View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19598_high_50 (Length: 244)

Name: NF19598_high_50
Description: NF19598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19598_high_50
NF19598_high_50
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (19-244)||(6744-6969)
scaffold0390 (19-244)||(13760-13985)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (19-244)||(2131-2356)
scaffold0234 (19-244)||(11022-11247)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (19-244)||(18460-18685)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (19-244)||(21940837-21941062)
chr8 (19-244)||(22171659-22171884)
chr8 (19-244)||(6094295-6094520)
chr8 (19-244)||(24642821-24643045)
chr8 (19-192)||(15326422-15326595)
chr8 (19-192)||(15506791-15506964)
chr8 (19-239)||(14983733-14983950)
chr8 (44-241)||(24797224-24797419)
chr8 (26-236)||(21969333-21969539)
chr8 (49-244)||(38232219-38232412)
chr8 (26-236)||(12562123-12562329)
chr8 (26-236)||(25611195-25611401)
chr8 (26-244)||(8371349-8371563)
chr8 (26-236)||(22130705-22130911)
chr8 (26-236)||(27007613-27007819)
chr8 (26-236)||(27014756-27014962)
chr8 (26-236)||(27880583-27880789)
chr8 (26-236)||(28020764-28020970)
chr8 (26-244)||(18835342-18835556)
chr8 (26-236)||(21916676-21916882)
chr8 (70-236)||(45534413-45534575)
chr8 (26-235)||(22659590-22659795)
chr8 (70-236)||(26240484-26240646)
chr8 (26-160)||(8781971-8782102)
chr8 (38-213)||(2375214-2375386)
chr8 (109-244)||(32872741-32872876)
chr8 (19-70)||(28548393-28548444)
chr8 (53-168)||(6430953-6431065)
chr8 (139-233)||(29645537-29645631)
chr8 (26-132)||(20535306-20535409)
chr8 (26-168)||(2963028-2963171)
chr8 (129-236)||(36970265-36970371)
chr8 (137-189)||(10920427-10920479)
chr8 (162-217)||(24535514-24535569)
chr8 (103-162)||(34659059-34659118)
chr8 (215-244)||(28555055-28555084)
chr8 (33-78)||(29645675-29645720)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (19-244)||(15152615-15152840)
chr7 (19-244)||(29327956-29328181)
chr7 (19-244)||(11542790-11543015)
chr7 (19-244)||(11535872-11536097)
chr7 (19-244)||(12750998-12751223)
chr7 (19-244)||(12738708-12738933)
chr7 (19-244)||(18561179-18561395)
chr7 (22-240)||(13392326-13392544)
chr7 (26-241)||(18257661-18257874)
chr7 (26-236)||(8464999-8465205)
chr7 (26-236)||(2204552-2204758)
chr7 (26-236)||(18400104-18400310)
chr7 (26-236)||(18407088-18407294)
chr7 (26-236)||(48808592-48808798)
chr7 (26-236)||(19230888-19231094)
chr7 (70-236)||(30254138-30254300)
chr7 (26-236)||(18139434-18139640)
chr7 (19-169)||(2365169-2365317)
chr7 (70-236)||(15729751-15729913)
chr7 (71-236)||(10669043-10669204)
chr7 (104-217)||(10235361-10235474)
chr7 (26-168)||(41681064-41681203)
chr7 (26-235)||(24443423-24443628)
chr7 (26-244)||(19388544-19388762)
chr7 (26-236)||(47166955-47167161)
chr7 (26-238)||(25845572-25845780)
chr7 (26-238)||(25845991-25846199)
chr7 (26-161)||(14591924-14592056)
chr7 (26-161)||(16011515-16011647)
chr7 (127-235)||(47833875-47833983)
chr7 (26-236)||(19393520-19393726)
chr7 (28-154)||(31190537-31190660)
chr7 (113-231)||(7662569-7662686)
chr7 (195-244)||(15148314-15148363)
chr7 (29-161)||(22969024-22969153)
chr7 (136-236)||(19859122-19859221)
chr7 (158-244)||(7396361-7396450)
chr7 (70-236)||(28130561-28130723)
chr7 (103-241)||(3132849-3132986)
chr7 (26-161)||(34128647-34128779)
chr7 (32-168)||(18259226-18259359)
chr7 (26-117)||(15169386-15169474)
chr7 (22-78)||(22948518-22948574)
chr7 (147-202)||(29983179-29983234)
chr7 (136-239)||(39111989-39112092)
chr7 (198-240)||(2365070-2365112)
chr7 (129-171)||(7396469-7396511)
chr7 (13-83)||(29984308-29984378)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (19-244)||(17684279-17684504)
chr6 (19-244)||(27381062-27381287)
chr6 (19-244)||(27471445-27471670)
chr6 (19-244)||(29309062-29309287)
chr6 (19-244)||(29316022-29316247)
chr6 (19-244)||(188787-189012)
chr6 (19-244)||(11651895-11652120)
chr6 (19-244)||(17691250-17691475)
chr6 (19-202)||(16394255-16394438)
chr6 (19-168)||(27296877-27297026)
chr6 (19-170)||(25537001-25537152)
chr6 (22-151)||(16559285-16559414)
chr6 (146-244)||(16566257-16566355)
chr6 (22-244)||(13359086-13359304)
chr6 (26-236)||(16789071-16789277)
chr6 (70-236)||(18019981-18020143)
chr6 (26-236)||(22859984-22860190)
chr6 (26-236)||(27508443-27508649)
chr6 (26-236)||(27528029-27528235)
chr6 (23-233)||(2669476-2669684)
chr6 (70-236)||(1586248-1586410)
chr6 (63-235)||(27925935-27926103)
chr6 (32-235)||(17850321-17850521)
chr6 (113-218)||(28172754-28172859)
chr6 (74-236)||(14074480-14074638)
chr6 (26-236)||(8612915-8613125)
chr6 (26-244)||(10359147-10359359)
chr6 (26-166)||(20736425-20736562)
chr6 (112-244)||(20553492-20553622)
chr6 (26-168)||(21994655-21994794)
chr6 (26-238)||(19218427-19218630)
chr6 (57-237)||(22560311-22560487)
chr6 (101-222)||(19347092-19347212)
chr6 (22-183)||(8510155-8510314)
chr6 (141-236)||(13995151-13995245)
chr6 (26-238)||(4073574-4073781)
chr6 (198-244)||(25537148-25537194)
chr6 (26-161)||(5758577-5758709)
chr6 (19-70)||(28172899-28172951)
chr6 (26-168)||(17120601-17120740)
chr6 (200-236)||(20736594-20736630)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (19-244)||(24695276-24695501)
chr5 (19-244)||(19714308-19714533)
chr5 (19-244)||(18569671-18569898)
chr5 (35-244)||(19707044-19707253)
chr5 (51-244)||(39538760-39538953)
chr5 (23-244)||(18806850-18807069)
chr5 (19-220)||(17285560-17285759)
chr5 (19-220)||(17298711-17298912)
chr5 (62-239)||(22546872-22547046)
chr5 (26-236)||(20941027-20941233)
chr5 (26-236)||(31899-32105)
chr5 (26-236)||(23545922-23546128)
chr5 (70-236)||(25805525-25805687)
chr5 (26-236)||(12789759-12789965)
chr5 (26-236)||(22941250-22941456)
chr5 (70-236)||(24933446-24933608)
chr5 (26-234)||(20100339-20100543)
chr5 (70-236)||(31096816-31096978)
chr5 (23-154)||(18806490-18806619)
chr5 (23-154)||(18806670-18806799)
chr5 (26-236)||(12765086-12765296)
chr5 (19-103)||(27347345-27347428)
chr5 (26-236)||(5097651-5097857)
chr5 (23-178)||(18829377-18829530)
chr5 (26-236)||(7865526-7865736)
chr5 (156-244)||(27347425-27347513)
chr5 (26-236)||(9811829-9812039)
chr5 (26-236)||(12703970-12704180)
chr5 (26-168)||(26129789-26129928)
chr5 (70-236)||(26245102-26245264)
chr5 (62-240)||(31651917-31652090)
chr5 (104-233)||(33477193-33477321)
chr5 (191-235)||(39535465-39535509)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (19-244)||(18262384-18262609)
chr4 (19-244)||(18269245-18269470)
chr4 (19-244)||(55612855-55613080)
chr4 (19-244)||(26963812-26964037)
chr4 (19-244)||(26970635-26970860)
chr4 (19-244)||(868769-868994)
chr4 (19-244)||(5707492-5707717)
chr4 (19-244)||(5714120-5714345)
chr4 (19-244)||(10621143-10621368)
chr4 (19-244)||(10628222-10628447)
chr4 (19-244)||(19926570-19926795)
chr4 (19-244)||(8858339-8858564)
chr4 (19-244)||(28392944-28393169)
chr4 (19-244)||(8845375-8845600)
chr4 (19-244)||(4426426-4426639)
chr4 (22-244)||(35223732-35223954)
chr4 (19-240)||(5667937-5668156)
chr4 (19-244)||(20311464-20311687)
chr4 (19-161)||(10677392-10677534)
chr4 (19-161)||(10891032-10891174)
chr4 (104-240)||(56516232-56516368)
chr4 (30-180)||(21453961-21454110)
chr4 (26-236)||(15461497-15461703)
chr4 (26-236)||(2677013-2677219)
chr4 (26-236)||(15815021-15815227)
chr4 (26-236)||(17300055-17300261)
chr4 (26-236)||(18111139-18111345)
chr4 (26-236)||(34975551-34975757)
chr4 (26-236)||(3369119-3369325)
chr4 (26-235)||(5870419-5870624)
chr4 (26-236)||(26531613-26531819)
chr4 (70-236)||(4676123-4676285)
chr4 (70-236)||(18163162-18163324)
chr4 (70-236)||(20243937-20244099)
chr4 (26-236)||(19365519-19365726)
chr4 (31-236)||(32636484-32636685)
chr4 (24-215)||(32646618-32646807)
chr4 (26-236)||(1941724-1941930)
chr4 (26-168)||(19362477-19362616)
chr4 (154-232)||(24700213-24700291)
chr4 (26-236)||(4546080-4546286)
chr4 (26-161)||(9487625-9487757)
chr4 (26-149)||(30040585-30040705)
chr4 (26-244)||(5616387-5616601)
chr4 (26-180)||(33888594-33888743)
chr4 (62-189)||(34777850-34777975)
chr4 (53-168)||(5528602-5528714)
chr4 (70-161)||(9538033-9538121)
chr4 (26-146)||(11421096-11421213)
chr4 (192-244)||(10677538-10677590)
chr4 (192-244)||(10891178-10891230)
chr4 (178-243)||(9937933-9937998)
chr4 (19-57)||(24701361-24701399)
chr4 (68-159)||(9937830-9937923)
chr4 (200-236)||(11421016-11421052)
chr4 (200-244)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (19-244)||(6110236-6110461)
chr3 (19-244)||(15600694-15600919)
chr3 (19-244)||(15607239-15607464)
chr3 (19-244)||(16482293-16482518)
chr3 (19-244)||(10579165-10579390)
chr3 (22-244)||(10572405-10572627)
chr3 (19-244)||(18520147-18520372)
chr3 (19-243)||(18522836-18523060)
chr3 (19-244)||(17780928-17781153)
chr3 (19-235)||(8490676-8490892)
chr3 (19-240)||(15357396-15357617)
chr3 (19-244)||(13211474-13211699)
chr3 (19-244)||(13248779-13249004)
chr3 (19-240)||(15342029-15342250)
chr3 (19-244)||(32056709-32056935)
chr3 (22-244)||(17199997-17200219)
chr3 (19-244)||(13516983-13517204)
chr3 (19-244)||(1647331-1647556)
chr3 (19-240)||(17136535-17136750)
chr3 (19-244)||(29925143-29925368)
chr3 (19-244)||(29974296-29974521)
chr3 (19-219)||(16200627-16200827)
chr3 (22-244)||(24253205-24253423)
chr3 (26-236)||(15846632-15846838)
chr3 (26-236)||(21034238-21034444)
chr3 (70-236)||(14890391-14890553)
chr3 (26-236)||(20147650-20147856)
chr3 (26-236)||(21398792-21398998)
chr3 (27-244)||(14147013-14147226)
chr3 (26-236)||(12299911-12300116)
chr3 (70-236)||(55427021-55427183)
chr3 (26-168)||(25978824-25978963)
chr3 (62-195)||(32280313-32280444)
chr3 (26-233)||(15317269-15317472)
chr3 (26-161)||(15526827-15526959)
chr3 (70-168)||(11787654-11787749)
chr3 (68-197)||(28953965-28954093)
chr3 (198-240)||(19089734-19089776)
chr3 (151-244)||(9504455-9504548)
chr3 (125-240)||(8251933-8252048)
chr3 (177-244)||(16200297-16200363)
chr3 (26-82)||(30464147-30464203)
chr3 (26-90)||(36138033-36138097)
chr3 (26-114)||(28088227-28088312)
chr3 (26-90)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (19-244)||(18252202-18252427)
chr1 (19-244)||(18532324-18532549)
chr1 (22-244)||(27131222-27131444)
chr1 (19-244)||(27310387-27310612)
chr1 (19-244)||(16358845-16359070)
chr1 (19-244)||(3855729-3855954)
chr1 (19-244)||(36816444-36816668)
chr1 (57-244)||(21171081-21171268)
chr1 (20-244)||(27277369-27277592)
chr1 (22-210)||(22641687-22641871)
chr1 (96-244)||(22657108-22657256)
chr1 (19-220)||(23507096-23507295)
chr1 (23-244)||(12014100-12014319)
chr1 (26-236)||(19706535-19706741)
chr1 (26-236)||(28134819-28135025)
chr1 (26-236)||(43802461-43802667)
chr1 (26-236)||(9456116-9456322)
chr1 (26-236)||(20779741-20779947)
chr1 (26-236)||(22670353-22670559)
chr1 (26-236)||(42817085-42817291)
chr1 (26-236)||(20391335-20391541)
chr1 (127-243)||(9917837-9917952)
chr1 (26-236)||(22612492-22612698)
chr1 (26-236)||(633934-634140)
chr1 (19-121)||(9916587-9916688)
chr1 (26-236)||(8727667-8727873)
chr1 (127-236)||(47667668-47667776)
chr1 (104-236)||(35930582-35930713)
chr1 (26-168)||(29096789-29096928)
chr1 (29-161)||(21881475-21881604)
chr1 (131-220)||(12006461-12006550)
chr1 (26-161)||(51997353-51997485)
chr1 (102-228)||(26923553-26923678)
chr1 (38-181)||(24301713-24301855)
chr1 (31-90)||(10852402-10852461)
chr1 (68-147)||(31236402-31236478)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (19-244)||(7279-7504)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (19-244)||(25800-26025)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (19-244)||(21330058-21330283)
chr2 (19-244)||(18796678-18796903)
chr2 (19-244)||(18619976-18620200)
chr2 (31-244)||(22183308-22183518)
chr2 (19-244)||(36270338-36270560)
chr2 (19-241)||(6991924-6992146)
chr2 (19-200)||(20978091-20978270)
chr2 (19-220)||(18822279-18822478)
chr2 (26-236)||(24250128-24250334)
chr2 (26-236)||(30174377-30174583)
chr2 (106-235)||(18851956-18852085)
chr2 (104-244)||(19279460-19279600)
chr2 (53-236)||(24229338-24229517)
chr2 (26-168)||(15342098-15342237)
chr2 (26-235)||(29800468-29800677)
chr2 (127-230)||(36801899-36802003)
chr2 (26-236)||(19616435-19616641)
chr2 (27-161)||(40301034-40301164)
chr2 (23-92)||(17241034-17241102)
chr2 (26-161)||(21626824-21626955)
chr2 (127-234)||(28741220-28741326)
chr2 (62-159)||(41316412-41316506)
chr2 (127-244)||(24763751-24763867)
chr2 (200-240)||(12098609-12098649)
chr2 (26-90)||(28740922-28740986)
chr2 (102-165)||(28718943-28719006)
chr2 (26-76)||(36799775-36799826)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (19-244)||(1165-1390)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (65-244)||(5701-5881)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (19-185)||(230201-230367)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (26-236)||(8305-8511)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (26-236)||(183-389)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (26-236)||(3771-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (26-236)||(119730-119936)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (26-236)||(130320-130526)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (26-236)||(40084-40290)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (26-236)||(13045-13251)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (26-168)||(26609-26748)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (113-244)||(90019-90151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (26-236)||(67470-67676)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (30-244)||(8723-8933)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (26-161)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (70-235)||(53766-53927)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (102-161)||(11699-11758)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (29-119)||(102-189)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (106-197)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (53-149)||(11328-11421)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (200-244)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 6744 - 6969
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 6843  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6844 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 6943  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6944 tacctacataatagtctctatgcttt 6969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 13760 - 13985
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13760 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctc 13859  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13860 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 13959  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13960 tacctacataatagtctttatgcttt 13985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 2131 - 2356
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 2230  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2231 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 2330  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2331 tacctacataatagtctctatgcttt 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 11022 - 11247
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 11121  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 11221  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11222 tacctacataatagtctctatgcttt 11247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18685 - 18460
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18586  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18585 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18486  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18485 tacctacataatagtctctatgcttt 18460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21941062 - 21940837
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941062 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 21940963  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940962 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 21940863  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21940862 tacctacataatagtctctatgcttt 21940837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22171884 - 22171659
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171884 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 22171785  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22171784 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtc 22171685  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22171684 tacctacataatagtctctatgcttt 22171659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6094520 - 6094295
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6094520 tagggtacatagtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctc 6094421  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6094420 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactc 6094321  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  6094320 tacccatataatagtctctatgcttt 6094295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24643045 - 24642821
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24643045 tagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctc 24642947  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642946 atggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 24642847  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  24642846 tacccacataatagtctctatacttt 24642821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15326595 - 15326422
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326595 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15326496  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326495 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15506964 - 15506791
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506964 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15506865  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506864 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 14983733 - 14983950
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  14983733 tagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattct 14983829  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  14983830 catggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatccgtgagatatgatcattagt 14983928  T
Q  218 ctacctacataatagtctctat 239  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  14983929 ctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 241
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  44 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  144 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 241  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21969539 - 21969333
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  21969539 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 21969443  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21969442 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21969344  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  21969343 ataatagtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 244
Target Start/End: Original strand, 38232219 - 38232412
Alignment:
Q  49 tggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 147  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38232219 tggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattac 38232315  T
Q  148 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
     | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  38232316 ccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgcttt 38232412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12562329 - 12562123
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  12562329 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12562233  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12562232 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12562134  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  12562133 ataatagtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25611401 - 25611195
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  25611401 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 25611305  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||    
T  25611304 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatac 25611206  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  25611205 ataatagtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 8371349 - 8371563
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8371349 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8371445  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8371446 gtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8371544  T
Q  226 ataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  8371545 ataatagtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 22130705 - 22130911
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  22130705 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22130801  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22130802 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22130900  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  22130901 ataatagtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 27007613 - 27007819
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  27007613 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27007709  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27007710 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27007808  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  27007809 ataatagtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 27014756 - 27014962
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  27014756 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27014852  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27014853 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27014951  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  27014952 ataatagtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 27880583 - 27880789
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  27880583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27880679  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27880680 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27880778  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  27880779 ataatagtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 28020764 - 28020970
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28020764 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 28020860  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  28020861 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 28020959  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  28020960 ataatagtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  226 ataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21916882 - 21916676
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | ||    
T  21916882 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgg 21916786  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21916785 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21916687  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  21916686 ataatagtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 45534413 - 45534575
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  45534413 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 45534509  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45534510 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 22659590 - 22659795
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  22659590 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 22659686  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||    
T  22659687 gtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatac 22659785  T
Q  226 ataatagtct 235  Q
    ||||||||||    
T  22659786 ataatagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26240646 - 26240484
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26240646 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgta 26240550  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  26240549 tatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacataatagtctc 26240484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 8781971 - 8782102
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| || ||    
T  8781971 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacag--actatgtagtattctcacggtgg 8782067  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttat 160  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782068 atcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2375386 - 2375214
Alignment:
Q  38 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 136  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||   ||| ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||    
T  2375386 aggtcaaatggttgaatacaccacttatcactatgagaataact-atgagt-tttacataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaat 2375291  T
Q  137 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 213  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375290 atacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 244
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872876
Alignment:
Q  109 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  209 atcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgcttt 32872876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 28548444 - 28548393
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548444 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6431065 - 6430953
Alignment:
Q  53 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 152  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||    
T  6431065 atacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactccta 6430969  T
Q  153 atatttatatctatgt 168  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6430968 atatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  139 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Original strand, 20535306 - 20535409
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||||| ||    
T  20535306 catagtggttccaggtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatgcaatattctcatggtgg 20535402  T
Q  126 atcaatc 132  Q
     ||||||    
T  20535403 gtcaatc 20535409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 2963028 - 2963171
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||  | |||||||||||||||||  ||    
T  2963028 catagtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcgg 2963125  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
      | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963126 taggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  129 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  229 atagtctc 236  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  137 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  162 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  103 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 162  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555055
Alignment:
Q  215 agtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgcttt 28555055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 29645720 - 29645675
Alignment:
Q  33 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 78  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  29645720 gtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15152840 - 15152615
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152840 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15152741  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152740 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 15152641  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15152640 tacctacataatagtctctatgcttt 15152615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29328181 - 29327956
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328181 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 29328082  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328081 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 29327982  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29327981 tacctacataatagtctctatgcttt 29327956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 11542790 - 11543015
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542790 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctc 11542889  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542890 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 11542989  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11542990 tacctacataatagtctctatgcttt 11543015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 11535872 - 11536097
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535872 tagggtacatagtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 11535971  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535972 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 11536071  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11536072 tacctacataatagtctctatgcttt 11536097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12751223 - 12750998
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751223 tagggtacctagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 12751124  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751123 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 12751024  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  12751023 tatccacataatagtctctatgcttt 12750998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12738933 - 12738708
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738933 tagggtacatagtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 12738834  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12738833 atggcggatcaatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtc 12738734  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  12738733 tacccacataatagtctctatgcttt 12738708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18561395 - 18561179
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561395 tagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18561305  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561304 atagagggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18561205  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  18561204 tacccacataatagtctctatgcttt 18561179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13392544 - 13392326
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13392544 ggtacatagtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatg 13392445  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  13392444 gtgggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctac 13392345  T
Q  222 ctacataatagtctctatg 240  Q
    | | | |||||||||||||    
T  13392344 caatacaatagtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 18257661 - 18257874
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||| |||||| | || ||    
T  18257661 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacggtgg 18257758  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  18257759 gttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatccac 18257858  T
Q  226 ataatagtctctatgc 241  Q
    |||||||||| |||||    
T  18257859 ataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8465205 - 8464999
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8465205 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8465109  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8465108 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8465010  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  8465009 ataatagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2204758 - 2204552
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  2204758 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 2204662  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  2204661 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 2204563  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  2204562 ataatagtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18400310 - 18400104
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  18400310 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18400214  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18400213 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18400115  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  18400114 ataatagtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18407294 - 18407088
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  18407294 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18407198  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18407197 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18407099  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  18407098 ataatagtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 48808592 - 48808798
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  48808592 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 48808688  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  48808689 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 48808787  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  48808788 ataatagtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19231094 - 19230888
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||    
T  19231094 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgg 19230998  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  19230997 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 19230899  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  19230898 ataatagtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30254300 - 30254138
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30254300 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgta 30254204  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254203 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 18139434 - 18139640
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  18139434 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18139530  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18139531 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18139629  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  18139630 ataatagtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2365317 - 2365169
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| |    
T  2365317 tagggtacatagtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcatttt 2365221  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365220 catggtgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15729913 - 15729751
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15729913 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 15729817  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15729816 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Original strand, 10669043 - 10669204
Alignment:
Q  71 gagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 170  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  10669043 gagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtat 10669139  T
Q  171 agacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10669140 agacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235361
Alignment:
Q  104 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 203  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgag 10235375  T
Q  204 atgtgatcatcagt 217  Q
    ||||||||||||||    
T  10235374 atgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 41681064 - 41681203
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  41681064 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 41681160  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681161 gtcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 24443423 - 24443628
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||    
T  24443423 cataatggtttcaagtctaagagtgttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgg 24443519  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  24443520 gttaatctagtataaatattactcctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 24443618  T
Q  226 ataatagtct 235  Q
    ||||||||||    
T  24443619 ataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19388762 - 19388544
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactt--ttactatgtagtattctcatggc 123  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |   |||||||||||||||||      
T  19388762 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacacttt-cataacatactatatatgtagtattctcatgat 19388664  T
Q  124 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 223  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || |||||| ||||  |    
T  19388663 tgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtcatcaatctatat 19388565  T
Q  224 acataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19388564 acataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 47166955 - 47167161
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  47166955 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 47167051  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  47167052 gtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 47167150  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  47167151 ataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 25845572 - 25845780
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |     
T  25845572 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgt 25845668  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |    
T  25845669 gtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgc 25845767  T
Q  226 ataatagtctcta 238  Q
    |||||||||||||    
T  25845768 ataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 25845991 - 25846199
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || |     
T  25845991 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgt 25846087  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |    
T  25846088 gtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgc 25846186  T
Q  226 ataatagtctcta 238  Q
    |||||||||||||    
T  25846187 ataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||| || ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    ||| | |||||||||||||| ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  227 taatagtct 235  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 19393520 - 19393726
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |    
T  19393520 catactggattcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcg 19393616  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  19393617 gtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatac 19393715  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  19393716 ataatagtctc 19393726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 31190537 - 31190660
Alignment:
Q  28 tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 127  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  || ||||||||||||||||| || |    
T  31190537 tagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataacat--acaatgtagtattctcatggtgggt 31190633  T
Q  128 caatccaatataaatattactcctaat 154  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190634 caatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  113 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 212  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  213 tcagtctacctacataata 231  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148314
Alignment:
Q  195 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 15148314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  29 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 128  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  129 aatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  136 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  158 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28130723 - 28130561
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  28130723 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgta 28130627  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  28130626 tagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcataatagtctc 28130561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  103 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 202  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  203 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 241  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34128779 - 34128647
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | |||||||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||||||||||    ||    
T  34128779 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacaatgg 34128683  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128682 atctatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Original strand, 18259226 - 18259359
Alignment:
Q  32 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaat 131  Q
    ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||| |||||||||| || || || ||    
T  18259226 ggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgcagtattctcacggtgggtctat 18259322  T
Q  132 ccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
    ||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259323 ccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 15169386 - 15169474
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169386 catagtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 78
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948574
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 78  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948518 ggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  147 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 202  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111989
Alignment:
Q  136 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  236 ctat 239  Q
    ||||    
T  39111992 ctat 39111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  198 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  129 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 171  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29984378 - 29984308
Alignment:
Q  13 tcatcatagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 83  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984378 tcataatagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 17684279 - 17684504
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684279 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 17684378  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684379 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 17684478  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17684479 tacctacataatagtctctatgcttt 17684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 27381062 - 27381287
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381062 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 27381161  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381162 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 27381261  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27381262 tacctacataatagtctctatgcttt 27381287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 27471445 - 27471670
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471445 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 27471544  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471545 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 27471644  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27471645 tacctacataatagtctctatgcttt 27471670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29309287 - 29309062
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309287 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 29309188  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29309187 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtc 29309088  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29309087 tacctacataatagtctctatgcttt 29309062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29316247 - 29316022
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316247 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 29316148  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29316147 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtc 29316048  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29316047 tacctacataatagtctctatgcttt 29316022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 188787 - 189012
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188787 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 188886  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  188887 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtc 188986  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  188987 tacccacataatagtctctatgcttt 189012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11652120 - 11651895
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652120 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 11652021  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652020 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 11651921  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  11651920 tacccacataatagtctctatgcttt 11651895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 17691250 - 17691475
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691250 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 17691349  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17691350 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtc 17691449  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17691450 tacctacataatagtctttatgcttt 17691475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 16394255 - 16394438
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16394255 tagggtacatagtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctc 16394354  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394355 atggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27297026 - 27296877
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297026 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 27296927  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296926 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 25537001 - 25537152
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537001 tagggtaaatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 25537100  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537101 atggcggatcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 151
Target Start/End: Original strand, 16559285 - 16559414
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559285 ggtacatagcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 16559384  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcct 151  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559385 gtggatcaatccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566355
Alignment:
Q  146 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 16566355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 13359086 - 13359304
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||  ||    
T  13359086 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataattttca--atgtagtattc--at 13359180  T
Q  121 ggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 220  Q
    || |   |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13359181 ggtgagacaattcaatataaatactacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtcta 13359280  T
Q  221 cctacataatagtctctatgcttt 244  Q
     | | ||||||||||||| |||||    
T  13359281 tccatataatagtctctacgcttt 13359304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16789277 - 16789071
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  16789277 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 16789181  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  16789180 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 16789082  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  16789081 ataatagtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020143
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18019981 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 18020077  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020078 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 22859984 - 22860190
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  22859984 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22860080  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22860081 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22860179  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  22860180 ataatagtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 27508443 - 27508649
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  27508443 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27508539  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27508540 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27508638  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||| ||||||    
T  27508639 ataacagtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 27528029 - 27528235
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  27528029 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27528125  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27528126 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27528224  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||| ||||||    
T  27528225 ataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2669684 - 2669476
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||    
T  2669684 gtacataatgatttcaggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatg 2669588  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
      |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||    
T  2669587 atgtgtcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctac 2669488  T
Q  222 ctacataatagt 233  Q
    | | ||||||||    
T  2669487 ccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 1586248 - 1586410
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1586248 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 1586344  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1586345 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27926103 - 27925935
Alignment:
Q  63 atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 162  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||  || ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  27926103 atcactatgataataacctatgaca-tttacataatttt--ctgtgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatat 27926008  T
Q  163 ctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27926007 ctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatgagatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  32 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaat 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||     |  |||||||||||| | || || |||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatactta-cataaaaccca--atgtagtattcttaaggagggtcaat 17850417  T
Q  132 ccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataata 231  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17850418 ccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataata 17850517  T
Q  232 gtct 235  Q
    ||||    
T  17850518 gtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  113 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 212  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  213 tcagtc 218  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14074638 - 14074480
Alignment:
Q  74 aatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaaga 173  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  14074638 aatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtataga 14074542  T
Q  174 cttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14074541 cttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8613125 - 8612915
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  8613125 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 8613028  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||     
T  8613027 tgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctaca 8612929  T
Q  223 tacataatagtctc 236  Q
    ||||||||||||||    
T  8612928 tacataatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Original strand, 10359147 - 10359359
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| ||| || ||    
T  10359147 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgg 10359242  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     || ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| ||     
T  10359243 gtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatat 10359340  T
Q  226 ataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  10359341 ataatagtctctacgcttt 10359359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 20736425 - 20736562
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||||||||||||| |  ||    
T  20736425 catagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagtattctcacgatgg 20736521  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736522 atcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553622
Alignment:
Q  112 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 211  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  212 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctcacggtgg 19218534  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  19218533 gt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatac 19218440  T
Q  226 ataatagtctcta 238  Q
    |||||||||||||    
T  19218439 ataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  57 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 156  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  157 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 237  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  101 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  201 gagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8510314 - 8510155
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||||| ||  |||||||||||| ||||     
T  8510314 ggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataacatt--ctatgtagtattatcatt 8510218  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 183  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510217 gtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995245
Alignment:
Q  141 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |  ||||||||||||||| ||  |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  226 ataatagtctcta 238  Q
    |||||||||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 244
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537194
Alignment:
Q  198 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgcttt 25537194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 5758577 - 5758709
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | | |||||| |  |||||||||||||||||  | ||    
T  5758577 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacagtgg 5758673  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758674 atctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 28172951 - 28172899
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 70  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172951 tagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 17120601 - 17120740
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | ||    
T  17120601 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgg 17120697  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120698 gtcaatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 236
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  200 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 24695276 - 24695501
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695276 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 24695375  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695376 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 24695475  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24695476 tacctacataatagtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 19714308 - 19714533
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714308 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 19714407  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714408 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 19714507  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  19714508 tacccacataatagtctctatgcttt 19714533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 18569671 - 18569898
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569671 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18569770  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcag 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18569771 atggcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcag 18569870  T
Q  217 tctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18569871 tctaccaacataatagtctttatgcttt 18569898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 19707044 - 19707253
Alignment:
Q  35 ttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707044 ttcaggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcca 19707143  T
Q  135 atataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19707144 atataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtc 19707243  T
Q  235 tctatgcttt 244  Q
    ||||||||||    
T  19707244 tctatgcttt 19707253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538760
Alignment:
Q  51 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  151 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgcttt 39538760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 18806850 - 18807069
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806850 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806946  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18806947 gtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatcagtctac 18807046  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  18807047 ccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 17285560 - 17285759
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||    
T  17285560 tagggtacatattgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattct 17285656  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17285657 cattgtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagt 17285756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 17298711 - 17298912
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  17298711 tagggtacatattggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattct 17298807  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatca 215  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||    
T  17298808 catggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatca 17298907  T
Q  216 gtcta 220  Q
    |||||    
T  17298908 gtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22547046
Alignment:
Q  62 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgata-tttacataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttata 22546968  T
Q  162 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 239  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22546969 tctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20941233 - 20941027
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  20941233 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 20941137  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20941136 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20941038  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  20941037 ataatagtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32105 - 31899
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  32105 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 32009  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  32008 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 31910  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  31909 ataatagtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23546128 - 23545922
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  23546128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 23546032  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  23546031 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 23545933  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  23545932 ataatagtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 25805525 - 25805687
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25805525 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 25805621  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25805622 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 12789759 - 12789965
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  12789759 catagtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 12789855  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12789856 gtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12789954  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  12789955 ataatagtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22941456 - 22941250
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  22941456 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 22941360  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| |||    
T  22941359 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatac 22941261  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  22941260 ataatagtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 24933446 - 24933608
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24933446 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 24933542  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24933543 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 20100339 - 20100543
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  ||    
T  20100339 catagtggtttcatgtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgg 20100435  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  20100436 gtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatac 20100534  T
Q  226 ataatagtc 234  Q
    |||||||||    
T  20100535 ataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31096978 - 31096816
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||     
T  31096978 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctataatttatacctatgta 31096882  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31096881 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Original strand, 18806490 - 18806619
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806490 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806586  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaat 154  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806587 gtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Original strand, 18806670 - 18806799
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  |||||||||    
T  18806670 gtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcattctcatg 18806766  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaat 154  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806767 gtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 12765086 - 12765296
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | |||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  12765086 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacgg 12765183  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  12765184 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 12765282  T
Q  223 tacataatagtctc 236  Q
    ||||||||||||||    
T  12765283 tacataatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 27347345 - 27347428
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 103  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27347345 tagggtacatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5097857 - 5097651
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  5097857 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgg 5097761  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| |||    
T  5097760 gttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatac 5097662  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  5097661 ataatagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 178  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 7865526 - 7865736
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  7865526 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 7865623  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||     
T  7865624 tgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctaca 7865722  T
Q  223 tacataatagtctc 236  Q
    ||||||||||||||    
T  7865723 tacataatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  156 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 9811829 - 9812039
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  9811829 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 9811926  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  9811927 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 9812025  T
Q  223 tacataatagtctc 236  Q
    |||||| |||||||    
T  9812026 tacatagtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 12703970 - 12704180
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt---tcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||    ||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  12703970 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacgg 12704067  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  12704068 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 12704166  T
Q  223 tacataatagtctc 236  Q
    |||||| |||||||    
T  12704167 tacatagtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 26129789 - 26129928
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||| ||||| ||| || ||    
T  26129789 catagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgg 26129885  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129886 gtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26245264 - 26245102
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26245264 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgta 26245168  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26245167 taaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacataatagtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 240
Target Start/End: Original strand, 31651917 - 31652090
Alignment:
Q  62 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   ||||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  31651917 tatcactatgagaatatcttatgatac--ttcataac--atactatgtaatattctcatagtaggtcaatccattattaatgttactcctaatattttta 31652012  T
Q  162 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 240  Q
     | ||||  | |||| ||| |||  |||| |||| | ||||||  |  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31652013 ccaatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccgtgagacttagtcatcagtctacatacatagtagtctctatg 31652090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  104 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 203  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  204 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 233  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  191 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18262609 - 18262384
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262609 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18262510  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262509 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18262410  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262409 tacctacataatagtctctatgcttt 18262384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18269470 - 18269245
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269470 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18269371  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269370 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18269271  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18269270 tacctacataatagtctctatgcttt 18269245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55613080 - 55612855
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613080 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 55612981  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612980 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 55612881  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  55612880 tacctacataatagtctctatgcttt 55612855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26964037 - 26963812
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964037 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 26963938  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963937 atggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 26963838  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26963837 tacctacataatagtctctatgcttt 26963812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26970860 - 26970635
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970860 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 26970761  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970760 atggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 26970661  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26970660 tacctacataatagtctctatgcttt 26970635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 868994 - 868769
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868994 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 868895  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868894 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 868795  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  868794 tacctacataatagtctctatgcttt 868769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5707717 - 5707492
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707717 tagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 5707618  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707617 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 5707518  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5707517 tacctacataatagtctctatgcttt 5707492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5714345 - 5714120
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714345 tagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 5714246  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714245 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 5714146  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5714145 tacctacataatagtctctatgcttt 5714120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 10621143 - 10621368
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621143 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 10621242  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621243 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 10621342  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10621343 tacctacataatagtctctatgcttt 10621368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 10628222 - 10628447
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628222 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 10628321  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628322 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 10628421  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10628422 tacctacataatagtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 19926570 - 19926795
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926570 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctc 19926669  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926670 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 19926769  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19926770 tacctacataatagtctctatgcttt 19926795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8858564 - 8858339
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858564 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 8858465  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8858464 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcc 8858365  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  8858364 tacccacataatagtctctatgcttt 8858339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 28392944 - 28393169
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392944 tagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 28393043  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28393044 atggcggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtc 28393143  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  28393144 tacccacataatagtctctatgcttt 28393169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8845600 - 8845375
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845600 tagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 8845501  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8845500 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcc 8845401  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  8845400 tacccacataatagtctctatgcttt 8845375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 4426426 - 4426639
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4426426 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctc 4426513  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426514 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 4426613  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  4426614 tacccacataatagtctctatgcttt 4426639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35223954 - 35223732
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223954 ggtacatcgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatg 35223855  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35223854 gtggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctac 35223755  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  35223754 ccacataatagtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 5667937 - 5668156
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667937 tagggtacatagtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 5668036  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||    
T  5668037 atggtgagtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtc 5668134  T
Q  219 tacctacataatagtctctatg 240  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  5668135 tatccacataatagtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20311687 - 20311464
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||  ||||||| |  ||||||||||||||    
T  20311687 tagggtaaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagtta-cataactgt--ctatgtagtattct 20311591  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |    
T  20311590 catgacaggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaat 20311491  T
Q  218 ctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20311490 ctacccacaaaatagtctctatgcttt 20311464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 10677392 - 10677534
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10677392 taggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctc 10677491  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677492 atagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 10891032 - 10891174
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10891032 taggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctc 10891131  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891132 atagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516232
Alignment:
Q  104 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  204 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 240  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 180
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  30 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  130 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 180  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15461703 - 15461497
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  15461703 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 15461607  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15461606 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 15461508  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  15461507 ataatagtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2677219 - 2677013
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  2677219 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 2677123  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  2677122 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 2677024  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  2677023 ataatagtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15815227 - 15815021
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  15815227 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 15815131  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15815130 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 15815032  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  15815031 ataatagtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 17300055 - 17300261
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  17300055 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 17300151  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  17300152 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 17300250  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  17300251 ataatagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 18111139 - 18111345
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  18111139 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18111235  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18111236 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18111334  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  18111335 ataatagtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34975757 - 34975551
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  34975757 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 34975661  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  34975660 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 34975562  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  34975561 ataatagtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 3369119 - 3369325
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  3369119 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 3369215  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  3369216 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 3369314  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  3369315 ataatagtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5870624 - 5870419
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  5870624 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 5870528  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  5870527 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 5870429  T
Q  226 ataatagtct 235  Q
    ||||||||||    
T  5870428 ataatagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26531819 - 26531613
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  26531819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 26531723  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  26531722 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 26531624  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  26531623 ataatagtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 4676123 - 4676285
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4676123 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 4676219  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4676220 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18163324 - 18163162
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18163324 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 18163228  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18163227 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20244099 - 20243937
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20244099 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 20244003  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20244002 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19365726 - 19365519
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 124  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| || |    
T  19365726 cataatggtttcaggtctaagagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacacttt-cataacat--actatgtagtactctcacggtg 19365630  T
Q  125 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 224  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  19365629 ggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgta 19365531  T
Q  225 cataatagtctc 236  Q
     |||||||||||    
T  19365530 tataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636484
Alignment:
Q  31 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 130  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  131 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  231 agtctc 236  Q
    ||||||    
T  32636489 agtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Original strand, 32646618 - 32646807
Alignment:
Q  24 tacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 122  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||    
T  32646618 tacagagttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatgg 32646714  T
Q  123 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 215  Q
      | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646715 taggtcaatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1941930 - 1941724
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  1941930 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 1941834  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||    
T  1941833 gttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatac 1941735  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  1941734 ataatagtctc 1941724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19362616 - 19362477
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  ||    
T  19362616 catagtggtttcaggtttaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgg 19362520  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362519 gtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  154 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4546286 - 4546080
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  4546286 catagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 4546190  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| ||||||| || |||    
T  4546189 gtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgattatcagtcaacatac 4546091  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  4546090 ataatagtctc 4546080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9487757 - 9487625
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  9487757 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacgatgg 9487661  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487660 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 30040585 - 30040705
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||    
T  30040585 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgg 30040681  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactc 149  Q
     |||||| | ||||||||||||||    
T  30040682 gtcaatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5616601 - 5616387
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||  |    
T  5616601 catagtggtttcagatctaagattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacacttt-cataa--taaactctgtagtattctcacggttg 5616505  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  5616504 gtcaatccagtataaatattacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatac 5616406  T
Q  226 ataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  5616405 ataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 180  Q
     ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 189
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  62 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |   | | |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  162 tctatgtgaagacttgataactctttat 189  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 5528602 - 5528714
Alignment:
Q  53 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 152  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| |||||||||||| |||||||    
T  5528602 atacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatatcactccta 5528698  T
Q  153 atatttatatctatgt 168  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5528699 atatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9538121 - 9538033
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9538121 tgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11421213 - 11421096
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||    
T  11421213 catagtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgg 11421117  T
Q  126 atcaatccaatataaatatta 146  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11421116 gtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  192 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  192 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 243
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9937998
Alignment:
Q  178 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 243  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgctt 9937998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24701399 - 24701361
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 57  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701399 tagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 159
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  68 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttacta---tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 159  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  200 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 244
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  200 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6110461 - 6110236
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110461 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 6110362  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110361 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 6110262  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6110261 tacctacataatagtctctatgcttt 6110236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 15600694 - 15600919
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600694 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15600793  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600794 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 15600893  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15600894 tacctacataatagtctctatgcttt 15600919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 15607239 - 15607464
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607239 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15607338  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607339 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 15607438  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15607439 tacctacataatagtctctatgcttt 15607464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 16482293 - 16482518
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482293 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 16482392  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482393 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 16482492  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16482493 tacctacataatagtctctatgcttt 16482518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 10579165 - 10579390
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10579165 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctc 10579264  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579265 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 10579364  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10579365 tacctacataatagtctctatgcttt 10579390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 10572405 - 10572627
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572405 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatg 10572504  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572505 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 10572604  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10572605 ctacataatagtctctatgcttt 10572627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18520372 - 18520147
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520372 tagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18520273  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520272 atggcggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18520173  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18520172 tacctacataatagtctctatgcttt 18520147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18523060 - 18522836
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18523060 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttc 18522961  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522960 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18522861  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgctt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18522860 tacctacataatagtctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 17780928 - 17781153
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17780928 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctc 17781027  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17781028 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtc 17781127  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17781128 tacctacataatagtctctatgcttt 17781153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8490892 - 8490676
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490892 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 8490793  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490792 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 8490693  T
Q  219 tacctacataatagtct 235  Q
    |||||||||||| ||||    
T  8490692 tacctacataatcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 15357396 - 15357617
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357396 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 15357495  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357496 atggcggatcaacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 15357595  T
Q  219 tacctacataatagtctctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15357596 tacctacataatagtctctatg 15357617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13211699 - 13211474
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13211699 taggttacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctc 13211600  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13211599 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtc 13211500  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13211499 tacctacataatagtctctatgcttt 13211474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13249004 - 13248779
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13249004 taggttacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctc 13248905  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13248904 atggcgaatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtc 13248805  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13248804 tacctacataatagtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 15342029 - 15342250
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15342029 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctc 15342128  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342129 atgacggatcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 15342228  T
Q  219 tacctacataatagtctctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15342229 tacctacataatagtctctatg 15342250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 32056709 - 32056935
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056709 tagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 32056808  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32056809 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagt 32056908  T
Q  218 ctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32056909 ctacccacataatagtctctatgcttt 32056935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 17199997 - 17200219
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17199997 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcata 17200096  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200097 gcgggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 17200196  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  17200197 ccacataatagtctctatgcttt 17200219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13517204 - 13516983
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13517204 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctc 13517109  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517108 atggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 13517009  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13517008 tacccacataatagtctctgtgcttt 13516983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 1647331 - 1647556
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1647331 tagggtatatagtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctc 1647430  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647431 atggcgagtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 1647530  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  1647531 tatccacataatagtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17136750 - 17136535
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17136750 tagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctc 17136651  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17136650 atggtgggtcaatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtc 17136557  T
Q  219 tacctacataatagtctctatg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  17136556 tacccacataatagtctctatg 17136535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29925368 - 29925143
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29925368 tagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctc 29925269  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
      || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  29925268 taggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatc 29925169  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||    
T  29925168 tatccacataatagcctccatgcttt 29925143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29974521 - 29974296
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29974521 tagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctc 29974422  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
      || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  29974421 taggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatc 29974322  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || | ||||||||| ||| |||||||    
T  29974321 tatccacataatagcctccatgcttt 29974296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16200827 - 16200627
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16200827 tagggtacatagtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctc 16200728  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16200727 atggtgggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtc 16200628  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  16200627 t 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 24253205 - 24253423
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||    
T  24253205 ggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatg 24253300  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    | || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  24253301 gagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctac 24253400  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  24253401 cgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 15846632 - 15846838
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  15846632 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 15846728  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15846729 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 15846827  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  15846828 ataatagtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21034444 - 21034238
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  21034444 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 21034348  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21034347 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21034249  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  21034248 ataatagtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14890553 - 14890391
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14890553 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 14890457  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14890456 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 20147650 - 20147856
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  20147650 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 20147746  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20147747 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20147845  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  20147846 ataatagtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21398998 - 21398792
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  21398998 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 21398902  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| |||    
T  21398901 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatac 21398803  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  21398802 ataatagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  27 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 126  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  227 taatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12300116 - 12299911
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  12300116 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 12300020  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12300019 gtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12299922  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  12299921 ataatagtctc 12299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55427183 - 55427021
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  55427183 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 55427087  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
     |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55427086 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 25978824 - 25978963
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  25978824 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 25978920  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978921 gtctatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32280444 - 32280313
Alignment:
Q  62 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  |||||    
T  32280444 tatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac--tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattata 32280347  T
Q  162 tctatgtgaagacttgataactctttatccatga 195  Q
     ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280346 cctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 15317269 - 15317472
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  15317269 catagtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 15317365  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| |||    
T  15317366 gtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatac 15317464  T
Q  226 ataatagt 233  Q
    ||||||||    
T  15317465 ataatagt 15317472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15526959 - 15526827
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||| |   |||||| ||||| ||||| |  ||    
T  15526959 catagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccattaacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgg 15526863  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526862 gtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11787749 - 11787654
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787749 tgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  68 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  167 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 197  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089776
Alignment:
Q  198 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 19089776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  151 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 240
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  125 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  225 cataatagtctctatg 240  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200297
Alignment:
Q  177 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgcttt 16200297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30464203 - 30464147
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatctta 82  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30464203 catagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 90  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28088312 - 28088227
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088312 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18252427 - 18252202
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252427 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18252328  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252327 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18252228  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18252227 tacctacataatagtctctatgcttt 18252202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 18532324 - 18532549
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532324 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18532423  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532424 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18532523  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  18532524 tatctacataatagtctctatgcttt 18532549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 244
Target Start/End: Original strand, 27131222 - 27131444
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131222 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 27131321  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131322 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 27131421  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  27131422 ctacataatagtctttatgcttt 27131444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 27310387 - 27310612
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310387 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 27310486  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27310487 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtc 27310586  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27310587 tacccacataatagtctctatgcttt 27310612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 16358845 - 16359070
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16358845 tagggtacatggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctc 16358944  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16358945 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtc 16359044  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  16359045 tacccacataatagtctctatgcttt 16359070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 3855729 - 3855954
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3855729 tagggtacatagtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctc 3855828  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3855829 attgcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtc 3855928  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| || |||||||||| |||||||    
T  3855929 tacccacgtaatagtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 36816444 - 36816668
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816444 tagggtacatagtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 36816542  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816543 atggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 36816642  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  36816643 tatccacataatagtctctatgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 57 - 244
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171268
Alignment:
Q  57 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  157 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgcttt 21171268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 27277369 - 27277592
Alignment:
Q  20 agggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |    
T  27277369 agggtacatagtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcacttt-catgacttttactatgcaatattctta 27277467  T
Q  120 tggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 219  Q
    ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27277468 tggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtct 27277567  T
Q  220 acctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  27277568 acccacataatagtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Original strand, 22641687 - 22641871
Alignment:
Q  22 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22641687 ggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatg 22641785  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 210  Q
    | || |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641786 gtgggtcaatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657256
Alignment:
Q  96 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  196 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgcttt 22657256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23507295 - 23507096
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| || ||| ||  || ||||| |||||    
T  23507295 tagggtacacagtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattct 23507199  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
     |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507198 aatggtgggttaatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagt 23507099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 12014100 - 12014319
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatg 121  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||| | |  || | |||||||  |||||||||    
T  12014100 gtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttctatgtaacattctcatg 12014196  T
Q  122 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctac 221  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12014197 ccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagatgtgatcatcattctac 12014296  T
Q  222 ctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    | ||||||| |||| || |||||    
T  12014297 ccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 19706535 - 19706741
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  19706535 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 19706631  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  19706632 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 19706730  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  19706731 ataatagtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 28134819 - 28135025
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  28134819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 28134915  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  28134916 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 28135014  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    ||||| |||||    
T  28135015 ataattgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 43802461 - 43802667
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  43802461 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 43802557  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  43802558 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 43802656  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  43802657 ataatagtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9456322 - 9456116
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  9456322 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 9456226  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  9456225 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 9456127  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  9456126 ataatagtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 20779741 - 20779947
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  20779741 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 20779837  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20779838 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20779936  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  20779937 ataatagtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 22670353 - 22670559
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  22670353 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22670449  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22670450 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22670548  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  22670549 ataatagtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 42817085 - 42817291
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  42817085 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 42817181  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  42817182 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 42817280  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  42817281 ataatagtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 20391335 - 20391541
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  20391335 catagtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaaaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 20391431  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20391432 gtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20391530  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  20391531 ataatagtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 243
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  227 taatagtctctatgctt 243  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22612698 - 22612492
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  22612698 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 22612602  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22612601 gtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22612503  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  22612502 ataatagtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 634140 - 633934
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  634140 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 634044  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  634043 gttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 633945  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  633944 ataatagtctc 633934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 9916587 - 9916688
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggttt-caggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattc 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  9916587 tagggtacatagtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattc 9916683  T
Q  117 tcatg 121  Q
    |||||    
T  9916684 tcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8727873 - 8727667
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  8727873 catagtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgg 8727777  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||     
T  8727776 atcaatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatag 8727678  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  8727677 ataatagtctc 8727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 236
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667776
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacataca 47667766  T
Q  227 taatagtctc 236  Q
    ||||||||||    
T  47667767 taatagtctc 47667776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930582
Alignment:
Q  104 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 203  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  204 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29096928 - 29096789
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || || ||    
T  29096928 catagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtattcacacggtgg 29096832  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096831 atcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  29 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 128  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  129 aatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  131 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 220  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51997485 - 51997353
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | || ||||| |||||||||| ||||||| || || |||||  |||  || ||||||||||||||| ||    
T  51997485 catagtagtttctggtctaagcgtggtatatatcattatcaatatgagaataacttatgatacatt-cataatattt--tacgtagtattctcatggtgg 51997389  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997388 gtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  102 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 201  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  202 agatgtgatcatcagtctacctacata 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Original strand, 24301713 - 24301855
Alignment:
Q  38 aggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 137  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  | ||||||| |||||||| ||  || |   || ||||    
T  24301713 aggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtattctcgtgatgggtatttctaata 24301810  T
Q  138 -taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 181  Q
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301811 gcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  31 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 90  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  68 tatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacacttt-cataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7504 - 7279
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7504 tagggtacatagttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 7405  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7404 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 7305  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7304 tacctacataatagtctctatgcttt 7279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 25800 - 26025
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25800 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 25899  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 25999  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  26000 tacctacataatagtcgctatgcttt 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 21330058 - 21330283
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330058 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 21330157  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330158 atggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 21330257  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  21330258 cacctacataatagtctctatgcttt 21330283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18796903 - 18796678
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796903 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 18796804  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796803 atagaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 18796704  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  18796703 tacccacataatagtctcaatgcttt 18796678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18620200 - 18619976
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18620200 tagggtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacacttt-cataacttttactatgtagtattctc 18620102  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |    
T  18620101 atggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcc 18620002  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18620001 tacccacataatagtctatatgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Original strand, 22183308 - 22183518
Alignment:
Q  31 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  ||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |||    
T  22183308 tggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggtca 22183404  T
Q  130 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 229  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||    
T  22183405 atccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgtaa 22183503  T
Q  230 tagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||| ||||    
T  22183504 tagtctctatacttt 22183518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36270560 - 36270338
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||  |||||||  |||||    
T  36270560 tagggtgcatggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattct 36270465  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||    
T  36270464 catggcgagtcaatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagt 36270365  T
Q  218 ctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  36270364 ctacccacacaatagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Original strand, 6991924 - 6992146
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||  ||||||||  ||||    
T  6991924 tagggaacatagtgatttcaggccgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcactta-cataatttt--ctatgtagcgttct 6992020  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 215  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |    
T  6992021 tatggaggatcaatccaatataaatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcatta 6992120  T
Q  216 gtctacctacataatagtctctatgc 241  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||    
T  6992121 gtctacccatataataatctttatgc 6992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20978270 - 20978091
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | || ||  |||||    
T  20978270 tagggtacatagtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattct 20978174  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978173 catggcgggtcaatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18822478 - 18822279
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattct 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  |||| |||||| |||  ||||||  | |||    
T  18822478 tagggtacacagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatct 18822382  T
Q  118 catggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  18822381 catggcagatcaatccaatataaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagt 18822282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 24250128 - 24250334
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  24250128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 24250224  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  24250225 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 24250323  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  24250324 ataatagtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30174583 - 30174377
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  30174583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 30174487  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  30174486 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 30174388  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  30174387 ataatagtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 235
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852085
Alignment:
Q  106 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 205  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagat 18852055  T
Q  206 gtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18852056 gggatcattagtctaccgacataatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279460
Alignment:
Q  104 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  204 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 236
Target Start/End: Original strand, 24229338 - 24229517
Alignment:
Q  53 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta 152  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  24229338 atacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactccta 24229434  T
Q  153 atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 236  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24229435 atatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 15342098 - 15342237
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||| || ||    
T  15342098 catagtggtttcaggtctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacac-tttcataac--atactatgtagtattttcacggtgg 15342194  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342195 gttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29800677 - 29800468
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  29800677 catagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtgg 29800581  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 222  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || |||||||||||||||||||     
T  29800580 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctaca 29800481  T
Q  223 tacataatagtct 235  Q
    |||||||||||||    
T  29800480 tacataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  226 ataat 230  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19616641 - 19616435
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||| || ||    
T  19616641 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataaaat--actatgtagtattctcacggtgg 19616545  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19616544 gtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcatcagtctacatac 19616446  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  19616445 ataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  27 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 126  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacactt--cataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17241102 - 17241034
Alignment:
Q  23 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241102 gtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||   |||||||||||||||| ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  227 taatagtc 234  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 41316412 - 41316506
Alignment:
Q  62 tatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  41316412 tatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataatattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 244
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763867
Alignment:
Q  127 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 226  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  227 taatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttt 24763867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 240
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  200 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 240  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 28740922 - 28740986
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 90  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740922 catagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 165
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  102 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 165  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 36799775 - 36799826
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 76  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799775 catagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1390 - 1165
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1390 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctc 1291  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1290 atggcagatcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtc 1191  T
Q  219 tacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1190 tacctacataatagtctctatgcttt 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5881 - 5701
Alignment:
Q  65 cactatgagaatatcttatgacactttt-cataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881 cactatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatc 5782  T
Q  164 tatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5781 tatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctttatgcttt 5701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 230201 - 230367
Alignment:
Q  19 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230201 tagggtacataatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctc 230300  T
Q  119 atggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230301 atggcagatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 389 - 183
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  389 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 293  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || |||    
T  292 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatac 194  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  193 ataatagtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 3771 - 3977
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  3771 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 3867  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  3868 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 3966  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  3967 ataatagtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 119936 - 119730
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  119936 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 119840  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  119839 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtac 119741  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  119740 ataatagtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 130320 - 130526
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  130320 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgg 130416  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  130417 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 130515  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  130516 ataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 40084 - 40290
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||    
T  40084 catagtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgg 40180  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||    
T  40181 gtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatac 40279  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  40280 ataatagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 13045 - 13251
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  13045 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgg 13141  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||    
T  13142 gtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatac 13240  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  13241 ataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26748 - 26609
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||    
T  26748 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgg 26652  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 168  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26651 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90151
Alignment:
Q  113 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatc 211  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||     
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgatt 90118  T
Q  212 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  90119 atcagtctatctacatagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 67470 - 67676
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  67470 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatct-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 67566  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  |||    
T  67567 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatac 67665  T
Q  226 ataatagtctc 236  Q
    |||||||||||    
T  67666 ataatagtctc 67676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8723
Alignment:
Q  30 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 129  Q
    ||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || |||    
T  8933 gtggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtca 8837  T
Q  130 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 229  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  8836 atctagtataaatattactcctaatatttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatat 8738  T
Q  230 tagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||||| |||||    
T  8737 tagtctctacgcttt 8723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  26 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 125  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacacctt-cgtaacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  126 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53927 - 53766
Alignment:
Q  70 tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 169  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| || || |||| ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  53927 tgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgta 53831  T
Q  170 aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 235  Q
     ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  53830 tagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataatagtct 53766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Original strand, 11699 - 11758
Alignment:
Q  102 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 161  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 tactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 102
Alignment:
Q  29 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctca 119  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  106 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 197  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11328
Alignment:
Q  53 atacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactc 149  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||    
T  11421 atacaccattatcactattagaataacttataaca-tcttcataacat--actatgtagtattctcatggtgggtaaatccatcataaatattactc 11328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 244
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  200 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 244  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University