View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19582_low_30 (Length: 238)

Name: NF19582_low_30
Description: NF19582
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19582_low_30
NF19582_low_30
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-238)||(8958-9185)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (11-234)||(16658090-16658313)
chr3 (11-238)||(52920890-52921117)
chr3 (25-238)||(22141229-22141443)
chr3 (11-238)||(18142300-18142527)
chr3 (19-238)||(49665848-49666067)
chr3 (11-238)||(30053702-30053929)
chr3 (19-238)||(12962556-12962775)
chr3 (63-238)||(15833878-15834054)
chr3 (66-238)||(16390987-16391158)
chr3 (47-238)||(13382651-13382841)
chr3 (47-238)||(13393245-13393435)
chr3 (35-221)||(16812258-16812446)
chr3 (41-238)||(19884010-19884206)
chr3 (47-238)||(5627387-5627577)
chr3 (47-238)||(5875665-5875855)
chr3 (47-238)||(10654669-10654859)
chr3 (47-238)||(13122320-13122510)
chr3 (47-238)||(19779044-19779234)
chr3 (47-238)||(24660576-24660766)
chr3 (47-238)||(39372730-39372920)
chr3 (66-238)||(1054383-1054554)
chr3 (47-238)||(5511353-5511543)
chr3 (47-238)||(5546993-5547183)
chr3 (47-238)||(6220087-6220277)
chr3 (47-238)||(8775351-8775541)
chr3 (47-234)||(12248835-12249021)
chr3 (47-238)||(12296188-12296378)
chr3 (47-238)||(14466249-14466439)
chr3 (47-238)||(16476936-16477126)
chr3 (47-238)||(18484720-18484910)
chr3 (47-238)||(20683168-20683358)
chr3 (47-238)||(20721771-20721961)
chr3 (47-238)||(23757956-23758146)
chr3 (47-238)||(37867105-37867295)
chr3 (47-238)||(41684336-41684526)
chr3 (44-238)||(14008069-14008261)
chr3 (66-238)||(9005879-9006050)
chr3 (44-236)||(12397601-12397792)
chr3 (66-238)||(15662095-15662266)
chr3 (66-238)||(16670534-16670705)
chr3 (47-238)||(4744396-4744586)
chr3 (47-234)||(6500389-6500575)
chr3 (66-236)||(29905558-29905728)
chr3 (66-236)||(29946723-29946893)
chr3 (66-236)||(29995877-29996047)
chr3 (47-238)||(38195401-38195591)
chr3 (136-238)||(29951013-29951115)
chr3 (136-238)||(30000167-30000269)
chr3 (45-238)||(14131414-14131606)
chr3 (47-238)||(11216093-11216283)
chr3 (47-238)||(28324218-28324408)
chr3 (66-238)||(14321071-14321243)
chr3 (85-238)||(31113366-31113518)
chr3 (47-238)||(9390590-9390781)
chr3 (47-238)||(14581873-14582063)
chr3 (44-238)||(16793808-16793997)
chr3 (47-238)||(4404945-4405137)
chr3 (66-238)||(15226370-15226542)
chr3 (47-234)||(18851069-18851257)
chr3 (47-238)||(7803918-7804108)
chr3 (47-238)||(17962084-17962275)
chr3 (143-238)||(9993375-9993470)
chr3 (28-134)||(15834111-15834218)
chr3 (143-234)||(17909468-17909559)
chr3 (146-238)||(1793952-1794044)
chr3 (44-238)||(13654390-13654579)
chr3 (47-238)||(18006988-18007179)
chr3 (122-238)||(21317782-21317894)
chr3 (44-238)||(11514274-11514464)
chr3 (179-238)||(20627100-20627159)
chr3 (152-234)||(17034036-17034114)
chr3 (63-134)||(15834025-15834097)
chr3 (63-134)||(15834068-15834140)
chr3 (194-233)||(9295050-9295089)
chr3 (75-134)||(15648223-15648281)
chr3 (191-234)||(28352726-28352769)
chr3 (154-234)||(19643124-19643201)
chr3 (191-225)||(48987265-48987299)
chr3 (47-91)||(9993322-9993366)
chr3 (81-133)||(15552543-15552594)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-238)||(4411-4637)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-238)||(30271-30497)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (24-238)||(36134659-36134873)
chr1 (11-238)||(20953825-20954051)
chr1 (11-234)||(21134531-21134753)
chr1 (25-234)||(22464174-22464383)
chr1 (11-233)||(19717999-19718220)
chr1 (47-238)||(153703-153893)
chr1 (47-238)||(20255538-20255728)
chr1 (47-238)||(7507923-7508113)
chr1 (47-238)||(12623212-12623402)
chr1 (47-238)||(12731133-12731323)
chr1 (47-238)||(12741726-12741916)
chr1 (47-238)||(20883275-20883465)
chr1 (47-238)||(35648086-35648276)
chr1 (47-238)||(38095663-38095853)
chr1 (47-238)||(51655859-51656049)
chr1 (47-238)||(3172209-3172399)
chr1 (47-238)||(5833839-5834029)
chr1 (47-238)||(19179546-19179736)
chr1 (47-234)||(21878359-21878544)
chr1 (47-238)||(36246407-36246597)
chr1 (47-238)||(4167845-4168035)
chr1 (47-234)||(22643399-22643584)
chr1 (47-238)||(35400560-35400750)
chr1 (47-238)||(47617934-47618125)
chr1 (47-238)||(21864247-21864437)
chr1 (72-238)||(20909914-20910079)
chr1 (47-238)||(7679835-7680025)
chr1 (47-238)||(20109372-20109562)
chr1 (81-238)||(19169783-19169939)
chr1 (47-199)||(23067484-23067635)
chr1 (66-228)||(26561074-26561235)
chr1 (122-235)||(18516678-18516787)
chr1 (74-237)||(7744504-7744661)
chr1 (195-238)||(23065432-23065475)
chr1 (47-100)||(5649804-5649857)
chr1 (179-234)||(29216272-29216328)
chr1 (126-233)||(19337235-19337337)
chr1 (191-225)||(15491074-15491108)
chr1 (193-234)||(10751617-10751658)
chr1 (72-173)||(26898554-26898653)
chr1 (44-92)||(18516642-18516690)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (19-236)||(143578-143795)
scaffold0007 (68-236)||(58722-58889)
scaffold0007 (81-134)||(58693-58746)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (13-238)||(8382-8607)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (13-234)||(13260075-13260296)
chr7 (26-238)||(14426995-14427207)
chr7 (27-238)||(22577486-22577696)
chr7 (25-238)||(9709303-9709515)
chr7 (40-238)||(12173802-12174000)
chr7 (11-234)||(13031535-13031759)
chr7 (40-234)||(4428529-4428724)
chr7 (27-238)||(16316042-16316252)
chr7 (40-238)||(16556284-16556482)
chr7 (40-238)||(16609180-16609378)
chr7 (57-238)||(48236432-48236613)
chr7 (11-238)||(332132-332359)
chr7 (63-238)||(13649181-13649356)
chr7 (40-238)||(2265009-2265207)
chr7 (47-238)||(15887746-15887936)
chr7 (47-238)||(2715684-2715874)
chr7 (27-238)||(13137390-13137600)
chr7 (40-194)||(21695878-21696032)
chr7 (47-238)||(467049-467239)
chr7 (47-238)||(5710930-5711120)
chr7 (47-238)||(11096697-11096887)
chr7 (47-238)||(26400171-26400361)
chr7 (72-236)||(15216978-15217141)
chr7 (47-238)||(1988218-1988408)
chr7 (47-238)||(8012176-8012366)
chr7 (47-238)||(8618028-8618218)
chr7 (47-238)||(9085925-9086115)
chr7 (47-238)||(21002476-21002666)
chr7 (47-238)||(24735414-24735604)
chr7 (47-238)||(42866505-42866695)
chr7 (47-238)||(167524-167714)
chr7 (47-234)||(4212657-4212843)
chr7 (47-238)||(9160388-9160578)
chr7 (63-238)||(13171908-13172081)
chr7 (47-238)||(40052126-40052316)
chr7 (68-238)||(22089765-22089934)
chr7 (122-238)||(4821957-4822073)
chr7 (47-238)||(6877325-6877515)
chr7 (47-238)||(11005844-11006034)
chr7 (47-238)||(17960192-17960382)
chr7 (68-238)||(5686144-5686313)
chr7 (66-238)||(18419792-18419963)
chr7 (44-238)||(18361130-18361319)
chr7 (145-238)||(26699219-26699312)
chr7 (154-238)||(9433906-9433990)
chr7 (47-186)||(25214841-25214979)
chr7 (48-234)||(9763131-9763312)
chr7 (44-234)||(19144032-19144216)
chr7 (44-234)||(20743431-20743615)
chr7 (122-235)||(14303948-14304059)
chr7 (37-131)||(13649330-13649423)
chr7 (48-234)||(9803623-9803803)
chr7 (122-234)||(26822757-26822865)
chr7 (11-92)||(4822061-4822142)
chr7 (76-235)||(11571821-11571974)
chr7 (47-134)||(5686289-5686376)
chr7 (47-134)||(22089910-22089997)
chr7 (146-234)||(17890946-17891030)
chr7 (191-234)||(7592141-7592184)
chr7 (191-234)||(15201867-15201910)
chr7 (47-91)||(9434011-9434055)
chr7 (47-91)||(19993479-19993523)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (25-238)||(22318092-22318305)
chr2 (11-238)||(24377549-24377774)
chr2 (11-238)||(24850060-24850286)
chr2 (25-238)||(28711120-28711333)
chr2 (44-238)||(22454416-22454610)
chr2 (47-238)||(34803766-34803956)
chr2 (47-238)||(40222965-40223155)
chr2 (66-238)||(22764323-22764494)
chr2 (47-238)||(11404876-11405066)
chr2 (66-236)||(22751613-22751783)
chr2 (47-238)||(29244854-29245044)
chr2 (47-238)||(43083280-43083470)
chr2 (47-238)||(4210523-4210713)
chr2 (47-238)||(9907568-9907758)
chr2 (47-238)||(10267626-10267816)
chr2 (47-238)||(10278203-10278393)
chr2 (47-238)||(22959738-22959928)
chr2 (47-238)||(24337810-24338000)
chr2 (47-238)||(24424925-24425115)
chr2 (47-238)||(43346039-43346229)
chr2 (47-238)||(9772712-9772902)
chr2 (47-238)||(19312374-19312565)
chr2 (47-234)||(24813989-24814175)
chr2 (47-238)||(27222032-27222222)
chr2 (81-234)||(20569948-20570100)
chr2 (47-238)||(28731294-28731484)
chr2 (47-238)||(28379224-28379416)
chr2 (47-238)||(21171838-21172029)
chr2 (144-238)||(26867737-26867831)
chr2 (144-238)||(20417131-20417225)
chr2 (47-238)||(35253650-35253834)
chr2 (47-238)||(35264259-35264443)
chr2 (122-230)||(29410139-29410242)
chr2 (44-233)||(28769974-28770158)
chr2 (193-234)||(18848820-18848861)
chr2 (191-225)||(1799548-1799582)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (26-238)||(102-314)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (11-238)||(21625586-21625812)
chr6 (11-236)||(13602642-13602866)
chr6 (11-233)||(20112146-20112367)
chr6 (40-238)||(22802605-22802803)
chr6 (40-238)||(19483266-19483463)
chr6 (11-238)||(16877701-16877928)
chr6 (47-238)||(25788325-25788515)
chr6 (36-238)||(17048236-17048441)
chr6 (47-238)||(9122530-9122720)
chr6 (47-238)||(17981918-17982108)
chr6 (47-238)||(17984107-17984297)
chr6 (47-238)||(18543568-18543758)
chr6 (47-238)||(19288745-19288935)
chr6 (47-238)||(26026067-26026257)
chr6 (47-238)||(27342302-27342492)
chr6 (47-238)||(27403042-27403232)
chr6 (44-238)||(25593012-25593205)
chr6 (66-238)||(25686113-25686287)
chr6 (66-238)||(13913654-13913825)
chr6 (47-235)||(27385044-27385230)
chr6 (47-235)||(27475457-27475643)
chr6 (47-234)||(4631498-4631683)
chr6 (47-238)||(11236139-11236330)
chr6 (47-238)||(12726846-12727036)
chr6 (47-238)||(16931041-16931231)
chr6 (47-238)||(19461377-19461567)
chr6 (47-238)||(26865396-26865586)
chr6 (47-238)||(32311083-32311273)
chr6 (47-238)||(34817190-34817380)
chr6 (47-238)||(3661990-3662180)
chr6 (47-238)||(27373404-27373594)
chr6 (47-238)||(27463754-27463944)
chr6 (47-238)||(18925128-18925317)
chr6 (67-238)||(20062057-20062227)
chr6 (47-238)||(32971946-32972136)
chr6 (122-238)||(18378740-18378856)
chr6 (72-238)||(17043299-17043464)
chr6 (47-225)||(25794481-25794658)
chr6 (44-238)||(31126860-31127048)
chr6 (42-238)||(14069525-14069722)
chr6 (66-238)||(25734932-25735110)
chr6 (143-238)||(12855629-12855724)
chr6 (47-236)||(20462372-20462556)
chr6 (143-238)||(29918489-29918583)
chr6 (47-188)||(12358788-12358928)
chr6 (47-175)||(25589886-25590013)
chr6 (11-92)||(18378844-18378924)
chr6 (37-101)||(21235595-21235659)
chr6 (114-175)||(13553148-13553208)
chr6 (144-219)||(16742703-16742775)
chr6 (191-234)||(18419692-18419735)
chr6 (192-225)||(22065208-22065241)
chr6 (47-91)||(12855733-12855777)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (11-238)||(88882-89108)
chr5 (42-238)||(5430343-5430539)
chr5 (11-238)||(30743494-30743719)
chr5 (37-238)||(21099162-21099363)
chr5 (28-238)||(21660708-21660919)
chr5 (47-238)||(13523681-13523871)
chr5 (47-238)||(23706895-23707085)
chr5 (47-238)||(40400526-40400716)
chr5 (47-238)||(6985804-6985994)
chr5 (47-238)||(14040103-14040293)
chr5 (47-238)||(15993892-15994082)
chr5 (47-238)||(17617185-17617376)
chr5 (47-238)||(17729042-17729233)
chr5 (47-238)||(27042793-27042983)
chr5 (47-238)||(31358659-31358850)
chr5 (47-238)||(39361821-39362011)
chr5 (47-238)||(39491495-39491685)
chr5 (47-237)||(23405937-23406126)
chr5 (47-238)||(1109725-1109915)
chr5 (47-238)||(9346050-9346240)
chr5 (47-238)||(14447598-14447788)
chr5 (47-238)||(22156611-22156801)
chr5 (47-238)||(23306352-23306542)
chr5 (47-238)||(23372018-23372208)
chr5 (47-238)||(24588669-24588859)
chr5 (47-238)||(24817449-24817639)
chr5 (47-238)||(27470067-27470257)
chr5 (47-238)||(30228060-30228250)
chr5 (47-238)||(31843466-31843656)
chr5 (47-238)||(34062111-34062301)
chr5 (47-238)||(35225579-35225769)
chr5 (47-238)||(36583104-36583294)
chr5 (47-238)||(42052867-42053057)
chr5 (47-238)||(5291139-5291329)
chr5 (47-238)||(19477476-19477666)
chr5 (47-238)||(22685509-22685699)
chr5 (47-238)||(23478856-23479048)
chr5 (72-238)||(14558581-14558746)
chr5 (47-238)||(27603981-27604168)
chr5 (47-238)||(20561814-20562004)
chr5 (47-238)||(20797186-20797376)
chr5 (47-238)||(21414796-21414986)
chr5 (47-238)||(24926719-24926909)
chr5 (47-238)||(31448027-31448217)
chr5 (47-234)||(36697737-36697923)
chr5 (144-238)||(17447292-17447386)
chr5 (143-238)||(21519646-21519741)
chr5 (122-234)||(25935805-25935912)
chr5 (47-134)||(14558726-14558813)
chr5 (191-234)||(24421428-24421471)
chr5 (191-234)||(30445834-30445877)
chr5 (191-234)||(30455206-30455249)
chr5 (191-225)||(5609276-5609310)
chr5 (47-91)||(21519593-21519637)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (11-238)||(19620499-19620724)
chr4 (25-238)||(13575570-13575782)
chr4 (11-238)||(15139708-15139933)
chr4 (11-238)||(13004296-13004522)
chr4 (28-238)||(15474568-15474779)
chr4 (51-238)||(15206778-15206964)
chr4 (47-238)||(451253-451443)
chr4 (47-238)||(10750541-10750731)
chr4 (47-238)||(10964310-10964500)
chr4 (47-238)||(17918729-17918919)
chr4 (47-234)||(18762476-18762662)
chr4 (47-238)||(21997090-21997280)
chr4 (47-238)||(40469981-40470171)
chr4 (47-238)||(14777834-14778024)
chr4 (47-238)||(27657313-27657503)
chr4 (47-238)||(30936465-30936655)
chr4 (47-238)||(36019013-36019203)
chr4 (74-238)||(11536556-11536719)
chr4 (47-238)||(24027477-24027668)
chr4 (47-238)||(16818732-16818923)
chr4 (66-238)||(10291214-10291386)
chr4 (66-238)||(11515745-11515916)
chr4 (47-238)||(16256546-16256736)
chr4 (47-238)||(24640960-24641150)
chr4 (47-238)||(16305799-16305991)
chr4 (44-238)||(18776450-18776639)
chr4 (44-235)||(13306483-13306667)
chr4 (143-238)||(55755299-55755394)
chr4 (145-236)||(19954452-19954543)
chr4 (165-238)||(5874078-5874151)
chr4 (44-174)||(19887815-19887941)
chr4 (44-98)||(13890776-13890830)
chr4 (47-133)||(19571768-19571854)
chr4 (193-238)||(14356749-14356794)
chr4 (47-175)||(10327871-10327998)
chr4 (66-138)||(39520260-39520332)
chr4 (193-238)||(19888723-19888768)
chr4 (193-235)||(24620020-24620062)
chr4 (191-234)||(26821117-26821160)
chr4 (194-233)||(50066858-50066897)
chr4 (191-234)||(54690919-54690962)
chr4 (193-231)||(16321789-16321827)
chr4 (47-91)||(19954397-19954441)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (25-238)||(3597789-3598002)
chr8 (11-234)||(20381829-20382051)
chr8 (19-238)||(19927523-19927744)
chr8 (28-234)||(21288883-21289090)
chr8 (37-234)||(23184714-23184911)
chr8 (11-238)||(15335489-15335715)
chr8 (11-238)||(15424554-15424780)
chr8 (11-238)||(15515858-15516084)
chr8 (40-238)||(22663632-22663830)
chr8 (47-238)||(30324715-30324905)
chr8 (66-238)||(23371250-23371421)
chr8 (47-238)||(3358623-3358813)
chr8 (47-238)||(9341814-9342004)
chr8 (47-238)||(15780131-15780321)
chr8 (47-238)||(15790720-15790910)
chr8 (47-238)||(19129399-19129589)
chr8 (47-238)||(44481772-44481963)
chr8 (66-236)||(3833430-3833599)
chr8 (72-238)||(20259047-20259212)
chr8 (72-238)||(21045677-21045842)
chr8 (47-238)||(23784018-23784208)
chr8 (47-238)||(29077399-29077589)
chr8 (47-238)||(29087650-29087840)
chr8 (47-238)||(36078605-36078795)
chr8 (47-238)||(36293571-36293761)
chr8 (47-234)||(17518527-17518714)
chr8 (47-238)||(209575-209765)
chr8 (47-238)||(723198-723388)
chr8 (47-238)||(32087691-32087881)
chr8 (133-238)||(22745948-22746053)
chr8 (122-238)||(24646815-24646931)
chr8 (47-238)||(242492-242682)
chr8 (47-238)||(795862-796052)
chr8 (47-238)||(23468865-23469054)
chr8 (63-237)||(23352588-23352761)
chr8 (47-238)||(19419037-19419227)
chr8 (142-238)||(19225620-19225716)
chr8 (143-238)||(13688048-13688143)
chr8 (47-238)||(26111902-26112092)
chr8 (122-238)||(18684967-18685085)
chr8 (122-238)||(18730532-18730650)
chr8 (165-238)||(6151740-6151813)
chr8 (43-236)||(18773111-18773295)
chr8 (143-238)||(18154420-18154515)
chr8 (44-235)||(23192089-23192275)
chr8 (144-234)||(24502272-24502358)
chr8 (66-161)||(22163912-22164006)
chr8 (47-133)||(6151827-6151913)
chr8 (24-134)||(23352509-23352617)
chr8 (19-70)||(18720986-18721037)
chr8 (207-238)||(16189477-16189508)
chr8 (50-92)||(18684937-18684979)
chr8 (50-92)||(18730502-18730544)
chr8 (120-235)||(24497708-24497819)
chr8 (27-88)||(24646923-24646983)
chr8 (47-91)||(19225724-19225768)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (11-238)||(14097-14324)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (11-238)||(60284-60510)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (11-238)||(5008-5235)
scaffold0028 (191-234)||(95437-95480)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (24-236)||(12948-13157)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (25-234)||(23150-23359)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (11-238)||(134788-135015)
scaffold0011 (46-238)||(60017-60207)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (28-238)||(19798-20009)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (40-234)||(7408-7602)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (40-238)||(6560-6758)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (40-234)||(11013-11207)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (11-238)||(24755-24981)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (11-238)||(4175-4402)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-238)||(32904-33116)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (40-238)||(9672-9870)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (40-234)||(7884-8079)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (40-238)||(34233-34432)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (11-238)||(902-1127)
scaffold0040 (66-238)||(70270-70441)
scaffold0040 (44-238)||(3469-3657)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (42-238)||(7795-7992)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (40-238)||(15007-15209)
[»] scaffold0435 (1 HSPs)
scaffold0435 (11-202)||(4719-4908)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (40-238)||(21129-21328)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (40-238)||(11884-12083)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (81-238)||(36244-36401)
scaffold0120 (81-238)||(42604-42761)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (11-238)||(17167-17393)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (11-238)||(41135-41361)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (47-238)||(211202-211392)
scaffold0014 (47-238)||(217071-217261)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (47-236)||(12238-12426)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (66-238)||(10710-10881)
[»] scaffold0537 (1 HSPs)
scaffold0537 (47-238)||(4121-4311)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (47-238)||(17476-17666)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (66-238)||(3636-3807)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (75-238)||(7213-7375)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (47-238)||(23276-23466)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (47-238)||(9803-9993)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (47-238)||(31772-31962)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (47-238)||(192581-192771)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (66-238)||(6591-6762)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (47-238)||(12695-12886)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (47-238)||(3924-4114)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (47-238)||(4090-4280)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (47-238)||(1375-1565)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (47-238)||(9315-9505)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (47-238)||(52954-53144)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (66-236)||(128303-128473)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (47-238)||(46998-47188)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (47-238)||(61706-61896)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (72-236)||(2668-2831)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (66-238)||(175999-176170)
scaffold0017 (47-212)||(53262-53426)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (47-238)||(2507-2697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (47-238)||(58957-59147)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (47-234)||(5933-6119)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (66-236)||(9699-9868)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (66-236)||(15542-15711)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (122-238)||(2232-2348)
scaffold0473 (40-92)||(2192-2244)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (47-201)||(12052-12205)
scaffold0398 (47-188)||(3777-3917)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (126-238)||(10279-10391)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (28-138)||(3982-4092)
scaffold0069 (136-234)||(4864-4963)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (142-238)||(3437-3533)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (143-234)||(37573-37664)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (44-238)||(87381-87569)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (47-118)||(3311-3382)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (122-173)||(9953-10003)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (126-233)||(292-394)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (180-233)||(16439-16494)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (191-234)||(2676-2719)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (191-234)||(27125-27168)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (66-129)||(30530-30593)


Alignment Details
Target: scaffold0009 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 8958 - 9185
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8958 agattattctgagtgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaacatgtatagaactcaggggaagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 9057  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9058 ctcagggggagcttacaaacctcgtacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatggttgtcatcatcaaaa 9157  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9158 atggggagattgttggaacaaaatgtgt 9185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 16658090 - 16658313
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16658090 agattattttgagtgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaacatggatggaactcagggggagctttcaaacctcaccttaaagtactattgga 16658189  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16658190 ctcagggggagcttacaaacctcatacccttatattcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 16658289  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16658290 agggggagattgttggaacaaaat 16658313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52921117 - 52920890
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  52921117 agattattctgagtgttatttagttcttaaatgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttgaagtactattgca 52921018  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52921017 ctcagggagagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcataaaaa 52920918  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52920917 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 52920890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22141443 - 22141229
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||    
T  22141443 gttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcaaggggagctt 22141344  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22141343 acaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaaatactattgtttgtcatcataaaaaagggggagattgt 22141244  T
Q  224 tggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||    
T  22141243 tggaacaaaatgtgt 22141229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 18142300 - 18142527
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142300 agattattctgagagttctttcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 18142399  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18142400 cttagggggagcattcaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattacactttttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 18142499  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18142500 agggagagattgttggaacaaaatgtgt 18142527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 49665848 - 49666067
Alignment:
Q  19 ctgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggg 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49665848 ctgagtgttatttcgttcttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggactcaggg 49665946  T
Q  118 gaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaaggggga 217  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  49665947 ggagcttacaaacctcataccctaataatcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggga 49666046  T
Q  218 gattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49666047 gattgttggaacaaaatgtgt 49666067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 30053702 - 30053929
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattgg 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30053702 agattattctgagtgttatttcgaatttaa-tgatgaatttaattaacatggatataactcagtgggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattgg 30053800  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  30053801 actaagggggagcttacaaacctcataccctaatggtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaa 30053900  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30053901 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 30053929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 12962556 - 12962775
Alignment:
Q  19 ctgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaagggg 118  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12962556 ctgagtgttatttcatttttaaatgatgaatttaattaacttgaatagaacttagggaaagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcaaggg 12962655  T
Q  119 aatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggag 218  Q
     | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12962656 gagcttataaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattacacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggag 12962755  T
Q  219 attgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  12962756 attgtttgaacaaattgtgt 12962775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15834054 - 15833878
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattag 161  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15834054 attggacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattagatttagggggagcttacaaacctcatacccaaatagtcaacgtgttaattag 15833955  T
Q  162 attaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833954 attaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15833878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 16390987 - 16391158
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||||||    
T  16390987 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagtcaacttattaattagatta 16391085  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16391086 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16391158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 13382651 - 13382841
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  13382651 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 13382749  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382750 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13382841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 13393245 - 13393435
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  13393245 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 13393343  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13393344 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13393435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16812446 - 16812258
Alignment:
Q  35 tcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  16812446 tctttaatgataaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcacctt-aagtactattggactcaggtggagcttacaaacctca 16812348  T
Q  135 tacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcaca----ttttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16812347 taccc-tatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgtacattttttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagatt 16812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 19884010 - 19884206
Alignment:
Q  41 atgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccct 140  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||||||| |||||||    
T  19884010 atgatgaatttaattaacttggatagaattg-gggggagtttacaaaactcgccttaaagtactattggatttagagggagcttacaaaccttataccct 19884108  T
Q  141 tatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  19884109 tataatcaaattgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttagaaataaatgtgt 19884206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 5627387 - 5627577
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  5627387 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 5627485  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627486 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5627577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 5875665 - 5875855
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  5875665 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 5875763  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875764 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5875855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 10654669 - 10654859
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  10654669 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 10654767  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10654768 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10654859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13122510 - 13122320
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  13122510 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 13122412  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13122411 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13122320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19779234 - 19779044
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  19779234 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 19779136  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779135 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19779044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24660766 - 24660576
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  24660766 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 24660668  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24660667 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24660576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39372920 - 39372730
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  39372920 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 39372822  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39372821 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 39372730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1054554 - 1054383
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  1054554 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 1054456  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1054455 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttgaaacaaaatgtgt 1054383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5511543 - 5511353
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  5511543 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 5511445  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5511444 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5511353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 5546993 - 5547183
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  5546993 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 5547091  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547092 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5547183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 6220087 - 6220277
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |  ||||||||||| || ||   | ||    
T  6220087 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagtttacaaacctc-tatcccagtggt 6220185  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6220186 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6220277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8775541 - 8775351
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  8775541 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 8775443  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775442 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 8775351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 12248835 - 12249021
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  12248835 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattatactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 12248933  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248934 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 12249021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 12296188 - 12296378
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  12296188 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 12296286  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12296287 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12296378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14466439 - 14466249
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  14466439 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 14466341  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14466340 caacttattaattagatcaacaacaattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14466249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16477126 - 16476936
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  16477126 aatttaactaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 16477028  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477027 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16476936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18484910 - 18484720
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  18484910 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 18484812  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18484811 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 18484720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 20683168 - 20683358
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  20683168 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 20683266  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20683267 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20683358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20721961 - 20721771
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  20721961 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 20721863  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20721862 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20721771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23758146 - 23757956
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  23758146 aatttaaataataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 23758048  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23758047 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23757956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37867295 - 37867105
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  37867295 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 37867197  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867196 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 37867105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41684526 - 41684336
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  41684526 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 41684428  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41684427 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 41684336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14008261 - 14008069
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |     
T  14008261 atgaatttaattaacttgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gagcaattggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaaa 14008163  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14008162 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgaaca-tttcaatacaagtgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatgtgt 14008069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 9005879 - 9006050
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| | |||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||| |    
T  9005879 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctactagactcagggggagcttacaaacctcttacc-taggagtcaacttgttaattagatca 9005977  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9005978 acaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaccaaaatgtgt 9006050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12397792 - 12397601
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  || || ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || || | |||| |||||||| |||||  |    
T  12397792 atgaatttaattaacttgtatagaacctagggggagcttacaaacctcaccttaaaggactattagactcagtgggagcttataaacctcagaccctatt 12397693  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12397692 ggtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacaattt-aataatagtgtttgtcatcataaaaaaggggaagattgttggaacaaaatgt 12397601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 15662095 - 15662266
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||| |    
T  15662095 gaacttaggaggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatatc-tagtggtcaacttgttaattagatca 15662193  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15662194 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15662266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 16670534 - 16670705
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||||| |    
T  16670534 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaatctcatatc-tagtagtcaacttgttaattagatca 16670632  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16670633 acaacaattgaacattttaaatactattgtttttcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16670705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4744586 - 4744396
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  4744586 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 4744488  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4744487 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaagtgtgt 4744396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 6500389 - 6500575
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  6500389 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaatctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 6500487  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500488 caacttattaattagatcaacaacaattgaacagtttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 6500575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 29905558 - 29905728
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  29905558 gaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatc 29905656  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29905657 aacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 29905728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 29946723 - 29946893
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  29946723 gaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatc 29946821  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946822 aacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 29946893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 29995877 - 29996047
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||     
T  29995877 gaactcagggggagcttacacacctcaccttaaaagatctattagactcaggggcagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatc 29995975  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995976 aacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 29996047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38195591 - 38195401
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  38195591 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 38195493  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38195492 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 38195401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 29951013 - 29951115
Alignment:
Q  136 acccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951013 acccttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 29951112  T
Q  236 tgt 238  Q
    |||    
T  29951113 tgt 29951115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 30000167 - 30000269
Alignment:
Q  136 acccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30000167 acccttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 30000266  T
Q  236 tgt 238  Q
    |||    
T  30000267 tgt 30000269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 14131414 - 14131606
Alignment:
Q  45 tgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttata 144  Q
    |||||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |    
T  14131414 tgaatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagagctattgcacttagggggaccttacaaacctcagaccctaaaa 14131513  T
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14131514 gtcaacttgttaattagattaccaacaattgaac-tttttaatacaaatgtttgtcatcatattaaaggaggagattgttagaacaaaatgtgt 14131606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 11216093 - 11216283
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| | |||||||||||| || ||   || |    
T  11216093 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactctgggggagcttacaaacctc-tatcccggtatt 11216191  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11216192 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatgtgt 11216283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 28324218 - 28324408
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  28324218 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 28324316  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28324317 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactgttgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 28324408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 14321071 - 14321243
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||   ||| |||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |    
T  14321071 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcaggggttgctttcaaacctc-tatcctagaagtcaacttgttaattagatca 14321169  T
Q  166 acaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321170 acaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14321243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Original strand, 31113366 - 31113518
Alignment:
Q  85 aaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttta 184  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31113366 aaacctcaccttaaaaatctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tggcagtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttta 31113464  T
Q  185 aatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31113465 aatactattgtttgtcgtcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 31113518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9390590 - 9390781
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    ||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| | ||| | |||||||||||| || ||   |||    
T  9390590 aatttaattaatgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcatggggagcttacaaacctc-tatcccagtag 9390688  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9390689 tcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9390781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14582063 - 14581873
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| | | || ||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||    
T  14582063 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaagg-ctattagactcagggggagcttacaaacctcatacccaaa-agt 14581966  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581965 caacgtgttaattaggttaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14581873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 16793808 - 16793997
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||  |||||||||| || ||||| |     
T  16793808 atgaatttaattaacttagatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcagactcaggggag-cttacaaaccacagaccctaa- 16793904  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16793905 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgagcattt--aatactagtgtttgtcatcataaaaatgggagagattgttggaacaaaatgtgt 16793997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4405137 - 4404945
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaat--cttacaaacctcatacccttata 144  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |   ||||||||||||   |||  | |    
T  4405137 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagagcttacaaacctctatcccaga-a 4405039  T
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4405038 gtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgatggaacaaaatgtgt 4404945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 15226370 - 15226542
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||   ||| |||||||  | || |  ||||||||||||||||||||| |    
T  15226370 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcaggggttgctttcaaacctttttcc-tagtagtcaacttgttaattagatca 15226468  T
Q  166 acaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15226469 acaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15226542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 18851069 - 18851257
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaat--cttacaaacctc-atacccttat 143  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |   |||||||||||| |||||  ||     
T  18851069 aatttaattaatgagtatagaactcagggggggcttacaaacctcaacttaaagatctattagactcagggggagagcttacaaacctctataccagta- 18851167  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18851168 -gtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 18851257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 7803918 - 7804108
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| | ||| |||| |||   |||   ||||    
T  7803918 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctataagactcagggggagctttcaaaactctgtcccag-tagt 7804016  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7804017 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagaatgttagaacaaaatgtgt 7804108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17962275 - 17962084
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| | | || ||| | |||||||| || ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||    
T  17962275 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaaag-ctattagactgagggggagcttacaaacctcataccca-acagt 17962178  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt--aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17962177 caacgtgttaattagattaacaacaattgaacaattctgaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17962084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 9993375 - 9993470
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993375 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9993470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15834218 - 15834111
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||    
T  15834218 atttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggcgagcttac 15834119  T
Q  127 aaacctca 134  Q
    ||||||||    
T  15834118 aaacctca 15834111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Original strand, 17909468 - 17909559
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909468 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 17909559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 1793952 - 1794044
Alignment:
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1793952 tcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggatattgttggaacaaaatgtgt 1794044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13654579 - 13654390
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||| | |||||| |||||||| ||  ||||| | |||||| |||| | ||| | ||||||||||||| ||||| |     
T  13654579 atgaatttaattaacttggatataacttaaggggagtttacaaacttcgtcttaa-gaactattagactcaaggggagcttacaaacctcagaccctaa- 13654482  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13654481 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgaccatt---aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgctggaacaaaatgtgt 13654390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18007179 - 18006988
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| | | || ||| | |||||||| || ||||||||||||||||   | ||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||  | |||    
T  18007179 aatttaattaacaagtatagaatttagggggagctttcaaacctcaccttaaaagcc-attagactcagggggagcttacgaacctcataccca-acagt 18007082  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt--aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007081 caacgtgttcattagattaacaacaattgaacaattctgaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 18006988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21317894 - 21317782
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||| || ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  21317894 cttacaaacctcataccctaa-agtcaacttgttaattagattaacaacaattgaccatt---aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagcggaagatt 21317799  T
Q  222 gttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||    
T  21317798 gttggaacaaaatgtgt 21317782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11514464 - 11514274
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaag-gggaatcttacaaacctcataccctta 142  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||| || ||||||  |||||||||| | |||||| |||| || ||| | ||||| ||||||| ||||| |    
T  11514464 atgaatttaattaacttgaatagaactcaggggaagcttacaagtctcaccttaa-gaactattagactcagaggggagcttacgaacctcagaccctaa 11514366  T
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||   |||   |||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11514365 gt-tcaacttgttaattagattaacaacaattgactatt---aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaatgtgt 11514274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 238
Target Start/End: Original strand, 20627100 - 20627159
Alignment:
Q  179 attttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20627100 attttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtaggaacaaaatgtgt 20627159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 17034036 - 17034114
Alignment:
Q  152 tgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17034036 tgttaattagattaacaacaattg----ttccaaatacttatgtttgtcatcatcaaaaagggggagatggttggaacaaaat 17034114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15834097 - 15834025
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcacctt-aaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15834097 attggacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtattattggacttagggggagcttacaaacctca 15834025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15834140 - 15834068
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15834140 attggacttagggcgagcttacaaacctcaccttaaaagtattattggacttagggggagcttacaaacctca 15834068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9295089 - 9295050
Alignment:
Q  194 gtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaa 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9295089 gtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaa 9295050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15648281 - 15648223
Alignment:
Q  75 gggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15648281 gggagcttacaaacctcaccttaagg-actattagactcagggggatcttacaaacctca 15648223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28352769 - 28352726
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  28352769 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 28352726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Original strand, 19643124 - 19643201
Alignment:
Q  154 ttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||   |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  19643124 ttaattagattaacaacaattgactatt---aatacttgtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattaatggaacaaaat 19643201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Original strand, 48987265 - 48987299
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48987265 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 48987299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 9993322 - 9993366
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  9993322 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 9993366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15552594 - 15552543
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctc 133  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15552594 ttacaaacctcaccttaagg-actattagactcagggggatcttacaaacctc 15552543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 4411 - 4637
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4411 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 4509  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4510 ctcaggggcagcttacaaacctcatacccttacagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 4609  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4610 agggggagattgttgaaacaaaatgtgt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 30271 - 30497
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30271 agattattttgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaggggaaacttacaaacctcaccttaaagtactattgga 30370  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30371 cttaggggag-cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 30469  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30470 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36134873 - 36134659
Alignment:
Q  24 tgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatct 123  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  36134873 tgttattgcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagct 36134774  T
Q  124 tacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36134773 tacaaacctcatacccttatactcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgt 36134674  T
Q  224 tggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||    
T  36134673 tggaacaaaatgtgt 36134659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 20953825 - 20954051
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20953825 agattattctgagtgatattttgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcctaaaaacctcaccttaaagtactattgga 20953923  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20953924 cttagggagagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 20954023  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20954024 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 20954051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 21134531 - 21134753
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21134531 agattattctgagtgttatttcgaatttaa-tgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 21134629  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  21134630 ctcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaaagtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaa 21134729  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21134730 agggggagattgttggaacaaaat 21134753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 22464174 - 22464383
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  22464174 gttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcaggcgaagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagctt 22464273  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22464274 acaaacctcatacctctatagtcaacgtgttcattagattaacaaaaattgagcattttaaatactaatgtttgtcagcatcaaaaagggggagattgtt 22464373  T
Q  225 ggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||    
T  22464374 ggaacaaaat 22464383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19718220 - 19717999
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19718220 agattattctgagtgttaattcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaattcaggatgagcttacaaacctcaccttaaagtactattaga 19718122  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19718121 ctcagagggagcttacaaacctcatacccttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattacatattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 19718022  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaa 233  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  19718021 agggagagattgttggaagaaaa 19717999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 153703 - 153893
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  153703 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatcccaga-agt 153801  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  153802 caacttattaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20255728 - 20255538
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  20255728 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggacttagggggagcttacaaacctcatacc-tggtagt 20255630  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255629 caacttgttaattggatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20255538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7508113 - 7507923
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  7508113 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 7508015  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508014 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 7507923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 12623212 - 12623402
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || |||  | ||    
T  12623212 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcctagtggt 12623310  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12623311 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12623402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12731323 - 12731133
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  12731323 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 12731225  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12731224 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12731133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12741916 - 12741726
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  12741916 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 12741818  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12741817 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12741726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 20883275 - 20883465
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  20883275 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagctttcaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-ttgtagt 20883373  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20883374 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgctggaataaaatgtgt 20883465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 35648086 - 35648276
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  35648086 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 35648184  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35648185 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 35648276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38095853 - 38095663
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  38095853 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 38095755  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38095754 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 38095663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 51655859 - 51656049
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  51655859 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagacttagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 51655957  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51655958 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 51656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3172399 - 3172209
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  3172399 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccaga-agt 3172301  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172300 caacttattaattagatcaacgacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 3172209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5834029 - 5833839
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  5834029 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 5833931  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5833930 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5833839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19179736 - 19179546
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| || || | |||||||||||| || ||   | ||    
T  19179736 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagcgggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 19179638  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19179637 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19179546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21878544 - 21878359
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||    
T  21878544 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatccaga-agt 21878447  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21878446 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 21878359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 36246407 - 36246597
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  36246407 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 36246505  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246506 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36246597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4168035 - 4167845
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || |    | ||    
T  4168035 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatctcagtggt 4167937  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167936 caacttattaattagatcaacaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 4167845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22643584 - 22643399
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  22643584 aatttaattaacttgtatagaacttagtgggagcttacaaacctcaccttaaaagtctatttgactcagggggagcttacaaacctcatacc-tggtagt 22643486  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22643485 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcataaaaaa-ggggagattgttggaacaaaat 22643399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 35400560 - 35400750
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  35400560 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 35400658  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400659 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 35400750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 47617934 - 47618125
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  47617934 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 47618032  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47618033 caacttattaattagatcaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 47618125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21864437 - 21864247
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  21864437 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 21864339  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21864338 caacttattaattagatcaacaacaatttaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaatgtgt 21864247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20910079 - 20909914
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  20910079 agggagagcttacaaaccgcaccttaaaggactattggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaaaagtttacttgttaattaaattaacaaca 20909980  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| ||||| | |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909979 attgaacattgt-aatactagtgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20909914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7680025 - 7679835
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaagggga-atcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  | ||| |||||||| || ||   |||    
T  7680025 aatttaattaataagaatagaactcagggg-agcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcaggggggagctttcaaacctc-tatcccagtag 7679928  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7679927 tcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 7679835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 20109372 - 20109562
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20109372 aatttaattaacttgaatagaacttagggggagcttacaaatctcaccttaaagatattttggacttagggggagcttacaaacctcagaccctaatagt 20109471  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  20109472 caacttgttaattaggttaacaacaattgaacatttt-aatacaagtgtatgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaatataatgtgt 20109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Original strand, 19169783 - 19169939
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacat 180  Q
    ||||||| || ||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  19169783 ttacaaatcttaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatact-tgagagtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaaaat 19169881  T
Q  181 tttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19169882 tttaaatactattgtttgtcatcattaaaaaggggaagattgttggaacaaaatgtgt 19169939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23067635 - 23067484
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||  ||||    
T  23067635 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagtttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcata-cctggtagt 23067537  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  23067536 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgt 23067484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26561235 - 26561074
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| |  || |||| ||| | |||   |||||||||| |||||||||| |    
T  26561235 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctataagactcagggggagatttcaaaactc-tgccccagtagtcaacttattaattagatca 26561137  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaa 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26561136 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaa 26561074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Original strand, 18516678 - 18516787
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18516678 cttacaaacctcagaccctaa-agtcaacttgttaattagattaacaacaattg-acattt--aataccaatctttgtcatcaccaaaaagggggagatt 18516773  T
Q  222 gttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  18516774 gttggaacaaaatg 18516787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 7744504 - 7744661
Alignment:
Q  74 ggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttata-gtcaacttgttaattagattaacaacaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| | ||| | |||||||||||||   ||| | | |||| ||||||||||||||||||||       
T  7744504 ggggagcttacaaacctcacccaaaaggactattagactcaaggggagcttacaaacctca---cctaagaagtca-cttgttaattagattaacaa--- 7744596  T
Q  173 ttgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtg 237  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744597 ttgaatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtg 7744661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23065475 - 23065432
Alignment:
Q  195 tttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065475 tttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23065432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 5649804 - 5649857
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaag 100  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5649804 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaag 5649857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29216328 - 29216272
Alignment:
Q  179 attttaaatattaatgtttgtcatcat-aaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  29216328 attttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaagggggaaatagttggaacaaaat 29216272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19337337 - 19337235
Alignment:
Q  126 caaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    ||  |||||||   | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19337337 caaacctcgtaccctga-agtcaacttgataattagattaacaacaattg----ttccaaatatttgaggttgtcatcattaaaaaggggaagattgttg 19337243  T
Q  226 gaacaaaa 233  Q
    ||| ||||    
T  19337242 gaataaaa 19337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15491108 - 15491074
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15491108 aatgtttgtcatcataaaaaatggggagattgttg 15491074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10751658 - 10751617
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10751658 tgtttgtcatcataaaaaatggggggattgttgaaacaaaat 10751617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26898653 - 26898554
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  | |||||  |||| ||| | | ||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26898653 agggggagcttgcaaacctcaccttatgg-actatcagactcaggaggagcttacaaacctcatactatga-agtcaactggttaattagattaacaaca 26898556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 18516642 - 18516690
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18516642 atgaatttaattaacctggatagaacttagggggagcttacaaacctca 18516690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 143795 - 143578
Alignment:
Q  19 ctgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaagggg 118  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  143795 ctgagtgttatttcgattttaattgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcatcttaaagtactattggactcagggg 143696  T
Q  119 aatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggag 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  143695 aagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaaattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggag 143596  T
Q  219 attgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  143595 attgttggaacaaaatgt 143578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Original strand, 58722 - 58889
Alignment:
Q  68 actcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaac 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || |||| ||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||    
T  58722 actcagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctgttagacttagggagagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatcaac 58820  T
Q  168 aacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58821 aacaattgaacgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgt 58889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Original strand, 58693 - 58746
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||    
T  58693 ttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctca 58746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8607 - 8382
Alignment:
Q  13 attatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggact 112  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8607 attattctgagtgttgtttcgttcttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgaact 8508  T
Q  113 aaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaag 212  Q
     |  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  8507 caatgggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaataattgcacattttaaatactaatgtttgtcattatcaaaaag 8408  T
Q  213 ggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8407 ggggagattgttggaacaaaatgtgt 8382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 13260075 - 13260296
Alignment:
Q  13 attatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggact 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13260075 attattctgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacttggatagaactcaaggggagcttaaaaacctcaccttaaagtactattcgact 13260174  T
Q  113 aaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaag 212  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13260175 tagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaag 13260274  T
Q  213 ggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13260275 ggggagattgttggaacaaaat 13260296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14427207 - 14426995
Alignment:
Q  26 ttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctta 125  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  14427207 ttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattggactcagggggagctta 14427108  T
Q  126 caaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14427107 caaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttg 14427008  T
Q  226 gaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| ||||||||    
T  14427007 gaacgaaatgtgt 14426995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 22577486 - 22577696
Alignment:
Q  27 tatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||    
T  22577486 tatttcgtt-ttaaatgattaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactataggacttagggggagcttac 22577584  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22577585 aaacctcaaacccttatactcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttgg 22577684  T
Q  227 aacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  22577685 aacaaaatgtgt 22577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 9709303 - 9709515
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  9709303 gttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttagaaacctcacgttaaagtactattggactcagggggagctt 9709402  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9709403 acaaacctcatacc-ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgtt 9709501  T
Q  225 ggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  9709502 ggaacaaaatgtgt 9709515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 12173802 - 12174000
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||    
T  12173802 aatgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggacacagggggagcttagaaacctcataccc 12173901  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173902 ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12174000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 13031535 - 13031759
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttctta-aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgg 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13031535 agattattctgagtgttattttgtttttttaatgatgaatttaattattatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattag 13031634  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    |||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  13031635 actttgggggagcttaaaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcgaa 13031734  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13031735 aagggggtgattattggaacaaaat 13031759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Original strand, 4428529 - 4428724
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4428529 aatgatgaatttaattaacatggatataactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggactaagggggagcttacaaacctcatacc 4428628  T
Q  139 cttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4428629 ctaattgtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4428724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 16316042 - 16316252
Alignment:
Q  27 tatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  16316042 tatttcgtt-ttaaatgatgaatttaattaacttgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttagagtactattgtacttagggggagcttac 16316140  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  16316141 aaacctcaaatccttatagccaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaataataatgtttgtcaccatcaaaaagggggagattgttga 16316240  T
Q  227 aacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  16316241 aacaaaatgtgt 16316252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 16556284 - 16556482
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||    
T  16556284 aatgatgaatttaattaatatggtgagaactcaaggggagcttacaaaccacaccttaaagtactattggactcatggagagcttacaaacctcataccc 16556383  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16556384 ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaatattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 16556482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16609378 - 16609180
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||    
T  16609378 aatgatgaatttaattaatatggtgagaactcaaggggagcttacaaaccacaccttaaagtactattggactcatggagagcttacaaacctcataccc 16609279  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16609278 ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaatattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 16609180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 48236432 - 48236613
Alignment:
Q  57 atatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgtta 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48236432 atatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaatactattggactcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgtta 48236531  T
Q  157 attagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  48236532 attagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgatgaaacaaaatgtgt 48236613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 332359 - 332132
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  332359 agattattctgagtgttattgcgttttataattatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaatactattgga 332260  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcaca-ttttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  332259 ctcagggggagcttacaaacctcataccc-tacattcaacttgttaattagattaacaacaattgcaaatttttaaatattatcgtttgtcatcatcaaa 332161  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  332160 aaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 332132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13649356 - 13649181
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaga 162  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13649356 attggacttagggggagcttacaaaccacaccttagagtactattggacttagggggaacttacaaacttcaaacccttatagtcaacttgttaattaga 13649257  T
Q  163 ttaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13649256 ttaacaataattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13649181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 2265009 - 2265207
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  2265009 aatgatgaatttaattaacatgaatagaactcaggggaagcttacaaacttcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcataccc 2265108  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2265109 tcacagacaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgattgtcatcataaaaaatgaggagattgttggaacaaaatgtgt 2265207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 15887746 - 15887936
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  15887746 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 15887844  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887845 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15887936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 2715684 - 2715874
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||   ||||    
T  2715684 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tgccccagtagt 2715782  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2715783 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 2715874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 13137390 - 13137600
Alignment:
Q  27 tatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | || |     
T  13137390 tatttcgtttttaaatgaagaatttaattaacttggatagaactcatggg-agcttataaacctcacctaagagtactatcagacttagggggagctgat 13137488  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13137489 aaaccgcatacccttaaagtcaacttgttaattggattaataacaattacacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggtgagattgttgg 13137588  T
Q  227 aacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  13137589 aacaaaatgtgt 13137600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21696032 - 21695878
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| ||||    
T  21696032 aatgatgaatttaattaacttggataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattcgacttagggggagattacaaacctcaaaccc 21695933  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatg 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21695932 ttacagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatg 21695878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 467049 - 467239
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  467049 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 467147  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  467148 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 467239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5711120 - 5710930
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  5711120 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 5711022  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5711021 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5710930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11096887 - 11096697
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  11096887 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 11096789  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11096788 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 11096697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 26400171 - 26400361
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  26400171 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 26400269  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26400270 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26400361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15217141 - 15216978
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15217141 agggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcatcttgttaattagatcaacaaca 15217043  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15217042 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 15216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1988408 - 1988218
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  1988408 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 1988310  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988309 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 1988218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 8012176 - 8012366
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  8012176 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 8012274  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8012275 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 8012366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8618218 - 8618028
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  8618218 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 8618120  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8618119 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 8618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9086115 - 9085925
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  9086115 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 9086017  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086016 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9085925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 21002476 - 21002666
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  21002476 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttagagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 21002574  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002575 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 21002666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24735604 - 24735414
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  24735604 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccataaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 24735506  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735505 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24735414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42866695 - 42866505
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  42866695 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 42866597  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42866596 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 42866505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 167714 - 167524
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  167714 aatttaattaataagaatagaacttagggagagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 167616  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167615 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 167524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4212843 - 4212657
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  4212843 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 4212745  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4212744 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4212657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9160578 - 9160388
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||| || || ||  |||||    
T  9160578 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacatc-tatcccaatagt 9160480  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9160479 caacttattaattaaatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaattgtgt 9160388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Original strand, 13171908 - 13172081
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaga 162  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13171908 attgaacttagggggagcttacaaacctcaccttaa-gagctattggacttagggggagcttacaaacctcataccctaaaagtcaacttgttaattaga 13172006  T
Q  163 ttaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||  | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13172007 ttaacaacaattgaac-tttttaatacaagtgtttgtgatcatcaaaaagggggaaattgttggaacaaaatgtgt 13172081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 40052126 - 40052316
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  40052126 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 40052224  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40052225 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaatgtgt 40052316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22089934 - 22089765
Alignment:
Q  68 actcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaac 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | |||||||| |||||||||| |||    
T  22089934 actcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggtcaacttattaattagatcaac 22089836  T
Q  168 aacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089835 aacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 22089765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4822073 - 4821957
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4822073 cttacaaacctcatacccttatagtcaacgttttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcataaaaaaggggaatatt 4821974  T
Q  222 gttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||| |||||||||||||    
T  4821973 gttagaacaaaatgtgt 4821957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 6877325 - 6877515
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  6877325 aatttaattaataagaatagaactcaggggaagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 6877423  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877424 caacttattaattagatcaacatcaattgaacattttaaatactattgtttatcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6877515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11006034 - 11005844
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  11006034 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 11005936  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005935 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactgttgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 11005844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 17960192 - 17960382
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  17960192 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 17960290  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960291 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatgctattgtttgtcatcgtcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17960382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5686313 - 5686144
Alignment:
Q  68 actcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaac 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | |||||||| |||||||||| |||    
T  5686313 actcagggggagcttacaaacctcaccttagagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggtcaacttattaattagatcaac 5686215  T
Q  168 aacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686214 aacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5686144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18419963 - 18419792
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||     
T  18419963 gaacttagggggagcttacaaaccttaccttaatagt-ctattagactcagggggagcttacaaacctcttacc-tagtagtcaacttgttaatttgatc 18419866  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18419865 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 18419792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 18361130 - 18361319
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||     
T  18361130 atgaatttaattaacttggatagaactcagggggaacttacaaacctcacctt-aagaactatcaaactcagggggagcttacaaacctcagaccc-taa 18361227  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18361228 agtcaacttgttaattagattaacaacaattg---actattaatactagtgtttgtcatcataaaaaaggaggagattgttggaacaaaatgtgt 18361319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 238
Target Start/End: Original strand, 26699219 - 26699312
Alignment:
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699219 gtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9433990 - 9433906
Alignment:
Q  154 ttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9433990 ttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9433906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 25214841 - 25214979
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| || ||   ||||    
T  25214841 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagctttcaaacctc-tatcccagtagt 25214939  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25214940 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaa 25214979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9763312 - 9763131
Alignment:
Q  48 atttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtc 147  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||  |||| ||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  9763312 atttaattaatttggatagaactcagggggagcttacaaaactcaccttacaa-actataagacttaggggag-ctttcaaacctcagaccctaa-agtc 9763216  T
Q  148 aacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcat-aaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | | |||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9763215 aacttgttaattagattaacaacaattg---actattaatacttgtgtttgtcatcataaaaaaatggggagattgttggaagaaaat 9763131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19144216 - 19144032
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||  | ||| |  |||| ||| | | |||||||| ||||||| || |     
T  19144216 atgaatttaattaatcaggattgaacttagggggagcttataaacctcatcttaggg-actgtctgactcaggcggagcttacaaatctcatactctga- 19144119  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19144118 agtcaacttgttaattagattgacaacaattg----tttcaaatacttatgttggtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaat 19144032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20743615 - 20743431
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||  | ||| |  |||| ||| | | |||||||| ||||||| || |     
T  20743615 atgaatttaattaatcaggattgaacttagggggagcttataaacctcatcttaggg-actgtctgactcaggcggagcttacaaatctcatactctga- 20743518  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20743517 agtcaacttgttaattagattgacaacaattg----tttcaaatacttatgttggtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaat 20743431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 235
Target Start/End: Original strand, 14303948 - 14304059
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  14303948 cttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattaaattaacaacaattgaacatttt-aatactggtgtttgtcatcat-caaaatgggaagatt 14304045  T
Q  222 gttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  14304046 gttggaacaaaatg 14304059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13649423 - 13649330
Alignment:
Q  37 ttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13649423 ttaaatgatgaatttaattaacttggataaaac-cagggggagcttacaaacctcaccttagagtactattggacttagggggagcttacaaacc 13649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9803803 - 9803623
Alignment:
Q  48 atttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtc 147  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |  |||||  || | ||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||    
T  9803803 atttaattaatttggatagaattcagaaggagcttacaaaactcaccttacaa-actataagatttaggggag-ctttcaaacctcataccctaa-agtc 9803707  T
Q  148 aacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | | |||| |  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  9803706 aacttgttaattagattaacaacaattg---actattaatacttgtgtttgtcatcataaaaaatgaggacattgttggaacaaaat 9803623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26822865 - 26822757
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  26822865 cttacaaacctcagactctga-agtcaacttgttaattagattaacaacaattg---tttttaaatacttgtgtttgtcatcatcaaaaagggaaagatt 26822770  T
Q  222 gttggaacaaaat 234  Q
    ||| |||||||||    
T  26822769 gttcgaacaaaat 26822757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4822142 - 4822061
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4822142 agattattctgagcgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaacttagggggggcttacaaacctca 4822061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 235
Target Start/End: Original strand, 11571821 - 11571974
Alignment:
Q  76 ggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattg 175  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||| | |||||||| |||| ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11571821 ggagtttacaaacctcaccttaaggaa-tattagacttagggggagcttacaaatctcagaccataa-agtcaacttcttaattaaattaacaacaattg 11571918  T
Q  176 cacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
       | | | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11571919 ---actattaatactaatgtttgtcatcatcaaaaa-ggggagattgtcggaacaaaatg 11571974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5686376 - 5686289
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||    
T  5686376 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttagagatctattagactcagggggagcttacaaacctca 5686289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22089997 - 22089910
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||    
T  22089997 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctca 22089910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 234
Target Start/End: Original strand, 17890946 - 17891030
Alignment:
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||    | |||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17890946 tcaacttatttattatattaacaacaattg----tcttaaatatttgtgtttgtgatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaat 17891030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 7592141 - 7592184
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  7592141 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 7592184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 15201867 - 15201910
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  15201867 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 15201910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9434055 - 9434011
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  9434055 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 9434011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 19993479 - 19993523
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19993479 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 19993523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22318305 - 22318092
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  22318305 gttatttcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccataaagtactattgaactcaggggaagctt 22318206  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22318205 acaaacttcatacccttttagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgtt 22318106  T
Q  225 ggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  22318105 ggaacaaaatgtgt 22318092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24377774 - 24377549
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377774 agattattctgagtgatatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactaagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 24377676  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    ||  |||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  24377675 ctttgggggagcttacaaaccttatacccttaaa-tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcataa 24377577  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377576 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 24377549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 24850060 - 24850286
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24850060 agattattctgagtgttatttcgtttttaaa-gatgaatttaattaacatagatagaactcatggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattaaa 24850158  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || |||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24850159 ctcagggggtgcttacaaacctcatacccttaaattcaacttgttaattagattaacaaaaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 24850258  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24850259 agggggagattgttagaacaaaatgtgt 24850286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 28711120 - 28711333
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  28711120 gttattgcgtttttaatttatgaatttaattaacatggatagaactcagatggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagctt 28711219  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28711220 acaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaaaattttatatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtt 28711319  T
Q  225 ggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  28711320 ggaacaaaatgtgt 28711333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 22454416 - 22454610
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||     
T  22454416 atgaatttaattaacatgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggggagattacaaacctcgtacccttaa 22454515  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22454516 agtcaatttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaacagggagattgttggaacaaaatgtgt 22454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 34803766 - 34803956
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  34803766 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 34803864  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34803865 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 34803956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40223155 - 40222965
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  40223155 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 40223057  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223056 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 40222965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22764494 - 22764323
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  22764494 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 22764396  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22764395 acaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 22764323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 11404876 - 11405066
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  11404876 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 11404974  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404975 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 11405066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 22751613 - 22751783
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  22751613 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-ttgtagtcaacttgttaattagatc 22751711  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22751712 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 22751783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29245044 - 29244854
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  29245044 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 29244946  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244945 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 29244854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43083470 - 43083280
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  43083470 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 43083372  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083371 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 43083280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4210713 - 4210523
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  4210713 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 4210615  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4210614 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 4210523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9907568 - 9907758
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  9907568 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaaccttaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 9907666  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9907667 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9907758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10267816 - 10267626
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  10267816 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 10267718  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267717 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10267626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10278393 - 10278203
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  10278393 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 10278295  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278294 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10278203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 22959738 - 22959928
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  22959738 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 22959836  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959837 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 22959928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 24337810 - 24338000
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  24337810 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctactagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 24337908  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24337909 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24338000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 24424925 - 24425115
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  24424925 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 24425023  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24425024 caacttattaattaaatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24425115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43346229 - 43346039
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  43346229 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 43346131  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346130 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 43346039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9772712 - 9772902
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  9772712 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttagaaacctcgtcttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 9772810  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772811 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9772902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 19312374 - 19312565
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  19312374 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 19312473  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19312474 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgtgt 19312565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 24813989 - 24814175
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  24813989 aatttaattaacttgtatagaacttagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tgatagt 24814087  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24814088 caatttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaat 24814175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27222222 - 27222032
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  27222222 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 27222124  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222123 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27222032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20570100 - 20569948
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacat 180  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20570100 ttacaaacctcaccttaaagagctataggacttagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacat 20570001  T
Q  181 tttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20570000 ttt-aatacaagtgtttgtcatcatcaaaaagggggaaattgttgtaacaaaat 20569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 28731294 - 28731484
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  28731294 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctctccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 28731392  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28731393 caacttattaattaaatcaacaacaattgaacagtttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 28731484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 28379224 - 28379416
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaat--cttacaaacctcatacccttata 144  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |   |||||||||||| || ||   ||    
T  28379224 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaacttaaagatctattagactcagggggagagcttacaaacctc-tatcccagta 28379322  T
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28379323 gtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtgatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 28379416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 21171838 - 21172029
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| || ||   ||||    
T  21171838 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagctttcaaacctc-tatcccagtagt 21171936  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21171937 caacttattaattagatcaacagcaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgtgt 21172029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26867831 - 26867737
Alignment:
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867831 agtcaacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26867737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 20417131 - 20417225
Alignment:
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20417131 agtcaacttgttaattagatcaacaacaatttaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20417225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35253834 - 35253650
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||| |  ||   ||||    
T  35253834 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctc-tgtcccagtagt 35253736  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   || |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253735 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatacta---ttag--atcat-caaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 35253650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35264443 - 35264259
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||| |  ||   ||||    
T  35264443 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctc-tgtcccagtagt 35264345  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   || |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264344 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatacta---ttag--atcat-caaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 35264259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29410242 - 29410139
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    ||| |||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29410242 cttacaaacctcataccctta-agtctacatgttaattagattaacaacaattg----tttcaaatacctgtgtttgtcatcatcaaaaagggggagatt 29410148  T
Q  222 gttggaaca 230  Q
    |||||||||    
T  29410147 gttggaaca 29410139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28770158 - 28769974
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | || ||   ||| | ||||| ||||||||||||| | ||| |     
T  28770158 atgaatttaattaacctggatagaacttagggggagcttgcaaacctcaccttatgg-acaatcaaacttatgggaaacttacaaacctcagatcctaa- 28770061  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaa 233  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||   |||   |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28770060 agtcagctcgttaattaaattaacaacaattgtctatt---aatgcttgtgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtcggaacaaaa 28769974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18848861 - 18848820
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18848861 tgtttgtcatcataaaaaagggggagaatgttggaacaaaat 18848820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Original strand, 1799548 - 1799582
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1799548 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 1799582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 102 - 314
Alignment:
Q  26 ttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctta 125  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||    
T  102 ttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaagatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaataatattggactcagggggagctta 201  T
Q  126 caaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  202 caaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 301  T
Q  226 gaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||    
T  302 gaacaaaatgtgt 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21625812 - 21625586
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| ||||  |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21625812 agattattctgagagttattgcgcttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacgaacctcaccttaaagtactattgga 21625713  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21625712 ctcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcactttttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 21625613  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21625612 agggggagattgttggaa-aaaatgtgt 21625586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13602866 - 13602642
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13602866 agattattcttagtgttatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattaga 13602768  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13602767 ctcatggggagcttacaaacctcatacccttacagtcaacttgttaattagattaacaataattgcacattttaaataccaatgtttgtcatcataaaaa 13602668  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13602667 aggaggagattgttggaacaaaatgt 13602642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20112146 - 20112367
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20112146 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgattaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcgccttaaagtactattgga 20112244  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20112245 cttagggggagcttacaaaccttaaaccctaatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 20112344  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  20112345 agggggagattgttggaagaaaa 20112367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22802803 - 22802605
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |     
T  22802803 aatgaggaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatatct 22802704  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22802703 ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattaaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagagggagaatgttggaacaaaatgtgt 22802605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19483463 - 19483266
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||| |||||    
T  19483463 aatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggg-agcttacaaaactcaccttaaagtactatttgactcaaggggagcttacaaacctcctaccc 19483365  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19483364 aaagagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatgaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19483266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16877928 - 16877701
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16877928 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-taatgattttaattaacatggatataactcatggggagcttacaaacctcaccataatgtactattgga 16877830  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattg-cacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16877829 ctcagggggagcttacaaacctcataccctaacagtcaacgtcttaattagattaacaacaattgaaattttttaaatattattgtttgtcatcatcaaa 16877730  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877729 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16877701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25788515 - 25788325
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  25788515 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 25788417  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788416 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 25788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17048441 - 17048236
Alignment:
Q  36 cttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||    
T  17048441 cttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttccaaacctcacctttagagtactattagactcagggggagcttacaaacctca 17048342  T
Q  135 tacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatt---ttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaa 231  Q
     ||||  | ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048341 cacccaaa-agtcaatgtgttaattaggttaacaacaattgaacattgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaa 17048243  T
Q  232 aatgtgt 238  Q
    |||||||    
T  17048242 aatgtgt 17048236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9122530 - 9122720
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  9122530 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 9122628  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122629 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9122720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 17981918 - 17982108
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  17981918 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 17982016  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982017 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17982108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 17984107 - 17984297
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  17984107 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 17984205  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984206 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17984297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18543758 - 18543568
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  18543758 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcggggggagcttacaaacctcatacc-tagtagt 18543660  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18543659 caacttcttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 18543568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 19288745 - 19288935
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||   | |||    
T  19288745 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacctaga-agt 19288843  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19288844 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacactttaaatactattgtctgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19288935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26026257 - 26026067
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  26026257 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 26026159  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026158 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26026067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27342492 - 27342302
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  27342492 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 27342394  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342393 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27342302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27403232 - 27403042
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  27403232 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 27403134  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403133 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27403042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25593205 - 25593012
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  || || |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| ||    
T  25593205 atgaatttaattaacttgtatagaacttcgggggagcttacaaacctcatcttaaaggactattggacttagcgggagcttacaaacctcataccctaat 25593106  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25593105 agtcaacttgttaattagattaacaacaattaaacatttt-aatacaagtgtttgtcatcaataaaaacggggagattgttggaacaaaatgtgt 25593012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 25686113 - 25686287
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  25686113 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactaagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 25686211  T
Q  166 acaacaattgcacatttt---aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25686212 acaacaattgaacatttttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 25686287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13913825 - 13913654
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||| |    
T  13913825 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcaatccccg-tagtcaacttgttaattagatca 13913727  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13913726 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaacgtgt 13913654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27385230 - 27385044
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||    
T  27385230 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatccaga-agt 27385133  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385132 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27385044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27475643 - 27475457
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||    
T  27475643 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatccaga-agt 27475546  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27475545 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 27475457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4631683 - 4631498
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||    
T  4631683 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatccaga-agt 4631586  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631585 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 4631498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11236330 - 11236139
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  11236330 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 11236231  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236230 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 11236139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 12726846 - 12727036
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  12726846 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 12726944  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726945 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12727036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16931231 - 16931041
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  16931231 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 16931133  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931132 caacttattaattagatcaacaacaattgaatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16931041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 19461377 - 19461567
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |   |||    
T  19461377 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcactttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaaccttatacc-tggcagt 19461475  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19461476 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19461567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26865586 - 26865396
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  26865586 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 26865488  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26865487 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26865396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 32311083 - 32311273
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  32311083 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcacctcaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 32311181  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32311182 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 32311273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 34817190 - 34817380
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  34817190 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 34817288  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34817289 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 34817380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3662180 - 3661990
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  3662180 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 3662082  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3662081 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgcaacaaaatgtgt 3661990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27373594 - 27373404
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||   | ||    
T  27373594 aatttaattaataagattagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaatcccag-tggt 27373496  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373495 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27373404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27463944 - 27463754
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||||  |||   | ||    
T  27463944 aatttaattaataagattagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaatcccag-tggt 27463846  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463845 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27463754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 18925128 - 18925317
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  18925128 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatcccaga-agt 18925226  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925227 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaa-tactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 18925317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 20062057 - 20062227
Alignment:
Q  67 aactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| | ||| |||| ||| | |||   |||||||||| |||||||||| ||    
T  20062057 aactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctataagactcagggggagctttcaaaactc-tgccccagtagtcaacttattaattagatcaa 20062155  T
Q  167 caacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062156 caacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20062227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 32971946 - 32972136
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  || || |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  32971946 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctgttagacttagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 32972044  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972045 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 32972136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18378856 - 18378740
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  18378856 cttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgtttattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttatcatctttaaaaaaggggagatt 18378757  T
Q  222 gttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||    
T  18378756 gttggaaaaaaatgtgt 18378740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17043464 - 17043299
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17043464 agggggagctttcaaacctcaccttaaagg-ctattagactcagggggagcttacaaacctcatacccaaa-agtcaacgtgttaattaggttaacaaca 17043367  T
Q  172 attgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043366 attgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17043299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25794658 - 25794481
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  25794658 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaatatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 25794560  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25794559 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 25794481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 31126860 - 31127048
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||     
T  31126860 atgaatttaattaacttggataaaactcagggggagcttacaaacctcacctt-aagaactatcagactcagggg-agcttacaaacctcata-ccttaa 31126956  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31126957 agtcaacttgttaattagattaacaacaattg-ac-tattaaa-agtagtgtttgtcatcatcaaaaagggggtgattgttggaacaaaatgtgt 31127048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Original strand, 14069525 - 14069722
Alignment:
Q  42 tgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccctt 141  Q
    |||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||   | | |||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||      
T  14069525 tgataaatttgattaacatgggtagaactcagggggagcttacaaacccttcttgaaagttttattggacttagggggagcttacaaacctcaaacccag 14069624  T
Q  142 atagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt--aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14069625 -tagtcaacttgttaattaaatcaacaacaattgaacattttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaaaaaaatgtgt 14069722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 25734932 - 25735110
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25734932 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggtgagcttacaaacctcata-ccttgtagtcaacttgttaattagatca 25735030  T
Q  166 acaacaattgcacatttt-------aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| ||||| |||||||       ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25735031 acaagaattgaacatttttttttaaaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggaaattgttggaataaaatgtgt 25735110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12855724 - 12855629
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12855724 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12855629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20462556 - 20462372
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| |  || | |||| |||||||| ||||| | |||    
T  20462556 aatttaattaacttgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gagctattagacttaatgggagcttaaaaacctcagaccctaa-agt 20462459  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | | | || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20462458 caacttgttaattagattaacaacaattg---actattaacattaatgtttgtcatcatcaaaaaaggagagattgttggaacaaaatgt 20462372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29918583 - 29918489
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29918583 tagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgcacattttgaatactaatg-ttgttatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 29918489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12358928 - 12358788
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  12358928 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 12358830  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaata 188  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12358829 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaata 12358788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25590013 - 25589886
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |  ||||||| ||| || ||   | ||    
T  25590013 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagtttacaaaactc-tatcccagtggt 25589915  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattg 175  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25589914 caacttattaattagatcaacaacaattg 25589886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18378924 - 18378844
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18378924 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgaagaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctca 18378844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21235659 - 21235595
Alignment:
Q  37 ttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21235659 ttaaatggtgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttccaaacctcaccttaaagt 21235595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 175
Target Start/End: Original strand, 13553148 - 13553208
Alignment:
Q  114 aggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattg 175  Q
    ||||||| | ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13553148 aggggaagcatacaaacctcagactctaa-agtcaacttgttaattagattaacaacaattg 13553208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16742775 - 16742703
Alignment:
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | | | || | | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16742775 agtcaacttgttaattagattaacaacaattg---actattaacacttatgtttgtcatcatcaaaaagggggaga 16742703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 18419692 - 18419735
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  18419692 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 18419735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 22065208 - 22065241
Alignment:
Q  192 atgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22065208 atgtttgttatcataaaaaagggggagattgttg 22065241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12855777 - 12855733
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  12855777 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 12855733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 88882 - 89108
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88882 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgattaatttaattaacttggatagaactaagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 88980  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  88981 ctcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaaattgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaa 89080  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  89081 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 89108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5430539 - 5430343
Alignment:
Q  42 tgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccctt 141  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5430539 tgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcataccctt 5430440  T
Q  142 atagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5430439 atagtcaacgtgttagttagattaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5430343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30743719 - 30743494
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30743719 agattattctgagagttatttcatttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactc-gggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgga 30743621  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  30743620 ctcaggggag-cttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaa 30743522  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30743521 agggggagattgttgtaacaaaatgtgt 30743494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 21099162 - 21099363
Alignment:
Q  37 ttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcata 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21099162 ttaaatgatgaatctaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattgaactcagggggagcttacaaacctcata 21099261  T
Q  137 cccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099262 cccttaaagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaataccagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 21099361  T
Q  237 gt 238  Q
    ||    
T  21099362 gt 21099363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21660919 - 21660708
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  21660919 atttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttac 21660820  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    ||||||| ||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21660819 aaacctcttacctaaatattcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgg 21660720  T
Q  227 aacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  21660719 aacaaaatgtgt 21660708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13523871 - 13523681
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  13523871 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagt 13523773  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13523772 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacagtttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13523681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 23706895 - 23707085
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||  |||||    
T  23706895 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtccca-atagt 23706993  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706994 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23707085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 40400526 - 40400716
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  40400526 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 40400624  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400625 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 40400716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 6985804 - 6985994
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  6985804 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 6985902  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985903 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6985994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 14040103 - 14040293
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  14040103 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 14040201  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040202 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14040293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15994082 - 15993892
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  15994082 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 15993984  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993983 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15993892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 17617185 - 17617376
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  17617185 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 17617284  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17617285 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17617376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 17729042 - 17729233
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  17729042 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 17729141  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17729142 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17729233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27042983 - 27042793
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  27042983 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 27042885  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27042884 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27042793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 31358659 - 31358850
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  31358659 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 31358758  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358759 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 31358850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 39361821 - 39362011
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  39361821 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 39361919  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361920 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 39362011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39491685 - 39491495
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  39491685 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 39491587  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39491586 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 39491495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 23405937 - 23406126
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  23405937 aatttaattaataagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 23406035  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtg 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406036 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttatatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtg 23406126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1109915 - 1109725
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  1109915 aatttaattaataagaatagaactcaaggggggcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatcccaga-agt 1109817  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109816 caacttattaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcagaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 1109725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9346050 - 9346240
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  9346050 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 9346148  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346149 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9346240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14447788 - 14447598
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  14447788 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 14447690  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447689 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14447598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 22156611 - 22156801
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||| ||   | ||    
T  22156611 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacct-atatcccagtggt 22156709  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22156710 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 22156801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 23306352 - 23306542
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  23306352 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 23306450  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23306451 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23306542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 23372018 - 23372208
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  23372018 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 23372116  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372117 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23372208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24588859 - 24588669
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  24588859 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 24588761  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588760 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24588669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24817639 - 24817449
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  24817639 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 24817541  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24817540 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24817449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 27470067 - 27470257
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  27470067 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 27470165  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27470166 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27470257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30228250 - 30228060
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  30228250 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 30228152  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228151 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 30228060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 31843466 - 31843656
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  31843466 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 31843564  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31843565 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 31843656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 34062111 - 34062301
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  34062111 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 34062209  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062210 caactgattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 34062301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 35225579 - 35225769
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  35225579 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 35225677  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225678 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 35225769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36583294 - 36583104
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| | |||   ||||    
T  36583294 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tgccccagtagt 36583196  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583195 caacttattaattagatcaacatcaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36583104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 42052867 - 42053057
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  42052867 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 42052965  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42052966 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 42053057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5291329 - 5291139
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  5291329 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttagagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 5291231  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5291230 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 5291139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 19477476 - 19477666
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| || ||   ||||    
T  19477476 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagctttcaaacctc-tatcccagtagt 19477574  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19477575 caactcattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19477666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 22685509 - 22685699
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||| |||||||   |||    |||    
T  22685509 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttaaaaacctctgtcccagc-agt 22685607  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22685608 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 22685699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23479048 - 23478856
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||    
T  23479048 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacatcaccttaatagt-ctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tgatag 23478951  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt--aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478950 tcaacttgttaattagatcaacaagaattgaacattttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23478856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14558746 - 14558581
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14558746 agggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagtcaacttattaattagatcaacaaca 14558648  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14558647 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14558581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27604168 - 27603981
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  27604168 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 27604070  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604069 caacttattaattagat---caacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27603981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 20561814 - 20562004
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| | ||| |||| ||| || ||   ||||    
T  20561814 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattaaactcagggggagctttcaaaactc-tatcccagtagt 20561912  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561913 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20562004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 20797186 - 20797376
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  20797186 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacatcaccttaaagatctattagactcaaggggagcttacaaacctctatcccaga-agt 20797284  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797285 caacttattaattagatcaacaaaaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 20797376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21414986 - 21414796
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| | || |  | ||    
T  21414986 aatttaattaatgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctttcc-tagttgt 21414888  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21414887 caactttttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 21414796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24926909 - 24926719
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||| | ||| |||| ||| || ||   ||||    
T  24926909 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctataagactcagggggagctttcaaaactc-tatcccagtagt 24926811  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926810 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24926719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 31448027 - 31448217
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  31448027 aatttaattaatgagaatagaactcagggagagcttacaaacctcactttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 31448125  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448126 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 31448217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 36697737 - 36697923
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  36697737 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcacctcaaagaactattagactcggggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 36697835  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697836 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 36697923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17447386 - 17447292
Alignment:
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17447386 agtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17447292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 21519646 - 21519741
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21519646 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttttcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgtgt 21519741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 25935805 - 25935912
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25935805 cttacaaacctcaaatcctga-agtcaacttgttaattagattaacaacatttg----ttttaaatacttatgtttgtcatcatcaaaaaaggggagatt 25935899  T
Q  222 gttggaacaaaat 234  Q
    |||||||||||||    
T  25935900 gttggaacaaaat 25935912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14558813 - 14558726
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctca 134  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||    
T  14558813 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagacttagggggagcttacaaacctca 14558726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 24421428 - 24421471
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  24421428 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 24421471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30445877 - 30445834
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  30445877 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 30445834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30455249 - 30455206
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  30455249 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 30455206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 225
Target Start/End: Original strand, 5609276 - 5609310
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5609276 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 5609310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 21519593 - 21519637
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21519593 aatttaattaataagtatagaactcagggggagcttacaaacctc 21519637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 19620499 - 19620724
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19620499 agattattctgagtgttatttcgcttttaa-tgatgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacttcaccttaaagtactattgga 19620597  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19620598 cttaggggag-cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaaattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 19620696  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19620697 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 19620724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 13575570 - 13575782
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  13575570 gttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttagaaacctcacgttaaagtactattggactcagggggagctt 13575669  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13575670 acaaacctcatacc-ttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgtt 13575768  T
Q  225 ggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  13575769 ggaacaaaatgtgt 13575782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15139933 - 15139708
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15139933 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaatatggatagaactcagggggagcttacaaacctccccttaaagtactattaga 15139835  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15139834 ctcagggggagcttacaaacctcaaacccatatagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 15139735  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||    
T  15139734 agggtgagatt-tttgaacaaaatgtgt 15139708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13004296 - 13004522
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13004296 agattattctgagtgttattatgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaattcagggagagcttacaaacctcaccttaaagtaatattgga 13004394  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13004395 ctcagggggagcttacaaacctcatacttttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatattaatgtttgtcatcatcaaaa 13004494  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  13004495 atgaggagattgttggaacaaaatgtgt 13004522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 15474568 - 15474779
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||  |||||    
T  15474568 atttcatttttaaatgataaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcatcttaagagtactattggacttatgggag-cttac 15474666  T
Q  127 aaacctcataccctta-tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15474667 aaacctcttacccaaaatagtcaacttgttcattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttg 15474766  T
Q  226 gaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||    
T  15474767 gaacaaaatgtgt 15474779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 238
Target Start/End: Original strand, 15206778 - 15206964
Alignment:
Q  51 taattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaac 150  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || |||   |||||||    
T  15206778 taattaataagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcctagaagtcaac 15206876  T
Q  151 ttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206877 ttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15206964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 451443 - 451253
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  451443 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 451345  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  451344 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 451253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 10750541 - 10750731
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  10750541 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 10750639  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750640 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10750731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 10964310 - 10964500
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  10964310 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 10964408  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10964409 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10964500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17918919 - 17918729
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  17918919 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 17918821  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918820 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17918729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 18762476 - 18762662
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  18762476 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 18762574  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762575 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 18762662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21997280 - 21997090
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  21997280 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 21997182  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997181 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 21997090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 40469981 - 40470171
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  40469981 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 40470079  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470080 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 40470171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 14777834 - 14778024
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||   | |||    
T  14777834 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctataggactcagggggagcttacaaacctcatacctgga-agt 14777932  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777933 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgttagtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14778024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27657503 - 27657313
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  27657503 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccaga-agt 27657405  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657404 caacttattaattagatcaacgacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 27657313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 30936465 - 30936655
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||  |   | ||    
T  30936465 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tattccagtggt 30936563  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30936564 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 30936655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36019203 - 36019013
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  36019203 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 36019105  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019104 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36019013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11536719 - 11536556
Alignment:
Q  74 ggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaat 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11536719 ggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcaaacc-tagtagtcaacttgttaattagatcaacaacaat 11536621  T
Q  174 tgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11536620 tgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgtaacaaaatgtgt 11536556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 24027477 - 24027668
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | |    
T  24027477 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtgg 24027575  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027576 tcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 24027668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 16818732 - 16818923
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  16818732 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 16818831  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16818832 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgtgt 16818923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10291386 - 10291214
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||     
T  10291386 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcaaacc-tagtagtcaacttgttaattagatc 10291288  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10291287 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaatgtgt 10291214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11515916 - 11515745
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |    
T  11515916 gaacttagggcgagctgacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcttatc-ttgtagtcaacttgttaattagatca 11515818  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515817 acaacaattgaacattttaattactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 11515745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16256736 - 16256546
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||  |   | ||    
T  16256736 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tattccagtggt 16256638  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256637 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16256546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24641150 - 24640960
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  24641150 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 24641052  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24641051 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgtgt 24640960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16305991 - 16305799
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaat--cttacaaacctcatacccttata 144  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| |   ||||||||||||   |||  | |    
T  16305991 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagagcttacaaacctctatcccaga-a 16305893  T
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305892 gtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16305799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18776639 - 18776450
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||   ||| ||||||  || |||||||||||||||| |     
T  18776639 atgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa-gaactatcaaactcaggggag-ctgacaaacctcataccctaaa 18776542  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18776541 a-tcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattt--aatataagtgtttgtgatcatcaaaaagggggagattgttggaacacaatgtgt 18776450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Original strand, 13306483 - 13306667
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |     
T  13306483 atgaatttaattaacttgaattgaactc--ggggagtttacaaaactcaccttaa-gaactattaaacttagggagatcttacaaacctcagaccctaa- 13306578  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13306579 agtcaacttgttaattagattaacaacaattg-acaatt--aatacaaatatttgtcatcaaaaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 13306667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 55755299 - 55755394
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55755299 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 55755394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 236
Target Start/End: Original strand, 19954452 - 19954543
Alignment:
Q  145 gtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19954452 gtcaacttattaattagatcaaccacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 19954543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5874151 - 5874078
Alignment:
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5874151 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 5874078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 19887815 - 19887941
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| | || |||  | | ||||| | ||||||||||||| ||||| |     
T  19887815 atgaatttaattaatatggatagaactcagggg-agcttacaaaactcaccttaa-gaacaatta-atttagggggagcttacaaacctcagaccctaa- 19887910  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaatt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887911 agtcaacttgttaattagattaacaacaatt 19887941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13890830 - 13890776
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa 98  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13890830 atgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaa 13890776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19571854 - 19571768
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctc 133  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  19571854 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc 19571768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Original strand, 14356749 - 14356794
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14356749 tgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 14356794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 10327871 - 10327998
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  ||||  |||| ||||| | ||||| ||||||| |||| || |||    
T  10327871 aatttaattaacatggatagaacttagggggtgcttacaaacctcaccttctggacctatcagacttagggggagcttacgaacctcagaccc-taaagt 10327969  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattg 175  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10327970 caacttgttaattaatttaacaacaattg 10327998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 138
Target Start/End: Original strand, 39520260 - 39520332
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  39520260 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcttacc 39520332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Original strand, 19888723 - 19888768
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19888723 tgtttgtcatcatcaaaacgggggagattgttggaacaaaatgtgt 19888768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24620062 - 24620020
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24620062 tgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaatg 24620020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 26821117 - 26821160
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  26821117 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 26821160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50066897 - 50066858
Alignment:
Q  194 gtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaa 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50066897 gtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgaaacaaaa 50066858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54690962 - 54690919
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  54690962 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 54690919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 16321789 - 16321827
Alignment:
Q  193 tgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaa 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16321789 tgttcgtcatcataaaaaagggggagattgttagaacaa 16321827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 19954397 - 19954441
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19954397 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 19954441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 3597789 - 3598002
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  3597789 gttattttgtttttaaatcatgaatgtaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattggactcagggggagctt 3597888  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3597889 acaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaccaattgaacattttaaatattaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtt 3597988  T
Q  225 ggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||    
T  3597989 ggaacaaaatgtgt 3598002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 20381829 - 20382051
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20381829 agattattctgagtgttatttcggttttaa-tgatgaattgaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcagcttaaagtactattgga 20381927  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20381928 ctcagggggagcttacaaacctcatacccttataatcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 20382027  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  20382028 agggggagattattggaacaaaat 20382051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19927744 - 19927523
Alignment:
Q  19 ctgaatgttatttcgttctt--aaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaagg 116  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  19927744 ctgagtgttatttcgtttttttaaatgatgaatttaattgacatggatagaactcagggggagcttacaaaccttaccttaaagtactattggattcagg 19927645  T
Q  117 ggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaaggggg 216  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  19927644 gggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttctcatcatcaaaaaggggg 19927545  T
Q  217 agattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19927544 agattgttggaacaaaatgtgt 19927523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21289090 - 21288883
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  21289090 atttcgtttctaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttac 21288991  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21288990 aaacctcataccctattagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgg 21288891  T
Q  227 aacaaaat 234  Q
    ||||||||    
T  21288890 aacaaaat 21288883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 23184714 - 23184911
Alignment:
Q  37 ttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcata 136  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23184714 ttaaatgataaatttaattaacatggatagaattcagggggagtttacaaacctcaccttaaagtactattgaacttagggggagcttacaaacctcata 23184813  T
Q  137 cccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184814 tctttatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 23184911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 15335489 - 15335715
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15335489 agattattctgagtgttattacgcttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattgga 15335587  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||    
T  15335588 ctcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatcaaaa 15335687  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15335688 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 15335715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 15424554 - 15424780
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15424554 agattattctgagtgttattacgcttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattgga 15424652  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||    
T  15424653 ctcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatcaaaa 15424752  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424753 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 15424780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 15515858 - 15516084
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15515858 agattattctgagtgttattacgcttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtattattgga 15515956  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||    
T  15515957 ctcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactatggtttttcatcatcaaaa 15516056  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516057 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 15516084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22663830 - 22663632
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
T  22663830 aatgatgaatttaataaacatggatagaaatcagggggaacttacaaacctcaccttaaagaactattggactcaaggggagcttacaaacctcataccc 22663731  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22663730 ttaaagtcaacgtgttaattaaattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaggggggagattgtgggaacaaaatgtgt 22663632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 30324715 - 30324905
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||    
T  30324715 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctatcccaga-agt 30324813  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30324814 caacttattaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaacgggggagattgttggaacaaaatgtgt 30324905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23371421 - 23371250
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  23371421 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaaactcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 23371323  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371322 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23371250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 3358623 - 3358813
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  3358623 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 3358721  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358722 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 3358813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9342004 - 9341814
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  9342004 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 9341906  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341905 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9341814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 15780131 - 15780321
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  15780131 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 15780229  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780230 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15780321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 15790720 - 15790910
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  15790720 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 15790818  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15790819 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 15790910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19129589 - 19129399
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  19129589 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 19129491  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19129490 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19129399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44481963 - 44481772
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||    |||    
T  44481963 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattggactcagggggagcttacaaacctctgtcccaagaagt 44481864  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44481863 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 44481772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3833599 - 3833430
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  3833599 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacatcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 3833501  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3833500 acaacaattgaacattttaaatattattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaaccaaatgt 3833430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Original strand, 20259047 - 20259212
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20259047 agggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatcaacaaca 20259145  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20259146 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacataatgtgt 20259212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 238
Target Start/End: Original strand, 21045677 - 21045842
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045677 agggggagcttacaaacctcaccttaaaggcctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatcaacaaca 21045775  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045776 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacataatgtgt 21045842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23784208 - 23784018
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |   |||    
T  23784208 aatttaattaacttgtatagaacttagtggtagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-taggagt 23784110  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23784109 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23784018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29077589 - 29077399
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  29077589 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 29077491  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29077490 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 29077399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29087840 - 29087650
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  29087840 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 29087742  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29087741 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 29087650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36078795 - 36078605
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  36078795 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 36078697  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36078696 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36078605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36293761 - 36293571
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  36293761 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 36293663  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36293662 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36293571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 17518527 - 17518714
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   |||    
T  17518527 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcata-cctggcagt 17518625  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcaca-ttttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17518626 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 17518714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 209575 - 209765
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  209575 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 209673  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209674 caacttattaattagatcaacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 209765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 723198 - 723388
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  723198 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 723296  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  723297 caacttattaattagatcaacaataattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 723388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 32087691 - 32087881
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  32087691 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 32087789  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32087790 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaagtgtgt 32087881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22746053 - 22745948
Alignment:
Q  133 catacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22746053 catacccttatagtcaacttgttaattagattagcaacaattgcactttttaaatactaatgtttgtcatcataaaaaagtgggagattgttggaacaaa 22745954  T
Q  233 atgtgt 238  Q
    ||||||    
T  22745953 atgtgt 22745948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24646931 - 24646815
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24646931 cttacaaacttcaaacccttatagtcaacttgttaattagattaaaaacaattgcacattttaaatactaatgtttttcatcataaaaaatggggagatt 24646832  T
Q  222 gttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24646831 gttggaacaatatgtgt 24646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 242682 - 242492
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  242682 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattaaactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 242584  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242583 caacttattaattagatcaacaacaattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 242492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 796052 - 795862
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  796052 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattaaactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 795954  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795953 caacttattaattagatcaacaacaattaaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 795862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 23468865 - 23469054
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  23468865 aatttaattaattagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 23468963  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23468964 caactctttaattagatcaacaacaattgaaca-tttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaatgtgt 23469054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 23352588 - 23352761
Alignment:
Q  63 attgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattaga 162  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23352588 attggacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaaagctattggacttaggggag-cttacaaacctcagaccctaaaagtcaacttgttaattaga 23352686  T
Q  163 ttaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtg 237  Q
    ||||||||||| |  | |||| ||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23352687 ttaacaacaatggagcctttttaatacaagtgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttggaacaaaatgtg 23352761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19419227 - 19419037
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||  ||||| | ||| |||| ||| || ||   ||||    
T  19419227 aatttaattaatgagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctataagacctagggggagctttcaaaactc-tatcccagtagt 19419129  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19419128 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19225716 - 19225620
Alignment:
Q  142 atagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225716 atagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 19225620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 13688048 - 13688143
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688048 tagtcaacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 13688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26112092 - 26111902
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||| |  |||||| |||| || |    | ||    
T  26112092 aatttaattaataagaataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatgtattatactcagggggagattacaatcctc-tatctcagtggt 26111994  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111993 caacttattaattagatcaacaacaattgaacgttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 26111902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 18684967 - 18685085
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcaca-ttttaaatattaa-tgtttgtcatcataaaaaagggggaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18684967 cttacaaacctcatacccttaaagttaacttgttaattaaattaacaacaattgaacatttttaaatactaagtgtttgtcaccatcaaaaatggggaga 18685066  T
Q  220 ttgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18685067 ttgttggaacaaaatgtgt 18685085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 18730532 - 18730650
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcaca-ttttaaatattaa-tgtttgtcatcataaaaaagggggaga 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18730532 cttacaaacctcatacccttaaagttaacttgttaattaaattaacaacaattgaacatttttaaatactaagtgtttgtcaccatcaaaaatggggaga 18730631  T
Q  220 ttgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18730632 ttgttggaacaaaatgtgt 18730650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6151813 - 6151740
Alignment:
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6151813 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6151740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18773295 - 18773111
Alignment:
Q  43 gatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccctta 142  Q
    |||||||||||||||  || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || || |    
T  18773295 gatgaatttaattaacttgtatagaatttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggactattggactcagggggaacttacaaacctcagacgctaa 18773196  T
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
     || |       | |   |   ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18773195 aagac-------tcaggggg--aacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 18773111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18154515 - 18154420
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18154515 tagtaaacttattaattagatcaacaacaattgagcattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggacattgttgaaacaaaatgtgt 18154420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 235
Target Start/End: Original strand, 23192089 - 23192275
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||  |||| | ||| | ||||||||||||| | || ||     
T  23192089 atgaatataattaacattgatagaacttagggggagtttacaaacctcaccttaaa-aattatcagactcatggggagcttacaaacctcaaatcc-taa 23192186  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||   |||| |  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23192187 agtcaactagttaattagattaacaacatttgaccatt---aatactggtgtttgtcatcatcaaaaagtcggagattgttggaacaaaatg 23192275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Original strand, 24502272 - 24502358
Alignment:
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24502272 agtcaacttgttaattaaatcaacaataattg----ttttaaatacttatgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttggaacaaaat 24502358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 161
Target Start/End: Original strand, 22163912 - 22164006
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattag 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||    
T  22163912 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctcgta-cctagtaatcaacttgttaattag 22164006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6151913 - 6151827
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctc 133  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  6151913 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc 6151827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 23352509 - 23352617
Alignment:
Q  24 tgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatct 123  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| | ||    
T  23352509 tgttattacgtttttaaa-gatgaatttaattact-tgtatagaacttagggggagcttacaaacatcaccttaaaaagctattggacttagggggagct 23352606  T
Q  124 tacaaacctca 134  Q
    |||||||||||    
T  23352607 tacaaacctca 23352617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 18720986 - 18721037
Alignment:
Q  19 ctgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaact 70  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18720986 ctgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaact 18721037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16189508 - 16189477
Alignment:
Q  207 aaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16189508 aaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 16189477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 18684937 - 18684979
Alignment:
Q  50 ttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18684937 ttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctca 18684979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 18730502 - 18730544
Alignment:
Q  50 ttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18730502 ttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctca 18730544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 24497708 - 24497819
Alignment:
Q  120 atcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggaga 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||   | | | ||||||    ||||||||||| |||||| |  |||    
T  24497708 atcttagaaacctcagaccctaa-agtcaagttgttaattagattaacaacaagtg---actattaatatttgattttgtcatcatcaaaaagagaaaga 24497803  T
Q  220 ttgttggaacaaaatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  24497804 ttgttggaacaaaatg 24497819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24646983 - 24646923
Alignment:
Q  27 tatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaac 88  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  24646983 tatttcgtt-ttaaataatgaatttaattaacttggatagaactcaaggggagcttacaaac 24646923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19225768 - 19225724
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctc 91  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19225768 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctc 19225724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14324 - 14097
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14324 agattattctgagtgacatttcgtttttaactgatgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattaga 14225  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |    
T  14224 cttagggagagcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaataattgcacatttaaaatactaatgtttgtcatcatcaaca 14125  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14124 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 14097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 60284 - 60510
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60284 agattattctgagtgttatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagataacaaacctcactttaaagtactattgga 60382  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  60383 ctcagggggagtttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaattagaataaaaacaactgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaa 60482  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
      ||||||||||||||||||||||||||    
T  60483 ttggggagattgttggaacaaaatgtgt 60510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 5008 - 5235
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  5008 agattattctgagtgttatttcgttttaaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaagctcacctcaaactactattgga 5107  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||  |||    
T  5108 ctcagggggagcttacaaacctcatacccttatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgaacattttaaacactattgtttgtcatcatcgaaa 5207  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5208 aaggggagattgttggaacaaaatgtgt 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 95480 - 95437
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  95480 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 95437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 12948 - 13157
Alignment:
Q  24 tgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatct 123  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  12948 tgttatttcgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagataacaaacctcaccttaaagtactattggactcaaggggagct 13046  T
Q  124 tacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13047 tacaaacctcaaacccttatagtcaacttgttaatt--attaaaaacaactgcacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgt 13144  T
Q  224 tggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||||||||    
T  13145 tggaacaaaatgt 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23359 - 23150
Alignment:
Q  25 gttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatctt 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| | |||    
T  23359 gttattgcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaatttagggggagcttacaaaccttaccttaaaatactattagactcagggggagctt 23260  T
Q  125 acaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23259 acaaacctcatacccttatagtcaacatgttaattagattaacaacaattgcacattttatatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgtt 23160  T
Q  225 ggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||    
T  23159 ggaacaaaat 23150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 134788 - 135015
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagt-actattgg 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  134788 agattattctgagtgttatttcgttcttaa-tgataaatttaattaacatggataaaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaattactattgg 134886  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  134887 actcagggggagcttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaa 134986  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  134987 aagggggagattgttggaagaaaatgtgt 135015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 60207 - 60017
Alignment:
Q  46 gaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||  |||| ||||| | ||||||||||||| || || | ||    
T  60207 gaatttaattaacatggatagaactcagggggaacttacaaaactcaccttaa-gaactatcagactcagggggagcttacaaacctcagactctaaaag 60109  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60108 tcaacttgttaattagattaacaacaattgaacatttt-aatactagtgtttctcatcatcaaaaagggggagattgttggaacataatgtgt 60017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 19798 - 20009
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||    
T  19798 atttcgtttttaaatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttac 19897  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttgg 226  Q
    ||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19898 aaacctcttaccaaaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgg 19997  T
Q  227 aacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  19998 aacaaaatgtgt 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7602 - 7408
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  7602 aatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattggactcagggggagcttacaaacctcataccc 7503  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7502 ttaaagtcaacgtgttaattagattaacaacagttgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 6560 - 6758
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
T  6560 aatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattggactcaaggggagcttacaaacctcataccc 6659  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6660 ttaaagtcaatgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11207 - 11013
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11207 aatgatgaatttaattaacatggataaaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcataccc 11108  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107 ttatggtcaacatgttaattagattaacaataattgaacattttaaatattagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaat 11013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 24755 - 24981
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24755 agattattctgagtgttattatgtttttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaattcagggagagcttacaaacctcaccttaaagtaatattgga 24853  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24854 ctcagggggagcttacaaacctcatacttttaaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatattaatgtttgtcatcatcaaaa 24953  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24954 atgaggagattgttggaacaaaatgtgt 24981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 4175 - 4402
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattgg 109  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4175 agattattttgagtgttatttcgtttttaaatgatgaatttaattaacttggatagaactcagggtgagcttacaaacctcaccttaaaagtatt-ttgg 4273  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    |||  |||| | ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4274 acttcgggggagcttacaaaagtcaaacccttatggtcaacttgttaattagattaacaacaattgcatattttaaatactaatgtttgtcatcataaaa 4373  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33116 - 32904
Alignment:
Q  27 tatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttac 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  33116 tatttcgtttttaaatgatggatttaattaacttggatagaactccgggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattggacttagggggagcttac 33017  T
Q  127 aaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33016 aaacctcaaacccgtacaatcaacttgttaattagattaacagcaattgcacattttaaaatactaatgtttgtcatcataaaaaagggagagattgtta 32917  T
Q  226 gaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||    
T  32916 gaacaaaatgtgt 32904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9870 - 9672
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccc 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  9870 aatgatgaatttaattaacatggatagaattcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggagagcttacaaacctcataccc 9771  T
Q  140 ttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9770 ttaaagtcaacgtgttaattatattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcctcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8079 - 7884
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  8079 aatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggacttagggggagcttacaaacctcatacc 7980  T
Q  139 cttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7979 caaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttagaacaaaat 7884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 34233 - 34432
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  34233 aatgatgaatttaattaacatgaatagaactcagggggagcttacaaacttcaccctaaaagtactattggactcagggggagcttacaaacctcatacc 34332  T
Q  139 cttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34333 ctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggaggagattgttggaacaaaatgtgt 34432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 902 - 1127
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  902 agattattctgagtgttattacgtttttat-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagtttacaaacctcaccttaaagta-tattgga 999  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaa 210  Q
    || | |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  1000 ctcaaggggggcttacaaacctcatacccttaaagtcaacttgttaattaaattaacaacaagtgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatctaaa 1099  T
Q  211 agggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1100 acggggagattgttggaacaaaatgtgt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 70441 - 70270
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  70441 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagaatcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 70343  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  70342 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaatgggagattgttggaacaaaatgtgt 70270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 3469 - 3657
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||   ||| ||||| | | ||||||||||||||||| |     
T  3469 atgaatttaattaacttggataaaactcatggg-agcttacaaacctcaccttaa-gaactatcaaactcagggggagcatacaaacctcataccctaa- 3565  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3566 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgaccatt---aatactagtgtttgtcatcatcaaaaagggggagattattggaacaaactgtgt 3657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7992 - 7795
Alignment:
Q  42 tgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaa-agtactattggactaaggggaatcttacaaacctcataccct 140  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | ||      
T  7992 tgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcctacaaacctcaccttaagagtactattggacttagggggagcttacaaacctctttccaa 7893  T
Q  141 tatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892 aatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 7795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 15007 - 15209
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatc----ttacaaacctcat 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |    ||||||||||| |    
T  15007 aatgatgaatttaattaacatggatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagtactattagactcagggggagcttaattacaaacctctt 15106  T
Q  136 acccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 235  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15107 acccaaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatg 15206  T
Q  236 tgt 238  Q
    |||    
T  15207 tgt 15209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 4719 - 4908
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgga 110  Q
    ||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4719 agattattctgagtggtatttcgtttttaaa-gatgaatttaattaacttggatagaactcagggggagcttacaaacctcacct-aaagtactattgga 4816  T
Q  111 ctaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcat 202  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4817 cttagggggagcttacaaacctcataccctttaagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatactaatgtttgtcat 4908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21328 - 21129
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21328 aatgatgaatttaattaacatggatatgacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattggacttagggggagcttacaaacctcatacc 21229  T
Q  139 cttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228 caaatagtcaacatgttaattaaattaacaacaattgaacgttttaaatactattgtttatcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 21129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12083 - 11884
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacc 138  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12083 aatgatgaacttaattaacatggatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaaagtactactggacttagggggagcttacaaacctcatacc 11984  T
Q  139 cttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11983 caaatagtcagcgtgttaattagattaacaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagagggagattgttggaacaaaatgtgt 11884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Original strand, 36244 - 36401
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacat 180  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36244 ttacaaaactcaccttaaaatactattagactcagggggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgataattagattaacaacaattgcacat 36343  T
Q  181 tttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344 tttaaatactaatgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatgtgt 36401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42761 - 42604
Alignment:
Q  81 ttacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacat 180  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42761 ttacaaaactcaccttaaaatactattagactcagggggagcttacaaacctcaaacccttatagtcaacttgataattagattaacaacaattgcacat 42662  T
Q  181 tttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42661 tttaaatactaatgtttgtcatcatcaaagagggggagattgttggaacaaaatgtgt 42604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 17167 - 17393
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaa-gtactattgg 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17167 agattattctgagtgttatttcgaatttaa-tgatgaatttaattaacatggatagaactcagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtactattgg 17265  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    ||| | ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  17266 actcaaggggagcttacaaac-tcataccctaatagtcaacatgttaattagattaacaataattgaacattttaaatgctattgtttgtcatcatcaaa 17364  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17365 aaaggggagattgttgaaacaaaatgtgt 17393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41361 - 41135
Alignment:
Q  11 agattatactgaatgttatttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactca-gggggagattacaaacctcaccttaaagtactattgg 109  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |    
T  41361 agattattttgagtgttattacgtt-ttaaatgatgaatttaattaacttgaatagaactcaagggggagcttacaaactttaccttaaagtactattcg 41263  T
Q  110 actaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaa 209  Q
    ||| | ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||    
T  41262 actcaagggag-cttacaaaactcatactcttatagtcaatttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgttatcatcaaa 41164  T
Q  210 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41163 aagggggagattgttggaacaaaatgtgt 41135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 211392 - 211202
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  211392 aatttaattaacaagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagt 211294  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211293 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 211202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 217261 - 217071
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  217261 aatttaattaacaagtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagt 217163  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  217162 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 217071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12426 - 12238
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  12426 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tgatagt 12328  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12327 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattattggaacaaaatgt 12238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 10710 - 10881
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  10710 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tgacagtcaacttgttaattagatca 10808  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10809 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 10881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0537 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0537
Description:

Target: scaffold0537; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 4121 - 4311
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  4121 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagctctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagt 4219  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactatagtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 4311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17666 - 17476
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  | ||||    
T  17666 aatttaattaacttgtatagaaattagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacctgt-tagt 17568  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17567 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 17476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 3636 - 3807
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |    
T  3636 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcataac-tagtagtcaacttgttaattagatca 3734  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3735 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 3807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7375 - 7213
Alignment:
Q  75 gggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaatt 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7375 gggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagacttagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagtcaacttgttaattagatcaacaacaatt 7277  T
Q  175 gcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7276 gaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23466 - 23276
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   || |    
T  23466 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtatt 23368  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23367 caacttattaattaggtcaacaacaattgaacattttaaatactaatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 23276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9993 - 9803
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  9993 aatttaattaacttgtatagaacttaggaggagcttacaaaactcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaaccttatacc-ttgtagt 9895  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9894 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcagaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31962 - 31772
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||   ||||    
T  31962 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagaactattagactcagggggagcttacaaacctctgtcccag-tagt 31864  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31863 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 31772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 192771 - 192581
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  192771 aatttaattaatgagtatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 192673  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  192672 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 192581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Original strand, 6591 - 6762
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||   |||  | |||||||||||||||||||| |    
T  6591 gaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctctatcccaga-agtcaacttgttaattagatca 6689  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6690 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 6762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 12695 - 12886
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcaggggg-agattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatag 145  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   |||    
T  12695 aatttaattaatgagtatagaactcaggggggagcttacaaacctcaccttgaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtag 12793  T
Q  146 tcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12794 tcaacttgttaattagattaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 12886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 3924 - 4114
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||    
T  3924 aatttaattaataagaatagaactcaaggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccaaaagt 4022  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4023 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactagtgtttgtcatcattaaaaagggggagattgttagaacaaaatgtgt 4114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 4090 - 4280
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | |  ||||    
T  4090 aatttaattaacttgtatagaacttagaggaagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatatc-tagtagt 4188  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4189 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1375
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |   |||    
T  1565 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagcagt 1467  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1466 caacttgttcattaaatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaataaaatgtgt 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9505
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| |   |||    
T  9315 aatttaattaacttgtatagaacttagtgggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactaagggggagcttacaaacctcttacc-tagcagt 9413  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9414 caatttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 9505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 52954 - 53144
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  52954 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatttattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 53052  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53053 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 53144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 128473 - 128303
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagta-ctattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatt 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||     
T  128473 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctcacacc-ttgtagtcaacttgttaattagatc 128375  T
Q  165 aacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128374 aacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 128303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 46998 - 47188
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   | ||    
T  46998 aatttaattaataagaatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaggatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtggt 47096  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47097 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 47188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 61896 - 61706
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||   | |||    
T  61896 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaagtctataagactcagggggagcttacaaacctcatacctgga-agt 61798  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61797 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgttagtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 61706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2831 - 2668
Alignment:
Q  72 agggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaaca 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  2831 agggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaacctcatacc-tagtagttatcttgttaattagatcaacatca 2733  T
Q  172 attgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 attgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 176170 - 175999
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  176170 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactccgggggagcttacaaacctcaaacc-tagtagtcaacttgttaattagatca 176072  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  176071 acaacaattgaatattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaggggaagattgttggaacaaaatgtgt 175999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 53262 - 53426
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| |   |||    
T  53262 aatttaattaatttgtatagaacttagggggagtttacaaacctcaccttaaaaatctattggactcagggggagcttacaaaccacaaacc-tggcagt 53360  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaag 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  53361 caacttgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaag 53426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2697 - 2507
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||| |   |||    
T  2697 aatttaattaacctgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagacttagggggagctttcaaacctcttacc-tggcagt 2599  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2598 caacttgttaattggatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaatgggggagattgttggaacaaaatgtgt 2507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 59147 - 58957
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||| |  ||||    
T  59147 aatttaattaacttgtatagaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttaaaaacctcatacc-tagtagt 59049  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59048 caacttgttaatttgaccaacaacaattgaattttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 58957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 5933 - 6119
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    |||||||||||  || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | |||    
T  5933 aatttaattaacttgtatagaacttagagggagcttacaaacctcaccttaaaagtctattggactcagggggagcttacaaacctcatacc-tgaaagt 6031  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6032 caaattgttaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattatttgtcatcatcaaaaatggggagattgttggaacaaaat 6119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 9699 - 9868
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |    
T  9699 gaacttagggggggcttacaaacctcgccttaaaggtctattagacttagggggagcttacaaacctcttacc-tggtagtcaacttgttaattagatca 9797  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798 aaaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 9868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15711 - 15542
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagatta 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||  | ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |    
T  15711 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattaaactcagggagagcttacaaacctcatacc-tagtagtcagcttgttaattagatca 15613  T
Q  166 acaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgt 236  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15612 acaacaattgaacattttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaaaggggagattgttggaacaaaatgt 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2348
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagatt 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2232 cttacaaacctcataccctaatagtcaacgtgttaattagattaacaacaattgaacattttaagtactattgtttgtcatcaccaaaaagggggagatt 2331  T
Q  222 gttggaacaaaatgtgt 238  Q
     ||||||||||||||||    
T  2332 attggaacaaaatgtgt 2348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 92
Target Start/End: Original strand, 2192 - 2244
Alignment:
Q  40 aatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctca 92  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2192 aatgatgaatttaattaacattgatagaactcagggggagcttacaaacctca 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 12052 - 12205
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  12052 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 12150  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtca 201  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  12151 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaatactattgtttgtca 12205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 3777 - 3917
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttatagt 146  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | |||||||||||| || ||   ||||    
T  3777 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggggagcttacaaacctc-tatcccagtagt 3875  T
Q  147 caacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaata 188  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3876 caacttattaattagatcaacaacaattgaacattttaaata 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10391 - 10279
Alignment:
Q  126 caaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10391 caaacctcaaacccttataatcaacttgttaactagattcacaacaattgaaaattttaaatactgctgtttgtcatcatcaaaaagggtgagattgttg 10292  T
Q  226 gaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||||    
T  10291 gaacaaaatgtgt 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 3982 - 4092
Alignment:
Q  28 atttcgttcttaaatgatgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttaca 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  3982 atttcgtttttaaatgatgaatttaattaccatgaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccataaagtactattggacttagagggagcttaca 4081  T
Q  128 aacctcatacc 138  Q
    |||||||||||    
T  4082 aacctcatacc 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 4864 - 4963
Alignment:
Q  136 acccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacatttt-aaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4864 accctaatagtcaaagtgttaattagattaacaacaattgaacatttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaat 4963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3533 - 3437
Alignment:
Q  142 atagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3533 atagtcaacttattaattagatcagcaacaattgaactttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Original strand, 37573 - 37664
Alignment:
Q  143 tagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37573 tagtcaacttgttaattagatcaacaaaaattgaacattttaaatactattgcttgtcatcatcaaaaagggagagattgttggaacaaaat 37664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 87569 - 87381
Alignment:
Q  44 atgaatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaacctcatacccttat 143  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||| |     
T  87569 atgaatttaattaacttgaatagaactcaagggtagcttacaaacctcaccttaagaga-tattggacttagggggagcttacaaacatcacaccctaa- 87472  T
Q  144 agtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaatgtgt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    ||| |  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  87471 agtcaacttgttgattagattaacaacaattgaccatt---gatactggtgtttgtcatcatcaaaaa-ggggagttttttggaacaaaatgtgt 87381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 118
Target Start/End: Original strand, 3311 - 3382
Alignment:
Q  47 aatttaattaatatggattgaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaagggg 118  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  3311 aatttaattaataagaatagaactcagggggagcttacaaacctcaccttaaagatctattagactcagggg 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 173
Target Start/End: Original strand, 9953 - 10003
Alignment:
Q  122 cttacaaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaat 173  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9953 cttacaaacctcataccctaa-agtcaacttgttaattagattaacaacaat 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 394 - 292
Alignment:
Q  126 caaacctcatacccttatagtcaacttgttaattagattaacaacaattgcacattttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttg 225  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    ||  |||||||   | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  394 caaacctcgtaccctga-agtcaacttgataattagattaacaacaattg----ttccaaatatttgaggttgtcatcattaaaaaggggaagattgttg 300  T
Q  226 gaacaaaa 233  Q
    ||| ||||    
T  299 gaataaaa 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 16439 - 16494
Alignment:
Q  180 ttttaaatattaatgtttgtcatcataaaaaaggggga--gattgttggaacaaaa 233  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16439 ttttaaatactattgtttgtcatcatcaaaaagggggaaggattgttggaacaaaa 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Original strand, 2676 - 2719
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  2676 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27168 - 27125
Alignment:
Q  191 aatgtttgtcatcataaaaaagggggagattgttggaacaaaat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  27168 aatgtttgtcatcatcaaaaagggggagattgttgagacaaaat 27125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30593 - 30530
Alignment:
Q  66 gaactcagggggagattacaaacctcaccttaaagtactattggactaaggggaatcttacaaa 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||    
T  30593 gaacttagggggagcttacaaacctcaccttaaaggtctattagactcagggggagcttacaaa 30530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University