View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19628_low_38 (Length: 331)

Name: NF19628_low_38
Description: NF19628
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19628_low_38
NF19628_low_38
[»] chr4 (89 HSPs)
chr4 (105-329)||(16038021-16038245)
chr4 (104-331)||(8591967-8592194)
chr4 (104-331)||(14985329-14985556)
chr4 (106-331)||(38339492-38339717)
chr4 (103-331)||(19088566-19088794)
chr4 (111-331)||(46849894-46850114)
chr4 (100-331)||(25182037-25182268)
chr4 (106-331)||(53751127-53751352)
chr4 (105-331)||(21763406-21763632)
chr4 (105-331)||(42855564-42855790)
chr4 (118-331)||(30683753-30683966)
chr4 (102-331)||(50768817-50769046)
chr4 (91-331)||(39448713-39448953)
chr4 (111-331)||(52557312-52557532)
chr4 (111-330)||(53259364-53259583)
chr4 (105-331)||(623904-624130)
chr4 (105-331)||(6711962-6712188)
chr4 (93-331)||(33091678-33091916)
chr4 (106-331)||(15477870-15478095)
chr4 (105-331)||(53995159-53995386)
chr4 (111-331)||(24898194-24898414)
chr4 (105-331)||(1433496-1433722)
chr4 (106-331)||(37206652-37206877)
chr4 (118-331)||(43734511-43734724)
chr4 (105-331)||(12817805-12818031)
chr4 (105-331)||(44991503-44991729)
chr4 (101-331)||(23756025-23756255)
chr4 (105-331)||(44957388-44957614)
chr4 (105-331)||(50508682-50508908)
chr4 (119-331)||(41752041-41752253)
chr4 (105-331)||(41878084-41878309)
chr4 (145-330)||(19508639-19508824)
chr4 (142-331)||(43566603-43566792)
chr4 (105-331)||(36122658-36122883)
chr4 (102-268)||(46849665-46849831)
chr4 (96-268)||(53994924-53995096)
chr4 (105-268)||(42855338-42855501)
chr4 (106-268)||(44991279-44991441)
chr4 (100-268)||(16037788-16037956)
chr4 (106-268)||(8592257-8592419)
chr4 (104-268)||(14985619-14985783)
chr4 (104-268)||(43734284-43734448)
chr4 (102-264)||(53750898-53751060)
chr4 (104-268)||(15477643-15477807)
chr4 (109-268)||(19088344-19088503)
chr4 (105-268)||(24898477-24898640)
chr4 (102-268)||(6505533-6505698)
chr4 (106-268)||(8398031-8398193)
chr4 (108-266)||(43566380-43566538)
chr4 (106-266)||(38339782-38339942)
chr4 (108-265)||(50769112-50769269)
chr4 (108-268)||(36122435-36122595)
chr4 (96-264)||(41877850-41878017)
chr4 (108-268)||(52557089-52557249)
chr4 (107-265)||(30683527-30683686)
chr4 (104-269)||(12818093-12818258)
chr4 (104-249)||(25269307-25269452)
chr4 (97-266)||(37206419-37206587)
chr4 (107-265)||(1433272-1433430)
chr4 (102-268)||(25181808-25181974)
chr4 (106-268)||(33091453-33091615)
chr4 (108-268)||(39448490-39448650)
chr4 (106-268)||(21763180-21763343)
chr4 (106-268)||(623679-623841)
chr4 (104-268)||(6712251-6712413)
chr4 (111-266)||(20888148-20888303)
chr4 (104-250)||(55022282-55022427)
chr4 (104-268)||(41751816-41751978)
chr4 (106-268)||(19508413-19508575)
chr4 (106-245)||(44957668-44957807)
chr4 (106-266)||(23755418-23755578)
chr4 (105-252)||(44125774-44125921)
chr4 (152-268)||(53259184-53259300)
chr4 (105-220)||(4513252-4513367)
chr4 (109-261)||(49135928-49136084)
chr4 (161-264)||(50508512-50508615)
chr4 (108-239)||(44125624-44125755)
chr4 (105-251)||(47602942-47603088)
chr4 (105-207)||(47603710-47603812)
chr4 (106-257)||(52692740-52692889)
chr4 (111-204)||(52692029-52692122)
chr4 (104-194)||(31214160-31214250)
chr4 (15-105)||(22210176-22210266)
chr4 (270-331)||(6505761-6505822)
chr4 (107-192)||(55022424-55022508)
chr4 (266-331)||(23755643-23755708)
chr4 (11-61)||(53591506-53591556)
chr4 (118-187)||(44432929-44432998)
chr4 (104-181)||(48209946-48210023)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (103-330)||(6356762-6356989)
chr7 (111-331)||(41453230-41453450)
chr7 (105-331)||(10526310-10526535)
chr7 (106-331)||(44332744-44332969)
chr7 (104-331)||(19681720-19681947)
chr7 (118-331)||(33716600-33716813)
chr7 (104-331)||(48626288-48626515)
chr7 (101-331)||(41191910-41192140)
chr7 (130-331)||(17359205-17359406)
chr7 (105-331)||(8542498-8542724)
chr7 (97-331)||(31638168-31638402)
chr7 (111-306)||(1114059-1114254)
chr7 (109-331)||(6356289-6356510)
chr7 (127-331)||(28297840-28298044)
chr7 (111-331)||(34037136-34037356)
chr7 (104-331)||(8937074-8937301)
chr7 (106-331)||(21391415-21391640)
chr7 (111-331)||(7579097-7579317)
chr7 (111-331)||(28286342-28286562)
chr7 (106-331)||(41751650-41751875)
chr7 (105-331)||(43247414-43247640)
chr7 (106-268)||(35146699-35146861)
chr7 (106-265)||(48626063-48626222)
chr7 (104-268)||(28286115-28286279)
chr7 (103-266)||(21391187-21391350)
chr7 (128-331)||(36423391-36423594)
chr7 (106-268)||(7578872-7579034)
chr7 (106-268)||(41453005-41453167)
chr7 (104-281)||(7909285-7909461)
chr7 (107-268)||(19681496-19681657)
chr7 (104-268)||(6356573-6356737)
chr7 (111-331)||(35146923-35147134)
chr7 (105-268)||(10526598-10526761)
chr7 (106-268)||(1114333-1114495)
chr7 (124-268)||(36423657-36423801)
chr7 (105-268)||(8936848-8937011)
chr7 (106-268)||(17749935-17750097)
chr7 (91-264)||(31075485-31075658)
chr7 (106-266)||(6357055-6357215)
chr7 (106-268)||(41191683-41191844)
chr7 (109-266)||(31637946-31638103)
chr7 (103-286)||(27738935-27739117)
chr7 (111-273)||(4931556-4931718)
chr7 (107-229)||(36673976-36674098)
chr7 (108-262)||(8542793-8542946)
chr7 (125-262)||(7909460-7909597)
chr7 (106-239)||(16867707-16867840)
chr7 (109-262)||(17363532-17363683)
chr7 (105-234)||(4155597-4155726)
chr7 (128-268)||(28298107-28298247)
chr7 (105-268)||(41751938-41752102)
chr7 (183-331)||(40673232-40673378)
chr7 (104-257)||(8416483-8416635)
chr7 (106-251)||(41891966-41892111)
chr7 (106-228)||(36282786-36282908)
chr7 (104-228)||(29277671-29277795)
chr7 (141-228)||(32946669-32946756)
chr7 (106-207)||(8417285-8417386)
chr7 (108-268)||(40673014-40673169)
chr7 (134-268)||(33716872-33717005)
chr7 (203-262)||(17359479-17359538)
chr7 (111-249)||(36283512-36283651)
chr7 (108-192)||(29276877-29276961)
chr7 (118-228)||(41893403-41893513)
chr7 (116-257)||(28264587-28264728)
chr7 (104-192)||(36674095-36674181)
chr7 (200-283)||(38447600-38447682)
chr7 (105-166)||(36423790-36423851)
chr7 (105-236)||(28263495-28263626)
chr7 (97-187)||(10625389-10625479)
chr7 (109-196)||(38447695-38447778)
chr7 (99-181)||(38677053-38677135)
chr7 (111-236)||(4156509-4156634)
chr7 (152-228)||(29276950-29277026)
chr7 (106-187)||(40263616-40263697)
chr7 (154-207)||(46540017-46540070)
chr7 (104-180)||(35086052-35086128)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (104-331)||(5900648-5900875)
chr3 (106-331)||(10506173-10506398)
chr3 (108-331)||(1994394-1994616)
chr3 (96-331)||(42591774-42592009)
chr3 (106-331)||(54108127-54108352)
chr3 (104-316)||(4757733-4757945)
chr3 (111-331)||(47669264-47669484)
chr3 (104-331)||(32633290-32633517)
chr3 (111-331)||(39241363-39241583)
chr3 (117-331)||(53716305-53716518)
chr3 (111-331)||(8474071-8474291)
chr3 (99-331)||(44893733-44893965)
chr3 (104-331)||(4773241-4773467)
chr3 (104-331)||(26318407-26318634)
chr3 (101-331)||(39664409-39664639)
chr3 (111-331)||(21969634-21969854)
chr3 (111-331)||(21992070-21992290)
chr3 (111-331)||(29818182-29818402)
chr3 (100-331)||(22201610-22201841)
chr3 (105-331)||(16931605-16931831)
chr3 (104-331)||(22151843-22152070)
chr3 (106-331)||(54752163-54752388)
chr3 (111-330)||(12203777-12203996)
chr3 (106-331)||(15986235-15986459)
chr3 (105-331)||(11256102-11256328)
chr3 (105-331)||(18464455-18464681)
chr3 (105-331)||(24428566-24428792)
chr3 (106-331)||(21568746-21568970)
chr3 (118-331)||(27801501-27801714)
chr3 (105-331)||(46152614-46152838)
chr3 (119-331)||(51509344-51509555)
chr3 (109-331)||(47303244-47303463)
chr3 (100-301)||(28986397-28986597)
chr3 (103-268)||(39664181-39664346)
chr3 (102-268)||(54752451-54752617)
chr3 (105-266)||(42592074-42592235)
chr3 (111-331)||(41835151-41835371)
chr3 (105-268)||(51509118-51509281)
chr3 (106-268)||(24428855-24429017)
chr3 (104-268)||(1994167-1994331)
chr3 (104-268)||(1999326-1999490)
chr3 (104-268)||(27801777-27801941)
chr3 (104-268)||(54107900-54108064)
chr3 (106-265)||(26318182-26318341)
chr3 (102-268)||(18464744-18464910)
chr3 (105-331)||(39951356-39951582)
chr3 (106-267)||(47669548-47669709)
chr3 (96-268)||(5900413-5900585)
chr3 (108-268)||(29818465-29818625)
chr3 (105-268)||(4757493-4757656)
chr3 (109-268)||(10505951-10506110)
chr3 (105-268)||(21569033-21569196)
chr3 (106-257)||(45306991-45307142)
chr3 (106-264)||(15986526-15986684)
chr3 (106-268)||(22201904-22202066)
chr3 (105-267)||(11256392-11256554)
chr3 (105-268)||(22152133-22152298)
chr3 (104-266)||(44894030-44894192)
chr3 (105-268)||(53716581-53716744)
chr3 (108-268)||(21969917-21970079)
chr3 (108-268)||(21992353-21992515)
chr3 (106-268)||(12203551-12203713)
chr3 (106-259)||(12791473-12791626)
chr3 (107-259)||(16931903-16932055)
chr3 (105-268)||(4773530-4773693)
chr3 (137-268)||(41834957-41835088)
chr3 (125-265)||(8473865-8474005)
chr3 (98-257)||(13866012-13866171)
chr3 (106-257)||(44317514-44317665)
chr3 (105-268)||(47303018-47303181)
chr3 (101-251)||(45306827-45306977)
chr3 (100-268)||(19883528-19883695)
chr3 (105-257)||(49528148-49528300)
chr3 (102-232)||(7681447-7681578)
chr3 (106-217)||(28985509-28985620)
chr3 (134-265)||(46152904-46153032)
chr3 (111-223)||(15790684-15790796)
chr3 (173-268)||(39241646-39241741)
chr3 (119-224)||(7163463-7163568)
chr3 (226-331)||(19883359-19883464)
chr3 (105-221)||(30681752-30681868)
chr3 (105-257)||(20963525-20963676)
chr3 (184-268)||(32633143-32633227)
chr3 (105-228)||(15791434-15791555)
chr3 (105-225)||(30681028-30681148)
chr3 (105-192)||(42853245-42853331)
chr3 (207-268)||(28986261-28986322)
chr3 (161-268)||(39951645-39951748)
chr3 (118-236)||(49529076-49529194)
chr3 (118-236)||(13866920-13867038)
chr3 (118-207)||(43844384-43844473)
chr3 (105-236)||(44316626-44316756)
chr3 (130-187)||(43839984-43840041)
chr3 (15-62)||(4858128-4858175)
chr3 (117-251)||(8327680-8327814)
chr3 (107-141)||(42853340-42853374)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (105-331)||(12481284-12481510)
chr1 (104-331)||(45052914-45053141)
chr1 (105-331)||(37304027-37304253)
chr1 (111-331)||(35612307-35612527)
chr1 (104-331)||(1762899-1763126)
chr1 (106-331)||(16023897-16024122)
chr1 (106-331)||(27547894-27548119)
chr1 (106-331)||(49140368-49140592)
chr1 (104-331)||(23476566-23476793)
chr1 (103-331)||(3089339-3089567)
chr1 (111-331)||(6798032-6798252)
chr1 (109-331)||(20306005-20306227)
chr1 (102-331)||(25995780-25996009)
chr1 (106-331)||(37576181-37576406)
chr1 (103-331)||(8762624-8762852)
chr1 (107-331)||(38127710-38127934)
chr1 (105-331)||(2064436-2064662)
chr1 (111-305)||(45843368-45843562)
chr1 (105-331)||(49643896-49644121)
chr1 (111-331)||(12127278-12127501)
chr1 (152-331)||(31703660-31703839)
chr1 (105-331)||(9006416-9006641)
chr1 (111-331)||(4330062-4330282)
chr1 (106-331)||(37284953-37285177)
chr1 (111-331)||(37585918-37586138)
chr1 (104-268)||(49140141-49140305)
chr1 (106-268)||(37576469-37576631)
chr1 (107-268)||(12481060-12481221)
chr1 (107-268)||(44322948-44323109)
chr1 (101-265)||(12127052-12127216)
chr1 (103-268)||(16024185-16024350)
chr1 (109-268)||(49643674-49643833)
chr1 (105-268)||(26707195-26707358)
chr1 (106-268)||(23476341-23476503)
chr1 (106-268)||(27547669-27547831)
chr1 (103-305)||(39486444-39486645)
chr1 (104-268)||(9006189-9006353)
chr1 (165-331)||(27400649-27400815)
chr1 (118-268)||(37304316-37304466)
chr1 (104-268)||(4696880-4697044)
chr1 (104-268)||(20306290-20306454)
chr1 (105-265)||(26723092-26723252)
chr1 (109-265)||(35612085-35612241)
chr1 (105-268)||(8760271-8760434)
chr1 (106-268)||(1762674-1762836)
chr1 (106-268)||(31703901-31704063)
chr1 (109-262)||(38000492-38000645)
chr1 (108-268)||(6797809-6797969)
chr1 (109-264)||(37585696-37585851)
chr1 (105-266)||(45052689-45052849)
chr1 (118-264)||(37284740-37284886)
chr1 (111-268)||(39486207-39486364)
chr1 (99-257)||(10831124-10831281)
chr1 (105-245)||(23598071-23598213)
chr1 (92-228)||(46593559-46593694)
chr1 (105-228)||(34967050-34967173)
chr1 (105-228)||(32047742-32047865)
chr1 (118-228)||(5537132-5537242)
chr1 (111-228)||(34966308-34966425)
chr1 (106-222)||(37467554-37467670)
chr1 (105-228)||(5536397-5536520)
chr1 (111-254)||(46592817-46592959)
chr1 (106-192)||(13109191-13109277)
chr1 (111-207)||(10831935-10832031)
chr1 (262-331)||(44322816-44322885)
chr1 (261-331)||(26707421-26707491)
chr1 (266-331)||(4697107-4697172)
chr1 (111-192)||(4697163-4697244)
chr1 (100-228)||(28884011-28884139)
chr1 (108-228)||(28884751-28884871)
chr1 (108-228)||(32048510-32048630)
chr1 (152-228)||(49837417-49837493)
chr1 (106-192)||(13183766-13183852)
chr1 (210-268)||(25996072-25996130)
chr1 (109-179)||(46289327-46289397)
chr1 (106-186)||(49838756-49838835)
chr1 (104-249)||(37466800-37466943)
chr1 (104-187)||(52412903-52412986)
chr1 (15-62)||(10550790-10550837)
chr1 (212-255)||(46015766-46015809)
chr1 (97-187)||(25088007-25088097)
chr1 (16-62)||(27308653-27308699)
chr1 (183-232)||(10824445-10824494)
chr1 (103-187)||(28970416-28970500)
chr1 (183-231)||(37189444-37189492)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (103-331)||(27473296-27473524)
chr8 (105-331)||(33295909-33296135)
chr8 (106-331)||(15048399-15048624)
chr8 (104-331)||(38588586-38588812)
chr8 (102-331)||(45276821-45277050)
chr8 (111-331)||(7949417-7949637)
chr8 (96-331)||(1651797-1652031)
chr8 (96-331)||(1740173-1740407)
chr8 (106-331)||(15871846-15872071)
chr8 (105-331)||(45077428-45077654)
chr8 (111-331)||(1432136-1432356)
chr8 (105-331)||(1646732-1646957)
chr8 (104-331)||(7535058-7535285)
chr8 (106-331)||(44594826-44595050)
chr8 (111-331)||(11173859-11174079)
chr8 (106-331)||(5435125-5435350)
chr8 (111-331)||(5152759-5152978)
chr8 (106-268)||(34470832-34470994)
chr8 (106-323)||(1869934-1870150)
chr8 (130-331)||(27669440-27669641)
chr8 (108-265)||(15048690-15048847)
chr8 (105-268)||(37569313-37569476)
chr8 (104-268)||(33819783-33819947)
chr8 (97-268)||(1646492-1646663)
chr8 (106-268)||(45276597-45276759)
chr8 (108-268)||(5434902-5435062)
chr8 (104-267)||(1870224-1870387)
chr8 (107-268)||(5152536-5152696)
chr8 (99-268)||(11707743-11707912)
chr8 (106-268)||(27473072-27473233)
chr8 (109-263)||(40660179-40660333)
chr8 (106-268)||(15871621-15871783)
chr8 (110-268)||(1739952-1740110)
chr8 (108-268)||(38588875-38589035)
chr8 (109-268)||(40048342-40048501)
chr8 (106-266)||(40659983-40660143)
chr8 (119-330)||(37569541-37569752)
chr8 (105-257)||(22763232-22763384)
chr8 (107-268)||(27669709-27669868)
chr8 (174-297)||(18298488-18298611)
chr8 (106-331)||(40048067-40048280)
chr8 (109-232)||(33295739-33295862)
chr8 (109-268)||(44594604-44594763)
chr8 (106-268)||(45077221-45077364)
chr8 (109-268)||(7534845-7534995)
chr8 (105-228)||(24666006-24666129)
chr8 (105-192)||(11920136-11920223)
chr8 (239-331)||(11707975-11708067)
chr8 (105-188)||(24652822-24652905)
chr8 (106-228)||(15740613-15740735)
chr8 (118-207)||(22762525-22762614)
chr8 (106-181)||(12643891-12643966)
chr8 (106-181)||(15741607-15741682)
chr8 (108-194)||(33819975-33820062)
chr8 (276-331)||(34470714-34470769)
chr8 (104-165)||(11920074-11920135)
chr8 (152-228)||(24652898-24652974)
chr8 (15-66)||(11151966-11152017)
chr8 (273-331)||(24659421-24659479)
chr8 (101-179)||(29770376-29770454)
chr8 (102-170)||(13462102-13462170)
chr8 (105-181)||(30650189-30650265)
chr8 (111-187)||(39912224-39912300)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (111-331)||(7469171-7469391)
chr2 (111-331)||(15744462-15744682)
chr2 (92-331)||(10991837-10992076)
chr2 (105-331)||(13192987-13193213)
chr2 (106-331)||(29472242-29472467)
chr2 (99-331)||(24372192-24372424)
chr2 (105-316)||(7496219-7496430)
chr2 (100-331)||(19847544-19847774)
chr2 (106-331)||(34735568-34735793)
chr2 (105-331)||(8174110-8174336)
chr2 (106-331)||(26181925-26182150)
chr2 (106-331)||(38332704-38332929)
chr2 (152-331)||(12860592-12860771)
chr2 (105-331)||(16305024-16305250)
chr2 (97-330)||(15405982-15406214)
chr2 (102-331)||(19815929-19816158)
chr2 (105-284)||(33470195-33470374)
chr2 (106-331)||(24138731-24138957)
chr2 (109-331)||(2148111-2148333)
chr2 (104-268)||(24371965-24372129)
chr2 (106-329)||(36713588-36713809)
chr2 (107-268)||(12860381-12860542)
chr2 (105-265)||(24138067-24138227)
chr2 (111-331)||(41474087-41474307)
chr2 (109-268)||(8173888-8174047)
chr2 (102-268)||(34735339-34735505)
chr2 (105-268)||(7495979-7496142)
chr2 (105-268)||(15405755-15405918)
chr2 (109-265)||(19815707-19815863)
chr2 (105-268)||(13193276-13193439)
chr2 (95-268)||(2147874-2148048)
chr2 (109-268)||(30898589-30898748)
chr2 (101-265)||(41474373-41474537)
chr2 (101-265)||(26181695-26181859)
chr2 (105-265)||(29472533-29472693)
chr2 (111-268)||(17052342-17052499)
chr2 (108-262)||(38332974-38333128)
chr2 (110-268)||(16305313-16305471)
chr2 (106-268)||(15744745-15744897)
chr2 (152-268)||(10992139-10992255)
chr2 (136-266)||(42834452-42834582)
chr2 (109-235)||(8444825-8444951)
chr2 (109-264)||(7469458-7469605)
chr2 (105-216)||(17032592-17032703)
chr2 (117-268)||(36713873-36714024)
chr2 (92-216)||(17050915-17051039)
chr2 (111-257)||(8962365-8962510)
chr2 (213-331)||(17052164-17052279)
chr2 (111-218)||(8445127-8445234)
chr2 (106-207)||(8963166-8963267)
chr2 (11-62)||(42236415-42236466)
chr2 (105-195)||(19847277-19847361)
chr2 (117-187)||(23992211-23992281)
chr2 (118-187)||(16655911-16655980)
chr2 (100-181)||(37744443-37744524)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (104-331)||(72760-72986)
scaffold0029 (105-268)||(73049-73212)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (105-330)||(9989322-9989547)
chr5 (104-331)||(2182941-2183168)
chr5 (105-331)||(36440425-36440651)
chr5 (106-331)||(38958949-38959173)
chr5 (111-331)||(37424487-37424709)
chr5 (106-331)||(27185874-27186098)
chr5 (101-331)||(24040310-24040542)
chr5 (111-331)||(32288302-32288521)
chr5 (102-331)||(25567213-25567442)
chr5 (118-331)||(35570005-35570218)
chr5 (118-310)||(11315970-11316162)
chr5 (104-268)||(27186161-27186325)
chr5 (105-268)||(36440199-36440362)
chr5 (93-268)||(37424249-37424424)
chr5 (108-265)||(35569777-35569934)
chr5 (97-265)||(16860294-16860462)
chr5 (118-331)||(34264573-34264790)
chr5 (108-267)||(39325414-39325573)
chr5 (106-268)||(38958724-38958886)
chr5 (108-268)||(24040087-24040247)
chr5 (109-268)||(25182941-25183100)
chr5 (106-275)||(39325636-39325805)
chr5 (107-266)||(32288079-32288237)
chr5 (125-268)||(9989611-9989754)
chr5 (106-252)||(1140077-1140215)
chr5 (134-266)||(11316244-11316376)
chr5 (107-257)||(19184598-19184748)
chr5 (127-268)||(2183231-2183372)
chr5 (105-263)||(29198953-29199109)
chr5 (104-223)||(34264349-34264479)
chr5 (106-175)||(19128434-19128503)
chr5 (109-228)||(31756630-31756749)
chr5 (103-236)||(19185504-19185637)
chr5 (271-329)||(16860647-16860705)
chr5 (111-181)||(33817659-33817729)
chr5 (271-331)||(16860528-16860588)
chr5 (259-331)||(29199177-29199249)
chr5 (235-268)||(34264477-34264510)
chr5 (15-60)||(25640413-25640458)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (97-331)||(21503-21736)
scaffold0115 (105-258)||(22451-22604)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (106-331)||(50701-50927)
scaffold0019 (108-268)||(50478-50638)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (105-330)||(21856781-21857006)
chr6 (111-331)||(24744334-24744553)
chr6 (104-331)||(26600355-26600582)
chr6 (111-331)||(5938038-5938258)
chr6 (105-331)||(32993240-32993466)
chr6 (106-331)||(9046086-9046311)
chr6 (108-331)||(6137603-6137825)
chr6 (105-331)||(18052955-18053181)
chr6 (106-331)||(5310826-5311051)
chr6 (105-331)||(34890643-34890869)
chr6 (104-331)||(21540202-21540430)
chr6 (100-331)||(34994605-34994836)
chr6 (111-331)||(2517007-2517227)
chr6 (111-331)||(5639398-5639618)
chr6 (111-331)||(31237751-31237971)
chr6 (111-331)||(31247121-31247341)
chr6 (105-331)||(7269950-7270178)
chr6 (106-331)||(32753177-32753398)
chr6 (108-331)||(6236146-6236369)
chr6 (106-268)||(35167490-35167652)
chr6 (106-291)||(6532192-6532377)
chr6 (104-268)||(978413-978577)
chr6 (108-268)||(15932844-15933004)
chr6 (105-268)||(21856554-21856717)
chr6 (102-268)||(5311114-5311280)
chr6 (102-268)||(5937809-5937975)
chr6 (104-268)||(9046374-9046538)
chr6 (159-331)||(26957015-26957187)
chr6 (104-268)||(34890932-34891095)
chr6 (105-268)||(6235920-6236083)
chr6 (106-268)||(31238034-31238196)
chr6 (108-262)||(25176665-25176819)
chr6 (98-268)||(32753461-32753631)
chr6 (104-268)||(3423168-3423332)
chr6 (106-265)||(2517293-2517452)
chr6 (152-331)||(3423395-3423574)
chr6 (105-268)||(18053241-18053404)
chr6 (181-331)||(25176882-25177032)
chr6 (150-331)||(7270673-7270854)
chr6 (106-259)||(26957258-26957411)
chr6 (109-268)||(34994383-34994542)
chr6 (106-268)||(31247404-31247566)
chr6 (118-268)||(26600635-26600785)
chr6 (105-266)||(6137378-6137538)
chr6 (105-265)||(7270920-7271080)
chr6 (108-264)||(32993017-32993173)
chr6 (106-268)||(24744609-24744770)
chr6 (108-261)||(10412796-10412949)
chr6 (106-257)||(17244664-17244815)
chr6 (109-241)||(14276402-14276534)
chr6 (105-268)||(7270241-7270404)
chr6 (211-323)||(35167725-35167837)
chr6 (104-223)||(7438802-7438921)
chr6 (106-257)||(34517991-34518142)
chr6 (106-257)||(6228730-6228880)
chr6 (104-206)||(15932728-15932830)
chr6 (104-228)||(29261279-29261403)
chr6 (104-185)||(25180219-25180300)
chr6 (111-228)||(29260536-29260652)
chr6 (152-250)||(3035926-3036025)
chr6 (111-254)||(15286350-15286492)
chr6 (104-207)||(34517270-34517373)
chr6 (105-178)||(35167833-35167906)
chr6 (106-224)||(27829297-27829414)
chr6 (104-210)||(34251552-34251656)
chr6 (106-236)||(6229643-6229772)
chr6 (104-255)||(17245561-17245712)
chr6 (106-187)||(1158588-1158669)
chr6 (227-268)||(5639294-5639335)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (105-331)||(20750-20975)
scaffold0220 (218-268)||(21038-21088)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (118-331)||(18285-18498)
scaffold0340 (106-268)||(18561-18723)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (105-331)||(14360-14586)
scaffold0134 (103-268)||(14132-14297)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (105-331)||(45755-45981)
scaffold0037 (109-268)||(56424-56583)
scaffold0037 (109-268)||(63549-63708)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (111-331)||(19713-19933)
scaffold0182 (109-268)||(19996-20155)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (105-331)||(24161-24387)
scaffold0186 (106-262)||(24456-24612)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (118-331)||(349085-349298)
scaffold0003 (104-268)||(349361-349524)
scaffold0003 (106-268)||(113654-113816)
scaffold0003 (105-235)||(113392-113522)
scaffold0003 (259-331)||(113519-113591)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (105-331)||(8428-8653)
scaffold0221 (110-268)||(8716-8874)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (105-268)||(81857-82020)
scaffold0032 (183-331)||(82083-82231)
scaffold0032 (118-212)||(90782-90876)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (111-331)||(15458-15673)
scaffold0072 (106-268)||(15736-15898)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (152-331)||(6044-6220)
scaffold0246 (109-268)||(6283-6439)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (145-265)||(14231-14350)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (105-257)||(9781-9932)
scaffold0225 (104-253)||(10860-11008)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (125-253)||(144039-144166)
scaffold0001 (151-263)||(147133-147245)
[»] scaffold0526 (2 HSPs)
scaffold0526 (106-139)||(4030-4063)
scaffold0526 (106-139)||(4084-4117)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 89)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 105 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16038245 - 16038021
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16038245 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 16038146  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16038145 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 16038046  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaa 329  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  16038045 ttccttgttaaggtattatgattaa 16038021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 8591967 - 8592194
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8591967 aaggctaaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 8592066  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8592067 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 8592166  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8592167 attccttgttaaggtattatgattaaat 8592194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 14985329 - 14985556
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14985329 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacca 14985428  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985429 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 14985528  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  14985529 atgccttgttaaagtattatgattaaat 14985556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 38339492 - 38339717
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38339492 ggctgaattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgtt 38339591  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38339592 gctacatttagtcctttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 38339691  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  38339692 gccttgttaaggtattatgattaaat 38339717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19088794 - 19088566
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19088794 taaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcact 19088695  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19088694 gttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatct 19088595  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19088594 tattccttgttaaggtattatgattaaat 19088566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46850114 - 46849894
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46850114 aattatctttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttactac 46850015  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46850014 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcctt 46849915  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  46849914 gttaagatattatgattaaat 46849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25182268 - 25182037
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25182268 atttaaggctaaattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 25182169  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25182168 accgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttgg 25182069  T
Q  300 tcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25182068 tcctattccttgttaagatattatgattaaat 25182037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53751352 - 53751127
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  53751352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 53751253  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  53751252 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttat 53751153  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  53751152 gccttgttaaggtattatgattaaat 53751127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21763632 - 21763406
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21763632 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 21763533  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  21763532 tactacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgttttta 21763433  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21763432 tttcttgttaaggtattatgattaaat 21763406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42855790 - 42855564
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42855790 aggctaaattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 42855691  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855690 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 42855591  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  42855590 ttcctcgttaaggtattatgattaaat 42855564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30683966 - 30683753
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  30683966 tttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttattacatttagt 30683867  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  30683866 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaagg 30683767  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  30683766 tattatgattaaat 30683753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Original strand, 50768817 - 50769046
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50768817 ttaaggcttaattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 50768916  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768917 cgttactacatttagtactttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtc 50769016  T
Q  302 ctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50769017 ttatgccttgttaaggtattatgattaaat 50769046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39448953 - 39448713
Alignment:
Q  91 taataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct 190  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39448953 taataatatttttttggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct 39448854  T
Q  191 aagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagta 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39448853 aagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagca 39448754  T
Q  291 tcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39448753 tcattttggtcttatgccttgttaaggtattatgattaaat 39448713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52557532 - 52557312
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52557532 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactac 52557433  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52557432 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtctt 52557333  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52557332 gttaaggtattatgattaaat 52557312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53259583 - 53259364
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53259583 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 53259484  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  53259483 atttagtcatttctgttagttttattcaaatacacgttagagtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcctt 53259384  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53259383 gttaaggtattatgattaaa 53259364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 624130 - 623904
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  624130 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgt 624031  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  624030 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtctta 623931  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  623930 ttccttgttaagatattatgattaaat 623904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 6711962 - 6712188
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6711962 aggctaaattatatttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 6712061  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6712062 tactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctg 6712161  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  6712162 tgccttattaagatattatgattaaat 6712188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 93 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33091916 - 33091678
Alignment:
Q  93 ataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||||| || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33091916 ataataaatataaggttaaattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaa 33091817  T
Q  193 gtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatc 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33091816 gtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatc 33091717  T
Q  293 attttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  33091716 attttggtcctatgctttgttaaggtattatgattaaat 33091678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15478095 - 15477870
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15478095 ggctaaattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15477996  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15477995 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttacgtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatat 15477896  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  15477895 gccttgttaaggtattatgattaaat 15477870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53995386 - 53995159
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53995386 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 53995287  T
Q  205 tactacatttagtcc--tttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53995286 tactacatttagtcctttttatgttagttttattcaaat-aacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcc 53995188  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53995187 tattccttgttaaggtattatgattaaat 53995159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 24898194 - 24898414
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24898194 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 24898293  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  24898294 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcacatgtctt 24898393  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24898394 gttaatgtattatgattaaat 24898414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1433722 - 1433496
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  1433722 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcactgt 1433623  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1433622 tactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 1433523  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1433522 tgccttgttatggtattatgattaaat 1433496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37206877 - 37206652
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37206877 ggctaaattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgtt 37206778  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37206777 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37206678  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  37206677 tctttgttaaggtattatgattaaat 37206652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43734724 - 43734511
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43734724 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttagt 43734625  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||      
T  43734624 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaagatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaa 43734525  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  43734524 tattatgattaaat 43734511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 12817805 - 12818031
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  12817805 aggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcactgt 12817904  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12817905 tactacatttagccctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtcata 12818004  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12818005 tgccttgttaaggtattatgattaaat 12818031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44991729 - 44991503
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44991729 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 44991630  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44991629 tattacatttagtcttttttgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 44991530  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44991529 tgccttgttaaggtattatgattaaat 44991503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23756255 - 23756025
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  23756255 tttaaggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctca 23756156  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggt 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756155 ccgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgcgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggt 23756056  T
Q  301 cctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23756055 catatgttttgttaaggtattatgattaaat 23756025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 44957388 - 44957614
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  44957388 aggctaaattatatttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 44957487  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44957488 tactgcatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 44957587  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||| ||| |||||||||||||||    
T  44957588 tgccttgataatgtattatgattaaat 44957614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50508908 - 50508682
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50508908 aggctaaattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgt 50508809  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  50508808 tactgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcata 50508709  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50508708 tgccttgttaaggtattatgattaaat 50508682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 119 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41752253 - 41752041
Alignment:
Q  119 ttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  41752253 ttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgttactacatgtagtc 41752154  T
Q  219 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||  |||| ||||||    
T  41752153 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatgccttgctaaggt 41752054  T
Q  319 attatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||    
T  41752053 attatgattaaat 41752041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41878309 - 41878084
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  41878309 aggctaaattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagtttctcactgt 41878210  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41878209 tactacatt-agtcctttctgctagttttattcaaataaatgttagggtttatgttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattttggtcata 41878111  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41878110 ttatttgttaaggtattatgattaaat 41878084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19508824 - 19508639
Alignment:
Q  145 tatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508824 tatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 19508725  T
Q  245 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaa 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19508724 cgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaa 19508639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43566792 - 43566603
Alignment:
Q  142 tggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaat 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43566792 tggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaat 43566693  T
Q  242 aaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43566692 aaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaat 43566603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36122883 - 36122658
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36122883 aggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcactgt 36122785  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36122784 tattacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatataggtcctctaactatatttattagtatcattttggtcata 36122685  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||    
T  36122684 tgccttgttaaggtattatgactaaat 36122658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 46849665 - 46849831
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46849665 ttaaggcttaattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcac 46849764  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46849765 tgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 46849831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 53994924 - 53995096
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53994924 atatatttatggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtt 53995023  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53995024 tctcaccgttactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 53995096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 42855338 - 42855501
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42855338 aggcgtaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 42855437  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42855438 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaaggttagggtttgtgttatgtgggt 42855501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 44991279 - 44991441
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44991279 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44991378  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44991379 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44991441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 16037788 - 16037956
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16037788 attttaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctc 16037887  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16037888 actgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 16037956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8592419 - 8592257
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8592419 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 8592320  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8592319 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 8592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14985783 - 14985619
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |    
T  14985783 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactg 14985684  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14985683 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 14985619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 43734284 - 43734448
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43734284 aaggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactg 43734383  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43734384 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 43734448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Original strand, 53750898 - 53751060
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53750898 ttaaagcttaattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 53750997  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750998 tgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 53751060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 15477643 - 15477807
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15477643 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcg 15477742  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15477743 ttactacatttagtccattctgttagttttattaaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 15477807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 19088344 - 19088503
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  19088344 ttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgttact 19088443  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19088444 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19088503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24898640 - 24898477
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  24898640 aggcttaattactttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccgt 24898541  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898540 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24898477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 6505533 - 6505698
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6505533 ttaaggcttaattacatttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 6505632  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6505633 tgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-gttagggtttgtgttatgtgggt 6505698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 8398031 - 8398193
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  |||    
T  8398031 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgtt 8398130  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8398131 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 108 - 266
Target Start/End: Original strand, 43566380 - 43566538
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43566380 cttaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 43566479  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43566480 tacaattagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 43566538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38339942 - 38339782
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||    
T  38339942 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgtt 38339843  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339842 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 38339782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50769269 - 50769112
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50769269 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttac 50769170  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50769169 tacatttagtcatttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtg 50769112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 36122435 - 36122595
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||    
T  36122435 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttac 36122534  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36122535 tacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36122595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 41877850 - 41878017
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41877850 atatattctaggcttagttacctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-t 41877948  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877949 tctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt 41878017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 52557089 - 52557249
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  52557089 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttac 52557188  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52557189 tacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 52557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Original strand, 30683527 - 30683686
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30683527 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 30683626  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30683627 ctacatttagtcatttctgttagtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 30683686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12818258 - 12818093
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  12818258 aaggcttacttatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattg 12818159  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtc 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12818158 ttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtc 12818093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25269452 - 25269307
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25269452 aaggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 25269353  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269352 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 25269307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 37206419 - 37206587
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37206419 tatatttttggcttaattacctttt-gatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 37206517  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37206518 ttcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 37206587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Original strand, 1433272 - 1433430
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  1433272 gcttaattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgtta 1433371  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1433372 ttacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 1433430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 25181808 - 25181974
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  25181808 ttaaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcac 25181907  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25181908 tgttattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatatgggt 25181974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 33091453 - 33091615
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  33091453 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccatt 33091552  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33091553 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 33091615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 39448490 - 39448650
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39448490 cttaattatctgtttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 39448589  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39448590 tacatttagtcctttttgttagttttatttaaataagcgttagagtttgtgttatgtgggt 39448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 21763180 - 21763343
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21763180 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgtt 21763279  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21763280 actacatttagtcatttctgtttgtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21763343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 623679 - 623841
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  623679 ggcttaattatatttttggtcctttaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgtt 623778  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  623779 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttatgttatatgggt 623841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6712413 - 6712251
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  6712413 aaggcttaattacctttttggtc-tctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaatttt-cactg 6712316  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6712315 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 6712251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 266
Target Start/End: Original strand, 20888148 - 20888303
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  20888148 aattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactgc 20888247  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20888248 atttagtcatttctgttagttttattcaaatgaatgttagggtttgtgttatgtgg 20888303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 250
Target Start/End: Original strand, 55022282 - 55022427
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  55022282 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactg 55022381  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55022382 ttactacattta-tcctttctgttagttttattaaaataaacgttag 55022427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 41751816 - 41751978
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |    
T  41751816 aaggcttaattacctttttg-tcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtctt-taagtttctcactg 41751913  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41751914 ttactacatttagtctttactgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 41751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 19508413 - 19508575
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||     
T  19508413 ggcttaattac-tttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtg 19508511  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-gggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19508512 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggggtttgtgttatgtgggt 19508575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44957807 - 44957668
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  44957807 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacattt 44957708  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaac 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44957707 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaac 44957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Original strand, 23755418 - 23755578
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  23755418 ggcttaattaacttattcgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgtt 23755517  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  23755518 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttacgtgg 23755578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44125921 - 44125774
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  44125921 aggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgt 44125822  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 252  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44125821 tattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 44125774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 268
Target Start/End: Original strand, 53259184 - 53259300
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53259184 ttggtcctctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagg 53259283  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  53259284 gtttgtgttatgtgggt 53259300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4513367 - 4513252
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4513367 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 4513268  T
Q  205 tactacatttagtcct 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  4513267 tactacatttagtcct 4513252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49136084 - 49135928
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49136084 ttaattactttttttatcgtctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttact 49135985  T
Q  209 acatttag----tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 261  Q
    ||||||||    | |||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49135984 acatttagttatttctttatgtcaattttattcaaataaacgttaggatttgtgtta 49135928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 264
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508615
Alignment:
Q  161 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 50508611  T
Q  261 atgt 264  Q
    ||||    
T  50508612 atgt 50508615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 44125624 - 44125755
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  44125624 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgttac 44125723  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaa 239  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44125724 tacatttaatcatttctgttagttttattcaa 44125755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Original strand, 47602942 - 47603088
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||    
T  47602942 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcactgt 47603041  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||    
T  47603042 tactacatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagg 47603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47603812 - 47603710
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47603812 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 47603713  T
Q  205 tac 207  Q
    |||    
T  47603712 tac 47603710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52692889 - 52692740
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  52692889 ggctaaattacctttttggtcctttagctatttaattgctatc-gattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 52692791  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||    
T  52692790 actacatttagtcatttccgttaaatttaatttaa-aaacgttagggtttgt 52692740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 52692029 - 52692122
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  52692029 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 52692122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 31214160 - 31214250
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 194  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31214160 aaggctaaattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22210266 - 22210176
Alignment:
Q  15 gacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaagatgtggagatttgaaattgattgttagtaataatatatttaa 105  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  22210266 gacaatccagcgaatccacgtgtgagcgcgaaaccgaattgtaaaaaagacgtggagatttgagatcgatcgtcagtaataatatatttaa 22210176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505761
Alignment:
Q  270 ctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaat 6505761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 55022508 - 55022424
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55022508 gcttaattatctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23755708 - 23755643
Alignment:
Q  266 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  23755708 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaat 23755643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 53591506 - 53591556
Alignment:
Q  11 cacagacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaa 61  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53591506 cacagacaatctatcgaacccacgtatgagcgtgaaatcgaattgcaaaaa 53591556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44432998 - 44432929
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44432998 tttttggtcccttaactatttagatagtatcactttggtcccttaactaaaatttgatttattttggtcc 44432929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 181
Target Start/End: Original strand, 48209946 - 48210023
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  48209946 aaggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattt 48210023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Original strand, 6356762 - 6356989
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6356762 taaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 6356861  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6356862 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttc 6356961  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaa 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6356962 tattccttgttaaggtattatgattaaa 6356989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41453450 - 41453230
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41453450 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 41453351  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41453350 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcctt 41453251  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41453250 gttaaggtattatgattaaat 41453230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 10526310 - 10526535
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10526310 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 10526409  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10526410 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc-a 10526508  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     | | ||||||||||||||||||||||    
T  10526509 atgcctgttaaggtattatgattaaat 10526535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44332969 - 44332744
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44332969 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44332870  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332869 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 44332770  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  44332769 gccttgttaaggtattatgattaaat 44332744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19681947 - 19681720
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681947 aaggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 19681848  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19681847 ttactacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 19681748  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19681747 atttcttgttaatgcattatgattaaat 19681720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Original strand, 33716600 - 33716813
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33716600 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 33716699  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33716700 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaagg 33716799  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  33716800 tattatgattaaat 33716813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 48626515 - 48626288
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||    
T  48626515 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccg 48626416  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48626415 ttgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 48626316  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48626315 attccttgttaaggtattatgattaaat 48626288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41192140 - 41191910
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  41192140 tttaatgctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctca 41192041  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggt 300  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41192040 ctgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggt 41191941  T
Q  301 cctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41191940 catatttcttattaaggtattatgattaaat 41191910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 130 - 331
Target Start/End: Original strand, 17359205 - 17359406
Alignment:
Q  130 taactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttag 229  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17359205 taactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttag 17359304  T
Q  230 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaa 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359305 ttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaa 17359404  T
Q  330 at 331  Q
    ||    
T  17359405 at 17359406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 8542498 - 8542724
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8542498 aggctaaattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgt 8542597  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8542598 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttgtgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcata 8542697  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8542698 ttccttgttaaggtattatgattaaat 8542724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31638402 - 31638168
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31638402 tatatttatggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaattt 31638303  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattt 296  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638302 ctcatcgttactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttatggtttgtgtcatgtggatcctctaactttatttattagtatcattt 31638203  T
Q  297 tggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31638202 tggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaat 31638168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 111 - 306
Target Start/End: Original strand, 1114059 - 1114254
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||     
T  1114059 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttactaa 1114158  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1114159 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattgtggtcctatt 1114254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Original strand, 6356289 - 6356510
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6356289 ttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccgttact 6356388  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 308  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6356389 acatttagtcatttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatc 6356487  T
Q  309 ttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  6356488 tcgttaagatattatgattaaat 6356510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 127 - 331
Target Start/End: Original strand, 28297840 - 28298044
Alignment:
Q  127 ctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28297840 ctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctgt 28297939  T
Q  227 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  28297940 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatgat 28298039  T
Q  327 taaat 331  Q
    |||||    
T  28298040 taaat 28298044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34037356 - 34037136
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  34037356 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttactgc 34037257  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  34037256 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatatttttt 34037157  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34037156 gttaaggtattatgattaaat 34037136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8937301 - 8937074
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8937301 aaggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 8937202  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  8937201 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcat 8937102  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8937101 attccttgttaaggtattgtgattaaat 8937074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21391640 - 21391415
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  21391640 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactctt 21391541  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21391540 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttat 21391441  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  21391440 gccttgttaaggtattatgattaaat 21391415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7579317 - 7579097
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  7579317 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttactac 7579218  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7579217 atttagtcctttattttagttatattcaaataaacgttatggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcctt 7579118  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7579117 gttaaggtattatgattaaat 7579097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28286562 - 28286342
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28286562 aattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 28286463  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  28286462 atttagttctttatattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactattcctt 28286363  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  28286362 cttaaggtattatgattaaat 28286342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 41751650 - 41751875
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41751650 ggctaaattatctttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 41751749  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41751750 actacatttaatcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctat 41751849  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  41751850 gtcttgttaagttattatgattaaat 41751875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 43247414 - 43247640
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43247414 aggctgaattatattttttgtcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 43247513  T
Q  205 tactacatttagt-cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43247514 tactacatttactccctttctattagttttattcaaataaacatta-ggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 43247612  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||    
T  43247613 atgcattgttaaggtattatgattaaat 43247640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 35146699 - 35146861
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  35146699 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 35146798  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35146799 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35146861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 48626063 - 48626222
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48626063 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 48626162  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48626163 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 48626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 28286115 - 28286279
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  28286115 aaggcttaattatatttttggtcttctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcg 28286214  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28286215 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 28286279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 21391187 - 21391350
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21391187 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 21391286  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21391287 gctactacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgg 21391350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 331
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423594
Alignment:
Q  128 tctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtt 227  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| | || ||| || |||||||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  228 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  36423491 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatc 36423590  T
Q  328 aaat 331  Q
    ||||    
T  36423591 aaat 36423594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 7578872 - 7579034
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  7578872 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaatgtt 7578971  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7578972 acttcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 7579034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 41453005 - 41453167
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41453005 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 41453104  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41453105 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatatgggt 41453167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 281
Target Start/End: Original strand, 7909285 - 7909461
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7909285 aaggtttaattacttttttg-tcctttaactatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 7909383  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7909384 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtggatcctctaactttat 7909461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 19681496 - 19681657
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19681496 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgtta 19681595  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681596 ctacatttattcctttctgttagttttagtcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19681657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6356737 - 6356573
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  6356737 aaggcttaattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 6356638  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6356637 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 6356573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35147134 - 35146923
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35147134 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 35147035  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||         |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||    
T  35147034 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttatggtttgtgtt---------ctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattcctt 35146944  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35146943 gttaaggtattatgattaaat 35146923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10526761 - 10526598
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10526761 aggcttaattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 10526662  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10526661 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaagttttgtgttatgtgggt 10526598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1114495 - 1114333
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1114495 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1114396  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1114395 actacatttactcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 1114333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36423801 - 36423657
Alignment:
Q  124 gtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttc 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36423801 gtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttc 36423702  T
Q  224 tgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36423701 tgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36423657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 8936848 - 8937011
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  8936848 aggcttaattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcacttt 8936947  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8936948 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8937011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 17749935 - 17750097
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17749935 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 17750034  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17750035 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatatgggt 17750097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31075658 - 31075485
Alignment:
Q  91 taataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct 190  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31075658 taataataaaatgaaggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctct 31075559  T
Q  191 aagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31075558 aagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 31075485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6357215 - 6357055
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  6357215 ggcttaattacatttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagtt 6357116  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6357115 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgctatgtgg 6357055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 41191683 - 41191844
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  41191683 ggcttaattaccttttta-tcctctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgtt 41191781  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191782 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41191844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 266
Target Start/End: Original strand, 31637946 - 31638103
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    
T  31637946 ttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgttact 31638045  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31638046 acatttagtcatttctgttagttttattcatataaacgttagggtttgtgttacgtgg 31638103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27739117 - 27738935
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| |||||| ||||  || || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  27739117 taaggctaaattactttttctgttctttaactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcacc 27739018  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 286  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739017 gttactatatttaatc-tttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 27738935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4931718 - 4931556
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4931718 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 4931619  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctct 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  4931618 attcagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtaagtcctct 4931556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 36673976 - 36674098
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36673976 gcttaattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 36674075  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36674076 ctacatttagtcctttctgttag 36674098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8542946 - 8542793
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||    
T  8542946 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgac 8542847  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8542846 tacatttaatcctttctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttat 8542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7909597 - 7909460
Alignment:
Q  125 tcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttct 224  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7909597 tcctctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagtcatttct 7909498  T
Q  225 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7909497 gttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 7909460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 16867707 - 16867840
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||    
T  16867707 ggctaaattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttcttactgtt 16867806  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaa 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16867807 actacatttagtcatttctgttagttttattcaa 16867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17363683 - 17363532
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||    
T  17363683 ttaattatatttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagttt--caatgttact 17363586  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17363585 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 4155597 - 4155726
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4155597 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgt 4155696  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagtttta 234  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4155697 tactatatttcgtcctttctgttagtttta 4155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28298107
Alignment:
Q  128 tctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  228 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28298147 aattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 28298107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41752102 - 41751938
Alignment:
Q  105 aggcttaattacc-tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |    
T  41752102 aggcttaattacaattttttatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatctg 41752003  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  41752002 ttaccatatttagttctttctgttagttttaatcaaataaacattagggtttatgctatgtgggt 41751938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40673378 - 40673232
Alignment:
Q  183 ggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40673378 ggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 40673279  T
Q  283 tattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||  |||||||| ||||||  |||||||    
T  40673278 tattagta--attttagtcatatgccttgttaaagtattagaattaaat 40673232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 257
Target Start/End: Original strand, 8416483 - 8416635
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  8416483 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactg 8416582  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8416583 ttactacatttagtcatttccattaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 8416635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Original strand, 41891966 - 41892111
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |  |||    
T  41891966 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttcttaatgtt 41892065  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  41892066 actacatttagtcctttctgttaaatttatttaaaaaaacgttagg 41892111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 36282786 - 36282908
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  36282786 ggctaaattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 36282885  T
Q  206 actacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||    
T  36282886 actacatttggtcttttccgtta 36282908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29277795 - 29277671
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  29277795 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactg 29277696  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    |||| | |||| |||||||||||||    
T  29277695 ttaccatatttcgtcctttctgtta 29277671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32946756 - 32946669
Alignment:
Q  141 ttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32946756 ttggtatcagattggtactctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcactgttagtacatttagtcctttctgtta 32946669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8417386 - 8417285
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  8417386 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 8417287  T
Q  206 ac 207  Q
    ||    
T  8417286 ac 8417285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 40673014 - 40673169
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||  |||||    
T  40673014 cttaattacatttttg-tcctctatctatttaattggtatc---ttgatcctctaactaaaatttaatttatttgagttctgtaagtttttcattgttac 40673109  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataa--acgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40673110 tacatttagtcctttctgttagtt---ttcaaataaacacgttaggatttgtgttatgtgggt 40673169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716872
Alignment:
Q  134 tatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagtttt 233  Q
    |||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactacatt-agtcatttatgttaatttt 33716907  T
Q  234 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33716906 gttcaaataaacgttagggttggtgttatgtgggt 33716872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17359538 - 17359479
Alignment:
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17359538 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17359479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36283651 - 36283512
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgg-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttacta 209  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||| |||||||    
T  36283651 aattacattttttgttctctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcactgttacta 36283552  T
Q  210 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 249  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||| | ||| ||||||||    
T  36283551 catttagtcatttttgttaaatttaattaaaaaaacgtta 36283512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 29276877 - 29276961
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29276877 cttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41893513 - 41893403
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41893513 ttttttgtcctttaactatttaattaatatcggattggtcatctaactaaaaatttatttatttcgattccttaagtttttcaccgttactacatttaat 41893414  T
Q  218 cctttctgtta 228  Q
    | |||| ||||    
T  41893413 cttttccgtta 41893403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28264728 - 28264587
Alignment:
Q  116 cctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacattta 215  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| || ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||   |||||||| ||||    
T  28264728 cctttttagtccattaactatttaattagtatcaatttggtcttttaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctctatgttactactttta 28264629  T
Q  216 gtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
     |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28264628 atcctttccattagttttatttaaaaaaacgttagggtttgt 28264587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36674181 - 36674095
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674181 aaggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtc--ttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 283
Target Start/End: Original strand, 38447600 - 38447682
Alignment:
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattt 283  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38447600 accgttactacatttaatcatttctttaaattttattcaaataaatatt-gggtttgtgttatgtggatcctctaactttattt 38447682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36423851 - 36423790
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaacta 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  36423851 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 236
Target Start/End: Original strand, 28263495 - 28263626
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||| |  ||||    
T  28263495 aggctaaattacttttttgatcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtaccttaaatttcttcccgt 28263594  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28263595 taccacctttagtcgtttccgttagttttatt 28263626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10625479 - 10625389
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  10625479 tatatttaaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcattttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcc 10625389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38447778 - 38447695
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  38447778 ttaattatctttttggtcctctaactatttaattgatattagattgatcc----attaaaaattgatttatttcagtcccttaagttt 38447695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38677135 - 38677053
Alignment:
Q  99 tatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  38677135 tattttaggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattt 38677053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4156634 - 4156509
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||| || | ||||||||    
T  4156634 aattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatctgtttggtaccctaactaaaatttgatttattttggtctcttaaatttctctctgttactac 4156535  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
     ||||||| |||  |||| |||||||    
T  4156534 ttttagtctttttcgttaattttatt 4156509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 29276950 - 29277026
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||    
T  29276950 ttggtcctctaattaaaaaatgatttcttttggtcctctaactttatcactgttaccatatttcgtcctttcagtta 29277026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40263697 - 40263616
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || | |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  40263697 ggctaaattacctttttggtcccttaaatatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttattttggtcc 40263616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46540070 - 46540017
Alignment:
Q  154 ggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||    
T  46540070 ggtcctctaactaaaaattgattcatttcaatcccttaagtttctcaccgttac 46540017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35086128 - 35086052
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatt 180  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||   |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35086128 aaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcccttaactaaaatttgatttatt 35086052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5900875 - 5900648
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5900875 aaggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 5900776  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5900775 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcct 5900676  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5900675 attccttgttaaggtattatgattaaat 5900648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10506398 - 10506173
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  10506398 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 10506299  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10506298 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 10506199  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  10506198 gccttgttaaggtattatgattaaat 10506173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 108 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1994616 - 1994394
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1994616 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 1994517  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1994516 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattc 1994417  T
Q  308 cttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  1994416 cttgttaa-gaattatgattaaat 1994394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 96 - 331
Target Start/End: Original strand, 42591774 - 42592009
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42591774 atatattgatggctaaattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtt 42591873  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 295  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42591874 tctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 42591973  T
Q  296 ttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42591974 ttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaat 42592009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 54108352 - 54108127
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  54108352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgtt 54108253  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54108252 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 54108153  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  54108152 gtcttgttaaggtattatgattaaat 54108127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4757945 - 4757733
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4757945 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 4757846  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4757845 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttct 4757746  T
Q  304 atttcttgttaag 316  Q
    ||| |||| ||||    
T  4757745 attccttgataag 4757733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 47669264 - 47669484
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47669264 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 47669363  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  47669364 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 47669463  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  47669464 gttaagatattatgattaaat 47669484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32633517 - 32633290
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32633517 aaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 32633418  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32633417 ttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 32633318  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32633317 atttcttgttaagatattatgattaaat 32633290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 39241363 - 39241583
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39241363 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39241462  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39241463 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtctt 39241562  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39241563 gttaaggtattatgattaaat 39241583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 117 - 331
Target Start/End: Original strand, 53716305 - 53716518
Alignment:
Q  117 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttag 216  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  53716305 cttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactatatttgg 53716404  T
Q  217 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53716405 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttacgtggg-cctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaag 53716503  T
Q  317 gtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||    
T  53716504 gtattatgattaaat 53716518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8474291 - 8474071
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8474291 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgttactac 8474192  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  8474191 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcttt 8474092  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8474091 gttaaggtattatgattaaat 8474071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Original strand, 44893733 - 44893965
Alignment:
Q  99 tatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttt 198  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44893733 tatttatggctaaattatctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttct 44893832  T
Q  199 caccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44893833 caccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 44893932  T
Q  299 gtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  44893933 gtcatatgtcttgttaagatattatgatcaaat 44893965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 4773241 - 4773467
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4773241 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 4773340  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773341 ttactatatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 4773439  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  4773440 atatctcgttaagatattatgattaaat 4773467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26318634 - 26318407
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26318634 aaggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccg 26318535  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26318534 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 26318435  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26318434 attctttgttaaggtattatgattaaat 26318407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39664639 - 39664409
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39664639 tttatggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctca 39664540  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggt 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664539 ccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggt 39664440  T
Q  301 cctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39664439 tctatgccttgttaaggtattatgattaaat 39664409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 21969634 - 21969854
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21969634 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21969733  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  21969734 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcctt 21969833  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  21969834 gttaaggtattatgtttaaat 21969854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 21992070 - 21992290
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21992070 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 21992169  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  21992170 atttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttattcctt 21992269  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  21992270 gttaaggtattatgtttaaat 21992290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 29818182 - 29818402
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  29818182 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttactac 29818281  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29818282 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtttt 29818381  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  29818382 attaaggtattatgattaaat 29818402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 331
Target Start/End: Original strand, 22201610 - 22201841
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22201610 atttaaggttaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctc 22201709  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22201710 accgttactacatttagtcctttctgttaggtttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgg 22201809  T
Q  300 tcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22201810 tcatatgccttgttaaggtattatgattaaat 22201841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 16931605 - 16931831
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagtt-ggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16931605 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttggta-cggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 16931703  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16931704 ttactacatttagtcctttctgttagttttatacaaatatacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 16931803  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    
T  16931804 atgtcttgttaaggtattaagattaaat 16931831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 22151843 - 22152070
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22151843 aaggctaaattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccg 22151942  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22151943 ttactacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaacgatagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 22152042  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22152043 attcattgttaaggtattatgattaaat 22152070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 54752163 - 54752388
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  54752163 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgtt 54752262  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54752263 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 54752362  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  54752363 tctttgttaaggtattatgattaaat 54752388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12203996 - 12203777
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12203996 aattaccgttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 12203897  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  12203896 atttagtcctttctgatagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaatatgtttt 12203797  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12203796 gttaaggtattatgattaaa 12203777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 15986235 - 15986459
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15986235 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986334  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15986335 actgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtccta- 15986433  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15986434 ttcgtgttaaggtattatgattaaat 15986459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 11256102 - 11256328
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||| |||    
T  11256102 aggcttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagtttctcatcgt 11256201  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11256202 tactacatttagtcctttttgatagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 11256301  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11256302 tgccttgttaaggtattatgattaaat 11256328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18464455 - 18464681
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18464455 aggctaaattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 18464554  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18464555 tactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcata 18464654  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||    
T  18464655 tgcattgttaaggtattatggttaaat 18464681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 24428566 - 24428792
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  24428566 aggctaaattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgt 24428665  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24428666 tactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttgggatttgtgttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctccta 24428765  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  24428766 tgccttcttaaggtattatgattaaat 24428792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 21568746 - 21568970
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21568746 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 21568845  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21568846 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt-ggtcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatat 21568944  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  21568945 gccttgttaagatattatgattaaat 21568970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Original strand, 27801501 - 27801714
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |    
T  27801501 tttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactagatttatt 27801600  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  27801601 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgttaaag 27801700  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  27801701 tattatgattaaat 27801714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 46152614 - 46152838
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  46152614 aggctaaattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccat 46152713  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46152714 cactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatctgg--catctaactttatttattagtatcattttggtcata 46152811  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  46152812 ttccttgttaaggtattatgattaaat 46152838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 119 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51509555 - 51509344
Alignment:
Q  119 ttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtc 218  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51509555 tttttgtcctccaactatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagtc 51509457  T
Q  219 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggt 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51509456 ttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggt 51509357  T
Q  319 attatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||    
T  51509356 attatgattaaat 51509344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47303463 - 47303244
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  47303463 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcaccgttact 47303364  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |    
T  47303363 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt--tgttatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatcatatgcc 47303267  T
Q  309 ttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  47303266 ttattaaggtattatgattaaat 47303244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28986597 - 28986397
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28986597 attttaggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 28986498  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 299  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986497 actgttacta-atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgagtcctctaactttatttattagtatcattttgg 28986399  T
Q  300 tc 301  Q
    ||    
T  28986398 tc 28986397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 39664181 - 39664346
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39664181 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 39664280  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664281 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 39664346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54752617 - 54752451
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  54752617 ttaagccttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcat 54752518  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54752517 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54752451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42592235 - 42592074
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42592235 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 42592136  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42592135 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgg 42592074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41835371 - 41835151
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41835371 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 41835272  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41835271 atttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttacatgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 41835172  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  41835171 gttaatgtattttgattaaat 41835151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 51509118 - 51509281
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51509118 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 51509217  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51509218 tcctacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 51509281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24429017 - 24428855
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24429017 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 24428918  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428917 actacatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24428855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 1994167 - 1994331
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1994167 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 1994266  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1994267 ttgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1994331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 1999326 - 1999490
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1999326 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccg 1999425  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1999426 ttgctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1999490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27801941 - 27801777
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27801941 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 27801842  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801841 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 27801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 54107900 - 54108064
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54107900 aaggctttattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 54107999  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54108000 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54108064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Original strand, 26318182 - 26318341
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26318182 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 26318281  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26318282 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 26318341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18464910 - 18464744
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18464910 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcac 18464811  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18464810 cgttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 18464744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 39951356 - 39951582
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||    
T  39951356 aggctaaattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcatcgt 39951455  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39951456 tactatatttagttctttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcattttggtcata 39951555  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  39951556 tgccttgttaagatattatgattaaat 39951582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47669709 - 47669548
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47669709 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47669610  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47669609 actacatttagtccttactgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 47669548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 5900413 - 5900585
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5900413 atattttttaggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtt 5900512  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5900513 tctcaccgttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 5900585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29818625 - 29818465
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29818625 cttaattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 29818526  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29818525 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggt 29818465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 4757493 - 4757656
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  4757493 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccat 4757592  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757593 tactacatttattcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 4757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 10505951 - 10506110
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10505951 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattact 10506050  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10506051 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatatgggt 10506110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21569196 - 21569033
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21569196 aggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 21569097  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21569096 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 21569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45307142 - 45306991
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45307142 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45307043  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307042 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaatgttagggtttgt 45306991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15986684 - 15986526
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15986684 ggcttaattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986585  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986584 actacatttagtcctttcaataagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 15986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22202066 - 22201904
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22202066 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 22201967  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22201966 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtgggt 22201904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11256554 - 11256392
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11256554 aggcgtaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgt 11256455  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 267  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11256454 tactaaatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtggg 11256392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22152298 - 22152133
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactat--ttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||     
T  22152298 aggcttaattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctcact 22152199  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22152198 gttactacatttagtcgtttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 22152133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44894192 - 44894030
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44894192 aaggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccg 44894093  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44894092 ttactacatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacattagagtttgtgttatgtgg 44894030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53716744 - 53716581
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |    
T  53716744 aggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatcat 53716645  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53716644 tactacatttagtcatttatgttagttttattcaaattaacgttagggtttgtgttatgtgggt 53716581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21970079 - 21969917
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactat--ttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  21970079 cttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtt 21969980  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969979 actacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21969917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21992515 - 21992353
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactat--ttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  21992515 cttaattacatttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgtt 21992416  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21992415 actacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21992353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 12203551 - 12203713
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12203551 ggcttaattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12203650  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12203651 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 12203713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12791626 - 12791473
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12791626 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgtt 12791527  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12791526 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgt 12791473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16932055 - 16931903
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16932055 gcttaattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgtta 16931956  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16931955 ctacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagagtttgtgt 16931903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4773693 - 4773530
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  4773693 aggcttaatcatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgt 4773594  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4773593 tactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 4773530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 268
Target Start/End: Original strand, 41834957 - 41835088
Alignment:
Q  137 ttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41834957 ttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagttgtatt 41835056  T
Q  237 caaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41835057 taaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41835088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 8473865 - 8474005
Alignment:
Q  125 tcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  8473865 tcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttct 8473964  T
Q  225 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8473965 gttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 8474005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Original strand, 13866012 - 13866171
Alignment:
Q  98 atatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  13866012 atatttaaggattaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagttta 13866111  T
Q  198 tcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  13866112 tcaccgttactatatttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 13866171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44317665 - 44317514
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44317665 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 44317566  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  44317565 actatatttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 44317514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 47303018 - 47303181
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||   ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47303018 aggcttaattacttttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 47303117  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47303118 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 47303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 251
Target Start/End: Original strand, 45306827 - 45306977
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45306827 tttatggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctca 45306926  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45306927 ctgttactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagg 45306977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19883695 - 19883528
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19883695 attttagggttaattaccttttta-tcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctc 19883597  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || ||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19883596 acagttactacatttaatcgtttttattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19883528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Original strand, 49528148 - 49528300
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49528148 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgt 49528247  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  49528248 tactatatttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 49528300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7681578 - 7681447
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7681578 ttaaggctaaattacacttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 7681479  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7681478 ccgttactacattcagtcctttctgttagttt 7681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 217
Target Start/End: Original strand, 28985509 - 28985620
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28985509 ggcttaattacccttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtt 28985608  T
Q  206 actacatttagt 217  Q
    | ||||||||||    
T  28985609 attacatttagt 28985620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46153032 - 46152904
Alignment:
Q  134 tatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagtttt 233  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  46153032 tatttagttggtatcgaattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcac---tactacatttagtcatttatgttagtttt 46152936  T
Q  234 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46152935 attcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtg 46152904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Original strand, 15790684 - 15790796
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||    
T  15790684 aattatctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgttactac 15790783  T
Q  211 atttagtcctttc 223  Q
    |||||||||||||    
T  15790784 atttagtcctttc 15790796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241646
Alignment:
Q  173 gatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 39241646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 7163463 - 7163568
Alignment:
Q  119 ttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7163463 ttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactacatttagtc 7163562  T
Q  219 ctttct 224  Q
    ||||||    
T  7163563 ctttct 7163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Original strand, 19883359 - 19883464
Alignment:
Q  226 ttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatga 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19883359 ttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtaccttaactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatga 19883458  T
Q  326 ttaaat 331  Q
    ||||||    
T  19883459 ttaaat 19883464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30681868 - 30681752
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  30681868 aggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgt 30681769  T
Q  205 tactacatttagtcctt 221  Q
    ||| | |||| ||||||    
T  30681768 taccatatttcgtcctt 30681752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20963676 - 20963525
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || | ||    
T  20963676 aggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctctctgt 20963577  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  20963576 tacttcttttagtcctttccgttagttttatt-aaaaaaaagttaggatttgt 20963525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Original strand, 32633143 - 32633227
Alignment:
Q  184 gtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32633143 gtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgatatgtgggt 32633227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15791555 - 15791434
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15791555 aggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggat-----ctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 15791461  T
Q  205 tactac---atttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||    
T  15791460 tactacaatatttagtcctttccgtta 15791434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 30681028 - 30681148
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  30681028 aggcttaattacatttttggtcatctaactatttaattggtaacggtttggttctctaactaaaaaaatatttattttggtcctctaactttatcaccgt 30681127  T
Q  205 tactacatttagtcctttctg 225  Q
    ||| | |||| ||||||||||    
T  30681128 taccatatttcgtcctttctg 30681148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Original strand, 42853245 - 42853331
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853245 aggctaaattacctttttggtc-tctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Original strand, 28986261 - 28986322
Alignment:
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28986261 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 28986322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39951748 - 39951645
Alignment:
Q  161 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    |||| |||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  39951748 taactaaaaattgatttatttcaattctctaagtttttcaacgttattacatttagtcatttct----gtttcattcgaataaacattaggttttgagtt 39951653  T
Q  261 atgtgggt 268  Q
    ||||||||    
T  39951652 atgtgggt 39951645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49529194 - 49529076
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| ||||||    
T  49529194 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgttactacttttagt 49529095  T
Q  218 cctttctgttagttttatt 236  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  49529094 cctttccgttaattttatt 49529076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13867038 - 13866920
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||||||| |||| |    
T  13867038 tttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctcagttactacttttaat 13866939  T
Q  218 cctttctgttagttttatt 236  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  13866938 cctttccgttaattttatt 13866920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43844473 - 43844384
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| || |||||||    
T  43844473 tttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctctccgttac 43844384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 236
Target Start/End: Original strand, 44316626 - 44316756
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||| || ||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | ||    
T  44316626 aggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttagtcccctaactaaaatttgatttattt-ggtcccttaaatttctctctgt 44316724  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  44316725 tactacttttagtcctttccgttaattttatt 44316756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Original strand, 43839984 - 43840041
Alignment:
Q  130 taactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    |||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43839984 taactatttaattagtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcc 43840041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Original strand, 4858128 - 4858175
Alignment:
Q  15 gacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaa 62  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4858128 gacaattcagcgaacccacgtatgagcgccaaaccgaattgcaaaaaa 4858175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8327814 - 8327680
Alignment:
Q  117 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttag 216  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||| | |||||||  |||||| |  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||   ||||| ||||||||    
T  8327814 ctttttgatcccttaactatttatttggtatcggtttggtcccttaactatattttgatttattttggtcctttaaatttatctttgttaccacatttag 8327715  T
Q  217 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    |  ||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  8327714 ttatttctattagttttaatagaagaaacgttagg 8327680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 42853374 - 42853340
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42853374 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagt 42853340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12481510 - 12481284
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12481510 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 12481411  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12481410 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 12481311  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  12481310 ttccttgttaaggtattatgattaaat 12481284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45053141 - 45052914
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  45053141 aaggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtg 45053042  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45053041 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 45052942  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45052941 atgccttgttaaggtattatgattaaat 45052914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 37304027 - 37304253
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37304027 aggctaaattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgt 37304126  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37304127 tactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 37304226  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  37304227 tgccttgttaaggtattatgattaaat 37304253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35612527 - 35612307
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35612527 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttactac 35612428  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35612427 atttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtctgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtctt 35612328  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35612327 gttaaggtattatgattaaat 35612307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1763126 - 1762899
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  1763126 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcg 1763027  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1763026 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 1762927  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  |||||||| || || |||||||||    
T  1762926 atgccttgttaaagtgttctgattaaat 1762899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 16023897 - 16024122
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16023897 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16023996  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16023997 actacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 16024096  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      |||||| |||||||||||||||||    
T  16024097 gccttgttgaggtattatgattaaat 16024122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27548119 - 27547894
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27548119 ggctaaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27548020  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27548019 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatggtatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactat 27547920  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
       ||||||| |||||||||||||||    
T  27547919 gctttgttaaagtattatgattaaat 27547894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49140592 - 49140368
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  49140592 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgtt 49140494  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49140493 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatat 49140394  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  49140393 tccttgttaaggtattatgattaaat 49140368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23476793 - 23476566
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  23476793 aaggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattg 23476694  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23476693 ttacttcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 23476594  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  23476593 atgtcttgttaaggtattatgattaaat 23476566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Original strand, 3089339 - 3089567
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3089339 taaggctaaattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 3089438  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  3089439 gttattacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtca 3089538  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3089539 tatgtcttgttaaagtattatgattaaat 3089567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6798252 - 6798032
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  6798252 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttactac 6798153  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  6798152 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 6798053  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6798052 gttaaggtattatgattaaat 6798032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Original strand, 20306005 - 20306227
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  20306005 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccaccgttatt 20306104  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 308  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  20306105 acatttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 20306204  T
Q  309 ttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20306205 ttgttaaggtattatgattaaat 20306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Original strand, 25995780 - 25996009
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25995780 ttaaggataaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcac 25995879  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25995880 tgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttgagatttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtc 25995979  T
Q  302 ctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  25995980 ctatgccttgttaaggtaatatgattaaat 25996009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 37576181 - 37576406
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  37576181 ggctaaattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagtt 37576280  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37576281 actaaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctat 37576380  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    
T  37576381 tccttgttaaggtattaggattaaat 37576406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8762852 - 8762624
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8762852 taaggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatc 8762753  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8762752 ggtactacatttagtcctttctgttagctttattcaaataaacgttaagagttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 8762653  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8762652 tatgtcttgttaaggtattatgaataaat 8762624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 107 - 331
Target Start/End: Original strand, 38127710 - 38127934
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38127710 gcttaattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtta 38127809  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatt 306  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38127810 ctatatttagtccttgctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 38127909  T
Q  307 tcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  38127910 ccttattaaggtattatgattaaat 38127934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2064662 - 2064436
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  2064662 aggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgt 2064563  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2064562 tactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 2064463  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  2064462 tgtcttgttaaggtattatgattaaat 2064436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 111 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45843562 - 45843368
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45843562 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 45843463  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45843462 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttggtcctat 45843368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 49644121 - 49643896
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    || |    
T  49644121 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtttccatccat 49644022  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49644021 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-ggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttgatccta 49643923  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  49643922 tgccttgttaaggtattatgattaaat 49643896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12127501 - 12127278
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggt---cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12127501 aattacattttttatcctctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgttac 12127402  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12127401 tacatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattc 12127302  T
Q  308 cttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12127301 cttgttaaggtattatgattaaat 12127278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 31703660 - 31703839
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31703660 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggg 31703759  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31703760 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaat 31703839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9006641 - 9006416
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |    
T  9006641 aggctaaattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctcacc-t 9006543  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006542 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 9006443  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||    
T  9006442 tgccttgttaatgtattatgattaaat 9006416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4330282 - 4330062
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  4330282 aattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttactac 4330183  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  4330182 atttagtcctttctcttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattcctt 4330083  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  4330082 gttaaggtattatggttaaat 4330062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37285177 - 37284953
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||  ||    
T  37285177 ggctaaattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaatt 37285078  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37285077 actacatttagtcctta-tgttagttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37284979  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  37284978 gccttgttaaggtattatgattaaat 37284953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37586138 - 37585918
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37586138 aattatcttttttgtcatctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgttactac 37586039  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  37586038 atttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttatattatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtctt 37585939  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  37585938 gttaagatattatgattaaat 37585918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 49140141 - 49140305
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49140141 aaggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 49140240  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49140241 ttactacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 49140305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37576631 - 37576469
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  37576631 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 37576532  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37576531 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 37576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 12481060 - 12481221
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12481060 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12481159  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12481160 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12481221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44323109 - 44322948
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44323109 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 44323010  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44323009 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44322948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 12127052 - 12127216
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12127052 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 12127151  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12127152 ccgtttctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 12127216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16024350 - 16024185
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16024350 taaggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 16024251  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16024250 gttactacatttagtcctttctggtagttttattcaaataaacgttagggtttatgttatgtgggt 16024185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 49643674 - 49643833
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49643674 ttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 49643773  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49643774 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 49643833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 26707195 - 26707358
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26707195 aggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccgt 26707294  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26707295 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttggagtttgtgttatgtgggt 26707358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 23476341 - 23476503
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23476341 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 23476440  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23476441 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatctgtgttatgtgggt 23476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 27547669 - 27547831
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27547669 ggcttaattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27547768  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27547769 aatacatttagtcctttctgttggttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatgtgggt 27547831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39486645 - 39486444
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    |||||| ||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||    
T  39486645 taaggcataattacttttttaatcatctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttacc 39486546  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486545 gttactacatttagtcctttcagttagttttattcaaa-aaacgttagggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 39486447  T
Q  303 tat 305  Q
    |||    
T  39486446 tat 39486444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 9006189 - 9006353
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9006189 aaggtttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccg 9006288  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9006289 ttagtacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9006353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400649
Alignment:
Q  165 taaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27400716  T
Q  265 gggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27400715 gggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaat 27400649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37304466 - 37304316
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37304466 tttttggccctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 37304367  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37304366 cctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 37304316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 4696880 - 4697044
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  4696880 aaggctaaattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactg 4696979  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4696980 ttactacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 4697044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20306454 - 20306290
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  20306454 aaggcttaattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactg 20306355  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20306354 ttactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 20306290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26723252 - 26723092
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26723252 aggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 26723153  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26723152 tattacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtg 26723092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 35612085 - 35612241
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  35612085 ttaattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttact 35612184  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35612185 acatttagtcctttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35612241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 8760271 - 8760434
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8760271 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtgt 8760370  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8760371 tactacatttagtcatttatgttagctttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 8760434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 1762674 - 1762836
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  1762674 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1762773  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1762774 acaacatttaatcatttatgttagttttattcaaataaacattagggtttgtattatgtgggt 1762836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31704063 - 31703901
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||    
T  31704063 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgtt 31703964  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  31703963 actacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaacgttaggctttatgttatatgggt 31703901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Original strand, 38000492 - 38000645
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  38000492 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttact 38000591  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38000592 acatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 38000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 6797809 - 6797969
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6797809 cttaattacttttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6797908  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6797909 tccatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6797969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 37585696 - 37585851
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  37585696 ttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttatt 37585795  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37585796 atatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgt 37585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Original strand, 45052689 - 45052849
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  45052689 aggcttaattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactgt 45052788  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45052789 tactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttt-tgttatgtgg 45052849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Original strand, 37284740 - 37284886
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37284740 tttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttagt 37284839  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37284840 cttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgt 37284886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Original strand, 39486207 - 39486364
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |    
T  39486207 aattatctttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcacatttactgc 39486306  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39486307 atttggtcttttctgttagttctattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 39486364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 257
Target Start/End: Original strand, 10831124 - 10831281
Alignment:
Q  99 tatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttt 198  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  10831124 tattaaaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagttttt 10831223  T
Q  199 caccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10831224 caccgttactacatttagtccttttcgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 10831281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 245
Target Start/End: Original strand, 23598071 - 23598213
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23598071 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcaccgt 23598170  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttt--tattcaaataaac 245  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23598171 tactacatttagtcatttttgttagttttatattcaaataaac 23598213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46593694 - 46593559
Alignment:
Q  92 aataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta 191  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46593694 aataatttattttaggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-ta 46593596  T
Q  192 agtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  46593595 agtttctcactgttactatatttagtcatttccgtta 46593559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34967173 - 34967050
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34967173 aggctaaattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctcaccgt 34967074  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||    
T  34967073 tactatatttagtcatttccgtta 34967050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 32047742 - 32047865
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||    
T  32047742 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaacttcatcaccgt 32047841  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||| | |||| || ||||||||||    
T  32047842 taccatatttcgttctttctgtta 32047865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5537242 - 5537132
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||    
T  5537242 tttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcactgttactacatttagt 5537143  T
Q  218 cctttctgtta 228  Q
    | |||| ||||    
T  5537142 catttccgtta 5537132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 34966308 - 34966425
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||| |    
T  34966308 aattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcactgttactgc 34966407  T
Q  211 atttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  34966408 atttagtcttttatgtta 34966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37467670 - 37467554
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||    
T  37467670 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcactgtt 37467571  T
Q  206 actacatttagtccttt 222  Q
    ||||||||  |||||||    
T  37467570 actacattcggtccttt 37467554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Original strand, 5536397 - 5536520
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||| |||    
T  5536397 aggctaaattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgt 5536496  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5536497 tactacatttagtcctttccgtta 5536520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 46592817 - 46592959
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||| |    
T  46592817 aattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcactgttactgc 46592916  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 254  Q
    |||||||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||    
T  46592917 atttagtcatttccgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtt 46592959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13109277 - 13109191
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109277 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10832031 - 10831935
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  10832031 aattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttac 10831935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 331
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322885
Alignment:
Q  262 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaat 44322885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707421
Alignment:
Q  261 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaat 26707421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4697172 - 4697107
Alignment:
Q  266 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4697172 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaat 4697107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4697244 - 4697163
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    ||||||||||||  | | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697244 aattacctttttaattcgctatctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 4697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 28884011 - 28884139
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||    
T  28884011 attttaggtttaattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatc 28884110  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    || ||||| | ||||  || |||||||||    
T  28884111 actgttaccatatttcatcatttctgtta 28884139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28884871 - 28884751
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||    
T  28884871 cttaattgcttttttggtcctctaactatttaattggttacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttagtcctctaactttatcactgttac 28884772  T
Q  208 tacatttagtcctttctgtta 228  Q
     | |||| |||||||||||||    
T  28884771 catatttcgtcctttctgtta 28884751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32048630 - 32048510
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||    
T  32048630 cttaattacttttttggtcctctaactatttatttgataacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttatttttgtcctctaactttatcacagttac 32048531  T
Q  208 tacatttagtcctttctgtta 228  Q
     | ||||  ||||||||||||    
T  32048530 catatttcatcctttctgtta 32048510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 49837417 - 49837493
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49837417 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttccgtta 49837493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 13183766 - 13183852
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183766 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25996130 - 25996072
Alignment:
Q  210 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25996130 catttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25996072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Original strand, 46289327 - 46289397
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttat 179  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46289327 ttaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49838835 - 49838756
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtc 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49838835 ggctaaattacctttttgg-cctttaattatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 249
Target Start/End: Original strand, 37466800 - 37466943
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| |||||  | ||||||  ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||  |    
T  37466800 aaggctaaattacattttttattctctaatcatttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtc--ccaagtttttcattg 37466897  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||||    
T  37466898 ttactacatttagtcttttctgttaaatttaattaaaaaaacgtta 37466943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52412986 - 52412903
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  52412986 aaggctaaattacatttttggtcccttaactatttaggtggtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcc 52412903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10550837 - 10550790
Alignment:
Q  15 gacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaa 62  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10550837 gacaatccagcaaacccacgtatgagcacgaaaccgaattgcaaaaaa 10550790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 46015809 - 46015766
Alignment:
Q  212 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttt 255  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  46015809 tttagtcctttccgttaattttattcaaaaaaacgttagggttt 46015766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Original strand, 25088007 - 25088097
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  25088007 tatattttaggctaaattgcatttttggtcccttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaactaaaattcgatttattttggtcc 25088097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 27308653 - 27308699
Alignment:
Q  16 acaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  27308653 acaatccagtgaacccacatatgagcgtgaaacggaattgcaaaaaa 27308699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Original strand, 10824445 - 10824494
Alignment:
Q  183 ggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 232  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10824445 ggtcctctatgttttgctccgttactagttttagtcctttctgttagttt 10824494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Original strand, 28970416 - 28970500
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||   |||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  28970416 taaggctaaattgcatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcc 28970500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 37189444 - 37189492
Alignment:
Q  183 ggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagtt 231  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37189444 ggtcctctatgttttgctccgttactagttttagtcctttctgttagtt 37189492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 103 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27473524 - 27473296
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27473524 taaggctaaattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacc 27473425  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27473424 gttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtct 27473325  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27473324 tattccttgttaaggtattatgattaaat 27473296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33296135 - 33295909
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33296135 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 33296036  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33296035 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 33295936  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  33295935 ttccttgttaaggtattatgattaaat 33295909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 15048399 - 15048624
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15048399 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 15048498  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15048499 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 15048598  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  15048599 tatttgttaaggtattatgattaaat 15048624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 38588586 - 38588812
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38588586 aaggctaaattaccttttcg-tcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 38588684  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588685 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 38588784  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38588785 atgccttgttaaggtattatgattaaat 38588812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45277050 - 45276821
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45277050 ttaaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcac 45276951  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45276950 cgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 45276851  T
Q  302 ctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45276850 atattccttgttaaagtattatgattaaat 45276821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 7949417 - 7949637
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7949417 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 7949516  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  7949517 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcctt 7949616  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7949617 gttaaggtattatgattaaat 7949637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 96 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1652031 - 1651797
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1652031 atatttttaaggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 1651932  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1651931 tctcaccgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcatt 1651833  T
Q  296 ttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1651832 ttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaat 1651797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 96 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1740407 - 1740173
Alignment:
Q  96 atatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740407 atatttttaaggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 1740308  T
Q  196 tttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1740307 tctcaccgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcatt 1740209  T
Q  296 ttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1740208 ttggtcatatatctcgttaagatattatgattaaat 1740173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15872071 - 15871846
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15872071 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 15871972  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871971 actacatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgttagagcttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 15871872  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  15871871 gtcttgttaaggtattatgattaaat 15871846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45077654 - 45077428
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  45077654 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgt 45077555  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45077554 tactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 45077455  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  45077454 tgccttgttaaggtattatgattaaat 45077428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 1432136 - 1432356
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1432136 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1432235  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||    
T  1432236 atttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgcctt 1432335  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  1432336 gttaatgtattatgtttaaat 1432356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1646957 - 1646732
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1646957 aggcttaattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 1646858  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1646857 tactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 1646759  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  1646758 tatctcgttaagatattatgattaaat 1646732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7535285 - 7535058
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7535285 aaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcg 7535186  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7535185 ttactacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtctt 7535086  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  7535085 attcctcgttaacgtattatgattaaat 7535058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44595050 - 44594826
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44595050 ggctaaattatctttttg-tcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 44594952  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44594951 actacatttagtcatttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctat 44594852  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  44594851 gtcttgttaaggtattatgattaaat 44594826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11174079 - 11173859
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11174079 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 11173980  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||    
T  11173979 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttagattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgcttt 11173880  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  11173879 gttaaggtattatgaataaat 11173859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5435350 - 5435125
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5435350 ggctaaattatctttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 5435251  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5435250 actacatttagtcacttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatat 5435151  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      || ||||||||||||| |||||||    
T  5435150 gcctagttaaggtattataattaaat 5435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5152978 - 5152759
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5152978 aattacctttttg-tcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattac 5152880  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  5152879 atttagttttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatgcctt 5152780  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5152779 cttaaggtattatgattaaat 5152759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34470994 - 34470832
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34470994 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 34470895  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34470894 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 34470832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 106 - 323
Target Start/End: Original strand, 1869934 - 1870150
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1869934 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 1870032  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1870033 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgaattgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttat 1870132  T
Q  306 ttcttgttaaggtattat 323  Q
      ||| |||| |||||||    
T  1870133 gccttattaatgtattat 1870150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 331
Target Start/End: Original strand, 27669440 - 27669641
Alignment:
Q  130 taactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttag 229  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27669440 taactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtacatttagtcctttctgttag 27669539  T
Q  230 ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaa 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||    
T  27669540 ttttattgaaataaacgttagggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaa 27669639  T
Q  330 at 331  Q
    ||    
T  27669640 at 27669641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15048847 - 15048690
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15048847 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 15048748  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15048747 tacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 15048690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 37569313 - 37569476
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37569313 aggcttgattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 37569412  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37569413 tactacatttagtcatttctgttagttttattcgaataaacgttatggtttttgttatgtgggt 37569476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 33819783 - 33819947
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33819783 aaggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 33819882  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33819883 ttactacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 33819947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Original strand, 1646492 - 1646663
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646492 tatattttaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 1646591  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  1646592 ctcactgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 1646663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 45276597 - 45276759
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45276597 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 45276696  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45276697 actacatttagtcatttatattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 45276759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 5434902 - 5435062
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5434902 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttac 5435001  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435002 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5435062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1870387 - 1870224
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  1870387 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaag 1870288  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870287 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 1870224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 5152536 - 5152696
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  5152536 gcttaattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgtta 5152634  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5152635 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5152696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Original strand, 11707743 - 11707912
Alignment:
Q  99 tatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttt 198  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  11707743 tattttaggcttaattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttct 11707842  T
Q  199 caccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11707843 cactgttaatacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 11707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 27473072 - 27473233
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27473072 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca-cgtt 27473170  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  27473171 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacattatgatttgtgttatgtgggt 27473233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40660333 - 40660179
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40660333 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 40660234  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 263  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40660233 atatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 40660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 15871621 - 15871783
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||    
T  15871621 ggcttaattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgtt 15871720  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15871721 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15871783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Original strand, 1739952 - 1740110
Alignment:
Q  110 taattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  1739952 taattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttatta 1740051  T
Q  210 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  1740052 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaagatttgtgctatgtgggt 1740110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38589035 - 38588875
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38589035 cttaattatttttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 38588936  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38588935 tagatttagtcctttatgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 38588875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40048501 - 40048342
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  40048501 ttaattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgttact 40048402  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40048401 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 40048342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Original strand, 40659983 - 40660143
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  40659983 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 40660082  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660083 actacatttagtcttttctaatagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 40660143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37569752 - 37569541
Alignment:
Q  119 ttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtc 218  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||    
T  37569752 ttttgatcttctaagtatttaattgatatcggattgatcatctaattaaaaatttatttattttggtcctctaaatttctcgttgttactatatttagtc 37569653  T
Q  219 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggt 318  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37569652 ttttcagttagttttattcaaataaacgttagagtttatgctacgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggt 37569553  T
Q  319 attatgattaaa 330  Q
    ||||||||||||    
T  37569552 attatgattaaa 37569541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22763384 - 22763232
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  22763384 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 22763285  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  22763284 tactacatttagtcttttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagggtttgt 22763232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27669868 - 27669709
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||| ||||    
T  27669868 gcttaattatcttttta-tcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgatctt-taagtttcacactgtta 27669771  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27669770 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataatcattagggtttgtgttatgtgggt 27669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298488
Alignment:
Q  174 atttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctct 273  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgagtcctct 18298512  T
Q  274 aactttatttattagtatcatttt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18298511 aactttatttattagtatcatttt 18298488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 40048067 - 40048280
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| |        |||    
T  40048067 ggctaaattacttttttgataatctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctctaact--------gtt 40048158  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40048159 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgt----cctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 40048254  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  40048255 tcattgttaaggtattatgattaaat 40048280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 232
Target Start/End: Original strand, 33295739 - 33295862
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  33295739 ttaatgacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcaccgttatt 33295838  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttt 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  33295839 acatttagtcatttctgttagttt 33295862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 44594604 - 44594763
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||    
T  44594604 ttaattacatttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttact 44594703  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  44594704 acatttagttatttctgttagttttattcatataaacattagagtttgtgctatgtgggt 44594763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 45077221 - 45077364
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  45077221 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta-------------- 45077306  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
         |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45077307 -----atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggt 45077364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 7534845 - 7534995
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||         
T  7534845 ttaattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccg----- 7534939  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7534940 ----ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 7534995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24666129 - 24666006
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  24666129 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgt 24666030  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    ||| | |||| |||||||||||||    
T  24666029 taccatatttcgtcctttctgtta 24666006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11920223 - 11920136
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920223 aggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11708067 - 11707975
Alignment:
Q  239 aataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11708067 aataaacgttagggcttatattatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaat 11707975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 24652822 - 24652905
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24652822 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 15740613 - 15740735
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |  |||||    
T  15740613 ggcttaattgcctttttggtccattaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttccgtt 15740712  T
Q  206 actacatttagtcctttctgtta 228  Q
    || || |||||||||||| ||||    
T  15740713 accacttttagtcctttccgtta 15740735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Original strand, 22762525 - 22762614
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  22762525 tttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcaccgttac 22762614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12643966 - 12643891
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12643966 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaatttgtatcgatttggtcctctaactaaatattgatttattt 12643891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15741682 - 15741607
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15741682 ggcttaattacctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaattttgatttattt 15741607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33820062 - 33819975
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttgg-tcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 194  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  33820062 cttaattacctttttttatcctctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470769
Alignment:
Q  276 ctttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaat 34470769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Original strand, 11920074 - 11920135
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaact 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  11920074 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttatttggttttggattggtcctctaact 11920135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 24652898 - 24652974
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  24652898 ttggtcctttaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcaccgttaccatatttcgtcctttctgtta 24652974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 11151966 - 11152017
Alignment:
Q  15 gacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaagatg 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11151966 gacaatccagcgaacccacgtatgagcgcgaaaccgaattgcaaaaatgatg 11152017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659421
Alignment:
Q  273 taactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaat 24659421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29770454 - 29770376
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttat 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||  |||||||||    
T  29770454 tttaaggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattggtttcggtttggtcccttaactaaattttgatttat 29770376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Original strand, 13462102 - 13462170
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaa 170  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  13462102 ttaaggcttaaatgcgtttttggtcccttaactatttatttggtatcactttggtcccttaactaaaaa 13462170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Original strand, 30650189 - 30650265
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  30650189 aggctaaattgcatttttagtcctctaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattt 30650265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39912300 - 39912224
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39912300 aattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattttggtcc 39912224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 7469171 - 7469391
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7469171 aattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 7469270  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7469271 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattcctt 7469370  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7469371 gttaaggtattatgattaaat 7469391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 15744462 - 15744682
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15744462 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgttactac 15744561  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  15744562 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcctt 15744661  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15744662 gttaaggtattatgattaaat 15744682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 92 - 331
Target Start/End: Original strand, 10991837 - 10992076
Alignment:
Q  92 aataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta 191  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10991837 aataatttttttaaggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta 10991936  T
Q  192 agtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10991937 aatttttcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttacagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcat 10992036  T
Q  292 cattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  10992037 cattttggtcctatgtcttgctaagatattatgattaaat 10992076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 13192987 - 13193213
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13192987 aggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 13193086  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13193087 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 13193186  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13193187 tgccttgttaaggtattatgattaaat 13193213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 29472242 - 29472467
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29472242 ggctcaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 29472341  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29472342 cctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 29472441  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  29472442 gccttgttaaggtattatgattaaat 29472467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 99 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24372424 - 24372192
Alignment:
Q  99 tatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttt 198  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24372424 tattttaggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttct 24372325  T
Q  199 caccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24372324 caccgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 24372225  T
Q  299 gtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24372224 gtcctattcctttttaaagtattatgattaaat 24372192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 105 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7496430 - 7496219
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7496430 aggcttaattacatttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgt 7496331  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7496330 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtccta 7496231  T
Q  305 tttcttgttaag 316  Q
    || |||||||||    
T  7496230 ttccttgttaag 7496219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19847774 - 19847544
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19847774 atttaaggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctc 19847675  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19847674 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttgg 19847575  T
Q  300 tcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||||    
T  19847574 tcatattccttgttaa-gaattatgattaaat 19847544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34735793 - 34735568
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  34735793 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgtt 34735694  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735693 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 34735594  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    
T  34735593 tccttgttaaggtattaggattaaat 34735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8174336 - 8174110
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  8174336 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcaccgt 8174237  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  8174236 ttctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgttttta 8174137  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  8174136 ttccttgttaaggtattatgattaaat 8174110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26182150 - 26181925
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  26182150 ggctaaattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgtt 26182051  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26182050 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 26181951  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  26181950 gccttgttaaggtattatgattaaat 26181925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 38332704 - 38332929
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38332704 ggctaaattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38332803  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332804 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 38332903  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  38332904 gccttgttaagatattatgattaaat 38332929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12860771 - 12860592
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12860771 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttacg 12860672  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12860671 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaat 12860592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 16305024 - 16305250
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagatt-ggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  16305024 aggctaaattacatttttg-tcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaa 16305122  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16305123 ttactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctt 16305222  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||    
T  16305223 atgtcttgttaagatattatgattaaat 16305250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 97 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15406214 - 15405982
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406214 tatatttttggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 15406116  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattt 296  Q
     | || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15406115 cttactgttactacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattt 15406016  T
Q  297 tggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaa 330  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15406015 tggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaa 15405982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19816158 - 19815929
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19816158 ttaaggctaaattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagac 19816059  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 301  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19816058 cattactacatttagtcctttctgctagttttattcaaataaacgttagagtctgtgttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctc 19815959  T
Q  302 ctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19815958 atattccttgttaaggtattatgattaaat 19815929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 105 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33470374 - 33470195
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33470374 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 33470275  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33470274 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 33470195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24138957 - 24138731
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  24138957 ggcttaattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 24138858  T
Q  206 actacatttagtccttt-ctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24138857 actacatttagtctttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 24138758  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24138757 tgccttgttaagatattatgattaaat 24138731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2148333 - 2148111
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||| ||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2148333 ttaaatacattttttgtcatttaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttact 2148234  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2148233 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtc 2148134  T
Q  309 ttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2148133 ttgttaaggtattatgattaaat 2148111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 24371965 - 24372129
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24371965 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 24372064  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24372065 ttactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 24372129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 329
Target Start/End: Original strand, 36713588 - 36713809
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||  |||    
T  36713588 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgtt 36713687  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36713688 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattag--tcattttggttctat 36713785  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaa 329  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  36713786 gccttgttaaggtattatgattaa 36713809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 12860381 - 12860542
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12860381 gcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 12860480  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12860481 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12860542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Original strand, 24138067 - 24138227
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24138067 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgt 24138166  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24138167 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 24138227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 41474087 - 41474307
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  41474087 aattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 41474186  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  41474187 atttagtcttttatgttagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgcctt 41474286  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  41474287 gttaaggtattataattaaat 41474307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 8173888 - 8174047
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8173888 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 8173987  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8173988 acatttagtcctttctgttaattttattcaaatgaacgttagggtttgtgttatgtgggt 8174047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 34735339 - 34735505
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34735339 ttaaggcttaataatctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 34735438  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34735439 cgttactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 34735505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 7495979 - 7496142
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7495979 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 7496078  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7496079 tactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 7496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 15405755 - 15405918
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15405755 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 15405854  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15405855 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 15405918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 265
Target Start/End: Original strand, 19815707 - 19815863
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19815707 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 19815806  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19815807 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtg 19815863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13193439 - 13193276
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13193439 aggcttaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 13193340  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13193339 tactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 13193276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Original strand, 2147874 - 2148048
Alignment:
Q  95 aatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaat-tgatttatttcggtcctctaag 193  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2147874 aatatattttagatttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaag 2147973  T
Q  194 tttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2147974 tttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 2148048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30898748 - 30898589
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  30898748 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgttact 30898649  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30898648 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 30898589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41474537 - 41474373
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41474537 tttatggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctca 41474438  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41474437 ctgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 41474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 26181695 - 26181859
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26181695 tttaaagcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca 26181794  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26181795 ccgttactacatatattcctttctgttagttttattcaaataaaccttaaggtttgtgttatgtg 26181859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29472693 - 29472533
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  29472693 aggcttaaatacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgt 29472594  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472593 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 29472533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17052499 - 17052342
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17052499 aattacatgtttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccnttactac 17052400  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17052399 atttagtcatttctgttagtttcattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 17052342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38333128 - 38332974
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38333128 cttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 38333029  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38333028 tacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttat 38332974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16305471 - 16305313
Alignment:
Q  110 taattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttacta 209  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  16305471 taattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttacta 16305372  T
Q  210 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  16305371 catttagtcttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgtgggt 16305313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15744897 - 15744745
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15744897 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 15744798  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15744797 actacatttagtc----------gttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 15744745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10992255 - 10992139
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10992255 ttggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaga 10992156  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||    
T  10992155 gtttgtgttatgtgggt 10992139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834582
Alignment:
Q  136 tttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttat 235  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttttat 42834551  T
Q  236 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42834552 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 42834582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 8444825 - 8444951
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8444825 ttaattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 8444924  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttat 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8444925 acatttagtcatttctgttagttttat 8444951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7469605 - 7469458
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||         
T  7469605 ttaattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctcatcg----- 7469511  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
       ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7469510 ---tttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgt 7469458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Original strand, 17032592 - 17032703
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17032592 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgt 17032691  T
Q  205 tactacatttag 216  Q
    ||||||||||||    
T  17032692 tactacatttag 17032703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36714024 - 36713873
Alignment:
Q  117 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  36714024 ctttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacacttag 36713925  T
Q  217 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36713924 tcatttctgtttgttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36713873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 216
Target Start/End: Original strand, 17050915 - 17051039
Alignment:
Q  92 aataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcta 191  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17050915 aataataaaatttaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcga 17051014  T
Q  192 agtttttcaccgttactacatttag 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17051015 agtttctcaccgttactacatttag 17051039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 257
Target Start/End: Original strand, 8962365 - 8962510
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  8962365 aattatctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgttactac 8962464  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||||||| ||||  |||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8962465 atttagtcttttccattaaatttaattaaa-aaacgttagggtttgt 8962510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 17052164 - 17052279
Alignment:
Q  213 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttg 311  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||   |    
T  17052164 ttagtctttgctgttagttttattcaaataaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc----ttaacg 17052259  T
Q  312 ttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17052260 ttaaggtattatgattaaat 17052279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8445234 - 8445127
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8445234 aattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcacagttactac 8445135  T
Q  211 atttagtc 218  Q
    ||||||||    
T  8445134 atttagtc 8445127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8963267 - 8963166
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  8963267 ggctaaattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 8963168  T
Q  206 ac 207  Q
    ||    
T  8963167 ac 8963166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 42236415 - 42236466
Alignment:
Q  11 cacagacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaaaa 62  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42236415 cacagacaatccagcgcacccatgtatggacgcgaaatcgaattgcaaaaaa 42236466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 19847277 - 19847361
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtt 195  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19847277 aggcttaattag-tttttggtc-tctaactatttagttggta-cggattgg-cctct-actaaaaattgatttattttgg-cctctaagtt 19847361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23992281 - 23992211
Alignment:
Q  117 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    |||||||||||   ||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23992281 ctttttggtccctgaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcc 23992211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16655980 - 16655911
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16655980 tttttggtcccttaactatttaggtagtatcgttttggtcctttaactaaaatttgatttattttggtcc 16655911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Original strand, 37744443 - 37744524
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  37744443 atttaagactaaattacatttttggtcccttaactatttaggtagtatcactttggtcccttaattaaaatttgatttattt 37744524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 72760 - 72986
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  72760 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 72859  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  72860 ttactacatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtctt 72959  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| |||||||| | |||||||||||||    
T  72960 attccttgttaa-gaattatgattaaat 72986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 73212 - 73049
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  73212 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 73113  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  73112 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 73049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 9989322 - 9989547
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9989322 aggctaaattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 9989421  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989422 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 9989521  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaa 330  Q
    | |||| |||||||||||||||||||    
T  9989522 tgtcttattaaggtattatgattaaa 9989547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 2182941 - 2183168
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  2182941 aaggctaaattaattttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccg 2183040  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2183041 ttactacatttagtcctttatgttagctttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 2183140  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||    
T  2183141 atatcttgttaaagtattatgattaaat 2183168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36440651 - 36440425
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  36440651 aggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactat 36440552  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36440551 aactatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 36440452  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36440451 ttcattgttaaggtattatgattaaat 36440425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38959173 - 38958949
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38959173 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38959074  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  38959073 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttat 38958975  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  38958974 atctcgttaagatattatgattaaat 38958949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37424709 - 37424487
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37424709 aattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 37424611  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt---cctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37424610 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctcctctaactttatttattaatatcattttggtcctattt 37424511  T
Q  308 cttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  37424510 tttgttaagatattatgattaaat 37424487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 27185874 - 27186098
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  27185874 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 27185973  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27185974 actacatttagtccttcctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttat 27186072  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  27186073 gccttgttaaggtattatgattaaat 27186098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24040542 - 24040310
Alignment:
Q  101 tttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttca 200  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  24040542 tttatggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctca 24040443  T
Q  201 ccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatc--attttg 298  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24040442 ccgttcctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttg 24040343  T
Q  299 gtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24040342 gtcatatgccttgttaaggtattatgattaaat 24040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32288521 - 32288302
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  32288521 aattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcactgttaatac 32288422  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  32288421 atttagtcatttctgttagttttattcaaat-aatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgcctt 32288323  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  32288322 gttaaagtattatgattaaat 32288302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 102 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25567442 - 25567213
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  25567442 ttaaggctaaattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcac 25567343  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtc 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25567342 cgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttttgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtc 25567243  T
Q  302 ctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
     |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  25567242 atatgccttgttaaagtattatgattaaat 25567213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35570218 - 35570005
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35570218 ttttttgtcctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttagt 35570119  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||     
T  35570118 cacttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagt 35570019  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  35570018 tattatgattaaat 35570005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 310
Target Start/End: Original strand, 11315970 - 11316162
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  11315970 ttttttgtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttactattactacatttagt 11316069  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11316070 catttctgttagttttattccaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtctt 11316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27186325 - 27186161
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  27186325 aaggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactg 27186226  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27186225 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 27186161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 36440199 - 36440362
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36440199 aggcttaattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 36440298  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36440299 tattacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36440362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 268
Target Start/End: Original strand, 37424249 - 37424424
Alignment:
Q  93 ataatatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37424249 ataatatatttttggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaa 37424348  T
Q  193 gtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37424349 gtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatttgggt 37424424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 265
Target Start/End: Original strand, 35569777 - 35569934
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35569777 cttaattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 35569876  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569877 tacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35569934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Original strand, 16860294 - 16860462
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16860294 tatatttatggctaaattatctttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagttt 16860393  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16860394 ctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 16860462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34264790 - 34264573
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgattta----tttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatt 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||    
T  34264790 tttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcattgttattacatt 34264691  T
Q  214 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgtt 313  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  34264690 tagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgccttgtt 34264591  T
Q  314 aaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  34264590 aagatattatgattaaat 34264573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 39325414 - 39325573
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39325414 cttaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttac 39325513  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39325514 tacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtggg 39325573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 38958724 - 38958886
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38958724 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 38958823  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  38958824 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 38958886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 24040087 - 24040247
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24040087 cttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttac 24040186  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24040187 tacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 24040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25183100 - 25182941
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||    
T  25183100 ttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgct 25183001  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183000 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25182941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39325805 - 39325636
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  39325805 ggctaaattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 39325706  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaa 275  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39325705 attacatttagtactttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggctcctctaa 39325636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 32288079 - 32288237
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  32288079 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtta 32288178  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32288179 ctacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgtta-ggtttgtgttatgtgg 32288237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9989754 - 9989611
Alignment:
Q  125 tcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttct 224  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9989754 tcctctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttct 9989655  T
Q  225 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9989654 gttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 9989611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1140215 - 1140077
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1140215 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1140116  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggg 252  Q
    ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140115 actacattta--------tgttagttttattcaaataaacgttaggg 1140077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316244
Alignment:
Q  134 tatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagtttt 233  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctattaatttt 11316277  T
Q  234 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11316276 attcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 11316244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 257
Target Start/End: Original strand, 19184598 - 19184748
Alignment:
Q  107 gcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  19184598 gcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgtta 19184697  T
Q  207 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  19184698 ctatatttcgtcctttctgttagttttaatagaagaaccgttagggtttgt 19184748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2183372 - 2183231
Alignment:
Q  127 ctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgt 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2183372 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctat 2183273  T
Q  227 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  2183272 tagttttattcaaataaacattaaggtttgtcttatgtgggt 2183231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 29198953 - 29199109
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||    
T  29198953 aggcttaattacctttca--tcctctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgt 29199050  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatg 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29199051 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaagtttagggtttgtgttatg 29199109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 34264349 - 34264479
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggt-----------cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34264349 aaggcttaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgttggattggtgttggattggccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaa 34264448  T
Q  193 gtttttcaccgttactacatttagtcctttc 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34264449 gtttctcaccgttactacatttagtcctttc 34264479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19128503 - 19128434
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19128503 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31756749 - 31756630
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||     
T  31756749 ttaattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgttacc 31756650  T
Q  209 acatttagtcctttctgtta 228  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  31756649 atattttgtcatttctgtta 31756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19185637 - 19185504
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || |     
T  19185637 taaggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctct 19185538  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  19185537 gttactacttttagtcctttccgttaattttatt 19185504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860647
Alignment:
Q  271 tctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaa 16860647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33817729 - 33817659
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattt 181  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33817729 aattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattt 33817659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860528
Alignment:
Q  271 tctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaat 16860528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29199249 - 29199177
Alignment:
Q  259 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  29199249 ttatgtggatcttctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaat 29199177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 268
Target Start/End: Original strand, 34264477 - 34264510
Alignment:
Q  235 ttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34264477 ttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 34264510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 25640413 - 25640458
Alignment:
Q  15 gacaatccagcgaacccacatatgagcgcgaaatcgaattgcaaaa 60  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  25640413 gacaatccagcgaacccacgtgtgggcgcgaaaccgaattgcaaaa 25640458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Original strand, 21503 - 21736
Alignment:
Q  97 tatatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21503 tataattaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttt 21602  T
Q  197 ttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattt 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21603 ctcaccgttactacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattt 21701  T
Q  297 tggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  21702 tggtcctatatctcgttaaaatattatgattaaat 21736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 105 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22604 - 22451
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  22604 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactat 22505  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtg 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22504 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtg 22451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 50927 - 50701
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactattt-agttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  50927 ggctaaattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 50828  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50827 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 50728  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50727 tgccttgttaaggtattatgattaaat 50701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Original strand, 50478 - 50638
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50478 cttaattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttac 50577  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50578 tacatttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 50638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21857006 - 21856781
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21857006 aggctaaattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 21856907  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21856906 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttttgttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtctta 21856807  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaa 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21856806 ttccttgttaaggtattatgattaaa 21856781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 24744334 - 24744553
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |    
T  24744334 aattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttactgc 24744432  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744433 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 24744532  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24744533 gttaaggtattatgattaaat 24744553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Original strand, 26600355 - 26600582
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26600355 aaggctaaattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccg 26600454  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcct 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26600455 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 26600554  T
Q  304 atttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26600555 attccttattaaggtattatgattaaat 26600582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5938258 - 5938038
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  5938258 aattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattactac 5938159  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  5938158 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgcctt 5938059  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5938058 gttaaggtattatgattaaat 5938038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32993466 - 32993240
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32993466 aggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgt 32993367  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32993366 ttctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 32993267  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  32993266 tgccttgttaaggtgttatgattaaat 32993240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 9046086 - 9046311
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9046086 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgtt 9046185  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9046186 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttat 9046285  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  9046286 gccttgttaagctattatgattaaat 9046311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 108 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6137825 - 6137603
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6137825 cttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 6137726  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6137725 tacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatat 6137627  T
Q  308 cttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  6137626 ctcgttaagatattatgattaaat 6137603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18052955 - 18053181
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18052955 aggctaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 18053054  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18053055 tactacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttcta 18053154  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |   |||||||||||||||||||||||    
T  18053155 tgctttgttaaggtattatgattaaat 18053181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 5310826 - 5311051
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  5310826 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtt 5310925  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5310926 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 5311025  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  5311026 tcattgttaaggtattatgattaaat 5311051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 34890643 - 34890869
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  34890643 aggctaaattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagtttctcactgt 34890742  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34890743 tattacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 34890842  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||    
T  34890843 tgccttgttaaagtattatgattaaat 34890869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 104 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21540430 - 21540202
Alignment:
Q  104 aaggcttaattaccttttt-ggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21540430 aaggctaaattaccttttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatc 21540331  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21540330 gttactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcc 21540231  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21540230 tatgccttgttaagatattatgattaaat 21540202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34994836 - 34994605
Alignment:
Q  100 atttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttc 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34994836 atttatggctaaattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctc 34994737  T
Q  200 accgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgg 299  Q
    || |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34994736 actgttactgcatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttgg 34994637  T
Q  300 tcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34994636 tcttatgccttgttaaggtattatgattaaat 34994605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 2517007 - 2517227
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  2517007 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgactgttactac 2517106  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||    
T  2517107 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtcatattcttt 2517206  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2517207 gttaaggtattatgattaaat 2517227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5639618 - 5639398
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5639618 aattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 5639519  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  5639518 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcctt 5639419  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5639418 gttaaggtattatgattaaat 5639398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 31237751 - 31237971
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31237751 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttactac 31237850  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||    
T  31237851 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttcctt 31237950  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31237951 gttaaggtattatgattaaat 31237971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 31247121 - 31247341
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31247121 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgttactac 31247220  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  31247221 atttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattcctt 31247320  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31247321 gttaaggtattatgattaaat 31247341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 7269950 - 7270178
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7269950 aggctaaattacttttttaatcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgt 7270049  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttag--ttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7270050 tactacatttagtcatttctgttagttttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtca 7270149  T
Q  303 tatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  7270150 tatgccttgttaaagtattatgattaaat 7270178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 331
Target Start/End: Original strand, 32753177 - 32753398
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32753177 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32753276  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 305  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    ||||||||    
T  32753277 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctat 32753372  T
Q  306 ttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  32753373 gccttgttaaggtattatgattaaat 32753398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 108 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6236369 - 6236146
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  6236369 cttaattacttttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttac 6236270  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 307  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      
T  6236269 taaatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgc 6236170  T
Q  308 cttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  6236169 cttgttaagatattatgattaaat 6236146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Original strand, 35167490 - 35167652
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35167490 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 35167589  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35167590 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35167652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 6532192 - 6532377
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6532192 ggcttaattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgtt 6532291  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 291  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532292 actacatttagtgatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 978413 - 978577
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  978413 aaggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg 978512  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978513 ttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 978577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15933004 - 15932844
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15933004 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttac 15932905  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15932904 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 15932844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 21856554 - 21856717
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21856554 aggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgt 21856653  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21856654 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 21856717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5311280 - 5311114
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  5311280 ttaagccttagttacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcat 5311181  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5311180 cgttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 5311114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Original strand, 5937809 - 5937975
Alignment:
Q  102 ttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcac 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5937809 ttaaggtttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 5937908  T
Q  202 cgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5937909 tgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5937975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9046538 - 9046374
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9046538 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccg 9046439  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9046438 ctactacatttagtcctttctgttagttctattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9046374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 331
Target Start/End: Original strand, 26957015 - 26957187
Alignment:
Q  159 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26957015 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttatg 26957114  T
Q  259 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26957115 ttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaat 26957187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34891095 - 34890932
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34891095 aaggcttaattac-tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 34890997  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34890996 ttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 34890932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 6235920 - 6236083
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6235920 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 6236019  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236020 tactgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 6236083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31238196 - 31238034
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct-aagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31238196 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgt 31238098  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31238097 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 31238034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 25176665 - 25176819
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25176665 cttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttac 25176764  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176765 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 25176819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32753631 - 32753461
Alignment:
Q  98 atatttaaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttt 197  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32753631 atattttagacttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttc 32753532  T
Q  198 tcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32753531 tcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttatgtgggt 32753461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Original strand, 3423168 - 3423332
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3423168 aaggcttaattaccattttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactg 3423267  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423268 ttactacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 3423332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2517452 - 2517293
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2517452 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 2517353  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  2517352 actacatttaatcctttctgttagttttatttaaataaacgttatgatctgtgttatgtg 2517293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3423574 - 3423395
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3423574 ttggtccgctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaga 3423475  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  3423474 gtttgtgatatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaat 3423395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18053404 - 18053241
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18053404 aggcttagttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcaccgt 18053305  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  18053304 tactacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatatgggt 18053241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25177032 - 25176882
Alignment:
Q  181 tcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaacttta 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25177032 tcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggggcctctaacttta 25176933  T
Q  281 tttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25176932 tttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaat 25176882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 331
Target Start/End: Original strand, 7270673 - 7270854
Alignment:
Q  150 gattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7270673 gattggtcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgtta 7270772  T
Q  250 gggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7270773 gggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaat 7270854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26957411 - 26957258
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26957411 ggcttaattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgtt 26957312  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957311 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgt 26957258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 34994383 - 34994542
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34994383 ttaattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 34994482  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34994483 atatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 34994542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31247566 - 31247404
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31247566 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgt 31247467  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31247466 tactaca-ttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgtgggt 31247404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26600785 - 26600635
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26600785 ttttttgtcctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagt 26600686  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26600685 catttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 26600635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 266
Target Start/End: Original strand, 6137378 - 6137538
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6137378 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaat-gatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 6137476  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 266  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6137477 tactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgttatgtgg 6137538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7271080 - 7270920
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  7271080 aggcttaattgcctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcgt 7270981  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7270980 tactatatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttggggtttgtgttatgtg 7270920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 264
Target Start/End: Original strand, 32993017 - 32993173
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||    
T  32993017 cttaattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttac 32993116  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32993117 tacatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 32993173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24744770 - 24744609
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||| |||    
T  24744770 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatta-attggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgtt 24744672  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744671 attacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24744609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10412949 - 10412796
Alignment:
Q  108 cttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttac 207  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10412949 cttaattatctttttggtcttttaactatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 10412850  T
Q  208 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 261  Q
    || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10412849 tatatttagtcatttctattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgtta 10412796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Original strand, 17244664 - 17244815
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17244664 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 17244763  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  17244764 attatatttcgtcatttctgttagttttaatagaagaaacgttagggtttgt 17244815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 14276402 - 14276534
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14276402 ttaattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcaccgttact 14276501  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaat 241  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14276502 acatttagtcctttgtattagttttattcaaat 14276534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7270404 - 7270241
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||| |||    
T  7270404 aggcttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcgt 7270305  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7270304 tactacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtggtatgtgggt 7270241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35167837 - 35167725
Alignment:
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  35167837 atttaatcctttctgttagttttattcaagtaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatcctt 35167738  T
Q  311 gttaaggtattat 323  Q
    |||||||||||||    
T  35167737 gttaaggtattat 35167725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 7438802 - 7438921
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  7438802 aaggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccg 7438901  T
Q  204 ttactacatttagtcctttc 223  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  7438902 ttactacatttagttctttc 7438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34518142 - 34517991
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||    
T  34518142 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgtt 34518043  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  34518042 actacatttagtcctttccgttaaatttaattaaaaaaacgttagggtttgt 34517991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Original strand, 6228730 - 6228880
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6228730 ggcttaattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgtt 6228828  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||| |||| ||| |||||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  6228829 actatatttcgtcatttctgtttgttttaatagaagaaatgttagggtttgt 6228880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 15932728 - 15932830
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  15932728 aaggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcatcg 15932827  T
Q  204 tta 206  Q
    |||    
T  15932828 tta 15932830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29261403 - 29261279
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |    
T  29261403 aaggctaaattatatttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcactg 29261304  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  29261303 ttactacatttagtcctttccgtta 29261279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25180300 - 25180219
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 185  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180300 aaggctaaattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 25180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 29260536 - 29260652
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||    
T  29260536 aattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctca-cattactac 29260634  T
Q  211 atttagtcctttctgtta 228  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  29260635 atttagtcatttccgtta 29260652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Original strand, 3035926 - 3036025
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtc-ctttctgttagttttattcaaataaacgttag 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035926 ttggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtcattttctgttaattttattcaaataaacgttag 3036025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Original strand, 15286350 - 15286492
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||| |    
T  15286350 aattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttatttcaatcccttaagtttctcaccgttactgc 15286449  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 254  Q
    |||||||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||    
T  15286450 atttagtcatttccgttaaatttaattaaa-aaacgttagggtt 15286492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 207
Target Start/End: Original strand, 34517270 - 34517373
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  34517270 aaggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcactg 34517369  T
Q  204 ttac 207  Q
    ||||    
T  34517370 ttac 34517373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35167906 - 35167833
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgattta 178  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35167906 aggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27829414 - 27829297
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| |||    
T  27829414 ggcttaattacctttt-ggtcctccaactatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcactgtt 27829316  T
Q  206 actacatttagtcctttct 224  Q
    || | |||| ||| |||||    
T  27829315 accatatttcgtcatttct 27829297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 34251552 - 34251656
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  34251552 aaggctaaattacctttttaatcctctaattatttagttggtatcggattagtc--ctgactaaaaattaatttatttcgatcctctaagtttctcatcg 34251649  T
Q  204 ttactac 210  Q
    |||||||    
T  34251650 ttactac 34251656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6229772 - 6229643
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |||    
T  6229772 ggctaaattgcctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcc-ctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctgtt 6229674  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttatt 236  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  6229673 actacttttagtcctttccgttaattttatt 6229643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17245712 - 17245561
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| || | |    
T  17245712 aaggctaaattgcatttttggtcccttaattatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaaatttctctctg 17245613  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttt 255  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | | ||| ||||||||||    
T  17245612 ttactacttttagtcttttccgttaattttattaataaaaaagttagggttt 17245561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Original strand, 1158588 - 1158669
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||   |||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  1158588 ggcttaattacatttttggtcctttaactatttaggtagtatcgctttggtcctttaattaaaattcgatttattttggtcc 1158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 5639294 - 5639335
Alignment:
Q  227 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5639294 tagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 5639335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 20750 - 20975
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  20750 aggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactgt 20849  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20850 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtccta 20949  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || |||||||| | |||||||||||||    
T  20950 ttccttgttaa-gaattatgattaaat 20975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 21038
Alignment:
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21088 cctttctattagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 21038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18498
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18285 tttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttctcaccgctactacatttagt 18384  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18385 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaagg 18484  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  18485 tattatgattaaat 18498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18723 - 18561
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18723 ggcttaattacatttttggtcctttaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgtt 18624  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18623 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 18561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14586 - 14360
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14586 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcaccgt 14487  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14486 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcata 14387  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14386 tgccttgttaaggtattatgattaaat 14360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 14132 - 14297
Alignment:
Q  103 taaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcacc 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14132 taaggcttaattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcacc 14231  T
Q  203 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14232 gttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 45755 - 45981
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45755 aggctaaattactattttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggt 45854  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  45855 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcata 45954  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  45955 ttccttgttaaggtattatgattaaat 45981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 56583 - 56424
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  56583 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 56484  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56483 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 56424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 63708 - 63549
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  63708 ttaattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 63609  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  63608 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 63549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 19713 - 19933
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19713 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactac 19812  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  19813 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcctt 19912  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  19913 gttaaggttttatgattaaat 19933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20155 - 19996
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20155 ttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttact 20056  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20055 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 24161 - 24387
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24161 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgt 24260  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  24261 tattacatttagtcatttctgttagtttttttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctg 24360  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24361 ttccttgttaagatattatgattaaat 24387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24612 - 24456
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  24612 ggcttaattacatttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 24513  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24512 actacatttagtcatttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Original strand, 349085 - 349298
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagt 217  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  349085 ttttttgtcctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtttttacatttagt 349184  T
Q  218 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaagg 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  349185 catttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaagg 349284  T
Q  318 tattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||    
T  349285 tattatgattaaat 349298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 349524 - 349361
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  349524 aaggcttagttacctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcactt 349426  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  349425 ttactacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 349361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 113816 - 113654
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  113816 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgtt 113717  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  113716 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttagtgttatgtgggt 113654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 235
Target Start/End: Original strand, 113392 - 113522
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  113392 aggctaaataacatttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcgt 113491  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttat 235  Q
    || || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  113492 tagtaaatttattcctttccgttagttttat 113522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 331
Target Start/End: Original strand, 113519 - 113591
Alignment:
Q  259 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  113519 ttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaat 113591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 8428 - 8653
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  8428 aggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatctt-taactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcactgt 8526  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 304  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8527 tacaatatttagtattttctgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 8626  T
Q  305 tttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  8627 tgccttgttaaggtattatgattaaat 8653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8874 - 8716
Alignment:
Q  110 taattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttacta 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  8874 taattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttacta 8775  T
Q  210 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8774 catttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggt 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Original strand, 81857 - 82020
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  81857 aggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgt 81956  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  81957 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtaatttgggt 82020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 82231 - 82083
Alignment:
Q  183 ggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82231 ggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatt 82132  T
Q  283 tattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  82131 tattaatatcattttggtcctatttcttgttaagatattatgattaaat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 90876 - 90782
Alignment:
Q  118 tttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacat 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  90876 tttttcgtcctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacat 90782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 331
Target Start/End: Original strand, 15458 - 15673
Alignment:
Q  111 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactac 210  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  15458 aattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactgttactac 15557  T
Q  211 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttctt 310  Q
    |||||||| |||||||||     ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  15558 atttagtcatttctgtta-----attcaaataaatgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcctatgcctt 15652  T
Q  311 gttaaggtattatgattaaat 331  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  15653 gttaagatattatgattaaat 15673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15736
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 205  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  15898 ggcttaattacttttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatg 15799  T
Q  206 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15798 actacatttaatcccttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 331
Target Start/End: Original strand, 6044 - 6220
Alignment:
Q  152 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6044 ttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaga 6143  T
Q  252 gtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttcttgttaaggtattatgattaaat 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6144 gtttgtgttatgtggatcctctaactttatttat---tatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 6283
Alignment:
Q  109 ttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttact 208  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6439 ttaattacctttt--gtcctttaactaattaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttact 6343  T
Q  209 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6342 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 265
Target Start/End: Original strand, 14231 - 14350
Alignment:
Q  145 tatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa 244  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14231 tatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaa 14329  T
Q  245 cgttagggtttgtgttatgtg 265  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  14330 cgttagagtttgtgttatgtg 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 257
Target Start/End: Original strand, 9781 - 9932
Alignment:
Q  105 aggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgt 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||    
T  9781 aggcttaattgcctttttggtcccttaactatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccgt 9880  T
Q  205 tactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 257  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9881 tactacttttagtcctttccgttagttttatt-aaaaaaacgttagggtttgt 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11008 - 10860
Alignment:
Q  104 aaggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccg 203  Q
    |||| ||||||  |||||||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| |  | |    
T  11008 aaggtttaattgtctttttggtcccttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcccttaagtttctttctg 10909  T
Q  204 ttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggt 253  Q
    |||| || |||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  10908 ttaccacttttagttctttccgttaattttatt-aaaaaaacgttagggt 10860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 253
Target Start/End: Original strand, 144039 - 144166
Alignment:
Q  125 tcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttct 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||     
T  144039 tcctctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctcaccgttactacttttagtcttttcc 144138  T
Q  225 gttagttttattcaaataaacgttagggt 253  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  144139 attggttttatt-aaaaaaacgttagggt 144166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 147245 - 147133
Alignment:
Q  151 attggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  147245 attggtcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgttactatatttagtcatttccgttaattttattcgaataaacgttag 147146  T
Q  251 ggtttgtgttatg 263  Q
    | ||| |||||||    
T  147145 gatttatgttatg 147133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0526
Description:

Target: scaffold0526; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 139
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4063
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 4063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0526; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4117 - 4084
Alignment:
Q  106 ggcttaattacctttttggtcctctaactattta 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4117 ggctaaattacctttttggtcctctaactattta 4084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University