View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19605_high_13 (Length: 320)

Name: NF19605_high_13
Description: NF19605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19605_high_13
NF19605_high_13
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (5-294)||(589-878)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-294)||(111514-111803)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (5-294)||(34130423-34130712)
chr5 (5-294)||(27274115-27274404)
chr5 (5-294)||(31916845-31917134)
chr5 (5-294)||(37298748-37299037)
chr5 (8-294)||(37817633-37817917)
chr5 (8-294)||(13571617-13571903)
chr5 (5-294)||(22173186-22173473)
chr5 (5-294)||(4037913-4038202)
chr5 (5-294)||(20764389-20764676)
chr5 (77-294)||(30943802-30944019)
chr5 (77-294)||(30953224-30953441)
chr5 (5-294)||(42090452-42090739)
chr5 (77-294)||(37548613-37548828)
chr5 (72-294)||(19888353-19888577)
chr5 (72-294)||(21681676-21681902)
chr5 (72-271)||(18209806-18210005)
chr5 (72-271)||(18219144-18219343)
chr5 (77-294)||(37648007-37648222)
chr5 (5-294)||(205413-205698)
chr5 (5-130)||(19780782-19780906)
chr5 (5-294)||(20896986-20897272)
chr5 (5-243)||(20904468-20904706)
chr5 (41-145)||(21483777-21483880)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (5-294)||(16629566-16629855)
chr4 (77-294)||(17828316-17828533)
chr4 (77-294)||(17837707-17837924)
chr4 (5-294)||(7846488-7846777)
chr4 (5-294)||(16210908-16211196)
chr4 (5-221)||(44888847-44889062)
chr4 (50-294)||(16396956-16397199)
chr4 (90-294)||(53946108-53946312)
chr4 (84-294)||(2829595-2829790)
chr4 (10-84)||(14600416-14600491)
chr4 (5-62)||(2829788-2829845)
chr4 (5-61)||(53946050-53946103)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (5-294)||(45190870-45191159)
chr2 (5-278)||(574314-574587)
chr2 (46-294)||(37862797-37863045)
chr2 (5-294)||(12570620-12570907)
chr2 (5-291)||(22687410-22687692)
chr2 (139-294)||(16902674-16902829)
chr2 (139-294)||(16996065-16996220)
chr2 (5-294)||(3605662-3605945)
chr2 (50-118)||(69861-69928)
chr2 (5-39)||(37862787-37862821)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (5-294)||(20744804-20745093)
chr3 (8-294)||(19827976-19828260)
chr3 (77-294)||(2489372-2489589)
chr3 (77-294)||(13119771-13119988)
chr3 (5-294)||(20293068-20293355)
chr3 (77-278)||(4782774-4782975)
chr3 (6-294)||(12376585-12376872)
chr3 (46-294)||(51978537-51978784)
chr3 (8-70)||(10011959-10012021)
chr3 (15-70)||(16335182-16335237)
chr3 (50-84)||(10508439-10508473)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (5-294)||(24505139-24505428)
chr6 (5-294)||(16321343-16321630)
chr6 (5-294)||(16333491-16333778)
chr6 (6-293)||(18712013-18712298)
chr6 (77-294)||(26020914-26021131)
chr6 (72-294)||(1596488-1596710)
chr6 (6-223)||(18706078-18706295)
chr6 (5-294)||(790958-791245)
chr6 (5-294)||(26168401-26168724)
chr6 (5-98)||(30657892-30657984)
chr6 (121-294)||(30657981-30658149)
chr6 (59-221)||(17824204-17824366)
chr6 (15-61)||(17826125-17826171)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (1-294)||(14881421-14881714)
chr8 (5-294)||(14893775-14894064)
chr8 (5-294)||(31991391-31991679)
chr8 (5-294)||(33773868-33774157)
chr8 (5-294)||(31998980-31999267)
chr8 (5-294)||(20531059-20531346)
chr8 (77-294)||(13674287-13674504)
chr8 (5-294)||(5759434-5759721)
chr8 (46-294)||(23014785-23015028)
chr8 (5-221)||(11430407-11430622)
chr8 (19-84)||(20851721-20851787)
chr8 (46-145)||(2690039-2690137)
chr8 (50-145)||(31224485-31224579)
chr8 (5-33)||(2690029-2690057)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (5-294)||(24540560-24540849)
chr7 (5-278)||(45553251-45553524)
chr7 (46-294)||(19585808-19586056)
chr7 (77-294)||(27988548-27988765)
chr7 (5-278)||(10415751-10416022)
chr7 (5-261)||(12491397-12491652)
chr7 (61-278)||(12515188-12515404)
chr7 (5-145)||(9007118-9007258)
chr7 (5-39)||(19586032-19586066)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (5-294)||(20317781-20318070)
chr1 (5-294)||(20308902-20309191)
chr1 (15-294)||(27066122-27066401)
chr1 (5-294)||(26193187-26193466)
chr1 (8-276)||(20314482-20314750)
chr1 (5-294)||(22960925-22961211)
chr1 (5-294)||(49333379-49333667)
chr1 (5-294)||(18096673-18096959)
chr1 (5-172)||(20328263-20328430)
chr1 (5-294)||(25039152-25039441)
chr1 (5-278)||(25823191-25823463)
chr1 (5-278)||(4950578-4950847)
chr1 (5-140)||(25044364-25044499)
chr1 (5-214)||(37012105-37012313)
chr1 (90-278)||(41543915-41544101)
chr1 (5-145)||(21792926-21793066)
chr1 (90-221)||(19748364-19748495)
chr1 (50-278)||(21821220-21821446)
chr1 (5-118)||(22956797-22956910)
chr1 (248-294)||(37012037-37012080)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (5-278)||(23211-23484)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (8-294)||(29034-29320)
scaffold0058 (210-243)||(55415-55448)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (5-278)||(952-1225)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (5-294)||(18794-19081)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (8-294)||(1709-1995)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (5-294)||(146726-147013)
scaffold0014 (5-215)||(114280-114489)
scaffold0014 (131-291)||(153389-153547)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (77-294)||(13244-13462)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (5-294)||(1360-1648)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (6-294)||(7461-7748)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (5-142)||(58777-58914)
scaffold0018 (5-142)||(60205-60342)
scaffold0018 (5-142)||(54825-54962)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (5-145)||(15602-15742)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (50-278)||(11363-11589)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (36-145)||(4537-4642)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (22-84)||(16325-16388)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-84)||(216887-216962)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (5-116)||(197130-197241)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (19-76)||(6735-6793)
scaffold0121 (97-145)||(6783-6831)


Alignment Details
Target: scaffold0553 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 589 - 878
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  589 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctctgttcttcataagaatgtttgattttcatgatgttcttc 688  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  689 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcttggaccatccattacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 788  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  789 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 111514 - 111803
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  111514 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 111613  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111614 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 111713  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  111714 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 111803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 34130423 - 34130712
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  34130423 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 34130522  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34130523 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaatgttacttctcc 34130622  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34130623 aaatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtagaaaaaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 34130712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 27274115 - 27274404
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27274115 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 27274214  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274215 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttcctgggtccatccaatacatgacaggggatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 27274314  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27274315 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 27274404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31917134 - 31916845
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  31917134 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttt 31917035  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31917034 atcggggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttcctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctcc 31916935  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31916934 atatgcatcaaaagtttcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaaagaggatagtggatctg 31916845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 37298748 - 37299037
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37298748 gtgaacattctgaacatcataatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 37298847  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37298848 atctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtgtctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttatatccttcaaaagttacttctcc 37298947  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37298948 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctg 37299037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37817917 - 37817633
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  37817917 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatattcatgatgttcttcatc 37817818  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37817817 tgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 37817718  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  37817717 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaccaaatctgtcttggatttggtgcaggagag--aggatcgtggatctg 37817633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 13571617 - 13571903
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  13571617 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatc 13571716  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571717 tgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 13571816  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13571817 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaccaaatctgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctg 13571903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 22173186 - 22173473
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22173186 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 22173285  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173286 atctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 22173385  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22173386 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaccaaatctgtcttggatttggtgcaggagag--aggatagtggatctg 22173473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 4037913 - 4038202
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4037913 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 4038012  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4038013 atctgggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctgagttcatccaatacgtgacctgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctcc 4038112  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4038113 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatatgtcttggatttggtgaaggagagagaggatagtggatctg 4038202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20764676 - 20764389
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  20764676 gtgaactttctgaacatcataatgttgttgtgttcccaggatgaaaatcagaatgttgctgtgttctgcattggaatgtttggtattcatgatgttcttc 20764577  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20764576 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctcc 20764477  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20764476 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggactttgtgcaggagagagaggatagtggatctg 20764389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 30943802 - 30944019
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30943802 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 30943901  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30943902 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 30944001  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  30944002 gagaggatagtggatctg 30944019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 30953224 - 30953441
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30953224 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctggattcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 30953323  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30953324 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 30953423  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  30953424 gagaggatagtggatctg 30953441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 42090452 - 42090739
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  42090452 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaatatcagaatgttgatgtgttgttcaccagaacgtttggtattcatgatgttcttc 42090551  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  42090552 atctaggttcatcaacgatgaatgtctgatgagtttatgagtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttacccttaaaaagttacttctcc 42090651  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42090652 atatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaaatt--accaaatctgtcttggacttggtgcatgagagagaggatagtggatctg 42090739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 37548613 - 37548828
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37548613 agaatgtttaatattcataatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 37548712  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37548713 agttttatccttcaaaagttacttctccat-tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttg-attaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 37548810  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  37548811 gagaggatagtggatctg 37548828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 294
Target Start/End: Original strand, 19888353 - 19888577
Alignment:
Q  72 tcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagattt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||    
T  19888353 tcatcagaatgtttgatattcatgatgctcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 19888452  T
Q  172 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888453 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 19888552  T
Q  272 --ggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
       |||||| |||||||||||||||    
T  19888553 agagagagagaggatagtggatctg 19888577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21681902 - 21681676
Alignment:
Q  72 tcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagattt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||    
T  21681902 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 21681803  T
Q  172 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681802 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 21681703  T
Q  272 ----ggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
         |||||| |||||||||||||||    
T  21681702 aaagagagagagaggatagtggatctg 21681676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Original strand, 18209806 - 18210005
Alignment:
Q  72 tcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagattt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||    
T  18209806 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 18209905  T
Q  172 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18209906 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 18210005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Original strand, 18219144 - 18219343
Alignment:
Q  72 tcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagattt 171  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||    
T  18219144 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 18219243  T
Q  172 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18219244 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 18219343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 37648007 - 37648222
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37648007 agaatgtttaatattcataatgttcttcgtctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 37648106  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37648107 agttttatccttcaaaagttacttctccat-tgcatcaaaagttgcttgaaaaaataggataaagttg-attaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 37648204  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  37648205 gagaggatagtggatctg 37648222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 205413 - 205698
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  205413 gtgaacattctgaccatcataatgttgttgtgtttccaagatgaacaccagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 205511  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    | |||| |||||||||| |||||||   |||||||||  | |||||| |||||||    
T  205512 atttgggttcatcaatgatgaatgtcttatgagtttctaggtttgttcaatttgtgacatgatatttgtt-gggttttatccaccaaaaagtaacttctc 205610  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  205611 catatgcatcaaaagttgttggataaagtaggataaagtt--atcaaatctgtcttggacttggtgcaggagagaga-gatagtggatctg 205698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19780906 - 19780782
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19780906 gtgaatattttgaccatcagaatgttgttgtgttcccatgatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 19780808  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtc 130  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||    
T  19780807 atctaggttcatcaatgatgaatgtc 19780782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20897272 - 20896986
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttccca-ggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||| ||    
T  20897272 gtgaacattcggttcatcagaatgttgttgtgttttcaaggatgaacattagaatgttgttgtgttcttcataagaatg-atgatgtttatgatgttatt 20897174  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctc 203  Q
    ||  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||     | ||||  ||| |||  ||||| |  | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  20897173 catctgggttcatctttgatgaatgtatgatgagtttctggatttgttcaatgcgtgccatatgattt-tctaggctttatccataaaaagttacttctc 20897075  T
Q  204 catatgcatc-aaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
     ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||  ||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  20897074 tatatgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagtt-aaccaaatctgcattgaacttggtgcaggagag--agaatagtggatctg 20896986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 243
Target Start/End: Original strand, 20904468 - 20904706
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttccc-aggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||  ||||||| ||    
T  20904468 gtgaacattctgaccatcagaatgttcttgtgttttctaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaacg-ttaatttttttgatgttttt 20904566  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctc 203  Q
    ||  | |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    | |||| |||| |||  ||||| | | || ||||||| | ||||||||||||||    
T  20904567 catctaggttcatcattgatgaatgtatgatgaatttctgggtttgttcaatgtgtgccatatgattt-tccgagctttatccataaaaagttacttctc 20904665  T
Q  204 catatgcatc-aaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 243  Q
    ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20904666 catttgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagtt 20904706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 145
Target Start/End: Original strand, 21483777 - 21483880
Alignment:
Q  41 caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||| ||||||  | ||||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  21483777 caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatg-ttgatgttcattatgatcttcatctaggttcattatttatgaatgtatgatgagttt 21483875  T
Q  141 ctggg 145  Q
    |||||    
T  21483876 ctggg 21483880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16629855 - 16629566
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16629855 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 16629756  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629755 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 16629656  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16629655 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 16629566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 17828316 - 17828533
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17828316 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 17828415  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17828416 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 17828515  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  17828516 gagaggatagtggatctg 17828533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 17837707 - 17837924
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17837707 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 17837806  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17837807 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 17837906  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  17837907 gagaggatagtggatctg 17837924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 7846488 - 7846777
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  7846488 gtgaacattctgaacttcagaatgttgttgtgttcctaggatgaacatcagcatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttaatattcatgatgttcttc 7846586  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctc 203  Q
    |  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    | ||| | |||||||||||||||||   | |||||||| ||||| || |||||||    
T  7846587 atctgggttcttcaatgatgaatgtcagatgagtttctgggctagttcaagacgtgacatgagatttgtt-gggctttatcctccaaaaggtgacttctc 7846685  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttgga-tttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7846686 catatgcagcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatatgtcctggattttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 7846777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 16210908 - 16211196
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16210908 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcctaggatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 16211006  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||   ||||||||||||||||| | | |||||||  | |||||| |||||||    
T  16211007 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-aggctttatccagcaaaaagtaacttctc 16211105  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16211106 catatgcatcaaaaattgctggataaagtaggataaagttgattcaaatcttccttggatattgtgcaggagagagaggatagtgggtctg 16211196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44889062 - 44888847
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  44889062 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcccatgatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 44888964  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  |  ||||||| || |||||| |||||||    
T  44888963 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttatccaatacgtgacatgagatttgttgga-ctttatccatcaaaaagtaacttctc 44888865  T
Q  204 catatgcatcaaaagttg 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44888864 catatgcatcaaaagttg 44888847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16397199 - 16396956
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggacca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        
T  16397199 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatatctatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaaagtctgatgagtttctgggtttt 16397101  T
Q  150 tccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatc 248  Q
      ||| | |||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |    
T  16397100 ctcaagacgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttcttcatatgcattaaaagttgctggataaagtaagataaagttgaacc 16397002  T
Q  249 aaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16397001 aaatctgtcttggtcattgtgcaggagagagaggatagtggatctg 16396956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 294
Target Start/End: Original strand, 53946108 - 53946312
Alignment:
Q  90 ttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc 189  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||   ||| |||||||||||||   | |||||||  |    
T  53946108 ttcatgacgttcttcatatgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtggcatgagatttgttgg-gctttatccacc 53946206  T
Q  190 aaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtg 288  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  53946207 aaaaagtaacttttccatatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagttgattcaaatatgtcttggtctttgtgcaggagagagaggatagtg 53946306  T
Q  289 gatctg 294  Q
    | ||||    
T  53946307 ggtctg 53946312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2829790 - 2829595
Alignment:
Q  84 ttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagtttta 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||   |||||||| |||||||||||||||||   | ||||    
T  2829790 ttgatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtttgatgagtttatcggtttatccaatacgtgacatgagatttgtt-gggcttta 2829692  T
Q  184 tccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaagg 282  Q
    |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |    
T  2829691 tccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgat----------ggataaagtt--atcaaatctgtcttggacttgatgcaggagaga---g 2829607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Original strand, 14600416 - 14600491
Alignment:
Q  10 cattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtt 84  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14600416 cattctgaccaccagaatgttgttgtgttcttcaggatgaacattagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt 14600491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2829845 - 2829788
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttg 62  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2829845 gtgaacattctgaccattagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcataatgttg 2829788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 53946050 - 53946103
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgtt 61  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  53946050 gtgaacattctgaccatcaaaatgttgt---gttcccaggatgaacatcagaatgtt 53946103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45191159 - 45190870
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45191159 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 45191060  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191059 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 45190960  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45190959 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 45190870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 574587 - 574314
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  574587 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttgatattcgtgatgttcttc 574488  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  574487 atctaggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctgggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctcc 574388  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  574387 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatttgtcttggatttggtgcaggagaga 574314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Original strand, 37862797 - 37863045
Alignment:
Q  46 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862797 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatattcctgatgttcttcatctaggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 37862896  T
Q  146 accatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttga 245  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37862897 tccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaaataggataaagttga 37862996  T
Q  246 atcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37862997 ttcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 37863045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12570907 - 12570620
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12570907 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttc 12570808  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12570807 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtctatccaatacatgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctcc 12570708  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12570707 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttagaatttgtgcaggagagagtggatagtggatctg 12570620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Original strand, 22687410 - 22687692
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687410 gtgaacattttgaacatcagaatgttgttgagttcccaagatgaacatcagaatgttgt-gtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 22687508  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687509 atctgggttcatcattgatgaatgtttgatgagtttctgggttcatccaatacgtgacatgagatttcttcaggttttatccttaaaaagttacttctcc 22687608  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggat 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22687609 atatgcatcaaaagttgcttg-aaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggacttcgtgcaggagagagaggatagtggat 22687692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 16902674 - 16902829
Alignment:
Q  139 ttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902674 ttctgggtccatccaatacgtgacataagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 16902773  T
Q  239 aagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16902774 aagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 16902829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 16996065 - 16996220
Alignment:
Q  139 ttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 238  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996065 ttctgggtccatccaatacgtgacataagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 16996164  T
Q  239 aagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16996165 aagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 16996220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 3605662 - 3605945
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3605662 gtgaacattctgaccatcataatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 3605760  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||| ||||||||||||   | |||||||  | |||||| |||||||    
T  3605761 atctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtttatccaatacgtgatatgagatttgtt-gggctttatccaccaaaaagtaacttctc 3605859  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3605860 catatccatcaaaagttgatggataaagtatgataaagtt--atcaaatctgtcttggacttggtgcaggagaga---gatagtggatctg 3605945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 118
Target Start/End: Original strand, 69861 - 69928
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  69861 catcagaatgttgttatgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcatggtcttcatttgggttcatca 69928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Original strand, 37862787 - 37862821
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37862787 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttc 37862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 20744804 - 20745093
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20744804 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgaatttccaggatgaacatcagaattttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 20744903  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20744904 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 20745003  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20745004 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaactaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 20745093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 19827976 - 19828260
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  19827976 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatc 19828075  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828076 tgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 19828175  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19828176 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagag--aggatagtggatctg 19828260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 2489372 - 2489589
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2489372 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcttggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 2489471  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489472 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 2489571  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  2489572 gagaggatagtggatctg 2489589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 13119771 - 13119988
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13119771 agaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 13119870  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13119871 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtaggaga 13119970  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  13119971 gagaggatagtggatctg 13119988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20293355 - 20293068
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20293355 gtgaacattctgaacatcggaatgttgttttgttcccaggatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgaagttcttc 20293256  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20293255 atctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgtccaatacgtgacttgagatttgttcaggttttatccttaaaaatttacttctcc 20293156  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20293155 atatgcatcaaaagttgctgaaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggactttgtgcaggagagagaggatagtggatctg 20293068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 278
Target Start/End: Original strand, 4782774 - 4782975
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4782774 agaatgtttaatattcatgattttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 4782873  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4782874 agttttatccttcaaaagttacttcaccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggttcaggaga 4782973  T
Q  277 ga 278  Q
    ||    
T  4782974 ga 4782975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12376872 - 12376585
Alignment:
Q  6 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttca 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12376872 tgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgtttccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ctgatattcatgatgttcttca 12376774  T
Q  106 gttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcca 205  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    | ||||  ||||||| ||||||||| | | |||||||   |||||| ||||| |||    
T  12376773 tttgggttaatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaatgcgtgacataagatttgtt-aggctttatccacaaaaagtaacttcacca 12376675  T
Q  206 tatgca-tcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12376674 tatgcagccaaaatttgctggataaagtaggataaagttgaaccaaatctgacttggacattgtgcaggagagagaggatagtggatctg 12376585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Original strand, 51978537 - 51978784
Alignment:
Q  46 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51978537 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgataagtttctggg 51978635  T
Q  146 accatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatcc-ttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttg 244  Q
        | |||   |||||||||||||||||   | |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||    
T  51978636 tttgttcaaggagtgacatgagatttgtt-gggctttatccacaaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagtcgctggataaagtaggataaaattg 51978734  T
Q  245 aatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    | ||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  51978735 attcaaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctg 51978784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 10011959 - 10012021
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttc 70  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10011959 aacattatgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttc 10012021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Original strand, 16335182 - 16335237
Alignment:
Q  15 tgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttc 70  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335182 tgaacatcagaatgttgctgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttc 16335237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 84
Target Start/End: Original strand, 10508439 - 10508473
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10508439 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt 10508473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 24505139 - 24505428
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24505139 gtgaacattctgaacttcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 24505238  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24505239 atctgggttcatcaaggataaatgtctaatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 24505338  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24505339 atatgcatcaaaagtttcttgaaaaagtaggataaatttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 24505428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16321630 - 16321343
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16321630 gtgaacattctaaccattagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgtagctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 16321531  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16321530 atttgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttcattcaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctcc 16321431  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16321430 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggattttctgcaggagagagaggatagtggatctg 16321343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16333778 - 16333491
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16333778 gtgaacattctaaccattagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgtagctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 16333679  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16333678 atttgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttcattcaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctcc 16333579  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16333578 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggattttctgcaggagagagaggatagtggatctg 16333491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Original strand, 18712013 - 18712298
Alignment:
Q  6 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  18712013 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcaaaatgtttggtattcatgatgttcttca 18712112  T
Q  106 gttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcca 205  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18712113 tctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctcca 18712212  T
Q  206 tatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatct 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18712213 tatgcatcaaaagttgctggaaaaagtaggataaagtt--accaaatatgtcttggactttgtgcaggagagataggatagtggatct 18712298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 26020914 - 26021131
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26020914 agaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 26021013  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26021014 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 26021113  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  26021114 gagaggatagtggatctg 26021131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1596710 - 1596488
Alignment:
Q  72 tcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagattt 171  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  1596710 tcatcagaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcttggtccatccaatacgtgacatgagattt 1596611  T
Q  172 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1596610 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttaattcaaatctgtcttggatttggtgca 1596511  T
Q  272 ggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||| |||||| ||||||||    
T  1596510 ggagagagaggataatggatctg 1596488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 18706078 - 18706295
Alignment:
Q  6 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  18706078 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcaaaatgtttggtattcatgatgttcttca 18706177  T
Q  106 gttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcca 205  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18706178 tctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctcca 18706277  T
Q  206 tatgcatcaaaagttgct 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18706278 tatgcatcaaaagttgct 18706295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 790958 - 791245
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  790958 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 791056  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||   ||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||| |||||||    
T  791057 atctgagttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttttctcaaggcgtgacatgagatttgtt-aggttttatccaccaaaaagtaacttctc 791155  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  791156 catatgcataaaaagctgctggataaagtaggataaagttgaaccaaatctgccttggatattgtgcagga-agagaggatagtggatctg 791245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26168724 - 26168401
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgt--------------------- 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||                         
T  26168724 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccagtatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaat 26168625  T
Q  84 -ttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgg------------gac--catccaatatgtgacatgaga 168  Q
     ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            | |   |||||||| |||||||||||    
T  26168624 gttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggctttatccaattggctttatccaatacgtgacatgaga 26168525  T
Q  169 tttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  26168524 tttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgctggaaaagttaggataaagtt--accaaatctgtcttggatttggt 26168427  T
Q  269 gcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  26168426 gcaggagagagaggatagtggatctg 26168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 30657892 - 30657984
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  30657892 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatgatg 30657984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 294
Target Start/End: Original strand, 30657981 - 30658149
Alignment:
Q  121 gatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagt 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30657981 gatgaatgtttgatgagtttctgagtttatccaatacgtgacatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagt 30658079  T
Q  220 tgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    || | || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  30658080 tgatggataaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggacttggtgcaggagaga---gatagtggatctg 30658149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17824366 - 17824204
Alignment:
Q  59 gttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatg 158  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||| ||||      
T  17824366 gttgctgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctggatttatctaataca 17824267  T
Q  159 tgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttg 221  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17824266 tgacatgagatttgtt-gggctttattcaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttg 17824204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17826171 - 17826125
Alignment:
Q  15 tgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgtt 61  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17826171 tgaacattagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgtt 17826125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14881421 - 14881714
Alignment:
Q  1 ctgagtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14881421 ctgagtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttctttattagaatgtttgatattcatgatgtt 14881520  T
Q  101 cttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttactt 200  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881521 cttcatctgggtttatcaaggatgaatgtcagatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttactt 14881620  T
Q  201 ctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14881621 ctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 14881714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 14893775 - 14894064
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14893775 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttctttattagaatgtttgatattcatgatgttcttc 14893874  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893875 atctgggtttatcaaggatgaatgtcagatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 14893974  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14893975 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 14894064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 31991391 - 31991679
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31991391 gtgaacattctgaacatcagaatgt-gttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 31991489  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31991490 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctaggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 31991589  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31991590 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagttgaatcaaatatgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 31991679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 33773868 - 33774157
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33773868 gtgaacattctgaacatcagaatattgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgatattcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 33773967  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33773968 atctgggatcatcaaggatgaaagtctgatgagtttctgggtcaatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctcc 33774067  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33774068 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 33774157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 31998980 - 31999267
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31998980 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaattttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 31999079  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31999080 atctgggttcatcaaggatggatgtctgatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagattttttcaagttttatccttcgaaagttacttctcc 31999179  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31999180 atatgcatcaaaagttgctcgaaaaagtaagataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagag--aggatagtggatctg 31999267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 20531059 - 20531346
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20531059 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcctaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 20531158  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20531159 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgagttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctcc 20531258  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20531259 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatttgtcttggattttgtgcaggagagagaggatagtggatctg 20531346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13674504 - 13674287
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13674504 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 13674405  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13674404 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaaa 13674305  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  13674304 gagaggatagtggatctg 13674287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5759721 - 5759434
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5759721 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcctagtatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 5759622  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  5759621 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgtccaatgcgtgacataagatttgttcaaattctatccttaataagttacttctcc 5759522  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5759521 atatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggataatggatctg 5759434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Original strand, 23014785 - 23015028
Alignment:
Q  46 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23014785 tgaacatcataatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatatctgatgagtttctgga 23014884  T
Q  146 accatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttg 244  Q
       |||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  23014885 tttatccaatacgtgacatgagatttgtt-gagctttattcaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgatggataaagtaggataaagtt- 23014982  T
Q  245 aatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  23014983 -accaaatctgtcttggatttggtgtaggagaga---gatagtggatctg 23015028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 11430407 - 11430622
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  11430407 gtgaacattttgaccatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatatccatgatgttcttc 11430505  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||   |||||||||||||||||   | |||||||  | |||||| |||||||    
T  11430506 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-gggctttatccaccaaaaagtaacttctc 11430604  T
Q  204 catatgcatcaaaagttg 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11430605 catatgcatcaaaagttg 11430622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20851787 - 20851721
Alignment:
Q  19 catcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtt 84  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20851787 catcagaatgttgttgtcttcttcaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt 20851721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 145
Target Start/End: Original strand, 2690039 - 2690137
Alignment:
Q  46 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||    
T  2690039 tgaacatcagaatgttgttatgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcatgacaatcagttgggttcatcatttatgagtgtatgatgagtttctggg 2690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Original strand, 31224485 - 31224579
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||   ||||  |||||||||||   |||||||  |||||||||||||||    
T  31224485 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcatgacattcatatgggttcatcatttatgaatgaatgatgagtttctggg 31224579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 33
Target Start/End: Original strand, 2690029 - 2690057
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgtt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2690029 gtgaacattctgaacatcagaatgttgtt 2690057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 24540560 - 24540849
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24540560 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttccccggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 24540659  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540660 atctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 24540759  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24540760 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 24540849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45553524 - 45553251
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45553524 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcacgatgttcttc 45553425  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45553424 atctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 45553325  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45553324 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaagagaga 45553251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19586056 - 19585808
Alignment:
Q  46 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19586056 tgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgattgatattcatgatgttcttcatttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 19585957  T
Q  146 accatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttga 245  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19585956 accatccaatacttgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccttatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttga 19585857  T
Q  246 atcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19585856 atcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 19585808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27988765 - 27988548
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27988765 agaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggatccatccaatacgtgacatgagatttgttca 27988666  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27988665 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagt 27988566  T
Q  277 gaaaggatagtggatctg 294  Q
    || |||||||||||||||    
T  27988565 gagaggatagtggatctg 27988548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10416022 - 10415751
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  10416022 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttc 10415923  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||  | |||||| |||||||    
T  10415922 atctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttatccaatacgtgacatgagatttgtt-gggctttatccaccaaaaagtaacttctc 10415824  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  | |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  10415823 catatgcatcaaaagttgatggataaagtaggataaagtt--accaaatcagtcttggacttagtgcaggagaga 10415751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12491652 - 12491397
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12491652 gtgaacattctaaccatcagaatgttgttgtgttcgtaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 12491554  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    || ||   ||||||||||||||||| | | |||||||  | |||||| |||||||    
T  12491553 atctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctaggtttgtctaaggcgtgacatgagatttgtt-aggctttatccaccaaaaagtaacttctc 12491455  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttgg 261  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12491454 catatgcatcaaaaattgttggataaagtaggataaagttgaatcaaatctgccttgg 12491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12515404 - 12515188
Alignment:
Q  61 tgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtg 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    || ||   |||    
T  12515404 tgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctaggtttgtctaaggcgtg 12515306  T
Q  161 acatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtctt 259  Q
    |||||||||||||| | | |||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12515305 acatgagatttgtt-aggctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgtatcaaaagttgttggataaagtaggataaagttgaatcaaatctgcctt 12515207  T
Q  260 ggatttggtgcaggagaga 278  Q
    ||   | ||||||||||||    
T  12515206 ggtcattgtgcaggagaga 12515188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9007258 - 9007118
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttc-ccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | | ||||    
T  9007258 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttatgttttccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcaagatctt 9007160  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    || ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  9007159 catttgggttcatcatatatgaatgtatgatgagtttctggg 9007118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19586066 - 19586032
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19586066 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttc 19586032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 20317781 - 20318070
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20317781 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttaagttcccaagatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttattc 20317880  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20317881 atctaggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatacgtgacaaaagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctcc 20317980  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20317981 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctatcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 20318070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20309191 - 20308902
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  20309191 gtgaacattcttaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatctttgatattcattatgttcttc 20309092  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20309091 atctgggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctaggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccctcaaaagttacttctcc 20308992  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20308991 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 20308902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27066401 - 27066122
Alignment:
Q  15 tgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27066401 tgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttc 27066302  T
Q  115 atcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatca 214  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066301 atcaaggatgagtgtcagatgagtttctgggtccattccatacgtgacatgaggtatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatca 27066202  T
Q  215 aaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27066201 aaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatatgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctg 27066122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 26193187 - 26193466
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||||||||||    
T  26193187 gtgaacattctgaacatcagaattttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt----------gatgttcttc 26193276  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26193277 atctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaagagttacttctcc 26193376  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26193377 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtaggagagagaggatagtggatctg 26193466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20314750 - 20314482
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  20314750 aacattctaaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacattagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatc 20314651  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20314650 taggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctgggttcatccaatacgtaacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccata 20314551  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggaga 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20314550 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatttgtcttggatttggtgcatgaga 20314482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22961211 - 22960925
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22961211 gtgaaaattctgaccattagaatgttgttgtgttcctaggatgaacatcataatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 22961113  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |     |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22961112 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgattttctagatttgtccaatgtgtgacataagatttatttaggttttatccttaaaaagttacttcttc 22961013  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22961012 ataagcatcaaaagttgctggataaagtgggataaagttg--ccaaatttgtcttggactttgtgcaagagagagaggatagtggatctg 22960925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49333667 - 49333379
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  49333667 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttccaaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatg-ttgatattcatgatgttcttc 49333569  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||   |||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||| ||    
T  49333568 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttatc 49333470  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49333469 catatgcatcaaaagttgctgaataaagtaggataaagttgatccaaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctg 49333379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 18096673 - 18096959
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18096673 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgtttccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatg-ttgatattcatgatgttcttc 18096771  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    | |||| |||||||| |||||||||  || |||||||||  || |||| || |||    
T  18096772 atttgagttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctcggtttgttcaatgtgtgacataagatttgtt-taggtttatccttataatgttatttttcc 18096870  T
Q  205 atatgcatc-aaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18096871 atatgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagtt--atcaaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggatagtgaatctg 18096959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 20328263 - 20328430
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20328263 gtgaacattatgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttattc 20328362  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttg 172  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20328363 atctgggttcatcaaggatgaatctctgatgagtttctaggaccatccaatacgtgacaaaagatttg 20328430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 25039152 - 25039441
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25039152 gtgaaaattctgaccatcagaatgttgttgtgttcccatgatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 25039251  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||      |||   ||||| ||||||||||| | | ||||| |  | |||||| | |||||    
T  25039252 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttttgggtttgctcaaggcgtgacctgagatttgtt-aggctttattcaccaaaaagtaaattctc 25039350  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||||| |||||    
T  25039351 catatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagttaaaccaaatctgcctttgatattgtgcaggagagagatgatagtgaatctg 25039441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Original strand, 25823191 - 25823463
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25823191 gtgaacattttaaccatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatcttgttgttttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 25823289  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    | ||| | ||||||||| |||||||   |||||||||  | |||||| |||||||    
T  25823290 atatgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtttgttcaagacgtgacatgatatttgtt-gggttttatccaccaaaaagtaacttctc 25823388  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  25823389 catatgcatcaaaagttgttggataaagtaggataaagttgaaccaaatatgtcttggttattgtgcaggagaga 25823463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4950847 - 4950578
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4950847 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcaaaatg-ttgatattcatgatattcttc 4950749  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||  |  |||||||  | |||||| |||||||    
T  4950748 atctgagttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctgggtttgtccaatgcgtgacatgagatttgttgga-ctttatccaccaaaaagtaacttctc 4950650  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4950649 catatgcatcaaaagttgatagataaagtaggataaaatt---acaaatctgtcttggacttggtgcaagagaga 4950578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Original strand, 25044364 - 25044499
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25044364 gtgaaaattctgaccatcagaatgttgttgtgttcccatgatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 25044463  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttt 140  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25044464 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagttt 25044499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37012313 - 37012105
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  37012313 gtgaacattttgaccatcagaatgttgttgtgttcccatgatgaacatcagaatgttgccgtgttcttcatcagattgtt-gatgttcatgatgttcttc 37012215  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||  | |||||| |||||||    
T  37012214 atctgggttcatcaatgatgaatgtttgatgagtttctgggtttatccaatacgtgacatgagatttgtt-gggctttatccaccaaaaagtaacttctc 37012116  T
Q  204 catatgcatca 214  Q
    |||||||||||    
T  37012115 catatgcatca 37012105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 278
Target Start/End: Original strand, 41543915 - 41544101
Alignment:
Q  90 ttcatgatgttcttcagttgggttcatcaag-gatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatcctt 188  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||    |||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41543915 ttcatgatgatcttcatctgggttcatcaaatgatgaatgtctgatgagttgttgggttg-tccagtgcgtgacataagatttgttcaggttttatcctt 41544013  T
Q  189 caaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41544014 aaaaagttacttctccatatgtatcaaaagttgctggataaagtgggataaagtt--accaaatctgtcttggacttggtgcaggagaga 41544101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21793066 - 21792926
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttccca-ggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  21793066 gtgaacattcggaccatcagaatgtcattgtgttttcaaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcataagaatg-ttgatgtttatgatgttctt 21792968  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  21792967 catctgggttcatcattgatgaatgtatgatgagtttctggg 21792926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 221
Target Start/End: Original strand, 19748364 - 19748495
Alignment:
Q  90 ttcatgatgttcttcagttgggttcatcaag-gatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatcctt 188  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19748364 ttcatgatgatcttcatctgggttcatcaaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttg-tccagtgcgtgacataagatttgttcaggttttatcctt 19748462  T
Q  189 caaaagttacttctccatatgcatcaaaagttg 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19748463 aaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttg 19748495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 21821220 - 21821446
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggacca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||        
T  21821220 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttaatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatttattatgagtttctgggtttg 21821318  T
Q  150 tccaatatgtgacatgagatttgttcaagt-tttatccttcaaaagttacttctccatatgcat-caaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaat 247  Q
    | |||| |||| |||  ||||  |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| ||     
T  21821319 ttcaatgtgtgccatatgatt--ttcctgtctttatccataaaaagttacttctccatatgcataaaaaagttgctggataaagtaggataaagtt-aac 21821415  T
Q  248 caaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    ||||| ||  ||| | |||||||||||||||    
T  21821416 caaatttgcattgaacttggtgcaggagaga 21821446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22956910 - 22956797
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttccc-aggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||   | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||    
T  22956910 gtgaacattctgaccatctgagtgttgttgtgttctttaagatgaacattagaacgttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatctt 22956812  T
Q  104 cagttgggttcatca 118  Q
    ||  |||||||||||    
T  22956811 catctgggttcatca 22956797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37012080 - 37012037
Alignment:
Q  248 caaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  37012080 caaatctgtcttggacttggtgcaggagaga---gatagtggatctg 37012037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23484 - 23211
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23484 gtgaacattctgaacaccagaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 23385  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23384 atctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccattcaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 23285  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaattatgataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 23211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 29034 - 29320
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||      
T  29034 aacattctgaacatcaaaatgttgttgtgttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtttgatattcatgatgttcttcatc 29133  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29134 tgggttcatccaggatgaatttctgatgattatctgggtccatccaacacgtgacatgagattttttcaggttttatccttcaaaagttacttctccata 29233  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29234 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 29320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 243
Target Start/End: Original strand, 55415 - 55448
Alignment:
Q  210 catcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55415 catcaaaagttggttgaaaaagtaggataaagtt 55448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 952
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1225 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagtttccaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcttgatgttcttc 1126  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125 atctgggttcatcaaggatgaatgtctggtgagttcctgggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 1026  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1025 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatatgtcttggatttggtgcaggagaga 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19081 - 18794
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19081 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgtgtttccaggataaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttc 18982  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18981 atctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttatatccttgaaaagttacttctcc 18882  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18881 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggattttgtgcaggagagagaggatagtgaatctg 18794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Original strand, 1709 - 1995
Alignment:
Q  8 aacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagt 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||      
T  1709 aacattttgaccatcagaatggtattgtggtcctaggatgaacatcagaatgttgctgtgttctttatcagaatgtttgatatttatgatgttcttcatc 1808  T
Q  108 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1809 tgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttcaaaggttacttctccata 1908  T
Q  208 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1909 tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggatatagttgattcaaatctgtcttggatttcatgcaggagagagaggatagtggatctg 1995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 147013 - 146726
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  147013 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttcccaagatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatattcttc 146914  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  146913 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccataaaaagttacttcttc 146814  T
Q  205 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  146813 atatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaaatctgtctttgactttgtgcaggagagagaggatagtggatctg 146726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 114280 - 114489
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  114280 gtgaacattttgaacatcagaatgttgttgtgttcccaggatgaatatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatattcatgatgttcttc 114378  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcc 204  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  114379 atctgggtttatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtttatcacatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctcc 114478  T
Q  205 atatgcatcaa 215  Q
    |||||||||||    
T  114479 atatgcatcaa 114489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 291
Target Start/End: Original strand, 153389 - 153547
Alignment:
Q  131 tgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaa 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  153389 tgatgagtttctgggttcatccaatacgtgacataagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaa 153488  T
Q  231 gtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggat 291  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  153489 gtaggataaagtt--accaaatctgtcttgggttttgtgcaggagagagaggatagtggat 153547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 13244 - 13462
Alignment:
Q  77 agaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttca 176  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244 agaatgttgaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttca 13343  T
Q  177 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtg-caggag 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13344 agttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtcaggaa 13443  T
Q  276 agaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  13444 agagaggataatggatctg 13462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1360
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttc 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  1648 gtgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgttccaaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatg-ttgatattcatgatgttcttc 1550  T
Q  105 agttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctc 203  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | |||   |||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||| ||    
T  1549 atctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttatc 1451  T
Q  204 catatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1450 catatgcatcaaaagttgctgaataaagtaggataaagttgatccaaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctg 1360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7748 - 7461
Alignment:
Q  6 tgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttca 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7748 tgaacattctgaccatcagaatgttgttgtgtttctagaatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatg-ttgatattcatgatgttcttca 7650  T
Q  106 gttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggaccatccaatatgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctcca 205  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | |||| |||||||| |||||||||   | |||||||   |||||| |||||||||    
T  7649 tctgggttcatcaaagatgaatgtatgatgagtttctgggtttgttcaatgtgtgacataagatttgtt-gggctttatccacaaaaagtaacttctcca 7551  T
Q  206 tatgcat-caaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagaaaggatagtggatctg 294  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7550 tatgaatccaaaagttgctggataaagtaggataaagttgaaccaaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggataatggatctg 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 58914 - 58777
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  58914 gtgaacattctgaccatcataatgttgttgtgttcttcaggatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatg-ttgatgttcatgatgttctt 58816  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 142  Q
    ||  | |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  58815 catctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 58777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 60342 - 60205
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  60342 gtgaacattctgaccatcataatgttgttgtgttcttcaggatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatg-ttgatgttcatgatgttctt 60244  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 142  Q
    ||  | |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  60243 catctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 60205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 54962 - 54825
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  54962 gtgaacattttgaccatgataatgttgttgtgttcttcaggatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatg-ttgatgttcatgatgttctt 54864  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 142  Q
    ||  | |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  54863 catctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 54825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15742 - 15602
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||    
T  15742 gtgaacattctaaccatcagaatgttgttgtcttcttcaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttcattttcatcatgttctt 15644  T
Q  104 cagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||  |||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||||    
T  15643 catctgggttcatcatttatgagtgtatgatgaatttctggg 15602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11589 - 11363
Alignment:
Q  50 catcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggacca 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||        
T  11589 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttaatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatttattatgagtttctgggtttg 11491  T
Q  150 tccaatatgtgacatgagatttgttcaagt-tttatccttcaaaagttacttctccatatgcat-caaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaat 247  Q
    | |||| |||| |||  ||||  |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| ||     
T  11490 ttcaatgtgtgccatatgatt--ttcctgtctttatccataaaaagttacttctccatatgcataaaaaagttgctggataaagtaggataaagtt-aac 11394  T
Q  248 caaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 278  Q
    ||||| ||  ||| | |||||||||||||||    
T  11393 caaatttgcattgaacttggtgcaggagaga 11363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4642 - 4537
Alignment:
Q  36 gttcccaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatg 135  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4642 gttcccaggatgaacatca---tgttgttgtgttcttcatcagaatgtc-gatattcaagatgttcttcatttggattcatcaatgatgaatgtctgatg 4547  T
Q  136 agtttctggg 145  Q
    ||||| ||||    
T  4546 agtttttggg 4537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 16325 - 16388
Alignment:
Q  22 cagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtt 84  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16325 cagaatgttgttgtgttcttcaggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt 16388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 216962 - 216887
Alignment:
Q  10 cattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtt 84  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  216962 cattctgaccaccagaatgttgttgtgttcttcaggatgaacattagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt 216887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 197130 - 197241
Alignment:
Q  5 gtgaacattctgaacatcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatcttcatgatgttctt 103  Q
    ||||||||| | | |||| || |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||    
T  197130 gtgaacattatcaccatctgagtgttgttgtgttcttcaggatgaacattagaatgttgttgtgttcttcattagaat-attgatgttcatcatgatctt 197228  T
Q  104 cagttgggttcat 116  Q
    ||  |||||||||    
T  197229 cacctgggttcat 197241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 6735 - 6793
Alignment:
Q  19 catcagaatgttgttgagttcc-caggatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatt 76  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6735 catcagaatgttgttgtgttcttcaggatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatt 6793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Original strand, 6783 - 6831
Alignment:
Q  97 tgttcttcagttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggg 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6783 tgttcttcatttgggttcatcattgatgaatgtgtgatgagtttatggg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University