View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19602_high_16 (Length: 390)

Name: NF19602_high_16
Description: NF19602
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19602_high_16
NF19602_high_16
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (18-372)||(27718451-27718805)
chr6 (18-369)||(27724917-27725267)
chr6 (18-372)||(27698566-27698918)
chr6 (18-350)||(27611074-27611406)
chr6 (48-372)||(28786039-28786363)
chr6 (48-348)||(28792184-28792484)
chr6 (18-372)||(28780900-28781254)
chr6 (18-372)||(27604777-27605137)
chr6 (18-372)||(26802199-26802557)
chr6 (18-372)||(27228995-27229347)
chr6 (18-372)||(26655750-26656104)
chr6 (18-372)||(26761721-26762075)
chr6 (18-335)||(27678744-27679061)
chr6 (18-301)||(27593092-27593375)
chr6 (18-343)||(31284078-31284403)
chr6 (18-251)||(27531269-27531502)
chr6 (18-372)||(27338137-27338484)
chr6 (18-372)||(27398877-27399224)
chr6 (18-335)||(27706474-27706791)
chr6 (18-301)||(27677686-27677969)
chr6 (18-278)||(26646334-26646594)
chr6 (18-278)||(26752302-26752562)
chr6 (18-267)||(26884029-26884278)
chr6 (18-353)||(26823626-26823955)
chr6 (18-239)||(25579613-25579834)
chr6 (18-304)||(26622805-26623091)
chr6 (18-304)||(26728783-26729069)
chr6 (18-239)||(25481636-25481857)
chr6 (18-239)||(26142759-26142980)
chr6 (18-303)||(26861446-26861731)
chr6 (18-239)||(26055820-26056041)
chr6 (18-239)||(26075790-26076011)
chr6 (18-239)||(25538434-25538655)
chr6 (18-239)||(26048739-26048960)
chr6 (18-239)||(26069908-26070129)
chr6 (18-259)||(28234438-28234679)
chr6 (135-351)||(27427792-27428006)
chr6 (18-295)||(28139379-28139656)
chr6 (18-267)||(28325347-28325596)
chr6 (18-277)||(28185222-28185481)
chr6 (18-277)||(28180970-28181229)
chr6 (18-256)||(28226827-28227065)
chr6 (18-235)||(28242702-28242919)
chr6 (18-190)||(26848603-26848775)
chr6 (18-129)||(25506981-25507092)
chr6 (18-159)||(28149912-28150052)
chr6 (18-154)||(26937073-26937209)
chr6 (30-202)||(29825958-29826130)
chr6 (18-267)||(26342006-26342255)
chr6 (274-354)||(26055738-26055818)
chr6 (18-286)||(28098441-28098709)
chr6 (275-354)||(25481554-25481633)
chr6 (275-350)||(25538356-25538431)
chr6 (275-354)||(26048657-26048736)
chr6 (275-354)||(26069826-26069905)
chr6 (275-354)||(26075708-26075787)
chr6 (275-354)||(26142677-26142756)
chr6 (18-259)||(28297785-28298026)
chr6 (18-259)||(28514047-28514288)
chr6 (74-238)||(26635585-26635749)
chr6 (74-238)||(26741551-26741715)
chr6 (110-238)||(27214312-27214440)
chr6 (110-238)||(27234788-27234916)
chr6 (74-187)||(27665245-27665358)
chr6 (95-203)||(26949591-26949699)
chr6 (95-238)||(25071554-25071697)
chr6 (74-189)||(26811453-26811568)
chr6 (275-354)||(25579529-25579610)
chr6 (108-229)||(26959069-26959190)
chr6 (18-187)||(26974998-26975167)
chr6 (108-190)||(26617269-26617351)
chr6 (108-190)||(26723197-26723279)
chr6 (18-256)||(26893543-26893781)
chr6 (229-296)||(26018770-26018837)
chr6 (229-296)||(26139474-26139541)
chr6 (18-151)||(2184880-2185013)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (18-372)||(14428-14779)
scaffold0349 (18-369)||(3493-3844)
scaffold0349 (207-372)||(8062-8227)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (18-348)||(4743-5073)
scaffold0277 (18-372)||(13704-14058)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (18-372)||(7293-7640)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (39-372)||(10-336)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (18-346)||(18699459-18699787)
chr4 (18-346)||(18655536-18655864)
chr4 (18-346)||(18679626-18679954)
chr4 (18-346)||(18731563-18731891)
chr4 (18-306)||(18724144-18724432)
chr4 (135-351)||(17989226-17989440)
chr4 (135-351)||(18073549-18073763)
chr4 (18-229)||(5091026-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (18-330)||(28164421-28164733)
chr1 (18-306)||(268416-268704)
chr1 (18-327)||(28127738-28128042)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (18-295)||(29273842-29274119)
chr8 (102-256)||(31903728-31903882)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (18-259)||(34599-34840)
scaffold0038 (18-267)||(116662-116911)
scaffold0038 (18-256)||(27325-27563)
scaffold0038 (18-235)||(42864-43081)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (18-259)||(58354-58595)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (135-351)||(59357-59571)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (18-229)||(3279592-3279803)
chr2 (95-300)||(17993833-17994038)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (18-170)||(16688974-16689126)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (229-296)||(5915-5982)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (81-125)||(214469-214513)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 27718451 - 27718805
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718451 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 27718550  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  27718551 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagt 27718650  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27718651 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg 27718750  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27718751 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtgat 27718805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 27724917 - 27725267
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724917 agttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 27725016  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27725017 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27725116  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  27725117 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatg 27725216  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27725217 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 27698566 - 27698918
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698566 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 27698665  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27698666 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27698765  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27698766 gcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg 27698865  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27698866 -aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtgat 27698918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 18 - 350
Target Start/End: Original strand, 27611074 - 27611406
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611074 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 27611173  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27611174 catctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 27611273  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27611274 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagagaaattggatg 27611373  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611374 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 48 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28786363 - 28786039
Alignment:
Q  48 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786363 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 28786264  T
Q  148 tgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 247  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786263 tgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 28786164  T
Q  248 gaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28786163 gaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaa 28786064  T
Q  348 tgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||   |||||||| ||||||||    
T  28786063 tgagtttgtttttgtggtctgtgat 28786039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 48 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28792484 - 28792184
Alignment:
Q  48 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792484 tagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaa 28792385  T
Q  148 tgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 247  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792384 tgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagt 28792285  T
Q  248 gaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28792284 gaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaa 28792185  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  28792184 t 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28781254 - 28780900
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781254 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgattt 28781155  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28781154 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 28781055  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28781054 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatg 28780955  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  28780954 aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtgat 28780900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 27604777 - 27605137
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27604777 agttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgattt 27604876  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  27604877 catctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagt 27604976  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaa------gtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaat 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27604977 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaat 27605076  T
Q  312 tggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27605077 tggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 27605137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26802557 - 26802199
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26802557 agttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 26802458  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||    
T  26802457 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagt 26802358  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  26802357 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatg 26802258  T
Q  318 aa----aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26802257 aaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 26802199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27228995
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg 27229048  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  27229047 --aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtggtatgtgat 27228995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26656104 - 26655750
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26656104 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgattt 26656005  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| |    
T  26656004 catctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaat 26655905  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26655904 gcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatg 26655805  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26655804 aaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 26655750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26762075 - 26761721
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26762075 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgattt 26761976  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| |    
T  26761975 catctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaat 26761876  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26761875 gcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatg 26761776  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26761775 aaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 26761721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27679061 - 27678744
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27679061 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 27678962  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| |    
T  27678961 catctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcact 27678862  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
     || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  27678861 tcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatg 27678762  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaat 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27678761 aaaaaagagtttgagaat 27678744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 27593092 - 27593375
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27593092 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 27593191  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| |    
T  27593192 catttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcact 27593291  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaat 301  Q
     || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27593292 tcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31284403 - 31284078
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  31284403 agttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgattt 31284304  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||| |    
T  31284303 catcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcact 31284204  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  31284203 tcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatg 31284104  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaata 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  31284103 aagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 27531269 - 27531502
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  27531269 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgattt 27531368  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  27531369 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgc 27531468  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531469 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 27338137 - 27338484
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  27338137 agttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgcttt 27338236  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||| |    
T  27338237 catctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaat 27338336  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  27338337 gtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatg 27338436  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27338437 aaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 27338484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 27398877 - 27399224
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  27398877 agttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgcttt 27398976  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||| |    
T  27398977 catctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaat 27399076  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  27399077 gtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatg 27399176  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27399177 aaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 27399224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Original strand, 27706474 - 27706791
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27706474 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 27706573  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||||      
T  27706574 catcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacc 27706673  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
     || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  27706674 tcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatg 27706773  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaat 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27706774 aaaaaagagtttgagaat 27706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 27677686 - 27677969
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27677686 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgattt 27677785  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| |    
T  27677786 catcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcact 27677885  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaat 301  Q
     || || ||| ||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27677886 tcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26646594 - 26646334
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26646594 agttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 26646495  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |    
T  26646494 catctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcact 26646395  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaa 278  Q
    |||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||    
T  26646394 gcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26646334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26752562 - 26752302
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26752562 agttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 26752463  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |    
T  26752462 catctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcact 26752363  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaa 278  Q
    |||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||    
T  26752362 gcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26752302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26884278 - 26884029
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26884278 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 26884179  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| |  ||||||||| |    
T  26884178 cgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcact 26884079  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 267  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884078 tcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 26884029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26823955 - 26823626
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||||||| ||  |||||    
T  26823955 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattt 26823856  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
     ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  | |  ||||||||||     
T  26823855 tatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagc 26823756  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| |||| ||||      ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26823755 gcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaa------gaggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacg 26823662  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 353  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26823661 aagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 26823626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25579834 - 25579613
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25579834 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 25579735  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  25579734 catctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcact 25579635  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  25579634 gcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26623091 - 26622805
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||    
T  26623091 agttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgattt 26622992  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |    
T  26622991 cgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcact 26622892  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattga 304  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  26622891 gcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26729069 - 26728783
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||    
T  26729069 agttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgattt 26728970  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |    
T  26728969 cgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcact 26728870  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattga 304  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  26728869 gcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25481857 - 25481636
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25481857 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 25481758  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  25481757 catctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 25481658  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  25481657 gcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26142980 - 26142759
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26142980 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 26142881  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||   || |||||||||| |    
T  26142880 catctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcact 26142781  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  26142780 gcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26861731 - 26861446
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||  |||||||  | ||||||    
T  26861731 agttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgattt 26861632  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||| |    
T  26861631 catcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcact 26861532  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 303  Q
     || || ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  26861531 tcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26056041 - 26055820
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26056041 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgattt 26055942  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  26055941 catctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 26055842  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  26055841 gcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26076011 - 26075790
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26076011 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgattt 26075912  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  26075911 catctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 26075812  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| ||| |||||||||||    
T  26075811 gcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25538655 - 25538434
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25538655 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgattt 25538556  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||   || |||||||||| |    
T  25538555 catctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcact 25538456  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25538455 gcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26048960 - 26048739
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||   ||||||||||    
T  26048960 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgattt 26048861  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  26048860 catctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 26048761  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  26048760 gcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26070129 - 26069908
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||   ||||||||||    
T  26070129 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgtgattt 26070030  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||| |    
T  26070029 catctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcact 26069930  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacact 239  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  26069929 gcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28234679 - 28234438
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28234679 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattt 28234580  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  28234579 catctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcgagtgtcact 28234480  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 259  Q
     || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  28234479 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 28234438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 27427792 - 27428006
Alignment:
Q  135 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 234  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  27427792 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 27427891  T
Q  235 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 334  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  27427892 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 27427989  T
Q  335 tgcagaatatgaatgag 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  27427990 tgcagaatatgaatgag 27428006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28139656 - 28139379
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||  ||||    
T  28139656 agttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatattt 28139557  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| ||  | |||||||| || || ||||||||   ||||  |||||| |||||||||||||  || ||||||   ||||||||| |    
T  28139556 cgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcact 28139457  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccat 295  Q
    ||| || || ||||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||| ||| | ||||||    
T  28139456 gcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccataggagaaagaagtagaagaagaaggtggttgcaaagccat 28139379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28325596 - 28325347
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  28325596 agttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtgttattt 28325497  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  28325496 cgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcact 28325397  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 267  Q
     || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  28325396 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 28325347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28185481 - 28185222
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28185481 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttattt 28185382  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||  |||||||  |  ||||||||| |    
T  28185381 cttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgataacgagtgtcact 28185282  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 277  Q
     || ||||| || |||||||| |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28185281 acctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28181229 - 28180970
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28181229 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttattt 28181130  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||  |||||||| |  |||||||||      
T  28181129 cttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaaccataacgagtgtcacc 28181030  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 277  Q
     || ||||| || |||||| | |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28181029 acctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28227065 - 28226827
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28227065 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttattt 28226966  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  28226965 catcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaat 28226866  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 256  Q
     || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  28226865 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 28226827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28242919 - 28242702
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28242919 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattt 28242820  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
      || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  28242819 tgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcact 28242720  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaa 235  Q
     || |||||||| |||||    
T  28242719 acctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26848775 - 26848603
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| || || ||||||  ||||||||| || |||||||| |    
T  26848775 agttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatct 26848676  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 190  Q
    |||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  26848675 catcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Original strand, 25506981 - 25507092
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25506981 agttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgattt 25507080  T
Q  118 catctcctcttt 129  Q
    ||||||||||||    
T  25507081 catctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28150052 - 28149912
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28150052 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgattt 28149954  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 159  Q
    | || |||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28149953 cgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26937209 - 26937073
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  || || ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26937209 agttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgattt 26937110  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 154  Q
    | |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937109 cttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29826130 - 29825958
Alignment:
Q  30 caaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||    ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29826130 caaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctcttt 29826031  T
Q  130 gaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaacc 202  Q
    |||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29826030 gaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Original strand, 26342006 - 26342255
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| || || |||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  26342006 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaagtgattgtgtgattt 26342105  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
      || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||  ||| |||   ||||   |||||  | |||| ||| |  |||||||| | ||||||| || |    
T  26342106 tgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctatagatattgccagtaaaaccatagcgagtgccaat 26342205  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 267  Q
    |||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||    
T  26342206 gcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaag 26342255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055738
Alignment:
Q  274 aggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26055738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 286
Target Start/End: Original strand, 28098441 - 28098709
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| || || || ||||||||||  || ||| ||||||||     
T  28098441 agttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgattc 28098540  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
     ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| ||    
T  28098541 tatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtcggt 28098640  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattg 286  Q
    |||||||||| | || ||||| |  || ||||||||||| || ||||||| | | ||||||| ||||||    
T  28098641 gcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaagatgattg 28098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481554
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25481554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538356
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 350  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatga 25538356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048657
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26048657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069826
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075708
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26075708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142677
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 28297785 - 28298026
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  28297785 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatggtgttattt 28297884  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| ||||||||   |||||| || ||| |||||| |    
T  28297885 cgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaataaaactgtagcgtgtgtcact 28297984  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 259  Q
     || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||    
T  28297985 acctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccatagga 28298026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28514288 - 28514047
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  28514288 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatggtgttattt 28514189  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| ||||||||   |||||| || ||| |||||| |    
T  28514188 cgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttccaataaaactgtagcgtgtgtcact 28514089  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 259  Q
     || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||    
T  28514088 acctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccatagga 28514047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26635749 - 26635585
Alignment:
Q  74 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 173  Q
    |||||| || || ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    
T  26635749 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26635650  T
Q  174 agagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    ||||| || ||||| || | ||| ||||||    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26635649 agagctttatagaggttaccggtgaaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26741715 - 26741551
Alignment:
Q  74 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 173  Q
    |||||| || || ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    
T  26741715 aatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaa 26741616  T
Q  174 agagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    ||||| || ||||| || | ||| ||||||    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26741615 agagctttatagaggttaccggtgaaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214312
Alignment:
Q  110 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcga 209  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| | ||| |||||||| |||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27214341  T
Q  210 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214340 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234916
Alignment:
Q  110 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcga 209  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| | ||| |||||||| |||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  210 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234888 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 187
Target Start/End: Original strand, 27665245 - 27665358
Alignment:
Q  74 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 173  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||  ||||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  27665245 aatcctcgattcttcaatgctcttccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaa 27665344  T
Q  174 agagccttgtagag 187  Q
    |||||||| |||||    
T  27665345 agagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26949699 - 26949591
Alignment:
Q  95 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctg 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||| | |    
T  26949699 cttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccg 26949600  T
Q  195 gtaaaaccg 203  Q
    || ||||||    
T  26949599 gtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25071697 - 25071554
Alignment:
Q  95 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctg 194  Q
    |||| |||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| | |    
T  25071697 cttgcggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccg 25071598  T
Q  195 gtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    |||||||||   |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  25071597 gtaaaaccgaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  74 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 173  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  174 agagccttgtagagat 189  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579529
Alignment:
Q  275 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatga--aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 354  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaataaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25579529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959069
Alignment:
Q  108 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 207  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | ||| |||| |   |    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaactgaatc 26959091  T
Q  208 gagtgtcagtgcccctaaaact 229  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  26959090 gagtgtcggtgcccctgaaact 26959069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26975167 - 26974998
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  26975167 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgattt 26975068  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 187  Q
    | || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26975067 cgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26974998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617269
Alignment:
Q  108 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26617269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723197
Alignment:
Q  108 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26723197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893781
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| |||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||  | |||  |||||| || || ||||  |  ||||||||    ||||||||||     
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaaaacgagtgtcaga 26893742  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 256  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| |||||||||||    
T  26893743 gcctctaaaattgaggaagacatcgtaggtgaatccata 26893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018837
Alignment:
Q  229 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 296  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  || ||||||||||| |||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccata 26018837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139541
Alignment:
Q  229 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 296  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 26139541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2185013 - 2184880
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||    
T  2185013 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattctggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttattt 2184914  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 151  Q
    || | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184913 caccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 14428 - 14779
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14428 agttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 14526  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14527 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 14626  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14627 gcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg 14726  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14727 -aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 3493 - 3844
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatt 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3493 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatt 3592  T
Q  117 tcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3593 tcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcag 3692  T
Q  217 tgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggat 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3693 tgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggat 3792  T
Q  317 gaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3793 gaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 372
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8227
Alignment:
Q  207 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  307 gaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtgat 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 18 - 348
Target Start/End: Original strand, 4743 - 5073
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4743 agttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgattt 4842  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4843 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaat 4942  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4943 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 5042  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5043 aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Original strand, 13704 - 14058
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13704 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgattt 13803  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13804 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 13903  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13904 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatg 14003  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  14004 aaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtgat 14058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7640 - 7293
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640 agttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgattt 7541  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7540 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 7441  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7440 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatg 7341  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7340 aaaaaagagtttga-------gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 39 - 372
Target Start/End: Original strand, 10 - 336
Alignment:
Q  39 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 138  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  139 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 238  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  239 ttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgca 338  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------a 302  T
Q  339 gaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtgat 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  303 gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtgat 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 18699459 - 18699787
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18699459 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 18699558  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||||    
T  18699559 catccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagt 18699658  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  18699659 gcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatg 18699758  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699759 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18699787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 18655536 - 18655864
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18655536 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 18655635  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |    
T  18655636 catccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcact 18655735  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18655736 gcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatg 18655835  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655836 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18655864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 18679626 - 18679954
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18679626 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 18679725  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |    
T  18679726 catcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcact 18679825  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18679826 gcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatg 18679925  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679926 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18679954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 346
Target Start/End: Original strand, 18731563 - 18731891
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18731563 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 18731662  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |    
T  18731663 catcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcact 18731762  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18731763 gcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatg 18731862  T
Q  318 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731863 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18731891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 18724144 - 18724432
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18724144 agttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 18724243  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |    
T  18724244 catcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcact 18724343  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 306  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18724344 gcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 17989226 - 17989440
Alignment:
Q  135 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 234  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  17989226 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 17989325  T
Q  235 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 334  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  17989326 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 17989423  T
Q  335 tgcagaatatgaatgag 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  17989424 tgcagaatatgaatgag 17989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18073763 - 18073549
Alignment:
Q  135 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 234  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  18073763 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 18073664  T
Q  235 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 334  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  18073663 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 18073566  T
Q  335 tgcagaatatgaatgag 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  18073565 tgcagaatatgaatgag 18073549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 5091026 - 5091237
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||   ||| | |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5091026 agttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttattt 5091125  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
      |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  ||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||    
T  5091126 ggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggt 5091225  T
Q  218 gcccctaaaact 229  Q
    ||| ||||||||    
T  5091226 gcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 330
Target Start/End: Original strand, 28164421 - 28164733
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  28164421 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgattt 28164520  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||| ||||| |||||||  |  || |||||||  ||||||||| |    
T  28164521 cttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcact 28164620  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28164621 gcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattggatg 28164720  T
Q  318 aaaaaagagtttg 330  Q
    | |||||||||||    
T  28164721 agaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 268416 - 268704
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  268416 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgattt 268515  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| |  |||||||||      
T  268516 catcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcacc 268615  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 306  Q
    ||| || ||  ||||||| || ||||| |  |||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  268616 gcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgaga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 327
Target Start/End: Original strand, 28127738 - 28128042
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  28127738 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgattt 28127837  T
Q  118 cat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcag 216  Q
      | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |  || |||||||  |||||||||     
T  28127838 ttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcac 28127937  T
Q  217 tgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggat 316  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  28127938 tgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaa------gaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggat 28128031  T
Q  317 gaaaaaagagt 327  Q
    || ||||||||    
T  28128032 gagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Original strand, 29273842 - 29274119
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |||  |||||||| | ||||||    
T  29273842 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgattt 29273941  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   |||||||||  |||||||||      
T  29273942 catcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcacc 29274041  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccat 295  Q
    ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29274042 gcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903728
Alignment:
Q  102 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  202 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 256  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34840 - 34599
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  34840 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattt 34741  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  34740 catctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcgagtgtcact 34641  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 259  Q
     || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  34640 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 34599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 116911 - 116662
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  116911 agttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgacggtgttattt 116812  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  116811 cgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcact 116712  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 267  Q
     || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  116711 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27325
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  27563 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttattt 27464  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  27463 catcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcaat 27364  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 256  Q
     || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  27363 acctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 27325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43081 - 42864
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  43081 agttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattt 42982  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
      || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |    
T  42981 tgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcact 42882  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaa 235  Q
     || |||||||| |||||    
T  42881 acctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 58354 - 58595
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  58354 agttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatggtgttattt 58453  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    | || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||      
T  58454 cgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtcaca 58553  T
Q  218 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 259  Q
     || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  58554 acctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccatagga 58595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 59571 - 59357
Alignment:
Q  135 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 234  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  59571 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 59472  T
Q  235 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 334  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  59471 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 59374  T
Q  335 tgcagaatatgaatgag 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  59373 tgcagaatatgaatgag 59357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3279803 - 3279592
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || || || ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3279803 agttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggccttgacaagtgattgtgtgattt 3279704  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 217  Q
    |||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  3279703 catcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtcagt 3279604  T
Q  218 gcccctaaaact 229  Q
    ||||||||||||    
T  3279603 gcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 300
Target Start/End: Original strand, 17993833 - 17994038
Alignment:
Q  95 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctg 194  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||| | |    
T  17993833 cttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccg 17993932  T
Q  195 gtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagcca 294  Q
    || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||| | |||||| | | |  |||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| |||||||    
T  17993933 gtgaaaccatatcgagtatcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagctgaaaccataagataaggaggaagaggaggaaggtgattgcatagcca 17994032  T
Q  295 taagaa 300  Q
    ||||||    
T  17994033 taagaa 17994038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16689126 - 16688974
Alignment:
Q  18 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16689126 agttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatggtgtgattt 16689027  T
Q  118 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 170  Q
      || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16689026 tgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtca 16688974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5915
Alignment:
Q  229 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 296  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 125
Target Start/End: Original strand, 214469 - 214513
Alignment:
Q  81 gattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcct 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  214469 gattcatcaattgccttgaaaagtgatggtgtaatttcatctcct 214513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University