View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19611_low_1 (Length: 579)

Name: NF19611_low_1
Description: NF19611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19611_low_1
NF19611_low_1
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (6-563)||(40717863-40718405)
chr8 (6-557)||(14183112-14183648)
chr8 (203-396)||(14192208-14192401)
chr8 (117-309)||(14201295-14201487)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (4-414)||(19648845-19649252)
chr5 (6-538)||(34665878-34666398)
chr5 (6-534)||(34646188-34646704)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (7-530)||(45645388-45645899)
chr4 (137-300)||(1390492-1390655)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (204-563)||(34302817-34303173)
chr6 (261-300)||(33889226-33889265)
chr6 (261-300)||(33893731-33893770)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 500; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40718405 - 40717863
Alignment:
Q  6 caaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaaggtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718405 caaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatatgtctgatgtggtactatagcaaaggtt 40718306  T
Q  106 taattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40718305 taattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaacgtt 40718206  T
Q  206 gtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaaat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718205 gtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaaat 40718106  T
Q  306 agtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718105 agtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctgtt 40718006  T
Q  406 tgactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacgggacca 505  Q
    ||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40718005 tgac---------------tcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacgggacca 40717921  T
Q  506 cctccaaggccaactataccagagcttgcacctttaaacgacactgtattgttggttc 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40717920 cctccaaggccaactataccagagcttgcacctttaaacgacactgtattgttggttc 40717863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14183648 - 14183112
Alignment:
Q  6 caaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaaggtt 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||   ||||||||||||||    
T  14183648 caaatgtactaataggatgcaacttaacatccgcacctttaaaatgtgtcgttattataggaaaatcatatccatctgatgtgacgctatagcaaaggtt 14183549  T
Q  106 taattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggtt 205  Q
     |||  | | |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||   ||| |||||||||||||||||||||| || || ||| | || |||||| |||    
T  14183548 aaataatcgggttggatcattaacacgcttcagtttcaccaattccaacaccgctgattccaaattattataaacatcagttggaataaccgtcaacgtt 14183449  T
Q  206 gtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaaat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183448 gtacctgaatcaattatgatgttaccttcatgaccaccatttgaagacccttcaaattctattcttttgttaccaacactaaatgcttccaatgtcaaat 14183349  T
Q  306 agtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctgtt 405  Q
    ||||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||| |||| | || || ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14183348 agtagaaaactataggatcctttttcactataggggttgacacaacaccatccccggaaaccacagccgtgtctccaaaattgagtttgcttgtcgtgtt 14183249  T
Q  406 tgactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacgggacca 505  Q
    ||||||||| |||||               ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||| ||||||||  | || |||    
T  14183248 tgactcaaccgggtt---------------tggcaacaaacaataagagaattttgcatcaattgatgatcccaattgtgtaataagagatgctggtcca 14183164  T
Q  506 cctccaaggccaactataccagagcttgcacctttaaacgacactgtattgt 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14183163 cctccaaggccaactataccagaacttgcaccttcaaatgacactgtattgt 14183112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14192401 - 14192208
Alignment:
Q  203 gttgtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtca 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |  ||  |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192401 gttgtacccgaatcaattatgatgttaccctcattatcaccatttggaactcctccaatttctactcttctatttccaacactaaatgcttccaatgtca 14192302  T
Q  303 aatagtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgct 396  Q
    ||||||| ||   |  |||||||||||||| ||||||||||| || |||  | || ||||| |||  ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  14192301 aatagtaaaaggtttcggggtcttttttcaatataggagttgtcacaaccccgtctccagataccgtagccgcatctccaaaattgagcttgct 14192208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14201487 - 14201295
Alignment:
Q  117 ttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggttgtacctgaatc 216  Q
    ||||||| |||||| |||| || || | | ||||||| || |||||||| ||  ||| ||||| || | | |||||||  || || |||||||| |||||    
T  14201487 ttggatcctcaacatgctccagattaatatattctgctacagctgattcaaatctataataaacatcatagggcaaaaatgtgaatgttgtaccagaatc 14201388  T
Q  217 aattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaaatagta 309  Q
    |||||  ||||||||||||| || ||||| || || ||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14201387 aattaaaatgttaccctcattaccaccatatgtaggtcctccaaattctattaatttgtttcccacactaaatgcttctaatgtcaagtagta 14201295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 414
Target Start/End: Original strand, 19648845 - 19649252
Alignment:
Q  4 agcaaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaagg 103  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  19648845 agcaaaggtactaattgggttcaacttaatatctgcacctttaaaatgtgcagtgattataggaaaatcatattggtctgatgtgatactataacaaagg 19648944  T
Q  104 tttaattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaagg 203  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||   || ||| || || |||||||||||| |||||| || ||| || ||||  ||||| |    
T  19648945 tttaatagttgattaggatcatcaacacgatctagtttcaccagttgtgctaccgccgattccaaattagtataaacatgagacggtaaaagagtcaatg 19649044  T
Q  204 ttgtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaa 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| | || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19649045 ttgtaccagaatcaagtatgatgttaccctcctcactgtcatct-aacactt--caaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttctaacgtcaa 19649141  T
Q  304 atagtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctg 403  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  19649142 atagtagaaagcttgagggtcttttttcacaaaaggagttgacacaacaccgtcaccagaaaccacagcggcatctccaaaattgagtttgctcgtcttg 19649241  T
Q  404 tttgactcaac 414  Q
    || || |||||    
T  19649242 ttcgagtcaac 19649252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 34666398 - 34665878
Alignment:
Q  6 caaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaaggtt 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| | ||||   | |||| |   ||||||||| ||| |    
T  34666398 caaaggtactaatagaatgcaactcaatatcggcacctttaaaatgtgcggtgattataggaaaatcatattcatttgatttcaaactatagcataggct 34666299  T
Q  106 taattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggtt 205  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  | ||  |||| ||||||||||| ||| |||| |  |  || || | ||  ||||| |||    
T  34666298 gaattgttgattaggatcatcaacacgatctagtttcaccaaatccaccacagctgattccaagttagtatagacgtcggaaggtataagtgtcaatgtt 34666199  T
Q  206 gtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccattt---gaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |   ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34666198 gtacctgaatcaattatgatgttaccttcatcatcaccaccttccgaagagcctccaaattctactcttttgtttccaacactaaatgcttgtaatgtca 34666099  T
Q  303 aatagtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcct 402  Q
    || ||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||        
T  34666098 aaaagtagaaaac---ggggtctttttttattagaggagttgacacaacaccgtcacccgaaaccacagcggcatctccaaaactgagtatacttgatgc 34666002  T
Q  403 gtttgactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacggga 502  Q
    |||||||||  || |  || |        ||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||     
T  34666001 gtttgactc--cttg--ttca--------acaatggcaccaaacaataagagaatttaccaccaattgatgatcccaattgtgttatgagagacaccggc 34665914  T
Q  503 ccacctccaaggccaactataccagagcttgcacct 538  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34665913 ccgcctccaaggccaactataccagagcttgcacct 34665878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34646704 - 34646188
Alignment:
Q  6 caaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaaggtt 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||  | || |||| |||||| | ||||   | |||| |   ||||||||| ||| |    
T  34646704 caaaggtactaatagaatgcaactcaacatcggcacctttaaaatgtacggtgattataggaaaatcatattcatttgatttcaaactatagcataggct 34646605  T
Q  106 taattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggtt 205  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  | ||  |||| ||||||||||| ||| |||| |  |  || || | ||  ||||| |||    
T  34646604 gaattgttgattaggatcatcaacacgatctagtttcaccaaatccaccacagctgattccaagttagtatagacgtcggaaggtataagtgtcaatgtt 34646505  T
Q  206 gtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccattt---gaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |   ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34646504 gtacctgaatcaattatgatgttaccttcatcatcaccaccttccgaagagcctccaaattctactcttttgtttccaacactaaatgcttgtaatgtca 34646405  T
Q  303 aatagtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcct 402  Q
    || ||||||||||   |||||||||||| | || ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||        
T  34646404 aaaagtagaaaac---ggggtctttttttattagaggagttgacacaacaccgtcacccgaaaccacagcggcatctccaaaactgagtatacttgatgc 34646308  T
Q  403 gtttgactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacggga 502  Q
    |||||||||  || |  || |        ||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||     
T  34646307 gtttgactc--cttg--ttca--------acaatggcaccaaacaataagagaatttaccaccaattgatgatcccaattgtgttatgagagacaccggc 34646220  T
Q  503 ccacctccaaggccaactataccagagcttgc 534  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646219 ccgcctccaaggccaactataccagagcttgc 34646188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 45645899 - 45645388
Alignment:
Q  7 aaaggtactaatgggatgcaacttaatatccgcacctttaaaatgcgctgttattagaggaaagttatatctgtctgatgtggtactatagcaaaggttt 106  Q
    |||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||   ||| |||| | ||||||||| |||       
T  45645899 aaaggtactaatagaatgcaactcaacatcagcacctttaaaatgtgcggtgattagaggaaaatcatattcatctaatgtcgcactatagcataggccg 45645800  T
Q  107 aattgttgagttggatcatcaacacgctctagtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggttg 206  Q
    ||| ||| |   |||||||| ||||| | |||||||||  | ||  |||| |||||||||||||| |||||||  | || ||| |||| | |||| ||||    
T  45645799 aatagtttataaggatcatccacacgttttagtttcaccaaatcaaccacagctgattccaaatttttataaacgtcagctggtaaaaccatcaatgttg 45645700  T
Q  207 tacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaaata 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  45645699 tacctgaatcaattataatgttaccttcatcaccatcctctgaagaccctccaaattctactcttttgtttccaacactaaatgcttctaatgtcaaaac 45645600  T
Q  307 gtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctgttt 406  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||    
T  45645599 gtagtaaactgaagggtctttttttattataggagttgacacaacattgtcacccgaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttactcgttgtgttt 45645500  T
Q  407 gactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacgggaccac 506  Q
    |||||  || | |          |  |||||| | |||||||||||||||||    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||    
T  45645499 gactc--cttgtt----------atccaatggcaccaaacaataagagaattcaccaccaattgatgatcccaattgtgttattagagacactggtccac 45645412  T
Q  507 ctccaaggccaactataccagagc 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  45645411 ctccaaggcccactataccagagc 45645388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1390655 - 1390492
Alignment:
Q  137 agtttcacagattctgccacggctgattccaaattattataaatattagatggcaaaatcgtcaaggttgtacctgaatcaattatgatgttaccctcat 236  Q
    ||||| || |||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||  |||||| | ||  ||||  |  |||||||||||||  | ||||||||| |||     
T  1390655 agtttaaccgattttgccacagcttatttcaaattatgataaataccagatggtacaactgtcactgccgtacctgaatcaaccacgatgttaccatcaa 1390556  T
Q  237 cactaccatttgaa-gatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgt 300  Q
    |||||||||||||  | | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1390555 cactaccatttgattgctttga-aaattctactcttttgtttccaacactaaatgctttcaatgt 1390492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34303173 - 34302817
Alignment:
Q  204 ttgtacctgaatcaattatgatgttaccctcatcactaccatttgaagatctgccaaattctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgtcaa 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| || |   ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  34303173 ttgtacttgaatcaattatgatgttaccttcttcaacaccttttgaggaccctgcaaattctactcttttgtctccaacgctaaatgcttctattgtcaa 34303074  T
Q  304 atagtagaaaactgtggggtcttttttcactataggagttgacaaaacatcctcaccagaaaccacagcggcatctccaaaactgagtttgcttgtcctg 403  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| || | ||      
T  34303073 atagtagaaaaatgaatggtcttttttaactataggagttgacaatacattgtgaccagaaacaattgcgacatctccaaaattgagtttactcgacccc 34302974  T
Q  404 tttgactcaactgggtttgactcaagagacaatggaagcaaacaataagagaattttgaaccaattgacgatccaagttgtgttataagagacacgggac 503  Q
     | |||  |  |   ||| ||  ||  |||| | | | ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||  | || |    
T  34302973 atagacatattt---tttaacgtaattgacattcgcaccaaacaataagagaatttaccaccaattgacggtcccaattgtgttattagagatgcaggtc 34302877  T
Q  504 cacctccaaggccaactataccagagcttgcacctttaaacgacactgtattgttggttc 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| || ||||||| ||||    
T  34302876 cacctccaaggccaactacaccagagcttacgcgtttaaacgaccctatattgttagttc 34302817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 33889226 - 33889265
Alignment:
Q  261 attctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33889226 attctattctattgtttcccacactaaatgcttccaatgt 33889265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33893770 - 33893731
Alignment:
Q  261 attctattcttttgtttccaacactaaatgcttccaatgt 300  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33893770 attctattctattgtttcccacactaaatgcttccaatgt 33893731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University