View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19605_high_1 (Length: 506)

Name: NF19605_high_1
Description: NF19605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19605_high_1
NF19605_high_1
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (15-506)||(16743998-16744489)
chr3 (132-421)||(17912483-17912771)
chr3 (58-427)||(12030073-12030443)
chr3 (58-427)||(2049777-2050147)
chr3 (58-427)||(14842487-14842856)
chr3 (58-437)||(13838852-13839232)
chr3 (106-438)||(15858996-15859331)
chr3 (132-298)||(2449238-2449404)
chr3 (122-438)||(51158008-51158325)
chr3 (139-427)||(15936634-15936922)
chr3 (15-194)||(19231982-19232164)
chr3 (139-427)||(15938476-15938764)
chr3 (132-427)||(45860773-45861068)
chr3 (176-420)||(15614808-15615053)
chr3 (132-427)||(13954890-13955185)
chr3 (132-427)||(13975722-13976017)
chr3 (58-178)||(19260749-19260869)
chr3 (318-503)||(15468520-15468706)
chr3 (318-503)||(22275099-22275285)
chr3 (144-427)||(55316187-55316471)
chr3 (144-427)||(41270043-41270327)
chr3 (166-435)||(16821099-16821369)
chr3 (15-93)||(15857120-15857198)
chr3 (15-90)||(3992873-3992948)
chr3 (285-420)||(47984624-47984759)
chr3 (285-420)||(48003198-48003333)
chr3 (15-90)||(55513193-55513268)
chr3 (15-90)||(2844514-2844589)
chr3 (285-420)||(47993911-47994046)
chr3 (285-420)||(48012484-48012619)
chr3 (15-90)||(54037981-54038056)
chr3 (15-90)||(17955837-17955916)
chr3 (15-90)||(7854305-7854380)
chr3 (453-506)||(2449391-2449444)
chr3 (29-90)||(45581954-45582016)
chr3 (148-189)||(14080715-14080756)
chr3 (17-74)||(17205019-17205076)
chr3 (378-427)||(19231945-19231994)
chr3 (17-72)||(12031849-12031904)
chr3 (139-398)||(12264791-12265053)
chr3 (17-74)||(17191879-17191936)
chr3 (17-74)||(38810868-38810925)
chr3 (58-90)||(13954804-13954836)
chr3 (406-438)||(22144532-22144564)
chr3 (58-90)||(45861122-45861154)
chr3 (58-228)||(54651625-54651796)
chr3 (139-229)||(11986173-11986263)
chr3 (17-74)||(3576290-3576347)
chr3 (17-74)||(13301323-13301380)
chr3 (17-74)||(13311979-13312036)
chr3 (57-90)||(15615137-15615170)
chr3 (58-90)||(2449152-2449184)
chr3 (283-398)||(11329098-11329214)
chr3 (58-90)||(16261777-16261809)
chr3 (58-90)||(16933869-16933901)
chr3 (58-90)||(17912398-17912430)
chr3 (434-506)||(18969976-18970048)
chr3 (58-90)||(23492696-23492728)
chr3 (58-90)||(38168237-38168269)
chr3 (58-90)||(53771365-53771397)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (132-506)||(22907214-22907588)
chr8 (15-427)||(16404857-16405268)
chr8 (58-420)||(16193643-16194005)
chr8 (58-427)||(43373392-43373761)
chr8 (58-437)||(24928716-24929096)
chr8 (132-298)||(5238184-5238350)
chr8 (132-298)||(24661248-24661414)
chr8 (132-298)||(43685643-43685809)
chr8 (132-424)||(17345540-17345832)
chr8 (144-420)||(24548956-24549233)
chr8 (144-420)||(6774258-6774535)
chr8 (148-427)||(21844576-21844856)
chr8 (148-427)||(21851969-21852249)
chr8 (144-427)||(30120690-30120974)
chr8 (207-427)||(222754-222975)
chr8 (207-427)||(736377-736598)
chr8 (207-427)||(860272-860493)
chr8 (15-90)||(274766-274841)
chr8 (15-90)||(641008-641083)
chr8 (15-90)||(826814-826889)
chr8 (15-90)||(24716719-24716794)
chr8 (144-423)||(16674392-16674672)
chr8 (453-506)||(5238144-5238197)
chr8 (453-506)||(24661401-24661454)
chr8 (453-506)||(43685603-43685656)
chr8 (283-437)||(23837154-23837308)
chr8 (15-90)||(39115598-39115673)
chr8 (316-438)||(41246613-41246735)
chr8 (17-74)||(17285543-17285600)
chr8 (17-74)||(21198005-21198062)
chr8 (365-435)||(13662492-13662561)
chr8 (457-506)||(22321597-22321646)
chr8 (148-189)||(23149985-23150026)
chr8 (148-189)||(23226076-23226117)
chr8 (58-90)||(5238404-5238436)
chr8 (58-90)||(22907128-22907160)
chr8 (58-90)||(24385652-24385684)
chr8 (58-90)||(24661162-24661194)
chr8 (58-90)||(43685863-43685895)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (132-506)||(26680089-26680463)
chr4 (15-438)||(54118125-54118551)
chr4 (58-438)||(13246386-13246769)
chr4 (58-423)||(15675009-15675381)
chr4 (58-264)||(122020-122226)
chr4 (58-423)||(10104170-10104523)
chr4 (132-298)||(10488659-10488825)
chr4 (132-298)||(16327926-16328092)
chr4 (159-420)||(31115603-31115865)
chr4 (148-427)||(10644187-10644467)
chr4 (132-427)||(13048221-13048517)
chr4 (58-194)||(33240901-33241043)
chr4 (144-427)||(47357622-47357906)
chr4 (296-427)||(111362-111493)
chr4 (15-90)||(25119064-25119139)
chr4 (148-330)||(40885570-40885753)
chr4 (453-506)||(10488619-10488672)
chr4 (453-506)||(16328079-16328132)
chr4 (58-164)||(31132545-31132657)
chr4 (15-90)||(5682385-5682460)
chr4 (147-424)||(7849970-7850248)
chr4 (283-427)||(15044794-15044938)
chr4 (17-74)||(41165808-41165865)
chr4 (283-372)||(41166083-41166172)
chr4 (17-74)||(47534933-47534990)
chr4 (406-438)||(44055870-44055902)
chr4 (283-370)||(7185981-7186068)
chr4 (58-90)||(7850314-7850346)
chr4 (149-189)||(13809511-13809551)
chr4 (58-90)||(14952085-14952117)
chr4 (58-90)||(15135907-15135939)
chr4 (58-90)||(15272211-15272243)
chr4 (58-90)||(16327840-16327872)
chr4 (58-90)||(16609013-16609045)
chr4 (58-90)||(26680517-26680549)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (132-506)||(7292905-7293279)
chr7 (58-439)||(13036938-13037322)
chr7 (58-427)||(16211733-16212103)
chr7 (17-427)||(3059933-3060344)
chr7 (58-427)||(11580661-11581035)
chr7 (58-427)||(36052634-36053003)
chr7 (132-298)||(11516324-11516490)
chr7 (132-298)||(15441564-15441730)
chr7 (132-298)||(30262129-30262295)
chr7 (132-420)||(47481031-47481320)
chr7 (139-427)||(18253842-18254130)
chr7 (133-420)||(13320988-13321278)
chr7 (150-424)||(16478968-16479244)
chr7 (132-427)||(25292338-25292633)
chr7 (144-427)||(10989378-10989661)
chr7 (148-427)||(13572644-13572924)
chr7 (144-409)||(13911024-13911292)
chr7 (143-427)||(2437425-2437710)
chr7 (60-424)||(295893-296257)
chr7 (15-90)||(32493903-32493978)
chr7 (453-506)||(15441717-15441770)
chr7 (453-506)||(30262282-30262335)
chr7 (15-90)||(126738-126813)
chr7 (453-506)||(11516284-11516337)
chr7 (15-90)||(1936874-1936949)
chr7 (15-90)||(111126-111201)
chr7 (15-89)||(7283913-7283987)
chr7 (132-174)||(14113989-14114031)
chr7 (132-174)||(14423639-14423681)
chr7 (17-74)||(13377867-13377924)
chr7 (17-74)||(13389693-13389750)
chr7 (406-438)||(15822691-15822723)
chr7 (17-73)||(16919870-16919926)
chr7 (148-228)||(16914928-16915009)
chr7 (58-90)||(2029244-2029276)
chr7 (58-90)||(7293333-7293365)
chr7 (58-90)||(11516544-11516576)
chr7 (58-90)||(14113903-14113935)
chr7 (58-90)||(15441478-15441510)
chr7 (58-127)||(15709428-15709501)
chr7 (283-438)||(17224075-17224230)
chr7 (58-90)||(30262043-30262075)
chr7 (58-90)||(42056188-42056220)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (132-506)||(37066-37440)
scaffold0078 (15-90)||(41632-41707)
scaffold0078 (58-90)||(36980-37012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (15-424)||(41394191-41394602)
chr1 (58-427)||(20445646-20446019)
chr1 (58-427)||(20931312-20931682)
chr1 (58-427)||(20531411-20531783)
chr1 (58-438)||(20893551-20893933)
chr1 (58-427)||(20913004-20913367)
chr1 (58-427)||(37844374-37844746)
chr1 (132-298)||(51452589-51452755)
chr1 (144-420)||(2116228-2116506)
chr1 (143-427)||(22227777-22228061)
chr1 (143-427)||(22232474-22232758)
chr1 (144-427)||(5072388-5072672)
chr1 (144-427)||(18601118-18601402)
chr1 (144-420)||(45051416-45051674)
chr1 (15-90)||(21860334-21860409)
chr1 (16-90)||(44034829-44034903)
chr1 (453-506)||(51452549-51452602)
chr1 (15-75)||(41218743-41218803)
chr1 (17-88)||(27675120-27675191)
chr1 (17-74)||(13376711-13376768)
chr1 (17-74)||(20177513-20177570)
chr1 (406-437)||(49967607-49967638)
chr1 (148-189)||(22143361-22143402)
chr1 (57-90)||(45051726-45051759)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (15-438)||(19794586-19795011)
chr2 (58-427)||(36982364-36982737)
chr2 (15-427)||(20627195-20627609)
chr2 (15-427)||(43642838-43643250)
chr2 (58-427)||(462706-463075)
chr2 (58-427)||(8891209-8891581)
chr2 (58-423)||(24341309-24341681)
chr2 (132-298)||(19689401-19689567)
chr2 (132-298)||(23820168-23820334)
chr2 (132-298)||(14906440-14906606)
chr2 (132-420)||(25265390-25265679)
chr2 (132-298)||(20015108-20015274)
chr2 (132-427)||(17396653-17396948)
chr2 (182-424)||(7507894-7508138)
chr2 (144-427)||(19886661-19886945)
chr2 (15-90)||(22275045-22275120)
chr2 (15-90)||(22284278-22284353)
chr2 (58-154)||(22863169-22863267)
chr2 (15-89)||(15633538-15633612)
chr2 (453-499)||(19689554-19689600)
chr2 (453-506)||(14906593-14906646)
chr2 (453-506)||(20015068-20015121)
chr2 (453-506)||(23820128-23820181)
chr2 (17-74)||(43646232-43646289)
chr2 (58-90)||(17396567-17396599)
chr2 (17-69)||(19660221-19660273)
chr2 (316-372)||(19669279-19669335)
chr2 (57-90)||(19689314-19689347)
chr2 (17-74)||(25305769-25305826)
chr2 (58-90)||(9652796-9652828)
chr2 (58-90)||(14906354-14906386)
chr2 (58-90)||(23820388-23820420)
chr2 (406-438)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (58-427)||(1091-1462)
scaffold0266 (58-427)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (58-427)||(48565-48935)
scaffold0023 (166-423)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (57-427)||(36836-37209)
scaffold0077 (15-74)||(15324-15383)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (58-427)||(23506932-23507302)
chr5 (58-438)||(27182471-27182854)
chr5 (58-419)||(18530988-18531355)
chr5 (58-423)||(22053753-22054125)
chr5 (132-298)||(20623066-20623232)
chr5 (132-298)||(21233528-21233694)
chr5 (132-295)||(37052844-37053007)
chr5 (132-298)||(16536294-16536460)
chr5 (132-424)||(34939248-34939540)
chr5 (134-298)||(25900408-25900571)
chr5 (144-427)||(22366481-22366765)
chr5 (144-427)||(25426596-25426880)
chr5 (147-427)||(18777995-18778276)
chr5 (144-427)||(12342-12626)
chr5 (144-427)||(19499867-19500151)
chr5 (144-427)||(21073595-21073879)
chr5 (144-408)||(4199985-4200251)
chr5 (147-427)||(43443398-43443679)
chr5 (148-427)||(27009809-27010089)
chr5 (318-437)||(17471768-17471887)
chr5 (144-264)||(29188284-29188404)
chr5 (346-420)||(29190478-29190552)
chr5 (453-506)||(20623026-20623079)
chr5 (453-506)||(21233681-21233734)
chr5 (453-506)||(25900558-25900611)
chr5 (453-506)||(37052801-37052854)
chr5 (453-506)||(16536254-16536307)
chr5 (15-74)||(11584389-11584448)
chr5 (283-416)||(19862186-19862319)
chr5 (17-74)||(21222462-21222519)
chr5 (283-427)||(23493885-23494029)
chr5 (139-229)||(32950861-32950951)
chr5 (17-74)||(5450695-5450752)
chr5 (148-189)||(21310709-21310750)
chr5 (148-189)||(23981516-23981557)
chr5 (148-228)||(29918131-29918212)
chr5 (58-90)||(16105967-16105999)
chr5 (58-90)||(20623286-20623318)
chr5 (58-90)||(21233442-21233474)
chr5 (58-90)||(25900320-25900352)
chr5 (58-90)||(37053061-37053093)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (58-438)||(23153403-23153786)
chr6 (59-420)||(14626045-14626407)
chr6 (132-427)||(35009439-35009735)
chr6 (132-424)||(1657748-1658040)
chr6 (132-424)||(15862443-15862734)
chr6 (144-420)||(1650105-1650382)
chr6 (59-427)||(25175531-25175901)
chr6 (144-427)||(27653983-27654267)
chr6 (144-427)||(16825752-16826038)
chr6 (15-90)||(19983149-19983224)
chr6 (15-90)||(35015014-35015089)
chr6 (58-127)||(23148266-23148335)
chr6 (291-424)||(27740808-27740941)
chr6 (284-438)||(18381821-18381975)
chr6 (15-90)||(18583640-18583715)
chr6 (132-215)||(27751605-27751688)
chr6 (132-330)||(29665937-29666137)
chr6 (17-74)||(21623506-21623563)
chr6 (17-74)||(22361619-22361676)
chr6 (307-413)||(22361926-22362032)
chr6 (57-90)||(1650020-1650053)
chr6 (148-189)||(16887792-16887833)
chr6 (148-228)||(18629608-18629689)
chr6 (409-438)||(32898745-32898774)
chr6 (148-189)||(33324898-33324939)
chr6 (148-189)||(35136013-35136054)
chr6 (17-89)||(14152632-14152704)
chr6 (58-90)||(18002395-18002427)
chr6 (58-90)||(23995247-23995279)
chr6 (283-398)||(25367374-25367490)
chr6 (58-90)||(26090059-26090091)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (61-427)||(19173-19543)
scaffold0195 (132-427)||(21257-21553)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (58-438)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (58-427)||(882-1250)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (58-427)||(12083-12450)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (58-427)||(5990-6358)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (58-427)||(128095-128464)
scaffold0008 (166-408)||(31697-31942)
scaffold0008 (406-434)||(22650-22678)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (58-427)||(247366-247738)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (58-437)||(171863-172242)
scaffold0001 (58-437)||(177566-177945)
scaffold0001 (406-438)||(70882-70914)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (58-427)||(123087-123460)
scaffold0011 (406-438)||(255074-255106)
scaffold0011 (406-438)||(261680-261712)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (58-427)||(8846-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (58-423)||(8820-9192)
scaffold0025 (106-427)||(148688-149012)
scaffold0025 (58-158)||(146838-146938)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (58-427)||(26340-26710)
scaffold0162 (132-420)||(8180-8466)
scaffold0162 (17-74)||(6877-6934)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (68-427)||(4996-5356)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (58-437)||(271983-272362)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (132-298)||(26892-27058)
scaffold0141 (139-298)||(22637-22796)
scaffold0141 (453-506)||(22597-22650)
scaffold0141 (453-506)||(26852-26905)
scaffold0141 (58-90)||(22857-22889)
scaffold0141 (58-90)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (132-298)||(1582-1748)
scaffold0124 (453-506)||(1735-1788)
scaffold0124 (58-90)||(1496-1528)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (139-427)||(48155-48443)
scaffold0049 (15-89)||(20493-20567)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (60-264)||(51110-51314)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (132-420)||(13480-13769)
scaffold0132 (15-90)||(42677-42749)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (132-420)||(41622-41911)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (139-427)||(107715-108003)
scaffold0026 (148-427)||(64527-64812)
scaffold0026 (147-189)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (132-425)||(534-828)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (58-264)||(89378-89586)
scaffold0028 (58-183)||(107708-107835)
scaffold0028 (316-398)||(79533-79616)
scaffold0028 (148-189)||(79745-79786)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (132-424)||(34460-34755)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (143-420)||(2936-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (166-420)||(9371-9626)
scaffold0215 (166-420)||(16269-16524)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (167-427)||(42965-43226)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (296-438)||(9338-9480)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (139-264)||(5660-5785)
scaffold0772 (58-90)||(5846-5878)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (182-427)||(5254-5498)
scaffold0022 (149-189)||(102923-102963)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (182-427)||(3690-3936)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (148-427)||(3-283)
scaffold0116 (15-90)||(30417-30492)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (166-427)||(14083-14344)
scaffold0139 (143-427)||(21115-21399)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (144-264)||(13325-13445)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (15-90)||(80187-80262)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (305-427)||(48482-48603)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (15-91)||(166121-166197)
scaffold0016 (16-91)||(162036-162111)
scaffold0016 (17-74)||(116410-116467)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (15-90)||(31137-31212)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (305-427)||(26-147)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (16-90)||(5735-5809)
scaffold0686 (16-90)||(5941-6015)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (144-264)||(1304-1424)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (15-91)||(309-385)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (182-398)||(54412-54630)
scaffold0066 (182-330)||(45094-45244)
scaffold0066 (354-398)||(45007-45051)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (15-89)||(1701-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (15-89)||(19807-19881)
scaffold0122 (15-89)||(24111-24185)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (378-427)||(1815-1863)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (350-419)||(3183-3252)
scaffold0361 (132-221)||(3364-3453)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (19-89)||(94-164)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (15-89)||(6261-6335)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (139-257)||(56106-56226)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-74)||(35816-35873)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (283-438)||(76984-77139)
scaffold0053 (17-74)||(76699-76756)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (316-438)||(132420-132542)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (17-74)||(442-499)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-74)||(1363-1420)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (148-189)||(1546-1587)
scaffold0456 (148-189)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (148-189)||(8216-8257)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (148-189)||(70307-70348)
scaffold0058 (58-90)||(57392-57424)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (58-257)||(10256-10458)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (148-186)||(1348-1386)
scaffold0409 (148-186)||(9603-9641)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (17-74)||(632-689)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (17-74)||(6999-7056)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (409-438)||(7522-7551)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (148-189)||(22422-22463)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (17-74)||(43651-43708)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (409-438)||(38253-38282)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (148-189)||(93773-93814)
scaffold0032 (58-90)||(55904-55936)
scaffold0032 (58-90)||(108075-108107)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (17-74)||(31357-31414)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (57-90)||(193396-193429)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (316-372)||(2476-2532)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (58-90)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (58-90)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (58-90)||(9882-9914)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (149-189)||(10868-10908)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (58-90)||(13285-13317)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 506
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744489
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 16744097  T
Q  115 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttgg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744098 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttgg 16744197  T
Q  215 ttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 314  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16744198 ttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgt 16744297  T
Q  315 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744298 gcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 16744397  T
Q  415 tgttttggtgaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744398 tgttttggtgaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 16744489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 132 - 421
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912771
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  332 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttg 421  Q
    || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030443
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049777
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842856
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838852
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgat-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 355  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  356 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 106 - 438
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859331
Alignment:
Q  106 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 203  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  204 atgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagc 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  303 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttg 402  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttg 15859295  T
Q  403 aattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859296 aattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 122 - 438
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158325
Alignment:
Q  122 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaatt 221  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  222 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 320  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  321 gatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgtt-ggtgttt 419  Q
    |||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttt 51158307  T
Q  420 tggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    || | ||||||||||||||    
T  51158308 tgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936922
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 337  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  338 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19231982
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtg-atttttcaaat 113  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaat 19232065  T
Q  114 gttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 194  Q
    ||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232064 gttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938764
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 337  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  338 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860773
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 329  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 176 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614808
Alignment:
Q  176 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  276 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatac 374  Q
    ||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  375 atgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15614853 atattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955185
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 329  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13976017
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 329  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||| || | |||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  158 tccaactttgatgatatgttt 178  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 503
Target Start/End: Original strand, 15468520 - 15468706
Alignment:
Q  318 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 417  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15468520 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgt 15468619  T
Q  418 tttggtgaaatttgtg-aattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggtt 503  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  15468620 tttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgatcataagttgtggttgtggtt 15468706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22275285 - 22275099
Alignment:
Q  318 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 417  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275285 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 22275186  T
Q  418 tttggtgaaatttgtgaattgag-gaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggtt 503  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||    
T  22275185 tttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggtt 22275099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  266 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 363  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  364 cttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 435  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992873
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  285 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 384  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  385 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  285 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 384  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  385 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513193
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844514
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  285 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 384  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  385 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  285 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 384  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  385 attgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038056
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955916
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854305
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449444
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 2449444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  29 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205019
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 378 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19231994 - 19231945
Alignment:
Q  378 ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231994 ttcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtt 72  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 398
Target Start/End: Original strand, 12264791 - 12265053
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa--tatg 236  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||  ||||    
T  12264791 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 12264890  T
Q  237 tagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa--tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgc 334  Q
    || |||||  ||||||||| | || | |  ||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |      
T  12264891 tataaatgttaagttatgaga-ttatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctat 12264989  T
Q  335 taatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 398  Q
    |||  |||||| | || | ||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12264990 taactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaa 12265053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191879
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17191879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810925
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttag 38810925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54651796 - 54651625
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||| ||   ||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  54651796 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 54651697  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 228  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| ||||||    
T  54651696 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986263
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 3576290 - 3576347
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  3576290 taggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttag 3576347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301380
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 13301380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312036
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 13312036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 398
Target Start/End: Original strand, 11329098 - 11329214
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||| | |||| |||||||||| |||| ||||    
T  11329098 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattca 11329197  T
Q  382 tggattgatgatgagaa 398  Q
    ||  ||| |||||||||    
T  11329198 tgatttgttgatgagaa 11329214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18970048 - 18969976
Alignment:
Q  434 aattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18970048 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattctgatggaaagcatgattataagttgtggttgtggttgat 18969976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 506
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907588
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 331  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  332 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 22907513  T
Q  432 tgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907514 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 22907588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 427
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16405268
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatg 16404955  T
Q  115 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 212  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16404956 ttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 16405055  T
Q  213 ggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 311  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||    
T  16405056 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattct 16405152  T
Q  312 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgt 411  Q
    ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  16405153 tgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagatgttgt 16405252  T
Q  412 tggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||| |||||    
T  16405253 tggtgttttgatgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 420
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16194005
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16193941  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193942 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373761
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929096
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgat-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 355  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| |  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  356 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345540
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 342  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  343 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 342  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  343 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844856
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852249
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 427
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  207 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 304  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  305 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 404  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  405 ttgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 427
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  207 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 304  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  305 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 404  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  405 ttgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 427
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  207 attgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 304  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  305 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 404  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  405 ttgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274766
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641083
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826889
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716794
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 423
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674672
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |  |||  || |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238144
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 5238144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661454
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 24661454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685603
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 43685603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115598
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41246735 - 41246613
Alignment:
Q  316 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 414  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| | | |||| | |||| |||||||| | |||| ||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||    
T  41246735 caattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaat-gaaatgttgttgg 41246637  T
Q  415 tgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41246636 tgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285543
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198062
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttag 21198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Original strand, 13662492 - 13662561
Alignment:
Q  365 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 435  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662492 ttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 506
Target Start/End: Original strand, 22321597 - 22321646
Alignment:
Q  457 ttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22321597 ttgttaaattgtgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgat 22321646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680089
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  332 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 26680164  T
Q  432 tgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680163 ggaatcgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 26680089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118551
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatg 54118224  T
Q  115 ttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 212  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54118225 ttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 54118324  T
Q  213 ggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 311  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||    
T  54118325 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattct 54118424  T
Q  312 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgt 411  Q
    ||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54118425 tgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgt 54118524  T
Q  412 tggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54118525 tggtgttttggtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246386
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675381
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  252 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 350  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  351 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  258 attgtgc 264  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104523
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    |||   ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 251  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  252 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 350  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||                   ||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt-------------------gt 10104450  T
Q  351 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  159 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  259 ttgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 357  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  358 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644187
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048517
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 329  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||| || |||||  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatagttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13048517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  296 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 395  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  396 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119139
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 246  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  247 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488619
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 10488619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328132
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 16328132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  152 tcgtgctccaact 164  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682460
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 7850248 - 7849970
Alignment:
Q  147 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 246  Q
    ||||||||||||||||    |||| |||||||| ||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||  ||||  ||||  || |||||  ||||| |    
T  7850248 taaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtg 7850149  T
Q  247 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa--tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 344  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||  | ||  | ||||||||||| ||||| |  |||   ||||||||||||| || |||  ||       
T  7850148 aagttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagatatgaattgtgtttcattgatgttgttgttgttaaaggagta 7850049  T
Q  345 tatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    | | |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850048 tgttgttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||   |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165865
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttag 41165865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 372
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166172
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 372  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtat 41166172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 370
Target Start/End: Original strand, 7185981 - 7186068
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggt 370  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7185981 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggt 7186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7850346 - 7850314
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7850346 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcat 7850314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  149 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7292905
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 331  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  332 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 7292980  T
Q  432 tgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7292979 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 7292905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 439
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037322
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||| | ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 439  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211733
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059933
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgtt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  117 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtt 216  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  217 aaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 314  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||  |||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  315 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 414  Q
     ||||||||||| |   || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| ||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtggg 3059946  T
Q  415 tgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||| |||||    
T  3059945 tgttttgatgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581035
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgatttttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  154 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 253  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  254 gaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttg 352  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  353 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052634
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| | ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481320
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcg 47481230  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     |  |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481231 ctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254130
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 337  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  338 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13320988
Alignment:
Q  133 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--a 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  231 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 328  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  329 tgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    || || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 424
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479244
Alignment:
Q  150 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaag 249  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  250 ttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttata 348  Q
    || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||| |     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  349 gttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292633
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||  ||| | |||||| |   | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |      
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 25292537  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| || | ||| ||||   | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292538 atgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgta-atttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572644
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 409
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911292
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 340  Q
    || |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | |    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  341 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 409  Q
    || ||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437425
Alignment:
Q  143 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 340  Q
    ||| |||||||||| ||||||   ||| | |||||||  |  | ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | |    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  341 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||  ||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 424
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296257
Alignment:
Q  60 aggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||  ||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    || || |  | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaa 296091  T
Q  258 attgt-gcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||  |  ||| |  |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   ||||||    
T  296092 attatatccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgat 296187  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    |||| | || |||||||| | | |||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  296188 gaattactgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493978
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441770
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 15441770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262335
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 30262335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126738
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516284
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgat 11516284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936949
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111201
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7283987
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377867
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13377867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtta 73  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915009
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 228  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 16915009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatc----attttgtgatttttcaaatgttgtatgaatttt 127  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 17224075 - 17224230
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| |||||||||   || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |   |||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  17224075 atgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattca 17224174  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  17224175 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaattg 17224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 506
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37440
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 331  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  332 tgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 37365  T
Q  432 tgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37366 tgaattgatgaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgat 37440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41632
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394191
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 41394503  T
Q  115 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttgg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41394502 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttgg 41394403  T
Q  215 ttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg 313  Q
    | || || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||    
T  41394402 tgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttg 41394303  T
Q  314 tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaattgttgtt 412  Q
      ||||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41394302 ctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgtt 41394203  T
Q  413 ggtgttttggtg 424  Q
    ||||||||||||    
T  41394202 ggtgttttggtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445646
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgat-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  155 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 254  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  255 aaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 353  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931312
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531411
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| ||||||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgat 20531484  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531483 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893933
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaatttt-caaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913004
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844746
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  255 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 353  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116228
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctat-gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227777
Alignment:
Q  143 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22227862  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227861 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232474
Alignment:
Q  143 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattga 22232559  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232558 tgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601402
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |  |||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051416
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 342  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  |||||||||                      
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatg------------------ 45051493  T
Q  343 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051492 -ttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860334
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  16 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452549
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgat 51452549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218743
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 75  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 41218743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675120
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatc 88  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376768
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 406 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19795011
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatg 19794684  T
Q  115 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 212  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19794685 ttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 19794784  T
Q  213 ggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 311  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19794785 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattct 19794884  T
Q  312 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgt 411  Q
    ||| ||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19794885 tgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaatttttgt 19794984  T
Q  412 tggtg-ttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19794985 tggtgtttttggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982737
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  155 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  255 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 353  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 427
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627609
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgat-ttttcaaat 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaat 20627294  T
Q  114 gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttg 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20627295 attgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttg 20627394  T
Q  214 gttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattctt 312  Q
    || ||||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | ||||||    
T  20627395 gtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattctt 20627494  T
Q  313 gtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgtt 412  Q
    || |||||||| || | | || |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  20627495 gttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtt 20627594  T
Q  413 ggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||||| |||||    
T  20627595 ggtgttttgatgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 427
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43643250
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatg 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 43642937  T
Q  115 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 212  Q
    |||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43642938 ttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 43643037  T
Q  213 ggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattct 311  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||    
T  43643038 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattct 43643137  T
Q  312 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgt 411  Q
    ||| ||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||   | |||    
T  43643138 tgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga---gatgt 43643234  T
Q  412 tggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||| |||||    
T  43643235 tggtgttttgatgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462706
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||  |  |||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891209
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 8891282  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891281 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341681
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 251  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  252 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 350  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  351 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265679
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     || |||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396948
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 329  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     ||| || | ||| ||||  || ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 424
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  182 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 281  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||| | ||||||||     
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  282 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 379  Q
    | | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  7507994 ctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatatt 7508092  T
Q  380 catggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508093 catggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275045
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284278
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633538
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 499
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689600
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 19689600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906646
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 14906646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015068
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 20015068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820128
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 23820128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646232
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660221
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 19660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669335
Alignment:
Q  316 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtat 19669335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 90
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25305826 - 25305769
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25305826 taggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttag 25305769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1091
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgat-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 355  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| || | |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  356 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3877
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48565
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  266 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattg 363  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  |||  ||||||||| ||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  364 cttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 57 - 427
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37209
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  155 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  255 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 353  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15383
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttag 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506932
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182854
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 419
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531355
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  153 cgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  253 tgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagtt 351  Q
    |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | |||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  352 gatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054125
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 251  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  252 atgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 350  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  351 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttga 295  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939248
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 298
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  134 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  234 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 427
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778276
Alignment:
Q  147 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 246  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  247 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 344  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  345 tatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 408
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200251
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgt 408  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 427
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443679
Alignment:
Q  147 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgag 246  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  247 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 344  Q
    |||||||||| |||||||  ||| | |||||||    |  ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| |    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  345 tatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009809
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 318 - 437
Target Start/End: Original strand, 17471768 - 17471887
Alignment:
Q  318 attgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 417  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471768 attgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgt 17471867  T
Q  418 tttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  17471868 tttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgc 264  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 420
Target Start/End: Original strand, 29190478 - 29190552
Alignment:
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29190478 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623026
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 20623026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233734
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 21233734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900611
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 25900611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052801
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgat 37052801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536254
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattgtagttgat 16536254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584389
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttag 11584389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19862319 - 19862186
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||  ||||    
T  19862319 atgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattca 19862220  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtg 416  Q
    ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19862219 tgatttgatgatgagaa-atgagttgttgttggtg 19862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222519
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttag 21222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493885
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||  ||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  |||||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatgagaa-ataagttgttgttgttggtttggtgaaa 23493885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950861
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 32950861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5450752
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttag 5450752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310750
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaa 21310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981557
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23981557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918131
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 29918131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153403
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||| | ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 420
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626407
Alignment:
Q  59 aaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 158  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||| |||   | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  159 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 258  Q
    |   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  259 ttgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaa 357  Q
    |||||   ||| | |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||| |||||||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 14626344  T
Q  358 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14626345 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009735
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1658040
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862443
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 420
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 342  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  343 gttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25175901 - 25175531
Alignment:
Q  59 aaggtaagggggttagtctttaccataatcatc-atcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||  |||||||  ||||||||||||  | |||| ||| |  |||  |||||||||||||    
T  25175901 aaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataattttgc-atttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 25175803  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    |||   || || || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  25175802 ctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 25175703  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
     ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  |||||    
T  25175702 gattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 25175603  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175602 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826038
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaa 241  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  242 atgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatg--ttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaata 339  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||  | |   |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||       
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  340 gatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| ||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983224
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015089
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaatttt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  291 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgat 390  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||| | || |||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  391 gatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 438
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381975
Alignment:
Q  284 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcat 382  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 18381920  T
Q  383 ggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18381921 gatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583640
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 215  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt-- 229  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  230 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 328  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  329 tg 330  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623506
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361676
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 22361676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 413
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362032
Alignment:
Q  307 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcatggattgatgatgagaatttgaat 405  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||||| |||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaa-ttgagt 22362024  T
Q  406 tgttgttg 413  Q
    ||||||||    
T  22362025 tgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 90
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887833
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaa 16887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629689
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtt 228  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 18629689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  409 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136054
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 35136054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 398
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367490
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |  | ||| | |||| |||||||| | |||| ||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattca 25367473  T
Q  382 tggattgatgatgagaa 398  Q
    || |||| |||||||||    
T  25367474 tgaattgttgatgagaa 25367490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 61 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19173
Alignment:
Q  61 ggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 19244  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19243 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21257
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41686
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||| ||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 882 - 1250
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||   | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  |||||||  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12083
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 355  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  356 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6358
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   ||||||  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128464
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| |  ||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 408
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  266 aaatggatgaatttgacat---gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcatt 362  Q
     ||| | |||||||  | |   ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || ||||  ||||||||| |||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  363 gcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgt 408  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247738
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  256 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgat 354  Q
    |||||||||  ||| | | || ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||| | ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  355 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171863
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| || | ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttgttaagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177566
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| || | ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttgttaagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123460
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  155 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 254  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  255 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttga 353  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 438
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  406 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8846
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 58 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8820
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 151  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  152 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 251  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  252 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagt 350  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||| | ||    
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgt 8893  T
Q  351 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8892 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148688
Alignment:
Q  106 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  204 atgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 302  Q
    | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | |||||     
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgaga 148813  T
Q  303 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttg 402  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  148812 tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgagaatttg 148713  T
Q  403 aattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  148712 aattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  158 t 158  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26710
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  257 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatg 355  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  356 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8466
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     || |||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6934
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 427
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5356
Alignment:
Q  68 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaacttt 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  167 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaa 266  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  267 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgct 365  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  366 tgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 271983
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  158 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  258 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatga 356  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  357 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 437  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |   |||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgttatagagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22597
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 22597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26852
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 26852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 298
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 298  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1788
Alignment:
Q  453 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgat 1788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48155
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 337  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  338 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20493
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51314
Alignment:
Q  60 aggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 159  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  160 caactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat 259  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  260 tgtgc 264  Q
    |||||    
T  51310 tgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13480
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     || |||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42677
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 132 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41622
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 41712  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
     || |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41711 ttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107715
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 337  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  338 tagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64812
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 340  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  341 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    || ||||  || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 189
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  147 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 425
Target Start/End: Original strand, 534 - 828
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  331 atgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtga 425  Q
     ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 255  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  256 aaattgtgc 264  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 183
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  156 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 183  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 79616 - 79533
Alignment:
Q  316 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcatggattgatgatgagaa 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||    
T  79616 caattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaa 79533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79745
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 79745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 132 - 424
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34755
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaa 231  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  232 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 329  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  330 gatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 424  Q
    | || || | |||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  143 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 340  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  341 atgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 420
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  266 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 364  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  365 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 420
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  266 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 364  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  365 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 420  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  167 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaa 266  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  267 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 364  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||||  ||||||||| |||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  365 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  296 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 395  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  396 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  239 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 264  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 427
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  182 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttg 280  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  281 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttc 380  Q
        ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  381 atggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5453 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  149 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  182 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa-tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttg 280  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||   ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  281 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 379  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||| ||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  380 catggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 3
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 247  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  248 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 345  Q
    ||||||| | |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  346 atagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||  || |||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30492 - 30417
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  30492 catagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 427
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  166 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 265  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  266 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgc 364  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | ||||||||  ||||||||| |||||    
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  365 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21399
Alignment:
Q  143 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaa 242  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  243 tgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 341  Q
    ||| |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttga 21314  T
Q  342 tgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21315 tgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgc 264  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80187
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48482
Alignment:
Q  305 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 404  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 48504  T
Q  405 ttgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  48503 ttg-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166197
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatc 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  16 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatc 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116467
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 116467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31212
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 427
Target Start/End: Original strand, 26 - 147
Alignment:
Q  305 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaa 404  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 125  T
Q  405 ttgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  126 ttgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  16 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  16 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 264
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  144 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgtttaaatatgtagaaat 243  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  244 gagaagttatgaaaattgtgc 264  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 309 - 385
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatcatc 91  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54412
Alignment:
Q  182 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 278  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  279 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatgt 378  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||| | || | ||||||||   |||||||||||| |    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  379 tcatggattgatgatgagaa 398  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatgagaa 54412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45094
Alignment:
Q  182 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 278  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||||| |||||  ||||| || ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  279 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 330  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45051 - 45007
Alignment:
Q  354 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 398  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45051 tgaatcatgacttgggtatacatatttatggattgatgatgagaa 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1701
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 19807 - 19881
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24185
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1863 - 1815
Alignment:
Q  378 ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1863 ttcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3252 - 3183
Alignment:
Q  350 ttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttt 419  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3252 ttgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3364
Alignment:
Q  132 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaatt 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaatt 3364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  19 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  15 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttaccataatca 89  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 257
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  139 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  237 tagaaatgagaagttatgaaa 257  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35816
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 76984 - 77139
Alignment:
Q  283 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 381  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| || |  ||||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  76984 atgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattca 77083  T
Q  382 tggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||  ||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77084 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76756
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttag 76756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 132420 - 132542
Alignment:
Q  316 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttgg 414  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| | | |||| | |||| |||||||| | |||| ||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||    
T  132420 caattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaat-gaaatgttgttgg 132518  T
Q  415 tgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  132519 tgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1420
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttag 1420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 257
Target Start/End: Original strand, 10256 - 10458
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgatttttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 156  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||||  ||| ||| ||  |||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  10256 taaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 10355  T
Q  157 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattccatgttt--aaatatgtagaaatgagaagttatg 254  Q
    |||   || ||||||||| ||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| |||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  10356 ctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatg 10455  T
Q  255 aaa 257  Q
    |||    
T  10456 aaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 186
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1386
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 186  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 186
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9641
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 186  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 632
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    
T  689 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6999
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7056 taggagctaaagtgaaggttgggctaggaattggtgataattatggtaagggggttag 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  409 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22463
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaa 22463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43708
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 43708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  409 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  148 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31357
Alignment:
Q  17 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 74  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 31357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 90
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  57 ttaaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2476
Alignment:
Q  316 caattgatgttgttgatgctaatagatgttatagttgatgaatcattgcttgggtat 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtat 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10868
Alignment:
Q  149 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 189  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaa 10868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  58 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University