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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19598_low_17 (Length: 409)
Name: NF19598_low_17
Description: NF19598
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19598_low_17 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27577658 - 27577278
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27577658 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccaacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
27577559 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27577558 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
27577459 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27577458 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
27577359 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27577358 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
27577278 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 22431484 - 22431864
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22431484 |
ataccaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
22431583 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22431584 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
22431683 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22431684 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
22431783 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22431784 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
22431864 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 392
Target Start/End: Original strand, 29181789 - 29182125
Alignment:
| Q |
56 |
cccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttc |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29181789 |
cccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttc |
29181888 |
T |
|
| Q |
156 |
ataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29181889 |
ataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaa |
29181988 |
T |
|
| Q |
256 |
tacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatataca |
355 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29181989 |
ttcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatataca |
29182088 |
T |
|
| Q |
356 |
gaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29182089 |
gaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
29182125 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18068827 - 18068604
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaac------- |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18068827 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgcttaacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaacataattt |
18068728 |
T |
|
| Q |
105 |
----------taacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataa |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18068727 |
caaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataaaataa |
18068628 |
T |
|
| Q |
195 |
atgatttcaaaatgaaccaatttc |
218 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18068627 |
atgatttcaaaacgaaccaatttc |
18068604 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Original strand, 29181158 - 29181269
Alignment:
| Q |
105 |
taacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaa |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29181158 |
taacaatacattgtttcaatgttaaatcaattctaataacatttaaatttcataacaa-aaccagtttcgatttcatggatataacatacatgatttcaa |
29181256 |
T |
|
| Q |
205 |
aatgaaccaattt |
217 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
29181257 |
aatagaccaattt |
29181269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 21357215 - 21357595
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21357215 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
21357314 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21357315 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
21357414 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21357415 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
21357514 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21357515 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
21357595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 6471407 - 6471787
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6471407 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
6471506 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6471507 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacgttcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
6471606 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6471607 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccataaatgtt |
6471706 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6471707 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
6471787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 35012090 - 35012470
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35012090 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
35012189 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35012190 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
35012289 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35012290 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccataaatgtt |
35012389 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35012390 |
gctacttttcatgacaagttgctaggacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
35012470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10573660 - 10573280
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10573660 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
10573561 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10573560 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatggccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
10573461 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10573460 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
10573361 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10573360 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
10573280 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32864542 - 32864162
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32864542 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
32864443 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32864442 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
32864343 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32864342 |
caatttcacttgattttcaaaaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
32864243 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32864242 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
32864162 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21605352 - 21604972
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605352 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagttccaaaatcaactaacaat |
21605253 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605252 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
21605153 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605152 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
21605053 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21605052 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
21604972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 8432153 - 8432533
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8432153 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagttccaaaatcaactaacaat |
8432252 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8432253 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattaaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
8432352 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8432353 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
8432452 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8432453 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
8432533 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 46163541 - 46163921
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46163541 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
46163640 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46163641 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
46163740 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46163741 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctaaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
46163840 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46163841 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatatagaaaaaccgaacactatcaaaaatagaggaagattag |
46163921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47826915 - 47826561
Alignment:
| Q |
37 |
aaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacat--caa |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
47826915 |
aaagtgatgctttacacatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaatacatggtttcgatgttacatatcaa |
47826816 |
T |
|
| Q |
135 |
ttctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaa |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47826815 |
ttctaataacattcaaatttcataaca---gccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaa |
47826719 |
T |
|
| Q |
235 |
cagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgct |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47826718 |
cagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatggatctttctgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcacgacaagttgct |
47826619 |
T |
|
| Q |
335 |
agaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47826618 |
agaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
47826561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 5743767 - 5744083
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttc---------------- |
95 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
5743767 |
atactaaaaaccgatcattatattcaaagtgatgttttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctattataacagtttcaaaatcaacataattt |
5743866 |
T |
|
| Q |
96 |
-aaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataa |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5743867 |
caaaatcaactaataatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagctggtttcaatttcattgaaataacataa |
5743966 |
T |
|
| Q |
195 |
atgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatgg |
294 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5743967 |
atgatttcaaaatgaaccaattttacttgattttcataaacacaagatgatgatagctgaattcaaaagttgagttaggtttgatagatctttctgatgg |
5744066 |
T |
|
| Q |
295 |
aaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5744067 |
aaaatgccatgaatgtt |
5744083 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 5744345 - 5744424
Alignment:
| Q |
313 |
ctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5744345 |
ctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatgtacagaaaaaccagacactatcaaaaatagaggaagattag |
5744424 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9457342 - 9456962
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9457342 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
9457243 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9457242 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataccataaatgatttcaaaatgaac |
9457143 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9457142 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
9457043 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9457042 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
9456962 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 23208898 - 23208961
Alignment:
| Q |
136 |
tctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgat |
199 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23208898 |
tctaattacattcaaatttcataacaaaaggcagtttcaatttcattgaaataacatacatgat |
23208961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 147
Target Start/End: Original strand, 23208828 - 23208879
Alignment:
| Q |
96 |
aaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacatt |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23208828 |
aaaatcaaataacaatacatagtttcaatgttacatcaactctaataacatt |
23208879 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Original strand, 23208759 - 23208803
Alignment:
| Q |
60 |
acttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaac |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23208759 |
acttttcatcgtaactttttctgttgaaacagtttcaaaatcaac |
23208803 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 325546 - 325166
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325546 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcttgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
325447 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325446 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
325347 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325346 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttatgatggaaaatgccatgaatgtt |
325247 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
325246 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatgaaaaatagaggaagattag |
325166 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48185159 - 48184779
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48185159 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgttttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
48185060 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48185059 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataactttcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
48184960 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48184959 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatggctgaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
48184860 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48184859 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
48184779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26015431 - 26015057
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26015431 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
26015332 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26015331 |
acatggtttcaatgttacattaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcacaatgaac |
26015232 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26015231 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagctgagccaggttcgatagatctttccgatggaaaatgccatgaatgtt |
26015132 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaag |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26015131 |
gctacttttcatgacaggttgctggaacatgcttat-agttatagaaaaaccagacactataaaaaatagaggaag |
26015057 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26355956 - 26355658
Alignment:
| Q |
92 |
tttcaaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26355956 |
tttcaaaatcaaataacaatacatggtttcaatgttacaccaattctaataacattcaaatttcataacaaaagccagtttcaatttcattgaaataac- |
26355858 |
T |
|
| Q |
192 |
taaatgatttcaaaatgaacca------atttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatct |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26355857 |
-aaatgatttcaaaatggaccaatttatattttacttgataaacataaacagaagacgatgatagctgaattcaaaagctgagccaggttcgatagatct |
26355759 |
T |
|
| Q |
286 |
ttctgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagagga |
385 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | | || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26355758 |
ttccgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaggttgctggaacatgcttat-agttatagaaaaaccagacactataaaaaatagagga |
26355660 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 387
Target Start/End: Original strand, 19658698 - 19658995
Alignment:
| Q |
96 |
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195 |
Q |
| |
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| T |
19658698 |
aaaatcaaattacaatacatggtttcaatgttacattaattctaataacattcaaatttcataacagaagccagtttcaatttcattgaaataacgtaca |
19658797 |
T |
|
| Q |
196 |
tgatttcaaaatgaacca------atttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatc-tttc |
288 |
Q |
| |
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| T |
19658798 |
tgatttcaaaatgaaccaatttatatttcacttgattttcataaacataagaccatgttagctgaattcaaaagctgagccaggttcgatagaacttttc |
19658897 |
T |
|
| Q |
289 |
tgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaag |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19658898 |
tgatggaaaatgccatgaatgttgctacttttcatgagaggttgctagaacatgattat-agttatagaaaaaccatacataatcaaaaatagaggaag |
19658995 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 29592931 - 29593082
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29592931 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
29593030 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaat |
163 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29593031 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaat |
29593082 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5733683 - 5733409
Alignment:
| Q |
119 |
ttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaaccaattt- |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5733683 |
ttcaatgtcacattaattctaataacattcaaatttcataacaaaagccagtttcaatttcattgaaatagcatacatgatttcaaaatggaccaattta |
5733584 |
T |
|
| Q |
218 |
-----cacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatc-tttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
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| T |
5733583 |
tatttcacttgattttcaataacagaagacgatgatagctgaattcaaaagataagccaggttcgatagatcttttctaatgaaaaatgccatgaatgtt |
5733484 |
T |
|
| Q |
312 |
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387 |
Q |
| |
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|
| T |
5733483 |
gctacttttcatgacaggttgctagagcatgcttat-agttatagaaaaaccagacacaatcaaaaatagaggaag |
5733409 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26355993 - 26355961
Alignment:
| Q |
72 |
aacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaac |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26355993 |
aacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaac |
26355961 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Original strand, 32493850 - 32493903
Alignment:
| Q |
232 |
aaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatct |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32493850 |
aaacagaagacgaggaaagctgaatacaaaagtagaaccaggttcgatagatct |
32493903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 104
Target Start/End: Original strand, 19658632 - 19658664
Alignment:
| Q |
72 |
aacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaac |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19658632 |
aacttttcctgttgaaacactttcaaaatcaac |
19658664 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 284
Target Start/End: Original strand, 21900430 - 21900482
Alignment:
| Q |
232 |
aaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatc |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
21900430 |
aaacagaagacgacgatagctgaattcaaaagctgagcgaggttcgatagatc |
21900482 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 25696730 - 25697110
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25696730 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatactttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttaaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
25696829 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25696830 |
acatggtttcaatgttgcatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
25696929 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25696930 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacgatgatagctaaattcaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
25697029 |
T |
|
| Q |
312 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25697030 |
gctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
25697110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37456913 - 37456516
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacag-----------------ttt |
94 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37456913 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgttttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctattataacagcttcaaaatcaacataattt |
37456814 |
T |
|
| Q |
95 |
caaaatcaactaacaatacatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataa |
194 |
Q |
| |
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|
| T |
37456813 |
caaaatcaactaataatacatggtttgaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataataatagccggtttcaatttcattgaaataacataa |
37456714 |
T |
|
| Q |
195 |
atgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatgg |
294 |
Q |
| |
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|
| T |
37456713 |
atgatttcaaaatgaaccaatttcacttgattttcataaacacaagatgatgatagctgaattcaaaagttgagtcaggtttgatagatctttctgatgg |
37456614 |
T |
|
| Q |
295 |
aaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaaccaaacactatcaaaaatagaggaagattag |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37456613 |
aaaatgccatgaatgttgctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacaaaaaaaccagacactatcaaaaatagaggaaaattag |
37456516 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27560135 - 27559836
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27560135 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgttttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctattataacagtttcaaaatcaactaataat |
27560036 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
27560035 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaataggtggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
27559936 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaagacaatgatagctgaatacaaaagttgagccaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27559935 |
caattttacttgattttcataaacacaagatgatgatagctgaattcaaaagttgagttaggtttgatagatctttctgatggaaaatgccatgaatgtt |
27559836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39016835 - 39016606
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacagtttcaaaatcaactaacaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39016835 |
atactaaaaactgatcctcatattcaaagtgatgttttaagcatctcgacttttcatcttaacttttcctgttgaaacaatttcaaaatcaactaacaat |
39016736 |
T |
|
| Q |
112 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagccggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39016735 |
acatggtttcaatgttacatcaattctaataacattcaaatttcataacaatagtcggtttcaatttcattgaaataacataaatgatttcaaaatgaac |
39016636 |
T |
|
| Q |
212 |
caatttcacttgattttcataaacagaaga |
241 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
39016635 |
caatttcacttgatttccataaacagaaga |
39016606 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27559574 - 27559523
Alignment:
| Q |
313 |
ctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatatacagaaaaacca |
364 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
27559574 |
ctacttttcatgacaagttgctagaacatgctagtcatgtacagaaaaacca |
27559523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 16503917 - 16503984
Alignment:
| Q |
12 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttc |
79 |
Q |
| |
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|
| T |
16503917 |
atactaaaaaccgatcatcatattcaaagtgatgctttacgcatcccgacttttcatcttaacttttc |
16503984 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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