View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19530_low_25 (Length: 488)

Name: NF19530_low_25
Description: NF19530
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19530_low_25
NF19530_low_25
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (15-472)||(51764185-51764642)
chr3 (25-445)||(13470487-13470907)
chr3 (26-443)||(51113537-51113954)
chr3 (24-454)||(514479-514912)
chr3 (204-453)||(51120827-51121076)
chr3 (274-454)||(1657166-1657346)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (25-454)||(10614508-10614937)
chr7 (34-454)||(15091915-15092335)
chr7 (28-280)||(10169888-10170140)
chr7 (28-280)||(10177413-10177665)
chr7 (28-130)||(10167432-10167534)
chr7 (332-451)||(10170143-10170262)
chr7 (332-451)||(10177668-10177787)
chr7 (202-277)||(7977670-7977745)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (25-457)||(19468254-19468686)
chr1 (55-164)||(9581276-9581385)
chr1 (101-164)||(9586844-9586907)
chr1 (324-442)||(7554415-7554533)
chr1 (309-442)||(29658935-29659068)
chr1 (309-441)||(29718962-29719094)
chr1 (119-168)||(29658811-29658860)
chr1 (127-168)||(29691334-29691375)
chr1 (127-168)||(29718846-29718887)
chr1 (111-168)||(30827311-30827368)
chr1 (31-83)||(52082870-52082922)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (25-446)||(6415889-6416310)
chr6 (66-444)||(6589119-6589497)
chr6 (58-452)||(7119074-7119468)
chr6 (58-452)||(7131552-7131946)
chr6 (59-452)||(6432078-6432471)
chr6 (119-442)||(7994031-7994354)
chr6 (56-446)||(10579523-10579913)
chr6 (56-446)||(6426434-6426824)
chr6 (100-454)||(6402775-6403129)
chr6 (111-455)||(6594447-6594791)
chr6 (55-446)||(19632362-19632750)
chr6 (25-429)||(6409946-6410350)
chr6 (34-454)||(6423132-6423552)
chr6 (56-454)||(6394779-6395177)
chr6 (183-457)||(6585150-6585424)
chr6 (26-454)||(14820608-14821033)
chr6 (59-363)||(6596717-6597021)
chr6 (68-298)||(8913783-8914012)
chr6 (249-454)||(11936254-11936459)
chr6 (249-454)||(11948234-11948439)
chr6 (264-455)||(14818296-14818487)
chr6 (324-452)||(6603256-6603384)
chr6 (26-170)||(6602961-6603105)
chr6 (102-168)||(9411556-9411622)
chr6 (266-374)||(14802331-14802439)
chr6 (25-86)||(6403164-6403225)
chr6 (269-430)||(9411294-9411455)
chr6 (272-446)||(6586112-6586284)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (102-446)||(53761597-53761945)
chr4 (25-443)||(546839-547260)
chr4 (32-314)||(21834140-21834422)
chr4 (112-455)||(55908567-55908913)
chr4 (249-454)||(644746-644950)
chr4 (96-451)||(570269-570621)
chr4 (106-454)||(640830-641178)
chr4 (271-446)||(8184031-8184206)
chr4 (105-455)||(1548258-1548609)
chr4 (102-455)||(8186920-8187276)
chr4 (120-344)||(1600444-1600671)
chr4 (204-446)||(553402-553644)
chr4 (258-455)||(566103-566300)
chr4 (202-454)||(7225815-7226067)
chr4 (33-180)||(570723-570873)
chr4 (204-454)||(1524420-1524667)
chr4 (260-427)||(1552757-1552927)
chr4 (270-454)||(1513407-1513588)
chr4 (260-442)||(1537757-1537939)
chr4 (98-446)||(12121282-12121633)
chr4 (232-446)||(55505070-55505281)
chr4 (251-362)||(532196-532307)
chr4 (66-446)||(370843-371226)
chr4 (277-439)||(1495926-1496088)
chr4 (348-439)||(1517574-1517665)
chr4 (111-389)||(3438404-3438684)
chr4 (101-151)||(532404-532454)
chr4 (366-446)||(1489457-1489537)
chr4 (272-451)||(7307778-7307957)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (39-454)||(20477851-20478266)
chr5 (42-430)||(41889323-41889714)
chr5 (110-452)||(41901375-41901717)
chr5 (66-282)||(28525098-28525314)
chr5 (130-442)||(32267402-32267714)
chr5 (204-430)||(37937826-37938052)
chr5 (368-454)||(17205514-17205600)
chr5 (276-443)||(38267562-38267729)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (112-455)||(1037503-1037849)
chr2 (204-446)||(45245019-45245261)
chr2 (33-168)||(32785535-32785670)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (144-451)||(34936034-34936344)
chr8 (100-446)||(18315100-18315449)
chr8 (26-451)||(17636150-17636581)
chr8 (249-454)||(28246274-28246477)
chr8 (202-452)||(27922425-27922672)
chr8 (119-428)||(32151242-32151551)
chr8 (31-166)||(17627817-17627952)
chr8 (323-445)||(17628067-17628189)
chr8 (269-451)||(21235476-21235658)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (198-446)||(552-800)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (202-446)||(1396-1643)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (313-454)||(39099-39240)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 472
Target Start/End: Original strand, 51764185 - 51764642
Alignment:
Q  15 gggacggattgtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764185 gggacggattgtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatg 51764284  T
Q  115 aaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764285 aaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgattttaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggag 51764384  T
Q  215 atgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtca 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51764385 atgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagacttgtca 51764484  T
Q  315 tttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51764485 tttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcaaggagaagg 51764584  T
Q  415 gagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaagatcgccttcttta 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51764585 gagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaacaagatcgccttcttta 51764642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 445
Target Start/End: Original strand, 13470487 - 13470907
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    ||||||||||||||||    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13470487 gtgtagagaattctgaaaaattggtcgaggttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaatcaatggttaagtgatgaaggcatcat 13470586  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaag 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13470587 aatgtttgcttccaatttccccaatttgcagctgcttgatttgaattgttgcaatctcttatcaaaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaag 13470686  T
Q  225 attaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaag 324  Q
    ||||||||||||||| || || | |||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||  | ||||||  |||||| |    
T  13470687 attaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaactttgttgttcccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaagg 13470786  T
Q  325 ttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaaca 424  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  13470787 ttaatgataaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactattacttgaactttgtcataatgtcacagaagagggagtgaaaca 13470886  T
Q  425 tgtggttgaaaactgcacaca 445  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  13470887 tgtggtagagaactgcacaca 13470907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 443
Target Start/End: Original strand, 51113537 - 51113954
Alignment:
Q  26 tgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcata 125  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |||| ||||   || ||||||||||||||| |  ||| | | ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  51113537 tgtagagaattctaattctttgatgggttttgttgtaagaccgcaattaaagtctctccagttggatcacaatccatggttaagagatgagagcatcata 51113636  T
Q  126 atgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaaga 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||| ||   |||||  ||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||| |    
T  51113637 atgattgcttccattttccccaatctgcagcttcttgatttaactcattgctatgagatatccgaaggtatttgtcaagttttaaagagatgttgtaaaa 51113736  T
Q  226 ttaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagt 325  Q
    |||||||||||||  || |  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  51113737 ttaggcatttgaaattagcttactgttcaaaactgaagctacttggaatgaactttgaagctcccaaactggaggtgttagacttgtcaaatacaatggt 51113836  T
Q  326 tgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacat 425  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  51113837 tgatgatgaaacactctatgtgatctcgaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactgaaaaattgttaccatgtcacagagaagggagtgaagcat 51113936  T
Q  426 gtggttgaaaactgcaca 443  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  51113937 gtggtagaaaaatgcaca 51113954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 454
Target Start/End: Original strand, 514479 - 514912
Alignment:
Q  24 tgtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatca 123  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| |||| ||||| ||||||| | | |    
T  514479 tgtgtagagaactccaattctttgttggactttgttgtgaaccctcaattaaaatctctctatttggctcacaattcatgcttaagagatgaaaacctta 514578  T
Q  124 taatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttc 220  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||  ||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  514579 taatgtttgcttcaattttcccgaatttgcagctaattgatttgagctattgtgataacatatctgacaaaagtatctgtcaagttttaaagagatggtc 514678  T
Q  221 taagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtt-agatttgtcatttac 319  Q
    ||||||||||||||||||| || || | || |||||||||||| |    || |||||| ||  |||||  || || |||||||| || ||  | |  |||    
T  514679 taagattaggcatttgaacttagcccactgctcaagagtgaagttgtacggtatgaacattagagttctcaaacttgaggtgttgagcttaat-agatac 514777  T
Q  320 aaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtg 419  Q
    || ||| || ||| || ||||  ||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||   | |||| |||| |||||||    
T  514778 aagagtcgacgatgaagcacttcatgtgatctcgaagagttgctgtgggcttttgcaactattactgcaaaattgtgaaggtatcacagagacgggagtg 514877  T
Q  420 aaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    || ||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  514878 aagcatgtggtgaaaaactgcacacgactgagaga 514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 453
Target Start/End: Original strand, 51120827 - 51121076
Alignment:
Q  204 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 303  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||| |  |||  |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||  ||  |||||||||    
T  51120827 gttttatggagatgttgtaacattagacacttgaacttcaccggttgttcaagagtgaaactgcatggaatgaactttgaagttctcaaattggaggtgt 51120926  T
Q  304 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 403  Q
    |  | |||||   ||||| |||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||| |||| | |||||||||||| | |  || |||   |||    ||||    
T  51120927 tgaacttgtcgcatacaagagttgatgatgaaaaactatatgtaatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaattgtctctagaaagctgtttgtatgt 51121026  T
Q  404 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagag 453  Q
    |||  | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51121027 cacacaaaaaggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagag 51121076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1657346 - 1657166
Alignment:
Q  274 tgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctttt 373  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1657346 tgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacaatatatcactctattggatctcaaagagttgcagcgggctttt 1657247  T
Q  374 gcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |||||| | |||  ||  ||||||   |||  | || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1657246 gcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgttgcagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaactgagaga 1657166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10614937 - 10614508
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   |||||||| |||||| |||| ||    
T  10614937 gtgtagagaattctgattcattggcggagtttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaatcagtggttaagcgatgaaggcattat 10614838  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaag 224  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||| | ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  10614837 aaagtttgcttccaatttccccaatttgcaactgcttgatttgaatcgttgcaatctcttatatgaaggtatttgtcaagttttaaggatatgttgtaag 10614738  T
Q  225 attaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaag 324  Q
    ||||||||||||||| || || | |||  || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||  | ||||||  ||| || |    
T  10614737 attaggcatttgaacttagcctattgtaaaaaagtgaagctacttggaatgaacgttgttgttcccaatctggaggtgttgaacttgtcaaatacgaagg 10614638  T
Q  325 ttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaaca 424  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||  | |||||||||||    
T  10614637 ttaatgataaaacactctatgtgatctcgaagaactgtagtgggcttttgcaactattacttgaactttctcataatgtcacagaagaaggagtgaaaca 10614538  T
Q  425 tgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10614537 tgtggtagaaaactgcatgcaattgagaga 10614508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 454
Target Start/End: Original strand, 15091915 - 15092335
Alignment:
Q  34 attctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgc 133  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||    
T  15091915 attcagattctttagttgagtttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttggctcacaattaccggttaagtgatgaaatcatcagaatacttgc 15092014  T
Q  134 ttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcat 233  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||  |  |||| ||  ||||||| ||||| | | | |||||||||||| ||||| |||| |||  |||    
T  15092015 ttccattttccccaacttagagctacttgatttgggtcattgctataacatatctcaaggtatttctcaagttttaaggaaatgttataagcttaaacat 15092114  T
Q  234 ttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgata 333  Q
    |||||| || | | ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| ||||||    
T  15092115 ttgaacttaactggatgtttaagtgtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcagaaacaaaggttaatgata 15092214  T
Q  334 aaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttga 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||    
T  15092215 aaacactctatgcgatctcaaagaattgttgtgggcttttgcaactattacttgaattttgttataatgtcacagaagtgggagtgaaacatgtgctaga 15092314  T
Q  434 aaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15092315 aaactgcacacaattgagaga 15092335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 10169888 - 10170140
Alignment:
Q  28 tagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataat 127  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  10169888 tagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataat 10169987  T
Q  128 gtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagatt 227  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  10169988 gttttcttccatttttcctaatttgaagctgtttgatttgaactcttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatatt 10170087  T
Q  228 aggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactt 280  Q
    |||||||| ||  || || | |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  10170088 aggcatttaaatttagcccactgttcaagagtgaatctacttgaagtgaactt 10170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 10177413 - 10177665
Alignment:
Q  28 tagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataat 127  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  10177413 tagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataat 10177512  T
Q  128 gtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagatt 227  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  10177513 gttttcttccatttttcctaatttgaagctgtttgatttgaactcttgcaatcacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaatatt 10177612  T
Q  228 aggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactt 280  Q
    |||||||| ||  || || | |||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  10177613 aggcatttaaatttagcccactgttcaagagtgaatctacttgaagtgaactt 10177665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 10167432 - 10167534
Alignment:
Q  28 tagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataat 127  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  10167432 tagacaattctgattctttgccggattttggtgtataccctcaattgaagtctctctatttggcttacaatacatgggtaagggatgaacacatcataat 10167531  T
Q  128 gtt 130  Q
    |||    
T  10167532 gtt 10167534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 451
Target Start/End: Original strand, 10170143 - 10170262
Alignment:
Q  332 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  || |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  10170143 taaaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaa 10170242  T
Q  432 gaaaactgcacacaattgag 451  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  10170243 gaaaactgctcacaactgag 10170262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 451
Target Start/End: Original strand, 10177668 - 10177787
Alignment:
Q  332 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  || |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  10177668 taaaacactctatgtgatctcaaagtattgttgtggacttttgaaactatttgtgaacaattgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaacatgtgaaa 10177767  T
Q  432 gaaaactgcacacaattgag 451  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  10177768 gaaaactgctcacaactgag 10177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7977745 - 7977670
Alignment:
Q  202 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaa 277  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||   |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  7977745 aagttttaaggagatgttgtaacattagacatttaaacctagcctgttgttcaagggtgaatctacgtggaatgaa 7977670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 457
Target Start/End: Original strand, 19468254 - 19468686
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  19468254 gtgtagagaattctgattctttgccggattttggtgtattccctcaattaaagtatctctacttggctgagaattcatggttaagcgatgaaaacatcat 19468353  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaag 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||  ||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  19468354 aatgtttgcttccatttttcccaatttgcagctgcttgatttgaactcatgcaaccacatatcggaaggcatttgtcaagttttaaggaggtgttctaat 19468453  T
Q  225 attaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaag 324  Q
    ||||||||||| ||| || || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||| |    
T  19468454 attaggcatttaaacttagcccactgttcaagagtgaatctacttggagtgaactttgtagttcccaagctggaggtgttgaagttgtcagatacaaagg 19468553  T
Q  325 ttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaaca 424  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| || ||||  ||||   |||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19468554 ttgatgatgaaacactttatgtgatctcaaagaactgttgtggacttttggaattatttgtggacggttgtaatgatgtcacagagaaaggagtgaaaca 19468653  T
Q  425 tgtggttgaaaactgcacacaattgagagaaca 457  Q
    ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  19468654 tgtgaaagaaaattgctcacaactgagagaaca 19468686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9581385 - 9581276
Alignment:
Q  55 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgca 154  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||| | |||  ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9581385 ttggtgtaagccctcaattaaagtctcttgatttgggtcacaatcaatgtttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgca 9581286  T
Q  155 gctgcttgat 164  Q
    ||||||||||    
T  9581285 gctgcttgat 9581276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9586907 - 9586844
Alignment:
Q  101 atggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgat 164  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9586907 atggttaagagataaaaacatcataatgtttgcttcaattttccccaatttgcagctgcttgat 9586844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7554533 - 7554415
Alignment:
Q  324 gttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaac 423  Q
    ||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||| | || ||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  7554533 gttgatgatgaagcactctatatgatctcaaagagttgtggtggacttttacaactgttactgaaaggatgtgataatgtcacagaaaagggagtgaagc 7554434  T
Q  424 atgtggttgaaaactgcac 442  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  7554433 atgtggtagaaaactgcac 7554415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 442
Target Start/End: Original strand, 29658935 - 29659068
Alignment:
Q  309 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 408  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||   || |||| || |||||| || ||||||||| | |||||||||  ||||   |||||||| |    
T  29658935 ttgtcatataccaaagttgatgataaagcactccatatcatatcaacgagttgttgtggccttttgcaattgttactggaatgttgtacgaatgtcacag 29659034  T
Q  409 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcac 442  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29659035 agaatggagtaaaacatgtggttcaaaactgcac 29659068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 441
Target Start/End: Original strand, 29718962 - 29719094
Alignment:
Q  309 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 408  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||   || |||| || |||||| || ||||||||| | |||||||||  ||||   |||||||| |    
T  29718962 ttgtcatataccaacgttgatgataaatcactccatatcatatcaacgagttgttgtggccttttgcaattgttactggaaagttgtatgaatgtcacag 29719061  T
Q  409 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgca 441  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29719062 agaatggagtgaaacatgtggttcaaaactgca 29719094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Original strand, 29658811 - 29658860
Alignment:
Q  119 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  29658811 catcatattgtttgcttccattttccccaacttggaagtgcttgatttga 29658860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 29691334 - 29691375
Alignment:
Q  127 tgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  29691334 tgtttgcttccattttccccaacttggaggtgcttgatttga 29691375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 29718846 - 29718887
Alignment:
Q  127 tgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  29718846 tgtttgcttccattttccccaacttggaggtgcttgatttga 29718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30827368 - 30827311
Alignment:
Q  111 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30827368 gatgaaaacatcctattgtttacttctattttccccaatttggaggtgcttgatttga 30827311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 52082922 - 52082870
Alignment:
Q  31 agaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctc 83  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  52082922 agaactctaattctttgctggactttgttgtataccctcaagtgaagtctctc 52082870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6416310 - 6415889
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    ||||||||||||||||    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  6416310 gtgtagagaattctgaaaaattggtcgagtttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttgggaaaaaataaatggttaagcgatgaaggtatcat 6416211  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaag 224  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  6416210 aatgttttcttccaacttccccaatttgcagctgcttgatttgaatcgttgtaatctcttatctgaaggtatttgtcaagttttaaagatatgttgtaag 6416111  T
Q  225 attaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaag 324  Q
    ||| ||||||||||| || ||   |||  || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||||||||||  | ||||||  |||||| |    
T  6416110 attgggcatttgaacttagccttttgtaaaaaagtgaagctacatggaatggactttgtagttcccaacctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaagg 6416011  T
Q  325 ttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaaca 424  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  6416010 ttaatgataaaactctctatgtgatctcaaagaattgtagcgggcttttgcaactattacttgaattttgtgataatgtcacagaagtgggagtgaaaca 6415911  T
Q  425 tgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||| || ||||||||||||    
T  6415910 tgtggtagagaactgcacacaa 6415889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 444
Target Start/End: Original strand, 6589119 - 6589497
Alignment:
Q  66 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6589119 cctcaattaaagtctctctatttgggtaaaaattcatggttaagtgatgcaaatatcataatgtttgcttccattttccccaatttagaggtgcttgatt 6589218  T
Q  166 tgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagct 265  Q
    | |||||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||   | |||||||||    
T  6589219 tcaattcttgtaataacatatctaaaggtatttgtcaagtattgagaagatgttgtaagattaggcatttgaacttagccttctgtaagaaagtgaagct 6589318  T
Q  266 acttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgc 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  | ||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||       
T  6589319 acttggaatgaactttgtagttcccatgctggaggtgttgaacttgtcaaatacaaatgttaatgataaaacactatatctgatctcaaaaaattgtata 6589418  T
Q  366 gggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacac 444  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6589419 gggcttatgcaattatcacttcaactttgtaattatgtcacggaggagggagtgaaacatgtggtagaaaactgcacac 6589497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7119468 - 7119074
Alignment:
Q  58 gtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagct 157  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||  | |||||| ||||||||  ||  |||| || |||||| ||||||||||||| || ||    
T  7119468 gtgtatatcctcagttaaagtctctctatttaggtagaaatttacggttaactgatgaaaaaattgtaatattagcttcctttttccccaatttacaact 7119369  T
Q  158 gcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaaga 257  Q
     |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||    
T  7119368 tcttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaaga 7119269  T
Q  258 gtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaaga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  7119268 gtgaagctacttggaatgaactttgttgttcaccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaaga 7119169  T
Q  358 attgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||  | || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7119168 attgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaaaaaagaagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7119074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7131946 - 7131552
Alignment:
Q  58 gtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagct 157  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||  ||||  | |||||| ||||||||  ||  |||| || |||||| ||||||||||||| || ||    
T  7131946 gtgtatatcctcagttaaagtctctctatttaggtagaaatttacggttaactgatgaaaaaattgtaatattagcttcctttttccccaatttacaact 7131847  T
Q  158 gcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaaga 257  Q
     |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||    
T  7131846 tcttgatttgaatacttgcaataacatatctgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttctaagattaaacatttgaacttagcccactgttcaaga 7131747  T
Q  258 gtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaaga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||    
T  7131746 gtgaagctacttggaatgaactttgttgttcgccagctggaggtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactccatgtgatctcgaaga 7131647  T
Q  358 attgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||  | || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7131646 attgttgcgggcttttggaactattactgaaagattgttattatgtcacaaacaaagcagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaattgaga 7131552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6432471 - 6432078
Alignment:
Q  59 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6432471 tgtataccctcagttaaagtctctctatttgggtcacaattcatggttaaggaatgaaaggatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcaacat 6432372  T
Q  159 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 258  Q
    |||||||||  ||  ||  |||| |||  | ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| || || | |||  || ||    
T  6432371 cttgatttgcgttggtgtcatcgtataaatgaaggtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaaacttaaacatttgaacttagcctattgtataaaag 6432272  T
Q  259 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||  |||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6432271 tgaagctacatggaatgaactttgaagttcccaagctgaaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaacactttatgtgatcttaaagaa 6432172  T
Q  359 ttgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6432171 ttgttgtgggcttctgcaactattcctgtacaattgtgataatgtcacacagaagggagtgaaacttgtggtagaaaaatgcacacaattgaga 6432078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 119 - 442
Target Start/End: Original strand, 7994031 - 7994354
Alignment:
Q  119 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgt 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||| | |||||||||| ||||    
T  7994031 catcatattgtttgctaccattttcccaaatttgcagatgctcgatttgaattcttgcaatggtatatctgaaggtatttgttacgttttaaggaaatgt 7994130  T
Q  219 tctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcattta 318  Q
    | |||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||  ||    
T  7994131 tgtaagatcaggcatttgaacatagccgattgtacaagagtgaagctactaggaatgaactttgtagttccgaagctagaggtgttgaacatgtcaaata 7994230  T
Q  319 caaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagt 418  Q
    |||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| || ||| |||||||    
T  7994231 caagggttaatgacgaaacactatatgtgatctcaaagaattgttctggacttttgcaactattacttgaactttgtaatgatgttaccgaggagggagt 7994330  T
Q  419 gaaacatgtggttgaaaactgcac 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  7994331 gaaacatgtggtagaaaactgcac 7994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 446
Target Start/End: Original strand, 10579523 - 10579913
Alignment:
Q  56 tggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcag 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10579523 tggtgtatacc-tcaattaaaatctctctatttgggtagaaattcattgttacgtgatgaaatgattataatgttagcttcctttttccccaatttgcag 10579621  T
Q  156 ctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaa 255  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||||| | | | |||||| | | ||||||  |||||||| |||||||||| || || ||||| |||    
T  10579622 ctgcttgatttgaatacttgcgaatacatatctgaaggtatttttcaagtttcaggaagatgtggtaagattaagcatttgaacttagccaaatgtccaa 10579721  T
Q  256 gagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaa 355  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  ||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10579722 gagtgaagcgacttagaataaagattgtaattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaaagttgatgataaaacactctattcgatctcaaa 10579821  T
Q  356 gaattgttgcgggcttttgcaactatt-actggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||| || | ||| | |  |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10579822 gaattgttgtcggcttttggaactatttactgaaaaactgtaaaagggtcacaaagaagggagttaaacatgtggtagaaaactgcacacaa 10579913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6426824 - 6426434
Alignment:
Q  56 tggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcag 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6426824 tggtgtataccctcaattgaagtctctctatctgggtagaaattcatggttaagtgatgaaatcatcataatgtatgcttccattttccccaatttacag 6426725  T
Q  156 ctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaa 255  Q
    || |||||||||||   ||||  |   |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| || |    |||||||    
T  6426724 ctacttgatttgaaggtttgccgtgaaatatctgaaggtatttgtgaagttttaaggaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaa 6426625  T
Q  256 gagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaa 355  Q
      ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||   ||||   |||||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  6426624 acgtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaatttgtcaaacacaagcattgatgatgaaactttttatgcgatctcaaa 6426525  T
Q  356 gaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||||| ||| ||||| |   ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6426524 gaattgttgtcggattttgcaattattacttgaaaattgtaaaggtgtcacaatgaagggtgtgaaacaagtggtagaaaactgcacacaa 6426434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6403129 - 6402775
Alignment:
Q  100 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctg 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |||  ||  ||| |||| |||||| ||||| | ||    
T  6403129 catggttgagtgatgaaagcatcataagttttgcttccatttttcccagtttgcaacatcttgaattgcgttggtgcgatcgtatatctgaaggtatttg 6403030  T
Q  200 tgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggag 299  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||     
T  6403029 tcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttaactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttgcagttccccaactagaa 6402930  T
Q  300 gtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 399  Q
    |||||  | ||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||    
T  6402929 gtgttgaacttgtcagatacgaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgtagtgggcttttgaaactattattgagagattgttata 6402830  T
Q  400 atgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  6402829 atgtcacagaaaagggagcgaaacatgtgatagaaaactgtacacaactgagaga 6402775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 111 - 455
Target Start/End: Original strand, 6594447 - 6594791
Alignment:
Q  111 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaa 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  | || | |||  |||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  6594447 gatgaaaacatcatattgtttgcttctattttccccactttggagctgcttgatttgaggttttccgatcaaatatctgaaggtatttgtcaagttttaa 6594546  T
Q  211 ggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagattt 310  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||||||  | ||    
T  6594547 ggagatgttataagattacacatttgtacttatccgggtgttcaagagtgaagctacatggaataaactttttagttcccaaactggaggtgttgtactt 6594646  T
Q  311 gtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggag 410  Q
    ||||  |||| | ||||||||| | |||||   || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| || |||| |||    
T  6594647 gtcaaatacagaggttgatgatgagacactacgtgtgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactaaaactagaaaattgtgatcatctcacagag 6594746  T
Q  411 aagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6594747 gagggagccaaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagagaa 6594791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19632750 - 19632362
Alignment:
Q  55 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgca 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||||||  || | |||||| |||||  |||| ||||||||| |    
T  19632750 ttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttgggtcgaaatttacggttaagtgatgaaaagattacaatgttcgcttcgttttttcccaatttgta 19632651  T
Q  155 gctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttca 254  Q
    || |||||||||||||  |||| ||  ||||||||| | | | ||| ||||||||||   ||||| |||||| | |||||||||| || |   |||||||    
T  19632650 gcggcttgatttgaatcgttgctattacatatctaatgctatttgtcaagttttaag---atgttgtaagataacgcatttgaacttaactcgatgttca 19632554  T
Q  255 agagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaa 354  Q
    | ||| || ||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||||||| |   ||| | || ||||||||    
T  19632553 atagttaacctacttggaataaactttctagttcccaagctagaggtgttggacttgtcgtatacaaaggttgatgatgagcaactttttgtgatctcaa 19632454  T
Q  355 agaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19632453 agaattgttgtgggcttttgcaactcttactgaaaaattgtgctaatatcacagagaagggagtgaaacacgtggtagaaaactgcaaacaa 19632362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6410350 - 6409946
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  6410350 gtgtagggcattctaattctttggttgagtttggtgtataccctcaattaaagtctctctatttggattacaatacatcgttaagtgatgaaataatcat 6410251  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaag 224  Q
      |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    |||| | |  |||||| ||||| | ||| ||||||||  || ||||| ||||    
T  6410250 tttgtttgcttccatttttcccaatttacaactacttgatttgacgggttgccagcaaatatctgaaggtatttgtcaagttttacagaaatgttgtaag 6410151  T
Q  225 attaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaag 324  Q
     ||| ||||||| || || || | ||   || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | | ||||  |||||  |    
T  6410150 cttaagcatttggacttagcctattgcaaaaaagtgaagctacatggaatgaactttgaagttcccaagctgaaggtgttgaactagtcaaatacaagcg 6410051  T
Q  325 ttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaaca 424  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6410050 ttgatgatgaaactctttatgtgatctcaaagaattgttgtcggcttttgcaactatttttgtacaactgtgataatgtcacacagaagggagtgaaaca 6409951  T
Q  425 tgtgg 429  Q
    |||||    
T  6409950 tgtgg 6409946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6423552 - 6423132
Alignment:
Q  34 attctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgc 133  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6423552 attcagattctttagttgagtttggggtataccctcaattaaagtctctctatttgggttacacttcgtggttaagtgatgaaatcatcataatgtttgc 6423453  T
Q  134 ttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcat 233  Q
    |||||||||||| |||||  | || |||||||||||   |||| |||  |||| | | ||| | ||| | |||||| ||| ||||  | || |||  |||    
T  6423452 ttccattttccctaatttaaaactacttgatttgaagggttgccatcaaatatttgatggtatttgtcatgttttacggaaatgtcgtgagcttaaacat 6423353  T
Q  234 ttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgata 333  Q
    |||||| || || | |||  |  ||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||| ||||   ||||    
T  6423352 ttgaacttagcctattgtgaacaagtgaagctacgtgcaatgaacttttaagttcccaagctggaggtgttgaacttgtcaaatacaagagttagcgata 6423253  T
Q  334 aaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttga 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | || ||| |||||| ||||||       
T  6423252 aaacactctatgcgatctcaaagagttgttgtgggattttgcaactattacttgaagattgtgattatgtaacaaacaaaggactgaaacgtgtggtatt 6423153  T
Q  434 aaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6423152 aaactgcacacaattgagaga 6423132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6395177 - 6394779
Alignment:
Q  56 tggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcag 155  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||   |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6395177 tggtgtataccctcagttaaactctctctatttgggtacaaattactggttaatagatgaaataatcataatgtttacttccattttccccaatttacag 6395078  T
Q  156 ctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaa 255  Q
    || ||||||||||    ||||   |  |||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||| || |    |||||||    
T  6395077 ctacttgatttgacacgttgctcacaaatatctgaaggtatttgtcaagttttaaagaaatgttgtaagcttaaacatttgaacttagctttctgttcaa 6394978  T
Q  256 gagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaa 355  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||  |||||  ||||||||| |||| || | || |||||||||    
T  6394977 aagtgaaactacatggaatgaactttgcagttcccgagctggaggtgttgaacttgtcaaatacaagcgttgatgatgaaactctttctgtgatctcaaa 6394878  T
Q  356 gaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||  ||||| | |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6394877 gaattgttgtgggcttttgcaattacaacttgataattgtaaaaatgtcacagaaaagggtgtggaacatgtggtagaaaactgcacacaattgagaga 6394779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 457
Target Start/End: Original strand, 6585150 - 6585424
Alignment:
Q  183 atatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttg 282  Q
    |||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6585150 atatctgaaggtatttgtcatgttttaaggagatgttttaatattaggcatttgaactttactgggtgttcaagagtgaagctacttggaataaactttt 6585249  T
Q  283 cagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactatt 382  Q
     |||| |  || ||||||| ||  | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  6585250 tagttacccagttggaggtattgaacttgtcagatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttctgcgcttttggaactatt 6585349  T
Q  383 actggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaaca 457  Q
    |||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  6585350 actgaaaggttgtgaaaatgtcacagagaagggactgaaacatgtggtagaaatttgcacacaactgagaaaaca 6585424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14821033 - 14820608
Alignment:
Q  26 tgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcata 125  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||  |||||     
T  14821033 tgtagggaattcagattctttagttgagtatggtgtataccctcaattgaagtctctctatttgggtcacaattcatggttaaatgatgaaataatcatt 14820934  T
Q  126 atgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaaga 225  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||  |   ||    ||  |||||| ||||| | ||| ||| |||||||| ||||| ||||     
T  14820933 ttgtatgcttccattttcccaaatttaaagctacttgatttacaagattc---tcctatatctgaaggtatttgtcaaggtttaaggaaatgttgtaagc 14820837  T
Q  226 ttaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagt 325  Q
    |||  ||||||||| ||      |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  | || |||  |||||| ||    
T  14820836 ttaaacatttgaacttagaattttgttcaggagtgaaactacatggaattaactttgcagttcccaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggt 14820737  T
Q  326 tgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacat 425  Q
    |||| || ||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| | ||| || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  14820736 tgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgttgtgggcttttgcgattattacttgaaaaatgtaatgatgtcacagagaagggtgtgaaacat 14820637  T
Q  426 gtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |||||  |||||||||||||  |||||||    
T  14820636 gtggtaaaaaactgcacacagctgagaga 14820608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 363
Target Start/End: Original strand, 6596717 - 6597021
Alignment:
Q  59 tgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| ||||||  || ||||  || |||||| |||| || ||||||||||||    
T  6596717 tgtataccctcaattaaagtctctctatttgggtagaaatttttggttaagtaatgaaaatattataagattagcttccttttttcctaatttgcagctg 6596816  T
Q  159 cttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagag 258  Q
    ||||| ||  |||||   |||  ||| ||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  6596817 cttgacttatattctaataataacatttctgaaggtatttgtcaagttttcaggagatgtgataagattaagcatttgaactgagccgaatgttcaagtg 6596916  T
Q  259 tgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaa 358  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  6596917 tgaagcgacttgaaataaactttgaaattccccagctggaggtgttgaacttgtcaagtacaaatgttgatgatgaaacactctacgctatctcaaagaa 6597016  T
Q  359 ttgtt 363  Q
    |||||    
T  6597017 ttgtt 6597021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 298
Target Start/End: Original strand, 8913783 - 8914012
Alignment:
Q  68 tcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttg 167  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||     
T  8913783 tcaattaaagtctctttatttgggtgacaatttgtggttaacggatgaaatcatcataatgtttgcttccattttttccaatttgcatatgcttgattt- 8913881  T
Q  168 aattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctac 267  Q
    |||| |||  ||   |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |    | ||| ||||||||||||||||    
T  8913882 aattattgagattatatatctaaaggtatttgtcaagttttaagaagatgttgtaagattaaacatttgaacttcgttggatgatcaagagtgaagctac 8913981  T
Q  268 ttggaatgaactttgcagttccgaagctgga 298  Q
    ||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  8913982 ttgcaataaactttgtagttcccaagttgga 8914012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 454
Target Start/End: Original strand, 11936254 - 11936459
Alignment:
Q  249 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 348  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||    
T  11936254 tgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattgga 11936353  T
Q  349 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 448  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  11936354 tctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaaat 11936453  T
Q  449 gagaga 454  Q
    ||||||    
T  11936454 gagaga 11936459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 454
Target Start/End: Original strand, 11948234 - 11948439
Alignment:
Q  249 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 348  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||    
T  11948234 tgttcaagactgaagctacgtacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttgacgataaatcactctattgga 11948333  T
Q  349 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 448  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  11948334 tctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaaggagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaaat 11948433  T
Q  449 gagaga 454  Q
    ||||||    
T  11948434 gagaga 11948439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14818487 - 14818296
Alignment:
Q  264 ctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgtt 363  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||  | || |||  |||||| |||||| || ||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  14818487 ctacatggaattaactttgcagttctcaagttagaggtgttgaacttatcaaatacaaaggttgataatgaaacactttatatgatctccaagaattgtt 14818388  T
Q  364 gcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
      |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  14818387 ctgggcttttgcgattattacttgaaaattgtaataatgtcacagagaagggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacagctgagagaa 14818296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 452
Target Start/End: Original strand, 6603256 - 6603384
Alignment:
Q  324 gttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaac 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  6603256 gttgatgatgaaacagtctatgcgatctcaaagagttgtcctgggcttttggaactattattgaaatattgttattatgtcacagagaaaggagtgaaac 6603355  T
Q  424 atgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  6603356 atgtggtagaaaactgcaaacaactgaga 6603384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 6602961 - 6603105
Alignment:
Q  26 tgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcata 125  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||| | |||  ||||||    
T  6602961 tgtagagaataatgattctatgatggatattggtatataccctcaattaaagtctctctatttaggtgacaatttatggttaagtgttcaaaaaatcata 6603060  T
Q  126 atgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaat 170  Q
    |||||||||||   | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6603061 atgtttgcttcttctatccccagtttgcagctacttgatttgaat 6603105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9411622 - 9411556
Alignment:
Q  102 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9411622 tggttaagagataaaaacatcaaaaggtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 9411556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14802439 - 14802331
Alignment:
Q  266 acttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgc 365  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| |||||  ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  14802439 acttggaactaactttgaagttcccaagatggaagtgttgaatttgtcaaatacaaaggttgatgatgaaacactctatgtgatttcaaagaattgttgt 14802340  T
Q  366 gggcttttg 374  Q
    || ||||||    
T  14802339 ggtcttttg 14802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6403225 - 6403164
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6403225 gtgtagagaattctgattctttgacggatattggtgtataccctcagttaaagtctctctat 6403164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9411455 - 9411294
Alignment:
Q  269 tggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcggg 368  Q
    |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||   |||   ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  9411455 tggattgaactttgaggttcccaagctggaggtgttgaacttgtcatatacaggtgttttcgatgaaatactctatgagatctcaaagaattgtcgtgga 9411356  T
Q  369 cttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggt 430  Q
    ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  9411355 cttttgcaactgttactgcaatgctgtcataatgtcagagataagggagtgatgcatgtggt 9411294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 446
Target Start/End: Original strand, 6586112 - 6586284
Alignment:
Q  272 aatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctt 371  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||   ||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    |||||    
T  6586112 aatgaactttgtacttcccaagctagaggtgttggatttgtcaaaaacagatgttcatgatgaaacactctgtgcgatctcaaagatttgtcctaggctt 6586211  T
Q  372 ttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    ||| |||||| ||||  |  |||||||   |||||  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  6586212 ttggaactatcactgataggttgtgattgggtcac--agaaaggagtgaaagatgtggtgcaaaactgcaaacaa 6586284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 446
Target Start/End: Original strand, 53761597 - 53761945
Alignment:
Q  102 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcag-------ctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggt 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||        || |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  53761597 tggttaagtgatgaaaacatcataacgtttgcatcaattttccccaatttgcaagttgcaactacttgatttaagttcttgcgatcgaatatctaaaggt 53761696  T
Q  195 gtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagc 294  Q
     | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53761697 atttgtcaagttttaaggagatgttgtaacattaggcatttgaacttagccgagtgttcaagagtgaagctaattggaatgaactttgtagttcccaagc 53761796  T
Q  295 tggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg 394  Q
    | |||| |||  | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||  || |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53761797 tagaggcgttgaacttgtcatttacgaaagttaacgataaaacactc--tgtgatctcgaagaattgtcgtgggcttttgcaa-tattactgaaacattg 53761893  T
Q  395 tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53761894 tgataatgtcacggacaagggagtgaaacatgtggaagaaaactgcacacaa 53761945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 547260 - 546839
Alignment:
Q  25 gtgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat 124  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||| ||||  |||| |||||||||||||     
T  547260 gtgtagagaattctaattctttcaaggattttgttgtaagccctcaattgaagtctctccatttggctaaaaattcatgcataagagatgaaagcatcaa 547161  T
Q  125 aatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagatgttct 221  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || |||   |  ||||||| |||   || | ||||| |||||||||||||||| |    
T  547160 aatgtttccttccatgttccccaatttgcaactgcttgatttaagttattgtcgtaacatatctgaagacagtatttgtgatgttttaaggagatgttgt 547061  T
Q  222 aagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaa 321  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| | |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |  | ||||||  |||||    
T  547060 aagataaggcatttgaacttatccaattgtttagtagtgaacctatttggaatgaactttgaagttcctaaattggaggtggtgaacttgtcacgtacaa 546961  T
Q  322 aagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaa 421  Q
      ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  546960 ttgtcaatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttggaattgttactggaagaatgttttcatgtcacagagaagggagtgaa 546861  T
Q  422 acatgtggttgaaaactgcaca 443  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  546860 acatgtgctagaaaactgcaca 546839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 21834140 - 21834422
Alignment:
Q  32 gaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgttt 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21834140 gaattctgaatctttggtggattttggtgtgtaccctcaattaaagtctctctttttgggccgcaattcatggttaaatgatgaaagaatcataatgttt 21834239  T
Q  132 gcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggc 231  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |  |||||  ||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  21834240 gcttcaattttccccaatttacagctgcttgatttgacttcttccacacagatatcagaaggtatttgcgaagttttaaggaaatgttgtaagattaagc 21834339  T
Q  232 atttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtca 314  Q
    |||||||| |||| |  ||||  | ||||||||||| | | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21834340 atttgaacttatcaggttgttataaagtgaagctacatagtatcaactttgtagttcccaagctggaggtgttggacttgtca 21834422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 455
Target Start/End: Original strand, 55908567 - 55908913
Alignment:
Q  112 atgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtttt 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||| ||  ||||||| |||   || | ||||||||| |    
T  55908567 atgaaaacatcatattgtttgcttccattttccccaatttgcaatttcttgatttgagctcctgccataacatatctgaagaaggtatttgtgaagttct 55908666  T
Q  209 aaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagat 308  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || || | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | ||||||||  |     
T  55908667 aaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattagaggtgtttaac 55908766  T
Q  309 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 408  Q
    ||||||  ||||   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||| |    
T  55908767 ttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctggaaaattgtgatgaagtcacag 55908866  T
Q  409 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  55908867 agaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagagaa 55908913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 644950 - 644746
Alignment:
Q  249 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 348  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| || | |||  ||    
T  644950 tgttcaagactgaagctacttacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttagacttgtcatttacaagagtttacgataaatca-tttatttga 644852  T
Q  349 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 448  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||| | |||  ||  ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  644851 tctcaaagagttgcagcgggcttgtgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacggagaaaggagtgaaacatgtggttgaaaaatgcacacaact 644752  T
Q  449 gagaga 454  Q
    ||||||    
T  644751 gagaga 644746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 570621 - 570269
Alignment:
Q  96 aatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtg 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||  |||||  |  ||     
T  570621 aatacatggttaagtgatgaaaacattttaatgtttgcttctattttccccaatttgcagatacttgatttaagttattgcaatcagatatccgatagta 570522  T
Q  196 tctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagct 295  Q
    | ||| ||||||||   ||||||| |||  |||||||||||||| || |  | || |||| |||||| || | |||| ||||||||| |||||  || ||    
T  570521 tttgtcaagtttta---agatgttgtaaacttaggcatttgaacttagctcactgctcaaaagtgaaactgcgtggattgaactttgaagttctcaaact 570425  T
Q  296 ggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgt 395  Q
     ||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| |  ||  |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  570424 cgaggtgttgaacttgtcatatacaggagttgataacgaagaactctatctgatttcaaagagttgtcgcgggcttttgcaactgttacttgagcattgt 570325  T
Q  396 gataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 451  Q
     || |||| ||  | |  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  570324 tattatgttactaaaagaggcgtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaactgag 570269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 641178 - 640830
Alignment:
Q  106 taagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagt 205  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||| |  |||  ||| | ||||| ||||  | | | ||||    
T  641178 taagagatgaaaacataataatgtttgcttccatgttcccaaatttacggttgcttgatttgagtgattgtgatcacgtatctgaaggaatttttcaagt 641079  T
Q  206 tttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtta 305  Q
    |||||||| ||||| |||  |||| ||||||||| || |||  |||    |||| || |||||||||||||| |||| | | || |   ||||||||||     
T  641078 tttaaggatatgttgtaatgttagacatttgaacttagccggttgtgatggagtaaacctacttggaatgaaatttgaactaccaatattggaggtgttg 640979  T
Q  306 gatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtca 405  Q
     | ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  | || |||||||| || ||||||||| ||||| || |||| |    
T  640978 aacttgtcagatacaaacgttgatgatgaaacactctacgtgacctcaaagaattgccgtggtcttttgcatctgttactggaagattgtcattatgtaa 640879  T
Q  406 cggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  640878 caaagaagggagtgaatcatgtggtagaaaactgcaaagaattaagaga 640830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 446
Target Start/End: Original strand, 8184031 - 8184206
Alignment:
Q  271 gaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggct 370  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  8184031 gaatgaactttgaagttccgaaactagaggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgatatagcactctatgcaatctcaaagagttgttgtgggct 8184130  T
Q  371 tttgcaactattactggaacattgtgataatg-tcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  8184131 tttggaactgttactggaaaattgtga-aatgatcacagatgagggagtgaagcatgtgctagaaaattgcacacaa 8184206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 455
Target Start/End: Original strand, 1548258 - 1548609
Alignment:
Q  105 ttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa---aggtgtctgtg 201  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| | |||||||  |   |||| | ||||    
T  1548258 ttaagagatgaaaccatcaaaatattttcttcgattttccccaatttgcaactgcttgatttgattaattgcagtggcatatcagacgaaggtatttgtg 1548357  T
Q  202 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatc-cgaatgttcaagagtgaagctactt-ggaatgaactttgcagttccgaagctggag 299  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| || |||||| || | || | ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| || ||||||    
T  1548358 aagttttaag---atgttgtaagattagacagttgaacttagctcgta-gtttaaaagtgaagctactttggactgaactttgaaattcccaaactggag 1548453  T
Q  300 gtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgata 399  Q
    |||||  | ||||||  |||||   |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||   ||| |||| | |    
T  1548454 gtgttgaacttgtcacatacaagtattgatgatgaaacactcaatgtgatctcaaagagttgttgtgggcttttgcacttgttacaaaaacgttgtaaaa 1548553  T
Q  400 atgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
    || |||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||| | ||| ||||||||    
T  1548554 atatcacagagaagggagtgaaacatatagaagaaaactgctcgcaactgagagaa 1548609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 455
Target Start/End: Original strand, 8186920 - 8187276
Alignment:
Q  102 tggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtct 198  Q
    ||||||||| |||||| | ||  ||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||  ||||||| |||   || | |    
T  8186920 tggttaagtaatgaaaacctcgaaatgttatcttccttattccccaatttgcagttgcttgatttgagtcattgctatgacatatctgaagaaggtattt 8187019  T
Q  199 gtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctgga 298  Q
    || ||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||| || || | ||| |||||||   |||    ||||||||||||| | || | || |||||    
T  8187020 gtcaagttttgaagagatgttgtgagattagggatttgaacttagcctactgtccaagagttgggctctccggaatgaactttgaaatttccaaactgga 8187119  T
Q  299 ggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgat 398  Q
    ||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||  |    
T  8187120 ggtgttgaacttgtcacatacaagagttgatgataaaacactttatgcaatttcaaagagttgttgtgggcttttgcagttgttactggaaaattgtcgt 8187219  T
Q  399 aatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
    || ||||| | |||||||||||   |||||||  |||||||||| ||| ||| ||||    
T  8187220 aacgtcacagggaagggagtgatggatgtggtaaaaaactgcacgcaactgacagaa 8187276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1600671 - 1600444
Alignment:
Q  120 atcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||| |  ||||||| |||   || | ||| |||||||||||||||    
T  1600671 atcataatgtttgcttccaattttcccaatttgcaactgcttgatttgagcagttgcattaacatatctgaagaaggtatttgtcaagttttaaggagat 1600572  T
Q  217 gttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatt 316  Q
     |||||| ||||| ||||||||| || || | ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||  | |||||||     
T  1600571 tttctaaaattagacatttgaacttagcccagtgttcaataatgaagctgcgaggaatgaactttgaagttcttaaactggaggtgttgaacttgtcata 1600472  T
Q  317 tacaaaagttgatgataaaacactctat 344  Q
    |||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  1600471 tacaagggttgacgatgaagcactctat 1600444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 553644 - 553402
Alignment:
Q  204 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 303  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| || ||   ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||  |||||  || ||||||||||    
T  553644 gttttaaggacatgttgtaacattagacatttgaacttaacccgctgttcaagagtgaagttacgtacattgaactttaaagttctcaaactggaggtgt 553545  T
Q  304 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 403  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||  ||    |||||  | ||||    
T  553544 tgaacttgtcatttacaagagttgatgatgaagcacttaatgtgatttcaaagagttgttctgggcttttgcaactgttgttgttttattgtagtgatgt 553445  T
Q  404 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  553444 cacagataaaggagtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaa 553402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 566300 - 566103
Alignment:
Q  258 gtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaaga 357  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  || || ||   ||| ||||| |||| | |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  566300 gtgaagctacgtggaatgaactttgaagttctaaaacttgaaacgttggatttatcatgttcaagcgttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagt 566201  T
Q  358 attgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
    | ||| | ||||||||||| || | |||| || ||  | | ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  566200 actgtcgtgggcttttgcagctgtcactgcaatataatcaaaatgttacagagaagggagtgaaacacctggtggaaaactgcacacaactgagagaa 566103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 454
Target Start/End: Original strand, 7225815 - 7226067
Alignment:
Q  202 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttc-cgaagctggagg 300  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||     |||||||||| ||||| ||||  ||||||    
T  7225815 aagttttacggagatgttgtaagattagacatttgaacttatcctactgtccaagagtgaagctacgcaacatgaactttgaagttctcgaa-ttggagg 7225913  T
Q  301 tgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataa 400  Q
    | ||  | ||||||  ||||| ||||||||| |||  |||   || ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||  | |    
T  7225914 tcttgaacttgtcacatacaagagttgatgacaaaggacttcgtgtgatatcaaagagttgttgtggacttttgcaactattactggaaagttgttttga 7226013  T
Q  401 tgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
     ||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  7226014 ggtcaccgagaagggattgaagcacgtggtagaaaactgcaagcaactgagaga 7226067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 570873 - 570723
Alignment:
Q  33 aattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcat---aatgt 129  Q
    |||||| |||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||||| |   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||    
T  570873 aattctaattctttggttgatttggctgtatgccctcaattgaagtctctatccttggctcacaatacatggttaagtgatgaaaacattattataatgt 570774  T
Q  130 ttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  570773 ttgcttccattttccccaatttgcaactacttgatttaagttattgcaatc 570723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 454
Target Start/End: Original strand, 1524420 - 1524667
Alignment:
Q  204 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 303  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || | ||||| | | |  | || | |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  1524420 gttttaaggagatgttgtaaacttaggcatttgaacttagccaactgttctaaaatagaacttcatggaatgaactttgaagttcccaatttggaggtgt 1524519  T
Q  304 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 403  Q
    |  ||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||| ||   | | ||  | ||||    
T  1524520 tgaatttgtcacgtacaagtgttgatgatgaaacactctatatgatctcacagagttgtcgtgggcttttgcaactgttattg---cgtagttgttatgt 1524616  T
Q  404 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  1524617 cacagagaggggagtgaattatgtgatagaaaactgcacacaactgagaga 1524667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 427
Target Start/End: Original strand, 1552757 - 1552927
Alignment:
Q  260 gaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||  ||||||  || ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  1552757 gaagctacttggactgaactttgaaattcccaaactggaagtgttgaatttgtcacatacaaatattaatgatgaaacactcaatgtgatatcaaagaat 1552856  T
Q  360 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg---tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgt 427  Q
    ||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||   | || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1552857 tgtcgtgggcttttgcagctgttactagaacaatgtaattattatgtcaccgagaagggagtgaagcatgt 1552927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 454
Target Start/End: Original strand, 1513407 - 1513588
Alignment:
Q  270 ggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggc 369  Q
    ||||||||||||| |||||| || || || |||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||| | ||||    
T  1513407 ggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatttacaaatgttgatgatgaaacactctacgtaatctcaaagtgttgtcgtgggc 1513506  T
Q  370 ttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||||||||||  ||||| ||  |||   || |||||| |||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  1513507 ttttgcaactcatactgaaaggttg---tattgtcacagagatgggagtgaagcttgtgctagaaaaatgcacacaactgagaga 1513588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 442
Target Start/End: Original strand, 1537757 - 1537939
Alignment:
Q  260 gaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaat 359  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| || || || |||||  | ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||  |    
T  1537757 gaagctgcatggaatgaactttgaagttcccaaactagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttaatgacaaaacactgtgtgtaatctcaaagtgt 1537856  T
Q  360 tgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcac 442  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||  |||||||||||||  ||||| | ||||| |||||    
T  1537857 tgtcgtgggcttttgcaacttttactggaactttgttatcttgtcacacagaagggagtgaagtatgtgctagaaaaatgcac 1537939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 446
Target Start/End: Original strand, 12121282 - 12121633
Alignment:
Q  98 tacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggt 194  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| ||  |||||||    |||||    
T  12121282 tacatggttacaagatgaaagcatcaaaaggattgcttccgttttccccaatttgcaattgcttgatttgagtttttgctataacatatctgaagaaggt 12121381  T
Q  195 gtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagc 294  Q
     | |   |||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||   |||| | ||  |||||| |   |||||||||||| |||||| || |    
T  12121382 attttccaagtcttaaggacatgttccgagattacgcatttgaacttaaccagttgtttaggaaggaagctgcgccgaatgaactttgaagttcccaaac 12121481  T
Q  295 tggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattg 394  Q
    | || |||||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |  |||||||||  |||  | |||||||||||||| | |||||||   ||    
T  12121482 tagaagtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaaacactctccgtaatctcaaagtgttgccgtgggcttttgcaactctcactggaatggtg 12121581  T
Q  395 tgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
       |  |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12121582 cttttttgtcacagagatgggagtgaagcatgtggtagaaaaatgcacacaa 12121633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 446
Target Start/End: Original strand, 55505070 - 55505281
Alignment:
Q  232 atttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatga 331  Q
    ||||||||||| || | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||  | || ||||||||  | ||||||| |||||| ||||| ||    
T  55505070 atttgaacctagcctactgttcaacagtgaacctaattggaatgaactttagagtcccccaactagaggtgttgaacttgtcatatacaaaggttgacga 55505169  T
Q  332 taaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggtt 431  Q
    |  |||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||||||  | ||| || || || | |   ||||||| ||||||||||||||||| ||| |     
T  55505170 tggaacactttatgtgacctcaaagaattgtcgtggacttttgcatttgttattgaaaaatagcg---atgtcacagagaagggagtgaaacacgtgtta 55505266  T
Q  432 gaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||||||||||||    
T  55505267 gaaaactgcacacaa 55505281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 532307 - 532196
Alignment:
Q  251 ttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatc 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  | ||||||| ||||||  |||||||| |||  || |||| || |    
T  532307 ttcaagagtgaatctacttggaatgaactttgaagtccccaagctagaggtgttgaacttgtcatatacaaacattgatgatgaaaagctttatgtgacc 532208  T
Q  351 tcaaagaattgt 362  Q
    ||||||||||||    
T  532207 tcaaagaattgt 532196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 371226 - 370843
Alignment:
Q  66 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 165  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||    
T  371226 cctcaattaaaatctctctatttggctcacaattcatggttaagagatgaataccttataatgtttgcttcaattttcctgaatttgcagctaattggtt 371127  T
Q  166 tgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaa 262  Q
    |||  | |||  ||  |||||||   ||  || |||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || | || |||||||||||    
T  371126 tgagctattgtgataacatatctgacaacagtatctgtcgagttttaaatagatggtctaagattaggcatttgaacttagcccactgctcaagagtgaa 371027  T
Q  263 gctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgtt-agatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattg 361  Q
    | |   ||| |||||| ||  |||||  || || |||||||| || ||  | |  ||||| |||  || || || ||||  ||| ||||||||||| |||    
T  371026 gttgtatggtatgaacattagagttctcaaacttgaggtgttgagcttaat-agatacaagagtctattatgaagcacttcatgtgatctcaaagagttg 370928  T
Q  362 ttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || |||||||   | ||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  370927 ttgtcggcttttgcaactattactgcaaaattgtgaaggtatcacaaagatgggagtgaagcatgtggtgaaaaactgcacacaa 370843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 439
Target Start/End: Original strand, 1495926 - 1496088
Alignment:
Q  277 actttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgca 376  Q
    |||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||| |  |||||| ||  ||||||||||||||| | ||  |||||||    
T  1495926 actttgaagttcctaacctcaaggtgttggatttgtcaatgacaaaagttaacgatgacgcactctttgtaatctcaaagaattgtcgtggaattttgca 1496025  T
Q  377 actattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactg 439  Q
    || |||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  1496026 acaattactggaaaattgtcatgatatcacagagaagggagttaggcatgtggtagagaactg 1496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 439
Target Start/End: Original strand, 1517574 - 1517665
Alignment:
Q  348 atctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactg 439  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  1517574 atctcaaagaattgtcgtggaattttgaaactattactggaaaattgtcatgatgtcacagagaagggagttaggcatgtggtagagaactg 1517665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 389
Target Start/End: Original strand, 3438404 - 3438684
Alignment:
Q  111 gatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatct---aaaggtgtctgtgaagttt 207  Q
    ||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||| |   |||||||    |||||||   | ||||||    
T  3438404 gatgaaagcctcttgatgttttcttctattttccccaatttgcagctgcttgatgtgagagaatgcgactacatatctgacgaaggtgttattcaagttt 3438503  T
Q  208 taaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttaga 307  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |  |||| | |||||||  |   || |||||||||||  ||| | ||  ||||||| ||       
T  3438504 taaggagatgttgtaagattagacatttgaacttagctggttgtttaggagtgaatttgtgtgcaatgaactttgatgtttcaaaattggaggtattgag 3438603  T
Q  308 tttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaa 389  Q
     ||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3438604 cttgtcacatacaagagttgatgat-aaatactccatgtaatctcaaagagttgttgtgggcttttgcaactgttactggaa 3438684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 532454 - 532404
Alignment:
Q  101 atggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaattt 151  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  532454 atggttgagagatgaaagcattataatgtttgcatccattttccccaattt 532404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 446
Target Start/End: Original strand, 1489457 - 1489537
Alignment:
Q  366 gggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||    
T  1489457 gggcttttgcaactcttactggaagggtgttttaatgtcacagagaagggagtgaagcatgtgctagaaaaatgcgcacaa 1489537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 7307957 - 7307778
Alignment:
Q  272 aatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggctt 371  Q
    ||||||||||  |||||| ||  ||||||| ||  | ||||||| |||| ||||||||||| || ||||   |  ||||||||||| ||||||  |||||    
T  7307957 aatgaactttaaagttcccaaattggaggtattgaacttgtcatatacagaagttgatgatgaagcactacgtatgatctcaaagagttgttgtaggctt 7307858  T
Q  372 ttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 451  Q
    ||||| || |||||||||  ||||  || |||||||  ||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  7307857 ttgcacctgttactggaaggttgttttattgtcacgatgactggattgaagcatgtggtagaaaactgcacgcaactgag 7307778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 454
Target Start/End: Original strand, 20477851 - 20478266
Alignment:
Q  39 gattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttcca 138  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |    
T  20477851 gattctttggagcagtttggtgtatatcctcgattgaagtctctctacttgggtcataatccatggttaagtgatgaaataataataatatttgcttcta 20477950  T
Q  139 ttttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaa 238  Q
    | |||||||||||||| |  ||||||||   ||  |||||||| |||||| ||| | | ||| || | |||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  20477951 tgttccccaatttgcaacatcttgattttccttggtgcaatcgtatatctgaagatatttgtcaattcttaacgagatgttgtaagttaaggcatttgaa 20478050  T
Q  239 cctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaaca 338  Q
    | || | | ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||  |||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||  |||||    
T  20478051 cttagctggatgtcgaagagcgaagctacttggaataaacgttgtaattccccagctggaggtgttgaacttgtcatatacaaatgttgatgacgaaaca 20478150  T
Q  339 ctctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaact 438  Q
     | | || |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||   ||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  20478151 ttatctgtgatctcaaggaattgttgtgggcttttgcaaatactactgaaaaattgcgataatgtcacaatgaaaggagcgaaacatgtcgtagaaaact 20478250  T
Q  439 gcacacaattgagaga 454  Q
    |||||||| |||||||    
T  20478251 gcacacaactgagaga 20478266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 430
Target Start/End: Original strand, 41889323 - 41889714
Alignment:
Q  42 tctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattt 141  Q
    |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||  |||   | ||| | ||||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41889323 tctttgatggattttgttgcataccctcaattaaagcatcttcgtttggctcaaaatccatggttatcagatgaagacatcataatgtttgcttccattt 41889422  T
Q  142 tccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa---aggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaa 238  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    |||   |||||||| | |   |||| |   | |||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||    
T  41889423 tccctaatttgcagctacttgatttgagcaattgttgtcgcatatttgatgaaggtattactcaagttttaaggatatgttgtaacattagatatttgaa 41889522  T
Q  239 cctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaaca 338  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  ||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  41889523 cttatccggatgttcaatagtgaagctacttgaaatgaactttaaagttcccaaattggaggtgttgaacttatcatatacaaaagttgatgatgaaaca 41889622  T
Q  339 ctctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggt 430  Q
    || |||  ||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||  || ||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  41889623 ctttataagatctcaaagagttgttgcgggctttcgaaattgttacttaaaaattgttatgatgtcacaaagaagggagtgaatcatgtggt 41889714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 452
Target Start/End: Original strand, 41901375 - 41901717
Alignment:
Q  110 tgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtt 206  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||   |||||||| | |||   || |   | |||||    
T  41901375 tgatgaagacatcacaatgttcgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgagcaattgttgtcgcatatttgaagaaggtattgttcaagtt 41901474  T
Q  207 ttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttag 306  Q
    |||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||  |||   | |||  |||||| |||||| || |||||||||||      
T  41901475 ttaaggatgtgttgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttccatagtgagacta---gaaatagactttgaagttcccaaactggaggtgttga 41901571  T
Q  307 atttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcac 406  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| || |||||| || | | |||  || ||||| || |||||||    
T  41901572 acttgtcatatacaaaagttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtggacttttgaaattgtcacttcaagattgtaatgatgtcac 41901671  T
Q  407 ggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  41901672 aaagaagggagtgaagcatgtggtagaaaactgtacgcaattgaga 41901717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28525314 - 28525098
Alignment:
Q  66 cctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatt 165  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||    
T  28525314 cctcaattaaagtctctcaatttgtgtgacaattcatggttaagggacgaaaatatcataaggtttgcttccattttccacaatttggaggtgcttaatt 28525215  T
Q  166 tgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagct 265  Q
    || |   ||| || | |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||  | | ||||||| | ||||||     
T  28525214 tggaccattgtaagcacatatctaaatgtatttgtcaagttttaaggagatgttgtaagatgagggatttgaaattaagcaactgttcaataatgaagcc 28525115  T
Q  266 acttggaatgaactttg 282  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28525114 acttggaatcaactttg 28525098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32267714 - 32267402
Alignment:
Q  130 ttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagat 226  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||   |||||||||| |||   || ||  | || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  32267714 ttgcttccatcttctccaatttgcagctgcttgatttgagcaattgttgtcgcatatctgaagaaggtatcgttcaatttttaaggatatgttgtaacat 32267615  T
Q  227 taggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagtt 326  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||   | ||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||  | ||||||   |||| ||||    
T  32267614 tagacatttgaacttatcccagtgttcaacagtgaaacta---gaaatgaactttgaagttcccaaattggaggtattgaacttgtcacaaacaatagtt 32267518  T
Q  327 gatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatg 426  Q
    |||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||| || | | |||  || ||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||    
T  32267517 gatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttaaaaattgtaatgatatcacaaagaagggagtgaagcatg 32267418  T
Q  427 tggttgaaaactgcac 442  Q
    | || |||||||||||    
T  32267417 tagtagaaaactgcac 32267402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37938052 - 37937826
Alignment:
Q  204 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||  | |||  ||||| |||  |||||| |||||| || || |||||||    
T  37938052 gttttaaggagatgtcctaagattaggcatttaaacctaaccaactgttcgagtcttaagtcacttgaaatcgactttgaagttcccaaccttgaggtgt 37937953  T
Q  304 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 403  Q
    | || ||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||| | ||||||||||||||    ||| ||| ||||   |||||    
T  37937952 tggacttgacacatacaagaattgatgatcaaacactctatgtaatctcaaagatgtgtcgtgggcttttgcaactcacgctgcaactttgtacgaatgt 37937853  T
Q  404 cacggagaagggagtgaaacatgtggt 430  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  37937852 caccgagaagggagtgatgcatgtggt 37937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17205600 - 17205514
Alignment:
Q  368 gcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  17205600 gcttttgcatctaatactggaacattgtaatgatgtcacagaaaaaggattgaaacatgtggtagaaaactgcataaatttgagaga 17205514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 443
Target Start/End: Original strand, 38267562 - 38267729
Alignment:
Q  276 aactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgc 375  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||| || ||| ||  ||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||  ||  | |||||||||     
T  38267562 aactttgaagttcccaaccttgaggtgttggacttgacacatacaagagttgatgatgacacactctatgtaatctcaaagacgtgccgtgggcttttga 38267661  T
Q  376 aactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcaca 443  Q
    |||| |  ||| ||| ||||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  38267662 aactgtcgctgcaactttgtacgaatgtcaccgagaagggagtgatgcatgtggtcaaaaactgcaca 38267729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 455
Target Start/End: Original strand, 1037503 - 1037849
Alignment:
Q  112 atgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgtctgtgaagtttt 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||| ||  ||||||| |||   || | |||||||||||    
T  1037503 atgaaaacatcatattgtttgcttccattttccccaatttgcaatttcttgatttgagctcctgccataacatatctgaagaaggtatttgtgaagtttt 1037602  T
Q  209 aaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagat 308  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||  || || | | |||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | ||||||||  |     
T  1037603 aaggagatgttgtaaggttagacatttgaatttagcctactattcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattagaggtgtttaac 1037702  T
Q  309 ttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacgg 408  Q
    ||||||  ||||   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||||| |    
T  1037703 ttgtcacatacatgtgttgatgatgaaacactctatatgatctcaaagaattgttgtgggcttttacaactgtttctggaaaattgtgatgaagtcacag 1037802  T
Q  409 agaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagagaa 455  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  1037803 agaatggtgtgaaacatgtagtcgaaaactgcacacaactcagagaa 1037849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 446
Target Start/End: Original strand, 45245019 - 45245261
Alignment:
Q  204 gttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgt 303  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||      ||||||||| || |  ||| |||||| ||||||| |||||| || || |||||||    
T  45245019 gttttaaggagatgttgtaacattaggcatttaaacttagtttgctgttcaagactggaattacgtggaataaactttgaagttccaaaacttgaggtgt 45245118  T
Q  304 tagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgt 403  Q
    |  ||||||||   ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || | ||| || ||||    
T  45245119 tgaatttgtcagagacaatggttgatgatgaaacactccatgtgatctcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattattgaaaaaatgttatcatgt 45245218  T
Q  404 cacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45245219 cacagataagggagtgaaacatgtggtagaaaattgcacacaa 45245261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Original strand, 32785535 - 32785670
Alignment:
Q  33 aattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtttg 132  Q
    |||||| |||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||| |   |||   |||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  32785535 aattctaattctttgatggattttgttgtaatccctcaattaaagtttctccatttggctcgcaattattggttaagagatgaaagcatcaggatgtttt 32785634  T
Q  133 cttccattttccccaatttgcagctgcttgatttga 168  Q
    |||| |||||  |||||||||| || ||||||||||    
T  32785635 cttctattttttccaatttgcaactacttgatttga 32785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 34936034 - 34936344
Alignment:
Q  144 cccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaa---aggtgtctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacc 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||| | ||||||||||   |||| | | | | |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||     
T  34936034 cccaatttgcatctgcttgatttgagcgattgcagtggcatatctaatcaaggtatttatcatgttttaaggagatgttgtgacattagacatttgtact 34936133  T
Q  241 tatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacact 340  Q
    |  |||| ||||||| |||||| || |   |||||| |||||  ||||| || || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34936134 tggccgattgttcaaaagtgaaccttcacagaatgatctttgatgttccaaaactagaggtgttggacttgtcatatacaagagttgatgataaaacact 34936233  T
Q  341 ctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgc 440  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||    
T  34936234 ctatgccatcgcaaagagttgtcgtgggcttttgcaactattacttcaaaattgttgtgatgtcacggagaagggagttgagcgtgtggttgaaaattgc 34936333  T
Q  441 acacaattgag 451  Q
    |||||||||||    
T  34936334 acacaattgag 34936344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 446
Target Start/End: Original strand, 18315100 - 18315449
Alignment:
Q  100 catggttaagtgatgaaagcatcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaag---gtgt 196  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| ||  |||| || |||   || |    
T  18315100 catggttaagagaggaaagcatcaaaatattttcttccattttccccaatttgcagttgcttgatttgagctactgcgataacatacctgaagaaggtat 18315199  T
Q  197 ctgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctg 296  Q
     ||| |||||||| | || |||||| ||||||| || |||||| || |      ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||    
T  18315200 ttgtcaagttttacgaagttgttctgagattagacagttgaacttagctcgtgattcaagaatgaagctacgtggaatgaactttaaagttcccaaactg 18315299  T
Q  297 gaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtg 396  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  |||     
T  18315300 gaggtgttgaacttgtcacatacaaaagttgatgatgaagcactctatgtgatctcaaagagttgtcgtaggcttttgcaactgttattggaacgctgtt 18315399  T
Q  397 ataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
     | ||||||| ||||| ||||  ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  18315400 gtgatgtcacagagaaaggagaaaagtatgtggtagaaaactgcacacaa 18315449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 17636150 - 17636581
Alignment:
Q  26 tgtagagaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcata 125  Q
    ||||||||||||| |||||| | || | |||| |||| |||||||||| ||||||||| || ||  | | ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17636150 tgtagagaattctaattcttcgatgaattttgttgtaaaccctcaatttaagtctctccatttgccttacaattcatggttaagagatgaaagcctcata 17636249  T
Q  126 atgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatc---taaaggtgtctgtgaagttttaaggagatgttcta 222  Q
    | | | | | |||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||   |||||    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  17636250 aagctcgataccattttccccaatttgcagctgcttgatttacgagattgcaataaaatatcagagaaaggtatttgtcaagttttaaggggatgttcta 17636349  T
Q  223 agattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctac----ttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcattta 318  Q
    | ||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||     | |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||  | ||||||   |    
T  17636350 atattaggcatttgaacttaggccgatgttcaagagtgaaactacatcgatcgaatgaactttgaagttcccaaattggaggtgttgaacttgtcacaaa 17636449  T
Q  319 caaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagt 418  Q
    ||  |||||| ||| || || | |||| ||||||||||| ||||    | ||||||||| | | ||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  17636450 caggagttgacgatgaagcattgtatgtgatctcaaagagttgtcttagacttttgcaattgtcacttgaatattgtgttaatgtcac-gagaaaggagt 17636548  T
Q  419 gaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 451  Q
    ||  |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17636549 gaggcatgtgctagaaaattgcacacaattgag 17636581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 454
Target Start/End: Original strand, 28246274 - 28246477
Alignment:
Q  249 tgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcga 348  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||    
T  28246274 tgttcaagactgaagctacatacattgaactttgaagttcccaaactggaggtgttggacttgtcatttacaagagttga--ataaatcactctattgga 28246371  T
Q  349 tctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaatt 448  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||  ||  ||||||   |||||| || ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  28246372 tctcaaagagttgtagcgggcttttgcaactgtcacttaaattttgtgaaggtgtcacagacaaatgagtgacgcatgtggttgaaaaatgcacacaact 28246471  T
Q  449 gagaga 454  Q
    ||||||    
T  28246472 gagaga 28246477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27922672 - 27922425
Alignment:
Q  202 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggt 301  Q
    |||||||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||| |||   | ||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  27922672 aagttttagggatatgctgtaacattagacatttgaacttatccaagtgttcaatggtgaaacta---gaaatgaactttgaagttcccaaattggaggt 27922576  T
Q  302 gttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataat 401  Q
    |||  | ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||| || | | ||| ||| ||||| || ||    
T  27922575 gttgaacttgtcatatacaaatgttgatgatgaagcactttatatgatctcaaagagttgttgtgggcttttgaaattgtcacttgaaaattgtaatgat 27922476  T
Q  402 gtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgaga 452  Q
     ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  27922475 ttcacaaagaagggagtgaaccatgtggtagaaaactgcactcaactgaga 27922425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32151551 - 32151242
Alignment:
Q  119 catcataatgtttgcttccattttccccaatttgcagctgcttgatttgaattcttgcaatcgcatatctaaaggtg---tctgtgaagttttaaggaga 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||| ||  ||||||| |||  |   | ||| ||||||||||   |    
T  32151551 catcaaaatgtttgcttccattttccctaatttgcaactgcttgatttgaggtgttgccataacatatctgaagaaggaatttgtcaagttttaag---a 32151455  T
Q  216 tgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcat 315  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |  |||  |||| |   |||||||| | |||||||||||| | |||| | || |||||||||||| | |||||||    
T  32151454 tgctctgagattaggcatttgaatttcaccggctgtttacatgtgaagctgcgtggaatgaacttcgaagtttccaatctggaggtgttaaacttgtcat 32151355  T
Q  316 ttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaaggg 415  Q
     |||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||    |||| |  ||||||| ||||||||    
T  32151354 gtacaaggtttgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcaactgttattggtgtcttgtaaatatgtcacagagaaggg 32151255  T
Q  416 agtgaaacatgtg 428  Q
     ||||| ||||||    
T  32151254 ggtgaagcatgtg 32151242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 17627817 - 17627952
Alignment:
Q  31 agaattctgattctttggtggactttggtgtataccctcaattaaagtctctctatctgggtgaaaatacatggttaagtgatgaaagcatcataatgtt 130  Q
    |||||||| ||||||||||||| || | ||||  |||||||||||| ||||||||| ||| |   ||| ||| | || | ||||||| ||||| ||||||    
T  17627817 agaattctaattctttggtggatttcgttgtaagccctcaattaaaatctctctatttggctttcaattcattgctatgcgatgaaaacatcaaaatgtt 17627916  T
Q  131 tgcttccattttccccaatttgcagctgcttgattt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17627917 tgcttccattttccccaatttgcaactgcttgattt 17627952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 445
Target Start/End: Original strand, 17628067 - 17628189
Alignment:
Q  323 agttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaa 422  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||  |||| |   |||||| || |||||||||||     
T  17628067 agttgatgataaagcactccgtgtgatctcaaagaattgttttgggctcttgaaactattactagaattttgtaaaggtgtcacagacaagggagtgaag 17628166  T
Q  423 catgtggttgaaaactgcacaca 445  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  17628167 catgtgttgaaaaactgcacaca 17628189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 21235658 - 21235476
Alignment:
Q  269 tggaatgaactttgcagttccgaagctggaggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcggg 368  Q
    |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| |  ||  |||||||  ||| |||||||  ||| || ||    
T  21235658 tggagtgaactttgaagttcccaaactggaggtgttgaacttgtcatatacaggagttgataacgaagaactctatttgatttcaaagagctgtcgcagg 21235559  T
Q  369 cttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgag 451  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||  | |  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21235558 cttttgcaactgttacttgagcattgttattatgtcactaaaagaggcgtgaatcatgtggtagaaaactgcacacaactgag 21235476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 446
Target Start/End: Original strand, 552 - 800
Alignment:
Q  198 tgtgaagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctgg 297  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  || || | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |  | |    
T  552 tgtgaagttctaaggagatgttgtaaggctagacatttgaatttagcctactgttcaagagtgaaactacttagaataaactttaaagttcctgaattag 651  T
Q  298 aggtgttagatttgtcatttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtga 397  Q
    |||||||  | ||||||  |||||  || |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  652 aggtgtttaacttgtcacatacaagtgtcgatgatgaaacactctatatgatctcgaagaattgttgtgggctattacaactgttactggaaaattgtga 751  T
Q  398 taatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
    | | ||||  ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  752 tgaagtcatagagaatggtgtgaaacatgtagtagaaaactgcacacaa 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 446
Target Start/End: Original strand, 1396 - 1643
Alignment:
Q  202 aagttttaaggagatgttctaagattaggcatttgaacctatccgaatgttcaagagtgaagctacttggaatgaactttgcagttccgaagctggaggt 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||   ||||||   ||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1396 aagttttaaggagatgttataagattagacatttgaacttagcctggtgttcatctgtggacctatttgaaatgaactttgtagttcctaagctagaggt 1495  T
Q  302 gttagatttgtcatttacaaaagttgatgataa---aacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgat 398  Q
    ||| || ||||||  |||||| ||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||  ||||  | ||||||||    
T  1496 gttggacttgtcaaatacaaatgttgatgatgatgaaacactctatgtgatctcaaagaattgttcagggattttggaactaagactgataaattgtgat 1595  T
Q  399 aatgtcacggagaagggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaa 446  Q
       ||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  1596 tgggtcatagagaaaggagtgaaagatgtcgtggaaaactgcaaacaa 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 39240 - 39099
Alignment:
Q  313 catttacaaaagttgatgataaaacactctatgcgatctcaaagaattgttgcgggcttttgcaactattactggaacattgtgataatgtcacggagaa 412  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||| | |||  |  ||||||   |||    
T  39240 catttacaaaggttaatgatgaaacactttatgtgatctcaaagagttgtagtgggcttttgcacctgatactggaaaaatgttctcgtgtcacaatgaa 39141  T
Q  413 gggagtgaaacatgtggttgaaaactgcacacaattgagaga 454  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  39140 gggagtgaaacatgtggtaaacaactgcacgcaactgagaga 39099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University