368)||(12143-12491)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (13-368)||(76107-76462)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (16-378)||(6873-7235)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (13-387)||(16127-16502)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-387)||(14317-14689)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (241-377)||(7205-7341)
scaffold0447 (241-377)||(11819-11955)
scaffold0447 (132-212)||(7340-7420)
scaffold0447 (132-212)||(11954-12034)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (241-377)||(9814-9950)
scaffold0383 (132-212)||(9949-10029)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (16-234)||(34981-35196)
scaffold0160 (288-388)||(35212-35313)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (13-118)||(5002-5107)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 41978101 - 41977731
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978101 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 41978002  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41978001 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 41977902  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977901 gataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 41977802  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaa 383  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41977801 atagctaaaatcgtatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaa 41977731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21160472 - 21160098
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21160472 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagttta 21160373  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21160372 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 21160273  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21160272 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 21160173  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21160172 atagctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 21160098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27257891 - 27257526
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27257891 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 27257792  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27257791 atcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaa 27257692  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27257691 gatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatttaagaataacaacaatattgaataa 27257592  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  27257591 atagctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 27257526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29224221 - 29223865
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29224221 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 29224122  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224121 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 29224022  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29224021 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 29223922  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  29223921 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 29223865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29337520 - 29337164
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29337520 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 29337421  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337420 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 29337321  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29337320 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 29337221  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  29337220 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 29337164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 13229997 - 13230352
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13229997 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgttta 13230096  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13230097 atcgacgatttcccaaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 13230196  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13230197 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 13230296  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  13230297 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 13230352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 23924687 - 23925051
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23924687 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattta 23924786  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23924787 attgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctagagtgataacttaa 23924886  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924887 gatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 23924986  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||  | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23924987 atagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 23925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 36667533 - 36667898
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36667533 atcactcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaggga------aaacatcgatttcctaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatc 36667626  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36667627 gacgatttcccaacggattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgcctagagtgataacttaagat 36667726  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36667727 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata 36667826  T
Q  316 gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36667827 gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 36667898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32523435 - 32523062
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32523435 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgttgaaacatcgatttcccaaatatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgttta 32523336  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32523335 atcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttagagtgataacttaa 32523236  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  32523235 gatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacactattgaataa 32523136  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  32523135 atcgctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagggt 32523062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 36039917 - 36040282
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||    
T  36039917 aatatcattcatgtccaaatgatatcgttatttataagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcaaaaagtcgataggatagttta 36040016  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36040017 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 36040116  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaat-aaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36040117 gatagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaaaaaataaaagcaagaataacaacaatattgaata 36040216  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    ||||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  36040217 aatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 36040282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 334
Target Start/End: Original strand, 42700628 - 42700949
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42700628 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 42700727  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42700728 atcgacgatttcccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacttccatgtctagagtgataacttaa 42700827  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  42700828 tatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattaaacaa 42700927  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaa 334  Q
    |||||||  | |||||||||||    
T  42700928 atagctagaaccatatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43992021 - 43991666
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  43992021 aatatcattagtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcg-----------atttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattagatagtttt 43991933  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43991932 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctacagtgataacttaa 43991833  T
Q  213 gatagattgttattcta-tttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43991832 gatagattgttattctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 43991733  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  43991732 aatagctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 43991666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14701150 - 14700774
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  14701150 aatatcattcgtgtctaaaagatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 14701051  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14701050 atcgacgatttcccaacctattaaacgacctaaaaatattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 14700951  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14700950 gatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaacaatattgaata 14700851  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14700850 aataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggt 14700774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Original strand, 9786759 - 9787131
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  9786759 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaggaattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgaatcgttta 9786858  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9786859 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctagagtgataacttaa 9786958  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9786959 gatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaata 9787058  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaa 383  Q
    ||| |||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9787059 aataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa 9787131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 28457532 - 28457906
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||    
T  28457532 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagagattgtttaaatgtctatttcccaaacatttaaacaatcacaaagttgattggatcattta 28457631  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28457632 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 28457731  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28457732 gatagattgttattctatttcttaaacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaca--caagaataacaacaatattaaata 28457829  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| |||||  |  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28457830 aataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 28457906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 36557217 - 36557466
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |  ||    
T  36557217 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttataagggatcgtttaaatgtcaattttccaaacatttacacaatcacaaagtcgattgcattgtata 36557316  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36557317 atcgacgatttcccagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 36557416  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcat 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36557417 gatagattgttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcat 36557466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31758784 - 31758500
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  31758784 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaatgtcgatttaccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 31758685  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||    
T  31758684 atcaacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctggaatgaaaacttaa 31758585  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa 296  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  31758584 gatagcttgttattctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 31758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 24662786 - 24663157
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaat 114  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||||| || ||||||||   |||||    
T  24662786 atcattcgtgtccaaataatgtcgtgatttctaatggattatttaaaagtcgatttcccaaactatttaaataatcacaatgttgattggatcatttaat 24662885  T
Q  115 cgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||     
T  24662886 cgacgatttcccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaatgaaaactta- 24662983  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24662984 gatagattattattttaatcttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataataacaatattgaata 24663083  T
Q  312 aata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    |||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24663084 aataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaag 24663157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40200363 - 40200173
Alignment:
Q  96 gtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt 195  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40200363 gtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgt 40200264  T
Q  196 ctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaa 285  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40200263 ctggaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaa 40200173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 90
Target Start/End: Original strand, 8679450 - 8679527
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatc 90  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8679450 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatc 8679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 387
Target Start/End: Original strand, 36557488 - 36557551
Alignment:
Q  324 catatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  36557488 catatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggt 36557551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 37251560 - 37251934
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251560 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 37251659  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37251660 atcgacgatttcccaaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 37251759  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251760 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 37251859  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37251860 atagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 37251934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 16904264 - 16904629
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16904264 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 16904363  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16904364 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 16904463  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16904464 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 16904563  T
Q  313 ata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  16904564 ataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 16904629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 27166753 - 27167118
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27166753 aatatcattcgtgtccaaatgatattgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 27166852  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27166853 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 27166952  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166953 gataaattgttattctatttctagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 27167052  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  27167053 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc 27167118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33435109 - 33434757
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33435109 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 33435010  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33435009 atcgtcgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 33434910  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33434909 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 33434810  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttga 365  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  33434809 attgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 33434757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9404931 - 9404566
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9404931 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 9404832  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9404831 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9404732  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9404731 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 9404632  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9404631 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 9404566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 11722931 - 11723296
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||    
T  11722931 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgtttgggtagttta 11723030  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11723031 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11723130  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723131 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 11723230  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  11723231 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 11723296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 34869400 - 34869775
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaa-gggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34869400 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattt 34869499  T
Q  112 aatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactta 211  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34869500 aatcgaggatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactta 34869599  T
Q  212 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34869600 agaaagattgttattttatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaatagaacattatatgcaagaataacaacaatattgaata 34869699  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||  | ||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34869700 aatagctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 34869775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11767261 - 11766897
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11767261 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaggggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaaatcgattgggtagttta 11767162  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11767161 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11767062  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11767061 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 11766962  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  11766961 attgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 11766897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34456802 - 34456439
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  34456802 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 34456703  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  34456702 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtc--gagtgataacttaa 34456605  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34456604 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 34456505  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  34456504 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 34456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7315711 - 7315358
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  7315711 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagagatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 7315612  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7315611 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7315512  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7315511 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 7315412  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttga 365  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  7315411 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 30606731 - 30607096
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  30606731 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagagatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 30606830  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30606831 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 30606930  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30606931 gatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 30607030  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  30607031 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 30607096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6270397 - 6270031
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6270397 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagagatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 6270298  T
Q  113 atcgacgatttctc-aaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactta 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6270297 atcgacgatttccccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactta 6270198  T
Q  212 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6270197 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtacatgtccatatcattttgagtctcaataaaacaataaagacaagaataacaacaatattgaata 6270098  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||||||  |  |||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  6270097 aatagctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 6270031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14344968 - 14344666
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  14344968 aatatcattcgtgttcaaatgatatctttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 14344869  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14344868 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 14344769  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14344768 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 14344669  T
Q  313 ata 315  Q
    |||    
T  14344668 ata 14344666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24836229 - 24835877
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24836229 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 24836130  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  24836129 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt-------------ttaa 24836043  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24836042 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 24835943  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  24835942 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 24835877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 70 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31846429 - 31846122
Alignment:
Q  70 tttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaag 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846429 tttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaag 31846330  T
Q  170 tgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31846329 tgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatc 31846230  T
Q  270 tcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatag 369  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||     
T  31846229 tcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatac 31846130  T
Q  370 cttaaaac 377  Q
    || |||||    
T  31846129 ctcaaaac 31846122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32227165 - 32226914
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32227165 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 32227066  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  32227065 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctagagtgataacttaa 32226966  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttt 264  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32226965 gacagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttt 32226914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 143 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7315107
Alignment:
Q  143 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315342 caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaa 7315243  T
Q  243 aagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  7315242 aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaa 7315143  T
Q  342 gagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
     || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7315142 aagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 7315107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 519530 - 519315
Alignment:
Q  19 attcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgac 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  519530 attcgtgtccaaatgatatcgttatctctaagggatcgtttaattgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagttgatttgatcgtttaatcgac 519431  T
Q  119 gatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagataga 218  Q
     ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||| |||||||||||||    
T  519430 aatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatttagaatgaaaacttaagataga 519331  T
Q  219 ttgttattctatttct 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  519330 ttgttattctatttct 519315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 39655694 - 39656067
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||| ||||||  |||||| |||| |||||| || |||| | | ||||    
T  39655694 atcatttgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcagaaagtcaatcggatcgttcaatc 39655793  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctaaagtgataacttaag 213  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | | | |||||| |    
T  39655794 gacgatttcccaatctattaaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaattaaaactta-g 39655891  T
Q  214 atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  39655892 atagattattattttaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaagattgaataa 39655991  T
Q  313 ata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39655992 ataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 39656067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 8995917 - 8996291
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995917 aatatcattcgtgtcaaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 8996016  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8996017 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagcatccatgtctagagtgataacttaa 8996116  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8996117 gatagattgttattctatttctagattcaaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaataataacaacaatattgaataa 8996216  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  8996217 atagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggt 8996291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 38121587 - 38121952
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38121587 aatatcattcgtgtacaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 38121686  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38121687 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 38121786  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38121787 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 38121886  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  38121887 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 38121952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 39000836 - 39001201
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  39000836 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagcgatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgggtagttta 39000935  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39000936 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctagagtgataacttaa 39001035  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39001036 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 39001135  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39001136 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaac 39001201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 33491853 - 33492209
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  33491853 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 33491952  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33491953 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 33492052  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33492053 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataa 33492152  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  33492153 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 33492209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 11738453 - 11738818
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11738453 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaaaatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 11738552  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11738553 gtcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11738652  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11738653 gatagattgttattctatttctagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 11738752  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  11738753 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 11738818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 12167871 - 12168236
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  12167871 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 12167970  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12167971 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 12168070  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12168071 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 12168170  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12168171 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 12168236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 40999759 - 41000124
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||    
T  40999759 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagccttttggatcgttta 40999858  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40999859 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 40999958  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40999959 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaagaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 41000058  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  41000059 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 41000124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 431996 - 432361
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||    
T  431996 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacgaagtcgattggataattta 432095  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  432096 atcgacgatttcccaaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 432195  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  432196 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 432295  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    || ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  432296 attgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 432361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 9667351 - 9667716
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  9667351 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcctttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataattta 9667450  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9667451 atcgacgatttaccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9667550  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9667551 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 9667650  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    || ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  9667651 attgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 9667716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 16832438 - 16832803
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16832438 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattta 16832537  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16832538 atcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 16832637  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16832638 gatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatgcaagaatagcaacaatattgaataa 16832737  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  16832738 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 16832803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Original strand, 44504923 - 44505296
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44504923 aatatcattcgtgtccaaatgatgtcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 44505022  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44505023 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataatttaa 44505122  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44505123 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 44505222  T
Q  313 atagcta-atatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttg-tttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    ||||||| |   |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  44505223 atagctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaag 44505296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49249571 - 49249245
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  49249571 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 49249472  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49249471 atcgacgatttcccaaccgattaaattactcaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaa 49249372  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49249371 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatataattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 49249272  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagat 338  Q
    || |||||  | |||||||||||||||    
T  49249271 ataagctagaaccatatattaaaagat 49249245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36084265 - 36083892
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||    
T  36084265 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttatataatcacaaagtcgattggatcgttta 36084166  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  36084165 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaa 36084066  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36084065 gatagattgttattatatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaata 36083966  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagg 385  Q
    ||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36083965 aataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 36083892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 13217703 - 13218055
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaa-gtcgattggatagctt 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  13217703 aatatcaatcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcccaaaagtcgattggatagttt 13217802  T
Q  112 aatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactta 211  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13217803 aatcgacgatttcccagctaattaaattatccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactta 13217902  T
Q  212 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  13217903 agataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacattaaaggc---aataacaacaatattgaata 13217999  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaat 367  Q
    ||||||||  | | |||||||||  ||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  13218000 aatagctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaat 13218055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16131012 - 16130714
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16131012 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaatatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgttta 16130913  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16130912 atcgacgattccctaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 16130813  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  16130812 gatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaa--------gcaagaataacaacaatattgaataa 16130721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15161934 - 15161612
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||    
T  15161934 aatatcattcatgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaatgtcaatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattgaaccgttta 15161835  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15161834 atcgactatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 15161735  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161734 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 15161635  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaa 334  Q
    ||||||||  | |||||||||||    
T  15161634 aatagctagaaccatatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 9269139 - 9268768
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||   ||||||  || |||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  9269139 atcattcgtgtctaaatgatgtcgtgatttctaatggactatttaaaagtcaattttccaaactattaaacaatca-aaagccgattggatcgtttaatc 9269041  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaag-tgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaaga 214  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||| |||||  || ||||||| | |||  ||||| ||    
T  9269040 gacgatttcccaatcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaaattctatgtctagaatgaacactta-ga 9268942  T
Q  215 tagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaa 313  Q
    |||||| |||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||  |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9268941 tagattattattctgatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgcaagaataataacaatattgaataaa 9268842  T
Q  314 tagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  9268841 tagctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggt 9268768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161242
Alignment:
Q  326 tatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaaccca 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaaccca 15161242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6244605 - 6244334
Alignment:
Q  110 ttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataac 208  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||   |||  || ||||||| | | | |||    
T  6244605 ttaatcgatgatttctcaatctattaaatgacccaataacattaagttcttgattttaaagtgattaccaaaatctaaactctatgtctagaataaaaac 6244506  T
Q  209 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattga 308  Q
    || | ||||||| ||||| ||   |||||||||||||||  | || ||| |||||  ||||| ||  ||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  6244505 ttta-atagattattattttaaccctagattcaaaagtacctttcaataacatttcgaatctaaaataaacattaaacacaagaatgataacaatattga 6244407  T
Q  309 ataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||  ||||   | ||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6244406 ataaaagagctggaaccatatattaaatgatcaagagtttaca-------ttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 6244334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13830515 - 13830420
Alignment:
Q  292 aataacaacaatattgaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13830515 aataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaag-taatacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggt 13830420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 352
Target Start/End: Original strand, 13249135 - 13249254
Alignment:
Q  233 ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaata-aaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatatt 331  Q
    |||||||||||||||| | || ||| |||||||||||  |||| |||||| || | |||||||||   ||||||  |||||| |||||  ||||||||||    
T  13249135 ctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatc-aaatataaacatgaattacaagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatatt 13249233  T
Q  332 aaaagatcaagagtttacata 352  Q
    |||||| ||| || |||||||    
T  13249234 aaaagaacaaaagattacata 13249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22909624 - 22909253
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22909624 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattta 22909525  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22909524 atcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22909425  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22909424 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatat 22909325  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22909324 atagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaag 22909253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 2797218 - 2797592
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2797218 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgaccacaaagtcgattggatagttta 2797317  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2797318 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 2797417  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2797418 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 2797517  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2797518 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 2797592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1275094 - 1274720
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1275094 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 1274995  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1274994 atcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 1274895  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274894 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 1274795  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  1274794 atagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggt 1274720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 10345960 - 10346325
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10345960 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 10346059  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10346060 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 10346159  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10346160 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 10346259  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  10346260 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 10346325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 31157931 - 31158296
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31157931 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 31158030  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31158031 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 31158130  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31158131 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 31158230  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31158231 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 31158296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 32 - 377
Target Start/End: Original strand, 19471864 - 19472209
Alignment:
Q  32 tgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19471864 tgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccg 19471963  T
Q  132 attaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471964 attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatt 19472063  T
Q  232 tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  19472064 tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt 19472163  T
Q  332 aaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19472164 aaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 19472209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31879106 - 31878741
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31879106 aatatcatttgtttccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaaatcgattggatagatta 31879007  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31879006 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataacttaa 31878907  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31878906 gatagattgttattatatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaactgcaagaataacaacaatattgaataa 31878807  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31878806 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 31878741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 8107543 - 8107899
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8107543 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 8107642  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8107643 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 8107742  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8107743 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataa 8107842  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  8107843 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 8107899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6173022 - 6172658
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6173022 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 6172923  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6172922 atcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 6172823  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6172822 gatagattgttattctatttctagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagcaatattgaataa 6172723  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  6172722 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 6172658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2631903 - 2631538
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  2631903 aatatcattcgtgtccaaataatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 2631804  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2631803 atcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 2631704  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2631703 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaataatattgaataa 2631604  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  2631603 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 2631538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23795601 - 23795236
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  23795601 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 23795502  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23795501 atcgacgatttcccaatcgactaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 23795402  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  23795401 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataa 23795302  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23795301 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 23795236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 22321456 - 22321820
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||  ||    
T  22321456 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacttttaaacgatcaaaaagtcaattgggtagtcta 22321555  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22321556 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22321655  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22321656 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaata-tgaataa 22321754  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22321755 ataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 22321820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 45500366 - 45500731
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  45500366 aatatcattcatgtctaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgaccacaaagtcgattggatcgttta 45500465  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45500466 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 45500565  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45500566 gatacattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 45500665  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||| |||  | ||||||||||| | |||| |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  45500666 ataactataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 45500731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 12090115 - 12090481
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12090115 aatatcattcatgtccaaatgatatcgttatttctaagaggttgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaaggatcacaaagtcgattggatagttta 12090214  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12090215 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 12090314  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac-aatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  12090315 gatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaaatattgaata 12090414  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  12090415 aatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaacc 12090481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12191348 - 12190984
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12191348 aatatcaatcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttaa 12191249  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || || || ||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12191248 atagaagaattacaaaacgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtctagagtgataacttaa 12191149  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12191148 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 12191050  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||| | |  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  12191049 atatccagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 12190984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 36 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12184348 - 12184007
Alignment:
Q  36 atcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgatta 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  12184348 atcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaactgatta 12184249  T
Q  136 aattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttcta 235  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12184248 aattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtatagagtgataactcaagatagattgttattctatctcta 12184149  T
Q  236 gattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||     
T  12184148 gattcaaaagtatgtatccatatca-tttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaacaaatagctagaaccatatattaaat 12184050  T
Q  336 gatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  12184049 gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 12184007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2478164 - 2477791
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2478164 atcattcatgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaatgttgattttccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatc 2478065  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    |||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2478064 gacgatttcctaacctattaaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctagagtgataacttaagat 2477965  T
Q  216 agattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2477964 agattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagccttaaatagaagaataacaacaatattgaataaat 2477865  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
     |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2477864 aagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 2477791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 24 - 387
Target Start/End: Original strand, 3544544 - 3544909
Alignment:
Q  24 tgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgattt 123  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  3544544 tgtccaaatgatattgttatttctaagagattgtttaaatgtcgatttctcaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatcgacgattt 3544643  T
Q  124 ctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgtt 223  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3544644 cccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaagatagattgtt 3544743  T
Q  224 attctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctaat 321  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  3544744 attctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctaga 3544843  T
Q  322 atcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3544844 accatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 3544909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24483252 - 24482877
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  24483252 aatatcattcgggtccaaatgatatcgttatttctaatggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 24483153  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24483152 atcgacga-ttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaag-tctagattaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 24483055  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24483054 gataaattattattctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaata 24482955  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagct-taaaacccacaagggt 387  Q
    ||| | |||  | ||||| |||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24482954 aataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggt 24482877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 31664167 - 31664515
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| |||    
T  31664167 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttttaagaggtcgtttaaacatcgattctccaaacatttaaacaataaaaaagtcgattgaatagttta 31664266  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31664267 atcgacgatttc-----------------ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaa 31664349  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31664350 gatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 31664449  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||| ||||| || ||||||    
T  31664450 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaacc 31664515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22820611 - 22820401
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  22820611 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataattta 22820512  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22820511 atcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22820412  T
Q  213 gatagattgtt 223  Q
    |||||||||||    
T  22820411 gatagattgtt 22820401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 385
Target Start/End: Original strand, 29032452 - 29032811
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||   ||||||    
T  29032452 atcatccgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgatcggatcatttaatc 29032551  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    || |||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||    
T  29032552 gatgatttctcaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaa------------aagtgataacttaagat 29032639  T
Q  216 agattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29032640 atatttttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaat 29032739  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagg 385  Q
     |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  29032740 aagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 29032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31882617 - 31882433
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  31882617 aatatcattcgtgtccaaatgatattgttatttccaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaattcgattggatagttta 31882518  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct 197  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882517 atcaatgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct 31882433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818553
Alignment:
Q  210 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa 22818622  T
Q  310 taaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22818621 taaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 22818553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1954431 - 1954285
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1954431 atcattagtgtccaaatgatatcgttatttctatgggatcatttaaacatcgattttctaaacatttatacgatcacaaagtcgattggatcgtttaatc 1954332  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctaga 162  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1954331 gacgatttcctaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaga 1954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1954267 - 1954098
Alignment:
Q  200 agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||            
T  1954267 agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaaagcaag-------- 1954176  T
Q  300 caatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
     |||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  1954175 -aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc 1954098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22825115 - 22825036
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcac 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22825115 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcac 22825036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 4705043 - 4705116
Alignment:
Q  23 gtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaag 96  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4705043 gtgtccaaatgatatcgttagttctaagggatcgtttaaatatcgattttcaaaacatttaaacgatcacaaag 4705116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Original strand, 27951126 - 27951174
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaaca 64  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  27951126 atcattcgtgtctaaatgatgtcatgatttctaatggatcatttaaaca 27951174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13510470 - 13510096
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13510470 aatatcattcgtgtccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 13510371  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13510370 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 13510271  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510270 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 13510171  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13510170 atagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 13510096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13600000 - 13599626
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13600000 aatatcattcgtgtccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 13599901  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13599900 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 13599801  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599800 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 13599701  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13599700 atagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 13599626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 9067822 - 9068187
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9067822 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 9067921  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9067922 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9068021  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9068022 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 9068121  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9068122 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 9068187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3299308 - 3298944
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3299308 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 3299209  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3299208 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 3299109  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3299108 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 3299009  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  3299008 attgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 3298944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 8742938 - 8743303
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8742938 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 8743037  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8743038 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 8743137  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8743138 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 8743237  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8743238 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 8743303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 11308642 - 11309007
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  11308642 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggcagttta 11308741  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11308742 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11308841  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11308842 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaacaatattgaataa 11308941  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  11308942 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 11309007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 28925798 - 28926163
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28925798 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 28925897  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28925898 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 28925997  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28925998 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 28926097  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28926098 ataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 28926163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28370600 - 28370235
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  28370600 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataattta 28370501  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28370500 atcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 28370401  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28370400 gatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 28370301  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28370300 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 28370235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Original strand, 22242898 - 22243269
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  22242898 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcttttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgattacaaagtcgattggatagttca 22242997  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22242998 atcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22243097  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22243098 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaataa 22243197  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaa 383  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  22243198 ataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaa 22243269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27348533 - 27348177
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  27348533 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattgggtagttta 27348434  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27348433 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 27348334  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27348333 gatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 27348234  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27348233 ataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 27348177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 40 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22181081 - 22180737
Alignment:
Q  40 ttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgattaaatt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22181081 ttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatt 22180982  T
Q  140 acccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctatttctagatt 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22180981 acccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagatt 22180882  T
Q  240 caaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  22180881 caaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatc 22180782  T
Q  340 aagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22180781 aaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaag 22180737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 41576986 - 41577342
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  41576986 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 41577085  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  41577086 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaagatccatgtttagagtgataacttaa 41577185  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41577186 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 41577285  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  41577286 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 41577342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 22233505 - 22233880
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  22233505 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgttta 22233604  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22233605 atcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 22233704  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22233705 gatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaata 22233804  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22233805 aacagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 22233880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 34006428 - 34006791
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||    
T  34006428 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcttttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtagataagataattta 34006527  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  34006528 aacgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtatagagtgataacttaa 34006627  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34006628 gatagattgttattctatttatagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 34006726  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  34006727 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 34006791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 22222330 - 22222694
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  22222330 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccgaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgttta 22222429  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22222430 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 22222529  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22222530 gatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaata 22222629  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||  |||||||||            |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22222630 aatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 22222694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Original strand, 4861609 - 4861971
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||    
T  4861609 atcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcgcaaagtcgatcggatcatttaatc 4861708  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4861709 gacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagat 4861808  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4861809 aaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata 4861908  T
Q  316 gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  4861909 gctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 4861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12538670 - 12538290
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  12538670 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaggaattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 12538571  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||   || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12538570 atcgacgattttctaatcgattaaatgacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatatctagagtgataacttaa 12538471  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatt------ttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  12538470 gataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaattttaaatctcaataaaataataaaatcaagaataacaacaatatt 12538371  T
Q  307 gaataaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12538370 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 12538290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16959055 - 16958683
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  16959055 atcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagg-atcgtttaaatgtcaatttctcaaacatttaaacaatcacagagtcgattggatcgtttaatc 16958957  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16958956 gacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaatctatgtctaaagtgataacttaaaat 16958857  T
Q  216 agattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16958856 agattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatagtgaataaat 16958757  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
     |||||  | ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16958756 aagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 16958683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 22228672 - 22229036
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  22228672 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccgaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgttta 22228771  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22228772 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 22228871  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22228872 gatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaata 22228971  T
Q  312 aatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||  |||||||||            |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22228972 aatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 22229036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17993370 - 17993087
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||   || |||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  17993370 atcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcgcaaagtcgatcggatcgtttaatc 17993271  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17993270 gacgattttccaagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagat 17993171  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993170 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 17993087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21692953 - 21692669
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  21692953 aatatcattcgtgtccaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 21692854  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||| |  ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||    
T  21692853 atcaaaaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaatttaa 21692754  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa 296  Q
     |||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  21692753 aatagattgttattctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 21692669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Original strand, 36736861 - 36737117
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  36736861 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatatcgatttcacaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgcatcattta 36736960  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |    
T  36736961 atcgatgatttcccaatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctagagtgaaaactt-a 36737059  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatct 270  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  36737060 gatagattattattctattcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct 36737117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 13848999 - 13849278
Alignment:
Q  29 aaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctca 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| ||    
T  13848999 aaatgatagcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgattttccaaactatttaaatgatcacaaaatcgattggatcatttaatcgatgatttccca 13849098  T
Q  128 accgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattc 227  Q
    | | ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  13849099 atctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatagaatgaaaactta-gatagattgttattc 13849197  T
Q  228 tatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattga 308  Q
    || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13849198 tactcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataataacaatattga 13849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580227
Alignment:
Q  201 gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16580404 gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac 16580305  T
Q  301 aatattgaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  16580304 aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 16580227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Original strand, 22227163 - 22227297
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  22227163 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacattaaaacaatcacaaagtcgactggatcgttta 22227262  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaa 147  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22227263 atcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaa 22227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040857
Alignment:
Q  297 caacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  24040937 caacaatattgaataaatagctaaaaccatatatt-aaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 24040857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17993027
Alignment:
Q  329 attaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggt 17993027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 11859 - 12233
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11859 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtagattggatagttta 11958  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11959 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaa 12058  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12059 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 12158  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  12159 atagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggt 12233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 15629 - 16003
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15629 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagttta 15728  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15729 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaa 15828  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15829 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 15928  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  15929 atagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggt 16003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 13173479 - 13173853
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13173479 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttca 13173578  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13173579 atcgaagatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 13173678  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173679 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 13173778  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  13173779 atagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggt 13173853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 34914195 - 34913821
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34914195 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 34914096  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34914095 atcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 34913996  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34913995 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagcaatattgaataa 34913896  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34913895 atagatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 34913821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25977456 - 25977081
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25977456 aatatcattcgtttccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggttagttta 25977357  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25977356 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 25977257  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25977256 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatacaaaaataacaacaatattgaataa 25977157  T
Q  313 a-tagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25977156 acaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 25977081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 13182012 - 13182386
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13182012 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaaggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttca 13182111  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13182112 atcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 13182211  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13182212 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaataa 13182311  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  13182312 atagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggt 13182386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3539554 - 3539189
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3539554 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 3539455  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3539454 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 3539355  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3539354 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 3539255  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  3539254 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 3539189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14271179 - 14270804
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14271179 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 14271080  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14271079 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 14270980  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14270979 gatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataa 14270880  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || |||||  | |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14270879 ataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 14270804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 9932460 - 9932825
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9932460 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 9932559  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9932560 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9932659  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9932660 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 9932759  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9932760 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 9932825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 26515083 - 26515448
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  26515083 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 26515182  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26515183 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 26515282  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26515283 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 26515382  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  26515383 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 26515448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34007009 - 34006644
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  34007009 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 34006910  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34006909 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 34006810  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34006809 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 34006710  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  34006709 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 34006644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 24160911 - 24161276
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24160911 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattccccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 24161010  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24161011 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgagagtgataacttaa 24161110  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24161111 gatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 24161210  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||| |||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  24161211 ataactagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 24161276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24879372 - 24879007
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24879372 aatatcattcttgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattta 24879273  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879272 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 24879173  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24879172 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgtatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataa 24879073  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  24879072 ataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 24879007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 32806418 - 32806783
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32806418 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaacgtcgattggatagttta 32806517  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32806518 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 32806617  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32806618 gatagatttttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaccaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 32806717  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  32806718 atagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 32806783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 21596183 - 21596548
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  21596183 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttattgctaagaggtcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcaaaaagtcgattggatatttta 21596282  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21596283 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 21596382  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21596383 gatagtttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 21596482  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  21596483 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 21596548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1455298 - 1454928
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1455298 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 1455199  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1455198 atcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 1455099  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||| |||||||     ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1455098 gatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataa 1455004  T
Q  313 a-tagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1455003 acaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 1454928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1466990 - 1466620
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1466990 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcaatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 1466891  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1466890 atcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 1466791  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||| |||||||     ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1466790 gatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataa 1466696  T
Q  313 a-tagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1466695 acaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 1466620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16698416 - 16698088
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16698416 aatatcattcgtgtccaaatgataacgttatttctaagggatcgcttaaaaatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 16698317  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16698316 atcgacgatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 16698217  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16698216 gataggttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 16698117  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaa 341  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||    
T  16698116 atagttagaaccatatattaaatgatcaa 16698088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 5988657 - 5989032
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||    
T  5988657 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaatattcacaacgtcgattggatcgttta 5988756  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  5988757 attgacgatttccctaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaa 5988856  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5988857 gatagattgtta-tctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaata 5988955  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5988956 aataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 5989032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21631687 - 21631333
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||  | |||| ||||| ||||||   ||||||  ||||| | ||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21631687 atcattcgtgtccaaattgtgtcgtgatttccaagggactatttaaaattcgatatcccaaactattacacaatcacaaagtcgattagatcgtttaatc 21631588  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21631587 gacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaacatctatgtctagagtgataacttaagat 21631488  T
Q  216 agattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21631487 agattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaat 21631388  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
     |||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21631387 aagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaata 21631333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15642923 - 15642549
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaat 114  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||    
T  15642923 atcattcttgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggattatttaaaagtcgattttccaaactatttaaataatcacaaagtcgattggatcgtttaat 15642824  T
Q  115 cgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaag 213  Q
    ||||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||   | ||||||| | ||| ||| || |    
T  15642823 cgacgatttcctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtctagaatgaaaacata-g 15642725  T
Q  214 atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| || |||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  15642724 atagattattattctaatcctagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataataacaatattcaataa 15642625  T
Q  313 ata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  15642624 ataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggt 15642549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 9518104 - 9518473
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||    | |||  ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9518104 atcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactactcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgatcggatcgtttaatc 9518203  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatcc-atgtctaaagtgataacttaag 213  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | | | ||||||      
T  9518204 gacgatttctcaatctattaaacgacccaaaagtattaagttcttaattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaataaaaactta-- 9518300  T
Q  214 atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
       |||| ||||||||   |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  9518301 ---gattattattctaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaattatgaataa 9518397  T
Q  313 atag-ctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9518398 ataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 9518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821935
Alignment:
Q  201 gtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa 299  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32822119 gtgataacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaa 32822020  T
Q  300 caatattgaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  32822019 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa-atctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaag 32821935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26604750 - 26604474
Alignment:
Q  110 ttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataac 208  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||  | | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  || ||||||| | | | |||    
T  26604750 ttaatcgacgatttcccaatctattaaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaataaaaac 26604651  T
Q  209 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattg 307  Q
    ||  |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||| | || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26604650 ttt-gatagattattattctaaccctacatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataacaatattg 26604552  T
Q  308 aataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagg 385  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||    
T  26604551 aataaataagctagaatcttatattaaatgatcaa-agattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaagg 26604474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 387
Target Start/End: Original strand, 6867907 - 6868082
Alignment:
Q  214 atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||  | || ||| ||||| |||||| || |||| |||||||  ||||| ||| || |||||  || ||    
T  6867907 atagattattattctaaccctagattcaaaagtacctttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaacacaagactaataaaaatatcaaaaaa 6868006  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || |||||  | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6868007 atgagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggt 6868082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 1232146 - 1232520
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1232146 aatatcattcgtgtccaaaggatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagttta 1232245  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1232246 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctatagtgataacttaa 1232345  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1232346 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaacaatattgaataa 1232445  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1232446 atagctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 1232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9989902 - 9989538
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9989902 aatatcattcgtgtccaaatgatattgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 9989803  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9989802 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9989703  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9989702 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 9989603  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9989602 attgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 9989538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 48167849 - 48168214
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  48167849 aatatcattcgtgttcaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgctcacaaattcgattggatagttta 48167948  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48167949 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 48168048  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168049 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 48168148  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||| |  |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  48168149 atagctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 48168214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 7652877 - 7653242
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  7652877 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 7652976  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7652977 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7653076  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7653077 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataa 7653176  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  7653177 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 7653242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 10385725 - 10386090
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10385725 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 10385824  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10385825 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 10385924  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10385925 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatacaagcaagaataacaacaatattgaataa 10386024  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  10386025 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 10386090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22098173 - 22097809
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22098173 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 22098074  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22098073 atcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22097974  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22097973 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacaatattgaataa 22097874  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || ||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22097873 atggctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 22097809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 37471342 - 37471697
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  37471342 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggataattta 37471441  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37471442 atcgacgatttctcaactgattaaattatccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 37471541  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37471542 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 37471641  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  37471642 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 37471697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 27850206 - 27850571
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27850206 aatatcattcgtgtccaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaacatcggtttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagttta 27850305  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27850306 atcgacgatttctcaaccgattaaattagccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttac 27850405  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27850406 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 27850505  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  27850506 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc 27850571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 4742658 - 4743020
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4742658 aatatcattcgtgaccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 4742757  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4742758 atcgacaatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 4742857  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4742858 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaat-aaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 4742956  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||  | |||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4742957 atagctagaaccatatatt-aatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 4743020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20837600 - 20837235
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  20837600 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacgtcgatttcccaaacattcaaacgatcacgaagtcgattggataattta 20837501  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20837500 atcgatgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctagagtgataacttaa 20837401  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20837400 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaataatattgaataa 20837301  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20837300 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 20837235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 36469091 - 36469456
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||    
T  36469091 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttagatatttta 36469190  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36469191 accgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 36469290  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36469291 gatagattgttattctatgtctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaacaataaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 36469390  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    || ||||  | ||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  36469391 attgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 36469456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 52307740 - 52308105
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  52307740 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcacaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 52307839  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52307840 atcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 52307939  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52307940 gatagattattattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataa 52308039  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  52308040 ataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 52308105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37023197 - 37022867
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37023197 aatatcatccgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgtttttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttt 37023098  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagt--tctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37023097 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaatcatatagattaaaagtgattatcaaatatcaacatccatgtctagagtgataactt 37022998  T
Q  211 aagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37022997 aagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaat 37022898  T
Q  311 aaatagctaatatcatatattaaaagatcaa 341  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  37022897 aaatagctagaaccatatattaaatgatcaa 37022867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45528150 - 45527788
Alignment:
Q  17 tcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcg 116  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45528150 tcattcgtgtccaaatgttgtcgttatttctaagggatcgtttacacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagtttaatcg 45528051  T
Q  117 acgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45528050 acgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagata 45527951  T
Q  217 gattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacatt-aaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45527950 gatttttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 45527851  T
Q  316 gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||  | ||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  45527850 gctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 45527788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3588907 - 3588542
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  3588907 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 3588808  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3588807 atcgacgatttcccaaccgactaaatgacccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 3588708  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3588707 gatagattgttattctatctctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 3588608  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  3588607 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 3588542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 20962911 - 20963200
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20962911 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttcaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 20963010  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20963011 atcgatgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataccttaa 20963110  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaa 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  20963111 gatatattgttattctatttctagattcaaaagtatatgttcatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49434604 - 49434231
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  49434604 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggattgtttaaatgtcgatttctcaaacatttaaataatcacaaagtcgattggatcgttta 49434505  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||    
T  49434504 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgtaaacttaa 49434405  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  49434404 gatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttaaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattaaata 49434305  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaag 384  Q
    ||| || ||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  49434304 aataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaag 49434231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23194423 - 23194055
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||   || |||  | ||||| ||||||  |||||| ||  |||||||||| |||| | ||||||    
T  23194423 atcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagttgatttcccaaactattaaacaattgcaaagtcgatcggatcgtttaatc 23194324  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23194323 gacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagat 23194224  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23194223 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaata---acaatattgaataaata 23194127  T
Q  316 gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    | ||  | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23194126 gatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 23194055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33248496 - 33248121
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  33248496 aatatcattcgcgtccaaatgatatcgttatttctaagagattgtttaaatgtcgatttctcatacatttaaacaatcacaaagttgattggatcgttta 33248397  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33248396 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 33248297  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||    
T  33248296 gatagattgttattctagttcttagacccaaaaatattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacataag-ataacaacaatattgaata 33248198  T
Q  312 aa-tagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || ||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33248197 aattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 33248121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 73 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26335555 - 26335239
Alignment:
Q  73 ccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtga 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26335555 ccaaacatttaaactatcacaaagtcgattggatcatttaattgacgatttccaaacctattaaacgacccataagcattaaattctagattaaaagtga 26335456  T
Q  173 ttatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattcta-tttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctc 271  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  26335455 ttatcaaatattaacatctatatctagagttataacttaagatagattgttattctattttttagatccaaaagtatttgtcaatatcgttttgaatctc 26335356  T
Q  272 aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagc 370  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26335355 aataaagcaataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacc 26335256  T
Q  371 ttaaaacccacaagggt 387  Q
    | |||||||||||||||    
T  26335255 tcaaaacccacaagggt 26335239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23411984 - 23411748
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23411984 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 23411885  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||    
T  23411884 atcgacgatttcccaaccgaataaattacccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaa-----------atgtctagagtgataacttaa 23411796  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411795 gatagatcgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2357664 - 2357297
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| | |   || |||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  2357664 atcatttgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatgaactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggttcatttaatc 2357565  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    || |||||| ||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  2357564 gatgatttcccaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatc--tgtctagagtgataacttaatat 2357467  T
Q  216 agattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357466 agattattattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 2357367  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaa 383  Q
     |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  2357366 aagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaa 2357297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8626130 - 8625931
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8626130 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 8626031  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8626030 atcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataaattaa 8625931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 207 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615645
Alignment:
Q  207 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 8615717  T
Q  307 gaataaat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8615716 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 8615645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22098487 - 22098376
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22098487 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 22098388  T
Q  113 atcgacgatttc 124  Q
    ||||||||||||    
T  22098387 atcgacgatttc 22098376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27104495 - 27104326
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaat 114  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  27104495 atcattcatgtccaaatcatatcgttatttcgaagggatcatttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcgattggatcatttaat 27104396  T
Q  115 cgacgatttctcaaccga----ttaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaa 180  Q
    |||||||||||||| | |    |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27104395 cgacgatttctcaatctatatgttaattgatccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaa 27104326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385538
Alignment:
Q  294 taacaacaatattgaataaata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaac 23385538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12701 - 12325
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12701 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagttta 12602  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12601 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataacttaa 12502  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaac-attaaatgcaagaat-aacaacaatattgaat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12501 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatattgaat 12402  T
Q  311 aaatagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  12401 aaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggt 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 21677322 - 21677688
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21677322 aatatcattcatgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 21677421  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21677422 atcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 21677521  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677522 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 21677621  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  21677622 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc 21677688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 4838791 - 4839156
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  4838791 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 4838890  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4838891 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 4838990  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4838991 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 4839090  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4839091 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 4839156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 5273217 - 5273582
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  5273217 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 5273316  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5273317 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 5273416  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  5273417 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataa 5273516  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  5273517 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 5273582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52619009 - 52618644
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52619009 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 52618910  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52618909 attgacgatttcccgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 52618810  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52618809 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 52618710  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  52618709 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 52618644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 19247483 - 19247848
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19247483 aatatcattcgtatccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatagttta 19247582  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19247583 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 19247682  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247683 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 19247782  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  19247783 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc 19247848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22048188 - 22047823
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  22048188 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 22048089  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22048088 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 22047989  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22047988 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaataaaacaataaaaacaaaaataacaacaatattgaataa 22047889  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  22047888 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 22047823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26070234 - 26069860
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  26070234 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgttaaaacatcgatttctcaaacatttaaacgaccacaaagtcgattagatagttta 26070135  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26070134 atcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacatacatgtctagagtgataacttaa 26070035  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26070034 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtctgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 26069935  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  26069934 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggt 26069860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 323945 - 323589
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  323945 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaacgttgattgggtagttta 323846  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  323845 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagcgtgataacttaa 323746  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  323745 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 323646  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  323645 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 323589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 42532541 - 42532908
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42532541 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 42532640  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42532641 atcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 42532740  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattc-aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42532741 gatagattgttattctagttctagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaata 42532840  T
Q  312 aatagcta-atatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||| |   ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  42532841 aatagctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 42532908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1188471 - 1188106
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1188471 aatatcatacgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagttta 1188372  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1188371 ttcgacgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagcatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 1188272  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  1188271 gatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaataataacaacaatattaaataa 1188172  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  1188171 ataactagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 1188106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 35416351 - 35416700
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  35416351 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcataaagtcgattggatagttta 35416450  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35416451 attgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 35416550  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35416551 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaatatcaataatattgaataa 35416650  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtt 362  Q
    || ||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||    
T  35416651 attgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt 35416700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 40995202 - 40995570
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  40995202 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttctcaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggttcattta 40995301  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40995302 atcgacgatttcccaaccgattaaatgactcaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 40995401  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40995402 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 40995501  T
Q  313 atagctaatatcata---tattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||   ||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  40995502 atagctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaacc 40995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 46691692 - 46692057
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  46691692 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagttgattggatcgttta 46691791  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  46691792 atcgatgatttcccaaccgattaattgacctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtttagagggataacttaa 46691891  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46691892 gatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 46691991  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  46691992 atagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 46692057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 55327279 - 55326909
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55327279 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 55327180  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    | ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55327179 accgacgatttc----ccgattaaattacccaaaaacattaagctctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 55327084  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  55327083 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataa 55326984  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    || |||||  | ||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  55326983 ataagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaa-ccacaagggt 55326909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 26373286 - 26373650
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26373286 aatatcattcgtgtccaaattatattgttatttctaagggattgtttaaacattgatttcccaaacgtttaaacgatcacaaagtcgattggatcgttta 26373385  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26373386 atcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaa 26373485  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26373486 ggtagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaaca-taaaagcaagaataacaacaatattgaataa 26373584  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  26373585 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 26373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 30218042 - 30218420
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  30218042 aatatcattcctgtccaaatgatatcgttatttctaatggatcgtctaaatgtcgatttcccaaacatttaaactatcacaaagtcgattggatct-tta 30218140  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30218141 atcgatgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataacttaa 30218240  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30218241 gatagattgttattctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaacaatattgaata 30218340  T
Q  312 aat----agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||    |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  30218341 aataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggt 30218420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Original strand, 33110360 - 33110732
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33110360 atcattcgtgtccaaatgttgtcgtgatttctaagggattgttcaaatgtcgatctcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatagtttaatc 33110459  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  33110460 gacgatttcccaaccgattaaattacccctgaacattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgataacttaagat 33110559  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat- 314  Q
    ||| | ||||  | || |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33110560 agactcttatgtttttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataacaacaatattgaataaata 33110659  T
Q  315 agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  33110660 agctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggt 33110732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20949253 - 20948880
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagctt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  20949253 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgaccacaaagtcgattggatcattt 20949154  T
Q  112 aatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactta 211  Q
    |||||| |||||  ||| | ||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||| ||||||    
T  20949153 aatcgatgattttccaatctattaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctggaatgaaaactta 20949054  T
Q  212 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20949053 -gatagattgttattctattcctagatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaatacaagaataacaacaatattgaata 20948955  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagg 385  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20948954 aataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagg 20948880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 53895885 - 53895512
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  53895885 aatatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactatttaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 53895786  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  53895785 atagacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaa 53895686  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53895685 gatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaata 53895586  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| |||||  | ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  53895585 aataagctagaaccatatattaaaa---taagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggt 53895512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Original strand, 9417088 - 9417372
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  9417088 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaggggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgattggatcattta 9417187  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||     
T  9417188 atcgacgatttcccaacctattaaacaaaccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttac 9417287  T
Q  213 gatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9417288 gatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa 9417372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 21668560 - 21668703
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21668560 aatatcattcgtgaccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 21668659  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21668660 atcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagt 21668703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 42271883 - 42271781
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42271883 aatatcattcgtgtccaaatgatatcattatttctaaaaggccgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 42271784  T
Q  113 atc 115  Q
    |||    
T  42271783 atc 42271781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 33239424 - 33239375
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaa 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33239424 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaa 33239375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8895276 - 8895205
Alignment:
Q  110 ttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctaga-ttaaaagtgattatcaaa 180  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8895276 ttaatcgatgatttctcaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgatttcaaagtgattatcaaa 8895205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6640170 - 6640110
Alignment:
Q  326 tatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6640170 tatattaaatgatcaa-agattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 6640110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 28554 - 28919
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  28554 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgtttgggtagttta 28653  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28654 atcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 28753  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28754 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 28853  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28854 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 28919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 383
Target Start/End: Original strand, 639 - 1009
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  639 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacattaaaacaatcacaaagtcgattggatcgttta 738  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  739 atcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 838  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  839 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 938  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaa 383  Q
    || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  939 ataagct-acaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9249 - 8884
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9249 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttagacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 9150  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9149 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9050  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9049 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 8950  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8949 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 8884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 378
Target Start/End: Original strand, 116223 - 116588
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  116223 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagttta 116322  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  116323 atcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 116422  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  116423 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaatta 116522  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  116523 atagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaacc 116588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 169063 - 169226
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  169063 aatatcgttcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcaaaaagtcgattgggtagttta 169162  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattat 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  169163 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatttaaagtgattat 169226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 25305 - 25670
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  25305 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcgattggataattta 25404  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25405 atcgacgatttccaaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 25504  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25505 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataa 25604  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  25605 ataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaac 25670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 12143 - 12491
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12143 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagttta 12242  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12243 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 12342  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  12343 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaa--------gcaagaataacaacaatattgaataa 12434  T
Q  313 at-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    || |||||  | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  12435 ataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Original strand, 76107 - 76462
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  76107 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacaacgatttcccaatgatttaaacgatcacaaagtcgattgaatagttta 76206  T
Q  113 atcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  76207 atcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 76306  T
Q  213 gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76307 gatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 76406  T
Q  313 atagctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata 368  Q
    |||||||  | |||| |||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  76407 atagctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaata 76462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7235 - 6873
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7235 atcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaaagatcacaaagtcgattggataacttaatc 7136  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7135 gacgattttccaaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaaaat 7036  T
Q  216 agattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaata 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7035 atattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata 6936  T
Q  316 gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacc 378  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  6935 gctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacc 6873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 387
Target Start/End: Original strand, 16127 - 16502
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagctt 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16127 aatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcgattggatcgttt 16226  T
Q  112 aatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataactta 211  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||     
T  16227 aatcgatgatttcccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctagaatgaaaactt- 16325  T
Q  212 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 311  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16326 agatagattgttatataattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaatacaagaataacaaccatattgaata 16425  T
Q  312 aat-agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
    ||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  16426 aataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggt 16502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14689 - 14317
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14689 atcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttataatggaccatttaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggatcgtttaatc 14590  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagat 215  Q
    ||||||||  ||| | ||||||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  14589 gacgattttccaatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaaacttaagat 14490  T
Q  216 agattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat 314  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14489 agattgttattctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatattgaataaat 14390  T
Q  315 -agctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaagggt 387  Q
     | |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14389 aaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 14317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 241 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7205
Alignment:
Q  241 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatca 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 7242  T
Q  341 agagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7241 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 241 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11819
Alignment:
Q  241 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatca 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 11856  T
Q  341 agagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11855 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7340
Alignment:
Q  132 attaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7420 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12034 - 11954
Alignment:
Q  132 attaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12034 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 241 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9814
Alignment:
Q  241 aaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaatatcatatattaaaagatca 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca 9851  T
Q  341 agagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaac 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9850 agagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10029 - 9949
Alignment:
Q  132 attaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaa 212  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10029 attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 34981 - 35196
Alignment:
Q  16 atcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagcttaatc 115  Q
    |||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||   ||||||  ||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  34981 atcattcgtgtccaaatgatgttgtgatttctaatggactatttaaaagtcgatttcccaaactattaaataatcacaaagtcgatcggatcgtttaatc 35080  T
Q  116 gacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctaga-ttaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaaga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||     
T  35081 gacgatttcccaaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatc----tatagagtgataacttaagg 35176  T
Q  215 tagattgttattctatttct 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35177 tagattgttattctatttct 35196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 388
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35313
Alignment:
Q  288 caagaataacaacaatattgaataaata-gctaatatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatagcttaaaacccacaaggg 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  35212 caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatgg 35311  T
Q  387 tg 388  Q
    ||    
T  35312 tg 35313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 5002 - 5107
Alignment:
Q  13 aatatcattcgtgtctaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagctta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  5002 aatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagaggtcatttaaacatcgatttccttaacatttaaacgttcacaaagttgattggatagttta 5101  T
Q  113 atcgac 118  Q
    ||||||    
T  5102 atcgac 5107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University