View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19508_low_7 (Length: 258)

Name: NF19508_low_7
Description: NF19508
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19508_low_7
NF19508_low_7
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (1-254)||(15167954-15168207)
chr7 (1-254)||(18873139-18873392)
chr7 (4-254)||(10895817-10896067)
chr7 (4-254)||(14422764-14423013)
chr7 (4-254)||(16009357-16009605)
chr7 (4-251)||(12709870-12710117)
chr7 (4-251)||(13122941-13123188)
chr7 (4-251)||(13743492-13743737)
chr7 (4-174)||(16677152-16677324)
chr7 (4-174)||(17651388-17651560)
chr7 (4-186)||(12590670-12590850)
chr7 (4-254)||(13007213-13007460)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (1-254)||(22750920-22751173)
chr5 (4-254)||(28370081-28370329)
chr5 (4-254)||(19512166-19512415)
chr5 (4-253)||(38144563-38144810)
chr5 (4-186)||(23528479-23528659)
chr5 (4-42)||(18407970-18408008)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (1-254)||(14762781-14763034)
chr3 (1-254)||(38310823-38311076)
chr3 (4-254)||(20247815-20248057)
chr3 (4-254)||(24192734-24192985)
chr3 (4-254)||(9534108-9534356)
chr3 (4-254)||(23370532-23370781)
chr3 (59-254)||(55499185-55499377)
chr3 (4-251)||(24933855-24934100)
chr3 (4-186)||(41455124-41455304)
chr3 (16-146)||(16801505-16801635)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-254)||(11877-12127)
scaffold0026 (4-254)||(111466-111714)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (4-254)||(958-1206)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (4-254)||(49959-50207)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (4-254)||(8727759-8728009)
chr8 (4-254)||(44477403-44477651)
chr8 (4-254)||(44492561-44492809)
chr8 (4-251)||(23866396-23866643)
chr8 (69-252)||(27940946-27941127)
chr8 (4-186)||(17054440-17054619)
chr8 (4-87)||(18614217-18614301)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (1-251)||(8045856-8046105)
chr4 (4-254)||(11847886-11848142)
chr4 (4-91)||(53483646-53483733)
chr4 (7-138)||(27906159-27906291)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-211)||(23057760-23057970)
chr6 (4-252)||(23838980-23839227)
chr6 (4-254)||(29614173-29614423)
chr6 (4-253)||(10986207-10986455)
chr6 (4-254)||(4477637-4477886)
chr6 (4-238)||(18800233-18800466)
chr6 (18-254)||(21565253-21565486)
chr6 (4-112)||(930122-930229)
chr6 (4-254)||(12168144-12168391)
chr6 (4-254)||(19287053-19287300)
chr6 (4-254)||(19785896-19786143)
chr6 (4-254)||(19878237-19878484)
chr6 (4-254)||(19884013-19884260)
chr6 (4-91)||(34640013-34640100)
chr6 (4-91)||(34646687-34646774)
chr6 (4-91)||(25469731-25469816)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (1-254)||(19661477-19661728)
chr2 (4-254)||(6483498-6483746)
chr2 (4-254)||(6486965-6487213)
chr2 (4-254)||(26583608-26583855)
chr2 (18-254)||(23089096-23089329)
chr2 (58-254)||(23878789-23878982)
chr2 (59-238)||(23101545-23101722)
chr2 (5-91)||(5706051-5706137)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (4-254)||(14422-14672)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (4-254)||(20437050-20437299)
chr1 (4-91)||(41111977-41112063)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (4-254)||(777-1027)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (4-254)||(10222-10471)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (4-254)||(1552-1801)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (4-186)||(111728-111911)
scaffold0029 (207-254)||(111680-111727)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (4-254)||(1924-2173)
scaffold0117 (4-254)||(8601-8850)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (4-254)||(11122-11370)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (4-251)||(75-319)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (4-254)||(17948-18198)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (18-254)||(3334-3568)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (18-238)||(3663-3881)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (137-254)||(3441-3558)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (4-174)||(30715-30886)
[»] scaffold0456 (4 HSPs)
scaffold0456 (121-217)||(806-901)
scaffold0456 (121-217)||(7951-8046)
scaffold0456 (4-60)||(904-960)
scaffold0456 (4-60)||(8049-8105)
[»] scaffold0796 (2 HSPs)
scaffold0796 (4-168)||(1759-1920)
scaffold0796 (4-168)||(5782-5943)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (4-89)||(45301-45386)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15168207 - 15167954
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168207 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 15168108  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15168107 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 15168008  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15168007 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 15167954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18873392 - 18873139
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873392 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 18873293  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18873292 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 18873193  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18873192 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 18873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 10895817 - 10896067
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10895817 ataatcataatctataatttttgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 10895915  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10895916 tattgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgattg 10896015  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10896016 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 10896067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14423013 - 14422764
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14423013 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 14422915  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14422914 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 14422816  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  14422815 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 14422764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16009605 - 16009357
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16009605 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatggttttggaagataaattgtgggttaaggtttgatgatgattctg-aggggaatgggt 16009507  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||    
T  16009506 attgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaactgattga-aattatgattgattgg 16009408  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16009407 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 16009357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 12709870 - 12710117
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12709870 ataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattatgaagagaaatgggt 12709968  T
Q  104 aataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaa-ttatgagcgatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||    
T  12709969 aatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctgtgatcgtaaactgatttggaatttatgagtgatt 12710067  T
Q  202 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12710068 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtgattgttg 12710117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 13122941 - 13123188
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13122941 ataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattatgaagagaaatgggt 13123039  T
Q  104 aataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaa-ttatgagcgatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||    
T  13123040 aatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctgtgatcgtaaactgatttggaatttatgagtgatt 13123138  T
Q  202 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13123139 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtgattgttg 13123188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13743737 - 13743492
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13743737 ataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattatgaagagaaatgggt 13743639  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |||  |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||   | ||||    
T  13743638 aatgatcatgttaattttcttgtattatgctgttcagattgaagacttaatctatgttattgctgtgatcataaattggttga-aattatgcttggttgg 13743540  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    || |||||||||||   ||||| |||||||| |||  ||| |||||||    
T  13743539 ataaattgatgaataattgtataatggtggagtgatatgtgattgttg 13743492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16677324 - 16677152
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |  |     
T  16677324 ataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaaattaagggttagggtttgatgatgattttgaggaggatggt 16677225  T
Q  102 gtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatca 174  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  16677224 gtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatca 16677152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17651560 - 17651388
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatag-ttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |  |     
T  17651560 ataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaaattaagggttagggtttgatgatgattttgaggaggatggt 17651461  T
Q  102 gtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatca 174  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  17651460 gtaatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatca 17651388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 12590670 - 12590850
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  12590670 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 12590766  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattga 186  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  12590767 aaagatgatgttagttttcttggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgttgttgctgtaatccattaattgattga 12590850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13007460 - 13007213
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  13007460 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 13007364  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  13007363 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 13007266  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  13007265 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 13007213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22751173 - 22750920
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22751173 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 22751074  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22751073 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 22750974  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22750973 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 22750920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 28370081 - 28370329
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  28370081 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattttg-aggggaatgggt 28370179  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  28370180 attgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgatggg 28370278  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28370279 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 28370329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19512415 - 19512166
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  19512415 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattttgaggggaa-tggg 19512317  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  19512316 tattgatcatgttaattctattgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 19512218  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19512217 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 19512166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 38144563 - 38144810
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38144563 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcataattttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattctg-aggggaatgggt 38144661  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||    
T  38144662 attgatcatgttaattctattgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattacgattgattgg 38144760  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgtt 253  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38144761 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgtt 38144810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23528659 - 23528479
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  23528659 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 23528563  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattga 186  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23528562 aaggatgatgttagttttcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga 23528479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 42
Target Start/End: Original strand, 18407970 - 18408008
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattg 42  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18407970 ataatcataatatataatttctgaaaattgatctaattg 18408008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14762781 - 14763034
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14762781 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 14762880  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14762881 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 14762980  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14762981 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggagtgatctgtaattgttgttg 14763034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 38310823 - 38311076
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38310823 tcgataatcataatctataatttctgaatattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 38310922  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38310923 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 38311022  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38311023 tggatgaatggatgaatttgtgtatgaaggtggaatgatctgtaattgttgttg 38311076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 20247815 - 20248057
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20247815 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 20247914  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  20247915 aatgatcatgttaattttcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgattg- 20248013  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20248014 -------gatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 20248057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24192985 - 24192734
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192985 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 24192886  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtg-atcataaattgattgagaattatgagcgatt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||  ||||    
T  24192885 taatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctatgctgttgctgtgaatcataaactgattga-aaatatgattgatt 24192787  T
Q  202 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24192786 ggataaattgatgaatattggtatgatggtggaatgatctgtatttcttgttg 24192734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9534356 - 9534108
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  9534356 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattctg-agtggaatgggt 9534258  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  9534257 attgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgtcgtgatcataaattgattga-aattatgattgattgg 9534159  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9534158 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 9534108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 23370532 - 23370781
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23370532 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 23370630  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  23370631 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 23370729  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  23370730 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 23370781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 254
Target Start/End: Original strand, 55499185 - 55499377
Alignment:
Q  59 aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||    
T  55499185 aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctat 55499283  T
Q  159 gttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55499284 acagttgctgtgatcataaattgattga-aaatataattgattggatgaattgatcaagttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 55499377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 24933855 - 24934100
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||   ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  24933855 ataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaaattagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 24933951  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||| | || |||   ||||    
T  24933952 aaagatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgttgttgctgcaatccattaattgattga-atttttgatgtattg 24934050  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttg 251  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24934051 tatgaattgatgaatatttgtatgatggtagaatgattctgtaattgttg 24934100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 41455124 - 41455304
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||   |||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  41455124 ataatcataatctataatttctg-aaattgacctaattgaatagttttggaaaataggatgaaaattagggattgatgatgattctgatgg--aatgagt 41455220  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattga 186  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||  ||||||||| | ||||| || | |||||||| || ||| ||||||||||    
T  41455221 aaagatgatgttagttttcttgaaatttaatgtcaagaatgaaatcttaatccatatggttgctgtaatccatgaattgattga 41455304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 16801505 - 16801635
Alignment:
Q  16 tataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||  | ||||| |||||||    
T  16801505 tataatttctgaaaattgacctgattgcttagcttttgaagataaaattgaaggttaggg-ttgatgatgattttgaggagaatggtgtaatgatcatgt 16801603  T
Q  115 taattctgttgtaatataatgttcagaatgaa 146  Q
    ||| | || |||||| | ||||| ||||||||    
T  16801604 taaatatgctgtaatgtgatgtttagaatgaa 16801635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 11877 - 12127
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11877 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagagttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 11976  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||    
T  11977 aatgatcatgttaattctcttgtaatataatcttcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataagttgattgaaatttatgagtgattgg 12076  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12077 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 12127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 111714 - 111466
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  111714 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattctg-aggggaatgggt 111616  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  111615 attgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattgg 111517  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  111516 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 111466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1206 - 958
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1206 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgaggattatgaagggaaatgggt 1108  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1107 aatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct-tgttgttgctgtgatcataaattgattgaaatttatgagtgattgg 1009  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1008 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50207 - 49959
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50207 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgaggattatgaagggaaatgggt 50109  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  50108 aatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatct-tgttgttgctgtgatcataaattgattgaaatttatgagtgattgg 50010  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50009 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 49959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 8727759 - 8728009
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  8727759 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgacgatgattctgaggggta-tggg 8727857  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8727858 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgattg 8727957  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8727958 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 8728009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44477651 - 44477403
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  44477651 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattttg-aggggaatgggt 44477553  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  44477552 attgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattgg 44477454  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44477453 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 44477403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44492809 - 44492561
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  44492809 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattttg-aggggaatgggt 44492711  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  44492710 attgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattgg 44492612  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44492611 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 44492561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23866643 - 23866396
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23866643 ataatcataatttataattcctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattatgaagagaaatgggt 23866545  T
Q  104 aataatcatgttaattct-gttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaa-ttatgagcgatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||    
T  23866544 aatgatcatgttaattctatttgtaatataatgttcagaatataaacttaatct-tgttgttgctctgatcgtaaactgatttggaatttatgagtgatt 23866446  T
Q  202 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  23866445 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaataatctgtgattgttg 23866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 252
Target Start/End: Original strand, 27940946 - 27941127
Alignment:
Q  69 ttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |     
T  27940946 ttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tgggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaatttaatctatactgttgtta 27941044  T
Q  169 tgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgt 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  27941045 tgatcataaattgattga-aattatgattgattggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctatatttgttgt 27941127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17054619 - 17054440
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  17054619 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 17054523  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattga 186  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  17054522 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga 17054440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18614301 - 18614217
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgatt 87  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  18614301 ataatcatgatatataatttctgaaaattgatccaattgaattgttcttgaagataaaattgagaattagggttttatgctgatt 18614217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 8045856 - 8046105
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8045856 tcgataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgacgagaattctgaagggaaatg 8045954  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  8045955 ggtaaagataatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataaattgattgaaatttatgagtgat 8046054  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8046055 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttg 8046105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11848142 - 11847886
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa------ttgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaa 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||      ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  11848142 ataatcataatctataattcctgaaaattgacctagtggcatagttttgaaaaattaaaatcaattgagggttagggtttgatgacgattctgaagagga 11848043  T
Q  98 atgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagc 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  11848042 atgggtaatgatcatgttaatccttttataatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagt 11847943  T
Q  198 gattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11847942 gattggatgaattgatgaatttgtgtatgatgatggaatgatctgtaattgttgttg 11847886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 53483733 - 53483646
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  53483733 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggtttgatgatgattctga 53483646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27906291 - 27906159
Alignment:
Q  7 atcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaa 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||| | |||||| | |||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| | ||| | ||||    
T  27906291 atcataatgtataatttctgaaaattaatataatagaatagttcttgaagataaaattgagaattagggtgtgatgttgattttgaaagaaaaggtgtaa 27906192  T
Q  106 taatcatgttaattctgttgtaatataatgttc 138  Q
     ||||||||| | | ||||||||| | ||||||    
T  27906191 gaatcatgtttaatgtgttgtaatttgatgttc 27906159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23057970 - 23057760
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23057970 tcgataatcataatctataattcctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 23057871  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23057870 ggtaatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattgaaaattatgagtgat 23057771  T
Q  201 tggatgaattg 211  Q
    |||||||||||    
T  23057770 tggatgaattg 23057760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23839227 - 23838980
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagt-tttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23839227 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtgtttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattct-aaggggaatggg 23839129  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  23839128 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 23839030  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgt 252  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23839029 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgt 23838980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 29614173 - 29614423
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaga-taaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29614173 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctagttgcataattttggaaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattatgaagggaaatggg 29614272  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||    
T  29614273 taatgatcatgttaattctcttgtattg-aatgtttagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataacttgattgaaatttatgaatgattg 29614371  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  29614372 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaataatctgtaagtgttgttg 29614423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Original strand, 10986207 - 10986455
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10986207 ataatcataatctataatttctaaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 10986305  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||    
T  10986306 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattacgattgattg 10986404  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgtt 253  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10986405 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgtt 10986455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4477886 - 4477637
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4477886 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 4477788  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  4477787 tattgatcatgctaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 4477689  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  4477688 gatgatttgataaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 4477637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18800466 - 18800233
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagata-aattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  18800466 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcttagttttggaaaatagaattgagggttagggtttgatgatgattctggagggaa-tgag 18800368  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |  |||||    
T  18800367 taatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatctatattgttgttgtgatcacaaattgattga-aaatataattgattg 18800269  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga 238  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18800268 gatgaattgatgaagtttggtatgatggtggaatga 18800233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 21565253 - 21565486
Alignment:
Q  18 taatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgtta 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21565253 taatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggtttgatgatgattct-aaggggaatgggtaatgatcatgtta 21565350  T
Q  117 attctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaa 216  Q
    ||| ||||||||| | | |||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  21565351 attatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcataaattgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaa 21565449  T
Q  217 tttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
     || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21565450 gttctgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 21565486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 930122 - 930229
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  930122 ataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgtatagttttgaaaaataaattgagggttagggtttgatgatgtttctgaaggg-aatgggt 930220  T
Q  104 aataatcat 112  Q
    ||| |||||    
T  930221 aatgatcat 930229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12168391 - 12168144
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  12168391 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 12168295  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  12168294 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 12168197  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12168196 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 12168144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19287300 - 19287053
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  19287300 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 19287204  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  19287203 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 19287106  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19287105 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 19287053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 19785896 - 19786143
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  19785896 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctagttgaatagttttggaaaataaaatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 19785992  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  19785993 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 19786090  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19786091 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 19786143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19878484 - 19878237
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  19878484 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 19878388  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  19878387 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 19878290  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19878289 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 19878237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19884260 - 19884013
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  19884260 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 19884164  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgat-cataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    ||  || |||||| || | ||| ||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||  ||   ||||    
T  19884163 aaagatgatgttagtt-tcttggaatttaatgttaagaacgaaatcttaatccatgttgttgctgtaatccatgaattgattga-attttggatgaattg 19884066  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga-gctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  19884065 tatgaattgatgaaatattgtgtgatggtggaatgattctataattgttgttg 19884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 34640013 - 34640100
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||   |||||||||||||||| ||||||    
T  34640013 ataatcttaatctataatttctgaaaattgacctaattgaatagttttggaaaataataagaaaattagggtttgatgatggttctga 34640100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 34646687 - 34646774
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   ||   |||||||||||||||| ||||||    
T  34646687 ataatcttaatctataatttctgaaaattgacctaattgaataattttggaaaataataagaaaattagggtttgatgatggttctga 34646774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 25469731 - 25469816
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||  |||   ||||||||||||||| |||||||    
T  25469731 ataatcataatctataatt-ctgaaa-ttgacctaattgaatggttttggaaaataatatgaaaattagggtttgatgataattctga 25469816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19661477 - 19661728
Alignment:
Q  1 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19661477 tcgataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctg-aggggaatg 19661575  T
Q  101 ggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgat 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  19661576 ggtattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatattgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgat 19661674  T
Q  201 tggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  19661675 tggatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 19661728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6483746 - 6483498
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  6483746 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattttg-aggggaatgggt 6483648  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  6483647 attgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgatggg 6483549  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6483548 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 6483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6487213 - 6486965
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  6487213 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattttg-aggggaatgggt 6487115  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  6487114 attgatcatgttaattctgttgtaacgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgatggg 6487016  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6487015 atgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 6486965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26583855 - 26583608
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26583855 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggcttgatgatgattctgaggggaaa-gggt 26583758  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||| || |||| |   |||||  |  | ||||    
T  26583757 aatgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgttcagaatgaattcctaatctataatgttgctgtgatcacaatttgaattgtaattagaattggttgg 26583658  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26583657 atgaattggtgaaattttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 26583608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 23089096 - 23089329
Alignment:
Q  18 taatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgtta 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  23089096 taatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggtttgatgatgattct-aaggggaatgggtaatgatcatgtta 23089193  T
Q  117 attctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaa 216  Q
    ||| ||||||||| | | |||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  23089194 attatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcataaattgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaa 23089292  T
Q  217 tttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
     || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23089293 gttctgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 23089329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23878982 - 23878789
Alignment:
Q  58 taaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatcta 157  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  23878982 taaattgagggttagggtt-gttgatgattctgaggggaatggggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatcta 23878884  T
Q  158 tgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23878883 tactgttgttgtgatcataaattgattga-aaatagaattgattggatgaattgatgaagttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 23878789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 238
Target Start/End: Original strand, 23101545 - 23101722
Alignment:
Q  59 aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||| | ||||||||    
T  23101545 aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgatcatgttaattatgttgtaatgtgacgttcggaatgaaatcttaatctat 23101643  T
Q  159 gttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatga 238  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23101644 actgttgttgtgatcataaattgattga-aaatataattgattggatgaattcatgaagttctgtatgatggtggaatga 23101722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 5706051 - 5706137
Alignment:
Q  5 taatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  5706051 taatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggtttgatgatgattctga 5706137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 14422 - 14672
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 14521  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||    
T  14522 taatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttccgaatgaaaacttaatctatgctgttgctgtgatcataaactgattga-aaatatgattgattg 14620  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14621 gataaattgatgaatattggtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 14672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 20437050 - 20437299
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20437050 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 20437148  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20437149 tattgatcatgttaattatgttgtaatgtaatgttcagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 20437247  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20437248 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggaatgatctgtatttgttgttg 20437299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 41112063 - 41111977
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41112063 ataatcataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgaatagttttgaaaaataagatgaaagttagggtttgatgatgattctga 41111977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 777 - 1027
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  777 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgaggattatgaagggaaatggg 876  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  877 taatgatcatgataatactcttgtaatataatgttcaggataaaaacttaatct-tgttgttgatgtgatcataaactgattgaaatttatgagtgattg 975  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  976 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaaagatttgtgattgttgttg 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 10222 - 10471
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10222 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 10320  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  10321 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 10419  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  10420 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 10471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1801
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1552 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttttggaagataaattgtgggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tggg 1650  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  1651 tattgatcatgttaattctgttgtaatgtaatgtttagaatgaaaacttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aattatgattgattg 1749  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  1750 gatgaattgatgaagatttgtatgatggtggagtgatctgtatttgttgttg 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 111911 - 111728
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111911 ataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 111812  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattga 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  111811 taatgatcatgttaattctcttgtaatataatgttcagaatgaaaacttaatctttgttgctgctgtgatcataaattgattga 111728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 111727 - 111680
Alignment:
Q  207 aattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  111727 aattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgatctgtaattgttgttg 111680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 1924 - 2173
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  1924 ataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgtatagttttggaaaataatttgagggttagggtttgatgatgattttgatgg--aatggg 2021  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||    
T  2022 taatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcataatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataacttgattgaaattgatgagtgattg 2121  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  2122 tatgaattgatgaatttgtgtacgatggtggaataatctgtaaatgttgttg 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 8601 - 8850
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaa-ttgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  8601 ataatcataatctataatttctgaaaaattgacctaattgtatagttttggaaaataatttgagggttagggtttgatgatgattatgatgg--aatggg 8698  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | | || || |||||    
T  8699 taatgattatgttaattctcttgtaatttaatgttcaaaatgaaaacttaatccttgttgttgctgtgatcataacttgattgaaattgataagtgattg 8798  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8799 tatgaattgatgaatttgtgtacgatggtggaataatctgtaaatgttgttg 8850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11370 - 11122
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagata-aattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  11370 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcttagttttggaaaatagaattgagggttagggtttgatgatgattctggaggg-aatgag 11272  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  |||||    
T  11271 taatgatcatgttaattctgttgtaatgtgatgttcaaaatgaaatcttaatccatactgttgctgtgatcacaaattgattga-aaatataattgattg 11173  T
Q  203 gatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  11172 gatgaattgatgaagttttgtatgatggtggattgatctgt-attgttgttg 11122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 319 - 75
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  319 ataaccataatctataatttctgaaa-ttgacctaattgcatagttttggaaaataaattgagggttagggtttgatgatgattctg-aggggaatgggt 222  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattgg 203  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |||  |||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||    
T  221 aatgatcatgttaattttcttgtattatggtgttcagattgaagacttaatctatgttattgatgtgatcataaattggttga-aattatgattggttgg 123  T
Q  204 atgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttg 251  Q
    || |||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  122 ataaattgatgaataattgtataatggtggagtgatctgtatttgttg 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18198 - 17948
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagtttt-ggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||     
T  18198 ataatcataatctataatttttgaaaattgacctaattgcttagctttaggaaaataaattgagggttaaggtttaatgatgattctaacgggaaatgg- 18100  T
Q  103 taataatcatgttaattctgtt-gtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgatt 201  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||  ||||    
T  18099 taatggtcatgttaattctgtttgtaatgtgatgtccagaatgaaaacttaacctatgttgttgctgtgatcatgaattgattga-aatttggattgatt 18001  T
Q  202 ggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18000 ggataaattgatgaatatttgtatgatggtgtgatgatctgtaattgttgttg 17948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 3334 - 3568
Alignment:
Q  18 taatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaat-aatcatgtt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  3334 taatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttggg-gataaaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggaa-tgggtaatgaatcatgtt 3431  T
Q  116 aattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatga 215  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  3432 aattttgttgtaatgtgatgttcagaatgaaatcttaatctatactgttgctgtgatcacaaattgattga-aaatataattgattggatgaattgatga 3530  T
Q  216 atttgtgtatgatggtggaatgagctgtaattgttgttg 254  Q
    | || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3531 agttttgtatgatggtggaatgatctgt-attgttgttg 3568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 3663 - 3881
Alignment:
Q  18 taatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaa-ttgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggtaataatcatgtta 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  3663 taatttcggaaaattgacctaattgcttaaccttg-aggataaaattgagggttagggtttgatgatgattctgaggggga-tgggtaatgatcatgtta 3760  T
Q  117 attctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaa 216  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  3761 attatgttgtaatgtgatgttcggaatgaaatcttaatctatactgttgttgtgatcataaattgattga-aaatataattgattggatgaattgatgaa 3859  T
Q  217 tttgtgtatgatggtggaatga 238  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  3860 gttttgtatgatggtggaatga 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3558 - 3441
Alignment:
Q  137 tcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaat 236  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3558 tcagaatgaaaacttaatctttgttgttgctgtgatcataaattgattgaaatttatgggtgattggatgaattgatgaatttgtgtatgatggtggaat 3459  T
Q  237 gagctgtaattgttgttg 254  Q
    || |||||||||||||||    
T  3458 gatctgtaattgttgttg 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30886 - 30715
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagat-aaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  | |    
T  30886 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaaggtaaaattgaggattagggtttgatgatgattttgaggggaatggtg 30787  T
Q  103 taataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatca 174  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||    
T  30786 taacgatcatgttaaatatgttgtaaagtgatgtgcagaatgaattcctaatctataatgttgatgtgatca 30715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 901 - 806
Alignment:
Q  121 tgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaat 217  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  901 tgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctgtgttgttgctgtgatcataaattgattg-gaattatgagggattggataaattgatgaat 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8046 - 7951
Alignment:
Q  121 tgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctgtgatcataaattgattgagaattatgagcgattggatgaattgatgaat 217  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8046 tgttgtaatgtgatgttcagaatgaaaacttaatctgtgttgttgctgtgatcataaattgattg-gaattatgagggattggataaattgatgaat 7951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 960 - 904
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  960 ataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgcatagtcttggaagataa 904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8105 - 8049
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataa 60  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8105 ataatcataatctatagtttctgaaaattgacctaattgcatagtcttggaagataa 8049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0796
Description:

Target: scaffold0796; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 1759 - 1920
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  1759 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 1855  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctg 168  Q
    ||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  1856 aaggatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgctgttgctg 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0796; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 5782 - 5943
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaattgagggttagggtttgatgatgattctgaagggaaatgggt 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  5782 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagttttggaaaataatatgaaagttagggtttgatgatgattctgatgg--aatgagt 5878  T
Q  104 aataatcatgttaattctgttgtaatataatgttcagaatgaaaacataatctatgttgttgctg 168  Q
    ||  || |||||| || | | | ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  5879 aaggatgatgttagttttctcggaatttaatgttaagaatgaaagcttaatccatgctgttgctg 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Original strand, 45301 - 45386
Alignment:
Q  4 ataatcataatctataatttctgaaaattgacctaattgcatagttttggaagataaat-tgagggttagggtttgatgatgattct 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |  ||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  45301 ataatcataatctataattcctgaaa-ttgacctaattgaatagtttttgaaaaataatatgaaaattagggtttgatgatgattct 45386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University