View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19628_low_59 (Length: 209)

Name: NF19628_low_59
Description: NF19628
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19628_low_59
NF19628_low_59
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (21-209)||(35020929-35021116)
chr4 (21-209)||(37663635-37663822)
chr4 (23-209)||(38011984-38012169)
chr4 (21-209)||(19440542-19440729)
chr4 (21-209)||(55477785-55477972)
chr4 (21-206)||(879442-879626)
chr4 (21-209)||(50697371-50697559)
chr4 (21-209)||(3042749-3042936)
chr4 (21-209)||(6864165-6864352)
chr4 (21-209)||(28002880-28003067)
chr4 (21-206)||(25184246-25184430)
chr4 (21-209)||(1815431-1815618)
chr4 (21-209)||(19089347-19089534)
chr4 (23-209)||(34361388-34361573)
chr4 (23-198)||(32912476-32912650)
chr4 (21-209)||(17173420-17173607)
chr4 (23-209)||(42199859-42200045)
chr4 (21-188)||(55240999-55241165)
chr4 (21-209)||(17167843-17168030)
chr4 (21-199)||(36493583-36493759)
chr4 (21-206)||(47253873-47254057)
chr4 (21-209)||(33341528-33341715)
chr4 (21-207)||(32579578-32579763)
chr4 (21-206)||(7703642-7703826)
chr4 (21-209)||(46888052-46888238)
chr4 (21-209)||(5047860-5048046)
chr4 (24-209)||(34947992-34948178)
chr4 (21-143)||(33816410-33816532)
chr4 (62-207)||(4934137-4934281)
chr4 (61-209)||(25700990-25701138)
chr4 (21-200)||(37287865-37288045)
chr4 (21-209)||(17272094-17272281)
chr4 (21-209)||(23761202-23761388)
chr4 (62-206)||(35025531-35025674)
chr4 (21-209)||(37775797-37775975)
chr4 (21-190)||(46884008-46884170)
chr4 (21-209)||(29584094-29584281)
chr4 (21-206)||(30002535-30002710)
chr4 (21-209)||(27396746-27396933)
chr4 (21-209)||(49376097-49376284)
chr4 (21-143)||(50764915-50765037)
chr4 (21-106)||(4205216-4205301)
chr4 (21-141)||(7152098-7152218)
chr4 (21-206)||(9139378-9139546)
chr4 (23-140)||(26896285-26896402)
chr4 (66-209)||(54499177-54499319)
chr4 (21-76)||(35025460-35025515)
chr4 (23-110)||(39400236-39400323)
chr4 (21-209)||(32592223-32592401)
chr4 (21-115)||(4598205-4598299)
chr4 (39-97)||(56050171-56050229)
chr4 (145-209)||(33816550-33816614)
chr4 (133-199)||(39398049-39398114)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (21-209)||(408297-408484)
scaffold0002 (21-209)||(264-445)
scaffold0002 (101-209)||(94331-94438)
scaffold0002 (22-109)||(93969-94056)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (21-209)||(28769778-28769966)
chr1 (21-209)||(30326815-30327002)
chr1 (21-209)||(8222254-8222441)
chr1 (21-209)||(15383059-15383246)
chr1 (21-209)||(27227348-27227535)
chr1 (21-199)||(37451421-37451598)
chr1 (21-209)||(51128985-51129172)
chr1 (19-209)||(27563766-27563955)
chr1 (21-206)||(10922856-10923040)
chr1 (21-209)||(2959874-2960061)
chr1 (23-209)||(19899634-19899819)
chr1 (21-209)||(18422777-18422964)
chr1 (21-209)||(25160758-25160945)
chr1 (21-209)||(27267063-27267249)
chr1 (21-209)||(30254549-30254736)
chr1 (21-209)||(32216181-32216368)
chr1 (21-205)||(32267164-32267347)
chr1 (23-209)||(23999473-23999658)
chr1 (21-209)||(28564646-28564831)
chr1 (21-197)||(238376-238551)
chr1 (21-209)||(15752155-15752342)
chr1 (21-209)||(47279315-47279502)
chr1 (21-209)||(7078926-7079113)
chr1 (21-209)||(16415772-16415959)
chr1 (27-198)||(27763180-27763350)
chr1 (23-209)||(46931537-46931720)
chr1 (21-209)||(40884939-40885126)
chr1 (21-209)||(42721165-42721349)
chr1 (21-209)||(4330407-4330594)
chr1 (21-209)||(15168222-15168409)
chr1 (21-209)||(14758167-14758345)
chr1 (21-209)||(27532844-27533030)
chr1 (4-209)||(33725445-33725650)
chr1 (21-209)||(37618764-37618942)
chr1 (21-209)||(47682357-47682544)
chr1 (21-209)||(10181870-10182058)
chr1 (21-209)||(9902917-9903104)
chr1 (20-209)||(38759659-38759847)
chr1 (21-209)||(34012245-34012427)
chr1 (21-209)||(38823340-38823527)
chr1 (21-209)||(22170837-22171024)
chr1 (21-209)||(39393509-39393697)
chr1 (21-209)||(41926289-41926469)
chr1 (21-206)||(1547408-1547584)
chr1 (21-142)||(1359798-1359919)
chr1 (21-209)||(3535058-3535236)
chr1 (24-209)||(31621415-31621603)
chr1 (21-142)||(48353735-48353855)
chr1 (21-126)||(11742231-11742336)
chr1 (21-209)||(3309273-3309466)
chr1 (21-105)||(21289829-21289913)
chr1 (133-209)||(48620763-48620838)
chr1 (146-209)||(11742338-11742401)
chr1 (24-99)||(31962851-31962926)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (21-206)||(1149506-1149690)
chr8 (21-199)||(1205066-1205243)
chr8 (21-209)||(37970393-37970580)
chr8 (21-209)||(33906341-33906528)
chr8 (21-206)||(43643469-43643653)
chr8 (21-209)||(4132560-4132746)
chr8 (21-209)||(16222992-16223179)
chr8 (21-209)||(7890831-7891018)
chr8 (21-209)||(27082712-27082899)
chr8 (21-197)||(40862560-40862735)
chr8 (23-198)||(8803693-8803867)
chr8 (21-209)||(16446749-16446936)
chr8 (21-209)||(31933760-31933947)
chr8 (21-209)||(36694840-36695027)
chr8 (23-209)||(9864277-9864462)
chr8 (21-209)||(6098387-6098579)
chr8 (21-209)||(10555078-10555263)
chr8 (21-209)||(12876238-12876426)
chr8 (21-206)||(35459585-35459769)
chr8 (21-209)||(5299820-5300007)
chr8 (21-209)||(11727153-11727340)
chr8 (21-209)||(39098993-39099180)
chr8 (21-200)||(23854305-23854483)
chr8 (21-209)||(1953862-1954050)
chr8 (23-207)||(30654459-30654642)
chr8 (21-209)||(38644107-38644294)
chr8 (21-209)||(34895096-34895278)
chr8 (21-147)||(1149794-1149916)
chr8 (65-209)||(41910907-41911049)
chr8 (23-209)||(13307752-13307936)
chr8 (133-206)||(1150091-1150163)
chr8 (21-209)||(465971-466148)
chr8 (67-209)||(43025831-43025972)
chr8 (21-209)||(44869626-44869813)
chr8 (19-111)||(35859160-35859252)
chr8 (21-110)||(34951931-34952020)
chr8 (21-89)||(24823268-24823336)
chr8 (21-188)||(18259233-18259395)
chr8 (21-107)||(12587812-12587898)
chr8 (146-209)||(41362644-41362707)
chr8 (62-137)||(7998478-7998553)
chr8 (144-205)||(7998427-7998489)
chr8 (143-209)||(34952026-34952092)
chr8 (21-107)||(34463704-34463787)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (21-209)||(699280-699467)
chr5 (21-199)||(5830032-5830209)
chr5 (21-209)||(7208722-7208909)
chr5 (21-209)||(31705470-31705657)
chr5 (21-209)||(22980923-22981110)
chr5 (21-209)||(22255312-22255499)
chr5 (21-209)||(35504495-35504682)
chr5 (21-206)||(22973940-22974124)
chr5 (21-209)||(27318347-27318532)
chr5 (21-209)||(36866892-36867079)
chr5 (27-200)||(33908372-33908544)
chr5 (21-209)||(12910485-12910672)
chr5 (21-209)||(31786504-31786691)
chr5 (21-200)||(35826344-35826520)
chr5 (21-209)||(38528095-38528282)
chr5 (21-209)||(40133515-40133702)
chr5 (39-209)||(23116098-23116267)
chr5 (21-209)||(17157889-17158076)
chr5 (21-209)||(13956220-13956407)
chr5 (21-197)||(21088624-21088799)
chr5 (25-209)||(30969186-30969369)
chr5 (60-199)||(14919425-14919563)
chr5 (21-197)||(36860565-36860741)
chr5 (21-209)||(19119989-19120176)
chr5 (53-209)||(23954680-23954834)
chr5 (21-137)||(24886288-24886404)
chr5 (21-209)||(35511340-35511522)
chr5 (21-190)||(2888303-2888471)
chr5 (21-209)||(5837685-5837872)
chr5 (21-205)||(8437099-8437282)
chr5 (24-209)||(8741746-8741931)
chr5 (24-209)||(25500787-25500971)
chr5 (80-209)||(26268204-26268332)
chr5 (21-209)||(35934025-35934213)
chr5 (21-209)||(15992398-15992585)
chr5 (21-209)||(27330434-27330621)
chr5 (21-209)||(39572949-39573128)
chr5 (21-127)||(14409199-14409305)
chr5 (21-137)||(1429020-1429136)
chr5 (25-209)||(6824343-6824524)
chr5 (21-209)||(32563279-32563457)
chr5 (21-198)||(43308518-43308686)
chr5 (21-209)||(9200363-9200541)
chr5 (21-209)||(42342861-42343038)
chr5 (21-124)||(25889584-25889687)
chr5 (21-115)||(25669799-25669893)
chr5 (99-199)||(5112250-5112348)
chr5 (21-209)||(7693360-7693538)
chr5 (21-209)||(15724618-15724805)
chr5 (21-199)||(22019772-22019940)
chr5 (144-199)||(24886244-24886299)
chr5 (21-127)||(8466938-8467043)
chr5 (147-209)||(14409310-14409372)
chr5 (133-209)||(28416497-28416572)
chr5 (158-209)||(1429139-1429190)
chr5 (142-188)||(25669737-25669783)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (21-209)||(8017-8204)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (21-209)||(7234902-7235089)
chr6 (21-209)||(6091049-6091237)
chr6 (23-198)||(1945975-1946149)
chr6 (23-209)||(5627521-5627706)
chr6 (21-209)||(3879806-3879993)
chr6 (5-209)||(29182293-29182500)
chr6 (21-209)||(20768214-20768399)
chr6 (52-209)||(30353256-30353412)
chr6 (62-209)||(21017020-21017166)
chr6 (21-209)||(4318689-4318877)
chr6 (80-209)||(7055141-7055269)
chr6 (21-209)||(33892879-33893057)
chr6 (69-209)||(15491745-15491884)
chr6 (21-127)||(33619036-33619147)
chr6 (21-140)||(8513426-8513545)
chr6 (21-127)||(6089114-6089220)
chr6 (23-85)||(7054642-7054704)
chr6 (163-209)||(33618964-33619010)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (21-209)||(42505943-42506130)
chr3 (21-209)||(46297630-46297817)
chr3 (21-209)||(26941128-26941315)
chr3 (21-209)||(40552127-40552314)
chr3 (21-206)||(48355065-48355249)
chr3 (21-209)||(22622586-22622773)
chr3 (23-209)||(52040792-52040977)
chr3 (21-206)||(4761516-4761701)
chr3 (23-209)||(21009672-21009857)
chr3 (21-209)||(33378653-33378840)
chr3 (21-209)||(34133056-34133243)
chr3 (21-209)||(53229020-53229207)
chr3 (21-209)||(54828569-54828756)
chr3 (21-208)||(39282774-39282960)
chr3 (21-200)||(46994529-46994707)
chr3 (23-198)||(54505939-54506113)
chr3 (19-209)||(33698274-33698463)
chr3 (21-200)||(37157837-37158016)
chr3 (22-209)||(32373591-32373777)
chr3 (19-209)||(2008054-2008242)
chr3 (27-209)||(3655076-3655257)
chr3 (21-209)||(22451089-22451276)
chr3 (21-209)||(44891618-44891805)
chr3 (21-209)||(24707983-24708172)
chr3 (21-200)||(25579869-25580047)
chr3 (23-198)||(47481654-47481828)
chr3 (21-209)||(7327350-7327537)
chr3 (17-209)||(43348378-43348569)
chr3 (39-209)||(11466945-11467114)
chr3 (21-190)||(1089833-1090001)
chr3 (21-209)||(45174626-45174814)
chr3 (21-137)||(11357249-11357365)
chr3 (45-173)||(20373136-20373263)
chr3 (21-209)||(24488830-24489017)
chr3 (21-190)||(22445933-22446100)
chr3 (21-209)||(21193727-21193915)
chr3 (21-209)||(37203188-37203376)
chr3 (21-209)||(4015581-4015767)
chr3 (19-209)||(43975758-43975943)
chr3 (21-198)||(3362385-3362563)
chr3 (21-199)||(11835501-11835673)
chr3 (21-209)||(29163939-29164117)
chr3 (21-125)||(51212639-51212743)
chr3 (39-206)||(38591822-38591988)
chr3 (21-209)||(29099476-29099654)
chr3 (21-209)||(14586548-14586725)
chr3 (21-209)||(36012258-36012447)
chr3 (39-143)||(11357036-11357140)
chr3 (21-137)||(40936165-40936281)
chr3 (50-137)||(27480259-27480350)
chr3 (133-206)||(51212961-51213033)
chr3 (80-209)||(35844447-35844575)
chr3 (21-121)||(44186385-44186485)
chr3 (21-113)||(50475027-50475119)
chr3 (99-209)||(53176175-53176284)
chr3 (21-124)||(53811602-53811701)
chr3 (145-209)||(44186492-44186556)
chr3 (158-209)||(20373300-20373351)
chr3 (161-209)||(11357371-11357419)
chr3 (145-209)||(27480370-27480434)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (21-209)||(37109977-37110166)
chr7 (21-209)||(10481710-10481897)
chr7 (21-209)||(27283849-27284036)
chr7 (21-209)||(30055632-30055819)
chr7 (22-209)||(9355696-9355882)
chr7 (21-209)||(17842453-17842642)
chr7 (42-209)||(38258650-38258816)
chr7 (21-206)||(18797435-18797619)
chr7 (21-206)||(37703367-37703551)
chr7 (21-209)||(31578933-31579120)
chr7 (21-209)||(32820922-32821109)
chr7 (23-209)||(24211846-24212031)
chr7 (21-209)||(41764947-41765134)
chr7 (21-209)||(48928166-48928353)
chr7 (21-209)||(15612628-15612815)
chr7 (21-209)||(23111295-23111484)
chr7 (21-209)||(11071311-11071495)
chr7 (39-209)||(21991741-21991910)
chr7 (23-209)||(43686145-43686330)
chr7 (21-209)||(5657350-5657537)
chr7 (21-199)||(37347137-37347313)
chr7 (21-198)||(7334910-7335085)
chr7 (21-209)||(15672628-15672818)
chr7 (21-209)||(32432557-32432744)
chr7 (25-209)||(10359087-10359271)
chr7 (21-206)||(46480998-46481182)
chr7 (21-209)||(4583024-4583211)
chr7 (21-209)||(25691413-25691600)
chr7 (22-209)||(33688132-33688318)
chr7 (24-209)||(44598771-44598955)
chr7 (21-209)||(6546624-6546811)
chr7 (83-209)||(37704262-37704387)
chr7 (24-209)||(8861390-8861574)
chr7 (21-209)||(12165857-12166035)
chr7 (21-137)||(31520610-31520726)
chr7 (21-137)||(32593075-32593191)
chr7 (57-209)||(48928469-48928620)
chr7 (23-166)||(35353256-35353398)
chr7 (21-127)||(29173709-29173814)
chr7 (19-121)||(44411407-44411509)
chr7 (21-209)||(22687344-22687523)
chr7 (21-137)||(26980482-26980598)
chr7 (21-188)||(26587961-26588119)
chr7 (23-137)||(38053637-38053751)
chr7 (21-197)||(43925218-43925387)
chr7 (21-115)||(12390518-12390612)
chr7 (85-209)||(27421313-27421436)
chr7 (21-108)||(37704387-37704474)
chr7 (124-209)||(44413351-44413435)
chr7 (21-97)||(34362047-34362123)
chr7 (144-199)||(38053593-38053648)
chr7 (144-209)||(12390621-12390686)
chr7 (158-199)||(31520729-31520770)
chr7 (158-209)||(32593194-32593245)
chr7 (144-209)||(26980428-26980493)
chr7 (19-70)||(27421232-27421283)
chr7 (153-197)||(29173657-29173701)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (39-209)||(44913793-44913963)
chr2 (21-206)||(43648131-43648315)
chr2 (21-199)||(2325264-2325441)
chr2 (44-209)||(17071646-17071810)
chr2 (21-209)||(37905838-37906027)
chr2 (21-209)||(3177069-3177256)
chr2 (21-209)||(4763761-4763948)
chr2 (21-209)||(41960970-41961157)
chr2 (23-209)||(33550875-33551059)
chr2 (21-209)||(4167052-4167239)
chr2 (21-209)||(31861982-31862169)
chr2 (21-209)||(44286079-44286266)
chr2 (21-209)||(35959027-35959209)
chr2 (23-209)||(11366269-11366454)
chr2 (21-206)||(19289209-19289393)
chr2 (21-185)||(41465655-41465818)
chr2 (44-209)||(17054005-17054169)
chr2 (39-209)||(45327850-45328019)
chr2 (21-209)||(26357707-26357894)
chr2 (45-209)||(29242048-29242211)
chr2 (21-209)||(31570620-31570807)
chr2 (19-209)||(4263960-4264150)
chr2 (21-200)||(33709118-33709296)
chr2 (22-209)||(4478499-4478681)
chr2 (80-209)||(19424573-19424701)
chr2 (22-209)||(18494168-18494353)
chr2 (21-209)||(27349834-27350012)
chr2 (39-209)||(36642116-36642287)
chr2 (21-197)||(39167255-39167424)
chr2 (22-137)||(7006825-7006940)
chr2 (21-209)||(19313981-19314164)
chr2 (21-144)||(19500801-19500924)
chr2 (21-209)||(13711594-13711776)
chr2 (62-198)||(18258214-18258349)
chr2 (21-209)||(33660263-33660441)
chr2 (22-209)||(43770735-43770912)
chr2 (85-207)||(33902198-33902319)
chr2 (64-209)||(41463779-41463923)
chr2 (21-115)||(5881752-5881846)
chr2 (158-200)||(7006943-7006985)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (23-209)||(145886-146071)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-209)||(267414-267626)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (21-209)||(12039-12226)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (21-209)||(44087-44273)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-209)||(154514-154700)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (71-115)||(100950-100994)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 35020929 - 35021116
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  35020929 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 35021028  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35021029 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 35021116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 37663635 - 37663822
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  37663635 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatag 37663734  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37663735 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 37663822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011984
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctggga-tgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 38011984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 19440542 - 19440729
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  19440542 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataa 19440641  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19440642 acttaagggttacacgttgtggg-gtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 19440729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 55477785 - 55477972
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55477785 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 55477884  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| || ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55477885 tcttcagtgttacacgttgtggg-gtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 55477972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 879442 - 879626
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  879442 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 879541  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  879542 tcttaaatgttacactttgtgag-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50697559 - 50697371
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacat-gcaaacatagttgatgatattatgtaata 119  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50697559 taattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgata 50697460  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50697459 gtcttaagtgttgcactttgtgtg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 50697371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3042936 - 3042749
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3042936 taattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 3042837  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  3042836 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaatt 3042749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6864352 - 6864165
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6864352 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 6864253  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6864252 tcttaagtattacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaatt 6864165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 28002880 - 28003067
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28002880 taattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 28002979  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  28002980 ttttaagtgttacactttctggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaatt 28003067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25184430 - 25184246
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  25184430 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatag 25184331  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25184330 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 25184246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1815618 - 1815431
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1815618 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag 1815519  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  1815518 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaatt 1815431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 19089347 - 19089534
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  19089347 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatag 19089446  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19089447 tcttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 19089534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 34361388 - 34361573
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||      
T  34361388 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagct 34361487  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34361488 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaatt 34361573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 32912476 - 32912650
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  32912476 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 32912575  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32912576 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 32912650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17173607 - 17173420
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17173607 taattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 17173508  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  17173507 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 17173420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42200045 - 42199859
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacata-tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  42200045 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagt 42199946  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42199945 cttaagtgttacactttgtagg-gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 42199859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 55240999 - 55241165
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||    
T  55240999 taatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatag 55241098  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgta 188  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55241099 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgta 55241165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17168030 - 17167843
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  17168030 taattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag 17167931  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  17167930 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 17167843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 36493583 - 36493759
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  36493583 taattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtag 36493682  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36493683 tcttaagtgttacactttgt-ggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 36493759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47254057 - 47253873
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  47254057 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 47253958  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  47253957 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 47253873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33341715 - 33341528
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  33341715 taattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 33341616  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  33341615 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaatt 33341528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32579763 - 32579578
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  32579763 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatag 32579664  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaa 207  Q
    ||||||| ||| |||||| || | || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||    
T  32579663 tcttaagagttacactttctgag-gtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaa 32579578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7703826 - 7703642
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  7703826 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 7703727  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7703726 tcttaagtgtgacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 7703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 46888052 - 46888238
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  46888052 taattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatag 46888151  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || |||| ||| |  |||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46888152 tc-taagtgttacgttttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 46888238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 5047860 - 5048046
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5047860 taatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatag 5047959  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||| ||  || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||    
T  5047960 tcttaagtgttacattttgcgg--gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaatt 5048046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 34947992 - 34948178
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtct 123  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  34947992 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 34948091  T
Q  124 taag--cgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||| | |||  |||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  34948092 taagtacgttacactttgtggg-gtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaatt 34948178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 33816410 - 33816532
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33816410 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 33816509  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtggg 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  33816510 tcttaagtgttacactttgtggg 33816532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 4934137 - 4934281
Alignment:
Q  62 tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataaca 161  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||   |||| ||||    
T  4934137 tactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgag-gtgttggacttaaaaca 4934235  T
Q  162 aggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaa 207  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4934236 aggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaa 4934281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 25700990 - 25701138
Alignment:
Q  61 atactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataac 160  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||| |||    
T  25700990 atactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaac 25701089  T
Q  161 aaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  25701090 aaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaatt 25701138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37288045 - 37287865
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||    
T  37288045 taattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctag 37287946  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37287945 tcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc 37287865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17272281 - 17272094
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||  ||||    
T  17272281 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatag 17272182  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||    
T  17272181 tcttaagtgtgacacttcatggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaatt 17272094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23761388 - 23761202
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  23761388 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatag 23761289  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||  ||  |||||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23761288 tcttaaatgtgacactttatgag-gtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 23761202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Original strand, 35025531 - 35025674
Alignment:
Q  62 tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataaca 161  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||| |||| || |||| ||||    
T  35025531 tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggg-gtgtgacacttaaaaca 35025629  T
Q  162 aggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    || || |||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||    
T  35025630 agataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatga 35025674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37775975 - 37775797
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  37775975 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg------ 37775882  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37775881 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 37775797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 46884008 - 46884170
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  46884008 taattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttacata--ctattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag 46884103  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 190  Q
    | ||||| ||| || |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46884104 t-ttaagtgttacattttgtgaga-tgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagt 46884170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 29584094 - 29584281
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||||    
T  29584094 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatag 29584193  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  |||||  |||| |||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||    
T  29584194 tcttaagtgtgacacttcatggg-gtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaatt 29584281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 30002535 - 30002710
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  30002535 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg------ 30002628  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  30002629 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30002710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27396933 - 27396746
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |  ||| | |||||||||   ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||  || |    
T  27396933 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatgg 27396834  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27396833 tcttaagtgtgacactttatggga-tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 27396746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49376284 - 49376097
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  || |||| || ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||     
T  49376284 taattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataa 49376185  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    |||| | ||||| |  |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  49376184 tcttaagtgttacacattgtggg-gtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaatt 49376097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50765037 - 50764915
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||     
T  50765037 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataa 50764938  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtggg 143  Q
    | || || ||| |||||||||||    
T  50764937 tattgagtgtttcactttgtggg 50764915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4205301 - 4205216
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatg 106  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4205301 taattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 7152098 - 7152218
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  7152098 taattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatag 7152197  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtg 141  Q
    | ||||| |||  ||||||||    
T  7152198 tattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9139546 - 9139378
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||                   
T  9139546 taattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttat--------------- 9139462  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
     |||||| ||| |||||||| || |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9139461 -cttaagtgttacactttgtagg-gtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9139378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26896402 - 26896285
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcat-ggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||  |||||    
T  26896402 attcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagt 26896304  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgt 140  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  26896303 cttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Original strand, 54499177 - 54499319
Alignment:
Q  66 attttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggt 165  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||  | |||| |||| ||||||||||  ||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||    
T  54499177 attttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagg-gtgttacacttaaaacaaggt 54499274  T
Q  166 atgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||    
T  54499275 atgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaatt 54499319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 35025460 - 35025515
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgtt 76  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35025460 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39400323 - 39400236
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39400323 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32592401 - 32592223
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttaga-atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaata 119  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||| || |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||          
T  32592401 taattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcg-tagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcat------ 32592309  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
        | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  32592308 ---atgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 32592223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4598299 - 4598205
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  4598299 taattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgt 4598205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 56050229 - 56050171
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaaca 97  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  56050229 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaaca 56050171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 33816550 - 33816614
Alignment:
Q  145 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||    
T  33816550 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaatt 33816614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39398114 - 39398049
Alignment:
Q  133 cactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39398114 cactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 408297 - 408484
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  408297 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatag 408396  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  408397 tcttaagtgttccactttgtgag-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 408484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 445 - 264
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||      |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  445 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtac------tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 352  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  351 tcttaagtgttacactttatggg-gtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94438
Alignment:
Q  101 ttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 94429  T
Q  201 ggatgaatt 209  Q
      |||||||    
T  94430 tcatgaatt 94438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 93969 - 94056
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgata 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  93969 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28769966 - 28769778
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  28769966 taattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatag 28769867  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28769866 tcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 28769778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 30326815 - 30327002
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30326815 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 30326914  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30326915 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 30327002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8222441 - 8222254
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8222441 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 8222342  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  8222341 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 8222254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15383246 - 15383059
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15383246 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatag 15383147  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15383146 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 15383059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27227348 - 27227535
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27227348 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatag 27227447  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27227448 tcttaagtgttgcactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 27227535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37451598 - 37451421
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37451598 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 37451499  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37451498 tcttaagtgttacactttttgag-gtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 37451421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51129172 - 51128985
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51129172 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51129073  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  51129072 ttttaattgttacactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 51128985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27563766 - 27563955
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27563766 attaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgat 27563865  T
Q  119 agtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27563866 agtcttaagtgttcctctttgtggg-gtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 27563955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10923040 - 10922856
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  10923040 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacag 10922941  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10922940 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10922856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2960061 - 2959874
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2960061 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatag 2959962  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2959961 tcttaagtgttacaatttgtggga-tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaatt 2959874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 19899634 - 19899819
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19899634 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtc 19899733  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19899734 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 19899819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18422964 - 18422777
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  18422964 taattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatag 18422865  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18422864 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 18422777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25160945 - 25160758
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25160945 taattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 25160846  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  25160845 ttttaagtgttatactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaatt 25160758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27267063 - 27267249
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27267063 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 27267162  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27267163 tcttaagtgttgcactttgtggg-gtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 27267249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30254736 - 30254549
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  30254736 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacag 30254637  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  30254636 tcttaagtgttacactttatagg-gtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaatt 30254549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32216368 - 32216181
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  32216368 taattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatag 32216269  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  32216268 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaatt 32216181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32267347 - 32267164
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32267347 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 32267248  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatg 205  Q
    |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  32267247 tcttgagtgttacactttgt-ggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 32267164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23999658 - 23999473
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  23999658 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 23999559  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  23999558 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 23999473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 28564646 - 28564831
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28564646 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 28564745  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
      ||||| ||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28564746 --ttaagtgttacactttacggg-gtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 28564831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 238376 - 238551
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  238376 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 238475  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  238476 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgtta 238551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15752342 - 15752155
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||     
T  15752342 taattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatac 15752243  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15752242 tcttaagtgttacactttatggg-gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 15752155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47279502 - 47279315
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  47279502 taattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatag 47279403  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  47279402 tcttaagtgttacactttatggga-tgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 47279315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7078926 - 7079113
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  7078926 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag 7079025  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  ||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  7079026 tcttaagtcttatactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 7079113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16415959 - 16415772
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16415959 taattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 16415860  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  || || | |||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16415859 tcttaagtattacaatatgtggg-gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaatt 16415772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Original strand, 27763180 - 27763350
Alignment:
Q  27 atctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaa 126  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27763180 atctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaa 27763279  T
Q  127 gcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    |  || |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27763280 gtattacactttgtagg-gtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 27763350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46931720 - 46931537
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  46931720 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 46931621  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  46931620 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 46931537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40885126 - 40884939
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40885126 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 40885027  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||| |||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  40885026 tcttaagtgttacacttt-tcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaatt 40884939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42721349 - 42721165
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||     
T  42721349 taattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataa 42721253  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| |||  |||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42721252 tcttaagtgttatactttgtggg-gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 42721165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4330594 - 4330407
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  4330594 taattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatag 4330495  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  4330494 tcttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaatt 4330407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15168409 - 15168222
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15168409 taattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 15168310  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||| ||| |||||| || | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  15168309 ccttaagtgttacactttctgag-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaatt 15168222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14758345 - 14758167
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14758345 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 14758246  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||         ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  14758245 tcttaa---------tttctggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaatt 14758167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27532844 - 27533030
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  27532844 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatag 27532943  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| || ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27532944 tcttgagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 27533030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 33725445 - 33725650
Alignment:
Q  4 aattgttgattactgattaattcatc--tagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagt 101  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  33725445 aattgttgattgctgattaatg-atcaatagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagt 33725543  T
Q  102 tgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcg 201  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||      
T  33725544 tgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggg-gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatat 33725642  T
Q  202 gatgaatt 209  Q
    ||||||||    
T  33725643 gatgaatt 33725650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 37618764 - 37618942
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  37618764 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat------- 37618856  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37618857 --atgagtgttacactttatggga-tgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaatt 37618942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 47682357 - 47682544
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47682357 taattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatag 47682456  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  47682457 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaatt 47682544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 10181870 - 10182058
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacata-tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaata 119  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||   ||||||| ||| |||   ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  10181870 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgata 10181969  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  10181970 gtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 10182058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 9902917 - 9903104
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  9902917 taattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatag 9903016  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  9903017 tcttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaatt 9903104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38759847 - 38759659
Alignment:
Q  20 ttaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaata 119  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  38759847 ttaattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgata 38759748  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  38759747 gtctcaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaatt 38759659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 34012245 - 34012427
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34012245 taattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 34012344  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |     | ||| || |||||||| ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34012345 t-----gtgttacattttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 34012427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38823527 - 38823340
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  38823527 taattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 38823428  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  38823427 tcttaagtgttacactttgttgg-gtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 38823340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22171024 - 22170837
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||   | ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  22171024 taatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 22170925  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  22170924 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaatt 22170837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39393697 - 39393509
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| | |||| || | ||||    
T  39393697 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatag 39393598  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39393597 tcttaagtgttacactttgtagga-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 39393509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41926469 - 41926289
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||       
T  41926469 taattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaa--- 41926374  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       |||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41926373 ---taagtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 41926289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1547584 - 1547408
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||         ||||| |||||| |||| ||||    
T  1547584 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacag--------agttgttgatatcatgtgatag 1547493  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    | || || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1547492 ttttgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 1547408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Original strand, 1359798 - 1359919
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||  || |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  1359798 taattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataa 1359897  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgg 142  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    
T  1359898 tcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3535236 - 3535058
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  3535236 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg------ 3535143  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  3535142 ---taagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 3535058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 31621415 - 31621603
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 118  Q
    |||||||| ||||  |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  31621415 ttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgat 31621514  T
Q  119 agtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| ||  ||| || |||| || || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31621515 agtcttaagtgtcacac-ttctggg-gtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 31621603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 48353855 - 48353735
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  48353855 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 48353756  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgg 142  Q
    |||| || ||| ||||||||||    
T  48353755 tctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Original strand, 11742231 - 11742336
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  11742231 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatag 11742330  T
Q  121 tcttaa 126  Q
    ||||||    
T  11742331 tcttaa 11742336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3309466 - 3309273
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  3309466 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatag 3309367  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtg----ggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||| |||    |  |||||||  ||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3309366 tcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 3309273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21289913 - 21289829
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgat 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21289913 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagttgat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48620838 - 48620763
Alignment:
Q  133 cactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48620838 cactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 48620763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 11742338 - 11742401
Alignment:
Q  146 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11742338 tgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaatt 11742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31962926 - 31962851
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacata 99  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  31962926 ttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaacata 31962851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 1149506 - 1149690
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1149506 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatag 1149605  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1149606 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1149690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1205243 - 1205066
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  1205243 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatag 1205144  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1205143 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 1205066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 37970393 - 37970580
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37970393 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 37970492  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  37970493 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaatt 37970580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33906528 - 33906341
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33906528 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 33906429  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  33906428 tcttaagtgttacacttt-ttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 33906341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 43643469 - 43643653
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  43643469 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatag 43643568  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  43643569 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 43643653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 4132560 - 4132746
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4132560 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 4132659  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4132660 tcttatgtgttacactttgtggg-gtgttacactta-aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaatt 4132746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16223179 - 16222992
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  16223179 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatac 16223080  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16223079 tcttaagtgttacactttttggg-gtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaatt 16222992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7890831 - 7891018
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||     
T  7890831 taattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataa 7890930  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7890931 tcttaagtgttacacgttgtggg-gtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 7891018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27082712 - 27082899
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27082712 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatag 27082811  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  27082812 tcttaagtgttacactttgcggg-gtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaatt 27082899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40862735 - 40862560
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40862735 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatag 40862636  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40862635 tcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgtta 40862560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 8803693 - 8803867
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||     
T  8803693 attcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagta 8803792  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| ||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8803793 ttaagtgttacactttttagg-gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 8803867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 16446749 - 16446936
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16446749 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 16446848  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16446849 tcttaagtgttacgctttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 16446936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 31933760 - 31933947
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||     
T  31933760 taattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataa 31933859  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31933860 ttttaagtgttacactttgtgcg-gtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaatt 31933947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 36694840 - 36695027
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36694840 taattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 36694939  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  36694940 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 36695027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9864462 - 9864277
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9864462 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtc 9864363  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  9864362 ttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaatt 9864277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 6098387 - 6098579
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttat-----cgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6098387 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 6098486  T
Q  116 aatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  6098487 gatagtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaatt 6098579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 10555078 - 10555263
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10555078 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 10555177  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||  ||| ||| |  |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10555178 tc--aagtgttacgttttgtgag-gtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 10555263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12876426 - 12876238
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12876426 taattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 12876327  T
Q  121 tc-ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||    
T  12876326 tctttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaatt 12876238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 35459585 - 35459769
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  35459585 taattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatag 35459684  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| |||  | | ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35459685 tcttaagtgttataatctgtggga-tgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35459769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 5299820 - 5300007
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| |||||| || | |||     
T  5299820 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataa 5299919  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  5299920 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 5300007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11727340 - 11727153
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  11727340 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatag 11727241  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||    
T  11727240 tcttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaatt 11727153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 39098993 - 39099180
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  39098993 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatag 39099092  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||   ||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39099093 tcttaagtgtgatactttgtggga-tgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaatt 39099180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Original strand, 23854305 - 23854483
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |    
T  23854305 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattg 23854404  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||| |||||| || | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23854405 tcttaagtgttacactttatgcg-gtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatc 23854483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 1953862 - 1954050
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1953862 taattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatag 1953961  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||    
T  1953962 tcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaatt 1954050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Original strand, 30654459 - 30654642
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  30654459 attcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc 30654558  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaa 207  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  30654559 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaa 30654642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38644294 - 38644107
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  38644294 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatag 38644195  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| || ||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  38644194 tcttgagtgttacactttat-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 38644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34895278 - 34895096
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34895278 taattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 34895179  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |     | ||| || |||||||| ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34895178 t-----gtgttacattttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 34895096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 147
Target Start/End: Original strand, 1149794 - 1149916
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |    
T  1149794 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----g 1149889  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtg 147  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1149890 tcttaagtgttacactttgtgggagtg 1149916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Original strand, 41910907 - 41911049
Alignment:
Q  65 tattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaagg 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  41910907 tattttatcgtt-gcatctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaagg 41911004  T
Q  165 tatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  41911005 taggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 41911049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307752
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||   |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggg-gtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaatt 13307752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 1150091 - 1150163
Alignment:
Q  133 cactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1150091 cactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1150163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 466148 - 465971
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  || ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||          
T  466148 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgata-tatg------ 466056  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  466055 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025831
Alignment:
Q  67 ttttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggta 166  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||  ||| || ||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggg-gtgttacagttaaaataaggta 43025874  T
Q  167 tgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||||||||||||| |||| | || ||| || ||||||||    
T  43025873 ggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaatt 43025831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44869813 - 44869626
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  44869813 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatag 44869714  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |    || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  44869713 tcttaagtgttacactttgtgg--ggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaatt 44869626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 35859252 - 35859160
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatt 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35859252 attaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 34951931 - 34952020
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatat 110  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34951931 taattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 24823268 - 24823336
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaaca 89  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24823268 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18259395 - 18259233
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||   | ||| ||||||  |||    |    
T  18259395 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgt----g 18259300  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgta 188  Q
     |||| | ||| |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18259299 acttaggtgttacactttgtggga-tgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12587898 - 12587812
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatga 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12587898 taattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362644
Alignment:
Q  146 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaatt 41362644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7998553 - 7998478
Alignment:
Q  62 tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  7998553 tactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7998489 - 7998427
Alignment:
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatcggatg 205  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  7998489 agtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 7998427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 34952026 - 34952092
Alignment:
Q  143 gagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||    
T  34952026 gagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaatt 34952092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34463787 - 34463704
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatga 107  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||   ||||||| |  || ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34463787 taattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 3e-62; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 699467 - 699280
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  699467 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 699368  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  699367 tcttaagtattacactttgt-ggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 699280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5830209 - 5830032
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5830209 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 5830110  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5830109 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat 5830032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7208722 - 7208909
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  7208722 taattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatag 7208821  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7208822 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 7208909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 31705470 - 31705657
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  31705470 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatgg 31705569  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31705570 tcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 31705657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22981110 - 22980923
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22981110 taattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatag 22981011  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22981010 tcttaagtgttacattttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 22980923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22255499 - 22255312
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255499 taattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 22255400  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22255399 ttttaagtgttacactttgtgtg-gtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 22255312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35504682 - 35504495
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  35504682 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatag 35504583  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  35504582 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 35504495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 22973940 - 22974124
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22973940 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatag 22974039  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  22974040 tcttaagtgttacattttgtgag-gtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatga 22974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27318347 - 27318532
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27318347 taattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaactta--tgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 27318444  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  27318445 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 27318532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36867079 - 36866892
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36867079 taattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 36866980  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  36866979 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 36866892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33908544 - 33908372
Alignment:
Q  27 atctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaa 126  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  33908544 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaa 33908445  T
Q  127 gcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    | ||| |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33908444 gtgttacactttctggg-gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatc 33908372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12910672 - 12910485
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  12910672 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatag 12910573  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  12910572 tcttaggtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaatt 12910485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 31786504 - 31786691
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  31786504 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatag 31786603  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31786604 ttttaagtgttacactttgtagg-gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 31786691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Original strand, 35826344 - 35826520
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||     
T  35826344 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatg--ataa 35826441  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  35826442 tcttaagggttacactttgt-ggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatc 35826520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 38528095 - 38528282
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  38528095 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatag 38528194  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  38528195 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 38528282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40133702 - 40133515
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40133702 taattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 40133603  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  40133602 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 40133515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 23116098 - 23116267
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  23116098 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 23116197  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23116198 gtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaatt 23116267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 17157889 - 17158076
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |    
T  17157889 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatgg 17157988  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17157989 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 17158076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 13956220 - 13956407
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  13956220 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatatgatag 13956319  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| | |||||| || ||||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13956320 tcttaagtgttacgctttgtagg-gtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaatt 13956407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 21088624 - 21088799
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  21088624 taattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataa 21088723  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21088724 tcttaagtgttacactttgtggga-tgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgtta 21088799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 30969186 - 30969369
Alignment:
Q  25 tcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtctt 124  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| | |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30969186 tcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtctt 30969285  T
Q  125 aagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30969286 aagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 30969369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 14919425 - 14919563
Alignment:
Q  60 tatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataa 159  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||| | ||||||| |||||||    
T  14919425 tatacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgag-gtgttacacttataa 14919523  T
Q  160 caaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919524 taaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaat 14919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36860741 - 36860565
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36860741 taattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 36860642  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgctt-ataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  36860641 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgtta 36860565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19120176 - 19119989
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||    
T  19120176 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatag 19120077  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  19120076 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaatt 19119989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 23954680 - 23954834
Alignment:
Q  53 acttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacg 152  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| | |||||||     
T  23954680 acttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgag-gtgttaca 23954777  T
Q  153 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23954778 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 23954834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24886404 - 24886288
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24886404 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 24886305  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  24886304 tcttaagtgttacactt 24886288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 35511340 - 35511522
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35511340 taattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatag 35511439  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |     | ||| || |||||||| ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35511440 t-----gtgttacattttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 35511522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 2888303 - 2888471
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  2888303 taattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatag 2888402  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 190  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||| |||||  |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2888403 tcttaagtgttacactttat-ggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagt 2888471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5837872 - 5837685
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  5837872 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatag 5837773  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  5837772 tcttaagtgttacactttgtggg-gtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaatt 5837685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8437282 - 8437099
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||     
T  8437282 taattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataa 8437183  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatg 205  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||    |||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  8437182 tcttaagtgttacacattgtggg-gtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg 8437099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 8741746 - 8741931
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgat-attatgtaatagtc 122  Q
    |||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| | || || |||| ||||||    
T  8741746 ttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtc 8741845  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||    
T  8741846 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaatt 8741931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 25500787 - 25500971
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtct 123  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||| ||  |||    
T  25500787 ttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatct 25500886  T
Q  124 taagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  25500887 taagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaatt 25500971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268204
Alignment:
Q  80 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaga 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcg-gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttga 26268234  T
Q  180 ttaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  26268233 ttaattgtattcttgttaatctgatgaatt 26268204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35934213 - 35934025
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  35934213 taattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatag 35934114  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  35934113 tcttaagtgttacactttgtagg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 35934025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 15992398 - 15992585
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||  ||||    
T  15992398 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatag 15992497  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||| | || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15992498 tcttaagtgtgacactttgtggg-gtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 15992585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27330621 - 27330434
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||||    
T  27330621 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatag 27330522  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||    
T  27330521 tcttaagtgtgacacttcatggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaatt 27330434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39573128 - 39572949
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||         ||||| |||||| |||| ||||    
T  39573128 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacag--------agttgttgatatcatgtgatag 39573037  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||  || ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39573036 tctcgagtgttacactttgtggga-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 39572949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Original strand, 14409199 - 14409305
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14409199 taattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 14409298  T
Q  121 tcttaag 127  Q
    |||||||    
T  14409299 tcttaag 14409305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 1429020 - 1429136
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  1429020 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttatgatattatgtgatag 1429119  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  1429120 tcttaagtgttacactt 1429136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824524
Alignment:
Q  25 tcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtctt 124  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||| || | ||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||| ||||||||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatcttgaca-tctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctt 6824440  T
Q  125 aagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  6824441 aagtgttacactttgtggg-gtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatt 6824524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32563457 - 32563279
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  32563457 taatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatg------ 32563364  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  32563363 ---tgagtgttacactttgtggg-ctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 32563279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 43308518 - 43308686
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||        ||||    
T  43308518 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgat--------atag 43308609  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||||| ||| |||||| |  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43308610 tcttaagtgttacacttt-tcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaa 43308686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9200541 - 9200363
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  9200541 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg------ 9200448  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||    
T  9200447 ---tgagtgttacactttgt-ggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaatt 9200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42343038 - 42342861
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||          
T  42343038 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatg------ 42342945  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| |||||||| || || |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  42342944 ---tgagtgttacactttgt-ggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 42342861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25889687 - 25889584
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  25889687 taattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtcataa 25889588  T
Q  121 tctt 124  Q
    ||||    
T  25889587 tctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25669893 - 25669799
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25669893 taattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgt 25669799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112348
Alignment:
Q  99 agttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggg-gt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaa 5112347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7693538 - 7693360
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||          
T  7693538 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatg------ 7693445  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||  |||||||    
T  7693444 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaatt 7693360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15724805 - 15724618
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||  ||||||||||  ||||||||||| |||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  15724805 taattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatag 15724706  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||  | | ||||||| ||| ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  15724705 tcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 15724618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22019940 - 22019772
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | ||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||          
T  22019940 taattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatg------ 22019847  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
       | || |||  |||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22019846 ---tgagtgttatactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 22019772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24886299 - 24886244
Alignment:
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24886299 agtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 24886244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8467043 - 8466938
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| ||| ||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  8467043 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgtta-cacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatag 8466945  T
Q  121 tcttaag 127  Q
    |||||||    
T  8466944 tcttaag 8466938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409372
Alignment:
Q  147 gttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 14409372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 28416497 - 28416572
Alignment:
Q  133 cactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || |||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  28416497 cactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 28416572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 1429139 - 1429190
Alignment:
Q  158 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  1429139 aacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaatt 1429190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25669783 - 25669737
Alignment:
Q  142 ggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgta 188  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25669783 ggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8204 - 8017
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  8204 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatag 8105  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8104 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7234902 - 7235089
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7234902 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 7235001  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  7235002 tcttaagcgttacactttctggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 7235089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 6091049 - 6091237
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6091049 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 6091148  T
Q  121 tc-ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6091149 tctttaagtgttacactttgttgg-gtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 6091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1946149 - 1945975
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  1946149 attcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 1946050  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1946049 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 1945975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5627706 - 5627521
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  5627706 attcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 5627607  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||  || |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  5627606 ttaagtattacactttgtagg-gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 5627521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 3879806 - 3879993
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3879806 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 3879905  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||    
T  3879906 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaatt 3879993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29182500 - 29182293
Alignment:
Q  5 attgttgattactgat---taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagt 101  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||    
T  29182500 attgttgattaatgatcagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagt 29182401  T
Q  102 tgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcg 201  Q
    || |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||     
T  29182400 tgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatct 29182301  T
Q  202 gatgaatt 209  Q
    ||||||||    
T  29182300 gatgaatt 29182293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20768399 - 20768214
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||      
T  20768399 taattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatga 20768300  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||    
T  20768299 tcttaagtgttacactttatggga-tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaatt 20768214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353412
Alignment:
Q  52 gacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttac 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggga-tgttac 30353354  T
Q  152 gcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||    
T  30353355 acttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaatt 30353412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 21017020 - 21017166
Alignment:
Q  62 tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataaca 161  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |    
T  21017020 tactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaata 21017118  T
Q  162 aggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||    
T  21017119 acgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaatt 21017166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 4318689 - 4318877
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |   |||||||| ||||||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  4318689 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatag 4318788  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| | || ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  4318789 tcttaagtgttacactttatagg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaatt 4318877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055269
Alignment:
Q  80 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaga 179  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagc-gtgttacacttagaacaaggtatgataaaattata 7055239  T
Q  180 ttaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7055240 ttaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 7055269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 33892879 - 33893057
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||          
T  33892879 taattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatg------ 33892972  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33892973 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 33893057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491745
Alignment:
Q  69 ttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatg 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||| ||| | ||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| || |||||| |    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtagg 15491786  T
Q  169 ataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  15491785 ataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaatt 15491745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33619147 - 33619036
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatct-----ttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33619147 taattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgc 33619048  T
Q  116 aatagtcttaag 127  Q
     ||| |||||||    
T  33619047 gatactcttaag 33619036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8513545 - 8513426
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  8513545 taattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatag 8513446  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgt 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  8513445 tcttaagtgttacactttgt 8513426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6089220 - 6089114
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  6089220 taattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatag 6089121  T
Q  121 tcttaag 127  Q
    |||||||    
T  6089120 tcttaag 6089114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 7054642 - 7054704
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatcttt 85  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  7054642 attcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618964
Alignment:
Q  163 ggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 33618964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 42505943 - 42506130
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  42505943 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatag 42506042  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42506043 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 42506130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 46297630 - 46297817
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46297630 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 46297729  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  46297730 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaatt 46297817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 26941128 - 26941315
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  26941128 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatag 26941227  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26941228 ttttaagtgttacactttatgag-gtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 26941315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 40552127 - 40552314
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |     
T  40552127 taattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaa 40552226  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40552227 tcctaagtgttacacgttgtggga-tgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaatt 40552314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48355249 - 48355065
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48355249 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 48355150  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  48355149 tcttaagtgttacactttgtggta-tgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatga 48355065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 22622586 - 22622773
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  22622586 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatag 22622685  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22622686 tcttaagtgttacgctttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 22622773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 52040792 - 52040977
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52040792 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtc 52040891  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  52040892 ttaagtgttacactatgtggg-gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 52040977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 4761516 - 4761701
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4761516 taattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatag 4761615  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| |||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4761616 tcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatga 4761701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 21009672 - 21009857
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21009672 attcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtc 21009771  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21009772 ttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 21009857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 33378653 - 33378840
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  33378653 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatag 33378752  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  || |||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  33378753 tcttaagtattacacttcttggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 33378840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34133243 - 34133056
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34133243 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatag 34133144  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  34133143 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaatt 34133056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 53229020 - 53229207
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  53229020 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatag 53229119  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  53229120 tcttaagtgttacactttgtggg-gagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaatt 53229207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 54828569 - 54828756
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54828569 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttgatgatattatttgatag 54828668  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  54828669 ttttaagtgttacactttgtggga-tgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaatt 54828756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39282960 - 39282774
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39282960 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatag 39282861  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaat 208  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39282860 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaat 39282774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Original strand, 46994529 - 46994707
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  46994529 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatag 46994628  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46994629 tcttaagtgttacattttgtggg-gcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 46994707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 54506113 - 54505939
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  54506113 attcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtc 54506014  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  54506013 ttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 54505939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33698463 - 33698274
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||    
T  33698463 attaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgat 33698364  T
Q  119 agtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33698363 agtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 33698274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37158016 - 37157837
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtaata 119  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  37158016 taattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgata 37157917  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37157916 gtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 37157837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32373777 - 32373591
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  32373777 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagt 32373678  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  32373677 cttaagtgtcacactttgtggga-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaatt 32373591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2008242 - 2008054
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 118  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  2008242 attatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgat 2008143  T
Q  119 agtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  2008142 agtcttaagtgttacactttgt-ggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaatt 2008054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 3655076 - 3655257
Alignment:
Q  27 atctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaa 126  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| || |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  3655076 atctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaa 3655175  T
Q  127 gcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3655176 gtgttacattttgt-ggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 3655257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22451276 - 22451089
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  22451276 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatag 22451177  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||  ||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  22451176 tgttaaatgttacacttactggg-gtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaatt 22451089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44891805 - 44891618
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||  |  |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  44891805 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatag 44891706  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  44891705 tcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaatt 44891618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 24707983 - 24708172
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  24707983 taatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattg 24708082  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagat--taagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24708083 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 24708172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25580047 - 25579869
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| | || ||| |  |||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  25580047 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatag 25579948  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25579947 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatc 25579869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47481828 - 47481654
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  47481828 attcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtc 47481729  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47481728 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 47481654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7327350 - 7327537
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  7327350 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatag 7327449  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||   || |||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7327450 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaatt 7327537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43348569 - 43348378
Alignment:
Q  17 tgattaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgta 116  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||     
T  43348569 tgattgattcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtg 43348470  T
Q  117 atagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  43348469 atagtcttaagtgtcacactttatggga-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 43348378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11467114 - 11466945
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| | ||||| ||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  11467114 ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 11467015  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11467014 gtggg-gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 11466945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1090001 - 1089833
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||    
T  1090001 taattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatag 1089903  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 190  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1089902 tcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagt 1089833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45174814 - 45174626
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  45174814 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattatag 45174715  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  45174714 tcttaagtgttacactttgt-agagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 45174626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 11357249 - 11357365
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11357249 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 11357348  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  11357349 tcttaagtgttacactt 11357365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 173
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373263
Alignment:
Q  45 catcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtggga 144  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggga 20373235  T
Q  145 gtgttacgcttataacaaggtatgataaa 173  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373236 -tattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 24488830 - 24489017
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  24488830 taatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatag 24488929  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  24488930 tcttaagtgttacaccttgtgag-gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaatt 24489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 22445933 - 22446100
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  22445933 taattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatag 22446032  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 190  Q
    |||| || |||  || ||||  ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22446033 tcttgagtgttatacattgt--gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagt 22446100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21193915 - 21193727
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  21193915 taattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatag 21193816  T
Q  121 tc-ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || ||||| |||   |||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  21193815 tctttaagtgttatcctttat-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 21193727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37203376 - 37203188
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaaca-tagttgatgatattatgtaata 119  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||  ||||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  37203376 taattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgata 37203277  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| || | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  37203276 gtcttaagtgttacactttgtggg-gtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaatt 37203188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4015767 - 4015581
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||||    
T  4015767 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatag 4015669  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||  ||||||||    
T  4015668 tcttaagtgtgacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaatt 4015581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 43975758 - 43975943
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgca---aacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||     
T  43975758 attaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgc 43975857  T
Q  116 aatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||       ||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  43975858 gatagt-------gttacactttctggg-gtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaatt 43975943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3362563 - 3362385
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||  |  ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  3362563 taattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatag 3362464  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagatta--agtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  3362463 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaa 3362385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 11835501 - 11835673
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||      ||||||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  11835501 taattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcatgtgatag 11835594  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaa-attagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||  ||| |||||||| ||  |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11835595 tcttaattgttacactttgtagg-ttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaat 11835673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29164117 - 29163939
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  29164117 taattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg------ 29164024  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29164023 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaatt 29163939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 51212639 - 51212743
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51212639 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51212738  T
Q  121 tctta 125  Q
     ||||    
T  51212739 cctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38591988 - 38591822
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||    
T  38591988 ttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgtttt 38591889  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||| || |||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38591888 gtggg-gtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38591822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29099654 - 29099476
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |     
T  29099654 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa- 29099556  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
            ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  29099555 --------gttacactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaatt 29099476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 14586548 - 14586725
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||  ||    
T  14586548 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatca--tacgag 14586644  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |       ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14586645 t-------gttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 14586725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36012447 - 36012258
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaac-atagttgatgatattatgtaata 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||| |||||| || | |||    
T  36012447 taattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgata 36012348  T
Q  120 gtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  36012347 gtcttaagtgttacattttgtggga-tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaatt 36012258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Original strand, 11357036 - 11357140
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||    
T  11357036 ttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacacttt 11357135  T
Q  139 gtggg 143  Q
    |||||    
T  11357136 gtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40936281 - 40936165
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| | |||| |||| ||||    
T  40936281 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatag 40936182  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  40936181 tcttaagtgttacactt 40936165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Original strand, 27480259 - 27480350
Alignment:
Q  50 tggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaac----atagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  27480259 tggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 27480350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 51212961 - 51213033
Alignment:
Q  133 cactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51212961 cactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 51213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844447
Alignment:
Q  80 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttag 178  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagg-gtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattag 35844478  T
Q  179 attaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  35844477 attaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 35844447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 44186385 - 44186485
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  44186385 taatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag 44186484  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  44186485 t 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 50475119 - 50475027
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattat 113  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||   |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  50475119 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattat 50475027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176175
Alignment:
Q  99 agttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||   ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgg-agtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaa 53176186  T
Q  199 tcggatgaatt 209  Q
    || ||||||||    
T  53176185 tctgatgaatt 53176175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 53811602 - 53811701
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||    
T  53811602 taattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgtgatag 53811697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 44186492 - 44186556
Alignment:
Q  145 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44186492 gtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaatt 44186556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373351
Alignment:
Q  158 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaatt 20373351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 11357371 - 11357419
Alignment:
Q  161 aaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11357371 aaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaatt 11357419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 209
Target Start/End: Original strand, 27480370 - 27480434
Alignment:
Q  145 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  27480370 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaatt 27480434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37110166 - 37109977
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37110166 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtag 37110067  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtat--gataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37110066 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 37109977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10481897 - 10481710
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  10481897 taattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatag 10481798  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  10481797 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaatt 10481710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27284036 - 27283849
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27284036 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatag 27283937  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  27283936 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaatt 27283849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30055819 - 30055632
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  30055819 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatag 30055720  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30055719 tcttaagtgttacactttgtagg-gtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 30055632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 9355696 - 9355882
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9355696 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagt 9355795  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9355796 tttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 9355882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 17842453 - 17842642
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  17842453 taattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtag 17842552  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtat--gataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17842553 tcttaagtgttacactttgtggga-tgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 17842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258650
Alignment:
Q  42 caacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtg 141  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  142 ggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  38258716 gg-gtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 38258650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18797619 - 18797435
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18797619 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 18797520  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18797519 tcttaagtgttacactttgtgag-gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 18797435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 37703367 - 37703551
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37703367 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 37703466  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  37703467 tcttaagtggtacactttgtggga-tgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 31578933 - 31579120
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  31578933 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatag 31579032  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| | || ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31579033 tcttaagtgttacactttatagg-gtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 31579120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 32820922 - 32821109
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  32820922 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatag 32821021  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  32821022 tcttaagtgttacactttatggg-gtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaatt 32821109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24212031 - 24211846
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  24212031 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtc 24211932  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||| | ||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  24211931 ttaggtgttacactttgtagga-tgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 24211846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 41764947 - 41765134
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41764947 taattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 41765046  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  41765047 tcttaagtgttacactttctggg-gtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 41765134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 48928166 - 48928353
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48928166 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 48928265  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| || |||||| || | ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  48928266 tcttaagcattacactttctgag-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaatt 48928353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 15612628 - 15612815
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  15612628 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 15612727  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15612728 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 15612815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23111484 - 23111295
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||| | || |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23111484 taattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 23111385  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatg--ataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  23111384 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaatt 23111295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11071495 - 11071311
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  11071495 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataa 11071399  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11071398 tcttaagtgttacactttgtggg-gtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaatt 11071311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21991910 - 21991741
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21991910 ttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 21991811  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21991810 gtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 21991741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686145
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 43686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 5657350 - 5657537
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||    
T  5657350 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatag 5657449  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||  || |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  5657450 tcttaagtattacactttgtggg-ctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaatt 5657537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37347313 - 37347137
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37347313 taattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtag 37347214  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37347213 tcttaagtgttacactttgt-ggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaat 37347137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7335085 - 7334910
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||     
T  7335085 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataa 7334987  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7334986 tcttaagtgttacactctgtggg-gtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 7334910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 15672628 - 15672818
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactatt---ttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaa 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  |||||||   |||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  15672628 taattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtga 15672727  T
Q  118 tagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  15672728 tagtcttaagtgttacactttgt-ggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaatt 15672818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32432744 - 32432557
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32432744 taattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatag 32432645  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  32432644 tcttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaatt 32432557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 10359087 - 10359271
Alignment:
Q  25 tcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtctt 124  Q
    |||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  10359087 tcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtctt 10359186  T
Q  125 aagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaga-ttaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  10359187 aagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaatt 10359271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 46480998 - 46481182
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  46480998 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatag 46481097  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| |||||| || || |||||| |||| ||||| |||  ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||    
T  46481098 tcttaagtgttacactttatgaga-tgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4583211 - 4583024
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4583211 taattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 4583112  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  4583111 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 4583024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 25691413 - 25691600
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |  |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  25691413 taattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatag 25691512  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  25691513 tcttaagtgtgacactttgtggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaatt 25691600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 33688132 - 33688318
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | |||||    
T  33688132 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagt 33688231  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||| |  ||| |||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33688232 cttgaatgttacactttat-ggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 33688318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44598955 - 44598771
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtct 123  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  44598955 ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 44598856  T
Q  124 taagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  44598855 taggtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 44598771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6546811 - 6546624
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||     
T  6546811 taattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataa 6546712  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  6546711 tattaagtgttatactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 6546624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704262
Alignment:
Q  83 tttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagatta 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaatta 37704289  T
Q  183 agtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  37704288 agtgtagtcttgttaatctgataaatt 37704262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8861574 - 8861390
Alignment:
Q  24 ttcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtct 123  Q
    |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| || ||||    
T  8861574 ttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtct 8861475  T
Q  124 taagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | || ||| ||||||| ||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||    
T  8861474 tgagtgttacactttgcggg-gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaatt 8861390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12166035 - 12165857
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||          
T  12166035 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatattatg------ 12165942  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12165941 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 12165857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 31520610 - 31520726
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  31520610 taattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatag 31520709  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  31520710 tcttaagtgttacactt 31520726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Original strand, 32593075 - 32593191
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32593075 taatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatag 32593174  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  32593175 tcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 48928469 - 48928620
Alignment:
Q  57 acatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgctta 156  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| || | ||||||| ||||    
T  48928469 acatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgag-gtgttacactta 48928567  T
Q  157 taacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     || || ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  48928568 aaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaatt 48928620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35353398 - 35353256
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  35353398 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtc 35353299  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggta 166  Q
    ||||| ||| || ||| |||| ||||||| |||| |||||||||    
T  35353298 ttaagtgttacattttctggg-gtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29173814 - 29173709
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29173814 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 29173716  T
Q  121 tcttaag 127  Q
    |||||||    
T  29173715 tcttaag 29173709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 44411407 - 44411509
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaat 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44411407 attaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgat 44411506  T
Q  119 agt 121  Q
    |||    
T  44411507 agt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22687523 - 22687344
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||         ||||| |||||| |||  ||||    
T  22687523 taattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaacag--------agttgttgatatcatgagatag 22687432  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22687431 tcttgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatt 22687344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26980598 - 26980482
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||    
T  26980598 taattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatag 26980499  T
Q  121 tcttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  26980498 tcttaagtgttacactt 26980482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 26587961 - 26588119
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||         ||||| |||||| |||| ||||    
T  26587961 taattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacag--------agttgttgatatcatgtgatag 26588052  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgta 188  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26588053 tcttgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 26588119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  123 ttaagcgttgcactt 137  Q
    ||||| ||| |||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43925387 - 43925218
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||       |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  43925387 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtat------tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattg 43925294  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    | |||||  ||  || ||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43925293 tattaagtattaaacgttgtgag-gtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgtta 43925218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 12390518 - 12390612
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  12390518 taattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgt 12390612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421436
Alignment:
Q  85 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaag 184  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtggga-tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaag 27421411  T
Q  185 tgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||    
T  27421412 tgtattcttgttaatctgataaatt 27421436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 37704474 - 37704387
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 108  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37704474 taattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 209
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413435
Alignment:
Q  124 taagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaatt 44413435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 34362047 - 34362123
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaaca 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  34362047 taattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38053648 - 38053593
Alignment:
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38053648 agtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 38053593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 12390621 - 12390686
Alignment:
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12390621 agtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 12390686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 31520729 - 31520770
Alignment:
Q  158 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31520729 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 31520770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 32593194 - 32593245
Alignment:
Q  158 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  32593194 aacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaatt 32593245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26980493 - 26980428
Alignment:
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  26980493 agtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 26980428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 27421232 - 27421283
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactatttt 70  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27421232 attatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29173701 - 29173657
Alignment:
Q  153 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29173701 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 29173657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44913963 - 44913793
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  44913963 ttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacacttt 44913864  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  44913863 gtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaatt 44913793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 43648131 - 43648315
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43648131 taattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatag 43648230  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| |||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43648231 tcttaagtgttatactttgtgtg-gtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 43648315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 2325264 - 2325441
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  2325264 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatag 2325363  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaat 199  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2325364 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 2325441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071810
Alignment:
Q  44 acatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtggg 143  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17071746 -gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 17071810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37906027 - 37905838
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||    
T  37906027 taattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatag 37905928  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgt-gggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37905927 ttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 37905838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3177256 - 3177069
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3177256 taattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 3177157  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||    
T  3177156 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatt 3177069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4763948 - 4763761
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  4763948 taattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatag 4763849  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4763848 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 4763761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41961157 - 41960970
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||     
T  41961157 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataa 41961058  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41961057 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 41960970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 33550875 - 33551059
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33550875 attcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtc 33550973  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33550974 ttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 33551059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4167239 - 4167052
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4167239 taattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatag 4167140  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||    
T  4167139 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaatt 4167052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31862169 - 31861982
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||     
T  31862169 taattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataa 31862070  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31862069 ttttaagtgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 31861982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44286266 - 44286079
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||  |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  44286266 taattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgttgatatcatgtgatag 44286167  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  44286166 tcttaagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatt 44286079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35959209 - 35959027
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35959209 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac----atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatag 35959114  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  35959113 tcttaactgttacactttgtggg-gtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaatt 35959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 11366269 - 11366454
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  11366269 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 11366368  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  11366369 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaatt 11366454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 19289209 - 19289393
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19289209 taattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatag 19289308  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  19289309 tcttaagtgttacactttgtggga-tgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 19289393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41465818 - 41465655
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  41465818 taattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatag 41465719  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagt 185  Q
    ||||||| ||| |||||| || | ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  41465718 tcttaagtgttacactttctgag-gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagt 41465655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054169
Alignment:
Q  44 acatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtggg 143  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  144 agtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  17054105 -gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaatt 17054169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45328019 - 45327850
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||    
T  45328019 ttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgttacacttt 45327920  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  45327919 ctgag-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaatt 45327850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26357894 - 26357707
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  26357894 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatag 26357795  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    | ||||| ||| || ||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  26357794 ttttaagtgttacaatttgtggga-tgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaatt 26357707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 29242048 - 29242211
Alignment:
Q  45 catcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtggga 144  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||     
T  29242048 catcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggg- 29242146  T
Q  145 gtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29242147 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaatt 29242211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 31570620 - 31570807
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| | ||    
T  31570620 taattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacag 31570719  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31570720 tcttaagtgttacattttgtggg-gtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 31570807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4263960 - 4264150
Alignment:
Q  19 attaattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatg-taa 117  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |    
T  4263960 attatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgttga 4264059  T
Q  118 tagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||    
T  4264060 tagtcttaagtgttacactttgtggg-gtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaatt 4264150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Original strand, 33709118 - 33709296
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  33709118 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatag 33709217  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||| ||  |||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  33709218 tcttaagtgtgacactttgtagg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatc 33709296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4478681 - 4478499
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  4478681 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggtgatatcatgtgataga 4478582  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| ||| ||||||      ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  4478581 cttaagtgttacacttt------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 4478499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Original strand, 19424573 - 19424701
Alignment:
Q  80 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaga 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19424573 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattaga 19424671  T
Q  180 ttaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  19424672 ttaagcgtattcttgttaatctgatgaatt 19424701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 18494168 - 18494353
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  18494168 aattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagt 18494267  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||| ||  | ||||||  |||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | || |||| ||||||||    
T  18494268 cttaagtgtgactctttgt--gaggtttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaatt 18494353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27349834 - 27350012
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||          
T  27349834 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatg------ 27349927  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27349928 ---tgagtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 27350012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36642287 - 36642116
Alignment:
Q  39 ttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcacttt 138  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  36642287 ttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 36642188  T
Q  139 gtgggagtgttacgcttataacaaggtatgat--aaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    || || ||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  36642187 gtagg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 36642116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 39167255 - 39167424
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39167255 taattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatag 39167354  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgtta 197  Q
    |       ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  39167355 t------tgttacactttgtggga-tgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgtta 39167424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 7006825 - 7006940
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |    
T  7006825 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatatt 7006924  T
Q  122 cttaagcgttgcactt 137  Q
    |||||| ||| |||||    
T  7006925 cttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19314164 - 19313981
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggactta---catatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaa 117  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||   ||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  19314164 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtga 19314065  T
Q  118 tagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||       ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19314064 tagt-------gttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 19313981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 19500801 - 19500924
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  19500801 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatag 19500900  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtggga 144  Q
    ||||||| ||| || |||||||||    
T  19500901 tcttaagtgttacattttgtggga 19500924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13711776 - 13711594
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  13711776 taattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatag 13711677  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||   ||  ||||| |||| ||||||| |||| |||     |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  13711676 tcttaactattatactttatggg-gtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 13711594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 198
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258349
Alignment:
Q  62 tactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataaca 161  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| || |    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggg-gtgttacacttaaaaaa 18258312  T
Q  162 aggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaa 198  Q
    | ||| |||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18258313 atgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 33660263 - 33660441
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||          
T  33660263 taattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg------ 33660356  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
       |  | ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||    
T  33660357 ---tgggtgttacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaatt 33660441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 43770735 - 43770912
Alignment:
Q  22 aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagt 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||           
T  43770735 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg------- 43770827  T
Q  122 cttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
      | || ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  43770828 --tgagtgttacactttgtgag-gtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaatt 43770912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902198
Alignment:
Q  85 taacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaag 184  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||     
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggg-gtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaa 33902221  T
Q  185 tgtagttttgttaatcggatgaa 207  Q
    | |||| ||||||||| ||||||    
T  33902220 tatagtcttgttaatctgatgaa 33902198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463923
Alignment:
Q  64 ctattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaag 163  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| || |||||| | |||||||  ||| |||||     
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgag-gtgttacaattaaaacaaa 41463877  T
Q  164 gtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||  ||||||||    
T  41463878 gtatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaatt 41463923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5881846 - 5881752
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  5881846 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgt 5881752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 200
Target Start/End: Original strand, 7006943 - 7006985
Alignment:
Q  158 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7006943 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatc 7006985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Original strand, 145886 - 146071
Alignment:
Q  23 attcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagtc 122  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  145886 attcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 145985  T
Q  123 ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  145986 ttaagtgttacactttgtagg-gtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaatt 146071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 267626 - 267414
Alignment:
Q  1 ttaaattgttgattactgatt----aattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaac 96  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  267626 ttaaattgttgattactgattggttaattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaac 267527  T
Q  97 atagttgatgatattatgtaatagtc-ttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgt 195  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  267526 aaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggga-tgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgc 267428  T
Q  196 taatcggatgaatt 209  Q
    |||||  |||||||    
T  267427 taatctaatgaatt 267414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12226 - 12039
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  12226 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatag 12127  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12126 tcttaagtgtgacactttgtggg-gtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44273 - 44087
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44273 taattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 44174  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  44173 -cttaagtgttacactttgtggg-gtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaatt 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 154514 - 154700
Alignment:
Q  21 taattcatctagtaatatttgcaacatcatggacttacatatactattttatcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatag 120  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  154514 taattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 154613  T
Q  121 tcttaagcgttgcactttgtgggagtgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcggatgaatt 209  Q
     |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  154614 -cttaagtgttacactttgtggg-gtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaatt 154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 100994 - 100950
Alignment:
Q  71 atcgttagaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100994 atcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 100950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University