View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1955_low_5 (Length: 396)

Name: NF1955_low_5
Description: NF1955
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1955_low_5
NF1955_low_5
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (65-317)||(4154570-4154822)
chr8 (164-313)||(4154282-4154432)
chr8 (81-317)||(9620596-9620832)
chr8 (174-318)||(3038301-3038447)
chr8 (174-317)||(3669689-3669834)
chr8 (174-318)||(25561826-25561973)
chr8 (173-318)||(34835210-34835357)
chr8 (180-317)||(40518584-40518723)
chr8 (189-317)||(41972160-41972293)
chr8 (174-318)||(34834877-34835023)
chr8 (203-317)||(45121952-45122066)
chr8 (202-317)||(9608747-9608862)
chr8 (202-316)||(147454-147568)
chr8 (205-317)||(8918808-8918920)
chr8 (202-317)||(9309357-9309472)
chr8 (202-317)||(45122098-45122213)
chr8 (174-317)||(3670062-3670207)
chr8 (174-317)||(40518071-40518218)
chr8 (180-309)||(18372011-18372142)
chr8 (202-318)||(30359272-30359388)
chr8 (202-318)||(33113408-33113524)
chr8 (220-316)||(40991756-40991852)
chr8 (189-277)||(45122666-45122756)
chr8 (174-317)||(1014256-1014401)
chr8 (174-317)||(30441083-30441232)
chr8 (173-318)||(34835475-34835623)
chr8 (173-318)||(34835741-34835889)
chr8 (189-317)||(5420653-5420783)
chr8 (174-317)||(6876873-6877019)
chr8 (189-312)||(70300-70425)
chr8 (174-256)||(5915930-5916014)
chr8 (202-318)||(30359610-30359726)
chr8 (203-277)||(9483229-9483303)
chr8 (189-317)||(20870599-20870731)
chr8 (205-319)||(37544534-37544648)
chr8 (174-312)||(9482615-9482755)
chr8 (210-318)||(1513964-1514072)
chr8 (184-317)||(5274777-5274912)
chr8 (140-240)||(20995393-20995495)
chr8 (262-317)||(20995502-20995557)
chr8 (214-317)||(9308979-9309084)
chr8 (203-265)||(9507836-9507898)
chr8 (202-296)||(9609108-9609202)
chr8 (215-315)||(18372988-18373085)
chr8 (203-277)||(40579548-40579622)
chr8 (236-297)||(34219208-34219269)
chr8 (140-256)||(32640508-32640627)
chr8 (202-317)||(6731906-6732012)
chr8 (211-317)||(1013921-1014027)
chr8 (202-256)||(6651557-6651611)
chr8 (242-312)||(41416252-41416322)
chr8 (210-316)||(43274828-43274934)
chr8 (280-317)||(147831-147868)
chr8 (165-314)||(2467507-2467656)
chr8 (211-318)||(18372656-18372759)
chr8 (247-316)||(18372785-18372854)
chr8 (207-315)||(43398114-43398225)
chr8 (195-315)||(18380051-18380171)
chr8 (174-297)||(15836411-15836528)
chr8 (242-317)||(33831980-33832055)
chr8 (211-318)||(45121706-45121812)
chr8 (237-287)||(4715308-4715358)
chr8 (220-278)||(11442894-11442952)
chr8 (202-251)||(147888-147937)
chr8 (247-316)||(18372342-18372411)
chr8 (257-317)||(9620384-9620444)
chr8 (205-277)||(32305519-32305591)
chr8 (241-317)||(44358150-44358226)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (173-317)||(30323466-30323610)
chr2 (180-317)||(30313180-30313318)
chr2 (174-318)||(29874034-29874180)
chr2 (211-317)||(33561501-33561607)
chr2 (173-317)||(29873547-29873693)
chr2 (174-317)||(962600-962745)
chr2 (189-315)||(28254265-28254391)
chr2 (180-317)||(36178622-36178761)
chr2 (174-317)||(41283486-41283631)
chr2 (202-318)||(15880264-15880380)
chr2 (202-317)||(14745708-14745823)
chr2 (174-318)||(36005891-36006036)
chr2 (202-317)||(42514651-42514766)
chr2 (202-319)||(6421385-6421502)
chr2 (210-317)||(28531363-28531470)
chr2 (206-313)||(33953816-33953923)
chr2 (109-317)||(35580670-35580879)
chr2 (202-317)||(37105926-37106041)
chr2 (210-317)||(37106190-37106297)
chr2 (202-313)||(40679670-40679781)
chr2 (203-317)||(5543040-5543154)
chr2 (189-317)||(38796644-38796776)
chr2 (202-317)||(41678409-41678525)
chr2 (174-303)||(6422126-6422257)
chr2 (83-316)||(30312792-30313028)
chr2 (202-317)||(5542666-5542781)
chr2 (109-317)||(7598230-7598440)
chr2 (189-312)||(15511521-15511646)
chr2 (203-317)||(31385739-31385853)
chr2 (191-318)||(40733518-40733647)
chr2 (172-314)||(33731653-33731797)
chr2 (202-313)||(14745335-14745446)
chr2 (244-317)||(7598611-7598684)
chr2 (211-317)||(31468800-31468902)
chr2 (220-288)||(2336655-2336723)
chr2 (202-317)||(16542451-16542566)
chr2 (73-221)||(33561745-33561894)
chr2 (234-316)||(31899499-31899581)
chr2 (211-316)||(3594228-3594333)
chr2 (174-256)||(6421794-6421878)
chr2 (202-318)||(6712977-6713094)
chr2 (212-317)||(36178320-36178425)
chr2 (126-306)||(23346250-23346431)
chr2 (202-317)||(33954303-33954417)
chr2 (189-301)||(36178197-36178311)
chr2 (210-317)||(37632646-37632753)
chr2 (189-308)||(40163398-40163520)
chr2 (202-311)||(29676543-29676646)
chr2 (202-261)||(35580479-35580540)
chr2 (214-303)||(28254165-28254254)
chr2 (210-311)||(37895110-37895211)
chr2 (202-318)||(5367456-5367572)
chr2 (212-316)||(12910231-12910335)
chr2 (238-317)||(1769894-1769973)
chr2 (242-317)||(38796299-38796374)
chr2 (174-256)||(6421689-6421773)
chr2 (236-317)||(18204459-18204540)
chr2 (202-314)||(29676908-29677025)
chr2 (234-317)||(12529101-12529184)
chr2 (242-288)||(2323647-2323693)
chr2 (213-318)||(34481267-34481372)
chr2 (202-266)||(3673121-3673185)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (164-317)||(12092483-12092638)
chr6 (184-317)||(6071134-6071269)
chr6 (174-317)||(3409261-3409406)
chr6 (202-317)||(10074404-10074519)
chr6 (174-317)||(14748353-14748494)
chr6 (202-317)||(8481929-8482043)
chr6 (109-317)||(29518505-29518715)
chr6 (109-318)||(16107679-16107892)
chr6 (174-317)||(29518922-29519067)
chr6 (174-317)||(32741181-32741326)
chr6 (109-318)||(16454576-16454787)
chr6 (205-319)||(2377754-2377868)
chr6 (174-306)||(31714683-31714815)
chr6 (203-318)||(2578485-2578599)
chr6 (202-317)||(10074032-10074147)
chr6 (174-318)||(16454908-16455054)
chr6 (174-317)||(2378128-2378273)
chr6 (174-317)||(2579883-2580028)
chr6 (174-317)||(35210206-35210351)
chr6 (202-317)||(3058228-3058343)
chr6 (202-316)||(6999837-6999951)
chr6 (174-317)||(12071702-12071847)
chr6 (202-315)||(3415462-3415575)
chr6 (175-317)||(12085046-12085189)
chr6 (164-313)||(1127366-1127517)
chr6 (202-317)||(10073657-10073770)
chr6 (202-317)||(26544051-26544166)
chr6 (211-314)||(32460630-32460733)
chr6 (189-314)||(2579518-2579645)
chr6 (109-317)||(2578781-2578990)
chr6 (174-317)||(3409662-3409807)
chr6 (174-319)||(2843554-2843702)
chr6 (202-317)||(10911567-10911683)
chr6 (249-317)||(33605656-33605724)
chr6 (210-317)||(593758-593865)
chr6 (203-317)||(1846750-1846864)
chr6 (202-316)||(1950226-1950340)
chr6 (234-318)||(16108064-16108148)
chr6 (210-313)||(9062399-9062501)
chr6 (173-319)||(5832037-5832184)
chr6 (260-309)||(33605985-33606034)
chr6 (239-286)||(5034899-5034946)
chr6 (83-115)||(12092343-12092375)
chr6 (245-288)||(34661693-34661736)
chr6 (174-315)||(17135080-17135223)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (109-317)||(1085562-1085772)
chr7 (164-317)||(7517582-7517737)
chr7 (189-318)||(30245078-30245205)
chr7 (205-317)||(118345-118457)
chr7 (192-317)||(7554027-7554154)
chr7 (202-318)||(30244271-30244387)
chr7 (202-318)||(45434637-45434753)
chr7 (210-317)||(22566711-22566818)
chr7 (202-317)||(37533052-37533166)
chr7 (174-317)||(22567050-22567194)
chr7 (202-318)||(6054561-6054677)
chr7 (109-317)||(8128386-8128597)
chr7 (202-318)||(34218075-34218191)
chr7 (202-313)||(23418-23529)
chr7 (174-317)||(14681512-14681655)
chr7 (202-317)||(16569198-16569313)
chr7 (202-317)||(16596349-16596464)
chr7 (202-317)||(29157567-29157682)
chr7 (174-317)||(40094785-40094930)
chr7 (202-317)||(24177437-24177552)
chr7 (202-312)||(11845198-11845308)
chr7 (202-317)||(37345918-37346035)
chr7 (109-316)||(37533310-37533519)
chr7 (189-317)||(36534812-36534940)
chr7 (189-318)||(45754717-45754847)
chr7 (174-318)||(45433242-45433388)
chr7 (189-278)||(30253533-30253620)
chr7 (189-311)||(19122740-19122863)
chr7 (202-319)||(47129095-47129212)
chr7 (202-313)||(4124129-4124240)
chr7 (234-317)||(28301616-28301699)
chr7 (210-317)||(36939782-36939889)
chr7 (202-316)||(9901648-9901760)
chr7 (248-309)||(10341842-10341903)
chr7 (215-316)||(20599317-20599418)
chr7 (236-316)||(41910669-41910749)
chr7 (189-316)||(24838727-24838857)
chr7 (214-317)||(36622962-36623065)
chr7 (202-317)||(40230332-40230447)
chr7 (210-263)||(1085297-1085350)
chr7 (244-288)||(42282101-42282145)
chr7 (246-317)||(30245496-30245567)
chr7 (218-317)||(43241497-43241596)
chr7 (145-284)||(15902335-15902475)
chr7 (202-250)||(28300294-28300342)
chr7 (246-317)||(30255341-30255412)
chr7 (202-252)||(21416182-21416232)
chr7 (242-280)||(45335547-45335585)
chr7 (126-207)||(30244466-30244547)
chr7 (237-298)||(10342275-10342338)
chr7 (202-250)||(23569043-23569091)
chr7 (249-317)||(30244703-30244771)
chr7 (273-317)||(37345563-37345607)
chr7 (174-231)||(47129457-47129516)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (145-317)||(19283437-19283611)
chr1 (189-318)||(26661548-26661679)
chr1 (174-317)||(1188599-1188744)
chr1 (202-318)||(17294578-17294694)
chr1 (202-317)||(22077536-22077651)
chr1 (180-317)||(5319982-5320121)
chr1 (180-317)||(22793280-22793420)
chr1 (202-317)||(32594757-32594872)
chr1 (174-317)||(41142374-41142520)
chr1 (189-318)||(26661924-26662055)
chr1 (202-317)||(3550722-3550837)
chr1 (109-315)||(9955911-9956121)
chr1 (174-317)||(44290835-44290981)
chr1 (173-317)||(66099-66245)
chr1 (174-317)||(41156993-41157138)
chr1 (174-317)||(41157377-41157522)
chr1 (205-317)||(44290502-44290614)
chr1 (174-314)||(3537610-3537752)
chr1 (202-317)||(24600355-24600470)
chr1 (202-317)||(34364927-34365042)
chr1 (174-318)||(34649439-34649585)
chr1 (189-318)||(37556112-37556243)
chr1 (180-317)||(66489-66628)
chr1 (202-317)||(1187405-1187520)
chr1 (202-297)||(10351182-10351277)
chr1 (202-317)||(39066241-39066356)
chr1 (204-290)||(22077153-22077239)
chr1 (174-317)||(34364509-34364654)
chr1 (174-317)||(41759485-41759630)
chr1 (225-317)||(41184489-41184581)
chr1 (202-317)||(29798201-29798316)
chr1 (189-317)||(31767187-31767317)
chr1 (210-317)||(40082409-40082515)
chr1 (202-317)||(48588529-48588644)
chr1 (203-317)||(22077871-22077984)
chr1 (174-317)||(24448279-24448424)
chr1 (174-317)||(30630649-30630794)
chr1 (202-316)||(50052064-50052178)
chr1 (180-318)||(38804372-38804512)
chr1 (173-313)||(24131998-24132137)
chr1 (242-317)||(3537228-3537303)
chr1 (202-309)||(3875372-3875479)
chr1 (202-313)||(5575110-5575221)
chr1 (189-316)||(37555733-37555861)
chr1 (174-317)||(37850611-37850756)
chr1 (202-311)||(14318875-14318984)
chr1 (174-256)||(32168709-32168793)
chr1 (205-317)||(44685458-44685570)
chr1 (202-318)||(11977281-11977397)
chr1 (265-317)||(47379889-47379941)
chr1 (244-317)||(45084384-45084457)
chr1 (202-309)||(5528795-5528902)
chr1 (174-317)||(5996883-5997027)
chr1 (126-248)||(47380129-47380254)
chr1 (205-290)||(4956220-4956305)
chr1 (202-275)||(44043813-44043886)
chr1 (174-318)||(45839628-45839778)
chr1 (253-317)||(50556453-50556517)
chr1 (242-317)||(21378122-21378197)
chr1 (202-317)||(45494015-45494135)
chr1 (243-304)||(44091909-44091970)
chr1 (260-317)||(50469180-50469237)
chr1 (253-313)||(4878809-4878869)
chr1 (245-285)||(30576667-30576707)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (184-317)||(39336252-39336385)
chr3 (186-317)||(47964541-47964674)
chr3 (180-318)||(43346808-43346948)
chr3 (109-317)||(15772856-15773066)
chr3 (187-316)||(25317161-25317292)
chr3 (202-317)||(12114603-12114718)
chr3 (174-317)||(21832356-21832499)
chr3 (174-318)||(37990650-37990796)
chr3 (202-318)||(35946523-35946639)
chr3 (202-317)||(22304571-22304686)
chr3 (202-317)||(29644622-29644737)
chr3 (202-317)||(29644943-29645058)
chr3 (174-318)||(37990988-37991134)
chr3 (174-313)||(33803263-33803404)
chr3 (180-317)||(42342405-42342544)
chr3 (202-318)||(52634677-52634792)
chr3 (202-317)||(47964956-47965071)
chr3 (174-300)||(41359776-41359904)
chr3 (211-316)||(46546375-46546480)
chr3 (145-318)||(25755395-25755570)
chr3 (174-318)||(32462911-32463058)
chr3 (211-318)||(33175711-33175821)
chr3 (202-318)||(49336728-49336844)
chr3 (202-317)||(25739466-25739581)
chr3 (203-317)||(39389072-39389186)
chr3 (174-265)||(42342101-42342194)
chr3 (174-317)||(54018209-54018354)
chr3 (213-317)||(1634366-1634471)
chr3 (189-317)||(32589706-32589835)
chr3 (174-310)||(39934966-39935104)
chr3 (202-317)||(54017857-54017972)
chr3 (184-279)||(39335991-39336088)
chr3 (212-317)||(3384317-3384422)
chr3 (253-314)||(36986040-36986101)
chr3 (253-314)||(37011479-37011540)
chr3 (202-318)||(45901714-45901831)
chr3 (205-317)||(4823657-4823769)
chr3 (197-317)||(15773194-15773314)
chr3 (202-317)||(8327906-8328021)
chr3 (202-317)||(39914254-39914369)
chr3 (202-312)||(3135114-3135224)
chr3 (174-317)||(45395664-45395809)
chr3 (174-318)||(22303966-22304105)
chr3 (220-313)||(54451235-54451328)
chr3 (236-316)||(7767389-7767469)
chr3 (202-317)||(53118016-53118130)
chr3 (202-317)||(31190019-31190126)
chr3 (174-316)||(11661954-11662098)
chr3 (202-317)||(9240151-9240266)
chr3 (210-281)||(12749207-12749278)
chr3 (210-261)||(22303708-22303759)
chr3 (210-265)||(52634994-52635049)
chr3 (202-317)||(53577366-53577481)
chr3 (279-317)||(12747870-12747908)
chr3 (203-309)||(42584864-42584970)
chr3 (243-317)||(50612534-50612608)
chr3 (235-317)||(51886563-51886645)
chr3 (274-317)||(2299978-2300021)
chr3 (164-231)||(7766784-7766851)
chr3 (203-249)||(54017590-54017636)
chr3 (255-313)||(54769708-54769766)
chr3 (197-265)||(33362331-33362397)
chr3 (212-264)||(16871010-16871062)
chr3 (203-231)||(41359533-41359561)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (174-317)||(36629239-36629384)
chr4 (202-317)||(28034231-28034346)
chr4 (174-318)||(39792869-39793015)
chr4 (185-314)||(760194-760324)
chr4 (174-318)||(39404019-39404165)
chr4 (174-317)||(25483338-25483483)
chr4 (179-305)||(15841382-15841510)
chr4 (180-317)||(4955332-4955471)
chr4 (202-318)||(34646688-34646804)
chr4 (206-317)||(2741073-2741184)
chr4 (202-317)||(3244490-3244605)
chr4 (70-316)||(34544107-34544349)
chr4 (202-317)||(50630794-50630909)
chr4 (174-317)||(3340809-3340954)
chr4 (202-317)||(2740702-2740817)
chr4 (202-317)||(16888855-16888970)
chr4 (202-317)||(22183303-22183418)
chr4 (174-318)||(39404399-39404545)
chr4 (210-317)||(44620662-44620768)
chr4 (202-317)||(50002428-50002543)
chr4 (202-317)||(55933163-55933278)
chr4 (174-317)||(32941132-32941277)
chr4 (174-317)||(54017604-54017749)
chr4 (164-317)||(52884697-52884853)
chr4 (180-313)||(1731662-1731797)
chr4 (127-283)||(11783515-11783671)
chr4 (184-317)||(23556885-23557020)
chr4 (202-317)||(52884889-52885005)
chr4 (202-317)||(49880162-49880277)
chr4 (174-317)||(41370359-41370504)
chr4 (210-316)||(49302907-49303015)
chr4 (205-265)||(31691206-31691266)
chr4 (202-318)||(41707504-41707619)
chr4 (202-317)||(22028000-22028115)
chr4 (192-304)||(45496820-45496934)
chr4 (202-318)||(54936201-54936313)
chr4 (174-317)||(10245922-10246066)
chr4 (212-318)||(15841034-15841139)
chr4 (202-304)||(54108928-54109029)
chr4 (212-317)||(54741227-54741332)
chr4 (202-318)||(36572020-36572136)
chr4 (234-313)||(11348399-11348478)
chr4 (202-317)||(34004624-34004737)
chr4 (202-317)||(36608700-36608815)
chr4 (211-317)||(3341130-3341236)
chr4 (174-265)||(23817690-23817783)
chr4 (174-316)||(50459724-50459868)
chr4 (180-277)||(22028384-22028483)
chr4 (242-286)||(41603270-41603314)
chr4 (189-310)||(44620362-44620485)
chr4 (210-310)||(44621011-44621111)
chr4 (174-309)||(54343017-54343147)
chr4 (202-317)||(4390140-4390255)
chr4 (202-317)||(16889575-16889690)
chr4 (202-318)||(43174507-43174624)
chr4 (210-318)||(20825837-20825945)
chr4 (202-313)||(6975495-6975606)
chr4 (202-265)||(18932788-18932851)
chr4 (202-313)||(20826223-20826334)
chr4 (180-317)||(54108540-54108678)
chr4 (223-284)||(29802576-29802637)
chr4 (236-317)||(49076521-49076602)
chr4 (203-247)||(11706584-11706628)
chr4 (175-256)||(19504759-19504842)
chr4 (242-317)||(7147721-7147795)
chr4 (211-306)||(54017750-54017845)
chr4 (211-265)||(3271841-3271895)
chr4 (202-252)||(11197293-11197343)
chr4 (259-317)||(12197380-12197438)
chr4 (242-290)||(31249937-31249985)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (189-317)||(36568595-36568723)
chr5 (234-317)||(31509625-31509708)
chr5 (174-317)||(18603131-18603276)
chr5 (186-317)||(36521919-36522052)
chr5 (202-318)||(1028558-1028674)
chr5 (203-317)||(299491-299605)
chr5 (174-317)||(40296326-40296471)
chr5 (180-317)||(13415777-13415916)
chr5 (202-318)||(26074613-26074729)
chr5 (202-305)||(31509745-31509849)
chr5 (202-313)||(9498695-9498806)
chr5 (174-318)||(34753036-34753182)
chr5 (174-317)||(32487396-32487540)
chr5 (174-317)||(36492228-36492373)
chr5 (202-316)||(36522278-36522392)
chr5 (210-318)||(6224197-6224305)
chr5 (180-313)||(41170640-41170775)
chr5 (202-317)||(26074187-26074302)
chr5 (202-317)||(41632784-41632899)
chr5 (68-316)||(3622795-3623035)
chr5 (174-317)||(6500453-6500597)
chr5 (202-318)||(26075202-26075319)
chr5 (174-318)||(42405609-42405753)
chr5 (202-317)||(6500825-6500939)
chr5 (202-316)||(25327938-25328052)
chr5 (184-318)||(26074802-26074939)
chr5 (202-317)||(624198-624313)
chr5 (202-317)||(3295056-3295170)
chr5 (202-317)||(15370101-15370216)
chr5 (203-317)||(24489248-24489360)
chr5 (189-317)||(27502062-27502192)
chr5 (202-317)||(35150009-35150123)
chr5 (174-316)||(3295356-3295498)
chr5 (211-312)||(11417027-11417128)
chr5 (202-307)||(33747783-33747888)
chr5 (202-314)||(38427553-38427664)
chr5 (202-317)||(623820-623935)
chr5 (210-317)||(12662701-12662808)
chr5 (242-317)||(26074320-26074395)
chr5 (202-317)||(26590951-26591066)
chr5 (202-317)||(29549296-29549411)
chr5 (202-275)||(15370446-15370519)
chr5 (242-316)||(9510601-9510675)
chr5 (277-318)||(36527199-36527240)
chr5 (212-316)||(2411010-2411114)
chr5 (165-290)||(19275558-19275683)
chr5 (246-288)||(6557471-6557513)
chr5 (202-288)||(32445916-32446002)
chr5 (224-318)||(42508613-42508707)
chr5 (202-252)||(13042606-13042656)
chr5 (126-262)||(36527054-36527196)
chr5 (212-277)||(6557098-6557163)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (205-319)||(558-672)
scaffold0702 (249-317)||(230-298)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (70-317)||(39459-39705)
scaffold0113 (254-317)||(39840-39903)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (202-317)||(5359-5474)
scaffold0078 (174-317)||(4984-5129)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (202-318)||(1147-1263)
scaffold0391 (202-265)||(1732-1795)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (234-317)||(5779-5862)
scaffold0734 (202-317)||(5398-5514)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (203-317)||(17496-17612)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (242-319)||(10192-10269)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (225-288)||(3109-3172)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (202-317)||(47362-47477)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 65 - 317
Target Start/End: Original strand, 4154570 - 4154822
Alignment:
Q  65 attattctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4154570 attattctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccactgttgggtcatgaagggagtccgag 4154669  T
Q  165 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttata 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4154670 ggaccactcacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttata 4154769  T
Q  265 aagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154770 aagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 4154822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 313
Target Start/End: Original strand, 4154282 - 4154432
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4154282 gggaccacccacatctaggccagagcaaccaaacaattgagagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcactt 4154380  T
Q  262 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4154381 ataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacatataactcaca 4154432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 317
Target Start/End: Original strand, 9620596 - 9620832
Alignment:
Q  81 aagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatcta 180  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |  || ||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||||||    ||||| |    
T  9620596 aagactttcgacacaaggatccgatagaacccttcgtcgaaccacaactctgataccatcgttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatcca 9620695  T
Q  181 ggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 278  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  |  || |||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9620696 ggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttc 9620793  T
Q  279 cacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  9620794 tacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttg 9620832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 3038301 - 3038447
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  3038301 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgtt 3038400  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3038401 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 3038447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3669834 - 3669689
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  3669834 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 3669735  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3669734 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 25561826 - 25561973
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  25561826 acatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 25561925  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25561926 tcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 25561973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34835357 - 34835210
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835357 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835258  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34835257 tcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgt 34835210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40518723 - 40518584
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  40518723 aggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacct 40518624  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518623 ttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41972293 - 41972160
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaa---aaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 283  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  41972293 caaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttactt 41972194  T
Q  284 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41972193 ttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 41972160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34835023 - 34834877
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |    
T  34835023 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 34834924  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
     |||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34834923 taacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgt 34834877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 45121952 - 45122066
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||  |||||||||||    
T  45121952 agagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggaca 45122051  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  45122052 tataactcacacttg 45122066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9608862 - 9608747
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  9608862 gagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 9608763  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  9608762 atataactcacacttg 9608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 147568 - 147454
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  147568 gagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 147469  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  147468 atataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Original strand, 8918808 - 8918920
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||||||||||     
T  8918808 agacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatg 8918907  T
Q  305 taactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||    
T  8918908 taactcacacttg 8918920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9309472 - 9309357
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  9309472 gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggac 9309373  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  9309372 atataactcacacttg 9309357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 45122098 - 45122213
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  45122098 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 45122197  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  45122198 atataactcacacttg 45122213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3670207 - 3670062
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  3670207 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgtt 3670108  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     |||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3670107 aaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40518218 - 40518071
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | |||||||| ||| |    
T  40518218 acatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgtt 40518119  T
Q  272 caacctccac--ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||  |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518118 caacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 18372011 - 18372142
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18372011 aggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 18372110  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
      ||| || |||  ||||||| ||||||||||    
T  18372111 ttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30359388 - 30359272
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  30359388 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac 30359289  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359288 atataactcacacttgt 30359272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 33113408 - 33113524
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  33113408 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 33113507  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||| ||||||    
T  33113508 atataactcaaacttgt 33113524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  220 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45122756 - 45122666
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  45122756 caaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 45122666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 1014256 - 1014401
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |    
T  1014256 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgtt 1014355  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1014356 caacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttg 1014401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30441232 - 30441083
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta----taaag 267  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||    ||| |    
T  30441232 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaagg 30441133  T
Q  268 tgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    || |||||||  ||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30441132 tgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttg 30441083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34835623 - 34835475
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835623 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835524  T
Q  271 tcaacctccacttttctatc-agatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    | |||||  ||| || ||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  34835523 taaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgt 34835475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34835889 - 34835741
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  34835889 tacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 34835790  T
Q  271 tcaacctccacttttctatc-agatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    | |||||  ||| || ||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  34835789 taaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgt 34835741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5420783 - 5420653
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||  ||| |||    
T  5420783 caaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattc 5420684  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5420683 tatccgatgtgggacatataatacacacttg 5420653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 6876873 - 6877019
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |    
T  6876873 acatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgtt 6876972  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggac-atataactcacacttg 317  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6876973 caacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttg 6877019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 312
Target Start/End: Original strand, 70300 - 70425
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| ||     
T  70300 caaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacatttactcttt 70399  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcac 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  70400 tatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5916014 - 5915930
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5916014 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctct 5915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30359726 - 30359610
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  30359726 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagac 30359627  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  30359626 atataactcacacttgt 30359610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 9483229 - 9483303
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  9483229 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 9483303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 20870599 - 20870731
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| ||     
T  20870599 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattt 20870698  T
Q  287 tatcagatgtgggac--atataactcacacttg 317  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20870699 tatctgatgtggaacatatataactcacacttg 20870731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Original strand, 37544534 - 37544648
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||| ||    
T  37544534 agacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgactta 37544633  T
Q  305 taactcacacttgtg 319  Q
    |||||||||||||||    
T  37544634 taactcacacttgtg 37544648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 9482615 - 9482755
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  9482615 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 9482714  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 312  Q
    ||||||  ||| || ||||  |||||| |||||||||||||    
T  9482715 caacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Original strand, 1513964 - 1514072
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  1513964 ccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataact 1514063  T
Q  310 cacacttgt 318  Q
    || ||||||    
T  1514064 catacttgt 1514072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5274912 - 5274777
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagcga--gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 281  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||  |    
T  5274912 cagagcaacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctcc 5274813  T
Q  282 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| |||   |||| | |||||||||||| |||||    
T  5274812 ttttttattcaatgtagaacatataactcatacttg 5274777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 240
Target Start/End: Original strand, 20995393 - 20995495
Alignment:
Q  140 tgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggca 237  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  20995393 tgttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 20995492  T
Q  238 atg 240  Q
    |||    
T  20995493 atg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995557
Alignment:
Q  262 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 20995557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9309084 - 9308979
Alignment:
Q  214 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg--ggacatataactca 311  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| || |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9309084 actcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactca 9308985  T
Q  312 cacttg 317  Q
    ||||||    
T  9308984 cacttg 9308979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9507898 - 9507836
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  9507898 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataa 9507836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9609202 - 9609108
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||    
T  9609202 gagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttacttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 315
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  215 ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 40579548 - 40579622
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  40579548 agagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 40579622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 297
Target Start/End: Original strand, 34219208 - 34219269
Alignment:
Q  236 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 297  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  34219208 caataagtttatggatcctctctcttataaagtgttcaacctccacttttctaaccgatgtg 34219269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 32640508 - 32640627
Alignment:
Q  140 tgtttggtcatgaagggag-tccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggc 236  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||| |||| ||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  32640508 tgtttggtcatgaggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggc 32640607  T
Q  237 aatgagtttatgggtcctct 256  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  32640608 aatgggtttatcggtcctct 32640627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6732012 - 6731906
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||         |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  6732012 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt---------tcaacctttactattttatccgatgtgggac 6731922  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  6731921 atataactcacacttg 6731906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 317
Target Start/End: Original strand, 1013921 - 1014027
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  1013921 cacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactc 1014020  T
Q  311 acacttg 317  Q
    |||||||    
T  1014021 acacttg 1014027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6651611 - 6651557
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  6651611 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctct 6651557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 312
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 312  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 316
Target Start/End: Original strand, 43274828 - 43274934
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| || |||| ||||||  ||||||||||    
T  43274828 ccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatataact 43274927  T
Q  310 cacactt 316  Q
    |||||||    
T  43274928 cacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 147868 - 147831
Alignment:
Q  280 acttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147868 acttttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2467656 - 2467507
Alignment:
Q  165 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 262  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||  | |||||||| |||||| ||||| ||||| ||  | ||| ||||||||| |  |||||||  |    
T  2467656 ggaccacatacatctaggctaaagcaaccatacaagtgagagagacgtcacacttttaccaaaaactttaagacaacgagtttatgtgctctctcac--a 2467559  T
Q  263 taaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    || |||| ||||| || | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  2467558 tatagtgttcaacttctaattttctatccgacgtgagacatataactcacac 2467507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 318
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372759
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||| || |||| ||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttat-aagtgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  311 acacttgt 318  Q
    ||||||||    
T  18372752 acacttgt 18372759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  247 tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 315
Target Start/End: Original strand, 43398114 - 43398225
Alignment:
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg---tcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacat 303  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||   |||||| | |||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| || || ||    
T  43398114 acgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatat 43398213  T
Q  304 ataactcacact 315  Q
    ||||||||||||    
T  43398214 ataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 315
Target Start/End: Original strand, 18380051 - 18380171
Alignment:
Q  195 cacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagat 294  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  || | || |||||| || || || |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  |||    
T  18380051 cacaagcaagaggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgat 18380150  T
Q  295 gtgggacatataactcacact 315  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18380151 gtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 297
Target Start/End: Original strand, 15836411 - 15836528
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 273  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || |||| ||| | |||| |||  |||||||||| |||||    |||||||  ||||||| |||    
T  15836411 acatctaggccatatcaacaacataagcgagagacaccgcacttttatctaaaatcttaaggcaatgagtctatgg----tctcact--taaagtgttca 15836504  T
Q  274 acctccacttttctatcagatgtg 297  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15836505 acctccactttactatcggatgtg 15836528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831980
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |   | ||| |||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttg 33831980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 318
Target Start/End: Original strand, 45121706 - 45121812
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  |  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||| | |||||    
T  45121706 cacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactc 45121804  T
Q  311 acacttgt 318  Q
    ||||||||    
T  45121805 acacttgt 45121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4715358 - 4715308
Alignment:
Q  237 aatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttct 287  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4715358 aatgagtttatagatcgtctcatttataaagtgttcaacctccacttttct 4715308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442894
Alignment:
Q  220 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 278  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcacttgtatgttgctcaacctc 11442894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 147937 - 147888
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggt 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  147937 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  247 tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 9620384 - 9620444
Alignment:
Q  257 cacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||    
T  9620384 cacttataaagtgttcaaactccacttttctattcaacgtgggatatataactgacacttg 9620444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32305591 - 32305519
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  || |||| |||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  32305591 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacct 32305519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Original strand, 44358150 - 44358226
Alignment:
Q  241 agtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||||    
T  44358150 agtttatgagtcatctcacttataaaatggtcaacattcacttttttatctgatgtgagacatgttactgacacttg 44358226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30323610 - 30323466
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 272  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  30323610 tacatccagaccagagcaacaacacaaatgagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttc 30323511  T
Q  273 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30323510 aacctccaattttctatctgatttgggacatataacacacacttg 30323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30313318 - 30313180
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30313318 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttat-aagtgttcaacct 30313220  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30313219 ccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttg 30313180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 29874034 - 29874180
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |    
T  29874034 acatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgtt 29874133  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29874134 caacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttgt 29874180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 211 - 317
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561607
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  311 acacttg 317  Q
    |||||||    
T  33561601 acacttg 33561607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 29873547 - 29873693
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  29873547 tacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgt 29873646  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  29873647 tcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttg 29873693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 962745 - 962600
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  962745 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 962646  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  962645 caacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 962600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Original strand, 28254265 - 28254391
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||    
T  28254265 caaccccacaagagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttcta 28254364  T
Q  289 tcagatgtgggacatataactcacact 315  Q
    || |||||||||||||||| |||||||    
T  28254365 tccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 36178622 - 36178761
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  36178622 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 36178721  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36178722 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 41283486 - 41283631
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41283486 acatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41283585  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41283586 caacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttg 41283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15880380 - 15880264
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  15880380 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaac 15880281  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  15880280 atataactcacacttgt 15880264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 14745708 - 14745823
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  14745708 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 14745807  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  14745808 atataactcacacttg 14745823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 36005891 - 36006036
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  36005891 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36005990  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| |  || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005991 caacttttac-tttctattcgatgtgggacatataactcacacttgt 36006036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42514766 - 42514651
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  42514766 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggac 42514667  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  42514666 atataactcacacttg 42514651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6421502 - 6421385
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  6421502 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 6421403  T
Q  302 atataactcacacttgtg 319  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6421402 atataactcacacttgtg 6421385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 28531363 - 28531470
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28531363 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataact 28531462  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  28531463 cacacttg 28531470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 313
Target Start/End: Original strand, 33953816 - 33953923
Alignment:
Q  206 gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||  |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33953816 gacgtcacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttat 33953915  T
Q  306 aactcaca 313  Q
    ||||||||    
T  33953916 aactcaca 33953923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Original strand, 35580670 - 35580879
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||   ||||||| | ||||||    ||||| |||| ||| ||||| ||||| |  |||||    
T  35580670 acccttcgtcgaaccggggctctgataccattattgggtcattgggggagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagag 35580769  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |  | | || |||| |||||||||||||||    
T  35580770 acgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcacttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatata 35580868  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    |||||||||||    
T  35580869 actcacacttg 35580879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37106041 - 37105926
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  37106041 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 37105942  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  37105941 atataactcacacttg 37105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37106297 - 37106190
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  37106297 ccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 37106198  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  37106197 cacacttg 37106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 40679670 - 40679781
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  40679670 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggac 40679769  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  40679770 atataactcaca 40679781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 5543040 - 5543154
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  5543040 agagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggaca 5543139  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  5543140 tataactcacacttg 5543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 38796644 - 38796776
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcga--gagacgccaca--ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 284  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | |    
T  38796644 caaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgt 38796743  T
Q  285 tctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796744 tttatcagatgtgggacatataactcacacttg 38796776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 41678409 - 41678525
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  41678409 gagagacgttacactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagac 41678507  T
Q  302 --atataactcacacttg 317  Q
      ||||||||||||||||    
T  41678508 atatataactcacacttg 41678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6422257 - 6422126
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  6422257 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgtt 6422158  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacat 303  Q
    ||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  6422157 caacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30313028 - 30312792
Alignment:
Q  83 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaact-cggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctag 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |  || |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||||  ||||  ||    
T  30313028 gactttcgacacaaggagccggtcgaactcttcc-cgaaaccacaactctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccacccacattcag 30312930  T
Q  182 gccagagcaaccacacaa---gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 278  Q
    |||||||||||| |||||   | |||||||  |||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  30312929 gccagagcaaccgcacaaattgagagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacctc 30312830  T
Q  279 cac-ttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  30312829 cactttttctat-tgatgtggggcatataacacacactt 30312792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 5542666 - 5542781
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  ||| ||||||    
T  5542666 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggac 5542765  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  5542766 atataactcacacttg 5542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7598440 - 7598230
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga- 207  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||||  |  ||||||  | ||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||     
T  7598440 acccttcgtcgaacctgggctttgataccagtgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagag 7598341  T
Q  208 -cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
     | ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| | |||||  ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  7598340 acaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatata 7598241  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    | |||||||||    
T  7598240 attcacacttg 7598230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 312
Target Start/End: Original strand, 15511521 - 15511646
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  15511521 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactcttt 15511620  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcac 312  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||    
T  15511621 tatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31385853 - 31385739
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||  |||     
T  31385853 agagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttctaaccgatgtcagact 31385754  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    | |||||||||||||    
T  31385753 tctaactcacacttg 31385739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40733647 - 40733518
Alignment:
Q  191 accacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  ||   |  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  |||||| ||    
T  40733647 accacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactttttta 40733548  T
Q  289 tcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733547 tctgatgtgggacatataactcacacttgt 40733518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33731797 - 33731653
Alignment:
Q  172 ttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtg 269  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  33731797 ttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtg 33731698  T
Q  270 ctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    ||||||||  ||| || |||| |||||| || |||||||||||||    
T  33731697 ctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 14745335 - 14745446
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||   ||| || |||  ||||||||||    
T  14745335 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggac 14745434  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  14745435 atataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7598684 - 7598611
Alignment:
Q  244 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7598684 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 7598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 317
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468902
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||  |  |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcct----cttataagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  311 acacttg 317  Q
    |||||||    
T  31468896 acacttg 31468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336655
Alignment:
Q  220 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacctccacttttcta 2336655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16542566 - 16542451
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  16542566 gagagatgctacactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 16542467  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
     |||||||||||||||    
T  16542466 ttataactcacacttg 16542451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 33561745 - 33561894
Alignment:
Q  73 ttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccact 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||  |||| ||||||||||||| | |||  |  |||  |||||||||| ||    
T  33561745 ttgtcaagaagactttcgaaacaaggagtcggttgtaccctttgtcg-aaccaggctctgataccattgttggttcacaagaggaacccgagggaccgct 33561843  T
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttac 221  Q
     | |||||| |||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  33561844 catatctagtccagagcaaccatacaagtgagagagacaccacactcttac 33561894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 316
Target Start/End: Original strand, 31899499 - 31899581
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31899499 ggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 316
Target Start/End: Original strand, 3594228 - 3594333
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||    
T  3594228 cacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcacttataaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactc 3594327  T
Q  311 acactt 316  Q
    ||||||    
T  3594328 acactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6421878 - 6421794
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  6421878 acatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctct 6421794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6713094 - 6712977
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| ||    
T  6713094 gagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgaga 6712995  T
Q  301 catataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6712994 catataactcacacttgt 6712977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178425
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||  ||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  312 cacttg 317  Q
    ||||||    
T  36178420 cacttg 36178425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23346431 - 23346250
Alignment:
Q  126 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc 223  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||  || | ||||    |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||     
T  23346431 ggctctgataccattgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccg 23346332  T
Q  224 aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||| | |||||  ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23346331 aaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 33954303 - 33954417
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||  || |||||| ||| | | | ||||| | || | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33954303 gagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggcataga-tttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtgggac 33954401  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  33954402 atataactcacacttg 33954417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 301
Target Start/End: Original strand, 36178197 - 36178311
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| | || |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  36178197 caaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattt 36178296  T
Q  287 tatcagatgtgggac 301  Q
    |||| ||||||||||    
T  36178297 tatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 37632646 - 37632753
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  37632646 ccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 37632745  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  37632746 cacacttg 37632753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Original strand, 40163398 - 40163520
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttgggg-caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 285  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||   | || |  ||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  40163398 caaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactttt 40163497  T
Q  286 ctatcagatgtgggacatataac 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  40163498 ctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29676646 - 29676543
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||  ||| || ||||  ||||| |||    
T  29676646 gagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagac 29676553  T
Q  302 atataactca 311  Q
    ||||||||||    
T  29676552 atataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 261
Target Start/End: Original strand, 35580479 - 35580540
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactct--tacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35580479 gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcacactt 35580540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  214 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacat 303  Q
    |||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Original strand, 37895110 - 37895211
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || || | |||| ||| ||  ||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37895110 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatataact 37895209  T
Q  310 ca 311  Q
    ||    
T  37895210 ca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5367572 - 5367456
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||| || ||| |||||||| ||| |||||||   || || |||| ||| ||||||    
T  5367572 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttgctcttttatccgatctgggac 5367473  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||  ||||||||||    
T  5367472 atatatatcacacttgt 5367456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||  ||| | |||||||||| | | |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  312 cactt 316  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1769973 - 1769894
Alignment:
Q  238 atgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1769973 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 1769894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796374
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 38796374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6421773 - 6421689
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||    
T  6421773 acatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctct 6421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 18204459 - 18204540
Alignment:
Q  236 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| | |||||||||||||    
T  18204459 caatgagtttatgggtcctttcatttattaaatgctcaatctccgcttttctaaccgacttgggacttctaactcacacttg 18204540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29677025 - 29676908
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc-----ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 296  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||||     ||||||| ||||| ||| | |||||  ||| || |||| |||||    
T  29677025 gagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 29676926  T
Q  297 gggacatataactcacac 314  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29676925 gggacatataactcacac 29676908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Original strand, 12529101 - 12529184
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||| ||  ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12529101 ggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttg 12529184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2323693 - 2323647
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2323693 gtttatggatcctctcacttataaagtgtccaacctccatttttcta 2323647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34481372 - 34481267
Alignment:
Q  213 cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcac 312  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| | ||||| | | || ||| ||||||| |  ||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||     
T  34481372 cactcttacccaaaaccttaaagcaataaatttatagattctatcatttataaaatattcaacctccacttttatatccgacgtgagaaatataactcat 34481273  T
Q  313 acttgt 318  Q
    ||||||    
T  34481272 acttgt 34481267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3673185 - 3673121
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 266  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3673185 gagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaa 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Original strand, 12092483 - 12092638
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12092483 gggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcactt 12092582  T
Q  262 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||    
T  12092583 ataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttg 12092638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6071269 - 6071134
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6071269 cagagcaaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccac 6071170  T
Q  282 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  6071169 ttttctattcaatgtgggacatataactcacacttg 6071134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3409406 - 3409261
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  3409406 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3409307  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3409306 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3409261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 10074404 - 10074519
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10074404 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggac 10074503  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
     | |||||||||||||    
T  10074504 ctctaactcacacttg 10074519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 14748353 - 14748494
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 273  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||    
T  14748353 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagac--cacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttca 14748450  T
Q  274 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14748451 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 14748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8482043 - 8481929
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8482043 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-ggac 8481945  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  8481944 atataactcacacttg 8481929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29518715 - 29518505
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| ||||  ||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  29518715 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 29518616  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  29518615 acaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 29518516  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    |||||||||||    
T  29518515 actcacacttg 29518505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16107892 - 16107679
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtca-tgaaggg-agtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gag 204  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  | || |||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  16107892 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactgaaggggagttaggggtaccacccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagag 16107793  T
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||  |||||    
T  16107792 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacacata 16107693  T
Q  305 taactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||    
T  16107692 taactcacacttgt 16107679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29519067 - 29518922
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  29519067 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 29518968  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29518967 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32741326 - 32741181
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  32741326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 32741227  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32741226 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16454787 - 16454576
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  16454787 acccttcgtcgaacctgggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 16454688  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  | | || |||| ||||||||||| |||    
T  16454687 acgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacata 16454588  T
Q  307 actcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||    
T  16454587 actcacacttgt 16454576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2377868 - 2377754
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || || | |||||||||||||    
T  2377868 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 2377769  T
Q  305 taactcacacttgtg 319  Q
    |||||||||||||||    
T  2377768 taactcacacttgtg 2377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31714815 - 31714683
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga-cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 272  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  | ||    
T  31714815 acatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttc 31714717  T
Q  273 aacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31714716 aacctccacttttctatccgatgtaggacatata 31714683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Original strand, 2578485 - 2578599
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| | |||||||||    
T  2578485 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggaca 2578583  T
Q  303 tataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  2578584 tataactcacacttgt 2578599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 10074032 - 10074147
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||     
T  10074032 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggat 10074131  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10074132 atataactcacccttg 10074147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16455054 - 16454908
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||| |    
T  16455054 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgtt 16454955  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16454954 caacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgt 16454908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2378273 - 2378128
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  2378273 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 2378174  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2378173 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 2579883 - 2580028
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  2579883 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtt 2579982  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579983 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2580028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35210351 - 35210206
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  35210351 acatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgtt 35210252  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  35210251 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 35210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3058343 - 3058228
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3058343 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3058244  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  3058243 atataactaacacttg 3058228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Original strand, 6999837 - 6999951
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||| |  |||||| |||| ||||| ||||    
T  6999837 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggac 6999936  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6999937 atataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 12071702 - 12071847
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  ||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| |    
T  12071702 acatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgtt 12071801  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  12071802 caaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttg 12071847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3415575 - 3415462
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  3415575 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggac 3415476  T
Q  302 atataactcacact 315  Q
    ||||||||||||||    
T  3415475 atataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 12085046 - 12085189
Alignment:
Q  175 catctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 272  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||| ||||| ||  |||||||||| ||    
T  12085046 catcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttc 12085145  T
Q  273 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    || |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  12085146 aaactccac-tttctatctgatgcaggacatataactcacacttg 12085189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1127517 - 1127366
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1127517 gggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttactt 1127418  T
Q  262 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||| ||| |||||||  ||| || || | ||||||||| ||||||||||||    
T  1127417 ataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 10073657 - 10073770
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  10073657 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttc--tccgatgtgggac 10073754  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  10073755 atataactaacacttg 10073770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26544166 - 26544051
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  26544166 gagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 26544067  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  26544066 atataactcacacttg 26544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 314
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  311 acac 314  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 314
Target Start/End: Original strand, 2579518 - 2579645
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   | ||||  ||||||     
T  2579518 caaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttt 2579617  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  2579618 tgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Original strand, 2578781 - 2578990
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcga--gag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||   |||||| ||||| | | ||||||    ||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||    
T  2578781 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgattcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagag 2578880  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||  ||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  2578881 acaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttactttt-tatccgatgagggacatata 2578979  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    | |||||||||    
T  2578980 aatcacacttg 2578990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3409807 - 3409662
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  3409807 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 3409708  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409707 caacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttg 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2843702 - 2843554
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat-gggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||     
T  2843702 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgt 2843603  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 319  Q
    ||||| |  | | || |||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  2843602 tcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgtg 2843554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10911683 - 10911567
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac-ttttctatcagatgtggga 300  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  || |||| |||| ||||| |||    
T  10911683 gagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtagga 10911584  T
Q  301 catataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  10911583 catataactcacacttg 10911567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33605724 - 33605656
Alignment:
Q  249 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  33605724 ggtcttctcaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgagacatatagctcacacttg 33605656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 593758 - 593865
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  593758 ccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaact 593857  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  593858 cacacttg 593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1846864 - 1846750
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||||    
T  1846864 agagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagaca 1846765  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    || || |||||||||    
T  1846764 tagaattcacacttg 1846750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Original strand, 1950226 - 1950340
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |   ||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  1950226 gagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 1950325  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  1950326 atataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16108148 - 16108064
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16108148 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgt 16108064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 9062399 - 9062501
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  9062399 ccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 9062497  T
Q  310 caca 313  Q
    ||||    
T  9062498 caca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 319
Target Start/End: Original strand, 5832037 - 5832184
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaacctt--ggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagt 268  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||   ||  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  5832037 tacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg---tggctttatgggtcctcttacttataaggt 5832133  T
Q  269 gctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 319  Q
    | |||||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5832134 gttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtg 5832184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33606034 - 33605985
Alignment:
Q  260 ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33606034 ttataaagtgttcaacctccacttttctattcgatgtgggacatataact 33605985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Original strand, 5034899 - 5034946
Alignment:
Q  239 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5034899 tgagttgatgggtcatctcacttataaagtggtcaacctccacttttc 5034946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 115
Target Start/End: Original strand, 12092343 - 12092375
Alignment:
Q  83 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092343 gactttcgatacaaggagccggttgaacccttc 12092375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Original strand, 34661693 - 34661736
Alignment:
Q  245 tatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34661693 tatgggttctcttacttataaagtgatcaacctccacttttcta 34661736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Original strand, 17135080 - 17135223
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||  || |||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||  |    
T  17135080 acatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtatt 17135179  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacact 315  Q
     ||| |  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17135180 aaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Original strand, 1085562 - 1085772
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||| ||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||||    ||||| |||| ||| ||||||||||||   |||||    
T  1085562 acccttcatcgaaccggggctatgataccactgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagag 1085661  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  1085662 acgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 1085761  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    |||||||||||    
T  1085762 actcacacttg 1085772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7517737 - 7517582
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7517737 gggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 7517638  T
Q  262 ataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7517637 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 7517582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30245205 - 30245078
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||    
T  30245205 caaccacacaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactctttta 30245108  T
Q  289 tcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30245107 tccgatgtggaacatataactcacacttgt 30245078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Original strand, 118345 - 118457
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  118345 agacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacata 118444  T
Q  305 taactcacacttg 317  Q
    ||||| |||||||    
T  118445 taacttacacttg 118457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554027
Alignment:
Q  192 ccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctat 289  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  290 cagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttg 7554027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30244387 - 30244271
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  30244387 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 30244288  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  30244287 atataactcacacttgt 30244271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45434753 - 45434637
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  45434753 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggac 45434654  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||| ||||||||    
T  45434653 atataacttacacttgt 45434637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566818
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  22566811 cacacttg 22566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 37533052 - 37533166
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  37533052 gagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggac 37533150  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  37533151 atataactcacacttg 37533166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 22567050 - 22567194
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  22567050 acatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 22567149  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22567150 caacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttg 22567194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6054677 - 6054561
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| |||||| |||    
T  6054677 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagac 6054578  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||| ||||||||    
T  6054577 atataactaacacttgt 6054561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Original strand, 8128386 - 8128597
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtca-tgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag- 206  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||| || |||||   | ||||| | || ||| |||||||| |||||||||     
T  8128386 acccttcgtcgaaccagggctttgataccactgttgggttagtgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagt 8128485  T
Q  207 -acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 305  Q
     || ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  8128486 gacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatat 8128585  T
Q  306 aactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||    
T  8128586 aactcacacttg 8128597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 34218075 - 34218191
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||| |||| |||||| |||    
T  34218075 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagac 34218174  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||| ||||    
T  34218175 atataactcacatttgt 34218191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 23418 - 23529
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  23418 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaac 23517  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  23518 atataactcaca 23529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14681655 - 14681512
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 273  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||| |||    
T  14681655 acatcaaggctagaacaaccacacttgtgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttca 14681556  T
Q  274 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14681555 acctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttg 14681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16569313 - 16569198
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  16569313 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16569214  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  16569213 atataactcacacttg 16569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 16596349 - 16596464
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  16596349 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16596448  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  16596449 atataactcacacttg 16596464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29157682 - 29157567
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| | ||||||||    
T  29157682 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggac 29157583  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  29157582 atataactcacacttg 29157567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 40094785 - 40094930
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  40094785 acatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40094884  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     |||||  ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  40094885 gaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttg 40094930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24177552 - 24177437
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||  ||| || |||| ||||||||||    
T  24177552 gagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggac 24177453  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||||| |||||    
T  24177452 atataactcatacttg 24177437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11845308 - 11845198
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||    
T  11845308 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaac 11845209  T
Q  302 atataactcac 312  Q
    |||||||||||    
T  11845208 atataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37346035 - 37345918
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  37346035 gagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatgac 37345936  T
Q  302 --atataactcacacttg 317  Q
      ||||||||||||||||    
T  37345935 atatataactcacacttg 37345918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 316
Target Start/End: Original strand, 37533310 - 37533519
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcga--gag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| || |||||  || ||||||    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |  |||    
T  37533310 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagag 37533409  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||| | |||||||    
T  37533410 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatata 37533509  T
Q  307 actcacactt 316  Q
    ||||||||||    
T  37533510 actcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 36534812 - 36534940
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |  |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || ||    
T  36534812 caaccacacttgtgagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgtttta 36534911  T
Q  289 tcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    || || ||||||||||||| | |||||||    
T  36534912 tccgaggtgggacatataagttacacttg 36534940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45754847 - 45754717
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||| |  ||| ||     
T  45754847 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattt 45754748  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  45754747 tatccgatgt-ggacatataactcacacttgt 45754717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45433388 - 45433242
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| || |||| |||||||| ||| |    
T  45433388 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgtt 45433289  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  45433288 caacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgt 45433242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30253620 - 30253533
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctc 278  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||    
T  30253620 caaccacacaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacctc 30253533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19122863 - 19122740
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  19122863 caaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 19122764  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  19122763 tatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47129212 - 47129095
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||||   | |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  47129212 gagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagac 47129113  T
Q  302 atataactcacacttgtg 319  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47129112 atataactcacacttgtg 47129095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 4124129 - 4124240
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| | ||||| ||||    
T  4124129 gagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtaggac 4124228  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    || ||| |||||    
T  4124229 atgtaattcaca 4124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Original strand, 28301616 - 28301699
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28301616 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 28301699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 36939782 - 36939889
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||  ||| ||||||||||||||    
T  36939782 ccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataact 36939881  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  36939882 cacacttg 36939889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9901760 - 9901648
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| || |||||  || |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  9901760 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctct-acgtataagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggac 9901663  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  9901662 atataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10341903 - 10341842
Alignment:
Q  248 gggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10341903 gggttctcccacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataact 10341842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20599418 - 20599317
Alignment:
Q  215 ctcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| | | |||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20599418 ctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacac 20599319  T
Q  315 tt 316  Q
    ||    
T  20599318 tt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 41910669 - 41910749
Alignment:
Q  236 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41910669 caatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Original strand, 24838727 - 24838857
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcc-tctcacttataaagtgctcaacctccactttt 285  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  24838727 caaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttactctt 24838826  T
Q  286 ctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
     |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838827 ttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36623065 - 36622962
Alignment:
Q  214 actcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||  ||||||||| || | |||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36623065 actcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 36622966  T
Q  314 cttg 317  Q
    ||||    
T  36622965 cttg 36622962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 40230332 - 40230447
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |  |||||| |||  ||||||||||    
T  40230332 gagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggac 40230431  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  40230432 atataacttacacttg 40230447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Original strand, 1085297 - 1085350
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttat 263  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1085297 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttat 1085350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Original strand, 42282101 - 42282145
Alignment:
Q  244 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42282101 ttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttcta 42282145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245496
Alignment:
Q  246 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 30245496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43241596 - 43241497
Alignment:
Q  218 ttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||  | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43241596 ttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 43241497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15902475 - 15902335
Alignment:
Q  145 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 242  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||  || ||||||| ||| ||||||||||  | ||| |||    
T  15902475 ggtcacgaggggagtccgggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgag 15902377  T
Q  243 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 284  Q
     ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15902376 cttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacctccacttt 15902335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 250
Target Start/End: Original strand, 28300294 - 28300342
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  28300294 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggg 28300342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255341
Alignment:
Q  246 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttg 30255341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Original strand, 21416182 - 21416232
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  21416182 gagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 280
Target Start/End: Original strand, 45335547 - 45335585
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcca 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45335547 gtttatgggttctctcacttataaagtgctcaacatcca 45335585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30244547 - 30244466
Alignment:
Q  126 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    ||||| ||||  || |||||||||||| ||||||    
T  30244547 ggctttgataccattgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagaga 30244466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10342338 - 10342275
Alignment:
Q  237 aatgagtttatgggtcctctc--acttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgg 298  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||    
T  10342338 aatgagtttatgggttctctcccacttataaagtgtttaacctctacttttctatatgatgtgg 10342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 250
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatggg 250  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244703
Alignment:
Q  249 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 30244703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37345607 - 37345563
Alignment:
Q  273 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37345607 aacctccactttcctattcgatgtgggacatataactcactcttg 37345563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47129516 - 47129457
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaacctt 231  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47129516 acatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 47129457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 317
Target Start/End: Original strand, 19283437 - 19283611
Alignment:
Q  145 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 242  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |  ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  19283437 ggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgag 19283536  T
Q  243 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19283537 tttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttg 19283611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Original strand, 26661548 - 26661679
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  26661548 caaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttt 26661647  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661648 tacccgatgtgggacatataactcacacttgt 26661679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 1188599 - 1188744
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |    
T  1188599 acatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatatt 1188698  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1188699 caacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 1188744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17294694 - 17294578
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  17294694 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 17294595  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  17294594 atataactcacacttgt 17294578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 22077536 - 22077651
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  22077536 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 22077635  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  22077636 atataactcacacttg 22077651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 5319982 - 5320121
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  5319982 aggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaactt 5320081  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5320082 ttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttg 5320121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22793420 - 22793280
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaa-tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 276  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  22793420 aggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacc 22793321  T
Q  277 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22793320 tctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttg 22793280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 32594757 - 32594872
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  32594757 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtaggac 32594856  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  32594857 atataactcacacttg 32594872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41142520 - 41142374
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||     
T  41142520 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgt 41142421  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41142420 tcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 41142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Original strand, 26661924 - 26662055
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  26661924 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttt 26662023  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26662024 tatctgatatgggatatataactcacacttgt 26662055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3550837 - 3550722
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3550837 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3550738  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  3550737 atataactcacacttg 3550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9956121 - 9955911
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| || | ||| |   |||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  9956121 acccttcgtcgaaccgaggctctgataccactgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagag 9956022  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagttta-tgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttct-atcagatgtgggacata 304  Q
    ||  |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||| | ||| |||||||||||||    
T  9956021 acatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacata 9955922  T
Q  305 taactcacact 315  Q
    |||||||||||    
T  9955921 taactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 44290835 - 44290981
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgc 270  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||     
T  44290835 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 44290934  T
Q  271 tcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44290935 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Original strand, 66099 - 66245
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 272  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  66099 tacatcgaggccagaacaaccatacaagtgagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 66198  T
Q  273 -aacctccacttttctatcagatgtgggacat-ataactcacacttg 317  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  66199 aaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttg 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41157138 - 41156993
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcga--gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41157138 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157039  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  41157038 caacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttg 41156993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41157522 - 41157377
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  41157522 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 41157423  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41157422 caacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 41157377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Original strand, 44290502 - 44290614
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  44290502 agacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 44290601  T
Q  305 taactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||    
T  44290602 taactcacacttg 44290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 3537610 - 3537752
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| |    
T  3537610 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgtt 3537709  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3537710 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 24600355 - 24600470
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  24600355 gagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatgggac 24600454  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  24600455 atataactcacacttg 24600470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34365042 - 34364927
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | || |||| |||||| |||    
T  34365042 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgac 34364943  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  34364942 atataactcacacttg 34364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34649585 - 34649439
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| ||  ||||||||| ||| |    
T  34649585 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgtt 34649486  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34649485 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 34649439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37556243 - 37556112
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact-ttt 285  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||  ||| |||    
T  37556243 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgg-tcctcttacttataagatgttcaacctttactattt 37556145  T
Q  286 ctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37556144 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 37556112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 66489 - 66628
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  66489 aggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacct 66588  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  66589 ttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 66628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 1187405 - 1187520
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  1187405 gagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagac 1187504  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||||    
T  1187505 atataattcacacttg 1187520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10351277 - 10351182
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||   | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10351277 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctctatttttctatctgatgtg 10351182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 39066241 - 39066356
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |     
T  39066241 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaat 39066340  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  39066341 atataactcacacttg 39066356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 22077153 - 22077239
Alignment:
Q  204 gagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 290  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||    
T  22077153 gagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatc 22077239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34364654 - 34364509
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||| ||| |    
T  34364654 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgtt 34364555  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  34364554 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 34364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41759630 - 41759485
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||| |||||||| ||| |    
T  41759630 acatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgtt 41759531  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| |  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41759530 caacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 41759485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184581
Alignment:
Q  225 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 41184581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29798316 - 29798201
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||| ||||    
T  29798316 gagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggac 29798217  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  29798216 atataactcacacttg 29798201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 31767187 - 31767317
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  31767187 caaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttt 31767286  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31767287 tatccgatgtggaacatataacccacacttg 31767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40082515 - 40082409
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||    
T  40082515 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataact 40082417  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  40082416 cacacttg 40082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 48588529 - 48588644
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  48588529 gagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggac 48588628  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||| ||||||||||||    
T  48588629 atagaactcacacttg 48588644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 22077871 - 22077984
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  | ||||||||| ||| |   |||    
T  22077871 agagacgccacactcttaccccaaaccttagg-ctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaaca 22077969  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  22077970 tataactcacacttg 22077984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24448424 - 24448279
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagac--gccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||| |||||||  |||||||| ||| |||||| |||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  24448424 acatctaggcctgaacaacctcataagtgagagacacgccacacttttatccaaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatgtt 24448325  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||   |||||||||| |||||||    
T  24448324 caacttccacttttctttgagatgtctaacatataacttacacttg 24448279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 30630649 - 30630794
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| || ||  ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||      
T  30630649 acatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtc 30630748  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     |||||  | |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  30630749 aaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 30630794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Original strand, 50052064 - 50052178
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |  |||  ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  50052064 gagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 50052163  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  50052164 atataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Original strand, 38804372 - 38804512
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  38804372 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacct 38804471  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
      ||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804472 ttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgt 38804512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 24131998 - 24132137
Alignment:
Q  173 tacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctc 272  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||  |  ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || | |||||| ||| ||    
T  24131998 tacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttc 24132096  T
Q  273 aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24132097 aacctttacttttctatccgatgagggacatataactcaca 24132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537303
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3537303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 3875372 - 3875479
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||| |||    
T  3875372 gagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgac 3875471  T
Q  302 atataact 309  Q
    ||||||||    
T  3875472 atataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5575221 - 5575110
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||  ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| || |||||||    
T  5575221 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggac 5575122  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    |||||| |||||    
T  5575121 atataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37555861 - 37555733
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |  |||| || |||||| |||||||| ||  ||||||| |||| ||     
T  37555861 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatgtattcaaccttcactattt 37555763  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37555762 tatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 37850611 - 37850756
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||    || |  |||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  37850611 acatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgtt 37850710  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37850711 caacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 37850756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14318984 - 14318875
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| || |||| ||    
T  14318984 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaac 14318885  T
Q  302 atataactca 311  Q
    ||||||||||    
T  14318884 atataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Original strand, 32168709 - 32168793
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  32168709 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct 32168793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44685570 - 44685458
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaa-cctccacttttctatcagatgtgggacat 303  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  44685570 agacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacat 44685472  T
Q  304 ataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||    
T  44685471 ataactcacacttg 44685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11977397 - 11977281
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| || |||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || || | ||||||||||    
T  11977397 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggac 11977298  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  11977297 atataactcacacttgt 11977281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 317
Target Start/End: Original strand, 47379889 - 47379941
Alignment:
Q  265 aagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47379889 aagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttg 47379941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45084457 - 45084384
Alignment:
Q  244 ttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  45084457 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttg 45084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 5528795 - 5528902
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| | ||||||  || |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  5528795 gagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 5528894  T
Q  302 atataact 309  Q
    ||||||||    
T  5528895 atataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 5996883 - 5997027
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| || |||||||||    |||||  | ||||| |||||||| ||||||| || |    
T  5996883 acatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaaa-caatggatatatggatcctctcatttataaaatgtt 5996981  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5996982 caagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttg 5997027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Original strand, 47380129 - 47380254
Alignment:
Q  126 ggctttgataccattgtttggtca-tgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagac--gccacactcttacc 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||   ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||   | ||||||||||||    
T  47380129 ggctctgataccattgttgggtcaattaggggagtctaggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacc 47380228  T
Q  223 caaaaccttggggcaatgagtttatg 248  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||    
T  47380229 caaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4956305 - 4956220
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 290  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||||    
T  4956305 agacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatc 4956220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Original strand, 44043813 - 44043886
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaac 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  44043813 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaac 44043886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45839778 - 45839628
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |   |||||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  45839778 acatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgtt 45839679  T
Q  272 c-----aacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |     |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45839678 cgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactcatacttgt 45839628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50556517 - 50556453
Alignment:
Q  253 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||    
T  50556517 ctctcacttataaattgttcaacctccgcttttctatatgatgtgtgatatataacccacacttg 50556453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378197
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttg 21378197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 45494015 - 45494135
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa----gtgctcaacctccacttttctatcagatgtg 297  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| ||||||| |    ||| |||||||  ||| || |||| ||||||    
T  45494015 gagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 45494114  T
Q  298 ggacatat-aactcacacttg 317  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  45494115 ggacatataaactcacacttg 45494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44091970 - 44091909
Alignment:
Q  243 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||    
T  44091970 tttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469237
Alignment:
Q  260 ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttg 50469237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878809
Alignment:
Q  253 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcaca 4878809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Original strand, 30576667 - 30576707
Alignment:
Q  245 tatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  30576667 tatgggtcctctcactcataaagtgttcaacctctactttt 30576707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 39336252 - 39336385
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  39336252 cagagcaaccacacgagcgagagaggcaacactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaact 39336351  T
Q  284 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39336352 ttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39336385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 47964541 - 47964674
Alignment:
Q  186 gagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 283  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |    
T  47964541 gagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacat 47964640  T
Q  284 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  47964641 ttctatccgatgcgggacatacaactcacacttg 47964674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Original strand, 43346808 - 43346948
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  43346808 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacct 43346907  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
      ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43346908 ttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 43346948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15773066 - 15772856
Alignment:
Q  109 acccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagag 206  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||    ||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||    
T  15773066 acccttcgtcgaatcagggctctgataccactgttgggtcatgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagag 15772967  T
Q  207 acgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    || ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  15772966 acaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatata 15772867  T
Q  307 actcacacttg 317  Q
    |||||||||||    
T  15772866 actcacacttg 15772856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25317292 - 25317161
Alignment:
Q  187 agcaaccacacaagcgagagacgcc--acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 284  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25317292 agcaaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttt 25317193  T
Q  285 tctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317192 tccatctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 12114603 - 12114718
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  12114603 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggat 12114702  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  12114703 atataacttacacttg 12114718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 21832356 - 21832499
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 273  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||  |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  21832356 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttca 21832455  T
Q  274 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21832456 acctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttg 21832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 37990650 - 37990796
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  37990650 acatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgtt 37990749  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| |  ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37990750 caacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgt 37990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35946639 - 35946523
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  35946639 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 35946540  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  35946539 atataactcacacttgt 35946523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22304686 - 22304571
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  22304686 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggac 22304587  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22304586 atatagctcacacttg 22304571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 29644622 - 29644737
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||  ||| ||||||||||    
T  29644622 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggac 29644721  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  29644722 atataactcacacttg 29644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 29644943 - 29645058
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  29644943 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggac 29645042  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  29645043 atataacttacacttg 29645058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 37990988 - 37991134
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  37990988 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgtt 37991087  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37991088 caacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgt 37991134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 33803263 - 33803404
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  33803263 acatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgtt 33803362  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33803363 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 33803404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 42342405 - 42342544
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  42342405 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacct 42342504  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42342505 ttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttg 42342544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 52634792 - 52634677
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | | |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  52634792 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 52634694  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  52634693 atataactcacacttgt 52634677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 47964956 - 47965071
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| | ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||   ||    
T  47964956 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaac 47965055  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  47965056 atataactcacacttg 47965071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 300
Target Start/End: Original strand, 41359776 - 41359904
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  41359776 acatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtatt 41359875  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||||    
T  41359876 caacctttactattgtatccgatgtggga 41359904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 316
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  311 acactt 316  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25755570 - 25755395
Alignment:
Q  145 ggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgag 242  Q
    |||||||| |||||| || |||||||   ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||||      
T  25755570 ggtcatgaggggagttcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatgga 25755471  T
Q  243 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25755470 tttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgt 25755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 32462911 - 32463058
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||  |    
T  32462911 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtatt 32463010  T
Q  272 caacc-tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32463011 caaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgt 32463058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 318
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175821
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat---gggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataa 307  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  308 ctcacacttgt 318  Q
    |||||||||||    
T  33175811 ctcacacttgt 33175821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 49336728 - 49336844
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  | | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  49336728 gagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgagac 49336827  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    || ||||||||||||||    
T  49336828 atgtaactcacacttgt 49336844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 25739466 - 25739581
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  25739466 gagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggac 25739565  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  25739566 atataactcacacttg 25739581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39389186 - 39389072
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| |||||    
T  39389186 agagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggaca 39389087  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  39389086 tataactcacacttg 39389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 42342101 - 42342194
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42342101 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataa 42342194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 54018209 - 54018354
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  54018209 acatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 54018308  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  54018309 caatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttg 54018354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 317
Target Start/End: Original strand, 1634366 - 1634471
Alignment:
Q  213 cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc-tccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1634366 cactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactca 1634465  T
Q  312 cacttg 317  Q
    ||||||    
T  1634466 cacttg 1634471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32589835 - 32589706
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | | ||     
T  32589835 caaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattt 32589736  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  32589735 tatcttatgtgggacatat-actcacacttg 32589706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 310
Target Start/End: Original strand, 39934966 - 39935104
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  39934966 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 39935065  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  39935066 caacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 54017857 - 54017972
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  54017857 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggac 54017956  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  54017957 atataactcacacttg 54017972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 279
Target Start/End: Original strand, 39335991 - 39336088
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcc 279  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  39335991 cagagcaatcacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacctcc 39336088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384422
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  312 cacttg 317  Q
    | ||||    
T  3384417 cgcttg 3384422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  253 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  253 ctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45901831 - 45901714
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt-ttctatcagatgtggga 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    || || |||| |||||||||    
T  45901831 gagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtggga 45901732  T
Q  301 catataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45901731 catataactcacacttgt 45901714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823657
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| |  ||| || |||| |||||| ||| ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  305 taactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||    
T  4823669 taactcacacttg 4823657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15773314 - 15773194
Alignment:
Q  197 caagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgt 296  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||| |  ||| || |||  |||||    
T  15773314 caagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgt 15773215  T
Q  297 gggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15773214 gggacatataactcacacttg 15773194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8328021 - 8327906
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| |||| ||||||||  |  ||| |||  ||| || |||| ||||||||||    
T  8328021 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggac 8327922  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  8327921 atataactcacacttg 8327906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39914369 - 39914254
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||| || |||| |||||| |||    
T  39914369 gagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctctactgttttatctgatgtgagac 39914270  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  39914269 atataactcacacttg 39914254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 312
Target Start/End: Original strand, 3135114 - 3135224
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||| || | |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  3135114 gagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgggac 3135213  T
Q  302 atataactcac 312  Q
    |||||||||||    
T  3135214 atataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 45395664 - 45395809
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  45395664 acatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtt 45395763  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     |||||  ||| || |||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  45395764 taacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttg 45395809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 22303966 - 22304105
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||          
T  22303966 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataa------ 22304059  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
      ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22304060 -gacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 22304105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 54451235 - 54451328
Alignment:
Q  220 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    ||||||||||||  | |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54451235 acccaaaaccttaagacaataagtatatggatcatctcactcataaagtgttcaacctccatttttctttttgatgtgggacatataactcaca 54451328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 7767389 - 7767469
Alignment:
Q  236 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7767389 caatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 53118016 - 53118130
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  53118016 gagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 53118114  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  53118115 atataactcacacttg 53118130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31190126 - 31190019
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||        |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  31190126 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 31190035  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||| |||||||||||    
T  31190034 atatcactcacacttg 31190019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11662098 - 11661954
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaa-gcgagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| | |||||||||| ||| ||| |    
T  11662098 acatcgaggctagaacaaccacacaatgagagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgtt 11661999  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||||  ||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11661998 caacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9240266 - 9240151
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| |||  || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |  |||| |||||| ||||||| ||    
T  9240266 gagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaac 9240167  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  9240166 atataactcacacttg 9240151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12749278 - 12749207
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 281  Q
    ||||||||||| | ||||||||   |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12749278 ccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacctccac 12749207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 261
Target Start/End: Original strand, 22303708 - 22303759
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22303708 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52635049 - 52634994
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52635049 ccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataa 52634994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53577481 - 53577366
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||| ||| || | || |||  || |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  53577481 gagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgac 53577382  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  53577381 atataactcacacttg 53577366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Original strand, 12747870 - 12747908
Alignment:
Q  279 cacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12747870 cacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 12747908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 309
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||  | ||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  303 tataact 309  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Original strand, 50612534 - 50612608
Alignment:
Q  243 tttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50612534 tttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51886645 - 51886563
Alignment:
Q  235 gcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||  ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  51886645 gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttg 51886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2300021 - 2299978
Alignment:
Q  274 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2300021 acctccacttttctatctgacgtgggacatataacccacacttg 2299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 7766784 - 7766851
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaacctt 231  Q
    |||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7766784 gggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaagtgagagacgccacaatcttacctaaaacctt 7766851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 249
Target Start/End: Original strand, 54017590 - 54017636
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgg 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  54017590 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 313
Target Start/End: Original strand, 54769708 - 54769766
Alignment:
Q  255 ctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  54769708 ctcacttataaagtgatcaactttcacttttctatttgatgtacgacatataactcaca 54769766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Original strand, 33362331 - 33362397
Alignment:
Q  197 caagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33362331 caagagagagacgccacact--tacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataa 33362397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Original strand, 16871010 - 16871062
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttata 264  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16871010 acactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttccctctcttata 16871062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 231
Target Start/End: Original strand, 41359533 - 41359561
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaacctt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359533 agagacgccacactcttacccaaaacctt 41359561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36629384 - 36629239
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  36629384 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 36629285  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36629284 taacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28034346 - 28034231
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28034346 gagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggac 28034247  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||||    
T  28034246 atataattcacacttg 28034231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 39792869 - 39793015
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||| |    
T  39792869 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgtt 39792968  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39792969 caacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgt 39793015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 760324 - 760194
Alignment:
Q  185 agagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact 282  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  760324 agagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatt 760226  T
Q  283 tttctatcagatgtgggacatataactcacac 314  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  760225 tttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39404165 - 39404019
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  39404165 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgtt 39404066  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||  ||| || |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  39404065 caacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgt 39404019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25483483 - 25483338
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||  || |    
T  25483483 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgtt 25483384  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25483383 caacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 25483338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 305
Target Start/End: Original strand, 15841382 - 15841510
Alignment:
Q  179 taggccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 276  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15841382 taggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacc 15841481  T
Q  277 tccacttttctatcagatgtgggacatat 305  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  15841482 tccacttttctatttgatgtgagacatat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955471
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      ||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttg 4955471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 34646688 - 34646804
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  34646688 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggac 34646787  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  34646788 atataactcacacttgt 34646804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2741184 - 2741073
Alignment:
Q  206 gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2741184 gacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatat 2741085  T
Q  306 aactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||    
T  2741084 aactcacacttg 2741073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 3244490 - 3244605
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  3244490 gagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 3244589  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  3244590 atataactcacacttg 3244605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34544349 - 34544107
Alignment:
Q  70 tctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggacc 169  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| | | ||||||    
T  34544349 tctttgtcaagaagactttcgacacaaggag-------aacacttcgttgaacctcggctctgataccaatgttgggtcacgaggggagccag-gggacc 34544258  T
Q  170 acttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacg--ccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 266  Q
    ||  |||||  ||   ||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34544257 acccacatcctgggg-gagcaaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaa 34544159  T
Q  267 gtgctcaacctccacttttctatcagatgtggg--acatataactcacactt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||||    
T  34544158 gtgatcaacctccacttttctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 50630794 - 50630909
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  50630794 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 50630893  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||| ||||    
T  50630894 atataactcacgcttg 50630909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3340954 - 3340809
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3340954 acatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgct 3340855  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3340854 caacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttg 3340809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2740817 - 2740702
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  || |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  2740817 gagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggac 2740718  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  2740717 atataactcacacttg 2740702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 16888855 - 16888970
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16888855 gagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggac 16888954  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  16888955 atataactcacacttg 16888970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 22183303 - 22183418
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |  ||| || |||| |||||||||     
T  22183303 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggat 22183402  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  22183403 atataactcacacttg 22183418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39404545 - 39404399
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  39404545 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 39404446  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    | ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39404445 ccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgt 39404399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44620768 - 44620662
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  44620768 ccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataact 44620670  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  44620669 cacacttg 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50002543 - 50002428
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  50002543 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagac 50002444  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  50002443 atataactcacacttg 50002428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 55933163 - 55933278
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||| || |||| ||||| ||||    
T  55933163 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggac 55933262  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  55933263 atataactcacacttg 55933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 32941132 - 32941277
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||| |    
T  32941132 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgtt 32941231  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| |||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  32941232 caacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttg 32941277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 54017604 - 54017749
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  54017604 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgtt 54017703  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54017704 caacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttg 54017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52884853 - 52884697
Alignment:
Q  164 gggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcact 260  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | || ||| |||    
T  52884853 gggaccacgcacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttact 52884754  T
Q  261 tataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52884753 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Original strand, 1731662 - 1731797
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||  || |||||||    
T  1731662 aggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaacct 1731761  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1731762 ttactgttttatctgatgtgggacatataactcaca 1731797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Original strand, 11783515 - 11783671
Alignment:
Q  127 gctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgagag--acgccacactcttaccca 224  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||| | | | ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  11783515 gctttgataccactgttgggtcatgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttaccca 11783614  T
Q  225 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 283  Q
    |||| ||  ||||||  || |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  11783615 aaactttatggcaataggtgtatgggtcctctcac--ataaagggcttaacctccactt 11783671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 23556885 - 23557020
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccac 281  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||| | |||| | ||||||| || |||||||||||    
T  23556885 cagagcaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccac 23556984  T
Q  282 ttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||| |||||   |||| |||||||||||||    
T  23556985 ttttctatccgatgtaaaacatttaactcacacttg 23557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52885005 - 52884889
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttaccc-aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||    
T  52885005 gagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884906  T
Q  301 catataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  52884905 catataactcacacttg 52884889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 49880277 - 49880162
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||||||||    
T  49880277 gagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggac 49880178  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  49880177 atataactcacacttg 49880162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41370504 - 41370359
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  41370504 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtttt 41370405  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||| |  ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41370404 caacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttg 41370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49303015 - 49302907
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcac--ttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  49303015 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataa 49302916  T
Q  308 ctcacactt 316  Q
    |||||||||    
T  49302915 ctcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31691266 - 31691206
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31691266 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataa 31691206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 41707504 - 41707619
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| || | |||||||  ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  41707504 gagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 41707602  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707603 atataactcacacttgt 41707619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 22028000 - 22028115
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    | || |||| ||||||||||    
T  22028000 gagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggac 22028099  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||| |||||||||    
T  22028100 atataagtcacacttg 22028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  192 ccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctat 289  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||  || |||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  290 cagatgtgggacata 304  Q
    | |||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 54936313 - 54936201
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||      
T  54936313 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg-- 54936216  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
      |||||||||||||||    
T  54936215 --ataactcacacttgt 54936201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10246066 - 10245922
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgag--agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  10246066 acatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgtt 10245968  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10245967 caacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttg 10245922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 318
Target Start/End: Original strand, 15841034 - 15841139
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  15841034 acactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatgggacatataattca 15841132  T
Q  312 cacttgt 318  Q
    || ||||    
T  15841133 catttgt 15841139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 54109029 - 54108928
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  54109029 gagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 54108931  T
Q  302 ata 304  Q
    |||    
T  54108930 ata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Original strand, 54741227 - 54741332
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||  || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  54741227 acactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattca 54741326  T
Q  312 cacttg 317  Q
    ||||||    
T  54741327 cacttg 54741332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36572136 - 36572020
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||  ||||||||||    
T  36572136 gagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggac 36572037  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  36572036 atataactcacacttgt 36572020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 313
Target Start/End: Original strand, 11348399 - 11348478
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11348399 ggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcaca 11348478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 34004624 - 34004737
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||  | |||| ||||| ||||| |||    
T  34004624 gagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagtttt-tatcatatgtgtgac 34004721  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  34004722 atataactcacacttg 34004737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 36608700 - 36608815
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||| |||||| |||||| | ||| ||||| |  ||| || |||| ||||| ||||    
T  36608700 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggac 36608799  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  36608800 atataactcacacttg 36608815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3341236 - 3341130
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  3341236 cacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactc 3341137  T
Q  311 acacttg 317  Q
    |||||||    
T  3341136 acacttg 3341130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 23817690 - 23817783
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23817690 acatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50459868 - 50459724
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||  |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||  || |    
T  50459868 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgtt 50459769  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||||  ||| || || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  50459768 caacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Original strand, 22028384 - 22028483
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  22028384 aggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacct 22028483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 286
Target Start/End: Original strand, 41603270 - 41603314
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41603270 gtttatgggtcttctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 41603314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44620485 - 44620362
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgc--cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    ||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| ||| |||||||  ||| ||     
T  44620485 caaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttt 44620386  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  44620385 tatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44621111 - 44621011
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||| |||| ||||    
T  44621111 ccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaact 44621012  T
Q  310 c 310  Q
    |    
T  44621011 c 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 309
Target Start/End: Original strand, 54343017 - 54343147
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||       ||||||||| |||||||| ||| |    
T  54343017 acatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataaggtgtt 54343109  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  54343110 caacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 4390140 - 4390255
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| | | | || |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||     
T  4390140 gagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggat 4390239  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    || |||||||||||||    
T  4390240 atgtaactcacacttg 4390255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 16889575 - 16889690
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||  |||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||| || |||    
T  16889575 gagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagac 16889674  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  16889675 atataactcacacttg 16889690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43174624 - 43174507
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccact-tttctatcagatgtggga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||  ||  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||| |||||| |     
T  43174624 gagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtgg 43174525  T
Q  301 catataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43174524 catataactcacacttgt 43174507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20825945 - 20825837
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| ||||||||||    
T  20825945 ccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataact 20825846  T
Q  310 cacacttgt 318  Q
    |||| ||||    
T  20825845 cacatttgt 20825837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 6975495 - 6975606
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||  |||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  6975495 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgagac 6975594  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  6975595 atataactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 265
Target Start/End: Original strand, 18932788 - 18932851
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  18932788 gagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataa 18932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20826334 - 20826223
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||  ||  ||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||||||||    
T  20826334 gagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggac 20826235  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  20826234 atataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54108678 - 54108540
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatg-agtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacc 276  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||    
T  54108678 aggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacc 54108579  T
Q  277 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |  ||| || ||||  || ||||||  ||||||||||||||    
T  54108578 tttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttg 54108540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802576
Alignment:
Q  223 caaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttt 284  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctctcagttgtcaagtgctcaacctccacttt 29802576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 49076521 - 49076602
Alignment:
Q  236 caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49076521 caatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttg 49076602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 247
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706628
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504759
Alignment:
Q  175 catctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctct 256  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||||||||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctct 19504759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 7147721 - 7147795
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||| | |||||||||||||    
T  7147721 gtttacgggtcctctcactta-aaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgagacttctaactcacacttg 7147795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatata 306  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||| |  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3271895 - 3271841
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  3271895 cacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataa 3271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11197343 - 11197293
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  11197343 gagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12197438 - 12197380
Alignment:
Q  259 cttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  12197438 cttataaagtattgaaccttcacttttctatttgatgtgggacctataactcacacttg 12197380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 290
Target Start/End: Original strand, 31249937 - 31249985
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatc 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31249937 gtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaacattcacctttctatc 31249985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 36568595 - 36568723
Alignment:
Q  189 caaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||    
T  36568595 caaccacacaagagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttcta 36568694  T
Q  289 tcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36568695 tccgatgtgggacatataactcacacttg 36568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31509708 - 31509625
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31509708 ggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 31509625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 18603131 - 18603276
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  18603131 acatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 18603230  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18603231 caacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 36521919 - 36522052
Alignment:
Q  186 gagcaaccacacaa--gcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccactt 283  Q
    ||||||||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||    
T  36521919 gagcaaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaactt 36522018  T
Q  284 ttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36522019 ttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 36522052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 1028558 - 1028674
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1028558 gagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggac 1028657  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  1028658 atataactcacacttgt 1028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 299605 - 299491
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  299605 agagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggaca 299506  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  299505 tataactcacacttg 299491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 40296326 - 40296471
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  40296326 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 40296425  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||   || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40296426 caaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 40296471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 13415777 - 13415916
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  13415777 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 13415876  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
      |||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13415877 ttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttg 13415916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26074729 - 26074613
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  26074729 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaac 26074630  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  26074629 atataactcacacttgt 26074613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31509849 - 31509745
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaa-ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31509849 gagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgaga 31509750  T
Q  301 catat 305  Q
    |||||    
T  31509749 catat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 9498695 - 9498806
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| |||||| |||    
T  9498695 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagac 9498794  T
Q  302 atataactcaca 313  Q
    ||||||||||||    
T  9498795 atataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 34753036 - 34753182
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||| |    
T  34753036 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgtt 34753135  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34753136 caacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgt 34753182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32487540 - 32487396
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  32487540 acatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgtt 32487442  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32487441 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32487396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Original strand, 36492228 - 36492373
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  36492228 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgtt 36492327  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36492328 caacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36492373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Original strand, 36522278 - 36522392
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||  ||||| |||    
T  36522278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagac 36522377  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  36522378 atataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6224305 - 6224197
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| || |||||||||||||||    
T  6224305 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataact 6224206  T
Q  310 cacacttgt 318  Q
    |||||||||    
T  6224205 cacacttgt 6224197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41170775 - 41170640
Alignment:
Q  180 aggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  41170775 aggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacct 41170676  T
Q  278 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcaca 313  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41170675 ttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 26074187 - 26074302
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||||  |||||| |||| |||||| |||    
T  26074187 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgac 26074286  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  26074287 atataactcacacttg 26074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41632899 - 41632784
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  41632899 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 41632800  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||    
T  41632799 atataacttacacttg 41632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 316
Target Start/End: Original strand, 3622795 - 3623035
Alignment:
Q  68 attctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgaggga 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||    
T  3622795 attctttgtcaagaaaacttttgacacaaggagtcggtcgaacccttcgtcgaacctcaactctgataccattgttgggtcatgagggaagccctgggga 3622894  T
Q  168 ccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcg--agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    ||||  ||||| ||| ||| |||||||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||        |||| | || |||||||||     
T  3622895 ccacccacatccagg-cagggcaaccacactagtgacagagacgtcacactcttacctaaaa-cttaaggca--------atggattctttcacttatag 3622984  T
Q  266 agtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  3622985 agtgttcaacttccacttttctatccgatttaagacatataactcacactt 3623035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6500597 - 6500453
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||| |    
T  6500597 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgtt 6500498  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6500497 caacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 6500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 26075202 - 26075319
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||    
T  26075202 gagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgaga 26075301  T
Q  301 catataactcacacttgt 318  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  26075302 catataaatcacacttgt 26075319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 42405609 - 42405753
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctca 273  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||    
T  42405609 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttca 42405708  T
Q  274 acctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||  ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42405709 acctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgt 42405753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6500939 - 6500825
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||||    
T  6500939 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggac 6500841  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  6500840 atataactcacacttg 6500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25328052 - 25327938
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || |||| ||||| ||||    
T  25328052 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggac 25327953  T
Q  302 atataactcacactt 316  Q
    |||||||||||||||    
T  25327952 atataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 318
Target Start/End: Original strand, 26074802 - 26074939
Alignment:
Q  184 cagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactctt-acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctcca 280  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||  |    
T  26074802 cagagcaaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaaccttta 26074901  T
Q  281 cttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26074902 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 26074939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 624313 - 624198
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||   |||||||||    
T  624313 gagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggac 624214  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  624213 atataactcacacttg 624198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 3295056 - 3295170
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  3295056 gagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3295155  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    |||| |||||||||||    
T  3295156 atat-actcacacttg 3295170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15370216 - 15370101
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||  ||| || |||  ||||||||||    
T  15370216 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggac 15370117  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  15370116 atataactcacacttg 15370101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 24489248 - 24489360
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggaca 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||||  ||| ||| |||| ||| | |||||   |||||||||| |||||||||||    
T  24489248 agagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggaca 24489345  T
Q  303 tataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  24489346 tataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 27502062 - 27502192
Alignment:
Q  189 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttc 286  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||  ||| ||     
T  27502062 caaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattt 27502161  T
Q  287 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27502162 tatccaatgtgggacatataactcacacttg 27502192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35150123 - 35150009
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  35150123 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggac 35150025  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  35150024 atataactcacacttg 35150009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 316
Target Start/End: Original strand, 3295356 - 3295498
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  3295356 acatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 3295454  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295455 caacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 312
Target Start/End: Original strand, 11417027 - 11417128
Alignment:
Q  211 cacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactc 310  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  11417027 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactc 11417126  T
Q  311 ac 312  Q
    ||    
T  11417127 ac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33747888 - 33747783
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  33747888 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatttaacctttactattttatccgatgtgggac 33747789  T
Q  302 atataa 307  Q
    ||||||    
T  33747788 atataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38427664 - 38427553
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||  || ||||||||||| ||||||||  || |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  38427664 gagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagatgttcaacctttacttttctatccaatgtgggac 38427566  T
Q  302 atataactcacac 314  Q
    |||||||||||||    
T  38427565 atataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 623935 - 623820
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||| ||  || |||| ||||||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||    
T  623935 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagac 623836  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  623835 atataactcacacttg 623820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 12662701 - 12662808
Alignment:
Q  210 ccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataact 309  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||  |||||||||  ||| ||||||||| || |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  12662701 ccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 12662800  T
Q  310 cacacttg 317  Q
    ||||||||    
T  12662801 cacacttg 12662808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 26590951 - 26591066
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||  ||| ||| ||    
T  26590951 gagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaac 26591050  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    || ||| |||||||||    
T  26591051 atttaaatcacacttg 26591066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 29549296 - 29549411
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| |||  ||| || |||| ||| ||| ||    
T  29549296 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattttatctgatatggaac 29549395  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  29549396 atataactcacacttg 29549411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15370519 - 15370446
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaac 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  15370519 gagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 15370446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Original strand, 9510601 - 9510675
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacactt 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  9510601 gtttatggctcctctcacttataaatgactcaacctccacttttctattcaatgtgaaacatataactcacactt 9510675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 318
Target Start/End: Original strand, 36527199 - 36527240
Alignment:
Q  277 tccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36527199 tccacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgt 36527240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2411114 - 2411010
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactca 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||  || ||||| |  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  2411114 acactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactca 2411015  T
Q  312 cactt 316  Q
    |||||    
T  2411014 cactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19275683 - 19275558
Alignment:
Q  165 ggaccacttacatctaggccagagcaaccacacaagcgaga--gacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 262  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| |||  ||||    
T  19275683 ggaccgctcacatccaggcca-agcagccaaacaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttcctta 19275585  T
Q  263 taaagtgctcaacctccacttttctatc 290  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19275584 t-aagtgttcaacctctacttttctatc 19275558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 288
Target Start/End: Original strand, 6557471 - 6557513
Alignment:
Q  246 atgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6557471 atggatcctctcacttataaagtgctcaacctacacttttcta 6557513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32446002 - 32445916
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||    
T  32446002 gagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcacttgtaaagtgcaccacctcctcttctcta 32445916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508613
Alignment:
Q  224 aaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgt 318  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  || | |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgt 42508613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13042656 - 13042606
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtc 252  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  13042656 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 36527054 - 36527196
Alignment:
Q  126 ggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggaccacttacatctagg----ccagagcaaccacacaagcgagagacgc--cacactctt 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||||    | ||| || ||||||||| ||||||  |  |||||||||    
T  36527054 ggctctgataccattgttgggtcacgaagggagcccggtggatcacccacatctaggtgagcaagaacagccacacaagtgagagagacagcacactctt 36527153  T
Q  220 acccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcactta 262  Q
    | |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36527154 atccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 277
Target Start/End: Original strand, 6557098 - 6557163
Alignment:
Q  212 acactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacct 277  Q
    ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  6557098 acacttttacccaacaccttgagacaatgaatttatgagttctctcgcttgtaaagtgctcaacct 6557163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Original strand, 558 - 672
Alignment:
Q  205 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || || | |||||||||||||    
T  558 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacata 657  T
Q  305 taactcacacttgtg 319  Q
    |||||||||||||||    
T  658 taactcacacttgtg 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Original strand, 230 - 298
Alignment:
Q  249 ggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  230 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39705 - 39459
Alignment:
Q  70 tctttgtcaagaagactttcgatacaaggagccggttgaacccttcgtcgaaactcggctttgataccattgtttggtcatgaagggagtccgagggacc 169  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||  | ||||| | | || ||     
T  39705 tctttgtctataagactttcgacacaaggagatggtcgaacccttcgtcgaacctcggctctgataccactgttgggtcactaggggagccaggggaact 39606  T
Q  170 acttacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgcca-cactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 266  Q
    ||  ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||   |||||| | |||||||||||||||     
T  39605 acccacatc-aggc-agatcaaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataag 39509  T
Q  267 gtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    | | |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  39508 gagttcaacctccacttttctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39903 - 39840
Alignment:
Q  254 tctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39903 tctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5474 - 5359
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||    
T  5474 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaac 5375  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  5374 atataactcacacttg 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5129 - 4984
Alignment:
Q  174 acatctaggccagagcaaccacacaagcgagaga--cgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgct 271  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | | ||||||||  |  |    
T  5129 acatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatatt 5030  T
Q  272 caacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
     |||||  ||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5029 aaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttg 4984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1263
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||| || ||||  |||||||||    
T  1147 gagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggac 1246  T
Q  302 atataactcacacttgt 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  1247 atataactcacacttgt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 265
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1795
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataa 265  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1732 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5862 - 5779
Alignment:
Q  234 ggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttg 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5862 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttg 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5514 - 5398
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttgggg-caatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||   | ||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  5514 gagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtagga 5415  T
Q  301 catataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  5414 catataactcacacttg 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17612
Alignment:
Q  203 agagacgccacactcttacccaaaa--ccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtggga 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||| || |||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  301 catataactcacacttg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttg 17612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10269
Alignment:
Q  242 gtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgtg 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtg 10269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3172 - 3109
Alignment:
Q  225 aaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttcta 288  Q
    |||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3172 aaaccttaaggcaatgagtttattgatgctctcacttataaagtgtataacctccacttttcta 3109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47477 - 47362
Alignment:
Q  202 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatcagatgtgggac 301  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||| |||| ||  ||| || |||| |||||| |||    
T  47477 gagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagac 47378  T
Q  302 atataactcacacttg 317  Q
    || ||| |||||||||    
T  47377 atttaattcacacttg 47362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University