View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1949_low_11 (Length: 292)

Name: NF1949_low_11
Description: NF1949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1949_low_11
NF1949_low_11
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (50-275)||(12756422-12756647)
chr2 (50-275)||(45418940-45419165)
chr2 (50-275)||(31581204-31581427)
chr2 (64-275)||(18981964-18982173)
chr2 (52-275)||(6403386-6403608)
chr2 (50-271)||(26162291-26162511)
chr2 (52-275)||(41251216-41251438)
chr2 (50-275)||(44084186-44084413)
chr2 (50-275)||(7072119-7072341)
chr2 (50-275)||(4554777-4555002)
chr2 (52-275)||(17444623-17444845)
chr2 (67-275)||(35963068-35963274)
chr2 (50-275)||(2286150-2286371)
chr2 (50-275)||(26238300-26238523)
chr2 (50-275)||(8058928-8059142)
chr2 (118-275)||(2957729-2957886)
chr2 (142-275)||(32126772-32126905)
chr2 (118-275)||(42442411-42442568)
chr2 (50-173)||(8147709-8147832)
chr2 (67-255)||(37621666-37621853)
chr2 (67-255)||(21556471-21556658)
chr2 (185-275)||(45121701-45121791)
chr2 (140-263)||(15441781-15441904)
chr2 (148-275)||(18829312-18829439)
chr2 (67-265)||(816652-816849)
chr2 (67-154)||(42442338-42442423)
chr2 (148-250)||(26591498-26591599)
chr2 (67-154)||(2957874-2957959)
chr2 (116-265)||(25391404-25391552)
chr2 (50-156)||(45121591-45121697)
chr2 (140-275)||(17373422-17373558)
chr2 (88-128)||(32126895-32126935)
chr2 (114-191)||(2042746-2042822)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (50-275)||(43184053-43184278)
chr7 (50-275)||(8867316-8867541)
chr7 (81-275)||(40919606-40919800)
chr7 (50-275)||(7003082-7003307)
chr7 (50-275)||(7048953-7049178)
chr7 (50-275)||(26625103-26625327)
chr7 (50-275)||(33685920-33686145)
chr7 (67-275)||(3113705-3113911)
chr7 (67-275)||(5555840-5556046)
chr7 (52-275)||(14776689-14776911)
chr7 (50-275)||(8394486-8394708)
chr7 (50-275)||(36631177-36631399)
chr7 (59-275)||(36658545-36658750)
chr7 (142-271)||(34388669-34388798)
chr7 (164-275)||(38637967-38638078)
chr7 (68-267)||(11020622-11020825)
chr7 (197-275)||(37001825-37001903)
chr7 (140-275)||(49010181-49010316)
chr7 (50-128)||(34388788-34388866)
chr7 (140-249)||(20606072-20606181)
chr7 (140-275)||(13072445-13072580)
chr7 (50-113)||(37001904-37001967)
chr7 (140-249)||(20609365-20609474)
chr7 (140-249)||(20611854-20611963)
chr7 (116-221)||(32199111-32199215)
chr7 (115-250)||(23581433-23581567)
chr7 (116-231)||(45709938-45710052)
chr7 (67-228)||(33386975-33387134)
chr7 (217-275)||(12224568-12224626)
chr7 (156-249)||(28837399-28837491)
chr7 (69-173)||(8725268-8725371)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (50-275)||(43143169-43143394)
chr4 (50-275)||(3292481-3292706)
chr4 (50-275)||(6689820-6690045)
chr4 (50-275)||(35546310-35546534)
chr4 (50-275)||(42333359-42333586)
chr4 (50-275)||(30216330-30216552)
chr4 (50-275)||(28876899-28877124)
chr4 (50-275)||(48989686-48989911)
chr4 (50-275)||(29995567-29995794)
chr4 (50-275)||(6235869-6236092)
chr4 (50-275)||(10352468-10352694)
chr4 (52-275)||(26438861-26439083)
chr4 (50-275)||(33136029-33136254)
chr4 (50-272)||(25931069-25931289)
chr4 (52-275)||(20129676-20129898)
chr4 (52-275)||(34406866-34407088)
chr4 (52-275)||(43356267-43356489)
chr4 (52-275)||(47501136-47501358)
chr4 (50-275)||(40529376-40529599)
chr4 (52-275)||(13012551-13012773)
chr4 (50-275)||(17510812-17511039)
chr4 (50-271)||(30077224-30077445)
chr4 (50-275)||(36381931-36382153)
chr4 (50-275)||(50204673-50204888)
chr4 (50-275)||(48130336-48130560)
chr4 (50-275)||(30110321-30110545)
chr4 (50-237)||(1818074-1818262)
chr4 (50-179)||(26448409-26448538)
chr4 (142-236)||(13394865-13394959)
chr4 (50-128)||(13394949-13395027)
chr4 (77-228)||(29094531-29094683)
chr4 (70-275)||(44157023-44157206)
chr4 (67-275)||(29134215-29134421)
chr4 (120-249)||(31853655-31853783)
chr4 (115-275)||(4038289-4038448)
chr4 (111-277)||(16877507-16877673)
chr4 (140-275)||(9415346-9415481)
chr4 (153-264)||(13502213-13502324)
chr4 (229-275)||(13391032-13391078)
chr4 (154-275)||(26546884-26547005)
chr4 (140-265)||(56225751-56225876)
chr4 (222-272)||(26448544-26448591)
chr4 (140-222)||(5290888-5290970)
chr4 (234-266)||(19168356-19168388)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (50-275)||(16787610-16787835)
chr8 (52-275)||(4404367-4404590)
chr8 (50-275)||(9877577-9877802)
chr8 (50-272)||(23402465-23402687)
chr8 (50-275)||(42231294-42231519)
chr8 (50-275)||(3648377-3648600)
chr8 (52-275)||(39914877-39915099)
chr8 (50-271)||(40470130-40470350)
chr8 (50-275)||(2728778-2729006)
chr8 (50-275)||(378782-379006)
chr8 (118-275)||(34136386-34136543)
chr8 (67-275)||(29727967-29728171)
chr8 (150-275)||(7278480-7278605)
chr8 (50-238)||(36408897-36409093)
chr8 (50-275)||(15838646-15838857)
chr8 (50-154)||(34136531-34136635)
chr8 (173-275)||(3435726-3435828)
chr8 (67-248)||(32540076-32540256)
chr8 (101-265)||(9175543-9175706)
chr8 (140-275)||(29351809-29351944)
chr8 (139-275)||(19033-19170)
chr8 (50-146)||(3435622-3435722)
chr8 (67-275)||(40401091-40401298)
chr8 (150-204)||(15863282-15863336)
chr8 (148-206)||(32750375-32750433)
chr8 (235-275)||(17479972-17480012)
chr8 (234-275)||(33639179-33639220)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (50-275)||(31680724-31680949)
chr5 (50-275)||(33430678-33430903)
chr5 (50-275)||(17332204-17332429)
chr5 (50-276)||(12278440-12278669)
chr5 (54-275)||(31501303-31501524)
chr5 (50-275)||(13818338-13818561)
chr5 (67-275)||(10034280-10034486)
chr5 (52-275)||(26282900-26283122)
chr5 (69-275)||(15959530-15959736)
chr5 (50-275)||(36291728-36291953)
chr5 (52-275)||(36293203-36293425)
chr5 (52-275)||(39435059-39435281)
chr5 (67-264)||(39657125-39657320)
chr5 (50-275)||(1775960-1776182)
chr5 (67-275)||(16333484-16333690)
chr5 (50-275)||(16155358-16155579)
chr5 (50-275)||(192264-192489)
chr5 (50-275)||(38269005-38269219)
chr5 (142-275)||(37255054-37255187)
chr5 (165-275)||(43069329-43069439)
chr5 (50-128)||(37254986-37255064)
chr5 (148-275)||(23034430-23034557)
chr5 (208-275)||(28801716-28801783)
chr5 (138-275)||(31271852-31271989)
chr5 (50-128)||(43069235-43069313)
chr5 (140-265)||(27750684-27750807)
chr5 (168-247)||(24792892-24792971)
chr5 (117-191)||(30297621-30297693)
chr5 (149-249)||(23034262-23034362)
chr5 (116-222)||(20368468-20368573)
chr5 (153-271)||(18266195-18266317)
chr5 (140-249)||(35911341-35911450)
chr5 (143-255)||(22761177-22761287)
chr5 (115-201)||(11779220-11779303)
chr5 (140-248)||(8788265-8788373)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (50-275)||(28997087-28997312)
chr6 (50-273)||(33228922-33229146)
chr6 (52-275)||(398980-399202)
chr6 (67-275)||(34948366-34948572)
chr6 (50-275)||(29743640-29743867)
chr6 (50-193)||(18339450-18339594)
chr6 (67-261)||(13838174-13838366)
chr6 (140-271)||(10231748-10231879)
chr6 (143-264)||(31373279-31373400)
chr6 (140-265)||(28931456-28931581)
chr6 (116-231)||(22814712-22814826)
chr6 (115-264)||(12849976-12850124)
chr6 (53-128)||(23217377-23217451)
chr6 (150-265)||(21556351-21556470)
chr6 (216-265)||(23217452-23217501)
chr6 (115-179)||(12098413-12098476)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (50-275)||(6503154-6503379)
chr3 (50-275)||(45183338-45183562)
chr3 (50-270)||(33041310-33041529)
chr3 (50-275)||(6930478-6930704)
chr3 (50-275)||(19565085-19565311)
chr3 (50-275)||(40081324-40081547)
chr3 (50-275)||(27935534-27935758)
chr3 (50-275)||(5135645-5135870)
chr3 (52-275)||(6269008-6269230)
chr3 (52-275)||(22968026-22968248)
chr3 (52-275)||(39772153-39772375)
chr3 (52-275)||(19390509-19390731)
chr3 (50-263)||(34083715-34083926)
chr3 (50-275)||(45336231-45336456)
chr3 (162-275)||(11017854-11017967)
chr3 (51-275)||(38282774-38282987)
chr3 (50-124)||(11017958-11018032)
chr3 (54-255)||(29564759-29564954)
chr3 (116-275)||(27912430-27912586)
chr3 (119-249)||(35937650-35937778)
chr3 (86-224)||(8257223-8257359)
chr3 (148-265)||(219199-219316)
chr3 (140-220)||(19814766-19814846)
chr3 (148-228)||(38415440-38415520)
chr3 (114-177)||(48559591-48559653)
chr3 (115-172)||(2592308-2592363)
chr3 (123-168)||(5177307-5177352)
chr3 (64-165)||(40368604-40368704)
chr3 (114-165)||(39326640-39326689)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (81-275)||(53295-53489)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (50-275)||(3829340-3829564)
chr1 (50-275)||(41971842-41972067)
chr1 (50-275)||(42310524-42310747)
chr1 (59-268)||(33490071-33490281)
chr1 (67-275)||(7433798-7434004)
chr1 (50-274)||(32981641-32981863)
chr1 (104-275)||(17445705-17445876)
chr1 (101-275)||(23313403-23313577)
chr1 (142-275)||(35907977-35908110)
chr1 (133-275)||(11957934-11958076)
chr1 (50-128)||(35907909-35907987)
chr1 (141-275)||(28463396-28463519)
chr1 (148-265)||(3604706-3604824)
chr1 (114-265)||(18716341-18716491)
chr1 (170-265)||(5715404-5715499)
chr1 (235-275)||(30094650-30094690)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (52-275)||(480039-480261)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (148-275)||(18015-18143)
[»] scaffold2142 (1 HSPs)
scaffold2142 (52-168)||(885-999)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (53-264)||(17669-17878)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (140-271)||(8468-8599)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (168-247)||(35275-35354)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12756647 - 12756422
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12756647 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 12756548  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756547 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 12756448  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12756447 gggaactaaatttgacttgtgagtat 12756422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 45418940 - 45419165
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45418940 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaactaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 45419039  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419040 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 45419139  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45419140 gggaactaaatttgacttgtgagtat 45419165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31581427 - 31581204
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  31581427 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 31581330  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581329 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 31581230  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31581229 gggaactaaatttgacttgtgagtat 31581204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 275
Target Start/End: Original strand, 18981964 - 18982173
Alignment:
Q  64 acattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18981964 acattaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaaacaa 18982061  T
Q  164 tttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttg 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18982062 tttataattaatttttatctcgtttaaaaattacaaaatttcatcgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttg 18982161  T
Q  264 acttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||    
T  18982162 acttgtgagtat 18982173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6403608 - 6403386
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6403608 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 6403511  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6403510 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 6403411  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6403410 ggaactaaatttgacttgtgagtat 6403386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26162511 - 26162291
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  26162511 catacatgtttagcacattaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattat-aatttttattccctcataattatg 26162413  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26162412 aattttttaaacaatttataactaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattctgaaggtccttatcatgttctagtcatacctacaaaatta 26162313  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtga 271  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26162312 gggaactaaatttgacttgtga 26162291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41251438 - 41251216
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  41251438 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 41251341  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41251340 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 41251241  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41251240 ggaactaaatttgacttgtgagtat 41251216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44084413 - 44084186
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa--ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattt 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||     
T  44084413 catacatgtttagcacgttaaagtatagctttacacaaaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttattccctcataatta 44084314  T
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44084313 tgaatttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttattatcattttctagtcatgcctacaaaat 44084214  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44084213 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 44084186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7072341 - 7072119
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  7072341 catacatg-ttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcgtaattatg 7072245  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072244 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaataactacaaaatttcattgggaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 7072145  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7072144 gggaactaaatttgacttgtgggtat 7072119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4555002 - 4554777
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |    
T  4555002 catacatgtttagcacgttaaaaaatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccatggataaattaattatgaatttttattccctcgtaattaag 4554903  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4554902 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaatgttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 4554803  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||    
T  4554802 gagaattaaatttgacttgttagtat 4554777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17444845 - 17444623
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  17444845 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaacagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 17444748  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg-ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444747 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaaggtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 17444648  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17444647 ggaactaaatttgacttgtgagtat 17444623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 35963068 - 35963274
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35963068 ttaaaatatagttttacacaata--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttattaaacaattt 35963165  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35963166 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttgtcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 35963265  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  35963266 tgtgagtat 35963274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 2286150 - 2286371
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  2286150 catacatgtttagcacgttaaaatatagttttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttt-atcccctcataattatg 2286246  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2286247 aatttcttaaacaatttataattaagttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 2286346  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  2286347 ggaaactaaatttg-cttgtgagtat 2286371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 26238300 - 26238523
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||    
T  26238300 catacatgtttagcacgttaaattatatctttacacaaaaa-ttaaatttcttcgaaaagggataaatta-ttatgaatttttatcccctcgtaattatg 26238397  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26238398 aattttataaacaatttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 26238497  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26238498 gggaactaaatttgccttgtgagtat 26238523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8059142 - 8058928
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||    
T  8059142 catacatgtttaacacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttctaccagggataaattaaatatgaatttttattccctcataattatg 8059043  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  8059042 aatttcttaaacaatttataattaatttgcatcttgtttaaagactacgaaatttcattgggaaggttcttat-----------catgcctacaaaatta 8058954  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8058953 gggaactaaatttgacttgtgagtat 8058928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2957886 - 2957729
Alignment:
Q  118 taattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt 217  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  2957886 taattatgaatttttattccctcatatttatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgtaggtt 2957787  T
Q  218 cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2957786 cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 2957729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32126905 - 32126772
Alignment:
Q  142 taattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgccta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32126905 taattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcactttgaaggttattatcatgttctagtcatgccta 32126806  T
Q  242 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32126805 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 32126772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Original strand, 42442411 - 42442568
Alignment:
Q  118 taattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt 217  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||    
T  42442411 taattatgaatttttattccctcatatttatgaatttcttaaacaatttatagttaatttatatctcgtttaaaaattataaaatttcattgtgaatgtt 42442510  T
Q  218 cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42442511 cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattatggaactaaatttgacttgtgagtat 42442568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Original strand, 8147709 - 8147832
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8147709 catacatgattagcacattaaaatatagctttatataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcatttcctcataattatg 8147808  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattatta 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  8147809 aatttcttaaacaatttataatta 8147832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37621853 - 37621666
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| | |||| | |||| || ||   ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||     
T  37621853 ttaaaacatagttttacacaaaaaatcagatttttccgactagggacggattaattatgaatttttattccc-cataattatgaatttcttaaataattc 37621755  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaac 255  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37621754 ataattaattcgtatctcgtttaaaaacttcaaaatttcattgtgaaggttcttatgatgttctaaccatgcctacaaaattagagaac 37621666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 255
Target Start/End: Original strand, 21556471 - 21556658
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| |||| | |||| || ||  || | ||||||||| || ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  21556471 ttaaaacatggctttacacaaaaaattagatttttccgactagggacgaaattattatgaatttttatttca-cataattatgaatttcttaaacaattc 21556569  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaac 255  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  21556570 ataattaatttgtatctcgtttaaaaactccaaaatttcatggtgaaggttcttatgatgttccaaccatgcctacaaaattagagaac 21556658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 275
Target Start/End: Original strand, 45121701 - 45121791
Alignment:
Q  185 gtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45121701 gtttaaaaactacaaaatttcattgtgaagtttcttatcatgttttagtcatacgtacaaaattagggaactaaatttgacatgtgagtat 45121791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15441904 - 15441781
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||  ||||  |||||| | | ||||||||||||||    
T  15441904 cataattatgaatttcttaaacaattcataattaatttgtgtctcatttaaaaaatccaaaatttcatggtgatagttcttgtgaagttctagtcatgcc 15441805  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttg 263  Q
    |||||||||||  ||| |||||||    
T  15441804 tacaaaattagaaaacgaaatttg 15441781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 18829312 - 18829439
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  18829312 tgaatttcttaaacaattcataattaattcgtatattgtttaaaaacttctaaatttcacggtgaatgttcttatgatgttctaactatgcctacaaaat 18829411  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||| ||||  ||||||||  ||||||||    
T  18829412 tagagaacggaatttgacccgtgagtat 18829439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 816849 - 816652
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||  ||| ||| || |||   |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  816849 ttaaaatacaactttacataaaatattagattttttcgactagagacgaattaggtataaattttaatttg-tcataattatgaattttttaaacaattc 816751  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    || |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||| ||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  816750 ataattaatttgtctctcctttaaaaactccaaaatttcaaagtgatagttcttataatgctcctaccatgcctacaaaattaggaaacaaaatttgac 816652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 42442338 - 42442423
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaattt 154  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  42442338 ttaaattatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcaaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaattt 42442423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 250
Target Start/End: Original strand, 26591498 - 26591599
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||    
T  26591498 tgaatttcttaaacaattcataattaatttgtatctcgtttaaaaactctaaaatttcttggtgaaggttcttat-atggtctaaccatgcctaaaaaat 26591596  T
Q  248 tag 250  Q
    |||    
T  26591597 tag 26591599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2957959 - 2957874
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaattt 154  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  2957959 ttaaattatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcaaccagggataaattaattatgaatttttatttcctcataattatgaattt 2957874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 265
Target Start/End: Original strand, 25391404 - 25391552
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    ||||||||||||| || |||| | ||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| || | |||| |||||| ||| |||||||| |  ||||| |    
T  25391404 attaattatgaatttttattctc-cataattataaattttttaaacaattcataattaacttatttctcctttaaaaactccaaaattttatggtgaaag 25391502  T
Q  216 ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  25391503 tacttatgatgttctaaccatgcctacaaaattagtgaatgaaatttgac 25391552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 156
Target Start/End: Original strand, 45121591 - 45121697
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| || || ||  |  ||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||    
T  45121591 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttataaaaaaaattaattttttttgagcaatgccaaattaattatgaatttttattcccccattattatg 45121690  T
Q  150 aatttct 156  Q
    |||||||    
T  45121691 aatttct 45121697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17373558 - 17373422
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttct-agtcatgc 238  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||  | ||||||| ||||| | |||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |  |||||    
T  17373558 cataattatgaatttcctaaaaaattcgtaattaattcgtatcacatttagaaactccaaaatttcatggtgaatgttcttatgatgtttttaaccatgc 17373459  T
Q  239 ctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||    
T  17373458 ctacaaaattagagaatgaaatttgacccgtgagtat 17373422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32126935 - 32126895
Alignment:
Q  88 aaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32126935 aaaattaaatttcttcgaccatggataaattaattatgaat 32126895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2042822 - 2042746
Alignment:
Q  114 aaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaa 191  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  2042822 aaattaattatgaattttcatttcc-cataattgtaaattttttaaacaattcataattaattcgtccctcgtttaaa 2042746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43184278 - 43184053
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43184278 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 43184179  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43184178 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 43184079  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43184078 gggaactaaatttgacttgtgagtat 43184053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8867541 - 8867316
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8867541 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccttcataattatg 8867442  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8867441 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatcttgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 8867342  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8867341 gggaactaaatttgacttgtgagtat 8867316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40919800 - 40919606
Alignment:
Q  81 tacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40919800 tacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattgattatgaattttcattccctcataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgta 40919701  T
Q  181 tctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40919700 tctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 40919606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 7003082 - 7003307
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||    
T  7003082 catacatgtttagcacgttaaaatatagttttacataaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattcccacataattatg 7003181  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7003182 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatatcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 7003281  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  7003282 gggaactaaacttgacttgttagtat 7003307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 7048953 - 7049178
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||    
T  7048953 catacatgtttagcacgttaaaatatagttttacataaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattcccacataattatg 7049052  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7049053 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatatcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 7049152  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  7049153 gggaactaaacttgacttgttagtat 7049178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 26625103 - 26625327
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||    
T  26625103 catacatgattaacacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgttttttcatttcctcataattatg 26625202  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26625203 aatctct-aaacaatttataattaatttgtatctcatttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 26625301  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26625302 gggaactaaatttaacttgtgagtat 26625327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 33685920 - 33686145
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||    
T  33685920 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattatgaccttttattccctcataattatg 33686019  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33686020 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaattttattgtgaagattcttatcatgttctagtcatgcctacaaaagta 33686119  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33686120 gggaactaaatttgacttgtgagtat 33686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3113911 - 3113705
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3113911 ttaaaatatagctttacacaata--ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaaacaattt 3113814  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3113813 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttgtcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 3113714  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  3113713 tgtgagtat 3113705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 5555840 - 5556046
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5555840 ttaaaatatagctttacacaata--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaaacaattt 5555937  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5555938 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttgtcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 5556037  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  5556038 tgtgagtat 5556046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14776911 - 14776689
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14776911 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 14776814  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14776813 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatattctagtcatgcctacaaaattag 14776714  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14776713 ggaactaaatttgacttgtgagtat 14776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 8394486 - 8394708
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  8394486 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 8394583  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8394584 aatttcttaaacaatttataattaatttatatctcatttaaaaattacaaaatttcatcgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 8394683  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  8394684 gggaactaaattt-tcttgtgagtat 8394708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 36631177 - 36631399
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  36631177 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 36631274  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36631275 aatttcttaaacaattgataattaaattgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaagttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 36631374  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  36631375 gagaactaaatttg-cttgtgagtat 36631399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Original strand, 36658545 - 36658750
Alignment:
Q  59 ttagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttctta 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36658545 ttagcacgttaaaatatagctttacataaaaaaataaatttcttcgaacagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttctta 36658644  T
Q  159 aacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaa 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||           ||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  36658645 aacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaattttattgtgaag-----------gttctagtcttgcctacagaattagggaattaa 36658733  T
Q  259 atttgacttgtgagtat 275  Q
    |||| ||||||||||||    
T  36658734 atttcacttgtgagtat 36658750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34388798 - 34388669
Alignment:
Q  142 taattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgccta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34388798 taattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttccagtcatgccta 34388699  T
Q  242 caaaattagggaactaaatttgacttgtga 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34388698 caaaattagggaactaaatttgacttgtga 34388669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38638078 - 38637967
Alignment:
Q  164 tttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttg 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38638078 tttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaaattcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttg 38637979  T
Q  264 acttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||    
T  38637978 acttgtgagtat 38637967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11020825 - 11020622
Alignment:
Q  68 taaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttc---gacca-gagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaa 163  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||  | | |||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11020825 taaaatataactttacacaaaaaattaaatttcttcagggataaagggataaattaattatgaatttttattatctcgtaattataaatttcttaaacaa 11020726  T
Q  164 tttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttg 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11020725 tttataattaatttgtatctcgtttaaaaactccaaaatttcgttgtgaaggttcttatcattgtctagtcatgcctacaagattagggaactaaatttg 11020626  T
Q  264 actt 267  Q
    ||||    
T  11020625 actt 11020622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37001903 - 37001825
Alignment:
Q  197 caaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37001903 caaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 37001825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Original strand, 49010181 - 49010316
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||     
T  49010181 cataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtctctcgtttaaaaattgcaaaacttcattgtgaagattcttattatgttctaaccatgct 49010280  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  49010281 tataaaattagggaacgaaatttgacctgtgagtat 49010316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34388866 - 34388788
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34388866 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgatcagagataaattaattatgaat 34388788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 249
Target Start/End: Original strand, 20606072 - 20606181
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20606072 cataattatgaatttcttaaacaattcataattaatttgtatctcatttaaaaacttcaaaatttcatggtgaaggttcttatcatgttctaaccatgcc 20606171  T
Q  240 tacaaaatta 249  Q
    |||| |||||    
T  20606172 tacagaatta 20606181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13072580 - 13072445
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||| ||    
T  13072580 cataattatgaatttcttaaacaattcataattaattagtatctcgtttaaaatctccaaaatttcatggtgaaggttcttatgatattctaaacatacc 13072481  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  13072480 tccaaaattagagaacaaaatttgacccgtgagtat 13072445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37001967 - 37001904
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagat 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37001967 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagat 37001904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 249
Target Start/End: Original strand, 20609365 - 20609474
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  20609365 cataattatgaatttcttaaactattcataattaatttgtatctcatttaaaatcttcaaaattgcatggtgaaggttcttatcttgttctaaccatgcc 20609464  T
Q  240 tacaaaatta 249  Q
    |||| |||||    
T  20609465 tacagaatta 20609474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 249
Target Start/End: Original strand, 20611854 - 20611963
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   |||||    
T  20611854 cataattatgaatttcttaaactattcataattaatttgtatctcatttaaaatcttcaaaattgcatggtgaaggttcttatcatgttctaactatgcc 20611953  T
Q  240 tacaaaatta 249  Q
    |||| |||||    
T  20611954 tacagaatta 20611963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 32199111 - 32199215
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||     
T  32199111 attaattatgaattttcattcc-tcctaattaagaatttcataaacaatttttaattaatttgtctctcgtttaaaaactataaaattccacggtgaaga 32199209  T
Q  216 ttctta 221  Q
    ||||||    
T  32199210 ttctta 32199215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 250
Target Start/End: Original strand, 23581433 - 23581567
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaag 214  Q
    |||| ||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||     
T  23581433 aatttattatgattttttattccc-cataattaagaatttctttaacaattcataattaattagtatctcgtttaacaactccaaaatttcatggtgaaa 23581531  T
Q  215 gttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23581532 gttcttataatgttttaacgatgcctacaaaattag 23581567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 45709938 - 45710052
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||  |  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||     
T  45709938 attaattatgaattttcattcc-tcattattaagaattacttaaacaatttataattaattcttccctcgttcaaaaactctaaaatttcatggtgaaga 45710036  T
Q  216 ttcttatcatgttcta 231  Q
    ||||||| ||||||||    
T  45710037 ttcttataatgttcta 45710052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 33386975 - 33387134
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||| || ||   ||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  33386975 ttaaaatatgcctttacacaaataattaaatttttccgactag-gacggattaattatgaatttttactcc-tcataattatgaatttcttaaacaattc 33387072  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgtt 228  Q
    || |||||||| |  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||| ||| |||| |||||    
T  33387073 ataattaatttatcactcgttcaaaaactcaaaaatttcatggtgaaagttattattatgtt 33387134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12224626 - 12224568
Alignment:
Q  217 tcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  12224626 tcttatgatgttctaatcatgcctataaaattagggagcgacatttgacatgtgagtat 12224568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28837491 - 28837399
Alignment:
Q  156 ttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| || |||||  ||| |||| |||||||    
T  28837491 ttaaacaattcat-attaatttgtttctcgttaaaaaactctaaaatttcattgtgaaggtttttatgatattctaaccatacctagaaaatta 28837399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8725371 - 8725268
Alignment:
Q  69 aaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttat 168  Q
    ||||||||| |||||  |||||| || |||| |||||| |  || | ||||||||||||| || ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8725371 aaaatatagatttacgcaaaaaaatagattttttcgactaatgaaagattaattatgaatttttatttcc-cataattataaatttcttaaacaatttat 8725273  T
Q  169 tatta 173  Q
     ||||    
T  8725272 aatta 8725268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43143394 - 43143169
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43143394 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 43143295  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43143294 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaatta 43143195  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43143194 gggaactaaatttgacttgtgagtat 43143169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3292706 - 3292481
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3292706 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 3292607  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3292606 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctaatcatgcctacaaaatta 3292507  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3292506 gggaactaaatttgacttgtgagtat 3292481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6690045 - 6689820
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6690045 catacatgattagcatgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 6689946  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6689945 aatttcttaaacaatttataattaatttgaatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctaatcatgcctacaaaatta 6689846  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6689845 gggaattaaatttgacttgtgagtat 6689820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 35546310 - 35546534
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35546310 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 35546409  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35546410 aatttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttttagtcatgcctac-aaatta 35546508  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35546509 gggaactaaatttgacttgtgagtat 35546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42333586 - 42333359
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa-ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  42333586 catacatgattagcacgttaaaatatagttttacataaaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcatcccctcataattat 42333487  T
Q  149 gaatttcttaaa-caatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42333486 gaatttcttaaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaat 42333387  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42333386 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 42333359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30216552 - 30216330
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30216552 catacatgattaacacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 30216453  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30216452 aatttc-taaacaatttataattaacttgtatctcatttaaagactacaaaatttcac--tgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 30216356  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30216355 gggaactaaatttgacttgtgagtat 30216330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28877124 - 28876899
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  28877124 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataagaaattaaatttcttcgatcagggataaattaattatgaatttttatttcctcataattatg 28877025  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877024 aatttcttaaacaatttataattaatttctatctcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 28876925  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28876924 gggaactaaatttgacttgtgagtat 28876899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 48989686 - 48989911
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  48989686 catacatgtatagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttattccctcataattatg 48989785  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48989786 aatttcttaaacaatttatgattaatttgtatctcgtttaaaaactaaaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 48989885  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48989886 gggaattaaatttgacttgtgggtat 48989911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29995794 - 29995567
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa-ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  29995794 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattat 29995695  T
Q  149 gaatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995694 gaatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 29995595  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995594 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 29995567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 6235869 - 6236092
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  6235869 catacatgtttagcacattaaaaaatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccttcataattatg 6235966  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6235967 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 6236066  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6236067 gggaactaaatttgacttgtgagtat 6236092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10352694 - 10352468
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  10352694 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgacaagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 10352595  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10352594 aatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttaaaaagtacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctaatcatgcctacaaaatt 10352495  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10352494 agggaactaaatttgacttgtgagtat 10352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26439083 - 26438861
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  26439083 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 26438986  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438985 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 26438886  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26438885 ggaactaaatttgacttgtgagtat 26438861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33136254 - 33136029
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||    
T  33136254 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgatcaaggataaattaattatgaatttttactccctcgtaattatg 33136155  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33136154 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatcttgtttaaaaactacgaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 33136055  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  33136054 gggaactaaatttgacttatgagtat 33136029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Original strand, 25931069 - 25931289
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  25931069 catatatgtttagcacgttaaaatatggctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 25931166  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25931167 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttaactgtgaaggttcttatcatgttttagtcatgcctacaaaatta 25931266  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgag 272  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25931267 gggaactaaatttgacttgtgag 25931289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 20129676 - 20129898
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  20129676 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 20129773  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20129774 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 20129873  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20129874 ggaactaaatttgacttgtgagtat 20129898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34407088 - 34406866
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  34407088 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 34406991  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34406990 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 34406891  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34406890 ggaactaaatttgacttgtgagtat 34406866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 43356267 - 43356489
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  43356267 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 43356364  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43356365 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 43356464  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43356465 ggaactaaatttgacttgtgagtat 43356489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 47501136 - 47501358
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47501136 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 47501233  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47501234 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 47501333  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  47501334 ggaactaaatttgacttgtgagtat 47501358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 40529376 - 40529599
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  40529376 catacatgtttagcacgttaaaatataactttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 40529473  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40529474 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatcttgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggtttttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 40529573  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  40529574 tggaactaaatttgacttgtgagtat 40529599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 13012551 - 13012773
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13012551 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 13012648  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13012649 tttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 13012748  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13012749 ggaactaaatttgacttgtgagtat 13012773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17511039 - 17510812
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  17511039 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcaaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 17510942  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatca----tgttctagtcatgcctacaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||    
T  17510941 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattataaaatttcattgtgaaggttcttatcatgtttgttctagtcatacctacaaa 17510842  T
Q  246 attagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17510841 attagggaactaaatttgacttgtgagtat 17510812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30077445 - 30077224
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  30077445 catacatgtttagcatgttaaaatatagctttaaacaaaaa-ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 30077347  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30077346 aatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttataatcatgcctacaaaatt 30077247  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtga 271  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  30077246 tgggaactaaatttgacttgtga 30077224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36382153 - 36381931
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  36382153 catacatttttaacacgttaaaatatagttttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 36382056  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36382055 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaattttattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 36381956  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  36381955 gggaactaaatttg-cttgtgagtat 36381931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 50204888 - 50204673
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattc-attccctcataatttt 148  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |    
T  50204888 catacatgtttagcacgttaaaatgtagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaattttttattccctcataattat 50204789  T
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  50204788 gaatttcttaaacaatttataattaatttatatctcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttat-----------catgcctacaaaatt 50204700  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  50204699 agggaactaaatttgacttgtgagtat 50204673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 48130336 - 48130560
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  48130336 catacatgtttaatacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgac-agggataaaataattatgaatttttattccttcataattatg 48130434  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48130435 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatgtcgtttaaaaactacaatattttattgtgaaggttcttatcatgttctagtattgcctacaaaatta 48130534  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  48130535 gggaactaattttgacttgtgagtat 48130560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 30110321 - 30110545
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |     
T  30110321 catacatatttagcacgttaaaatatagctttgcacaaaa-attaaatttcttcgaccagggataaattaattatgagtttttattccctcataattata 30110419  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30110420 aatttcttaaacactttataactaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaatgttattatcatgttattgtcatgcctacaaaatta 30110519  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  30110520 aggaactaaatttgacctgtgagtat 30110545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 1818074 - 1818262
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  1818074 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 1818173  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatg 237  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1818174 aatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttgaaaactacaaaatttcattgtgaaggttctaatcatgttctagtcatg 1818262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 26448409 - 26448538
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  26448409 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaatttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttattccctcataattatg 26448508  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgt 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26448509 aatttcttaaacaatttataattaatttgt 26448538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13394959 - 13394865
Alignment:
Q  142 taattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcat 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394959 taattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcat 13394865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13395027 - 13394949
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13395027 catacatctttagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaat 13394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 29094531 - 29094683
Alignment:
Q  77 gctttacataaaaaattaaat--ttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaa 174  Q
    |||||||| ||||||||| ||  || |||||| || || ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  29094531 gctttacacaaaaaattatatattttttcgactagggacaaatttattatgaatttgtattccc-cataattatgaatttcttaaacaattcataattaa 29094629  T
Q  175 tttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgtt 228  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29094630 ttcgtatctcgtttaaaaacttcaaaatttcatggtgaaggttcttatgatgtt 29094683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Original strand, 44157023 - 44157206
Alignment:
Q  70 aaatatagctttacataaaa-aattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttat 168  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  44157023 aaatatagttttacgtaaaaaaattaaatttcttcaaccagggataaattaattatgaatttttattctctcataattatgaatttcttaaataattaat 44157122  T
Q  169 tattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttg 268  Q
     |                |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||       | ||||||||||||||||||    
T  44157123 aa----------------ttaaagactacaaaatttcattgtgaaagttcttattatgttctagtcatgtcta-------acggaactaaatttgacttg 44157199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29134421 - 29134215
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |  || | |||||||| |||| || ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  29134421 ttaaaatattgttttacacaaaaaattagatttttacgactat-gacagattaattacgaatttttattccct-ataactatgaatttcttaatcaattt 29134324  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    |  |||||||| | || |||||| | ||  |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  29134323 aaaattaatttttgtcacgtttataaacagcaaaatttcattgtgaaatttcttattatgttctaatcttgcctacaaaattagagaacaaaatttgacc 29134224  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    | |||||||    
T  29134223 tatgagtat 29134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Original strand, 31853655 - 31853783
Alignment:
Q  120 attatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttct 219  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  31853655 attatgaatttttattccc-cataagtatgaatttcttaaacaattcataattaatttgtatttcggttaaacactccaaatttttatggtgaaggttct 31853753  T
Q  220 tatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  31853754 tatgacgttctaaccatgcctacaaaatta 31853783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4038448 - 4038289
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaag 214  Q
    |||| ||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||     
T  4038448 aatttattatgagtttttattccc-cataattatgaatttcttaagcaattcataactaatttatatctcgtttaaaacctccaaaatttcatggtgaaa 4038350  T
Q  215 gttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||| | |||  |  ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  4038349 gttcttatgaagttaaaaccatacctacaaaattagagaacgaaattagacctgtgagtat 4038289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16877673 - 16877507
Alignment:
Q  111 gataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaat--ttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcact 208  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||   |||| |   |||||| ||| ||||||||||      
T  16877673 gataaattaattatgaatttttattccc-cataattatgaatttcttaaacaattcgtcattaatccctgta-cagttttaaaaacttcaaaatttcatg 16877576  T
Q  209 gtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtattg 277  Q
    |||| | ||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  16877575 gtgatgattcttatgatgtcctaaccatgcctacaaaatcagggaatgaaatttgacatgtgaatattg 16877507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Original strand, 9415346 - 9415481
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |  | ||||||| |||| || ||||   |||| |    
T  9415346 cataattatgaatttcttaaacaattcataataaatttgtatctcgtttaaaaaccccaaaattttatggcgaaggtttttatgatattctgaccatgtc 9415445  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||| || |||||    
T  9415446 taaaaaattagagaacggaatttgactcgtaagtat 9415481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13502324 - 13502213
Alignment:
Q  153 ttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggg 252  Q
    ||||||||||||| || ||||||  || |||| |||||| ||| ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  13502324 ttcttaaacaattcataattaatccgtctctcatttaaaaactccaaaatttcatggtgtaagttcttatgatgttctgagcatgcctacaaaattaggg 13502225  T
Q  253 aactaaatttga 264  Q
    ||  ||||||||    
T  13502224 aaggaaatttga 13502213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13391078 - 13391032
Alignment:
Q  229 ctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13391078 ctagtcatgtctacaaaattagggaactaaatttgacttgttagtat 13391032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26547005 - 26546884
Alignment:
Q  154 tcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggga 253  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||  || |||||| |||  |||||||||  || || |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  26547005 tcttaaaaaattcataattaatttgtacgtcttttaaaaactctaaaatttcatggtaaatgttcttatgatgttctaacaatgcctacaaaattagaga 26546906  T
Q  254 actaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||  ||||||||  ||||||||    
T  26546905 acggaatttgacccgtgagtat 26546884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 56225751 - 56225876
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  || ||||| |||| |||| |||||| |||| ||||       |||||||||||| | ||||||||  ||||||    
T  56225751 cataattatgaatttctttaacaatccataattaaattgtctctcatttaaaaactataaaaaaatttggtgaaggttcttgtgatgttctaaccatgcc 56225850  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||    
T  56225851 tacaaaattatggaacgaaatttgac 56225876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 272
Target Start/End: Original strand, 26448544 - 26448591
Alignment:
Q  222 tcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgag 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  26448544 tcatgttctagtcatgcctacaaaattagg---ataaatttgacttgtgag 26448591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Original strand, 5290888 - 5290970
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttat 222  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| || || ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5290888 cataattatgaatttcttggattattcataataaatttgtttatcgtttaaaaactccaaaatttcattgtgaaggttcttat 5290970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19168388 - 19168356
Alignment:
Q  234 catgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19168388 catgcctacaaaattagggaacaaaatttgact 19168356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16787835 - 16787610
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16787835 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 16787736  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16787735 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaagttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaatta 16787636  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16787635 gggaactaaatttgacttgtgagtat 16787610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 4404367 - 4404590
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4404367 tacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccacagataaattaattatgaattttcattccctcataattatgaa 4404466  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagg 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404467 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtaaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagg 4404566  T
Q  252 gaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4404567 gaactaaatttgacttgtgagtat 4404590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 9877577 - 9877802
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  9877577 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 9877676  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877677 aatttcttaaacaattcataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 9877776  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9877777 gggaactaaatttgacttgtgagtat 9877802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Original strand, 23402465 - 23402687
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa-ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23402465 catacatgattagcacgttaaaatatagttttacataaaaaaattaaatttcttcgaccagagataaatta-ttatgaattttcattccctcataattat 23402563  T
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402564 gaatttcttaaacaacttataattaatttgtatcttgtttaaagactacaaaatttcactatgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 23402663  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgag 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23402664 agggaactaaatttgacttgtgag 23402687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 42231294 - 42231519
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  42231294 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcaaacagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 42231393  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42231394 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcatcgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 42231493  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42231494 gggaactaaatttgacttgtgagtat 42231519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3648600 - 3648377
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  3648600 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 3648503  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648502 aatttcttaaacaatttataattaatttttatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 3648403  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3648402 gggaactaaatttgacttgtgagtat 3648377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 39914877 - 39915099
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39914877 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 39914974  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914975 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 39915074  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39915075 ggaactaaatttgacttgtgagtat 39915099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40470350 - 40470130
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  40470350 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaatta-ttatgaatttttattccctcataattatg 40470252  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40470251 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgtgaatattcttatcatgttttagtcatgcctacaaaatta 40470152  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtga 271  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  40470151 gggaactaaatttgccttgtga 40470130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2729006 - 2728778
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa---ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatt 146  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||    
T  2729006 catacatgtttagcatgttaaaatatagctttacacaaaaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttgttccatcataatt 2728907  T
Q  147 ttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaa 246  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2728906 atgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactataaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctataaaa 2728807  T
Q  247 ttagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2728806 ttagggaactaaatttaacttgtgagtat 2728778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 378782 - 379006
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  378782 catacatgtttagcatgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaattttttcgaccagggacaaattaattatgaatttttattcc-tcataattatg 378880  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  378881 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaattttattgtgaagtttcttatcatgttctagtcatgcctgcaaaatta 378980  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||    
T  378981 gggaattaaatttgacctatgagtat 379006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34136543 - 34136386
Alignment:
Q  118 taattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34136543 taattatgaattttcattccctcataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt 34136444  T
Q  218 cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34136443 cttatcatgctctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 34136386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29728171 - 29727967
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29728171 ttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggatcaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaaacaattt 29728074  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29728073 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttct--tcgtgttctagtcatgcctgcaaaattagggaactaaatttgact 29727976  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  29727975 tgtgagtat 29727967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 275
Target Start/End: Original strand, 7278480 - 7278605
Alignment:
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7278480 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 7278579  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7278580 gggaactaaatttgacttgtgagtat 7278605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 238
Target Start/End: Original strand, 36408897 - 36409093
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  36408897 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 36408996  T
Q  150 aatttcttaaac--------aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgc 238  Q
    ||||||||||||        || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36408997 aatttcttaaactaacttataacttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttctaatcatgttctagtcatgc 36409093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 15838646 - 15838857
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  15838646 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttgcacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttgtattccctcataattatg 15838743  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  15838744 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaattttattgtgaaggttctta-----------tcatgcctacaaaatta 15838832  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15838833 gggaactaaatttg-cttgtgagtat 15838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34136635 - 34136531
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34136635 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 34136536  T
Q  150 aattt 154  Q
    |||||    
T  34136535 aattt 34136531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 3435726 - 3435828
Alignment:
Q  173 aatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgag 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435726 aatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttaattgtgaatgttcttatcatgttctagtcatgcctacataattagggaactaaatttgacttgtgag 3435825  T
Q  273 tat 275  Q
    |||    
T  3435826 tat 3435828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32540256 - 32540076
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| || |||| || ||| || || ||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  32540256 ttaaaatatgactttacacaaaaaaatagatttttttgactagggacaaattaattatgaatttttattccc-cataattataaatttcttaaaaaattt 32540158  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    || ||||||| || |||| |||||| | || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  32540157 ataattaattcgtctctcatttaaaaattataaaatttcattttgaaggttcttattatgttctaaccatgcctacaaaatt 32540076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 9175543 - 9175706
Alignment:
Q  101 ttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaa 200  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  9175543 ttcgaccaaggacaaattaattatgaatttttatttc-tcataattatgaatttcttaaataacttataattaatttgtctctcgtttaaaaactgcaaa 9175641  T
Q  201 atttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    | ||||  ||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9175642 acttcatagtgaaggatcttattatgttctaacattgcctacaaaattagggaacaaaatttgac 9175706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Original strand, 29351809 - 29351944
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||  ||||| ||| ||||  |||||||  ||||||    
T  29351809 cataattatgaatttcttaaaaaattcattattaatttgtatctcgagtaaaaactccaaaatctcatggtgaaagtttttatgctgttctaaccatgcc 29351908  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |||||||    
T  29351909 tacaaagttagggaacataatttgactcatgagtat 29351944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 275
Target Start/End: Original strand, 19033 - 19170
Alignment:
Q  139 tcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttc-actgtgaaggttcttatcatgttctagtcatg 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||  | |||||| |||||||  | |||||  ||||    
T  19033 tcataattatgaatttcttaaacaattaataattaatttgtccctggtttaaaaacttcaaaatttcgtcggtgaagattcttatggtattctaaccatg 19132  T
Q  238 cctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  19133 caaacaaaattagggaacaaaatttgaccagtgagtat 19170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Original strand, 3435622 - 3435722
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaa----atttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataat 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    |  ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3435622 catacatgtttagcacattaaaatatagctttacacaaaaaaaaaaaaataaatcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccttcataat 3435721  T
Q  146 t 146  Q
    |    
T  3435722 t 3435722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40401298 - 40401091
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||| |||| | ||||  | |||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  40401298 ttaaaatatggttttacataatatattagatttttccgacttgggatagattaattatgaatttttgttccctg-taattatgaatttctaaaataattt 40401200  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || ||||||| || ||||||| ||| ||| || ||| |||   ||||||||||||| ||||||||   |||||   ||||||||||||  ||||||||      
T  40401199 ataattaattcgtctctcgttcaaaaactccagaatgtcatgttgaaggttcttatgatgttctaactatgcccgtaaaattagggaatgaaatttgagc 40401100  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  40401099 tgtgagtat 40401091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15863336 - 15863282
Alignment:
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaattt 204  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15863336 aatttcttaaacaattcataattaattcgtatctcgtttaaaaactccaaaattt 15863282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 206
Target Start/End: Original strand, 32750375 - 32750433
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttca 206  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32750375 tgaatttcataaacaattcataattaattcgtatctcgtttaaaaactccaaaatttca 32750433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 17479972 - 17480012
Alignment:
Q  235 atgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17479972 atgcctacaaaattagggaacaaaatttgactcgtgagtat 17480012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 275
Target Start/End: Original strand, 33639179 - 33639220
Alignment:
Q  234 catgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  33639179 catgcctacaaaattagggaacaaaatttgatgtgtgagtat 33639220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 31680724 - 31680949
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31680724 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 31680823  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680824 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgcgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 31680923  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31680924 gggaactaaatttgacttgtgagtat 31680949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 33430678 - 33430903
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33430678 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 33430777  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33430778 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgcgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 33430877  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33430878 gggaactaaatttgacttgtgagtat 33430903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17332429 - 17332204
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  17332429 catacatgtttagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgatttttcattccctcataattatg 17332330  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17332329 aatttcttaagcaatttataattaatttgtatcttgtttaaagactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 17332230  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     |||||||||||||||||| ||||||    
T  17332229 aggaactaaatttgacttgcgagtat 17332204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12278669 - 12278440
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaa---tttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatt 146  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12278669 catacaggattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaaaaaaaaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataatt 12278570  T
Q  147 ttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaa 246  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12278569 atgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagattacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaa 12278470  T
Q  247 ttagggaactaaatttgacttgtgagtatt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12278469 ttagggaactaaatttgacttgtgagtatt 12278440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31501524 - 31501303
Alignment:
Q  54 catgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatt 153  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  31501524 catgtttagcacattaaattatagctttacataaaatattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatt 31501425  T
Q  154 tcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31501424 tcttaaacaatttataattaatttgtatcttgtttaaagactacataatttcattgtgatggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggga 31501325  T
Q  254 actaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31501324 actaaatttgacttgtgagtat 31501303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 13818338 - 13818561
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  13818338 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 13818435  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818436 aatttcttaaacagtttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 13818535  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13818536 gggaactaaatttgacttgtgagtat 13818561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 10034280 - 10034486
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10034280 ttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatatttattccctcataattatgaatttcttaaacaattt 10034377  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10034378 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattataaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 10034477  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  10034478 tgtgagtat 10034486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26283122 - 26282900
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  26283122 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcgtaattatgaa 26283025  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26283024 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 26282925  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26282924 ggaactaaatttgacttgtgagtat 26282900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15959736 - 15959530
Alignment:
Q  69 aaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttat 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15959736 aaaatacagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaatcaatttat 15959637  T
Q  169 tattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttg 268  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15959636 aattaatttgcagctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatttgggaactaaatttgacctg 15959537  T
Q  269 tgagtat 275  Q
    |||||||    
T  15959536 tgagtat 15959530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 36291728 - 36291953
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  36291728 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattataaatttttattccctcataattatg 36291827  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36291828 aatt-cttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttaaaaactataaaattttattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 36291926  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36291927 agggaactaaatttgacttatgagtat 36291953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36293425 - 36293203
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  36293425 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 36293328  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg-ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36293327 tttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaaggtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 36293228  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  36293227 gaaactaaatttgacttgtgagtat 36293203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 39435059 - 39435281
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39435059 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttgcacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 39435156  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg-ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39435157 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaaggtttcttatcatgttctagtcatacctacaaaattag 39435256  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  39435257 ggaactaaatttgacttgtgggtat 39435281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39657320 - 39657125
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39657320 ttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccatggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttattaaacaattt 39657223  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttga 264  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39657222 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttga 39657125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1776182 - 1775960
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  1776182 catacatgtttagcacgttaaaatatagctatacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 1776085  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1776084 aatttcttaaacaatttataattaatctgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctaaaaaatta 1775985  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||    
T  1775984 gagaattaaatttg-cttgtgagtat 1775960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16333690 - 16333484
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16333690 ttaaaatatagcttta--tacaaaattaaatttcttcaaccagagataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttcttaaaaaattt 16333593  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16333592 ataattaatttgtatcttgtttaaaaattacaaaatttcattgggaaggttcttatcatattttagtcatgcttacaaaattagggaactaaatttgact 16333493  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  16333492 tgtgagtat 16333484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 16155358 - 16155579
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16155358 catacatgtttaacacgttaaaatatagttttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 16155455  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| | || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155456 aatttcttaaccaatttataattaatttgt--ctcgtttaaaaattataaaatattattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 16155553  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16155554 gggaactaaatttgacttgtgagtat 16155579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 192264 - 192489
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||    
T  192264 catacatgtttagcacgttaaaatatagttttacactaaaaataaaatttttttgaccagggaaaaattaattatgaatttttattcccccataattatg 192363  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  192364 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgttaaggttcttatcatgttctcgtcatgcctataaaatta 192463  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||| | |||||||    
T  192464 gggaactaaatttgacctatgagtat 192489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38269219 - 38269005
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaa-aaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |    
T  38269219 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaataaattaaattttttcgaccagggacaaattaattatgaatttttattccc-cataattat 38269121  T
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  38269120 gaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtataaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttat-----------catgcctacaaaatt 38269032  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38269031 agggaactaaatttgacctgtaagtat 38269005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Original strand, 37255054 - 37255187
Alignment:
Q  142 taattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgccta 241  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255054 taattatgaatttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactcggaaggttcttatcatgttctagtcatgccta 37255153  T
Q  242 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255154 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 37255187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Original strand, 43069329 - 43069439
Alignment:
Q  165 ttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttga 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43069329 ttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattttgaaggttcttatcatgttctagtcatgtctgcaaaattagggaactaaatttga 43069428  T
Q  265 cttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||    
T  43069429 cttgtgagtat 43069439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 37254986 - 37255064
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37254986 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgatcagagataaattaattatgaat 37255064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 23034430 - 23034557
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23034430 tgaatttcttaaacaatttataattaatttgtctctcgttttaaaactataaaatttaattgtgaaagttcttattatgttataatcatgcctacaaaat 23034529  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || ||||  ||||||||| |||||||||    
T  23034530 taaggaatgaaatttgacctgtgagtat 23034557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Original strand, 28801716 - 28801783
Alignment:
Q  208 tgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28801716 tgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcttacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 28801783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Original strand, 31271852 - 31271989
Alignment:
Q  138 ctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatg 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||| || | | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31271852 ctcataattatgaatttcttaaaccatttataattaatttgtctctcgtttcaaaactgaaaaactttattctgaaggttcttattatgttctagccatg 31271951  T
Q  238 cctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31271952 gctaccaaattagtgaacaaattttgacttgtgagtat 31271989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 43069235 - 43069313
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43069235 catacatgtttagcacgttaaattatagttttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaat 43069313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 27750684 - 27750807
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||  |||| |    
T  27750684 cataattatgaatttcttaa-caattaat-attaatttgtcgctcgtttaaaaactacaaaatttcttggtgaatgtttttatgatgttctaaccatggc 27750781  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27750782 tacacaattagggaattaaatttgac 27750807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 247
Target Start/End: Original strand, 24792892 - 24792971
Alignment:
Q  168 ttattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  24792892 ttattaatttgcatctcgtttaaaaactccaaaatttcatggtgaaggttcttataatgttctaaccatgcctataaaat 24792971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30297693 - 30297621
Alignment:
Q  117 ttaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaa 191  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30297693 ttaattatgaatttt-attccc-cataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtctctcgtttaaa 30297621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Original strand, 23034262 - 23034362
Alignment:
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| || ||  |  |||||||||||||||    
T  23034262 gaatttcttaaacaatttataattaatttgtctcttatttaaaaactataaaatttaattttgaaggttcttattatattacaaccatgcctacaaaatt 23034361  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  23034362 a 23034362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Original strand, 20368468 - 20368573
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || || ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  20368468 attaattatgagttttcgttccc-cataattatgaatttcttggataattcataataaatttgtttatcgtttaaaaactccaaaatttcattgtgaagg 20368566  T
Q  216 ttcttat 222  Q
    |||||||    
T  20368567 ttcttat 20368573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18266317 - 18266195
Alignment:
Q  153 ttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagt----catgcctacaaaatt 248  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||| || ||||| |    |||||||||||||||    
T  18266317 ttcttaaacaattcataattagtttgtctctcatttaaaaacttcaaaattccatggtgaaggttcttatgatattctaatcgaccatgcctacaaaatt 18266218  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtga 271  Q
     ||||   ||||||||| |||||    
T  18266217 tgggagtgaaatttgacctgtga 18266195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35911450 - 35911341
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||||||| || | || |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  |||  |    
T  35911450 cataattatgaatttcttaaacaattcatagttaattcatctctcgtttgaaaaatataaaatttcatggtgaaggtttttatgatgttctaaccatagc 35911351  T
Q  240 tacaaaatta 249  Q
    ||||||||||    
T  35911350 tacaaaatta 35911341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 22761177 - 22761287
Alignment:
Q  143 aattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctac 242  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || ||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||    
T  22761177 aattatgaatttcttaaacaattcagaattaatttgtctctctttcaaaaac-acaaa-tttcacggtgaaggttcttattatgttttaaatatgtctac 22761274  T
Q  243 aaaattagggaac 255  Q
    || ||||||||||    
T  22761275 aacattagggaac 22761287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11779303 - 11779220
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaa 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  11779303 aattaattatgaatatt-tttcc--cataattatgaattttttaaacaattcataattaatttgtcgctcgtttaaaaactccaaaa 11779220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 248
Target Start/End: Original strand, 8788265 - 8788373
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||  |||||| ||||||  |||  ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  8788265 cataattatgaatttcttaaataattaggaattaatccgtatcttgtttaagaactcgaaaatttaatggtgaagtttcttatgatgttctaaccatgcc 8788364  T
Q  240 tacaaaatt 248  Q
    |||||||||    
T  8788365 tacaaaatt 8788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 28997087 - 28997312
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28997087 catacataattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 28997186  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997187 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgcgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 28997286  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28997287 gggaactaaatttgacttgtgagtat 28997312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33229146 - 33228922
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||    
T  33229146 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttgtattccctcataattatg 33229047  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33229046 aatttcttaaactaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctgcaaaatt 33228947  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33228946 agggaactaaatttgacttgtgagt 33228922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 398980 - 399202
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  398980 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 399077  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  399078 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 399177  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  399178 ggaactaaatttgacttgtgagtat 399202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34948572 - 34948366
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34948572 ttaaaatataactttacacaata--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcgtaattatgaatttcttaaacaattt 34948475  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34948474 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttgtcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 34948375  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  34948374 tgtgagtat 34948366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 29743640 - 29743867
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaa-ttaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  29743640 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattcactcataattat 29743739  T
Q  149 gaatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29743740 gaatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaatgttcttatcatgttccaatcatgcctacaaaat 29743839  T
Q  248 tagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29743840 tagggaattaaatttgacttgtgagtat 29743867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Original strand, 18339450 - 18339594
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaa-aattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18339450 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcattccctcataattat 18339549  T
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18339550 gaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaga 18339594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 13838174 - 13838366
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13838174 ttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccatggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttattaaacaattt 13838271  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatt 261  Q
    || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13838272 ataattaatttgtatatcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatctagttccagtcatgtctacaaaattagggaactaaatt 13838366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Original strand, 10231748 - 10231879
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  10231748 cataattatgaatttcttaaacaattaataattaattcgtatctcatttaaaatcttcaaaatttcatggtgaaggttcttatgttgttctaaccatgcc 10231847  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtga 271  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  10231848 tagaaaattagaaaacgaaatttgactcgtga 10231879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31373400 - 31373279
Alignment:
Q  143 aattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctac 242  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  |  |||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||    
T  31373400 aattatgaatttcttaaacaattcataattaattcatcactcgtttaaaaacttcaaaattttgttgtgaaggttcttatgatgttttaaccttgcctac 31373301  T
Q  243 aaaattagggaactaaatttga 264  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  31373300 aaaattagggaactgaatttga 31373279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 28931456 - 28931581
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||   ||||| || |||| |  |||||  ||||||    
T  28931456 cataattatgaatttcgtaaataattcataattaatttttatcttgtttaaaaacttcaaaattgcatgttgaagattgttatgaccttctaaccatgcc 28931555  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  28931556 tacaaaattagagaacgaaatttgac 28931581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22814826 - 22814712
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | || |||||| |||  |||||||||  |||  ||    
T  22814826 attaataatgaatttttattccc-cgtaattttgaatttcttaaacaattcataattaattcgtctatcatttaaaaacttgaaaatttcatggtggcgg 22814728  T
Q  216 ttcttatcatgttcta 231  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22814727 ttcttatgatgttcta 22814712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12850124 - 12849976
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaag 214  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |  | | |||||| |||  |||||||||  || |||    
T  12850124 aattaattataaattttcgttccc-cataattatgaatttcttaaacaattcataattaatttatcccgcatttaaaaactctaaaatttcatggtaaag 12850026  T
Q  215 gttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttga 264  Q
    |||||| | |||||| |  |||||||| ||||  ||||||  ||||||||    
T  12850025 gttcttttgatgttcaaaccatgcctaaaaaagaagggaataaaatttga 12849976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 23217377 - 23217451
Alignment:
Q  53 acatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| || || | |||||||||||||    
T  23217377 acatgtttaggacattaaaatatggctttacacaaaaaattatattt-ttcgacaagggacagattaattatgaat 23217451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21556470 - 21556351
Alignment:
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtc----atgcctacaaa 245  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||  ||| |||||||| |  ||||| |||||| | ||||||||  |    |||||||| ||    
T  21556470 aatttcttaaaaaattcataattaatttgtatcttgttaaataactccaaaattttatggtgaaagttcttttgatgttctaaacatgaatgcctactaa 21556371  T
Q  246 attagggaactaaatttgac 265  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21556370 attagggaacaaaatttgac 21556351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 265
Target Start/End: Original strand, 23217452 - 23217501
Alignment:
Q  216 ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23217452 ttcttattatgttctaaccatgcctacaaaattaaggaacgaaatttgac 23217501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Original strand, 12098413 - 12098476
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgt 179  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  12098413 aattaattataaattttcgttccc-cataattatgaatttcttaaataattcataattaatttgt 12098476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6503379 - 6503154
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  6503379 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattctctcataattatg 6503280  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6503279 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacgaaatttcactgtgaaggttcttatcatactctagtcatgcctacaaaatta 6503180  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6503179 gggaactaaatttgacttgtgagtat 6503154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 45183338 - 45183562
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45183338 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattatg 45183437  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45183438 aatttcttaaaaaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttttagtcatgcctac-aaatta 45183536  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45183537 gggaactaaatttgacttgtgagtat 45183562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 270
Target Start/End: Original strand, 33041310 - 33041529
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  33041310 catacatgattaacacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaattttcatttcctcataattatg 33041409  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33041410 aatttct-aaacaatttataattaatttgtatctcatttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 33041508  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  33041509 gggaactaaatttgacctgtg 33041529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6930704 - 6930478
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaa-tttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataatttt 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6930704 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaaaaaaaatttcttcgactagagataaattaattatgaattttcattccctcataattat 6930605  T
Q  149 gaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6930604 gaacttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttccttgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 6930505  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6930504 agggaactaaatttgacttgtgagtat 6930478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19565311 - 19565085
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19565311 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 19565212  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19565211 aatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctaatcatgcctacaaaatt 19565112  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  19565111 agagaactaaatttgacttgtgagtat 19565085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40081547 - 40081324
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  40081547 catacatgtttagcacgttaaaatgtagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 40081450  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40081449 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattataaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 40081350  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40081349 gggaactaaatttgacttgtgagtat 40081324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 27935534 - 27935758
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  27935534 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttattccctcataattatg 27935633  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27935634 aatttcttaaacaatttgtaattaatttgtatc-cgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaagattcttataatgttctagtcatgcctacaaaatta 27935732  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27935733 gggaactaaatttgacttgtgagtat 27935758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 5135645 - 5135870
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  5135645 catacatgtttagcacgttaaaaaatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattatgaatttttattccttcataattatg 5135744  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  5135745 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttatagtcatgcctacgaaaata 5135844  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5135845 gggaactaaatttgacttgtgagtat 5135870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6269230 - 6269008
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6269230 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 6269133  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6269132 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 6269033  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6269032 ggaactaaatttgacttgtgagtat 6269008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22968248 - 22968026
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22968248 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 22968151  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22968150 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 22968051  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22968050 ggaactaaatttgacttgtgagtat 22968026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 39772153 - 39772375
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39772153 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 39772250  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt-cttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39772251 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgttccttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 39772350  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39772351 ggaactaaatttgacttgtgagtat 39772375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 19390509 - 19390731
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  19390509 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgaccagcgataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 19390606  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg-ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390607 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaaggtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 19390706  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  19390707 gaaactaaatttgactggtgagtat 19390731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34083926 - 34083715
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  34083926 catacatgtttagcacgttaaaatatagctttacacaaaa--ttaaatttcttcgactagggagaaattaattatgaatttttattccctcataattatg 34083829  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34083828 aatttcttaaacaatttataattaatttatatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 34083729  T
Q  250 gggaactaaatttg 263  Q
    ||||||||||||||    
T  34083728 gggaactaaatttg 34083715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 45336231 - 45336456
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  45336231 catacatttttagcacgttaaaatatagctt-acacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatg 45336329  T
Q  150 aatttcttaaac-aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatt 248  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45336330 aatttcttaaactaacttataattaatttgtatctcatttaaaaactacaaaatttcattgtaaaggttcttatcatgttctaatcatgcctacaaaatt 45336429  T
Q  249 agggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  45336430 tgggaactaaatttgacttgtgagtat 45336456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11017967 - 11017854
Alignment:
Q  162 aatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatt 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11017967 aattaattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatt 11017868  T
Q  262 tgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||| |||||    
T  11017867 tgacttgtaagtat 11017854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 275
Target Start/End: Original strand, 38282774 - 38282987
Alignment:
Q  51 atacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttctt-cgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    || |||| || || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||    
T  38282774 atacatgtttagcacgttaaaatatagctttacaaaaaaaaaaaaaaaaatttcgacaagggacaaattaattatgaatttttatttcc-cataattatg 38282872  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||           |||||||||||    
T  38282873 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaagatttcattgtgaatgttattatcatgt-----------ctacaaaatta 38282961  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  38282962 ggaaactaaatttgacctgtgagtat 38282987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11018032 - 11017958
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattat 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11018032 catacatgattagcacgttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattat 11017958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29564954 - 29564759
Alignment:
Q  54 catgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatt 153  Q
    |||| |||| || |||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| |  || |  |||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||    
T  29564954 catgtttaggacgttaaaatacagttttacacaaaaaattagattttttcgactaaggaca--ttaattatgaatttttattc--tcatgattatgaatt 29564859  T
Q  154 tcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggga 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  29564858 tcttaaacaatttataattaatttgt--ctcatttaaaaactataaaatttcattgtgaaggttcttattatgttctaaccatgcctacaaaattaagga 29564761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 27912430 - 27912586
Alignment:
Q  116 attaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaagg 215  Q
    ||||||||||||| |||||   || ||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||| | |    
T  27912430 attaattatgaattttcat---cttatatttatgaatttcataaacaattcataattaatttgtccctcgtttaaaaactccaaaatttcatggtgcatg 27912526  T
Q  216 ttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27912527 ttcttatcatgttccaaccatgcctgcaaatttagggaacaaaatttgacctatgagtat 27912586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Original strand, 35937650 - 35937778
Alignment:
Q  119 aattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttc 218  Q
    |||||||||| || ||||||  || ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  35937650 aattatgaatttttattccc--attattatgagtttcttaaacaattcataattaatttgtatctcttttaaaaactccaaaacttcatggtgaaggttc 35937747  T
Q  219 ttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  35937748 ttatgatgttctaactatgcctacaaaatta 35937778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 8257223 - 8257359
Alignment:
Q  86 aaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcg 185  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||| ||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||    
T  8257223 aaaaaattagattt-ttctactagagacaaaataattatcaatttttattcc-tcataattatgaatttcttaagcaatttataattaatttttctttcg 8257320  T
Q  186 tttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatca 224  Q
    |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8257321 tttaaaaactttaaaatttcattgtgaaggttcttatca 8257359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 219316 - 219199
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||| | |||||||||||  || |||||||| |  |||||| ||||| | ||||| ||  ||||||||||||||    
T  219316 tgaatttattaaacaattcagaattaatttttgtctcgtttaaaatctccaaaatttaaaggtgaagtttcttgtgatgttataaccatgcctacaaaat 219217  T
Q  248 tagggaactaaatttgac 265  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  219216 tagagaacaaaatttgac 219199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19814846 - 19814766
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttctt 220  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19814846 cataattatgtatttcttaaaaaattcataattgattcgtatctcgtttaaaaacttcaaaatttcatggtgaaggttctt 19814766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38415520 - 38415440
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgtt 228  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  38415520 tgaatttgttaaataatttataattaatttgtctctagtttaaaaactaaaaatttttacggtgaaggttcttatgatgtt 38415440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48559653 - 48559591
Alignment:
Q  114 aaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaattt 177  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  48559653 aaattaattataaattttcatt-cctcataattatgaattttttaaacaattcataattaattt 48559591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2592363 - 2592308
Alignment:
Q  115 aattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattatt 172  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2592363 aattagttatgaatttt-attccc-cataattttgaatttcttaaacaattcattatt 2592308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 5177307 - 5177352
Alignment:
Q  123 atgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttat 168  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5177307 atgaattttcgttcccccataattttgaatttgttaaacaatttat 5177352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Original strand, 40368604 - 40368704
Alignment:
Q  64 acattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaa 163  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | |||| || ||  || ||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  40368604 acattaaaatattgctctacacaaaaaattagatttttccgactagggacgaactaattatgaatttttattttc-cataattatgaatttcttaaacaa 40368702  T
Q  164 tt 165  Q
    ||    
T  40368703 tt 40368704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 39326640 - 39326689
Alignment:
Q  114 aaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatt 165  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  39326640 aaattaattatgaatctccattccc--ataattctgaatttcttaaacaatt 39326689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 53295 - 53489
Alignment:
Q  81 tacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53295 tacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattgattatgaattttcattccctcataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgta 53394  T
Q  181 tctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53395 tctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgctctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 53489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 3829340 - 3829564
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  3829340 catacatgtttagcacattaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgaccagggataaattaattatgattttttattccctcataattatg 3829439  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3829440 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactac-aaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaagtta 3829538  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3829539 gggaactaaatttgacttgtgagtat 3829564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41972067 - 41971842
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  41972067 catacatgtttagcatgttaaaatatagctttacacaaaaaattaaatttcttcgacaagggataaagtaattatgaatttttattccctcataattatg 41971968  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41971967 aatttcttaaacaatttataattaatttatacctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 41971868  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  41971867 gggaattaaatttgacctgtgagtat 41971842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42310747 - 42310524
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  42310747 catacatatttagcacgttaaaatatagctttactcaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccatcataattatg 42310650  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42310649 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctagtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 42310550  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42310549 gggaactaaatttgacttgtgagtat 42310524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Original strand, 33490071 - 33490281
Alignment:
Q  59 ttagcacattaaaatatagctttacataaaa-aattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttctt 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  33490071 ttagcacgttaaaatatagctttacacaaaaaaattaaatttcttcgactagggataaattaattattaatttttattccctcataattatgaatttctt 33490170  T
Q  158 aaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaacta 257  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33490171 aaacaatttataattaattcgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttattatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaacta 33490270  T
Q  258 aatttgacttg 268  Q
    |||||||||||    
T  33490271 aatttgacttg 33490281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 7433798 - 7434004
Alignment:
Q  67 ttaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaattt 166  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7433798 ttaaaatatagctttacacaata--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaatttctttaacaattt 7433895  T
Q  167 attattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7433896 ataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaaatttcattgtgaaggttcttgtcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgact 7433995  T
Q  267 tgtgagtat 275  Q
    |||||||||    
T  7433996 tgtgagtat 7434004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32981863 - 32981641
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttg 149  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||    
T  32981863 catacatgtttagcacgttaaaatataactttactcaaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattataaatttttattctctcataattatg 32981766  T
Q  150 aatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaatta 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32981765 aatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgttgaaaaattataaaattttattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattt 32981666  T
Q  250 gggaactaaatttgacttgtgagta 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32981665 gggaactaaatttgacttgtgagta 32981641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 275
Target Start/End: Original strand, 17445705 - 17445876
Alignment:
Q  104 gaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatt 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445705 gaccagggataaattaattatgaatttttattccttcataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatt 17445804  T
Q  204 tcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17445805 tcattatgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaaggaactaaatttgacttgtgagtat 17445876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 101 - 275
Target Start/End: Original strand, 23313403 - 23313577
Alignment:
Q  101 ttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23313403 ttcgaccagggataaattaattatgaatttttattcccttataattatgaatttattaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaaattacaaa 23313502  T
Q  201 atttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23313503 atttcattgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttatgagtat 23313577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Original strand, 35907977 - 35908110
Alignment:
Q  142 taattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgccta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35907977 taattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcata 35908076  T
Q  242 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35908077 caaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 35908110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11958076 - 11957934
Alignment:
Q  133 attccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctag 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11958076 attccctcataattatgaatttcttaaataatttataattaatttgtatctcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaaggttcttatcatgttctaa 11957977  T
Q  233 tcatgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  11957976 tcatgcctagaaaattagtgaattgaatttgacttgtgagtat 11957934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Original strand, 35907909 - 35907987
Alignment:
Q  50 catacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35907909 catacatgattagcacgttaaaatatagttttacataaaaaattaaatttcttcgatcagagataaattaattatgaat 35907987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Original strand, 28463396 - 28463519
Alignment:
Q  141 ataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcct 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||    
T  28463396 ataattatgaatttcttaaacaatttataattaatttgtatttcgtttaaaaactacaaaatttcattgtgaag-----------gttctagtcatgcct 28463484  T
Q  241 acaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  28463485 gcaaaattagggaattaattttgacctgtgagtat 28463519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 3604706 - 3604824
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaa-tttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaa 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||   | ||  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  3604706 tgaatttcttaaactattaattattaatttgtttttcgtttaaaaactccaaaattttcgtggcgaccgtttttatgatgttctaaccatgcctacaaaa 3604805  T
Q  247 ttagggaactaaatttgac 265  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  3604806 ttagggaataaaatttgac 3604824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18716491 - 18716341
Alignment:
Q  114 aaattaattatgaatattcattccctcataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaa-gactacaaaatttcactgtga 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||    ||| |||||||   ||| ||||||| |   |||    
T  18716491 aaattaattatgaattttcattccc-caaaattatgaatttcttaaacaattcataattaattcacctcttgtttaaatctcta-aaaattttatgttga 18716394  T
Q  213 aggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18716393 aggttcttatgatgttctaaccatgtctataaaattagggaataaaatttgac 18716341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5715499 - 5715404
Alignment:
Q  170 attaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattagggaactaaatttgac 265  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  5715499 attaattcgtatctcgtttaaaaattccaaaattttatggtgaagtttcttatgatgttttaaccatgcctacaaaattatagaacaaaatttgac 5715404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30094690 - 30094650
Alignment:
Q  235 atgcctacaaaattagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  30094690 atgcctacaaaattagggaacgaaatttgactcatgagtat 30094650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 480261 - 480039
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  480261 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 480164  T
Q  152 tttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaa-ggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  480163 tttcttaaacaatttataattaatttgtatctcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaatgtttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattag 480064  T
Q  251 ggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  480063 ggaactaaatttgacttgtgagtat 480039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18143
Alignment:
Q  148 tgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggtt-cttatcatgttctagtcatgcctacaaaa 246  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18015 tgaatgtcttaaacaatttataattaatttgtatatcgtttaaaatttacaaaatttcattgtgaaggtttcttatcatgttctagtcatgcttacaaaa 18114  T
Q  247 ttagggaactaaatttgacttgtgagtat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18115 ttagggaactaaatttgacttgtgagtat 18143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2142 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2142
Description:

Target: scaffold2142; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Original strand, 885 - 999
Alignment:
Q  52 tacatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaa 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  885 tacatgtttagcacgttaaaatatagctttacataaaa--ttaaatttcttcgaccagggataaattaattatgaatttttattccctcataattatgaa 982  T
Q  152 tttcttaaacaatttat 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  983 tttcttaaacaatttat 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 264
Target Start/End: Original strand, 17669 - 17878
Alignment:
Q  53 acatgattagcacattaaaatatagctttacataaaaaattaaatttcttcgaccagagataaattaattatgaatattcattccctcataattttgaat 152  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  || || || ||||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||    
T  17669 acatgtttaggatattaaaatatagctttacacaaaaaattagattttttttactagggacaaattaattatgaatttttattccc-cataagtatgaat 17767  T
Q  153 ttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaattaggg 252  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  17768 ttctttaacaatttataagtaatttgtctctc-tttaaaaacagcaaaatttcattgtgaaggttcatattatgttctaaccatgcctacaaaattaagg 17866  T
Q  253 aactaaatttga 264  Q
    ||| | ||||||    
T  17867 aacgacatttga 17878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Original strand, 8468 - 8599
Alignment:
Q  140 cataattttgaatttcttaaacaatttattattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  8468 cataattatgaatttcttaaacaattaataattaattcgtatctcatttaaaatcttcaaaatttcatggtgaaggttcttatgttgttctaaccatgcc 8567  T
Q  240 tacaaaattagggaactaaatttgacttgtga 271  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  8568 tagaaaattagaaaacgaaatttgactcgtga 8599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 247
Target Start/End: Original strand, 35275 - 35354
Alignment:
Q  168 ttattaatttgtatctcgtttaaagactacaaaatttcactgtgaaggttcttatcatgttctagtcatgcctacaaaat 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  35275 ttattaatttgcatctcgtttaaaaactccaaaatttcatggtgaaggttcttataatgttctaaccatgcctataaaat 35354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University