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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF19533_low_3 (Length: 385)
Name: NF19533_low_3
Description: NF19533
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19533_low_3 |
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1831554 - 1831185
Alignment:
| Q |
1 |
tattgagtgtaagccataccaagatatctatgatatggtatatgatactattttctgtaacaatagcctaaagttgcctacaattggctcgtaataacaa |
100 |
Q |
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| T |
1831554 |
tattgagtgtaagccataccaagatatctatgatatggtatatgatactattttctgtaacaatagcctaaagttgcctacaattggttcgtaataacaa |
1831455 |
T |
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| Q |
101 |
aactttcattcagtcatgtattcgtcgatttttcatgttttgccaagtatatgtctgtgtaacaataagtggtagccaccaatgtattcatgtatataga |
200 |
Q |
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| T |
1831454 |
aactttcattcagtcatgtattcgtcgatttttcatgttttgccaagtatatgtctgtgtaacaataagtggtagccaccaatgtattcatgtatataga |
1831355 |
T |
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| Q |
201 |
ttagtattgtcaaataacaactataacatcgatgtagtatagctgaatttaaacaaaccgttattattttgtgatacaatatctagaagtgttgtcaaat |
300 |
Q |
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| T |
1831354 |
ttagtattgtcaaataacaactataacatcgatgtagtatagctgaatttaaacaaaccgttattattttgtgatacaatatctagaagtgttgtcaaat |
1831255 |
T |
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| Q |
301 |
agcagctataaaacactgtaacattgaaaattttgaattatttatattttccacgagtcattattgacat |
370 |
Q |
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| T |
1831254 |
agcagctataaaacactgtaacattgaaaattttgaattatttatattttccacgagtcattattgacat |
1831185 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1865997 - 1865628
Alignment:
| Q |
1 |
tattgagtgtaagccataccaagatatctatgatatggtatatgatactattttctgtaacaatagcctaaagttgcctacaattggctcgtaataacaa |
100 |
Q |
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| T |
1865997 |
tattgagtgtaagccataccaagatatctatgatatggtatatgatactattttctgtaacaatagcctaaagttgcctacaattggttcgtaataacaa |
1865898 |
T |
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| Q |
101 |
aactttcattcagtcatgtattcgtcgatttttcatgttttgccaagtatatgtctgtgtaacaataagtggtagccaccaatgtattcatgtatataga |
200 |
Q |
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| T |
1865897 |
aactttcattcagtcatgtattcgtcgatttttcatgttttgccaagtatatgtctgtgtaacaataagtggtagccaccaatgtattcatgtatataga |
1865798 |
T |
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| Q |
201 |
ttagtattgtcaaataacaactataacatcgatgtagtatagctgaatttaaacaaaccgttattattttgtgatacaatatctagaagtgttgtcaaat |
300 |
Q |
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| T |
1865797 |
ttagtattgtcaaataacaactataacatcgatgtagtatagctgaatttaaacaaaccgttattattttgtgatacaatatctagaagtgttgtcaaat |
1865698 |
T |
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| Q |
301 |
agcagctataaaacactgtaacattgaaaattttgaattatttatattttccacgagtcattattgacat |
370 |
Q |
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| T |
1865697 |
agcagctataaaacactgtaacattgaaaattttgaattatttatattttccacgagtcattattgacat |
1865628 |
T |
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