View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19520_low_2 (Length: 1198)

Name: NF19520_low_2
Description: NF19520
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19520_low_2
NF19520_low_2
[»] scaffold0224 (2 HSPs)
scaffold0224 (91-1181)||(17566-18656)
scaffold0224 (1-31)||(17476-17506)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (91-1181)||(42919675-42920765)
chr1 (712-1024)||(34644538-34644851)
chr1 (685-1024)||(28040922-28041262)
chr1 (1061-1181)||(38564956-38565076)
chr1 (686-1024)||(29169590-29169928)
chr1 (738-966)||(25375681-25375910)
chr1 (848-1023)||(50161375-50161554)
chr1 (731-1024)||(4861830-4862124)
chr1 (712-937)||(19035506-19035732)
chr1 (808-1024)||(2764451-2764668)
chr1 (1070-1179)||(17891575-17891684)
chr1 (738-1024)||(45659495-45659781)
chr1 (829-1009)||(50314563-50314744)
chr1 (857-1024)||(22346867-22347034)
chr1 (869-1024)||(31737302-31737458)
chr1 (894-1024)||(21472975-21473106)
chr1 (869-1024)||(20259776-20259932)
chr1 (712-936)||(37932040-37932264)
chr1 (847-996)||(16500034-16500184)
chr1 (902-1015)||(38731590-38731704)
chr1 (1105-1181)||(44662408-44662484)
chr1 (808-966)||(37200013-37200171)
chr1 (866-1015)||(2898683-2898836)
chr1 (919-1047)||(24177541-24177670)
chr1 (686-792)||(38731785-38731891)
chr1 (859-937)||(23043936-23044015)
chr1 (728-795)||(43831435-43831502)
chr1 (1068-1181)||(9067511-9067624)
chr1 (1-31)||(42920825-42920855)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (692-1047)||(28517089-28517446)
chr7 (727-1047)||(43856822-43857144)
chr7 (761-1024)||(21326709-21326973)
chr7 (760-1024)||(4501231-4501495)
chr7 (685-1024)||(19277265-19277605)
chr7 (776-1024)||(27521443-27521690)
chr7 (685-962)||(3676673-3676952)
chr7 (686-1024)||(45613638-45613977)
chr7 (829-1024)||(982921-983117)
chr7 (727-1024)||(5825245-5825541)
chr7 (829-1001)||(32584596-32584769)
chr7 (870-1013)||(2904348-2904492)
chr7 (911-1015)||(40726502-40726606)
chr7 (848-1001)||(22197981-22198135)
chr7 (848-1001)||(22239686-22239840)
chr7 (857-1013)||(9281099-9281255)
chr7 (857-1013)||(9292070-9292226)
chr7 (829-1024)||(24527561-24527757)
chr7 (829-1024)||(25186875-25187066)
chr7 (872-1024)||(30216040-30216193)
chr7 (1074-1178)||(46262028-46262133)
chr7 (978-1024)||(41117859-41117905)
chr7 (712-773)||(38596679-38596740)
chr7 (973-1015)||(10032255-10032297)
chr7 (880-997)||(42295174-42295292)
chr7 (927-984)||(38839336-38839393)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (686-1009)||(35310435-35310759)
chr5 (847-1024)||(37873595-37873773)
chr5 (712-999)||(27336690-27336978)
chr5 (727-1024)||(15291863-15292160)
chr5 (817-960)||(3114090-3114234)
chr5 (756-1024)||(32269663-32269932)
chr5 (686-1047)||(13166706-13167069)
chr5 (738-958)||(33691903-33692124)
chr5 (727-1014)||(34335319-34335607)
chr5 (818-1015)||(43115386-43115583)
chr5 (1070-1179)||(18557600-18557709)
chr5 (724-1006)||(43129524-43129806)
chr5 (869-1024)||(25663011-25663167)
chr5 (866-1024)||(38875610-38875769)
chr5 (727-917)||(433371-433562)
chr5 (818-958)||(14423716-14423857)
chr5 (897-1024)||(8100524-8100652)
chr5 (889-966)||(14436530-14436605)
chr5 (871-950)||(26212564-26212644)
chr5 (846-942)||(8858970-8859067)
chr5 (872-960)||(32230489-32230578)
chr5 (907-1024)||(42921669-42921786)
chr5 (1107-1146)||(1918459-1918498)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (685-1024)||(41867703-41868043)
chr2 (685-1021)||(4412861-4413198)
chr2 (862-1047)||(2888464-2888651)
chr2 (686-966)||(27502392-27502672)
chr2 (727-1000)||(28224996-28225270)
chr2 (692-1024)||(9685217-9685550)
chr2 (1064-1179)||(44888227-44888342)
chr2 (818-1048)||(5532367-5532598)
chr2 (848-1024)||(19161741-19161918)
chr2 (712-1024)||(3825698-3826012)
chr2 (686-1024)||(17344610-17344949)
chr2 (692-957)||(23484740-23485006)
chr2 (689-892)||(9674949-9675152)
chr2 (832-937)||(1295992-1296098)
chr2 (1064-1178)||(9560698-9560812)
chr2 (1096-1179)||(14328185-14328268)
chr2 (860-1024)||(16351811-16351979)
chr2 (919-1012)||(32029116-32029209)
chr2 (690-794)||(13146934-13147038)
chr2 (944-1024)||(13413323-13413403)
chr2 (897-1024)||(34814826-34814953)
chr2 (911-1022)||(2886637-2886748)
chr2 (974-1024)||(7760930-7760980)
chr2 (898-994)||(33612555-33612652)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (686-1024)||(39583025-39583364)
chr3 (685-1024)||(52741306-52741647)
chr3 (761-1024)||(7900830-7901094)
chr3 (685-1024)||(44198739-44199079)
chr3 (756-962)||(46940635-46940843)
chr3 (818-1024)||(38146028-38146235)
chr3 (738-1024)||(53785681-53785968)
chr3 (869-1024)||(37132978-37133134)
chr3 (869-1000)||(26772754-26772886)
chr3 (712-1015)||(49017944-49018248)
chr3 (848-1014)||(3443270-3443437)
chr3 (910-1024)||(26856783-26856897)
chr3 (910-1024)||(52411912-52412026)
chr3 (874-996)||(54508367-54508491)
chr3 (727-795)||(29861999-29862067)
chr3 (897-1024)||(38670887-38671015)
chr3 (818-1024)||(7501939-7502145)
chr3 (875-1024)||(37992305-37992454)
chr3 (845-1024)||(5338615-5338798)
chr3 (919-1024)||(51234588-51234693)
chr3 (985-1047)||(25094668-25094731)
chr3 (818-889)||(51234711-51234782)
chr3 (974-1024)||(44808-44858)
chr3 (1064-1178)||(3968460-3968574)
chr3 (1064-1178)||(4000231-4000345)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (749-1047)||(53619534-53619834)
chr4 (718-1024)||(26521460-26521767)
chr4 (686-1024)||(50000721-50001061)
chr4 (715-1015)||(56461932-56462232)
chr4 (727-1000)||(12918209-12918483)
chr4 (685-958)||(30940534-30940807)
chr4 (712-1000)||(31847083-31847372)
chr4 (712-1024)||(132357-132672)
chr4 (829-1009)||(55933401-55933580)
chr4 (857-1013)||(600659-600816)
chr4 (865-1024)||(34107669-34107831)
chr4 (710-942)||(12053467-12053698)
chr4 (907-1024)||(6865838-6865955)
chr4 (1065-1173)||(9763077-9763188)
chr4 (873-953)||(23255747-23255828)
chr4 (808-1024)||(25504267-25504482)
chr4 (948-1024)||(38535628-38535704)
chr4 (1064-1181)||(40813686-40813805)
chr4 (857-1015)||(50462913-50463072)
chr4 (907-981)||(24719949-24720023)
chr4 (686-863)||(3330084-3330261)
chr4 (947-1055)||(54190909-54191018)
chr4 (712-795)||(16957738-16957821)
chr4 (870-1023)||(46440869-46441023)
chr4 (685-1024)||(53170485-53170813)
chr4 (974-1015)||(747854-747895)
chr4 (919-1024)||(3329968-3330073)
chr4 (974-1014)||(53098403-53098443)
chr4 (914-1013)||(50483221-50483320)
chr4 (974-1024)||(4419235-4419285)
chr4 (974-1024)||(16955432-16955482)
chr4 (974-1015)||(712678-712719)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (820-1024)||(38815266-38815471)
chr8 (686-1025)||(39434638-39434978)
chr8 (738-1024)||(35739835-35740121)
chr8 (712-1060)||(24124963-24125313)
chr8 (727-1024)||(25021651-25021949)
chr8 (727-937)||(500286-500497)
chr8 (871-1024)||(3187942-3188095)
chr8 (782-936)||(4699929-4700083)
chr8 (848-996)||(8540335-8540484)
chr8 (872-1015)||(6592556-6592700)
chr8 (1064-1178)||(36796663-36796777)
chr8 (692-971)||(42921929-42922209)
chr8 (1070-1173)||(544263-544366)
chr8 (1070-1173)||(40531295-40531398)
chr8 (889-1024)||(28196164-28196300)
chr8 (780-966)||(10189573-10189760)
chr8 (1071-1175)||(23264771-23264876)
chr8 (973-1055)||(9259376-9259459)
chr8 (974-1024)||(3821196-3821246)
chr8 (865-937)||(4073594-4073667)
chr8 (847-903)||(8390234-8390290)
chr8 (848-999)||(8619811-8619963)
chr8 (872-958)||(6618322-6618409)
chr8 (879-936)||(8882387-8882445)
chr8 (919-1013)||(36004105-36004199)
chr8 (739-792)||(39671036-39671089)
chr8 (975-1024)||(40223489-40223538)
chr8 (1132-1181)||(40457509-40457558)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (686-1000)||(357513-357827)
chr6 (727-1060)||(29337920-29338251)
chr6 (847-1000)||(17249262-17249416)
chr6 (685-1015)||(4206391-4206722)
chr6 (751-1024)||(959553-959826)
chr6 (738-1024)||(33220559-33220846)
chr6 (841-965)||(3714948-3715073)
chr6 (712-1022)||(34304470-34304781)
chr6 (888-1015)||(4165920-4166048)
chr6 (818-1024)||(45605-45812)
chr6 (1070-1179)||(12129280-12129390)
chr6 (818-926)||(28008915-28009024)
chr6 (751-909)||(28543463-28543621)
chr6 (768-1024)||(34415408-34415665)
chr6 (756-903)||(12401425-12401572)
chr6 (865-1022)||(34554252-34554410)
chr6 (712-909)||(32115777-32115974)
chr6 (729-795)||(20693440-20693506)
chr6 (1075-1178)||(7546338-7546442)
chr6 (860-1015)||(24016318-24016474)
chr6 (857-909)||(34168956-34169008)
chr6 (878-960)||(6225108-6225191)
chr6 (894-965)||(7200541-7200611)
chr6 (907-1015)||(28625911-28626020)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (808-1024)||(6306-6522)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (729-1022)||(33224-33519)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (818-1024)||(10333-10543)
scaffold0186 (686-795)||(19923-20032)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (832-937)||(16193-16299)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (848-985)||(47497-47635)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (860-965)||(49442-49548)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (872-958)||(7640-7727)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (899-1015)||(8525-8642)


Alignment Details
Target: scaffold0224 (Bit Score: 998; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 998; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 1181
Target Start/End: Original strand, 17566 - 18656
Alignment:
Q  91 gcttatgaaaaacatcattggtacagaccttatattcagtttcatagccnnnnnnntattagtggtcgatagtcatccaacatgacgaggacaaaaaact 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17566 gcttatgaaaaacatcattggtacagaccttatattcagtttcatagccaaaaaaatattagtggtcgatagtcatccaacatgacgaggacaaaaaact 17665  T
Q  191 gaatcagcactaattgctatgtcccatataagagaaaaacagtcaaaggaacaatgtctttgcccttgtttgagttcttttatcattcatgtgcatgttt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17666 gaatcagcactaattgctatgtcccatataagagaaaaacaatcaaaggaacaatgtctttgcccttgtttgagttcttttatcattcatgtgcatgttt 17765  T
Q  291 ttgtactgaagtgacattctgagagatatcttacactcaagaggcagtgtggactatttatttattgcttaaattaatcaattattgagtgcatatcatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17766 ttgtactgaagtgacattctgagagatatcttacactcaagaggcagtgtggactatttatttattgcttaaattaatcaattattgagtgcatatcatg 17865  T
Q  391 atggagtgagtactactttatttcacatccttaaaaagattttactttcaattttccagtgatggcttgtaaaaaactgcttttggctttgtgttgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866 atggagtgagtactactttatttcacatccttaaaaagattttactttcaattttccagtgatggcttgtaaaaaactgcttttggctttgtgttgatga 17965  T
Q  491 cttttgaccgacaaataatttttgacctattgttggtcttagcattgtctttgcattcattggatccccgtcaattcaaatcttcaaattattaaaataa 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17966 cttttgaccgacaaataatttttgacctattgttggtcttagcattgtctttgcattcattggatccccgtcaattcaaatcttcaaattattaaaataa 18065  T
Q  591 tctctccttccctcccacattctatatcatcaaaattgaaccgtggttaattacttgagtgaacggttaatgaattgcaataattagttataccatatca 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18066 tctctccttccctcccacattctatatcatcaaaattgaaccgtggttaattacttgagtgaacggttaatgaattgcaacaactagttataccatatca 18165  T
Q  691 atgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaa 790  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18166 acgaagaaggagaccactataaacttcatgaccgatccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaa 18265  T
Q  791 aacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaa 890  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18266 aacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaa 18365  T
Q  891 agcggccaaacatgagaaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttc 990  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18366 agcggccaaacatgagaaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttc 18465  T
Q  991 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgtataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaaggttctttgacgcaagttcttttaggcttgtt 1090  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18466 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgtataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaaggttctttgacgcaggttcttttaggcttgtt 18565  T
Q  1091 gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18566 gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctactcatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 18656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 17476 - 17506
Alignment:
Q  1 ctaaactattacttaatattcttgatggcta 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17476 ctaaactattacttaatattcttgatggcta 17506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 998; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 998; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 42920765 - 42919675
Alignment:
Q  91 gcttatgaaaaacatcattggtacagaccttatattcagtttcatagccnnnnnnntattagtggtcgatagtcatccaacatgacgaggacaaaaaact 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920765 gcttatgaaaaacatcattggtacagaccttatattcagtttcatagccaaaaaaatattagtggtcgatagtcatccaacatgacgaggacaaaaaact 42920666  T
Q  191 gaatcagcactaattgctatgtcccatataagagaaaaacagtcaaaggaacaatgtctttgcccttgtttgagttcttttatcattcatgtgcatgttt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920665 gaatcagcactaattgctatgtcccatataagagaaaaacaatcaaaggaacaatgtctttgcccttgtttgagttcttttatcattcatgtgcatgttt 42920566  T
Q  291 ttgtactgaagtgacattctgagagatatcttacactcaagaggcagtgtggactatttatttattgcttaaattaatcaattattgagtgcatatcatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920565 ttgtactgaagtgacattctgagagatatcttacactcaagaggcagtgtggactatttatttattgcttaaattaatcaattattgagtgcatatcatg 42920466  T
Q  391 atggagtgagtactactttatttcacatccttaaaaagattttactttcaattttccagtgatggcttgtaaaaaactgcttttggctttgtgttgatga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920465 atggagtgagtactactttatttcacatccttaaaaagattttactttcaattttccagtgatggcttgtaaaaaactgcttttggctttgtgttgatga 42920366  T
Q  491 cttttgaccgacaaataatttttgacctattgttggtcttagcattgtctttgcattcattggatccccgtcaattcaaatcttcaaattattaaaataa 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920365 cttttgaccgacaaataatttttgacctattgttggtcttagcattgtctttgcattcattggatccccgtcaattcaaatcttcaaattattaaaataa 42920266  T
Q  591 tctctccttccctcccacattctatatcatcaaaattgaaccgtggttaattacttgagtgaacggttaatgaattgcaataattagttataccatatca 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42920265 tctctccttccctcccacattctatatcatcaaaattgaaccgtggttaattacttgagtgaacggttaatgaattgcaacaactagttataccatatca 42920166  T
Q  691 atgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaa 790  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42920165 acgaagaaggagaccactataaacttcatgaccgatccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaa 42920066  T
Q  791 aacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaa 890  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42920065 aacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaa 42919966  T
Q  891 agcggccaaacatgagaaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttc 990  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42919965 agcggccaaacatgagaaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttc 42919866  T
Q  991 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgtataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaaggttctttgacgcaagttcttttaggcttgtt 1090  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42919865 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgtataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaaggttctttgacgcaggttcttttaggcttgtt 42919766  T
Q  1091 gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42919765 gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctactcatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 42919675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 712 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 34644851 - 34644538
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||   || ||||  ||||    
T  34644851 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtatgcggatgttatggtgtatggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 34644752  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    ||| | |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34644751 ctggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagc 34644652  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  34644651 gtgttctgacaacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaagggtt 34644552  T
Q  1011 atgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||| | ||||||    
T  34644551 atgcatatcaatgt 34644538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Original strand, 28040922 - 28041262
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  || | |||||||||||  | |||||| ||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28040922 atatcagtgaagaaggaggcgtctgtgaacttcctgactaacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgttatggtgtacagatgggtag 28041021  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||   ||||| |  || | ||||||   |||||    
T  28041022 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtc 28041121  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  |||||  |||    
T  28041122 aaacaaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggtt 28041221  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  28041222 gaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 28041262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1061 - 1181
Target Start/End: Original strand, 38564956 - 38565076
Alignment:
Q  1061 ttctttgacgcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgt 1160  Q
    ||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  38564956 ttctttgccgcgggttcatttaagcttgttgatgtctcctccggcttatcagatgttgagcggtgggcgattctgatcgtttgaagcaacatatcgtcgt 38565055  T
Q  1161 cggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38565056 cggctgcttttttgatctctg 38565076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 686 - 1024
Target Start/End: Original strand, 29169590 - 29169928
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || || ||| | | |||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  29169590 tatcagtgaagaaggaggcgcctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggataggtagg 29169689  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| |||  |||||||| | |||||  ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  29169690 aggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtca 29169788  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    |  || | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  |||||||||||    
T  29169789 agtaaggtggccaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgtta 29169888  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  29169889 accttctacatagagttcaaaaggtcatgcacagcaatgt 29169928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 738 - 966
Target Start/End: Original strand, 25375681 - 25375910
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    |||||| ||||||   | ||||||||||||| ||||||    
T  25375681 aagattgacacttaggtctgcagatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgtcggatta 25375780  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatga-gaaacgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  25375781 ggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacatgttttta 25375880  T
Q  937 tgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
    |  ||| || | |||||||||||| |||||    
T  25375881 taccatttgctattgacacttttggcttcc 25375910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 848 - 1023
Target Start/End: Original strand, 50161375 - 50161554
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |    
T  50161375 cttttacggtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgcttttatatcattttt 50161474  T
Q  947 tttt---gacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatg 1023  Q
    ||||    | ||||||| || || | ||  | |||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  50161475 ttttttatatacttttggctccctagcaccaaaggttgatgacattctacatagagttcaaaggatcatgcagagcaatg 50161554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 731 - 1024
Target Start/End: Original strand, 4861830 - 4862124
Alignment:
Q  731 taaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgt 830  Q
    |||||| |||||||||| ||  || | ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||   || |||| ||||||||   |||||| ||| ||    
T  4861830 taaatagaagatcgacacttcagcctacagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggatttgactggtgtttcaccacttgt 4861929  T
Q  831 gggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacat 929  Q
     |||||| |||||    | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  |||  || ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  4861930 tggattaggggtcttgacatttatggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtcttctgacaagcaacat 4862029  T
Q  930 gtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
      ||||||   || || |||||||||||| || |||| ||||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4862030 acttttatacaatttgcttttgacactttcgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcataacaatgt 4862124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 712 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 19035732 - 19035506
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||  ||  || |||  ||||||  |||||||||| |||| ||||  ||| || |  ||||    
T  19035732 aacttcctgaccgacccactagataaaagatcaacactcaggtatgtggacgttttggtgtacggatgggtaggtggaacacatgcttgtgtagacttga 19035633  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    ||| |||||||| | | ||||||||| | |||||| ||||||   |||| ||  || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  19035632 ctgggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 19035533  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttat 937  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19035532 gtgttctgacaatcaacatgcttttat 19035506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 808 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 2764668 - 2764451
Alignment:
Q  808 ttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgaga 907  Q
    |||| |||| |||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  2764668 ttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagacaaagtggtcaaacatgaga 2764569  T
Q  908 aa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||   ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||| |||  ||||    
T  2764568 aaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacataaagtccaaag 2764469  T
Q  1007 ggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| ||||| | ||||||    
T  2764468 ggttatgcaaatcaatgt 2764451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1070 - 1179
Target Start/End: Original strand, 17891575 - 17891684
Alignment:
Q  1070 gcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctt 1169  Q
    ||||||||||||  |||| ||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  17891575 gcaagttcttttcagctttttggtggctcctccgatttatcggttgttgagtggtgtgtgaatttgatcgtttgatgcaacatatcatcgtcggctgctt 17891674  T
Q  1170 ttttgatctc 1179  Q
    ||||||||||    
T  17891675 ttttgatctc 17891684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 738 - 1024
Target Start/End: Original strand, 45659495 - 45659781
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    |||||| ||| | |||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| |  ||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  45659495 aagatcaacactcaggcatgcacatgttatagtgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggatta 45659594  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccct-aaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgttttt 935  Q
     |  ||||  ||||||   |||||||  || |||| ||||| ||||||||  || | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  45659595 ggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgctttt 45659694  T
Q  936 atgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||  ||| || |||||||||||| || |||| | ||  ||||| |||| |||||||  |||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  45659695 ataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgaccttct--atagagttcaaaagatcatgcatagcaatgt 45659781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 829 - 1009
Target Start/End: Original strand, 50314563 - 50314744
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaac 927  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || ||| | || ||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50314563 gtgggattagaggtcagagattttatgatcggacaaacaactctaagagctgcataaagcaaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaac 50314662  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    ||| ||||||  ||| |  |||||||| |||| | |||| ||||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  50314663 atgcttttataccatttacttttgacattttttatttcctaacacaagatgttgttgactttctacatagagttcaaagggt 50314744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 857 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 22347034 - 22346867
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacac 955  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||  | | || |||||||||    
T  22347034 taggacaaacaacc-taaaagttatgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgcttttgacac 22346936  T
Q  956 ttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| |  |||| |  || |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  22346935 tttcggtttcctagtagcagaggttgttgaccttctacacagagttcaaaaggtcatgcatagaaatgt 22346867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 869 - 1024
Target Start/End: Original strand, 31737302 - 31737458
Alignment:
Q  869 ccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcca 967  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| || || |     
T  31737302 ccctaaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgattttct 31737401  T
Q  968 aacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | || |||||| | || || |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  31737402 agcattagaggctattgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgt 31737458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 894 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 21473106 - 21472975
Alignment:
Q  894 ggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttcta 992  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||     |||| | ||  ||||| |||| ||||||||    
T  21473106 ggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagaggctgttgaccttcta 21473007  T
Q  993 catagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  21473006 catagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 21472975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 869 - 1024
Target Start/End: Original strand, 20259776 - 20259932
Alignment:
Q  869 ccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcca 967  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||| |  |||      
T  20259776 ccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttattgttgacactttcggtttctt 20259875  T
Q  968 aacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  20259876 agcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagtaatgt 20259932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 712 - 936
Target Start/End: Original strand, 37932040 - 37932264
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||| || ||||||| |||||| ||| ||||||| | |||| | ||||  |||||||||||||   |||||||  ||||    
T  37932040 aactttctgaccgacccattagatagaaaatcgacacttaggcctgcggatgttatgatgtacatatggacaggaggaaaacatgcatgcgtggacttga 37932139  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaacg 911  Q
     |||| |||||| ||| ||||||||| ||| |   |||||||   || |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||  || |||| | |||||| |    
T  37932140 ttgaggtttcaccacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaaatggtcaaatacgagaaagg 37932239  T
Q  912 tgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  37932240 tgttctgacaatcaacgtgttttta 37932264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 847 - 996
Target Start/End: Complemental strand, 16500184 - 16500034
Alignment:
Q  847 gcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctg 945  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||  |||||   || ||    
T  16500184 gcttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatactatttg 16500085  T
Q  946 tttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacata 996  Q
     |||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||    
T  16500084 cttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttctacata 16500034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 902 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731590
Alignment:
Q  902 atgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||   || || |||||| ||||||| ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttctacatagagt 38731605  T
Q  1001 ttaaagggtcatgca 1015  Q
    | |||||||||||||    
T  38731604 tcaaagggtcatgca 38731590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1105 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 44662484 - 44662408
Alignment:
Q  1105 cttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  44662484 cttatcggattttgagtggtggtcgaatctgatcgtttgaagcatcgtaccttcgtcggctacttttttgatctctg 44662408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 808 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 37200171 - 37200013
Alignment:
Q  808 ttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgaga 907  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||  || || |||||||| ||||||  |||| || ||||||| |||    
T  37200171 ttgactgatgtttcaccactcgtgggattaaggaccggagcttttacaataggacatgcagccataaaagttacgtcaagtaaagtggtcaaacataaga 37200072  T
Q  908 aa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
    || | ||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  37200071 aagcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttgttttt-acacttttggcttcc 37200013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 866 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 2898836 - 2898683
Alignment:
Q  866 caaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-----cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttg 960  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||     |||||||| |||||||| | ||||||||  ||| || |||||| ||||| |    
T  2898836 caaccctaaaagatgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgatactttcg 2898738  T
Q  961 acttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
      |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  2898737 gtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagatcatgca 2898683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 919 - 1047
Target Start/End: Original strand, 24177541 - 24177670
Alignment:
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagag 1018  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||    
T  24177541 acaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcatag 24177640  T
Q  1019 caatgt-ataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  24177641 caatgtcatatctcctaggtccatgaatgt 24177670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 38731891 - 38731785
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| |||||||| || || |||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||| ||| |||||   ||||||||||    
T  38731891 tatcagtgaagaaggaggtccctatgaacttccttactgacccactagatagaagatcgatagttaaacttgcagatattatggtgtgcggatgggtagg 38731792  T
Q  786 aggaaaa 792  Q
    |||||||    
T  38731791 aggaaaa 38731785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 859 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 23044015 - 23043936
Alignment:
Q  859 ggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttat 937  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  23044015 ggacaaacaaccctcaaagctgcatcaagcaaagtggccaaatatgagaaaacaagtactcacaatcaacatgcttttat 23043936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 795
Target Start/End: Original strand, 43831435 - 43831502
Alignment:
Q  728 cactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacat 795  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  || |||||| ||||| ||||    
T  43831435 cactaaatagaagatcgacatttaggcttacatatgttatggtgtacggacgggtagaaggaatacat 43831502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1068 - 1181
Target Start/End: Original strand, 9067511 - 9067624
Alignment:
Q  1068 acgcaagttcttttaggcttgtt-gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctg 1166  Q
    |||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||   |||||||||||| || |   |||||||| |||||    
T  9067511 acgcaagttcttttaggctttttcggtggctccttcggcttttcagatgttgagtg-tggacggagctgatcgtttgatgcaaaaaatcatcgttggctg 9067609  T
Q  1167 cttttttgatctctg 1181  Q
    || ||||||||||||    
T  9067610 ctcttttgatctctg 9067624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 42920855 - 42920825
Alignment:
Q  1 ctaaactattacttaatattcttgatggcta 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42920855 ctaaactattacttaatattcttgatggcta 42920825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 692 - 1047
Target Start/End: Original strand, 28517089 - 28517446
Alignment:
Q  692 tgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaa 791  Q
    |||||||||||||  || | ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  28517089 tgaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaa 28517188  T
Q  792 acatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 891  Q
    |||| | || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| || |||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28517189 acatgtatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaa 28517288  T
Q  892 gcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttc 990  Q
    | |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| | ||  ||||   ||| ||||||    
T  28517289 gtggccaaacatgagaaagcgtgtttagacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttc 28517388  T
Q  991 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatg-tataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  28517389 tacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatgt 28517446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 727 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 43857144 - 43856822
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| | | |||||| ||    
T  43857144 ccactagatagaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatacatgcgtggacttgacgggggtttcaccac 43857045  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||| | |||||||    
T  43857044 ttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaagtggctagacatgagaaagcgtgttttgacaatca 43856945  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt- 1024  Q
    |||||  |||||   || || |||||||| |||||  |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||     
T  43856944 acatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcacaacaatgtc 43856845  T
Q  1025 ataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
    || |||| || ||||||||||||    
T  43856844 atgactcctaggtccatgaatgt 43856822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 761 - 1024
Target Start/End: Original strand, 21326709 - 21326973
Alignment:
Q  761 atgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatagg 860  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||   |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||   ||||    
T  21326709 atgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatacttgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 21326808  T
Q  861 acaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacactttt 959  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||     
T  21326809 acaaacagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc 21326908  T
Q  960 gacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    || |||| | ||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  21326909 gatttcctagcaccagaggctgttgaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 21326973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 760 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 4501495 - 4501231
Alignment:
Q  760 gatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatag 859  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||   |||    
T  4501495 gatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtag 4501396  T
Q  860 gacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | || || ||||||||| ||    
T  4501395 gacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatataatttgcttttgacac-tt 4501297  T
Q  959 tgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||  || | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  4501296 tggttttctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagttcatgcatagcaatgt 4501231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 19277605 - 19277265
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||    
T  19277605 atatcagtgaagaaggaggcacctataaacttcctgactgacgcactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtctacggatgggtag 19277506  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||| | |||||| ||| || |||||| |  || || |||||    |||||||  ||  |||||||| ||||||    
T  19277505 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtc 19277406  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  ||||||||||    
T  19277405 aagcaaagtagccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgtt 19277306  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  19277305 gaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 19277265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 776 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 27521690 - 27521443
Alignment:
Q  776 gatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaa 875  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  | |  |||||||||||||||| | | ||||||||| | |||||  |||||| | |||||||  || || ||||    
T  27521690 gatgggtaggagaaaaacatatgtg--tagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacatgcacccttaaa 27521593  T
Q  876 agttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagta 974  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||   || |  ||||||||||||||  |||| | ||  |    
T  27521592 agttgcgttaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaatttacttttgacacttttggtttcctagcatca 27521493  T
Q  975 gaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  27521492 gaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 27521443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 685 - 962
Target Start/End: Complemental strand, 3676952 - 3676673
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| || ||| || ||| || ||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  3676952 atatcaatgaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccaatagatagaaaatcaacactcaggcttgtagatgttatggtgtagggatgggtag 3676853  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggaca-aacaaccctaaaagttgcgt 883  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||   |||||||   || ||||||||| |||||    
T  3676852 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgt 3676753  T
Q  884 caaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgac 962  Q
    ||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  3676752 caagcaaagtggtcaaacatcagaaagcgtgttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttttgac 3676673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 686 - 1024
Target Start/End: Original strand, 45613638 - 45613977
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||||| || || ||| | | |||||| ||| | |||| ||| ||||||| | ||||   |||||||||    
T  45613638 tatcagtgaagaaggagacgtctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgatgtacgaatgggtagg 45613737  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| ||| || |||||| | |||||  |||||    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45613738 aggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtca 45613837  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    |  || | | ||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |  |||||| ||  ||||| |||||    
T  45613838 agtaaggtgaccaaacacgggaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagaggctgtta 45613937  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     |||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||    
T  45613938 gccttctacatagagttcaaaagttcatgcataacaatgt 45613977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 829 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 983117 - 982921
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaac 927  Q
    ||||||||| | || ||| |||||||  |||||||  || || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  983117 gtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttctgacaatcaac 983018  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| ||||||  ||| || |||||| ||||| |  || | | ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  983017 atgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgt 982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 727 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 5825541 - 5825245
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||    
T  5825541 ccactagatagaagatcgacacataggcctgcggatgttatggtgtacgaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccac 5825442  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||| ||| ||||||  ||||||| |  ||||||   | ||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||| | |||||||    
T  5825441 ttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaagtg--caaacatgacaatgcgtgttatgacaatca 5825344  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||  ||| |  |||||||||||| | | ||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  5825343 acatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagtcgaaagggttatgcatagcaatgt 5825245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 829 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 32584769 - 32584596
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaac 927  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  32584769 gtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatcaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaag 32584670  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtt 1001  Q
    ||| |||||   ||| || ||||||||||||    |||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32584669 atgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgttgaccttctagatagagtt 32584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 870 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 2904492 - 2904348
Alignment:
Q  870 cctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaa 968  Q
    |||||||||| |||||| ||||   | ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||| |    
T  2904492 cctaaaagttacgtcaagcaaaatagtcaaacatgagaaagcatgttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttccta 2904393  T
Q  969 acagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
     || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2904392 gcactagaggttgttgaccttctacgtaaagtttaaagggtcatg 2904348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 911 - 1015
Target Start/End: Original strand, 40726502 - 40726606
Alignment:
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||  | ||  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  40726502 gtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaagggtt 40726601  T
Q  1011 atgca 1015  Q
    |||||    
T  40726602 atgca 40726606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 848 - 1001
Target Start/End: Complemental strand, 22198135 - 22197981
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  22198135 cttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgc 22198036  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtt 1001  Q
    ||||| |||||| |  |||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22198035 ttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtt 22197981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 848 - 1001
Target Start/End: Original strand, 22239686 - 22239840
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  22239686 cttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgc 22239785  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtt 1001  Q
    ||||| |||||| |  |||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22239786 ttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtt 22239840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 857 - 1013
Target Start/End: Original strand, 9281099 - 9281255
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacac 955  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||   || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   || ||  |||||||     
T  9281099 taggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgacat 9281197  T
Q  956 ttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    ||||  ||||| | ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9281198 tttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatg 9281255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 857 - 1013
Target Start/End: Original strand, 9292070 - 9292226
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacac 955  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||   || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   || ||  |||||||     
T  9292070 taggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactagc-aaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgacat 9292168  T
Q  956 ttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    ||||  ||||| | ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9292169 tttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatg 9292226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 24527757 - 24527561
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaac 927  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||   |||||||  || |||||||||  | |||||  |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24527757 gtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaac 24527658  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| ||||||  ||| || ||||||||||||    |||| | ||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  24527657 atgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 24527561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 1024
Target Start/End: Original strand, 25186875 - 25187066
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaac 927  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||   ||||||| | |||||||||||||| |||||  |||| || | ||||||||||| |||||||  | |||||||    
T  25186875 gtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacataaaaccctaaaagttgtgtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatcaac 25186974  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||| |  ||| || ||||||     | |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  25186975 atgtttttctaccatttgcttttga-----tcggtttccgaacactagaggttgttgaccttctatatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 25187066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 872 - 1024
Target Start/End: Original strand, 30216040 - 30216193
Alignment:
Q  872 taaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaac 970  Q
    |||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | |    
T  30216040 taaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagc 30216139  T
Q  971 agtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |  |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  30216140 atcagagtttgttgatcttccacataaagttcaaatggtcatgcatagcaatgt 30216193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1074 - 1178
Target Start/End: Complemental strand, 46262133 - 46262028
Alignment:
Q  1074 gttcttttaggctt-gttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttt 1172  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||  |||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |    
T  46262133 gttcttttaggctttgttggtggctcctccatcttaccggaatttgagtggtggccgcgtctgatcgtttgaagcaactaatcattgtcggctactttat 46262034  T
Q  1173 tgatct 1178  Q
    ||||||    
T  46262033 tgatct 46262028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 978 - 1024
Target Start/End: Original strand, 41117859 - 41117905
Alignment:
Q  978 gttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  41117859 gttgttaaccttctacatagagtttaaaagatcatgcatagcaatgt 41117905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 38596740 - 38596679
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgta 773  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||    
T  38596740 aacttcctgaccgacccactaaataaaagatcgacacttaagcatgtggatgttatggtgta 38596679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 973 - 1015
Target Start/End: Original strand, 10032255 - 10032297
Alignment:
Q  973 tagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10032255 tagatgttgttaaccttctacatagagttcaaaggatcatgca 10032297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 880 - 997
Target Start/End: Original strand, 42295174 - 42295292
Alignment:
Q  880 gcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagagg 978  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||| |  |||| ||||  || ||    
T  42295174 gcgtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaacaccagggg 42295273  T
Q  979 ttgttaaccttctacatag 997  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  42295274 ttgttgaccttctacatag 42295292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 927 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 38839393 - 38839336
Alignment:
Q  927 catgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    ||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38839393 catgtttttatataatttgcttttgacacttttgacttcctaacacgagaggttgtta 38839336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 101; Significance: 2e-49; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 1009
Target Start/End: Complemental strand, 35310759 - 35310435
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | |||||||| || || |||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||  ||||||| ||    
T  35310759 tatcagtgaagaaggaggcgcctgtgaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacacttaggcttgcggatgttatgatgtacggatgggttgg 35310660  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || ||||  |||| || | |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35310659 aggaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtca 35310560  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    | ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | |||||   ||  ||||| |||||    
T  35310559 agcaaagtggccaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgtta 35310460  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  35310459 accttctacatagagtccaaagggt 35310435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 847 - 1024
Target Start/End: Original strand, 37873595 - 37873773
Alignment:
Q  847 gcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctg 945  Q
    ||||||| | ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||    
T  37873595 gcttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttg 37873694  T
Q  946 tttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37873695 cttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcagaacaatgt 37873773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 712 - 999
Target Start/End: Complemental strand, 27336978 - 27336690
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||   || ||||  ||||    
T  27336978 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 27336879  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    ||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| || |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  27336878 ctggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaatc 27336779  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagag 999  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||  |||||  ||| |||||||||||||||    
T  27336778 gtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagag 27336690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 727 - 1024
Target Start/End: Original strand, 15291863 - 15292160
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| |||||| ||| | |||| |||  |||||| ||||||  | |||||||||||||||||| |||| || |  |||| |||| |||||| ||    
T  15291863 ccactagatagaagatcaacactcaggcctgcgaatgttatggtgtacggctgggtaggaggaaaacatgtttgtgtagacttgaatgaggtttcaccac 15291962  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatca 925  Q
    | || |||||| | |||||  |||||  | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15291963 ttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatca 15292062  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||||   || | | || |||||||| || | |||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  15292063 acatgtttttatacaatttgttttttacacttttagttttctagcactagaggttattgatcttctaca-aaagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 15292160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 817 - 960
Target Start/End: Original strand, 3114090 - 3114234
Alignment:
Q  817 atttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgtt 915  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  3114090 atttcaccactcatgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcatgtt 3114189  T
Q  916 ctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttg 960  Q
    || ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3114190 ctgacagtcaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttg 3114234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 756 - 1024
Target Start/End: Original strand, 32269663 - 32269932
Alignment:
Q  756 tgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatg 855  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| |||  ||| |||| | |||||  ||||||||    
T  32269663 tgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttctggaattaggtgtcgggccttttatg 32269762  T
Q  856 ataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgaca 954  Q
     |||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||  ||| || |||||| |    
T  32269763 gtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgata 32269862  T
Q  955 cttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  32269863 ctttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttctgcatgaagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 32269932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 686 - 1047
Target Start/End: Original strand, 13166706 - 13167069
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||| ||  || | ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||| ||  ||||||| ||    
T  13166706 tatcagtgaagaaggaagcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcatgcggatgttatggtctacggatgggttgg 13166805  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatt-acgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    ||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||  || | ||||  | ||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  13166806 aggaaaacatgcatgtgtggacttgactggg-tttcaccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtc 13166904  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| | ||||| | ||  ||||  ||||    
T  13166905 aagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgtt 13167004  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaat-gtataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||  ||| || ||||||||||||    
T  13167005 gaccttctacatagagtccaaagggttatgcatagcaatggtatgtctcctaggtccatgaatgt 13167069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 738 - 958
Target Start/End: Original strand, 33691903 - 33692124
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||   || ||||  ||||||||| |||||| ||| ||||| |||    
T  33691903 aagatcgacacttaagcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggttta 33692002  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatga-gaaacgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
     ||||||| ||||||| | |||||||  ||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  33692003 ggggtcggggcttttacggtaggacaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgacaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttg 33692102  T
Q  937 tgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |  ||| || ||||||||||||    
T  33692103 taccatttgcttttgacacttt 33692124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 727 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 34335607 - 34335319
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||   || ||||  || |||| | ||  |  ||    
T  34335607 ccactagatagaagatcgacacttaggcttgcatatgttatggtgtacaaatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtggaattcactggggttctatcac 34335508  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    | || |||||| |||||  ||||||||   ||||| | |||||||||||||    ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  34335507 ttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaaagggccaaacatgagaaagcgtgtcctgacaatca 34335408  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgc 1014  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |  |||  ||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  34335407 acatgcttttataccatttgtttttgacactttcgactttctgacaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaacggatcatgc 34335319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 818 - 1015
Target Start/End: Original strand, 43115386 - 43115583
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttc 916  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||     
T  43115386 tttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgt-aaataaagcggtcaaatatgagaaagcgtgttt 43115484  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    | |||||||||||| ||| ||  ||| || ||||||||||| |||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  43115485 tgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacacttctgacttcgtaacaccagagattgttgaccttctacgtagagtttaaatgatcatgca 43115583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1070 - 1179
Target Start/End: Original strand, 18557600 - 18557709
Alignment:
Q  1070 gcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctt 1169  Q
    |||||||||||| | ||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  18557600 gcaagttcttttcgactttttggtggctcctccgacttatcggttgttgagtggtgggtgaatctgatcgtttgatgcaacatatcatcctcggctgctt 18557699  T
Q  1170 ttttgatctc 1179  Q
    ||||||||||    
T  18557700 ttttgatctc 18557709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 724 - 1006
Target Start/End: Complemental strand, 43129806 - 43129524
Alignment:
Q  724 gatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcac 823  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| ||   || |||   ||||||| | ||||||    
T  43129806 gatctactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatgatgtacggatggataggaggaaaa-atgcatgtgtgaaattgactggggtttcac 43129708  T
Q  824 tactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaa 922  Q
     ||| || |||||| |||||||| |||||| | | |||||  ||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43129707 cacttgttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaa 43129608  T
Q  923 tcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| ||| |  |||| ||||  ||| ||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  43129607 tcaacatgtttttctaccatttgcttttgacattttcggtttcctaacaccagatgtttttgaccttctacagagagttcaaag 43129524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 869 - 1024
Target Start/End: Original strand, 25663011 - 25663167
Alignment:
Q  869 ccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcca 967  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||   |||||     
T  25663011 ccctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttcct 25663110  T
Q  968 aacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | ||  ||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||    
T  25663111 agcatcagaagttgttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgt 25663167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 866 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 38875769 - 38875610
Alignment:
Q  866 caaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgactt 964  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||   |||    
T  38875769 caaccctaaaaactgcatcaaacaaagcgaccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttcagctt 38875670  T
Q  965 ccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    || | ||  ||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  38875669 cctagcaccagaggctgctgaccttctacgtagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 38875610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 727 - 917
Target Start/End: Complemental strand, 433562 - 433371
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||   || ||||  ||||| | | |||||| ||    
T  433562 ccactaaatagaagatccacacttaggcatgcggatgttatggtgtacagatgggttggaggaaaatatgcatgtgtggacttgaccggggtttcaccac 433463  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttct 917  Q
      ||||| ||| |||| || ||||||| | ||||| | |||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  433462 ctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 818 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 14423857 - 14423716
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttc 916  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |   |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  14423857 tttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggacaggcaaccctaaaaaatgcgtcaagcaaagtgaccgaacatgagaaagcgtgttc 14423758  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    | |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||    
T  14423757 tgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttt 14423716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 897 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 8100652 - 8100524
Alignment:
Q  897 caaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacat 995  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||  ||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||  ||||||   || ||||||||||| ||||||||| |    
T  8100652 caaacatgagaaaacgtgttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacactttcaacttccttccactagaggttgttgaccttctacgt 8100553  T
Q  996 agagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  8100552 agagtttaaagattcatgcatatcaatgt 8100524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 889 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 14436605 - 14436530
Alignment:
Q  889 aaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14436605 aaagtggccaaacatgaaaaaacgtgttct---aatcaacatgtttttatatcatttgtttttgacacctttgacttcc 14436530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 871 - 950
Target Start/End: Original strand, 26212564 - 26212644
Alignment:
Q  871 ctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgttttt 950  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  26212564 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtattctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttt 26212644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 846 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 8859067 - 8858970
Alignment:
Q  846 agcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcat 942  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||  |||  |||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8859067 agcttttacggtgggacaagcaacccacaaaactgcgtcaagcaaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcat 8858970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 872 - 960
Target Start/End: Original strand, 32230489 - 32230578
Alignment:
Q  872 taaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttg 960  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||  || ||||||||||    
T  32230489 taaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatgtgttctgacaatcaacaagcttttataccatctgcgttcgacacttttg 32230578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 907 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 42921786 - 42921669
Alignment:
Q  907 aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || || ||||||||| |  |||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |     
T  42921786 aaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttatgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcagaa 42921687  T
Q  1007 ggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  42921686 ggtcatgcataacaatgt 42921669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1107 - 1146
Target Start/End: Original strand, 1918459 - 1918498
Alignment:
Q  1107 tatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaag 1146  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1918459 tatcggatgttgagtggtggtcgaatctgatcgtttgaag 1918498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 101; Significance: 2e-49; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Original strand, 41867703 - 41868043
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41867703 atatcagtgaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgggtag 41867802  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||  |||||||  || || |||||| ||||||    
T  41867803 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactgagatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtc 41867902  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || ||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  ||||| ||||    
T  41867903 aagcaaagtggtcaaacatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgtt 41868002  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  41868003 gaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 41868043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 685 - 1021
Target Start/End: Original strand, 4412861 - 4413198
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  4412861 atatcagtgaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtag 4412960  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||   |||||||  |||||||||||| || |||    
T  4412961 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtc 4413060  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  |||| |||||    
T  4413061 aagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgtt 4413160  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaa 1021  Q
     ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  4413161 gaccttctacatagggttcaaaaggtcatgcatagcaa 4413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 862 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 2888651 - 2888464
Alignment:
Q  862 caaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttg 960  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||    
T  2888651 caaacaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccattcgtttatgacacttttg 2888552  T
Q  961 acttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt-ataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
     ||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |  ||| |||  |||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  2888551 gcttcctaacacaagaggttgttgaccttctacacaaggttcaaaatgtcatgcacaacaatgtcatatctcttaaatccataaatgt 2888464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 686 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 27502672 - 27502392
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | ||||| ||||| || |||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  27502672 tatcactgaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatgcaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttgg 27502573  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || ||||   ||| || | |||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  27502572 aggaaaacatgcatgtgtggacctgaatggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggacaat-aaccctaaaagctgcgtca 27502474  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||   ||   ||||||||||||| |||||||    
T  27502473 agcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcc 27502392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 727 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 28225270 - 28224996
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||| | | ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||   || ||||  |||| || | |||||||||    
T  28225270 ccactagatagaatatcgacacttaggcctacggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgaatggggtttcactac 28225171  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||| ||| | ||  | ||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  28225170 ttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaatatgagaaagcgtattctgacaatca 28225071  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
    ||||| ||||||  ||| || |||||||||||| | ||||| | |   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28225070 acatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttctacatagagt 28224996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 692 - 1024
Target Start/End: Original strand, 9685217 - 9685550
Alignment:
Q  692 tgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaa 791  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||| ||| ||| || ||| | |||| |||| |  ||| |||||  | ||||||||| |||||    
T  9685217 tgaagaaggaggcttctgtgaacttcctgactgacccactagatagaaggtcaacactcaggcctgcaaacattatggtgtgcatatgggtaggtggaaa 9685316  T
Q  792 acatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 891  Q
    ||||  ||| || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||   ||||| |  || ||||||||   ||||||| ||||    
T  9685317 acatgattgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaa 9685416  T
Q  892 gcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttc 990  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||| || | | || |||||| |||  ||||||    
T  9685417 gtggccaaacatgaaaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttc 9685516  T
Q  991 tacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    || |||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  9685517 tatatagagttcaaaaggtcatggatagcaatgt 9685550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1179
Target Start/End: Complemental strand, 44888342 - 44888227
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcgg 1163  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  44888342 tttgacgcaagttctctcaggctttttggtggctcctccgacttatcggaagttgagtgttggacgaatatgatcgtttgatgcaacaaatcatcgtcgg 44888243  T
Q  1164 ctgcttttttgatctc 1179  Q
    ||||||||||||||||    
T  44888242 ctgcttttttgatctc 44888227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 818 - 1048
Target Start/End: Complemental strand, 5532598 - 5532367
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttc 916  Q
    |||||| |||| | |||||| ||||||| | ||||| | |||||||  || ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||     
T  5532598 tttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttg 5532499  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcag 1016  Q
    | |||||||||||| ||||||   || |  |||||||||||| | ||||| | ||  | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5532498 tgacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacactttag-cttcctagcaccataggttgttgagcttctacatagagttcaaagggtcatgcac 5532400  T
Q  1017 agcaatg-tataactcttaagtccatgaatgtg 1048  Q
    | |||||  || |||| ||||| ||||||||||    
T  5532399 aacaatgccatgactcctaagttcatgaatgtg 5532367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 848 - 1024
Target Start/End: Original strand, 19161741 - 19161918
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  19161741 cttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaagtgggcaaacatgaaaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgc 19161840  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||||| |  ||   |||| |||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  19161841 ttttgacactttcggttttgtaacactagaggctgcttaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgt 19161918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 712 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 3826012 - 3825698
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||   || ||||  ||||    
T  3826012 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacctttatgcttgtggatgttaaggtgtacaaatgagtaggagaaaaacatgcatgtgtggacttga 3825913  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaacg 911  Q
     |||| ||||||  || ||||||||| ||||| |  |||||| | || |||| | | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||      
T  3825912 ttgaggtttcaccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaaaaagt 3825813  T
Q  912 tgtt--ctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    | ||  || |||||| |||||||||||| |||| || ||  ||||||||  | |||| | ||  | |||||||| |||||| |||| ||||| ||||  |    
T  3825812 tttttcctgacaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgaccttcaacatcgagttcaaagaat 3825713  T
Q  1010 catgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||| ||||||||    
T  3825712 catgcatagcaatgt 3825698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 686 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 17344949 - 17344610
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | ||||| ||||| || || ||| | | |||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  17344949 tatcagtgaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtagg 17344850  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||   ||||| |  ||  ||| |||| |||||||    
T  17344849 aggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtca 17344750  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    |  || | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||    |||| | ||  | ||| ||||     
T  17344749 agtaaggtggccaaacacgagaaaacgtgttttcacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttg 17344650  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  17344649 accttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 17344610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 692 - 957
Target Start/End: Original strand, 23484740 - 23485006
Alignment:
Q  692 tgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaa 791  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||  || | |||| ||| |||||| ||| | | || |||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  23484740 tgaagaaggaggcgtctgtgaacttcctgattgacctactatatagaagatcaacactcaagcatgcatatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaa 23484839  T
Q  792 acatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 891  Q
    ||||   || || |  |||| || | |||||| ||| ||||||||| | |||||  |||| | | | ||||||  | ||||||||| | |||||||||||    
T  23484840 acatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaa 23484939  T
Q  892 gcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacactt 957  Q
    | ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  23484940 gtggccaaatatgagaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactt 23485006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 9675152 - 9674949
Alignment:
Q  689 caatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggagg 788  Q
    |||||||||| |||||  || | ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||   ||| ||||||||    
T  9675152 caatgaagaatgaggcgcctgtgaactttctgaccgaccgattaaataaaagatcgacacttagacatgcagatgttatgatgtacgaatgagtaggagg 9675053  T
Q  789 aaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaac 888  Q
    |||||||   ||  ||   |||| || | |||||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  9675052 aaaacatgcatgtatgaacttgattggggtttcaccactcatgggattagggatcagaccttttatggtaggacaaatagccctaaaatatgcgtcaaac 9674953  T
Q  889 aaag 892  Q
    ||||    
T  9674952 aaag 9674949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 832 - 937
Target Start/End: Original strand, 1295992 - 1296098
Alignment:
Q  832 ggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatg 930  Q
    |||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||    
T  1295992 ggattagggatcggaacttttataataggagagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatg 1296091  T
Q  931 tttttat 937  Q
    |||||||    
T  1296092 tttttat 1296098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1178
Target Start/End: Complemental strand, 9560812 - 9560698
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcgg 1163  Q
    |||||| || |||||||| |  |||||| || |||||||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  9560812 tttgactcaggttcttttggctttgttggtggctcctccgtcctaacggaagttgagtggtggtcgcgtctgatcgtttgaagcaacaaatcattgtcgg 9560713  T
Q  1164 ctgcttttttgatct 1178  Q
    ||||||| |||||||    
T  9560712 ctgctttattgatct 9560698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1096 - 1179
Target Start/End: Original strand, 14328185 - 14328268
Alignment:
Q  1096 ctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttttgatctc 1179  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| || || ||||||| || | ||||||||| |||||    
T  14328185 ctcctccgacttatcggttgttgagtggtgggtgaatatgatcgtttgatgcaacatatcatcttcagttgctttttttatctc 14328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 860 - 1024
Target Start/End: Original strand, 16351811 - 16351979
Alignment:
Q  860 gacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |  | || |||||||| |||    
T  16351811 gacagacaatcctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaatgtgttctcacaatcaacataattttatattgtttgcttttgacatttt 16351910  T
Q  959 ---tgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
       || ||    | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  16351911 gtttggctctttatcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcacaacaatgt 16351979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 919 - 1012
Target Start/End: Original strand, 32029116 - 32029209
Alignment:
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcat 1012  Q
    |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||   ||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32029116 acaatcaacatgctttcatatcatttgtttttgacactttcagcttcccaacttcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaagagtcat 32029209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 690 - 794
Target Start/End: Original strand, 13146934 - 13147038
Alignment:
Q  690 aatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggagga 789  Q
    ||||||||| |||||  || | ||||||||||   | |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||   |||||||||| ||    
T  13146934 aatgaagaatgaggcgtctgtgaacttcctgattaacccactagatagaagatcgacatttaggcatgtagatgttatggtgtacgcatgggtaggaaga 13147033  T
Q  790 aaaca 794  Q
    |||||    
T  13147034 aaaca 13147038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 944 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 13413403 - 13413323
Alignment:
Q  944 tgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  13413403 tgtttttgacactttcggttttcaagcagcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 13413323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 897 - 1024
Target Start/End: Original strand, 34814826 - 34814953
Alignment:
Q  897 caaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacat 995  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| || ||| |||||||| |  |||| ||||  ||||  |||| |||||||||||    
T  34814826 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcgg-ttcctaacaccagagactgttgaccttctacat 34814924  T
Q  996 agagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  34814925 agagttcaaatggtcatgcataacaatgt 34814953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 911 - 1022
Target Start/End: Original strand, 2886637 - 2886748
Alignment:
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| |  |||||| ||  ||||| |||| | ||| ||||||||||| ||| |  |    
T  2886637 gtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagaggctgttgatcttttacatagagttcaaaagagc 2886736  T
Q  1011 atgcagagcaat 1022  Q
    ||||| ||||||    
T  2886737 atgcatagcaat 2886748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 974 - 1024
Target Start/End: Original strand, 7760930 - 7760980
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  7760930 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcgtagcaatgt 7760980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 994
Target Start/End: Original strand, 33612555 - 33612652
Alignment:
Q  898 aaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctaca 994  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||   || ||| ||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||| || |||||||    
T  33612555 aaacatgagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacacttttggcttcctaacaccggaggttgttgacattctaca 33612652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 7e-49; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 1024
Target Start/End: Original strand, 39583025 - 39583364
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||   | | ||||| ||||  || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||  ||||||||||    
T  39583025 tatcagtgaagaaggaggcgtatgtgaactttctgattgacccactagatagaagatcgacacttaggcatgcggatgttatagtgtacggatgggtagg 39583124  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   |||||||  |||||| || ||| || ||| ||||||||| |||||||  | |||||| ||||| |  || ||||||||| |||||||    
T  39583125 aggaaaacatgcatgcgtggacttgacttaggttttaccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtca 39583224  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| |  |||| | ||  | ||||||||     
T  39583225 agcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttg 39583324  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39583325 accttctgcatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgt 39583364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Original strand, 52741306 - 52741647
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||   | | ||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | || ||||||||||||  ||| ||  |||||||||    
T  52741306 atatcagtgaagaaggaggcgtatgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcagacttgcagatgttgtggtatacggatgggtag 52741405  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaa-gttgcgt 883  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||   || ||| |||||||  |||||||  || |||||||| | || ||    
T  52741406 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactgaggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagt 52741505  T
Q  884 caaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgt 982  Q
    ||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||  |||| | ||  |||||||||    
T  52741506 caaacaaattgaccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgt 52741605  T
Q  983 taaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  52741606 tgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 52741647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 761 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 7901094 - 7900830
Alignment:
Q  761 atgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatagg 860  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||| ||  |||||| | ||||    
T  7901094 atgttatggtgtatagatgtgtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtagg 7900995  T
Q  861 acaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacactttt 959  Q
    ||  | | ||||||||  |||||||| ||||   ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||     
T  7900994 acggatatccctaaaaactgcgtcaagcaaaatagccgaacatgagaaagcgttttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttc 7900895  T
Q  960 gacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || || ||||||||    
T  7900894 ggcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtttgaaggattatacatagcaatgt 7900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 44199079 - 44198739
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||||||||||||||||   || | |||||| |||| || |||||| ||| |||||| ||| | |||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||    
T  44199079 atatcaatgaagaaggaggtgcctgtgaacttcgtgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcttgtggacattatggtgtatggatgagtag 44198980  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | ||||||||| || | || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||   |||| ||  || | ||||||||||||||    
T  44198979 gtggaaaacatgttagtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtc 44198880  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |  |||  ||||   |||| ||||    
T  44198879 aagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgagaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgtt 44198780  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||    
T  44198779 gaccttctacatagagttcagaaggttatgcatagcaatgt 44198739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 756 - 962
Target Start/End: Original strand, 46940635 - 46940843
Alignment:
Q  756 tgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaa-catatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttat 854  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||| ||| | || |||   ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||    
T  46940635 tgcagatgttatggtgtatggatagataggagcaaaaacatgtatgtgtgaacttgactgaggtttcattactcgtgggattaggggtcgaggattttat 46940734  T
Q  855 gataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgac 953  Q
    | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  46940735 ggtaggacagacaactctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgac 46940834  T
Q  954 acttttgac 962  Q
    |||||||||    
T  46940835 acttttgac 46940843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 818 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 38146235 - 38146028
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgaga-aacgtgttc 916  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  || |||||||||  || |||| ||||| || |||||  |||| ||||||||     
T  38146235 tttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcatcaatcaaagtggtcaaacgcgagacaacgtgttt 38146136  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcag 1016  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||     
T  38146135 tgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtttacattctacttagagttcaaagggtcatgcat 38146036  T
Q  1017 agcaatgt 1024  Q
    | ||||||    
T  38146035 aacaatgt 38146028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 738 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 53785968 - 53785681
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    |||||| ||| | |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  53785968 aagatcaacactcaggcatgcggatgttttggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccactagtgggatta 53785869  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
     | |||||  ||||||   ||||| |  || |||| ||||  |||||||  || | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  53785868 ggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgctttta 53785769  T
Q  937 tgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |  ||| || |||||||||||| |  |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  53785768 taccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 53785681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 869 - 1024
Target Start/End: Original strand, 37132978 - 37133134
Alignment:
Q  869 ccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcca 967  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |  |||      
T  37132978 ccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttacactttcggtttctt 37133077  T
Q  968 aacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    | ||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  37133078 agcaccagaggttgttgaccttctacatagagttctaaaggtcatgcatagcaatgt 37133134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 869 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 26772886 - 26772754
Alignment:
Q  869 ccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcca 967  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||     
T  26772886 ccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcct 26772787  T
Q  968 aacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
    | ||  |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  26772786 agcatcagaggcagttgaccttctatatagagt 26772754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 712 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 49018248 - 49017944
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| |||||  ||| | |||| ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||   || ||    ||||    
T  49018248 aacttcctgactgacccactagatagaagattaacactcaggcatgcagatgttatggtgtacggattggtacgaggaaaacatgcatgtgtaaacttga 49018149  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    |||   |||||| ||| |||| |||| | ||||   |||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||      
T  49018148 ctggagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaagtgaccaaacatgagaaagt 49018049  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||| |  |||| | ||   ||||||||| | ||||||| || |||| ||| ||||    
T  49018048 gtgttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttctacgtaaagttcaaaaggtc 49017949  T
Q  1011 atgca 1015  Q
    |||||    
T  49017948 atgca 49017944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 848 - 1014
Target Start/End: Original strand, 3443270 - 3443437
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||  || |||| |||||||||||| ||||||  ||| |      
T  3443270 cttttacgataggacagagagtcctaaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatgcttttataccattttc 3443369  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgc 1014  Q
    | ||||||||||    |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3443370 tgttgacactttcagtttcctagcactagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgc 3443437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 910 - 1024
Target Start/End: Original strand, 26856783 - 26856897
Alignment:
Q  910 cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||| || |||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26856783 cgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactgttgaccttctacatagagttcaaagggt 26856882  T
Q  1010 catgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||| ||||||||    
T  26856883 catgcatagcaatgt 26856897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 910 - 1024
Target Start/End: Original strand, 52411912 - 52412026
Alignment:
Q  910 cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||   ||| | |||| |||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  52411912 cgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttcagctttctaacactagatgtcgttgaccttctacatagagttcaaagggt 52412011  T
Q  1010 catgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||| | ||||||    
T  52412012 catgcataacaatgt 52412026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 874 - 996
Target Start/End: Original strand, 54508367 - 54508491
Alignment:
Q  874 aaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa--cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaaca 971  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| || | | ||    
T  54508367 aaagttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaacatgtttttatatcatttgcttttgacatttttgattttctagca 54508466  T
Q  972 gtagaggttgttaaccttctacata 996  Q
      |||||||||| ||||||| ||||    
T  54508467 ccagaggttgttgaccttctgcata 54508491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 29862067 - 29861999
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacat 795  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29862067 ccactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacat 29861999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 897 - 1024
Target Start/End: Original strand, 38670887 - 38671015
Alignment:
Q  897 caaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacat 995  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||| | | ||  |||||  | | |||||||||||    
T  38670887 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttttggctttctagcatcagaggcggatgaccttctacat 38670986  T
Q  996 agagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  38670987 agagtctaaagagttatgcatagcaatgt 38671015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 818 - 1024
Target Start/End: Original strand, 7501939 - 7502145
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgc-gtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgtt 915  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||| ||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||   |||||  |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7501939 tttcaccactcgtgggtctaggggtcgg-gctgttacgataggacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgtt 7502037  T
Q  916 ctcacaatcaacatgttttt-atgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgc 1014  Q
    |  ||||||||||||||||| ||  ||| |  |||||||| |||||  |||| | ||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7502038 cgaacaatcaacatgttttttataccattttcttttgacatttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctaca--gagtttaaagggtcatgc 7502135  T
Q  1015 agagcaatgt 1024  Q
    | | ||||||    
T  7502136 acaacaatgt 7502145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 875 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 37992454 - 37992305
Alignment:
Q  875 aagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagt 973  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||| |||| |  ||||||   ||||| ||||  | || |    
T  37992454 aagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgaggaagcatgttctgacaatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcact 37992355  T
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||| || |||||    
T  37992354 agaggttgttgaccttctacaaagag-ttcaagggtcatgcacagtaatgt 37992305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 845 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 5338798 - 5338615
Alignment:
Q  845 gagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttc---tcacaatcaacatgtttttatgtc 940  Q
    ||||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||    | ||| |||||||| ||||||       
T  5338798 gagcttttacggtaggacagaaagccctaagagttgcgtcaaacaaaattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttataca 5338699  T
Q  941 atctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    || || |||||||||||| | ||||| | || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  5338698 atttgcttttgacactttcggcttcctagcactagagattgttgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcgtagcaatgt 5338615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 919 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 51234693 - 51234588
Alignment:
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagag 1018  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |     
T  51234693 acaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggttatgcataa 51234594  T
Q  1019 caatgt 1024  Q
    ||||||    
T  51234593 caatgt 51234588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 985 - 1047
Target Start/End: Original strand, 25094668 - 25094731
Alignment:
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt-ataactcttaagtccatgaatgt 1047  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  25094668 accttctacatatagttcaaatggtcatgcatagcaatgtaatatcttttaagtccatgaatgt 25094731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 818 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 51234782 - 51234711
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaaca 889  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51234782 tttcaccacttgtgggtttaggggtcgagacttttacgataggacaaacaaccctaaaaactgcgtcaaaca 51234711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 974 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 44858 - 44808
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  44858 agaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 44808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1178
Target Start/End: Complemental strand, 3968574 - 3968460
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcgg 1163  Q
    |||||| || |||||||| |  |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||| || ||||||  | ||    
T  3968574 tttgactcaggttcttttcgctttgttggtggctcctccgtcttaccggaagttgagtggtggtcgcgtccgatcgtttcaagcaacatatcattattgg 3968475  T
Q  1164 ctgcttttttgatct 1178  Q
    ||||||| |||||||    
T  3968474 ctgctttattgatct 3968460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1178
Target Start/End: Original strand, 4000231 - 4000345
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcgg 1163  Q
    |||||| || |||||||| |  |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||| || ||||||  | ||    
T  4000231 tttgactcatgttcttttcgctttgttggtggctcctccgtcttaccggaagttgagtggtggtcgcgtccgatcgtttcaagcaacatatcattattgg 4000330  T
Q  1164 ctgcttttttgatct 1178  Q
    ||||||| |||||||    
T  4000331 ctgctttattgatct 4000345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 89; Significance: 3e-42; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 749 - 1047
Target Start/End: Complemental strand, 53619834 - 53619534
Alignment:
Q  749 ttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagc 848  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||| |||  ||| || ||    
T  53619834 ttaggcctgcatatgttatggtgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagaggtgggggc 53619735  T
Q  849 ttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtt 947  Q
    |||||   |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  53619734 ttttacagtaggacaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtt 53619635  T
Q  948 tttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatg-tataactcttaagtccatgaatg 1046  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  53619634 tttgacacttttgacttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtctaaagggttatgcataacaatgttatgtctcttaggtccatgaatg 53619535  T
Q  1047 t 1047  Q
    |    
T  53619534 t 53619534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 718 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 26521767 - 26521460
Alignment:
Q  718 ctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgaga 817  Q
    ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| || | |  | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||   ||  |||  |||||||       
T  26521767 ctgactgacccactagatagaagatcgacatttaagcctacgaaggttatggtgtacagacgggtaggaggaaaacatgcatgtatggacttgactggag 26521668  T
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatg-agaaacgtgttc 916  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||     
T  26521667 tttcatcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggctaaacatgaaaaaacgtgtta 26521568  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcag 1016  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| || |||  |||||||||  |||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  26521567 tgacaatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatacagttcaaagggtcatgcgt 26521468  T
Q  1017 agcaatgt 1024  Q
    ||||||||    
T  26521467 agcaatgt 26521460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 686 - 1024
Target Start/End: Original strand, 50000721 - 50001061
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    |||||||||||||||||||  || | ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  50000721 tatcaatgaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttgg 50000820  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||| | | |||| || ||||||| | ||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  50000821 aggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtca 50000920  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtca-tctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    | ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||   || | || |||||||||||||| ||| | | ||  |||||  |||    
T  50000921 agcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttttggctttctagcatcagaggcagtt 50001020  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     |||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  50001021 gaccttctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgt 50001061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 715 - 1015
Target Start/End: Original strand, 56461932 - 56462232
Alignment:
Q  715 ttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactg 814  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||  |||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||   || ||||  |||||||    
T  56461932 ttcctggctgatccactagatagaagatcgacacttaagcatgcgaatgttatggtgtacggatgagtaggtggaaaacatgcatgtgtggacttgactg 56462031  T
Q  815 agatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtg 913  Q
    || |||||| | | || |||||| ||||||   |||||| | | | | | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  56462032 aggtttcaccatttgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggc-aaacatgataaagcgtg 56462130  T
Q  914 ttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  56462131 ttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatg 56462230  T
Q  1014 ca 1015  Q
    ||    
T  56462231 ca 56462232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 727 - 1000
Target Start/End: Original strand, 12918209 - 12918483
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||   || |||   |||||||   |||||  ||    
T  12918209 ccactagatagaagatcgacacttaggcctgtggatgtcatggtgtatggatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtgtagttgactggagtttcatcac 12918308  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||||||| |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12918309 ttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggtcaaacataagaaatcgtgttctgacaatca 12918408  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
    |||   ||||||   || |  |||||||||||| ||||||| | ||  |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12918409 acacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttctagatagagt 12918483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 685 - 958
Target Start/End: Original strand, 30940534 - 30940807
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  || | ||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |||| | |  |||||| ||||||   ||||||||    
T  30940534 atatcagtgaagaaggaggcacctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactaaggcctacgaatgttatggtgtacgaatgggtag 30940633  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||||| |||| | ||| ||||||||| | |||  | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30940634 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactgaggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtc 30940733  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    ||  |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||    
T  30940734 aagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccat-tgcttttgacacttt 30940807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 712 - 1000
Target Start/End: Complemental strand, 31847372 - 31847083
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||   || ||||  ||||    
T  31847372 aactttctgactgacccactagataaaagattgacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatggattggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 31847273  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    ||  | |||||| ||| ||||| ||| |||| || |||||||   |||||||  || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |    
T  31847272 ctagggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaacc 31847173  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||| ||||| | ||  ||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  31847172 atgttctgacagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaagcggttgaccttctacatagagt 31847083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 712 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 132672 - 132357
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||   || |||   ||||    
T  132672 aacttcttgactggtccactagatagaagatcgacacttcggcatgcagatgttatggtgtacagatacgtaggaggaaaatatgcatgtgtgaacttga 132573  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgat--aggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa 909  Q
    ||| | |||||| ||| || |||||| |||||||  |||||| | |  ||||||  || ||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  132572 ctggggtttcaccacttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaaatggcaaaacatgagaaa 132473  T
Q  910 -cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaaggg 1008  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| |  |||| || |  |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  132472 tcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgacattctacacagagtttaaaggg 132373  T
Q  1009 tcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| ||| | ||||||    
T  132372 tcaagcataacaatgt 132357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 829 - 1009
Target Start/End: Original strand, 55933401 - 55933580
Alignment:
Q  829 gtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaac 927  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  55933401 gtgggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtttgttctaacaatcaac 55933500  T
Q  928 atgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggt 1009  Q
    ||| ||||||  ||| || |||||||||||| ||||||| | ||    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  55933501 atgcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagca--tcaggttgttgaccttctacatagagtccaaagggt 55933580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 857 - 1013
Target Start/End: Original strand, 600659 - 600816
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacac 955  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| || ||||| |||    
T  600659 taggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgcttttgtcac 600758  T
Q  956 ttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    ||| |  |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  600759 tttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 600816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 865 - 1024
Target Start/End: Original strand, 34107669 - 34107831
Alignment:
Q  865 acaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac---gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttga 961  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  34107669 acaatcctaaaaattgcgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcga 34107768  T
Q  962 cttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     |||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  34107769 tttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgt 34107831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 710 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 12053698 - 12053467
Alignment:
Q  710 taaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggttt 809  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||   || ||||   |    
T  12053698 taaacttcctgactgatccactagatagaagatcgagactttggtctgcagatgttatgttgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacat 12053599  T
Q  810 gactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa 909  Q
     | || | |||||| | | || |||||  ||||||   ||||||   ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12053598 tattggggtttcaccattagttggattgggggtcg--acttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaagttgtcaaacatgagaaa 12053501  T
Q  910 -cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcat 942  Q
     |||||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  12053500 tcgtgttctaacaatcaaaacgtttttatatcat 12053467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 907 - 1024
Target Start/End: Original strand, 6865838 - 6865955
Alignment:
Q  907 aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||   ||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6865838 aaacgtgttctgactatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttgagcttcatagcactagatgttgttaaccttttacatagagttcaaag 6865937  T
Q  1007 ggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  6865938 ggtaatgcatagcaatgt 6865955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1065 - 1173
Target Start/End: Original strand, 9763077 - 9763188
Alignment:
Q  1065 ttgacgcaagttcttttaggcttgtt---gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtc 1161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||||     
T  9763077 ttgacgcaagttcttttaggctttttttggatggctcctccgacttatcagaagttgagtggtgggcaaatctgatcgtttgatgctataaatcatcgtt 9763176  T
Q  1162 ggctgctttttt 1173  Q
    | ||||||||||    
T  9763177 gactgctttttt 9763188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 873 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 23255828 - 23255747
Alignment:
Q  873 aaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgac 953  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  23255828 aaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgtttttgac 23255747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 808 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 25504482 - 25504267
Alignment:
Q  808 ttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgaga 907  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| |  |||||| | || ||||  |||||||||| ||||| |||| ||||  || |||||||||||    
T  25504482 ttgactgaggtttcaccacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccctaaa-gttgcatcaagcaaat-ggtcaaacatgaga 25504385  T
Q  908 aa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||  | | || |||||||| |||||  |||| | || |||||  |||| ||||| || ||||||||||||     
T  25504384 aaacgtgttctaacaatcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgaccttttaaatagagtttaaaa 25504285  T
Q  1007 ggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| || |||||    
T  25504284 ggtcatgcatagtaatgt 25504267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 948 - 1024
Target Start/End: Original strand, 38535628 - 38535704
Alignment:
Q  948 tttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  38535628 tttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgttcaccctctacatagagttcaaagagtcatgcatagcaatgt 38535704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 40813805 - 40813686
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggctt-gttgat-gtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtc 1161  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||  ||| | |||    
T  40813805 tttgactcaggttcttttaggctttgttggttgtctcctccgtcttaccggaagttgagtggtggtcgcatctgattgtttgaagcaacaaatctttgtc 40813706  T
Q  1162 ggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  40813705 ggctgctttattgatctctg 40813686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 857 - 1015
Target Start/End: Original strand, 50462913 - 50463072
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacac 955  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||  || |||  |||||||||||| ||| ||  ||| || |||||||||    
T  50462913 taggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaatcaacatgctttcataccatttgcttttgacac 50463012  T
Q  956 ttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    |||||| ||||  |||  ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50463013 ttttgatttccttacaccagagactgttgaccttctacgtagagtttaaagggccatgca 50463072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 907 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 24720023 - 24719949
Alignment:
Q  907 aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttg 981  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  24720023 aaacgcgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtgtttgacacttttgtcttcctaacaacagaggttg 24719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 686 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3330261 - 3330084
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | ||||| ||||| || |||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||| | ||    
T  3330261 tatcagtgaagaaggaggcacctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatggattgg 3330162  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggaca 863  Q
    |||||||| |   || ||||  ||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||| | |||||||    
T  3330161 aggaaaacgtgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacggtaggaca 3330084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 947 - 1055
Target Start/End: Original strand, 54190909 - 54191018
Alignment:
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt-ataactcttaagtccatgaat 1045  Q
    |||||||||||||||||| | |  |  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||| |||    
T  54190909 ttttgacacttttgactttctagtatcagaggttgttgaccttccacatagagttcaaagggccatgcataacaatgtcatgactcttaagtccataaat 54191008  T
Q  1046 gtggtattta 1055  Q
     | |||||||    
T  54191009 attgtattta 54191018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 712 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 16957821 - 16957738
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacat 795  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||    
T  16957821 aacttcctgactgacccgctagataaaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggtgtaaaacat 16957738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 870 - 1023
Target Start/End: Original strand, 46440869 - 46441023
Alignment:
Q  870 cctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaa 968  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||| | |||  ||||||| ||||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||| | ||||| |    
T  46440869 cctaaaagtaacgtcaaacaaagtggtcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttccta 46440968  T
Q  969 acagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatg 1023  Q
     ||  ||| | || | ||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||    
T  46440969 gcatcagaagctgctgaccttctacatagagtccaaagggttgtgcatagcaatg 46441023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 685 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 53170813 - 53170485
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| ||||||| |||||  || | ||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||| |||||| |||||| |||| |||      ||||||||    
T  53170813 atatcagtgaagaaagaggcgtctgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacacttaggcatgcagacgttatggt------atgggtag 53170720  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    | |||||||||  ||| || |  ||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||   || ||||  || |||||||||| | ||     
T  53170719 gtggaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgtt 53170620  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    |   ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||       || || |||||||||||| |  || | | ||  ||||| ||||    
T  53170619 aggtaaagtagccaaacatgagaaagcgtgttctgacagtcaacatgcttg------atttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgtt 53170526  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  53170525 gaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 53170485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 974 - 1015
Target Start/End: Original strand, 747854 - 747895
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  747854 agaggttgttgaccttctacatagagtttaaaaggtcatgca 747895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 919 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 3330073 - 3329968
Alignment:
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagag 1018  Q
    |||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||| ||||| | ||  |||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  3330073 acaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcatag 3329974  T
Q  1019 caatgt 1024  Q
    ||||||    
T  3329973 caatgt 3329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 974 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 53098443 - 53098403
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgc 1014  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53098443 agaggttgttaaccttctacatagagttcaaatggtcatgc 53098403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 914 - 1013
Target Start/End: Original strand, 50483221 - 50483320
Alignment:
Q  914 ttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||||||| |  |||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50483221 ttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 50483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 974 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 4419285 - 4419235
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  4419285 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggttatgcataacaatgt 4419235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 974 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 16955482 - 16955432
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  16955482 agaggttgctgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 16955432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1015
Target Start/End: Original strand, 712678 - 712719
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  712678 agaggttgttgtccttctacatagagtttaaaaggtcatgca 712719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 4e-38; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 820 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 38815471 - 38815266
Alignment:
Q  820 tcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctc 918  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  38815471 tcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggacagacagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctg 38815372  T
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagag 1018  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||   ||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38815371 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgcttcctagcaccagagggtgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatag 38815272  T
Q  1019 caatgt 1024  Q
    ||||||    
T  38815271 caatgt 38815266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 686 - 1025
Target Start/End: Complemental strand, 39434978 - 39434638
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||  || | ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||  ||  ||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  39434978 tatcagtgaagaaggaggcgcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtctgtcgatgttatggtgtacggatgggttgg 39434879  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    ||||||||||   || |||   ||||||| | |||||| ||| ||||| ||| |||| |  |||||||   |||||||   | | |||||||||||||||    
T  39434878 aggaaaacatgcatgtgtgtacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtca 39434779  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||   ||     
T  39434778 agcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcatttg 39434679  T
Q  985 accttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgta 1025  Q
    | ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||    
T  39434678 atcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgta 39434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 738 - 1024
Target Start/End: Original strand, 35739835 - 35740121
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||   || ||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  35739835 aagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtatgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccactagtgggatta 35739934  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
      ||||||  |||||| | ||||||| ||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  35739935 -aggtcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgggttctgacaatcaacatgttttta 35740033  T
Q  937 tgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |   ||  | ||||||||||||    |||| | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  35740034 tacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgt 35740121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 712 - 1060
Target Start/End: Complemental strand, 24125313 - 24124963
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | |||| |||| |||||| ||| ||  || |||||||| ||||||||   || || |  ||||    
T  24125313 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcatatgttatggtctactgacgggtaggaagaaaacatgcatgtgtagacttga 24125214  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||| | ||||   |||||| | | |||||| || ||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||| |    
T  24125213 ctggggtttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaaatggccaaacatgagaaagc 24125114  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  24125113 gtgctctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttctacataaagttcaaaaggtc 24125014  T
Q  1011 atgcagagcaatgt-ataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaagg 1060  Q
    ||||| |||||||| ||  ||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  24125013 atgcatagcaatgtcatgtctcataggtccatgaatgttgtgtttacaagg 24124963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 727 - 1024
Target Start/End: Original strand, 25021651 - 25021949
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   || ||||  ||||| |   |||||| ||    
T  25021651 ccactagatagaagatcgtcacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgaccggagtttcaccac 25021750  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||||||| ||||||  | |||||   || |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  25021751 ttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtgaaatatgagaaagtgtgttctcacaatca 25021850  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||||||  ||| |  |||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||||| ||| || ||| | |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  25021851 acatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccatccacacaaagttcaaagggtcatgcacaacaatgt 25021949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 727 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 500497 - 500286
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||   || || |  |||| |||| |||||| ||    
T  500497 ccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgttgtatggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttgagtgaggtttcaccac 500398  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatca 925  Q
    | ||||||||| | |||||  |||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  500397 ttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatca 500298  T
Q  926 acatgtttttat 937  Q
    ||||| ||||||    
T  500297 acatgcttttat 500286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 871 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 3188095 - 3187942
Alignment:
Q  871 ctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaa 969  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||| ||||| | ||||| |     
T  3188095 ctaaaagttgcatcaagcaaagtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaactttcggcttcctag 3187996  T
Q  970 cagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  3187995 catcagaggttgttaaccttctacatagag-tcaaagggttatgcatagcaatgt 3187942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 782 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 4700083 - 4699929
Alignment:
Q  782 taggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgc 881  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||||| | |||||| ||| ||||| ||| || |||  |||||||  || ||| | |||||||| |||||||     
T  4700083 taggaggaaaacatatgtatgtggatttgactggggtttcaccacttgtgggtttaaggatcgcggcttttacaatcggatagacaaccctcaaagttgt 4699984  T
Q  882 gtcaaacaaagcggccaaacatgagaaacgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4699983 gtcaagcaaagtggccaaacatgataagcgtgttctcacaattaacatgttttta 4699929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 848 - 996
Target Start/End: Original strand, 8540335 - 8540484
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  8540335 cttttatggtaagacaaacaatcttaaaagttgcgtcaaacaaaatagtcaaacattagaaaatgtgttctaacaatcgacatgtttttatgtcatctgc 8540434  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacata 996  Q
     |||||||||||  |||| | ||||  |||||||||| || |||||||||    
T  8540435 atttgacactttcaactttctaacatcagaggttgttgactttctacata 8540484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 872 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 6592700 - 6592556
Alignment:
Q  872 taaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaac 970  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||    |||| | |    
T  6592700 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 6592601  T
Q  971 agtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
       |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  6592600 tccagaggttgttgaccttctgcatagagttcaaaaggtcatgca 6592556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1064 - 1178
Target Start/End: Original strand, 36796663 - 36796777
Alignment:
Q  1064 tttgacgcaagttcttttaggctt-gttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcg 1162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||| ||| || || |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36796663 tttgacgcaggttcttttaggctttgtcggtggctcctccgtctt-tccgaagttgagtggtggtcgcatctgatcgtttgaagcaacttatcattgtcg 36796761  T
Q  1163 gctgcttttttgatct 1178  Q
    |||||||| |||||||    
T  36796762 gctgctttattgatct 36796777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 692 - 971
Target Start/End: Original strand, 42921929 - 42922209
Alignment:
Q  692 tgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaa 791  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||  |  ||||| ||| ||||| |||| ||| |  || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42921929 tgaagaaggagacccctatgaacttcttgacttactcactatatagaagattgacacttacgtatgtagatgttatggtgtacagatgggtaggaggaaa 42922028  T
Q  792 acatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaa 891  Q
    ||| |  || ||||  |||||||   |||||  |  |||| |||||  |||| ||||||||||| || ||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  42922029 acaaacatgtgtggacttgactggagtttcatcaaacgtgagattaatggtcagagcttttatggtaagacatgcagccataaaagttgcgtcaaacaaa 42922128  T
Q  892 gcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaaca 971  Q
      || ||||  |||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||  |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  42922129 atggtcaaatttgagaaaacgtgttttgacaatcaaaatgcttttaaatcatttgcctttgacacttttggcttcctaaca 42922209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1070 - 1173
Target Start/End: Complemental strand, 544366 - 544263
Alignment:
Q  1070 gcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctt 1169  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  544366 gcaagttcttttcggcttttttgtggctcctccaactcatcggttgttgagtggtgggtgaatctgatcgtttgatgcaacatatcattgtcggctgctt 544267  T
Q  1170 tttt 1173  Q
    ||||    
T  544266 tttt 544263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1070 - 1173
Target Start/End: Original strand, 40531295 - 40531398
Alignment:
Q  1070 gcaagttcttttaggcttgttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctt 1169  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  40531295 gcaagttctttccggctttttggtggctcctctgacttatcggttgttgagtggtgggtgaatctgatcgtgtgatgcaacatatcatcgtcggctactt 40531394  T
Q  1170 tttt 1173  Q
    ||||    
T  40531395 tttt 40531398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 889 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 28196300 - 28196164
Alignment:
Q  889 aaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaacc 987  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| | | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| | ||  | |||||||| |||    
T  28196300 aaagcggctaaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttcctagcaccataggttgttgacc 28196201  T
Q  988 ttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  28196200 atctacgtagagttcaaaggatcatgcacaacaatgt 28196164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 780 - 966
Target Start/End: Complemental strand, 10189760 - 10189573
Alignment:
Q  780 ggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagtt 879  Q
    |||||||||||||||| | || ||||  |||| || ||||||||  || ||| ||||| ||||    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  10189760 ggtaggaggaaaacatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtaggacatacattcctaaaagtt 10189661  T
Q  880 gcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
    ||| |||  ||||  | |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  10189660 gcgccaattaaagtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgcatttgacatttttggcttcc 10189573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1071 - 1175
Target Start/End: Original strand, 23264771 - 23264876
Alignment:
Q  1071 caagttcttttaggcttgtt-gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctt 1169  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||    
T  23264771 caagtacttttaggcttttttggtgtctcctccgacatatcggaagttaagtggtggtcgaatctgatcgtttgaagcaacaaatcattgtctgctgctt 23264870  T
Q  1170 ttttga 1175  Q
    | ||||    
T  23264871 tattga 23264876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 973 - 1055
Target Start/End: Original strand, 9259376 - 9259459
Alignment:
Q  973 tagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt-ataactcttaagtccatgaatgtggtattta 1055  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  9259376 tagaggttgttgaccttctacatagagttcacagactcatgcatagcaatgtcatatatcctaagtccatgaatgttgtattta 9259459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 974 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 3821246 - 3821196
Alignment:
Q  974 agaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  3821246 agaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtaatgcatagcaatgt 3821196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 865 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 4073667 - 4073594
Alignment:
Q  865 acaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttat 937  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  4073667 acaaccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaacaagagaaaacgtgttttaccaatcaacatgattttat 4073594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 847 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 8390290 - 8390234
Alignment:
Q  847 gcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacat 903  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  8390290 gcttttatgatagggcagacaaccctaaaaattgcgtaaaacaaagtgaccaaacat 8390234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 848 - 999
Target Start/End: Complemental strand, 8619963 - 8619811
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||  || ||||||||| ||| ||| || | ||||||||| || ||||||  ||| |||    
T  8619963 cttttacgatagaacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgt 8619864  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagag 999  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||  |||||||||| || ||| ||||||||    
T  8619863 ttttaacatttttggctttctaacaccagaggttgttgactttcgacatagag 8619811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 872 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 6618409 - 6618322
Alignment:
Q  872 taaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |||||||||||||||| | ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||    
T  6618409 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacacttt 6618322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 879 - 936
Target Start/End: Complemental strand, 8882445 - 8882387
Alignment:
Q  879 tgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  8882445 tgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgctttta 8882387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 919 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 36004199 - 36004105
Alignment:
Q  919 acaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatg 1013  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  36004199 acaatcaacatgtttttataccatttacatttgacatttttgacttcctatcaccagaggttgttgaccatctaaaaagagtttcaagggtcatg 36004105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 739 - 792
Target Start/End: Original strand, 39671036 - 39671089
Alignment:
Q  739 agatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaa 792  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39671036 agatcgacatttaggtctgcggatgttacggtgtctagatgggtaggagaaaaa 39671089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 975 - 1024
Target Start/End: Original strand, 40223489 - 40223538
Alignment:
Q  975 gaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  40223489 gaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 40223538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1132 - 1181
Target Start/End: Original strand, 40457509 - 40457558
Alignment:
Q  1132 tctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgcttttttgatctctg 1181  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40457509 tctgatcgtttgaagcaacatatcattatcggctgctttattgatctctg 40457558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 80; Significance: 6e-37; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 686 - 1000
Target Start/End: Original strand, 357513 - 357827
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | |||||  |||| ||  ||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  357513 tatcagtgaagaaggaggcccttgtgaactttttgactgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgcagatgttatggtgtatggatgggttgg 357612  T
Q  786 aggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtca 885  Q
    || |||||||   || ||||  |||||||   |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||  || ||||||||| | |||||    
T  357613 agcaaaacatgcatgtgtggacttgactggagtttcaccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtca 357712  T
Q  886 aacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtta 984  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  | | ||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| |     
T  357713 agcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctaacattagaggttgatg 357811  T
Q  985 accttctacatagagt 1000  Q
    ||||||||||||||||    
T  357812 accttctacatagagt 357827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 727 - 1060
Target Start/End: Original strand, 29337920 - 29338251
Alignment:
Q  727 ccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactac 826  Q
    |||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||   || ||||  ||||  ||| ||| || ||    
T  29337920 ccactagatagaagttcgacacttaggcctgcagatgttatggtgtgcagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgatcgaggttttaccac 29338019  T
Q  827 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 925  Q
    |||    ||||  |||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29338020 tcg----attagtggtcggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatgagaaaacgtgttctaacaatca 29338115  T
Q  926 acatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt- 1024  Q
    ||||| | ||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||  |||| | ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||     
T  29338116 acatgctcttataccatttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttctacatatggttcaaagggtcatgcacatcaatgtc 29338215  T
Q  1025 ataactcttaagtccatgaatgtggtatttagaagg 1060  Q
    || |||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  29338216 atgactcctaggtccatgaatgttgtgtttacaagg 29338251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 847 - 1000
Target Start/End: Original strand, 17249262 - 17249416
Alignment:
Q  847 gcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctg 945  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||    
T  17249262 gcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttg 17249361  T
Q  946 tttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagt 1000  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  17249362 cttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagt 17249416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 685 - 1015
Target Start/End: Original strand, 4206391 - 4206722
Alignment:
Q  685 atatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtag 784  Q
    |||||| |||||||||||||  |  | |||||| |||  || |||||| |||||||||| ||| | | || ||| ||||||| |||||| | |||||| |    
T  4206391 atatcagtgaagaaggaggcacccgtgaacttcttgattgacccactagataaaagatcaacactcaagcctgcggatgttatggtgtacaaatgggttg 4206490  T
Q  785 gaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtc 884  Q
    |||||||||||   || || |  ||||||| | |||||| ||| ||||||||| |  || || |||||| | |||||||  || || ||||||| |||||    
T  4206491 gaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtc 4206590  T
Q  885 aaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgtt 983  Q
    || ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||| |  |||| | ||  ||||||||||    
T  4206591 aagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgtt 4206690  T
Q  984 aaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4206691 gaccttctacatagagttcaaaaggtcatgca 4206722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 751 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 959826 - 959553
Alignment:
Q  751 aggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagctt 850  Q
    |||| ||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||   || ||||  |||| |||  |||||| |||  |||||||| | |||||  |||    
T  959826 aggcatgcggatgttacagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtcgggcctt 959727  T
Q  851 ttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttt 949  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||    
T  959726 ttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccatttgtttt 959627  T
Q  950 tgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||| ||| |  |||| | ||  |||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  959626 tgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacgta-agttcaaaaggtcatgcatagcaatgt 959553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 738 - 1024
Target Start/End: Original strand, 33220559 - 33220846
Alignment:
Q  738 aagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggatta 837  Q
    ||||| |||| | |||| ||||||||||| | ||||  |||| || ||||||||||||   || |||  |||||||| | |||||| ||| ||||| |||    
T  33220559 aagattgacactcaggcctgcagatgttatgatgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgtgggttta 33220658  T
Q  838 cgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgttttta 936  Q
     ||||||| ||||||| | ||||||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||    
T  33220659 ggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacatgctttta 33220758  T
Q  937 tgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    |  ||| || |||||||||||| | ||||| | ||   ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  33220759 taccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgt 33220846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 841 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 3715073 - 3714948
Alignment:
Q  841 gtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgt 939  Q
    |||||| |||||| |||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3715073 gtcggaacttttacgataagacatacaatcataaaagttgtgtcaaacaaaatggttaaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatat 3714974  T
Q  940 catctgtttttgacacttttgacttc 965  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3714973 catctgtttttgacacttttgacttc 3714948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 712 - 1022
Target Start/End: Complemental strand, 34304781 - 34304470
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||   || ||||  ||||    
T  34304781 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 34304682  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-c 910  Q
     || | |||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | | |||||   | ||||||||| |||||||| ||||    |||||||||||||| |    
T  34304681 ttggggtttcaccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaaataaccaaacatgagaaagc 34304582  T
Q  911 gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtc 1010  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| | ||||| | ||  ||| | |||| ||||||||||||||||  |||| ||     
T  34304581 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttctacatagagtccaaagagtt 34304482  T
Q  1011 atgcagagcaat 1022  Q
    ||||| ||||||    
T  34304481 atgcatagcaat 34304470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 888 - 1015
Target Start/End: Original strand, 4165920 - 4166048
Alignment:
Q  888 caaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaac 986  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| |  |||| | ||  |||||||||| ||    
T  4165920 caaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgac 4166019  T
Q  987 cttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4166020 cttctacatagagtttaaaaggtcatgca 4166048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 818 - 1024
Target Start/End: Original strand, 45605 - 45812
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttc 916  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||   |||||||  || | ||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  45605 tttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaacatgagaaaacgtgttc 45704  T
Q  917 tcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcag 1016  Q
    | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||  | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  45705 tgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcat 45804  T
Q  1017 agcaatgt 1024  Q
    ||||||||    
T  45805 agcaatgt 45812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1070 - 1179
Target Start/End: Original strand, 12129280 - 12129390
Alignment:
Q  1070 gcaagttcttttaggcttgtt-gatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgct 1168  Q
    |||||||||||||| ||| || | || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  12129280 gcaagttcttttagacttttttggtgactcctctgacttatcggaagttgagtggtgggcgattctgatcgtttgatgcaacttatcatcatcgactgct 12129379  T
Q  1169 tttttgatctc 1179  Q
    ||||| |||||    
T  12129380 ttttttatctc 12129390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 818 - 926
Target Start/End: Original strand, 28008915 - 28009024
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttc 916  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  28008915 tttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagcaaagcggtcaaacatgagaaagcttgttc 28009014  T
Q  917 tcacaatcaa 926  Q
    | ||||||||    
T  28009015 taacaatcaa 28009024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 751 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 28543621 - 28543463
Alignment:
Q  751 aggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagctt 850  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||   || |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| |  |||    
T  28543621 aggcatgcagatgttatgatgtacagatggataggaggaaaacatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtcaggactt 28543522  T
Q  851 ttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa 909  Q
    ||| | || ||||  || || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28543521 ttacggtaagacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 28543463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 768 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 34415665 - 34415408
Alignment:
Q  768 ggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaaca 867  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||   |||| || | |||||| || ||| |||||| ||||| |  |||||| | ||||| |  ||    
T  34415665 ggtgtatggatgggtaggaggaaaacatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggataggca 34415566  T
Q  868 accctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttcc 966  Q
     || || ||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  34415565 tccttacaagctgcgtcaagcaaaatggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacactttaggtttcc 34415466  T
Q  967 aaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
     ||||  | | |  ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  34415465 taacaccaaatgcagttgaccttctatatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgt 34415408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 12401572 - 12401425
Alignment:
Q  756 tgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatg 855  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   || || |  |||| || | |||||| |||  |||||||| || || | |||||||||    
T  12401572 tgcaaatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatg 12401473  T
Q  856 ataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacat 903  Q
     |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12401472 gtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacat 12401425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 865 - 1022
Target Start/End: Original strand, 34554252 - 34554410
Alignment:
Q  865 acaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgact 963  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  ||| |  ||||||||| || | ||    
T  34554252 acaacactaaaagttgcgtcaagcaaaacgaccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttataccatttacttttgacacattcggct 34554351  T
Q  964 tccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaat 1022  Q
    ||| | ||  ||| | | || || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  34554352 tcctagcaccagatgctattgactttctacatagagtttaaaaggtcatgtatagcaat 34554410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 712 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 32115974 - 32115777
Alignment:
Q  712 aacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggtttga 811  Q
    ||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||   || || |  ||||    
T  32115974 aacttcctgactgacctactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 32115875  T
Q  812 ctgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa 909  Q
    | | | |||||  |||  |||||||| | |||||   ||||| | |||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32115874 ccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaa 32115777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 729 - 795
Target Start/End: Original strand, 20693440 - 20693506
Alignment:
Q  729 actaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacat 795  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20693440 actagataaaagatccacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatgggtaggaggaaaacat 20693506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1075 - 1178
Target Start/End: Complemental strand, 7546442 - 7546338
Alignment:
Q  1075 ttcttttaggctt-gttgatgtctcctccggcttatcggatgttgagtggtgggcgactctgatcgtttgaagctacttatcatcgtcggctgctttttt 1173  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||  |||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  7546442 ttcttttaggctttgttggtggctcctccgtcttactggaaattgagtggtggtcatgtctgatcgtttgaagcaacatatcattgtcggctgctttttt 7546343  T
Q  1174 gatct 1178  Q
     ||||    
T  7546342 tatct 7546338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 860 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 24016474 - 24016318
Alignment:
Q  860 gacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||  |||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| || | |||| | |||    
T  24016474 gacagacaaccgtaaaagttgcatcaagtaaaatagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttataccatttgctattgatagttt 24016375  T
Q  959 tgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgca 1015  Q
    ||  |||| | ||  ||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24016374 tggtttcctagcaccagatgttgttgattttttacatagagttcaaagggtcatgca 24016318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 857 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 34169008 - 34168956
Alignment:
Q  857 taggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa 909  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34169008 taggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaa 34168956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 878 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 6225191 - 6225108
Alignment:
Q  878 ttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaacgt-gttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttg 960  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||  | ||| | |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  6225191 ttgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaattttgttgtgacaatcaacatgcttatatgtcatttgtgtttgacacttttg 6225108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 894 - 965
Target Start/End: Original strand, 7200541 - 7200611
Alignment:
Q  894 ggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttc 965  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  7200541 ggccaaacatgagaaatcgagttcaaacaatcaacatgttttta--tcatttgtgtttgacacttttggcttc 7200611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 907 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 28626020 - 28625911
Alignment:
Q  907 aaacgtgttctcacaatcaaca-tgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaa 1005  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||| |||||||  | |||| | ||  |||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  28626020 aaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacactttcaatttcctagcaccagaggttgttgagcttctacataaagttcaaa 28625921  T
Q  1006 gggtcatgca 1015  Q
     |||||||||    
T  28625920 aggtcatgca 28625911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 70; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 808 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 6522 - 6306
Alignment:
Q  808 ttgactgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgaga 907  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  6522 ttgactggggtttcaccacttgtgggatta-gggtcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaagtggccaaacatgaga 6424  T
Q  908 aa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaag 1006  Q
    || |||||||| |||||||||||| || |||  ||| || ||||||||||||    |||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  6423 aagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaa 6324  T
Q  1007 ggtcatgcagagcaatgt 1024  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  6323 ggtcatgcatagcaatgt 6306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 729 - 1022
Target Start/End: Complemental strand, 33519 - 33224
Alignment:
Q  729 actaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtaggaggaaaacatatttgcgtgggt----ttgactgagatttcact 824  Q
    |||| ||| |||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  || || |     |||| || | ||||||     
T  33519 actagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatat--gcatgtgcaaacttgattggggtttcacc 33422  T
Q  825 actcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaat 923  Q
    |||  |||||||| | |||||  |||||| | |||||||  ||||| |||| || || |||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  33421 acttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaaccttaaa-gtggcatcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaat 33323  T
Q  924 caacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaat 1022  Q
    ||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| |  |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  33322 caacatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaat 33224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 818 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10333
Alignment:
Q  818 tttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaa-acgtgttc 916  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| || |||||||   | |||||| || ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||  |||||||    
T  10543 tttcaccactcgtgggattaggggttggggcttttacagttggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgtgttc 10444  T
Q  917 tca----caatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatagagtttaaagggtcat 1012  Q
    | |    ||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||    
T  10443 tgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttcta-atagagttgaaagggccat 10345  T
Q  1013 gcagagcaatgt 1024  Q
    ||| | ||||||    
T  10344 gcataacaatgt 10333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 20032 - 19923
Alignment:
Q  686 tatcaatgaagaaggaggccactataaacttcctgaccgatccactaaataaaagatcgacatttaggcttgcagatgttaaggtgtatagatgggtagg 785  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||| | || || |||||| ||| |||||  ||| |||| | || |||||||| ||||||  ||| ||||||    
T  20032 tatcagtgaagaaggaggcctctctgaacttcttaactgacccactagatagaagatgaacacttagacctgtagatgttatggtgtacggataggtagg 19933  T
Q  786 aggaaaacat 795  Q
    ||||||||||    
T  19932 aggaaaacat 19923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 832 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 16299 - 16193
Alignment:
Q  832 ggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatg 930  Q
    |||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  16299 ggattagggatcggaacttttatagtaggacagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaataaacatg 16200  T
Q  931 tttttat 937  Q
    |||||||    
T  16199 tttttat 16193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 848 - 985
Target Start/End: Original strand, 47497 - 47635
Alignment:
Q  848 cttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgag-aaacgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgt 946  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||| |||||||  ||| ||     
T  47497 cttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagttaacatatttttataccatttgc 47596  T
Q  947 ttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaa 985  Q
    |||| ||||||| || |||| |||| |||| ||||||||    
T  47597 ttttaacactttcgatttcctaacactagaagttgttaa 47635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 860 - 965
Target Start/End: Complemental strand, 49548 - 49442
Alignment:
Q  860 gacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||  ||| || ||||||||||||    
T  49548 gacaagcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacacttt 49449  T
Q  959 tgacttc 965  Q
     ||||||    
T  49448 cgacttc 49442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 872 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 7727 - 7640
Alignment:
Q  872 taaaagttgcgtcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttt 958  Q
    |||||||||||||||| | ||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||| || ||||||||||||    
T  7727 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacacttt 7640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 899 - 1015
Target Start/End: Original strand, 8525 - 8642
Alignment:
Q  899 aacatgagaaa-cgtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgtttttgacacttttgacttccaaacagtagaggttgttaaccttctacatag 997  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||||||||  |||| | || |||||||||| || ||||| || ||    
T  8525 aacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagcactagaggttgtgaatcttctgcaaag 8624  T
Q  998 agtttaaagggtcatgca 1015  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  8625 agttcaaagactcatgca 8642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University