View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1950_high_8 (Length: 362)

Name: NF1950_high_8
Description: NF1950
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1950_high_8
NF1950_high_8
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (132-311)||(39934963-39935142)
chr3 (150-338)||(22304560-22304747)
chr3 (170-317)||(43346793-43346940)
chr3 (170-343)||(37990615-37990788)
chr3 (170-346)||(37990950-37991126)
chr3 (159-319)||(32589704-32589861)
chr3 (170-346)||(42342361-42342537)
chr3 (170-346)||(54017790-54017965)
chr3 (170-319)||(35946531-35946680)
chr3 (170-346)||(15772863-15773038)
chr3 (171-331)||(29644890-29645050)
chr3 (170-319)||(33803252-33803401)
chr3 (170-319)||(54018198-54018347)
chr3 (171-331)||(12114550-12114710)
chr3 (184-319)||(41359765-41359900)
chr3 (151-310)||(39389062-39389219)
chr3 (170-348)||(52634685-52634861)
chr3 (170-319)||(29644581-29644730)
chr3 (170-311)||(22303963-22304097)
chr3 (170-316)||(32462903-32463050)
chr3 (170-319)||(25739425-25739574)
chr3 (170-319)||(25755403-25755552)
chr3 (184-317)||(42342092-42342225)
chr3 (170-319)||(21832345-21832492)
chr3 (170-319)||(53577373-53577522)
chr3 (151-319)||(50612447-50612618)
chr3 (170-319)||(3135454-3135610)
chr3 (150-302)||(4823646-4823796)
chr3 (170-293)||(3135099-3135222)
chr3 (170-321)||(39914261-39914412)
chr3 (170-313)||(15773201-15773346)
chr3 (219-343)||(22303634-22303759)
chr3 (170-320)||(31190026-31190168)
chr3 (191-316)||(45395656-45395781)
chr3 (201-343)||(1634291-1634432)
chr3 (201-320)||(45901754-45901873)
chr3 (170-343)||(33175635-33175813)
chr3 (170-319)||(53117975-53118123)
chr3 (235-343)||(41359467-41359575)
chr3 (201-319)||(32462558-32462676)
chr3 (190-319)||(44160547-44160673)
chr3 (170-311)||(49336694-49336836)
chr3 (170-320)||(8327913-8328067)
chr3 (190-318)||(11661980-11662108)
chr3 (151-319)||(37726496-37726654)
chr3 (151-320)||(51886553-51886714)
chr3 (190-285)||(33362327-33362422)
chr3 (231-345)||(54017522-54017636)
chr3 (171-343)||(42584800-42584970)
chr3 (170-312)||(9240158-9240300)
chr3 (203-293)||(47964544-47964634)
chr3 (270-346)||(22304302-22304379)
chr3 (203-289)||(39336000-39336086)
chr3 (203-308)||(12749211-12749316)
chr3 (170-319)||(47964915-47965064)
chr3 (211-271)||(52634990-52635050)
chr3 (150-268)||(3384317-3384433)
chr3 (203-331)||(39336219-39336345)
chr3 (203-269)||(46546375-46546441)
chr3 (265-318)||(8328374-8328427)
chr3 (170-253)||(7767380-7767463)
chr3 (150-216)||(22304237-22304301)
chr3 (228-279)||(53596027-53596078)
chr3 (228-279)||(53596342-53596393)
chr3 (216-273)||(17731950-17732007)
chr3 (216-273)||(19033181-19033238)
chr3 (241-319)||(43978865-43978947)
chr3 (228-279)||(53596542-53596593)
chr3 (203-293)||(25317200-25317290)
chr3 (243-319)||(7766783-7766857)
chr3 (244-279)||(11661603-11661638)
chr3 (228-275)||(48127859-48127906)
chr3 (170-228)||(11661544-11661602)
chr3 (12-60)||(39935213-39935258)
chr3 (288-345)||(9239940-9239996)
chr3 (170-279)||(25991412-25991521)
chr3 (229-273)||(16871005-16871049)
chr3 (229-273)||(17735037-17735081)
chr3 (229-273)||(19036306-19036350)
chr3 (170-217)||(43346659-43346706)
chr3 (292-346)||(41360110-41360164)
chr3 (228-273)||(16143505-16143550)
chr3 (232-273)||(16869843-16869884)
chr3 (224-260)||(50329391-50329427)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (151-346)||(6500443-6500635)
chr5 (150-346)||(6500814-6501007)
chr5 (170-343)||(40296292-40296464)
chr5 (170-315)||(18603124-18603269)
chr5 (170-346)||(25327944-25328120)
chr5 (151-343)||(27502013-27502202)
chr5 (151-319)||(32487386-32487551)
chr5 (170-319)||(41170643-41170792)
chr5 (184-319)||(3295345-3295479)
chr5 (156-318)||(36492218-36492378)
chr5 (159-332)||(3295002-3295172)
chr5 (149-319)||(9498655-9498822)
chr5 (170-319)||(15370108-15370257)
chr5 (150-344)||(624187-624379)
chr5 (171-341)||(41632792-41632961)
chr5 (170-343)||(42405574-42405745)
chr5 (170-343)||(26074122-26074295)
chr5 (170-330)||(13415750-13415909)
chr5 (170-319)||(11416977-11417126)
chr5 (171-315)||(34753029-34753173)
chr5 (170-341)||(26074621-26074792)
chr5 (170-344)||(1028492-1028666)
chr5 (198-332)||(15370439-15370573)
chr5 (170-331)||(6224205-6224366)
chr5 (173-312)||(26075168-26075308)
chr5 (170-343)||(36568545-36568716)
chr5 (170-319)||(299498-299647)
chr5 (170-319)||(12662652-12662801)
chr5 (173-315)||(33747783-33747925)
chr5 (170-320)||(35150016-35150165)
chr5 (151-319)||(623810-623976)
chr5 (156-296)||(29549278-29549416)
chr5 (170-331)||(24489194-24489353)
chr5 (184-319)||(35167838-35167973)
chr5 (198-311)||(26590918-26591031)
chr5 (151-299)||(5723811-5723957)
chr5 (172-317)||(300970-301107)
chr5 (170-293)||(26074807-26074931)
chr5 (165-311)||(38427552-38427697)
chr5 (170-330)||(2411016-2411176)
chr5 (247-329)||(26900007-26900089)
chr5 (170-319)||(35914858-35915007)
chr5 (185-298)||(41635212-41635325)
chr5 (146-236)||(7768837-7768925)
chr5 (170-293)||(36521922-36522045)
chr5 (205-279)||(36522277-36522351)
chr5 (228-279)||(13042606-13042657)
chr5 (170-241)||(26074327-26074398)
chr5 (248-319)||(38427306-38427377)
chr5 (219-320)||(13785631-13785732)
chr5 (245-297)||(795254-795306)
chr5 (184-256)||(42508635-42508707)
chr5 (232-299)||(9498343-9498410)
chr5 (175-286)||(19275543-19275653)
chr5 (218-297)||(36527117-36527196)
chr5 (204-318)||(13786002-13786116)
chr5 (203-286)||(31509773-31509857)
chr5 (219-279)||(32445943-32446003)
chr5 (228-275)||(13112604-13112651)
chr5 (170-279)||(31509632-31509742)
chr5 (241-279)||(13042784-13042822)
chr5 (241-279)||(13112782-13112820)
chr5 (219-317)||(42435486-42435583)
chr5 (263-315)||(24489583-24489635)
chr5 (170-242)||(39309693-39309764)
chr5 (170-221)||(6225053-6225104)
chr5 (228-279)||(36389016-36389067)
chr5 (243-273)||(5963765-5963795)
chr5 (215-293)||(9510546-9510624)
chr5 (259-295)||(795152-795189)
chr5 (251-315)||(5660340-5660405)
chr5 (232-273)||(34103625-34103666)
chr5 (266-319)||(35150810-35150863)
chr5 (229-273)||(41341523-41341567)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (150-346)||(44290797-44290992)
chr1 (146-319)||(41759470-41759641)
chr1 (150-319)||(44290458-44290625)
chr1 (171-330)||(3537589-3537747)
chr1 (170-330)||(41157384-41157545)
chr1 (170-319)||(41142381-41142531)
chr1 (150-346)||(48588460-48588655)
chr1 (151-315)||(3550712-3550871)
chr1 (190-343)||(41157020-41157175)
chr1 (170-319)||(26661522-26661671)
chr1 (153-287)||(32594748-32594880)
chr1 (170-346)||(9955916-9956093)
chr1 (184-346)||(31767135-31767296)
chr1 (150-345)||(45493949-45494146)
chr1 (170-319)||(29798208-29798357)
chr1 (170-346)||(34364516-34364691)
chr1 (170-316)||(17294586-17294733)
chr1 (171-317)||(3875333-3875479)
chr1 (170-320)||(34364934-34365084)
chr1 (170-319)||(14318876-14319025)
chr1 (170-310)||(37556120-37556260)
chr1 (170-311)||(40082416-40082556)
chr1 (170-319)||(34649447-34649596)
chr1 (170-346)||(50051998-50052172)
chr1 (190-343)||(32168674-32168821)
chr1 (186-296)||(26661921-26662031)
chr1 (170-319)||(5319965-5320114)
chr1 (170-319)||(11977289-11977438)
chr1 (170-330)||(22077484-22077644)
chr1 (170-343)||(45084391-45084557)
chr1 (170-332)||(37850588-37850749)
chr1 (170-304)||(38804370-38804504)
chr1 (170-310)||(37555739-37555878)
chr1 (170-348)||(66444-66621)
chr1 (184-319)||(39066201-39066335)
chr1 (198-328)||(22077101-22077231)
chr1 (170-312)||(24600321-24600463)
chr1 (173-348)||(5575116-5575289)
chr1 (170-346)||(41184380-41184574)
chr1 (171-345)||(5528728-5528902)
chr1 (170-343)||(24131965-24132134)
chr1 (195-281)||(44043810-44043896)
chr1 (170-330)||(22077818-22077977)
chr1 (150-240)||(3537226-3537314)
chr1 (184-308)||(66100-66223)
chr1 (208-309)||(45839678-45839779)
chr1 (232-319)||(11977015-11977102)
chr1 (173-346)||(30630611-30630784)
chr1 (170-313)||(22793287-22793431)
chr1 (231-319)||(50051689-50051776)
chr1 (170-341)||(19283434-19283604)
chr1 (176-318)||(44091909-44092051)
chr1 (260-344)||(21378035-21378118)
chr1 (184-279)||(10351183-10351278)
chr1 (232-343)||(47380143-47380254)
chr1 (215-332)||(1188574-1188692)
chr1 (198-308)||(4956228-4956340)
chr1 (170-309)||(44685465-44685605)
chr1 (171-242)||(21378118-21378189)
chr1 (210-255)||(41184152-41184197)
chr1 (260-319)||(4266798-4266855)
chr1 (216-276)||(35154046-35154106)
chr1 (215-332)||(1187349-1187468)
chr1 (206-321)||(5996870-5996984)
chr1 (170-220)||(50469180-50469230)
chr1 (170-226)||(4266875-4266931)
chr1 (170-318)||(9498988-9499136)
chr1 (243-279)||(12466365-12466401)
chr1 (170-229)||(30630912-30630972)
chr1 (234-280)||(9956212-9956258)
chr1 (254-331)||(30697310-30697387)
chr1 (301-343)||(45084576-45084617)
chr1 (243-279)||(31973375-31973411)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (150-319)||(29518911-29519078)
chr6 (151-319)||(29518495-29518661)
chr6 (151-319)||(32741171-32741337)
chr6 (151-346)||(35210196-35210387)
chr6 (151-309)||(3409251-3409407)
chr6 (150-319)||(2378117-2378284)
chr6 (150-319)||(3409651-3409818)
chr6 (149-330)||(3415448-3415629)
chr6 (170-332)||(16454916-16455078)
chr6 (151-343)||(3058218-3058409)
chr6 (170-319)||(2377763-2377912)
chr6 (152-319)||(1846741-1846906)
chr6 (170-346)||(2579847-2580021)
chr6 (151-319)||(14748342-14748504)
chr6 (170-346)||(16454584-16454759)
chr6 (190-319)||(2578443-2578572)
chr6 (170-319)||(2843563-2843713)
chr6 (184-330)||(10074352-10074498)
chr6 (170-310)||(16107687-16107827)
chr6 (170-321)||(10073989-10074140)
chr6 (151-309)||(26544041-26544197)
chr6 (151-331)||(1127352-1127530)
chr6 (171-341)||(5832007-5832174)
chr6 (185-332)||(2578822-2578968)
chr6 (170-333)||(2579478-2579641)
chr6 (170-316)||(6999799-6999945)
chr6 (198-331)||(10073604-10073737)
chr6 (171-348)||(2579082-2579253)
chr6 (170-315)||(10911574-10911720)
chr6 (170-332)||(593694-593858)
chr6 (170-269)||(32460630-32460729)
chr6 (170-304)||(1950200-1950334)
chr6 (170-318)||(16108072-16108208)
chr6 (226-346)||(12071665-12071784)
chr6 (170-332)||(12085021-12085182)
chr6 (170-286)||(9062383-9062498)
chr6 (170-313)||(5958613-5958752)
chr6 (224-342)||(31714732-31714849)
chr6 (203-331)||(12092470-12092598)
chr6 (170-280)||(8481936-8482045)
chr6 (203-293)||(6071174-6071264)
chr6 (207-346)||(30618592-30618727)
chr6 (184-277)||(2975575-2975668)
chr6 (170-330)||(17135058-17135218)
chr6 (229-273)||(22605301-22605345)
chr6 (265-312)||(3409405-3409452)
chr6 (229-280)||(11637760-11637811)
chr6 (198-244)||(14789279-14789325)
chr6 (184-234)||(35210501-35210551)
chr6 (229-273)||(21130103-21130147)
chr6 (253-311)||(10902438-10902496)
chr6 (286-346)||(2975296-2975355)
chr6 (237-279)||(11638053-11638095)
chr6 (295-344)||(35210554-35210602)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (150-341)||(50630731-50630920)
chr4 (170-346)||(25483345-25483520)
chr4 (151-328)||(55933113-55933288)
chr4 (170-342)||(36629246-36629418)
chr4 (151-319)||(41370349-41370515)
chr4 (170-316)||(54017596-54017742)
chr4 (170-318)||(1731646-1731794)
chr4 (170-346)||(3340816-3340991)
chr4 (170-346)||(10245929-10246104)
chr4 (170-332)||(39792845-39793007)
chr4 (170-346)||(39404027-39404203)
chr4 (170-318)||(39404407-39404555)
chr4 (184-350)||(54936219-54936383)
chr4 (173-346)||(22028339-22028515)
chr4 (156-319)||(50002423-50002584)
chr4 (170-331)||(36608647-36608808)
chr4 (184-309)||(54108936-54109060)
chr4 (183-319)||(18932747-18932883)
chr4 (173-344)||(22027935-22028105)
chr4 (168-319)||(44620360-44620511)
chr4 (171-319)||(54343006-54343147)
chr4 (170-309)||(52884704-52884844)
chr4 (184-319)||(44621025-44621160)
chr4 (170-332)||(44620669-44620830)
chr4 (170-318)||(34646648-34646796)
chr4 (170-318)||(50459730-50459878)
chr4 (170-312)||(32941128-32941270)
chr4 (192-346)||(49076804-49076955)
chr4 (170-319)||(36572028-36572177)
chr4 (170-320)||(49302913-49303065)
chr4 (151-299)||(49880152-49880297)
chr4 (170-302)||(4955332-4955464)
chr4 (170-346)||(20825845-20826021)
chr4 (170-309)||(52884896-52885038)
chr4 (170-328)||(22183253-22183411)
chr4 (190-319)||(54108565-54108694)
chr4 (215-319)||(23817679-23817783)
chr4 (184-290)||(45496828-45496934)
chr4 (184-316)||(4390102-4390234)
chr4 (170-318)||(16889535-16889683)
chr4 (170-314)||(20826226-20826370)
chr4 (170-329)||(16888804-16888963)
chr4 (170-332)||(43174515-43174677)
chr4 (170-332)||(2740709-2740869)
chr4 (170-320)||(3244448-3244598)
chr4 (170-270)||(2741080-2741180)
chr4 (207-317)||(18879852-18879962)
chr4 (170-316)||(34004586-34004730)
chr4 (201-319)||(43827480-43827597)
chr4 (212-313)||(31691203-31691306)
chr4 (170-284)||(6975489-6975603)
chr4 (173-346)||(54741151-54741322)
chr4 (184-319)||(3271807-3271947)
chr4 (170-316)||(51768061-51768207)
chr4 (170-307)||(19504714-19504842)
chr4 (170-279)||(41707503-41707611)
chr4 (173-318)||(45489331-45489475)
chr4 (170-319)||(49076449-49076595)
chr4 (170-319)||(3341137-3341286)
chr4 (170-316)||(3700374-3700512)
chr4 (190-319)||(48111696-48111825)
chr4 (184-269)||(54017750-54017835)
chr4 (203-302)||(15841383-15841482)
chr4 (170-298)||(40067052-40067181)
chr4 (253-319)||(43174233-43174299)
chr4 (203-319)||(28034271-28034387)
chr4 (163-330)||(760191-760356)
chr4 (228-279)||(11197293-11197344)
chr4 (172-250)||(10246358-10246436)
chr4 (224-346)||(11783525-11783646)
chr4 (203-279)||(34544148-34544225)
chr4 (247-319)||(45489712-45489784)
chr4 (170-293)||(23556890-23557013)
chr4 (274-345)||(23817429-23817498)
chr4 (198-317)||(39698944-39699065)
chr4 (241-315)||(41370738-41370812)
chr4 (170-227)||(44620305-44620362)
chr4 (228-279)||(10396198-10396249)
chr4 (228-279)||(10396483-10396534)
chr4 (170-249)||(11348396-11348475)
chr4 (228-280)||(922485-922537)
chr4 (229-268)||(1868119-1868158)
chr4 (271-310)||(19895406-19895445)
chr4 (151-213)||(50788087-50788147)
chr4 (219-277)||(11706584-11706641)
chr4 (173-279)||(15841023-15841128)
chr4 (227-273)||(51681604-51681650)
chr4 (275-332)||(11702284-11702341)
chr4 (170-227)||(44621435-44621492)
chr4 (289-346)||(45496678-45496735)
chr4 (234-315)||(50787996-50788077)
chr4 (215-275)||(2891864-2891924)
chr4 (228-279)||(11197003-11197054)
chr4 (184-227)||(44620968-44621011)
chr4 (216-259)||(45484774-45484817)
chr4 (205-279)||(31249896-31249970)
chr4 (237-279)||(41707279-41707321)
chr4 (272-309)||(19895533-19895570)
chr4 (224-257)||(29802604-29802637)
chr4 (289-329)||(1731581-1731621)
chr4 (243-279)||(34946151-34946187)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (170-346)||(1085590-1085765)
chr7 (170-343)||(7517589-7517762)
chr7 (153-345)||(29157559-29157749)
chr7 (170-346)||(37533338-37533513)
chr7 (150-319)||(37533011-37533177)
chr7 (170-344)||(11845200-11845373)
chr7 (170-319)||(23377-23526)
chr7 (171-319)||(6054570-6054718)
chr7 (170-319)||(30244279-30244428)
chr7 (170-309)||(19122741-19122879)
chr7 (184-331)||(45433264-45433411)
chr7 (184-346)||(22567012-22567174)
chr7 (170-319)||(40094774-40094923)
chr7 (150-316)||(14681501-14681663)
chr7 (170-317)||(34218036-34218183)
chr7 (170-308)||(45754725-45754862)
chr7 (171-343)||(118277-118449)
chr7 (170-319)||(24177444-24177593)
chr7 (170-344)||(30245086-30245255)
chr7 (170-311)||(36939741-36939882)
chr7 (170-290)||(7554034-7554154)
chr7 (171-319)||(45434646-45434794)
chr7 (170-346)||(47129104-47129278)
chr7 (170-346)||(8128414-8128590)
chr7 (165-319)||(30032571-30032725)
chr7 (170-342)||(36622969-36623140)
chr7 (170-317)||(9901654-9901799)
chr7 (170-280)||(22566702-22566811)
chr7 (184-317)||(37167810-37167937)
chr7 (170-281)||(16569205-16569316)
chr7 (170-281)||(16596346-16596457)
chr7 (203-319)||(30253534-30253646)
chr7 (171-296)||(24838724-24838850)
chr7 (207-343)||(28300229-28300366)
chr7 (171-315)||(40230295-40230439)
chr7 (242-344)||(47129450-47129550)
chr7 (170-319)||(41854644-41854792)
chr7 (190-287)||(1085280-1085377)
chr7 (173-310)||(36534795-36534930)
chr7 (170-316)||(20599323-20599471)
chr7 (244-318)||(28300569-28300644)
chr7 (170-313)||(41910592-41910743)
chr7 (249-317)||(37532753-37532821)
chr7 (262-343)||(30244453-30244533)
chr7 (262-343)||(30253671-30253751)
chr7 (170-282)||(43241504-43241616)
chr7 (170-249)||(28301613-28301692)
chr7 (262-346)||(30245256-30245339)
chr7 (170-234)||(30245503-30245567)
chr7 (228-279)||(21416181-21416232)
chr7 (271-343)||(7517767-7517839)
chr7 (271-343)||(7518033-7518105)
chr7 (230-278)||(23569043-23569091)
chr7 (172-234)||(30255350-30255412)
chr7 (210-279)||(4124128-4124197)
chr7 (159-279)||(37345916-37346036)
chr7 (174-266)||(44361517-44361608)
chr7 (170-229)||(36109007-36109066)
chr7 (229-308)||(40094424-40094503)
chr7 (244-306)||(45755010-45755072)
chr7 (228-273)||(21619091-21619136)
chr7 (170-231)||(30244710-30244771)
chr7 (216-319)||(37393114-37393216)
chr7 (203-319)||(15902342-15902457)
chr7 (229-273)||(27391815-27391859)
chr7 (256-310)||(4719305-4719359)
chr7 (297-343)||(7517982-7518028)
chr7 (170-211)||(40094502-40094543)
chr7 (228-268)||(27598052-27598092)
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (151-345)||(41283449-41283641)
chr2 (150-319)||(36178605-36178772)
chr2 (150-317)||(37106179-37106344)
chr2 (151-319)||(14745667-14745833)
chr2 (170-346)||(42514658-42514833)
chr2 (150-319)||(5542625-5542792)
chr2 (150-315)||(5543002-5543165)
chr2 (146-319)||(37105911-37106082)
chr2 (170-346)||(6421394-6421569)
chr2 (170-319)||(15511495-15511644)
chr2 (184-319)||(6422133-6422268)
chr2 (170-313)||(15880272-15880415)
chr2 (170-316)||(962607-962753)
chr2 (184-319)||(36178171-36178306)
chr2 (161-343)||(33731648-33731831)
chr2 (170-344)||(6712985-6713160)
chr2 (170-346)||(38796590-38796769)
chr2 (170-319)||(35580724-35580872)
chr2 (198-312)||(36005887-36006001)
chr2 (170-343)||(37632575-37632746)
chr2 (170-319)||(40733526-40733675)
chr2 (150-312)||(14745300-14745461)
chr2 (170-316)||(40679632-40679778)
chr2 (151-345)||(1769884-1770075)
chr2 (150-329)||(7598600-7598769)
chr2 (198-343)||(23346274-23346417)
chr2 (173-300)||(28254258-28254383)
chr2 (223-342)||(6421793-6421911)
chr2 (172-329)||(40163362-40163520)
chr2 (173-320)||(7598240-7598387)
chr2 (215-343)||(3673122-3673249)
chr2 (170-317)||(28531316-28531463)
chr2 (151-268)||(36178320-36178435)
chr2 (170-319)||(40733892-40734040)
chr2 (190-305)||(5367484-5367599)
chr2 (170-309)||(12529038-12529177)
chr2 (170-319)||(29676544-29676687)
chr2 (233-342)||(3672773-3672882)
chr2 (170-318)||(29676912-29677065)
chr2 (223-315)||(6421688-6421780)
chr2 (170-343)||(16590897-16591065)
chr2 (172-346)||(30313189-30313361)
chr2 (185-277)||(31259658-31259750)
chr2 (214-306)||(36784273-36784365)
chr2 (172-319)||(29874023-29874170)
chr2 (170-268)||(16542458-16542556)
chr2 (170-269)||(31468800-31468895)
chr2 (170-249)||(31899496-31899575)
chr2 (170-273)||(37895107-37895210)
chr2 (170-319)||(9231258-9231407)
chr2 (203-292)||(31385779-31385868)
chr2 (170-279)||(33561491-33561600)
chr2 (184-331)||(29873525-29873672)
chr2 (203-278)||(30323506-30323581)
chr2 (184-266)||(28254165-28254247)
chr2 (251-332)||(31899090-31899170)
chr2 (225-315)||(35580443-35580534)
chr2 (170-239)||(38796298-38796367)
chr2 (170-269)||(33953821-33953920)
chr2 (203-317)||(3594180-3594294)
chr2 (198-279)||(37894732-37894813)
chr2 (159-268)||(41678419-41678527)
chr2 (203-279)||(30312831-30312907)
chr2 (170-218)||(36785664-36785712)
chr2 (215-274)||(25390313-25390372)
chr2 (228-279)||(28226404-28226455)
chr2 (203-260)||(2336666-2336723)
chr2 (231-279)||(8904498-8904546)
chr2 (232-279)||(28226726-28226772)
chr2 (265-343)||(2109988-2110066)
chr2 (170-268)||(12910237-12910335)
chr2 (228-277)||(13792536-13792585)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (150-319)||(3669678-3669845)
chr8 (151-331)||(3670052-3670229)
chr8 (151-311)||(1014253-1014411)
chr8 (170-346)||(3038262-3038439)
chr8 (150-331)||(30441072-30441255)
chr8 (151-343)||(20870550-20870741)
chr8 (170-329)||(34835218-34835377)
chr8 (170-311)||(34834885-34835026)
chr8 (170-318)||(33113368-33113516)
chr8 (190-329)||(34835504-34835643)
chr8 (190-329)||(34835770-34835909)
chr8 (190-332)||(9483174-9483316)
chr8 (185-319)||(45122648-45122782)
chr8 (170-346)||(30359280-30359457)
chr8 (170-317)||(40518591-40518738)
chr8 (170-309)||(45122067-45122206)
chr8 (193-319)||(40518103-40518229)
chr8 (170-315)||(9482608-9482753)
chr8 (170-322)||(25561812-25561965)
chr8 (170-319)||(37544490-37544639)
chr8 (170-331)||(45121898-45122059)
chr8 (184-319)||(6876862-6876997)
chr8 (150-311)||(1013879-1014038)
chr8 (170-320)||(9608754-9608904)
chr8 (170-319)||(147460-147609)
chr8 (170-319)||(1513915-1514064)
chr8 (170-315)||(30359618-30359763)
chr8 (191-346)||(18371967-18372122)
chr8 (170-345)||(9309364-9309537)
chr8 (190-313)||(40579512-40579635)
chr8 (170-316)||(70277-70423)
chr8 (222-319)||(5915928-5916025)
chr8 (170-319)||(8918764-8918913)
chr8 (173-317)||(5420663-5420807)
chr8 (170-319)||(9308986-9309139)
chr8 (170-316)||(41972167-41972316)
chr8 (184-298)||(9609108-9609222)
chr8 (170-319)||(45123015-45123164)
chr8 (150-321)||(6731895-6732055)
chr8 (170-315)||(18371665-18371805)
chr8 (184-312)||(45121663-45121791)
chr8 (170-309)||(32640542-32640676)
chr8 (198-312)||(9507819-9507933)
chr8 (170-319)||(6651512-6651652)
chr8 (190-319)||(32305506-32305635)
chr8 (170-318)||(18380020-18380166)
chr8 (239-332)||(41129066-41129159)
chr8 (236-319)||(40579269-40579352)
chr8 (243-319)||(8919144-8919220)
chr8 (170-274)||(43274824-43274928)
chr8 (146-309)||(4154678-4154836)
chr8 (229-309)||(147888-147968)
chr8 (170-330)||(4154270-4154429)
chr8 (170-331)||(9620666-9620825)
chr8 (171-310)||(12283883-12284021)
chr8 (170-233)||(18372785-18372848)
chr8 (151-239)||(41416251-41416335)
chr8 (170-279)||(8794120-8794229)
chr8 (190-269)||(18372656-18372731)
chr8 (173-265)||(18372988-18373077)
chr8 (184-251)||(3037776-3037843)
chr8 (170-233)||(18372342-18372405)
chr8 (238-331)||(20995404-20995497)
chr8 (198-310)||(43398077-43398192)
chr8 (255-319)||(43274635-43274699)
chr8 (272-346)||(3037941-3038016)
chr8 (171-234)||(25561729-25561792)
chr8 (203-328)||(40991795-40991920)
chr8 (242-299)||(16524446-16524503)
chr8 (197-253)||(18373236-18373292)
chr8 (174-266)||(20130462-20130553)
chr8 (170-293)||(5274784-5274907)
chr8 (215-302)||(40417733-40417820)
chr8 (261-315)||(18372288-18372342)
chr8 (232-269)||(12156708-12156745)
chr8 (219-260)||(11442911-11442952)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (170-319)||(514-663)
scaffold0702 (150-319)||(147-309)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (170-344)||(1082-1255)
scaffold0391 (208-346)||(1657-1802)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (170-310)||(5405-5546)
scaffold0734 (170-310)||(5786-5931)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (184-319)||(47383-47518)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (170-277)||(17496-17605)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (170-281)||(5366-5477)
scaffold0078 (173-346)||(4994-5167)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (170-238)||(10192-10260)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (203-293)||(39498-39588)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (199-239)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39935142 - 39934963
Alignment:
Q  132 ggacgtggttatggatttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39935142 ggacgtggttatggatttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatc 39935043  T
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935042 cataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 338
Target Start/End: Original strand, 22304560 - 22304747
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22304560 gtgttggtttgcaagtgtgagc--tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgcctta 22304657  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304658 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43346940 - 43346793
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346940 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 43346841  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346840 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37990788 - 37990615
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990788 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37990689  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990688 gtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37991126 - 37990950
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37991126 gagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37991027  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37991026 gtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctca-tgacccaacagtg 37990950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  159 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 258  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgag---tatatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 32589800  T
Q  259 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589801 gtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42342537 - 42342361
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42342537 gagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 42342438  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  42342437 acgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaacagtg 42342361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54017965 - 54017790
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54017965 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54017866  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  54017865 gtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc-cagtgacccaacagtg 54017790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 35946531 - 35946680
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35946531 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 35946630  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946631 gtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 15772863 - 15773038
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15772863 gagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggataagagtgtg 15772962  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  15772963 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaacagtg 15773038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29645050 - 29644890
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29645050 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 29644951  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
     ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644950 cgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33803401 - 33803252
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33803401 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggtaagagtgtg 33803302  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803301 gcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54018347 - 54018198
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54018347 gagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54018248  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018247 gtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12114710 - 12114550
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12114710 agttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgg 12114611  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114610 tgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41359900 - 41359765
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  41359900 acatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgct 41359801  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359800 tgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaa 39389159  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389160 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 348
Target Start/End: Original strand, 52634685 - 52634861
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634685 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 52634783  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgat 348  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||    
T  52634784 acgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagtgat 52634861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29644730 - 29644581
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29644730 gagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 29644631  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  29644630 gcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22304097 - 22303963
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22304097 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtg 22304005  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304004 gtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32463050 - 32462903
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32463050 gagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgt 32462951  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462950 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25739574 - 25739425
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25739574 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggtaagagtgtg 25739475  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
      |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739474 acgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 25755403 - 25755552
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| ||||||| ||||||    
T  25755403 gagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaaaagtgtg 25755502  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755503 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42342225 - 42342092
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42342225 acatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgct 42342126  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342125 tgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21832492 - 21832345
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  21832492 gagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtg 21832395  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832394 gcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 53577373 - 53577522
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53577373 gagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggtaagagtgtg 53577472  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577473 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgc 245  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||      
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattat 50612521  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612520 cttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3135610 - 3135454
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttttgggtaa 262  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3135610 gagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttttagataa 3135511  T
Q  263 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135510 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 302
Target Start/End: Original strand, 4823646 - 4823796
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4823646 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgcctta 4823743  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823744 agattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3135222 - 3135099
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  3135222 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtg 3135123  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  3135122 gtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 321
Target Start/End: Original strand, 39914261 - 39914412
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  39914261 gagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggataagagtgtg 39914360  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 321  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914361 gtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 15773201 - 15773346
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15773201 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 15773300  T
Q  270 gtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773301 atgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  318 cctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 31190026 - 31190168
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  31190026 gagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggtaagagtgtg 31190117  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190118 gtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45395781 - 45395656
Alignment:
Q  191 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 290  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  45395781 ataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgggg 45395682  T
Q  291 ttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395681 ttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1634432 - 1634291
Alignment:
Q  201 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | | | |||||||||||||    
T  1634432 aaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagc 1634334  T
Q  301 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634333 ctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 320
Target Start/End: Original strand, 45901754 - 45901873
Alignment:
Q  201 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |    
T  45901754 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggtaagagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaac 45901853  T
Q  301 ctcgatgtggacggtcccct 320  Q
     |||||||||||||||||||    
T  45901854 ttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33175813 - 33175635
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttgggtaaga-- 264  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||      
T  33175813 gagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttgggtaagagt 33175714  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175713 gtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 53118123 - 53117975
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  53118123 gagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggtaagagtgta 53118025  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118024 gtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  235 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 334  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  335 gacccaaca 343  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32462676 - 32462558
Alignment:
Q  201 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  32462676 aaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagc 32462577  T
Q  301 ctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  32462576 ctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44160673 - 44160547
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |    
T  44160673 gataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggtaagaatgtggcgtctctcttact--tgcg 44160577  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160576 attgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49336836 - 49336694
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||| |||||  ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  49336836 gagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaagagtgtg 49336737  T
Q  270 gtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336736 gtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 8327913 - 8328067
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8327913 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 8328012  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    ||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328013 gtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Original strand, 11661980 - 11662108
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgt 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||    
T  11661980 gataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgt 11662078  T
Q  289 ggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662079 ggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgccttta 37726585  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726586 ggttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 320
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc----- 51886645  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886646 -gttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33362422 - 33362327
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 285  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362422 gataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017522
Alignment:
Q  231 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccctaactcccct 54017537  T
Q  331 cactgacccaacagt 345  Q
    |  ||||||||||||    
T  54017536 ctatgacccaacagt 54017522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Original strand, 9240158 - 9240300
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||    
T  9240158 gagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtg 9240257  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    ||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240258 gtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47964634 - 47964544
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964634 aggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 270 - 346
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304379
Alignment:
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacagtg 22304379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  303 cgatgt 308  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47965064 - 47964915
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  |||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47965064 gagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggtaagagtgtg 47964965  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964964 gcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  211 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3384433 - 3384317
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384433 gtgttggtgtgcaagcgtgag--ttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgt 268  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39336345 - 39336219
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  39336345 aggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggataatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcct 39336249  T
Q  303 cgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 331  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336248 ggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 46546441 - 46546375
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46546441 aggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 318
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7767463 - 7767380
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 253  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767463 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Original strand, 22304237 - 22304301
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22304237 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  216 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  216 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  241 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Original strand, 25317200 - 25317290
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317200 aggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaaagtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 279
Target Start/End: Original strand, 11661603 - 11661638
Alignment:
Q  244 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661603 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 275  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Original strand, 11661544 - 11661602
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 228  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  11661544 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg 11661602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39935258 - 39935213
Alignment:
Q  12 agattattctcgcaactttattaatgagagaggggaagatatgattcag 60  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  39935258 agattattctcgcaacttta---atgagagaggggaagatatgattcag 39935213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239996
Alignment:
Q  288 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca-tgatccaacagt 9239996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 25991412 - 25991521
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  25991412 gagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggttaaagtgtg 25991511  T
Q  270 gtgtctctct 279  Q
    || |||||||    
T  25991512 gtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 217
Target Start/End: Original strand, 43346659 - 43346706
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctta 217  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346659 gagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360110
Alignment:
Q  292 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacagtg 41360110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  224 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 260  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500635
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaa 6500539  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6500540 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaacagtg 6500635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Original strand, 6500814 - 6501007
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6500814 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgcctta 6500910  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  6500911 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaatagtg 6501007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40296464 - 40296292
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40296464 gagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtg 40296365  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296364 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18603269 - 18603124
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603269 gagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 18603170  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603169 gcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 25327944 - 25328120
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25327944 gagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 25328043  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  25328044 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaacagtg 25328120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaa 27502105  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502104 gatttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 32487482  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487483 ggttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 41170643 - 41170792
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170643 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 41170742  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170743 gtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3295479 - 3295345
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3295479 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaagagtgtgttgtctctcttgct 3295381  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295380 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 156 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  156 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 255  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttt 36492281  T
Q  256 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492280 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3295002
Alignment:
Q  159 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 258  Q
    ||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgag---tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgg 3295076  T
Q  259 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295075 gtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 149 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9498822 - 9498655
Alignment:
Q  149 tgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498822 tgtgttggtttgcaaatgtgag--ttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 9498725  T
Q  249 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498724 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 15370108 - 15370257
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15370108 gagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggtaagagtgtg 15370207  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370208 gtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 344
Target Start/End: Original strand, 624187 - 624379
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  624187 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttg 624284  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||    
T  624285 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctccccctagtgacccaacag 624379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Original strand, 41632792 - 41632961
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41632792 agttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggtaagagtgtgg 41632891  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632892 tgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42405745 - 42405574
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42405745 gagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 42405646  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405645 gtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26074295 - 26074122
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074295 gagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26074196  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26074195 gtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctctgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13415909 - 13415750
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13415909 gagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtg 13415810  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  13415809 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctcccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11417126 - 11416977
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11417126 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtgtg 11417027  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417026 atctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Original strand, 26074621 - 26074792
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074621 gagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26074720  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26074721 gtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagctcccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1028666 - 1028492
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1028666 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaagagtgtg 1028567  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  1028566 gcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaacag 1028492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 332
Target Start/End: Original strand, 15370439 - 15370573
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15370439 agtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtggggttgttct 15370538  T
Q  298 agcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370539 agcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Original strand, 6224205 - 6224366
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6224205 gagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 6224304  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224305 gtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26075308 - 26075168
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggt 271  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  26075308 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaagagtgtgtc 26075209  T
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075208 gtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36568716 - 36568545
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36568716 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtg 36568617  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568616 gcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 299498 - 299647
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  299498 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgtaagagtgtg 299597  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299598 gcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12662801 - 12662652
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12662801 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggtaagagtgtg 12662702  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662701 gtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 35150016 - 35150165
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35150016 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaagag-acccataaatccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtg 35150114  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150115 gtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaa 623907  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623908 ggttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  156 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 255  Q
    |||||||||||||||  ||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgag--ttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttt 29549319  T
Q  256 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 296  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549318 tggataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24489353 - 24489194
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24489353 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtg 24489256  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    | |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24489255 gcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35167973 - 35167838
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||   ||    
T  35167973 acatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaagagtgtgatgtctctcacact 35167874  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167873 agtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26591031 - 26590918
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  26591031 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttct 26590932  T
Q  298 agcctcgatgtgga 311  Q
    | ||||||||||||    
T  26590931 aacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaa 5723860  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 299  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723859 ggttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 300970 - 301107
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  300970 gttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaagagtgtggt 301061  T
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301062 gtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26074931 - 26074807
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26074931 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgt 26074832  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    || |||||||||||  |||||||||    
T  26074831 ggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Original strand, 38427552 - 38427697
Alignment:
Q  165 tgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 264  Q
    |||| ||||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||    
T  38427552 tgtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaaga 38427650  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    |||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427651 gtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Original strand, 2411016 - 2411176
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||  |||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2411016 gagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaagagtgta 2411115  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411116 gtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  247 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 35914858 - 35915007
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||| ||||    
T  35914858 gagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataagaatgtg 35914957  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914958 gtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41635325 - 41635212
Alignment:
Q  185 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 284  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||| || ||||| || |||    
T  41635325 catcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaagagtgtagtatctcttttactt 41635226  T
Q  285 gtgtggttgttcta 298  Q
    || |||||| ||||    
T  41635225 gtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 7768837 - 7768925
Alignment:
Q  146 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768837 atttttgttggttttcaagtgtgag--ttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36522045 - 36521922
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522045 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
       |||||||   |||||||||||    
T  36521945 tcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36522351 - 36522277
Alignment:
Q  205 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522351 gttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Original strand, 26074327 - 26074398
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074327 gagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  248 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  319 ct 320  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  245 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 256
Target Start/End: Original strand, 42508635 - 42508707
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 256  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508635 acatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 299  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Original strand, 19275543 - 19275653
Alignment:
Q  175 atatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 274  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  19275543 atatgtcttaaatcagatagaaaagtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtc 19275641  T
Q  275 tctcttgcttgt 286  Q
    | ||| ||||||    
T  19275642 tgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  218 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13786116 - 13786002
Alignment:
Q  204 ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc 303  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||    
T  13786116 ggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggataagagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctc 13786017  T
Q  304 gatgtggacggtccc 318  Q
    | ||| |||||||||    
T  13786016 gttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 286
Target Start/End: Original strand, 31509773 - 31509857
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg-ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 286  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31509773 aggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgtctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 279
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 31509632 - 31509742
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  31509632 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgt 31509731  T
Q  269 ggtgtctctct 279  Q
     ||||||||||    
T  31509732 agtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  241 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 279
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  241 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  263 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 242
Target Start/End: Original strand, 39309693 - 39309764
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 242  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309693 gagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 6225053 - 6225104
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 221  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225053 gagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 273
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  259 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 315  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 319
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  266 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44290992 - 44290797
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290992 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 44290895  T
Q  250 aggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  44290894 aggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacagtg 44290797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 41759470 - 41759641
Alignment:
Q  146 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  41759470 atttttgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgc 41759567  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759568 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44290625 - 44290458
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290625 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 44290528  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290527 aggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3537747 - 3537589
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3537747 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgtgg 3537648  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537647 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Original strand, 41157384 - 41157545
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41157384 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtg 41157483  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157484 gtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 41142381 - 41142531
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41142381 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaagagtgt 41142480  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142481 ggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48588655 - 48588460
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  48588655 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgcctta 48588558  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||    
T  48588557 aggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaaaagtg 48588460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 315
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 3550809  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550810 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Original strand, 41157020 - 41157175
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41157020 gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtg 41157119  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157120 gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26661671 - 26661522
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661671 gagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 26661572  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661571 gtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  153 ttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 252  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaagg 32594783  T
Q  253 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594782 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 9955916 - 9956093
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 267  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9955916 gagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtg 9956015  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  9956016 tgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc-gtgacccaacagtg 9956093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31767296 - 31767135
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  31767296 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgct 31767197  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  31767196 tgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaacagtg 31767135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493949
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgc 245  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagt-ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgc 45494048  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  45494047 cttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaacagt 45493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 29798208 - 29798357
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29798208 gagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggataagagtgtg 29798307  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798308 gtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 34364516 - 34364691
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34364516 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 34364615  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
     ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  34364616 atgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaacagtg 34364691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 17294586 - 17294733
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294586 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 17294685  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294686 gtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3875479 - 3875333
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3875479 agttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggtaagaatgtgg 3875380  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875379 agtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 34364934 - 34365084
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34364934 gagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 34365033  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    |||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34365034 gtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 14318876 - 14319025
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318876 gagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 14318975  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318976 gtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 37556120 - 37556260
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37556120 gagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgt 37556218  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556219 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Original strand, 40082416 - 40082556
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40082416 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatc-ataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 40082514  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082515 gtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 34649447 - 34649596
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34649447 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgag 34649546  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649547 gcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50052172 - 50051998
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  50052172 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaagagtgtg 50052073  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  50052072 gtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 50051998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32168821 - 32168674
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  32168821 gataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcg 32168728  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168727 gttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 186 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26662031 - 26661921
Alignment:
Q  186 atcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662031 atcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 26661932  T
Q  286 tgtggttgttc 296  Q
    |||||||||||    
T  26661931 tgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5320114 - 5319965
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5320114 gagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggtaagagtgta 5320015  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320014 gtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 11977289 - 11977438
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977289 gagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 11977388  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977389 atgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22077644 - 22077484
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22077644 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtg 22077545  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22077544 gcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 45084391 - 45084557
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||||||| |||    
T  45084391 gagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataac------gtcttaaggttttgggtaagagagtg 45084484  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084485 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37850749 - 37850588
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || ||||||||||    
T  37850749 gagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggataagagtgtg 37850650  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850649 gtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38804504 - 38804370
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||| |||  |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  38804504 gagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgta 38804405  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804404 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 37555739 - 37555878
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37555739 gagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaagagtgtg 37555837  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555838 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 66621 - 66444
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |     
T  66621 gagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggtaagagtata 66522  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgat 348  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  66521 gcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctca-tgacccaacagtgat 66444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39066335 - 39066201
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39066335 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttact 39066236  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066235 tatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22077231 - 22077101
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || ||||||||     
T  22077231 agtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttca 22077132  T
Q  298 agcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077131 agcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24600463 - 24600321
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24600463 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtg 24600364  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600363 gtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 348
Target Start/End: Original strand, 5575116 - 5575289
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  5575116 ttatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagtgtggcg 5575215  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgat 348  Q
    |||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  5575216 tctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaacattgat 5575289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41184574 - 41184380
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------------gttt 255  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||    
T  41184574 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagccttaaggttt 41184475  T
Q  256 tgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  41184474 tgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaacagtg 41184380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528728
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
     |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaacagt 5528728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24132134 - 24131965
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  24132134 gagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggta--agtgtg 24132038  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132037 gtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44043896 - 44043810
Alignment:
Q  195 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043896 aatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22077977 - 22077818
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  || ||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  22077977 gagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcct-aaggtttggggtaagagtgtg 22077879  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    | |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077878 gcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3537314 - 3537226
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537314 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 66223 - 66100
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 282  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |    
T  66223 acatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--ac 66126  T
Q  283 ttgtgtggttgttctagcctcgatgt 308  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  66125 ttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 309
Target Start/End: Original strand, 45839678 - 45839779
Alignment:
Q  208 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  45839678 gaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatg 45839777  T
Q  308 tg 309  Q
    ||    
T  45839778 tg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 319
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30630784 - 30630611
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  30630784 ttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcg 30630685  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    || || |  ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| || |||| || | || ||||||||||    
T  30630684 tccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtgagcagtcccccagactccacttagtgccccaacagtg 30630611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 22793287 - 22793431
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatt-gccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  |||||  ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22793287 gagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagtaagagtgt 22793386  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793387 gacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  231 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19283604 - 19283434
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19283604 gagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggataagagtgtg 19283505  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283504 gcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 318
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  176 tatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 275  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  276 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378035
Alignment:
Q  260 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaacag 21378035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 279
Target Start/End: Original strand, 10351183 - 10351278
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351183 acatcagatagaaaaatagaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380143
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  332 actgacccaaca 343  Q
    | ||||||||||    
T  47380154 attgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1188692 - 1188574
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 314  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||    
T  1188692 ttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcgg 1188593  T
Q  315 tccccta-ggctcccctca 332  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  1188592 tccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 308
Target Start/End: Original strand, 4956228 - 4956340
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||||| | ||| |    
T  4956228 agtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttgtgcgattgct 4956327  T
Q  296 ctagcctcgatgt 308  Q
     || |||||||||    
T  4956328 ttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Original strand, 44685465 - 44685605
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  44685465 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttgggtaacagtgt 44685563  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685564 gacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21378189 - 21378118
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 242  Q
    |||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21378189 agttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  210 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  260 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  216 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1187468 - 1187349
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||    
T  1187468 ttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagtaaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacg 1187369  T
Q  314 gtcccctag-gctcccctca 332  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  1187368 gtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5996984 - 5996870
Alignment:
Q  206 ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 305  Q
    |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||    
T  5996984 ttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagtgagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgaga 5996886  T
Q  306 tgtggacggtccccta 321  Q
    ||||| | ||||||||    
T  5996885 tgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50469230 - 50469180
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469230 gagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4266931 - 4266875
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266931 gagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 9498988 - 9499136
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  || || | ||| || ||| |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||    
T  9498988 gagttatatgttttatattaaatagaaaagtgaaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtg 9499087  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||| || || |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  9499088 gtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcctatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 229  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  234 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 280  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 331
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  254 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 343
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  301 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Original strand, 29518911 - 29519078
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29518911 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 29519008  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519009 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 29518592  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518593 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaa 32741268  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741269 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 346
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210387
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaa 35210293  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  35210294 ggttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaacagtg 35210387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 3409348  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409349 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Original strand, 2378117 - 2378284
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2378117 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattacctta 2378214  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378215 aggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Original strand, 3409651 - 3409818
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3409651 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttt 3409748  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409749 attttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 149 - 330
Target Start/End: Original strand, 3415448 - 3415629
Alignment:
Q  149 tgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415448 tgtgttggtttgcgagtgtgag--ttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcctt 3415545  T
Q  249 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415546 aaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 16454916 - 16455078
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454916 gagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 16455015  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16455016 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 151 - 343
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaa 3058315  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058316 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 2377763 - 2377912
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377763 gagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 2377862  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377863 gtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  152 gttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 251  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaa--ttctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaag 1846838  T
Q  252 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846839 gttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2580021 - 2579847
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2580021 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggtaagaatgtg 2579922  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  2579921 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca-ttacccaacagtg 2579847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaa 14748407  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748406 ggttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 16454584 - 16454759
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16454584 gagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtg 16454683  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  16454684 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 16454759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2578572 - 2578443
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2578572 gataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcg 2578473  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578472 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 2843563 - 2843713
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843563 gagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgt 2843662  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843663 ggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10074498 - 10074352
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10074498 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcact 10074399  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10074398 agtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 16107687 - 16107827
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107687 gagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 16107786  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107787 gtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10074140 - 10073989
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10074140 gagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 10074041  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 321  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074040 gtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaa 26544138  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544139 ggttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgag--ttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaa 1127449  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127450 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5832174 - 5832007
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||| |||||||    
T  5832174 agttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagccacc-ccttaagattttgggtaaaagtgtgg 5832076  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832075 tgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2578968 - 2578822
Alignment:
Q  185 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 284  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2578968 catcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctt 2578870  T
Q  285 gtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578869 gtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2579641 - 2579478
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2579641 gagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatg 2579542  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  2579541 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6999945 - 6999799
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6999945 gagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataagagtgtg 6999846  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999845 gcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 198 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10073737 - 10073604
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10073737 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttct 10073638  T
Q  298 agcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  10073637 agcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2579253 - 2579082
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||    
T  2579253 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtgg 2579158  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgat 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  2579157 tgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctca-tgacccaacagtgat 2579082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 10911574 - 10911720
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10911574 gagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaataagagtgt 10911673  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    | |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911674 gatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 593858 - 593694
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  593858 gagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggtaatagtgtg 593759  T
Q  270 g--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593758 gtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32460729 - 32460630
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460729 gagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1950334 - 1950200
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1950334 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaagagtgtg 1950235  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 304  Q
      ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950234 acgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 16108072 - 16108208
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||    
T  16108072 gagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtg 16108159  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108160 gtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12071784 - 12071665
Alignment:
Q  226 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 325  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12071784 aggactcataaacctatgaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagct 12071685  T
Q  326 cccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  12071684 cccctca-tgacctaacagtg 12071665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12085182 - 12085021
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| | ||||||||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12085182 gagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggtaagagtgtg 12085084  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085083 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9062498 - 9062383
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  9062498 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagtgtg 9062400  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgt 286  Q
    || |||||||| |||||    
T  9062399 gtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5958752 - 5958613
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  5958752 gagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttttgggatagagtgtg 5958653  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
     |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958652 atgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 342
Target Start/End: Original strand, 31714732 - 31714849
Alignment:
Q  224 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 323  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  31714732 agaggacccattaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccaga 31714830  T
Q  324 ctcccctcactgacccaac 342  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  31714831 ctcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12092598 - 12092470
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||    
T  12092598 aggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcct 12092499  T
Q  303 cgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
     |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092498 ggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Original strand, 8481936 - 8482045
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8481936 gagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 8482034  T
Q  270 gtgtctctctt 280  Q
    |||||||||||    
T  8482035 gtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Original strand, 6071174 - 6071264
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071174 aggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30618727 - 30618592
Alignment:
Q  207 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 306  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||    
T  30618727 tgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatgtggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aat 30618631  T
Q  307 gtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30618630 gtgggtggtccccaaggctcccctc-gtgacccaacagtg 30618592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 277
Target Start/End: Original strand, 2975575 - 2975668
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 277  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975575 acatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17135218 - 17135058
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| ||||||||||    
T  17135218 gagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataagagtgtg 17135119  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
      | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135118 acggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 312
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 280  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Original strand, 35210501 - 35210551
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210501 acatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  253 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 346
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975355
Alignment:
Q  286 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaacagtg 2975355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  237 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210602
Alignment:
Q  295 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacag 35210602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50630920 - 50630731
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630920 gtgttggtttgcaagcgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgcctta 50630823  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630822 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 25483345 - 25483520
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483345 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 25483444  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||    
T  25483445 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaacagtg 25483520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 55933191  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933190 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 342
Target Start/End: Original strand, 36629246 - 36629418
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629246 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36629345  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  36629346 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 41370446  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370447 agttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54017742 - 54017596
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54017742 gagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtg 54017643  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017642 atgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1731794 - 1731646
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1731794 gagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 1731695  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731694 gtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 3340816 - 3340991
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3340816 gagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3340915  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||    
T  3340916 gtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaacagtg 3340991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 10245929 - 10246104
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10245929 gagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggtaagagtgtg 10246027  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10246028 gtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacagtg 10246104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39793007 - 39792845
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39793007 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 39792908  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792907 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 39404027 - 39404203
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39404027 gagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaagagtgtg 39404126  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||    
T  39404127 gcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacagtg 39404203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 39404407 - 39404555
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  39404407 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtg 39404506  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404507 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 350
Target Start/End: Original strand, 54936219 - 54936383
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  54936219 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcac- 54936317  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgatga 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  54936318 tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagtaatga 54936383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22028515 - 22028339
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22028515 ttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgg 22028416  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22028415 tgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacagtg 22028339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 156 - 319
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  156 gtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 255  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgag--ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttt 50002520  T
Q  256 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002521 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36608808 - 36608647
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36608808 gagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 36608709  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608708 gtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 309
Target Start/End: Original strand, 54108936 - 54109060
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108936 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 54109034  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    
T  54109035 tgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 183 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18932883 - 18932747
Alignment:
Q  183 tacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18932883 tacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttac 18932784  T
Q  283 ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932783 ttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22028105 - 22027935
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22028105 ttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtg 22028006  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22028005 tctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctca-tgacccaacag 22027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Original strand, 44620360 - 44620511
Alignment:
Q  168 gagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 267  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620360 gagagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 44620459  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620460 tgatgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 171 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Original strand, 52884704 - 52884844
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52884704 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttggggtaagagtgt 52884803  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884804 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 44621025 - 44621160
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44621025 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgct 44621124  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621125 tgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 44620669 - 44620830
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44620669 gagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620767  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620768 gtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34646796 - 34646648
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646796 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 34646697  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646696 gtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 50459730 - 50459878
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50459730 gagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaagagcgtg 50459829  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459830 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32941270 - 32941128
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32941270 gagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 32941171  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941170 acgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 49076955 - 49076804
Alignment:
Q  192 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49076955 taaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggt 49076857  T
Q  292 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  49076856 tgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctca-tgacccaacagtg 49076804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 36572028 - 36572177
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36572028 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggttagagtatg 36572127  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572128 gtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 49302913 - 49303065
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 267  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302913 gagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 49303012  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    |||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303013 tggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 49880249  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880250 ggttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4955464 - 4955332
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955464 gagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 4955365  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955364 gcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 20825845 - 20826021
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20825845 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagtgtg 20825944  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| |||||||||    
T  20825945 gtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacagtg 20826021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Original strand, 52884896 - 52885038
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  52884896 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgt 52884995  T
Q  269 ggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884996 ggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22183411 - 22183253
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22183411 gagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtg 22183312  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 328  Q
    | ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183311 gcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Original strand, 54108565 - 54108694
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54108565 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttggctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgt 54108664  T
Q  289 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108665 ggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 314  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  315 tcccc 319  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 290
Target Start/End: Original strand, 45496828 - 45496934
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496828 acatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 45496927  T
Q  284 tgtgtgg 290  Q
    |||||||    
T  45496928 tgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4390234 - 4390102
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4390234 acatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgct 4390135  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390134 tgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16889683 - 16889535
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16889683 gagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggtaagagtatg 16889584  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889583 gtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 314
Target Start/End: Original strand, 20826226 - 20826370
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  20826226 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtg 20826325  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 314  Q
     |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826326 atgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16888963 - 16888804
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16888963 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggtaagagtgtg 16888864  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
     ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888863 atgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 43174515 - 43174677
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||    
T  43174515 gagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgt 43174614  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    || |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174615 ggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 2740709 - 2740869
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  2740709 gagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgtaagagtgtg 2740808  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    | ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740809 gcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3244598 - 3244448
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3244598 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtg 3244499  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
      ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244498 tcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 270
Target Start/End: Original strand, 2741080 - 2741180
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741080 gagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 2741179  T
Q  270 g 270  Q
    |    
T  2741180 g 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 317
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  207 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  307 gtggacggtcc 317  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34004730 - 34004586
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  34004730 gagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgataagagtgtg 34004633  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
      ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004632 ccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  201 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 300  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  301 ctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  212 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  310 gacg 313  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6975603 - 6975489
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6975603 gagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggtaagagtgtg 6975504  T
Q  270 gtgtctctcttgctt 284  Q
    | |||||||||||||    
T  6975503 gcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54741322 - 54741151
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||     
T  54741322 ttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggataagagtgtagtc 54741223  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  54741222 tctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaacagtg 54741151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 3271807 - 3271947
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc- 278  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  3271807 acatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctcg 3271906  T
Q  279 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271907 tttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51768207 - 51768061
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| || |||  ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |    
T  51768207 gagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggtaaaagtacg 51768108  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
     |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768107 atgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 307
Target Start/End: Original strand, 19504714 - 19504842
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19504714 gagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 19504804  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 307  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504805 gcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41707611 - 41707503
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41707611 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaagagtgtg 41707513  T
Q  270 gtgtctctct 279  Q
    ||||||||||    
T  41707512 gtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45489475 - 45489331
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  45489475 ttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactgt-ttaagatttttggtaagagtgtgatg 45489377  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489376 tctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49076595 - 49076449
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | |    
T  49076595 gagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcg 49076499  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076498 gtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 3341137 - 3341286
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  3341137 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtg 3341236  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
     ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  3341237 atgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtcccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 3700374 - 3700512
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||        |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3700374 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaaggactcat--------tgccttaaggttttggataagagtatg 3700465  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
     |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700466 atgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48111825 - 48111696
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |   ||||    
T  48111825 gataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctcacaaatgtg 48111726  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111725 gtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 54017835 - 54017750
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017835 acatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 298
Target Start/End: Original strand, 40067052 - 40067181
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  40067052 gagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggtaaaagtgt 40067151  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 298  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067152 gatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  253 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 28034271 - 28034387
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | ||    
T  28034271 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtct 28034370  T
Q  303 cgatgtggacggtcccc 319  Q
     |||||||| |||||||    
T  28034371 ggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 330
Target Start/End: Original strand, 760191 - 760356
Alignment:
Q  163 agtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||  ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  760191 agtgtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaa 760289  T
Q  263 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
     ||||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760290 aagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 250
Target Start/End: Original strand, 10246358 - 10246436
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246358 gttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783525
Alignment:
Q  224 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  324 ctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaacagtg 11783525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 34544148 - 34544225
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34544148 aggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45489784 - 45489712
Alignment:
Q  247 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489784 ttaaggttttgggtaatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23557013 - 23556890
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||| ||||  |||||| |||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23557013 gagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggataagagtgtg 23556914  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
      ||||||||| ||||||||||||    
T  23556913 acgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817429
Alignment:
Q  274 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaacagt 23817429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39699065 - 39698944
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 295  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||    
T  39699065 agtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgcttgtgcggttatt 39698966  T
Q  296 ctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  39698965 ctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 315
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  241 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 44620305 - 44620362
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 227  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620305 gagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11348475 - 11348396
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348475 gagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 280  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 310
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacac 213  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 277  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15841128 - 15841023
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  | |||||||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15841128 ttatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtattg 15841030  T
Q  273 tctctct 279  Q
    |||||||    
T  15841029 tctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  227 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  275 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 44621435 - 44621492
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 227  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621435 gagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496735
Alignment:
Q  289 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaacagtg 45496735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50788077 - 50787996
Alignment:
Q  234 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788077 taaatccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 44620968 - 44621011
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 227  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620968 acatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 216 - 259
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  216 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 259  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  205 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  237 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 309
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 257
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  224 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  289 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1085765 - 1085590
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085765 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 1085666  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  1085665 gcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaacagtg 1085590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 7517589 - 7517762
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517589 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 7517688  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517689 gtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 345
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157749
Alignment:
Q  153 ttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 252  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaagg 29157656  T
Q  253 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  29157657 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaacagt 29157749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37533513 - 37533338
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533513 gagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37533414  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  37533413 gtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-gtgacccaacagtg 37533338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37533177 - 37533011
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37533177 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 37533080  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533079 aggttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Original strand, 11845200 - 11845373
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11845200 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtg 11845299  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  11845300 gtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc-cagtgacccaacag 11845373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23526 - 23377
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23526 gagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 23427  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23426 gtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 171 - 319
Target Start/End: Original strand, 6054570 - 6054718
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6054570 agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 6054669  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054670 tgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 30244279 - 30244428
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244279 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 30244378  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244379 gtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Original strand, 19122741 - 19122879
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122741 gagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 19122839  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122840 gtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Original strand, 45433264 - 45433411
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45433264 acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 45433363  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433364 tgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22567174 - 22567012
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22567174 acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgct 22567075  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||||||| ||||    
T  22567074 tgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaatagtg 22567012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40094923 - 40094774
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40094923 gagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 40094824  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094823 gcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 316
Target Start/End: Original strand, 14681501 - 14681663
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14681501 gtgttggtttgcaagtgtaag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtctta 14681598  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681599 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34218183 - 34218036
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34218183 gagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 34218084  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218083 gtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Original strand, 45754725 - 45754862
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45754725 gagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 45754823  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754824 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 118449 - 118277
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  118449 agttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggtaagagtgtgg 118350  T
Q  271 tgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118349 cgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 24177444 - 24177593
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24177444 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggtaagagtgtg 24177543  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177544 gcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Original strand, 30245086 - 30245255
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245086 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 30245185  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    ||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  30245186 gtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 30245255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36939882 - 36939741
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36939882 gagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtg 36939783  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939782 gtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Original strand, 7554034 - 7554154
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7554034 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 7554133  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtgg 290  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7554134 gtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 171 - 319
Target Start/End: Original strand, 45434646 - 45434794
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||     
T  45434646 agttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtga 45434745  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434746 tgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 47129104 - 47129278
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  47129104 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtaggagtgtg 47129203  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  47129204 gtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca-tgatccaacagtg 47129278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8128590 - 8128414
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8128590 gagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggttaagagtgtg 8128491  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| |||||||||||    
T  8128490 gtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaacagtg 8128414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Original strand, 30032571 - 30032725
Alignment:
Q  165 tgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 264  Q
    |||| ||||||||||||  |||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30032571 tgtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaaga 30032670  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032671 gtgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 342
Target Start/End: Original strand, 36622969 - 36623140
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36622969 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggtaggagtatg 36623068  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 342  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623069 gtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 9901654 - 9901799
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9901654 gagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 9901751  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901752 gtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22566811 - 22566702
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566811 gagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 22566712  T
Q  270 gtgtctctctt 280  Q
    | |||||||||    
T  22566711 g-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 37167810 - 37167937
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167810 acatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 37167903  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167904 tgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Original strand, 16569205 - 16569316
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16569205 gagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgcg 16569304  T
Q  270 gtgtctctcttg 281  Q
    ||||||||||||    
T  16569305 gtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16596457 - 16596346
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16596457 gagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgcg 16596358  T
Q  270 gtgtctctcttg 281  Q
    ||||||||||||    
T  16596357 gtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  303 cgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24838850 - 24838724
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24838850 agttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 24838751  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 296  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  24838750 acgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  207 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  306 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40230439 - 40230295
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  40230439 agttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggtaaaagtctgg 40230340  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230339 tgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129550
Alignment:
Q  242 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T
Q  342 cag 344  Q
    |||    
T  47129548 cag 47129550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 41854644 - 41854792
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41854644 gagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggtaagagtgtg 41854742  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
      |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854743 acgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1085377 - 1085280
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 287  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085377 gataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36534930 - 36534795
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36534930 ttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggtaagagtgtggcg 36534831  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534830 tctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 20599323 - 20599471
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtg 267  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  20599323 gagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaagagagtg 20599422  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599423 tggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  244 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41910743 - 41910592
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttttgggta 261  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||| ||||    
T  41910743 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggatttttggta 41910644  T
Q  262 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910643 agagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  249 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  262 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  262 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 43241504 - 43241616
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  43241504 gagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggtaaaagtatg 43241603  T
Q  270 gtgtctctcttgc 282  Q
     ||||||||||||    
T  43241604 atgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28301692 - 28301613
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301692 gagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 346
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245339
Alignment:
Q  262 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaacagtg 30245339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 30245503 - 30245567
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245503 gagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  230 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Original strand, 30255350 - 30255412
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 234  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255350 gttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4124197 - 4124128
Alignment:
Q  210 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4124197 acactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 279
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  159 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 258  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  259 gtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44361608 - 44361517
Alignment:
Q  174 tatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 266  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  44361608 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 44361517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36109066 - 36109007
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 229  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109066 gagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 308  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  244 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 306  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 30244710 - 30244771
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 231  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244710 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 319
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  216 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  316 cccc 319  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 319
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  303 cgatgtggacggtcccc 319  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 273  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  256 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  297 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40094543 - 40094502
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaac 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40094543 gagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 151 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283449
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 41283544  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  41283543 ggttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaacagt 41283449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 36178675  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178674 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 37106179 - 37106344
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37106179 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttcctta 37106276  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106277 aggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 14745736  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745735 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 42514658 - 42514833
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42514658 gagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtg 42514757  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  42514758 gcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 42514833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5542792 - 5542625
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5542792 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgcctta 5542695  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542694 aggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5543165 - 5543002
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5543165 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgcctta 5543068  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543067 agattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 37105911 - 37106082
Alignment:
Q  146 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 245  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37105911 atttttgtgggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgc 37106008  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106009 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 6421394 - 6421569
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6421394 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaagagtgtg 6421493  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  6421494 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 6421569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15511644 - 15511495
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15511644 gagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtg 15511545  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511544 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 6422133 - 6422268
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6422133 acatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgct 6422232  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422233 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 15880272 - 15880415
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880272 gagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 15880371  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880372 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 962607 - 962753
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  962607 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 962706  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962707 ttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36178306 - 36178171
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36178306 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctcttgct 36178207  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178206 tgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 161 - 343
Target Start/End: Original strand, 33731648 - 33731831
Alignment:
Q  161 caagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 260  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33731648 caagtgtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggt 33731747  T
Q  261 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731748 aagagtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Original strand, 6712985 - 6713160
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6712985 gagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggtaagagtgt 6713084  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||    
T  6713085 gatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaacag 6713160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38796769 - 38796590
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag--tg 267  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||    
T  38796769 gagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtatg 38796670  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc--cctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||    
T  38796669 tggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccctccaaggctcccc-caatgacccaacagtg 38796590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35580872 - 35580724
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35580872 gagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgcg 35580774  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580773 gcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 198 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36006001 - 36005887
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36006001 agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttct 36005902  T
Q  298 agcctcgatgtggac 312  Q
    |||||||||||||||    
T  36005901 agcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37632746 - 37632575
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  37632746 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggtaagagtgtg 37632647  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632646 gtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 40733526 - 40733675
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  40733526 gagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtg 40733625  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733626 gtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14745461 - 14745300
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14745461 gtgttggtttgcaactgtgag--ttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgcctta 14745364  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745363 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40679778 - 40679632
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40679778 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtg 40679679  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679678 gcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 345
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770075
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgag--ttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttga 1769981  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
     | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1769982 agctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctccta-gctcccc-caatgacccaacagt 1770075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 329
Target Start/End: Original strand, 7598600 - 7598769
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  7598600 gtgttggtgtgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------cctta 7598689  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  7598690 acgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctcccc 7598769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 343
Target Start/End: Original strand, 23346274 - 23346417
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23346274 agtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgttct 23346372  T
Q  298 agcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346373 agcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28254383 - 28254258
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28254383 ttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 28254284  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagc 300  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254283 tctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  223 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  323 gctcccctcactgacccaac 342  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 320
Target Start/End: Original strand, 7598240 - 7598387
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    ||||||||  ||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  7598240 ttatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggtaagaatatggtg 7598339  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598340 tctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673249
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  315 tcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28531463 - 28531316
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28531463 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 28531364  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    ||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531363 gtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 151 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36178435 - 36178320
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  36178435 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaa 36178338  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36178337 ggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 40733892 - 40734040
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40733892 gagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtg 40733990  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733991 gtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Original strand, 5367484 - 5367599
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  5367484 gataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgca 5367583  T
Q  290 gttgttctagcctcga 305  Q
    ||||||||||||||||    
T  5367584 gttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12529177 - 12529038
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||     
T  12529177 gagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagataagaacgta 12529078  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529077 gtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 29676544 - 29676687
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      |||||||||||||||    
T  29676544 gagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgtg 29676637  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676638 gtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 342
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672882
Alignment:
Q  233 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  333 ctgacccaac 342  Q
     |||||||||    
T  3672873 gtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Original strand, 29676912 - 29677065
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 264  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  29676912 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaaga 29677011  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677012 gtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 315
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  223 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 16590897 - 16591065
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |    
T  16590897 gagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaagtaagaatct 16590990  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590991 aatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 346
Target Start/End: Original strand, 30313189 - 30313361
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 271  Q
    ||||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  30313189 gttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggc 30313287  T
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  30313288 gtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctc-gtgacccaacagtg 30313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31259750 - 31259658
Alignment:
Q  185 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 277  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31259750 catcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggtaagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  214 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29874170 - 29874023
Alignment:
Q  172 gttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 271  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29874170 gttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggc 29874071  T
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874070 gtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 268
Target Start/End: Original strand, 16542458 - 16542556
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16542458 gagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31468895 - 31468800
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468895 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatcttataag----aggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31899575 - 31899496
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899575 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37895210 - 37895107
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895210 gagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 37895111  T
Q  270 gtgt 273  Q
    ||||    
T  37895110 gtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 9231258 - 9231407
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||     
T  9231258 gagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaagagtgta 9231357  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231358 gtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 292
Target Start/End: Original strand, 31385779 - 31385868
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 292  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385779 aggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaataagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33561600 - 33561491
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33561600 gagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 33561501  T
Q  270 gtgtctctct 279  Q
     | |||||||    
T  33561500 atatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29873672 - 29873525
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||    
T  29873672 acatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcact 29873573  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  29873572 tgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 278
Target Start/End: Original strand, 30323506 - 30323581
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 278  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323506 aggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28254247 - 28254165
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 266  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254247 acatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  225 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38796367 - 38796298
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 239  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796367 gagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33953920 - 33953821
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||| |||  |||||||||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953920 gagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3594294 - 3594180
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||    
T  3594294 aggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaagagtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacct 3594195  T
Q  303 cgatgtggacggtcc 317  Q
    ||||||| |||||||    
T  3594194 cgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37894813 - 37894732
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894813 agtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  159 tgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 258  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||||||||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  259 gtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36785712 - 36785664
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttat 218  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785712 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 274  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 260  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 279
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  231 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 279  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 343
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 268
Target Start/End: Original strand, 12910237 - 12910335
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||   ||||| |||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12910237 gagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  228 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 277  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgcctta 3669775  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669776 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 331
Target Start/End: Original strand, 3670052 - 3670229
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3670052 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaa 3670149  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670150 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaa 1014314  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014313 agttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3038439 - 3038262
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038439 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 3038340  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc-ctcactgacccaacagtg 346  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||||||||||||    
T  3038339 gcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccctctcagtgacccaacagtg 3038262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Original strand, 30441072 - 30441255
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgc 245  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30441072 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgc 30441169  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30441170 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  251 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 343  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 34835218 - 34835377
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34835218 gagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 34835317  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835318 gtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Original strand, 34834885 - 34835026
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834885 gagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 34834984  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834985 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33113516 - 33113368
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33113516 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtg 33113417  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113416 gtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Original strand, 34835504 - 34835643
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34835504 gataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtg 34835603  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835604 gttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Original strand, 34835770 - 34835909
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34835770 gataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtg 34835869  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 329  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835870 gttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9483316 - 9483174
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9483316 gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcgtgcg 9483217  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483216 gttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 319
Target Start/End: Original strand, 45122648 - 45122782
Alignment:
Q  185 catcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45122648 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctt 45122747  T
Q  285 gtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122748 gtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 346
Target Start/End: Original strand, 30359280 - 30359457
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30359280 gagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtg 30359379  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  30359380 gtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaacagtg 30359457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 40518591 - 40518738
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40518591 gagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtg 40518690  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518691 acgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45122206 - 45122067
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45122206 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggtaagagtgtg 45122107  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122106 gtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Original strand, 40518103 - 40518229
Alignment:
Q  193 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40518103 aaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggtt 40518202  T
Q  293 gttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518203 gttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9482753 - 9482608
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  9482753 gagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtgtg 9482654  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482653 gtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25561965 - 25561812
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgt 268  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25561965 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggtaagagtgt 25561866  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 322  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561865 gacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37544639 - 37544490
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37544639 gagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaagagtgtg 37544540  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544539 gtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45122059 - 45121898
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45122059 gagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggtaacagtgtg 45121960  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121959 gcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6876997 - 6876862
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6876997 acatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtt 6876898  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876897 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1014038 - 1013879
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1014038 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgcctta 1013941  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 311  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013940 gagttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 9608754 - 9608904
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  9608754 gagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggtatgagtgtg 9608853  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 320  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608854 gcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 147460 - 147609
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147460 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 147559  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147560 gcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1514064 - 1513915
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1514064 gagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaaaagtgtg 1513965  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513964 gtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Original strand, 30359618 - 30359763
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  30359618 gagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtg 30359717  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  30359718 gtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18372122 - 18371967
Alignment:
Q  191 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  18372122 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctctcgcttgtgcgg 18372023  T
Q  291 ttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  18372022 ttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaacagtg 18371967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 345
Target Start/End: Original strand, 9309364 - 9309537
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9309364 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtg 9309463  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 345  Q
    ||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  9309464 gtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagt 9309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40579635 - 40579512
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  40579635 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacg 40579536  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacg 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  40579535 gttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 70423 - 70277
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  70423 gagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtgtg 70324  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70323 acgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Original strand, 5915928 - 5916025
Alignment:
Q  222 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915928 taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8918913 - 8918764
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8918913 gagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtg 8918814  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
      |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918813 acgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 5420663 - 5420807
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  5420663 ttatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgtaagagtgtgacg 5420762  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 317  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420763 tctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 9308986 - 9309139
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcataca--tcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag---a 264  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  9308986 gagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgggcaagagta 9309085  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309086 gtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 41972167 - 41972316
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttgggtaagagt 266  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||    
T  41972167 gagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttgggtaagagt 41972266  T
Q  267 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 316  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972267 gtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 298
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  284 tgtgtggttgttcta 298  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 45123015 - 45123164
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag--tg 267  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||    
T  45123015 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacctta--agtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtg 45123112  T
Q  268 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123113 tggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 321
Target Start/End: Original strand, 6731895 - 6732055
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6731895 gtgttgttttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgcctta 6731983  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731984 aggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18371805 - 18371665
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18371805 gagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtg 18371711  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    |||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18371710 gtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45121791 - 45121663
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||    
T  45121791 acatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttact 45121692  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 312  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  45121691 tatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32640676 - 32640542
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32640676 gagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtt 32640582  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640581 gcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 312
Target Start/End: Original strand, 9507819 - 9507933
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| | |||||||||     
T  9507819 agtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttca 9507918  T
Q  298 agcctcgatgtggac 312  Q
    |||||||||||||||    
T  9507919 agcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Original strand, 6651512 - 6651652
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651512 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 6651602  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651603 gtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Original strand, 32305506 - 32305635
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| | || ||| ||      
T  32305506 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtctttattacttatgca 32305605  T
Q  290 gttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305606 gttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18380166 - 18380020
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18380166 gagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaagagtgtg 18380067  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 318  Q
    |||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380066 gtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 332
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  239 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  236 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  243 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43274928 - 43274824
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43274928 gagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaagagtgtg 43274829  T
Q  270 gtgtc 274  Q
    |||||    
T  43274828 gtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4154836 - 4154678
Alignment:
Q  146 atttgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4154836 atttgtgttg-tgtgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgc 4154740  T
Q  246 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154739 cccaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 309
Target Start/End: Original strand, 147888 - 147968
Alignment:
Q  229 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147888 acccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4154429 - 4154270
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  4154429 gagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtg 4154331  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 330  Q
     |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || |||||||    
T  4154330 atgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagactcccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9620825 - 9620666
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||    
T  9620825 gagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--ataagagtttg 9620728  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
     |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620727 atgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 310
Target Start/End: Original strand, 12283883 - 12284021
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 270  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  12283883 agttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggataagagtgtag 12283981  T
Q  271 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283982 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18372848 - 18372785
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 233  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372848 gagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  151 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 239  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg----agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 279
Target Start/End: Original strand, 8794120 - 8794229
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |||||| |    
T  8794120 gagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtgagagtgcg 8794219  T
Q  270 gtgtctctct 279  Q
    ||||||||||    
T  8794220 gtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18372731 - 18372656
Alignment:
Q  190 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18372731 gataaaatagtaaaggttgaacac-ttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaagagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18373077 - 18372988
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 265  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373077 ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3037843 - 3037776
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 251  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037843 acatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18372405 - 18372342
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 233  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372405 gagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  238 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43398192 - 43398077
Alignment:
Q  198 agtaaaggttgaacaccttataagtaagagga---cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||| || || ||| |||||     
T  43398192 agtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggataagaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgc 43398093  T
Q  295 tctagcctcgatgtgg 310  Q
    |||| |||||||||||    
T  43398092 tctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  255 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037941
Alignment:
Q  272 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacagtg 3037941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  171 agttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 234  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 328
Target Start/End: Original strand, 40991795 - 40991920
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 301  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| |    
T  40991795 aggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaaga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggc 40991893  T
Q  302 tcgatgtggacggtcccctaggctccc 328  Q
     | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991894 ccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  242 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 299  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  197 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 266
Target Start/End: Original strand, 20130462 - 20130553
Alignment:
Q  174 tatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 266  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  20130462 tatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 20130553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Original strand, 5274784 - 5274907
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||  |||||   |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5274784 gagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagtaagagtgtg 5274883  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
     ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274884 atgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  215 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 302  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  261 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  232 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 260
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  219 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 260  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 514
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  663 gagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 564  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  563 gtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 309 - 147
Alignment:
Q  150 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||     
T  309 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--acttt 216  T
Q  250 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  215 agg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1082
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1255 gagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatg 1156  T
Q  270 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 344  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||    
T  1155 gtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaacag 1082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1657
Alignment:
Q  208 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct--------tgtgtggttgttctag 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||         |||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctctctctcacacaagtgtggttgttctag 1703  T
Q  300 cctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||||||| | ||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  1702 cctcgatgtgggcagtccccctagctcccctc-gtgacccaacagtg 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 5405 - 5546
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgt 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  5405 gagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttgggtaagagtgt 5504  T
Q  269 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5505 ggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 5786 - 5931
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaaga 264  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||    
T  5786 gagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaaga 5885  T
Q  265 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 310  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5886 gtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 47383 - 47518
Alignment:
Q  184 acatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47383 acatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggtaaaaatgtggtgtctctcttgct 47482  T
Q  284 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 319  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47483 tgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17605 - 17496
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtg 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||     
T  17605 gagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagta 17506  T
Q  268 tggtgtctct 277  Q
    ||||||||||    
T  17505 tggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Original strand, 5366 - 5477
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 269  Q
    |||||||||||   ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5366 gagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtg 5465  T
Q  270 gtgtctctcttg 281  Q
    ||||||||||||    
T  5466 gtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 346
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5167
Alignment:
Q  173 ttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 272  Q
    |||||||||  ||||| || | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4994 ttatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggtaagagtgtggtg 5093  T
Q  273 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 346  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  5094 tctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggaccattcccttttctcccctaagtgacccaacagtg 5167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10260 - 10192
Alignment:
Q  170 gagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 238  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10260 gagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 293
Target Start/End: Original strand, 39498 - 39588
Alignment:
Q  203 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 293  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39498 aggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaaaagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  199 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University