View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19622_low_6 (Length: 385)

Name: NF19622_low_6
Description: NF19622
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19622_low_6
NF19622_low_6
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (1-186)||(34279711-34279896)
chr3 (4-176)||(42589829-42590001)
chr3 (2-176)||(54707220-54707394)
chr3 (3-176)||(25641644-25641817)
chr3 (2-182)||(51415966-51416146)
chr3 (5-176)||(38156632-38156803)
chr3 (2-186)||(37028720-37028903)
chr3 (3-179)||(47510937-47511113)
chr3 (4-176)||(54401186-54401358)
chr3 (4-176)||(55000178-55000350)
chr3 (6-182)||(31286787-31286963)
chr3 (4-176)||(41635800-41635972)
chr3 (5-176)||(24688114-24688285)
chr3 (4-174)||(45058882-45059052)
chr3 (2-151)||(17665549-17665698)
chr3 (1-176)||(51224038-51224212)
chr3 (6-171)||(40022075-40022240)
chr3 (4-176)||(39141125-39141298)
chr3 (2-182)||(49130575-49130755)
chr3 (33-181)||(52756062-52756214)
chr3 (177-295)||(31701059-31701177)
chr3 (4-181)||(44945930-44946101)
chr3 (4-176)||(47257792-47257975)
chr3 (3-179)||(22399095-22399281)
chr3 (4-176)||(47809596-47809780)
chr3 (1-178)||(24100279-24100466)
chr3 (2-176)||(40130959-40131144)
chr3 (3-180)||(28048388-28048576)
chr3 (3-176)||(49330035-49330219)
chr3 (1-177)||(37313395-37313582)
chr3 (5-176)||(27066978-27067160)
chr3 (4-179)||(40643799-40643985)
chr3 (3-177)||(44222827-44223012)
chr3 (1-176)||(32234398-32234583)
chr3 (1-176)||(37324537-37324723)
chr3 (2-177)||(41464349-41464535)
chr3 (2-176)||(29625827-29626012)
chr3 (61-176)||(48534007-48534122)
chr3 (3-176)||(42291840-42292024)
chr3 (3-176)||(43612047-43612231)
chr3 (4-176)||(2665999-2666182)
chr3 (6-182)||(38416718-38416905)
chr3 (4-176)||(40419834-40420017)
chr3 (1-176)||(7855114-7855300)
chr3 (1-176)||(40804510-40804696)
chr3 (7-176)||(41293319-41293498)
chr3 (1-176)||(51102378-51102564)
chr3 (4-176)||(7755307-7755489)
chr3 (2-176)||(43125828-43126012)
chr3 (2-188)||(55453232-55453429)
chr3 (3-176)||(48739233-48739417)
chr3 (2-175)||(51170034-51170218)
chr3 (4-178)||(55379984-55380158)
chr3 (4-176)||(20754393-20754576)
chr3 (4-176)||(44806683-44806866)
chr3 (1-176)||(25353550-25353725)
chr3 (4-176)||(39053393-39053576)
chr3 (4-176)||(53115446-53115618)
chr3 (6-175)||(43021715-43021896)
chr3 (4-182)||(52628953-52629141)
chr3 (5-182)||(39634566-39634753)
chr3 (6-179)||(46134357-46134541)
chr3 (4-176)||(35748311-35748494)
chr3 (5-185)||(51452742-51452932)
chr3 (2-174)||(54159000-54159173)
chr3 (2-174)||(48609719-48609903)
chr3 (4-97)||(24376572-24376665)
chr3 (6-175)||(51143818-51143987)
chr3 (4-97)||(53943677-53943770)
chr3 (4-178)||(51146213-51146398)
chr3 (2-176)||(52638839-52639024)
chr3 (2-176)||(30251501-30251675)
chr3 (1-97)||(5560117-5560218)
chr3 (10-174)||(43183917-43184092)
chr3 (1-93)||(21597231-21597323)
chr3 (2-177)||(41732525-41732711)
chr3 (6-176)||(18946904-18947085)
chr3 (5-143)||(53637841-53637990)
chr3 (3-172)||(35594119-35594299)
chr3 (28-176)||(46126010-46126168)
chr3 (6-153)||(52215077-52215235)
chr3 (5-93)||(53832578-53832666)
chr3 (6-93)||(41882074-41882161)
chr3 (2-174)||(48546842-48547014)
chr3 (4-97)||(36368938-36369031)
chr3 (4-97)||(48726077-48726170)
chr3 (1-93)||(28576195-28576287)
chr3 (1-96)||(2228015-2228110)
chr3 (4-175)||(42998790-42998960)
chr3 (6-176)||(43176738-43176908)
chr3 (2-177)||(50731913-50732087)
chr3 (2-177)||(50780769-50780943)
chr3 (4-97)||(47894910-47895003)
chr3 (9-159)||(46949379-46949538)
chr3 (16-98)||(47402827-47402909)
chr3 (4-81)||(52434138-52434216)
chr3 (4-97)||(41216454-41216547)
chr3 (1-101)||(8847733-8847832)
chr3 (6-178)||(40165653-40165824)
chr3 (5-81)||(48752085-48752161)
chr3 (6-176)||(177162-177332)
chr3 (199-260)||(31649142-31649203)
chr3 (124-176)||(40688431-40688483)
chr3 (1-72)||(37758925-37758996)
chr3 (3-57)||(37741433-37741487)
chr3 (101-176)||(33550467-33550542)
chr3 (316-366)||(31700984-31701038)
chr3 (4-49)||(51942543-51942588)
chr3 (116-176)||(5560025-5560085)
chr3 (116-176)||(53943588-53943647)
chr3 (101-176)||(52864597-52864671)
chr3 (36-97)||(41609098-41609159)
chr3 (107-174)||(53832486-53832553)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (4-179)||(41467629-41467804)
chr1 (2-176)||(2657300-2657474)
chr1 (1-186)||(42234836-42235020)
chr1 (6-176)||(4953053-4953223)
chr1 (5-175)||(6626025-6626195)
chr1 (2-170)||(26472185-26472353)
chr1 (1-176)||(29770666-29770841)
chr1 (3-176)||(4243490-4243663)
chr1 (5-170)||(34752320-34752485)
chr1 (1-176)||(33073207-33073382)
chr1 (7-177)||(41895163-41895333)
chr1 (2-176)||(10928064-10928238)
chr1 (7-186)||(32448650-32448820)
chr1 (5-166)||(13281572-13281733)
chr1 (3-183)||(30289903-30290083)
chr1 (6-170)||(44544052-44544216)
chr1 (1-178)||(3611132-3611320)
chr1 (1-176)||(44293455-44293630)
chr1 (3-179)||(45538151-45538338)
chr1 (1-164)||(35991611-35991773)
chr1 (3-176)||(31307999-31308183)
chr1 (5-151)||(46428278-46428424)
chr1 (2-177)||(25058685-25058871)
chr1 (4-184)||(51155582-51155761)
chr1 (2-176)||(44661967-44662152)
chr1 (1-178)||(26277173-26277361)
chr1 (3-176)||(33112818-33113001)
chr1 (5-179)||(21139409-21139594)
chr1 (1-178)||(26085396-26085583)
chr1 (4-176)||(17994951-17995134)
chr1 (1-177)||(47671582-47671769)
chr1 (1-176)||(6327548-6327733)
chr1 (4-178)||(25678257-25678442)
chr1 (2-177)||(27983602-27983772)
chr1 (2-176)||(46616546-46616731)
chr1 (6-184)||(47317316-47317505)
chr1 (1-170)||(4068689-4068869)
chr1 (3-172)||(26794302-26794482)
chr1 (4-177)||(46967040-46967224)
chr1 (1-176)||(48373500-48373677)
chr1 (4-176)||(5981169-5981352)
chr1 (1-177)||(24245024-24245211)
chr1 (7-179)||(43251713-43251896)
chr1 (1-176)||(38331859-38332045)
chr1 (2-177)||(51057068-51057254)
chr1 (2-176)||(23984752-23984937)
chr1 (48-154)||(24215806-24215912)
chr1 (3-176)||(41999813-41999997)
chr1 (4-176)||(23932509-23932692)
chr1 (4-176)||(24885500-24885683)
chr1 (4-176)||(31040708-31040891)
chr1 (5-177)||(47383731-47383914)
chr1 (3-176)||(35692663-35692848)
chr1 (6-176)||(38790197-38790378)
chr1 (4-181)||(49253970-49254158)
chr1 (4-176)||(37620192-37620375)
chr1 (4-176)||(39646567-39646750)
chr1 (5-176)||(33884088-33884270)
chr1 (5-176)||(33959982-33960164)
chr1 (4-179)||(36566329-36566515)
chr1 (3-175)||(3285400-3285582)
chr1 (4-178)||(35273595-35273780)
chr1 (6-176)||(50774218-50774399)
chr1 (2-176)||(5961267-5961441)
chr1 (6-177)||(7561527-7561712)
chr1 (4-97)||(23221019-23221112)
chr1 (4-176)||(2954854-2955026)
chr1 (6-173)||(28888582-28888760)
chr1 (6-176)||(36003131-36003315)
chr1 (4-176)||(42313361-42313548)
chr1 (5-97)||(51403097-51403189)
chr1 (2-180)||(33187337-33187509)
chr1 (5-182)||(26524883-26525071)
chr1 (4-177)||(49398987-49399171)
chr1 (4-176)||(5980067-5980250)
chr1 (5-177)||(46784423-46784606)
chr1 (4-176)||(26685855-26686027)
chr1 (4-160)||(27924674-27924830)
chr1 (1-176)||(47187101-47187287)
chr1 (6-97)||(25518815-25518906)
chr1 (3-145)||(31844374-31844527)
chr1 (2-185)||(39475774-39475956)
chr1 (40-177)||(2450529-2450677)
chr1 (7-97)||(31980025-31980115)
chr1 (4-176)||(38716247-38716419)
chr1 (7-158)||(42863867-42864029)
chr1 (8-178)||(1388476-1388646)
chr1 (2-96)||(24649802-24649896)
chr1 (40-178)||(38718165-38718309)
chr1 (2-145)||(2556886-2557031)
chr1 (3-179)||(10920198-10920374)
chr1 (1-102)||(13313248-13313351)
chr1 (3-177)||(52323936-52324111)
chr1 (7-176)||(48683330-48683499)
chr1 (4-64)||(4156188-4156248)
chr1 (4-176)||(52367882-52368054)
chr1 (4-95)||(39637899-39637986)
chr1 (101-176)||(4156501-4156576)
chr1 (98-177)||(13312530-13312609)
chr1 (46-178)||(51045594-51045737)
chr1 (116-176)||(4808767-4808827)
chr1 (7-155)||(45475864-45476014)
chr1 (3-57)||(10919313-10919367)
chr1 (330-366)||(40523267-40523303)
chr1 (7-46)||(12891401-12891440)
chr1 (1-37)||(36030736-36030772)
chr1 (117-176)||(31286504-31286563)
chr1 (2-36)||(23994845-23994879)
chr1 (116-145)||(39359503-39359532)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (4-176)||(35752034-35752206)
chr7 (3-182)||(36816839-36817018)
chr7 (4-177)||(43489218-43489391)
chr7 (4-176)||(48085858-48086030)
chr7 (2-176)||(46817421-46817595)
chr7 (3-176)||(7876328-7876501)
chr7 (4-176)||(24923024-24923196)
chr7 (6-176)||(37127939-37128109)
chr7 (3-176)||(24228540-24228713)
chr7 (4-167)||(26941541-26941704)
chr7 (4-182)||(47906752-47906931)
chr7 (4-176)||(21718117-21718288)
chr7 (4-176)||(29610635-29610807)
chr7 (6-181)||(45237528-45237703)
chr7 (4-177)||(498187-498360)
chr7 (6-179)||(26371051-26371224)
chr7 (4-174)||(39453484-39453647)
chr7 (4-179)||(2332019-2332194)
chr7 (2-168)||(25037516-25037682)
chr7 (3-176)||(44659843-44660015)
chr7 (4-176)||(39323616-39323779)
chr7 (1-174)||(35484633-35484807)
chr7 (5-179)||(29098752-29098922)
chr7 (10-175)||(46103127-46103291)
chr7 (3-176)||(46898016-46898189)
chr7 (3-142)||(32556640-32556779)
chr7 (2-177)||(25893916-25894102)
chr7 (2-180)||(5712166-5712355)
chr7 (2-182)||(22979641-22979832)
chr7 (4-176)||(35328069-35328252)
chr7 (2-178)||(47740329-47740516)
chr7 (6-176)||(33455098-33455259)
chr7 (6-178)||(23393049-23393232)
chr7 (4-176)||(26579717-26579900)
chr7 (3-175)||(33423276-33423459)
chr7 (4-176)||(40670563-40670746)
chr7 (4-176)||(47066977-47067160)
chr7 (2-176)||(45690097-45690282)
chr7 (2-176)||(46913107-46913294)
chr7 (3-176)||(17855427-17855611)
chr7 (1-176)||(33332786-33332971)
chr7 (3-176)||(33839715-33839899)
chr7 (3-176)||(35355887-35356071)
chr7 (2-178)||(33695819-33696006)
chr7 (1-185)||(48609668-48609863)
chr7 (3-178)||(27018115-27018301)
chr7 (3-178)||(33411259-33411445)
chr7 (1-176)||(2341661-2341848)
chr7 (4-184)||(31429467-31429658)
chr7 (6-159)||(41855061-41855214)
chr7 (6-106)||(39866667-39866767)
chr7 (6-176)||(49171362-49171543)
chr7 (4-177)||(10028488-10028674)
chr7 (4-176)||(31586848-31587031)
chr7 (4-176)||(37846016-37846199)
chr7 (6-177)||(20165813-20165995)
chr7 (1-176)||(44003370-44003545)
chr7 (3-176)||(45482657-45482841)
chr7 (2-182)||(19563445-19563636)
chr7 (25-176)||(36389377-36389539)
chr7 (4-175)||(33393328-33393499)
chr7 (4-176)||(35757020-35757203)
chr7 (6-176)||(31625706-31625886)
chr7 (3-175)||(33870244-33870424)
chr7 (3-177)||(7257380-7257554)
chr7 (1-177)||(45063356-45063541)
chr7 (7-167)||(15877553-15877724)
chr7 (21-176)||(5183825-5183991)
chr7 (4-176)||(35767481-35767657)
chr7 (4-176)||(10618298-10618474)
chr7 (2-174)||(15643948-15644120)
chr7 (3-97)||(43499484-43499578)
chr7 (6-183)||(47460765-47460942)
chr7 (3-150)||(16482809-16482956)
chr7 (3-97)||(33720126-33720220)
chr7 (6-96)||(41990949-41991039)
chr7 (6-97)||(29863017-29863108)
chr7 (29-176)||(29446863-29447020)
chr7 (3-67)||(35823289-35823353)
chr7 (5-175)||(45502817-45502987)
chr7 (4-69)||(30077043-30077108)
chr7 (4-73)||(35557730-35557799)
chr7 (16-102)||(38448522-38448608)
chr7 (44-176)||(37443602-37443734)
chr7 (22-96)||(44564356-44564430)
chr7 (52-101)||(26456157-26456206)
chr7 (116-177)||(28233935-28233996)
chr7 (101-176)||(30076527-30076602)
chr7 (101-176)||(44405456-44405531)
chr7 (5-74)||(7720605-7720674)
chr7 (116-183)||(41904328-41904395)
chr7 (118-176)||(39866762-39866820)
chr7 (3-75)||(21649479-21649552)
chr7 (117-178)||(43499609-43499670)
chr7 (2-41)||(42272149-42272188)
chr7 (101-162)||(41990872-41990933)
chr7 (116-177)||(42272185-42272245)
chr7 (116-152)||(44564461-44564497)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (2-176)||(45633779-45633953)
chr4 (1-176)||(37239090-37239265)
chr4 (6-176)||(20351842-20352012)
chr4 (4-177)||(15060288-15060461)
chr4 (5-176)||(5117438-5117609)
chr4 (4-183)||(34552318-34552497)
chr4 (1-174)||(54216309-54216482)
chr4 (4-184)||(31881306-31881486)
chr4 (4-176)||(52688348-52688520)
chr4 (2-177)||(22620590-22620765)
chr4 (4-178)||(9997929-9998103)
chr4 (4-178)||(33289702-33289875)
chr4 (4-176)||(4486581-4486753)
chr4 (4-176)||(46708741-46708913)
chr4 (1-177)||(49014094-49014270)
chr4 (4-176)||(27873550-27873720)
chr4 (4-176)||(52461365-52461534)
chr4 (6-174)||(33557944-33558112)
chr4 (3-178)||(54216734-54216909)
chr4 (5-176)||(54715035-54715206)
chr4 (6-176)||(43890929-43891099)
chr4 (2-182)||(53461810-53462001)
chr4 (3-178)||(23437590-23437776)
chr4 (5-176)||(34276547-34276729)
chr4 (5-176)||(47811906-47812077)
chr4 (1-178)||(26091256-26091444)
chr4 (1-186)||(31532125-31532321)
chr4 (1-178)||(41632005-41632192)
chr4 (42-180)||(51981475-51981613)
chr4 (4-183)||(38591667-38591853)
chr4 (4-178)||(56022996-56023181)
chr4 (3-176)||(39077543-39077727)
chr4 (2-179)||(54574937-54575125)
chr4 (1-177)||(44984757-44984944)
chr4 (2-177)||(21366608-21366794)
chr4 (3-176)||(237475-237659)
chr4 (5-182)||(6285307-6285495)
chr4 (4-177)||(9798464-9798648)
chr4 (4-178)||(407753-407936)
chr4 (1-110)||(3293089-3293198)
chr4 (5-189)||(18462000-18462195)
chr4 (4-177)||(41949381-41949567)
chr4 (4-176)||(43471695-43471878)
chr4 (4-176)||(55056259-55056442)
chr4 (1-105)||(11972200-11972304)
chr4 (2-177)||(29478357-29478543)
chr4 (2-182)||(34835174-34835354)
chr4 (2-176)||(42085204-42085389)
chr4 (4-176)||(42765842-42766024)
chr4 (2-176)||(47344653-47344838)
chr4 (4-178)||(53854428-53854612)
chr4 (6-175)||(6019929-6020109)
chr4 (3-176)||(14017376-14017558)
chr4 (8-177)||(31972335-31972515)
chr4 (4-177)||(41560327-41560511)
chr4 (1-178)||(51363003-51363190)
chr4 (3-175)||(32366661-32366844)
chr4 (6-177)||(42222292-42222474)
chr4 (4-174)||(397401-397582)
chr4 (2-176)||(2826682-2826866)
chr4 (2-176)||(3170623-3170808)
chr4 (4-178)||(55519826-55520011)
chr4 (3-176)||(19387688-19387872)
chr4 (3-181)||(49881054-49881247)
chr4 (4-177)||(54607961-54608145)
chr4 (3-176)||(55776043-55776226)
chr4 (3-176)||(55840221-55840404)
chr4 (4-176)||(3692210-3692393)
chr4 (2-174)||(41702461-41702644)
chr4 (4-182)||(29777251-29777440)
chr4 (6-172)||(50534632-50534809)
chr4 (4-181)||(27373075-27373262)
chr4 (3-176)||(31914196-31914379)
chr4 (6-182)||(22618508-22618693)
chr4 (5-176)||(146429-146611)
chr4 (4-176)||(31070074-31070256)
chr4 (2-176)||(50233997-50234182)
chr4 (4-174)||(50457812-50457993)
chr4 (4-176)||(2243457-2243640)
chr4 (4-178)||(48313556-48313739)
chr4 (4-176)||(38547601-38547773)
chr4 (2-177)||(42033172-42033358)
chr4 (2-177)||(54086407-54086591)
chr4 (6-96)||(22468861-22468951)
chr4 (3-176)||(45797477-45797661)
chr4 (4-176)||(1932762-1932945)
chr4 (5-177)||(35446506-35446688)
chr4 (1-185)||(47662093-47662288)
chr4 (4-172)||(27398607-27398775)
chr4 (1-97)||(33897585-33897680)
chr4 (6-176)||(14335101-14335271)
chr4 (4-177)||(23609086-23609270)
chr4 (6-176)||(27580120-27580290)
chr4 (2-96)||(54805709-54805803)
chr4 (1-172)||(50536628-50536810)
chr4 (5-176)||(6371249-6371420)
chr4 (4-176)||(1662261-1662431)
chr4 (4-97)||(39587869-39587962)
chr4 (6-159)||(48259528-48259691)
chr4 (33-186)||(27872607-27872760)
chr4 (3-96)||(54424980-54425073)
chr4 (6-89)||(42557583-42557666)
chr4 (7-176)||(48657826-48658000)
chr4 (6-97)||(53834144-53834235)
chr4 (4-93)||(43231502-43231590)
chr4 (4-172)||(46720024-46720195)
chr4 (6-93)||(48654815-48654902)
chr4 (4-178)||(573802-573976)
chr4 (93-175)||(33048980-33049062)
chr4 (116-186)||(3291795-3291865)
chr4 (101-179)||(35595794-35595872)
chr4 (3-56)||(17555617-17555670)
chr4 (4-176)||(36532830-36533003)
chr4 (6-75)||(49057969-49058038)
chr4 (45-176)||(52728307-52728448)
chr4 (1-102)||(51951678-51951779)
chr4 (16-90)||(18206608-18206682)
chr4 (101-185)||(42509403-42509487)
chr4 (116-176)||(54805614-54805674)
chr4 (101-176)||(48259704-48259778)
chr4 (116-182)||(42558307-42558373)
chr4 (118-176)||(48654944-48655002)
chr4 (96-175)||(35344890-35344968)
chr4 (104-150)||(22468796-22468842)
chr4 (15-68)||(16738568-16738621)
chr4 (4-93)||(43478059-43478147)
chr4 (116-176)||(54425104-54425163)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (4-177)||(28641291-28641464)
chr2 (6-177)||(35158049-35158220)
chr2 (4-184)||(29687039-29687219)
chr2 (4-178)||(4258488-4258661)
chr2 (6-176)||(39301197-39301367)
chr2 (5-174)||(145281-145450)
chr2 (5-187)||(19428415-19428598)
chr2 (2-177)||(12333496-12333669)
chr2 (2-176)||(13543624-13543798)
chr2 (4-178)||(43898969-43899142)
chr2 (3-176)||(27764863-27765035)
chr2 (2-176)||(2688729-2688903)
chr2 (4-182)||(12730059-12730237)
chr2 (1-175)||(39103042-39103216)
chr2 (2-171)||(28566703-28566872)
chr2 (6-182)||(34249265-34249441)
chr2 (4-177)||(43356097-43356267)
chr2 (1-186)||(2000329-2000512)
chr2 (3-184)||(21734892-21735073)
chr2 (6-176)||(27331298-27331472)
chr2 (6-174)||(3266296-3266455)
chr2 (2-177)||(40544084-40544250)
chr2 (37-182)||(3711664-3711809)
chr2 (4-176)||(40635216-40635399)
chr2 (5-159)||(8056625-8056779)
chr2 (3-179)||(13815215-13815402)
chr2 (1-177)||(26710340-26710527)
chr2 (4-177)||(746464-746648)
chr2 (2-187)||(27400399-27400595)
chr2 (5-177)||(5726128-5726311)
chr2 (4-176)||(11184970-11185153)
chr2 (2-177)||(23901775-23901961)
chr2 (5-176)||(34518366-34518548)
chr2 (2-176)||(6594458-6594643)
chr2 (2-176)||(17600832-17601017)
chr2 (4-178)||(45370988-45371173)
chr2 (4-176)||(4034590-4034773)
chr2 (4-176)||(27024413-27024596)
chr2 (5-176)||(38997100-38997282)
chr2 (4-176)||(2324889-2325072)
chr2 (4-176)||(27651034-27651217)
chr2 (4-176)||(40037141-40037323)
chr2 (5-176)||(14660445-14660627)
chr2 (4-170)||(6430471-6430648)
chr2 (3-173)||(10424592-10424773)
chr2 (4-176)||(1091951-1092134)
chr2 (4-176)||(10244582-10244765)
chr2 (6-178)||(32327361-32327544)
chr2 (3-182)||(14697531-14697721)
chr2 (1-185)||(40735459-40735654)
chr2 (5-176)||(7892688-7892870)
chr2 (5-179)||(32948445-32948629)
chr2 (6-176)||(33427647-33427828)
chr2 (3-176)||(37255337-37255516)
chr2 (20-176)||(32856436-32856603)
chr2 (6-177)||(4609626-4609808)
chr2 (4-176)||(44481826-44481998)
chr2 (1-170)||(15925075-15925255)
chr2 (6-178)||(2914136-2914319)
chr2 (2-142)||(32608376-32608527)
chr2 (16-176)||(11159632-11159802)
chr2 (4-97)||(42899913-42900006)
chr2 (1-81)||(12814609-12814689)
chr2 (3-177)||(37620866-37621054)
chr2 (4-171)||(35126778-35126945)
chr2 (1-142)||(41172454-41172605)
chr2 (6-142)||(12842103-12842250)
chr2 (2-97)||(8433006-8433101)
chr2 (6-176)||(9444683-9444874)
chr2 (57-173)||(25294886-25295013)
chr2 (101-181)||(447628-447708)
chr2 (2-94)||(30545817-30545909)
chr2 (3-49)||(28019959-28020005)
chr2 (5-73)||(10176558-10176626)
chr2 (27-75)||(38985378-38985426)
chr2 (101-150)||(12827168-12827217)
chr2 (107-150)||(8432942-8432985)
chr2 (1-43)||(1229630-1229672)
chr2 (2-48)||(36216305-36216351)
chr2 (101-161)||(1229733-1229793)
chr2 (4-48)||(8264532-8264576)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-177)||(28948844-28949019)
chr6 (4-176)||(15965432-15965604)
chr6 (2-169)||(13329378-13329545)
chr6 (6-176)||(4487528-4487698)
chr6 (3-176)||(1398551-1398724)
chr6 (6-176)||(3291009-3291179)
chr6 (5-177)||(3786749-3786921)
chr6 (1-186)||(22551051-22551247)
chr6 (4-181)||(26377199-26377387)
chr6 (4-176)||(5882505-5882688)
chr6 (8-179)||(18101492-18101674)
chr6 (5-179)||(959901-960086)
chr6 (3-180)||(28947085-28947273)
chr6 (4-175)||(19281056-19281238)
chr6 (3-172)||(14891383-14891563)
chr6 (3-179)||(599890-600077)
chr6 (2-182)||(8615237-8615428)
chr6 (4-176)||(24168090-24168273)
chr6 (3-181)||(19415528-19415717)
chr6 (6-174)||(2892189-2892368)
chr6 (2-176)||(1970708-1970893)
chr6 (2-167)||(16703363-16703539)
chr6 (3-176)||(7167580-7167753)
chr6 (4-176)||(34527862-34528045)
chr6 (2-176)||(7393586-7393771)
chr6 (18-176)||(11988974-11989143)
chr6 (5-186)||(24224060-24224253)
chr6 (4-158)||(7345130-7345295)
chr6 (3-176)||(2593852-2594036)
chr6 (6-182)||(30743442-30743629)
chr6 (6-182)||(33452566-33452753)
chr6 (75-177)||(18661804-18661906)
chr6 (18-176)||(22341788-22341959)
chr6 (4-176)||(10507908-10508091)
chr6 (4-97)||(30467693-30467786)
chr6 (58-176)||(24913096-24913216)
chr6 (1-97)||(5294891-5294987)
chr6 (1-97)||(5299443-5299539)
chr6 (11-126)||(1939554-1939669)
chr6 (3-87)||(929657-929741)
chr6 (37-176)||(23261929-23262079)
chr6 (2-101)||(375799-375898)
chr6 (1-61)||(11743070-11743130)
chr6 (15-101)||(13844846-13844932)
chr6 (136-172)||(18661771-18661807)
chr6 (117-176)||(34262342-34262401)
chr6 (116-176)||(5294801-5294861)
chr6 (116-176)||(5299353-5299413)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (2-177)||(27503376-27503551)
chr5 (1-177)||(19295726-19295902)
chr5 (6-176)||(38015514-38015684)
chr5 (4-176)||(23195248-23195420)
chr5 (4-175)||(9424593-9424764)
chr5 (6-176)||(9374502-9374672)
chr5 (3-176)||(5497271-5497444)
chr5 (3-176)||(13957668-13957841)
chr5 (2-167)||(42658671-42658836)
chr5 (5-176)||(6973063-6973234)
chr5 (4-176)||(36365445-36365617)
chr5 (6-177)||(14971979-14972150)
chr5 (4-176)||(33617584-33617756)
chr5 (32-177)||(3656567-3656712)
chr5 (4-173)||(6206883-6207052)
chr5 (3-176)||(42247791-42247955)
chr5 (1-187)||(24253378-24253575)
chr5 (4-176)||(35626037-35626220)
chr5 (39-180)||(38492647-38492787)
chr5 (4-176)||(5184971-5185154)
chr5 (2-174)||(6901796-6901979)
chr5 (4-178)||(40886026-40886210)
chr5 (1-176)||(43262183-43262369)
chr5 (2-176)||(43326379-43326564)
chr5 (3-176)||(3466681-3466865)
chr5 (2-186)||(739695-739889)
chr5 (2-176)||(27938894-27939080)
chr5 (6-175)||(15398483-15398663)
chr5 (1-178)||(27501053-27501241)
chr5 (16-177)||(31938908-31939080)
chr5 (6-178)||(2484290-2484473)
chr5 (10-175)||(33623940-33624105)
chr5 (4-138)||(40632498-40632634)
chr5 (1-176)||(25831517-25831702)
chr5 (3-184)||(7722047-7722240)
chr5 (6-180)||(18479664-18479849)
chr5 (4-176)||(39932578-39932761)
chr5 (8-176)||(9171035-9171193)
chr5 (5-176)||(15683791-15683973)
chr5 (5-176)||(12648797-12648979)
chr5 (3-97)||(5137713-5137807)
chr5 (1-178)||(40278856-40279043)
chr5 (1-98)||(12558107-12558204)
chr5 (4-176)||(2585461-2585633)
chr5 (2-153)||(4149691-4149843)
chr5 (4-179)||(24167781-24167956)
chr5 (4-175)||(27278474-27278660)
chr5 (3-176)||(28424795-28424977)
chr5 (31-174)||(36948492-36948633)
chr5 (1-96)||(40110230-40110324)
chr5 (1-176)||(890902-891087)
chr5 (3-181)||(1402500-1402678)
chr5 (3-176)||(38637910-38638083)
chr5 (7-178)||(13504740-13504922)
chr5 (2-176)||(36472285-36472458)
chr5 (16-176)||(38756487-38756659)
chr5 (3-179)||(18327170-18327346)
chr5 (16-162)||(5120036-5120181)
chr5 (6-176)||(40686900-40687069)
chr5 (31-182)||(612751-612900)
chr5 (16-176)||(27390608-27390768)
chr5 (42-176)||(29789295-29789440)
chr5 (5-182)||(763723-763911)
chr5 (6-75)||(9527121-9527190)
chr5 (47-178)||(34451292-34451434)
chr5 (29-176)||(3940336-3940478)
chr5 (6-179)||(31293986-31294170)
chr5 (16-74)||(15300975-15301033)
chr5 (4-65)||(27584384-27584447)
chr5 (9-65)||(28756082-28756138)
chr5 (38-97)||(20207095-20207154)
chr5 (1-52)||(28392291-28392342)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (4-179)||(31940314-31940488)
chr8 (4-179)||(9713688-9713860)
chr8 (1-177)||(117328-117504)
chr8 (4-179)||(41843252-41843427)
chr8 (3-177)||(2379138-2379312)
chr8 (5-179)||(40458769-40458943)
chr8 (7-171)||(4975412-4975576)
chr8 (4-176)||(9509400-9509572)
chr8 (4-176)||(4447295-4447467)
chr8 (1-176)||(10378305-10378480)
chr8 (17-170)||(40649837-40649990)
chr8 (1-177)||(33622466-33622640)
chr8 (6-176)||(3211207-3211376)
chr8 (1-176)||(5946043-5946229)
chr8 (10-170)||(32373733-32373892)
chr8 (2-176)||(32984077-32984262)
chr8 (4-177)||(24079900-24080084)
chr8 (1-121)||(27243194-27243314)
chr8 (1-121)||(27254769-27254889)
chr8 (3-176)||(45236565-45236749)
chr8 (4-176)||(6365985-6366168)
chr8 (4-175)||(37301326-37301508)
chr8 (5-176)||(2275913-2276094)
chr8 (3-176)||(41862218-41862402)
chr8 (4-176)||(37956420-37956603)
chr8 (2-178)||(41653892-41654079)
chr8 (5-176)||(9303574-9303756)
chr8 (1-176)||(13356120-13356306)
chr8 (5-153)||(38631652-38631800)
chr8 (5-176)||(9734255-9734435)
chr8 (6-179)||(10646124-10646308)
chr8 (4-176)||(43328706-43328889)
chr8 (1-176)||(17718722-17718908)
chr8 (5-176)||(40435153-40435335)
chr8 (1-178)||(37419936-37420124)
chr8 (4-176)||(33730641-33730824)
chr8 (6-172)||(31830959-31831136)
chr8 (3-176)||(25185897-25186081)
chr8 (4-176)||(33981663-33981846)
chr8 (6-159)||(2714550-2714714)
chr8 (3-176)||(3490399-3490572)
chr8 (10-174)||(32114254-32114429)
chr8 (4-176)||(35628776-35628959)
chr8 (5-97)||(39915902-39915994)
chr8 (3-153)||(29048426-29048587)
chr8 (1-176)||(33896843-33897017)
chr8 (4-176)||(41231945-41232128)
chr8 (5-176)||(9013684-9013865)
chr8 (4-176)||(13760646-13760831)
chr8 (6-101)||(42701376-42701471)
chr8 (2-175)||(41639911-41640095)
chr8 (3-175)||(22878389-22878572)
chr8 (6-159)||(44088460-44088624)
chr8 (2-176)||(25248036-25248215)
chr8 (5-159)||(45258510-45258675)
chr8 (77-177)||(41425428-41425527)
chr8 (5-97)||(45066682-45066774)
chr8 (1-176)||(26196317-26196491)
chr8 (104-188)||(31336204-31336288)
chr8 (3-98)||(31148968-31149063)
chr8 (26-97)||(41981454-41981525)
chr8 (101-176)||(12033037-12033112)
chr8 (101-179)||(41981575-41981653)
chr8 (54-177)||(3904126-3904259)
chr8 (11-72)||(164728-164789)
chr8 (4-41)||(12032951-12032988)
chr8 (6-178)||(39901574-39901741)
chr8 (116-162)||(42701303-42701349)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (4-177)||(7089-7263)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (4-176)||(39556-39739)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (4-182)||(13756-13945)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (4-176)||(75244-75427)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (4-145)||(32560-32712)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (2-177)||(11132-11317)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (7-177)||(1871-2052)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (4-182)||(2426-2615)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (4-176)||(278005-278190)
scaffold0007 (17-176)||(176666-176836)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-177)||(14740-14916)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (4-142)||(17905-18043)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-176)||(20477-20648)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (1-177)||(98-273)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (4-97)||(18944-19037)
scaffold0198 (116-176)||(18854-18914)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (2-177)||(4553-4729)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (2-177)||(3389-3565)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (6-176)||(3089-3261)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (116-177)||(4595-4656)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (16-90)||(19228-19302)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34279896 - 34279711
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34279896 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 34279797  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279796 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccataaaataaa 34279711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 42589829 - 42590001
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42589829 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 42589928  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42589929 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54707394 - 54707220
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54707394 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 54707295  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54707294 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 25641644 - 25641817
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25641644 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatat 25641743  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25641744 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 51415966 - 51416146
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51415966 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata 51416065  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51416066 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaaaa 51416146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38156803 - 38156632
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38156803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgt 38156704  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38156703 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 37028720 - 37028903
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37028720 aaggttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaata 37028819  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37028820 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca-aaaataaa 37028903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47511113 - 47510937
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47511113 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 47511014  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47511013 gtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 47510937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 54401186 - 54401358
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54401186 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 54401285  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  54401286 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacc 54401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55000350 - 55000178
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  55000350 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatg 55000251  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55000250 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 55000178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31286963 - 31286787
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31286963 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 31286864  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31286863 cttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcaccttaaaa 31286787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41635972 - 41635800
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41635972 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 41635873  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41635872 tgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 24688114 - 24688285
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24688114 gttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgt 24688213  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688214 gtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 45058882 - 45059052
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45058882 ggttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 45058981  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    || |||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45058982 tgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17665698 - 17665549
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17665698 aaggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 17665599  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 151  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665598 tatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51224212 - 51224038
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51224212 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaac-aataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 51224114  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51224113 atgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 171
Target Start/End: Original strand, 40022075 - 40022240
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40022075 ttttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 40022174  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 171  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40022175 cttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39141298 - 39141125
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga--ata 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  39141298 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatata 39141199  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  39141198 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacc 39141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 49130575 - 49130755
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  49130575 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata 49130674  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || |||||    
T  49130675 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctccttaaaa 49130755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756062
Alignment:
Q  33 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatgg----ttaatgtgtattgg 128  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaattaatgtgtattgg 52756115  T
Q  129 ttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52756114 tttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 52756062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31701177 - 31701059
Alignment:
Q  177 ataaaataaagaagtgctgtatttaatcattgttccaagtcatcaactgtttggctaccaatgaatgctgagtttctcagcttgtttttaacttgtatgg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31701177 ataaaataaagaagtgctgtatttaatcattgttccaagtcatcaactgtttggctaccaatgaatgttgagtttctcagcttgttttttacttgtatgg 31701078  T
Q  277 tcaaggaaaaatttaattc 295  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  31701077 tcaaggaaaaaattaattc 31701059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44946101 - 44945930
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      |||||||    
T  44946101 ggttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata------gaatatg 44946008  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44946007 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcaccttaaa 44945930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 47257792 - 47257975
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat--- 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||       
T  47257792 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 47257891  T
Q  101 --------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47257892 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 22399095 - 22399281
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  22399095 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaac 22399194  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
         || ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22399195 cacttaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 22399281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47809780 - 47809596
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  47809780 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47809681  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47809680 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47809596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 24100279 - 24100466
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  24100279 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgata 24100378  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
           || || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24100379 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 24100466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40131144 - 40130959
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||        
T  40131144 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggata 40131045  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  40131044 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28048576 - 28048388
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  28048576 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 28048477  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28048476 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataa 28048388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 49330035 - 49330219
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  49330035 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 49330134  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49330135 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 37313395 - 37313582
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37313395 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaat 37313494  T
Q  101 -----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
               |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  37313495 atcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacca 37313582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27067160 - 27066978
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat---- 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||        
T  27067160 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 27067061  T
Q  101 -------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27067060 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 40643799 - 40643985
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||          
T  40643799 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatc 40643898  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40643899 atttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 40643985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 44222827 - 44223012
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||      
T  44222827 aggttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaatac 44222926  T
Q  101 ---------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
             ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44222927 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32234583 - 32234398
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  32234583 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 32234484  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || || || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32234483 accacttaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 37324537 - 37324723
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  37324537 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtat 37324636  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || || | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37324637 accacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 41464349 - 41464535
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||        
T  41464349 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggata 41464448  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  41464449 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacca 41464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29626012 - 29625827
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  29626012 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 29625913  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| || |||||    
T  29625912 ccacttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacc 29625827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534007
Alignment:
Q  61 aatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggg 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatggg 48534023  T
Q  161 tagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||||||| ||||    
T  48534022 tagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 42291840 - 42292024
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------- 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||           
T  42291840 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 42291939  T
Q  96 ----tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        |||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  42291940 cacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43612231 - 43612047
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||         
T  43612231 aggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggatac 43612132  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43612131 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 2665999 - 2666182
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-- 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||      
T  2665999 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2666098  T
Q  102 ---------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2666099 acttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38416905 - 38416718
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  38416905 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38416806  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
       || ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38416805 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 38416718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 40419834 - 40420017
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  40419834 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40419933  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40419934 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7855300 - 7855114
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca----- 95  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||         
T  7855300 taaggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggat 7855201  T
Q  96 ------tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          | || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7855200 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40804696 - 40804510
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||       
T  40804696 taagattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggat 40804597  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || |||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40804596 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293319
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat------ 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||          
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  101 ----atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  41293398 taaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51102564 - 51102378
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  51102564 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 51102465  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  51102464 atcacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7755489 - 7755307
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||          
T  7755489 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggatacc 7755390  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7755389 acttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 43125828 - 43126012
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        
T  43125828 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 43125927  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  43125928 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 55453429 - 55453232
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        
T  55453429 aaggttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 55453330  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaaga 188  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  55453329 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcactttaaaaaaaaga 55453232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48739417 - 48739233
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||         
T  48739417 aggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 48739318  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48739317 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 51170218 - 51170034
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  51170218 aaggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 51170119  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
           || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  51170118 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 55379984 - 55380158
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  55379984 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 55380083  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
       | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  55380084 acctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 55380158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20754576 - 20754393
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||          
T  20754576 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatc 20754477  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  20754476 acttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 44806683 - 44806866
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||          
T  44806683 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggatacc 44806782  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||| |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44806783 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25353550 - 25353725
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  25353550 taaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggat 25353649  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |     | | | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25353650 accacctaaaaaggtgaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 39053393 - 39053576
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||          
T  39053393 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatacc 39053492  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||    
T  39053493 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 53115446 - 53115618
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  53115446 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 53115545  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      || | | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  53115546 acttaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacc 53115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021896
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggatcaagatagttcatgaat---- 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||||        
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  101 -------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
           ||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 52628953 - 52629141
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  52628953 ggtttattctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 52629052  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
         || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  52629053 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccaaaaaa 52629141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39634753 - 39634566
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||           
T  39634753 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggatacca 39634655  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
        || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39634654 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 39634566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134541
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccata 46134541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35748494 - 35748311
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  35748494 ggttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35748395  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  35748394 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 51452932 - 51452742
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||           
T  51452932 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 51452833  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
        || ||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||    
T  51452832 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacctttaaataa 51452742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54159173 - 54159000
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||    
T  54159173 aaggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagata 54159074  T
Q  102 tgtgtttatatggt--taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
        || | |  ||  | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54159073 ccacttaaaaatgtgcttatgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 48609719 - 48609903
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaa-attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||       
T  48609719 aaggttttttttaagattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggat 48609818  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48609819 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 24376572 - 24376665
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24376572 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 24376665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 51143818 - 51143987
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||        
T  51143818 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
     | | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51143918 ctaaaaaggtgaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53943770 - 53943677
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53943770 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 53943677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51146398 - 51146213
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||          
T  51146398 ggttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 51146299  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || || || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51146298 acttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccaccat 51146213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 52638839 - 52639024
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||        
T  52638839 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggata 52638938  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| || | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  52638939 ccacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacc 52639024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30251675 - 30251501
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  30251675 aaggttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 30251576  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         | | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  30251575 ccacctaaaaaggtgaatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5560218 - 5560117
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatga-----aaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5560218 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttca 5560119  T
Q  96 tg 97  Q
    ||    
T  5560118 tg 5560117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  10 ttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------a 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||           |    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  99 atatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    | ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21597323 - 21597231
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21597323 taaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtt 21597231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 41732525 - 41732711
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  41732525 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggata 41732624  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || || |||||||||||    
T  41732625 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacca 41732711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 18946904 - 18947085
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||            
T  18946904 ttttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccag 18947003  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18947004 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Original strand, 53637841 - 53637990
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||           
T  53637841 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggatacca 53637940  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacc 143  Q
        || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53637941 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 35594119 - 35594299
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||         
T  35594119 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatat 35594218  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
          || || || |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  35594219 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126168
Alignment:
Q  28 gaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttatatggtt 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||| |||| ||| |    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  117 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215235
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||            
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 153  Q
       || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattctt 52215235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 53832666 - 53832578
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  53832666 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtt 53832578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882074
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 41882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48547014 - 48546842
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||    
T  48547014 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaa-atagttcatggata 48546917  T
Q  102 tgtgtttatatggt--taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
        || | |  ||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  48546916 ccacttaaaaatgtgcttatgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 36368938 - 36369031
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  36368938 ggttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 36369031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 48726170 - 48726077
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  48726170 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatg 48726077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28576287 - 28576195
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28576287 taaggttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtt 28576195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2228110 - 2228015
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  2228110 taaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcat 2228015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42998960 - 42998790
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  42998960 ggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 42998862  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
       | | | ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||| | ||||||||||    
T  42998861 acctaaaaaggtgaatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||        
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | | | |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtggatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50732087 - 50731913
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  50732087 aaggtttttt-tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50731989  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         | | | ||| |||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  50731988 ccatctaaaacggtgaatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 50780769 - 50780943
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  50780769 aaggtttttt-tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50780867  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         | | | ||| |||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  50780868 ccatctaaaacggtgaatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 50780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 47895003 - 47894910
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47895003 ggttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 47894910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  9 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 97  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||               
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  98 aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47402909 - 47402827
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47402909 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcatga 47402827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 52434138 - 52434216
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 81  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  52434138 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 41216454 - 41216547
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  41216454 ggttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatg 41216547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 8847832 - 8847733
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8847832 taaggtttttt-taaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaat 8847734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165824
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||        
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
     | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcaccat 40165824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Original strand, 48752085 - 48752161
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 81  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||    
T  48752085 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 177162 - 177332
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||        
T  177162 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaac 177261  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | | | ||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||| || ||||  || |||||||||||||    
T  177262 ctaaaaaggtgaatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 177332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31649203 - 31649142
Alignment:
Q  199 ttaatcattgttccaagtcatcaactgtttggctaccaatgaatgctgagtttctcagcttg 260  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31649203 ttaatcattgttccaagtaatcaaatgtttggctaccaatgaatgttgagtttctcaacttg 31649142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  124 attggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 37758925 - 37758996
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 72  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  37758925 taaggttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaattt 37758996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 37741433 - 37741487
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 57  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37741433 aggttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33550542 - 33550467
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  33550542 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31701038 - 31700984
Alignment:
Q  316 acaattatgtaaatgtgtttaaatagtgtgacca----aatagttgtgaccatac 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  31701038 acaattatgtaaatgtgtttaaatagtgtgaccaaattaatagttgtgaccatac 31700984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 51942588 - 51942543
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 49  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51942588 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5560085 - 5560025
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5560085 taatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53943647 - 53943588
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  53943647 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 52864597 - 52864671
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||| | | |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52864597 atgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609159
Alignment:
Q  36 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatg 41609159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53832553 - 53832486
Alignment:
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  53832553 ttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41467804 - 41467629
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41467804 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 41467705  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41467704 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 41467629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 2657300 - 2657474
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2657300 aaggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 2657399  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2657400 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42234836 - 42235020
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42234836 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 42234935  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42234936 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaaagtaaa 42235020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953223
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 4953152  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4953153 cttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6626195 - 6626025
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6626195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgt 6626096  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6626095 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26472353 - 26472185
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26472353 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 26472254  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26472253 tgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29770666 - 29770841
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29770666 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 29770765  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29770766 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4243663 - 4243490
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4243663 aggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat 4243564  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4243563 gtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34752485 - 34752320
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34752485 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaatatgt 34752386  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34752385 gcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 33073207 - 33073382
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33073207 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat 33073306  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33073307 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895163
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaatatgtgc 41895234  T
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41895233 ttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 10928064 - 10928238
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10928064 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 10928163  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  10928164 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448820
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgc 32448749  T
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32448750 tt---------aagtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcgccaaaaattaaa 32448820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13281733 - 13281572
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13281733 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgt 13281634  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcct 166  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  13281633 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattattttatgggtagcct 13281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30290083 - 30289903
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  30290083 aggtgttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaatat 30289984  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaat 183  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  30289983 gtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcaccataaaat 30289903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544052
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgta 44544117  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
     |||| |   |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544116 cttatgtaactaatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 44544052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3611132 - 3611320
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  3611132 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 3611231  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3611232 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 3611320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44293630 - 44293455
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44293630 taaggtttttttaaaattacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 44293531  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||  |||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44293530 atgtacttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 45538151 - 45538338
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  45538151 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 45538250  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45538251 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 45538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35991773 - 35991611
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35991773 taaggtttttt-taaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 35991675  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagc 164  Q
    || || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35991674 atatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatggatagc 35991611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 31307999 - 31308183
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  31307999 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 31308098  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31308099 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 46428424 - 46428278
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46428424 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatgaatatgt 46428325  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  46428324 gtttatatggctaatgtgtattggttagagtaaattatccaccattc 46428278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 25058685 - 25058871
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||        
T  25058685 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggata 25058784  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25058785 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25058871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 51155761 - 51155582
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  51155761 ggttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatgaatatg 51155662  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  51155661 tgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcaccttaaaata 51155582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 44661967 - 44662152
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------ 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||          
T  44661967 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 44662066  T
Q  96 -----tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44662067 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 26277173 - 26277361
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  26277173 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 26277272  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26277273 accacttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26277361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33113001 - 33112818
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  33113001 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33112902  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33112901 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21139594 - 21139409
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  21139594 gttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 21139495  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  21139494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccata 21139409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26085583 - 26085396
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26085583 taaggtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaat 26085485  T
Q  101 -----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
               ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26085484 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17995134 - 17994951
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||          
T  17995134 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 17995035  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17995034 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 47671582 - 47671769
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||       
T  47671582 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggat 47671681  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47671682 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 47671769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6327733 - 6327548
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  6327733 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 6327634  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6327633 accacttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25678442 - 25678257
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  25678442 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 25678343  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  25678342 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccat 25678257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27983772 - 27983602
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     ||||     | || |    
T  27983772 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-----gataccatttaaaaa 27983678  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27983677 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27983602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 46616546 - 46616731
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  46616546 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 46616645  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
              |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  46616646 tcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317505
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
       || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcaccataaaata 47317505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4068869 - 4068689
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  4068869 taaggctttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 4068770  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4068769 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 26794302 - 26794482
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||         
T  26794302 aggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatac 26794401  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
          || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  26794402 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46967224 - 46967040
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  46967224 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 46967125  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || ||||| |||| ||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46967124 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 46967040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 48373500 - 48373677
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  48373500 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggat 48373599  T
Q  101 atgtgtttatatggt--taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |    || | |  ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  48373600 accacttaaaaatgtgcttatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 5981169 - 5981352
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  5981169 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5981268  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5981269 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24245211 - 24245024
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  24245211 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 24245112  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
            || ||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  24245111 accacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacca 24245024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251896
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||             
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  98 --aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
      || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatcata 43251896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38332045 - 38331859
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38332045 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaat 38331946  T
Q  101 -----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
               || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  38331945 atcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 51057068 - 51057254
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||        
T  51057068 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggata 51057167  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51057168 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 51057254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 23984752 - 23984937
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  23984752 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 23984851  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23984852 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 154
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215912
Alignment:
Q  48 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatatatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 24215905  T
Q  148 attcttt 154  Q
    |||||||    
T  24215906 attcttt 24215912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 41999813 - 41999997
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||         
T  41999813 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 41999912  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  41999913 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23932692 - 23932509
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  23932692 ggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacacc 23932593  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23932592 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 24885500 - 24885683
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  24885500 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24885599  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  24885600 acttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 31040708 - 31040891
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  31040708 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 31040807  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || || || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  31040808 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47383914 - 47383731
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  47383914 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47383815  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        || ||||| |||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47383814 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacca 47383731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35692848 - 35692663
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  35692848 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 35692749  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  35692748 ccgcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790197
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||            
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49254158 - 49253970
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||          
T  49254158 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 49254059  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
         || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| || ||||| ||||    
T  49254058 acttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcaccttaaa 49253970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37620375 - 37620192
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  37620375 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37620276  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  37620275 acttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 39646567 - 39646750
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||          
T  39646567 ggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggatacc 39646666  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39646667 acttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 33884088 - 33884270
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca--------- 95  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||             
T  33884088 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33884187  T
Q  96 --tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  33884188 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33960164 - 33959982
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca--------- 95  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||             
T  33960164 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33960065  T
Q  96 --tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  33960064 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 36566329 - 36566515
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  36566329 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36566428  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
         || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36566429 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 36566515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 3285400 - 3285582
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  3285400 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 3285499  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  3285500 cacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 35273595 - 35273780
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  35273595 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35273694  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35273695 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 35273780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774399
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || || || |||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5961441 - 5961267
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  5961441 aaggttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggata 5961342  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         | | | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  5961341 ccacctaaaaaggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7561712 - 7561527
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaa------------gatagtt 93  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||             ||||||    
T  7561712 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagtt 7561613  T
Q  94 catgaatatgtgttta--tatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||||||||||| |||  |  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7561612 catgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23221112 - 23221019
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  23221112 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 23221019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 2954854 - 2955026
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  2954854 ggttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggatacc 2954953  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      || | | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  2954954 acttaaaaaggtgattgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||            
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 173  Q
       || |||||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003315
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||            
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatca---ttctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42313548 - 42313361
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgg----gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaa 99  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||    
T  42313548 ggttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaa 42313449  T
Q  100 t-----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |           |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  42313448 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 51403189 - 51403097
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  51403189 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 51403097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Original strand, 33187337 - 33187509
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||    
T  33187337 aaggttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagata 33187436  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
        || |       ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33187437 ccacttaa------aaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataa 33187509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26525071 - 26524883
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt----------- 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||               
T  26525071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagatacca 26524972  T
Q  94 catgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    | | || || || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  26524971 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcaccttaaaa 26524883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49399171 - 49398987
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||| |||          
T  49399171 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggatacc 49399072  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49399071 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacca 49398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 5980067 - 5980250
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-- 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  5980067 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacc 5980166  T
Q  102 ---------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             |  | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||||| |||||||    
T  5980167 acttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 46784423 - 46784606
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | |||||||||||||           
T  46784423 gttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggatacca 46784522  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  46784523 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacca 46784606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 26685855 - 26686027
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||      
T  26685855 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 26685954  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | |  || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  26685955 acctaaaaaagtgaatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27924830 - 27924674
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||      
T  27924830 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacc 27924731  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggg 160  Q
       | | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27924730 acctaaaaaggtgaatggttattggttggggtaaattacccaccattttttcatggg 27924674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 47187101 - 47187287
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||       
T  47187101 taaggttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggat 47187200  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47187201 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518906
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 25518906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 31844374 - 31844527
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||         
T  31844374 aggttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatac 31844473  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 145  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844474 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31844527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39475956 - 39475774
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  39475956 aaggttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggata 39475858  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
         | | |  || || || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39475857 ccacctaaaaatgtgaacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccaaaaaataa 39475774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 177
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450677
Alignment:
Q  40 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatatggttaatgtgtattgg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||           ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  129 ttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2450677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31980025
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatg 31980025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38716419 - 38716247
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||      
T  38716419 ggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacc 38716320  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  38716319 acctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864029
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 97  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||             
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  98 --aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 158  Q
      || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388646
Alignment:
Q  8 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtt 107  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||     |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  108 tatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
     | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  1388576 aaaaaggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 1388646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24649896 - 24649802
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24649896 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38718309 - 38718165
Alignment:
Q  40 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat------gaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggg 133  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  38718309 atttatccaccgaccaataaaaatgaacaatttatttgtggcatcaagatagttcataaatatgaatatgtgcttatgtggctaatgtatatcggttggg 38718210  T
Q  134 -gtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38718209 agtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccat 38718165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2557031 - 2556886
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2557031 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaata 2556932  T
Q  102 tgtgtt-tatatg-gttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 145  Q
        ||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2556931 ccacttaaaaatgtgtttatgtgtattggttggggtaaattaccca 2556886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 10920198 - 10920374
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  10920198 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 10920297  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
        | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  10920298 cacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcaccata 10920374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13313351 - 13313248
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaatta--cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga 98  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||     
T  13313351 taaggttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatgg 13313252  T
Q  99 atat 102  Q
    ||||    
T  13313251 atat 13313248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 52323936 - 52324111
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||     
T  52323936 aggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaatac 52324035  T
Q  103 gtgtttatatggt-taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        | | | |||  |||||  |||| |||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  52324036 cacctaaaaaggtgaaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacca 52324111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48683499 - 48683330
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgt 106  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||         
T  48683499 ttttcctaatttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacc 48683400  T
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | | | | | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  48683399 taaaaagatgaatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4156248 - 4156188
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 64  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156248 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 52367882 - 52368054
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||      
T  52367882 ggttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 52367981  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | ||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  52367982 acctaaaaaggtgaatgtttattgatttagataaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtcacc 52368054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 39637899 - 39637986
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca 95  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  39637899 ggttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 4156501 - 4156576
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  4156501 atgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13312609 - 13312530
Alignment:
Q  98 aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13312609 aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 13312530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045594
Alignment:
Q  46 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttgggg 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||           |||| |||| ||| |||||||||||| || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  135 taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcaccat 51045594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 4808767 - 4808827
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4808767 taatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475864
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat------ 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||          
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccact 45475923  T
Q  101 -----atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttc 155  Q
         ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45475922 tacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccaccattctttc 45475864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10919367 - 10919313
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 57  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10919367 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40523303 - 40523267
Alignment:
Q  330 gtgtttaaatagtgtgaccaaatagttgtgaccatac 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523303 gtgtttaaatagtgtgaccaaatagttgtgaccatac 40523267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 12891401 - 12891440
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacc 46  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12891401 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacc 12891440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 36030772 - 36030736
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggg 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36030772 taaggttttttctaaattacctttaaagaatggtggg 36030736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31286563 - 31286504
Alignment:
Q  117 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  31286563 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Original strand, 23994845 - 23994879
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgg 36  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23994845 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgg 23994879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 145
Target Start/End: Original strand, 39359503 - 39359532
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattaccca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359503 taatgtgtattggttggggtaaattaccca 39359532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35752206 - 35752034
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35752206 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 35752107  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35752106 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36817018 - 36816839
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36817018 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 36816919  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36816918 gtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccataaaa 36816839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 43489218 - 43489391
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43489218 ggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 43489317  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43489318 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 43489391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 48085858 - 48086030
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48085858 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 48085957  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48085958 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacc 48086030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46817595 - 46817421
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46817595 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 46817496  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46817495 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7876501 - 7876328
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7876501 aggttgtttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 7876402  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7876401 gtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24923196 - 24923024
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24923196 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatg 24923097  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24923096 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128109
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatgtg 37128038  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37128039 cttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 24228540 - 24228713
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24228540 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 24228639  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24228640 atgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26941704 - 26941541
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26941704 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 26941605  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 167  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26941604 tgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47906931 - 47906752
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906931 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 47906832  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggt-aaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    || |||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  47906831 tgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccaccttaaaa 47906752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 21718117 - 21718288
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21718117 ggttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 21718216  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21718217 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 29610635 - 29610807
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29610635 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatg 29610734  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29610735 tgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237528
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaatatgtg 45237604  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45237603 cttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcaccttaaa 45237528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 498360 - 498187
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  498360 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 498261  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    || |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  498260 tgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacca 498187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 26371051 - 26371224
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26371051 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtg 26371150  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
     |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26371151 cttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccata 26371224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39453647 - 39453484
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||    
T  39453647 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagt-------tatg 39453555  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39453554 tgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 2332019 - 2332194
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2332019 ggttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatg 2332118  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  2332119 tgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcaccata 2332194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25037682 - 25037516
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25037682 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 25037583  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctag 168  Q
    |||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25037582 tgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 44659843 - 44660015
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44659843 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatat 44659941  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44659942 atgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 39323616 - 39323779
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39323616 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 39323715  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39323716 --------tggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 35484633 - 35484807
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35484633 taaggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaa 35484732  T
Q  100 tatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    |||||| |||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35484733 tatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 29098752 - 29098922
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||| |    
T  29098752 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttc----atatat 29098847  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29098848 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttaccata 29098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  10 ttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgttta 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatatgtgctta 46103225  T
Q  110 tatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46103226 tgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46898189 - 46898016
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  46898189 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatat 46898090  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  46898089 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32556779 - 32556640
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32556779 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatgaatat 32556680  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac 142  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32556679 gtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25894102 - 25893916
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  25894102 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 25894003  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25894002 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Original strand, 5712166 - 5712355
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||        
T  5712166 aaggttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggata 5712265  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
           || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5712266 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccataa 5712355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22979832 - 22979641
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  22979832 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 22979733  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
           || || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22979732 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccataaaa 22979641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35328252 - 35328069
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  35328252 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35328153  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35328152 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 47740516 - 47740329
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  47740516 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 47740417  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
              ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  47740416 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 47740329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455259
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 33455197  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     ||         ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33455198 ctt---------atgtgtattggtttgggtaaattgtccatcattctttcataggtagcctagttgtcacc 33455259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23393232 - 23393049
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  23393232 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23393133  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
       || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23393132 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23393049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26579900 - 26579717
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  26579900 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtatacc 26579801  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  26579800 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33423459 - 33423276
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  33423459 aggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33423360  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33423359 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 40670563 - 40670746
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||          
T  40670563 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 40670662  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  40670663 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47067160 - 47066977
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  47067160 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47067061  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47067060 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45690282 - 45690097
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  45690282 aagggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45690183  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45690182 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 46913107 - 46913294
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  46913107 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 46913206  T
Q  98 ---------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46913207 ccacttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 17855427 - 17855611
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  17855427 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 17855526  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17855527 tacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 33332786 - 33332971
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  33332786 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgata 33332885  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || || || ||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33332886 ccacttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33839899 - 33839715
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  33839899 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33839800  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  33839799 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 35355887 - 35356071
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------- 95  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||           
T  35355887 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 35355986  T
Q  96 ----tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35355987 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33696006 - 33695819
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  33696006 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33695907  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33695906 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 33695819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48609863 - 48609668
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||       
T  48609863 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtat 48609764  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48609763 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataaaataa 48609668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 27018115 - 27018301
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||         
T  27018115 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatac 27018214  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27018215 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 27018301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 33411259 - 33411445
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  33411259 aggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33411358  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
          || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  33411359 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcaccat 33411445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2341848 - 2341661
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  2341848 taaggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 2341749  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcat-gggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2341748 acaacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31429658 - 31429467
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||          
T  31429658 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggatacc 31429559  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
         || |||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31429558 acttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccatataata 31429467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855214
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcataaatatatg 41855160  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  41855161 cttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Original strand, 39866667 - 39866767
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39866667 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 39866766  T
Q  106 t 106  Q
    |    
T  39866767 t 39866767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171362
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || || || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 10028488 - 10028674
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||          
T  10028488 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 10028587  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggg--tagcctagttgtcacca 177  Q
         || |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  10028588 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacca 10028674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 31586848 - 31587031
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||          
T  31586848 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 31586947  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  31586948 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37846199 - 37846016
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||          
T  37846199 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggatacc 37846100  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37846099 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165813
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
       || ||||  |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44003545 - 44003370
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||    
T  44003545 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggat 44003446  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |     | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  44003445 accacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 45482657 - 45482841
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  45482657 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 45482756  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || || || |||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  45482757 cacttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 19563445 - 19563636
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  19563445 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 19563544  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
              ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  19563545 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcaccaaaaaa 19563636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389539
Alignment:
Q  25 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-----------tgaatatgtgtttatatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||           | || ||||| |||| ||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  114 gttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 33393328 - 33393499
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  33393328 ggttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 33393427  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
       | | | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33393428 acctaaaaaggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35757203 - 35757020
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  35757203 ggttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgatacca 35757104  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35757103 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 31625706 - 31625886
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  31625706 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 31625805  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || ||||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31625806 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 33870244 - 33870424
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-- 100  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||      
T  33870244 aggttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 33870343  T
Q  101 ---------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
             ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||    
T  33870344 catttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 7257380 - 7257554
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  7257380 aggttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatac 7257479  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        | | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  7257480 cacctaaaaaggtgaatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacca 7257554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45063541 - 45063356
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||       
T  45063541 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggat 45063442  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45063441 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacca 45063356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877724
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  98 --aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 167  Q
      || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183825
Alignment:
Q  21 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgttta 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||| |||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  110 tatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 35767481 - 35767657
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-- 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       | |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||      
T  35767481 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35767573  T
Q  102 ---------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  35767574 acttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 10618298 - 10618474
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg---gatcaag-atagttcatgaa 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||   | ||| | |||   | | ||    
T  10618298 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggatagttcatgaataccacttaaa 10618397  T
Q  100 tatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10618398 aatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15644120 - 15643948
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15644120 aaggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggata 15644021  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
         | | | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  15644020 ccacctaaaaaggtgaatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 43499484 - 43499578
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43499484 aggttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 43499578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47460942 - 47460765
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| || ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||        
T  47460942 ttttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaat 183  Q
     | | | | | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47460842 ctaaaaagatgaatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccattaaat 47460765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16482956 - 16482809
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||     
T  16482956 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatac 16482857  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 150  Q
        | | | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16482856 cacctaaaaaggtgaatgtttattagttggggtaaattacccagcatt 16482809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33720220 - 33720126
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||    
T  33720220 aggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatg 33720126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41991039 - 41990949
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41991039 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 41990949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863108
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatg 29863108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  29 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttatatggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||           || || || |||| ||  ||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  118 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 35823289 - 35823353
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823289 aggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45502987 - 45502817
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||     | || || |    
T  45502987 gttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagataccatttaaaaatat 45502888  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    | |||| | | |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| || | ||||||||||    
T  45502887 gcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30077108 - 30077043
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 69  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077108 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 35557730 - 35557799
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 73  Q
    |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557730 ggttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 35557799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448522
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatat 38448522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443602
Alignment:
Q  44 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacc 143  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||     | | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacc 37443635  T
Q  144 catcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37443634 caccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564430
Alignment:
Q  22 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcat 44564430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 101
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456206
Alignment:
Q  52 accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata 26456206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28233996 - 28233935
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28233996 taatgtgtattggttggggtaaactacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 28233935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30076602 - 30076527
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  30076602 atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 44405456 - 44405531
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  44405456 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttccatgggtattctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7720674 - 7720605
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttat 74  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7720674 gttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttat 7720605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 183
Target Start/End: Original strand, 41904328 - 41904395
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  41904328 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtatcctagttgtcaccttaaaat 41904395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866820
Alignment:
Q  118 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattgccacc 39866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21649552 - 21649479
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaa-tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 75  Q
    ||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21649552 aggttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttatt 21649479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 178
Target Start/End: Original strand, 43499609 - 43499670
Alignment:
Q  117 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  43499609 aatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcaccat 43499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 41
Target Start/End: Original strand, 42272149 - 42272188
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaat 41  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42272149 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41990933 - 41990872
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 162  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||    
T  41990933 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta 41990872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Original strand, 42272185 - 42272245
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  42272185 taatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacca 42272245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 152
Target Start/End: Original strand, 44564461 - 44564497
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44564461 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45633953 - 45633779
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45633953 aaggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 45633854  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45633853 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37239265 - 37239090
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37239265 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 37239166  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37239165 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351842
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 20351913  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20351912 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15060461 - 15060288
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15060461 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 15060362  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    || |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060361 tgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 15060288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5117609 - 5117438
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5117609 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgt 5117510  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  5117509 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 34552318 - 34552497
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  34552318 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaatatg 34552417  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaat 183  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34552418 tgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaaaaat 34552497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 54216309 - 54216482
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54216309 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 54216408  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54216409 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31881486 - 31881306
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31881486 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 31881387  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31881386 tgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttaaaata 31881306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 52688348 - 52688520
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  52688348 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatata 52688447  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52688448 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 22620590 - 22620765
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22620590 aaggttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 22620689  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22620690 tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacca 22620765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9998103 - 9997929
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9998103 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatatg 9998004  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9998003 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 9997929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 33289702 - 33289875
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33289702 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatacg 33289801  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33289802 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcaccat 33289875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4486753 - 4486581
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4486753 ggttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatatg 4486654  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  4486653 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacc 4486581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46708913 - 46708741
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46708913 ggttatttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 46708814  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46708813 tgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 49014094 - 49014270
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49014094 taaggttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 49014193  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||  |||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49014194 atgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27873720 - 27873550
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27873720 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatg 27873621  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27873620 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttt--tgggtagcctagttgtcacc 27873550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 52461365 - 52461534
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52461365 ggttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 52461461  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52461462 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33558112 - 33557944
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  33558112 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatgta 33558013  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  33558012 tttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtca 33557944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 54216909 - 54216734
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  54216909 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatat 54216810  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  54216809 gtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcaccat 54216734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 54715035 - 54715206
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  54715035 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaatatgt 54715134  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  54715135 gcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891099
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaatatgtg 43891028  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  43891029 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 53462001 - 53461810
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  53462001 aaggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 53461902  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53461901 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 53461810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Original strand, 23437590 - 23437776
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  23437590 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 23437689  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
          || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23437690 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 23437776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 34276547 - 34276729
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  34276547 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 34276646  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34276647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 47811906 - 47812077
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||    
T  47811906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaatatgt 47812005  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||| ||||||||    
T  47812006 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26091444 - 26091256
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  26091444 taaggttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 26091345  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26091344 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 26091256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31532321 - 31532125
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  31532321 taaggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 31532222  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31532221 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccataatataaa 31532125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41632192 - 41632005
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  41632192 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggat 41632094  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41632093 atcgcttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcaccat 41632005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981475
Alignment:
Q  42 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaatta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 51981514  T
Q  142 cccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  51981513 ctcatcattctttcattggtagactagttatcaccataa 51981475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 38591667 - 38591853
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat--- 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||       
T  38591667 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38591766  T
Q  101 ----atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaat 183  Q
        ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38591767 attaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaat 38591853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 56023181 - 56022996
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  56023181 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacc 56023082  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  56023081 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccat 56022996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 39077543 - 39077727
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||         
T  39077543 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatac 39077642  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39077643 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54575125 - 54574937
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||        
T  54575125 aaggttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggata 54575026  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
           || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  54575025 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 54574937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 44984757 - 44984944
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  44984757 taagggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 44984856  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44984857 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 44984944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21366794 - 21366608
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  21366794 aagggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 21366695  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21366694 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21366608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 237475 - 237659
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  237475 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataa 237574  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  237575 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 6285307 - 6285495
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||           
T  6285307 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggatacca 6285406  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
        || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6285407 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtccccataaaa 6285495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 9798464 - 9798648
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  9798464 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 9798563  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9798564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9798648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 407753 - 407936
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  407753 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataca 407852  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  407853 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 407936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3293198 - 3293089
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3293198 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 3293099  T
Q  101 atgtgtttat 110  Q
    ||||| ||||    
T  3293098 atgtgcttat 3293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18462195 - 18462000
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  18462195 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 18462096  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaagaa 189  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  18462095 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccatttaataaagaa 18462000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 41949381 - 41949567
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  41949381 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41949480  T
Q  98 -----aatatgtgtttata--tggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41949481 acttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacca 41949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43471878 - 43471695
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||          
T  43471878 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggatacc 43471779  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  43471778 acttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55056442 - 55056259
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  55056442 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataca 55056343  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55056342 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11972304 - 11972200
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11972304 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 11972205  T
Q  101 atgtg 105  Q
    |||||    
T  11972204 atgtg 11972200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 29478357 - 29478543
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  29478357 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 29478456  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  29478457 ccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 29478543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 34835174 - 34835354
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  34835174 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 34835273  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
         | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34835274 ccatctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 34835354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 42085204 - 42085389
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  42085204 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 42085303  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42085304 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42766024 - 42765842
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  42766024 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgatacca 42765925  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42765924 cttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 47344653 - 47344838
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  47344653 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 47344752  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47344753 ccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53854612 - 53854428
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  53854612 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 53854513  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  53854512 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccat 53854428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020109
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
       || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14017558 - 14017376
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata- 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||     
T  14017558 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14017459  T
Q  102 --------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14017458 cacttaagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972335
Alignment:
Q  8 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat------- 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||           
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  101 ----atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacca 31972335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 41560327 - 41560511
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  41560327 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 41560426  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  41560427 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacca 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 51363003 - 51363190
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||       
T  51363003 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggat 51363102  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  51363103 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccat 51363190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32366844 - 32366661
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  32366844 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 32366745  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32366744 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 42222292 - 42222474
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca---------- 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||              
T  42222292 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccac 42222391  T
Q  96 -tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
     | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42222392 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacca 42222474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Original strand, 397401 - 397582
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  397401 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 397500  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
         || |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  397501 acttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2826866 - 2826682
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  2826866 aaggttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 2826767  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2826766 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 3170623 - 3170808
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  3170623 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 3170722  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
              ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  3170723 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 55519826 - 55520011
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  55519826 ggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggatacc 55519925  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55519926 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 55520011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19387872 - 19387688
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||         
T  19387872 aggttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 19387773  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19387772 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49881247 - 49881054
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||         
T  49881247 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 49881148  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt----ggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
          || |||||||||| ||| |||||||||||||||    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  49881147 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcaccataaa 49881054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 54607961 - 54608145
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  54607961 ggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacc 54608060  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  54608061 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacca 54608145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 55776043 - 55776226
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  55776043 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatac 55776141  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  55776142 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 55840221 - 55840404
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  55840221 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatac 55840319  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  55840320 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3692393 - 3692210
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt---------- 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||              
T  3692393 ggttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgatacc 3692294  T
Q  94 -catgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | | || |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3692293 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41702644 - 41702461
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||        
T  41702644 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 41702545  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41702544 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29777440 - 29777251
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt---------- 93  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||              
T  29777440 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggatacc 29777341  T
Q  94 -catgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
     | | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||    
T  29777340 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttaaaa 29777251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 50534632 - 50534809
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||            
T  50534632 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 50534731  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
       || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  50534732 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 27373075 - 27373262
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 95  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  27373075 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 27373174  T
Q  96 ---tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
       | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  27373175 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcaccataaa 27373262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 31914196 - 31914379
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  31914196 aggttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 31914295  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31914296 cacttaaaaatgtgcttat-gggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22618693 - 22618508
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  22618693 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 22618595  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
       || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22618594 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 22618508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 146611 - 146429
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  146611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 146512  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||  ||||||||||||    
T  146511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31070256 - 31070074
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||          
T  31070256 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatgatacca 31070157  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| | || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31070156 cttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 50233997 - 50234182
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||        
T  50233997 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggata 50234096  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||    
T  50234097 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50457993 - 50457812
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  50457993 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 50457894  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
         || ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50457893 acttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 2243457 - 2243640
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||          
T  2243457 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggatacc 2243556  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2243557 acttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 48313556 - 48313739
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  48313556 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacc 48313654  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
        || || || |||| | | |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  48313655 acttaaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccat 48313739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38547773 - 38547601
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  38547773 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 38547674  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  38547673 acctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 42033172 - 42033358
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||        
T  42033172 aaggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggata 42033271  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || |||||||||| | | |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42033272 ccacttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 42033358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 54086407 - 54086591
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  54086407 aaggttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 54086504  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54086505 ccgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 54086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468861
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcat 22468861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 45797477 - 45797661
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  45797477 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 45797576  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  45797577 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 45797661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 1932762 - 1932945
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||            
T  1932762 ggttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagatacc 1932861  T
Q  96 ---tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  1932862 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 35446506 - 35446688
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||           
T  35446506 gttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaattta-ccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatca 35446604  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  35446605 cttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgttacca 35446688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47662288 - 47662093
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||| |||||| |||       
T  47662288 taaggttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggat 47662189  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
            || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  47662188 accacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccttaatataa 47662093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27398775 - 27398607
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  27398775 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 27398676  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
      || | |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27398675 acttaaaaatgtaaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33897680 - 33897585
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  33897680 taaggtttttt-tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 33897585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335101
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||        
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | | | ||| ||||   |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14335171 ctaaaaaggtgaatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacc 14335101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 23609086 - 23609270
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 95  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  23609086 ggttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggatacc 23609185  T
Q  96 ---tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
       | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23609186 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacca 23609270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580290
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||        
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | | | | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  27580220 ctaaaaagatgaatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 54805803 - 54805709
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  54805803 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcat 54805709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50536810 - 50536628
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||       
T  50536810 taaggttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggat 50536711  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
            || || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  50536710 accacttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6371420 - 6371249
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || | |  ||       
T  6371420 gttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttacca 6371321  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  6371320 cctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 6371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1662431 - 1662261
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  1662431 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 1662332  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | | |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1662331 acctaaaaagat--atgttcattggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39587962 - 39587869
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  39587962 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 39587869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259528
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||         
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  101 -----atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
         ||||| |||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48259591 ttaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872760
Alignment:
Q  33 gtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttgg 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     | | | ||| ||||| ||||||||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtgaatgtttattggttgg 27872706  T
Q  133 ggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  27872707 ggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcaccaaataataaa 27872760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 54424980 - 54425073
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  54424980 aggttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 54425073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 89
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagat 89  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48658000
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata----- 101  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||         
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 48657919  T
Q  102 ------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48657920 taaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53834235 - 53834144
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  53834235 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatg 53834144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 43231502 - 43231590
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43231502 ggttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtt 43231590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 46720024 - 46720195
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||      
T  46720024 ggttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacc 46720123  T
Q  104 tgtttatatggtta---atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
       | | | ||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  46720124 acctaaaaaggtgatatatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48654902
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagtt 48654902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 573802 - 573976
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  573802 ggttgtttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 573901  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
       | | |  || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||  ||||||||||||||    
T  573902 acctaaaaaagtgaatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcaccat 573976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Original strand, 33048980 - 33049062
Alignment:
Q  93 tcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33048980 tcatgaatacgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3291865 - 3291795
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  3291865 taatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcaccttaaattaaa 3291795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Original strand, 35595794 - 35595872
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  35595794 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccata 35595872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17555670 - 17555617
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555670 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36533003 - 36532830
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-- 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||     |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||      
T  36533003 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttac------accac----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36532914  T
Q  102 ---------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36532913 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057969
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 75  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttatt 49057969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  45 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||           ||||| |||| ||  ||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  134 gtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 51951678 - 51951779
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||||||| ||    
T  51951678 taagattttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggat 51951777  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  51951778 at 51951779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206608
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagata 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 18206608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 42509403 - 42509487
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  42509403 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttatcaccaaaaaataa 42509487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54805674 - 54805614
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  54805674 taatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48259778 - 48259704
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  48259778 atgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 182
Target Start/End: Original strand, 42558307 - 42558373
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  42558307 taatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtcaccttaaaa 42558373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 48654944 - 48655002
Alignment:
Q  118 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  48654944 atgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Original strand, 35344890 - 35344968
Alignment:
Q  96 tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  35344890 tgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtcac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22468842 - 22468796
Alignment:
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22468842 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatt 22468796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Original strand, 16738568 - 16738621
Alignment:
Q  15 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagca 68  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16738568 aattacctttataaaatggtgggtaacttacccacgaactaatgaaaatgagca 16738621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Original strand, 43478059 - 43478147
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagtt 93  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||||   ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  43478059 ggttttttctagattactttcaaagaaccatgggtaatttatcgatcaaccaatgaaa-tgagcaatttattagtgtggtcaagatagtt 43478147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 54425104 - 54425163
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  54425104 taatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28641464 - 28641291
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28641464 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatata 28641365  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28641364 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28641291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35158220 - 35158049
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35158220 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 35158121  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
     |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35158120 cttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 35158049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 29687039 - 29687219
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29687039 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 29687138  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29687139 tgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaaaaata 29687219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 4258488 - 4258661
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4258488 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatgaatatg 4258586  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4258587 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcaccat 4258661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 39301268  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39301267 cttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 145281 - 145450
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  145281 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatacgt 145380  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145381 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19428598 - 19428415
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacc-tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19428598 gttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 19428499  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaag 187  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  19428498 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaaaaagaaag 19428415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12333669 - 12333496
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12333669 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata 12333570  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12333569 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacca 12333496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13543798 - 13543624
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13543798 aaggttctttttaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 13543699  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543698 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43899142 - 43898969
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43899142 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatg 43899043  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43899042 tgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccat 43898969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27765035 - 27764863
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27765035 aggttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat 27764936  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27764935 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2688903 - 2688729
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2688903 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata 2688804  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2688803 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Original strand, 12730059 - 12730237
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12730059 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaatatg 12730158  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    || |||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  12730159 tgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccaccttaaaa 12730237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 39103042 - 39103216
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  39103042 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaat 39103141  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39103142 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28566872 - 28566703
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28566872 aaggttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaata 28566773  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 171  Q
    |||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566772 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249441
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtg 34249364  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
     |||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34249365 cttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttaaaa 34249441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 43356097 - 43356267
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43356097 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 43356193  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43356194 tgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2000512 - 2000329
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  2000512 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcataaat 2000413  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
    ||||| |||  ||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  2000412 atgtgcttacgtggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccctcaaataaa 2000329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21735073 - 21734892
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21735073 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaatat 21734974  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaata 184  Q
    ||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  21734973 gtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttaaaata 21734892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 27331298 - 27331472
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga----ata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    |||    
T  27331298 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatatata 27331397  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27331398 tgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 3266296 - 3266455
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3266296 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtg 3266395  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
     ||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3266396 ctt---------atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40544250 - 40544084
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40544250 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 40544151  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    | || ||         |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40544150 tatgctt---------atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacca 40544084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711809
Alignment:
Q  37 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggta 136  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggta 3711763  T
Q  137 aattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3711764 aattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttaaaa 3711809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 40635216 - 40635399
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  40635216 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40635315  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40635316 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 8056625 - 8056779
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  8056625 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatgaatatgc 8056724  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
    | |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8056725 gcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13815402 - 13815215
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  13815402 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 13815303  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
          || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13815302 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccata 13815215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 26710340 - 26710527
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||       
T  26710340 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggat 26710439  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
            || ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26710440 accacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 26710527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 746464 - 746648
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||            
T  746464 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 746563  T
Q  96 ---tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
       | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  746564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 746648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 27400399 - 27400595
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  27400399 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 27400498  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaag 187  Q
           || ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27400499 ccacttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccattaaacaaag 27400595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 5726128 - 5726311
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  5726128 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttacca 5726227  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
        || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5726228 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 11184970 - 11185153
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  11184970 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 11185069  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11185070 acttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 23901775 - 23901961
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  23901775 aagggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 23901874  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23901875 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23901961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 34518366 - 34518548
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           
T  34518366 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 34518465  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34518466 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6594643 - 6594458
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  6594643 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 6594544  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  6594543 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 17600832 - 17601017
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  17600832 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 17600931  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17600932 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 45370988 - 45371173
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||          
T  45370988 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggatacc 45371087  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45371088 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 45371173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 4034590 - 4034773
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||          
T  4034590 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacc 4034689  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4034690 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 27024413 - 27024596
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||          
T  27024413 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 27024512  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || || || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27024513 acttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 38997100 - 38997282
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  38997100 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38997199  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  38997200 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2325072 - 2324889
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  2325072 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2324973  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  2324972 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27651217 - 27651034
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  27651217 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 27651118  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27651117 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 40037141 - 40037323
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-------- 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||            
T  40037141 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 40037240  T
Q  96 ---tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | || ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40037241 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 14660445 - 14660627
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  14660445 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14660544  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  14660545 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 6430471 - 6430648
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  6430471 ggttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 6430570  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
         || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  6430571 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 10424592 - 10424773
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  10424592 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 10424691  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 173  Q
          || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10424692 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1092134 - 1091951
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  1092134 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 1092035  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  1092034 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10244765 - 10244582
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  10244765 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10244666  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  10244665 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327544
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca---------- 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  96 -tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
     | || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcaccat 32327544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14697721 - 14697531
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||         
T  14697721 aggttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggatac 14697622  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
          || ||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14697621 cacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccataaaa 14697531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 40735459 - 40735654
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||       
T  40735459 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggat 40735558  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataa 185  Q
            || ||||  ||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||    
T  40735559 accacttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcaccataatataa 40735654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7892870 - 7892688
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||           
T  7892870 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggatacca 7892771  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  7892770 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 32948445 - 32948629
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||           
T  32948445 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggatacca 32948543  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
        || ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  32948544 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcaccata 32948629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427647
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca---------- 95  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||              
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  96 -tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37255516 - 37255337
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||         
T  37255516 aggttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 37255422  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37255421 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856436
Alignment:
Q  20 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgttt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||           ||||| ||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  109 atatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609808
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
       || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4609808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 44481826 - 44481998
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  44481826 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 44481925  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  44481926 acctaaaaaggtgaaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 15925075 - 15925255
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  15925075 taaggttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggat 15925174  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
            || || || |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  15925175 accacttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2914319 - 2914136
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||            
T  2914319 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 2914220  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
       || ||||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  2914219 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcaccat 2914136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 32608376 - 32608527
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||        
T  32608376 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtata 32608475  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac 142  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32608476 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 32608527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 11159632 - 11159802
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  11159632 attacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgt 11159730  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11159731 gtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 42899913 - 42900006
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  42899913 ggttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 42900006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 12814609 - 12814689
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12814609 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 12814689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37621054 - 37620866
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg---atcaagatagttcatg-- 97  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||||||||      
T  37621054 aggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatgga 37620955  T
Q  98 ---------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
             || ||||| |||| ||| | ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  37620954 taccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacca 37620866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 35126778 - 35126945
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  35126778 ggttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 35126877  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 171  Q
       | | | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| | || ||||||||    
T  35126878 acctaaaaaggtgaatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 41172454 - 41172605
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca----- 95  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||         
T  41172454 taaggtttttt-taaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggt 41172552  T
Q  96 ------tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac 142  Q
          | || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41172553 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 142
Target Start/End: Original strand, 12842103 - 12842250
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||| ||            
T  12842103 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaa 12842202  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac 142  Q
       || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12842203 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 12842250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8433101 - 8433006
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  8433101 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatg 8433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444874
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg- 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||     
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  98 ----------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac---ccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
              || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 173
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  57 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 145  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  146 tcattctttcatgggtagcctagttgtc 173  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 447708 - 447628
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  447708 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagttgtcaccataaa 447628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 30545817 - 30545909
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttc 94  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  30545817 aaggttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttc 30545909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 28020005 - 28019959
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 49  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020005 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 10176558 - 10176626
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 73  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10176558 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattta 10176626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 38985426 - 38985378
Alignment:
Q  27 agaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 75  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38985426 agaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 38985378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 150
Target Start/End: Original strand, 12827168 - 12827217
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 150  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12827168 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 12827217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8432985 - 8432942
Alignment:
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 150  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8432985 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 1229630 - 1229672
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattt 43  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1229630 taaggttttttctagattacctttaaagaatggtaggtaattt 1229672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 36216351 - 36216305
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  36216351 aaggttttttctaaattacctttgaaaactcatgggtaatttaccca 36216305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 161
Target Start/End: Original strand, 1229733 - 1229793
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggt 161  Q
    ||||| |||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1229733 atgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 8264532 - 8264576
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  8264532 ggttttttctaaattacctttgaaaattcatgggtaatttaccca 8264576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28949019 - 28948844
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28949019 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata 28948920  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948919 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 28948844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 15965432 - 15965604
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  15965432 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaatatg 15965531  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15965532 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 13329378 - 13329545
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  13329378 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcataaata 13329477  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 169  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13329478 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487698
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgta 4487627  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4487628 ctcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 1398551 - 1398724
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  1398551 aggttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaatat 1398650  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1398651 gtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291179
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcataaatatgtg 3291108  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3291109 cttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 3786749 - 3786921
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3786749 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaatatgt 3786848  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3786849 gcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3786921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22551247 - 22551051
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       
T  22551247 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggat 22551148  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22551147 accacctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataaattaaa 22551051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26377387 - 26377199
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  26377387 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 26377288  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26377287 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaa 26377199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 5882505 - 5882688
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  5882505 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5882604  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5882605 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101492
Alignment:
Q  8 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---------- 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||              
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  98 -aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
     || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccata 18101492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 960086 - 959901
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca--------- 95  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||             
T  960086 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagatacca 959987  T
Q  96 --tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
      | || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  959986 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccata 959901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Original strand, 28947085 - 28947273
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||         
T  28947085 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatac 28947184  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
          || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28947185 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataa 28947273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19281238 - 19281056
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat--- 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||       
T  19281238 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatc 19281139  T
Q  101 --------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
            || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19281138 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14891563 - 14891383
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  14891563 aggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14891464  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  14891463 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 599890 - 600077
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  599890 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 599989  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
          || |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  599990 cacttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccata 600077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 8615237 - 8615428
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  8615237 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 8615336  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
           || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8615337 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaaaaa 8615428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 24168090 - 24168273
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  24168090 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24168189  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24168190 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19415717 - 19415528
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||||         
T  19415717 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggatac 19415618  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19415617 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaa 19415528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 1970708 - 1970893
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  1970708 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 1970807  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
              ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  1970808 tcacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 16703363 - 16703539
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||        
T  16703363 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggata 16703462  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 167  Q
           || ||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16703463 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 7167580 - 7167753
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  7167580 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatac 7167679  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7167680 cacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34528045 - 34527862
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||          
T  34528045 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 34527946  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34527945 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7393771 - 7393586
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  7393771 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 7393672  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  7393671 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988974
Alignment:
Q  18 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || || ||     
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24224253 - 24224060
Alignment:
Q  5 gttttttctaaatt-acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||          
T  24224253 gttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 24224154  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
         || ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24224153 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcaccataaaataaa 24224060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7345295 - 7345130
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||          
T  7345295 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc 7345196  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 158  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7345195 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2594036 - 2593852
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  2594036 aggttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 2593937  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2593936 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30743629 - 30743442
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||            
T  30743629 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccac 30743530  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
       || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||| || ||||| |||||    
T  30743529 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcaccttaaaa 30743442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452566
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||| |||||||||||||||            
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
       || ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccataaaa 33452566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 18661804 - 18661906
Alignment:
Q  75 ttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18661804 ttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 18661903  T
Q  175 cca 177  Q
    |||    
T  18661904 cca 18661906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341788
Alignment:
Q  18 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10508091 - 10507908
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  10508091 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10507992  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| || |||||||||||||    
T  10507991 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30467786 - 30467693
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  30467786 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 30467693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24913216 - 24913096
Alignment:
Q  58 gaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgt--ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24913216 gaaaatgagcaatttatttgtggagtcaaaatagttcatgaatatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttc 24913117  T
Q  156 atgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  24913116 atgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5294987 - 5294891
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5294987 taagattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 5294891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5299539 - 5299443
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5299539 taagattttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatg 5299443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939554
Alignment:
Q  11 tctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||     
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggatatgtgtttac 1939570  T
Q  111 atggttaatgtgtatt 126  Q
     ||| |||| ||||||    
T  1939569 gtggctaatatgtatt 1939554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 87
Target Start/End: Original strand, 929657 - 929741
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaag 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  929657 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261929
Alignment:
Q  37 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttatatggttaatgtgtat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||           || ||||| ||||  ||||||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  126 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 375898 - 375799
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  375898 aaggttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 375799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11743130 - 11743070
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaa 61  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743130 taaggttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 13844846 - 13844932
Alignment:
Q  15 aattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||||||||| ||||    
T  13844846 aattacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaata 13844932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 18661771 - 18661807
Alignment:
Q  136 aaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18661771 aaattacccatcattctttcatggatagcctagttgt 18661807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  117 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5294861 - 5294801
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5294861 taatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5299413 - 5299353
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5299413 taatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 27503376 - 27503551
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27503376 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 27503475  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503476 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 27503551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 19295726 - 19295902
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  19295726 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat 19295825  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19295826 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 19295902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015514
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtg 38015585  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38015584 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23195420 - 23195248
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23195420 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 23195321  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195320 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9424764 - 9424593
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9424764 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatata 9424665  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9424664 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatatgtg 9374573  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9374572 tttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 5497271 - 5497444
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5497271 aggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat 5497370  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5497371 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 13957668 - 13957841
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13957668 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 13957767  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957768 gcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42658836 - 42658671
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42658836 aaggttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 42658737  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 167  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42658736 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 6973063 - 6973234
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6973063 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgt 6973162  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6973163 gcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36365617 - 36365445
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36365617 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 36365518  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  36365517 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacc 36365445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972150
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatatgtg 14972078  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
     |||| ||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972079 cttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 14972150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 33617584 - 33617756
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33617584 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatg 33617683  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  33617684 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656567
Alignment:
Q  32 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg 3656613  T
Q  132 gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3656612 gggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 6206883 - 6207052
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  6206883 ggttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaatatg 6206982  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 173  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  6206983 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcataagtaggctagttgtc 6207052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42247955 - 42247791
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42247955 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat 42247856  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| ||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42247855 gtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacc 42247791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24253378 - 24253575
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  24253378 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 24253477  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaag 187  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24253478 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccataaaaaaaag 24253575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 35626037 - 35626220
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  35626037 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 35626136  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  35626137 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492787
Alignment:
Q  39 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaa 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 38492746  T
Q  139 ttacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38492747 ttacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccaccataa 38492787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 5184971 - 5185154
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat--- 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||       
T  5184971 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 5185070  T
Q  101 --------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5185071 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 6901796 - 6901979
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat- 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  6901796 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 6901895  T
Q  101 ----------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
              ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6901896 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40886210 - 40886026
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  40886210 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40886111  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
        || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  40886110 acttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcaccat 40886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43262369 - 43262183
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  43262369 taaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 43262270  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43262269 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43326564 - 43326379
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  43326564 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 43326465  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43326464 ccacttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3466865 - 3466681
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  3466865 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 3466766  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3466765 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 739889 - 739695
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  739889 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 739790  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaa 186  Q
           || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  739789 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc-taaaataaa 739695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 27938894 - 27939080
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  27938894 aaggttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 27938993  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggg-tagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  27938994 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398483
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27501241 - 27501053
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  27501241 taaggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 27501142  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27501141 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccat 27501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939080
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacca 31939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484290
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||            
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
       || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccat 2484290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  10 ttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgttta 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||    
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggtatgtgctta 33624006  T
Q  110 tatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| || |||| |||||||    
T  33624005 tgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 40632498 - 40632634
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-- 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||      
T  40632498 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaa 138  Q
     ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40632598 ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25831517 - 25831702
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||       
T  25831517 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggat 25831615  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  25831616 accaattaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 7722047 - 7722240
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  7722047 aggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 7722146  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc-ataaaata 184  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  7722147 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacctataaaata 7722240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479664
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||            
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataa 180  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||| ||||||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcaccataa 18479664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 39932578 - 39932761
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  39932578 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39932677  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  39932678 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171035
Alignment:
Q  8 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |         |||| |    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataat---------tgtgct 9171103  T
Q  108 tatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9171102 tatgtggttaatgtgtattgatt-gggtaaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 9171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 15683791 - 15683973
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  15683791 gttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 15683890  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  15683891 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 12648797 - 12648979
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||           
T  12648797 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 12648896  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  12648897 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 5137713 - 5137807
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  5137713 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 5137807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40279043 - 40278856
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||       
T  40279043 taaggttttttttaa-ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggat 40278945  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  40278944 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcaccat 40278856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12558204 - 12558107
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  12558204 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcatga 12558107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 2585461 - 2585633
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  2585461 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 2585560  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       | | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  2585561 atctaaaaagttgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 4149691 - 4149843
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatca-agatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |  ||||   | | ||     
T  4149691 aaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggttatggataccacttaaaa 4149790  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 153  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4149791 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattctt 4149843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24167956 - 24167781
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||      
T  24167956 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 24167857  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
       | | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  24167856 acctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcaccata 24167781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27278660 - 27278474
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatag----ttcatg-- 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    ||||||      
T  27278660 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatgga 27278561  T
Q  98 ---------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
             || ||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27278560 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28424977 - 28424795
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-- 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||      
T  28424977 aggttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaat--gcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 28424880  T
Q  101 ---------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
             ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  28424879 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948492
Alignment:
Q  31 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-t 36948536  T
Q  131 ggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  36948535 agggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 40110230 - 40110324
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcat 96  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  40110230 taaggttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcat 40110324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 890902 - 891087
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||       
T  890902 taaggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggat 891001  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  891002 accacttaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1402678 - 1402500
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  1402678 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatac 1402579  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaa 181  Q
          | | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1402578 cacccaaaaaggtgaatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcaccttaaa 1402500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38638083 - 38637910
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||     
T  38638083 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 38637984  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        | | | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  38637983 caactaaaaaggtgaatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504740
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 97  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||             
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  98 --aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
      || ||||| |||| ||  |||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 13504740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36472458 - 36472285
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  36472458 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 36472359  T
Q  102 tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        |||| |  || ||| | |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  36472358 ccactttaaaaagtgaatatttattggttagaataaattacccaccattttttcat-ggtaccctagttgtcacc 36472285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38756659 - 38756487
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||           || ||||    
T  38756659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 38756560  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt-tcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  38756559 gtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18327346 - 18327170
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||     
T  18327346 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatac 18327247  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
        | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||| ||||||||    
T  18327246 cacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcaccata 18327170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120181
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||    || | |   |    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcatga-taccacttaaaaatat 5120134  T
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 162  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5120135 gaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattctttcatgggta 5120181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687069
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||        
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata-cca 40686998  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    | || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||| ||||||||    
T  40686999 tctaaaaagtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612751
Alignment:
Q  31 tggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||  || |||| ||| |||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata--tgcttatgtggctaatgtgtattggtt 612804  T
Q  131 ggg-gtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  612803 gggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcaccttaaaa 612751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 27390608 - 27390768
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||     | | | |||    
T  27390608 attacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggt 27390707  T
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27390708 gaatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  42 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  131 ggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 763723 - 763911
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  | |||||||||||||           
T  763723 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatca 763822  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
        || ||||  |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||    
T  763823 cttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcaccttaaaa 763911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527121
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt 75  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9527190 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatt 9527121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451434
Alignment:
Q  47 caccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||           |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  136 aaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccat 34451434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940336
Alignment:
Q  29 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattgg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||      ||||||| | || |||||||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat-----cgtgtttacaaggctaatgtgtattgg 3940384  T
Q  129 ttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |  |||||||| |||||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  3940383 ttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcacc 3940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293986
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat----- 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | |||| |||||||         
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  101 ------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
          || || |||  || || |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcaccata 31293986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300975
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttat 74  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttat 15300975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 27584384 - 27584447
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtggg--taatttacccaccaaccaatgaaaatga 65  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27584384 ggttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  9 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 65  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207095
Alignment:
Q  38 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatg 20207095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 28392291 - 28392342
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||    
T  28392291 taaggttttttctaaattacctttgaaaactcatgggcaatttacccaccaa 28392342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 31940314 - 31940488
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31940314 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatg 31940413  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31940414 tgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccata 31940488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 9713688 - 9713860
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9713688 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 9713784  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9713785 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccata 9713860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 117504 - 117328
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  117504 taagattttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat 117405  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117404 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 117328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 41843252 - 41843427
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41843252 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaatatg 41843351  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41843352 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcaccata 41843427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 2379138 - 2379312
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2379138 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatat 2379237  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2379238 gtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40458943 - 40458769
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40458943 gttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgt 40458844  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40458843 gtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccata 40458769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgt 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatatgtgc 4975477  T
Q  107 ttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttg 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4975476 ttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9509572 - 9509400
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9509572 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatatg 9509473  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509472 tgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4447467 - 4447295
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4447467 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatatg 4447368  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4447367 tgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10378305 - 10378480
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10378305 taaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat 10378404  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10378405 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649837
Alignment:
Q  17 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggtt 116  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaatatgtgcttatgtggct 40649891  T
Q  117 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40649890 aatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33622640 - 33622466
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  33622640 taagcttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttatggg-tcaaaatagttcatgaat 33622542  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33622541 atgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacca 33622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211376
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaatatgtg 3211305  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  3211306 cttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 5946043 - 5946229
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||       
T  5946043 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggat 5946142  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5946143 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  10 ttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgtgttta 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatatgtgctta 32373793  T
Q  110 tatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagtt 170  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  32373792 tgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32984262 - 32984077
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  32984262 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 32984163  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32984162 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24080084 - 24079900
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  24080084 ggttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24079985  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24079984 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 24079900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27243314 - 27243194
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27243314 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaat 27243215  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgt 121  Q
    ||||| |||| ||| ||||||    
T  27243214 atgtgcttatgtggctaatgt 27243194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27254889 - 27254769
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27254889 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaat 27254790  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgt 121  Q
    ||||| |||| ||| ||||||    
T  27254789 atgtgcttatgtggctaatgt 27254769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45236749 - 45236565
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||         
T  45236749 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 45236650  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45236649 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 6365985 - 6366168
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||          
T  6365985 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggatacc 6366084  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6366085 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37301508 - 37301326
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||          
T  37301508 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggatacc 37301409  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
         || |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37301408 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 2275913 - 2276094
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  2275913 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2276012  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || || || |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2276013 cttaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 41862218 - 41862402
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  41862218 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 41862317  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41862318 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 37956420 - 37956603
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  37956420 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37956519  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||    
T  37956520 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 41653892 - 41654079
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||        
T  41653892 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggata 41653991  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
           || ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41653992 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccat 41654079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9303756 - 9303574
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  9303756 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9303657  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9303656 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13356306 - 13356120
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  13356306 taaggttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 13356207  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  13356206 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 38631652 - 38631800
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |    
T  38631652 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatgaatatat 38631751  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 153  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  38631752 gcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattctt 38631800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 9734255 - 9734435
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||           
T  9734255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacac 9734354  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9734355 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646308
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
       || ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccata 10646308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 43328706 - 43328889
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  43328706 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 43328805  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  43328806 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17718908 - 17718722
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||       
T  17718908 taagattttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggat 17718809  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  17718808 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40435335 - 40435153
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||           
T  40435335 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 40435236  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  40435235 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 37419936 - 37420124
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--- 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||       
T  37419936 taaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 37420035  T
Q  98 --------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
            || ||||| |||| ||  |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  37420036 actacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccat 37420124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33730824 - 33730641
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  33730824 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33730725  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  33730724 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||            
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgt 172  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 25185897 - 25186081
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||         
T  25185897 aggtattttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatac 25185996  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
          || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | ||||||    
T  25185997 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacc 25186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33981846 - 33981663
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  33981846 ggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33981747  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  33981746 acttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714714
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||            
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
       || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3490572 - 3490399
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||  ||     
T  3490572 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttac 3490473  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        | | | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  3490472 cacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  10 ttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------a 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||           |    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  99 atatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 174  Q
    | ||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 35628776 - 35628959
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat--- 100  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||       
T  35628776 ggttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaatacc 35628875  T
Q  101 --------atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  35628876 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39915994 - 39915902
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39915994 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 39915902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29048587 - 29048426
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||         
T  29048587 aggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatac 29048488  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 153  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29048487 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33897017 - 33896843
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||    
T  33897017 taaggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagat 33896919  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |     | | | | | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33896918 accacctaaaaagatgaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 41231945 - 41232128
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  41231945 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41232044  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| || |||||||||||||    
T  41232045 acttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 9013684 - 9013865
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||           
T  9013684 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 9013783  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
        || ||||  |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9013784 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13760831 - 13760646
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  13760831 ggttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13760732  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg--gtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  13760731 atttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701376
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaata 42701376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 41639911 - 41640095
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca------ 95  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||          
T  41639911 aaggttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagata 41640010  T
Q  96 -----tgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
         | || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  41640011 ccgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 22878389 - 22878572
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||         
T  22878389 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggatac 22878488  T
Q  98 ------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 175  Q
          || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22878489 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088460
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||            
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  98 ---aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
       || ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 25248036 - 25248215
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  25248036 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 25248129  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || ||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  25248130 ccactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Original strand, 45258510 - 45258675
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 97  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||           
T  45258510 gttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 45258609  T
Q  98 ----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 159  Q
        || |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45258610 tttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41425527 - 41425428
Alignment:
Q  77 gtgggatcaagatagttcatgaatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41425527 gtggggtcaagatagttcatgaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacc 41425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45066774 - 45066682
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  45066774 gttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 45066682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26196491 - 26196317
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||    
T  26196491 taaggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggat 26196393  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    |     | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  || |||||||||||||    
T  26196392 accacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 31336204 - 31336288
Alignment:
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaataaaga 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  31336204 tgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaagaaaga 31336288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 31149063 - 31148968
Alignment:
Q  3 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  31149063 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcatga 31148968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 97
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981525
Alignment:
Q  26 aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41981525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 12033037 - 12033112
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12033037 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Original strand, 41981575 - 41981653
Alignment:
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccata 179  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41981575 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccata 41981653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904259
Alignment:
Q  54 caatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatga----------atatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacc 143  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||          | ||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattacc 3904225  T
Q  144 catcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  3904226 caccattcttccatgggtaccctagttatcacca 3904259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164789
Alignment:
Q  11 tctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 72  Q
    |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaattt 164789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Original strand, 12032951 - 12032988
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaat 41  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12032951 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 39901574 - 39901741
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttc-atgaatatgt 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||      ||||| |||| |||||   | || | |||||||||| ||||| ||||    
T  39901574 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccactaa-----aaaaataagcactttatagatagggttaagatagttcaatgaa-atgt 39901667  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccat 178  Q
    ||||   ||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |||| || | |||||||||||||    
T  39901668 gtttccgtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcaccat 39901741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42701349 - 42701303
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  42701349 taatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggta 42701303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 7089 - 7263
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7089 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 7188  T
Q  103 gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    ||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189 gtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39739 - 39556
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  39739 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39640  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39639 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13945 - 13756
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  13945 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13846  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
         || ||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13845 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttaaaa 13756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 75427 - 75244
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  75427 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcatacc 75328  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
         || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  75327 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 32560 - 32712
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          
T  32560 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 32659  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 145  Q
         || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660 atttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 32712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11317 - 11132
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 97  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  11317 aagggtttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 11219  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
           || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11218 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 11132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 177
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2052
Alignment:
Q  7 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg--------- 97  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||             
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  98 --aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
      || || || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2615 - 2426
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||          
T  2615 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 2516  T
Q  98 -----aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccataaaa 182  Q
         || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2515 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcaccaaaaaa 2426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 278005 - 278190
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||          
T  278005 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 278104  T
Q  98 -------aatatgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
           || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  278105 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176836
Alignment:
Q  17 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttca-----------tgaatatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||           |||| ||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  106 tttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 14740 - 14916
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14740 taaggttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaat 14839  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |     | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  14840 accacctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 17905 - 18043
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||  |||| ||| || ||||||| |    
T  17905 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatacg 18004  T
Q  104 tgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattac 142  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18005 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20648 - 20477
Alignment:
Q  5 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatatgt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||       
T  20648 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T
Q  105 gtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
      | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  20548 cctaaaaaggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 98 - 273
Alignment:
Q  1 taaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  98 taaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaat 197  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |     | | | ||| |||||  |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  198 accacctaaaaaggtgaatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19037 - 18944
Alignment:
Q  4 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 97  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  19037 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatg 18944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18914 - 18854
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18914 taatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4729 - 4553
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
T  4729 aaggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggat 4630  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |    || | | ||| |||||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4629 accatttaaaaaggtgaatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 3389 - 3565
Alignment:
Q  2 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||    
T  3389 aaggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggat 3488  T
Q  101 atgtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |    || | | ||| |||||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  3489 accatttaaaaaggtgaatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3261
Alignment:
Q  6 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat--- 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||         |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||       
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  103 --------gtgtttatatggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 176  Q
            ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| || | |||||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4656 - 4595
Alignment:
Q  116 taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4656 taatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 4595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19302
Alignment:
Q  16 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagata 90  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University