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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19602_high_10 (Length: 437)

Name: NF19602_high_10
Description: NF19602
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19602_high_10
NF19602_high_10
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (15-428)||(2187685-2188098)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (15-428)||(36615541-36615954)
chr2 (15-428)||(36649296-36649708)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2188098 - 2187685
Alignment:
Q  15 aaatagaatatagaatccttaaaaaatttgaacaactctcataacataaatttctttgtttcaacctattaggtgtttggtttattaacgtcatggccaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2188098 aaatagaatatagaatccttaaaaaatttgaacaactctcataacataaatttctttgtttcaacctattaggtgtttggtttattaacgtcatggccaa 2187999  T
Q  115 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2187998 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 2187899  T
Q  215 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2187898 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 2187799  T
Q  315 atcgcaaacccactttcctctacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaatgctttcgctatttcgtgaaatgaggttgtc 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2187798 atcgcaaacccactttcctcaacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaacgctttcgctatttcgtgaaatgaggttgtc 2187699  T
Q  415 ttataaaccctttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  2187698 ttataaaccctttg 2187685  T

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Target: chr2 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Original strand, 36615541 - 36615954
Alignment:
Q  15 aaatagaatatagaatccttaaaaaatttgaacaactctcataacataaatttctttgtttcaacctattaggtgtttggtttattaacgtcatggccaa 114  Q
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T  36615541 aaatagaatatagaatccttaaaaaatttgaacaactctcataacataaattcctttgtttcaacctattaggggtttggtttattaacgtcatggccaa 36615640  T
Q  115 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36615641 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 36615740  T
Q  215 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36615741 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 36615840  T
Q  315 atcgcaaacccactttcctctacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaatgctttcgctatttcgtgaaatgaggttgtc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36615841 atcgcaaacccactttcctctacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaacgctttcgatatttcgtgaaatgaggttgtc 36615940  T
Q  415 ttataaaccctttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  36615941 ttataaaccctttg 36615954  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 428
Target Start/End: Original strand, 36649296 - 36649708
Alignment:
Q  15 aaatagaatatagaatccttaaaaaatttgaacaactctcataacataaatttctttgtttcaacctattaggtgtttggtttattaacgtcatggccaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36649296 aaatagaatatagaatccttaaaa-atttgaacaactctcataacataaattcctttgtttcaacctattaggggtttggtttattaacgtcatggccaa 36649394  T
Q  115 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36649395 acctcatgaactcaaaccattatacgcaacacttctcaacaaatgtttttcctcgaaaaacataaacagcctcaaaataatccatgcacgcacaattcgt 36649494  T
Q  215 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36649495 ttaggtatttcacacgatgatttcattcgaaccaaacttgtttcttgctatgcttcatgttccaaattgcaccaagcaaatattcttttttcattcacaa 36649594  T
Q  315 atcgcaaacccactttcctctacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaatgctttcgctatttcgtgaaatgaggttgtc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36649595 atcgcaaacccactttcctctacaactctctcattagagcctatttatctctcaacctatttaaagaaacgctttcgctatttcgcgaaatgaggttgtc 36649694  T
Q  415 ttataaaccctttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  36649695 ttataaaccctttg 36649708  T

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