View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19615_high_37 (Length: 395)

Name: NF19615_high_37
Description: NF19615
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19615_high_37
NF19615_high_37
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (1-232)||(16099222-16099453)
chr2 (1-238)||(6658045-6658282)
chr2 (1-236)||(39498477-39498712)
chr2 (1-231)||(11163054-11163284)
chr2 (1-232)||(37895346-37895577)
chr2 (1-233)||(39423713-39423945)
chr2 (1-231)||(10712921-10713151)
chr2 (1-234)||(15848286-15848519)
chr2 (5-229)||(36479920-36480144)
chr2 (1-232)||(36755291-36755517)
chr2 (33-233)||(34448025-34448225)
chr2 (1-211)||(1695760-1695970)
chr2 (1-211)||(13995693-13995903)
chr2 (1-211)||(33062070-33062280)
chr2 (1-211)||(41248579-41248789)
chr2 (1-150)||(14900564-14900713)
chr2 (84-220)||(13692501-13692637)
chr2 (96-232)||(45556340-45556476)
chr2 (66-231)||(9076330-9076495)
chr2 (1-137)||(22051088-22051224)
chr2 (96-232)||(36382420-36382556)
chr2 (43-232)||(15848087-15848276)
chr2 (119-236)||(44045318-44045435)
chr2 (96-227)||(44713799-44713930)
chr2 (1-211)||(33739870-33740080)
chr2 (43-236)||(44714001-44714193)
chr2 (91-228)||(6588686-6588823)
chr2 (1-137)||(2318356-2318492)
chr2 (43-231)||(39423515-39423703)
chr2 (43-234)||(36382158-36382349)
chr2 (96-232)||(3555249-3555385)
chr2 (73-233)||(25231118-25231278)
chr2 (43-228)||(37895587-37895772)
chr2 (119-232)||(44044113-44044226)
chr2 (43-235)||(10712719-10712911)
chr2 (119-231)||(25230102-25230214)
chr2 (43-229)||(36479719-36479906)
chr2 (98-231)||(30729621-30729754)
chr2 (43-230)||(2318160-2318346)
chr2 (129-232)||(2318836-2318939)
chr2 (94-233)||(11163314-11163453)
chr2 (94-232)||(45556111-45556249)
chr2 (96-233)||(6657876-6658013)
chr2 (96-231)||(16099055-16099190)
chr2 (1-72)||(36382359-36382430)
chr2 (43-232)||(34447812-34448000)
chr2 (43-231)||(22051234-22051421)
chr2 (1-72)||(44713920-44713991)
chr2 (1-72)||(45556279-45556350)
chr2 (119-231)||(21370518-21370630)
chr2 (84-236)||(28228665-28228817)
chr2 (124-231)||(3556330-3556437)
chr2 (97-212)||(15604631-15604746)
chr2 (43-230)||(36755094-36755281)
chr2 (91-212)||(15604358-15604479)
chr2 (91-212)||(28226030-28226151)
chr2 (124-231)||(6307039-6307145)
chr2 (91-212)||(8710754-8710875)
chr2 (96-224)||(39498317-39498445)
chr2 (91-242)||(39936535-39936685)
chr2 (91-212)||(41588344-41588465)
chr2 (97-212)||(8342471-8342586)
chr2 (91-212)||(8342206-8342327)
chr2 (91-212)||(11830383-11830504)
chr2 (96-212)||(14900745-14900859)
chr2 (99-212)||(41587254-41587366)
chr2 (1-72)||(17266523-17266594)
chr2 (260-343)||(21744268-21744353)
chr2 (127-232)||(43742000-43742105)
chr2 (124-232)||(28230060-28230168)
chr2 (119-205)||(202672-202758)
chr2 (79-205)||(3653356-3653481)
chr2 (124-225)||(6589680-6589781)
chr2 (96-211)||(33739723-33739838)
chr2 (156-228)||(199024-199096)
[»] chr8 (117 HSPs)
chr8 (1-234)||(1425050-1425283)
chr8 (1-231)||(38955870-38956100)
chr8 (1-233)||(12198948-12199180)
chr8 (1-233)||(12443376-12443608)
chr8 (1-235)||(13186257-13186491)
chr8 (1-233)||(23663543-23663775)
chr8 (1-229)||(40317966-40318194)
chr8 (2-232)||(36928675-36928905)
chr8 (1-221)||(22915399-22915619)
chr8 (5-235)||(4994653-4994883)
chr8 (1-213)||(35756780-35756993)
chr8 (1-212)||(11674861-11675072)
chr8 (1-236)||(34685456-34685690)
chr8 (1-212)||(36325401-36325612)
chr8 (1-211)||(44406877-44407087)
chr8 (1-211)||(38845319-38845529)
chr8 (1-150)||(4405743-4405892)
chr8 (1-211)||(2266659-2266869)
chr8 (96-228)||(38862856-38862988)
chr8 (1-211)||(40775670-40775880)
chr8 (96-232)||(8316652-8316788)
chr8 (96-236)||(39071935-39072074)
chr8 (1-211)||(3041476-3041686)
chr8 (119-231)||(20385568-20385680)
chr8 (96-229)||(12272920-12273053)
chr8 (43-236)||(31608753-31608946)
chr8 (43-232)||(40318204-40318393)
chr8 (1-232)||(31608526-31608743)
chr8 (38-231)||(16388761-16388954)
chr8 (96-231)||(23698308-23698444)
chr8 (73-242)||(7295197-7295366)
chr8 (119-232)||(20386746-20386859)
chr8 (43-231)||(39071676-39071864)
chr8 (91-232)||(34061616-34061757)
chr8 (44-232)||(13186059-13186247)
chr8 (99-227)||(36186105-36186233)
chr8 (43-231)||(4405902-4406088)
chr8 (43-232)||(4994897-4995085)
chr8 (96-229)||(34177263-34177396)
chr8 (133-237)||(33357492-33357596)
chr8 (43-235)||(35756580-35756770)
chr8 (119-230)||(30712033-30712143)
chr8 (119-230)||(30719810-30719920)
chr8 (96-233)||(23663807-23663944)
chr8 (96-232)||(8316881-8317017)
chr8 (119-235)||(23698560-23698676)
chr8 (37-231)||(36928479-36928670)
chr8 (1-72)||(8316778-8316849)
chr8 (1-72)||(12273043-12273114)
chr8 (1-72)||(23698434-23698505)
chr8 (99-230)||(7294103-7294233)
chr8 (97-236)||(12273147-12273286)
chr8 (89-240)||(30459363-30459513)
chr8 (1-72)||(38862795-38862866)
chr8 (117-234)||(7313319-7313436)
chr8 (91-212)||(10445621-10445742)
chr8 (43-235)||(36186307-36186496)
chr8 (99-233)||(34176443-34176573)
chr8 (91-231)||(44664508-44664648)
chr8 (96-231)||(2535843-2535978)
chr8 (1-72)||(39071874-39071945)
chr8 (100-233)||(7983426-7983559)
chr8 (91-212)||(15230217-15230338)
chr8 (164-236)||(16388578-16388650)
chr8 (96-232)||(22915651-22915787)
chr8 (1-108)||(31873017-31873125)
chr8 (127-234)||(34060486-34060593)
chr8 (117-232)||(7306398-7306513)
chr8 (1-72)||(16388686-16388757)
chr8 (91-210)||(25124584-25124703)
chr8 (119-234)||(30710853-30710967)
chr8 (91-210)||(42945400-42945519)
chr8 (96-230)||(1425315-1425448)
chr8 (100-237)||(23507722-23507859)
chr8 (119-231)||(2534695-2534807)
chr8 (100-212)||(15229950-15230062)
chr8 (86-241)||(8746314-8746469)
chr8 (99-233)||(35634393-35634527)
chr8 (91-209)||(37542246-37542364)
chr8 (91-212)||(25124849-25124970)
chr8 (157-229)||(12199260-12199332)
chr8 (157-229)||(12443688-12443760)
chr8 (96-212)||(36325253-36325369)
chr8 (101-205)||(41353869-41353973)
chr8 (127-231)||(42803542-42803646)
chr8 (124-231)||(38955703-38955810)
chr8 (100-233)||(234035-234168)
chr8 (100-233)||(710446-710579)
chr8 (100-233)||(747658-747791)
chr8 (100-233)||(871553-871686)
chr8 (119-212)||(11674714-11674807)
chr8 (91-212)||(44664794-44664915)
chr8 (100-212)||(23505071-23505183)
chr8 (1-60)||(36186238-36186297)
chr8 (161-231)||(5960046-5960116)
chr8 (91-237)||(6471684-6471830)
chr8 (72-150)||(8747533-8747611)
chr8 (99-212)||(8997983-8998096)
chr8 (91-140)||(42945205-42945254)
chr8 (177-229)||(9065667-9065719)
chr8 (43-140)||(31873141-31873236)
chr8 (100-222)||(37542520-37542642)
chr8 (102-240)||(43181451-43181589)
chr8 (100-140)||(6471985-6472025)
chr8 (128-232)||(10749833-10749937)
chr8 (100-212)||(41353593-41353705)
chr8 (174-232)||(9065741-9065799)
chr8 (124-230)||(11762997-11763103)
chr8 (91-212)||(21432712-21432833)
chr8 (100-140)||(38003546-38003586)
chr8 (187-231)||(38862618-38862662)
chr8 (96-140)||(39474637-39474680)
chr8 (96-211)||(38845561-38845676)
chr8 (192-230)||(4405700-4405738)
chr8 (100-145)||(16388647-16388692)
chr8 (99-140)||(21432987-21433028)
chr8 (99-140)||(27500382-27500423)
[»] chr4 (139 HSPs)
chr4 (1-237)||(7452001-7452237)
chr4 (1-229)||(44967071-44967299)
chr4 (1-231)||(23613476-23613706)
chr4 (5-235)||(36008840-36009070)
chr4 (1-230)||(49879208-49879437)
chr4 (1-228)||(37248403-37248630)
chr4 (2-233)||(50418666-50418897)
chr4 (1-234)||(35027995-35028228)
chr4 (1-233)||(34765378-34765610)
chr4 (1-233)||(51692717-51692949)
chr4 (1-232)||(17355924-17356155)
chr4 (1-232)||(46661112-46661343)
chr4 (1-235)||(24711278-24711512)
chr4 (1-228)||(43155532-43155757)
chr4 (2-231)||(18831516-18831745)
chr4 (1-228)||(37976156-37976383)
chr4 (1-230)||(15507674-15507903)
chr4 (1-231)||(14801934-14802163)
chr4 (5-228)||(54086698-54086921)
chr4 (1-229)||(16006005-16006219)
chr4 (1-233)||(52909451-52909683)
chr4 (1-232)||(53129505-53129736)
chr4 (1-235)||(24411556-24411780)
chr4 (1-212)||(9400538-9400749)
chr4 (79-232)||(13058258-13058411)
chr4 (1-213)||(33247292-33247503)
chr4 (1-212)||(4982745-4982956)
chr4 (1-232)||(53702010-53702227)
chr4 (1-211)||(9144786-9144996)
chr4 (1-211)||(34837094-34837304)
chr4 (1-211)||(38012337-38012547)
chr4 (1-211)||(42738051-42738261)
chr4 (1-150)||(27934699-27934847)
chr4 (1-150)||(22566966-22567115)
chr4 (79-238)||(24349667-24349826)
chr4 (96-232)||(1179093-1179229)
chr4 (5-211)||(32950313-32950519)
chr4 (112-232)||(24350741-24350861)
chr4 (5-196)||(35508278-35508466)
chr4 (119-233)||(10781800-10781914)
chr4 (43-233)||(34765620-34765810)
chr4 (112-232)||(10780712-10780832)
chr4 (112-232)||(10974321-10974441)
chr4 (43-230)||(52909254-52909441)
chr4 (110-231)||(5369174-5369295)
chr4 (43-232)||(14801735-14801924)
chr4 (43-232)||(35028238-35028427)
chr4 (119-233)||(148071-148185)
chr4 (119-231)||(147319-147431)
chr4 (43-229)||(17356165-17356348)
chr4 (79-234)||(39539194-39539349)
chr4 (124-228)||(11108161-11108265)
chr4 (43-234)||(35508480-35508671)
chr4 (43-234)||(37976393-37976584)
chr4 (43-229)||(24411360-24411546)
chr4 (43-229)||(53701814-53702000)
chr4 (37-235)||(54086929-54087127)
chr4 (119-241)||(50418953-50419075)
chr4 (43-236)||(15507913-15508105)
chr4 (119-232)||(24711110-24711223)
chr4 (96-233)||(44967331-44967468)
chr4 (43-232)||(53129746-53129935)
chr4 (91-212)||(54713649-54713769)
chr4 (119-235)||(7451830-7451946)
chr4 (96-235)||(13058033-13058172)
chr4 (119-233)||(55867430-55867544)
chr4 (91-236)||(27068905-27069050)
chr4 (124-229)||(37248238-37248343)
chr4 (96-232)||(5368946-5369082)
chr4 (96-212)||(10408180-10408296)
chr4 (124-232)||(18831348-18831456)
chr4 (96-232)||(23613308-23613444)
chr4 (96-233)||(43155789-43155926)
chr4 (91-236)||(52573223-52573368)
chr4 (91-212)||(54858579-54858700)
chr4 (156-232)||(48528484-48528560)
chr4 (78-232)||(30642421-30642575)
chr4 (1-58)||(13058204-13058261)
chr4 (153-241)||(55866101-55866187)
chr4 (124-232)||(11448050-11448158)
chr4 (96-212)||(27934551-27934667)
chr4 (78-205)||(8439499-8439626)
chr4 (96-234)||(36009106-36009245)
chr4 (91-212)||(39667062-39667183)
chr4 (91-212)||(45463092-45463213)
chr4 (91-212)||(54858846-54858967)
chr4 (100-232)||(1178056-1178174)
chr4 (96-212)||(3032601-3032717)
chr4 (124-212)||(9400809-9400897)
chr4 (5-64)||(5369118-5369177)
chr4 (96-223)||(49879469-49879596)
chr4 (101-207)||(8438305-8438410)
chr4 (119-241)||(51692543-51692665)
chr4 (91-212)||(10407908-10408029)
chr4 (91-212)||(27069196-27069317)
chr4 (91-212)||(45463359-45463480)
chr4 (91-212)||(52573514-52573635)
chr4 (96-212)||(4982988-4983104)
chr4 (124-232)||(40387466-40387574)
chr4 (72-233)||(41582445-41582606)
chr4 (119-236)||(54435413-54435530)
chr4 (124-212)||(33247563-33247651)
chr4 (90-242)||(41583518-41583670)
chr4 (80-231)||(32062589-32062739)
chr4 (99-205)||(5818069-5818175)
chr4 (102-212)||(11523968-11524078)
chr4 (99-193)||(27891622-27891716)
chr4 (91-233)||(50504111-50504253)
chr4 (72-233)||(16605600-16605761)
chr4 (107-212)||(27149298-27149402)
chr4 (127-208)||(50750910-50750991)
chr4 (124-212)||(22566818-22566906)
chr4 (96-140)||(51859498-51859542)
chr4 (119-226)||(16005843-16005950)
chr4 (125-232)||(32063658-32063765)
chr4 (91-234)||(51859692-51859835)
chr4 (91-241)||(39701195-39701345)
chr4 (97-211)||(51203629-51203743)
chr4 (119-194)||(39538120-39538192)
chr4 (72-232)||(40388375-40388535)
chr4 (91-140)||(50503916-50503965)
chr4 (86-154)||(54434266-54434334)
chr4 (101-140)||(22718030-22718069)
chr4 (101-140)||(22987147-22987186)
chr4 (127-238)||(50751822-50751932)
chr4 (99-193)||(22923176-22923270)
chr4 (99-193)||(22927829-22927923)
chr4 (99-193)||(22984108-22984202)
chr4 (99-193)||(22997696-22997790)
chr4 (91-140)||(9731498-9731547)
chr4 (101-205)||(22718235-22718339)
chr4 (101-205)||(22986877-22986981)
chr4 (96-211)||(42738293-42738408)
chr4 (91-140)||(39666867-39666916)
chr4 (156-209)||(48529916-48529969)
chr4 (113-225)||(11446276-11446388)
chr4 (117-197)||(23535426-23535506)
chr4 (181-233)||(29321283-29321335)
chr4 (100-140)||(39701000-39701040)
[»] chr1 (125 HSPs)
chr1 (1-231)||(183221-183451)
chr1 (1-231)||(47999123-47999353)
chr1 (1-232)||(6367760-6367991)
chr1 (1-236)||(37578187-37578422)
chr1 (5-231)||(26024594-26024820)
chr1 (1-236)||(13914063-13914298)
chr1 (1-236)||(30711525-30711760)
chr1 (1-235)||(43759020-43759254)
chr1 (1-233)||(36694280-36694512)
chr1 (1-233)||(36710381-36710613)
chr1 (1-233)||(1841657-1841888)
chr1 (5-232)||(1103663-1103890)
chr1 (1-232)||(48779317-48779548)
chr1 (2-227)||(41098932-41099157)
chr1 (1-237)||(34464443-34464679)
chr1 (5-232)||(17661851-17662076)
chr1 (1-224)||(49722925-49723147)
chr1 (1-231)||(32917458-32917688)
chr1 (1-232)||(19017628-19017859)
chr1 (5-232)||(7821156-7821382)
chr1 (2-228)||(40210373-40210599)
chr1 (1-228)||(23209365-23209591)
chr1 (1-212)||(24905186-24905397)
chr1 (5-230)||(35152545-35152757)
chr1 (1-232)||(40772671-40772888)
chr1 (1-228)||(19323090-19323317)
chr1 (1-231)||(14879169-14879386)
chr1 (1-212)||(28011530-28011746)
chr1 (1-211)||(33442614-33442824)
chr1 (43-233)||(19322890-19323080)
chr1 (1-211)||(52134235-52134445)
chr1 (1-140)||(4716559-4716698)
chr1 (1-140)||(31514409-31514548)
chr1 (1-190)||(42248671-42248858)
chr1 (99-236)||(24009570-24009707)
chr1 (43-235)||(34464689-34464881)
chr1 (99-238)||(35473624-35473763)
chr1 (43-232)||(7820953-7821142)
chr1 (43-231)||(6367562-6367750)
chr1 (43-231)||(30711327-30711515)
chr1 (43-230)||(4960541-4960728)
chr1 (43-234)||(19017869-19018060)
chr1 (43-232)||(17662090-17662279)
chr1 (43-236)||(35152338-35152531)
chr1 (43-232)||(37578432-37578621)
chr1 (96-226)||(4960802-4960932)
chr1 (40-228)||(46163033-46163221)
chr1 (43-227)||(1103463-1103649)
chr1 (43-222)||(14878980-14879159)
chr1 (72-231)||(34850334-34850493)
chr1 (43-229)||(40210610-40210796)
chr1 (43-233)||(41098731-41098921)
chr1 (43-230)||(13914308-13914494)
chr1 (37-228)||(24009775-24009966)
chr1 (43-229)||(42248475-42248661)
chr1 (1-110)||(19515983-19516092)
chr1 (90-231)||(34849011-34849152)
chr1 (96-232)||(7231542-7231678)
chr1 (119-231)||(46899061-46899173)
chr1 (119-233)||(5734008-5734121)
chr1 (119-232)||(5735027-5735140)
chr1 (89-230)||(13300190-13300331)
chr1 (119-232)||(17691218-17691331)
chr1 (119-232)||(46899916-46900029)
chr1 (43-235)||(1841455-1841647)
chr1 (96-232)||(25647883-25648019)
chr1 (99-235)||(48692310-48692446)
chr1 (95-238)||(23209619-23209762)
chr1 (119-228)||(17692501-17692610)
chr1 (96-235)||(183484-183624)
chr1 (96-232)||(26024422-26024558)
chr1 (119-231)||(40772507-40772619)
chr1 (43-213)||(32917278-32917448)
chr1 (96-233)||(47999385-47999522)
chr1 (91-235)||(40714440-40714584)
chr1 (96-212)||(49955366-49955482)
chr1 (1-57)||(24009715-24009771)
chr1 (89-209)||(48691170-48691290)
chr1 (156-235)||(51015629-51015708)
chr1 (95-233)||(36694540-36694678)
chr1 (95-233)||(36710641-36710779)
chr1 (91-233)||(40714729-40714871)
chr1 (91-233)||(45750128-45750270)
chr1 (91-237)||(49955633-49955779)
chr1 (91-212)||(17188973-17189094)
chr1 (100-241)||(20760800-20760941)
chr1 (91-212)||(35038474-35038595)
chr1 (43-140)||(43758913-43759010)
chr1 (91-235)||(31050946-31051090)
chr1 (157-233)||(42533022-42533098)
chr1 (1-72)||(10304048-10304119)
chr1 (43-110)||(48779238-48779305)
chr1 (95-233)||(19515817-19515955)
chr1 (99-233)||(37929416-37929550)
chr1 (158-228)||(40435348-40435418)
chr1 (96-204)||(28011390-28011498)
chr1 (156-232)||(51019702-51019778)
chr1 (91-238)||(8898803-8898950)
chr1 (99-212)||(8898536-8898649)
chr1 (1-46)||(25648051-25648096)
chr1 (91-212)||(28324824-28324944)
chr1 (91-212)||(35040900-35041021)
chr1 (91-232)||(45749841-45749982)
chr1 (124-236)||(31197060-31197167)
chr1 (1-49)||(46163228-46163276)
chr1 (99-193)||(12905953-12906047)
chr1 (91-212)||(7371309-7371430)
chr1 (97-236)||(32133218-32133357)
chr1 (1-72)||(4960738-4960812)
chr1 (184-231)||(6518177-6518224)
chr1 (156-229)||(40439542-40439615)
chr1 (91-232)||(32132303-32132444)
chr1 (96-212)||(24905429-24905544)
chr1 (183-231)||(26234430-26234478)
chr1 (119-233)||(42534331-42534445)
chr1 (162-208)||(26234205-26234251)
chr1 (153-239)||(44522139-44522225)
chr1 (127-212)||(17189173-17189258)
chr1 (91-212)||(30326515-30326636)
chr1 (91-140)||(31058343-31058392)
chr1 (100-140)||(28325099-28325139)
chr1 (96-211)||(31514579-31514694)
chr1 (96-211)||(33442856-33442971)
chr1 (162-208)||(42267326-42267372)
chr1 (79-140)||(16970811-16970872)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (1-236)||(17102187-17102422)
chr7 (5-228)||(27991910-27992133)
chr7 (1-232)||(6253638-6253869)
chr7 (1-232)||(2640177-2640408)
chr7 (1-235)||(48788799-48789033)
chr7 (2-232)||(28469009-28469238)
chr7 (1-237)||(32053137-32053373)
chr7 (1-232)||(10935992-10936223)
chr7 (1-230)||(3914336-3914560)
chr7 (1-229)||(19204656-19204884)
chr7 (1-233)||(42731617-42731849)
chr7 (1-230)||(42019598-42019827)
chr7 (1-188)||(22871351-22871538)
chr7 (1-212)||(32680614-32680825)
chr7 (1-231)||(37657048-37657265)
chr7 (1-222)||(39686543-39686764)
chr7 (5-236)||(45010797-45011037)
chr7 (1-211)||(30948180-30948390)
chr7 (1-211)||(34928670-34928880)
chr7 (43-236)||(10935789-10935982)
chr7 (95-232)||(24389077-24389214)
chr7 (72-210)||(17885649-17885787)
chr7 (43-233)||(28469248-28469438)
chr7 (79-236)||(13386023-13386180)
chr7 (96-232)||(27396628-27396764)
chr7 (43-231)||(42731419-42731607)
chr7 (43-226)||(40379774-40379957)
chr7 (96-232)||(32298776-32298905)
chr7 (37-230)||(23181228-23181421)
chr7 (43-238)||(27396835-27397030)
chr7 (43-228)||(42019837-42020022)
chr7 (119-231)||(40380000-40380112)
chr7 (72-235)||(5457176-5457339)
chr7 (43-234)||(24388816-24389007)
chr7 (91-233)||(17886778-17886920)
chr7 (97-231)||(33808323-33808457)
chr7 (43-231)||(2640418-2640607)
chr7 (103-231)||(42362450-42362578)
chr7 (91-233)||(18086287-18086429)
chr7 (96-232)||(17102019-17102155)
chr7 (91-231)||(18087626-18087766)
chr7 (94-232)||(22871568-22871706)
chr7 (96-236)||(32298998-32299138)
chr7 (119-230)||(6253472-6253583)
chr7 (43-228)||(37656855-37657038)
chr7 (119-232)||(6571012-6571125)
chr7 (96-232)||(27991738-27991874)
chr7 (124-232)||(47945356-47945464)
chr7 (114-230)||(47946785-47946901)
chr7 (124-232)||(47950786-47950894)
chr7 (114-230)||(47952215-47952331)
chr7 (1-72)||(6571180-6571251)
chr7 (1-72)||(24389017-24389088)
chr7 (43-206)||(32053383-32053546)
chr7 (156-231)||(43123175-43123250)
chr7 (160-234)||(28105498-28105572)
chr7 (119-232)||(19204488-19204601)
chr7 (119-235)||(20426646-20426762)
chr7 (1-72)||(32298895-32298966)
chr7 (157-231)||(18670217-18670291)
chr7 (117-230)||(1960189-1960302)
chr7 (117-230)||(34799472-34799585)
chr7 (99-212)||(42618205-42618318)
chr7 (1-72)||(27396754-27396825)
chr7 (91-222)||(32934357-32934488)
chr7 (91-233)||(32688506-32688648)
chr7 (91-212)||(25453147-25453268)
chr7 (91-212)||(32068382-32068503)
chr7 (99-212)||(32934642-32934755)
chr7 (96-168)||(6571241-6571313)
chr7 (91-210)||(25628499-25628618)
chr7 (99-238)||(33828268-33828407)
chr7 (117-232)||(34793903-34794018)
chr7 (100-235)||(43266561-43266696)
chr7 (91-209)||(10600235-10600353)
chr7 (43-140)||(3914229-3914326)
chr7 (72-233)||(22828087-22828247)
chr7 (91-212)||(32068115-32068236)
chr7 (91-212)||(42617930-42618051)
chr7 (96-212)||(32680857-32680973)
chr7 (125-212)||(16803967-16804054)
chr7 (99-237)||(43266260-43266398)
chr7 (119-232)||(13384501-13384614)
chr7 (99-208)||(18855950-18856059)
chr7 (91-212)||(22081845-22081966)
chr7 (103-212)||(23058448-23058557)
chr7 (99-212)||(25628772-25628885)
chr7 (99-212)||(28890598-28890711)
chr7 (124-204)||(5455854-5455934)
chr7 (124-232)||(32687396-32687504)
chr7 (43-189)||(45010640-45010783)
chr7 (183-241)||(29141556-29141614)
chr7 (180-234)||(29144359-29144413)
chr7 (98-212)||(46204440-46204554)
chr7 (100-210)||(46205604-46205714)
chr7 (91-212)||(22081579-22081699)
chr7 (43-140)||(13311276-13311370)
chr7 (91-193)||(25453414-25453516)
chr7 (157-223)||(30128701-30128767)
chr7 (91-212)||(39274889-39275011)
chr7 (91-212)||(23058715-23058836)
chr7 (91-212)||(27138227-27138348)
chr7 (43-140)||(48789043-48789140)
chr7 (119-199)||(43124468-43124548)
chr7 (73-168)||(12229342-12229437)
chr7 (183-232)||(30127440-30127489)
chr7 (1-73)||(13311194-13311266)
chr7 (181-233)||(20425476-20425528)
chr7 (172-212)||(23608827-23608867)
chr7 (165-239)||(6764169-6764246)
chr7 (96-211)||(30948422-30948537)
chr7 (79-162)||(33809380-33809463)
chr7 (144-226)||(42363727-42363808)
chr7 (97-149)||(22827076-22827128)
[»] chr5 (111 HSPs)
chr5 (1-232)||(3528872-3529103)
chr5 (1-232)||(11761916-11762146)
chr5 (1-241)||(14194413-14194653)
chr5 (1-233)||(28770867-28771099)
chr5 (1-231)||(27587315-27587543)
chr5 (1-236)||(17202597-17202832)
chr5 (1-230)||(16156856-16157085)
chr5 (1-238)||(19892301-19892538)
chr5 (1-232)||(6301741-6301970)
chr5 (1-241)||(39453498-39453737)
chr5 (1-238)||(6150618-6150855)
chr5 (1-233)||(28269420-28269652)
chr5 (1-232)||(32242440-32242670)
chr5 (1-230)||(19517805-19518034)
chr5 (1-228)||(11047635-11047861)
chr5 (1-232)||(16083141-16083372)
chr5 (1-231)||(5024019-5024249)
chr5 (1-231)||(186617-186847)
chr5 (1-231)||(38475033-38475263)
chr5 (1-226)||(8322602-8322827)
chr5 (1-233)||(29646360-29646592)
chr5 (1-218)||(5994087-5994304)
chr5 (1-207)||(21265167-21265373)
chr5 (5-230)||(38442269-38442494)
chr5 (6-241)||(20814126-20814360)
chr5 (1-212)||(6757884-6758095)
chr5 (19-230)||(35920229-35920440)
chr5 (1-228)||(10684137-10684362)
chr5 (1-212)||(41930683-41930894)
chr5 (5-232)||(18247286-18247505)
chr5 (43-228)||(43159054-43159239)
chr5 (43-232)||(6301545-6301731)
chr5 (3-168)||(13362290-13362455)
chr5 (1-211)||(1506134-1506344)
chr5 (1-211)||(31482422-31482632)
chr5 (43-234)||(5993886-5994077)
chr5 (43-233)||(20814375-20814565)
chr5 (43-229)||(39453302-39453488)
chr5 (1-228)||(18670363-18670575)
chr5 (96-229)||(35512407-35512540)
chr5 (5-211)||(297034-297240)
chr5 (96-233)||(13963122-13963259)
chr5 (43-236)||(35512143-35512336)
chr5 (43-235)||(32242238-32242430)
chr5 (43-232)||(17202398-17202587)
chr5 (43-235)||(13962860-13963052)
chr5 (73-228)||(11740690-11740845)
chr5 (43-233)||(14194663-14194852)
chr5 (43-229)||(19892548-19892734)
chr5 (43-228)||(13362468-13362653)
chr5 (43-232)||(16157095-16157284)
chr5 (98-233)||(27937053-27937186)
chr5 (43-230)||(18247087-18247272)
chr5 (85-233)||(20840729-20840867)
chr5 (117-234)||(37991196-37991313)
chr5 (99-230)||(11741813-11741944)
chr5 (46-233)||(20840531-20840718)
chr5 (125-232)||(42265734-42265841)
chr5 (38-228)||(5024253-5024443)
chr5 (43-224)||(38442075-38442256)
chr5 (96-234)||(24547174-24547325)
chr5 (43-232)||(11047437-11047625)
chr5 (43-232)||(186419-186607)
chr5 (119-232)||(6150453-6150566)
chr5 (119-232)||(11761748-11761861)
chr5 (127-228)||(21257485-21257586)
chr5 (119-239)||(27587140-27587260)
chr5 (43-232)||(21265383-21265571)
chr5 (1-72)||(24547315-24547386)
chr5 (90-232)||(24547412-24547554)
chr5 (125-238)||(5835748-5835861)
chr5 (96-231)||(3529135-3529270)
chr5 (43-219)||(29646602-29646777)
chr5 (5-72)||(27937178-27937245)
chr5 (119-229)||(37992604-37992714)
chr5 (43-140)||(10684030-10684127)
chr5 (94-231)||(28771129-28771266)
chr5 (96-233)||(38475292-38475429)
chr5 (86-209)||(5255040-5255162)
chr5 (119-232)||(18670201-18670311)
chr5 (1-72)||(35512346-35512417)
chr5 (99-233)||(17544342-17544476)
chr5 (91-212)||(8875468-8875589)
chr5 (96-229)||(16082979-16083112)
chr5 (91-212)||(33871358-33871479)
chr5 (119-231)||(35920500-35920612)
chr5 (96-212)||(41930535-41930651)
chr5 (1-72)||(13963062-13963132)
chr5 (98-212)||(33871631-33871745)
chr5 (43-140)||(8322495-8322592)
chr5 (119-225)||(5256328-5256433)
chr5 (91-241)||(20152771-20152921)
chr5 (98-233)||(20153211-20153343)
chr5 (124-232)||(5835622-5835730)
chr5 (32-140)||(12904845-12904953)
chr5 (124-232)||(24141451-24141559)
chr5 (43-106)||(27937259-27937322)
chr5 (99-193)||(17544086-17544180)
chr5 (96-212)||(6758127-6758243)
chr5 (84-232)||(40150095-40150243)
chr5 (117-233)||(42067838-42067954)
chr5 (91-209)||(22298564-22298682)
chr5 (183-228)||(27937379-27937424)
chr5 (185-233)||(28269762-28269809)
chr5 (173-231)||(30096912-30096970)
chr5 (91-140)||(21287834-21287883)
chr5 (183-224)||(24204977-24205018)
chr5 (94-211)||(31482662-31482779)
chr5 (43-110)||(4700351-4700418)
chr5 (101-140)||(21287953-21287992)
chr5 (189-238)||(31006707-31006756)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (5-231)||(30337620-30337846)
chr6 (1-241)||(12080834-12081074)
chr6 (1-233)||(30725957-30726189)
chr6 (1-232)||(33517732-33517963)
chr6 (5-241)||(30804063-30804299)
chr6 (1-232)||(3059455-3059685)
chr6 (1-232)||(21627712-21627943)
chr6 (17-234)||(33647165-33647382)
chr6 (1-232)||(17734195-17734424)
chr6 (4-212)||(14196634-14196842)
chr6 (74-229)||(11434804-11434959)
chr6 (1-211)||(28000405-28000615)
chr6 (43-232)||(21627953-21628142)
chr6 (119-233)||(681044-681158)
chr6 (96-232)||(11393097-11393233)
chr6 (43-231)||(30725760-30725947)
chr6 (119-233)||(13379798-13379912)
chr6 (119-232)||(679865-679978)
chr6 (43-229)||(12080638-12080824)
chr6 (43-228)||(33517537-33517722)
chr6 (119-233)||(20651008-20651122)
chr6 (119-236)||(8090243-8090360)
chr6 (37-233)||(30803859-30804055)
chr6 (43-238)||(3059250-3059445)
chr6 (89-236)||(26463174-26463321)
chr6 (96-233)||(30337447-30337584)
chr6 (38-211)||(362890-363063)
chr6 (119-232)||(20651963-20652076)
chr6 (91-231)||(15115339-15115479)
chr6 (43-203)||(11392866-11393026)
chr6 (85-231)||(12407508-12407654)
chr6 (124-233)||(12408492-12408601)
chr6 (43-224)||(33646970-33647151)
chr6 (91-212)||(7160823-7160944)
chr6 (91-236)||(21836316-21836461)
chr6 (104-232)||(8089442-8089570)
chr6 (1-76)||(25486084-25486159)
chr6 (99-228)||(22617886-22618016)
chr6 (99-212)||(31407172-31407285)
chr6 (101-237)||(7161100-7161236)
chr6 (127-231)||(15116556-15116660)
chr6 (1-72)||(11393036-11393107)
chr6 (96-230)||(17734456-17734590)
chr6 (91-212)||(22502793-22502914)
chr6 (91-212)||(22503060-22503181)
chr6 (99-212)||(25485972-25486085)
chr6 (91-212)||(6517522-6517642)
chr6 (124-212)||(14196905-14196993)
chr6 (101-212)||(7905262-7905373)
chr6 (91-212)||(7905529-7905650)
chr6 (91-212)||(31406897-31407018)
chr6 (96-233)||(32593488-32593625)
chr6 (124-228)||(141061-141165)
chr6 (124-228)||(149082-149186)
chr6 (91-210)||(21836053-21836170)
chr6 (172-231)||(26464568-26464627)
chr6 (99-240)||(15913842-15913983)
chr6 (96-211)||(22372950-22373065)
chr6 (119-212)||(25486211-25486304)
chr6 (89-233)||(28498311-28498455)
chr6 (89-233)||(29810722-29810866)
chr6 (104-211)||(22367445-22367552)
chr6 (96-211)||(28000647-28000762)
chr6 (99-140)||(12065311-12065352)
chr6 (91-151)||(11435957-11436017)
chr6 (155-206)||(11436008-11436059)
chr6 (78-205)||(24210557-24210684)
chr6 (91-209)||(15913570-15913688)
chr6 (91-140)||(10781444-10781493)
chr6 (181-229)||(8418414-8418461)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-228)||(139839-140066)
scaffold0020 (96-235)||(139668-139807)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (1-231)||(36417886-36418116)
chr3 (1-233)||(19740921-19741153)
chr3 (1-228)||(46474979-46475205)
chr3 (1-222)||(23457988-23458209)
chr3 (1-229)||(43384481-43384709)
chr3 (1-237)||(33689376-33689609)
chr3 (1-239)||(36314290-36314528)
chr3 (2-230)||(53756923-53757150)
chr3 (5-228)||(55052295-55052505)
chr3 (1-212)||(10770509-10770720)
chr3 (1-212)||(48322396-48322607)
chr3 (45-228)||(36417691-36417874)
chr3 (96-235)||(40758403-40758542)
chr3 (1-211)||(54466590-54466800)
chr3 (43-231)||(9294198-9294386)
chr3 (1-211)||(8041783-8041993)
chr3 (95-228)||(26463635-26463768)
chr3 (43-235)||(23458219-23458411)
chr3 (1-176)||(9294013-9294188)
chr3 (43-235)||(33689619-33689811)
chr3 (96-228)||(42343024-42343156)
chr3 (79-233)||(9367739-9367893)
chr3 (117-227)||(41558196-41558306)
chr3 (43-231)||(40758147-40758332)
chr3 (96-233)||(51993962-51994086)
chr3 (5-224)||(40033526-40033716)
chr3 (96-233)||(2796177-2796314)
chr3 (124-236)||(41558003-41558115)
chr3 (44-232)||(43384282-43384470)
chr3 (117-232)||(3849030-3849145)
chr3 (1-72)||(51994076-51994147)
chr3 (119-231)||(3850443-3850555)
chr3 (117-232)||(53856371-53856486)
chr3 (91-225)||(9368589-9368723)
chr3 (91-212)||(40788706-40788827)
chr3 (124-232)||(19741213-19741321)
chr3 (1-72)||(2796346-2796417)
chr3 (1-72)||(26463757-26463828)
chr3 (1-72)||(42342963-42343034)
chr3 (117-242)||(53856004-53856129)
chr3 (90-230)||(51994173-51994313)
chr3 (86-233)||(21185978-21186125)
chr3 (45-228)||(53756747-53756930)
chr3 (91-209)||(3469222-3469340)
chr3 (119-233)||(41988582-41988696)
chr3 (91-212)||(29118824-29118945)
chr3 (174-231)||(34142589-34142646)
chr3 (91-212)||(35643870-35643991)
chr3 (91-212)||(37778559-37778680)
chr3 (102-235)||(47856383-47856516)
chr3 (91-238)||(3469486-3469633)
chr3 (91-222)||(29685950-29686081)
chr3 (1-72)||(40758342-40758413)
chr3 (119-233)||(1079537-1079651)
chr3 (99-237)||(13948774-13948912)
chr3 (119-233)||(40033772-40033886)
chr3 (119-233)||(42342789-42342903)
chr3 (113-211)||(42855615-42855713)
chr3 (100-237)||(11910693-11910830)
chr3 (157-230)||(35712045-35712118)
chr3 (95-228)||(46474818-46474951)
chr3 (91-212)||(52032157-52032278)
chr3 (96-240)||(2796407-2796534)
chr3 (96-212)||(47551512-47551628)
chr3 (43-140)||(26463838-26463935)
chr3 (91-212)||(29686226-29686347)
chr3 (91-212)||(32306710-32306831)
chr3 (52-228)||(40506036-40506213)
chr3 (96-212)||(36314560-36314676)
chr3 (96-212)||(48322639-48322755)
chr3 (119-230)||(23276299-23276410)
chr3 (101-212)||(52032435-52032546)
chr3 (83-225)||(32431472-32431614)
chr3 (100-193)||(10307670-10307763)
chr3 (91-212)||(32306443-32306564)
chr3 (107-212)||(33506252-33506357)
chr3 (179-228)||(36150530-36150579)
chr3 (91-193)||(10294845-10294947)
chr3 (72-230)||(25108364-25108522)
chr3 (91-212)||(3596128-3596249)
chr3 (127-208)||(4323526-4323607)
chr3 (180-229)||(9292245-9292294)
chr3 (156-228)||(21783403-21783473)
chr3 (119-232)||(25107212-25107325)
chr3 (96-212)||(10770753-10770869)
chr3 (180-232)||(26463963-26464015)
chr3 (91-231)||(47857533-47857673)
chr3 (101-212)||(10294586-10294697)
chr3 (99-140)||(29118629-29118670)
chr3 (174-231)||(55052619-55052675)
chr3 (174-233)||(1078535-1078594)
chr3 (127-238)||(4322585-4322695)
chr3 (153-241)||(33154865-33154955)
chr3 (43-110)||(41988083-41988149)
chr3 (119-225)||(6956254-6956360)
chr3 (91-193)||(43998183-43998285)
chr3 (171-212)||(14634120-14634161)
chr3 (79-140)||(35712122-35712183)
chr3 (99-140)||(41422063-41422104)
chr3 (119-208)||(43608798-43608887)
chr3 (72-212)||(33156263-33156403)
chr3 (96-211)||(8041636-8041751)
chr3 (124-207)||(21783816-21783899)
chr3 (96-211)||(47921486-47921601)
chr3 (162-236)||(23272819-23272893)
chr3 (192-230)||(41989575-41989613)
chr3 (156-225)||(43607786-43607855)
chr3 (100-140)||(40788511-40788551)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-231)||(69163-69393)
scaffold0031 (43-231)||(68965-69153)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-231)||(37564-37793)
scaffold0005 (43-232)||(37803-37992)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-232)||(1936-2170)
scaffold0007 (96-233)||(1767-1904)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (1-236)||(14424-14659)
scaffold0075 (43-110)||(14669-14736)
scaffold0075 (157-231)||(14744-14818)
[»] scaffold0295 (2 HSPs)
scaffold0295 (5-232)||(2345-2558)
scaffold0295 (37-140)||(2234-2337)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-211)||(141614-141824)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (111-232)||(6387-6508)
[»] scaffold0559 (1 HSPs)
scaffold0559 (1-130)||(1400-1529)
[»] scaffold0775 (2 HSPs)
scaffold0775 (91-233)||(4960-5102)
scaffold0775 (91-225)||(6266-6400)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (91-240)||(11426-11575)
scaffold0328 (91-209)||(11162-11280)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (124-228)||(19860-19964)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (1-72)||(21128-21199)
scaffold0205 (124-212)||(21028-21116)
scaffold0205 (96-212)||(21231-21347)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (91-236)||(222075-222220)
scaffold0006 (91-210)||(221812-221929)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (99-237)||(914-1052)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (100-237)||(2387-2524)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (91-212)||(12525-12646)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (91-212)||(12066-12187)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (96-212)||(239844-239960)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16099222 - 16099453
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16099222 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 16099321  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16099322 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 16099421  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16099422 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 16099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 6658045 - 6658282
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6658045 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 6658144  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6658145 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctc 6658244  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6658245 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccaaaaata 6658282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 39498477 - 39498712
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  39498477 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcatattagtgacgtggca 39498576  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  39498577 gtgattaagttggtcaaaggattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgatccc 39498676  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39498677 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 39498712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11163284 - 11163054
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11163284 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 11163185  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  11163184 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctt 11163085  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11163084 taattgcaaagatcaaatacatatttaagcc 11163054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37895577 - 37895346
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37895577 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggca 37895478  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37895477 gtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgaccct 37895378  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37895377 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 37895346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 39423713 - 39423945
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  39423713 tttccaattttttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 39423812  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39423813 gtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatatagggatcaatttttaaacgacccc 39423912  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39423913 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 39423945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10712921 - 10713151
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10712921 tttccgattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 10713020  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10713021 gtgattaagttggtcaaaggacgacattttaaatgattaacgattgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacagaaaccaatttttaaacgaccct 10713120  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10713121 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 10713151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15848286 - 15848519
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15848286 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 15848385  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15848386 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagttcgcaaggattagcgaatacataaaccaatttttaaacgacccc 15848485  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15848486 taattgcaaggatgaaatacttatttaagcctaa 15848519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 36479920 - 36480144
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  36479920 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtga 36480019  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36480020 ttaagttggtcaaaggacgaaattttaaattattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgacccttaat 36480119  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  36480120 tgcaaggatgaaatacatatttaag 36480144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 36755291 - 36755517
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  36755291 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggagaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccatgtcatcaaattagtgaca----- 36755385  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  36755386 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccc 36755485  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36755486 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 36755517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 34448025 - 34448225
Alignment:
Q  33 tcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaa 132  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34448025 tcttaaggacaaaattgaaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaa 34448124  T
Q  133 atgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  34448125 atgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatatagggaccaatttttaaacaacccctaattgcaaggatgaaatacatgtttaagcct 34448224  T
Q  233 a 233  Q
    |    
T  34448225 a 34448225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1695970 - 1695760
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1695970 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 1695871  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  1695870 gtgattaatttggtcaaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 1695771  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  1695770 taattgcaagg 1695760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13995903 - 13995693
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13995903 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 13995804  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  13995803 gtgattaatttggtcaaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 13995704  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  13995703 taattgcaagg 13995693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33062280 - 33062070
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33062280 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 33062181  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  33062180 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 33062081  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  33062080 taattgcaagg 33062070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41248789 - 41248579
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  41248789 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggca 41248690  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||  |||||||||| | | ||    
T  41248689 gtgattaatttggtcaaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggatgaatttttaaatgccgcc 41248590  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  41248589 taattgcaagg 41248579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14900713 - 14900564
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  14900713 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggta 14900614  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaag 150  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14900613 gtgattaagtttgtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 14900564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 13692501 - 13692637
Alignment:
Q  84 aaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacc 183  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13692501 aaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggacc 13692600  T
Q  184 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13692601 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatac 13692637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 45556340 - 45556476
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45556340 tggcagtgattaagttggtcaaaggattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagcgaccaatttttaaacg 45556439  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45556440 acccctaattacaaggatcaaatacatatttaagcct 45556476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 9076330 - 9076495
Alignment:
Q  66 agtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaagga 165  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9076330 agtgattgtcacgtcatcgaattagtgatgtggcagtgattaagttggttaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaagga 9076429  T
Q  166 ttagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9076430 ttaacgaatacggagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagaataaaatacatatttaagcc 9076495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22051224 - 22051088
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  22051224 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggca 22051125  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22051124 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgat 22051088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 36382420 - 36382556
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36382420 tggcagtgattaagttggccaaaggacgaaattttaaatgattaacgattgcaagactagtttgcatggattagcgaatacagggaccaatttttaaacg 36382519  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36382520 acccttaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 36382556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15848276 - 15848087
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  15848276 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 15848177  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| || | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15848176 aatgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatataagcct 15848087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Original strand, 44045318 - 44045435
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44045318 ggacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatcaaat 44045417  T
Q  219 acatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44045418 acatatttaagcctaaaa 44045435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44713930 - 44713799
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  44713930 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacattgaccaatttttaaacg 44713831  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatattta 227  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44713830 acccttaattacaaggatgaaatacatattta 44713799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 33739870 - 33740080
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||  |||||    
T  33739870 tttccaattctttcatcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccgcgttatcaaattagtgatgtggca 33739969  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  33739970 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 33740069  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||| ||||    
T  33740070 taattgtaagg 33740080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 44714001 - 44714193
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  44714001 aaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 44714100  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | ||||||  ||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44714101 aatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaa-acatatttaagcctaaaa 44714193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6588823 - 6588686
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6588823 tgacctggcagtgatcaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaattttt 6588724  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6588723 aaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 6588686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2318356 - 2318492
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||  |||||    
T  2318356 tttccaattctttcttcaatattgtgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattaatgatgtggca 2318455  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgat 137  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  2318456 gtgattaagttggtcaaaagatgaaattttaagtgat 2318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39423703 - 39423515
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  39423703 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 39423604  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | | ||||  ||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  39423603 aatacaaggataaattgccagaattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccgtaattacaaggatgaaatacgtatttaagcc 39423515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36382349 - 36382158
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||      
T  36382349 aaaattggaattttatgtctgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaac 36382250  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36382249 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaaggatgaaatacatacttaagcctaa 36382158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3555385 - 3555249
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  3555385 tggcagtgattaactgggttaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgtaaggaataacgaatacagagaccaatttttaaacg 3555286  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3555285 acccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 3555249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 25231118 - 25231278
Alignment:
Q  73 gccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtga 172  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  25231118 gccacgtcatcatattaatgacgtggcagtcattaactgggacaagggacgaaattttaaatgattaaagtttgcaagggtaatttgctaggattagcga 25231217  T
Q  173 atacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25231218 atacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggattaaatacatatttaagccta 25231278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 37895587 - 37895772
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  37895587 aaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 37895686  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37895687 aatgcaagtgtaaattgccaggattagcgattacgggaaccattttttaaacgacccataattgcaaggatgaaatacatatttaa 37895772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44044226 - 44044113
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44044226 ggacgaaattttaaatgattaatgattacaaggttagttttcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaaccacccctaattgcagggatcaaat 44044127  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  44044126 acatatttaagcct 44044113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10712911 - 10712719
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||      
T  10712911 aaaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaac 10712812  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | ||||||  ||| |||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10712811 aatgcaagggtaaattgccaggattaatgattataaggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaaggatgaaatacatacttaagtctaaa 10712719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25230214 - 25230102
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25230214 ggacgaaattttaaatgattagtaattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggattaaat 25230115  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  25230114 acatatttaagcc 25230102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36479906 - 36479719
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  36479906 aaaattggagtttcatgtatgacagttattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaac 36479807  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgc-aaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  |||  ||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36479806 aatgcaagggtaaaatgctaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaaggatgaaatacatatttaag 36479719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30729754 - 30729621
Alignment:
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30729754 gcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaacgattaaagaatgcaagggcaatttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgac 30729655  T
Q  198 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30729654 gtctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 30729621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2318346 - 2318160
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  2318346 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcattaattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 2318247  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2318246 aatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacatagaccaatttttaaacta-ccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Original strand, 2318836 - 2318939
Alignment:
Q  129 ttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2318836 ttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaacgaatagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccctaattggaaggatgaaatacatatttaa 2318935  T
Q  229 gcct 232  Q
    ||||    
T  2318936 gcct 2318939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 11163314 - 11163453
Alignment:
Q  94 catggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||    ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11163314 catggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcagaggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 11163413  T
Q  194 cgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163414 cgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 11163453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45556249 - 45556111
Alignment:
Q  94 catggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45556249 catggcagtgattaagtagggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcagggataaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 45556150  T
Q  194 cgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45556149 cgatccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 45556111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6658013 - 6657876
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6658013 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccatgattagtgattacagggaccaatttttaaacg 6657914  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6657913 accccaaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 6657876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16099190 - 16099055
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16099190 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaatg 16099091  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16099090 acccctaattgcaagaatcaaatacatatttaagcc 16099055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 36382359 - 36382430
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36382359 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 36382430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34448000 - 34447812
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||| |||| |||||      
T  34448000 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattt-aaattattaaac 34447902  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34447901 aatgcaagggtaaattgtcaggatttgcgattatagggaccaatttttaaatgacccctaattacaaggatgaaatacatatttaagcct 34447812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 22051234 - 22051421
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | || || |||||||||||||||||      
T  22051234 aaaattgaaacttcatatatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatatggcagtgattaggtgggagagag-acgaaattttaaatgattaaac 22051332  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22051333 aatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagagactaatttttaaacaacctctaattgcaagaatgaaatacatatttaagcc 22051421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 44713991 - 44713920
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44713991 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 44713920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 45556279 - 45556350
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45556279 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaaggacaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 45556350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 21370518 - 21370630
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  21370518 ggacgaaattttaaattattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattaacgaatacatggatcaatttttaaacgacctataattacaaggatgaaat 21370617  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  21370618 acatatttaagcc 21370630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28228817 - 28228665
Alignment:
Q  84 aaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacc 183  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||| | |||||  || ||||||||||    
T  28228817 aaattagggacatggcagtcattaagtgggttaaggaactaaatttcaaatgattaaactttgaaagagtaatttgccacgattaacgattacagggacc 28228718  T
Q  184 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  28228717 aatttttaaatgacccctaattgcagggacgaaacacatattaaagcctaaaa 28228665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 3556330 - 3556437
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  3556330 aaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaaggatgaaatgtata 3556429  T
Q  224 tttaagcc 231  Q
    ||||||||    
T  3556430 tttaagcc 3556437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 15604631 - 15604746
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||    
T  15604631 ggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactagtttttaaatga 15604730  T
Q  197 cccctaattgcaagga 212  Q
    | ||||||||||||||    
T  15604731 cacctaattgcaagga 15604746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36755281 - 36755094
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  36755281 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 36755182  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | || |||  ||| |||  |||||||| |  |||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  36755181 aatgtaagggtaaattgttaggattagcggttacatgaaccaatttttaaacgacctctaattataaagatgaaatacatatttaagc 36755094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15604479 - 15604358
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  15604479 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 15604380  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  15604379 aaatgacacctaattgcaagga 15604358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 28226030 - 28226151
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  28226030 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 28226129  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  28226130 aaatgacgcctaattgcaagga 28226151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 6307039 - 6307145
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6307039 aaattttaaatgattaaataatgcaggactaatttgtaaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgaccactaattgcaa-gatgaaatacata 6307137  T
Q  224 tttaagcc 231  Q
    ||||||||    
T  6307138 tttaagcc 6307145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 8710754 - 8710875
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  8710754 tgacgtggcagtgataaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 8710853  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  8710854 aaatgacgcctaattgcaagga 8710875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39498445 - 39498317
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | || | |  ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  39498445 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacg 39498346  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39498345 acccctaattacaaggatcaaatacatat 39498317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 242
Target Start/End: Original strand, 39936535 - 39936685
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||||  || |||| ||||||| ||||    
T  39936535 tgacgtggcattgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattacaaggaccaa-tttt 39936633  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatatg 242  Q
    |||| || |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  39936634 aaaccacgcctaattgcagggacgaaacacatattaaagcctataaaatatg 39936685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 41588344 - 41588465
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |||  ||| |||| || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  41588344 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagtgtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 41588443  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| |||||||| |||||    
T  41588444 aaatgacgcctaattgtaagga 41588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 8342471 - 8342586
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||  ||| |||  ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  8342471 ggcagtgattaagttgttcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattattgattacagagactaatttttaaatga 8342570  T
Q  197 cccctaattgcaagga 212  Q
    | |||||||| |||||    
T  8342571 cgcctaattgtaagga 8342586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8342327 - 8342206
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||   | ||||  ||| |||||||    
T  8342327 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattaccaattacatagactaattttt 8342228  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  8342227 aaatgacgcttaattgcaagga 8342206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11830504 - 11830383
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  11830504 tgacgtggcagtgattgagtttgtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcaattacagggactaattttt 11830405  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||  |||||||||||||    
T  11830404 aaatgacgtctaattgcaagga 11830383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 14900745 - 14900859
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||    | |||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  14900745 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaca--tacaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaacg 14900842  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||    
T  14900843 acccctaattgcaagga 14900859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41587366 - 41587254
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  |||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||     
T  41587366 cagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaattttccaggattaacgattaca-ggaccaatttttaaatgact 41587268  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    | ||||||||||||    
T  41587267 cttaattgcaagga 41587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17266594 - 17266523
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17266594 tttccaattttttcttccatcttctttcctcttcttaagggcaaaattggaatatcatgtgtgacagtgatt 17266523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Original strand, 21744268 - 21744353
Alignment:
Q  260 tagttctttacttgctaagactgctagtcaaaaagaggtatgcagggttttaaagat--tatttttcatgcttcaaagtcaaggca 343  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21744268 tagttctttacttgttaaggctgctagttcaaaagggctatgcagggttgtaaagatgatatatttcatgcttcaaattcaaggca 21744353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Original strand, 43742000 - 43742105
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||||   |||||||  |||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  |||||||||||     
T  43742000 ttttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgtcaggattaatgattacatggaccaatttttaaatgacctccaattgcagggacgaaatacatattg 43742099  T
Q  227 aagcct 232  Q
    ||||||    
T  43742100 aagcct 43742105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 28230060 - 28230168
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||  |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||| |||||    
T  28230060 aaattttaaatgattaaactttgaaagggtaatttgctaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccataattacagggacgaaacacata 28230159  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    || ||||||    
T  28230160 ttaaagcct 28230168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 205
Target Start/End: Original strand, 202672 - 202758
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaatt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||||| ||||||||| |||||||  || |||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  202672 ggacgaaattttaaatgattaaactctgcaaggctaatttgccaggattaacgattacatggacgaatttttaaatgacccctaatt 202758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 205
Target Start/End: Original strand, 3653356 - 3653481
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||   | |||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| | |||||  || ||||     
T  3653356 tcatcagattagtgacgtggtagtgattaacttggaagagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcca-gattaacgattacat 3653454  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaatt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3653455 ggaccaatttttaaatgacccataatt 3653481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 6589680 - 6589781
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| || ||||  || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  6589680 aaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagaattaacgattacatggaccaatttttaaatgacccttaattgcagggacgaaacacata 6589779  T
Q  224 tt 225  Q
    ||    
T  6589780 tt 6589781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33739838 - 33739723
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  33739838 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 33739739  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  33739738 ccgcctaattgcaagg 33739723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 199096 - 199024
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||||  || |||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  199096 tttgcaaggattaacgattacaggaactaatttttaaatgatccctaattgcagggactaaacacatatttaa 199024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 117)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1425283 - 1425050
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1425283 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 1425184  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1425183 atgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 1425084  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1425083 taattgcaaggatcaaatacatatttaaacctaa 1425050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38955870 - 38956100
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  38955870 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 38955969  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38955970 gtgattaagttgatcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttacaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 38956069  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38956070 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 38956100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12199180 - 12198948
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  12199180 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 12199081  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  12199080 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccc 12198981  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12198980 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 12198948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12443608 - 12443376
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  12443608 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 12443509  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  12443508 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccc 12443409  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12443408 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 12443376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13186257 - 13186491
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13186257 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 13186356  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13186357 gtgattaacttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccc 13186456  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13186457 taattgcaaggatgaaatatatatttaagcctaaa 13186491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23663775 - 23663543
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  23663775 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgaaatcaaattagtgacgtggca 23663676  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23663675 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggttagtttccaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 23663576  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23663575 taattgcaaggatgaaatgcatatttaagccta 23663543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40318194 - 40317966
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  40318194 tttccaattctttattcaatattttgtcctcttcttaagggcaagattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 40318095  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40318094 gtgattaagttggtcaaatgacgcaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagacaaatttttaaacgacccc 40317995  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40317994 taattgcaaggatgaaatacatatttaag 40317966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 36928675 - 36928905
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36928675 ttccaattctctcttcaatattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcacgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcag 36928774  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||   ||    
T  36928775 tgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatagaccaatttttaaacgatatct 36928874  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36928875 aattgcaacgatgaaatacatatttaagcct 36928905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22915619 - 22915399
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22915619 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatttccacgtcatcaaattagtgacgtggca 22915520  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || | |    
T  22915519 atgattaaattggtcaaaagacgaaattgtaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacatggaccaatttttaaatgatctc 22915420  T
Q  201 taattgcaaggatcaaataca 221  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  22915419 taattgcaagaatcaaataca 22915399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4994883 - 4994653
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  4994883 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtcattgtcacgtcatcgaattagcgacgtggtagtga 4994784  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  4994783 ttaagttggtcaaaagacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttccaaggattagcgaatacagagatcaatttttaaacaatccctaat 4994684  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4994683 tgcaacgatgaaatacatatttaagcctaaa 4994653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 35756780 - 35756993
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||    
T  35756780 tttccaattatttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgtattagtgacgtggca 35756879  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga-ccc 199  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35756880 gtgcttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgacccc 35756979  T
Q  200 ctaattgcaaggat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  35756980 ctaattgcaaggat 35756993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11674861 - 11675072
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11674861 tttccaattctttctttaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 11674960  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  11674961 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 11675060  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  11675061 taattgcaagga 11675072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 34685456 - 34685690
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  34685456 tttctaattttttctttaatattttgtcctcttcttaaaggaaaaattagaatttcatatgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgaca 34685555  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  34685556 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaataca-agaccaatttttaaacgatccc 34685654  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34685655 taattgcaaggataaaatacatatttaagccaaaaa 34685690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 36325401 - 36325612
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  36325401 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaagttagtgacgtggca 36325500  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  36325501 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagagacgaatttttaaatgacgcc 36325600  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  36325601 taattgcaagga 36325612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44407087 - 44406877
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44407087 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 44406988  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  44406987 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 44406888  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  44406887 taattgcaagg 44406877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38845529 - 38845319
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38845529 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 38845430  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  38845429 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 38845330  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  38845329 taattgcaagg 38845319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4405892 - 4405743
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  4405892 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgaca 4405793  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaag 150  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  4405792 gtgattaagttggtcaaatgacgaaatttaaaataattaatgattgcaag 4405743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 2266659 - 2266869
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |    
T  2266659 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggaa 2266758  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  2266759 gtgattaatttggtcaaaggatcaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 2266858  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  2266859 taattgcaagg 2266869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 38862856 - 38862988
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38862856 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacg 38862955  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38862956 acccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 38862988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40775880 - 40775670
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40775880 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 40775781  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| |||||||   | |||||| || |||||||||| | | ||    
T  40775780 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacaggaacgaatttttaaatgccgcc 40775681  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  40775680 taattgcaagg 40775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8316788 - 8316652
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8316788 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaacg 8316689  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8316688 acccctaattgcaaggatgaaatgcatatttaagcct 8316652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 39071935 - 39072074
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39071935 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta-cgaatacagggaccaatttttaaacg 39072033  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39072034 acccttgattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaa 39072074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3041686 - 3041476
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3041686 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaggtcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 3041587  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | |||| |||| |||||||||| | | |     
T  3041586 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccgct 3041487  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  3041486 taattgcaagg 3041476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20385680 - 20385568
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385680 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 20385581  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  20385580 acatatttaagcc 20385568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12273053 - 12272920
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  12273053 tggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaacg 12272954  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272953 atccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 12272920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 31608753 - 31608946
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||       
T  31608753 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgccatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattagac 31608852  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  31608853 aatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacttatttaagccaaaaa 31608946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 40318204 - 40318393
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||||      
T  40318204 aaaattggaatttcatgtatgactgtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagaaggacgaaattttaaatgattaaac 40318303  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40318304 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaacaacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 40318393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31608743 - 31608526
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  31608743 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatgtgatagtgattggcacatcatcaaattagtgacgtggca 31608644  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||              |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| |||    
T  31608643 gtgattaagtttgtcaaatgacgaaattttaaattattaatga-------------atgcaaggattagcgaataca-tgatcaatttttaaacgatccc 31608558  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  31608557 taattacaaggatgaaatacatgtttaagcct 31608526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 16388761 - 16388954
Alignment:
Q  38 agggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgat 137  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||    
T  16388761 agggtaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgat 16388860  T
Q  138 taatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||  | ||||||  ||| |||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16388861 taaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacatgaaccaatttttaaatgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 16388954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23698444 - 23698308
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  23698444 tggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaactgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgattacagggactaatttttaaacg 23698345  T
Q  196 a-cccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23698344 accccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 23698308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 242
Target Start/End: Original strand, 7295197 - 7295366
Alignment:
Q  73 gccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtga 172  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| | | ||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7295197 gccacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattgactgggtcaaaggatgaaattttaaacgattaaagaatgcaagactagtttgcaaggattagcga 7295296  T
Q  173 atacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatatg 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7295297 atacagggaccgatttttaaacgatccataattgcaaggataaaatacatatttaaacctaaaatctatg 7295366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 20386746 - 20386859
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20386746 ggacgaaattttaaatgattaataattgcgaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 20386845  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  20386846 acatatttaagcct 20386859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39071864 - 39071676
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  39071864 aaaattggaatttcatttgtgatagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 39071765  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39071764 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 39071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 34061616 - 34061757
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  34061616 tgacatggcagtgattaacttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggcaatttgcaaggattagcgaatacatggatcaattttt 34061715  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34061716 aaacgacgtctaattgcaaggatgcaatacatatttaagcct 34061757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13186247 - 13186059
Alignment:
Q  44 aaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatga 143  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  13186247 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcattaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 13186148  T
Q  144 ttgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
     ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13186147 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgatccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 13186059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36186233 - 36186105
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36186233 cagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaataattaatgattgcaatactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaaattttaaaagacc 36186134  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatattta 227  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  36186133 cctaattacaaagatgaaatacatattta 36186105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 4405902 - 4406088
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  4405902 aaaatttgaatttcatgt--gacagtgattgccacgtcttcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaac 4405999  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4406000 attgcaagggtaaattgcaaggattaacaaatacatggaccaatttttaaacaacccctaattacaaggatgaaatacatatttaagcc 4406088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 4994897 - 4995085
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||      
T  4994897 aaaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacatggattaagtggggagagggacgaaatttgaaatgattaaac 4994996  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4994997 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagg-accaatttttaaatgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 4995085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 34177263 - 34177396
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34177263 tggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttacaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacg 34177362  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  34177363 acccctaattacaaagatgaaatacatatttaag 34177396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33357596 - 33357492
Alignment:
Q  133 atgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33357596 atgattaatgattgtaagactggtttgcaaggattagcgaatacatggatcaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 33357497  T
Q  233 aaaat 237  Q
    |||||    
T  33357496 aaaat 33357492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35756770 - 35756580
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  35756770 aaaattggaatttcatatatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 35756671  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | | ||||  ||| |||  ||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  35756670 aattcaaggataaattgtcaggattagtgattata-agaccaatttttaaatgacccctaattgc-atgatgaaatacatatttaagcctaaa 35756580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 30712033 - 30712143
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30712033 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacagg-accaatttttaaacggcccctaatcgcaaggatcaaat 30712131  T
Q  219 acatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||    
T  30712132 acatatttaagc 30712143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 30719810 - 30719920
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30719810 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacagg-accaatttttaaacggcccctaatcgcaaggatcaaat 30719908  T
Q  219 acatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||    
T  30719909 acatatttaagc 30719920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 23663807 - 23663944
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23663807 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacg 23663906  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23663907 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 23663944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 8316881 - 8317017
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  8316881 tggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacg 8316980  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316981 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 8317017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Original strand, 23698560 - 23698676
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23698560 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaaggatcaaat 23698659  T
Q  219 acatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  23698660 acatatttaagcctaaa 23698676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36928670 - 36928479
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||    
T  36928670 aagggtaaaattgaaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatga 36928571  T
Q  137 ttaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  36928570 ttaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagaccaatttttaaacgacccttaattgaaagg---aaatacatatttaagcc 36928479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8316849 - 8316778
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8316849 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 8316778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12273114 - 12273043
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12273114 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 12273043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23698505 - 23698434
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23698505 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 23698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7294233 - 7294103
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  7294233 cagtgattaactgggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttacaaggattagcgaatatagagatcaatttttaaacgacc 7294134  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7294133 tctaattgcaa-gatgaaatacatatttaagc 7294103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Original strand, 12273147 - 12273286
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||   ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  12273147 ggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacgggattaacgattacagggaccaatttttaaacga 12273246  T
Q  197 cccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12273247 cccctaattgcaaggatcaaatacatatttaaacctaaaa 12273286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30459513 - 30459363
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    ||||||||| || || |||||| |||  |||||| || |||||| ||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  30459513 agtgacatgacactggttaagtgggttgaaggaccaatttttaagtgattaaagaatgcaattgtaatttgcaaggattagtgaatacatagactaattt 30459414  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatata 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30459413 ttaaacgacgcctaattgtaaggatgaaatacatatttaagcc-aaaatata 30459363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 38862795 - 38862866
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38862795 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 38862866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Original strand, 7313319 - 7313436
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || |||||| |||||||| |||||| |  |  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7313319 aaggaccaatttttaagtgattaataattgcagggtttgtttgcaaggattagtgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggatcaa 7313418  T
Q  217 atacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7313419 atacatatttaagcctaa 7313436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 10445621 - 10445742
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  10445621 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 10445720  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  10445721 aaatgacacctaattgcaagga 10445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 36186307 - 36186496
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  36186307 aaaattggaatttcatgtgtgacactgattgtcacgtcatcaaattagtaatgtggcagtgattaagtagggagagggacgaaattttaaatgattaaac 36186406  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | |||||   ||| |||  |||||||| || || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36186407 aatgcaaaggtaaattgtcaggattagcgattata--gaccaa-ttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 36186496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34176573 - 34176443
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |    
T  34176573 cagtgattaactgggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaagaatgcaagactagtttgcaaggattaacgaatata---accaatttttaaacga-c 34176478  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34176477 cataattgcaaggatgaaatacatatttaaaccta 34176443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44664648 - 44664508
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  44664648 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggttaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 44664549  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  44664548 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacataattaagcc 44664508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Original strand, 2535843 - 2535978
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||  |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  2535843 tggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgtaagggtaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatg 2535942  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  2535943 acccctaattgcagggacgaaatacatattaaagcc 2535978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 39071874 - 39071945
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39071874 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgatt 39071945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7983559 - 7983426
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |    
T  7983559 agtgattaagtttttcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 7983460  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  7983459 ctaattgcaaggacgaaacacataattaagccta 7983426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 15230217 - 15230338
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  | |||||| || ||||||||| |||||||    
T  15230217 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacagggactaattttt 15230316  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  15230317 aaatgacacctaattgcaagga 15230338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16388650 - 16388578
Alignment:
Q  164 gattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16388650 gattagcgaatataggaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaa 16388578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 22915651 - 22915787
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | ||||  ||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  22915651 tggcagtgattaagtggggagagggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacg 22915750  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915751 atccctagttgcaaggatcaaatacatatttaagcct 22915787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31873125 - 31873017
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaa-gggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggc 99  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |    
T  31873125 tttccaattctttcttccatcttatttcctcttcttaaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtgac 31873026  T
Q  100 agtgattaa 108  Q
     ||||||||    
T  31873025 ggtgattaa 31873017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34060593 - 34060486
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaa-gactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatt 225  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  34060593 ttttaaatgattaaagaatgcaacgac-aatttgcaaggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacgtttaattgcaaggatgaaatacatatt 34060495  T
Q  226 taagcctaa 234  Q
    |||||||||    
T  34060494 taagcctaa 34060486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7306513 - 7306398
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || |||||| |||||||| |||||| |  |  |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7306513 aaggaccaatttttaagtgattaataattgcagggtttgtttgcaagaattagtgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggatcaa 7306414  T
Q  217 atacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  7306413 atacatatttaagcct 7306398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16388757 - 16388686
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16388757 tttccaattctttcttcaatattgtgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatt 16388686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25124703 - 25124584
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  25124703 tgacttggcagtggttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 25124604  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaag 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  25124603 aaatgacgcctaattgcaag 25124584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30710967 - 30710853
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  30710967 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaaaattagcgaatacatgaaccaa-ttttaaacaacctctaattgcaaagatcaaat 30710869  T
Q  219 acatatttaagcctaa 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  30710868 acatatttaaacctaa 30710853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Original strand, 42945400 - 42945519
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||| || |||||| || |||||||    
T  42945400 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaggaactaattttt 42945499  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaag 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  42945500 aaatgacgcctaattgcaag 42945519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Original strand, 1425315 - 1425448
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1425315 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagtgattacagg-accaatttttaaacg 1425413  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1425414 acctctaattacaaggatcaaatatatatttaagc 1425448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 237
Target Start/End: Original strand, 23507722 - 23507859
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||| |    
T  23507722 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgcaaggattagcaattacagggacgtatttttaaatgacgc 23507821  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    |||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||    
T  23507822 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctaaaat 23507859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2534807 - 2534695
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||    
T  2534807 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtagtttgcaaggattagcgattacatgtaccaatttttaaacgacccataattgcagggtcgaaat 2534708  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  2534707 acatatttaagcc 2534695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15230062 - 15229950
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |    
T  15230062 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatccaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 15229963  T
Q  200 ctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||    
T  15229962 ctaattgcaagga 15229950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8746469 - 8746314
Alignment:
Q  86 attagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaa 185  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||  | |||||  || ||||| |||| |    
T  8746469 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagtgacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgtcacgattaacgattacagtgaccga 8746370  T
Q  186 tttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  8746369 tttttaaatgacccctaattgcagggaggaaacacatacttaagccaaaaatatat 8746314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 35634393 - 35634527
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||     
T  35634393 cagtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacg 35634492  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  35634493 cttaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 35634527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37542364 - 37542246
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || || |||||| |||||||    
T  37542364 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattaaagggactaattttt 37542265  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  37542264 aaatgacgcctaattgcaa 37542246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 25124849 - 25124970
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  25124849 tgacgtggcagtgattaagttgttcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagagactaattttt 25124948  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  25124949 aaatgacacctaattgcaagga 25124970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 12199260 - 12199332
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12199260 ttgcaaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgactcctaattataaggatcaaatacatatttaag 12199332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 12443688 - 12443760
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12443688 ttgcaaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgactcctaattataaggatcaaatacatatttaag 12443760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36325369 - 36325253
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  36325369 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacg 36325270  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||| |||||    
T  36325269 acccctaattgtaagga 36325253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 205
Target Start/End: Original strand, 41353869 - 41353973
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  41353869 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgctagggtaaattgtcaggattagtgattacagggactaatttttaaatgacgcc 41353968  T
Q  201 taatt 205  Q
    |||||    
T  41353969 taatt 41353973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 42803542 - 42803646
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42803542 ttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccacgattggtgattatagggaccaatttttaaacgacttctaattgcaaggatgaaatacatattt 42803641  T
Q  227 aagcc 231  Q
    |||||    
T  42803642 aagcc 42803646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38955810 - 38955703
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |  ||| || | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38955810 aaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattaccaggattagcgattacaatgaccaatttttaaacgatccccaattgcaaggatcaaatacata 38955711  T
Q  224 tttaagcc 231  Q
    ||||||||    
T  38955710 tttaagcc 38955703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 234035 - 234168
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| ||  |    
T  234035 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 234134  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  234135 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 710446 - 710579
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| ||  |    
T  710446 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 710545  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  710546 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 710579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 747658 - 747791
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| ||  |    
T  747658 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 747757  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  747758 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 747791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 871553 - 871686
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| ||  |    
T  871553 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 871652  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  871653 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 871686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11674807 - 11674714
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11674807 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaagga 11674714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 44664794 - 44664915
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  44664794 tgacttggcaatgattaagttggtcaaataacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaattttt 44664893  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  44664894 aaatgacgcctaattgcaagga 44664915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23505183 - 23505071
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||| | ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||| |    
T  23505183 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaatgacgc 23505084  T
Q  200 ctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||    
T  23505083 ctaattgcaagga 23505071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36186297 - 36186238
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgt 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  36186297 tttccagttctttcttcaatattttgtcctcttcttaagtgcaaaattgatatttcatgt 36186238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5960116 - 5960046
Alignment:
Q  161 aaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5960116 aaggattagcgattacagggagcaatttttaatcgatccctaattgcaaggatgaaatacatgtttaagcc 5960046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6471830 - 6471684
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || || || |||  ||||||    
T  6471830 tgacgtggcagtgattaagttgataaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagagactcattttt 6471731  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||| ||||||||    
T  6471730 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctaaaat 6471684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Original strand, 8747533 - 8747611
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaag 150  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8747533 tgccacgtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggttaagggacgaaattttaaatgattaatgtttgcaag 8747611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 8997983 - 8998096
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  | |||||| || |||| | || |||||||||| |||     
T  8997983 cagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcatgattagcgattacatgaactaatttttaaatgacg 8998082  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  8998083 cctaattgcaagga 8998096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 42945254 - 42945205
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42945254 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaa 42945205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9065719 - 9065667
Alignment:
Q  177 agggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  9065719 agggaccaatttttaaacgacccctaattacaaagatgaaatacatatttaag 9065667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Original strand, 31873141 - 31873236
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||   | | || |||||||||||||||||    
T  31873141 aaaattggaatttcatgt--ggcaatgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagtgggaagaggaacaaaattttaaatgattaa 31873236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Original strand, 37542520 - 37542642
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||   || ||||  ||  ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  37542520 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattatcagaattaacgataacaggaaccaatttttaaatgacgc 37542619  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||    
T  37542620 ctaattgtaaggatgaaacacat 37542642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 240
Target Start/End: Original strand, 43181451 - 43181589
Alignment:
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    |||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||  | || ||| ||||||| |||||||||  || | || ||| |||||||||||||| ||||    
T  43181451 tgatcaagttggtcgaggaacgaaattttaaatgattaaacaatgtaaggctaatttacaaggattaacgattgcatggatcaatttttaaacgatccct 43181550  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatata 240  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||| ||| || |||||||    
T  43181551 aattacaaagacgaaatacatattaaagtcttaaatata 43181589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 6471985 - 6472025
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6471985 agtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaa 6472025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 10749833 - 10749937
Alignment:
Q  128 tttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattta 227  Q
    ||||| ||||||| | |||||||  |||||||  |||||||  || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| |    
T  10749833 tttaagtgattaacgtttgcaagggtaatttgacaggattaacgattacatggaccaatttttaaatgatccctaattgcaaggacgaaacacatattaa 10749932  T
Q  228 agcct 232  Q
    |||||    
T  10749933 agcct 10749937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41353705 - 41353593
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||||  || |||||||||| ||| |    
T  41353705 agtgattaagttgctcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcgattacagaaactaatttttaaatgacgc 41353606  T
Q  200 ctaattgcaagga 212  Q
    ||||||| |||||    
T  41353605 ctaattgtaagga 41353593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 9065741 - 9065799
Alignment:
Q  174 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9065741 tacaaggatcaatttttaaataacccctaattgcaaggatggaatacatatttaagcct 9065799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 11762997 - 11763103
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||| |||  ||| |||||    
T  11762997 aaattttaaatgattaacgtttgcaggagcaatttgtcaggattagcgattacaaggaccaatttttaaatgatccttaattgcagggacgaaacacata 11763096  T
Q  224 tttaagc 230  Q
    || ||||    
T  11763097 ttaaagc 11763103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21432833 - 21432712
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |  |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21432833 tgacttgggagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaaaattagtgattacagagactaattttt 21432734  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    | | |||  |||||||||||||    
T  21432733 atatgacgtctaattgcaagga 21432712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38003586 - 38003546
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38003586 agtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaa 38003546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38862662 - 38862618
Alignment:
Q  187 ttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38862662 ttttaaacggcccttaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 38862618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39474680 - 39474637
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39474680 tggcagtgattaagttggtcaaa-gacgaaattttaaatgattaa 39474637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 38845561 - 38845676
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  38845561 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 38845660  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  38845661 ccgcctaattgcaagg 38845676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4405738 - 4405700
Alignment:
Q  192 aacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4405738 aacgacccctaattgcaagaatgaaatacatatttaagc 4405700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16388692 - 16388647
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgatt 145  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16388692 agtgattaagttgatcaaagcacgaaattttaaataattaatgatt 16388647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 21432987 - 21433028
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21432987 cagtgattaagttggtcaaaggacgacattgtaaatgattaa 21433028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 27500382 - 27500423
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  27500382 cagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaa 27500423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 139)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 7452001 - 7452237
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7452001 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 7452100  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7452101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccc 7452200  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7452201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccaaaaat 7452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44967299 - 44967071
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44967299 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 44967200  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44967199 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccc 44967100  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44967099 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 44967071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23613476 - 23613706
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
T  23613476 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggta 23613575  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23613576 gtgattaagttggtcaaagaactaaattttaaatgattagtgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccc 23613675  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23613676 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 23613706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36009070 - 36008840
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36009070 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtga 36008971  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36008970 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaatgattagcgaatacagggaccaatttttaaacgatccctaat 36008871  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36008870 tacaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 36008840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49879437 - 49879208
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49879437 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggca 49879338  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49879337 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccc 49879238  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49879237 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 49879208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37248403 - 37248630
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37248403 tttccaattctttcttcattattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 37248502  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37248503 atgattaaattggtcaaaggacgaaatttaaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccc 37248602  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248603 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 37248630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50418897 - 50418666
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  50418897 ttccaattctttcttcaatattttgtcctctccttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcag 50418798  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50418797 tgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccct 50418698  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50418697 aattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 50418666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35028228 - 35027995
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  35028228 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcg 35028129  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35028128 gtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccc 35028029  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35028028 taattgcaaggatgaaatacatatttaaacctaa 35027995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34765610 - 34765378
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  34765610 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 34765511  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  34765510 gtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccgatttttaaacgaccct 34765411  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34765410 taattgcaaggataaaatacatatttaagccta 34765378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 51692717 - 51692949
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  51692717 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtgatagtaattgccacgtcatcgaattagtgacatgaca 51692816  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51692817 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 51692916  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51692917 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 51692949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17356155 - 17355924
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17356155 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 17356056  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  17356055 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgaatgcaagactagtttgcaaagattagcgaatacagcaaccaatttttaaacgactcc 17355956  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17355955 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 17355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 46661112 - 46661343
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  46661112 tttccaattctttctttaatattttgttctattcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 46661211  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46661212 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcgaggattagtaaatacagggaccaatttttaaacgacccc 46661311  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46661312 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 46661343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24711278 - 24711512
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24711278 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggca 24711377  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24711378 gtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgatgacatggaccaatttttaaacgacccc 24711477  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711478 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 24711512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43155757 - 43155532
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  43155757 tttccaattctttcttcaatatt--gtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggca 43155660  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43155659 gtgattaagttggtcaaatgactaaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgaccct 43155560  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43155559 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 43155532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 18831516 - 18831745
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |    
T  18831516 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgcgacgtcatcaaataagtgacgtggcgg 18831615  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18831616 tgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaatgattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 18831715  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18831716 aattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 18831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37976383 - 37976156
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  37976383 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 37976284  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  37976283 atgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaagattagcgaatacaggaaccagtttttaaacgacctc 37976184  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37976183 taattgcaaggatgaaatacatatttaa 37976156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15507903 - 15507674
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  15507903 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 15507804  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15507803 atgattaagttggtcaaaggacgaaatttgaaatgaataatgattgcacgactagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgaccct 15507704  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15507703 taattgcaaggatgaaatacatatttaagc 15507674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14801934 - 14802163
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  14801934 tttccaattctttcttcaatattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggca 14802032  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  14802033 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagaatagtttgctagaattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgatctc 14802132  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14802133 taattgcaaggatgaaatatatatttaagcc 14802163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54086921 - 54086698
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  54086921 caattctttcttcaatattttatcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgtcatgtcatcgaattagtgacgtggcagtga 54086822  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54086821 ttaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattacaagactagctttgaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaat 54086722  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  54086721 tgcaaggatgaaatacatatttaa 54086698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16006005 - 16006219
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16006005 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 16006104  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16006105 gtgattaagttggt-aaaggactaaattttaaatgattaatga-------------ttggaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccc 16006190  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16006191 taattgcaagaatcaaatacatatttaag 16006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 52909451 - 52909683
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||| ||||| || ||    
T  52909451 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggttgtgattgccacatcatcgaatttgtgacgtgaca 52909550  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||     
T  52909551 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaatgatcca 52909650  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52909651 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 52909683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 53129736 - 53129505
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  | |||    
T  53129736 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgaagttgca 53129637  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaa-tttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  53129636 gtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgtaaggattagcaaataca-tgaccaattttttaaacgatcc 53129538  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53129537 ctaattgcaatgataaaatacatatttaagcct 53129505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24411556 - 24411780
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |    
T  24411556 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgggtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggta 24411655  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24411656 gtgattaagttggtcaaaggacgaa----------attaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagggatcaatttttaaacgaccct 24411745  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24411746 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 24411780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9400749 - 9400538
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  9400749 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgaca 9400650  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  9400649 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacc 9400550  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  9400549 taattgcaagga 9400538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 232
Target Start/End: Original strand, 13058258 - 13058411
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13058258 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacag 13058357  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13058358 ggaccaatttttaaacgaccccttattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 13058411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33247503 - 33247292
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33247503 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 33247404  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  33247403 gtgattaagttggtccaaggaccaaa-tttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacc 33247305  T
Q  201 taattgcaaggat 213  Q
    |||||||||||||    
T  33247304 taattgcaaggat 33247292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4982956 - 4982745
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  4982956 tttctaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgaggca 4982857  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||  | |||| |||| ||||||||||  ||  |    
T  4982856 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaattacgtc 4982757  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  4982756 taattgcaagga 4982745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 53702010 - 53702227
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53702010 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcagaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 53702109  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||             ||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  53702110 ttgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaga-------------attaacgaataca-tgaccaatttttaaacaacctc 53702195  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53702196 taattgcaaagatgaaatacatatttaagcct 53702227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9144996 - 9144786
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9144996 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 9144897  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  9144896 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 9144797  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  9144796 taattgcaagg 9144786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34837304 - 34837094
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34837304 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 34837205  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  34837204 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 34837105  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  34837104 taattgcaagg 34837094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 38012337 - 38012547
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  38012337 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggca 38012436  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  38012437 gtgattaatttggtcaaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 38012536  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  38012537 taattgcaagg 38012547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42738261 - 42738051
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42738261 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 42738162  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  |||  ||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  42738161 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcaaggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 42738062  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  42738061 taattgcaagg 42738051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 27934699 - 27934847
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27934699 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattg-cacgtcatcaaattagtgacatggca 27934797  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaag 150  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27934798 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 27934847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 22566966 - 22567115
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22566966 tttccaattctttcttcaatattttgtccttttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattattgacgtggca 22567065  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaag 150  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22567066 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 22567115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24349826 - 24349667
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24349826 tcatcagattagtgacgtggcagtgattaactggggagagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacag 24349727  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24349726 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctagaata 24349667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 1179093 - 1179229
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1179093 tggcagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacg 1179192  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1179193 acccctaattgcaaagataaaatacatatttaagcct 1179229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Original strand, 32950313 - 32950519
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  32950313 caattctttcttcaacattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtga 32950412  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||||||    
T  32950413 ttaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccacctaat 32950512  T
Q  205 tgcaagg 211  Q
    |||||||    
T  32950513 tgcaagg 32950519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 232
Target Start/End: Original strand, 24350741 - 24350861
Alignment:
Q  112 ggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24350741 ggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgaatgcagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 24350840  T
Q  212 atcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24350841 atcaaatacatatttaagcct 24350861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35508466 - 35508278
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||| || |||||||||| || ||||||    
T  35508466 caattctttcttcaatattttgtccgcttcttaagggtaaaattggaatttaatgtgtggtagtgtttgccacgtcttcgaattagtgacgtgacagtga 35508367  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  35508366 ttaagttggtcaaa-gacaaaattttaaatgattaatgattgcaagaccagtttgtaatgattag-caataca-tgaccaatttttaaacga 35508278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 10781800 - 10781914
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10781800 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 10781899  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  10781900 acatatttaagccta 10781914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 34765620 - 34765810
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  34765620 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcctcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 34765719  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | |||||   ||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34765720 aatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggataaaatacatatttaagccta 34765810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10780832 - 10780712
Alignment:
Q  112 ggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10780832 ggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 10780733  T
Q  212 atcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10780732 atcaaatacatatttaagcct 10780712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10974441 - 10974321
Alignment:
Q  112 ggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10974441 ggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 10974342  T
Q  212 atcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10974341 atcaaatacatatttaagcct 10974321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52909441 - 52909254
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  52909441 aaaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaac 52909342  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52909341 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttgaacgacccctaattgcaaagatgaaatacatatttaagc 52909254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Original strand, 5369174 - 5369295
Alignment:
Q  110 ttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  5369174 ttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatgcagggaccaatttttaaacgacccctacttataa 5369273  T
Q  210 ggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5369274 ggatcaaatacatatttaagcc 5369295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14801924 - 14801735
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  14801924 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 14801825  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | | ||||  ||| |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14801824 aatacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 14801735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 35028238 - 35028427
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  35028238 aaaattggaatttcatgtgtgaaagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaac 35028337  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35028338 aatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaacatatggaccaatttttaaaatacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 35028427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 148071 - 148185
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  148071 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaataaagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaaat 148170  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  148171 acatatttaagccta 148185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 147431 - 147319
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  147431 ggacaaaattttaaattattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgtagggatgaaat 147332  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  147331 acatatttaagcc 147319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 17356165 - 17356348
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||| ||      
T  17356165 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca---catcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgatcaaac 17356261  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17356262 aatgcaagagtaaattgccaagattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccgtaattggaaggatgaaatacatatttaag 17356348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 234
Target Start/End: Original strand, 39539194 - 39539349
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  || ||||     
T  39539194 tcatcaaattaatgatgtggcagtcattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgcaagaattaacgattacat 39539293  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39539294 tgaccaatttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaa 39539349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 11108161 - 11108265
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11108161 aaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacaaggatcaatttttaaacgatccctaattgcaaggatgaaatacata 11108260  T
Q  224 tttaa 228  Q
    |||||    
T  11108261 tttaa 11108265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 35508480 - 35508671
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |   || |||||||||||||||||      
T  35508480 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattaatgacatggcagtgattaagtggggagagatacgaaattttaaatgattaaac 35508579  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | ||||||  ||| |||  || ||||  || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35508580 aatgcaagggtaaattgttagaattaacgattacaaggattaatttttaaacgacccctaattgcaatgataaaatacatatttaagcctaa 35508671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 37976393 - 37976584
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  37976393 aaaattggaatttcatgtatgactgtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaac 37976492  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | |||||   ||| |||  || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  37976493 aatgcaatgataaattgtcagaattagcgattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgccatgatgaaatacatatttaagcctaa 37976584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24411546 - 24411360
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   | |||| ||  |||||||||||||      
T  24411546 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgggagtgattaagtgggaagagggacgaatctttaaatgattaaac 24411447  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24411446 aatgcaagggtaaattgtcagggttagcgattacagggaccaatttttaaactacccctaattgctaggatgaaatacatatttaag 24411360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53702000 - 53701814
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||      
T  53702000 aaaataggaatttcatgtgtgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggaagaaattttaaatgattaaac 53701901  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  53701900 aatgcaaggataaattgtcaggattagagattacagagatcaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatagatatttaag 53701814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 54086929 - 54087127
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||    
T  54086929 aagggtaaaattgaaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgttagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatga 54087028  T
Q  137 ttaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||  | ||||||  ||| |||  | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  54087029 ttaaacaatgcaagggtaaattgtcatgattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaatgatgaaatacatatttaagtctaaa 54087127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Original strand, 50418953 - 50419075
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||  |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50418953 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcgattagagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 50419052  T
Q  219 acatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50419053 acatatttaagcctaaaatatat 50419075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 15507913 - 15508105
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  15507913 aaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 15508012  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
      |||||   ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15508013 catgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaaggac-aatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagtctaaaa 15508105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24711223 - 24711110
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711223 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaacggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 24711124  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  24711123 acatatttaagcct 24711110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 44967331 - 44967468
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44967331 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 44967430  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44967431 acctctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 44967468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 53129746 - 53129935
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||| ||| ||      
T  53129746 aaaattagaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgatgaaac 53129845  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||| ||  ||| ||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53129846 aatgcgagggtaaattgcaaggattagcgattacgaggatcaatttttaaacgacccctgattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 53129935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54713769 - 54713649
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  54713769 tgacatggcaatgattaacagggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagattaattttt 54713670  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  54713669 aaacgacccc-aattgcaagga 54713649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7451946 - 7451830
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7451946 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 7451847  T
Q  219 acatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  7451846 acatatttaagcctaaa 7451830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13058172 - 13058033
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  13058172 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattaccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacg 13058073  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13058072 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 13058033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 55867430 - 55867544
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  || |||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55867430 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagtttgcaaggattaacgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatcaaat 55867529  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  55867530 acatatttaagccta 55867544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27069050 - 27068905
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27069050 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 27068951  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||| ||  ||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  27068950 aaatgatgcctaattgcaaggacgaaacacatccttaagcctaaaa 27068905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37248343 - 37248238
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37248343 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggttcaaatacata 37248244  T
Q  224 tttaag 229  Q
    ||||||    
T  37248243 tttaag 37248238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5369082 - 5368946
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  5369082 tggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacg 5368983  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5368982 atccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 5368946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 10408180 - 10408296
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  10408180 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatg 10408279  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  10408280 acgcctaattgcaagga 10408296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18831456 - 18831348
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||  ||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18831456 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgtaaggatcaaatacata 18831357  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    |||||||||    
T  18831356 tttaagcct 18831348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23613444 - 23613308
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23613444 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacg 23613345  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23613344 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 23613308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 43155789 - 43155926
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  43155789 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcagggataaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacg 43155888  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43155889 acccctaattataaggatcaaatacatatttaagccta 43155926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52573368 - 52573223
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| ||| |||| |||||||| || |||||| || |||||||    
T  52573368 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacaggtactaattttt 52573269  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  52573268 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaagcctaaaa 52573223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54858700 - 54858579
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  54858700 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 54858601  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  54858600 aaatgacgcctaattgcaagga 54858579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48528560 - 48528484
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528560 tttgcaaggattgacgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 48528484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 232
Target Start/End: Original strand, 30642421 - 30642575
Alignment:
Q  78 gtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaataca 177  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||  || ||||    
T  30642421 gtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagactaatttgctaggattaacgattaca 30642520  T
Q  178 gggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
      ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||||    
T  30642521 atgatgaatttttaaatgacccataattgcagggacgaaacacatattaaagcct 30642575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 13058204 - 13058261
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13058204 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcat 13058261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 55866187 - 55866101
Alignment:
Q  153 taatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55866187 taatttgcaaggattagtgaatacaa--accaatttttaaacgacccctaattgcagggacgaaatacatatttaagccaaaaatatat 55866101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 11448050 - 11448158
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  11448050 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgcaaggattagcgattacagagatcaatttttaaacgacccctaattacagggacgaaatacata 11448149  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    |||||||||    
T  11448150 tttaagcct 11448158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27934667 - 27934551
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  27934667 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaacg 27934568  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||    
T  27934567 acccctaattgcaagga 27934551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Original strand, 8439499 - 8439626
Alignment:
Q  78 gtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaataca 177  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||  || ||||    
T  8439499 gtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatgtttgcaaggataatttgctaggattaacgattaca 8439598  T
Q  178 gggaccaatttttaaacgacccctaatt 205  Q
      || |||||||||||| |||| |||||    
T  8439599 atgatcaatttttaaacaacccttaatt 8439626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 234
Target Start/End: Original strand, 36009106 - 36009245
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| || | |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  36009106 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaatttccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacg 36009205  T
Q  196 acccc-taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36009206 accccctaattacaaggatcaaatacatatttaagcctaa 36009245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 39667062 - 39667183
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||| | |||||||  || |||||||||||||||||    
T  39667062 tgacgtggcggtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttaccaggattaacgattacagggaccaattttt 39667161  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||    
T  39667162 aaatgacccgtaattacaagga 39667183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45463213 - 45463092
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  45463213 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 45463114  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  45463113 aaatgacgcctaattgcaagga 45463092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 54858846 - 54858967
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || |||| |||| |||||||    
T  54858846 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 54858945  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  54858946 aaatgacgcctaattgcaagga 54858967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1178174 - 1178056
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||             |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||     
T  1178174 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaag-------------gattagcgaatacatg-accaatttttaaacgacct 1178089  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1178088 ctaattacaaggatgaaatacatatttaagcct 1178056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3032717 - 3032601
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||||| |    
T  3032717 tggcggtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaatttttaaatg 3032618  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  3032617 acgcctaattgcaagga 3032601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 9400809 - 9400897
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9400809 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacccctaattgcaagga 9400897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 5369118 - 5369177
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttgg 64  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5369118 caattttttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgtttgg 5369177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Original strand, 49879469 - 49879596
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  49879469 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagatcagtttttaaacg 49879568  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49879569 acccctaattgcaaggatcaaatacata 49879596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8438410 - 8438305
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  8438410 gtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagagtaatttgccaggattaacgattaca-tgaccaatttttaaatgacccc 8438312  T
Q  201 taattgc 207  Q
    |||||||    
T  8438311 taattgc 8438305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51692665 - 51692543
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||| |||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51692665 ggacgaaattttaagtgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagatcaatttttaaacgacctctaattgcaaggatgaaat 51692566  T
Q  219 acatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  51692565 acatatttaagcctataatatat 51692543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10408029 - 10407908
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  10408029 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggagtaattttt 10407930  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  10407929 aaatgactcctaattgcaagga 10407908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 27069196 - 27069317
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  27069196 tgacttggcggtgattaaattggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 27069295  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  27069296 aaatgacgcctaattgcaagga 27069317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 45463359 - 45463480
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||  |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  45463359 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcaattacagggactaattttt 45463458  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  45463459 aaatgacgcctaattgcaagga 45463480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 52573514 - 52573635
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  52573514 tgacgtggcagtgattaaattgatcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgctaggattagtgattacatggactaattttt 52573613  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  52573614 aaatgacgcctaattgcaagga 52573635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 4982988 - 4983104
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||| |||  ||||||||||||    
T  4982988 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctaaattgcgaggattagcaattacaaggatgaatttttaaacg 4983087  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  4983088 acgcctaattgcaagga 4983104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40387574 - 40387466
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  40387574 aaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagggaccaatttttaaatggcccctaattgcagggatgaaacacata 40387475  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    || ||||||    
T  40387474 ttaaagcct 40387466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41582606 - 41582445
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||   ||||| |   ||||||| |||||||  |    
T  41582606 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattaacg 41582507  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  41582506 attagagggaccaatttttaaatgacccctgattgcagggatgaaacacatattaaagccta 41582445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Original strand, 54435413 - 54435530
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||   | |||||  ||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  54435413 ggacgaaattttaaataattatcaaatgcaatgctaatttgcaaggattgacgattacatggatcaatttttaaacgacacctaattgcaagcacgaaat 54435512  T
Q  219 acatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54435513 acatatttaagcctaaaa 54435530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 33247563 - 33247651
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33247563 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacggatttttaaacgatccctaattgcaagga 33247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 242
Target Start/End: Original strand, 41583518 - 41583670
Alignment:
Q  90 gtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||   ||||| |   ||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  41583518 gtgacgtggcagtgattaagtgagaagagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagaaatcaatttt 41583617  T
Q  190 taaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatatg 242  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  41583618 taaatgacccctaattgcagggatgaaacacatattaaagcctattatatatg 41583670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32062739 - 32062589
Alignment:
Q  80 catcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagg 179  Q
    ||||||||||  | |||| |||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||   || |||| ||||||||  ||||||| ||  |||| |    
T  32062739 catcaaattaacggcatgacagtcattaagcgggtcaa-ggacgaaattttaaatgattaaattttacaaggctaatttgtcaggattaatgtttacaag 32062641  T
Q  180 gaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||    
T  32062640 gaccaatttttaaatgacccctaatttcagggaccaaacacatattaaagcc 32062589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 5818069 - 5818175
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||  || ||||||||| |||||||||| |||     
T  5818069 cagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacaggattaacgattacagggactaatttttaaatgacg 5818168  T
Q  199 cctaatt 205  Q
    |||||||    
T  5818169 cctaatt 5818175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11524078 - 11523968
Alignment:
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||  |||| |||||||  || ||||| ||| |||||||||| ||| |||    
T  11524078 tgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattaacgattacagagactaatttttaaatgacgcct 11523979  T
Q  202 aattgcaagga 212  Q
    |||||||||||    
T  11523978 aattgcaagga 11523968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27891716 - 27891622
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27891716 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaaaattagcgattacagggactaatttttaaa 27891622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 50504111 - 50504253
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||  ||||||  || ||||| ||| |||||||    
T  50504111 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcctggattaacgattacagagactaattttt 50504210  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  50504211 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagccta 50504253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16605761 - 16605600
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||  ||| ||   |    
T  16605761 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaatcaatgcaagggtaaattggcaggtttgacg 16605662  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  16605661 attacagggactaatttttaaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 16605600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Original strand, 27149298 - 27149402
Alignment:
Q  107 aagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||  | ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  27149298 aagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaa-ttttaaatgacgcctaattg 27149396  T
Q  207 caagga 212  Q
    ||||||    
T  27149397 caagga 27149402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50750991 - 50750910
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 208  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50750991 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgca 50750910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22566906 - 22566818
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22566906 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacaggaacgaatttttaaacgatccctaattacaagga 22566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 51859542 - 51859498
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51859542 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaa 51859498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16005950 - 16005843
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | || |  ||| |||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16005950 ggacgaaattttaaatgattaaacaatacatggataaattgccagaattagcgattacagggattaatttttaaacgacccctaattataaggatcaaat 16005851  T
Q  219 acatattt 226  Q
    ||||||||    
T  16005850 acatattt 16005843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Original strand, 32063658 - 32063765
Alignment:
Q  125 aattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||| || ||||  || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32063658 aattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagtattaacgattacagaaaccaatttttaaatgacccctaattgcagggacaaaatacatat 32063757  T
Q  225 ttaagcct 232  Q
    | ||||||    
T  32063758 taaagcct 32063765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Original strand, 51859692 - 51859835
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  51859692 tgacttgggagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggataaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 51859791  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    |||  ||  |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||    
T  51859792 aaattacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaa 51859835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Original strand, 39701195 - 39701345
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||  | |||||  || ||||  ||| |||||||    
T  39701195 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgtcaagattaacgattacatagactaattttt 39701294  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||| |||| |||||||    
T  39701295 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctataatatat 39701345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 51203743 - 51203629
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |     
T  51203743 ggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgc 51203644  T
Q  197 cccctaattgcaagg 211  Q
    | |||||||||||||    
T  51203643 cgcctaattgcaagg 51203629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39538192 - 39538120
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  39538192 ggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagactaattttcaagaattagcgaatac---gaccaatttttaaac 39538120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 232
Target Start/End: Original strand, 40388375 - 40388535
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt-tggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |||  |||| |||||||||||||||||   |||   |   ||||||| ||||||||     
T  40388375 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatcag-ggacgaaattttaaatgattaacttttgttggggcaatttgccaggattagc 40388473  T
Q  171 gaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    || || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  40388474 gattagagggaccaatttttaaatggcccttaattgcagggatgaaacacatattaaagcct 40388535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50503965 - 50503916
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50503965 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaa 50503916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54434334 - 54434266
Alignment:
Q  86 attagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagacta 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54434334 attagtgacgtggcagtgattaactgggatgaaggacgtaattttaaatgattaatgattgcaagacta 54434266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22718069 - 22718030
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22718069 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaa 22718030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Original strand, 22987147 - 22987186
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22987147 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaa 22987186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Original strand, 50751822 - 50751932
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  |||||||  |||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||  ||    
T  50751822 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacagg-acgaatttttaaacgacgcctaattgcaggggtgaaacacatcatt 50751920  T
Q  227 aagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||    
T  50751921 aagcctaaaata 50751932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22923270 - 22923176
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  22923270 cagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaatttttaaa 22923176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22927923 - 22927829
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  22927923 cagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaatttttaaa 22927829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22984202 - 22984108
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  22984202 cagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaatttttaaa 22984108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22997790 - 22997696
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  22997790 cagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaatttttaaa 22997696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Original strand, 9731498 - 9731547
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  9731498 tgacgtggcagtgattaagttagtcaaagaacgaaattttaaatgattaa 9731547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 205
Target Start/End: Original strand, 22718235 - 22718339
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||   | ||||| ||  |||||||||| ||| ||    
T  22718235 gtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaatttttaaatgacgcc 22718334  T
Q  201 taatt 205  Q
    |||||    
T  22718335 taatt 22718339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22986981 - 22986877
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||   | ||||| ||  |||||||||| ||| ||    
T  22986981 gtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaatttttaaatgacgcc 22986882  T
Q  201 taatt 205  Q
    |||||    
T  22986881 taatt 22986877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 42738293 - 42738408
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  42738293 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 42738392  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  42738393 ccgcctaattgcaagg 42738408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39666916 - 39666867
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  39666916 tgacttggtagtgattaagttgctcgaaggacgaaattttaaatgattaa 39666867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 48529916 - 48529969
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 209  Q
    |||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48529916 tttgaaaggattagcgaatacggtgaacaatttttaaacgatccctaattgcaa 48529969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11446388 - 11446276
Alignment:
Q  113 gtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||   |||||||  |||||||| |||||||  || | || | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  11446388 gtcaagggacgaaattttaaaagattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattccatgaaccaatttttaaatgacctctaattgcaggga 11446289  T
Q  213 tcaaatacatatt 225  Q
      ||| |||||||    
T  11446288 cgaaacacatatt 11446276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Original strand, 23535426 - 23535506
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    |||||| || |||||| ||||||| || || |||  ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  23535426 aaggaccaatttttaagtgattaaagaatggaagggtaatttgcaagaaatagtaaatacattgaccaatttttaaacgac 23535506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Original strand, 29321283 - 29321335
Alignment:
Q  181 accaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  29321283 accaatttttaaatgacccttaattgcaaggacgaaacacatattaaagccta 29321335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 39701040 - 39701000
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  39701040 agtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaataattaa 39701000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 125)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 183451 - 183221
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  183451 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 183352  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183351 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 183252  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  183251 taattgtaaggatcaaatacatatttaagcc 183221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47999353 - 47999123
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  47999353 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattggtgacgtggca 47999254  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47999253 ataattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgatccc 47999154  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47999153 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 47999123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6367760 - 6367991
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6367760 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 6367859  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6367860 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgaccct 6367959  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6367960 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 6367991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37578422 - 37578187
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37578422 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagca 37578323  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37578322 gtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 37578223  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37578222 taattgcaaggatgaaatacatatttaaacctaaaa 37578187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 26024594 - 26024820
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26024594 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtga 26024693  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024694 ttaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaat 26024793  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26024794 tgcaaggatcaaatacatatttaagcc 26024820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13914298 - 13914063
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
T  13914298 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggta 13914199  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13914198 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaacgacccc 13914099  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13914098 taattgcaaggatgaaatacacatttaagcctaaaa 13914063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 30711525 - 30711760
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  30711525 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagcgattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggca 30711624  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30711625 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccc 30711724  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30711725 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaa 30711760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 43759020 - 43759254
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  43759020 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtgaca 43759119  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43759120 gtggttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattgaagattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccc 43759219  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43759220 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 43759254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36694512 - 36694280
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||| || ||    
T  36694512 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgaca 36694413  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36694412 gtgattaagttggtcaaagggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccc 36694313  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36694312 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 36694280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36710613 - 36710381
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||| || ||    
T  36710613 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgaca 36710514  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36710513 gtgattaagttggtcaaagggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccc 36710414  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36710413 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 36710381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 1841657 - 1841888
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  1841657 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaatttgaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggca 1841756  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1841757 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaag-ctagtttgcaaggattagcgaatacagggaacaatttttaaacgacccc 1841855  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1841856 tcattacaaggatgaaatacatatttaaaccta 1841888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 1103663 - 1103890
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  1103663 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgagtggtagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtga 1103762  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1103763 ataagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctttaat 1103862  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1103863 tgcaaggatgaaatatatatttaagcct 1103890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 48779317 - 48779548
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  48779317 tttcccattctttcttcaacattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 48779416  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  48779417 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcaaatacatggactaatttttaagcgactcc 48779516  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48779517 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 48779548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 41098932 - 41099157
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41098932 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacag 41099031  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41099032 tgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgaccact 41099131  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatattta 227  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  41099132 aattgtaaggatgaaatacatattta 41099157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34464679 - 34464443
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  34464679 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 34464580  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34464579 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccc 34464480  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34464479 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccaaaaat 34464443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17662076 - 17661851
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||    
T  17662076 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccgcgtcatcgaattagtgacgtggca-tga 17661978  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17661977 ttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaataca-ggaccaatttttaaacgacccctaat 17661879  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17661878 tgcaaggatgaaatacatatttaagcct 17661851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 49722925 - 49723147
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  49722925 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaat-ggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggca 49723023  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49723024 gtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgaaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccc 49723123  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  49723124 taattgcaaggatgaaatacatat 49723147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32917458 - 32917688
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32917458 tttccaattctttcttcaatattttgtcctatttttaagggtaaaattggaatttcatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 32917557  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32917558 atgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgaccct 32917657  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32917658 taattgcaagaatgaaatacatatttaagcc 32917688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19017859 - 19017628
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19017859 tttccaattatttcatcaatattttgtcctcttctcaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 19017760  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  19017759 gtgattaagttggtcaacgaacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgtaaggattagcgaatacagaaatcaatttttaaacaacccc 19017660  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19017659 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 19017628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 7821156 - 7821382
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7821156 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtga 7821255  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  7821256 ttaagttggtcaaaggacgaaattataaatgattaatgattgcacggctagtttgcaaggattagcgaataca-tgaccaatttttaaacgacctttaat 7821354  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7821355 tgcaatgatgaaatgcatatttaagcct 7821382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40210599 - 40210373
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||    
T  40210599 ttccaattttttcttcaatattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcacatgtaacagtgattgccatgtcatcaaattaatgtcgtggcag 40210500  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  40210499 tgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggattagcgaatacaaagaccaaattttaaacgaccact 40210400  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40210399 aattgcaaggatgaaatacatatttaa 40210373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23209591 - 23209365
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  23209591 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggca 23209492  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| | | |  ||||||||||||| |||    
T  23209491 gtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatataagtattaatttttaaacga-ccc 23209393  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23209392 taattgcaaggatgaaatacatatttaa 23209365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24905397 - 24905186
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24905397 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 24905298  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  24905297 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 24905198  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  24905197 taattgcaagga 24905186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 35152545 - 35152757
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||    
T  35152545 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtgacagtga 35152644  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35152645 ttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatga-------------ttgcaaggattagcgaatacagagactaatttttaaacgacccctaat 35152731  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35152732 tgcaaggatgaaatacatatttaagc 35152757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 40772671 - 40772888
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  40772671 tttccaaatctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccaagtcatcgaattagtgacgt-gca 40772769  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||             ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40772770 gtgattaagttggtcaaaggacgaaatttgaaataattaatga-------------ttgcaaggattagcgaatacagggaccgattttcaaacgacccc 40772856  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40772857 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 40772888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19323090 - 19323317
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  19323090 tttccaattctttcttcaatattttatccttttcttgagggtaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggta 19323189  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||     
T  19323190 gtgattaagttggtcaaagaacgaacttttaaatgattaatgattgcaaagttagtttgcaaggattagcgaatacatgaacgaatttttaaacgatcca 19323289  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  19323290 taattacaagaatgaaatacatatttaa 19323317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14879169 - 14879386
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  14879169 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 14879268  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||              ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  14879269 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatg-------------gttgcaaggattagcgaatatagagaccaatttttaaacgatccc 14879355  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  14879356 taattgcaatgatgaaatatatatttaagcc 14879386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 28011530 - 28011746
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcat-----gtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgaca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     || || |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28011530 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacg 28011629  T
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  28011630 tgacagtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 28011729  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  28011730 acgcctaattgcaagga 28011746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33442824 - 33442614
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33442824 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 33442725  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| | | ||    
T  33442724 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaatgccgcc 33442625  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  33442624 taattgcaagg 33442614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19323080 - 19322890
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19323080 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaacttttaaatgattaatg 19322981  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||   || |||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  19322980 attgcaaagttagtttgcaaggattagcgaatacatgaacgaatttttaaacgacccgtaattataaggatgaaatacatatttaagccta 19322890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 52134235 - 52134445
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  52134235 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 52134334  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  52134335 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 52134434  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  52134435 taattgcaagg 52134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4716698 - 4716559
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4716698 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 4716599  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  4716598 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaa 4716559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31514548 - 31514409
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31514548 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 31514449  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  31514448 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaa 31514409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 42248671 - 42248858
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || ||    
T  42248671 tttccaaatatttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgcc--gtcatcgaattagtgacgtgaca 42248768  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
     ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  42248769 atgattaagttggtcaaatgtcgaaattttaaataattaataattgcaagactagtttgcaagaattagcgaatacagagaccaattttt 42248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24009707 - 24009570
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24009707 cagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagttggcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaaacgacc 24009608  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24009607 cctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccaaaaa 24009570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 34464689 - 34464881
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  34464689 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaac 34464788  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||  ||| |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34464789 attgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacaacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 34464881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35473763 - 35473624
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35473763 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgtttaatgattacaaggctagtttgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacc 35473664  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35473663 cctaattgcaaggattaaatacatatttaagcctaaaata 35473624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7821142 - 7820953
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||| |||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  7821142 aaaaatggattttcatgcgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattacgttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaac 7821043  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7821042 aatgcaagggtaaattgtaaggattagcgattacagggactaattattaaaggacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 7820953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6367750 - 6367562
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  6367750 aaaattggagtttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 6367651  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6367650 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 6367562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30711515 - 30711327
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||      
T  30711515 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggcgagggacgaaattttaaatgattaaac 30711416  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30711415 aatgcaaggataaattgctaggattagcgattatagagatcaatttttaaacaacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 30711327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4960728 - 4960541
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  4960728 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaac 4960629  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4960628 aatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagagcaatttttaaacgacccctaattgcaatgatgaaatacatatttaagc 4960541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 19017869 - 19018060
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  19017869 aaaattggaatttcatgcgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgcggcagtgattaagtgggaagagggacaaaattttaaatgattaaat 19017968  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19017969 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacctgtaattgcaaggataaaatacatatttaagcctaa 19018060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 17662090 - 17662279
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  17662090 aaaattggaatttcatgtatgtcagtgattgccacttcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaac 17662189  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17662190 aatgcaagggtaaattgccaggattaacgattaaaggaaccaatttttaaacgaccccaaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 17662279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35152531 - 35152338
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  35152531 aaaattggaatttcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacattgcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaac 35152432  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | || |||  ||| |||  || ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35152431 aatgtaagggtaaattggcagtattagcgattatagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaa 35152338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 37578432 - 37578621
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| ||||||||||||||||||     
T  37578432 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaatc 37578531  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | || |||  ||| |||| |||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37578532 aatgtaagggtaaattgccaggattagcgattacaaaaaccaatttttaaacgacccccaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 37578621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 226
Target Start/End: Original strand, 4960802 - 4960932
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4960802 tggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacggggaccaatttttaaacg 4960901  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  4960902 acctctaattgctagtatgaaaaacatattt 4960932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46163221 - 46163033
Alignment:
Q  40 ggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgatta 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |  ||| ||||||||||||||||    
T  46163221 ggcaaaattggaatttcatgtatggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtaattaagtggggagagagacgaaattttaaatgatta 46163122  T
Q  140 atgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  46163121 aacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattacaatgatgaaatacatatttaa 46163033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1103649 - 1103463
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  1103649 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 1103550  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacca--atttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattta 227  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1103549 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatatttttaaacgacctctaattgcaaagatgaaatacatattta 1103463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14879159 - 14878980
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  14879159 aaaattggaatttcatgtatctcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 14879060  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14879059 aatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggataaaatacat 14878980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 34850334 - 34850493
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  34850334 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcg 34850433  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34850434 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggattaaatacatatttaagcc 34850493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 40210610 - 40210796
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  40210610 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaatttagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 40210709  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40210710 aatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacaaagaccaatttttaaacggcccctaattgcaatgatgaaatacatatttaag 40210796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41098921 - 41098731
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||     |||| |||||||||||||||||      
T  41098921 aaaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggtagtgattaagtggggagggggacaaaattttaaatgattaaac 41098822  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41098821 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagaatgaaatacatatttaagccta 41098731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 13914308 - 13914494
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  13914308 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgc-acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatttagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 13914406  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | | ||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13914407 aatacaagggtaaattgccaggattagcgattacatggaccaatttttaaacaacctctaattgcaaggatgaaatacatatttaagc 13914494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 228
Target Start/End: Original strand, 24009775 - 24009966
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||    
T  24009775 aagggtaaaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatga 24009874  T
Q  137 ttaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||  | ||||||  ||| |||| |||||| | || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24009875 ttaaacaatgcaagggtaaattgccaggattggcgattacaatgaccaatttttaaacgatccctaattgcaaggatgaaatacaaatttaa 24009966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42248661 - 42248475
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  42248661 aaaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacatcaacaaattagtcacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 42248562  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||| | |||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42248561 aatgcaagggtaaattgccacgattagcgactacaaagaccaatttttaaacgaccactaattgcaaggatgaaatacatatttaag 42248475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 19515983 - 19516092
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  19515983 tttccaattctctcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 19516082  T
Q  101 gtgattaagt 110  Q
     |||||||||    
T  19516083 atgattaagt 19516092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34849152 - 34849011
Alignment:
Q  90 gtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||   | |||| |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34849152 gtgacgtggcagtgattaagaggggagagggacgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttt 34849053  T
Q  190 taaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34849052 taaaagacccctaattgcaaggattaaatacatatttaagcc 34849011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 7231542 - 7231678
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  7231542 tggcagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaataattaatgattacaaagctagtttgtaaagattaatgaatacagtgatcaatttttaaacg 7231641  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7231642 actcctaattacaaggataaaatacatatttaagcct 7231678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46899173 - 46899061
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46899173 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaagctagtttgcaagaattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcatggatgaaat 46899074  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  46899073 acatatttaagcc 46899061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5734121 - 5734008
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5734121 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaatttgcaaggattagcgattacatg-accaatttttaaacgacccctaattgcaaggacgaaat 5734023  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  5734022 acatatttaagccta 5734008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 5735027 - 5735140
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||    
T  5735027 ggacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgattcctaattgcagggatgaaat 5735126  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  5735127 acatatttaagcct 5735140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 230
Target Start/End: Original strand, 13300190 - 13300331
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||  |||||  || |||||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13300190 agtgacgtggcactgattaagtgggttgaaggatcaatttttaagttattaaagaatgtaagagtaatttgcaaggattagtgaatacagagaccaattt 13300289  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13300290 ttaaacgacgcctaattgcaatgatgaaatacatatttaagc 13300331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17691331 - 17691218
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||    
T  17691331 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaatttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctacttgtaaggacgaaat 17691232  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||| ||||||    
T  17691231 acatattaaagcct 17691218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 46899916 - 46900029
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  46899916 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaatacattgaccaatttttaaatgacccttaattgcatggatgaaat 46900015  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  46900016 acatatttaagcct 46900029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1841647 - 1841455
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  1841647 aaaattggaatttcatatatggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaac 1841548  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | || |||  ||| |||  |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  1841547 aatgtaagggtaaattgtcaggattagcgattacggagaccaatttttaaacgactcttaattgcaaatatgaaatacatgtttaagcctaaa 1841455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25648019 - 25647883
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  25648019 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacg 25647920  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25647919 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 25647883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Original strand, 48692310 - 48692446
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||||||||||||    
T  48692310 cagtgattaagtgggtcaagagacaaaattttaaatgattaatgtttgtaaggctaatttgcaagaattaacgaatacaatgatcaatttttaaacgacc 48692409  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48692410 tctaattacaatgatcaaatacatatttaagcttaaa 48692446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Original strand, 23209619 - 23209762
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||||| |  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23209619 atggcagtgattaagtggggagagggacgaaattgtaaatgattgaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaac 23209718  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23209719 gacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaata 23209762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Original strand, 17692501 - 17692610
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17692501 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaagctaatttgcaaggattagcgataacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaat 17692600  T
Q  219 acatatttaa 228  Q
    ||||||||||    
T  17692601 acatatttaa 17692610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 183484 - 183624
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  183484 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgctaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 183583  T
Q  196 acccc-taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  183584 accccctaattacaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 183624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26024558 - 26024422
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| || ||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  26024558 tggcagtgattaagtggggagagggacgaacttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacg 26024459  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26024458 acccctaattgcaagaatcaaatacatatttaagcct 26024422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40772619 - 40772507
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40772619 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccataattgcaaggatgaaat 40772520  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  40772519 acatatttaagcc 40772507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32917448 - 32917278
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  32917448 aaaattggaatgtcatgtgtgacagtaattgccacgtcgtcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 32917349  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggat 213  Q
    | ||||||| |||  ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32917348 aatgcaagagtaaactgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgattcctaattgcaaggat 32917278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 47999385 - 47999522
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| | |||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47999385 tggcagtgattaagtggggagagggacgatattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacg 47999484  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47999485 acccctaattacaaggatcaaatacatatttaagccta 47999522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40714584 - 40714440
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  40714584 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 40714485  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||    
T  40714484 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaa 40714440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49955482 - 49955366
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  49955482 tggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatg 49955383  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    |  ||||||||||||||    
T  49955382 atgcctaattgcaagga 49955366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24009771 - 24009715
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24009771 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttca 24009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48691290 - 48691170
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  48691290 agtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacaaaattttaaatgatcaatgattgcaaggttagtttgcaagaattaacgaatacagcgaccaattt 48691191  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48691190 ttaaacgacccctaattgcaa 48691170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51015708 - 51015629
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51015708 tttgcaaggattagtgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggatcaattacatatttaagcctaaa 51015629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 36694540 - 36694678
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  36694540 atggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaac 36694639  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36694640 aacacctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 36694678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 36710641 - 36710779
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  36710641 atggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaac 36710740  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36710741 aacacctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 36710779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 40714729 - 40714871
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  40714729 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 40714828  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  40714829 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 40714871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 45750128 - 45750270
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  45750128 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgctaggattagcgattacaaagactaattttt 45750227  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  45750228 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 45750270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 237
Target Start/End: Original strand, 49955633 - 49955779
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||  ||| |||||||    
T  49955633 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaagactaattttt 49955732  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||    
T  49955733 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaat 49955779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17189094 - 17188973
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  17189094 tgacttggtagtgattaagctggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 17188995  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  17188994 aaatgacgcctaattgcaagga 17188973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 20760800 - 20760941
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  20760800 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaatgacgc 20760899  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||  |||||||| || |||||    
T  20760900 ctaattgtaaggacgaaacacatcattaagcctgaagtatat 20760941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35038595 - 35038474
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||| | |||||||| |||||||  || |||| ||| ||||||||    
T  35038595 tgacgtggcagtgattgagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaaagtaatttgctaggattaacgattacatggatcaattttt 35038496  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  35038495 aaatgacccttaattgcaagga 35038474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 43759010 - 43758913
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | |||| |||||||||||||||||    
T  43759010 aaaattagaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaa 43758913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31051090 - 31050946
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  31051090 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 31050991  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||  || ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||    
T  31050990 aaataacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaa 31050946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42533098 - 42533022
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42533098 ttgcaaggattaacgaatacatggactaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaaaccta 42533022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10304119 - 10304048
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10304119 tttccaattctttcttccatcttctttcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 10304048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 48779305 - 48779238
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 110  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48779305 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 48779238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19515955 - 19515817
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||  | ||||||  ||| || | || ||||  || ||||  |||||||||||||||    
T  19515955 atggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaatttccagaattaacgattacaaagaccaatttttaaac 19515856  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19515855 gacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 19515817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37929550 - 37929416
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||  ||| |||  |||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||     
T  37929550 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgtaagggtaaattgtcaggattagcgataacagggactaatttttaaatgacg 37929451  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  37929450 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 37929416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40435418 - 40435348
Alignment:
Q  158 tgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40435418 tgcaaggattaacgaatacaatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 40435348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28011498 - 28011390
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  28011498 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacg 28011399  T
Q  196 acccctaat 204  Q
    |||||||||    
T  28011398 acccctaat 28011390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 232
Target Start/End: Original strand, 51019702 - 51019778
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51019702 tttgcaaagattagtgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggatcaattacatatttaagcct 51019778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 8898803 - 8898950
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  || |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8898803 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagtattagtgattacagagactaattttt 8898902  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||| |||||    
T  8898903 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagccttaaata 8898950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8898649 - 8898536
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||| || | || ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||     
T  8898649 cagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagagtaaattaccagaattagcgattacagtgactaatttttaaatgacg 8898550  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  8898549 cctaattgcaagga 8898536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 25648051 - 25648096
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaa 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25648051 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaa 25648096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28324944 - 28324824
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| | || || ||||    
T  28324944 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaactaa-tttt 28324846  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  28324845 aaacgacgcctaattgcaagga 28324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 35040900 - 35041021
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  35040900 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 35040999  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||  |||||| ||||||    
T  35041000 aaatgacggctaattacaagga 35041021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45749982 - 45749841
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||  || ||||  ||| |||||||    
T  45749982 tgacttggtagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgtcaggattaacgattacaaagactaattttt 45749883  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  45749882 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcct 45749841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31197167 - 31197060
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||     ||||||  |||||| | |||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31197167 aaattttaaatgatta-----tgcaagggtaattttccaggattaacgaatacagagacaaatttttaaatgacccctaattgcagggatgaaatacata 31197073  T
Q  224 tttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||| ||||    
T  31197072 tttaagccaaaaa 31197060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 46163228 - 46163276
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattg 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46163228 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaaggcaaaattg 46163276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 12905953 - 12906047
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  12905953 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaa 12906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7371430 - 7371309
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||  ||| || | || || || || |||||  || |||||||    
T  7371430 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaaggataaattaccagaatcagcgattacagaaactaattttt 7371331  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  7371330 aaatgacacctaattgcaagga 7371309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Original strand, 32133218 - 32133357
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||| || ||||||||| | |||||  || |||| |||| |||||||||| ||    
T  32133218 ggcagtaattaagtgggtcaa-ggacgaaattttaaatgattaaactttgcgaggctaatttgccaagattaacgattacaaggacgaatttttaaagga 32133316  T
Q  197 c-ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | ||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||||    
T  32133317 ctccctaattgcaggaatgaaacacatattaaagcctaaaa 32133357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 4960738 - 4960812
Alignment:
Q  1 tttccaattcttt-cttcaatattttgtcctcttcttaagggc--aaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4960738 tttccaattcttttcttcaatattttgtcctcttgttaagtgcaaaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgatt 4960812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 6518177 - 6518224
Alignment:
Q  184 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6518177 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatatatatttaagcc 6518224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Original strand, 40439542 - 40439615
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct-aattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40439542 tttgcaaggattagcgaatacatg-atcaatttttaaacgacccattaattgcaaggatgaaatacatatttaag 40439615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32132444 - 32132303
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||  | |||| ||||||||| |||||||   ||| |||| ||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||    
T  32132444 tgacgtggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaattgattaaactttgtaagagtaatttgcaaggattaacgattacatggacgaattttt 32132345  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||| |||| ||||||| | |||  ||| ||||||| ||||||    
T  32132344 aaatgaccactaattggagggacgaaacacatattaaagcct 32132303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 24905429 - 24905544
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  24905429 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggctaaattgccaggattagcaattaca-ggacgaatttttaaacg 24905527  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    | || ||||||||||||    
T  24905528 atccataattgcaagga 24905544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 26234430 - 26234478
Alignment:
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26234430 caatttttaagcgacccctatttgcagggatcaaatacatatttaagcc 26234478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 42534331 - 42534445
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatg-attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaa 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||   || ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||    
T  42534331 ggacgaaattttaaatgattaatggattgtaaagttagtttgcaaagattaacgaatacagagactaatttttaaacga-ccctaattgtagagatgaaa 42534429  T
Q  218 tacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||| ||||    
T  42534430 tacatatttaaaccta 42534445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26234251 - 26234205
Alignment:
Q  162 aggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 208  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26234251 aggattagtgaatgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgca 26234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44522225 - 44522139
Alignment:
Q  153 taatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatat 239  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  44522225 taatttgctaggattaacgattacagggtccaatttttaaatgatccctaattgcagggacgaaacacatacttaagcctataatat 44522139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 212
Target Start/End: Original strand, 17189173 - 17189258
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  17189173 ttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtctaattgcaagga 17189258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30326636 - 30326515
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||  | ||||||  ||| || | || ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  30326636 tgacttggtagtgattaagttagttaaatgtcgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcgattacagagactaattttt 30326537  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  30326536 aaatgacgcctaattgcaagga 30326515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Original strand, 31058343 - 31058392
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  31058343 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaatacgaaattttaaatgattaa 31058392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 28325099 - 28325139
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28325099 agtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaa 28325139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 31514579 - 31514694
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  31514579 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 31514678  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||| ||||    
T  31514679 ccgcctaattgtaagg 31514694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 33442856 - 33442971
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  33442856 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 33442955  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  33442956 ccgcctaattgcaagg 33442971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42267372 - 42267326
Alignment:
Q  162 aggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 208  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42267372 aggattaaagaatacagggaccaatttttaaatgacccctatttgca 42267326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Original strand, 16970811 - 16970872
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||    
T  16970811 tcatcaaattactgacatggcaatgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaa 16970872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17102187 - 17102422
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17102187 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcataaaattagtgacgtggca 17102286  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17102287 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgctaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccc 17102386  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17102387 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 17102422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 27991910 - 27992133
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27991910 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtga 27992009  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27992010 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 27992109  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27992110 tgcaaggatcaaatacatatttaa 27992133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6253638 - 6253869
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  6253638 tttccaattctttcttcaatattttgtcctctacttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgaca 6253737  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6253738 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagacttgtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccc 6253837  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6253838 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 6253869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2640408 - 2640177
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  2640408 tttccgattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 2640309  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2640308 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacaggtaccaatttttaaacgacccc 2640209  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2640208 taattgtaaggatgaaatacatatttaagcct 2640177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48789033 - 48788799
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  48789033 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgaca 48788934  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48788933 ctgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 48788834  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48788833 taattgcaagaatgaaatacatatttaagcctaaa 48788799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28469238 - 28469009
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||     
T  28469238 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacg-ggcaa 28469140  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28469139 tgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatataaggaccaatttttaaacgacccct 28469040  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28469039 aattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 28469009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32053373 - 32053137
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  32053373 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcaagtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggca 32053274  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||     
T  32053273 gtgattaagttggtcaaaagatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattatcgtatatagggaccgatttttaaacgaccca 32053174  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32053173 taattacaaggatgaaatacatatttaagccttaaat 32053137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 10935992 - 10936223
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||| ||||||||||  ||||    
T  10935992 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtaatgattgtcacgtcatctaattagtgacgcggca 10936091  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10936092 atgattaagttgtccaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacaacccc 10936191  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10936192 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 10936223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3914336 - 3914560
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3914336 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccatgtcatcgaattagtgacatggca 3914435  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3914436 gtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaa-ttttaaacgacctc 3914534  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||    
T  3914535 taattgc----atgaaatacatatttaagc 3914560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19204656 - 19204884
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19204656 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 19204755  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||    
T  19204756 gtgattaaattggtcaaatgatgaaattttaaataattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgattacatgaaccaatttttaaaccacccc 19204855  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19204856 taattgtaaggatcaaattcatatttaag 19204884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 42731617 - 42731849
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  42731617 tttccaattttttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggca 42731716  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42731717 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaagctagcttgcaaggattagcggatatagggatcaatttttaaacgacccc 42731816  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42731817 taattacaaggatgaaatacatatttaagccta 42731849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42019827 - 42019598
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| | |||    
T  42019827 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttaatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtagca 42019728  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42019727 gtgattaatttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattacaaagctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgaccct 42019628  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42019627 taattgcaaggatgaaatacatatttaagc 42019598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22871538 - 22871351
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22871538 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 22871439  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  22871438 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaagactggtttgcaaggattagcgattacagggatcaattt 22871351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32680825 - 32680614
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32680825 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 32680726  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||  | |||||| || |||||||||| ||| ||    
T  32680725 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgtcaggattagcaattacaggaacgaatttttaaatgacgcc 32680626  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  32680625 taattgcaagga 32680614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37657048 - 37657265
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||    
T  37657048 tttccaattatttcttcaatattttgtcttcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagcgacgtgtca 37657147  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37657148 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatga-------------ttgcaaggattaacgaatacagggatcaatttttaaacgatccc 37657234  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37657235 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 37657265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39686764 - 39686543
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39686764 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 39686665  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  39686664 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 39686565  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  39686564 taattgcaagggttaaatacat 39686543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 236
Target Start/End: Original strand, 45010797 - 45011037
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagt---------gaca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||         |||     
T  45010797 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggcaatgattgctacgtcatcaaattagtgacgtggcagacg 45010896  T
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  45010897 tggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacg 45010996  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45010997 acccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaa 45011037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30948390 - 30948180
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30948390 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 30948291  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  30948290 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 30948191  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  30948190 taattgcaagg 30948180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34928880 - 34928670
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34928880 tttccaattatttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 34928781  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  34928780 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 34928681  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  34928680 taattgcaagg 34928670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10935982 - 10935789
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | |||| |||||||||||||||||      
T  10935982 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaaac 10935883  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  10935882 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacacatttaagccaaaaa 10935789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 232
Target Start/End: Original strand, 24389077 - 24389214
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24389077 atggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaac 24389176  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24389177 gacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 24389214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17885787 - 17885649
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  17885787 tgccaactcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagag 17885688  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17885687 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17885649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 28469248 - 28469438
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  28469248 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 28469347  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28469348 aatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 28469438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 236
Target Start/End: Original strand, 13386023 - 13386180
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  13386023 tcatcagattagtgacatggcagtgattaactgggtcaaaggataaaattttaaatgattaaacattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatag 13386122  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  13386123 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagtattaaatacatatttaagccaaaaa 13386180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27396764 - 27396628
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27396764 tggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacg 27396665  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27396664 gcccctaattacaaggatgaaatacatatttaagcct 27396628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42731607 - 42731419
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  42731607 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 42731508  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | |||| |  ||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42731507 aatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgagatacatatttaagcc 42731419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40379957 - 40379774
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  40379957 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcattgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 40379858  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    | | |||   ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40379857 aatacaaaggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatattt 40379774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32298905 - 32298776
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32298905 tggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgatt-------gcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccagtttttaaacg 32298813  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32298812 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 32298776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Original strand, 23181228 - 23181421
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    | |||| |||||||||||||    
T  23181228 aagggtaaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatga 23181327  T
Q  137 ttaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23181328 ttaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatatttaaacgacccctaattgcaatgatgaaatacatatttaagc 23181421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 27396835 - 27397030
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  27396835 aaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgacacgtcatcaaattcttgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 27396934  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    | ||||    | | |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27396935 aatgcagtggtgaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaata 27397030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 42019837 - 42020022
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| ||||||||||| |||||      
T  42019837 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagagacgaaattttaaataattaaac 42019936  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    | ||||||| ||| |||| | |||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42019937 aatgcaagagtaaattgccaagattagcgattataggaaccaatttttaaacaacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 42020022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 40380000 - 40380112
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40380000 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacatggaccaatttttaaacgactcctaattgcaaggatgaaat 40380099  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  40380100 acatatttaagcc 40380112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 5457176 - 5457339
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||  |    
T  5457176 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaacattgaaagggtaatttgcaaggattaacg 5457275  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5457276 aatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 5457339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24389007 - 24388816
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||| |||||||      
T  24389007 aaaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattggtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaagtgattaaac 24388908  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | | ||||  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24388907 aatacaagggtaaattgccatgattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaaggatgaaatacatatttaagtctaa 24388816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 17886778 - 17886920
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  17886778 tgacgtggcagtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggtagtttgcaaggattaacgaatacatggatcaattttt 17886877  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17886878 aaatgatccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 17886920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33808457 - 33808323
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacga 196  Q
    ||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33808457 ggcagcgattaactgggtcaatggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacga 33808358  T
Q  197 cccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | | ||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  33808357 cgcgtaatttcaagaatgaaatacatatttaagcc 33808323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 2640418 - 2640607
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  2640418 aaaattggaatttcatgtatggcagggattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 2640517  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacat-atttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  2640518 aatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagaggccaatttttaaacgacccctaattataaggatgaaatacataatttaagcc 2640607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42362578 - 42362450
Alignment:
Q  103 gattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccccta 202  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42362578 gattaactgggttaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacaccta 42362479  T
Q  203 attgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42362478 attgcaaggatgaaatacatatttaagcc 42362450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18086429 - 18086287
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  18086429 tgacatggcagtaattaactgggtcaagggacgaaattttaagtgattaataattgcaaggctaatttgcaaggattatcgtttacagggaccaattttt 18086330  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  18086329 aaacgactcctaattgcaaggactaaacacatattaaagccta 18086287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17102155 - 17102019
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17102155 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 17102056  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17102055 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 17102019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 18087626 - 18087766
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18087626 tgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacaaaattttaaatgattaataattgcaaggctattttgcaaggattagcgattacagtgaccaattttt 18087725  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  18087726 aaatgacccctaattgcaaggactaaacacatattaaagcc 18087766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 232
Target Start/End: Original strand, 22871568 - 22871706
Alignment:
Q  94 catggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22871568 catggcagtgattaagtggggagagggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagctattacagggaccaatttttaaa 22871667  T
Q  194 cgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871668 tgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 22871706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 32298998 - 32299138
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32298998 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttcaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 32299097  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32299098 actcctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcataaaa 32299138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6253583 - 6253472
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6253583 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 6253484  T
Q  219 acatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||    
T  6253483 acatatttaagc 6253472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37657038 - 37656855
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||   | |||| ||||||||||| | |||      
T  37657038 aaaattggaatttcatgt--gacagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtgccggtgattaagtggggagagggacgaaattttaaataaataaac 37656941  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37656940 aatgcaagcgtaaattgcgaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgattcctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 37656855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6571125 - 6571012
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6571125 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 6571026  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  6571025 acatatttaagcct 6571012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27991874 - 27991738
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  27991874 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggatcaatttctaaacg 27991775  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27991774 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 27991738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47945464 - 47945356
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  47945464 aaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgatccccaattgcaacgatgaaatacata 47945365  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    ||| |||||    
T  47945364 tttgagcct 47945356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 47946785 - 47946901
Alignment:
Q  114 tcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggat 213  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47946785 tcaaagaacgaaattttaaataattaatgattgcaagactaatttggaagggatagcgaatacagagaccgatttttaaacgattcctaattacaaggat 47946884  T
Q  214 caaatacatatttaagc 230  Q
     ||||||||||||||||    
T  47946885 aaaatacatatttaagc 47946901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47950894 - 47950786
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  47950894 aaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgatccccaattgcaacgatgaaatacata 47950795  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    ||| |||||    
T  47950794 tttgagcct 47950786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 47952215 - 47952331
Alignment:
Q  114 tcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggat 213  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47952215 tcaaagaacgaaattttaaataattaatgattgcaagactaatttggaagggatagcgaatacagagaccgatttttaaacgattcctaattacaaggat 47952314  T
Q  214 caaatacatatttaagc 230  Q
     ||||||||||||||||    
T  47952315 aaaatacatatttaagc 47952331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 6571180 - 6571251
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6571180 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgatt 6571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 24389017 - 24389088
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24389017 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 24389088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 32053383 - 32053546
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  32053383 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 32053482  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 206  Q
    | |||||   ||| |||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32053483 aatgcaatgataaattgctaggattaacgattataggaaccaatttttaaacgatccctaattg 32053546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43123250 - 43123175
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43123250 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggacgaaatacatatttaagcc 43123175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28105572 - 28105498
Alignment:
Q  160 caaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28105572 caaggattagtgaatacagggacaaatttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaa 28105498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19204601 - 19204488
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19204601 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaatttcaaggatcaaat 19204502  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  19204501 acatatttaagcct 19204488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Original strand, 20426646 - 20426762
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||  ||  |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  20426646 ggactaaattttaaatgattaaactttgtgagggtaaaatgccaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcagggatgaaat 20426745  T
Q  219 acatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  20426746 acatatttaagcctaaa 20426762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32298966 - 32298895
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32298966 tttccaattctttcttcaatatcttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggcagtgatt 32298895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 18670217 - 18670291
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18670217 ttgcaaggattaacgaatacagggaccattttttaaacgacccctaattgcaaggattaaatacatatttaagcc 18670291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 1960189 - 1960302
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||| |  |  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  1960189 aaggaccaatttttaaatgattaataattgcagggtttgtttgcaaggattagtgaatgcaaggaccaaattttaagcgacccctatttgcagggatcaa 1960288  T
Q  217 atacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||||    
T  1960289 atacatatttaagc 1960302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 34799472 - 34799585
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || |||||| |||||||| |||||| |  |  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34799472 aaggaccaatttttaagtgattaataattgcagggtttgtttgcaaggattagtgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggatcaa 34799571  T
Q  217 atacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||||    
T  34799572 atacatatttaagc 34799585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 42618205 - 42618318
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||| || |||||||||| |||     
T  42618205 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaatttttaaatgacg 42618304  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  42618305 cctaattgcaagga 42618318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27396825 - 27396754
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27396825 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcagaattggaattttatgtgtggcagtgatt 27396754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32934488 - 32934357
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  32934488 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagcgactaattttt 32934389  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32934388 aaatgacacctaattgcaaggatgaaacacat 32934357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 32688506 - 32688648
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||  |||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  32688506 tgacgtggcagttattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgtcaggattagcgattacaaggaccaaatttt 32688605  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||    
T  32688606 aaatgacccctaattgcaagggcgaaacacatattaaagccta 32688648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25453268 - 25453147
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || || |||||| |||||||    
T  25453268 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaattttt 25453169  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  25453168 aaatgacgcctaattgcaagga 25453147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 32068382 - 32068503
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  32068382 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagggattaattttt 32068481  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  32068482 aaatgactcctaattgcaagga 32068503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 32934642 - 32934755
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | || |||| ||| |||  |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||     
T  32934642 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacg 32934741  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  32934742 cctaattgcaagga 32934755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 6571241 - 6571313
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggatta 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  6571241 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaagaatta 6571313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25628618 - 25628499
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||  ||| |||||||    
T  25628618 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacaatgactaattttt 25628519  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaag 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  25628518 aaatgacgcctaattgcaag 25628499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Original strand, 33828268 - 33828407
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||     
T  33828268 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaatttttaaatgaca 33828367  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||||  |||  |||  ||||||||||||||    
T  33828368 cctaattgcaaggacgaaactcatcattaagcctaaaata 33828407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34794018 - 34793903
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || |||||| |||||||| |||||| |  |  ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  34794018 aaggaccaatttttaagtgattaataattgcagggtttgtttgcaaggattattgattgcaaggaccaatttttaaacgacccctatttgcagggataaa 34793919  T
Q  217 atacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  34793918 atacatatttaagcct 34793903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 235
Target Start/End: Original strand, 43266561 - 43266696
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  || ||||| || |||| |||| |||||||||| ||| |    
T  43266561 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagaattagcgattacatggactaatttttaaatgacgc 43266660  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||    
T  43266661 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaa 43266696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Original strand, 10600235 - 10600353
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  10600235 tgacatgacagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttgaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 10600334  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  10600335 aaatgacgcctaattgcaa 10600353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3914326 - 3914229
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||    
T  3914326 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattatcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggaagagggacgaaattttaaatgattaa 3914229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 233
Target Start/End: Original strand, 22828087 - 22828247
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||  ||  ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||  | |||||  |    
T  22828087 tgccacgtcatcaaattactaacatggcggtgattaagtgggttaagtgatgaaattttaaatgattaaggtttgcaggggtaatttgtcaagattaacg 22828186  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22828187 attacaaggaccaatttttaaatgacccctaattacaaggatgaaacacat-tttaagccta 22828247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32068236 - 32068115
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  32068236 tgacttggcattgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 32068137  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||  |||||||||||||    
T  32068136 aaatgacgtctaattgcaagga 32068115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42618051 - 42617930
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || || |||||| |||||||    
T  42618051 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattaaagggactaattttt 42617952  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  42617951 aaatgacgcctaattgcaagga 42617930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 32680857 - 32680973
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  32680857 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaacg 32680956  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  32680957 acgcctaattgcaagga 32680973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 16803967 - 16804054
Alignment:
Q  125 aattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16803967 aattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattggcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 16804054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43266398 - 43266260
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||  || |||| |||| |||||||||| |||     
T  43266398 cagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggactaatttttaaatgacg 43266299  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||    
T  43266298 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaat 43266260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13384614 - 13384501
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||     
T  13384614 ggacgaaattttaaatgattaacgtttgcaagggtagtttgctaggattagcgattacagggaccaaattttaagcgacccttaattgcagggatgaaac 13384515  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    || |||| ||||||    
T  13384514 acttattaaagcct 13384501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Original strand, 18855950 - 18856059
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||| ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18855950 cagtcattaagtgggttaagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaagattaacgattacagggaccaatttttaaatgacc 18856049  T
Q  199 cctaattgca 208  Q
    ||||||||||    
T  18856050 cctaattgca 18856059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 22081845 - 22081966
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||  || |||||||    
T  22081845 tgacttggcaatgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagaaactaattttt 22081944  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  22081945 aaatgacgcataattgcaagga 22081966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23058557 - 23058448
Alignment:
Q  103 gattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccccta 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||   ||  |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  23058557 gattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtatattgccaggattagtaattacagggactaatttttaaatgactctta 23058458  T
Q  203 attgcaagga 212  Q
    ||||||||||    
T  23058457 attgcaagga 23058448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 25628772 - 25628885
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||  ||| |||||||||| |||     
T  25628772 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagactaatttttaaatgacg 25628871  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    | ||||||||||||    
T  25628872 cataattgcaagga 25628885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28890711 - 28890598
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||||| |||     
T  28890711 cagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggactaatttttaaatgacg 28890612  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
     |||||||||||||    
T  28890611 tctaattgcaagga 28890598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5455934 - 5455854
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5455934 aaattttaaatgattaaactttgaaaggacaatatgcaaggattagagaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 5455854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32687504 - 32687396
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  32687504 aaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgccaggattaacgattacagggaccaaattttaaatgacccctaattacaaggacaaaacacata 32687405  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    || ||||||    
T  32687404 ttaaagcct 32687396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45010783 - 45010640
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  45010783 aaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgcca---catcaaattagtgacttggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaac 45010687  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| ||| |||||||    
T  45010686 aatgcaagcgtaaattgccaagattagcgattacaaggatcaatttt 45010640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 241
Target Start/End: Original strand, 29141556 - 29141614
Alignment:
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  29141556 caatttttaaacgacctctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccttacatatat 29141614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 234
Target Start/End: Original strand, 29144359 - 29144413
Alignment:
Q  180 gaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29144359 gaccaatttttaaacgacccctaattgcagggacgaaatacatatttaagcctaa 29144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46204554 - 46204440
Alignment:
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||   ||| |||  ||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  46204554 gcagtgattaagttggtcaatggacgaaattttaaatgataaaataatgcaatggtaaattgtcaggtttagcgattacagggactaatttttaaatgac 46204455  T
Q  198 ccctaattgcaagga 212  Q
     ||||||||||||||    
T  46204454 gcctaattgcaagga 46204440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Original strand, 46205604 - 46205714
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||  |||||||  || |||||| |||||| |||||| || |     
T  46205604 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgtcaggattaacgattacaggaaccaatctttaaatgatca 46205703  T
Q  200 ctaattgcaag 210  Q
     ||||||||||    
T  46205704 ttaattgcaag 46205714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22081699 - 22081579
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||| || || | |||| |||||||    
T  22081699 tgacttggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagcattagcgattaga-ggactaattttt 22081601  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  22081600 aaatgacgcataattgcaagga 22081579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Original strand, 13311276 - 13311370
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  13311276 aaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattaatg---tggcagtgattaagtcgggagagggacgaaattttaaattattaa 13311370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 25453414 - 25453516
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || | ||||||| |||||||    
T  25453414 tgacgtggcggtgattaagctggtcaaaggacgaaatgttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgatttcagggactaattttt 25453513  T
Q  191 aaa 193  Q
    |||    
T  25453514 aaa 25453516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 30128701 - 30128767
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30128701 ttgcaagaattaacgaatatagggaccattttttaaacgacccttaattgcaaggattaaatacata 30128767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39275011 - 39274889
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtc-aaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| || | |||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  39275011 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattactaggattagcgattacagagactaatttt 39274912  T
Q  190 taaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||  || || |||||||||||    
T  39274911 taaataacgccaaattgcaagga 39274889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 23058715 - 23058836
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||| ||  ||| |||| |||||||  || |||| |||  |||||||    
T  23058715 tgacgtggcagtaattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcgagggtaaattgccaggattaacgattacaaggattaattttt 23058814  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| || |||||||||||    
T  23058815 aaatgacgccgaattgcaagga 23058836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 27138227 - 27138348
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  27138227 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 27138326  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||| |||| |||||    
T  27138327 aaatgacgcctgattgaaagga 27138348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Original strand, 48789043 - 48789140
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||   | |||  |||||||||||||||||    
T  48789043 aaaattggaatttcatgtatgacagtgatcgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgatcaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaa 48789140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 199
Target Start/End: Original strand, 43124468 - 43124548
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  43124468 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagtttgtaaggattagcgattacagggaccaatttttaaatgaccc 43124548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Original strand, 12229342 - 12229437
Alignment:
Q  73 gccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggatta 168  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||   |||||||| |||||||  |||||||    
T  12229342 gccacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacgaaatttttaatgattaaactttgcaagaataatttgtcaggatta 12229437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30127489 - 30127440
Alignment:
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30127489 caatttttaaacgatccctaattgcagggattgaatacatatttaagcct 30127440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13311266 - 13311194
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattg 73  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||    
T  13311266 tttccaattctttcttccatcttctttccccttcttaaggacaaaattgaaatttcatatgtgacagtgattg 13311194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20425528 - 20425476
Alignment:
Q  181 accaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  20425528 accaatttttaaatgatccctaattgcagggatgaattacatatttaagccta 20425476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23608867 - 23608827
Alignment:
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23608867 aatacagggaccaatttttaaatgacccctatttgcaagga 23608827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6764246 - 6764169
Alignment:
Q  165 attagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa---ggatcaaatacatatttaagcctaaaatat 239  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  6764246 attaatgattacaggaaccaatttttaaatgacccctaattgcagcagggacgaaacacatatttaagcctaaaatat 6764169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 30948422 - 30948537
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  30948422 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 30948521  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  30948522 ccgcctaattgcaagg 30948537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Original strand, 33809380 - 33809463
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaa 162  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  33809380 tcatcaaattaatgacgtgtcagtcattaactggatcaaaggatgaaattttaaataattaaagaatgtaagactaatttgcaa 33809463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 42363727 - 42363808
Alignment:
Q  144 ttgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    |||||||  |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  42363727 ttgcaaggataatttgcaaagattaacgaatacagg-accaatttttaaacgacgtcaaattgcaagaatgaaatatatattt 42363808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22827128 - 22827076
Alignment:
Q  97 ggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22827128 ggcagtgattaagtgggtcaaggaacgaaattttaaatgattaaggtttgcaa 22827076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 111)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3529103 - 3528872
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  3529103 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacgtggca 3529004  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3529003 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacccc 3528904  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3528903 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 3528872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 11761916 - 11762146
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11761916 tttccaatccttt-ttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggca 11762014  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11762015 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 11762114  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11762115 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 11762146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14194653 - 14194413
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||    
T  14194653 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggctaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtggca 14194554  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194553 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 14194454  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14194453 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaattatat 14194413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28771099 - 28770867
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28771099 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 28771000  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28770999 gtgattaagttggtcaaatgactaaattttaaatgatcaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 28770900  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28770899 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 28770867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 27587315 - 27587543
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  27587315 tttccaattct--cttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttagcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagca 27587412  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27587413 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccc 27587512  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27587513 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 27587543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17202597 - 17202832
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  17202597 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggca 17202696  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17202697 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccc 17202796  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17202797 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccaaaaa 17202832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16157085 - 16156856
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16157085 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccatgtcatcgaattagtgacgtggca 16156986  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16156985 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacatagaccaatttttaaacgacccc 16156886  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16156885 taattgcaagtatgaaatacatatttaagc 16156856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19892538 - 19892301
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  19892538 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagttacgtggca 19892439  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19892438 gtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattacaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaacgacccc 19892339  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19892338 taattgcaaggatgaaatacatatttaagtctaaaata 19892301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 6301741 - 6301970
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6301741 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaggccaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 6301840  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6301841 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacccc 6301940  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6301941 taattgcaa--atgaaatacatatttaagcct 6301970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 39453498 - 39453737
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  39453498 tttccaattctttcttcaatattt-gtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 39453596  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39453597 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagggaccaatttttaaatgacccc 39453696  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  39453697 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccttaattatat 39453737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 6150618 - 6150855
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  6150618 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaattttatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 6150717  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6150718 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattaacgaatacatggactaatttttaaacgacccc 6150817  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6150818 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaata 6150855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28269652 - 28269420
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  28269652 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattaaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggca 28269553  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28269552 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatactgggaccaatttttaaacgacccc 28269453  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28269452 taattgcaatgatgaaatacatatttaagccta 28269420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 32242440 - 32242670
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32242440 tttccaattctttcttcaatatgttgtcctcttcgtaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 32242539  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  32242540 gtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataca-ggactaatttttaaacaacccc 32242638  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32242639 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 32242670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19517805 - 19518034
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19517805 tttccaattctttcttcactattttgtcctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggca 19517904  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19517905 gtgattaagttggtcaaaagacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacatggactaatttttaaactacccc 19518004  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19518005 taattgcaaggatgaaatacatatttaagc 19518034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11047635 - 11047861
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  11047635 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcatggtagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggca 11047734  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11047735 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaataca-tgaccaatttttaaacgacccc 11047833  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||    
T  11047834 tacttgcaaggatgaaatacatatttaa 11047861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16083141 - 16083372
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16083141 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaataggaatttcatgtgtgtcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggca 16083240  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||     
T  16083241 gtgattaagttggtcaaataacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatatatgaaccaatttttaaacgatcct 16083340  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16083341 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 16083372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5024249 - 5024019
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5024249 tttccaattctttcttcaatattttgtcttcttcttaacggaaaaattggaatttcacgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 5024150  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  5024149 gtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattagtgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgtatcaatttttaaacgacccc 5024050  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5024049 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 5024019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 186617 - 186847
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  186617 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaacttgaaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgaca 186716  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  186717 atgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacctc 186816  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  186817 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 186847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38475263 - 38475033
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38475263 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 38475164  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  38475163 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaatgacctt 38475064  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  38475063 taattgctatgatgaaatacatatttaagcc 38475033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 8322602 - 8322827
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  8322602 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaattttcatgtgtggtggtgattgccacgtcatcgaattagtgacgcggca 8322701  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8322702 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacggggaccaatttttaaacgacccc 8322801  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8322802 taattgcaaggatgaaatacatattt 8322827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29646592 - 29646360
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| |||||||||| |||||    
T  29646592 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatcgcaacgtcatcgaattagtgacgtggca 29646493  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29646492 gtgattaagttggtcaaaggataaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaaagacccc 29646393  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29646392 taattacaaggataaaatacatatttaagccta 29646360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5994087 - 5994304
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5994087 tttccaattcttttctcaatattttatcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggca 5994186  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  5994187 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgaccct 5994286  T
Q  201 taattgcaaggatcaaat 218  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5994287 taattgcaaggatgaaat 5994304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21265373 - 21265167
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  21265373 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcgaattagtgacgtggca 21265274  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21265273 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatggaccaatttttaaacgacctc 21265174  T
Q  201 taattgc 207  Q
    |||||||    
T  21265173 taattgc 21265167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 38442269 - 38442494
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||||    
T  38442269 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgatgtgacagtga 38442368  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  38442369 ttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatggttaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacaagaacccatttttaaacgacccctaat 38442468  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38442469 tgcaaggatgaaatacatatttaagc 38442494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20814360 - 20814126
Alignment:
Q  6 aattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgat 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  20814360 aattcttttttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgat 20814261  T
Q  106 taagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaatt 205  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20814260 taagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaatactagtttgcaaggattagcgaataca-agaccaatttttaaacgacctctaatt 20814162  T
Q  206 gcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20814161 gtaaggatgaaatacatatttaagcctaaaaaatat 20814126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6758095 - 6757884
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6758095 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 6757996  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  6757995 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcgagactaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaatgacgcc 6757896  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  6757895 taattgcaagga 6757884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35920440 - 35920229
Alignment:
Q  19 atattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  35920440 atattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgatattgattaagttggtcaaa 35920341  T
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  35920340 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacattgaccaatttttaaacgatccctaattaaaatgatcaaat 35920241  T
Q  219 acatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||    
T  35920240 acatatttaagc 35920229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 10684137 - 10684362
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||  |  ||    
T  10684137 tttccaattctttcttcaatattt-gtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgatgttaca 10684235  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||      
T  10684236 gtgattaagttggtcaaatgacgaaactttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagtgaatac-ggaatcaatttttaaacgacctt 10684334  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10684335 taattgcaaagatgaaatacatatttaa 10684362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 41930683 - 41930894
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |    
T  41930683 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacctcatcaaattagtgacgtggta 41930782  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  41930783 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 41930882  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||| ||||||    
T  41930883 taattacaagga 41930894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 18247286 - 18247505
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||||| |||| |||||||||    
T  18247286 caattctttctttaatattt-gtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcattgaattaatgacgtggcagtga 18247384  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||| ||||||||  ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18247385 ttaagttgatcaaaggaagaaat-------gattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaaattttaaacgacccctaat 18247477  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18247478 tgcaaggatgaaatacatatttaagcct 18247505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 43159054 - 43159239
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43159054 aaaattggaatttcatgtgtggtagtgattatcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatg 43159153  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43159154 attgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacaacgaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 43159239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6301731 - 6301545
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6301731 aaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaataattaatg 6301632  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6301631 attgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacga-ccataattgcaa--atgaaatacatatttaagcct 6301545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13362455 - 13362290
Alignment:
Q  3 tccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  13362455 tccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgtctgtgatttgcacgtcatcaaattagtgacgtggcagt 13362356  T
Q  103 gattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggatta 168  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13362355 gattaagttggtcagaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 13362290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 1506134 - 1506344
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1506134 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 1506233  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  1506234 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 1506333  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  1506334 taattgcaagg 1506344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31482632 - 31482422
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31482632 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 31482533  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  31482532 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 31482433  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  31482432 taattgcaagg 31482422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5994077 - 5993886
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  5994077 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 5993978  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    | ||||||  ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5993977 aatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaa 5993886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 20814375 - 20814565
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  20814375 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtagggagagggacaaaattttaaatgattaaac 20814474  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20814475 aatgcaagtgtaaattgctaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 20814565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39453488 - 39453302
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  39453488 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgccagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 39453389  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39453388 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaag 39453302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18670363 - 18670575
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  18670363 tttccaattctttcttcaatattttgtactcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 18670462  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||               ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |     
T  18670463 gtgattaagttggttaaatgacgaaattttaaatgat---------------taatttgcaaggattggcgaatacagagaccaatttttaaacgattca 18670547  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18670548 taattacaaggaagaaatacatatttaa 18670575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 35512407 - 35512540
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35512407 tggcagtgattaagttagtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacagggaccaatttttaaacg 35512506  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35512507 acccctaattgcaaggatgaaatacatatttaag 35512540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 297240 - 297034
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  297240 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttgagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtga 297141  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  | | ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | | ||||||    
T  297140 ttaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaataccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaat 297041  T
Q  205 tgcaagg 211  Q
    |||||||    
T  297040 tgcaagg 297034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 13963122 - 13963259
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  13963122 tggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacatagaccaatttttaaacg 13963221  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13963222 acccataattacaaggatgaaatatatatttaagccta 13963259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35512336 - 35512143
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  35512336 aaaattggaatttcatgtgtgacagggattgtcatgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 35512237  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35512236 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaaacctaaaa 35512143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32242430 - 32242238
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  32242430 aaaattggaatttcgtgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 32242331  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | ||||||| ||| |||| | ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32242330 aatgcaagagtaaattgccatgattagctattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaaccctaaa 32242238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17202587 - 17202398
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||| |||||||||||| ||||      
T  17202587 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagggggacgaaattttaaatgcttaaac 17202488  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17202487 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattggaaggatgaaatatatatttaagcct 17202398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13963052 - 13962860
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||      
T  13963052 aaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaac 13962953  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | ||||||  ||| || | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13962952 aatgcaagggtaaattaccaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggataaaatatatatttaagcctaaa 13962860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11740845 - 11740690
Alignment:
Q  73 gccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtga 172  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  11740845 gccacgtcatcaaattaatgacgtgacagtcattaactgggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcga 11740746  T
Q  173 atacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11740745 atatatggatcaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 11740690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 14194663 - 14194852
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  14194663 aaaattagaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 14194762  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||  ||| |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  14194763 aatgcaagggtaaattgccaggattagtaattacatgg-ccaatttttaaacgacccctaattacaaggatgaaagacatttttaagccta 14194852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 19892548 - 19892734
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||      
T  19892548 aaaattgggatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagaatgacgaaattttaaatgattaaac 19892647  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19892648 aatgcaagggtaaattgttaggattaacgattacagagaccaatttttaaacgacctctaattgcaaggatgaaatacatatttaag 19892734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Original strand, 13362468 - 13362653
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||   |  |||||||||||||||||||||      
T  13362468 aaaattggaatttcatgcgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagtggggagagagactaaattttaaatgattaaac 13362567  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13362568 aatgcaagggtaaattgccatgattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaatgatgaaatacatatttaa 13362653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 16157095 - 16157284
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  16157095 aaaattgaaatttcatgcatggcagtgattgctgcgtcatcaaattagtgacatggcagggattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaac 16157194  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16157195 aatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 16157284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27937186 - 27937053
Alignment:
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||  ||    
T  27937186 gcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagagaccaa--tttaaatcac 27937089  T
Q  198 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27937088 ccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 27937053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18247272 - 18247087
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   | |||| ||||| |||||||||||      
T  18247272 aaaattgaaattttatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcggtgattaagtggggagagggacgaaattctaaatgattaaat 18247173  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | ||||||  ||| |||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18247172 aatgcaagggtaaattgcca--attagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagc 18247087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Original strand, 20840729 - 20840867
Alignment:
Q  85 aattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacca 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||    
T  20840729 aattagtgacgtggcagtgattaagttggtca----------ttttaaatgattaatgattgcaagactagtttgctaggattagcgattacagttacca 20840818  T
Q  185 atttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20840819 atttttaaacgacccctaattgtaaggatgaaatacatatttaagccta 20840867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37991313 - 37991196
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37991313 aaggacgaaatttgaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaa 37991214  T
Q  217 atacatatttaagcctaa 234  Q
     | |||||||||||||||    
T  37991213 tttcatatttaagcctaa 37991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 11741813 - 11741944
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11741813 cagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagagaccgatttttaaatgacc 11741912  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11741913 cctaattacaaggatgaaatacatatttaagc 11741944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20840718 - 20840531
Alignment:
Q  46 attggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgatt 145  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||| | || || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||  | |    
T  20840718 attgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatcattaaacaat 20840619  T
Q  146 gcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||  ||| |||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20840618 gcaagggtaaattgctaggattaacgattacaggtaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 20840531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42265841 - 42265734
Alignment:
Q  125 aattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42265841 aattttaaatcattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaaatacatat 42265742  T
Q  225 ttaagcct 232  Q
    ||||||||    
T  42265741 ttaagcct 42265734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 5024253 - 5024443
Alignment:
Q  38 agggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgat 137  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   | | || ||||||||||||||    
T  5024253 agggtaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcgcgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagaggaacgaaattttaaatgat 5024352  T
Q  138 taatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||  | |||||   ||| |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5024353 taaacaatgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 5024443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38442256 - 38442075
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  38442256 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagttatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 38442157  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    | ||||||| ||| |||  |||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38442156 aatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaataacccctaattgcaacgatgaaatacatat 38442075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24547325 - 24547174
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaagg-------------attagtgaatacagggac 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||             ||||| || |||||||||    
T  24547325 tggcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggac 24547226  T
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaa 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24547225 caattttttaacgacccctaattgcaaggatcaagtacatatttaagcctaa 24547174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11047625 - 11047437
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  11047625 aaaattgaaattttatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 11047526  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac-gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||| | |||||| || ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11047525 aatgcaagggtaaattgccaagattagcgattac-ggga-caatttttaaactgactcctaattgcaagggtgaaatacatatttaagcct 11047437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 186607 - 186419
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  186607 aaaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaac 186508  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| || | || ||||  || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  186507 aatgcaaggttaaatttccagaattaacgattacaatgactaatttttaaacgacccctaatttcaa-gatgaaataaatatttaagcct 186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6150566 - 6150453
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6150566 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaaattgtcaggattagtgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaat 6150467  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  6150466 acatatttaagcct 6150453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11761861 - 11761748
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11761861 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 11761762  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  11761761 acatatttaagcct 11761748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 21257485 - 21257586
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21257485 ttttaaatgattaatgatcgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagtgtccaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaaatacatattt 21257584  T
Q  227 aa 228  Q
    ||    
T  21257585 aa 21257586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27587260 - 27587140
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||| |  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27587260 ggacgaaattttaaatgattaaacgatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 27587161  T
Q  219 acatatttaagcctaaaatat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  27587160 acatatttaagccaaaaatat 27587140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 21265383 - 21265571
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   |  ||| ||||||||||| |||||      
T  21265383 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagt--gaagagagacgaaattttaaataattaaac 21265480  T
Q  143 attgcaagact-aatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  | || |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21265481 aatgcaagggtaaaattgccacgattagcgattacaggaaccaatttttaaacgacccttaattgtaaggatgaaatacatatttaagcct 21265571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24547386 - 24547315
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24547386 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 24547315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 232
Target Start/End: Original strand, 24547412 - 24547554
Alignment:
Q  90 gtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || || | |||||||||||    
T  24547412 gtgacgtggcagtggttaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattataaggaccaatttt 24547511  T
Q  190 taaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24547512 taaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 24547554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Original strand, 5835748 - 5835861
Alignment:
Q  125 aattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5835748 aattttaaatgattaaatgttgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacagaaaccaatttttaaacaactcctaattgcaaggatgaaatacatat 5835847  T
Q  225 ttaagcctaaaata 238  Q
    |||| || ||||||    
T  5835848 ttaaaccaaaaata 5835861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Original strand, 3529135 - 3529270
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | || | |  ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  3529135 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacg 3529234  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3529235 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 3529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 29646602 - 29646777
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  29646602 aaaattggaaattcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 29646701  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaata 219  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29646702 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgcaccaa-ttttaaacgactcctaattacaaggatgaaata 29646777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27937245 - 27937178
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27937245 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgatt 27937178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 37992604 - 37992714
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37992604 ggacgaaattttaaacgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcaaatagagagatcgatttttaaacgacccctaattgcatggatgaaat 37992703  T
Q  219 acatatttaag 229  Q
    |||||||||||    
T  37992704 acatatttaag 37992714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10684127 - 10684030
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||  ||| |||||||||||||||||    
T  10684127 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtgaggaaagtgacaaaattttaaatgattaa 10684030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 28771129 - 28771266
Alignment:
Q  94 catggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | | || |  ||| |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  28771129 catggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatacaggggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaa 28771228  T
Q  194 cgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28771229 cgacccctaattacaaggatcaaatacatatttaagcc 28771266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Original strand, 38475292 - 38475429
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  38475292 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggaccaatttttaaacg 38475391  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38475392 acccctaattgcaaggatgaaatgcatatttaagccta 38475429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5255162 - 5255040
Alignment:
Q  86 attagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaa 185  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||| || |||| | |||||    
T  5255162 attagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaataaatgcaaggttaatttgc-aggattagcgattacatgaaccaa 5255064  T
Q  186 tttttaaacgacccctaattgcaa 209  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||    
T  5255063 ttttcaaacaacctctaattgcaa 5255040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18670311 - 18670201
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18670311 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgc---gattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctacttgcaaggatgaaat 18670215  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  18670214 acatatttaagcct 18670201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 35512346 - 35512417
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  35512346 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggaaaaattagaatttcacgtgtggcagtgatt 35512417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 17544342 - 17544476
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || |||||| || |||||||||| |||     
T  17544342 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaggaactaatttttaaatgacg 17544441  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  17544442 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 17544476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8875589 - 8875468
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  8875589 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 8875490  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  8875489 aaatgacgcttaattgcaagga 8875468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16083112 - 16082979
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||   | | || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||     
T  16083112 tggcagtgattaagttgggagaggtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacagggactaatttttaaaca 16083013  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16083012 acccctaattggaaggatgaaatacatatttaag 16082979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33871479 - 33871358
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  33871479 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 33871380  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| | ||||||||||||    
T  33871379 aaatgacacttaattgcaagga 33871358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 35920500 - 35920612
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || |||  ||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  35920500 ggacgaaattttaaatgattaaacaatggaaggataaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgctatgatgaaat 35920599  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  35920600 acatatttaagcc 35920612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41930651 - 41930535
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  41930651 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaacg 41930552  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41930551 acctctaattgcaagga 41930535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 13963062 - 13963132
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13963062 tttccagttcttt-ttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 13963132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 33871631 - 33871745
Alignment:
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  33871631 gcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattactgattacagagactaatttttaaatggc 33871730  T
Q  198 ccctaattgcaagga 212  Q
     ||||||||||||||    
T  33871731 gcctaattgcaagga 33871745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8322592 - 8322495
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||    
T  8322592 aaaattggaattttatgtatggcagtgattgcaacgtcatcaaattagtgaaatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaa 8322495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Original strand, 5256328 - 5256433
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  5256328 ggacgaaattttaaatgattaacaaatgtaaggctaatttgcaaggattagtcattacattgaccaatttttaaacga-ccctaattgcaaggacgagat 5256426  T
Q  219 acatatt 225  Q
    |||||||    
T  5256427 acatatt 5256433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20152921 - 20152771
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| || | |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  20152921 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaatttccaggattagcgattacagagactaattttt 20152822  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||| ||| | |||||||| |||  ||| ||||  ||||||| || ||||||    
T  20152821 aaatgacgcttaattgcatggacgaaacacatcattaagccaaatatatat 20152771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Original strand, 20153211 - 20153343
Alignment:
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| ||||   |||||| || |||| |||| |||||||||| |||    
T  20153211 gcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgc---gattagcgattacaaggactaatttttaaatgac 20153307  T
Q  198 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
     ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  20153308 acctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccta 20153343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5835730 - 5835622
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  |||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||  || |||||||||    
T  5835730 aaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcaaagattaacgaatacaagaaccaatttttaaacgatccctaattaaaaaaatgaaatacata 5835631  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    |||||||||    
T  5835630 tttaagcct 5835622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12904953 - 12904845
Alignment:
Q  32 ttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaatttta 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||||||| ||   | |||| ||||||||    
T  12904953 ttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgtaacgttatcaaattagtgacgtgacattgattaagtggggagagggacgaaatttta 12904854  T
Q  132 aatgattaa 140  Q
    ||| |||||    
T  12904853 aattattaa 12904845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24141559 - 24141451
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||| |||||    
T  24141559 aaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacgtctaattgcagggacgaaacacata 24141460  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    || ||||||    
T  24141459 ttaaagcct 24141451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 27937259 - 27937322
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27937259 aaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatt 27937322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17544180 - 17544086
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||  ||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  17544180 cagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcaattacagggactaatttttaaa 17544086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 6758127 - 6758243
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||| || ||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  6758127 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggttaaattgccagaattaacaattacagggacgaatttttaaacg 6758226  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  6758227 acgcctaattgcaagga 6758243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 232
Target Start/End: Original strand, 40150095 - 40150243
Alignment:
Q  84 aaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacc 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||  | |||| || | ||||||||||||   ||| |||  |||||| | |||||||  || ||||||||||    
T  40150095 aaattagtgatgtggcagtgattaattaggttgagggaccaattcttaaatgattaaactttgaaagggtaattttctaggattaacgattacagggacc 40150194  T
Q  184 aatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  40150195 aattttaaaatgacccctaattgcaaggacgaaacacatattaaagcct 40150243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Original strand, 42067838 - 42067954
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |   | ||||| |||||||   | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  42067838 aaggacgaaattttaaatgattaaagtttgcaggggcagtttgccaggattatcaattacagggaccaaattttaaatgacccctaattgcagggatgaa 42067937  T
Q  217 atacatatttaagccta 233  Q
    | ||||||| |||||||    
T  42067938 acacatattaaagccta 42067954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22298682 - 22298564
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |||  ||| ||||   |||||| || |||| |||| |||||||    
T  22298682 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagggtaaattgccccgattagcgattacatggactaattttt 22298583  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  22298582 aaatgacgcctaattgcaa 22298564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 27937379 - 27937424
Alignment:
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27937379 caatttttaaacgacccataattgcaaggatgaaatacatatttaa 27937424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 28269762 - 28269809
Alignment:
Q  185 atttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28269762 atttttaaacgacccctaattgcaa-gatgaaatacatatttaagccta 28269809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Original strand, 30096912 - 30096970
Alignment:
Q  173 atacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  30096912 atacagggaccattttttaaatgacccctaattacagggatgaaatacgtatttaagcc 30096970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21287883 - 21287834
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21287883 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaa 21287834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Original strand, 24204977 - 24205018
Alignment:
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24204977 caatttttaaacgacccctaattgcaaagataaaatacatat 24205018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Original strand, 31482662 - 31482779
Alignment:
Q  94 catggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  31482662 catggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 31482761  T
Q  194 cgacccctaattgcaagg 211  Q
     | | |||||||||||||    
T  31482762 tgccgcctaattgcaagg 31482779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 4700351 - 4700418
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 110  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| |||||||    
T  4700351 aaaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaatttatgatgtggcagtaattaagt 4700418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Original strand, 21287953 - 21287992
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21287953 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaa 21287992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31006756 - 31006707
Alignment:
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31006756 ttaaacgacctctaattataaggatgaaatacatatttaaacctaaaata 31006707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 30337620 - 30337846
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30337620 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggcagtga 30337719  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30337720 ttaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaat 30337819  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30337820 tgcaaggatcaaatacatatttaagcc 30337846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12080834 - 12081074
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  12080834 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacatgaca 12080933  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12080934 gtaattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggacaaatttttaaacgactcc 12081033  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12081034 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaaaaatat 12081074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 30725957 - 30726189
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  30725957 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgcaacgtcatcgaattagtgacgtggca 30726056  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726057 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 30726156  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30726157 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccta 30726189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 33517732 - 33517963
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33517732 tttccaattctgtcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgtcattgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 33517831  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33517832 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 33517931  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33517932 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 33517963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 30804063 - 30804299
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30804063 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtga 30804162  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30804163 ttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaacgctagtttgcaagaattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccctaat 30804262  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatatat 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  30804263 tgcaaggatgaaatacatatttaatcctagaatatat 30804299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 3059455 - 3059685
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3059455 tttccaattctttcttcaatattt-gtccacttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggca 3059553  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059554 gtgattaagttggtcaaaagatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 3059653  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3059654 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 3059685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21627943 - 21627712
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21627943 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggca 21627844  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||     
T  21627843 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggatcaatttttaaacgatcct 21627744  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21627743 taattacaaggatgaaatacatatttaagcct 21627712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 33647165 - 33647382
Alignment:
Q  17 caatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtca 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33647165 caattttttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccatgtcatcaaatttgtgacgtggcagtgattaagtttgtca 33647264  T
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33647265 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaa 33647364  T
Q  217 atacatatttaagcctaa 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33647365 atacatatttaagcctaa 33647382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17734424 - 17734195
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17734424 tttccaattctttcttcaatattttgtcctctt--taagggcaaaattgtaatttcatgtgtggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 17734327  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17734326 gtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacaagaaccaatttttaaacgacccc 17734227  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17734226 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 17734195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14196842 - 14196634
Alignment:
Q  4 ccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14196842 ccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtg 14196743  T
Q  104 attaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaa 203  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||| |||| || |||||  | ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  14196742 attaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaagctaaattgccagaattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaa 14196643  T
Q  204 ttgcaagga 212  Q
    |||||||||    
T  14196642 ttgcaagga 14196634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11434959 - 11434804
Alignment:
Q  74 ccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaa 173  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  11434959 ccaactcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaacgattagcgaa 11434860  T
Q  174 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11434859 tacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaag 11434804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28000615 - 28000405
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28000615 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 28000516  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||  ||||||||  | || |||||| |||||||||| | | ||    
T  28000515 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgacaggattagcaattaaagggacgaatttttaaatgccgcc 28000416  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  28000415 taattgcaagg 28000405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 21627953 - 21628142
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  21627953 aaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaac 21628052  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21628053 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaagcgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 21628142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 681044 - 681158
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681044 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 681143  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  681144 acatatttaagccta 681158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 11393097 - 11393233
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11393097 tggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggattagcgaatacggggaccaatttttaaacg 11393196  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  11393197 acccctaattacaaagatgaaatacatacttaagcct 11393233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30725947 - 30725760
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  30725947 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaaatggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 30725848  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30725847 agtgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacga-ccctaattgcaagaatgaaatacatatttaagcc 30725760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 13379798 - 13379912
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13379798 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatcaaat 13379897  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  13379898 acatatttaagccta 13379912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 679978 - 679865
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  679978 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccttaattgcaaggatcaaat 679879  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  679878 acatatttaagcct 679865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12080824 - 12080638
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  12080824 aaaattggaatttcatatatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 12080725  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    | |||| |  ||| |||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12080724 aatgcaggggtaaattgccatgattagcgattacagggagcaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacaaatttaag 12080638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33517722 - 33517537
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  33517722 aaaattgaaatttcatgtatgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 33517623  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33517622 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattacaaggatgaaatacatatttaa 33517537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20651122 - 20651008
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20651122 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctggtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgatccctaattgcagggatcaaat 20651023  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  20651022 acatatttaagccta 20651008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 236
Target Start/End: Original strand, 8090243 - 8090360
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8090243 ggaccaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgtaat 8090342  T
Q  219 acatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8090343 acatatttaagcctaaaa 8090360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30804055 - 30803859
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||    
T  30804055 aagggtaaaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgagatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatga 30803956  T
Q  137 ttaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||  | || |||  ||| |||| |||||||  || ||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30803955 ttaaacaatgtaagggtaaattgccaggattaacgattacatagatcaatttttaaacgacacctagttgcaaggatgaaatacatatttaacccta 30803859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3059445 - 3059250
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||      
T  3059445 aaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcacattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaac 3059346  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  3059345 aatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacatggacaatattttaaacgacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaaacctataata 3059250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26463321 - 26463174
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  26463321 agtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgaatacagggaccaattt 26463222  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26463221 ttaaacgacccctaattgcagggatcaaatacatatttaagcctaaaa 26463174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30337584 - 30337447
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30337584 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaccaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 30337485  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30337484 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 30337447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 363063 - 362890
Alignment:
Q  38 agggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||    
T  363063 agggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgat 362964  T
Q  138 taatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 211  Q
    |||  |||||| |  |||  ||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||    
T  362963 taacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagg 362890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 20651963 - 20652076
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  20651963 ggacgaaattttaaatgattaacgattgcaaggctggtttgcaaggattagtgaatacagggatcaatttttaaacgacccataattgcaggaattaaat 20652062  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  20652063 acatatttaagcct 20652076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15115479 - 15115339
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  15115479 tgacgtggtagtaattaagtgggtgtaaggactaaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgcaaggattaacgattatagggaccaattttt 15115380  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15115379 aaacgatctctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 15115339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11393026 - 11392866
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  11393026 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttgggagatagacgaaattttaaatgattaaac 11392927  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaa 203  Q
    | ||||||  ||| ||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11392926 aatgcaagggtaaattattaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgactcctaa 11392866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12407654 - 12407508
Alignment:
Q  85 aattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacca 184  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | |||  | |||| |||||||||||||||||   |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  12407654 aattagtgacgtggcagtaattaactaggttcagggaccaaattttaaatgattaaactttgctagagtaatttacaaggattagcgaatacagagacca 12407555  T
Q  185 atttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12407554 atttttaaacgatccttaattgtaaggatgaaatacatatttaagcc 12407508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 12408492 - 12408601
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12408492 aaattttaaatgattaaactttgcaaggataatttgcaaggattagcgaatacaaggaccaacttttaaacaacccctaattgtaaggatgaaatacata 12408591  T
Q  224 tttaagccta 233  Q
    ||||||||||    
T  12408592 tttaagccta 12408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33647151 - 33646970
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||   |  ||| |||||||||||||||||      
T  33647151 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaatggggagagagacgaaattttaaatgattaaat 33647052  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatat 224  Q
    | ||||||  ||| |||  | |||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  33647051 aatgcaagggtaaattggcaagattagcgattacagggatcactttttaaacgacccttaattgtaaggatgaaatagatat 33646970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7160944 - 7160823
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  7160944 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 7160845  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  7160844 aaatgacgcctaattgcaagga 7160823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 21836316 - 21836461
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| | || |||||||    
T  21836316 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaagaactaattttt 21836415  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  21836416 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcctaaaa 21836461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8089570 - 8089442
Alignment:
Q  104 attaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaa 203  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8089570 attaagtgggttaagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaa 8089471  T
Q  204 ttgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8089470 ttgcagggaggtaatacatatttaagcct 8089442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25486159 - 25486084
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgcca 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25486159 tttccaattctttcttcaatattttgtccccttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca 25486084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22618016 - 22617886
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggacc-aatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22618016 cagtgattaggtgggtcaatggacgacattttaaatgattaatatttgcaagggtagtctgcaaggattagcgaatgcagagacccaatttttaaacgac 22617917  T
Q  198 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22617916 tcctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 22617886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Original strand, 31407172 - 31407285
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||     
T  31407172 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacg 31407271  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  31407272 cctaattgcaagga 31407285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 237
Target Start/End: Original strand, 7161100 - 7161236
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||    
T  7161100 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagtgattatagggactaatttttaaatgacgcc 7161199  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||    
T  7161200 taattgcaaggacgaaatatatcattaagcctaaaat 7161236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 231
Target Start/End: Original strand, 15116556 - 15116660
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  15116556 ttttaaatgattaaactttgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacgaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggacgaaatacatatta 15116655  T
Q  227 aagcc 231  Q
    |||||    
T  15116656 aagcc 15116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 11393036 - 11393107
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11393036 tttccaattctttcttcaatattttgccatcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 11393107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Original strand, 17734456 - 17734590
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  17734456 tggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgataggattagcgattacatggatcaatttttaaacg 17734555  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17734556 acccataattgtaaggatcaaatacatatttaagc 17734590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22502914 - 22502793
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  22502914 tgacttggcagttattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 22502815  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  22502814 aaatgacgcctaattgcaagga 22502793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 22503060 - 22503181
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||| |||||||    
T  22503060 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaaatttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 22503159  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  22503160 aaatgacgcctaattgcaagga 22503181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25486085 - 25485972
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||     
T  25486085 cagtgattaaattggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacg 25485986  T
Q  199 cctaattgcaagga 212  Q
    | ||||||||||||    
T  25485985 cttaattgcaagga 25485972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6517642 - 6517522
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  6517642 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaag-gtaaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 6517544  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  6517543 aaatgacgcctaattgcaagga 6517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 14196905 - 14196993
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14196905 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaagga 14196993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7905373 - 7905262
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || |||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  7905373 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaggactaatttttaaatgacgcc 7905274  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  7905273 taattgcaagga 7905262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 7905529 - 7905650
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||| || || |||||| ||||| |    
T  7905529 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattatagggacaaatttat 7905628  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  7905629 aaatgacacctaattgcaagga 7905650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31407018 - 31406897
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||   || || | |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  31407018 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaaggacaaattaccaggattaacgattacagggactaattttt 31406919  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  31406918 aaatgacgcctaattgcaagga 31406897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32593625 - 32593488
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || || |||||| |||||||||| |    
T  32593625 tggcagtgattaagttggtccaaagacgaaattttaaatgattaacaaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaatttttaaatg 32593526  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    || |||||||| |||||  ||| ||||  |||||||||    
T  32593525 acgcctaattgaaaggactaaacacatcattaagccta 32593488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 141061 - 141165
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||  ||  |||||||||||||  ||| |||||    
T  141061 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaaggacgaaacacata 141160  T
Q  224 tttaa 228  Q
    |||||    
T  141161 tttaa 141165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 149082 - 149186
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||  ||  |||||||||||||  ||| |||||    
T  149082 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaaggacgaaacacata 149181  T
Q  224 tttaa 228  Q
    |||||    
T  149182 tttaa 149186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21836170 - 21836053
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  21836170 tgacgtggcagtgattaagttg-tcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattaca-agactaattttt 21836073  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaag 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21836072 aaatgacgcctaattgcaag 21836053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 26464568 - 26464627
Alignment:
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26464568 aatacagggaccattttttaaatgacccctaattgcagggatgaaatacatatttaagcc 26464627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 15913842 - 15913983
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | | || |  |||||| | | |||||  || || | |||| |||||||||| ||||    
T  15913842 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaattattaaacaatacaggggtaattttccaagattaacgattatatggacaaatttttaaatgacc 15913941  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatata 240  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15913942 cttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaatata 15913983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 22372950 - 22373065
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||| || |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  22372950 tggcagtcattaatttggtccaaggatcaaattttaaatgattaacaattgcaggattaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 22373049  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  22373050 ccgcctaattgcaagg 22373065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 25486211 - 25486304
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||||  | ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||    
T  25486211 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccgggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcttagttgcaagga 25486304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 28498311 - 28498455
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||   |||  ||  || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  28498311 agtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaaactttgggagggtagtttgccaggattagcgattacaaggaccaattt 28498410  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||    
T  28498411 ttaaatgagccctaattgcagggacgaaacacatattaaagccta 28498455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Original strand, 29810722 - 29810866
Alignment:
Q  89 agtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattt 188  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||   |||  ||  || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  29810722 agtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaaactttgggagggtagtttgccatgattagtgattacaaggaccaattt 29810821  T
Q  189 ttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||    
T  29810822 ttaaatgagccctaattgcagggacgaaacacatattaaagccta 29810866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22367552 - 22367445
Alignment:
Q  104 attaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaa 203  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |   |||||    
T  22367552 attaatttggtcaaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgctgcctaa 22367453  T
Q  204 ttgcaagg 211  Q
    ||||||||    
T  22367452 ttgcaagg 22367445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Original strand, 28000647 - 28000762
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| || |||||  | ||||| ||| |||||||||| |    
T  28000647 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccagaattagcaattacagagacaaatttttaaatg 28000746  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  28000747 ccgcctaattgcaagg 28000762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12065352 - 12065311
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12065352 cagtgattaagttggtcaaaggtcgaaattttaaatgattaa 12065311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Original strand, 11435957 - 11436017
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaga 151  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11435957 tgacgtggcaatgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaaga 11436017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Original strand, 11436008 - 11436059
Alignment:
Q  155 atttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11436008 atttgcaagaattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgaaccctaattg 11436059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24210684 - 24210557
Alignment:
Q  78 gtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaataca 177  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||   | |||  |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| | |||||   | ||||    
T  24210684 gtcatcaaattagtgacgtggcggtgattaggcggggagagggatgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgctatgattaacaattaca 24210585  T
Q  178 gggaccaatttttaaacgacccctaatt 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  24210584 gagaccaatttttaaatgacccctaatt 24210557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15913688 - 15913570
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| || | || |||||  | ||||  ||| |||||||    
T  15913688 tgacttggtagtgattaagttgttcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcaattacaaagactaattttt 15913589  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  15913588 aaatgacgcctaattgcaa 15913570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 140
Target Start/End: Original strand, 10781444 - 10781493
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  10781444 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaataattaa 10781493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Original strand, 8418414 - 8418461
Alignment:
Q  181 accaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8418414 accaatttttaaacgattcctaattgcaaggat-gaatacatatttaag 8418461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 139839 - 140066
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  139839 tttccaattctttcttcaatattttatcctcttcttaagagcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 139938  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  139939 gttattaagttggtcaaaggactaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagtgaatacagggaccaatttttaaacaacccc 140038  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  140039 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 140066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 139807 - 139668
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||| | | || |  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  139807 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaatcaattcatgggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacg 139708  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  139707 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaatcctaaa 139668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 36417886 - 36418116
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  36417886 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 36417985  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36417986 gtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccc 36418085  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36418086 taattacaaggatgaaatacatatttaagcc 36418116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19741153 - 19740921
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19741153 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaaaggtaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 19741054  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19741053 atgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccc 19740954  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19740953 taattgcatgaatcaaatacatatttaagccta 19740921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 46474979 - 46475205
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  46474979 tttccaattatttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 46475078  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  46475079 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataca-gtatcaatttttaaacgacccc 46475177  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  46475178 taattgtaaggatgaaatacatatttaa 46475205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23458209 - 23457988
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23458209 tttctaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagagaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 23458110  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23458109 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaattattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgaccct 23458010  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  23458009 taattgcaaggatgaaatacat 23457988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 43384481 - 43384709
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  43384481 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggca 43384580  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||  ||    
T  43384581 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgactaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatatagagacaaatttttaaacgattcc 43384680  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43384681 taattgcaaggatgaaatacatatttaag 43384709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33689609 - 33689376
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||||| |||||    
T  33689609 tttccaattcttt-ttcaatattttgtcctcttcttaagg-caaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggca 33689512  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33689511 gtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaataca-tgaccaatttttaaacgacccc 33689413  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33689412 taattgcaaggatgaaatacatatttaagccttaaat 33689376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36314528 - 36314290
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36314528 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 36314429  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  36314428 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 36314329  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatat 239  Q
    ||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||    
T  36314328 taattgcaaggactaatcacatcattaagcctaaaatat 36314290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 53756923 - 53757150
Alignment:
Q  2 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||  || ||    
T  53756923 ttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttcaggg-aaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgcggtag 53757021  T
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  53757022 tgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacttct 53757121  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53757122 aattgcaagaatgaaatacatatttaagc 53757150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55052505 - 55052295
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55052505 caattctttctttaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtga 55052406  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  55052405 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattg-------------caaggattagcgaatacagagaccaatttttagacgacccctaat 55052319  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  55052318 tataaggatcaaatacatatttaa 55052295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10770720 - 10770509
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  10770720 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggca 10770621  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  10770620 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcc 10770521  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  10770520 taattgcaagga 10770509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48322607 - 48322396
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48322607 tttctaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 48322508  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||   |    
T  48322507 gtgattaagttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgatgtc 48322408  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  48322407 taattgcaagga 48322396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36417874 - 36417691
Alignment:
Q  45 aattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgat 144  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36417874 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacggtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgat 36417775  T
Q  145 tgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  36417774 tgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaaggatgaaagacatgtttaa 36417691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 40758403 - 40758542
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  40758403 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaatg 40758502  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40758503 acccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 40758542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 54466590 - 54466800
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54466590 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 54466689  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| | | ||    
T  54466690 gtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaccaattacagggacgaatttttaaatgccgcc 54466789  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  54466790 taattgcaagg 54466800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 9294198 - 9294386
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  9294198 aaaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 9294297  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9294298 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 9294386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 8041783 - 8041993
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8041783 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 8041882  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| ||| |||||| | | ||    
T  8041883 gtgattaatttgttccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatatttaaatgccgcc 8041982  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  8041983 taattgcaagg 8041993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26463768 - 26463635
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26463768 atggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattaccgaatacaaggatcaatttttaaac 26463669  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26463668 gacccttaattgcaaggatgaaatacatatttaa 26463635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 23458219 - 23458411
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  23458219 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattggcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 23458318  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23458319 aatgcaagggtaaattgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaaggatgaaatacatatttaagcctaaa 23458411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9294188 - 9294013
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||  |  ||||||||| |||||    
T  9294188 tttccaattctttcttcaatattttgtcatcttcttaacggcaaaattagaatttcatgtgtggtagtgattgccacctccccgtattagtgacgtggca 9294089  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatac 176  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  9294088 gtgattaagttggtcaaaagacaaaattttaaatgattaatgattataagattagtttgcaaggattagcgaatac 9294013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 33689619 - 33689811
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  33689619 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaat 33689718  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33689719 aatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaagatgaaatacatatttaagcctaaa 33689811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 42343024 - 42343156
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42343024 tggcactgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatcattgcaagactaatttgcaaagattagcgaatacatggatcaatttttaaacg 42343123  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42343124 acccttaattacaaggatgaaatacatatttaa 42343156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9367893 - 9367739
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacag 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9367893 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaattgggatgagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacag 9367794  T
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  9367793 agaccattttttaaacgacccctaattgtagggattaaatacatatttaagccta 9367739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 41558196 - 41558306
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41558196 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggattaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaa 41558295  T
Q  217 atacatattta 227  Q
    |||||||||||    
T  41558296 atacatattta 41558306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40758332 - 40758147
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  40758332 aaaattgaaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 40758233  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | |||  |  ||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40758232 aatgcggg--taaattgca-ggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 40758147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51994086 - 51993962
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51994086 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgtaag-------------gattagcgaatacagggaccaatttttaaacg 51994000  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51993999 acctctaattgcaaagatcaaatacatatttaagccta 51993962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40033716 - 40033526
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||                ||||||    
T  40033716 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcat----------------cagtga 40033633  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  40033632 ttaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatga-------------ttgcaaggattagcgaatacatggatcaatttttaaacgatccttaat 40033546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2796314 - 2796177
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  2796314 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaatg 2796215  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2796214 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 2796177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41558115 - 41558003
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  41558115 aaattttaaatgattaataattgcaaggttaatgtgcaaggattagcgaatacaagtaccaatttttaaacgacccataattgcaagaatgaaatacata 41558016  T
Q  224 tttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||||||||    
T  41558015 tttaagcctaaaa 41558003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43384470 - 43384282
Alignment:
Q  44 aaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatga 143  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  43384470 aaattggaattttatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 43384371  T
Q  144 ttgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
     ||||||  ||| |||  |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  43384370 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaaggatccgtaattgcaaagatggaatacatatttcagcct 43384282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3849145 - 3849030
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  3849145 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcagggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgactcctaattgcagggatgaa 3849046  T
Q  217 atacatatttaagcct 232  Q
     | |||||||||||||    
T  3849045 tttcatatttaagcct 3849030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 51994147 - 51994076
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51994147 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 51994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 3850443 - 3850555
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3850443 ggacgaaattttaaacgattaatgattgcagagctagtttccaaggattatcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcagggatgaaat 3850542  T
Q  219 acatatttaagcc 231  Q
    |||||||||||||    
T  3850543 acatatttaagcc 3850555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 53856371 - 53856486
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||| |  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  53856371 aaggaccaatttttaaatgattaataattgcagggtttgtttgcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaagcgacccctatttgcagggatcaa 53856470  T
Q  217 atacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||    
T  53856471 atacatatttaagcct 53856486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 9368589 - 9368723
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||| || | || |||||||||||||||||  | || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9368589 tgacgtggcaatcattaagtgggttaaggaacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaatttgcaaggattaatgattacagggaccaattttt 9368688  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9368689 aaacgacccctaattgcaaggacgaaatacatatt 9368723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 40788706 - 40788827
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  40788706 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaaagattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 40788805  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  40788806 aaatgacgcctaattgcaagga 40788827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 19741213 - 19741321
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||  ||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19741213 aaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 19741312  T
Q  224 tttaagcct 232  Q
    |||||||||    
T  19741313 tttaagcct 19741321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 2796346 - 2796417
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2796346 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttctaaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 2796417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26463828 - 26463757
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26463828 tttccaattctttcttcaaaattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 26463757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 42342963 - 42343034
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42342963 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcactgatt 42343034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53856129 - 53856004
Alignment:
Q  117 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaa 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||| |  |  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  53856129 aaggaccaatttttaaatgattaataattgcagggtttgtttgcaagaattagtgaatgcaaggaccaatttttaagcgacccctatttgcagggatcaa 53856030  T
Q  217 atacatatttaagcctaaaatatatg 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  53856029 atacatatttaagccaagaatatatg 53856004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 230
Target Start/End: Original strand, 51994173 - 51994313
Alignment:
Q  90 gtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttt 189  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  51994173 gtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccagaattagcgattacaaggaccaatttt 51994272  T
Q  190 taaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51994273 taaacgatccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 51994313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 21185978 - 21186125
Alignment:
Q  86 attagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaa 185  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||  || |||| | |||||    
T  21185978 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattacatgtaccaa 21186077  T
Q  186 tttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||    
T  21186078 tttttaaatgacccctaattgcatggacaaaacacatattaaagccta 21186125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53756930 - 53756747
Alignment:
Q  45 aattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgat 144  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||  |     
T  53756930 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgattaaatgggaagatggacgaaattttaaatgattaaacaa 53756831  T
Q  145 tgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||  ||| || | | |||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  53756830 tgcaagggtaaattactaagattaacgattacatgaatcaatttttaaacgacccctaattgcaaagatgaaatacatatttaa 53756747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3469340 - 3469222
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  3469340 tgacgtggccgtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacatggactaattttt 3469241  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  3469240 aaatgacgcctaattgcaa 3469222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41988696 - 41988582
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||  ||||    
T  41988696 ggacgaaaatttaaatgattaaagaatgcaagagtaatttgcaagaattagtgaatacagggaccaatttttaaatgacccttatttataaggaggaaat 41988597  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||| ||||    
T  41988596 acatatttaaaccta 41988582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 29118824 - 29118945
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  29118824 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaggattagcgattacagtgactaattttt 29118923  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  29118924 aaatgacgcctaattgcaagga 29118945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 34142589 - 34142646
Alignment:
Q  174 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34142589 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 34142646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35643991 - 35643870
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |  ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  35643991 tgacgtggcagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcacgggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 35643892  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  35643891 aaatgacgcctaattgcaagga 35643870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 37778559 - 37778680
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  37778559 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 37778658  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  37778659 aaatgacgcctaattgcaagga 37778680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47856516 - 47856383
Alignment:
Q  102 tgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||||  |||||||  || |||| ||||||||||||||||||| | |    
T  47856516 tgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaactttgcaagagtaatttgtcaggattaacgattacaaggaccaatttttaaacgacgctt 47856417  T
Q  202 aattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaa 235  Q
    ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||    
T  47856416 aattgcagggacgaaacacatattaaagcctaaa 47856383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 3469486 - 3469633
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||| || |||||||    
T  3469486 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaattttt 3469585  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaata 238  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| | ||  ||||||||||||||    
T  3469586 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacagatcattaagcctaaaata 3469633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29686081 - 29685950
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || ||||||||| |||||||    
T  29686081 tgacgtggcagtgatcaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 29685982  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacat 222  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29685981 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaatacat 29685950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40758342 - 40758413
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  40758342 tttcctattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgatt 40758413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 1079537 - 1079651
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  1079537 ggacgaaattttaaaagattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcagggatgaaac 1079636  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    ||||||| |||||||    
T  1079637 acatattaaagccta 1079651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13948912 - 13948774
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| |||| |||||||||| ||      
T  13948912 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 13948813  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||    
T  13948812 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaat 13948774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 40033772 - 40033886
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40033772 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattatagaaaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaat 40033871  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  40033872 acatatttaagccta 40033886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42342903 - 42342789
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||| |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42342903 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggactagcaattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgtaaggatgaaat 42342804  T
Q  219 acatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  42342803 acatatttaagccta 42342789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 42855615 - 42855713
Alignment:
Q  113 gtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagg 211  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42855615 gtcaaaggatgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaatgacgcctaattgcaagg 42855713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11910830 - 11910693
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||      
T  11910830 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaaatgacgt 11910731  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  11910730 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagactaaaat 11910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35712118 - 35712045
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35712118 ttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaatgatccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagc 35712045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46474951 - 46474818
Alignment:
Q  95 atggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaac 194  Q
    |||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  46474951 atggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaagattagcgattacagagaccaatttttaaac 46474852  T
Q  195 gacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46474851 gacccctaattgcaaagatgaaatacatatttaa 46474818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52032278 - 52032157
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||| |||  |||||||    
T  52032278 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggattaattttt 52032179  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  52032178 aaatgacgcctaattgcaagga 52032157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 2796407 - 2796534
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||                 |||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  2796407 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaactgattaatgattgca-----------------ttagcgaatacatggaccaatttttaaaca 2796489  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatata 240  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  2796490 actcctaattgcaaggatgaagtacatatttaagccttaaatata 2796534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47551628 - 47551512
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  47551628 tggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagtattagcgattacagggactaatttttaaatg 47551529  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    ||  |||||||||||||    
T  47551528 acatctaattgcaagga 47551512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Original strand, 26463838 - 26463935
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||    
T  26463838 aaaactggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaa 26463935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 29686226 - 29686347
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||     
T  29686226 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacaatgactaatttta 29686325  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  29686326 aaatgacgcctaattgcaagga 29686347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 32306710 - 32306831
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  32306710 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacattgactaattttt 32306809  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  32306810 aaatgacgcctaattgcaagga 32306831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Original strand, 40506036 - 40506213
Alignment:
Q  52 atttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaga 151  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  | || |||     
T  40506036 atttcatgtatggcaatgattgccacatcatcaaattagttacatgacagtgattaagtgcggagagagacgaaattttaaatgattaaataatgtaagg 40506135  T
Q  152 ctaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc-taattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
     ||| |||  |||||||  || |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40506136 gtaaattgtcaggattaacgattacaggaaccaacttttaaatgaccccataattgcaaggatgaaatacatatttaa 40506213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 36314560 - 36314676
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  36314560 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacg 36314659  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  36314660 acgcctaattgcaagga 36314676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 48322639 - 48322755
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||| ||||||||||||    
T  48322639 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacg 48322738  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || ||||||||||||||    
T  48322739 acgcctaattgcaagga 48322755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 23276299 - 23276410
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||| | |  ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  23276299 ggacaaaattttaaatgattaacgtttgtaggggtaatttgccgggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcagggatgaaac 23276398  T
Q  219 acatatttaagc 230  Q
    ||||||| ||||    
T  23276399 acatattaaagc 23276410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Original strand, 52032435 - 52032546
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||  ||  |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |||  |    
T  52032435 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtc 52032534  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  52032535 taattgcaagga 52032546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 225
Target Start/End: Original strand, 32431472 - 32431614
Alignment:
Q  83 caaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggac 182  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||  |||||||  || | |||||||    
T  32431472 caaattaatgacgtggcaatcattaagcgggtcaagggacgaaattttaaatggttaaactttgcaaggctaatttgtcaggattaacgattgcagggac 32431571  T
Q  183 caatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  32431572 caatttttaaatgacccctaattacagggacgaaatacatatt 32431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Original strand, 10307670 - 10307763
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  10307670 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaa 10307763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32306564 - 32306443
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  | |||||| || |||| | || |||||||    
T  32306564 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacatgaactaattttt 32306465  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  32306464 aaatgacgcctaattgcaagga 32306443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 212
Target Start/End: Original strand, 33506252 - 33506357
Alignment:
Q  107 aagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| ||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  33506252 aagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaataacgcctaattg 33506351  T
Q  207 caagga 212  Q
     |||||    
T  33506352 aaagga 33506357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36150579 - 36150530
Alignment:
Q  179 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36150579 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaa 36150530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 10294845 - 10294947
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || |||||| || |||||||    
T  10294845 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaaaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcgaggattagcgattacaggaactaattttt 10294944  T
Q  191 aaa 193  Q
    |||    
T  10294945 aaa 10294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 25108364 - 25108522
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |   | ||||| ||||||||      
T  25108364 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgaaggacgaaattttaaatgattaacgtttgcagggacagtttgccaggattagca 25108463  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  25108464 attacagggaccaaattttaaatgacccctaattgcagggatgaaacacatattaaagc 25108522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3596249 - 3596128
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||   ||| |||  |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  3596249 tgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaataatgcaaaggtaaattgtcaggattagcgattacattgactaattttt 3596150  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||  || ||||||||||||||    
T  3596149 aaatcacgcctaattgcaagga 3596128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 4323526 - 4323607
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 208  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4323526 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgca 4323607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9292294 - 9292245
Alignment:
Q  180 gaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaag 229  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9292294 gaccaatttttaaacgatccctaattgcaaggatgaaatacatatttaag 9292245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21783473 - 21783403
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21783473 tttgcaaggattagcgaatacaggaaccaattt--aaacgacccttaattacaaggatgaaatacatatttaa 21783403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25107325 - 25107212
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||||| |   ||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  25107325 ggacgaaattttaaatgattaacatttgcaggggcaatttgccaggattagcgattagagagaccaatttttaaatgacccctaattgcagggatgaaac 25107226  T
Q  219 acatatttaagcct 232  Q
    ||||| ||||||||    
T  25107225 acatacttaagcct 25107212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 10770753 - 10770869
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||   | ||||||||| |||||||||| |    
T  10770753 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatg 10770852  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    || |||||||| |||||    
T  10770853 acgcctaattgtaagga 10770869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 26463963 - 26464015
Alignment:
Q  180 gaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26463963 gaccaatttttaaacgatctctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 26464015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 47857533 - 47857673
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||| | || ||||  || ||||  || ||||||||    
T  47857533 tgacgtggcattgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggataatttaccagaattaacgattacaaagatcaattttt 47857632  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||| ||||||| || |||  ||| ||||||| |||||    
T  47857633 aaacgacacctaattacagggacgaaacacatattaaagcc 47857673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10294697 - 10294586
Alignment:
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||  ||| |||  | ||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  10294697 gtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgtcatgattagcaattacagggactaatttttaaatgacgcc 10294598  T
Q  201 taattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||    
T  10294597 taattgcaagga 10294586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29118670 - 29118629
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29118670 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaa 29118629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 55052619 - 55052675
Alignment:
Q  174 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55052619 tacatggaccaatttttaaaa-acccctaattacaaggatcaaatacatatttaagcc 55052675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1078594 - 1078535
Alignment:
Q  174 tacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||    
T  1078594 tacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcatggacgaaaaacatattaaagccta 1078535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4322695 - 4322585
Alignment:
Q  127 ttttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatattt 226  Q
    ||||||||||||||  | ||||||  |||||||  |||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||  ||    
T  4322695 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacagg-acgaatttttaaacgacgcctaattgcaggggtgaaacacatcatt 4322597  T
Q  227 aagcctaaaata 238  Q
    ||||||||||||    
T  4322596 aagcctaaaata 4322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33154955 - 33154865
Alignment:
Q  153 taatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc--taaaatatat 241  Q
    |||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  33154955 taatttgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcatggacgaaacacatacttaagccaataaaatatat 33154865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 41988149 - 41988083
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 110  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41988149 aaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgt-atcaaattagtgatgtggcagtgattaagt 41988083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6956360 - 6956254
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 218  Q
    |||| ||||||||||||||| | | |||||||  |||||||| |||||||  || || |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||  |||     
T  6956360 ggacgaaattttaaatgatttaagtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattatagggactaatttttaaatgatccctaattgcagggacgaaac 6956261  T
Q  219 acatatt 225  Q
    |||||||    
T  6956260 acatatt 6956254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43998285 - 43998183
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| || ||||  || |||| |||| |||||||    
T  43998285 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacaaggactaattttt 43998186  T
Q  191 aaa 193  Q
    |||    
T  43998185 aaa 43998183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 212
Target Start/End: Original strand, 14634120 - 14634161
Alignment:
Q  171 gaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14634120 gaatacagggaccaatttttaaatgacccctatttgcaagga 14634161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35712183 - 35712122
Alignment:
Q  79 tcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35712183 tcatcagattagtgacctgacagtgattaactgggtcaaaagacgaaattttaaatgattaa 35712122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41422104 - 41422063
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41422104 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaa 41422063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 208
Target Start/End: Original strand, 43608798 - 43608887
Alignment:
Q  119 ggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 208  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||  |||||| | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  43608798 ggacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggttaatttacgaggattaacgattacagagaccaatttttaaatgatccctaattgca 43608887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 33156263 - 33156403
Alignment:
Q  72 tgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtg 171  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | || |||  ||| |||| | |||||  |    
T  33156263 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaacaatgaaagggtaaattgccaagattaacg 33156362  T
Q  172 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33156363 attacaatgactaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 33156403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8041751 - 8041636
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  8041751 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 8041652  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  8041651 ccgcctaattgcaagg 8041636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 21783816 - 21783899
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgc 207  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |  |||  |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21783816 aaattttaaatgattaaattttgcagggataaaatgcaaggattaacgaatataaggactaatttttaaacgacccctaattgc 21783899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47921601 - 47921486
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| | |||||   | ||||||||| |||||||||| |    
T  47921601 tggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaatg 47921502  T
Q  196 acccctaattgcaagg 211  Q
     | |||||||||||||    
T  47921501 ccgcctaattgcaagg 47921486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23272893 - 23272819
Alignment:
Q  162 aggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  23272893 aggattagcgattacagataccaatttttaaataatccctaattgcagggatgaaagacatattaaagcctaaaa 23272819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 41989575 - 41989613
Alignment:
Q  192 aacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagc 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41989575 aacgatccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagc 41989613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43607855 - 43607786
Alignment:
Q  156 tttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatt 225  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||  ||| |||||||    
T  43607855 tttgcaaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacgcttaattgcagggacgaaacacatatt 43607786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40788551 - 40788511
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 140  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40788551 agtgattaagttgatcaaatgacgaaattttaaatgattaa 40788511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 69163 - 69393
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||||| || |||||    
T  69163 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgtattagtaacgtggca 69262  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  69263 gtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacatc 69362  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  69363 taattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 69393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 69153 - 68965
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  69153 aaaattggaatttcatgtatggcagttattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 69054  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    | ||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  69053 aatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcc 68965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37793 - 37564
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  37793 tttccaattctttcttcaatattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggca 37695  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  37694 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagaatagtttgctagaattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgatctc 37595  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37594 taattgcaaggatgaaatatatatttaagcc 37564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Original strand, 37803 - 37992
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatg 142  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||      
T  37803 aaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaac 37902  T
Q  143 attgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    | | ||||  ||| |||  |||||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37903 aatacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaaggatgaaatacatatttaagcct 37992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1936 - 2170
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacat---g 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |    
T  1936 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggaaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtcgtg 2035  T
Q  98 gcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgac 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  2036 gcagtgattaaattggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggatagtttgcaaagattagcaatttcagggaccaatttttaaacgac 2135  T
Q  198 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2136 ccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcct 2170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1767
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  1904 tggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaattttttaacg 1805  T
Q  196 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804 acccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 1767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14659 - 14424
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14659 tttccaattctttcttcaatataatgttctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 14560  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||    
T  14559 gtgattaagttggtcaaaagacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataaatagactaatttttaaacgactcc 14460  T
Q  201 taattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14459 taattgcaatgatgaaatacatatttaagcctaaaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 110
Target Start/End: Original strand, 14669 - 14736
Alignment:
Q  43 aaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 110  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669 aaaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 14736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 14744 - 14818
Alignment:
Q  157 ttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcc 231  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14744 ttgccaggattagcgattagagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatgaaattcatatttaagcc 14818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 2345 - 2558
Alignment:
Q  5 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  2345 caattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtga 2444  T
Q  105 ttaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||             | |||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||||||    
T  2445 ttaagttggtcaaagggcgaaattttaaatgattaat-------------aattgcaaggattagtaaatac-gagaccaattttaaaacgatccctaat 2530  T
Q  205 tgcaaggatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2531 tgcaagaatgaaatacatatttaagcct 2558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2337 - 2234
Alignment:
Q  37 aagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||    
T  2337 aagggtaaaattggaatttcatgtgtgacgatgattgccacgtcatcaaattattgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatga 2238  T
Q  137 ttaa 140  Q
    ||||    
T  2237 ttaa 2234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 141824 - 141614
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  141824 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggca 141725  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccc 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |  |||  ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| | |  |    
T  141724 gtgattaatttggtccaaggactaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgtc 141625  T
Q  201 taattgcaagg 211  Q
    |||||||||||    
T  141624 taattgcaagg 141614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 232
Target Start/End: Original strand, 6387 - 6508
Alignment:
Q  111 tggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6387 tggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6486  T
Q  211 gatcaaatacatatttaagcct 232  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6487 gatgaaatacatatttaagcct 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 1400 - 1529
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccaagtcatcaaattagtgacatggca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1400 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggca 1499  T
Q  101 gtgattaagttggtcaaaggactaaatttt 130  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  1500 gtgattaatttggtccaaggaccaaatttt 1529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0775
Description:

Target: scaffold0775; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4960
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5102 tgacgtggcagcgattaattaggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagggatcaattttt 5003  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagccta 233  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  5002 aaacgacccctaattgtagggatgaaatacatatttaagccta 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 225
Target Start/End: Original strand, 6266 - 6400
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| || | || |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  || || | ||||||||||||    
T  6266 tgacgtggcagtcattaagtgggttaaggaacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaatttgcaaggattatcgattataaggaccaattttt 6365  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatt 225  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  6366 aagtgacccctaatttcaaggaagaaacacatatt 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 240
Target Start/End: Original strand, 11426 - 11575
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || |||| |||| |||||||    
T  11426 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 11525  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaatata 240  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  11526 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcctataatata 11575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11280 - 11162
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| ||  |||| ||| |||||||    
T  11280 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgatcacagagactaattttt 11181  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaa 209  Q
    | | |||  ||||||||||    
T  11180 agatgacgactaattgcaa 11162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19964 - 19860
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaatacata 223  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  19964 aaattttaaatgattaaagaatgcaaaggtaatttgcaaggattagcgatcacagggaccaatttttaaacgacccataattgcaaggacgaaatacata 19865  T
Q  224 tttaa 228  Q
    |||||    
T  19864 tttaa 19860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21199 - 21128
Alignment:
Q  1 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  21199 tttccaattctttcttcaatattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgatt 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21116 - 21028
Alignment:
Q  124 aaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21116 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaagga 21028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 21231 - 21347
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||||||||||| ||   | ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  21231 tggcagtgattaagtggggagagggacggaattttaaatgattaacaattgcaagactaaattgccatgattagcaattacagggacgaatttttaaacg 21330  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||||||||||||    
T  21331 acctctaattgcaagga 21347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 222075 - 222220
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||  |||||||| || |||| | || |||||||    
T  222075 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgtactaattttt 222174  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaa 236  Q
    ||| ||| ||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  222175 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaa 222220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 221929 - 221812
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||  ||| |||||||    
T  221929 tgacgtggcagtgattaagttg-tcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattaca-agactaattttt 221832  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaag 210  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  221831 aaatgacgcctaattgcaag 221812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 914
Alignment:
Q  99 cagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| | |||||| || |||| |||| |||||||||| ||      
T  1052 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 953  T
Q  199 cctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||    
T  952 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctaaaat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2387
Alignment:
Q  100 agtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgaccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||      
T  2524 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaaatgacgt 2425  T
Q  200 ctaattgcaaggatcaaatacatatttaagcctaaaat 237  Q
    |||||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  2424 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagactaaaat 2387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 12525 - 12646
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||  || ||||||||| |||||||    
T  12525 tgacgtggcagtgattaagtaggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 12624  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  12625 aaatgacgcctaattgcaagga 12646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12187
Alignment:
Q  91 tgacatggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaattttt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||||| || ||| ||||  |||||||    
T  12066 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattactgggattaattttt 12165  T
Q  191 aaacgacccctaattgcaagga 212  Q
    ||| |||   ||||||||||||    
T  12166 aaatgacgtttaattgcaagga 12187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 239844 - 239960
Alignment:
Q  96 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacg 195  Q
    ||||||| ||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||   ||| |||  |||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |    
T  239844 tggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaaatgattaaactttggaagggtaatttgccaggattatcgattacaggaaccaatttttaaatg 239943  T
Q  196 acccctaattgcaagga 212  Q
    |||||||| ||||||||    
T  239944 acccctaagtgcaagga 239960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University