View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19566_low_6 (Length: 265)

Name: NF19566_low_6
Description: NF19566
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19566_low_6
NF19566_low_6
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (1-252)||(50773957-50774213)
chr4 (1-159)||(8955774-8955931)
chr4 (1-157)||(45590864-45591019)
chr4 (1-141)||(36971170-36971310)
chr4 (1-141)||(18835829-18835969)
chr4 (4-139)||(33288421-33288557)
chr4 (1-157)||(34334454-34334613)
chr4 (20-156)||(39482003-39482138)
chr4 (26-141)||(30469228-30469343)
chr4 (40-158)||(49162249-49162366)
chr4 (9-138)||(26025546-26025675)
chr4 (1-130)||(33108924-33109053)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-158)||(29875076-29875232)
chr5 (1-158)||(34208660-34208816)
chr5 (1-157)||(12398946-12399101)
chr5 (1-151)||(4145816-4145965)
chr5 (1-158)||(23090420-23090576)
chr5 (1-157)||(4695162-4695317)
chr5 (1-141)||(22645924-22646064)
chr5 (1-142)||(3077719-3077860)
chr5 (10-157)||(42757805-42757949)
chr5 (26-138)||(4939669-4939781)
chr5 (76-136)||(19574883-19574943)
chr5 (1-128)||(594124-594251)
chr5 (1-119)||(22528127-22528244)
chr5 (26-127)||(12096231-12096332)
chr5 (39-107)||(32144285-32144353)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (1-157)||(17904285-17904440)
chr7 (1-158)||(29890825-29890981)
chr7 (1-158)||(46467334-46467490)
chr7 (1-157)||(6387692-6387847)
chr7 (1-158)||(26770301-26770457)
chr7 (1-158)||(4405231-4405387)
chr7 (1-141)||(29427179-29427319)
chr7 (1-158)||(31502652-31502809)
chr7 (1-157)||(37179331-37179487)
chr7 (1-157)||(9876385-9876539)
chr7 (1-158)||(6389854-6390002)
chr7 (1-157)||(48049124-48049280)
chr7 (1-119)||(41921892-41922009)
chr7 (20-158)||(9332461-9332599)
chr7 (1-138)||(31858110-31858247)
chr7 (1-138)||(12252194-12252331)
chr7 (1-157)||(46689989-46690140)
chr7 (1-159)||(9215461-9215617)
chr7 (1-138)||(5514901-5515038)
chr7 (1-158)||(22753067-22753223)
chr7 (1-138)||(33974616-33974753)
chr7 (1-138)||(7839182-7839315)
chr7 (86-136)||(19523813-19523863)
chr7 (124-162)||(29427409-29427446)
chr7 (76-136)||(30920301-30920361)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-157)||(18997089-18997244)
chr3 (1-157)||(18999628-18999783)
chr3 (1-157)||(1351996-1352151)
chr3 (1-157)||(29371538-29371693)
chr3 (1-157)||(32677477-32677632)
chr3 (1-158)||(29014689-29014845)
chr3 (1-158)||(41349370-41349526)
chr3 (1-157)||(39528871-39529026)
chr3 (1-157)||(39806979-39807134)
chr3 (1-158)||(36737833-36737989)
chr3 (1-158)||(39518529-39518685)
chr3 (1-158)||(38855439-38855595)
chr3 (1-157)||(32840070-32840226)
chr3 (1-141)||(22157380-22157520)
chr3 (1-141)||(21974271-21974411)
chr3 (1-141)||(21996702-21996842)
chr3 (1-141)||(28228558-28228700)
chr3 (41-128)||(55367714-55367801)
chr3 (1-138)||(49040862-49040999)
chr3 (38-157)||(840731-840849)
chr3 (1-42)||(55366030-55366071)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-157)||(33837729-33837884)
chr8 (1-157)||(45334276-45334431)
chr8 (1-141)||(2508811-2508951)
chr8 (1-157)||(25106333-25106488)
chr8 (1-157)||(9740107-9740263)
chr8 (1-157)||(28379069-28379224)
chr8 (1-157)||(38495472-38495627)
chr8 (1-145)||(2626249-2626393)
chr8 (24-158)||(13469507-13469639)
chr8 (10-158)||(32183480-32183627)
chr8 (1-142)||(27793058-27793197)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-157)||(47669241-47669396)
chr1 (1-160)||(10737698-10737856)
chr1 (1-158)||(48564939-48565095)
chr1 (1-160)||(46220381-46220539)
chr1 (1-154)||(9831625-9831777)
chr1 (3-143)||(4055608-4055748)
chr1 (1-155)||(3384597-3384750)
chr1 (20-156)||(1236071-1236206)
chr1 (1-157)||(8889564-8889720)
chr1 (1-141)||(39241274-39241414)
chr1 (6-141)||(18126977-18127112)
chr1 (1-142)||(4817391-4817532)
chr1 (1-107)||(7414329-7414436)
chr1 (28-158)||(37875726-37875854)
chr1 (12-107)||(26842573-26842668)
chr1 (30-107)||(49112323-49112400)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-157)||(15233877-15234032)
chr2 (1-157)||(43040849-43041004)
chr2 (1-141)||(41252537-41252678)
chr2 (1-158)||(41643016-41643173)
chr2 (1-141)||(35792922-35793062)
chr2 (1-157)||(44104546-44104704)
chr2 (1-137)||(31903400-31903535)
chr2 (1-138)||(21727794-21727931)
chr2 (1-76)||(31296205-31296278)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (1-158)||(27312113-27312271)
chr6 (1-158)||(2543203-2543359)
chr6 (1-157)||(32274556-32274711)
chr6 (1-141)||(29452557-29452697)
chr6 (1-158)||(31170989-31171145)
chr6 (1-137)||(7156256-7156392)
chr6 (56-158)||(5008308-5008409)
chr6 (10-157)||(18742078-18742223)
chr6 (92-157)||(8504733-8504797)
chr6 (1-62)||(8504796-8504857)
chr6 (1-54)||(5004004-5004057)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-158)||(44742-44896)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50774213 - 50773957
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774213 tattaaattagtcgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataagattatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 50774114  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacat-----caaaagaaaaaggaatggagggagtatcaataaaacttcaattatcagagnnnnnnngtttcta 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||    
T  50774113 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacataaaaaaaaaaaaaaaaggaatggagggagtatcaataaaacttcaattatcggagaaaaaaagtttcta 50774014  T
Q  196 gggtttgaaccatgcaaacatatagagctccatatattattgcagttcctcctccct 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774013 gggtttcaaccatgcaaacatatagagctccatatattattgcagttcctcctccct 50773957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8955931 - 8955774
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8955931 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 8955832  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtatc 159  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8955831 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggaatatc 8955774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 45590864 - 45591019
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45590864 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatatgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 45590963  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45590964 tccttacaacttatgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 45591019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 36971170 - 36971310
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36971170 tattaaaatagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 36971269  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36971270 ttcttaaaacttgtgtcaaaagctaaaacatcaaaagaaaa 36971310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 18835829 - 18835969
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18835829 tattaaagtagttgtgacatttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttagttaaaaacacacaaatatttatatattttaattac 18835928  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  18835929 tccttaaaatttgtgcgaaaagataaaacatcaaaataaaa 18835969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 33288557 - 33288421
Alignment:
Q  4 taaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaa-aaaacacacaaatatttatatactttaattactc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33288557 taaagtagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattactc 33288458  T
Q  103 cttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaa 139  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33288457 cttaaaacttgtgtcaatagctaaaacatcaaaagaa 33288421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 34334454 - 34334613
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatat---ttatatactttaat 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||    
T  34334454 tattaaagtagttgtgatctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacatttaagtaaaaaacatacaaatgtttattatatactttaat 34334553  T
Q  98 tactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34334554 tactccttaagacttgtgttaagagtttaatcatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 34334613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Original strand, 39482003 - 39482138
Alignment:
Q  20 tttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39482003 tttggtttatcacatgtgaatttaatactaaataaggacattttagtcaaaaatacacaaatatttatatactttaattactccttaaaacttgtgtcaa 39482102  T
Q  120 gagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagt 156  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39482103 gagctaaaacatcaaaag-aaaagaaatggagggagt 39482138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30469343 - 30469228
Alignment:
Q  26 ttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagata 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  30469343 ttatcacatgtgaatttaatgataaacaatgacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattacttcttaaaacttgtgtcaagagtta 30469244  T
Q  126 aaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||||||||||    
T  30469243 aaacatcaaaagaaaa 30469228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 158
Target Start/End: Original strand, 49162249 - 49162366
Alignment:
Q  40 tttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |    
T  49162249 tttaatgataaataaggacattttagtaaaaatcacacaaatatttatatactttaattactctttaaaacttgtgccaatagctaaaacatcaaaag-a 49162347  T
Q  140 aaaggaatggagggagtat 158  Q
    || ||||||||||||||||    
T  49162348 aagggaatggagggagtat 49162366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26025675 - 26025546
Alignment:
Q  9 tagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaa 108  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  26025675 tagttgtgacctttggcttatcacatgtgaatttaatcataaataaggacattttagtccaaaacatacaaatatttctatactttaattactccctaag 26025576  T
Q  109 atttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26025575 acttgtgccaagagctaaaacatcaaaaga 26025546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33109053 - 33108924
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||   |||||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  33109053 tattaaatgagttgtgacctttgtcttattacatgtaaatttaattataaataagaattttttagctcaaaacatagaaatatttatataatttaattat 33108954  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaaca 130  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  33108953 ttcttaagacttgtgtcaagagttaaaaca 33108924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 29875076 - 29875232
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29875076 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 29875175  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29875176 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 29875232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 34208660 - 34208816
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34208660 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcatatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 34208759  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34208760 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaa-aaaaaggaatggagggagtat 34208816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12399101 - 12398946
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12399101 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 12399002  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12399001 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 12398946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 4145816 - 4145965
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4145816 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 4145915  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggag 151  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4145916 tccttaaaacttgtgtcaagaactaaaacatcaaaag-aaaaggaatggag 4145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 23090420 - 23090576
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23090420 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcatatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttgtatactttaattac 23090519  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23090520 tccttaaaacttgtgtcaagaggtaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 23090576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4695317 - 4695162
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4695317 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaataataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 4695218  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4695217 tccttaaaacttgtgtcaagagctataacatcaaaag-aaaagaaatggagggagta 4695162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22646064 - 22645924
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22646064 tattaaagtagttgtgacttttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatattttagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 22645965  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  22645964 tccttaaaacttgtgccaagagctaaaacattaaaagaaaa 22645924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3077719 - 3077860
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3077719 tattaaagtagttgtgacattttgtttatcacatatgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 3077818  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaa 142  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3077819 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacataaaaaaaaaaa 3077860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42757949 - 42757805
Alignment:
Q  10 agttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaa 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  42757949 agttatgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaaaacatttaagtaaaaa-cacacaacg-tttatatactttaattactccttaaaa 42757852  T
Q  110 tttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42757851 cttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 42757805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Original strand, 4939669 - 4939781
Alignment:
Q  26 ttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagata 125  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||| | |  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | || ||||||||| ||    
T  4939669 ttatcacatgtgaatttaattataaataaaggctttttaatccaaaacatacaaatacttatatattttaattacttattaagacttatgtcaagagtta 4939768  T
Q  126 aaacatcaaaaga 138  Q
    |||||||||||||    
T  4939769 aaacatcaaaaga 4939781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 19574883 - 19574943
Alignment:
Q  76 acaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  19574883 acaaatatttatatactttaattacttcttaagacttgtgccaagagttaaaacatcaaaa 19574943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 594251 - 594124
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| || | |||  |||||| | |||||||| |||  |||||||||    
T  594251 tattaaatgagttgtgatatttggtttaacacatgtaaatttaataaaaattaaggatatcttagtccaaaacatataaatatttttatgttttaattac 594152  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaa 128  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  594151 tccttaagacttgtgttaagagttaaaa 594124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 22528127 - 22528244
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  | |||| | |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22528127 tattaaaagagttgtgacctttggcttatcacatatgaatttaatcataaataaaaatattttaatccaaaacatacaaatatttctatactttaattac 22528226  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaa 119  Q
      ||||||| |||||||||    
T  22528227 -gcttaaaacttgtgtcaa 22528244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12096332 - 12096231
Alignment:
Q  26 ttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagata 125  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||  | || | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  12096332 ttatcacatgcgaatttaattataaagaaggacattttagtccataagatacaaatacttatatgatttaattactccttaagtcttgtgtcaagagcta 12096233  T
Q  126 aa 127  Q
    ||    
T  12096232 aa 12096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Original strand, 32144285 - 32144353
Alignment:
Q  39 atttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaa 107  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| |||   ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32144285 atttaattataaacaaggactttttagttcgaaacataaaaatatttatatacgttaattactccttaa 32144353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17904285 - 17904440
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17904285 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 17904384  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17904385 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 17904440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29890981 - 29890825
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29890981 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaagtgtttatatactttaattac 29890882  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29890881 tccttaaaacttgtgtcaaaagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 29890825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 46467490 - 46467334
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46467490 tattaaagtagttgcgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 46467391  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46467390 tccttaaaatttgtgtcaagagttaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 46467334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6387847 - 6387692
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6387847 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 6387748  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6387747 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggaggaagta 6387692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 26770301 - 26770457
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26770301 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 26770400  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26770401 tccttaaaacttgtgtcaagaattaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagtat 26770457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4405231 - 4405387
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4405231 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttagtaaaaatcacacaaatatttatatattttaattac 4405330  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4405331 tccttaaaacttgtgccaatagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 4405387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29427319 - 29427179
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29427319 tattaaagtagttgtgatctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 29427220  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29427219 tccttaaaacttgtgtcaagaggtaaaacatcaaaagaaaa 29427179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31502809 - 31502652
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaa--aaaacacacaaatatttatatactttaatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31502809 tattaaagtagttgtgacttttggcttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaaaacacacaaatgtttatatactttaatt 31502710  T
Q  99 actccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31502709 actccttaaaacttgcatcaagagctaaaacatcaaaagaaaa--gaatggagggagtat 31502652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37179487 - 37179331
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaa-aaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  37179487 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaacaaggacatttaagtaaaaaaacacacaaatgtctatatactttcatta 37179388  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37179387 ctccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 37179331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 9876385 - 9876539
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9876385 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttagtaaaaatcacacaaatatttatatattttaattac 9876484  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| || || ||| || ||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  9876485 tccttaaaacttatgccaatagctaaaacat--aaaaaaaaaagaatggaggaagta 9876539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6389854 - 6390002
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6389854 tattaaagtagttgtgacatttgatttatcacat--------aatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaactac 6389945  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6389946 ttcttaaaacttgtgtcaagagttaaaacatcaaaagaaaaa-gaattgagggagtat 6390002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 48049124 - 48049280
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48049124 tattaaaggagttgtgacctttggcttatcacatgtaaatttaatcataaataaggacattttagtcaaaaacatacaaatatttctatactttaattac 48049223  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    | ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  48049224 tacttaagacttgtgccaagagctaaaacatcaaaagataaaaaaacggagggagta 48049280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 41922009 - 41921892
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41922009 tattaaagtagttgcaacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaa-acacaaatgtttatatactttaattac 41921911  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  41921910 tccttaaaacttgtgtcaa 41921892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 9332461 - 9332599
Alignment:
Q  20 tttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaac-acacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtca 118  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  9332461 tttgatttatcacatgtgaatttaatactaaataaggacattttagtaaaaaaatacacaaatatttatatactttaattactccttaaaacttgtgtta 9332560  T
Q  119 agagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9332561 agagctaaaatatcaaaag-aaaagaaatggagggagtat 9332599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31858247 - 31858110
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  31858247 tattaaatgagttgtgacctttgacttatcacatgtaaatttaatcataaataaggatattttaatcaaaaacatacaaatgtttatattctttaattac 31858148  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31858147 tccttaagatttgtgtcaagagttaaaacatcaaaaga 31858110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 12252194 - 12252331
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12252194 tattaaaggagttatgacttttggcttatcacatgtgaatttaatcataaataaggacattttagtccaaaacatacaaatatttctatacattaattac 12252293  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    ||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12252294 tccttaagacttgtgccaagtgttaaaacatcaaaaga 12252331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 46689989 - 46690140
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||     ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46689989 tattaaagaagttgtgacatttggcttatcacatgtgaatttaattataat----gacattttagtccaaaacatacaaatatttatatactttaattac 46690084  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  46690085 tccttaagatttgtgccaagagctaaaacatcaaaagataaa-aaatggagggagta 46690140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9215617 - 9215461
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9215617 tattaaaggagttgtgacctttgatttatcacatgtgaatttaattataa-taaggacattttagtccaaaacatacaaatatttatgtactttaattac 9215519  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtatc 159  Q
    | ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  9215518 ttcttaagatttgtaccaagagctaaaacatcaaaagataaa-aaatagagggagtatc 9215461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 5514901 - 5515038
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  5514901 tattaaaagagttgtgacctttgatttatcacatgtgaatttaatcataaataagaacattttagtacaaaacatacaaatatttttatattttaattat 5515000  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    || |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5515001 tcattaagacttgtgtcaagagctaatacatcaaaaga 5515038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22753223 - 22753067
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  22753223 tattaaaaaagttgtgacctttgacttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacattttagtccaaaacattcaaatatttttatgcttcaattac 22753124  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    || |||| | ||||||| |||  |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22753123 tcattaagacttgtgtccagaactaaaacatcaaaa-tataagaaatggagggagtat 22753067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 33974616 - 33974753
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||  || ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  33974616 tattaaaggagttgtgaccttcagcttatcacatgtgagtttaatcataaataaggatattttagtccaatacataccaatatttctatactttaattac 33974715  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  33974716 tccttaagacttgtgccaagagctaaaacgtcaaaaga 33974753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 7839182 - 7839315
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||    ||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7839182 tattaaaggagttgtgacatttggtttattacatgtgaatttaatcataaata----cattttatttcaaaacatacaaatatttatatactttaattac 7839277  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    ||||||| | |||||  || || ||||| |||||||||    
T  7839278 tccttaatacttgtgataacagctaaaatatcaaaaga 7839315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19523863 - 19523813
Alignment:
Q  86 atatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19523863 atatactttaattactccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaa 19523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 162
Target Start/End: Original strand, 29427409 - 29427446
Alignment:
Q  124 taaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtatcaat 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29427409 taaaacatcaaaagaaaa-ggaatggagggagtatcaat 29427446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 136
Target Start/End: Original strand, 30920301 - 30920361
Alignment:
Q  76 acaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaa 136  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  30920301 acaaatatttcaataatttaattactctttaatatttatgtcaaaagttaaaacatcaaaa 30920361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18997089 - 18997244
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18997089 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacgcacaaatgtttatatactttaattac 18997188  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18997189 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 18997244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18999628 - 18999783
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18999628 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacgcacaaatgtttatatactttaattac 18999727  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18999728 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 18999783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1352151 - 1351996
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1352151 tattaaagtagttgtgacctttagtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 1352052  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1352051 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 1351996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29371693 - 29371538
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29371693 tattaaagtacttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 29371594  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29371593 tccttaaaatttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 29371538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32677632 - 32677477
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32677632 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 32677533  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32677532 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 32677477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29014845 - 29014689
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29014845 tattaaagtagttgcgatttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 29014746  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29014745 ttcttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 29014689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41349526 - 41349370
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41349526 tattaaagtagttgtgacctttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 41349427  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41349426 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 41349370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 39528871 - 39529026
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39528871 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 39528970  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39528971 tccttaaaacttgtgtcaaaagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 39529026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39807134 - 39806979
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39807134 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 39807035  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39807034 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatgaagggagta 39806979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36737989 - 36737833
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  36737989 tattaaagtagttgtgacatttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattat 36737890  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36737889 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 36737833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 39518529 - 39518685
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39518529 tattaaagtagttatgacatttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 39518628  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39518629 tcattaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 39518685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 38855439 - 38855595
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38855439 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttagtaaaaatcacacaaatatttatatattttaattac 38855538  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38855539 tccttaaaacttgtgccaatagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 38855595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 32840070 - 32840226
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaa-aacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32840070 tattaaaatagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaaacacacaaatgtttatatactttaatta 32840169  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32840170 ctccttaaaacttgtgtcaagagctaaaatatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 32840226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 22157380 - 22157520
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22157380 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatactaaataaggacattttagtcaaaaatagacaaatatttatatactttaattac 22157479  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22157480 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaa 22157520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21974271 - 21974411
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21974271 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatactaaataaggatattttagtcaaaaatagacaaatatttatatactttaattac 21974370  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21974371 tccttaaaacttgtgtcaagagttaaaacatcaaaagaaaa 21974411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21996702 - 21996842
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21996702 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatactaaataaggatattttagtcaaaaatagacaaatatttatatactttaattac 21996801  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21996802 tccttaaaacttgtgtcaagagttaaaacatcaaaagaaaa 21996842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 28228558 - 28228700
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactt---taat 97  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||    
T  28228558 tattaaagtagctgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaa-aatggcatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaataat 28228656  T
Q  98 tactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28228657 tacttcttaaaacttgtgtcaagagccaaaacatcaaaaaaaaa 28228700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Original strand, 55367714 - 55367801
Alignment:
Q  41 ttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  55367714 ttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatatttatatactttaattactccttaaaacttgtatcaagagctaaaa 55367801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 49040999 - 49040862
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  49040999 tattaaaggagttgggacctttggtttatcaaatgtgaatttaatcataaacaaggacattttagtctaaaacatacaaatatttctataacttaattac 49040900  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    |||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  49040899 tcctcaagacttgtgccaggagctaaaacatcaaaaga 49040862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 840731 - 840849
Alignment:
Q  38 aatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaag 137  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  840731 aatttaatcctaaataaggacattttagtccaaaacatacaaatttttctatactttaattatttcttaagacttgtgccaagagttaaaacatcaaaag 840830  T
Q  138 aaaaaggaatggagggagta 157  Q
    | |||  |||||||||||||    
T  840831 ataaa-aaatggagggagta 840849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 55366030 - 55366071
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaattt 42  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  55366030 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaattt 55366071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33837884 - 33837729
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33837884 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 33837785  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33837784 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 33837729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45334431 - 45334276
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45334431 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 45334332  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45334331 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 45334276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2508951 - 2508811
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2508951 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 2508852  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2508851 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaa 2508811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 25106333 - 25106488
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25106333 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggaaatttaaataaaaaacacacaagtgtttatatactttaattac 25106432  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25106433 tccttaaaacttgtgtcaaaagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 25106488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 9740107 - 9740263
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagt-aaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9740107 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataatgacatttaagtaaaaaaaaacacaaatgtttatatactttaatta 9740206  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9740207 ctccctaaaacttgtgtcaagagttaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 9740263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 28379069 - 28379224
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28379069 tattaaagtagttgtgacctttgatttatcgcatgtgaatttaaggataaataaggacatttaagtaaaaaacgcacaaatgtttatatactttaatcac 28379168  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28379169 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 28379224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38495627 - 38495472
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  38495627 tattaaagtagttatgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatattttaattac 38495528  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38495527 tccttaaaacttatgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 38495472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2626393 - 2626249
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgt-aaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2626393 tattaaagtaattgtgacctttggtttatcacatgtgaaatttaatgataaataaggacatttaaataaaaa-cacacaaatgtttatatactttaatta 2626295  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaagga 145  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2626294 ctccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaaagga 2626249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13469639 - 13469507
Alignment:
Q  24 gtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagaga 123  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13469639 gtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaaggaaaaa-cacacaaatatttatatactttaattactccttaaaacttgtgtcaagagt 13469541  T
Q  124 taaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13469540 taaaacatcaaaag-aaaaggaatggaaggagtat 13469507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32183627 - 32183480
Alignment:
Q  10 agttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaa 109  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  32183627 agttgcgacctttggcttatcacatgtgaatttaatcataaataaggacattttagtccaaaacatacaaatatttctatgctttaattactccttaaga 32183528  T
Q  110 tttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  32183527 cttgtgccaagagctaaaacatcaaaagataaa-aaatggagggagtat 32183480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 27793197 - 27793058
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||  |||||||| |||||||     
T  27793197 tattaaattagttgtgacatttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggatatttaaat-aaaaatacacaaat-gttatatacattaattat 27793100  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaa 142  Q
    ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  27793099 tccttaaaacttatgtccagaggtaaaacataaaaaaaaaaa 27793058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 47669241 - 47669396
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47669241 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 47669340  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47669341 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 47669396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10737856 - 10737698
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10737856 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatctgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattgc 10737757  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtatca 160  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10737756 tccttaaaacttgtatcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtatca 10737698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 48564939 - 48565095
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48564939 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaagtgtttatatactttaattac 48565038  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48565039 tccttaaaacttgtgtcaaaagccaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 48565095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 46220381 - 46220539
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46220381 tattaaagtagttgtgacctttagtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacaattaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 46220480  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtatca 160  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46220481 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtatca 46220539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 9831625 - 9831777
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9831625 tattaaaatagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataagaacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 9831724  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggaggga 154  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9831725 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggaggga 9831777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 4055608 - 4055748
Alignment:
Q  3 ttaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactc 102  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055608 ttaaagtagttgtaacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacatttaagtgaaaaacacacaaatatttatatactttaattactc 4055707  T
Q  103 cttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaag 143  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4055708 cttaaaacttgtgtcaagagttaaaacatcaaaagaaaaag 4055748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3384750 - 3384597
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3384750 tattaaagtagttgtgacctttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaaaacatttaagtaaaaaacacacaaacgtttatatactttaattac 3384651  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggag 155  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3384650 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaaa-gaatggagggag 3384597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1236206 - 1236071
Alignment:
Q  20 tttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaa 119  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1236206 tttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattactccttaaaacttgtgtcaa 1236107  T
Q  120 gagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagt 156  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1236106 gagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagt 1236071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 8889564 - 8889720
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagt-aaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8889564 tattaaagtagttgtgacttttagtttatcacatgtgaatttaatgataaataatgacatttaagtaaaaaaacacacaaatgtatatatactttaatta 8889663  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8889664 cttcttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaa-taaaaggaatggagggagta 8889720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 39241274 - 39241414
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241274 tattaaagtagttgtgacttttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataagaatattttggtcaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 39241373  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39241374 ttcttaaaatttatgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaa 39241414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Original strand, 18126977 - 18127112
Alignment:
Q  6 aagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactcctt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18126977 aagtagttgtgacttttggtttatcacatgtgaatttaatgataaaaaagaatatttaagtaaaacacacacaaatgtttatatactttaattactcctt 18127076  T
Q  106 aaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18127077 aaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaaaaaaa 18127112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 4817391 - 4817532
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4817391 tattaaggtagttgtgatatttagtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaacacacacaaatgtttatatactttaattac 4817490  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaa 142  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  4817491 tccttaaaacttgtgtcaagagttaaaacataaaaaaaaaaa 4817532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 7414329 - 7414436
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagt-aaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7414329 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcatatgtgaatttaatgataaataaggatatttaagtaaaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 7414428  T
Q  100 ctccttaa 107  Q
    ||||||||    
T  7414429 ctccttaa 7414436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37875854 - 37875726
Alignment:
Q  28 atcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaa 127  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  37875854 atcaaatgtgaatttaatgataaataaggatattttagtcaaaa-catacaaatatttctatacattaattattccttaagacttgtgccaagagctaaa 37875756  T
Q  128 acatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37875755 acatcaaaag-aaaagaaatggagggagtat 37875726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 107
Target Start/End: Original strand, 26842573 - 26842668
Alignment:
Q  12 ttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaa 107  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26842573 ttgtgacatttgacttatcacatgtgaatttaatcataaataaggatattttagtctaaaacatatacatatttctatactttaattactccttaa 26842668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 49112400 - 49112323
Alignment:
Q  30 cacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaa 107  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  49112400 cacatgtgaatttaatcataaataaggatattttagtccaaaacatacaaatatttttatactttaattactctttaa 49112323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 15233877 - 15234032
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15233877 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaatatacaaatgtttatatactttaattac 15233976  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15233977 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 15234032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43041004 - 43040849
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43041004 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttagtaaaaatcacacaaatatttatatattttaattac 43040905  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43040904 tccttaaaacttgtgccaatagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 43040849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 41252537 - 41252678
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaa-aacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41252537 tattaaagtagttgtgacatttgttttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaaacacacaaatgtttatatactttaatta 41252636  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41252637 ctccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaagaaaa 41252678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 41643016 - 41643173
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41643016 tattaaagtagttgtgacctttgatttatcacatgttaatttaatgataaataaggacattttagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 41643115  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    || ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  41643116 tctttaaaatgtgtgccaagaattaaaacatcaaaagaaaaaaaaatgaagggagtat 41643173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35793062 - 35792922
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35793062 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcgcatgtgaatttaatgataaatcaggacatttaagtaaaaaacacacaaatgtttatatactttaattac 35792963  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35792962 tccttaaaacttatgtcaagagttaaaacatcaaaagaaaa 35792922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44104704 - 44104546
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgactttt--ggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaa-cacacaaatatttatatactttaat 97  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44104704 tattaaggtagttgtgacctttatggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacatttaagtaaaaaaacacacaaatgtttatatactttaat 44104605  T
Q  98 tactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44104604 tactccttaaaacttatgtcaaaagttaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 44104546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31903535 - 31903400
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31903535 tattaaagtagttgtgacctttggattatcacatgtgaatttaatgataaataaggacattttggtcaaaaacacacaaata-ttatatactttaattac 31903437  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaag 137  Q
    ||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||    
T  31903436 tccttaaaagtcgtgccaaaagctaaaacatcaaaag 31903400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 21727794 - 21727931
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21727794 tattaaaggagttgtggcatttgccttatcacatgtgaatttaatcataaacaaggacattttagtccaaaacatacaaatatttatatacttcaattac 21727893  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaaga 138  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21727894 tccttaagacttgtgccaagagctaaaacatcaaaaga 21727931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 31296205 - 31296278
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacaca 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31296205 tattaaagtagttgtgatatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaa--aaaaaacaca 31296278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27312271 - 27312113
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaa-aaaacacacaaatatttatatactttaatta 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27312271 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaaacacacaaatatttatatactttaatta 27312172  T
Q  100 ctccttaaaatttgtgtc-aagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27312171 ctccttaaaacttgtgtctaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagtat 27312113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 2543203 - 2543359
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2543203 tattaaagtagttgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaagacatttaagtaaaaaacacacagatgtttatatactttaattac 2543302  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2543303 ttcttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaacgaatggagggagtat 2543359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 32274556 - 32274711
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32274556 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcatatgtgactttaatgataaatacggacatttaagtaaaaaatacacaaatgtttatatactttaattac 32274655  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32274656 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaatgaatggagggagta 32274711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29452697 - 29452557
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452697 tattaaaatagttgtgacctttgatttatcacatgtgaatttaatgataaataatgactttttagtcaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 29452598  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaa 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29452597 tccttaaaacttgtgccaagagttaaaacatcaaaagaaaa 29452557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 31171145 - 31170989
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31171145 tattaaaatagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatattttaatcaaaaatacacaaatatttatatactttaattac 31171046  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31171045 tccttaaaatttgtgctaagaactaaaatatcaaaag-aaaagaaatggagggagtat 31170989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7156392 - 7156256
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7156392 tattaaagtaattgtgacatttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggatattttagtcaaagacacacaaatatttatatactttaattat 7156293  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaag 137  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7156292 tccttaaaacttgtatcaagagctaaaacatcaaaag 7156256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 158
Target Start/End: Original strand, 5008308 - 5008409
Alignment:
Q  56 gacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  5008308 gacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaacttgtgttaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatgaaaggag 5008406  T
Q  156 tat 158  Q
    |||    
T  5008407 tat 5008409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 18742078 - 18742223
Alignment:
Q  10 agttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattactccttaaaa 109  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  18742078 agttatgacttttggcttatgacatgagaatttattgatatataaggatattttagtcaaaa-cacacaaatatttttatacattaattattccttaaga 18742176  T
Q  110 tttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18742177 cttgtgccaagaggtaaaacatcaaaag-aaaagaaatggagggagta 18742223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8504797 - 8504733
Alignment:
Q  92 tttaattactccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagta 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8504797 tttaattactccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatggagggagta 8504733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 8504857 - 8504796
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacattt 62  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8504857 tattaaagtagttgtgacctttggtttattatatgtgaatttaatgataaataaggacattt 8504796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 5004004 - 5004057
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataa 54  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  5004004 tattaaagtagttttgacatttgatttatcacaggtgaatttaatgttaaataa 5004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 44742 - 44896
Alignment:
Q  1 tattaaagtagttgtgacttttggtttatcacatgtaaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaaacacacaaatatttatatactttaattac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44742 tattaaagtagttgtgacctttggtttatcacatgtgaatttaatgataaataaggacatttaagtaaaaa--acacaaatatttatatactttaattac 44839  T
Q  101 tccttaaaatttgtgtcaagagataaaacatcaaaagaaaaaggaatggagggagtat 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  44840 tccttaaaacttgtgtcaagagctaaaacatcaaaag-aaaaggaatgtagagagtat 44896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University