View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19615_low_3 (Length: 797)

Name: NF19615_low_3
Description: NF19615
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19615_low_3
NF19615_low_3
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (1-304)||(1945867-1946170)
chr6 (1-304)||(5627424-5627727)
chr6 (1-304)||(6091031-6091333)
chr6 (1-226)||(7055141-7055366)
chr6 (1-303)||(4318672-4318974)
chr6 (6-303)||(7234885-7235180)
chr6 (5-304)||(3879788-3880086)
chr6 (8-283)||(29182203-29182479)
chr6 (5-303)||(8513270-8513562)
chr6 (1-304)||(21016967-21017263)
chr6 (5-304)||(20768123-20768417)
chr6 (1-303)||(33892862-33893153)
chr6 (5-303)||(6088945-6089237)
chr6 (5-301)||(33618871-33619162)
chr6 (5-254)||(30353256-30353505)
chr6 (7-237)||(15491654-15491884)
chr6 (221-303)||(7054622-7054704)
chr6 (5-99)||(18498470-18498565)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (1-304)||(19899613-19899916)
chr1 (1-304)||(23999376-23999679)
chr1 (1-304)||(46931440-46931741)
chr1 (1-304)||(27763155-27763457)
chr1 (1-304)||(51128888-51129190)
chr1 (1-303)||(18422680-18422981)
chr1 (543-786)||(42982679-42982930)
chr1 (1-304)||(10922756-10923058)
chr1 (1-304)||(15382962-15383264)
chr1 (1-304)||(15752058-15752360)
chr1 (1-304)||(8222160-8222458)
chr1 (1-303)||(28564629-28564928)
chr1 (1-304)||(37451315-37451616)
chr1 (1-303)||(30254453-30254753)
chr1 (8-304)||(2959784-2960079)
chr1 (5-304)||(16415678-16415977)
chr1 (1-304)||(30326797-30327099)
chr1 (1-304)||(32267063-32267365)
chr1 (5-304)||(32216088-32216386)
chr1 (1-304)||(27563750-27564052)
chr1 (1-301)||(28769682-28769981)
chr1 (1-304)||(9902899-9903201)
chr1 (54-304)||(27227330-27227579)
chr1 (1-301)||(42721068-42721364)
chr1 (55-304)||(25160715-25160963)
chr1 (1-303)||(10181853-10182155)
chr1 (1-303)||(27267046-27267344)
chr1 (15-304)||(4330323-4330612)
chr1 (1-303)||(37618747-37619043)
chr1 (1-304)||(238358-238659)
chr1 (8-304)||(34012227-34012517)
chr1 (1-301)||(47279218-47279517)
chr1 (5-304)||(27532826-27533123)
chr1 (5-304)||(38823247-38823545)
chr1 (43-303)||(7078909-7079168)
chr1 (1-304)||(47682339-47682640)
chr1 (68-304)||(15168192-15168427)
chr1 (5-303)||(14758074-14758362)
chr1 (5-301)||(40884846-40885141)
chr1 (8-304)||(39393419-39393715)
chr1 (1-301)||(41926192-41926484)
chr1 (7-303)||(3534967-3535253)
chr1 (5-304)||(11742213-11742493)
chr1 (5-304)||(3309181-3309484)
chr1 (68-276)||(33725472-33725680)
chr1 (5-304)||(1547320-1547602)
chr1 (7-303)||(31621395-31621694)
chr1 (67-301)||(22170806-22171039)
chr1 (7-250)||(48620672-48620906)
chr1 (54-279)||(38759611-38759840)
chr1 (166-304)||(1359780-1359917)
chr1 (166-304)||(48353737-48353873)
chr1 (186-304)||(21289817-21289931)
chr1 (29-116)||(21289729-21289816)
chr1 (211-302)||(31962855-31962945)
chr1 (1-39)||(30254887-30254925)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-304)||(145865-146168)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (1-304)||(24211749-24212052)
chr7 (1-304)||(37109880-37110184)
chr7 (1-304)||(30055535-30055837)
chr7 (1-304)||(27283752-27284054)
chr7 (1-303)||(31578916-31579222)
chr7 (1-304)||(17842435-17842739)
chr7 (1-304)||(18797337-18797637)
chr7 (1-264)||(38258553-38258816)
chr7 (1-283)||(32820924-32821206)
chr7 (8-304)||(10481619-10481915)
chr7 (2-303)||(9355678-9355978)
chr7 (7-304)||(15612610-15612905)
chr7 (1-302)||(37347030-37347329)
chr7 (1-304)||(7334802-7335103)
chr7 (7-301)||(5657335-5657628)
chr7 (5-304)||(23111202-23111502)
chr7 (41-303)||(32432500-32432761)
chr7 (18-304)||(41764929-41765214)
chr7 (5-268)||(21991648-21991911)
chr7 (1-303)||(11071214-11071512)
chr7 (9-304)||(8861301-8861595)
chr7 (1-302)||(31520594-31520876)
chr7 (8-304)||(22687254-22687541)
chr7 (5-303)||(48928149-48928445)
chr7 (10-300)||(33688117-33688406)
chr7 (1-283)||(43686049-43686330)
chr7 (63-303)||(10359066-10359305)
chr7 (7-304)||(6546533-6546829)
chr7 (86-297)||(15672617-15672830)
chr7 (5-304)||(4582931-4583229)
chr7 (5-304)||(12165764-12166053)
chr7 (63-303)||(44598736-44598973)
chr7 (1-304)||(12390500-12390783)
chr7 (54-303)||(37703350-37703590)
chr7 (5-302)||(26980335-26980614)
chr7 (5-304)||(35353120-35353418)
chr7 (5-304)||(29173552-29173832)
chr7 (7-304)||(25691395-25691692)
chr7 (1-267)||(38053494-38053735)
chr7 (5-249)||(48928469-48928712)
chr7 (101-304)||(46480980-46481182)
chr7 (1-221)||(27421313-27421532)
chr7 (77-223)||(37704241-37704387)
chr7 (112-304)||(26587943-26588126)
chr7 (8-182)||(44413351-44413525)
chr7 (65-283)||(43925174-43925385)
chr7 (15-304)||(32593057-32593327)
chr7 (185-304)||(44411391-44411509)
chr7 (201-301)||(37704390-37704489)
chr7 (5-117)||(26524364-26524476)
chr7 (206-304)||(34362029-34362126)
chr7 (236-301)||(27421219-27421283)
chr7 (10-98)||(34362205-34362292)
chr7 (8-61)||(37704182-37704236)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-304)||(32912455-32912758)
chr4 (1-304)||(34361367-34361669)
chr4 (1-304)||(42199762-42200066)
chr4 (1-304)||(37663617-37663917)
chr4 (1-304)||(19089329-19089631)
chr4 (1-304)||(55477767-55478073)
chr4 (2-304)||(25184147-25184448)
chr4 (1-301)||(879427-879726)
chr4 (1-304)||(19440524-19440826)
chr4 (1-302)||(36493567-36493866)
chr4 (1-301)||(50697275-50697574)
chr4 (1-303)||(6864068-6864369)
chr4 (5-283)||(35020931-35021209)
chr4 (5-303)||(28002863-28003160)
chr4 (9-304)||(34947971-34948267)
chr4 (8-301)||(17167753-17168045)
chr4 (44-304)||(33341475-33341733)
chr4 (1-304)||(3042644-3042954)
chr4 (8-283)||(17173330-17173605)
chr4 (10-304)||(23761114-23761406)
chr4 (1-304)||(47253782-47254075)
chr4 (76-304)||(1815409-1815636)
chr4 (5-283)||(38011891-38012169)
chr4 (5-304)||(29584076-29584372)
chr4 (41-303)||(55240982-55241242)
chr4 (1-304)||(37775702-37775993)
chr4 (1-303)||(25700933-25701235)
chr4 (5-304)||(7703554-7703844)
chr4 (8-303)||(46888035-46888328)
chr4 (5-301)||(27396653-27396948)
chr4 (5-303)||(5047843-5048139)
chr4 (5-304)||(49376004-49376302)
chr4 (1-303)||(9139280-9139563)
chr4 (88-302)||(17272084-17272297)
chr4 (5-245)||(4934136-4934375)
chr4 (1-304)||(50764765-50765055)
chr4 (5-304)||(32579481-32579781)
chr4 (1-304)||(37287767-37288063)
chr4 (5-304)||(30002517-30002798)
chr4 (5-304)||(4598030-4598317)
chr4 (68-304)||(33816392-33816644)
chr4 (41-303)||(32592166-32592418)
chr4 (5-245)||(35025530-35025762)
chr4 (5-245)||(54499172-54499413)
chr4 (165-304)||(26896284-26896423)
chr4 (110-304)||(46883990-46884177)
chr4 (166-303)||(7152081-7152217)
chr4 (5-174)||(39397955-39398115)
chr4 (201-283)||(4205217-4205299)
chr4 (230-304)||(35025442-35025515)
chr4 (203-304)||(39400243-39400343)
chr4 (211-268)||(56050173-56050230)
chr4 (1-52)||(4396359-4396410)
chr4 (1-52)||(53124320-53124371)
chr4 (239-301)||(23431826-23431887)
chr4 (9-81)||(23518401-23518473)
chr4 (8-73)||(4205156-4205221)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-304)||(47481546-47481849)
chr3 (1-304)||(21009651-21009954)
chr3 (1-304)||(54505832-54506134)
chr3 (1-304)||(26941110-26941412)
chr3 (5-304)||(48354969-48355267)
chr3 (14-304)||(42505925-42506214)
chr3 (1-304)||(40552109-40552411)
chr3 (5-301)||(52040775-52041071)
chr3 (5-301)||(46297615-46297910)
chr3 (1-283)||(34132959-34133241)
chr3 (1-279)||(3655076-3655354)
chr3 (1-304)||(4761498-4761801)
chr3 (1-304)||(7327332-7327635)
chr3 (5-303)||(53229003-53229301)
chr3 (8-304)||(2007964-2008258)
chr3 (1-301)||(37157732-37158031)
chr3 (1-301)||(37203091-37203391)
chr3 (8-304)||(4015491-4015785)
chr3 (5-304)||(22450996-22451294)
chr3 (1-304)||(54828551-54828852)
chr3 (1-304)||(3362277-3362581)
chr3 (91-304)||(22622568-22622780)
chr3 (7-303)||(33378636-33378931)
chr3 (65-304)||(46994511-46994749)
chr3 (1-304)||(22445915-22446216)
chr3 (13-304)||(39282689-39282978)
chr3 (1-283)||(45174527-45174812)
chr3 (58-304)||(24707965-24708212)
chr3 (5-304)||(11357231-11357513)
chr3 (8-267)||(11466855-11467114)
chr3 (1-280)||(24488835-24489114)
chr3 (5-304)||(29099383-29099672)
chr3 (89-304)||(33698265-33698479)
chr3 (10-304)||(32373505-32373796)
chr3 (1-304)||(44891530-44891823)
chr3 (44-283)||(43348325-43348563)
chr3 (1-179)||(51212955-51213133)
chr3 (41-304)||(21193670-21193933)
chr3 (63-302)||(25579825-25580063)
chr3 (5-302)||(40936019-40936297)
chr3 (95-303)||(1089811-1090018)
chr3 (71-303)||(29163912-29164134)
chr3 (5-226)||(35844354-35844575)
chr3 (1-304)||(44186367-44186653)
chr3 (1-263)||(27480252-27480531)
chr3 (8-304)||(43975742-43976033)
chr3 (10-304)||(38591727-38592024)
chr3 (1-151)||(20373298-20373448)
chr3 (84-304)||(36012244-36012465)
chr3 (41-304)||(14586530-14586782)
chr3 (134-261)||(20373136-20373263)
chr3 (86-283)||(11835503-11835695)
chr3 (8-213)||(53176086-53176290)
chr3 (181-301)||(51212624-51212743)
chr3 (187-303)||(50475021-50475136)
chr3 (166-273)||(11357030-11357137)
chr3 (182-283)||(53811604-53811701)
chr3 (52-120)||(53811695-53811769)
chr3 (7-52)||(33698218-33698263)
chr3 (11-52)||(41585408-41585449)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-304)||(11366248-11366551)
chr2 (1-304)||(43648113-43648415)
chr2 (1-304)||(37905741-37906045)
chr2 (1-304)||(19289191-19289493)
chr2 (1-284)||(33550874-33551156)
chr2 (1-262)||(17071646-17071907)
chr2 (7-304)||(2325246-2325534)
chr2 (5-304)||(31570602-31570900)
chr2 (8-283)||(3176979-3177254)
chr2 (15-304)||(4763678-4763966)
chr2 (67-303)||(41960939-41961174)
chr2 (1-262)||(17054005-17054266)
chr2 (5-303)||(33709101-33709398)
chr2 (7-278)||(44913700-44913974)
chr2 (1-304)||(4478402-4478700)
chr2 (1-261)||(29242048-29242308)
chr2 (5-304)||(4263944-4264243)
chr2 (8-304)||(26357617-26357912)
chr2 (1-304)||(35958942-35959227)
chr2 (1-304)||(27349816-27350108)
chr2 (5-304)||(4166959-4167257)
chr2 (41-273)||(36642059-36642293)
chr2 (5-304)||(19424510-19424794)
chr2 (49-273)||(45327801-45328025)
chr2 (69-304)||(31861953-31862187)
chr2 (66-304)||(18494149-18494385)
chr2 (54-304)||(44286035-44286284)
chr2 (41-283)||(39167257-39167493)
chr2 (69-304)||(41465602-41465836)
chr2 (10-304)||(33660245-33660529)
chr2 (1-301)||(43770719-43771009)
chr2 (5-304)||(13711501-13711794)
chr2 (1-242)||(41463779-41464020)
chr2 (5-304)||(19313889-19314182)
chr2 (5-221)||(33902105-33902319)
chr2 (41-304)||(5881612-5881864)
chr2 (41-304)||(7006806-7007051)
chr2 (166-304)||(19500783-19500920)
chr2 (108-244)||(18258214-18258350)
chr2 (211-303)||(41051169-41051259)
chr2 (63-113)||(41051263-41051313)
chr2 (256-304)||(18257406-18257453)
chr2 (71-138)||(19501773-19501839)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (1-304)||(30654438-30654741)
chr8 (1-304)||(8803672-8803968)
chr8 (1-304)||(37970375-37970677)
chr8 (5-303)||(1204963-1205260)
chr8 (27-302)||(1149490-1149764)
chr8 (2-304)||(43643451-43643752)
chr8 (1-304)||(23854287-23854589)
chr8 (10-304)||(16446731-16447024)
chr8 (1-301)||(6098372-6098676)
chr8 (1-300)||(10555062-10555360)
chr8 (8-283)||(36694842-36695117)
chr8 (1-284)||(9864180-9864463)
chr8 (1-304)||(11727056-11727358)
chr8 (5-304)||(16222899-16223197)
chr8 (5-283)||(27082714-27082992)
chr8 (8-283)||(12876148-12876424)
chr8 (1-304)||(31933742-31934044)
chr8 (1-304)||(38644010-38644312)
chr8 (8-304)||(5299802-5300097)
chr8 (8-304)||(34895006-34895296)
chr8 (1-304)||(7890813-7891106)
chr8 (73-304)||(33906316-33906546)
chr8 (5-283)||(40862455-40862733)
chr8 (63-303)||(1953845-1954086)
chr8 (5-283)||(13307659-13307936)
chr8 (94-301)||(4132545-4132750)
chr8 (5-304)||(465878-466166)
chr8 (40-301)||(39098978-39099238)
chr8 (65-304)||(35459567-35459805)
chr8 (1-174)||(1150090-1150263)
chr8 (1-304)||(44869528-44869831)
chr8 (68-253)||(41910895-41911079)
chr8 (1-161)||(41362550-41362707)
chr8 (166-304)||(1149776-1149909)
chr8 (91-239)||(43025824-43025972)
chr8 (119-301)||(18259233-18259410)
chr8 (201-304)||(12587814-12587916)
chr8 (203-304)||(34951913-34952013)
chr8 (5-162)||(34952028-34952185)
chr8 (195-304)||(35859160-35859268)
chr8 (151-304)||(24823250-24823394)
chr8 (228-303)||(33198061-33198135)
chr8 (169-245)||(7998478-7998554)
chr8 (201-283)||(34463706-34463785)
chr8 (68-123)||(33197948-33198003)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (1-304)||(7920-8222)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-304)||(7208704-7209005)
chr5 (8-304)||(38528077-38528371)
chr5 (1-304)||(31705452-31705753)
chr5 (8-304)||(699190-699485)
chr5 (1-304)||(17157871-17158172)
chr5 (1-304)||(22973922-22974224)
chr5 (1-304)||(31786486-31786788)
chr5 (5-304)||(22980830-22981128)
chr5 (1-304)||(5829930-5830227)
chr5 (30-304)||(35504427-35504700)
chr5 (1-304)||(22255214-22255517)
chr5 (5-303)||(27318330-27318625)
chr5 (1-304)||(12910383-12910690)
chr5 (1-304)||(24886137-24886422)
chr5 (1-303)||(35826327-35826625)
chr5 (5-304)||(8741725-8742025)
chr5 (5-304)||(19119896-19120194)
chr5 (5-304)||(33908270-33908567)
chr5 (8-304)||(35511322-35511612)
chr5 (5-304)||(27330343-27330639)
chr5 (8-275)||(23116090-23116357)
chr5 (5-304)||(30969164-30969462)
chr5 (5-303)||(5837592-5837889)
chr5 (1-267)||(14919408-14919670)
chr5 (47-304)||(15992380-15992636)
chr5 (10-304)||(39572861-39573146)
chr5 (8-304)||(32563189-32563475)
chr5 (1-304)||(8436999-8437300)
chr5 (5-304)||(36866799-36867097)
chr5 (2-304)||(1429002-1429286)
chr5 (1-304)||(43308500-43308793)
chr5 (5-304)||(25500766-25501064)
chr5 (5-283)||(36860460-36860739)
chr5 (5-304)||(40133422-40133720)
chr5 (5-304)||(9200270-9200559)
chr5 (63-304)||(35933990-35934231)
chr5 (5-304)||(7693267-7693556)
chr5 (5-304)||(22019669-22019958)
chr5 (90-304)||(13956202-13956415)
chr5 (41-281)||(6824343-6824583)
chr5 (1-283)||(21088626-21088907)
chr5 (5-226)||(26268111-26268332)
chr5 (41-261)||(23954672-23954892)
chr5 (1-209)||(5112248-5112455)
chr5 (10-304)||(42342775-42343056)
chr5 (1-303)||(15724523-15724822)
chr5 (5-304)||(14409181-14409464)
chr5 (116-304)||(2888285-2888472)
chr5 (119-304)||(25669737-25669911)
chr5 (182-304)||(25889584-25889705)
chr5 (7-180)||(28416490-28416663)
chr5 (5-301)||(8466782-8467058)
chr5 (5-123)||(25668687-25668804)
chr5 (228-303)||(28416392-28416466)
chr5 (1-53)||(22255608-22255660)
chr5 (57-105)||(11898091-11898139)
chr5 (1-52)||(26317775-26317826)
chr5 (8-61)||(13956427-13956480)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-304)||(43990-44291)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-304)||(154496-154797)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (22-304)||(408279-408559)
scaffold0002 (5-304)||(171-463)
scaffold0002 (8-205)||(94331-94528)
scaffold0002 (211-303)||(93951-94042)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (5-304)||(11944-12244)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-283)||(267331-267600)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (189-235)||(100948-100994)
scaffold0009 (112-149)||(100894-100931)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 1945867 - 1946170
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1945867 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaat 1945966  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1945967 tcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 1946066  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1946067 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaagcattattagatgaatatactattgatcattaa 1946166  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  1946167 tcag 1946170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5627424 - 5627727
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5627424 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaat 5627523  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5627524 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 5627623  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5627624 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaggtgaatatactattgatcattaa 5627723  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  5627724 tcag 5627727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6091333 - 6091031
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  6091333 tttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaat 6091235  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatat 199  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6091234 tcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatat 6091135  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6091134 catcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 6091036  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  6091035 atcag 6091031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7055366 - 7055141
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7055366 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 7055267  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7055266 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 7055167  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  7055166 atcaactctatttggatgttaaagat 7055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4318974 - 4318672
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4318974 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaat 4318875  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataa-ttttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4318874 tcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 4318775  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     | ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4318774 cagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 4318676  T
Q  300 atca 303  Q
    ||||    
T  4318675 atca 4318672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7235180 - 7234885
Alignment:
Q  6 ggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatc 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  7235180 ggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatc 7235082  T
Q  106 aggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaa 205  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  7235081 agattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaa 7234982  T
Q  206 ctctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7234981 ctatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 7234885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3880086 - 3879788
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||| |||  | |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  3880086 tggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 3879987  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3879986 cagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 3879887  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3879886 actctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatgaatcag 3879788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 29182203 - 29182479
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  29182203 tgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcag 29182302  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
     |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| | || |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  29182303 attaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 29182402  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29182403 tctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaat 29182479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 8513270 - 8513562
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  8513270 tggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcat 8513369  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    ||  ||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  8513370 catattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------caccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagc 8513463  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8513464 aactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 8513562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21017263 - 21016967
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||  || ||||||||  | |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21017263 tttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 21017164  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21017163 tcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21017064  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||      ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||    
T  21017063 atcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcatgaa 21016971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 20768123 - 20768417
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| || || ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20768123 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatcc-attgtttgtta-gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcat 20768220  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  20768221 cagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatca 20768318  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20768319 attatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 20768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33893153 - 33892862
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||||| || | |||||||||||||    
T  33893153 tttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgatattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaat 33893055  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||         |||||| ||||     
T  33893054 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 33892964  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  33892963 agcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaat-tactattgatcattaa 33892865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 6088945 - 6089237
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6088945 tggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcat 6089044  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    ||| ||||||||| ||  ||| || ||||||| ||| ||||||||| |||      ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  6089045 cagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cactctacaaggtataacacttaagactatcacatgatatcagc 6089138  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  6089139 aactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaagcattactatatgaat-tactattgatcattaatca 6089237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 33618871 - 33619162
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| | |||| || |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33618871 tggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcat 33618970  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||        || ||||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  33618971 cagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaacaccctagaa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatca 33619061  T
Q  205 actctatttgcatgttaa-----agattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    ||| | ||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33619062 actatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 33619160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30353505 - 30353256
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||    ||||| | | || |||||||| |||| |||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  30353505 tggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggcatcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcat 30353406  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  30353405 catataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 30353306  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 254  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30353305 actctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 15491654 - 15491884
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||  | |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15491654 gtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 15491753  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||| | |||     
T  15491754 gattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcacatgatatcagcaat 15491853  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataa 237  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15491854 tctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054622
Alignment:
Q  221 aaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatca 7054622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Original strand, 18498470 - 18498565
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||| | || |||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18498470 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19899916 - 19899613
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19899916 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatggcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaat 19899817  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19899816 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19899717  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19899716 accaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 19899617  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  19899616 tcag 19899613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 23999376 - 23999679
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23999376 tttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaat 23999475  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23999476 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 23999575  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23999576 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 23999675  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  23999676 tcag 23999679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 46931440 - 46931741
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46931440 ttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaat 46931539  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46931540 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46931637  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931638 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaa 46931737  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  46931738 tcag 46931741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27763457 - 27763155
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27763457 ttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-atagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaat 27763359  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27763358 ttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatata 27763259  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27763258 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaa 27763159  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  27763158 tcag 27763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 51128888 - 51129190
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  51128888 tttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaat 51128987  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  51128988 tcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataatatc 51129087  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  51129088 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 51129186  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  51129187 tcag 51129190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 18422680 - 18422981
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18422680 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 18422779  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18422780 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18422879  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  18422880 atcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaagcattgctagatgaat-tactattgatcattaa 18422978  T
Q  301 tca 303  Q
    |||    
T  18422979 tca 18422981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 543 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 42982930 - 42982679
Alignment:
Q  543 ttaacgggtgcaaattttcctaggcattttccttagtatttctgtttttatttccttattaaacacacaca---------aaaatgaatgatccttataa 633  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |         ||||||||||||||||||||    
T  42982930 ttaacgggtgcaaattttccgaggcattttccttagtatttctgtttttatttccttattacacacacatatatatgaaaaaaatgaatgatccttataa 42982831  T
Q  634 tttcaagacaaaaatgtcaatttatcatcttgtttttactacagaggtttttcactttcataatataaattataaatataaatgtaaatgagtcatatta 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42982830 tttcaagacaaaaatgtcaatttatcatcttgtttttactacagaggtgtttcactttcata-tataaattataaatataaatgtaaatgagtcatatta 42982732  T
Q  734 taggttgttgcaattgcataaatattaataaactagcatggaccgtgatgatg 786  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42982731 taggtggttgcaattgcataaatattaataaactagcatggaccgtgacgatg 42982679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 10922756 - 10923058
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  10922756 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaac 10922855  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10922856 tcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactgtcacataatatc 10922955  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10922956 atcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 10923054  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  10923055 tcag 10923058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15382962 - 15383264
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | || |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15382962 tttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaatgtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaat 15383061  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15383062 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 15383161  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  15383162 atcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaa 15383260  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  15383261 tcag 15383264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15752058 - 15752360
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15752058 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 15752157  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15752158 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagagtatcacataatatc 15752257  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15752258 attaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatttttactagatgaat-tactattgatcattaa 15752356  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  15752357 tcag 15752360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8222160 - 8222458
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||   | | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8222160 tttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaat 8222256  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8222257 tcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 8222356  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8222357 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-ta-tattgatcattaa 8222454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28564928 - 28564629
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28564928 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 28564829  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  28564828 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacactta--actatcacataatatc 28564731  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28564730 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 28564632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37451315 - 37451616
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37451315 tttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaat 37451413  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37451414 ttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37451513  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37451514 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 37451612  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  37451613 tcag 37451616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 30254453 - 30254753
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30254453 tttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaat 30254551  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  30254552 tcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctataaagtgtaacacttaagactgtcacataataac 30254651  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  30254652 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaa 30254750  T
Q  301 tca 303  Q
    |||    
T  30254751 tca 30254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 2959784 - 2960079
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2959784 tgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcag 2959883  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2959884 attaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 2959983  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2959984 atgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 2960079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 16415678 - 16415977
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccat-tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16415678 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacagtggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattca 16415777  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  16415778 ttagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatc 16415877  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16415878 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaat-tactattgatcattaatca 16415976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30327099 - 30326797
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |  ||||||| | |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30327099 ttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatagcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaat 30327000  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30326999 tcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 30326900  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  30326899 atcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatcaa 30326801  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  30326800 tcag 30326797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 32267063 - 32267365
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  32267063 ttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaac 32267162  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  32267163 ccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatc 32267262  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  32267263 atcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgaacattaa 32267361  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  32267362 tcag 32267365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216386
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || ||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaat-tactattgatcattaatcag 32216386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27564052 - 27563750
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  ||| ||| ||||||    
T  27564052 tttttagtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaat 27563953  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |     
T  27563952 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttc 27563853  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27563852 atcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat-taatattgatcattaa 27563754  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  27563753 tcag 27563750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 28769682 - 28769981
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  28769682 ttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggcatcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaat 28769780  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28769781 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccacaaagtgtaacgcttaagactatcacataatat 28769880  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  28769881 catcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattgctagatgaat-tactattgatcatta 28769979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9903201 - 9902899
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  9903201 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatcaat 9903102  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9903101 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatc 9903002  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9903001 atcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaat-tactattgatcattaa 9902903  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  9902902 tcag 9902899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27227579 - 27227330
Alignment:
Q  54 tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaa 153  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  27227579 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 27227480  T
Q  154 gcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagt 253  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  27227479 gtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagt 27227380  T
Q  254 ccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27227379 ccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 27227330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 42721068 - 42721364
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  42721068 tttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaacatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaat 42721167  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||     
T  42721168 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtataacacttaagattatcacgtaatatc 42721267  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  42721268 atcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaattattactagattaat-tactattgatcattaa 42721363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 304
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25160963
Alignment:
Q  55 gtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaag 154  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
Q  155 cgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 254  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 25160914  T
Q  255 caagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25160915 caagatgttgcaagcattactatatgaat-tactattgatcattaatcag 25160963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10182155 - 10181853
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10182155 tttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaat 10182056  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10182055 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 10181956  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta-catgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10181955 atcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgaacatta 10181857  T
Q  300 atca 303  Q
    ||||    
T  10181856 atca 10181853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27267344 - 27267046
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  27267344 tttttggtgaagttaacactag--cataaaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtctccatagtatcatcaat 27267247  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27267246 tcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaacaccccacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 27267148  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  27267147 atcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgataattaa 27267049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 4330323 - 4330612
Alignment:
Q  15 aacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaac 113  Q
    ||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4330323 aacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaac 4330422  T
Q  114 aagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctattt 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4330423 aagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactcttttt 4330522  T
Q  214 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4330523 gcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaat-tacaattgatcattaatcag 4330612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37619043 - 37618747
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaa--caccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtat--cat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  37619043 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcat 37618944  T
Q  97 caattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataa 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||         ||| ||||    
T  37618943 caattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatcccataaagtgtaacac---------tcatataa 37618853  T
Q  197 tatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatca 296  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||    
T  37618852 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tagtattgacca 37618754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 238659 - 238358
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| || | |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  238659 tttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaat 238561  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  238560 taatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 238461  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||    
T  238460 atcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcatgaa 238362  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  238361 tcag 238358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34012517 - 34012227
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  34012517 tgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcag 34012418  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||     ||||||||||||||| ||||| |    
T  34012417 attaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 34012323  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  34012322 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaat-tactattgatcattaatcag 34012227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 47279218 - 47279517
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47279218 tttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 47279317  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47279318 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47279417  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  47279418 aacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagatgaat-tactattgatcattaa 47279516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27533123 - 27532826
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |  |  |||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  27533123 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 27533024  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  27533023 cagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcagca 27532925  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27532924 attctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 27532826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 38823247 - 38823545
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||    |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  38823247 tggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgtcatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 38823346  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  38823347 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 38823446  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38823447 actctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 38823545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7079168 - 7078909
Alignment:
Q  43 taacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcata 142  Q
    ||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  7079168 taacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatccta 7079069  T
Q  143 ccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatag 242  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7079068 ccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatag 7078969  T
Q  243 tacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7078968 tatatgtaagtctaagatattgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 7078909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47682640 - 47682339
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacac-cccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||  | |||||||| |||| || ||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47682640 tttttggtgaagttaacactag--cataaaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaa 47682543  T
Q  100 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47682542 ttcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatat 47682443  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  47682442 catcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactaaatgaat-tactattgatcatta 47682344  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  47682343 atcag 47682339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 304
Target Start/End: Original strand, 15168192 - 15168427
Alignment:
Q  68 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 167  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |     
T  15168192 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcag 15168291  T
Q  168 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15168292 aaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagatgttgcaa 15168391  T
Q  268 gtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15168392 gcattattagatgaat-tactattgatcattaatcag 15168427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 14758074 - 14758362
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  14758074 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcat 14758173  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||         ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14758174 tagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaa---------ttaagactatcgcataatatcatca 14758264  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14758265 actatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 14758362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 40884846 - 40885141
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  40884846 tggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaattcat 40884945  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| || |||||| |||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40884946 cagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatca 40885045  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40885046 actatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaat 40885141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 39393419 - 39393715
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||  | ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||    
T  39393419 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagtggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcag 39393518  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||    
T  39393519 attaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaac 39393618  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39393619 tctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 39393715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 41926192 - 41926484
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||| | |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  41926192 tttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggcatcacaagttcagtccctatagtatcatcaat 41926291  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||      ||| | |||||||     
T  41926292 tcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacact------tattaaataatatc 41926385  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41926386 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 41926483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 3534967 - 3535253
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||    
T  3534967 gtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatca 3535066  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||         |||| |||| | ||||    
T  3535067 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactt---------acatgatatcagcaac 3535157  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3535158 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 3535253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11742493 - 11742213
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  11742493 tggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcat 11742395  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    | | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||                 ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  11742394 cggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaag-----------------tgtaacaattaagactatcacatgatatcagca 11742312  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11742311 actctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 11742213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 3309181 - 3309484
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  3309181 tggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcat 3309279  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacacc---ctaca--aagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||| ||||| |||  ||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  3309280 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgata 3309379  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3309380 tcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatt 3309478  T
Q  299 aatcag 304  Q
    ||||||    
T  3309479 aatcag 3309484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33725680 - 33725472
Alignment:
Q  68 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |     
T  33725680 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccag 33725581  T
Q  168 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33725580 aaagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaa 33725481  T
Q  268 gtattacta 276  Q
      |||||||    
T  33725480 acattacta 33725472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 1547320 - 1547602
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||          
T  1547320 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatca------ 1547413  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
      | ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||    
T  1547414 --gattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 1547511  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1547512 actct--------gttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-taccattgatcattaatcag 1547602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31621694 - 31621395
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||| | |||| ||||||  | ||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31621694 gtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtggcatcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatca 31621595  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | || |||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  31621594 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccca-gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaac 31621496  T
Q  207 tctatttgcat-----gttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    | | |||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  31621495 tatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgttgcaagcattagtagatgaa-ctactattgatcattaat 31621397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 301
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22171039
Alignment:
Q  67 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 166  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||  ||||||||| |    
T  22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
Q  167 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgca 22171005  T
Q  267 agtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |  |||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  22171006 aacattattagataaat-tactattgatcattaat 22171039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 48620672 - 48620906
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  48620672 gtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatca 48620771  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| |||| | ||||    
T  48620772 gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaac 48620862  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 250  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  48620863 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 279
Target Start/End: Original strand, 38759611 - 38759840
Alignment:
Q  54 tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccc----tcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||     || || ||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  38759611 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttatt 38759710  T
Q  150 ctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 249  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||| |  |||| |||||||| || ||||    
T  38759711 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatgt 38759810  T
Q  250 aagtccaagatgttgcaagtattactagat 279  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38759811 aactccaagatgttgcaagcattactagat 38759840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1359917 - 1359780
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  1359917 acaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgc 1359818  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  1359817 aagcattactggatgaat-tactatcgatcattaatcag 1359780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 304
Target Start/End: Original strand, 48353737 - 48353873
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48353737 acaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgc 48353835  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48353836 aagcattactagatgaat-tattattgatcattaatcag 48353873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 304
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21289931
Alignment:
Q  186 ctatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatat 285  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  21289817 ctatcacataatat---caactctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-t 21289912  T
Q  286 attattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21289913 attattgatcattaatcag 21289931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 21289729 - 21289816
Alignment:
Q  29 aaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaag 116  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21289729 aaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 302
Target Start/End: Original strand, 31962855 - 31962945
Alignment:
Q  211 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  31962855 tttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaa-ctactattgatcattaatc 31962945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 30254887 - 30254925
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaat 39  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30254887 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaat 30254925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 146168 - 145865
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  146168 tttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcaat 146069  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  146068 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 145969  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  145968 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatacaattgatcattaa 145869  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  145868 tcag 145865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 24211749 - 24212052
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24211749 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 24211848  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24211849 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 24211948  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24211949 atcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 24212048  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  24212049 tcag 24212052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37109880 - 37110184
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  37109880 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattataatatcatcaat 37109979  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatc--ataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37109980 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 37110079  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  37110080 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatt 37110178  T
Q  299 aatcag 304  Q
    ||||||    
T  37110179 aatcag 37110184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 30055535 - 30055837
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30055535 tttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaat 30055634  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30055635 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30055734  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30055735 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 30055833  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  30055834 tcag 30055837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27283752 - 27284054
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27283752 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgaaatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaat 27283851  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27283852 ttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatt 27283951  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27283952 atcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 27284050  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  27284051 tcag 27284054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31579222 - 31578916
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttg-----taaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||      || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31579222 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttatacaatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatca 31579123  T
Q  96 tcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacata 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31579122 tcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacata 31579023  T
Q  196 atatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatc 295  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  31579022 atatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatc 31578924  T
Q  296 attaatca 303  Q
    ||||||||    
T  31578923 attaatca 31578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17842739 - 17842435
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||    
T  17842739 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaat 17842640  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatc--ataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17842639 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataata 17842540  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||    
T  17842539 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaat-tactattgatcatt 17842441  T
Q  299 aatcag 304  Q
    ||||||    
T  17842440 aatcag 17842435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18797337 - 18797637
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  18797337 tttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaac 18797434  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18797435 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 18797534  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18797535 atcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 18797633  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  18797634 tcag 18797637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 38258553 - 38258816
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38258553 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 38258652  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38258653 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 38258752  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 264  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38258753 atcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32821206 - 32820924
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32821206 tttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaat 32821107  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  32821106 tcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatc 32821007  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32821006 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat 32820924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 10481619 - 10481915
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  10481619 tgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatca 10481718  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10481818  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10481819 tctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat-tactattgatcgttaatcag 10481915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9355978 - 9355678
Alignment:
Q  2 ttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaatt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | || || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||||    
T  9355978 ttttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaatt 9355879  T
Q  102 catcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatga 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9355878 catcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatca 9355779  T
Q  202 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  9355778 tcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tgctattgatcattaat 9355680  T
Q  302 ca 303  Q
    ||    
T  9355679 ca 9355678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15612905 - 15612610
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  15612905 gtgaagttaacactataacatcaaag-tgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtggcatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatca 15612807  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  15612806 gattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaac 15612707  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15612706 tctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattgttgatcattaatcag 15612610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 37347030 - 37347329
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37347030 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37347129  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | || |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  37347130 ttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatc 37347228  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  37347229 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaagcattactcgatgaat-tactattgatcattaa 37347327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 7334802 - 7335103
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  7334802 tttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaac 7334901  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  7334902 tcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacagagtgtaacacttaagattatcagataatatc 7335001  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||   |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  7335002 atcaact-agtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcattaa 7335099  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  7335100 tcag 7335103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5657628 - 5657335
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5657628 gtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatca 5657529  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
      ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  5657528 tattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaac 5657429  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5657428 tatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 5657335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 23111202 - 23111502
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||| ||| | |||||| | || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23111202 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcat 23111301  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttat--cataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgat 202  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23111302 tagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcat 23111401  T
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  23111402 caactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaagcattactagaagaat-tactattgatcataaatc 23111500  T
Q  303 ag 304  Q
    ||    
T  23111501 ag 23111502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 32432500 - 32432761
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  32432500 agtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcc 32432599  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32432600 taccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaat 32432699  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  32432700 agtacatgtaagtccaaggtgttgcaagcattactagatgaat-tattattaatcatgaatca 32432761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41765214 - 41764929
Alignment:
Q  18 actataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaaga 117  Q
    |||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41765214 actatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 41765115  T
Q  118 ctacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcat 217  Q
    || |||||||| ||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  41765114 ctgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcat 41765015  T
Q  218 gttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41765014 gttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaagcattactggatgaat-tattattgatcattaatcag 41764929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 21991648 - 21991911
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21991648 tggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgtcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 21991747  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  21991748 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 21991847  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 268  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21991848 actttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 21991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 11071214 - 11071512
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| ||   |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11071214 tttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaat 11071313  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11071314 tcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 11071413  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | || ||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11071414 atcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 11071509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 8861301 - 8861595
Alignment:
Q  9 gaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| || | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||     
T  8861301 gaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcaga 8861400  T
Q  109 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactc 208  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||    
T  8861401 ttaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgcaaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactc 8861500  T
Q  209 tatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8861501 tctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcatgcattactagatgaa-atactattgatcattaatcag 8861595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31520876 - 31520594
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31520876 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaat 31520778  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31520777 tcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatc 31520695  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  31520694 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactcgatgaat-tactattgatcattaa 31520596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 22687254 - 22687541
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22687254 tgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcag 22687353  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||    
T  22687354 attaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatctcatgatatcaacaact 22687453  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22687454 c--------tgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaat-tactattgatcattaatcag 22687541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48928445 - 48928149
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  48928445 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcat 48928347  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  48928346 cagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatca 48928247  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48928246 actatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 48928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33688406 - 33688117
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| || | |||||||  |||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |    
T  33688406 aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggcatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagat 33688307  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | | ||||||||||| | |||||||||| || |||| | |||||||    
T  33688306 taacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactct 33688207  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
     |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33688206 gtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43686049 - 43686330
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  43686049 ttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaat 43686147  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43686148 tcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 43686247  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43686248 atcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10359305 - 10359066
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaa-tataattttatcataccttgttctaagcgtaaca 161  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10359305 agtgacatcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca 10359207  T
Q  162 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  10359206 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagatt 10359107  T
Q  262 ttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  10359106 ttgcaagcattactaaatg-atttactattgatcattaatca 10359066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 6546533 - 6546829
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||    |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |     |||||||||||||||||||||    
T  6546533 gtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaacatcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatca 6546632  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||    
T  6546633 gattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaac 6546732  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6546733 tctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 6546829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672617
Alignment:
Q  86 catagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  186 ctatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataa---aatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaa 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaa 15672631  T
Q  283 tatattattgatcat 297  Q
    | || ||||||||||    
T  15672630 t-tactattgatcat 15672617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 4582931 - 4583229
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||  | |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  4582931 tggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 4583030  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4583031 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 4583130  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  4583131 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactggatgaat-tactattaatcatgaatcag 4583229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 12165764 - 12166053
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcag-ccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  12165764 tggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtccctta-agtatcatcaattca 12165862  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||| | |    
T  12165863 tcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacataatatcagc 12165953  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12165954 aactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 12166052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Original strand, 44598736 - 44598973
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacac 162  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  44598736 agtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 44598835  T
Q  163 cctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 262  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44598836 cccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgt 44598935  T
Q  263 tgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    | |||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44598936 tacaagcattactagatgaa---actattgatcattaatca 44598973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12390783 - 12390500
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  12390783 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaat 12390684  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |                 ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  12390683 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttctttt-----------------aagtgtaacacttaagac--tcacataatatc 12390603  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  12390602 atcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaat-tactatttatcattaa 12390504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703350
Alignment:
Q  54 tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||        | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||    
T  37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatca--------gattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
Q  154 gcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagt 253  Q
    | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagt 37703399  T
Q  254 ccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37703398 ccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 37703350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 26980335 - 26980614
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||  | ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  26980335 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcat 26980434  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  26980435 caaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 26980517  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26980518 actctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaat-tattgttgatcattaatc 26980614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353418
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagtt-cagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||   ||  |||||||||| | | || |||||||||| |||||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| ||||||||||| || ||| || |  |    | ||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35353220 tcagattaacaagactgca-ttactagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatc 35353318  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  35353319 aactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-cactattgatcattaatca 35353417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 29173552 - 29173832
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||| |||  | |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29173552 tggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 29173651  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||   |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||                 ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29173652 caaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag-----------------tgttacacttaagactatcacataatatcatca 29173734  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  29173735 actctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatgaatcag 29173832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25691692 - 25691395
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaac-accccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatc 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||  ||| || |||||||| |||| |||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  25691692 gtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggcatcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatc 25691593  T
Q  106 aggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaa 205  Q
    |  ||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  25691592 atattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaa 25691493  T
Q  206 ctctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||| |||||| |||||||||   ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25691492 ctctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 25691395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 38053494 - 38053735
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||     
T  38053494 tttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaaa 38053593  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38053594 t--------taacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatc 38053668  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38053669 atcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 38053735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48928712 - 48928469
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  48928712 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcat 48928614  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  48928613 cagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatca 48928514  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 249  Q
    ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48928513 actatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgt 48928469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 101 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46480980
Alignment:
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||  ||| ||||| |||| |||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46481083  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    || |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  46481082 attaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 46480984  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  46480983 tcag 46480980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27421532 - 27421313
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||    
T  27421532 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcct-ataatatcataaat 27421434  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||     
T  27421433 ttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcgtatgatatc 27421334  T
Q  201 atcaactctatttgcatgtta 221  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  27421333 agcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704387
Alignment:
Q  77 ttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaa 176  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  177 cacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaa 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587943
Alignment:
Q  112 acaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctat 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||      
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactct-- 26588029  T
Q  212 ttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
          ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26588028 ------gttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 26587943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||     
T  44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaa 44413426  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactta 182  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 283
Target Start/End: Original strand, 43925174 - 43925385
Alignment:
Q  65 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 164  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||  |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||     
T  43925174 tgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacct 43925272  T
Q  165 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 264  Q
     |||| || ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||      |||||||||||||    
T  43925273 cacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttg 43925366  T
Q  265 caagtattactagatgaat 283  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  43925367 caagcattactagatgaat 43925385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32593327 - 32593057
Alignment:
Q  15 aacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaaca 114  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32593327 aacactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatca 32593229  T
Q  115 agactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttg 214  Q
    | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||                 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  32593228 aaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttg 32593146  T
Q  215 catgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  32593145 catgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaat-tactatggatcattaatcag 32593057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411391
Alignment:
Q  185 actatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaata 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat- 44411411  T
Q  285 tattattgatcattaatcag 304  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  44411410 taatattgaccattaatcag 44411391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 301
Target Start/End: Original strand, 37704390 - 37704489
Alignment:
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  37704390 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaat-tactattgatcattaa 37704488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26524476 - 26524364
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  | | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26524476 tggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttat 26524377  T
Q  105 caggttaacaaga 117  Q
    ||  |||||||||    
T  26524376 catattaacaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34362126 - 34362029
Alignment:
Q  206 ctctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  34362126 ctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaat-tacttttgatcattaatcag 34362029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  236 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaa-ataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34362292 - 34362205
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatca 98  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  34362292 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 37704182 - 37704236
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaa-tgtaataagtaacaccccattgtttgta 61  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37704182 tgaagttaacactatagcataaaaaaatgtagtgagtaacaccccattgtttgta 37704236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32912758 - 32912455
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32912758 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaatgatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaat 32912659  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32912658 ttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 32912559  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32912558 atcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 32912459  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  32912458 tcag 32912455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34361669 - 34361367
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34361669 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacattaaaagttcagcc-tcataatatcatcaat 34361571  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  34361570 tcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatc 34361471  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34361470 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 34361371  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  34361370 tcag 34361367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 42199762 - 42200066
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42199762 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 42199861  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42199862 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 42199961  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta-catgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  42199962 ataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactactgttcatta 42200061  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  42200062 atcag 42200066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37663917 - 37663617
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37663917 tttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37663820  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37663819 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37663720  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37663719 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 37663621  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  37663620 tcag 37663617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19089631 - 19089329
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19089631 tttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 19089532  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19089531 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19089432  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19089431 atcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 19089333  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  19089332 tcag 19089329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 55478073 - 55477767
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca----ttgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55478073 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 55477974  T
Q  97 caattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataa 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  55477973 caattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacaccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataa 55477874  T
Q  197 tatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatca 296  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  55477873 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatca 55477775  T
Q  297 ttaatcag 304  Q
    ||||||||    
T  55477774 ttaatcag 55477767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 25184147 - 25184448
Alignment:
Q  2 ttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |    
T  25184147 ttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaact 25184246  T
Q  102 catcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatga 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25184247 catcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatta 25184346  T
Q  202 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25184347 tcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 25184445  T
Q  302 cag 304  Q
    |||    
T  25184446 cag 25184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 879726 - 879427
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |  | |||||||||||||||     
T  879726 tttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaac 879627  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  879626 tcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacatttaagactatcacataatatc 879527  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  879526 atcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattattgatcattaa 879428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19440826 - 19440524
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||  ||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19440826 tttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 19440727  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||     
T  19440726 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacccttaagtttataacataatatc 19440627  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19440626 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 19440528  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  19440527 tcag 19440524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36493866 - 36493567
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36493866 tttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 36493767  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  36493766 tcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatc 36493668  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  36493667 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagcattactcgatgaat-tactattgatcattaa 36493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 50697275 - 50697574
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  50697275 tttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaat 50697373  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50697374 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatc 50697473  T
Q  201 atcaactctatttgc-atgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50697474 atcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgtaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 50697572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6864068 - 6864369
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||| || | | |||||| | |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6864068 tttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaat 6864167  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6864168 ttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatc 6864267  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6864268 atcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 6864366  T
Q  301 tca 303  Q
    |||    
T  6864367 tca 6864369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35021209 - 35020931
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| | || | |||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  35021209 tggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacattggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcat 35021110  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35021109 tagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 35021010  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  35021009 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaat 35020931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28003160 - 28002863
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | ||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28003160 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcat 28003061  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    | | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28003060 cggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 28002961  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28002960 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgctaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 28002863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34948267 - 34947971
Alignment:
Q  9 gaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagg 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  34948267 gaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcata 34948168  T
Q  109 ttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaac--acttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  34948167 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaaagtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaac 34948068  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  34948067 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa-atactattgatcgttaatcag 34947971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 301
Target Start/End: Original strand, 17167753 - 17168045
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  17167753 tgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcag 17167852  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
      ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17167853 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 17167952  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  17167953 ctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaat-tactatttatcattaat 17168045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 304
Target Start/End: Original strand, 33341475 - 33341733
Alignment:
Q  44 aacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatac 143  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  33341475 aacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctac 33341573  T
Q  144 cttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagt 243  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33341574 cttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagt 33341673  T
Q  244 acatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33341674 acatgtaagtccaagatgttgtaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 33341733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 3042644 - 3042954
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtat------- 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||  |||| || | ||||||||||| ||||| | | | |||||           
T  3042644 tttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatacaatgacatcaaaaattcagtcattagagtatcaatgta 3042743  T
Q  94 -catcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcac 192  Q
     |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3042744 tcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 3042843  T
Q  193 ataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattg 292  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  3042844 ataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaacatgttgcaagcattactagatgaat-tagtattg 3042942  T
Q  293 atcattaatcag 304  Q
    || |||||||||    
T  3042943 attattaatcag 3042954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 17173330 - 17173605
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  17173330 tgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcag 17173429  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
      ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17173430 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 17173529  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  17173530 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgaat 17173605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 23761114 - 23761406
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  23761114 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagat 23761213  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  23761214 taacaagaatacacttaatctaattttatc-taccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaagactatcgcatgatatcagcaactct 23761312  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23761313 gtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattattgatcattaatcag 23761406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 47253782 - 47254075
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  47253782 tttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-attgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca-- 47253878  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
          | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47253879 ------gattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 47253972  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47253973 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 47254071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 304
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815636
Alignment:
Q  76 gttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgta 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  176 acacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattact 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattact 1815608  T
Q  276 agatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1815609 agatgaat-tacaattgatcattaatcag 1815636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 38011891 - 38012169
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | | || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  38011891 tggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcat 38011990  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38011991 cagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatca 38012090  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||| | |||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38012091 actatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29584372 - 29584076
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29584372 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 29584275  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || |||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  29584274 cagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 29584175  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29584174 actctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 29584076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 55241242 - 55240982
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||| |||||||||||    
T  55241242 agtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatca 55241144  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55241143 taccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaat 55241044  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  55241043 agtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagataaat-tactattaatcattaatca 55240982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37775702 - 37775993
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  37775702 tttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcccccct--tagtatcatcaat 37775799  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| ||||     
T  37775800 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 37775890  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37775891 agcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 37775989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25701235 - 25700933
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25701235 tttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 25701136  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca-ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25701135 tcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacat 25701036  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  25701035 catcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgcaagcattgttagatgaat-tactattgatcatta 25700937  T
Q  300 atca 303  Q
    ||||    
T  25700936 atca 25700933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 7703554 - 7703844
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||          
T  7703554 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatca------ 7703647  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
      | ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  7703648 --gattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagca 7703745  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  7703746 actctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactatttatcattaatcag 7703844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46888328 - 46888035
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||| |||||| | |||||| || | |||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||    
T  46888328 tgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtccccatactatcgttaattcatcag 46888229  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  46888228 attaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactt-agactatcacataatatcatcaaat 46888130  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46888129 cggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 46888035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 27396653 - 27396948
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27396653 tggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcat 27396752  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| | ||    
T  27396753 cagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagca 27396852  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    || || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27396853 acgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 27396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5048139 - 5047843
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||  ||| || ||||||||   ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  5048139 tggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcat 5048040  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  5048039 gagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-caaaatgtaacacttaagactatcacatgatatcataa 5047941  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  5047940 actatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataaat-tattattgatcagtaatca 5047843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 49376004 - 49376302
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||  | |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  49376004 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 49376103  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||  | ||||| | ||||    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49376104 cagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatca 49376203  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  49376204 actttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaaagcattactaaatgaat-tactattgatcattaatcag 49376302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 9139280 - 9139563
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||  | | ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||||||     
T  9139280 tttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgtacagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaac 9139377  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||                |    
T  9139378 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctacaaagtgtaacacttaa----------------g 9139461  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  9139462 ataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagacgaat-tactattgatcattaa 9139560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 302
Target Start/End: Original strand, 17272084 - 17272297
Alignment:
Q  88 tagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagact 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  17272084 tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagact 17272183  T
Q  188 atcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatat 287  Q
    ||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  17272184 atcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tac 17272282  T
Q  288 tattgatcattaatc 302  Q
    |||||||||||||||    
T  17272283 tattgatcattaatc 17272297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934136
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    |||||||||||||||||  | |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  4934375 tggtgaagttaacactagtata--aaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttca 4934278  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4934277 tcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatc 4934178  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtac 245  Q
    |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4934177 aactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtac 4934136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 50764765 - 50765055
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||  | |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50764765 tttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 50764862  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |          ||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| ||||     
T  50764863 tcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctacgt----------gtaacaccccacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatc 50764952  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50764953 agcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 50765051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 32579481 - 32579781
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgt---aaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaatt 101  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| || | | |||| ||||||| |||||||   |  ||| ||||||||||| || | ||||||||| |||| ||    
T  32579481 tggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgtacggtgccatcaaaagtttagtc-tcatagtattatcagtt 32579579  T
Q  102 catcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatga 201  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  32579580 catcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatca 32579679  T
Q  202 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32579680 tcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaat 32579778  T
Q  302 cag 304  Q
    |||    
T  32579779 cag 32579781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37287767 - 37288063
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |      
T  37287767 tttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataa-- 37287864  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccct-acaaagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
          | ||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||| ||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37287865 ------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgata 37287958  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | | ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  37287959 tcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaat-tactattgagcatt 37288057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30002798 - 30002517
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||          
T  30002798 tggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatca------ 30002705  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
      | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||         ||||| |||| | ||    
T  30002704 --gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagca 30002616  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30002615 actctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 30002517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 4598030 - 4598317
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || | |||  ||||||||||||    
T  4598030 tggtgaagttaacactataacatcaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcat 4598128  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| |||| | ||    
T  4598129 catattaacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagca 4598218  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  4598219 actctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaagcattattagattaat-tactattgatcattaatcag 4598317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33816644 - 33816392
Alignment:
Q  68 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta- 166  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |     
T  33816644 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 33816545  T
Q  167 ----------------caaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 250  Q
                    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  33816544 aaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgta 33816445  T
Q  251 agtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33816444 agtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 33816392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Original strand, 32592166 - 32592418
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||     
T  32592166 agtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcc 32592265  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         ||| || || | | ||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  32592266 taccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcatatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaat 32592356  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  32592357 agtacctgtaagttcaagatgttgaaagcattactaaatgaat-tactattgatcgttaatca 32592418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35025762 - 35025530
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||          
T  35025762 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatca------ 35025669  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
      | ||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35025668 --gattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatca 35025571  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtac 245  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35025570 actatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54499413 - 54499172
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaa-agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  54499413 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattca 54499314  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgat 202  Q
    |||  ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |     
T  54499313 tcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatgatattag 54499214  T
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtac 245  Q
     |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  54499213 taactctgtttccatgttaaa-atgccaacgataaaatggtac 54499172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 304
Target Start/End: Original strand, 26896284 - 26896423
Alignment:
Q  165 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtcc-aagatgtt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  26896284 tacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgtt 26896382  T
Q  264 gcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26896383 gcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcag 26896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883990
Alignment:
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || | |    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaatttt 46884080  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagt--atgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 46883990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7152217 - 7152081
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7152217 acaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgc 7152118  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7152117 aagcattattagatgaat-tactattgatcattaatca 7152081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 39397955 - 39398115
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||         
T  39397955 tggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttctcagtatcatcaa----- 39398049  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgt 174  Q
        ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39398050 ----ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt 39398115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 4205217 - 4205299
Alignment:
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4205217 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaat 4205299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025442
Alignment:
Q  230 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 35025442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 304
Target Start/End: Original strand, 39400243 - 39400343
Alignment:
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  39400243 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaat-gactattgatcattaatc 39400341  T
Q  303 ag 304  Q
    ||    
T  39400342 ag 39400343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 268
Target Start/End: Original strand, 56050173 - 56050230
Alignment:
Q  211 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 268  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56050173 tttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 56050230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 4396359 - 4396410
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4396359 tttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccca 4396410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 53124320 - 53124371
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  53124320 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacacccca 53124371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 301
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431887
Alignment:
Q  239 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaat-tactattgatcattaat 23431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518401
Alignment:
Q  9 gaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcag 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||  || |||| |||||||| |||||    
T  23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcag 23518401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Original strand, 4205156 - 4205221
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaa 73  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | | |||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  4205156 tgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 47481546 - 47481849
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47481546 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaat 47481645  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47481646 tcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 47481745  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47481746 ataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 47481845  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  47481846 tcag 47481849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21009954 - 21009651
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21009954 ttttttgtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaat 21009855  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21009854 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 21009755  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21009754 atcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 21009655  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  21009654 tcag 21009651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 54505832 - 54506134
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  54505832 tttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcagcc-tcatagtatcataaat 54505930  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54505931 acatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 54506030  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54506031 atctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 54506130  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  54506131 tcag 54506134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26941412 - 26941110
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  26941412 tttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaat 26941313  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  26941312 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatc 26941213  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26941212 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 26941114  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  26941113 tcag 26941110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 48354969 - 48355267
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  48354969 tggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcat 48355068  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48355069 cagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 48355168  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48355169 actctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat-tattattgatcattaatcag 48355267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42505925
Alignment:
Q  14 taacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaac 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
Q  114 aagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctattt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttc 42506015  T
Q  214 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42506014 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 42505925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40552411 - 40552109
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40552411 tttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 40552312  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| || | |||||||||||     
T  40552311 tcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccacaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatc 40552212  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  40552211 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaa 40552113  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  40552112 tcag 40552109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52041071 - 52040775
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccat-tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52041071 tggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattca 52040972  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52040971 tcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 52040872  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52040871 aactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat-gattattgatcattaat 52040775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46297910 - 46297615
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||| |||||||| | || | |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  46297910 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcat 46297811  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || ||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46297810 tagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 46297711  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46297710 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 46297615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 34132959 - 34133241
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  34132959 tttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaat 34133058  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34133059 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 34133158  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34133159 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 34133241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3655354 - 3655076
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3655354 tttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 3655255  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||     
T  3655254 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccacaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatc 3655155  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagat 279  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3655154 atcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaagcattactagat 3655076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4761801 - 4761498
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4761801 tttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 4761702  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca-ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4761701 tcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccccacaaagtataacacttaagactatcacataatat 4761602  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  4761601 catcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttgcaaacattaccagatgaat-tactattaatcatta 4761503  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  4761502 atcag 4761498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7327635 - 7327332
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaa-cactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaa 99  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7327635 tttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 7327536  T
Q  100 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| ||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7327535 ttcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatat 7327436  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  7327435 caacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcatta 7327337  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  7327336 atcag 7327332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53229301 - 53229003
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccc-cattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| | || ||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  53229301 tggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattca 53229202  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  53229201 tcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatc 53229102  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53229101 aactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaat-tagtattgatcattaatca 53229003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 2007964 - 2008258
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  2007964 tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcag 2008063  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  2008064 attaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 2008162  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2008163 ctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa-ataatattgatcattaatcag 2008258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 37157732 - 37158031
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37157732 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaat 37157830  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | || || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37157831 ttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37157930  T
Q  201 atcaact-ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    ||||| |  | |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  37157931 atcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgcaagcattactagatgaat-taccattgatcatta 37158029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 37203091 - 37203391
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37203091 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37203190  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37203191 tcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37203290  T
Q  201 atcaact-ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
    ||||| |  | |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  37203291 atcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgcaagcattactagatgaat-taccattgatcatta 37203389  T
Q  300 at 301  Q
    ||    
T  37203390 at 37203391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 4015491 - 4015785
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4015491 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcat 4015590  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| || | ||| | |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| | |||||    
T  4015591 attaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact 4015690  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4015691 -tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 4015785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 22450996 - 22451294
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| |||| || ||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22450996 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 22451095  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22451096 catattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatca 22451195  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22451196 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattattgatcattaatcag 22451294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 54828852 - 54828551
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||  | |  |||||||||| ||||  | |||||| |||||||||    
T  54828852 tttttggtaaagttaacactataacat-aaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgacatcaaaaattcattcttcatagcatcatcaat 54828754  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  54828753 tcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatc 54828654  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54828653 atcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaat-tactattgatcattaa 54828555  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  54828554 tcag 54828551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 3362277 - 3362581
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  3362277 tttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaat 3362376  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacact--taatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3362377 tcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataaca 3362476  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  3362477 tcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaat-tactattgatcatt 3362575  T
Q  299 aatcag 304  Q
    ||||||    
T  3362576 aatcag 3362581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622568
Alignment:
Q  91 tatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatc 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  191 acataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattat 290  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactat 22622582  T
Q  291 tgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||    
T  22622581 tgatcattaatcag 22622568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33378931 - 33378636
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    ||||||| |||||||||  || |||| |||| | ||||  |||||| | ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33378931 gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatca 33378832  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  33378831 gattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaac 33378732  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33378731 tatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaatca 33378636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46994749 - 46994511
Alignment:
Q  65 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  46994749 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccc 46994650  T
Q  165 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 264  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  46994649 cacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 46994550  T
Q  265 caagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46994549 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 46994511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22446216 - 22445915
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcag-ccctcatagtatcatcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22446216 tttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaa 22446118  T
Q  100 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    |||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22446117 ttcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-acaatgtataacactcaagactatcatataatat 22446019  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  22446018 catcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaagtattactggatgaat-tactattgatcatta 22445920  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  22445919 atcag 22445915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Original strand, 39282689 - 39282978
Alignment:
Q  13 ttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  39282689 ttaacactataacatcaaaactgtg-tgagtaataccccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaa 39282787  T
Q  113 caagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||    
T  39282788 caagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtt 39282887  T
Q  213 tgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  39282888 tgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcattaatcag 39282978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 45174527 - 45174812
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaata--agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |   ||||||||  || |||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45174527 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtccccatagtatcatca 45174626  T
Q  99 attcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 197  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  45174627 attcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactctacaaagtgtaacacttaagactataatatgat 45174726  T
Q  198 atgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45174727 atcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 45174812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24708212 - 24707965
Alignment:
Q  58 tgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacactta--atataattttatcataccttgttctaagc 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||  |||     
T  24708212 tgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagt 24708113  T
Q  156 gtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtcc 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708112 gtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtcc 24708013  T
Q  256 aagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||    
T  24708012 aagaagttgcaagcattattagataaat-tactattaatcattaatcag 24707965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11357513 - 11357231
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | || | ||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11357513 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattca 11357414  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||                 |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11357413 tcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatcatc 11357331  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11357330 aactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 11357232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 11466855 - 11467114
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||| ||||||||||   || |||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  11466855 tgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcag 11466954  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  11466955 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaact 11467054  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 267  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11467055 ctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa 11467114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24489114 - 24488835
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||  | |||||||  ||| |||||| | | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  24489114 ttttttgtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaat 24489015  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24489014 tcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatc 24488915  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatg 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24488914 atcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatg 24488835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 29099383 - 29099672
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  29099383 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 29099482  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||         ||| |||||| |||| | ||    
T  29099483 catattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgta---------actttcacatgatatcagca 29099573  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29099574 actctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-taccattgatcattaatcag 29099672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698479
Alignment:
Q  89 agtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagacta 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  189 tcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatatt 288  Q
    || ||| ||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || |    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaat-taat 33698463  T
Q  289 attgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||    
T  33698464 attgatcattaatcag 33698479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 32373505 - 32373796
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||| || |  |||||||| |||| ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||  |    
T  32373505 aagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactccac--tgtttgtacagtggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatat 32373602  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  32373603 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactct 32373702  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  32373703 gtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-ttctattgatcattaatcag 32373796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 44891530 - 44891823
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||| |||| |||         | ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  44891530 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------ggcatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaat 44891620  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44891621 taatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatc 44891720  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  44891721 agcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactgttgatcattaa 44891819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 43348325 - 43348563
Alignment:
Q  44 aacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatac 143  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  43348325 aacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctac 43348423  T
Q  144 cttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagt 243  Q
    |||||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43348424 cttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagt 43348523  T
Q  244 acatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43348524 acttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51213133 - 51212955
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  51213133 tttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaac 51213034  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacac 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51213033 tcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 21193670 - 21193933
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||     
T  21193670 agtaacaccccactgtttgtagagtgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcc 21193769  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaa 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||| | | ||||  |||||||| |||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21193770 taccttgttttaagtgtaacactccataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaa 21193869  T
Q  240 tagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||    
T  21193870 tagtagccgtaagttcaagatgttgcaaccattactaaatgaat-tactattgattattaatcag 21193933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 302
Target Start/End: Original strand, 25579825 - 25580063
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacac 162  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || || || ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||    
T  25579825 agtgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacac 25579924  T
Q  163 cctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 262  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||| || ||||| |    
T  25579925 cccacaaagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatat 25580024  T
Q  263 tgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25580025 tgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 25580063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 40936019 - 40936297
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40936019 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatctattcat 40936118  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||                   |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  40936119 cagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttttttt------------------aagtgtaacacttaagactatcacatgatattagca 40936200  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  40936201 actccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagataaat-tactattgatcattaatc 40936297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 303
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1090018
Alignment:
Q  95 atcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca-ccctacaaagtgtaacacttaagactatcaca 193  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
Q  194 taatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattga 293  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattga 1090008  T
Q  294 tcattaatca 303  Q
    ||||||||||    
T  1090009 tcattaatca 1090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164134
Alignment:
Q  71 caaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaa 170  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  171 gtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagta 270  Q
    |||||||||         |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |    
T  29164012 gtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagca 29164102  T
Q  271 ttactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29164103 ttactagatgaat-tactattgatcattaatca 29164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 35844354 - 35844575
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  35844354 tggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcat 35844453  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataa-ttttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |      
T  35844454 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagt 35844552  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagat 226  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  35844553 aactttgtttccatgttaaagat 35844575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44186653 - 44186367
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44186653 tttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 44186554  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||                |||||||||| ||||     
T  44186553 tcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccaca----------------actatcacatgatatc 44186470  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  44186469 aacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaagcattactagataaat-tactattgatcattaa 44186371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27480531 - 27480252
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| || || ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27480531 tttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 27480432  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc--------taca-----aagtgtaacacttaagact 187  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||         |||     |||||||||||||||||||    
T  27480431 tcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccagaagtgtaacacccagaagtgtaacacttaagact 27480332  T
Q  188 atcacataatatgatcaactcta----tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 263  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27480331 atcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgtt 27480252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43976033 - 43975742
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||| ||| | ||||||   |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  43976033 tgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcag 43975934  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||| | | |||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||       ||| |||||||| |||||||    
T  43975933 attaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaacact-------atcgcataatatcatcaact 43975841  T
Q  208 ctatt---tgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | ||   | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  43975840 atgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgcaagcattactagatgaat-taatattgatcattaatcag 43975742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 38591727 - 38592024
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgt----ttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||   ||||||| | ||||||    ||||| | || ||||||||||| || || |||| ||| ||||| |||||    
T  38591727 aagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatc 38591826  T
Q  106 aggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||| |||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38591827 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaa 38591926  T
Q  206 ctctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||| || |||||||||||||||||    
T  38591927 atctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaat-tactattgatcattaatcag 38592024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20373448 - 20373298
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20373448 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaat 20373349  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttct 151  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20373348 tcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttct 20373298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012465
Alignment:
Q  84 ctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactta 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
Q  183 agactatcacataatatgatcaactcta-tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatga 281  Q
    ||||||||| || |||| | |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatga 36012443  T
Q  282 atatattattgatcattaatcag 304  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  36012444 at-tactattgatcattaatcag 36012465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14586782 - 14586530
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    ||||||||| || | ||| || ||||| ||||||||||  | || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||     
T  14586782 agtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaactttatcc 14586683  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         ||  || |||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14586682 taccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaat 14586592  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  14586591 agtac-ggtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaat-tactactgatcattaatcag 14586530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373136
Alignment:
Q  134 tttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacg 233  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
Q  234 ataaaatagtacatgtaagtccaagatg 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20373163 ataaaatagtacatataagtccaagatg 20373136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11835695 - 11835503
Alignment:
Q  86 catagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataat-tttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaag 184  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11835695 catagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaacaattaag 11835596  T
Q  185 actatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||      |||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11835595 actatcacatgatatcatcaactctatttgcat------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaat 11835503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 53176086 - 53176290
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||   || | |||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53176086 tgaagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaatgtcc-actgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 53176184  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||  || |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  53176185 attaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 53176284  T
Q  208 ctattt 213  Q
    ||||||    
T  53176285 ctattt 53176290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212624
Alignment:
Q  181 taagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatg 280  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
Q  281 aatatattattgatcattaat 301  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  51212643 aat-tactattgatcattaat 51212624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 303
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475136
Alignment:
Q  187 tatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatata 286  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-ta 50475119  T
Q  287 ttattgatcattaatca 303  Q
     ||||||||||||||||    
T  50475120 gtattgatcattaatca 50475136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11357137 - 11357030
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11357137 acaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgc 11357038  T
Q  266 aagtatta 273  Q
    ||| ||||    
T  11357037 aagcatta 11357030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811604
Alignment:
Q  182 aagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatga 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 53811769 - 53811695
Alignment:
Q  52 attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagc------cctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagacta 120  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53811769 attgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtatataaccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 53811695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 33698218 - 33698263
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  33698218 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacacccca 33698263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 41585449 - 41585408
Alignment:
Q  11 agttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca 52  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41585449 agttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacacccca 41585408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11366551 - 11366248
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | || | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366551 tttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 11366452  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11366451 tcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 11366352  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11366351 atcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaa 11366252  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  11366251 tcag 11366248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43648415 - 43648113
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  43648415 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaac 43648316  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  43648315 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatc 43648216  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43648215 atcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 43648117  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  43648116 tcag 43648113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37905741 - 37906045
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37905741 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 37905840  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca--ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataata 198  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37905841 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataata 37905940  T
Q  199 tgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatt 298  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  37905941 tcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaat-tactattgatcatt 37906039  T
Q  299 aatcag 304  Q
    ||||||    
T  37906040 aatcag 37906045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19289493 - 19289191
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||     
T  19289493 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaac 19289394  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19289393 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 19289294  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19289293 atcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 19289195  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  19289194 tcag 19289191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33551156 - 33550874
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  33551156 tttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaat 33551057  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||     
T  33551056 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatc 33550958  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaata 284  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33550957 atcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaagcattactagatgaata 33550874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17071907 - 17071646
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  17071907 tttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatgacatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaat 17071808  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17071807 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 17071708  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 262  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17071707 atcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2325534 - 2325246
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |         
T  2325534 gtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaaat----- 2325440  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaac 206  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2325439 ---taacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaa 2325343  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  2325342 tttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcag 2325246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31570900 - 31570602
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  31570900 tggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagtgacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcat 31570801  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  31570800 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaaca 31570701  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31570700 actctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattgctagatgaat-tactattgatcattaatcag 31570602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 3176979 - 3177254
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3176979 tgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 3177078  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
      ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3177079 actaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 3177178  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
     | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  3177179 atgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagcattactagatgaat 3177254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 4763678 - 4763966
Alignment:
Q  15 aacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaaca 114  Q
    ||||||||| ||  |||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4763678 aacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaaca 4763777  T
Q  115 agactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttg 214  Q
    | |||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4763778 aaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttg 4763877  T
Q  215 catgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  4763878 catgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagttgaat-tactattgatcattaatcag 4763966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961174
Alignment:
Q  67 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 166  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |    
T  41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
Q  167 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgca 41961138  T
Q  267 agtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41961139 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 41961174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17054266 - 17054005
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| | |   ||||| ||||||||||    
T  17054266 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtncggtattcataatatcatcaat 17054167  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17054166 tcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaanactatcacataatatc 17054067  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 262  Q
    ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17054066 atcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33709398 - 33709101
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |    
T  33709398 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaaatatt 33709299  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  33709298 cagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 33709199  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33709198 actctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatca 33709101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 44913700 - 44913974
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca-ttgtttgtaaagtgacatcaaaagttcag-ccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||  | ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  44913700 gtgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatgacataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcat 44913799  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44913800 cagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 44913899  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactaga 278  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44913900 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattattaga 44913974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4478402 - 4478700
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4478402 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaat 4478501  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataa-ttttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4478502 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaac-----acaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatat 4478596  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     | ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4478597 caccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tgctattgatcatta 4478695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29242308 - 29242048
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29242308 tttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaat 29242209  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29242208 tcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatc 29242109  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 261  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29242108 atcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagatg 29242048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4264243 - 4263944
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||  | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  4264243 tggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcat 4264144  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatc-acataatatgatc 203  Q
    ||  |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |    
T  4264143 catattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagc 4264044  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4264043 aactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgcaagcattactagatgaa-ataatattgatcattgatca 4263945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 26357617 - 26357912
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||     
T  26357617 tgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcat 26357716  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  26357717 attaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccacaaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaat 26357816  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26357817 gtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 26357912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 35958942 - 35959227
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||            ||||||    
T  35958942 tttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgacattaaaagttcagc------------atcaat 35959029  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  35959030 tcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacagttaagactatcacataatatc 35959128  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35959129 atcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacat----gtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 35959223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27350108 - 27349816
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27350108 tttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaat 27350010  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| ||||     
T  27350009 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 27349919  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27349918 aggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 27349820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 4166959 - 4167257
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||| |  | |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  4166959 tggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 4167058  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4167059 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 4167158  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  4167159 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat-tactattaatcatgaatcag 4167257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 36642059 - 36642293
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt--at 138  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  ||    
T  36642059 agtaacacctcactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttat 36642158  T
Q  139 cataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaa 238  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36642159 cctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaa 36642258  T
Q  239 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtatta 273  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||    
T  36642259 atagtaccggtaagttcaagatgttgcaagcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19424794 - 19424510
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19424794 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 19424695  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||    
T  19424694 cagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagca 19424595  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||              ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19424594 actctgtttgcatgttaaag--------------atagtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 19424510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Original strand, 45327801 - 45328025
Alignment:
Q  49 cccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgt 148  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45327801 cccattgtttatacggtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgt 45327900  T
Q  149 tctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatg 248  Q
    | |||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45327901 tttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 45328000  T
Q  249 taagtccaagatgttgcaagtatta 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  45328001 taagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 69 - 304
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862187
Alignment:
Q  69 atcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaca 168  Q
    ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccaca 31862052  T
Q  169 aagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 268  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |      
T  31862053 aagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtaga 31862152  T
Q  269 tattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31862153 cattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 31862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 66 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18494385 - 18494149
Alignment:
Q  66 gacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||| |||| |||      
T  18494385 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctc 18494287  T
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18494286 acaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgt 18494187  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18494186 aagcattactagatgaat-tgctattgatcattaatcag 18494149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 304
Target Start/End: Original strand, 44286035 - 44286284
Alignment:
Q  54 tgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaa 153  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  44286035 tgtttgtatagtggcatcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaa 44286134  T
Q  154 gcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagt 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||    
T  44286135 gtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagt 44286234  T
Q  254 ccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    | ||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44286235 ctaagatgttgcaagcattgttagatgaat-tactattgatcattaatcag 44286284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39167493 - 39167257
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  39167493 agtaacacctcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttatta 39167394  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  39167393 taccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaat 39167300  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  39167299 agtacatgtaagtccaaattgttgctagcattactagatgaat 39167257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 304
Target Start/End: Original strand, 41465602 - 41465836
Alignment:
Q  69 atcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaca 168  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  | |    
T  41465602 atcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcaga 41465701  T
Q  169 aagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41465702 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaa 41465801  T
Q  269 tattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  41465802 cattactatatgaat-tactattgatcattaatcag 41465836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33660529 - 33660245
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  33660529 aagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagat 33660430  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||          ||||| |||| | ||||| |    
T  33660429 taacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------ccacatgatatcagcaacttt 33660339  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33660338 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 33660245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43771009 - 43770719
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43771009 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggcatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaat 43770910  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||         |||||| ||||     
T  43770909 tcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatc 43770819  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43770818 agcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaat-ttctattgatcattaa 43770720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 13711501 - 13711794
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||  | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  13711501 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcat 13711600  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||     |||| |||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| |||| |||| | ||    
T  13711601 cagattaacaagaatacatttaatctaattttatca-----tgttttaagtgtaacaccccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagca 13711695  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13711696 actctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaacaatactagatgaat-tactattgatcattaatcag 13711794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41464020 - 41463779
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||  | ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41464020 tttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 41463921  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  41463920 tcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaaaatgtaacatttaagactatcacatgatatc 41463821  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatag 242  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41463820 aacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 19313889 - 19314182
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||| |||  | |||||||||  | | ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19313889 tggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtgacatcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcat 19313987  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||       |||||||||| |||| | ||    
T  19313988 cagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac-------actatcacatgatatcagca 19314080  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatg---taagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19314081 actatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 19314179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 33902105 - 33902319
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  33902105 tggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcat 33902202  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  33902203 cagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccacaaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcatta 33902302  T
Q  205 actctatttgcatgtta 221  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  33902303 actctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 5881612 - 5881864
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  5881612 agtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatca 5881710  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||         |||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  5881711 taccttgttttaagtgtaatacctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaat 5881801  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  5881802 agtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattattcag 5881864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7007051 - 7006806
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatca 140  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7007051 agtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatca 7006952  T
Q  141 taccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaat 240  Q
    ||||||||| ||||                 |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7006951 taccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaat 7006869  T
Q  241 agtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7006868 agtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-ttctattgatcattaatcag 7006806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19500920 - 19500783
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19500920 acaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgc 19500821  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19500820 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 19500783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18258350 - 18258214
Alignment:
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| || || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  18258350 gttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 18258251  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta 244  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18258250 ctctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagta 18258214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41051259 - 41051169
Alignment:
Q  211 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41051259 tttgcatgttaaa-atgccaaggataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaat-tgttattgatcattaatca 41051169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41051313 - 41051263
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaac 113  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41051313 agtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257406
Alignment:
Q  256 aagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaat-tattatttatcattaatcag 18257406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501773
Alignment:
Q  71 caaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttat 138  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttat 19501773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30654741 - 30654438
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  30654741 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcact 30654642  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30654641 tcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 30654542  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30654541 ataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaa 30654442  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  30654441 tcag 30654438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8803968 - 8803672
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||||       ||||||||||    
T  8803968 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc-------tatcatcaat 8803876  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8803875 ttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaaaaagtgtaacacttaatactatcacataatatc 8803776  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8803775 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaatatactattgatcattaa 8803676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37970677 - 37970375
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970677 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 37970578  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37970577 tcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 37970478  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  37970477 atcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactgttgatcattaa 37970379  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  37970378 tcag 37970375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 1204963 - 1205260
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1204963 tggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 1205062  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1205063 catattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatca 1205162  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1205163 actctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat-tactattgatcattaatca 1205260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1149764 - 1149490
Alignment:
Q  27 ttaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacactta 126  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1149764 ttaaaaatgtaatgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacactta 1149665  T
Q  127 atataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagat 226  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1149664 atctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagat 1149565  T
Q  227 tccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1149564 tccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 1149490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43643752 - 43643451
Alignment:
Q  2 ttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |    
T  43643752 ttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatgacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaact 43643653  T
Q  102 catcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatga 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43643652 catcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatta 43643553  T
Q  202 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43643552 tcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 43643454  T
Q  302 cag 304  Q
    |||    
T  43643453 cag 43643451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23854589 - 23854287
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23854589 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 23854490  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  23854489 tcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacacttaagacaatcacataatatc 23854390  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23854389 atcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 23854291  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  23854290 tcag 23854287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16447024 - 16446731
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |    
T  16447024 aagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatggcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagat 16446925  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16446924 taacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatct 16446825  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16446824 gtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 16446731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6098676 - 6098372
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  6098676 tttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaat 6098577  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6098576 tcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 6098477  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacg-----ataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||     ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  6098476 atcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatc 6098378  T
Q  296 attaat 301  Q
    ||||||    
T  6098377 attaat 6098372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10555360 - 10555062
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10555360 tttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 10555261  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||||||     
T  10555260 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcacaaaacgtaacactt--gactatcacataatatc 10555163  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaa-tatattattgatcatta 299  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  10555162 atcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaagcattactagatgaattacactattgatcatta 10555063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36695117 - 36694842
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36695117 tgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcag 36695018  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
      ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36695017 actaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 36694918  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36694917 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaagcatcactagatgaat 36694842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 9864180 - 9864463
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  9864180 tttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaat 9864279  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9864280 tcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 9864379  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaata 284  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9864380 atcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaata 9864463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 11727056 - 11727358
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11727056 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaat 11727155  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11727156 tcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacatgatatc 11727255  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11727256 aacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 11727354  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  11727355 tcag 11727358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 16222899 - 16223197
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||   |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16222899 tggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 16222998  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16222999 ccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatca 16223098  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16223099 actttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 16223197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27082992 - 27082714
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27082992 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtggcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 27082893  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27082892 caaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 27082793  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27082792 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 27082714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 12876148 - 12876424
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12876148 tgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcag 12876247  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacactt-aagactatcacataatatgatcaac 206  Q
     |||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12876248 attaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaac 12876347  T
Q  207 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  12876348 tctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaggcattactagatgaat 12876424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31934044 - 31933742
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  31934044 tttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaat 31933945  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  31933944 tcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatc 31933845  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31933844 atcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatgaat-tattattgatcattaa 31933746  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  31933745 tcag 31933742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 38644010 - 38644312
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  38644010 tttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagtggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaat 38644109  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| || ||||     
T  38644110 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatc 38644209  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38644210 agcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 38644308  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  38644309 tcag 38644312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5300097 - 5299802
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||| ||| | | |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5300097 tgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcag 5299998  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||| |    
T  5299997 attaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaatt 5299898  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  5299897 ttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcattaatcag 5299802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 34895006 - 34895296
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  34895006 tgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcag 34895105  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||     ||||||||||||||| ||||| |    
T  34895106 attaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 34895200  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  34895201 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaat-tactattgatcattaatcag 34895296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7891106 - 7890813
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||         ||||| |||  ||||||| | || |||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  7891106 ttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaat---------aacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaat 7891016  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  7891015 tcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatc 7890916  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7890915 atcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 7890817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 304
Target Start/End: Original strand, 33906316 - 33906546
Alignment:
Q  73 aaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagt 172  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | |||||    
T  33906316 aaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaaaaagt 33906415  T
Q  173 gtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtatt 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33906416 gtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 33906515  T
Q  273 actagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33906516 actagatgaat-tactattgatcattaatcag 33906546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 40862455 - 40862733
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaa-tgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||  | |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| | |||| ||||||||||||      
T  40862455 tggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttt 40862553  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    |||   |||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40862554 tcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatc 40862653  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    |||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40862654 aactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 40862733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1954086 - 1953845
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatc-atcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca 161  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1954086 agtggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca 1953987  T
Q  162 -ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 260  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1953986 tccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagat 1953887  T
Q  261 gttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
     ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1953886 tttgcaagcattattagatgaat-tactattgatcattaatca 1953845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 13307659 - 13307936
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  13307659 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcat 13307758  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  13307759 cagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaaca 13307858  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13307859 actctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaagcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132545
Alignment:
Q  94 catcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcaca 193  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgtt-taagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  194 taatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattga 293  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattga 4132553  T
Q  294 tcattaat 301  Q
    ||||||||    
T  4132552 tcattaat 4132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 465878 - 466166
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||    
T  465878 tggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcat 465977  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| |||| | ||    
T  465978 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacat-atatcagca 466067  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  466068 actctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 466166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39099238 - 39098978
Alignment:
Q  40 aagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatc 139  Q
    ||||||||||||| | |||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  39099238 aagtaacaccccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatc 39099139  T
Q  140 ataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaa 239  Q
     |||| |||| |||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  39099138 ttaccctgttttaagtgtaacatcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaa 39099039  T
Q  240 tagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39099038 tagtatatgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 39098978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35459805 - 35459567
Alignment:
Q  65 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 164  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||  |||||| ||    
T  35459805 tgacattaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcc 35459706  T
Q  165 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 264  Q
     ||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  35459705 cacagattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttg 35459606  T
Q  265 caagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35459605 caaacattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 35459567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1150263 - 1150090
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  1150263 tttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaac 1150164  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgt 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1150163 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 44869528 - 44869831
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaa--atgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  | ||| |  ||||| |||||| | | ||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  44869528 tttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgat-ccccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatca 44869626  T
Q  99 attcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 197  Q
    ||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||    ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44869627 atttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgtcccc-acaaagtgtaacacttaagactatcaaatgat 44869725  T
Q  198 atgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcat 297  Q
    || | ||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  44869726 atcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattgcaagcattactagatgaat-tactattgatcat 44869824  T
Q  298 taatcag 304  Q
    |||||||    
T  44869825 taatcag 44869831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41911079 - 41910895
Alignment:
Q  68 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 167  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  41911079 catcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 41910980  T
Q  168 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagt 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41910979 aaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaaga-tgcaacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 41362550 - 41362707
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |   |||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41362550 tttttggtgaagttaacactagca---taaaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtgacatcaaaagttcagacctcatagtatcatcaat 41362646  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca 161  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41362647 tcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1149909 - 1149776
Alignment:
Q  166 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 265  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1149909 acaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgc 1149814  T
Q  266 aagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1149813 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 1149776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 239
Target Start/End: Original strand, 43025824 - 43025972
Alignment:
Q  91 tatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatc 190  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43025824 tatcatcaattcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatc 43025923  T
Q  191 acataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaa 239  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||    
T  43025924 acataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259410
Alignment:
Q  119 tacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatg 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||| ||||    |||||  |||| | ||| |  |||||||||    
T  18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatg 18259328  T
Q  219 ttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  18259329 ttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattgttgatcagtaat 18259410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 304
Target Start/End: Original strand, 12587814 - 12587916
Alignment:
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12587814 atcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 12587912  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  12587913 tcag 12587916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34952013 - 34951913
Alignment:
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  34952013 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaat-tactattgatcattaatc 34951915  T
Q  303 ag 304  Q
    ||    
T  34951914 ag 34951913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34952185 - 34952028
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||  | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  34952185 tggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcat 34952086  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacac 162  Q
    ||  |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||    
T  34952085 caaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 304
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859268
Alignment:
Q  195 aatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgat 294  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaat-taatattgat 35859258  T
Q  295 cattaatcag 304  Q
    ||||||||||    
T  35859259 cattaatcag 35859268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24823394 - 24823250
Alignment:
Q  151 taagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgta 250  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||| | |||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24823394 taagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactct--------gttaaagatgccaacgataaaatagtacatgta 24823303  T
Q  251 agtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24823302 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgttcattaatcag 24823250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 33198061 - 33198135
Alignment:
Q  228 ccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33198061 ccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaat-tactattgatcattaatca 33198135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 245
Target Start/End: Original strand, 7998478 - 7998554
Alignment:
Q  169 aagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtac 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7998478 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtac 7998554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 34463706 - 34463785
Alignment:
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||| ||||||| ||||||    
T  34463706 atcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaat 34463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 123
Target Start/End: Original strand, 33197948 - 33198003
Alignment:
Q  68 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacac 123  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33197948 catcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 7920 - 8222
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7920 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 8019  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8020 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 8119  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8120 atcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 8218  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  8219 tcag 8222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7209005 - 7208704
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7209005 tttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaat 7208907  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7208906 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatt 7208807  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7208806 ttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaat-tattattgatcattaa 7208708  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  7208707 tcag 7208704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38528371 - 38528077
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38528371 tgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagtgacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcag 38528273  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38528272 attaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 38528173  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38528172 ctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 38528077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31705753 - 31705452
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  31705753 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaat 31705655  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31705654 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcacaaaatgtaacacttaagaccatcacataatatc 31705555  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31705554 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 31705456  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  31705455 tcag 31705452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 699190 - 699485
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  699190 tgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcag 699289  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  699290 attaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaact 699389  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  699390 atgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgattattaatcag 699485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17158172 - 17157871
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||| | | | |||||||||| |||    
T  17158172 ttttttgtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaat 17158074  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17158073 tcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatatt 17157974  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17157973 atcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tattattgatcattaa 17157875  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  17157874 tcag 17157871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22974224 - 22973922
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||   |||||| |||||||||     
T  22974224 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaac 22974125  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  22974124 tcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactattacataatatt 22974025  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22974024 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 22973926  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  22973925 tcag 22973922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31786788 - 31786486
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31786788 tttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaat 31786689  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  31786688 tcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatc 31786589  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31786588 atcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgttcattaa 31786490  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  31786489 tcag 31786486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 22980830 - 22981128
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||  | | ||||| |||||| ||||||   | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22980830 tggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcat 22980929  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22980930 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcataa 22981029  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22981030 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaatcattactagatgaat-tattattgatcattaatcag 22981128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5829930 - 5830227
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataa----cattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcat 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5829930 tttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcat 5830029  T
Q  97 caattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataa 196  Q
    |||||         |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5830030 caatt---------aacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataa 5830120  T
Q  197 tatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatca 296  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  5830121 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatca 5830219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 304
Target Start/End: Original strand, 35504427 - 35504700
Alignment:
Q  30 aaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaata 129  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35504427 aaaatgtaatgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaata 35504526  T
Q  130 taattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattcc 229  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  35504527 taattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttc 35504626  T
Q  230 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  35504627 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat-tactattgattattaatcag 35504700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22255214 - 22255517
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaa-atgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22255214 tttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaa 22255313  T
Q  100 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22255314 ttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccacacaaagtgtaacacttaaaactattacataatat 22255413  T
Q  200 gatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcatta 299  Q
     ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22255414 catcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagccttactagatgaat-tactattgatcatta 22255512  T
Q  300 atcag 304  Q
    |||||    
T  22255513 atcag 22255517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27318625 - 27318330
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  27318625 tggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagttctcacagtatcatcaattcat 27318526  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27318525 catattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 27318426  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  27318425 actctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtaca--taagtttaagatgttgcaaacattactatatgaat-tactattgatcattaatca 27318330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12910383 - 12910690
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagt-----gacatcaaaagttcagccctcatagtatca 95  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12910383 tttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcg 12910482  T
Q  96 tcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacata 195  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12910483 tcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacctaagactatcacata 12910582  T
Q  196 atatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatc 295  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  12910583 atatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgaac 12910681  T
Q  296 attaatcag 304  Q
    |||||||||    
T  12910682 attaatcag 12910690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 24886137 - 24886422
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24886137 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 24886236  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24886237 tcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatc 24886319  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24886320 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 24886418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35826625 - 35826327
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35826625 ttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagt 35826526  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| || ||||||| || ||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||     
T  35826525 tcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccacaaagtgtaacccttaagattatca--taatatc 35826429  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35826428 atcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 35826330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8742025 - 8741725
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattca 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8742025 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattca 8741926  T
Q  104 tcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacat-aatatgat 202  Q
    |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  8741925 tcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgag 8741826  T
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8741825 caactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgcaagcatcactagatgaa-atactattgatcattaatc 8741727  T
Q  303 ag 304  Q
    ||    
T  8741726 ag 8741725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 19119896 - 19120194
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  19119896 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcat 19119995  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  19119996 cagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 19120095  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19120096 actccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 19120194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 33908270 - 33908567
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  33908270 tggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattatt 33908369  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  33908370 cagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcgtca 33908469  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  33908470 actatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat-aat-tactattgatcattaatcag 33908567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35511612 - 35511322
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  35511612 tgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcag 35511513  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||     ||||||||||||||| ||||| |    
T  35511512 attaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaat 35511418  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  35511417 ctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactatatgaat-tactattgatcattaatcag 35511322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 27330343 - 27330639
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||  | |||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27330343 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcat 27330440  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  27330441 cagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagca 27330540  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27330541 actctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 27330639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23116357 - 23116090
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  23116357 tgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcag 23116258  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23116257 attaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaat 23116158  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattact 275  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23116157 ctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattact 23116090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30969462 - 30969164
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30969462 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 30969363  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  30969362 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 30969263  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||    
T  30969262 actttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatgagt-tactattaatcattaatcag 30969164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Original strand, 5837592 - 5837889
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5837592 tggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcat 5837691  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  5837692 catattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 5837791  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  5837792 actctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactgttgatcattaatca 5837889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14919670 - 14919408
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14919670 tttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 14919571  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14919570 tcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatc 14919471  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||| ||||||    
T  14919470 atcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattgcaa 14919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15992636 - 15992380
Alignment:
Q  47 accccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacctt 146  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||    
T  15992636 accccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctacctt 15992537  T
Q  147 gttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtaca 246  Q
    | | | || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15992536 gatttgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacc 15992437  T
Q  247 tgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15992436 ggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 15992380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 39572861 - 39573146
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  39572861 aagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagat 39572960  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||     
T  39572961 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactc- 39573059  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
           |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39573060 -------tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 39573146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 304
Target Start/End: Original strand, 32563189 - 32563475
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  32563189 tgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcag 32563288  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaact 207  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||         |||||| |||| | |||||    
T  32563289 attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaact 32563379  T
Q  208 ctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32563380 ctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagaattactagataaat-tattattgatcattaatcag 32563475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8436999 - 8437300
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |  ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  8436999 tttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac 8437098  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
     |||||| || |||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||| ||||    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8437099 -catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacacttaagattatcacataatatg 8437197  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8437198 atcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatgaat-tactattgatcattaa 8437296  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  8437297 tcag 8437300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 36866799 - 36867097
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  36866799 tggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcat 36866898  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36866899 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 36866998  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  36866999 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactggatgaat-tactattaatcatgaatcag 36867097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1429286 - 1429002
Alignment:
Q  2 ttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  1429286 ttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactggcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaatt 1429187  T
Q  102 catcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatga 201  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1429186 catcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatatca 1429104  T
Q  202 tcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1429103 taaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 1429005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43308793 - 43308500
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| | |||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  43308793 tttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacaccc-actgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaac 43308695  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||        ||||     
T  43308694 tcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacacttaagact--------atatc 43308603  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43308602 atcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaa 43308504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25501064 - 25500766
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |||  | | ||||||| || |||||||| | || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  25501064 tggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgccatcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcat 25500965  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||    
T  25500964 cagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagca 25500865  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  25500864 actttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaa-atactgttgatcattaatcag 25500766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 36860460 - 36860739
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  36860460 tggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcat 36860559  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttct-aagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatc 203  Q
    ||   |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36860560 catactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatc 36860659  T
Q  204 aactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36860660 aactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgaat 36860739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 40133422 - 40133720
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||  | |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  40133422 tggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatggcatcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcat 40133521  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40133522 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatca 40133621  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  40133622 actatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattactggatgaat-tactattaatcatgaatcag 40133720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 9200270 - 9200559
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  9200270 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcat 9200369  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||||         |||||| |||| | ||    
T  9200370 catattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagca 9200460  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9200461 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 9200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 304
Target Start/End: Original strand, 35933990 - 35934231
Alignment:
Q  63 agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataatttt-atcataccttgttctaagcgtaaca 161  Q
    |||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  35933990 agtggcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaaca 35934089  T
Q  162 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35934090 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatg 35934189  T
Q  262 ttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35934190 ttgcaagcattactagttgaat-tattattgatcattaatcag 35934231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 7693267 - 7693556
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7693267 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcat 7693366  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
     || |||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||| |||| | ||    
T  7693367 tagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatattagca 7693457  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  7693458 actctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgttcattaatcag 7693556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 22019669 - 22019958
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||    
T  22019669 tggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcat 22019768  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||         |||||| |||| | ||    
T  22019769 catattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaagtataacac---------tcacatgatatcagca 22019859  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22019860 actctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 22019958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956202
Alignment:
Q  90 gtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactat 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctacaaagcgtaacacttaagactat 13956316  T
Q  190 cacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatatta 289  Q
    || ||||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  13956315 catataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tacta 13956217  T
Q  290 ttgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||||||    
T  13956216 ttgatcattaatcag 13956202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 6824583 - 6824343
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagt--tcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttat 138  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6824583 agtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat 6824484  T
Q  139 cataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaa 238  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  6824483 cataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaa-gataaa 6824386  T
Q  239 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatga 281  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  6824385 acaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatga 6824343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21088907 - 21088626
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||  | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  21088907 tttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaat 21088809  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||   |||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21088808 tcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatc 21088709  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21088708 atcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaat 21088626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 26268111 - 26268332
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26268111 tggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcat 26268210  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  26268211 cagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagca 26268310  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagat 226  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  26268311 actatgtttgcatgttaaagat 26268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23954892 - 23954672
Alignment:
Q  41 agtaacaccccattgtttgtaa-agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatc 139  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23954892 agtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatc 23954793  T
Q  140 ataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaa 239  Q
     ||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23954792 ctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaa 23954694  T
Q  240 tagtacatgtaagtccaagatg 261  Q
    || ||  ||||||| |||||||    
T  23954693 taatatttgtaagtgcaagatg 23954672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5112455 - 5112248
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5112455 tttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaat 5112356  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  5112355 tcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accccacaaagtacaacacttaagactttcacataatatc 5112257  T
Q  201 atcaactct 209  Q
    |||||||||    
T  5112256 atcaactct 5112248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42343056
Alignment:
Q  10 aagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggt 109  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||  |   ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatttcccct--tagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
Q  110 taacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactct 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||| || | |||||||||||||||         ||||| |||| |||||||||    
T  42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcatcaactct 42342962  T
Q  210 atttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  42342963 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-taccattgatcattaatcag 42343056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15724523 - 15724822
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  15724523 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatgacatcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaat 15724620  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||  |||||| |  ||||||||| || |||||||||||| || ||||     
T  15724621 tcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccccaaagtgtatcaattaagactatcatatgatatc 15724720  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    | ||||| | ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  15724721 aacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaagcattactagatgaat-tactattaatcattaa 15724819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14409464 - 14409181
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| | ||  ||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14409464 tggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtggcatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcat 14409366  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||               || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  14409365 cagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaact--------------actcttaagactatcgcataatatcatca 14409280  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||    
T  14409279 actatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaat-tactattgatcattattcag 14409181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2888472 - 2888285
Alignment:
Q  116 gactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgc 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||  |||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||    
T  2888472 gactacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgc 2888373  T
Q  216 atgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2888372 atgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 2888285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669911
Alignment:
Q  119 tacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatg 218  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||         ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
Q  219 ttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25669827 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 25669911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 304
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889705
Alignment:
Q  182 aagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatga 281  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
Q  282 atatattattgatcattaatcag 304  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  25889684 at-tactattgatcattaatcag 25889705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
Q  7 gtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatca 106  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | |  | ||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||  |  | || ||||||||||||||||    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  107 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacact 180  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||  | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 8466782 - 8467058
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||  | | ||||||||| |  |||||| ||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  8466782 tggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacaccccctc-tttgtacagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcat 8466880  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| |                 || |||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  8466881 caaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgtttt-----------------aaatgtaacacttaagactatcatatgatatcacca 8466963  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaat 301  Q
    ||||| ||| ||| ||||||  |  |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466964 actctgtttacatattaaag-gtgtaacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaat 8467058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668804
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 25668785  T
Q  105 caggttaacaagactacac 123  Q
     || ||||||||| |||||    
T  25668786 tagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28416466 - 28416392
Alignment:
Q  228 ccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  28416466 ccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaat-tactattgatcattaatca 28416392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 22255608 - 22255660
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccat 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22255608 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccat 22255660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 105
Target Start/End: Original strand, 11898091 - 11898139
Alignment:
Q  57 ttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11898091 ttgtacagtgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 26317826 - 26317775
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccca 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  26317826 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacacccca 26317775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13956480 - 13956427
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgta 61  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| || ||||||||    
T  13956480 tgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgta 13956427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44291
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43990 tttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 44089  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44090 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatc 44188  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  44189 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaat-tactattgatcattaa 44287  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  44288 tcag 44291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 154797 - 154496
Alignment:
Q  1 tttttggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  154797 tttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggcataaaaagttcagtcctcatagtatcatcaat 154698  T
Q  101 tcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatg 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  154697 tcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaaagtgtaacacttaag-ctatcacataatatc 154599  T
Q  201 atcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaa 300  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  154598 atcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagcattactgaatgaat-tactattgatcattaa 154500  T
Q  301 tcag 304  Q
    ||||    
T  154499 tcag 154496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 408559 - 408279
Alignment:
Q  22 taacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactac 121  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  408559 taacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactac 408461  T
Q  122 acttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaactctatttgcatgtta 221  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  408460 acttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgtta 408361  T
Q  222 aagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  408360 aagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcag 408279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 171 - 463
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcat 104  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||  | |||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  171 tggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 270  T
Q  105 caggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatca 204  Q
    |||  |||||||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271 cagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 370  T
Q  205 actctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatcag 304  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  371 actctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattaatcatgaatcag 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 94528 - 94331
Alignment:
Q  8 tgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcag 107  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  | || |||| |||||||||||||| ||    
T  94528 tgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatcaattcatgag 94429  T
Q  108 gttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgatcaa 205  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  94428 attaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataatatcatcaa 94331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 94042 - 93951
Alignment:
Q  211 tttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatca 303  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  94042 tttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tgctattgatcattaatca 93951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 11944 - 12244
Alignment:
Q  5 tggtgaagttaacactataacattaaaaatgtaataagtaacacccc-attgtttgtaa-agtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattc 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11944 tggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtggtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattc 12043  T
Q  103 atcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatgat 202  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |     
T  12044 atcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcag 12143  T
Q  203 caactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaatatattattgatcattaatc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12144 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatc 12242  T
Q  303 ag 304  Q
    ||    
T  12243 ag 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267600
Alignment:
Q  16 acactataacattaaaaatgtaataagtaacaccccattgttt-gtaaagtgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaaca 114  Q
    |||||||| ||| |||||| || | ||||||| || | ||||| ||| |||| |||||||||||||| |   ||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
Q  115 agactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaa-gactatcacataatatgatcaactctattt 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgttt 267530  T
Q  214 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaat 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  267531 gcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctgcaagaattactagatgaat 267600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 100948 - 100994
Alignment:
Q  189 tcacataatatgatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgat 235  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100931
Alignment:
Q  112 acaagactacacttaatataattttatcataccttgtt 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtt 100931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University