View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1963-Insertion-1 (Length: 1122)

Name: NF1963-Insertion-1
Description: NF1963
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1963-Insertion-1
NF1963-Insertion-1
[»] chr4 (109 HSPs)
chr4 (481-1017)||(18672846-18673385)
chr4 (483-1017)||(25961876-25962414)
chr4 (481-1017)||(21419607-21420146)
chr4 (483-1017)||(40493133-40493671)
chr4 (483-1017)||(53009322-53009861)
chr4 (483-1002)||(30392403-30392927)
chr4 (483-1017)||(11195494-11196028)
chr4 (482-1017)||(29544636-29545177)
chr4 (483-989)||(46955244-46955752)
chr4 (679-1017)||(56195345-56195687)
chr4 (672-1017)||(48637323-48637672)
chr4 (490-961)||(18911375-18911853)
chr4 (490-990)||(40616581-40617083)
chr4 (645-1017)||(34017708-34018085)
chr4 (493-1017)||(15164010-15164543)
chr4 (670-1017)||(39501466-39501817)
chr4 (645-1017)||(19820546-19820922)
chr4 (670-1017)||(24150490-24150841)
chr4 (678-1017)||(3797769-3798111)
chr4 (679-1017)||(56198671-56199013)
chr4 (670-989)||(5672743-5673064)
chr4 (648-1017)||(15431897-15432270)
chr4 (680-1017)||(27014081-27014422)
chr4 (482-1017)||(52530699-52531239)
chr4 (680-1017)||(52006494-52006834)
chr4 (681-1017)||(5681246-5681585)
chr4 (679-1017)||(15812098-15812441)
chr4 (681-989)||(12238113-12238423)
chr4 (679-1017)||(34319879-34320221)
chr4 (766-1017)||(35509783-35510037)
chr4 (582-989)||(37103075-37103488)
chr4 (680-1017)||(40903046-40903387)
chr4 (679-1017)||(44808917-44809259)
chr4 (680-1017)||(27677018-27677358)
chr4 (670-983)||(5670431-5670746)
chr4 (680-1017)||(38283452-38283792)
chr4 (678-989)||(19864478-19864786)
chr4 (678-989)||(19859483-19859795)
chr4 (680-1017)||(24044104-24044444)
chr4 (679-1017)||(15405043-15405388)
chr4 (679-1017)||(29324643-29324984)
chr4 (680-1017)||(40794820-40795161)
chr4 (680-1017)||(12782723-12783063)
chr4 (696-1017)||(44164601-44164925)
chr4 (680-1017)||(48415488-48415833)
chr4 (702-1017)||(3718942-3719260)
chr4 (680-1017)||(15429819-15430159)
chr4 (679-1017)||(33926785-33927132)
chr4 (680-1017)||(15436433-15436773)
chr4 (652-1017)||(8877435-8877805)
chr4 (679-1017)||(33408279-33408621)
chr4 (696-989)||(49270531-49270822)
chr4 (679-986)||(53094358-53094669)
chr4 (773-1017)||(15446792-15447039)
chr4 (729-989)||(8874772-8875035)
chr4 (829-1016)||(27679337-27679527)
chr4 (614-787)||(35510043-35510218)
chr4 (843-1017)||(19827308-19827484)
chr4 (766-986)||(22172422-22172645)
chr4 (331-458)||(50066744-50066871)
chr4 (332-458)||(11477685-11477811)
chr4 (681-843)||(5706387-5706550)
chr4 (693-986)||(37739733-37740033)
chr4 (670-802)||(39498346-39498478)
chr4 (758-978)||(33493733-33493958)
chr4 (332-458)||(34496153-34496280)
chr4 (349-458)||(25514204-25514313)
chr4 (832-1021)||(48014167-48014359)
chr4 (331-435)||(16056606-16056710)
chr4 (332-435)||(53947861-53947964)
chr4 (330-435)||(41524292-41524397)
chr4 (348-444)||(5211896-5211992)
chr4 (680-782)||(15445328-15445430)
chr4 (758-976)||(5677449-5677660)
chr4 (371-458)||(50519095-50519182)
chr4 (490-562)||(29325098-29325170)
chr4 (483-562)||(24150949-24151028)
chr4 (483-562)||(38283247-38283326)
chr4 (680-742)||(19827512-19827574)
chr4 (330-458)||(7579811-7579937)
chr4 (483-562)||(44808723-44808802)
chr4 (483-548)||(3719261-3719327)
chr4 (913-954)||(24410206-24410247)
chr4 (490-562)||(34319692-34319764)
chr4 (490-562)||(40902848-40902920)
chr4 (493-548)||(3734600-3734656)
chr4 (493-548)||(49639592-49639648)
chr4 (491-538)||(48637806-48637853)
chr4 (482-562)||(5673170-5673251)
chr4 (481-562)||(11561091-11561172)
chr4 (483-548)||(14702193-14702259)
chr4 (657-734)||(8871705-8871782)
chr4 (340-425)||(10178281-10178366)
chr4 (482-538)||(12238558-12238615)
chr4 (482-546)||(19929178-19929243)
chr4 (358-434)||(22393927-22394004)
chr4 (490-538)||(34017558-34017606)
chr4 (493-548)||(49636299-49636355)
chr4 (496-538)||(27676826-27676868)
chr4 (490-531)||(15445127-15445168)
chr4 (499-562)||(5670852-5670915)
chr4 (491-562)||(15432356-15432427)
chr4 (491-562)||(27014537-27014608)
chr4 (483-523)||(46568427-46568467)
chr4 (758-797)||(8448609-8448648)
chr4 (396-435)||(30650018-30650057)
chr4 (919-983)||(8448745-8448810)
chr4 (494-527)||(8871481-8871514)
chr4 (966-1017)||(15438511-15438564)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (482-1017)||(26135898-26136436)
chr7 (483-1017)||(37165917-37166455)
chr7 (543-1017)||(26144339-26144816)
chr7 (486-1017)||(20080489-20081026)
chr7 (483-1017)||(3067745-3068285)
chr7 (483-1014)||(9132531-9133065)
chr7 (506-1017)||(10468950-10469467)
chr7 (483-1017)||(14683210-14683752)
chr7 (490-1017)||(13842446-13842976)
chr7 (648-1017)||(45287003-45287377)
chr7 (626-1017)||(10345020-10345397)
chr7 (670-1017)||(37415381-37415733)
chr7 (483-1017)||(16165554-16166090)
chr7 (645-1017)||(48645280-48645656)
chr7 (670-1017)||(23224863-23225214)
chr7 (680-1017)||(20594069-20594409)
chr7 (586-1017)||(2441146-2441587)
chr7 (680-1017)||(8276791-8277132)
chr7 (680-1017)||(17730620-17730960)
chr7 (680-1021)||(26557301-26557645)
chr7 (679-1017)||(13449743-13450084)
chr7 (680-1017)||(4546675-4547015)
chr7 (696-1017)||(6603264-6603589)
chr7 (645-1017)||(9864658-9865035)
chr7 (680-1017)||(4595977-4596317)
chr7 (648-898)||(45290414-45290667)
chr7 (680-958)||(9271433-9271705)
chr7 (824-1017)||(11398137-11398334)
chr7 (843-1017)||(37423089-37423265)
chr7 (677-1017)||(5242115-5242461)
chr7 (680-888)||(4542734-4542943)
chr7 (678-985)||(13809483-13809787)
chr7 (694-1017)||(7227333-7227660)
chr7 (680-867)||(11919833-11920021)
chr7 (856-1017)||(4695330-4695493)
chr7 (758-985)||(18562578-18562808)
chr7 (332-458)||(4315142-4315268)
chr7 (332-458)||(9735039-9735165)
chr7 (875-989)||(22611771-22611885)
chr7 (332-458)||(32816251-32816377)
chr7 (694-816)||(4695491-4695613)
chr7 (698-818)||(35961099-35961219)
chr7 (778-1017)||(5796357-5796600)
chr7 (483-580)||(20595912-20596010)
chr7 (649-777)||(22611649-22611775)
chr7 (332-435)||(12103083-12103186)
chr7 (482-562)||(8277259-8277339)
chr7 (679-792)||(11398016-11398129)
chr7 (332-435)||(15990303-15990407)
chr7 (490-562)||(6603720-6603792)
chr7 (874-978)||(24918041-24918145)
chr7 (340-403)||(2890005-2890068)
chr7 (340-435)||(12697679-12697774)
chr7 (483-548)||(20100931-20100997)
chr7 (490-538)||(13449559-13449607)
chr7 (482-548)||(23598527-23598594)
chr7 (483-548)||(2252158-2252224)
chr7 (393-446)||(28343406-28343460)
chr7 (491-562)||(4543069-4543140)
chr7 (493-548)||(26460752-26460808)
chr7 (491-539)||(45286848-45286896)
chr7 (496-562)||(37415207-37415273)
chr7 (483-548)||(709783-709849)
chr7 (493-538)||(44017558-44017603)
chr7 (490-534)||(23224683-23224727)
chr7 (493-548)||(26182588-26182644)
chr7 (491-539)||(45290259-45290307)
chr7 (491-538)||(4547165-4547212)
chr7 (873-959)||(2090471-2090557)
chr7 (331-377)||(48714732-48714778)
chr7 (332-377)||(28342168-28342213)
chr7 (964-1017)||(45290667-45290722)
chr7 (396-431)||(48714696-48714731)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (483-1017)||(34132749-34133286)
chr5 (483-1017)||(34142980-34143517)
chr5 (483-1017)||(12087777-12088314)
chr5 (483-1017)||(12058258-12058795)
chr5 (512-1017)||(17748259-17748767)
chr5 (483-1017)||(17664371-17664910)
chr5 (483-1016)||(26292611-26293148)
chr5 (483-989)||(11958957-11959444)
chr5 (493-1017)||(18952512-18953045)
chr5 (678-1017)||(26907416-26907758)
chr5 (614-1017)||(20055593-20056002)
chr5 (671-1017)||(40583068-40583417)
chr5 (507-1017)||(42062740-42063260)
chr5 (586-1017)||(26895470-26895907)
chr5 (681-1017)||(22936901-22937241)
chr5 (483-843)||(23044138-23044500)
chr5 (670-1017)||(26752654-26753005)
chr5 (670-1017)||(43491574-43491925)
chr5 (680-1017)||(41876727-41877068)
chr5 (483-908)||(22131159-22131590)
chr5 (645-989)||(21332605-21332953)
chr5 (680-1017)||(34831583-34831923)
chr5 (677-1017)||(41306487-41306830)
chr5 (645-1017)||(4099444-4099820)
chr5 (680-1017)||(7270835-7271175)
chr5 (680-1017)||(33551940-33552280)
chr5 (645-1017)||(21335623-21336001)
chr5 (679-1017)||(7624921-7625263)
chr5 (679-1017)||(14016100-14016442)
chr5 (681-989)||(14375759-14376081)
chr5 (680-1017)||(39192147-39192489)
chr5 (670-1017)||(31863519-31863884)
chr5 (678-1017)||(21914940-21915285)
chr5 (849-1017)||(32837837-32838007)
chr5 (483-669)||(26907181-26907371)
chr5 (786-1017)||(2837122-2837357)
chr5 (694-986)||(18239472-18239767)
chr5 (833-1017)||(30066161-30066348)
chr5 (670-864)||(37215019-37215213)
chr5 (718-989)||(28787330-28787595)
chr5 (879-1017)||(23043983-23044123)
chr5 (332-458)||(11221473-11221599)
chr5 (332-482)||(14914845-14914994)
chr5 (331-458)||(42734468-42734592)
chr5 (758-978)||(18765682-18765905)
chr5 (483-604)||(35049749-35049871)
chr5 (331-455)||(26648708-26648832)
chr5 (331-455)||(26920293-26920417)
chr5 (682-800)||(30066348-30066466)
chr5 (332-435)||(36312609-36312712)
chr5 (904-1017)||(22130083-22130198)
chr5 (341-435)||(31103824-31103918)
chr5 (798-953)||(563340-563497)
chr5 (491-562)||(14015915-14015986)
chr5 (874-961)||(31575290-31575379)
chr5 (490-562)||(22936715-22936787)
chr5 (493-642)||(20056040-20056193)
chr5 (491-562)||(41876530-41876601)
chr5 (482-548)||(26727233-26727300)
chr5 (491-565)||(37215313-37215387)
chr5 (481-546)||(43492047-43492114)
chr5 (491-535)||(26752477-26752521)
chr5 (490-538)||(40915932-40915980)
chr5 (491-562)||(41306302-41306373)
chr5 (491-538)||(31864015-31864062)
chr5 (483-548)||(25185676-25185741)
chr5 (480-526)||(21680679-21680724)
[»] chr2 (85 HSPs)
chr2 (483-1017)||(16790524-16791063)
chr2 (483-1017)||(1386191-1386726)
chr2 (483-1017)||(40258905-40259443)
chr2 (483-1017)||(37936986-37937523)
chr2 (483-1017)||(3875087-3875628)
chr2 (479-1017)||(22630642-22631187)
chr2 (482-1017)||(12219596-12220138)
chr2 (483-1017)||(16178928-16179484)
chr2 (482-1017)||(17876907-17877449)
chr2 (680-1017)||(5666319-5666658)
chr2 (481-1017)||(27266589-27267137)
chr2 (678-1017)||(45493118-45493460)
chr2 (678-1017)||(45500860-45501202)
chr2 (670-1017)||(8888437-8888787)
chr2 (489-1017)||(9966137-9966674)
chr2 (648-1017)||(9185354-9185729)
chr2 (645-1017)||(25820774-25821150)
chr2 (648-1017)||(37279606-37279981)
chr2 (680-1017)||(40781273-40781613)
chr2 (670-1017)||(9188606-9188957)
chr2 (645-1017)||(24234896-24235274)
chr2 (678-986)||(22020901-22021211)
chr2 (679-1017)||(31427504-31427846)
chr2 (680-1017)||(25959652-25959993)
chr2 (680-1017)||(31585904-31586245)
chr2 (680-1017)||(42368675-42369015)
chr2 (645-1017)||(5105527-5105904)
chr2 (670-1017)||(11347849-11348200)
chr2 (645-1017)||(25138858-25139236)
chr2 (645-1017)||(24238168-24238546)
chr2 (696-1017)||(30274748-30275073)
chr2 (680-1017)||(43207854-43208194)
chr2 (680-1017)||(13971858-13972198)
chr2 (714-989)||(17874585-17874856)
chr2 (681-1017)||(26365734-26366074)
chr2 (677-1017)||(25870585-25870928)
chr2 (679-1017)||(38015319-38015661)
chr2 (648-940)||(29440375-29440670)
chr2 (679-1017)||(33310467-33310809)
chr2 (679-1017)||(36808405-36808746)
chr2 (684-1017)||(6826573-6826908)
chr2 (680-989)||(43723531-43723841)
chr2 (679-1017)||(45456962-45457304)
chr2 (677-1017)||(25873976-25874325)
chr2 (679-1017)||(45453675-45454016)
chr2 (10-181)||(5284090-5284263)
chr2 (492-643)||(23205350-23205502)
chr2 (492-643)||(23676954-23677106)
chr2 (332-442)||(33402424-33402534)
chr2 (330-458)||(36722591-36722719)
chr2 (331-458)||(35882879-35883006)
chr2 (332-458)||(35875391-35875517)
chr2 (645-1017)||(30926348-30926718)
chr2 (332-446)||(14271269-14271382)
chr2 (700-859)||(10600876-10601036)
chr2 (758-986)||(35521402-35521637)
chr2 (915-1017)||(17876211-17876315)
chr2 (342-435)||(73284-73377)
chr2 (912-1017)||(10600747-10600854)
chr2 (680-742)||(13137020-13137082)
chr2 (490-562)||(33310923-33310995)
chr2 (491-538)||(9188429-9188476)
chr2 (490-537)||(10601135-10601182)
chr2 (680-733)||(15470546-15470599)
chr2 (491-562)||(9185201-9185272)
chr2 (758-896)||(34682624-34682763)
chr2 (483-562)||(37279445-37279524)
chr2 (331-398)||(18577198-18577265)
chr2 (482-562)||(8888893-8888974)
chr2 (900-978)||(11187927-11188005)
chr2 (489-562)||(38015775-38015848)
chr2 (493-548)||(18939181-18939237)
chr2 (491-562)||(24238629-24238700)
chr2 (490-538)||(25959465-25959513)
chr2 (490-538)||(30274544-30274592)
chr2 (491-562)||(45499135-45499206)
chr2 (496-562)||(25871041-25871107)
chr2 (496-562)||(29440752-29440818)
chr2 (483-548)||(22592800-22592866)
chr2 (490-562)||(11347670-11347742)
chr2 (493-538)||(40677538-40677583)
chr2 (496-562)||(25874438-25874504)
chr2 (491-538)||(42368476-42368523)
chr2 (507-562)||(24235357-24235412)
chr2 (966-1017)||(29440324-29440377)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (483-1017)||(30913-31451)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (483-1017)||(32366883-32367419)
chr3 (483-1017)||(22416589-22417124)
chr3 (483-1017)||(12560978-12561524)
chr3 (481-1017)||(25442611-25443150)
chr3 (483-1017)||(48063791-48064325)
chr3 (483-989)||(17531408-17531910)
chr3 (483-1017)||(54719875-54720416)
chr3 (483-989)||(17528513-17529017)
chr3 (544-1017)||(17141312-17141790)
chr3 (483-1017)||(11784669-11785217)
chr3 (493-1016)||(17039779-17040311)
chr3 (657-989)||(46884875-46885207)
chr3 (648-1017)||(53815732-53816106)
chr3 (678-1017)||(34983801-34984143)
chr3 (670-1017)||(16184627-16184978)
chr3 (670-1017)||(6434718-6435068)
chr3 (483-811)||(52990813-52991142)
chr3 (670-1017)||(24125403-24125753)
chr3 (670-1017)||(24128680-24129030)
chr3 (645-1017)||(52199817-52200193)
chr3 (648-1017)||(54723645-54724020)
chr3 (670-1017)||(7486474-7486825)
chr3 (648-1017)||(30690640-30691014)
chr3 (645-1017)||(43809483-43809862)
chr3 (680-1017)||(8461437-8461777)
chr3 (582-1021)||(10884757-10885205)
chr3 (497-961)||(35751402-35751869)
chr3 (678-1017)||(2873468-2873810)
chr3 (483-1017)||(27091798-27092341)
chr3 (626-1017)||(28007964-28008360)
chr3 (680-1017)||(43926739-43927079)
chr3 (680-1017)||(2775385-2775726)
chr3 (648-1017)||(11190430-11190805)
chr3 (714-1017)||(15195286-15195592)
chr3 (680-1017)||(2778628-2778969)
chr3 (680-1017)||(45896284-45896625)
chr3 (670-1017)||(23298555-23298906)
chr3 (680-1017)||(29343824-29344165)
chr3 (678-986)||(32287271-32287581)
chr3 (679-1017)||(50461497-50461839)
chr3 (681-988)||(18644719-18645028)
chr3 (680-989)||(16243807-16244117)
chr3 (680-1017)||(49742869-49743210)
chr3 (680-1017)||(20728597-20728937)
chr3 (681-1017)||(10106551-10106889)
chr3 (645-1017)||(19301420-19301795)
chr3 (694-1017)||(9392638-9392964)
chr3 (483-777)||(37408828-37409125)
chr3 (684-1017)||(3840420-3840757)
chr3 (680-971)||(25584628-25584921)
chr3 (648-1017)||(538730-539105)
chr3 (696-1017)||(10881384-10881708)
chr3 (681-1017)||(35412419-35412753)
chr3 (679-1017)||(47051399-47051741)
chr3 (681-989)||(55034807-55035121)
chr3 (806-1017)||(52988309-52988523)
chr3 (680-978)||(31549116-31549416)
chr3 (679-1017)||(47054829-47055171)
chr3 (549-978)||(30219820-30220258)
chr3 (681-1017)||(19304640-19304979)
chr3 (678-978)||(22993644-22993948)
chr3 (668-986)||(3292897-3293218)
chr3 (682-1017)||(41976919-41977243)
chr3 (681-927)||(54461010-54461258)
chr3 (483-686)||(34983541-34983747)
chr3 (824-1017)||(28265784-28265977)
chr3 (679-958)||(17545820-17546102)
chr3 (681-901)||(18641723-18641945)
chr3 (766-986)||(18542487-18542710)
chr3 (681-978)||(55031947-55032237)
chr3 (645-986)||(22783529-22783882)
chr3 (645-986)||(22787893-22788246)
chr3 (670-818)||(28266023-28266171)
chr3 (483-628)||(15195096-15195241)
chr3 (483-604)||(46885234-46885356)
chr3 (331-458)||(9294936-9295063)
chr3 (331-458)||(23484317-23484444)
chr3 (332-458)||(13978921-13979047)
chr3 (645-843)||(52309529-52309728)
chr3 (758-980)||(282219-282443)
chr3 (328-458)||(7787258-7787385)
chr3 (497-719)||(25486338-25486566)
chr3 (865-990)||(27308722-27308846)
chr3 (670-742)||(6922702-6922774)
chr3 (865-979)||(27308159-27308273)
chr3 (490-562)||(50461311-50461383)
chr3 (652-738)||(10902126-10902213)
chr3 (935-1017)||(31857720-31857804)
chr3 (483-562)||(2775855-2775935)
chr3 (483-562)||(2779097-2779177)
chr3 (482-538)||(2873949-2874006)
chr3 (490-562)||(35412866-35412938)
chr3 (926-1017)||(52309754-52309847)
chr3 (493-548)||(5886757-5886813)
chr3 (493-548)||(5896741-5896797)
chr3 (491-562)||(7486932-7487003)
chr3 (491-562)||(10106362-10106433)
chr3 (491-562)||(16184445-16184516)
chr3 (491-562)||(24125860-24125931)
chr3 (493-548)||(29233363-29233419)
chr3 (491-538)||(24129161-24129208)
chr3 (483-548)||(16314353-16314419)
chr3 (483-548)||(16414519-16414585)
chr3 (483-548)||(18495347-18495413)
chr3 (489-562)||(30691096-30691169)
chr3 (490-562)||(539187-539259)
chr3 (496-537)||(8461261-8461302)
chr3 (493-538)||(28327751-28327796)
chr3 (493-538)||(28331076-28331121)
chr3 (354-398)||(9307733-9307777)
chr3 (498-538)||(11190911-11190951)
chr3 (865-977)||(27298599-27298711)
chr3 (491-562)||(43927210-43927281)
chr3 (491-539)||(53816213-53816261)
chr3 (490-538)||(54724126-54724174)
chr3 (491-538)||(6922905-6922952)
chr3 (493-547)||(23374503-23374558)
chr3 (496-538)||(12541067-12541109)
chr3 (483-521)||(17141799-17141837)
chr3 (483-548)||(18505320-18505387)
chr3 (493-542)||(6173123-6173173)
chr3 (509-562)||(28266279-28266332)
chr3 (834-883)||(31857804-31857854)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (483-1017)||(18855791-18856328)
chr6 (483-1017)||(28230415-28230954)
chr6 (482-1017)||(13946839-13947373)
chr6 (483-949)||(7128190-7128657)
chr6 (482-1017)||(19475823-19476362)
chr6 (483-989)||(24410149-24410657)
chr6 (483-1017)||(24400000-24400536)
chr6 (483-989)||(4512323-4512836)
chr6 (496-924)||(26896035-26896467)
chr6 (485-785)||(24155133-24155434)
chr6 (480-1017)||(11125456-11125999)
chr6 (489-1017)||(22560930-22561467)
chr6 (670-1017)||(26942388-26942738)
chr6 (680-1017)||(9953784-9954124)
chr6 (670-1017)||(3596734-3597085)
chr6 (648-1017)||(2379050-2379425)
chr6 (670-989)||(23384705-23385027)
chr6 (680-1017)||(20185565-20185905)
chr6 (680-1017)||(22150086-22150426)
chr6 (670-1017)||(11402077-11402428)
chr6 (678-985)||(6513110-6513419)
chr6 (678-983)||(14281481-14281788)
chr6 (680-1017)||(5738042-5738388)
chr6 (696-1017)||(1125714-1126039)
chr6 (680-1017)||(30655264-30655605)
chr6 (680-1017)||(10289793-10290133)
chr6 (678-986)||(13005042-13005352)
chr6 (645-1017)||(9839323-9839698)
chr6 (645-974)||(17106537-17106868)
chr6 (724-989)||(28111773-28112038)
chr6 (678-989)||(28107748-28108062)
chr6 (497-818)||(32109691-32110016)
chr6 (679-978)||(2846163-2846466)
chr6 (645-968)||(23007932-23008258)
chr6 (645-968)||(23780106-23780432)
chr6 (645-1017)||(11247582-11247960)
chr6 (678-983)||(13021213-13021522)
chr6 (680-1017)||(12988086-12988429)
chr6 (758-983)||(5259793-5260017)
chr6 (331-458)||(14097007-14097133)
chr6 (331-458)||(2846882-2847009)
chr6 (758-986)||(28848694-28848925)
chr6 (331-458)||(2849649-2849776)
chr6 (823-1017)||(24371094-24371293)
chr6 (898-1017)||(31072125-31072246)
chr6 (332-455)||(17514360-17514483)
chr6 (330-435)||(792799-792904)
chr6 (872-960)||(2372201-2372289)
chr6 (680-818)||(23842762-23842899)
chr6 (824-978)||(11192685-11192846)
chr6 (332-435)||(22228040-22228143)
chr6 (697-806)||(2372293-2372397)
chr6 (768-826)||(23667721-23667779)
chr6 (651-818)||(23847792-23847962)
chr6 (483-538)||(2379531-2379586)
chr6 (918-989)||(26898071-26898142)
chr6 (483-538)||(26942201-26942256)
chr6 (481-538)||(1125500-1125558)
chr6 (483-548)||(22920816-22920882)
chr6 (490-562)||(9954239-9954311)
chr6 (490-562)||(30655734-30655806)
chr6 (483-562)||(2331556-2331635)
chr6 (497-562)||(5737844-5737909)
chr6 (930-1017)||(11188130-11188219)
chr6 (492-548)||(17696878-17696935)
chr6 (491-562)||(3596555-3596626)
chr6 (491-562)||(23381946-23382017)
chr6 (491-538)||(23384526-23384573)
chr6 (483-548)||(17232142-17232208)
chr6 (491-562)||(11187973-11188045)
chr6 (497-538)||(11729112-11729153)
chr6 (946-1017)||(23388327-23388400)
chr6 (494-562)||(31123711-31123779)
chr6 (483-526)||(22221924-22221967)
chr6 (483-526)||(22247759-22247802)
chr6 (481-526)||(14795849-14795894)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (483-1017)||(23619131-23619667)
chr8 (481-1014)||(31284493-31285030)
chr8 (483-1017)||(8911463-8912003)
chr8 (492-1017)||(44026865-44027396)
chr8 (483-1016)||(33419473-33420010)
chr8 (661-1017)||(10498158-10498517)
chr8 (493-1017)||(17930797-17931329)
chr8 (509-1017)||(21279558-21280072)
chr8 (483-1017)||(13196673-13197213)
chr8 (483-1017)||(2560368-2560909)
chr8 (497-989)||(12516226-12516727)
chr8 (648-1017)||(10663715-10664089)
chr8 (678-1017)||(14421560-14421904)
chr8 (645-1017)||(16953592-16953970)
chr8 (670-1017)||(18824347-18824698)
chr8 (670-1017)||(18825840-18826191)
chr8 (680-989)||(25591442-25591752)
chr8 (679-978)||(45155231-45155532)
chr8 (682-1017)||(18721246-18721585)
chr8 (679-1017)||(36710598-36710940)
chr8 (645-1017)||(22173850-22174227)
chr8 (680-1017)||(25594620-25594961)
chr8 (679-989)||(23643665-23643977)
chr8 (681-1017)||(43681834-43682174)
chr8 (674-1017)||(5980270-5980616)
chr8 (678-986)||(25230929-25231239)
chr8 (677-986)||(38248359-38248669)
chr8 (680-1017)||(12582824-12583167)
chr8 (645-1017)||(5538700-5539077)
chr8 (332-480)||(31577016-31577164)
chr8 (332-480)||(24267862-24268010)
chr8 (483-628)||(10498016-10498162)
chr8 (645-867)||(33883275-33883501)
chr8 (332-482)||(24097960-24098110)
chr8 (481-1017)||(30784745-30785284)
chr8 (645-986)||(5613645-5613998)
chr8 (332-458)||(42714486-42714612)
chr8 (759-1015)||(4868075-4868330)
chr8 (331-458)||(996603-996730)
chr8 (332-458)||(12765579-12765705)
chr8 (483-613)||(23612362-23612493)
chr8 (483-695)||(5253183-5253397)
chr8 (333-444)||(9417613-9417724)
chr8 (332-444)||(15968653-15968765)
chr8 (331-458)||(7835951-7836078)
chr8 (331-458)||(20035873-20036000)
chr8 (332-458)||(20025710-20025836)
chr8 (331-440)||(7806528-7806637)
chr8 (680-782)||(20887589-20887691)
chr8 (679-794)||(14589583-14589698)
chr8 (680-742)||(5584359-5584421)
chr8 (332-435)||(11432257-11432359)
chr8 (482-562)||(16954048-16954129)
chr8 (491-562)||(18825664-18825735)
chr8 (483-562)||(10664224-10664303)
chr8 (491-562)||(18824171-18824242)
chr8 (354-429)||(15543107-15543182)
chr8 (492-548)||(17012806-17012863)
chr8 (492-548)||(17544338-17544395)
chr8 (493-548)||(24435319-24435374)
chr8 (493-548)||(24445365-24445420)
chr8 (483-545)||(24903250-24903313)
chr8 (486-548)||(27863320-27863383)
chr8 (496-537)||(5584213-5584254)
chr8 (490-562)||(23597480-23597552)
chr8 (483-536)||(22173700-22173753)
chr8 (483-548)||(22654550-22654616)
chr8 (491-562)||(18721062-18721133)
chr8 (358-405)||(13573859-13573906)
chr8 (491-538)||(25591255-25591302)
chr8 (491-562)||(20887817-20887889)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (483-1017)||(29184-29715)
scaffold0084 (483-1017)||(19114-19636)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (483-1017)||(10228-10764)
[»] scaffold0065 (3 HSPs)
scaffold0065 (498-1017)||(58460-58986)
scaffold0065 (614-692)||(58315-58395)
scaffold0065 (499-538)||(58411-58450)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (483-989)||(63709-64218)
scaffold0035 (491-1017)||(62336-62872)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (498-1017)||(905463-905992)
chr1 (670-1017)||(3796779-3797129)
chr1 (482-938)||(27354705-27355165)
chr1 (645-1017)||(29643146-29643524)
chr1 (491-1017)||(1950222-1950758)
chr1 (680-1013)||(2405334-2405670)
chr1 (648-1017)||(2794048-2794422)
chr1 (511-1017)||(672861-673376)
chr1 (680-1017)||(45941236-45941577)
chr1 (680-1017)||(21107254-21107594)
chr1 (677-1017)||(49498457-49498801)
chr1 (670-1017)||(20398673-20399024)
chr1 (670-1017)||(23021876-23022227)
chr1 (680-1017)||(45960707-45961048)
chr1 (648-1017)||(28110876-28111251)
chr1 (679-1017)||(37183825-37184167)
chr1 (680-1017)||(41058265-41058605)
chr1 (683-1018)||(6070919-6071258)
chr1 (680-989)||(21018430-21018740)
chr1 (679-1017)||(31204658-31205000)
chr1 (725-1017)||(49853086-49853381)
chr1 (331-482)||(26908440-26908591)
chr1 (679-985)||(34732322-34732630)
chr1 (678-968)||(27355648-27355941)
chr1 (680-872)||(21111121-21111314)
chr1 (766-989)||(21434524-21434750)
chr1 (678-986)||(7635498-7635810)
chr1 (693-985)||(27331752-27332040)
chr1 (680-802)||(21114461-21114583)
chr1 (348-458)||(35756687-35756797)
chr1 (332-444)||(5383400-5383511)
chr1 (331-435)||(49331743-49331847)
chr1 (332-435)||(18063761-18063864)
chr1 (865-1017)||(11668175-11668329)
chr1 (331-435)||(41206859-41206963)
chr1 (718-867)||(11667001-11667152)
chr1 (331-435)||(25825006-25825110)
chr1 (483-562)||(3796595-3796674)
chr1 (679-742)||(27536493-27536556)
chr1 (678-896)||(13430918-13431140)
chr1 (778-894)||(16055629-16055747)
chr1 (489-562)||(45960519-45960592)
chr1 (900-978)||(34066626-34066704)
chr1 (490-562)||(31205114-31205186)
chr1 (645-894)||(16060893-16061148)
chr1 (758-894)||(16056843-16056982)
chr1 (496-562)||(20448109-20448175)
chr1 (496-562)||(20533876-20533942)
chr1 (678-818)||(42022657-42022803)
chr1 (483-548)||(17902553-17902619)
chr1 (481-538)||(23021685-23021743)
chr1 (482-562)||(27536297-27536378)
chr1 (490-562)||(28111333-28111405)
chr1 (491-562)||(2794504-2794575)
chr1 (493-548)||(16838709-16838765)
chr1 (493-548)||(16848639-16848695)
chr1 (482-545)||(20981649-20981713)
chr1 (483-548)||(24200009-24200075)
chr1 (490-532)||(37183639-37183681)
chr1 (493-538)||(23441050-23441095)
chr1 (478-538)||(49498263-49498324)
chr1 (493-548)||(33898621-33898677)
chr1 (344-435)||(13405222-13405313)
chr1 (758-836)||(30938602-30938681)
chr1 (496-548)||(28918663-28918716)
chr1 (482-540)||(37642156-37642215)
chr1 (483-548)||(20964734-20964800)
chr1 (758-867)||(34065203-34065313)
chr1 (926-976)||(37891150-37891200)
chr1 (501-538)||(20399154-20399191)
chr1 (952-989)||(42022533-42022570)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (482-828)||(15423-15769)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (483-1011)||(1837-2370)
[»] scaffold0321 (2 HSPs)
scaffold0321 (678-1017)||(2966-3315)
scaffold0321 (598-686)||(2851-2942)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (677-1017)||(292842-293185)
scaffold0005 (490-562)||(293294-293366)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (670-1017)||(3741-4092)
scaffold0427 (490-562)||(3561-3633)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (670-1017)||(19214-19565)
scaffold0250 (490-562)||(19672-19744)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (489-1017)||(57357-57893)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (680-1017)||(5361-5702)
scaffold0381 (491-562)||(5175-5246)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (680-1017)||(197966-198306)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (680-1017)||(8182-8522)
scaffold0520 (680-943)||(1512-1775)
scaffold0520 (923-1017)||(4187-4283)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (670-967)||(1-300)
scaffold0412 (490-529)||(444-483)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (489-742)||(14091-14344)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (726-989)||(1099-1362)
scaffold1785 (491-742)||(4-262)
[»] scaffold0962 (2 HSPs)
scaffold0962 (681-1017)||(3246-3586)
scaffold0962 (490-562)||(3056-3128)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (680-1017)||(5171-5511)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (712-1017)||(67520-67828)
scaffold0056 (483-716)||(65087-65322)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (679-1017)||(89588-89930)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (680-953)||(6-280)
[»] scaffold0270 (1 HSPs)
scaffold0270 (679-1016)||(25-366)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (680-942)||(27005-27268)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (680-943)||(248413-248677)
scaffold0007 (493-538)||(92739-92784)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (680-933)||(89-344)
scaffold1208 (491-538)||(483-530)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (481-763)||(3992-4275)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (681-1017)||(118410-118749)
scaffold0002 (715-794)||(99233-99312)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (822-986)||(14091-14256)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (766-989)||(19204-19422)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (681-945)||(2385-2659)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (678-904)||(241434-241661)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (645-806)||(7637-7801)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (680-903)||(1-224)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (694-854)||(844-1005)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (332-458)||(16570-16696)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (331-458)||(2900-3029)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (758-978)||(48443-48666)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (681-986)||(9789-10099)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (331-440)||(12052-12161)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (331-435)||(5066-5170)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (331-427)||(7803-7899)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (331-435)||(651-755)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (331-435)||(3960-4064)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (341-435)||(2509-2603)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (397-458)||(2910-2971)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (492-548)||(28433-28490)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (492-548)||(26652-26709)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (493-548)||(27649-27705)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (493-545)||(1691-1744)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (482-526)||(24184-24228)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (480-526)||(33727-33772)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 472; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18672846 - 18673385
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18672846 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggattggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 18672945  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18672946 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacataaaataaagattggtttaaagaataaga 18673045  T
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18673046 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaa 18673145  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18673146 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 18673245  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18673246 ctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcg 18673345  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18673346 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 18673385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 25962414 - 25961876
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  25962414 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggagtggttttaatttcaataattcaactacgttgtaag 25962315  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25962314 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagtagattggtttgtttgcataaa-agtaacagaaaataaagattggttttaagaataagag 25962216  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25962215 agagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaa 25962116  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtct-aataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||     
T  25962115 tattcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgtttaagcacgttaag 25962016  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25962015 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcg 25961916  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  25961915 ttctcattaaatcatttttatatttgatcaggatataaaa 25961876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 21420146 - 21419607
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgta 579  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21420146 actgatagaattttggcaagtgtatcaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacaaggattggttttaatctcaataattcaactacgttgta 21420047  T
Q  580 acttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  21420046 agttttgatgtataaaagttcttttgattttccactaggcagtttattggtttgtttgcataaa-agtaacagaaattaaagattgattttaagaataag 21419948  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  21419947 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaa 21419848  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21419847 aatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctagggttacatcacctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaa 21419748  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||    
T  21419747 cctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcgctc 21419648  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21419647 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 21419607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40493133 - 40493671
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40493133 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcctacaatgactgattttaatctcaataattcaactacgttgtaag 40493232  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  40493233 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttacataaa-agtaacataaattaaagatcggttttaagaataagag 40493331  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40493332 agatatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaaaaaaa 40493431  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttga-gttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40493432 tagtcctaatcaatcccttgaagttacgaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaac 40493531  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40493532 ctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcg 40493631  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  40493632 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 40493671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 53009322 - 53009861
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53009322 tgatagaagtttgacaagtgtaccaaatactatcgaattagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 53009421  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53009422 ttaggatgtataaaatttcttttgatt-gccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacagaaattaaagattggttttaagaataag 53009520  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  53009521 agagagatgagtttaggtcttttgaatcgtctatgttcccctaattagtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacgatagttaacaa 53009620  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53009621 aatagtcctaattaatctcttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaa 53009720  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53009721 cctaatatcactaataaatggttataaattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 53009820  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  53009821 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 53009861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 30392927 - 30392403
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30392927 tgatagaggtttggcaattgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 30392828  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttctttta-atttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  30392827 ttaggatgtataaaagttatttttgatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaacgacagaaagtaaag-ttggttttaagaataa 30392729  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||    
T  30392728 gagagagatgagtttaggtctttccaatcatatatgttcccctaattggtatattgcacctatttttatgaatgattcgctagttccacgatagttaaca 30392629  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30392628 aaataatcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctaaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgtta 30392529  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  30392528 acctaatatcactaataaagtattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcaaaagctagggtcagtagtcatt 30392429  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcatatt 1002  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  30392428 cgttctcactaaatcatatttatatt 30392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11196028 - 11195494
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  11196028 tgatagaagtttgacaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccataaggactggttttaatctcaatcattcaatcacgttgtaag 11195929  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataac---agaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
    ||     ||||||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||   | ||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  11195928 tt-----gtataaaagttattttgatttgccactaggtaattgattggtttgtttgcataaa-aataacgacaaaaagtaaag-tcggttttaagaataa 11195836  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  11195835 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaaca 11195736  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11195735 aaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaatttcttaggtggtctaataacctttgaaggtttaggcacgtta 11195636  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11195635 acctattatcactaataaatgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaagtaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcatt 11195536  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11195535 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaa 11195494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Original strand, 29544636 - 29545177
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29544636 ctgatagacgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtaataaaaatattgttcccataaggactggtttaaatctcaatcattcaattacgttgtaa 29544735  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
     ||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  ||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  29544736 gttaggatgtacaaaagctattttgatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaacgacaaaaagtaaaggttgattttaagaataa 29544835  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||    
T  29544836 gagagatatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcctctaattggtatattgcacctattattgtgaatgattaactagttccacgatagttaaca 29544935  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29544936 aaatagccctaatcaatcccttgagttatgactctcttatagggttacaacccctaattccttaggaggtctaataacctttgaaggtttaagcacatta 29545035  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||||||||    
T  29545036 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtgtaagtcaaaagttagggccagtagtcatt 29545135  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  29545136 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 29545177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Original strand, 46955244 - 46955752
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46955244 tgatagatttttggcaagtgtaccaaa-agtatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 46955342  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  46955343 ttaggatgtataaatgttcttttagtttgccactaggcagttgattgggttgtttgcataagtaataacagaaaataaagattggttttaagaataaaag 46955442  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  46955443 agagatgagattaggtcttttgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaaaa 46955542  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaa-ggtttaagcacgttaac 879  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||    
T  46955543 tagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgttaac 46955642  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  46955643 ctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaaatcgaaagttatggtcagtagtcattcg 46955742  T
Q  980 ttctcactaa 989  Q
    ||||||||||    
T  46955743 ttctcactaa 46955752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 56195687 - 56195345
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  56195687 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 56195588  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  56195587 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgtt 56195488  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  56195487 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 56195388  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  56195387 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 56195345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 672 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 48637672 - 48637323
Alignment:
Q  672 agaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgata 771  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| || |  ||| ||  ||||||    
T  48637672 agaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctatgcttatgaatgattttctaattccacgata 48637573  T
Q  772 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac-ctttgaaggtttaa 869  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  48637572 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaatctttgaaggtttaa 48637473  T
Q  870 gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcag 969  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  48637472 gcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcag 48637373  T
Q  970 tagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  48637372 tagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 48637323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 490 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 18911853 - 18911375
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagat 588  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    |||| |       | ||| |||    
T  18911853 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacgaggactg-tgttaatctcaatttagcaataaaaaaaatatttaggat 18911755  T
Q  589 gtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat--aagc--aataacagaaaataaagattggttt--aaagaataagaga 682  Q
    | |||||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||   |||   ||||||||||||||||||| | |||  |||  |||   ||    
T  18911754 gaataaattttcttttgaattgccactaggcagttgattggtttgattacaataaaggtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatga 18911655  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||    
T  18911654 gagatgagactaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaat 18911555  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18911554 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacct 18911455  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct 961  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911454 attatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct 18911375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 490 - 990
Target Start/End: Original strand, 40616581 - 40617083
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagat 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    |||| ||||||  | ||| |||    
T  40616581 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactg-tgttaatctcaatttagcaataacgttgatatttaggat 40616679  T
Q  589 gtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagc---aataa-cagaaaataaagattggttt--aaagaataagaga 682  Q
    || ||||  |||||||| || ||| ||||||||| | ||   | ||||||||||     ||||| ||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||    
T  40616680 gtgtaaat-ttcttttagtt-gcc-ctaggcagtagttt---tggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaataagaga 40616773  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  40616774 gagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaat 40616873  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  40616874 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacc 40616973  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  40616974 taaaatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctctctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcat 40617073  T
Q  981 tctcactaat 990  Q
    ||||||||||    
T  40617074 tctcactaat 40617083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34017708 - 34018085
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34017708 aataacagaatataaagatagtttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 34017807  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  34017808 ttatgaatgattttctggttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 34017907  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34017908 gtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaa 34018007  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  34018008 ttctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 34018085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 493 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15164543 - 15164010
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgta 591  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||| | |  || ||||||    
T  15164543 ttggcaagtgtatcaaaaactatcgaagtagtaaaa-tatcgttcctacaaggactatttttaatctcaacaattctactacgttattaaataggatgta 15164445  T
Q  592 taaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaat-aaagattggtttaaagaataag-agagagat 687  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||  | || | | |||||| |||||||| || | | |||| | ||||||||    
T  15164444 taaaggttattttgatttgccactaggtaattgatttgtttgtttgcataaaagtaacagctgaaaattaaagattgattaagaaaatatggagagagat 15164345  T
Q  688 gagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcc 787  Q
    ||| |  |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||| || |||| || |  ||||||  | |||||||||||||||||||     
T  15164344 gagatcgggtctttcgaatcatcgatattcctctaattggtatattgcccctattcttatgaatgattatctagttccatgatagttaacaaaatagtca 15164245  T
Q  788 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaata 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15164244 taatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagattaacctaata 15164145  T
Q  886 tcactaataaaggattatccatt-cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctc 984  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15164144 tcactaacaaacgattatccatttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattcgttctc 15164045  T
Q  985 act-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  15164044 actaaatcatgattatatttgatcaggatataaaa 15164010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 39501817 - 39501466
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  39501817 aaagaatgagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 39501718  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  39501717 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttatcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 39501618  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  39501617 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 39501518  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  39501517 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 39501466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19820922 - 19820546
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19820922 aataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctttgttcccctaattggtatactgcacctattc 19820823  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  19820822 ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 19820723  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19820722 gtggtctaataatctttgaaggtttaagcatcttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaat 19820623  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19820622 tctgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 19820546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24150841 - 24150490
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  24150841 aaagaatgagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctgtgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 24150742  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  24150741 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 24150642  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  24150641 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 24150542  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24150541 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24150490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3797769 - 3798111
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||  ||||||||||||    
T  3797769 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttattaatgattcactagttccacgatagttaac 3797868  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3797869 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcacactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgtt 3797968  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  3797969 aacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaaatagaaagctatggtcagtagtcat 3798068  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcatat-tgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  3798069 tcattctcattaaatcatgtttatatgtgatcaggatataaaa 3798111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 56199013 - 56198671
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  | |  |||||| || |||||||||||    
T  56199013 gagagagatgaaatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatcattttctagttctaagatagttaaca 56198914  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  56198913 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctctaactacaacccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcatgtt 56198814  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56198813 aacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 56198714  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  56198713 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 56198671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 670 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 5673064 - 5672743
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |  ||||||  ||||    
T  5673064 aaagaataagagagagatgcgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacga 5672965  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5672964 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 5672865  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||    
T  5672864 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaaactatggtc 5672765  T
Q  968 agtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  5672764 agtagtcattcattctcactaa 5672743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15432270 - 15431897
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattg 746  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15432270 aacagaaaataaagatttgtttggaaaataataagagagatgagactaggtctttcgagtcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattctta 15432171  T
Q  747 tgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tg 845  Q
    |||| || || |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||    
T  15432170 tgaatgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtg 15432071  T
Q  846 gtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattag 945  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  15432070 gtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaatctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattct 15431971  T
Q  946 gtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  15431970 gtctaagtagaaagctatgatcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 15431897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 27014422 - 27014081
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  27014422 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 27014323  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttg-aaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  27014322 aatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgtta 27014223  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27014222 gcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 27014123  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  27014122 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 27014081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Original strand, 52530699 - 52531239
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgta 579  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    |||| |||||       
T  52530699 ctgatagatattttagcaagcgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactg-tgttaatctcaatttagcaataacgttaat 52530797  T
Q  580 acttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagc---aataa-cagaaaataaagattggttt--aaag 673  Q
    |  |||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||| | ||    || ||||||||     ||||| ||||| |||||||| |  ||  ||||    
T  52530798 atctaagatgtgtaaat-ttcttttagtttgcc-ctaggcagtagttt----tgattgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaag 52530891  T
Q  674 aataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagt 773  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| ||  ||||||||    
T  52530892 aataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagt 52530991  T
Q  774 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagc 871  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||     
T  52530992 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 52531091  T
Q  872 acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagta 971  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||| ||    
T  52531092 gtgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtaaaaagctatggtcaata 52531191  T
Q  972 gtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  52531192 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 52531239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 52006494 - 52006834
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  52006494 agagagatgagaccaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 52006593  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  52006594 aatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgtcaa 52006693  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  52006694 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaacctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 52006793  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  52006794 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 52006834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5681585 - 5681246
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  5681585 gagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgaaactattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 5681486  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5681485 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaac 5681386  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5681385 ctagtatcactaacaaacgattatccattcctacactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcg 5681286  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |  || |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5681285 ttatggctaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 5681246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15812098 - 15812441
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  |||||| ||| ||||||||||    
T  15812098 gagagagatgagatcaggtctttcgatacatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttctacaatagttaaca 15812197  T
Q  779 aaatagtcctaa-tcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15812198 aaatagtcctaaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgt 15812297  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15812298 taacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 15812397  T
Q  976 ttcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  15812398 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 15812441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 681 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 12238423 - 12238113
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  12238423 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 12238324  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaa 878  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | |||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  12238323 atagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaa 12238224  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12238223 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattc 12238124  T
Q  979 gttctcactaa 989  Q
    |||||||||||    
T  12238123 gttctcactaa 12238113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34319879 - 34320221
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| ||  |||||||||||||    
T  34319879 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaaca 34319978  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  34319979 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgtt 34320078  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34320079 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 34320178  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  34320179 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 34320221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 766 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 35510037 - 35509783
Alignment:
Q  766 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaagg 864  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  35510037 acgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattaaagg 35509938  T
Q  865 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtg 964  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  35509937 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcgaaagctagg 35509838  T
Q  965 gtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| || ||||||||||||||    
T  35509837 gtcagtagtcattcgttcttactaaatcatgtttatatttaatcaggatataaaa 35509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 582 - 989
Target Start/End: Original strand, 37103075 - 37103488
Alignment:
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaa-taacagaaaataaagattggttt--aaagaa 675  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    ||| || ||| ||||||||||||| | |||  |||  |    
T  37103075 ttaagatgtataaaagttcttttgaattgccactaggcagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataatagaaaataaagatagttttggaaaata 37103174  T
Q  676 taagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtta 775  Q
    ||    |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  37103175 tatataagagatgagactaagtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagtta 37103274  T
Q  776 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcc-ttagtggtctaataacctttgaaggtttaagcacg 874  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37103275 acaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattcctttggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacg 37103374  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37103375 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacc-tgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 37103473  T
Q  975 attcgttctcactaa 989  Q
    |||| ||||||||||    
T  37103474 attcattctcactaa 37103488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40903046 - 40903387
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  40903046 agagagatgagatcaggtctttagaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 40903145  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  40903146 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 40903245  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40903246 acctaatatcactaataaaggattatcaattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 40903345  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  40903346 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 40903387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 44808917 - 44809259
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  44808917 gagaaagatgagatcagatctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 44809016  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  44809017 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtt 44809116  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44809117 aacctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 44809216  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  44809217 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 44809259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 27677018 - 27677358
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  || |||||||||||    
T  27677018 agagagatgagataaggtctatcgaatcatttatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccaccatagttaacaa 27677117  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27677118 aatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 27677217  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27677218 cctaatatcgctaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaataatttaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 27677317  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  27677318 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 27677358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 670 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 5670746 - 5670431
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |  ||||||  ||||    
T  5670746 aaagaataagagagagatgcgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacga 5670647  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  5670646 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 5670547  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| || |||||    
T  5670546 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaaactatggtc 5670447  T
Q  968 agtagtcattcgttct 983  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5670446 agtagtcattcattct 5670431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 38283452 - 38283792
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |  ||||||  | |||||| |||||    
T  38283452 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtaaacaa 38283551  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38283552 aatagtcataatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttagcacgttaa 38283651  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38283652 cctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatattctatcagtagaaagctatggtcagtagtcattc 38283751  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  38283752 attctcactaaatcaggtttatatttgatcaggatataaaa 38283792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 678 - 989
Target Start/End: Original strand, 19864478 - 19864786
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||     |||||||||    
T  19864478 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttc----atagttaac 19864573  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19864574 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttagatggtctaataatctttgaaggtttaagcatgtt 19864673  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  19864674 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagttat 19864773  T
Q  977 tcgttctcactaa 989  Q
    || ||||||||||    
T  19864774 tcattctcactaa 19864786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 678 - 989
Target Start/End: Original strand, 19859483 - 19859795
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||  | |  ||||||  |||||| ||||     
T  19859483 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacatattcttatgaattattttctagttccacgataattaat 19859582  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19859583 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgtt 19859682  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  19859683 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagttat 19859782  T
Q  977 tcgttctcactaa 989  Q
    || ||||||||||    
T  19859783 tcattctcactaa 19859795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 24044104 - 24044444
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  24044104 agagagatgagatcaggtctttgaaattatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 24044203  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  24044204 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggacactcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttaaaggtttaaacacgttaa 24044303  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  24044304 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtaattc 24044403  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24044404 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24044444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15405043 - 15405388
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  15405043 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattgatatactgcacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 15405142  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  15405143 aaatagccctaatcaatccattgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 15405242  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccatt---cctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15405243 aacctaatatcactaacaaacgattatccattattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagt 15405342  T
Q  974 cattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  15405343 cattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcacgatataaaa 15405388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 29324984 - 29324643
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  29324984 gagagagatcagatcaggtctttcgaatcatcgatgttccc-taattggtatattgcacctattcatattaatgattttctagttccacgatagttaaca 29324886  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  29324885 aaatagccctaatcaatcccttgagttatgaccattttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 29324786  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29324785 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 29324686  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  29324685 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 29324643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 40795161 - 40794820
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||     
T  40795161 agagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttacacgatagttaacag 40795062  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  40795061 aatagtcctgatcaattccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 40794962  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  40794961 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtttaagtagaaagttatggtcagtagtcatt 40794862  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40794861 cattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 40794820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 12783063 - 12782723
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || || |  ||||||| |  | |||||||||    
T  12783063 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttataaatgattttctagtttcattagagttaacaa 12782964  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12782963 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggacccttttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 12782864  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12782863 cctaatatccctaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattccgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 12782764  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || | ||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  12782763 atttttactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 12782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 696 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 44164925 - 44164601
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| || |   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44164925 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 44164826  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaata 894  Q
    ||||||| |||||||||||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44164825 cccttgacttaggaccctcttctcaaactacaatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcaggttaacctaatatcactaaca 44164726  T
Q  895 aaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcat 993  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44164725 aacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcat 44164626  T
Q  994 attcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||| |||||||| ||||||||    
T  44164625 gtttatatttgatcagaatataaaa 44164601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 48415488 - 48415833
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctat----gttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtta 775  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  | ||||||||    
T  48415488 agagagatgagatcaggtctttcgaattatctatatatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtta 48415587  T
Q  776 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcac 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48415588 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggactctcttctcaaactacagctcctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaac 48415687  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48415688 gttaacctaatatcaataataaatgattatccattcctagactaaccattattattagaaaaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 48415787  T
Q  974 cattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  48415788 cattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 48415833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 702 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 3719260 - 3718942
Alignment:
Q  702 cgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttg 801  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3719260 cgaatcatccatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttgctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttg 3719161  T
Q  802 agttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggat 900  Q
      |||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3719160 gcttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagatttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgat 3719061  T
Q  901 tatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcat 999  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||    
T  3719060 tatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatcatgtttat 3718961  T
Q  1000 a-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3718960 atttgatcaggatataaaa 3718942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15429819 - 15430159
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  15429819 agagagatgagatcaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 15429918  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||     ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15429919 aatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaaggtttaagcacgttaa 15430018  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  15430019 cctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgttc 15430118  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15430119 attttcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 15430159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 33927132 - 33926785
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  33927132 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 33927033  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||||||| |||||||    
T  33927032 aaatagccataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaaaactacagcccctaattcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaagcacgtt 33926933  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagta----- 971  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||         
T  33926932 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacagttcaattagatctaagtcgaaagctagggtcagtagtcaa 33926833  T
Q  972 gtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  33926832 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 33926785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15436433 - 15436773
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  15436433 agagagatgagatcaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 15436532  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||     ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15436533 aatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaaggtttaagcacgttaa 15436632  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  15436633 cctaatatcaataaaaaacgattatacattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgttc 15436732  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15436733 attttcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 15436773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 652 - 1017
Target Start/End: Original strand, 8877435 - 8877805
Alignment:
Q  652 gaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaa 750  Q
    |||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||    
T  8877435 gaaagtaaagatttgattagaaaatatgagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctaagttcccctatttagtatactgcacctatttcttatgaa 8877534  T
Q  751 ggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtct 849  Q
     || || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | | ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  8877535 tgactctctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctccgatcacaacccctaatttcttaggtggtct 8877634  T
Q  850 aataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 948  Q
    ||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  8877635 aatattctttgaaggttttaagaatgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaaatc 8877734  T
Q  949 taagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  8877735 taagttgaaagctatggtcagtagtcattcattcccactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 8877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 33408279 - 33408621
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||| ||||| |    
T  33408279 gagagtgatgagtttaggtctttcgaatcctctaagttcccctaatcggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaata 33408378  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||    
T  33408379 aaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactataacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgtt 33408478  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  33408479 aacttaatatcacaaataactgattatctattcctagactaacaatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtagacagctatggtcagtaatcat 33408578  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcatat-tgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  33408579 tcattctcactaaatcatgtttatatctgatcaggatataaaa 33408621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 696 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 49270822 - 49270531
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49270822 gtctttcgaatcatctatattctcctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattatctagttcaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 49270723  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    || ||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||     
T  49270722 cc-ttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccctaggtggtctaataa---ttgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaac 49270627  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49270626 aaacgattattcattcatatactaaccatgtttatgagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcattcgttctcactaa 49270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 679 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 53094669 - 53094358
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtcttt-cgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||| |||||  ||||    
T  53094669 gagagagatgagatcaggtcttttcaaatcctctaagttcccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatgattaa 53094570  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacg 874  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||| | | |||    
T  53094569 caaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatagtacaacccctaactccttaggtggtctaatactctttgaatgttttatgaacg 53094470  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||     
T  53094469 ttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaaactatggtcagtagta 53094370  T
Q  975 attcgttctcac 986  Q
    ||||||||||||    
T  53094369 attcgttctcac 53094358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 773 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15446792 - 15447039
Alignment:
Q  773 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagc 871  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  15446792 ttaaccaaatagttataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaaggtttaagc 15446891  T
Q  872 acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagta 971  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||    
T  15446892 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattcagtctaagtagaaagttatggtcagta 15446991  T
Q  972 gtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15446992 gtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 15447039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 729 - 989
Target Start/End: Original strand, 8874772 - 8875035
Alignment:
Q  729 atactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaca 827  Q
    ||||||||||||||  || |||| || || ||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||||||||||  | |||||    
T  8874772 atactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcaagatggttaacaaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattaca 8874871  T
Q  828 gcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtt 925  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8874872 gcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacattaacttaatataacaaataaacgactatccattcctagactaaccatgtt 8874971  T
Q  926 tattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8874972 tatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcattcattctcactaa 8875035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 829 - 1016
Target Start/End: Original strand, 27679337 - 27679527
Alignment:
Q  829 cccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta 927  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27679337 cccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgttta 27679436  T
Q  928 ttagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaa 1016  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  27679437 ttagaacaattcaattctgtataagtagaaagctatgttcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 27679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 614 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 35510218 - 35510043
Alignment:
Q  614 ctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatct 711  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35510218 ctaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggttttaagattaagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatct 35510119  T
Q  712 atgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcc 787  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  35510118 atattcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattcactagttccacgttagttaacaaaatagtcc 35510043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 843 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19827484 - 19827308
Alignment:
Q  843 gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19827484 gtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattccat 19827385  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  19827384 tcagtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttgtatttgatcaggatataaaa 19827308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 766 - 986
Target Start/End: Original strand, 22172422 - 22172645
Alignment:
Q  766 acgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaag 863  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||    
T  22172422 acgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatattcttcgaag 22172521  T
Q  864 gttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctg 962  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  22172522 gttttaagaacgttaacctaatatcgcaaataaacgattatccattcatagactaaccctgtttatttgaacaattcaataaggtctaagttgaaagcta 22172621  T
Q  963 tggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  22172622 tggtcagtaatcattcattctcac 22172645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50066871 - 50066744
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50066871 ttgttgaaacaaaaatcttttttatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcact 50066772  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||||| | || ||||||||    
T  50066771 taagtcttttcacaaaagttgacaagaa 50066744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 11477685 - 11477811
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11477685 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttgatgataacaaaccttatgaaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcacat 11477784  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||||| | || ||||||||    
T  11477785 aagtcttttcacaaaagttgacaagaa 11477811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 681 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 5706550 - 5706387
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  5706550 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 5706451  T
Q  781 at-agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  5706450 ataagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttag 5706387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 693 - 986
Target Start/End: Original strand, 37739733 - 37740033
Alignment:
Q  693 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat-tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaa 790  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||    || ||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||    
T  37739733 taggtctttcgaatcatcagagttcctctaattggtacactgcacctatgtcttatgaatatttctctagtttcacgatggttagctaaaatagccctaa 37739832  T
Q  791 tcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagca-cgttaacctaata--- 885  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  | | |||||||||||       
T  37739833 tcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattactgtccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacattaacctaataata 37739932  T
Q  886 tcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctca 985  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  37739933 tcacaaataaacgattatccattcatagattaacccagtttatttgaaaaattcgattaggtctaagttgaaagctatggttagtagtcattcattctca 37740032  T
Q  986 c 986  Q
    |    
T  37740033 c 37740033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 670 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 39498478 - 39498346
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  39498478 aaagaatgagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 39498379  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39498378 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 39498346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 758 - 978
Target Start/End: Original strand, 33493733 - 33493958
Alignment:
Q  758 ctagttttacgata--gttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaata 853  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| |||| | |||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  33493733 ctagttttacgataaagttaactaaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaata 33493832  T
Q  854 acctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaag 952  Q
      ||||||| |||||| | |||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  33493833 ttctttgaatgtttaaagaacgttaacatattatcacaaataaacgattatctattcctagactaactctgtttatttgaacaattcaattaggtctaaa 33493932  T
Q  953 tcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||    
T  33493933 ttgtaagctatggtcagtagtcattc 33493958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 34496280 - 34496153
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacact-aagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  34496280 tgttgaaacaaaaatctttttgataaatattttaatgataacaaaccttatggaataaacgctaaagttttatgaaaggtgatatactgatgtttgcgct 34496181  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  34496180 taagtcttttcgcagaagtagacaagaa 34496153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 349 - 458
Target Start/End: Original strand, 25514204 - 25514313
Alignment:
Q  349 ttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagtcttttcacagacg 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |    
T  25514204 tttttatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactaatgtttgcacttaagtcttttcacaaaag 25514303  T
Q  449 tagacaagaa 458  Q
    | ||||||||    
T  25514304 ttgacaagaa 25514313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 832 - 1021
Target Start/End: Original strand, 48014167 - 48014359
Alignment:
Q  832 ctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttatt 929  Q
    |||||||||||| || |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48014167 ctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatgtcacaaataaacgattatccattcctaaactaaccctgtttatt 48014266  T
Q  930 agaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa-tcatattcata-ttgatcaggatataaaagcat 1021  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  48014267 tgaacaattcaattaggtcaaagttgaaagttatggtcagtagttattcattctcacgaattcatatttatatttgatcaggata-aaaagcat 48014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 16056606 - 16056710
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16056606 ttgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttgtgtaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcact 16056705  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  16056706 tgagt 16056710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 53947964 - 53947861
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53947964 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcactt 53947865  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  53947864 gagt 53947861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Original strand, 41524292 - 41524397
Alignment:
Q  330 tttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41524292 tttgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaactttgtggaataaatgacaagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcac 41524391  T
Q  430 ttgagt 435  Q
    ||||||    
T  41524392 ttgagt 41524397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5211992 - 5211896
Alignment:
Q  348 tttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagtcttttcaca 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5211992 ttttttatgaatgttttaatgataacaaacattacggaataaacgctaagttttatgaataatgatctactgatgtttgcacttaagtcttttcaca 5211896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 680 - 782
Target Start/End: Original strand, 15445328 - 15445430
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| ||  ||||||||||||||    
T  15445328 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctacttccacgatagttaacaa 15445427  T
Q  780 aat 782  Q
    |||    
T  15445428 aat 15445430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 758 - 976
Target Start/End: Original strand, 5677449 - 5677660
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt-agtggtctaataac 855  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||| |||||||||||| |||| |||||||      
T  5677449 ctagtttcacgatggctaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaagtgatctaatatt 5677548  T
Q  856 ctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||| | |||    |||||||      ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5677549 ctttgaaggttttaaggacgttaaccttgtatcacaaatatacgat----cattcct------accttgtttatttgaacaattcaattaagtctaagtt 5677638  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    | ||| | |||| |||||||||    
T  5677639 gtaagttatggttagtagtcat 5677660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50519182 - 50519095
Alignment:
Q  371 aacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  50519182 aacaaaccttatggaattaacgctaagttttataaatggtgatctactgatgtttgcacttaagtcttttcacataagttgacaagaa 50519095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29325170 - 29325098
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  29325170 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 29325098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24151028 - 24150949
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  24151028 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 24150949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Original strand, 38283247 - 38283326
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  38283247 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 38283326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 680 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 19827574 - 19827512
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19827574 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatatt 19827512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 458
Target Start/End: Original strand, 7579811 - 7579937
Alignment:
Q  330 tttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcac 429  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  7579811 tttgttgaaataaaaatattttttatgaatgttttaatgataacagacattatggaataaaggctaa-atttattaatggtgatctactaatatttgcac 7579909  T
Q  430 ttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    || ||| |||||| ||  |||||||||||    
T  7579910 ttaagt-ttttcatagtagtagacaagaa 7579937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Original strand, 44808723 - 44808802
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  44808723 tgatagacttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 44808802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 3719261 - 3719327
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3719261 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 3719327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 913 - 954
Target Start/End: Original strand, 24410206 - 24410247
Alignment:
Q  913 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410206 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 24410247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 34319692 - 34319764
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  34319692 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 34319764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 40902848 - 40902920
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  40902848 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 40902920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3734656 - 3734600
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3734656 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 3734600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 49639592 - 49639648
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49639592 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 49639648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 48637853 - 48637806
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48637853 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 48637806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5673251 - 5673170
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  5673251 ctgatagatattttagcaagtgtactaaatattatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 5673170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 11561172 - 11561091
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||    
T  11561172 actgatagaattctggcaagtgtacaaaaaactatcgaagtagtaataaatatcattttacaaggact-gtattaatctcaat 11561091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 14702259 - 14702193
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14702259 tgatagatatttggcaaatgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 14702193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 657 - 734
Target Start/End: Original strand, 8871705 - 8871782
Alignment:
Q  657 taaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactg 734  Q
    |||||||| | ||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8871705 taaagatttgattagaaaatatgagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctaagttcccttaattggtatactg 8871782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 425
Target Start/End: Original strand, 10178281 - 10178366
Alignment:
Q  340 caaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgttt 425  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  |  ||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10178281 caaaaatctttttgatgaataatttaatgataacaagcctcgtagaataaatgataagttttatgaatggtgatatattgatgttt 10178366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 12238615 - 12238558
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12238615 ctgatagatattttagcaagtgtactaaataccatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 12238558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19929243 - 19929178
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggac 546  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19929243 ctgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacgaggac 19929178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Original strand, 22393927 - 22394004
Alignment:
Q  358 atgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacac-taagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgag 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22393927 atgttttgatgataacaaaccttgtgaaataaactgataagttttatgaatgttaatctactgatgtttgcacttgag 22394004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Original strand, 34017558 - 34017606
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34017558 attttagcaagtgtattaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 34017606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 49636299 - 49636355
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49636299 ttggcaagtgtatcaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 49636355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 538
Target Start/End: Original strand, 27676826 - 27676868
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27676826 gcaagtgtactaaatattatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 27676868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 15445127 - 15445168
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaata 531  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15445127 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaata 15445168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 499 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5670915 - 5670852
Alignment:
Q  499 agtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  5670915 agtgtactaaatattatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 5670852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15432427 - 15432356
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  15432427 ttttagcaagtgtacaaaatattatcgaagttgtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 15432356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 27014608 - 27014537
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  27014608 ttttagcaagtgcactaaataccatcgaagtagtaaaaatatcgttaccacgaggact-gtgttaatctcaat 27014537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 46568467 - 46568427
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtag 523  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46568467 tgatagatttttggcaagtgtatcaaatactatcgaagtag 46568427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 758 - 797
Target Start/End: Original strand, 8448609 - 8448648
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8448609 ctagttttacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcc 8448648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 435
Target Start/End: Original strand, 30650018 - 30650057
Alignment:
Q  396 agttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30650018 agttttatgaatgttgatctactgatgtttgcacttgagt 30650057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 919 - 983
Target Start/End: Original strand, 8448745 - 8448810
Alignment:
Q  919 ccatgtttattagaacaattcaatt-aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttct 983  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  8448745 ccatgtttatttgagcaattcaatttaggtctaagtagaaagctatgaccagtagtcattcattct 8448810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 527
Target Start/End: Original strand, 8871481 - 8871514
Alignment:
Q  494 tggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8871481 tggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaaa 8871514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 966 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 15438564 - 15438511
Alignment:
Q  966 tcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15438564 tcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 15438511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26135898 - 26136436
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26135898 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 26135997  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26135998 ttaagatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 26136097  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26136098 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaa 26136197  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26136198 tagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 26136297  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26136298 taatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgt 26136397  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26136398 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 26136436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37165917 - 37166455
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37165917 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccataaggactggttttaatcacaataattcaattacgttgtaaa 37166016  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166017 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 37166116  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37166117 agagatgaatttaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaag 37166216  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37166217 tagtcctaatcaatcccttgagttaggactctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaatgtttaagcacgttaacc 37166316  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  37166317 taatatcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgt 37166416  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  37166417 tctcactaaatcatatttatatttgatcaagatataaaa 37166455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 543 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26144339 - 26144816
Alignment:
Q  543 ggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26144339 ggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggaagttgattgatttgtttgcataa 26144438  T
Q  643 gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144439 gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 26144538  T
Q  743 attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26144539 cttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattcctta 26144638  T
Q  843 -gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144639 ggtggtctagtaacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 26144738  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26144739 ttacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 26144816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 486 - 1017
Target Start/End: Original strand, 20080489 - 20081026
Alignment:
Q  486 tagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaactta 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20080489 tagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaatgactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaagtta 20080588  T
Q  585 agatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20080589 ggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagaatggttttaagaataagaga 20080688  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20080689 gagatgagtttaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttctgaatgagtcactagttcaacgatagttaacaaaat 20080788  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20080789 agtcctaatcaatcccttgagttaggacccccttctagggttatagaccctaatttcttaggtggtctaataatcgctgaaggtttaagcacgttaacct 20080888  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  20080889 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagccattcgtt 20080988  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  20080989 ctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 20081026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3067745 - 3068285
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3067745 tgatagaaatttgacaagtataccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggatttgttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 3067844  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  3067845 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcatttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacaaaatttaaagattggttttaagaataag 3067944  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  3067945 agagacatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgttatactgcacctattcttgtgaatgactcactagttctatgatagttaacaa 3068044  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  3068045 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcacattaa 3068144  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3068145 cctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtatattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattc 3068244  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  3068245 gttctcactaaatcatgattatatttgatcaggatataaaa 3068285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1014
Target Start/End: Original strand, 9132531 - 9133065
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9132531 tgatagacgtttggcaagtgtaccaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactagttttaatctaaataattcaattacgttgtaag 9132630  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataa--cagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||  || ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  9132631 ttaggatatatataagttattttgatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaa-agtaatgcaaaaagtaaag-ttggttttaagaataag 9132728  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  9132729 agagagatgagtt-aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaa 9132827  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9132828 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 9132927  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9132928 cctaatatcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattccattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 9133027  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatata 1014  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9133028 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatata 9133065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 506 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10469467 - 10468950
Alignment:
Q  506 caaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttctttt 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10469467 caaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaagttaggatgtataaaagttatttt 10469368  T
Q  605 aatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttc 702  Q
     |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10469367 gattttccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaacaacaaaaagtaaagattgattttaagaataagagagagatgagtttagatctttc 10469268  T
Q  703 gaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttga 802  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    |  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10469267 gaatcatctatgttcccctaattagtacactgcacctattcttgtgaattcttttctagttccatgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatcccttga 10469168  T
Q  803 gttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggatt 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10469167 gttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggatt 10469068  T
Q  902 atccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata 1000  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  10469067 atctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcacgaaatcatgtttata 10468968  T
Q  1001 -ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||||||||||||    
T  10468967 tttgatcaggatataaaa 10468950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 14683210 - 14683752
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14683210 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaataccatcgaagtactaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 14683309  T
Q  582 ttaagatgt--ataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaata 677  Q
     || |||||  ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14683310 ctaggatgtgtataaaagttattttgttttgccactaggcagttgattgatttgtttgcataaaagtaaagacaaaaaataaagattggttttaagaata 14683409  T
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  14683410 aaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 14683509  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  14683510 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacagcccctaattccataggtggtctaatagttattgaaggtttaagcacgtt 14683609  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  14683610 aacctaatatcactaataaatgattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttatggtcactagtcat 14683709  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14683710 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 14683752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 490 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 13842976 - 13842446
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagat 588  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13842976 attttagcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaattaggat 13842878  T
Q  589 gtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatg 688  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13842877 atataaaggttcttttaatttgccactaggcagttgattgatttgtttgcataagaaataacagaaaataaagattggttttaagaataagagagagatg 13842778  T
Q  689 agtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcct 788  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  13842777 agatcaggtctttcgaatcatcgatattcccgtaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagccct 13842678  T
Q  789 aatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatc 887  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13842677 aatcaatcccttgaattaggaccctctcctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatc 13842578  T
Q  888 actaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact 987  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13842577 actaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagctagggtcagtagtcattcgttctcact 13842478  T
Q  988 -aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  13842477 aaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 13842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Original strand, 45287003 - 45287377
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45287003 aacagaaaataaagatagagttggaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattctt 45287102  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| |    
T  45287103 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 45287202  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 944  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45287203 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 45287302  T
Q  945 ggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45287303 ggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45287377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 626 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10345397 - 10345020
Alignment:
Q  626 ttgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaa 723  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10345397 ttgatttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaa 10345298  T
Q  724 ttggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggt 823  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| | |   ||||                ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10345297 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattcactagtttaagg---gtta----------------caatcccttgagttaggaccctcttatagggt 10345217  T
Q  824 tacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccat 922  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10345216 tacaacccctaattccttagatggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacttaatatcactaataaaggattatccattcttagactaaccat 10345117  T
Q  923 gtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  10345116 gtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcagtcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 10345020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37415381 - 37415733
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  | ||    
T  37415381 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccatga 37415480  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcc--ttag-tggtctaataacctttgaaggtt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37415481 tagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccccttaggtggtctaataatctttgaaggtt 37415580  T
Q  867 taagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggt 966  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  37415581 taagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggt 37415680  T
Q  967 cagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  37415681 tagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 37415733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 16166090 - 16165554
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   ||||| |||||   |     
T  16166090 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactg-tgttaatctcaatttatcaataacgttaatat 16165992  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttt---aaagaataa 678  Q
     || ||||| ||||  |||||||| |  ||| | ||||||| ||||| | ||  |  | |   ||||||||||||||| ||| | |||   |||||  |     
T  16165991 ctaggatgtgtaaat-ttcttttagt--gcc-cgaggcagtagattggtgtgcataaaaagtaaataacagaaaataa-gatagttttggaaaagacaag 16165897  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || || ||| ||  |||||||||||||    
T  16165896 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaaca 16165797  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  16165796 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtt 16165697  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16165696 aacctaatatcactaacaaacgattacccattcctagattaaccatgtttattagaataattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 16165597  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  16165596 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 16165554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 48645656 - 48645280
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata-agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  | |||| |  ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48645656 aataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactagatctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattc 48645557  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  48645556 ttatgaatgattttctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 48645457  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645456 gtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatcagtaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 48645357  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  48645356 taggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcgttatcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 48645280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23224863 - 23225214
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  23224863 aaagaatgagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacga 23224962  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  23224963 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 23225062  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  23225063 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 23225162  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  23225163 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 23225214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 20594409 - 20594069
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  20594409 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacgtattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 20594310  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20594309 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 20594210  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  20594209 cctaatatcactaaaaaacgattatccattcttacactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattc 20594110  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  20594109 attctcactaaatcatatttatatttgatcagaatataaaa 20594069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 586 - 1017
Target Start/End: Original strand, 2441146 - 2441587
Alignment:
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaa-taacagaaaataaagattggttta-aagaataag- 679  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    ||| || ||||||||||||||||| | |||  || ||||||     
T  2441146 gatgtataaattttcttttaaattgccactaggcagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaaataagg 2441245  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| || |||||||||||||||    
T  2441246 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattctacgatagttaacaa 2441345  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  2441346 aatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgtta 2441445  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2441446 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcttt 2441545  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2441546 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 8277132 - 8276791
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  8277132 agagagatgagatcaggtctttcgaagcatctatgttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 8277033  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  8277032 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 8276933  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8276932 acctaatatcactaacaaacgattatcaattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 8276833  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8276832 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 8276791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17730960 - 17730620
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  17730960 agagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 17730861  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17730860 aatagtcctaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 17730761  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17730760 cctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 17730661  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  17730660 attttcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 17730620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 680 - 1021
Target Start/End: Complemental strand, 26557645 - 26557301
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  26557645 agagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 26557546  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26557545 aatagtcctaatcaatcccttgacatagaaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 26557446  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26557445 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 26557346  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaagcat 1021  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  26557345 attctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaagcat 26557301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 13449743 - 13450084
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  13449743 gagagagatgagaacaggtctttcgaatcatcgatggtcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 13449842  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  13449843 aaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtt 13449942  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13449943 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctg-ggtcagtagtcat 13450041  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  13450042 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 13450084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 4547015 - 4546675
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  4547015 agagggatgagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 4546916  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4546915 aataatcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 4546816  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4546815 cctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattc 4546716  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  4546715 attctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 4546675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 696 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 6603589 - 6603264
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6603589 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaat 6603490  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6603489 cccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaac 6603390  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatca 992  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6603389 aaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcaatagtcattcgttctcactaaatca 6603290  T
Q  993 tattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | || ||| |||||||||||||||||    
T  6603289 tgtttatatttgatcaggatataaaa 6603264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9864658 - 9865035
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||     
T  9864658 aataacagaaaagaaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgtatccctaattggtatactacacctattc 9864757  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
     | | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||| |||||||||||    
T  9864758 gtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccataattccttag 9864857  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     |||||||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864858 gtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 9864957  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  9864958 ttaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 9865035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4595977 - 4596317
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||| ||    
T  4595977 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaaaa 4596076  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttagt-ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4596077 aatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 4596176  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||| |||||||||    
T  4596177 cctaatatcactaacaaacaattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaaactatggtcaatagtcattc 4596276  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  4596277 attctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 4596317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 648 - 898
Target Start/End: Original strand, 45290414 - 45290667
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45290414 aacagaaaataaagatagagttggaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 45290513  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  45290514 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 45290613  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaagg 898  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45290614 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaagg 45290667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 680 - 958
Target Start/End: Original strand, 9271433 - 9271705
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||| ||    
T  9271433 agagagatgagaacaggtatttagaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaagaa 9271532  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9271533 aatactcctaatcaatcccttgagttaggtccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 9271632  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaa 958  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9271633 ccaaatatcactaacaaacgattatccattcctag-------ttgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaa 9271705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 824 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11398137 - 11398334
Alignment:
Q  824 tacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacca 921  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  11398137 tacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccactcttagactaacca 11398236  T
Q  922 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  11398237 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 11398334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 843 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37423089 - 37423265
Alignment:
Q  843 gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37423089 gtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 37423188  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  37423189 taggtataagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 37423265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5242115 - 5242461
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagtta 775  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||| || || ||||    
T  5242115 aagagagagatgagatcaggtctttcgaatcttctgagttcccttaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcactatggtta 5242214  T
Q  776 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt--aagca 872  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||  ||| |    
T  5242215 acaaaatatccataaccaatcccttgacttaggaccctattctcagactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagattttaaagaa 5242314  T
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtag 972  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||    
T  5242315 cgttaacttaatatcacaaataaatgagtatccattcttggactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagcag 5242414  T
Q  973 tcattcgttctcac-taatcatattcatatt-gatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| || ||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  5242415 tcattcattatcacgaaatcatgtttatattctatcaggatataaaa 5242461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 680 - 888
Target Start/End: Complemental strand, 4542943 - 4542734
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  4542943 agagagatgagatcaggtcttccgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 4542844  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4542843 aataattctaatcaatcccttgacctagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 4542744  T
Q  879 cctaatatca 888  Q
    ||||||||||    
T  4542743 cctaatatca 4542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 678 - 985
Target Start/End: Original strand, 13809483 - 13809787
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt-attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| || || ||||||| ||||| |||||    
T  13809483 agagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctga-ttcccttaattggtatactgcacctatttattacgaatgattctctagtttcacgatggttaa 13809581  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacg 874  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    ||||| || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  13809582 caaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacaacctctaattccttatgtggcctaatactctttgaaggttttaagaacg 13809681  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||    
T  13809682 ttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaa-----caattaggtctgagttgaaagctatggccaatagtc 13809776  T
Q  975 attcgttctca 985  Q
    |||| ||||||    
T  13809777 attcattctca 13809787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 694 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7227660 - 7227333
Alignment:
Q  694 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatc 792  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||    
T  7227660 aggtctttcgaatcctctg-gttcccctgattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaacaaaataaccataatc 7227562  T
Q  793 aatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcact 890  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||  || |||||||  |||||||||||| | | |||||||| ||||||| |     
T  7227561 aatcccttgacttaggaccctattctccaattacagcctctaattccttatatgatctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatctca 7227462  T
Q  891 aataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taa 989  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  7227461 aataaacgattatccattgctaggctagccatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaa 7227362  T
Q  990 tcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | || || ||| |||||||||||||||||    
T  7227361 taatgtttatatttgatcaggatataaaa 7227333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 680 - 867
Target Start/End: Original strand, 11919833 - 11920021
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||| ||||||    
T  11919833 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgataggtaacaa 11919932  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11919933 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 856 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 4695493 - 4695330
Alignment:
Q  856 ctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcg 955  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  4695493 ctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaaatgtgtctaagtag 4695394  T
Q  956 aaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  4695393 aaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 4695330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 758 - 985
Target Start/End: Original strand, 18562578 - 18562808
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataac 855  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||| ||||||| |||||||    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||      
T  18562578 ctagttttacgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatatt 18562677  T
Q  856 ctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
     || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  18562678 attcgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttaattgaacaattcaattaggtctaagtt 18562777  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcattcgttctca 985  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18562778 gaaagctatggtcagtagtcattcattctca 18562808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 4315268 - 4315142
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4315268 tgttgaaacaaaaatctttttgacgaatgttttaatgataacaaaccatatggaataaacactaagttttatgaatggtgatccactgatgtttgcactt 4315169  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||||||| || ||||||||    
T  4315168 aagtcttttcacagaagttgacaagaa 4315142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 9735039 - 9735165
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9735039 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaagactaagttttatgaatggtgatctactgatggttgcactt 9735138  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     ||| |||||||||| || ||||||||    
T  9735139 aagtgttttcacagaagtggacaagaa 9735165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 875 - 989
Target Start/End: Original strand, 22611771 - 22611885
Alignment:
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22611771 ttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattaggtgtaagtcgaaagctagggtcagtagtc 22611870  T
Q  975 attcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||||||    
T  22611871 attcgttctcactaa 22611885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 32816251 - 32816377
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32816251 tgttgaaaccaaaatatttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactg 32816350  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     ||| |||| | ||| |||||||||||    
T  32816351 aagtattttaagagaagtagacaagaa 32816377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 694 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 4695613 - 4695491
Alignment:
Q  694 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatca 793  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4695613 aggtctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatca 4695514  T
Q  794 atcccttgagttaggaccctctt 816  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4695513 atcccttgacttaggaccctctt 4695491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 698 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 35961219 - 35961099
Alignment:
Q  698 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 797  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35961219 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcc 35961120  T
Q  798 cttgagttaggaccctcttct 818  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  35961119 cttgatttaggaccctcttct 35961099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 778 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5796600 - 5796357
Alignment:
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||  | |||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  5796600 aaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgt 5796501  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |    
T  5796500 taacattatatcacaaataaacgattattcattcatagactaaccctttttatttgaaaaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagcaggta 5796401  T
Q  976 ttcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5796400 ttcattctcacaaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 5796357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 483 - 580
Target Start/End: Original strand, 20595912 - 20596010
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20595912 tgatagaattttggcaagtgtatcaaatactatctaagtagtaaaaatttcgttcccacaatgactggttttaatttcaataattcaactacgttgtaa 20596010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 649 - 777
Target Start/End: Original strand, 22611649 - 22611775
Alignment:
Q  649 acagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtg 748  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  22611649 acagaaaataaagattggttttaagaataagataga--tgagtttaggtctttcgaatcattgatgttcccctaattgatatactgcatctattcttatg 22611746  T
Q  749 aaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    || || |||||||||  |||||| |||||    
T  22611747 aatgattcactagttccacgataattaac 22611775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Original strand, 12103083 - 12103186
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  12103083 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgtttcaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatatttgaactt 12103182  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  12103183 gagt 12103186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8277339 - 8277259
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  8277339 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttaccacgaggact-gtgttaatctcaat 8277259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 679 - 792
Target Start/End: Original strand, 11398016 - 11398129
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | | || || |  |||||| ||||||||||| ||    
T  11398016 gagagagatgagattaggtctttcgattcatcgatgttcccctaattggtatactgtacctattcgtattaatgattttctagttctacgatagttagca 11398115  T
Q  779 aaatagtcctaatc 792  Q
    ||||||||||||||    
T  11398116 aaatagtcctaatc 11398129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15990407 - 15990303
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaa-tggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  15990407 tgttgaagtaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataagaaacctcgtggaataaataataagttttatgaattggtaatctactgatggttgcact 15990308  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  15990307 tgagt 15990303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6603792 - 6603720
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  6603792 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 6603720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 874 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 24918145 - 24918041
Alignment:
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||||||| || | |||| |||||||||||| ||||| | || |||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24918145 gttaacctaatattacaattaaacgattatccattcatagacaagccctgtttaattgaacaatccaattatgtctaagttgaaagctttggtcagtagt 24918046  T
Q  974 cattc 978  Q
    |||||    
T  24918045 cattc 24918041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 403
Target Start/End: Original strand, 2890005 - 2890068
Alignment:
Q  340 caaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  2890005 caaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatagaataaacaccaagtattat 2890068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 340 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12697774 - 12697679
Alignment:
Q  340 caaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  12697774 caaaaatatttttgttgaatgttttaatgataacaaacctcgtggaataaatgataagttttatgaatggcgatctattgatgttttcacttgagt 12697679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20100997 - 20100931
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20100997 tgatagaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 20100931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Original strand, 13449559 - 13449607
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449559 attttagcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 13449607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 548
Target Start/End: Original strand, 23598527 - 23598594
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23598527 ctgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 23598594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 2252224 - 2252158
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2252224 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 2252158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 446
Target Start/End: Original strand, 28343406 - 28343460
Alignment:
Q  393 ctaagttttatgaatggtgattta-ctgatgtttgcacttgagtcttttcacaga 446  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28343406 ctaagttttatgaatggtgatttaactgatgtttgcacttgagtattttcacaga 28343460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 4543140 - 4543069
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  4543140 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 4543069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26460808 - 26460752
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26460808 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 26460752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 539
Target Start/End: Original strand, 45286848 - 45286896
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcca 539  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45286848 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcca 45286896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Original strand, 37415207 - 37415273
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  37415207 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 37415273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 709783 - 709849
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  709783 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacgaggactg 709849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Original strand, 44017558 - 44017603
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44017558 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 44017603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 534
Target Start/End: Original strand, 23224683 - 23224727
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg 534  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224683 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg 23224727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26182644 - 26182588
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26182644 ttggcaagtgtaccaataactatcaaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 26182588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 539
Target Start/End: Original strand, 45290259 - 45290307
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcca 539  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290259 ttttagcaagtgtactaaatactatcgtagtagtaaaaatatcgttcca 45290307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 4547212 - 4547165
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4547212 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcc 4547165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 873 - 959
Target Start/End: Complemental strand, 2090557 - 2090471
Alignment:
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaag 959  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  2090557 cgttaacctagtatcacaattaaacgatcatctattcctagactacccctgtttatttgaacaatccaattagatttaagttgaaag 2090471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48714778 - 48714732
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaac 377  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  48714778 ttgttgaaccaaaaatcttttcgatgaatattttaatgataacaaac 48714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 377
Target Start/End: Original strand, 28342168 - 28342213
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaac 377  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28342168 tgttgaaataaaaatattttttatgaatgttttaatgataacaaac 28342213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 964 - 1017
Target Start/End: Original strand, 45290667 - 45290722
Alignment:
Q  964 ggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45290667 ggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45290722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48714731 - 48714696
Alignment:
Q  396 agttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48714731 agttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 48714696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34132749 - 34133286
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132749 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 34132848  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  34132849 taagatgtataaaagttcttttaaattgccgctaggcggttgattgttttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggatttaagactaagaga 34132948  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132949 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaat 34133048  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133049 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 34133148  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34133149 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgtt 34133248  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34133249 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 34133286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34142980 - 34143517
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34142980 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 34143079  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  34143080 taagatgtataaaagttcttttaaattgccgctaggcggttgattgttttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggatttaagactaagaga 34143179  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143180 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaat 34143279  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143280 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 34143379  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34143380 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgtt 34143479  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34143480 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 34143517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 12088314 - 12087777
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12088314 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaagaactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 12088215  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  12088214 taagatgtataaaagttcttttaaattgccgctaggcggttgattgttttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggatttaagactaagaga 12088115  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12088114 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaat 12088015  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12088014 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 12087915  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12087914 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgtt 12087815  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12087814 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 12087777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 12058258 - 12058795
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12058258 tgatagaattttggcaactgtactaaatactatcgaagtagtagaaatatcattccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 12058357  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12058358 taagatgtataaaagttcttttaattttctgctaggcagttaattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 12058457  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12058458 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaacaaaat 12058557  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12058558 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 12058657  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12058658 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgtt 12058757  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12058758 ctcactaaatcatatttatatttgaccaggatataaaa 12058795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 512 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17748767 - 17748259
Alignment:
Q  512 ctatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaatttgc 611  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17748767 ctattgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaatcacgttgtaaattaggatgtataaaggttcttttaatttgc 17748668  T
Q  612 cgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatct 711  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17748667 cgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacataaaataaagattggttttaagaataagagagagatgagtttagatcttccgaatcatct 17748568  T
Q  712 atgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 811  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17748567 atgttcccctaattggtataccgcacctatttttgtgaatgagtccctagtttaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 17748468  T
Q  812 ctcttctagggttacagcccctaattcctt-agtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcc 910  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17748467 ctcttctagggttacagcccctaatttcttaagtgatctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcc 17748368  T
Q  911 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcag 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  17748367 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattagttctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcag 17748268  T
Q  1009 gatataaaa 1017  Q
    |||||||||    
T  17748267 gatataaaa 17748259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17664910 - 17664371
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc-cacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17664910 tgatagaagtttggcaaatgtaccaaatattatcgaagtagtaaaaatatcgttctcacaaggactgattttaatctcaataattcaattacattgtaaa 17664811  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
     ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  17664810 ctaagatgtataaaagttattttgttttgccactaggcagttgattgatttgtttgcataaaagtaaagacataaaataaagattggtttcaagaataaa 17664711  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||  ||||||||||||||    
T  17664710 agagagatgagatcaggtcttttgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcta-tgtatgattcactagttccacgatagttaacaa 17664612  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17664611 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaagattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 17664512  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17664511 cctaatatcactaataaaggattatcgattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattc 17664412  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  17664411 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 17664371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 483 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 26293148 - 26292611
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26293148 tgatagaagtttaacaagtgtaccaaataatatcaaagtagtaaaaatattgttcccataagtactggttttaatctcaataattcaattacattgtaaa 26293049  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  26293048 ttaagatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaatgacaaaaagtaaag-ttggttttaagaataag 26292950  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | || || || ||||||  | |||||||||| |    
T  26292949 agagagatgagtttaggtctt-cgaatcatctatgctcctctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattcgctagttccatgatagttaacca 26292851  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292850 aatagtccgaaccaatcccttgagttacgaccctcttatagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 26292751  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26292750 cctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattc 26292651  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaa 1016  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  26292650 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 26292611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Original strand, 11958957 - 11959444
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11958957 tgatagatttttggcaagtgggccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcattcctacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 11959056  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||              |||||||| |||||||||||    
T  11959057 ttaggatgtataaaggttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttccataagcaattt------------attggttttaagaataagag 11959144  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||        
T  11959145 --agatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaac---- 11959238  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11959239 tagttataatcaatcctttgagttagaaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtgtaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacc 11959338  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt-aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  11959339 taatatcactaataaaggattatc--tt--tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaaggtctaagtcgaacgctatggttagtagtcattcg 11959434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 493 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 18953045 - 18952512
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatg 589  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| | |  || ||||    
T  18953045 ttggtaagtgtaccaaaaactatcaaagtagtaaaataatatcgttcccacaaggactgtttttaatttcaacaattcaagtacgttattaaataggatg 18952946  T
Q  590 tataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagaga 686  Q
    |||||| ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  | || ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18952945 tataaaggttattttgttttgccactaggcaattgattggttcgtttgcataaaagtaacaactgaaagtaaaggttggttttaaagaataagagagaga 18952846  T
Q  687 tgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtc 786  Q
    |||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18952845 tgagatcaaatctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtc 18952746  T
Q  787 ctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaata 885  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18952745 ataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaata 18952646  T
Q  886 tcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctca 985  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18952645 tcactaacaaacaattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcattagtcattcgttctca 18952546  T
Q  986 ct-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  18952545 ctaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 18952512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26907416 - 26907758
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  26907416 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttctacgatagttaac 26907515  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26907516 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacctgtaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgtt 26907615  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26907616 aacctaatatcaccaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 26907715  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26907716 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 26907758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 614 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 20056002 - 20055593
Alignment:
Q  614 ctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatc 710  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  20056002 ctaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaacgacagaaaataaagattgattttaaagaataagagagatatgagatgaggtctttcgaatcatc 20055903  T
Q  711 tatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20055902 tatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatcccgtgagttaggac 20055803  T
Q  811 cctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattc 909  Q
    | ||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20055802 cgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattc 20055703  T
Q  910 ctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatca 1007  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  20055702 ctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattctttctcactaaatcatgtttatatttgatca 20055603  T
Q  1008 ggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||    
T  20055602 ggatataaaa 20055593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 671 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 40583417 - 40583068
Alignment:
Q  671 aagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgat 770  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||  || ||  |||||    
T  40583417 aagaataaaagagagatgagtttaggtctttcgaatcctcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctataattccacgat 40583318  T
Q  771 agttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa 869  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40583317 agttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaa 40583218  T
Q  870 gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcag 969  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40583217 gcacgttaacctaatatcactaagaaacgattatctattcctagactaaccatctttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcag 40583118  T
Q  970 tagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40583117 tagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 40583068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 507 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 42063260 - 42062740
Alignment:
Q  507 aaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttctttta 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||    |||| | ||    | |||||||||||||||||||||||     
T  42063260 aaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggacta-tgttaatctcaattcagcaataaagtaaatatttaagatgtataaaagttcttttg 42063162  T
Q  606 atttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaa-taacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtct 699  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||| |||||    ||| || ||||||||||||||||| | |||  |||  |||   ||||||||||  |||||||    
T  42063161 aattgccactaggcagttgatttgtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtct 42063062  T
Q  700 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 799  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42063061 tttgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctct 42062962  T
Q  800 tgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaag 897  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42062961 tgagttaggaccctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaac 42062862  T
Q  898 gattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatatt 996  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  42062861 gattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 42062762  T
Q  997 cata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  42062761 tatatttgattaggatataaaa 42062740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 586 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26895470 - 26895907
Alignment:
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtt-taaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||  | ||  | | ||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26895470 gatgtataaaagttattttgttttgccattaggcaattgattggtttgattgcataaaagtaacgataaaaaataaagctcggttgtagagaataagaga 26895569  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| || |   |||||  |||||| ||||||||||    
T  26895570 gagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatgttgcacctattcttatgaatgattttttagttcaacgataattaacaaaat 26895669  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26895670 agtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacct 26895769  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26895770 aatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcaatcgtt 26895869  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26895870 ctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 26895907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22936901 - 22937241
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| |||||||||||||||    
T  22936901 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaa 22937000  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22937001 atagtcctaatcaatccctttagttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaa 22937100  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22937101 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 22937200  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22937201 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 22937241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 483 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 23044500 - 23044138
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23044500 tgataaaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccataaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 23044401  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
     ||  || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||  ||| ||| ||| | | | |||||||||||||    
T  23044400 atagaatttataaaagttattttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaacgacaaaaagtaa-gttggttttaaagaataag 23044302  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  23044301 agagagatgagtttaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcagtagtttcacgatagttaacaa 23044202  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23044201 aataatcttaatcaatgccttgagttaggaccctcttctagggtcacatcccctaattccttag 23044138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26752654 - 26753005
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |  ||||||  ||||    
T  26752654 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcaccttttcttatgaatgattttctagttccacga 26752753  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  26752754 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 26752853  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  26752854 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 26752953  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26752954 agtagtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 26753005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 43491925 - 43491574
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  43491925 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatcggtatattgcatctatttttatgaatgattttctagttccacga 43491826  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     || | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||     
T  43491825 tagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactagaccccctaattccttaggtggtttaataatctttgaagatttt 43491726  T
Q  869 a-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43491725 atgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 43491626  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43491625 agtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 43491574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 41876727 - 41877068
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |  ||||||  ||||||||||||||    
T  41876727 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 41876826  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  41876827 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 41876926  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41876927 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 41877026  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  41877027 ctttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 41877068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 483 - 908
Target Start/End: Complemental strand, 22131590 - 22131159
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtacc-aaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131590 tgatagattattggcaagtgtacccaaaaactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacaaggactggatttaatctcaataattcaattacgttgtaa 22131491  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
     ||| |||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||| ||  |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| || | | ||||     
T  22131490 attaggatgtataaaagttatttagtttttccactaggcagttggtttgtttgtt-gcataaaagtaacaacagaaaataaagattgattaagaaaatat 22131392  T
Q  679 g-agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || || |||||| |||||||||||||    
T  22131391 ggagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtatgaatgattctctagttctacgatagttaac 22131292  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 875  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||| | |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  22131291 aaaatattcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacaacacctaattccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgt 22131192  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccatt 908  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22131191 taacctaatatcactaataaacgattatccatt 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 645 - 989
Target Start/End: Original strand, 21332605 - 21332953
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt---aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332605 aataacagaaaataaagatagttttggaaaggaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 21332704  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  21332705 tcttatgaatgattctctagttccacgatagttaataaaatagtcctaatcaattcattgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattcctt 21332804  T
Q  842 ag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21332805 agatgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattca 21332904  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  21332905 attatgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcatttattctcactaa 21332953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 34831923 - 34831583
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  | |  ||||||  ||||||||||||||    
T  34831923 agagagatgagattaggtctttcgaatcttctgagttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 34831824  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34831823 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 34831724  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34831723 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 34831624  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  34831623 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggaaataaaa 34831583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Original strand, 41306487 - 41306830
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||    
T  41306487 aagagagagataagatcgggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaa 41306586  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41306587 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttttcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgt 41306686  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41306687 taacctaatatcactaacaaacgattatccatacctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtca 41306786  T
Q  976 ttcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||| | | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  41306787 ttcattcttattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 41306830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4099444 - 4099820
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4099444 aataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagaaagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 4099543  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||| ||||    
T  4099544 ttatgaatgattttctagttgcacgatagttagcaaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattctttag 4099643  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4099644 gtggtctaataatatttgaagatttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaat 4099743  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  4099744 tatgtataagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 4099820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7271175 - 7270835
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  | ||||||||||||    
T  7271175 agagaaatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaa 7271076  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  7271075 aatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggtttaaacacgttag 7270976  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7270975 cccaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccatgtttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 7270876  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  7270875 attctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaa 7270835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 33552280 - 33551940
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| ||  ||||||||||||||    
T  33552280 agagtgatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaa 33552181  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33552180 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaagtggtcta-taatctttgaaggtttaagcacattaa 33552082  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33552081 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactgaccatatttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 33551982  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata--ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  33551981 attatcactaaatcatgtttatattttgatcaggatataaaa 33551940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 21335623 - 21336001
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt---aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||   || ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21335623 aataacataaaataaagatagttttggaaaggaataagcgagagatgagaccaagtctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctat 21335722  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||     ||||||||||||||||||    
T  21335723 tcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccgtcttctcaaactacagcccctaattcctt 21335822  T
Q  842 ag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21335823 aggtgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatttatagactaaccctgtttattagaacaattca 21335922  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21335923 attatgtctaagtagaaagttatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 21336001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7625263 - 7624921
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  7625263 gagagagatgagatcaggtctttcaaatcatcgatgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 7625164  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||| |||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  7625163 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 7625064  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7625063 aacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 7624964  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  7624963 ttgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 7624921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 14016100 - 14016442
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||||||  ||| |||||||||    
T  14016100 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatagtgcacctattcgtattaatgattttctagttccacggtagttaaca 14016199  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||   | |||||||||| |||| ||    
T  14016200 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagcacttt 14016299  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14016300 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 14016399  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14016400 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 14016442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 681 - 989
Target Start/End: Original strand, 14375759 - 14376081
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  | |||||||||||||    
T  14375759 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaa 14375858  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggacc-------------ctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14375859 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccttgagttaggaccctctactcaaactacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtt 14375958  T
Q  867 taagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggt 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14375959 taagcacgttaacctaatatcactagcaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggt 14376058  T
Q  967 cagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14376059 cagtagtcattcgttctcactaa 14376081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 39192489 - 39192147
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcact--agttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||| || || ||  ||||  ||||||||||||    
T  39192489 agagagatgagatcagatctttcgaatcatcaatgttcccctaattgatataatgcacgtattcttatgaatgattctctctagttgcacgatagttaac 39192390  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  39192389 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtataataatctttcaaggtttaagcacatt 39192290  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  39192289 aacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaggtcgaaagctatggtcaatagtcat 39192190  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39192189 ttgttctcattaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 39192147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31863884 - 31863519
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  31863884 aaagaataagagagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 31863785  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  31863784 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 31863685  T
Q  868 aagcacgttaacctaat--------------atcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 953  Q
    ||| |||||||||||||              |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  31863684 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattctgtctaagt 31863585  T
Q  954 cgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  31863584 agaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 31863519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 21915285 - 21914940
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||    || ||| ||| ||||| |||||    
T  21915285 agagagagatgtgactaggtctttcgaatcctttgagttcccctaattggtacactacacctatttcttatgaatatttctctaatttcacgatggttaa 21915186  T
Q  777 c-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcac 873  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  21915185 ctaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaac 21915086  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21915085 gttaacctaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagt 21914986  T
Q  974 cattcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| |||||||  |||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  21914985 cattcattctcacgaaatcatgtttatatttgatcaggctataaaa 21914940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 849 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 32838007 - 32837837
Alignment:
Q  849 taataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 947  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32838007 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 32837908  T
Q  948 ctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32837907 ctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcacaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 32837837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 483 - 669
Target Start/End: Original strand, 26907181 - 26907371
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26907181 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 26907280  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgatt-gatttgtttgcat--aagcaataacagaaaataaagattggttt 669  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  26907281 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggttttgtttgcataaaagtaatgatagaaattaaagattggttt 26907371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 786 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2837357 - 2837122
Alignment:
Q  786 cctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaa 883  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  2837357 cctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacctat 2837258  T
Q  884 tatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttct 983  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2837257 tatcactaataaacgattatccattcataaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattct 2837158  T
Q  984 cact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     ||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  2837157 gactaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaa 2837122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 694 - 986
Target Start/End: Original strand, 18239472 - 18239767
Alignment:
Q  694 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgt-gaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatc 792  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||| || || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  18239472 aggtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtgtactgcacctatttctttcgaatgattctctagtttcacgataattaacaaaatagccctaatc 18239571  T
Q  793 aatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcact 890  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |  |  || | ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||     
T  18239572 aatcccttgacttaggacccccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaatattaca 18239671  T
Q  891 aataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18239672 tataaacgattatccattcctagactagccttgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttcaaagctatggtcagtagtcattcattctcac 18239767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 833 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 30066348 - 30066161
Alignment:
Q  833 taattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattag 931  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30066348 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctaatatctctaacaaacgattatccactcctagactaaccatgtttgttag 30066249  T
Q  932 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  30066248 aacaattcatttaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 30066161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 670 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 37215213 - 37215019
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  37215213 aaagaataagagagagatgaaattaggtctttcgaatcatctaagttccc-taattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 37215115  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg 864  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37215114 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 718 - 989
Target Start/End: Original strand, 28787330 - 28787595
Alignment:
Q  718 ccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaat--caatcccttgagttaggaccctct 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |  ||| ||  || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  28787330 ccctaattggtatactgcacctattctgatgaatgattttctaattccacaatagttaacaaaatagtcttaatttcaatcccttgacttag-accctct 28787428  T
Q  816 tctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctaga 914  Q
    |||     |||| ||| ||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28787429 tctcaaactacaacccataattccttagctggtctaataa--------ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctaga 28787520  T
Q  915 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28787521 ctaaccttgtttattagaacaattcaattatgtccaagtagaaaactatggtcagtagtcattcattctcactaa 28787595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 879 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 23044123 - 23043983
Alignment:
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  23044123 cctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggccagtagtcattc 23044024  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  23044023 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 23043983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 11221473 - 11221599
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11221473 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaagactaagttttatgaatagtgatctactgatggttgcactt 11221572  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||    
T  11221573 aagtgttttcacagaagtagacaagaa 11221599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 482
Target Start/End: Original strand, 14914845 - 14914994
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  14914845 tgttgaaacaaaaatctttttgatagatattttaatgataacaaaccttatggaataaacactaacttt-acgaattgtgatctactgacgtttgcactt 14914943  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatcac 482  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14914944 gagtcttttcacagaagtaaacaagaagtaataccaaaccaatagcatcac 14914994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 42734592 - 42734468
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42734592 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgtttt---gataacaaaccttatggaataaagactaagttttatgaatggtgatctactgatggttgcact 42734496  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  42734495 taagtgttttcacagaagtagacaagaa 42734468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 758 - 978
Target Start/End: Original strand, 18765682 - 18765905
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataac 855  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||| | |||||||||||| ||||||||| |      
T  18765682 ctagttttacgatggttaactaaaatagttataatcaatcccttgagttagatccctcttgttagcttacaactcctaattccttaagtggtctaacatt 18765781  T
Q  856 ctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18765782 cttcgaaggttttaagagcgttaacctaatatcacaaataaatgattatttattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaaataggtctaagtc 18765881  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    | |||||  | | |||||||||||    
T  18765882 gtaagctaggattagtagtcattc 18765905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 483 - 604
Target Start/End: Original strand, 35049749 - 35049871
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  35049749 tgatagatgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccataaggactgattttaatctcagtaattcaattacgttgtaag 35049848  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttctttt 604  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  35049849 ttaggatgtataaaagttatttt 35049871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 455
Target Start/End: Original strand, 26648708 - 26648832
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  26648708 ttgttaaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataataaactttatggaataaacactaagttttctgaatggtgatctactaatgttttcact 26648807  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaa 455  Q
    | |||||||||| | | ||||||||    
T  26648808 taagtcttttcagaaaagtagacaa 26648832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 455
Target Start/End: Original strand, 26920293 - 26920417
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  26920293 ttgttaaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataataaactttatggaataaacactaagttttctgaatggtgatctactaatgttttcact 26920392  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaa 455  Q
    | |||||||||| | | ||||||||    
T  26920393 taagtcttttcagaaaagtagacaa 26920417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 682 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30066466 - 30066348
Alignment:
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||   |||||||||||||||    
T  30066466 agagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccgcgatagttaacaaaa 30066367  T
Q  782 tagtcctaatcaatccctt 800  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  30066366 tagtgctaatcaatccctt 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Original strand, 36312609 - 36312712
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  36312609 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacctcgtgaaataaataataagttttatgaatggtaatctactgatggttgcactt 36312708  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  36312709 gagt 36312712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 904 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22130198 - 22130083
Alignment:
Q  904 ccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata-t 1001  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  ||||||  |||||| || ||| |    
T  22130198 ccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctagggtccgtagtcattcaatctcacaaaatcatgtttatatt 22130099  T
Q  1002 tgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||    
T  22130098 tgatcaggatataaaa 22130083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Original strand, 31103824 - 31103918
Alignment:
Q  341 aaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31103824 aaaactctttttgatgaatgttttaatgataacaaattttgtagaataaatgataagttttatgaatgttgatttactgatgtttgcacttgagt 31103918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 798 - 953
Target Start/End: Original strand, 563340 - 563497
Alignment:
Q  798 cttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt---aagcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||| |||| || |||||||  |||  |||||||   |||||  ||||| ||||||||| | |    
T  563340 cttgagttagaaccctcttgtcggattacaacccctaattctttaggtgatctaatattcttcaaaggttttcaaagca--ttaacataatatcacaatt 563437  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 953  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  563438 aaacgattattcattcctagactaaccttgtttagttgaacaattcaattaggtctaagt 563497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 14015915 - 14015986
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg-ttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  14015915 ttttggcaagtgtaccaaatcctatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacgaggact-gtgttaatctcaat 14015986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 874 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 31575379 - 31575290
Alignment:
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattag--gtctaagtcgaaagct 961  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  31575379 gttaacctaatatcacaaataaacgaatatccattctcagaataaccctgtttatttgaacaattcaattaggtgtctaagttgaaagct 31575290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 22936715 - 22936787
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  22936715 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 22936787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20056193 - 20056040
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaa--aatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatg 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||   |||| | | ||| ||||    
T  20056193 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaaaataatattgttcccacaagaact-gttttaatctcaaaaatgcaaaagcgttattatttaggatg 20056095  T
Q  590 tataaaagttcttttaat--ttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa 642  Q
    | |||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20056094 tgtaaaagttgttttttttcttgccactaggcagttgattggtttgattgcataa 20056040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 41876530 - 41876601
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  41876530 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 41876601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 26727300 - 26727233
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26727300 ctgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaagactg 26727233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 37215387 - 37215313
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataat 565  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  37215387 ttttagcaagtgtactaaatactgtcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaataat 37215313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 43492114 - 43492047
Alignment:
Q  481 actgatagaattttg-gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggac 546  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43492114 actgatagaatttttagcaaatgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggac 43492047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 535
Target Start/End: Original strand, 26752477 - 26752521
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgt 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752477 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgt 26752521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Original strand, 40915932 - 40915980
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40915932 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcattcc 40915980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 41306302 - 41306373
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  41306302 ttttagcaagtgcactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 41306373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 31864062 - 31864015
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31864062 ttttagcaagtgtactaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcc 31864015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25185741 - 25185676
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25185741 tgatagatatttgacaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaataaatatcgttccaaaaggactg 25185676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21680724 - 21680679
Alignment:
Q  480 cactgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680724 cactgatagatatttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaa 21680679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 85)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 16790524 - 16791063
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16790524 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgctccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 16790623  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16790624 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 16790723  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16790724 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaagagtcactagtcttacgatagttaacaaaat 16790823  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcac--gttaac 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16790824 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggctacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtgttaac 16790923  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16790924 ctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagccgaaagctatggtcagtagtcattcg 16791023  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16791024 ttctcattaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 16791063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1386191 - 1386726
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1386191 tgataaaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa-tatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 1386289  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1386290 ttaagatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtt-gcataagcaataacagaaaataa-gattggtttaaagaataagag 1386387  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1386388 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaa 1386487  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1386488 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 1386587  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1386588 taatatcactaataaaggattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgt 1386687  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  1386688 tctcactaaatcatatttatatttgatcatgatataaaa 1386726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 40258905 - 40259443
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40258905 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctctataattcaattacgttgtaaa 40259004  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40259005 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccactaggcaattgattggtttgtttgcataagcaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagag 40259104  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40259105 agagatgagtttaggtcgttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaa 40259204  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40259205 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttatagggttacagcgcctaattccttaggtggtataataatcgttgaaggtttaagcacgttaacc 40259304  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40259305 taatatcactaataaatgattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcattcgt 40259404  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  40259405 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 40259443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37936986 - 37937523
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  37936986 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcattcccacaagaactggttttaatttcaataattcaactacgttgtaag 37937085  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37937086 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagtagattggtttgtttgcataaa-agtaacagaaaataaagattggttttaagaataagag 37937184  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37937185 agagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaa 37937284  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37937285 tagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccccaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcacgttaacc 37937384  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37937385 taatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaataattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgt 37937484  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  37937485 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 37937523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 3875628 - 3875087
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3875628 tgatagaagtttggcaagtgtatcaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggaccggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 3875529  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3875528 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactagtcagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggttttaagaataag 3875429  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattg-tgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||  | |||||||||  |||||||||||||    
T  3875428 agaaagatgagtttaggtctttcgaatcacctatgttcccctaattggtatactgcacatattctttattaataattcactagttccacgatagttaaca 3875329  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3875328 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattgaaggtttaatcacgtta 3875229  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||    
T  3875228 acctaatatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtaatt 3875129  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  3875128 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 3875087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 479 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 22631187 - 22630642
Alignment:
Q  479 tcactgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttg 577  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22631187 tcactgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggaccggttttaatctcaataatttaattatgttg 22631088  T
Q  578 taacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagc---aataacagaaaataaagattggtttaaaga 674  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     ||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  22631087 taagttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaaatgatagaaaataaagattgtttttaaga 22630988  T
Q  675 ataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtt 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||    
T  22630987 ataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccttaattggtatactgcacctattcttatgaatgattccctagttccacgatagtt 22630888  T
Q  775 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcac 873  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22630887 aacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccattttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcat 22630788  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  22630787 gttaacctaatatcaataataaaatattatccattcttagactaacaatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggttagtagt 22630688  T
Q  974 cattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22630687 cattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 22630642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 12220138 - 12219596
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12220138 ctgatagaagtttgacaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatttcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaa 12220039  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagc--aataacagaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    ||  ||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||    
T  12220038 gttaggatgtataaaagtttttttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaattaacgacaaaaagtaaaggttgattttaagaataa 12219939  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  ||||||  |||||||||| ||    
T  12219938 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgtttttctagttccacgatagttagca 12219839  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12219838 aaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttatatctcttaattccttatgtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 12219739  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtag-tcat 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12219738 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctagggtcagtagttcat 12219639  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12219638 tcgttctcactaaatgatatttatatttgatcaggatataaaa 12219596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 16179484 - 16178928
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgt----tg 577  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  16179484 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgtacattg 16179385  T
Q  578 taacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaa 675  Q
    |||  || |||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||  ||| |||||||||| |||||| || ||    
T  16179384 taaaataggatgtataaaagttattttgttttgccactaggaagttgattggtctgtttgcataaaagtaaagacaaaaaataaagactggttttaataa 16179285  T
Q  676 taagagagaga------------tgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagtt 763  Q
     ||||||||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| || || ||||||    
T  16179284 caagagagagagagagggggggatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcatatattcttatgaatgattctctagtt 16179185  T
Q  764 ttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaa 862  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16179184 ccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa 16179085  T
Q  863 ggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctg 962  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16179084 ggtttaagcacgttaacctaatatcactaataatggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagtta 16178985  T
Q  963 tggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16178984 gggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 16178928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17877449 - 17876907
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17877449 ctgatagacgtttggcaagtgtatcaaatactaccgaagtagtaaaaatatcggtcccaccagggttggttttaatttcaataattcaattacgttgtaa 17877350  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaata 677  Q
      || |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||    ||| ||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  17877349 aatatgatgtataaaagttcttttgttttgccactagacagttgattggtttgtttgcaataaaagtaacgacagaaagtaaaagttggttttaagaata 17877250  T
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| || | || || || ||||||  | ||||||||||    
T  17877249 agagggagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgctcccctaattgatatattgcacctattcttattaatgattctctagttccatgatagttaac 17877150  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttagtgg-tctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  17877149 aaaatagccaaaatcaatcccttgagttaggactttcttcgaggattacaacccttaattacttaggggctctaacaatctttgaacgtataagcacgtt 17877050  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  17877049 atcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtaat 17876950  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  17876949 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaa 17876907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5666658 - 5666319
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  | ||||||||||||    
T  5666658 agagagatgagatcaggtctttcgaat-atctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaa 5666560  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5666559 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 5666460  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5666459 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaactattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttc 5666360  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5666359 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 5666319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 481 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 27267137 - 27266589
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaa-aatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgt 578  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  27267137 actgatagaagtttggaaagtgtacaaaaaactatcgaagtggtaaataatatcgttcccacaaggactatttttaatctcaataattcaaagacgttat 27267038  T
Q  579 aacttaagatgtataaaagttcttttaattt--gccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaa-taaagattggtttaaa- 672  Q
       | | ||||||||||  || ||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||| |  | ||| ||||||||||||||||     
T  27267037 cgttcaggatgtataaagattttttttttttttgccactaggcagttgattggtttaattgcataaaagtaattagtggaaagtaaagattggtttaaaa 27266938  T
Q  673 gaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatag 772  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |  ||||||  |||||||    
T  27266937 gaataagagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtataatgcagctattcttatgaatgactttctagttccacgatag 27266838  T
Q  773 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aag 870  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  27266837 ttaacaaaatagtcctaataaattccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaag 27266738  T
Q  871 cacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagt 970  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  27266737 tacgttaacctattatcactaataaacgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctatggtcggt 27266638  T
Q  971 agtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  27266637 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 27266589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 45493118 - 45493460
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||||| |||||||||||||    
T  45493118 agagagagatgagatcaggtttttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaac 45493217  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45493218 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgtt 45493317  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45493318 aacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcat 45493417  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45493418 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45493460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 45500860 - 45501202
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||||| |||||||||||||    
T  45500860 agagagagatgagatcaggtttttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttctacgatagttaac 45500959  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45500960 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgtt 45501059  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45501060 aacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtcat 45501159  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45501160 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 8888787 - 8888437
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  8888787 aaagaataagagagagatgagattaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 8888688  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8888687 tagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta 8888588  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  8888587 agcatgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 8888488  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8888487 gtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 8888437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 489 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9966137 - 9966674
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaa 585  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||||   ||| | | |||     
T  9966137 aatttaggcaagtgcaccaattactatcgaagtaataaaataagatcgttcccacaaggacta-tgttaacttcaataattcaatagtgttattatttag 9966235  T
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaa-taacagaaaataaagattggttt-aaagaataagag 681  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| |||| || |||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9966236 gatgtataaaagttattttgttttgct-ctaggcagttgattggtttgattacataaaagtaactaacataaaataaagattggttttaaagaataagag 9966334  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  | |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  9966335 agagatgagatcaagtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaattattttctagtttcacgatagttaacaaaa 9966434  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaac 879  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  9966435 tagtcataatcaaacccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaac 9966534  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
     ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||     
T  9966535 ttaacatcacaaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtaggaagctatggtcagtagtcattca 9966634  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  9966635 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 9966674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9185354 - 9185729
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  9185354 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattctt 9185453  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| | ||||||||||| ||    
T  9185454 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtctctaattccttaggt 9185553  T
Q  845 ggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9185554 ggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgattattagaacaattcaatt 9185653  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  9185654 ctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 9185729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25820774 - 25821150
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata-agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  | |||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  25820774 aataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgcacctattc 25820873  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||    
T  25820874 ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttag 25820973  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25820974 gtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 25821073  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  25821074 taggtataagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 25821150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37279606 - 37279981
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37279606 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 37279705  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  37279706 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattccttacgt 37279805  T
Q  845 ggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37279806 ggtctaataatctttgaaggttttaagaatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatt 37279905  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37279906 ctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 37279981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 40781613 - 40781273
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  40781613 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 40781514  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40781513 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttga 40781414  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40781413 cctaatattactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctgtggtcagtagtcattc 40781314  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  40781313 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 40781273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9188606 - 9188957
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  9188606 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 9188705  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  9188706 tagtcaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattacttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 9188805  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||| || |||||    
T  9188806 aagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaatctatggtc 9188905  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  9188906 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 9188957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24235274 - 24234896
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24235274 aataacagaaaataaagatcgaattgaaaagaataagagaaagatgagatcaggtctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 24235175  T
Q  743 attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
     || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  24235174 cttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattcctta 24235075  T
Q  843 -gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24235074 ggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattca 24234975  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24234974 attctgtctaagtagaaagatatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24234896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 678 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 22021211 - 22020901
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  22021211 agagagagatgagataaggtctttcgaatcatctatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 22021112  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  22021111 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgt 22021012  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22021011 taacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtca 22020912  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  22020911 ttcattctcac 22020901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 31427504 - 31427846
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| ||  |||||||||||||    
T  31427504 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaaca 31427603  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  31427604 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtt 31427703  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31427704 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 31427803  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  31427804 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 31427846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25959652 - 25959993
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  25959652 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 25959751  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  25959752 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgtta 25959851  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25959852 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 25959951  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  25959952 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 25959993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 31585904 - 31586245
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  31585904 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 31586003  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  31586004 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 31586103  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31586104 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcatt 31586203  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  31586204 cattctcactaaatcatgattatatttgatcaggatataaaa 31586245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 42368675 - 42369015
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  42368675 agagagataagatcaggtctttcaaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 42368774  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42368775 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 42368874  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42368875 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 42368974  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  42368975 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 42369015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5105904 - 5105527
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5105904 aataacataaaataaagatttggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcaaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 5105805  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
     | |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5105804 atatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 5105705  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5105704 gtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgattattagaacaattcaa 5105605  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  5105604 ttctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaattatgtttatatttgatcaggatataaaa 5105527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11347849 - 11348200
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  11347849 aaagaatgagagatagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacga 11347948  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  11347949 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 11348048  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  11348049 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 11348148  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  11348149 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 11348200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25138858 - 25139236
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  25138858 aataacataaaataaagatttgtttggaaaatataagagagagatgagatcaggtctttcgaattatcgatatttccctaattggtatactgcacctatt 25138957  T
Q  743 attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
     || |||| || |  | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||    
T  25138958 cttatgaacgattttcaagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattcctta 25139057  T
Q  843 g-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25139058 ggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattatgagaacaattca 25139157  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||    
T  25139158 attaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttacatttgatcaggatataaaa 25139236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24238546 - 24238168
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238546 aataacagaaaataaagatcgaattggaaagaataagagaaagatgagatcaggtctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 24238447  T
Q  743 attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
     || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  24238446 cttatgaatgatttcctagttccacgatagttaacaaaatatacctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattcctta 24238347  T
Q  843 -gtggtctaataacctttgaag-gtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
     |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24238346 ggtggtctaataatctttgaagattttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattca 24238247  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||  |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24238246 attctgtctaagtagaaagatatggtcagtagccattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24238168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 696 - 1017
Target Start/End: Original strand, 30274748 - 30275073
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30274748 gtctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 30274847  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    ||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30274848 cccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactgat 30274947  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatca 992  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30274948 aaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 30275047  T
Q  993 tattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | || ||| |||||||| ||||||||    
T  30275048 tgtttatatttgatcagaatataaaa 30275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 43207854 - 43208194
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  43207854 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 43207953  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtt-taagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  43207954 aatagtcctaatcaatcccttgagt-aggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgtta 43208052  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43208053 acctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 43208152  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  43208153 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 43208194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 13971858 - 13972198
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  13971858 agagagatgatatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 13971957  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||     || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13971958 aatagtcataatcaatcccttaacttaggacactcttctcaaaataaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 13972057  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13972058 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgttttttagaaaaatccaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 13972157  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  13972158 attctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaa 13972198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 714 - 989
Target Start/End: Original strand, 17874585 - 17874856
Alignment:
Q  714 gttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 813  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  17874585 gttcccctaattggtacactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatgattaacaaaatagtcttagtcaatcccttaagttaggaccct 17874684  T
Q  814 cttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccta 912  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17874685 cttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaatatctgttgaaggtt-----acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccta 17874779  T
Q  913 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17874780 gactaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaa 17874856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 26366074 - 26365734
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||||    
T  26366074 gagagatgagactaggtcttttgaattatctatgttcccctaattggtatagtgtacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaa 26365975  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  26365974 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaa 26365875  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  26365874 cctaatatcactaacaaacgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtaattc 26365775  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26365774 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 26365734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 25870928 - 25870585
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| || || ||||||  |||||||||||    
T  25870928 aagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatgctacacctattcttgtgaatgattctctagttccacgatagttaa 25870829  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25870828 caaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgt 25870729  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25870728 taacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtca 25870629  T
Q  976 ttcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  25870628 ttcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 25870585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 38015661 - 38015319
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  38015661 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgaacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 38015562  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||| ||    
T  38015561 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacctt 38015462  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38015461 aacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcaaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 38015362  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  38015361 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaa 38015319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 648 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 29440670 - 29440375
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29440670 aacagaatataaagatagttttggaaagaaaaagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattctt 29440571  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  29440570 atgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 29440471  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29440470 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 33310809 - 33310467
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||  | |  ||||||  ||| |||||||||    
T  33310809 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcaactattcatattaataattttctagttccacggtagttaaca 33310710  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| ||| |||    
T  33310709 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaagtt 33310610  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  33310609 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtccaaagctagggtcagtagtcat 33310510  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  33310509 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 33310467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 36808405 - 36808746
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |  ||||||  || ||||||||||    
T  36808405 gagagagatgagatcaggtctttcaaatcctttaagttcccctaattggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaaca 36808504  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36808505 aaatagttctaatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacagaccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaagtttaagcacgtta 36808604  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36808605 acctaatattactaataaacgattatacattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 36808704  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||| ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  36808705 cattcttactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 36808746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 684 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 6826908 - 6826573
Alignment:
Q  684 agatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaata 783  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6826908 agatgagatcaggtctttcgaatcatctatgctcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgat-gttaacaaaata 6826810  T
Q  784 gtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaaccta 882  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6826809 gtcctaatcaaacccttgacttaggattctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatttttgaaggtttaagcacgttaaccta 6826710  T
Q  883 atatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttc 982  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||     
T  6826709 atatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctttctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattt 6826610  T
Q  983 tcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  6826609 tcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 6826573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 680 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 43723841 - 43723531
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  43723841 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 43723742  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| |||     || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43723741 aatagtcataatcaatcctttaacttaggaccctcgtctcaaactatagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgctaa 43723642  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43723641 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 43723542  T
Q  979 gttctcactaa 989  Q
     ||||||||||    
T  43723541 attctcactaa 43723531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45457304 - 45456962
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  45457304 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattgttatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 45457205  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| | |||||    
T  45457204 aaatagccctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaagaacgtt 45457105  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  45457104 aacctaatatcactaaaaaaagattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactagggtcagtagtcat 45457005  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||| || ||||||||||||||    
T  45457004 tcgttctaactaaatcatgtttatatttaatcaggatataaaa 45456962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 25874325 - 25873976
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||    
T  25874325 aagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 25874226  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaa------ttccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa 869  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||| |||||||      |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25874225 caaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaa 25874126  T
Q  870 gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcag 969  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| | |||||||    
T  25874125 gcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagttatggtcag 25874026  T
Q  970 tagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25874025 tagtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcagaatataaaa 25873976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45454016 - 45453675
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||||||  | |||||||||||    
T  45454016 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatataagtttctctaattggtataatgcacctattcgtattaatgattttctagttccatgatagttaaca 45453917  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  45453916 aaatagcactaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 45453817  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45453816 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 45453717  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45453716 tcgttctcactaaatcatgtt-atatttgatcaggatataaaa 45453675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5284263 - 5284090
Alignment:
Q  10 aggtgatcttcgccgccgcagcgataagaaaattgcccctgaagccatttcaatcacaaaatgacaattctagggtttctgaaaccccttttaaaattcc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5284263 aggtgatcttcgccgccgcagcgatgagaaaattgcccctgaagccatttcaatcacaaaatgaaaattctagggtttctgaaaccccttttgaaattcc 5284164  T
Q  110 actct--aaggaaaaacaatcctgaaaatccagatgataattttgaaaactaaacacttttatggtaaagagga 181  Q
    |||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5284163 actcttaaaagaaaaaaaatcttgaaaacccagatgataattatggaaactaaacacttttatggtaaaaagga 5284090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 492 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23205502 - 23205350
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23205502 tttgacaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaagttaggatgt 23205403  T
Q  591 ataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataag 643  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23205402 ataaaagttattttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataag 23205350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 492 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23677106 - 23676954
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgt 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23677106 tttgacaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaagttaggatgt 23677007  T
Q  591 ataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataag 643  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23677006 ataaaagttattttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataag 23676954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 442
Target Start/End: Original strand, 33402424 - 33402534
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33402424 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 33402523  T
Q  432 gagtcttttca 442  Q
     ||||||||||    
T  33402524 aagtcttttca 33402534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 458
Target Start/End: Original strand, 36722591 - 36722719
Alignment:
Q  330 tttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36722591 tttgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacattatggaataaacgctaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcac 36722690  T
Q  430 ttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||    
T  36722691 ttaagtcttttcagagaagtagacaagaa 36722719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 35882879 - 35883006
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35882879 ttgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacattatggaataaacgctaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcact 35882978  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  35882979 taagtcttttcagagaagtagacaagaa 35883006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 35875391 - 35875517
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35875391 tgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacattatggaataaacgctaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 35875490  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||    
T  35875491 aagtcttttcagagaagtagacaagaa 35875517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 30926718 - 30926348
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata-agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  30926718 aataatagaaagtaaagatttgattagaaaatatagagagagatgaaatcaggtctttcgaatcctctg-gtttccctaattgatatactgcacctattt 30926620  T
Q  744 t-tgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
    | |  ||| || |  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  30926619 tctacgaatgattttctagtttcacgatggttagcaaaatagtcctaatcaatccattgacttaggaccctcttctcagatgacaacccctaattcctta 30926520  T
Q  843 -----gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaa 936  Q
         |||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||           ||||||||||||| ||||||    
T  30926519 attaggtggtctaatactctttgaaggttttatgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatcc-----------aaccatgtttatttgaacaa 30926431  T
Q  937 ttcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  30926430 ttcaattaggtctaagttgaaagctatggttagcagtcattcattctcacaaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 30926348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 446
Target Start/End: Original strand, 14271269 - 14271382
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14271269 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaattataacaaactttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 14271368  T
Q  432 gagtcttttcacaga 446  Q
     ||| ||||||||||    
T  14271369 aagt-ttttcacaga 14271382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 700 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 10601036 - 10600876
Alignment:
Q  700 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 799  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10601036 ttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatccct 10600937  T
Q  800 tgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataaccttt 859  Q
    |||||||| ||||||||||     |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  10600936 tgagttagaaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctagtaatcttt 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 758 - 986
Target Start/End: Original strand, 35521402 - 35521637
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac 855  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||| || |||||||      
T  35521402 ctagtttttcgatggttaactaaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcagattacaatccctaatttcttaggtgatctaatatt 35521501  T
Q  856 ctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccat----tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcta 950  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35521502 ctttgaaggttttaagagcgctaaccttatatcacaaataaacaattatccatatattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtcta 35521601  T
Q  951 agtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||  | ||||||||| ||| |||||||    
T  35521602 agttgaaagctaggatcagtagtctttcattctcac 35521637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 915 - 1017
Target Start/End: Original strand, 17876211 - 17876315
Alignment:
Q  915 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggata 1012  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  17876211 ctaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggata 17876310  T
Q  1013 taaaa 1017  Q
    |||||    
T  17876311 taaaa 17876315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 73377 - 73284
Alignment:
Q  342 aaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  73377 aaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacctcgtggaataaataataagttttatgaatggtgatctactgatggttgcacttgagt 73284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 912 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10600854 - 10600747
Alignment:
Q  912 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcagg 1009  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||     
T  10600854 agactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaga 10600755  T
Q  1010 atataaaa 1017  Q
    ||||||||    
T  10600754 atataaaa 10600747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 680 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 13137082 - 13137020
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13137082 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctatt 13137020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 33310995 - 33310923
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  33310995 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 33310923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Original strand, 9188429 - 9188476
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188429 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 9188476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 490 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 10601182 - 10601135
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10601182 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 10601135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 680 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15470599 - 15470546
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 733  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470599 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 15470546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 9185201 - 9185272
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9185201 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 9185272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 758 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 34682763 - 34682624
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataac 855  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||| | ||| |||||||      
T  34682763 ctagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcagattacagtccctaattcctaaggtgatctaatatt 34682664  T
Q  856 ctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaa 896  Q
    |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  34682663 ctttg-ggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaa 34682624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Original strand, 37279445 - 37279524
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  37279445 tgatagatttttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 37279524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 398
Target Start/End: Original strand, 18577198 - 18577265
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  18577198 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaacggtaacaatccttatggaatagacaataagt 18577265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8888974 - 8888893
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  8888974 ctgatagatattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 8888893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 900 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 11188005 - 11187927
Alignment:
Q  900 ttatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||||||    
T  11188005 ttatccattcctagactaaccatgtttaattaaacaattcaattaggtataagttgaaagttaatgtcagtagtcattc 11187927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 489 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 38015848 - 38015775
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  38015848 aattttggaaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 38015775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 18939237 - 18939181
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18939237 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 18939181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24238700 - 24238629
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  24238700 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 24238629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Original strand, 25959465 - 25959513
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25959465 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 25959513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Original strand, 30274544 - 30274592
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30274544 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 30274592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 45499135 - 45499206
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  45499135 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 45499206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25871107 - 25871041
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  25871107 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcctacgaggact-gtgttaatctcaat 25871041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 29440818 - 29440752
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg-ttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  29440818 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacgaggact-gtgttaatctcaat 29440752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22592866 - 22592800
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22592866 tgatagatatttggtaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 22592800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 11347670 - 11347742
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  11347670 attttagcaagtgtactaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 11347742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Original strand, 40677538 - 40677583
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40677538 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 40677583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25874504 - 25874438
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  25874504 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 25874438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Original strand, 42368476 - 42368523
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42368476 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcc 42368523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 507 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24235412 - 24235357
Alignment:
Q  507 aaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  24235412 aaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 24235357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 966 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 29440377 - 29440324
Alignment:
Q  966 tcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  29440377 tcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 29440324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31451 - 30913
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31451 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaact 31352  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31351 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctagacagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagata 31252  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtt-cccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31251 gagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttacccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaa 31152  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31151 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 31052  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31051 taatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgt 30952  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30951 tctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 30913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 32366883 - 32367419
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366883 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 32366982  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366983 taagaagtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 32367082  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||    
T  32367083 gagatgagtttaagtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcatctattattgtgaaagaatcacta-tcttacgatagttaacaaaat 32367181  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32367182 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 32367281  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32367282 aatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgtt 32367381  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  32367382 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatacaaaa 32367419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22416589 - 22417124
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416589 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaa--tatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 22416686  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22416687 taagatgtataaaagttcttttaaattgccgctaggcggttgattgttttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttttaagaataagaga 22416786  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22416787 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaaagagtcactcgttttacgatagttaacaaaat 22416886  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416887 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 22416986  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22416987 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgtt 22417086  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  22417087 ctcactaaattatgtttatatttgatcaggatataaaa 22417124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 12560978 - 12561524
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12560978 tgatagaattttggcaagtgtaccacatactgtcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaactacgttataact 12561077  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaat-aacagaaaataa--------agattggtttaaag 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||        ||||||||||||||    
T  12561078 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaattaacataaaataaagatataaagattggtttaaag 12561177  T
Q  674 aataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12561178 aataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagt 12561277  T
Q  774 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagca 872  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561278 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagca 12561377  T
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtag 972  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12561378 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtag 12561477  T
Q  973 tcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12561478 tcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 12561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25442611 - 25443150
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25442611 actgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggattgattttaatctcaataattcaattacgttgtaa 25442710  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga 680  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25442711 attaggatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttt-aagaataaga 25442809  T
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25442810 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaa 25442909  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtct-aataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  25442910 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgtttaagcacgttaa 25443009  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25443010 gctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattc 25443109  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  25443110 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 25443150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 48063791 - 48064325
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48063791 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 48063890  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48063891 ttaggatgtataaaggttcttttaattttccactaggcagatgattg----gtttgcataagcaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagag 48063986  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48063987 agagatgagtttgggtcgttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaa 48064086  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48064087 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacc 48064186  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48064187 taatatcactaataaaggattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgt 48064286  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  48064287 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 48064325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Original strand, 17531408 - 17531910
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17531408 tgatagatctttggtaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttataaa 17531507  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17531508 ttaggatgtataaaggttcttttaatatgccactaggcagttgattggtttgtttgcataagcaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagag 17531607  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17531608 agagatgagtttaggtcgttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaa 17531707  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17531708 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaaacacgttaacc 17531807  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17531808 taatatcactaataaa-gattatccattcctagactaaccatgtttatt-----aattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgt 17531901  T
Q  981 tctcactaa 989  Q
    |||||||||    
T  17531902 tctcactaa 17531910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 54720416 - 54719875
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54720416 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcctacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaag 54720317  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||  | ||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  54720316 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactagacagttgattggtttgtttacataaaagtaatgacagaaattaaagattggtttga-gaataag 54720218  T
Q  680 a--gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  54720217 atagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttccataattggtatattgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaac 54720118  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54720117 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgtt 54720018  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  54720017 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 54719918  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  54719917 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 54719875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Original strand, 17528513 - 17529017
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  17528513 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataatacaattacgttataaa 17528612  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17528613 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataagcaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagag 17528712  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17528713 agagatgagattaggtcgttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacatattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaataaaa 17528812  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17528813 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccactaattccttaggtggtttaataaccgttgaaggtttaagcacattaacc 17528912  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  17528913 taatatcactaataaaggatt----attcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagagtcaatagtcattcgt 17529008  T
Q  981 tctcactaa 989  Q
    | |||||||    
T  17529009 tatcactaa 17529017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 544 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17141790 - 17141312
Alignment:
Q  544 gactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa- 642  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  17141790 gactggttttaatctcaataaatcaattacgttgtaaattaggatgtataaaagttcttttgatttgccattaaacagttgattggtttgtttgcacaaa 17141691  T
Q  643 -gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17141690 agtaatgacagaaaataaagattggttttaagaataagagagagatgagcttaggtcttttgaattatctatgttcccctaattggtatattgcacctat 17141591  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  17141590 tcttatgaatgattcgctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccaaatttctt 17141491  T
Q  842 a-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141490 aggtggtctaataaccgttaaaggtttaatcacgttaacctaatatcactaataaaggatcatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 17141391  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  17141390 attaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 17141312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11785217 - 11784669
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgt-aa 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11785217 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgctcccacaaggactggatttaatctcaataattcaattacgttgttaa 11785118  T
Q  581 cttaagatgta-taaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaataacagaaaataaagattggttt-----aa 671  Q
      || ||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    ||  ||||||  ||| || | |||| |||     ||    
T  11785117 aataggatataataaaggttcttttaattttccactaggcagtagattggtttgtttgcaataaaaataataactaaaagtaca-attgattttgaagaa 11785019  T
Q  672 agaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgata 771  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||  ||||||    
T  11785018 taaataagagagagatgaacttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgata 11784919  T
Q  772 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aa 869  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||    
T  11784918 gttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttatcggattacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaa 11784819  T
Q  870 gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcag 969  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11784818 gcacgttaatctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcag 11784719  T
Q  970 tagtcattcgttctcact-aatcatattcatat-tgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11784718 tagtcattcgttctcactaaatcatatttatatgtgatcaggatataaaa 11784669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 493 - 1016
Target Start/End: Original strand, 17039779 - 17040311
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatg 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||| | | | | ||||    
T  17039779 ttggcaagtgtaccaaaaactatcaaagtagtaaaataatatcgttcccacaaggactgttttcaatctcaataattcaaatgcgttattattcaggatg 17039878  T
Q  590 tataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagaga 686  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17039879 tataaaggttattttgatttgccactaggcagttgatttgtttggttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggttttaaagaataagagagaaa 17039978  T
Q  687 tgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtc 786  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||| || |||| || ||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  17039979 tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatacaacacttattcttatgaatgattctttagtttcatgatagttaacaaaatagtc 17040078  T
Q  787 ctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaata 885  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040079 ctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaata 17040178  T
Q  886 tcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctca 985  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17040179 tcactaacaaacaattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcgttctca 17040278  T
Q  986 ct-aatcatattcata-ttgatcaggatataaa 1016  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17040279 ctaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 17040311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 657 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 46885207 - 46884875
Alignment:
Q  657 taaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtc 756  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |     
T  46885207 taaagattgattttaagaataggagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgcttt 46885108  T
Q  757 actagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac 855  Q
     ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  46885107 tctagttc-acgatagttagcaaaatagtcctaatcaatcccttgagttgggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtgttctaataac 46885009  T
Q  856 ctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcg 955  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46885008 ctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccatttctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttg 46884909  T
Q  956 aaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46884908 aaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaa 46884875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 53816106 - 53815732
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    |||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53816106 aacagaaaataaagatagagttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 53816007  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| |    
T  53816006 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 53815907  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 944  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53815906 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 53815807  T
Q  945 ggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  53815806 ggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 53815732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 34983801 - 34984143
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  34983801 agagagagatgagtttaggtctttcgaatgatctatgttcccctgattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaac 34983900  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34983901 aaaagagtcataatcaatcccttgagttaggaccatcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacttt 34984000  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||||||    
T  34984001 aacctaatatcactaataaatgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagttagagtcggtagtcat 34984100  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  34984101 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 34984143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 16184627 - 16184978
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  16184627 aaagaataggagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 16184726  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  16184727 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacctttttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 16184826  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16184827 aagaacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtc 16184926  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16184927 agtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 16184978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 6434718 - 6435068
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  6434718 aaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacga 6434817  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6434818 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta 6434917  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  6434918 agaacgttaacctagtatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtca 6435017  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  6435018 gtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 6435068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 483 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 52991142 - 52990813
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  52991142 tgatagagttttggcaattgtactaaatattaccgaagtagtaaaaatatcgtgcccataaggtctgattttaatcttaataattcaattacgttgtaaa 52991043  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52991042 ttaagatgtataaaggttattttgatttgccactaggcagttgattggtttatttgcataagcaataacaaaaaataaagattggttttaagaataagag 52990943  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  52990942 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgataattaacaaaa 52990843  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 811  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52990842 tagtcgtaatcaatccattgagttaggacc 52990813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24125753 - 24125403
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  24125753 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 24125654  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24125653 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta 24125554  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  24125553 agcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 24125454  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24125453 gtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24125403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24129030 - 24128680
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  24129030 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 24128931  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24128930 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta 24128831  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  24128830 agcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 24128731  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24128730 gtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24128680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 52200193 - 52199817
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata-agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52200193 aataacagaaaataaagatatgtttgaaaaatatatggagagatgagactaggtctttcgaatcattgatgttcccctaattggtatactgcacctattc 52200094  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  52200093 ttatgaatgattttctagttccacgataattaacaaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 52199994  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52199993 gtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 52199894  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  52199893 taggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 52199817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 54724020 - 54723645
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  54724020 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtcttccgaatcatctatgttcccataattggtatactgcacctattctt 54723921  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||| |    
T  54723920 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctatttccttaggt 54723821  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54723820 ggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 54723721  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  54723720 aggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 54723645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 7486825 - 7486474
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  7486825 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 7486726  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  7486725 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 7486626  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  7486625 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 7486526  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  7486525 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 7486474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 30691014 - 30690640
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30691014 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattctt 30690915  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||| |    
T  30690914 atgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaataattctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacaacccctaattccttaggt 30690815  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 944  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  30690814 ggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattcaattc 30690715  T
Q  945 ggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30690714 tgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 30690640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 43809862 - 43809483
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt---aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43809862 aataacataaaataaagatagttttggaaaagaataggagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctac 43809763  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||    
T  43809762 tcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaccccctaattcctt 43809663  T
Q  842 ag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattc 939  Q
    || ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43809662 aggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattc 43809563  T
Q  940 aattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  43809562 aattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttcacactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 43809483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 8461437 - 8461777
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||  | ||||||||||||    
T  8461437 agagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattctatagttccatgatagttaacaa 8461536  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8461537 aatagtcctaatcaatcccttgatttagtatcctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaaaacgttaa 8461636  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8461637 cctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 8461736  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8461737 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 8461777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 582 - 1021
Target Start/End: Complemental strand, 10885205 - 10884757
Alignment:
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaa-taacagaaaataaagattggttt--aaagaa 675  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    ||| || ||||||||||||||||| | |||  |||  |    
T  10885205 ttaagatgtataaaagttcttttgaattgccactaggtagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaata 10885106  T
Q  676 taagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtta 775  Q
    ||    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||    
T  10885105 tatataagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagtta 10885006  T
Q  776 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  10885005 acaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaaacacg 10884906  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10884905 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 10884806  T
Q  975 attcgttctcact-aatcatattcatat-tgatcaggatataaaagcat 1021  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  10884805 attcattctcactaaatcatgtttatatatgatcgggatataaaagcat 10884757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 35751869 - 35751402
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaa 595  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  35751869 caagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaagactgattttaatctcaataattcaattatgttgtaaaataggatgtataaa 35751771  T
Q  596 agttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagca--ataacagaaaataaagattggtttaaagaataag-agagagatgagtt 692  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |  | |||||||| ||| ||||| || | | |||| | ||||||||||| |    
T  35751770 agttattttgatttgccactaggcagttggtttgtttgtt-gcataaaaataacaacagaaattaa-gattgattaagaaaatatggagagagatgagat 35751673  T
Q  693 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatc 792  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  | | || || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35751672 caggtctttcgaatcatcgatgttcccctaatttgtatactgcaccttttcgtattaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatc 35751573  T
Q  793 aatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcact 890  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35751572 aatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgttaacctaatatcatt 35751473  T
Q  891 aataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct 961  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35751472 aacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagttgaaagct 35751402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2873810 - 2873468
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||| ||  ||||||||||||    
T  2873810 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaac 2873711  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2873710 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgtt 2873611  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2873610 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcttagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 2873511  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2873510 tcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2873468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 27092341 - 27091798
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  27092341 tgatagatgtttgacaattgtaccaaaaattatcgaagtagtaaaataatatgtttccacaagaattgtttttaatctcaataattcaagtacgttatta 27092242  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttctt-ttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaat 676  Q
      || ||||||||||||||  | || ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||  | ||  | ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  27092241 aataggatgtataaaagtttatattgatttgccactagacaattgattggtttgattgcataaaagtaacgatagaaagtaaagaatggttttaaagaat 27092142  T
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | || || |  ||||||  |||||||||||    
T  27092141 aatagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttattaatgattttctagttccacgatagttaa 27092042  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttagt-ggtctaataacctttgaaggttt-aagcacg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  27092041 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc-tcttctcaaactacatcccctaatttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 27091943  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27091942 ttaaccttttatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaagttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtt 27091843  T
Q  975 attcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  27091842 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 27091798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 626 - 1017
Target Start/End: Original strand, 28007964 - 28008360
Alignment:
Q  626 ttgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtt-taaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttccccta 722  Q
    |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28007964 ttgatttgattgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggttctaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttccccaa 28008063  T
Q  723 attggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggg 822  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        
T  28008064 atttgtatactgcacctattcttatgaattattctctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaa 28008163  T
Q  823 ttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtt-taagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacc 920  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28008164 ctacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt--atctattatcactaataaacgattatccattcctagactaacc 28008261  T
Q  921 atgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  28008262 atatttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggttagtagttatttgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 28008360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 43927079 - 43926739
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  | ||||||||||||    
T  43927079 agagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaa 43926980  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43926979 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 43926880  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43926879 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 43926780  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  43926779 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 43926739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2775726 - 2775385
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  2775726 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 2775627  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2775626 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 2775527  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2775526 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 2775427  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2775426 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2775385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11190805 - 11190430
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11190805 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattctt 11190706  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || |  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||||| |    
T  11190705 atgaatgattttcttgttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaacctacaacccctaattccttaggt 11190606  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11190605 ggtctaataattcttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaagtgattatccattcctcgactaaccatgtttattagaacaattcaatt 11190506  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  11190505 aggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 11190430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 714 - 1017
Target Start/End: Original strand, 15195286 - 15195592
Alignment:
Q  714 gttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 813  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | || || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15195286 gttcccctaattggtatactgcacatattcttataaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagataggaccct 15195385  T
Q  814 cttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccta 912  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15195386 cttctaggactacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattccta 15195485  T
Q  913 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcagga 1010  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  15195486 gactaaccatgtttattagcacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttaatcagga 15195585  T
Q  1011 tataaaa 1017  Q
    |||||||    
T  15195586 tataaaa 15195592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2778969 - 2778628
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  2778969 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 2778870  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2778869 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 2778770  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2778769 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 2778670  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2778669 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2778628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45896625 - 45896284
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  45896625 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 45896526  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  45896525 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 45896426  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45896425 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaactcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 45896326  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45896325 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45896284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23298555 - 23298906
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  23298555 aaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccttaattggtatgctgcacctattcttatgaatgactttctagttccacga 23298654  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| |||| |||    
T  23298655 tagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaagaatctttcaaggtttt 23298754  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  23298755 aagaacattaacctaatatcaccaacaaacgattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtc 23298854  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23298855 agtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 23298906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 29343824 - 29344165
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  29343824 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 29343923  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  29343924 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 29344023  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29344024 acctaatatcactaataaaagattattcattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 29344123  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||| ||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  29344124 cattctaactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 29344165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 678 - 986
Target Start/End: Original strand, 32287271 - 32287581
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  32287271 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 32287370  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     || |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  32287371 aaaatagtcataatcaatcccttgagttagggccctcttctcaaactataatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtatgt 32287470  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32287471 taacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggttagtagtca 32287570  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  32287571 ttcattctcac 32287581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 50461497 - 50461839
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  50461497 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 50461596  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||| ||    
T  50461597 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacatt 50461696  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50461697 aacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 50461796  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  50461797 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 50461839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 681 - 988
Target Start/End: Original strand, 18644719 - 18645028
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  18644719 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 18644818  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  18644819 atagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaa 18644918  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18644919 cctaatatcactaacaaacgattgtccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattc 18645018  T
Q  979 gttctcacta 988  Q
    ||||||||||    
T  18645019 gttctcacta 18645028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 680 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 16244117 - 16243807
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  16244117 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 16244018  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16244017 aatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggtttaagcatgttaa 16243918  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16243917 cctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 16243818  T
Q  979 gttctcactaa 989  Q
     ||||||||||    
T  16243817 attctcactaa 16243807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 49742869 - 49743210
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  49742869 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagttccacgatagttaacaa 49742968  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  49742969 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 49743068  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  49743069 acctaatatcactaacagacgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 49743168  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  49743169 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 49743210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 20728597 - 20728937
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  | |||| |||||||    
T  20728597 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttcgatgatatttaacaa 20728696  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20728697 aatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacattaa 20728796  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20728797 cctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 20728896  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  20728897 attctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaa 20728937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 10106551 - 10106889
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| |||||||||||||||    
T  10106551 gagagatgagactaggtcttttgaatcatctatgtttcc-taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaa 10106649  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  10106650 atagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatatttgaaggtgtaagcacgttaac 10106749  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  10106750 ctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattca 10106849  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  10106850 ttctcactaaatcatgcttatatttgatcaggatataaaa 10106889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 19301420 - 19301795
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattat 744  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| || ||| || |||||||||||| |    
T  19301420 aataacagaaaataaagatttgtttgaaaaatatatgagagatgagactaggtctttcgaatcctctgagttcccgtatttgctacactgcacctattct 19301519  T
Q  745 tgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag- 843  Q
    | |||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||     
T  19301520 tatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagttctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttagg 19301619  T
Q  844 tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19301620 tggtttaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 19301719  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  19301720 atgtctaagttgaaagctagggtctgtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatttaaaa 19301795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 694 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9392964 - 9392638
Alignment:
Q  694 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatca 793  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| || |  ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  9392964 aggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctatacttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcataatca 9392865  T
Q  794 atcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaa 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9392864 atcccttgagttaggaccctcttctcaaactctagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaaactaatatcactaa 9392765  T
Q  893 taaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatc 991  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9392764 caaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattagatctaagtcgaaagctaggatcagtagtcattcgttctcactaaatc 9392665  T
Q  992 atattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||    
T  9392664 atgtttatatttgatcagaatataaaa 9392638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 483 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 37409125 - 37408828
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc-cacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37409125 tgatagaagtttggcaagtgtatcaaatactatggatgtagtaaaaatattgttctcataatgattggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 37409026  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37409025 ctaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaaacagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattgattttaagaataag 37408926  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  37408925 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 37408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 684 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 3840757 - 3840420
Alignment:
Q  684 agatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaata 783  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || | || || |  ||||||  |||||||||||||||| |    
T  3840757 agatgagatcaggtctttcgaatcatccatgttcccctaattgatatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaaca 3840658  T
Q  784 gtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3840657 gtcctaatcaatcccttgagttagtaccctcttctcaaactacaacccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacct 3840558  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3840557 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatt 3840458  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  3840457 ctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 3840420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 680 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 25584921 - 25584628
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  25584921 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 25584822  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  25584821 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 25584722  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagta 971  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25584721 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 25584628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 539105 - 538730
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  539105 aacagaatataaagatagttttggaaagtataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatatatgtttccctaattggtatactacacctattctt 539006  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     | || || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |    
T  539005 ataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 538906  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  538905 ggtctaataatctttgaatgttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgaatatccattgctagactaaacctgtttatttaaacaattcaatt 538806  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  538805 atgtctaagtagaaagctatggtcagtagtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 538730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 696 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10881708 - 10881384
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10881708 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagttctaatcaat 10881609  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaata 894  Q
    || |||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10881608 cctttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaca 10881509  T
Q  895 aaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcat 993  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10881508 aacgattatccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtataaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcat 10881409  T
Q  994 attcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     || ||| |||||||||||||||||    
T  10881408 gtttatatttgatcaggatataaaa 10881384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 35412753 - 35412419
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  35412753 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 35412654  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  35412653 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaa 35412554  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35412553 cctaatatcactaacaaacgattatcc------agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 35412460  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  35412459 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 35412419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 47051741 - 47051399
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  47051741 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaactggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 47051642  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  47051641 aaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 47051542  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47051541 aacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 47051442  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  47051441 tcattctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaa 47051399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 681 - 989
Target Start/End: Original strand, 55034807 - 55035121
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta----ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     || |||| || || ||||||  |||||||||||    
T  55034807 gagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 55034906  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     |||| ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| | |||||    
T  55034907 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaatcctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacg 55035006  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55035007 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 55035106  T
Q  975 attcgttctcactaa 989  Q
    |||| ||||||||||    
T  55035107 attcattctcactaa 55035121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 806 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 52988523 - 52988309
Alignment:
Q  806 aggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatc 904  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988523 aggaccctcttctagggttacagttcctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaagtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatc 52988424  T
Q  905 cattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-tt 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||    
T  52988423 cattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatattt 52988324  T
Q  1003 gatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||    
T  52988323 gatcaggatataaaa 52988309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 680 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 31549416 - 31549116
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |  ||||||  ||||||||||||||    
T  31549416 agagagataagatcaggtcttttgaatcatctaagtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 31549317  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtta 877  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  31549316 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctaaaactacagaccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgtta 31549217  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31549216 acctattatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcatt 31549117  T
Q  978 c 978  Q
    |    
T  31549116 c 31549116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 47055171 - 47054829
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  47055171 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccataactagtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 47055072  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||| ||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  47055071 aaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 47054972  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47054971 aacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 47054872  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || |||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||    
T  47054871 tcattctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaa 47054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 549 - 978
Target Start/End: Original strand, 30219820 - 30220258
Alignment:
Q  549 gttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgatt-gatttgtttgcataagc--- 644  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||| | ||  || ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||         
T  30219820 gttttaatctcaataattcaatagcgttattacttgagatgtgtaaaagttatatttgtt-gccactaggcagttgatttggtttgattgcataaaattt 30219918  T
Q  645 -aataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
     |||||| |||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||     
T  30219919 aaataactgaaagtaaaggtttgattagagaatatgagagagatgagatcatgtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtcaactgcacctattc 30220018  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta- 842  Q
    || |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||  | ||||||||||||||     
T  30220019 ttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcatagattgtaacccctaattccttag 30220118  T
Q  843 gtggtctaataacctttgaaggtttaa----gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaatt 938  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| |    |   |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30220119 gtggtctaatattctttgaagcttttaagttgatagttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatttgaacaatt 30220218  T
Q  939 caattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30220219 caattaggtttaagttgaaagctatggtcagtagtcattc 30220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 19304640 - 19304979
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||||  |||||| |||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  19304640 gagagatgagactaggtctttcaaatcctctgagttcccctgcttggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 19304739  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19304740 atagtcataatcaatcccctgagttacgaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaac 19304839  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||     
T  19304840 ctaacatcattaacaaatgattatccattcctatactaaccatgttcattagaacaattcatttatgtctaagttgaaagctagggtcaatagtcattca 19304939  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  19304940 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatttaaaa 19304979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 678 - 978
Target Start/End: Original strand, 22993644 - 22993948
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt-attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    || ||||||||||||| |||||    
T  22993644 agagagagatgagactaggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttactatgaatacttctctagttttacgatggttaa 22993743  T
Q  777 c-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta-agcac 873  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  || ||    
T  22993744 ctaaaatatccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttttagaac 22993843  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22993844 gttaacctagtatcacaaataaacgattatccattcctaaacttaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagt 22993943  T
Q  974 cattc 978  Q
    |||||    
T  22993944 cattc 22993948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 668 - 986
Target Start/End: Original strand, 3292897 - 3293218
Alignment:
Q  668 ttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagtttta 766  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||  |||||| |    
T  3292897 ttaaaaaatatgagagagatgagatcaggtcttttgaatcatctgt-ttcccctaattggtatattgcacctatttcttatgaatgattctatagtttca 3292995  T
Q  767 cgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggt 865  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3292996 cgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaagacccacttctccgattacaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggt 3293095  T
Q  866 tt-aagcacgttaacctaatatcactaa-taaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgt 963  Q
    || ||| |||||||| |||||| |  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||      
T  3293096 tttaagaacgttaacttaatataaaaaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaggctag 3293195  T
Q  964 ggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3293196 ggttagtagtcattcgttctcac 3293218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 682 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 41977243 - 41976919
Alignment:
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||    
T  41977243 agagatgagatcagatctttcgaatcatctgtgttctcctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa 41977144  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| ||||||||||||              |||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41977143 tagtcataatcaatccct--------------cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacc 41977058  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |    
T  41977057 taatatcactaacaaacgattatccattcatagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagttattcat 41976958  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  41976957 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 41976919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 681 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 54461258 - 54461010
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  54461258 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccccaaatgggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 54461159  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaa 878  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  54461158 atagtcataattcatcccttgagttaggaccctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaa 54461059  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta 927  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54461058 cctaatatcactagtaaaggattatacattcctagactaaccatgttta 54461010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 483 - 686
Target Start/End: Original strand, 34983541 - 34983747
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34983541 tgatagatgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggattgattttaatctcaataattcaattacgttgtaag 34983640  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat--aagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  34983641 ttagaatgtataaaagttcttttgatttaccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaatgacataaattaaagattggttttgagaataag 34983740  T
Q  680 agagaga 686  Q
    |||||||    
T  34983741 agagaga 34983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 824 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 28265977 - 28265784
Alignment:
Q  824 tacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccat 922  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28265977 tacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaacctagtatcactaataaaagattatccattcctagactaatcat 28265878  T
Q  923 gtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  28265877 gtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagta---attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 28265784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 679 - 958
Target Start/End: Complemental strand, 17546102 - 17545820
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| || || ||||||| ||||| ||||||    
T  17546102 gagagagatgagatcagatctttcgaatcttctg-gttcccctaattggtatactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaac 17546004  T
Q  778 -aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacg 874  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  17546003 taaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacaatccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacg 17545904  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaa 958  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17545903 ttaacctagtatcataaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaataattcaattaggtctaagttgaaa 17545820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 681 - 901
Target Start/End: Original strand, 18641723 - 18641945
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  18641723 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 18641822  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  18641823 atagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaa 18641922  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggatt 901  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  18641923 cctaatatcactaacaaacgatt 18641945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 766 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 18542710 - 18542487
Alignment:
Q  766 acgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaag 863  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  | |||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||    
T  18542710 acgatggttaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaag 18542611  T
Q  864 gttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctg 962  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  18542610 gttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagtta 18542511  T
Q  963 tggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  18542510 tggtcattagtcattcattctcac 18542487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 681 - 978
Target Start/End: Original strand, 55031947 - 55032237
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta----ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     || |||| || || ||||||  |||||||||||    
T  55031947 gagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 55032046  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaag-gtttaagcacg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||| |||||    
T  55032047 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacatcccctgattccttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacg 55032146  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||             |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55032147 ttaacctaatatcactgacaaacgattatccattcc-------------tttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 55032233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 645 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 22783882 - 22783529
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataag-agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  ||| ||||     
T  22783882 aataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattc 22783784  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggt--tacagcccctaattcctt 841  Q
    || |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||    
T  22783783 ttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattcctt 22783684  T
Q  842 a-gtggtctaata-acctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta-------ttag 931  Q
    | ||||| |||||    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||       || |    
T  22783683 aggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttg 22783584  T
Q  932 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22783583 aacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcac 22783529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 645 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 22788246 - 22787893
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataag-agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  ||| ||||     
T  22788246 aataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattc 22788148  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggt--tacagcccctaattcctt 841  Q
    || |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||    
T  22788147 ttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattcctt 22788048  T
Q  842 a-gtggtctaata-acctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta-------ttag 931  Q
    | ||||| |||||    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||       || |    
T  22788047 aggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttg 22787948  T
Q  932 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22787947 aacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcac 22787893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 670 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 28266171 - 28266023
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  28266171 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacga 28266072  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28266071 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagatagaaccctcttct 28266023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 483 - 628
Target Start/End: Original strand, 15195096 - 15195241
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15195096 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggattggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 15195195  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattg 628  Q
     || |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  15195196 ataggatgtataaaagttctttt-gtttgccagtaggcagttgattg 15195241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 483 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 46885356 - 46885234
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46885356 tgatagacgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 46885257  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttctttt 604  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  46885256 ttaggatgtatagaagttatttt 46885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9295063 - 9294936
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9295063 ttgttgaaacaaaaatctttttgattaatgttttaatgataacaaaccttctggaataaacactaagttttatgaatggtgatctaatgatgtttgcact 9294964  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||| ||| | || ||||||||    
T  9294963 taagtctttttacaaaagttgacaagaa 9294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 23484317 - 23484444
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23484317 ttgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaataataacaaactttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcact 23484416  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||  ||| ||| |||||||    
T  23484417 taagtcttttccgagaagtaaacaagaa 23484444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13979047 - 13978921
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13979047 tgttgaaccaaaactctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacacaaagttttatgaatggtgatctacttatgtttgcactt 13978948  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  13978947 aagtcttttcagagaagtaggcaagaa 13978921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 645 - 843
Target Start/End: Original strand, 52309529 - 52309728
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  52309529 aataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcgaatcaactatgttcccctaattggtatattgcacctattc 52309628  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||     |||| |||||||||||||||    
T  52309629 ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagctaggaccatcttctcaaactacaacccctaattccttag 52309728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 758 - 980
Target Start/End: Original strand, 282219 - 282443
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac 855  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||  | |||||    |||||||||||| || |||||||      
T  282219 ctagttttacgatggttaattaaaatagttctaatcaatca-ttgacttagaaccctcttctcagattacaattactaattccttaggtgatctaatatt 282317  T
Q  856 ctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  282318 cttcgaaggttttaagaacgttgacataatatcaccaataaacaattatccattcctagactaaccatgtttattcgaacaattcaattaggtctaagtc 282417  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
     |||| |  |||||||||||||||||    
T  282418 aaaagttagggtcagtagtcattcgt 282443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 328 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 7787385 - 7787258
Alignment:
Q  328 tttttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgc 427  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7787385 tttttgttgaaacaaaa--ctttttaa-gaatgttttaatgataacaaactttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgc 7787289  T
Q  428 acttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  7787288 aattgagtctttttacagaagttgacaagaa 7787258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 497 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25486566 - 25486338
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtata 593  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| | | | | ||||||||    
T  25486566 caagtgtaccaaaaactattgaagtagtaaaataatatcgttcccacaaggactgtttttaatctcaataattcaaaggcgttattattcaggatgtata 25486467  T
Q  594 aaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattgg-tttaaagaataagagagagatgag 690  Q
    || ||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  25486466 aaggttattttgttttgccactaggtagttgattggtttgattgcataaaagtaacgacagaaaataaagattggcttttaagaataagagaggggtgag 25486367  T
Q  691 tttaggtctttcgaatcatctatgttccc 719  Q
     | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  25486366 atcaggtttttcgaatcatcgatgttccc 25486338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 865 - 990
Target Start/End: Original strand, 27308722 - 27308846
Alignment:
Q  865 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtg 964  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  |    
T  27308722 tttaagaacgttaacctaatatcacaaataagcgattatctattcctagacta-ccatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtcgtaagctagg 27308820  T
Q  965 gtcagtagtcattcgttctcactaat 990  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  27308821 gtcagtggtcattcgatcttactaat 27308846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 670 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6922774 - 6922702
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6922774 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 6922702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 865 - 979
Target Start/End: Original strand, 27308159 - 27308273
Alignment:
Q  865 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtg 964  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||       
T  27308159 tttaagaacgttaacctaataacacaaataaacgattatctattccttgattaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtcttagtcataaactaga 27308258  T
Q  965 gtcagtagtcattcg 979  Q
    |||||||||||||||    
T  27308259 gtcagtagtcattcg 27308273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 50461311 - 50461383
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  50461311 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 50461383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 652 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 10902213 - 10902126
Alignment:
Q  652 gaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacc 738  Q
    ||||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10902213 gaaaataaagatttggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacc 10902126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 935 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31857804 - 31857720
Alignment:
Q  935 aattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  31857804 aattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatctttatatttgatcaagatataaaa 31857720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2775935 - 2775855
Alignment:
Q  483 tgatagaattttg-gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  2775935 tgatagatttttgtgcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 2775855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2779177 - 2779097
Alignment:
Q  483 tgatagaattttg-gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  2779177 tgatagatttttgtgcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 2779097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 482 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2874006 - 2873949
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874006 ctgatagatattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 2873949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 35412938 - 35412866
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  35412938 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 35412866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 926 - 1017
Target Start/End: Original strand, 52309754 - 52309847
Alignment:
Q  926 tattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  52309754 tatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaaactattgtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggaaataaaa 52309847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 5886757 - 5886813
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5886757 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 5886813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 5896741 - 5896797
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5896741 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 5896797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7487003 - 7486932
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  7487003 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 7486932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 10106362 - 10106433
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  10106362 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 10106433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 16184445 - 16184516
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg-ttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  16184445 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccacgaggact-gtgttaatctcaat 16184516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24125931 - 24125860
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  24125931 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 24125860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 29233363 - 29233419
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagt-aaaaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29233363 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaaatatcgttccacaaggactg 29233419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 24129208 - 24129161
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24129208 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 24129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 16314353 - 16314419
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16314353 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 16314419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 16414519 - 16414585
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16414519 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 16414585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 18495347 - 18495413
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18495347 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 18495413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30691169 - 30691096
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  30691169 aattttagcaagtgcactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 30691096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 539259 - 539187
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  539259 attttagcaagtatactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 539187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 537
Target Start/End: Original strand, 8461261 - 8461302
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 537  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8461261 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 8461302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28327796 - 28327751
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327796 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 28327751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 28331121 - 28331076
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331121 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 28331076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 398
Target Start/End: Original strand, 9307733 - 9307777
Alignment:
Q  354 atgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9307733 atgaatgttttaatgataacaaactttatggaataaacactaagt 9307777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11190951 - 11190911
Alignment:
Q  498 aagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11190951 aagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 11190911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 865 - 977
Target Start/End: Original strand, 27298599 - 27298711
Alignment:
Q  865 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtg 964  Q
    |||||| |||||||| |||||||||   || | ||||||| |||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||  |    
T  27298599 tttaagaacgttaacataatatcacaggtatatgattatctattcataaactaaccgtatttatttgaacaattcaattatgtctaagttgtaagctagg 27298698  T
Q  965 gtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||| |||||    
T  27298699 gtcagtaatcatt 27298711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 43927281 - 43927210
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  43927281 ttttagcaagtgtactaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 43927210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 53816261 - 53816213
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcca 539  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53816261 ttttagcaagtgtactaaatactatcgtagtagtaaaaatatcgttcca 53816213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 54724174 - 54724126
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54724174 attttagcaagtgtactaaatattatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 54724126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6922952 - 6922905
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6922952 ttttagcaagtatactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 6922905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 547
Target Start/End: Original strand, 23374503 - 23374558
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggact 547  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23374503 ttggcaagtgtaccaataactatcgaaatagtaataaatatcgttccacaaggact 23374558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 496 - 538
Target Start/End: Original strand, 12541067 - 12541109
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12541067 gcaagtgtactaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcc 12541109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 17141837 - 17141799
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagt 521  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141837 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagt 17141799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 18505320 - 18505387
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa--aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18505320 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactactgaagtagtaacaaaatatcgttccacaaggactg 18505387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 542
Target Start/End: Original strand, 6173123 - 6173173
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaa 542  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6173123 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatattgttccacaa 6173173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 509 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28266332 - 28266279
Alignment:
Q  509 atactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  28266332 atactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 28266279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 834 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 31857854 - 31857804
Alignment:
Q  834 aattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaa 883  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31857854 aattccttaggtggtctaataatttttgaaggattaagcacgttaacctaa 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18855791 - 18856328
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18855791 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattccgttgtaact 18855890  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855891 taagatgtataaaagttcttttaattggccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 18855990  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18855991 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttgcgatagttaacaatat 18856090  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856091 agtcctaatcaatcccttgagttaggaacctcttctagggttacaactcctaatttcttaggtggtctgctaacctttgaaggtttaagcacgttaacct 18856190  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18856191 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgtt 18856290  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18856291 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 18856328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 28230954 - 28230415
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28230954 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaact 28230855  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28230854 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctagacagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagata 28230755  T
Q  683 gag-atgagtttaggtctttcgaatcatctatgtt-cccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28230754 gagaatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttacccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaa 28230655  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28230654 atagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 28230555  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28230554 ctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcg 28230455  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28230454 ttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 28230415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 13947373 - 13946839
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947373 ctgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaac 13947274  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947273 ttaagat----aaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 13947178  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13947177 atagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaa 13947078  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13947077 tagtcctaattaatcccttgagttatgaccctcttcgagggttacaacccctaattccttaggtggtttaataacctttgaaggtttaagcacgttaatc 13946978  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  13946977 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcatttgt 13946878  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13946877 tctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 13946839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 949
Target Start/End: Complemental strand, 7128657 - 7128190
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7128657 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 7128558  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7128557 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagtttagtttaaagaataagaga 7128458  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7128457 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatattattgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaat 7128358  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7128357 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacatttgaaggtttaagcacgttaacct 7128258  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 949  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7128257 aatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcagttaggtct 7128190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 482 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19476362 - 19475823
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19476362 ctgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaa 19476263  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga 680  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19476262 attaggatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttttaagaataaga 19476163  T
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19476162 gagagatgaattttggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaacaaa 19476063  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19476062 atagtcctaatcagtcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaacacgttaac 19475963  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  19475962 ctactatcactaataaaggattatccattcctaggctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcgttcg 19475863  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19475862 ttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 19475823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 24410657 - 24410149
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24410657 tgatagaattttgacaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaacaattcaattacgttgtaac 24410558  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24410557 ttaggatatataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttttaagaataagag 24410458  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||     
T  24410457 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaat 24410358  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  24410357 aagtcctaatcaatcccttgagtcaggaccctctcctaaggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgtcggaggtttaagcacgttaacc 24410258  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24410257 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgt 24410158  T
Q  981 tctcactaa 989  Q
    |||||||||    
T  24410157 tctcactaa 24410149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24400536 - 24400000
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24400536 tgatagaattttggcaagt--accaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 24400439  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24400438 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattgattttaagaataagag 24400339  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||     
T  24400338 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaacaaat 24400239  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24400238 tagtcctaatcaatcccttaagtgaggaccctctcctaaggttacaacccctaattcctcaggtggtctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacc 24400139  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24400138 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggttagtagtcattcgt 24400039  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24400038 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24400000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 4512836 - 4512323
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4512836 tgatagacgtttcgcaagtgtaccgaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatttcaataattcaattacgttgtaag 4512737  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataac---agaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||   | ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  4512736 ttaggatgtacaaaagttatttttatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaa-attaacgaaataaagtaaag-ttggttttaagaataa 4512639  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||  |||||| ||||||    
T  4512638 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttccacgataattaaca 4512539  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttac----agcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcac 873  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  4512538 aaatagtcataatcaatccattgagttcggaccctcttctagggttacttgtagcccctaattccttaggtggtctactaacttttgaaggtttaagcat 4512439  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4512438 gttaacctaatatcactaataaatgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcagtctaagtcgaaagctagggtcagtagt 4512339  T
Q  974 cattcgttctcactaa 989  Q
    ||||||||||||||||    
T  4512338 cattcgttctcactaa 4512323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 496 - 924
Target Start/End: Original strand, 26896035 - 26896467
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataa 594  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  26896035 gcaagtgtaccaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacagggactggttttaatctcaatagttcaattacgttgtaagttaggatgtatag 26896134  T
Q  595 aagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtt 692  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||  | || |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26896135 aagttattttgattttccactaggcagttgattggtttgtttcaataaaagtaacaacaaaaattaaacattgattttaagaataagagagagatgagtt 26896234  T
Q  693 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatc 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||  || ||| |||||||||||| | |||||    
T  26896235 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacaataattaacaaaatagccataatc 26896334  T
Q  793 aatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcacta 891  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26896335 aatccattgagtttagaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctcataacctttgaaggtttaagcacattaacctaatatcacta 26896434  T
Q  892 ataaaggattatccattcctagactaaccatgt 924  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26896435 ataaaggattatccattcgtagagtaaccatgt 26896467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 485 - 785
Target Start/End: Original strand, 24155133 - 24155434
Alignment:
Q  485 atagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaactt 583  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24155133 atagatttttagcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccataaggattggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaatt 24155232  T
Q  584 aagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagag 683  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24155233 aggatgtataaaggttcttttaatttgtcgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagag 24155332  T
Q  684 agatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaata 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24155333 agatgagtttaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagta 24155432  T
Q  784 gt 785  Q
    ||    
T  24155433 gt 24155434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 480 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11125456 - 11125999
Alignment:
Q  480 cactgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgt 578  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| || |    
T  11125456 cactgatagacaattggcaagtgtatcaaaaattatcgaagtagtaaaaatatcattcccacaaggactgtttttaatctcaacaattctagtacattat 11125555  T
Q  579 aacttaagatgtataaaag-ttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagca--ataacagaaaataaagattggtttaaagaa 675  Q
     ||||| |||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||  |||||| |||| || |||||  |  || ||| || |||||||||||||| |||||    
T  11125556 tacttaggatgtaaaaaagattattttgatttgccactaggcatctgattggtttgattacataaaaataatgacaaaatataaagattggttttaagaa 11125655  T
Q  676 taagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtta 775  Q
    ||||| ||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||    
T  11125656 taagatagagatgggatcaagtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatga-tctctagttccacgatagtta 11125754  T
Q  776 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacg 874  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||      || ||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11125755 acaaaatagtcctgatcagtcccttgagttaggaccctcttcacaaactaaagcccatattttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacg 11125854  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11125855 ttaaccaaatatcagtaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 11125954  T
Q  975 attcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  11125955 attcgttttcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 11125999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 489 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22560930 - 22561467
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaa 585  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||  |||| | | |||     
T  22560930 aatttaggcaagtgcaccaattactatcgaagtaataaaataagatcgttcccacaaggactc-tgttaatctcaataattcaatagcgttattatttag 22561028  T
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaa-taacagaaaataaagattggtttaaa-gaataagag 681  Q
    | |||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22561029 gctgtataaaagttattttgttttacc-ctaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaactaacagaaaataaagattggtttaaaagaataagag 22561127  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  || |||| |||||||| |||||||    
T  22561128 agagatgagatcaggtctttcaaatcatctacgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaacaaaa 22561227  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaac 879  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  22561228 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgttaac 22561327  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
     ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||     
T  22561328 ttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagtagaaagctattgttagtagtcattca 22561427  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22561428 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 22561467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 26942388 - 26942738
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |  ||||||  ||||    
T  26942388 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgattcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcctatgaatgattttctagttccacga 26942487  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26942488 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggttta 26942587  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  26942588 agcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttatcaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtca 26942687  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26942688 gtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 26942738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 9954124 - 9953784
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |  ||| ||  ||||||||||||||    
T  9954124 agagagatgagatcagctctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctaattccacgatagttaacaa 9954025  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9954024 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 9953925  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9953924 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 9953825  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  9953824 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 9953784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3596734 - 3597085
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  3596734 aaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 3596833  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  3596834 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 3596933  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  3596934 aagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 3597033  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  3597034 agtagtcatttattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 3597085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2379425 - 2379050
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2379425 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 2379326  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||  |||||||||| ||    
T  2379325 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcctgtaattccttaggt 2379226  T
Q  845 ggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2379225 ggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatt 2379126  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2379125 ttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2379050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 670 - 989
Target Start/End: Original strand, 23384705 - 23385027
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |  ||||||  ||||    
T  23384705 aaagaataagagagagatgagattaggtctttcgattcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacga 23384804  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  23384805 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttgttctaataatctttgaaggttta 23384904  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggat--tatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggt 966  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  23384905 agcacgttaacctaatatcactaataaacgattatatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggt 23385004  T
Q  967 cagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  23385005 cagtagtcattcattctcactaa 23385027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 20185905 - 20185565
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  20185905 agagagataagatcaggtttttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 20185806  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  20185805 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaatgttaa 20185706  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20185705 cctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 20185606  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  20185605 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 20185565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22150086 - 22150426
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  22150086 agagagataagatcaggtttttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 22150185  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  22150186 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaatgttaa 22150285  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22150286 cctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 22150385  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22150386 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 22150426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11402428 - 11402077
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |  ||||||  ||||    
T  11402428 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgattcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacga 11402329  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  11402328 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttatactatatcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggtttt 11402229  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  11402228 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc 11402129  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  11402128 agtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 11402077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 678 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6513419 - 6513110
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  6513419 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 6513320  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6513319 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 6513220  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6513219 taacctaatatcactaataaacgattattcattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 6513120  T
Q  976 ttcgttctca 985  Q
    ||| ||||||    
T  6513119 ttcattctca 6513110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 678 - 983
Target Start/End: Original strand, 14281481 - 14281788
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || || || |||| ||||||||||||    
T  14281481 agagagagatgacatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttatgaatgattctcttgtttcacgatagttaac 14281580  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  14281581 aaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 14281680  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14281681 taacctaatatcactaataaacgattatcaattcctagactaaccatgtttattagaacaattgaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtca 14281780  T
Q  976 ttcgttct 983  Q
    ||| ||||    
T  14281781 ttcattct 14281788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5738042 - 5738388
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtt-----cccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagtt 774  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||    
T  5738042 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 5738141  T
Q  775 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagca 872  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  5738142 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaa 5738241  T
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtag 972  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5738242 cgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtag 5738341  T
Q  973 tcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5738342 tcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 5738388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 696 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1125714 - 1126039
Alignment:
Q  696 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 795  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125714 gtctttcgaatcatttatgttctcctaattggtatactggacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 1125813  T
Q  796 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    ||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1125814 cccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaat 1125913  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatca 992  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  1125914 aaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagttattccttctcactaaatca 1126013  T
Q  993 tattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | || ||| |||||||| ||||||||    
T  1126014 tgtttatatttgatcagaatataaaa 1126039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 30655605 - 30655264
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || || ||||||  |  |||||||||||    
T  30655605 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattctctagttccataatagttaacaa 30655506  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  30655505 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 30655406  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  30655405 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcatt 30655306  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  30655305 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaa 30655264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10290133 - 10289793
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  | |   |||||  ||||||||||||||    
T  10290133 agagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgttccccgaattggtatactgcacttattcttatgaattattttttagttccacgatagttaacaa 10290034  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10290033 aatagtcctaatcaatcctttaacttaggaccttcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacattaa 10289934  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10289933 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 10289834  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  10289833 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 10289793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 678 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 13005352 - 13005042
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  13005352 agagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 13005253  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaa-ggtttaagcacgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  13005252 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagtacgt 13005153  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13005152 taacctaatatcactaataaacgattatctattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggccagtagtca 13005053  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  13005052 ttcattctcac 13005042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 9839323 - 9839698
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattat 744  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9839323 aataaaagaaaataaagtttg-tttagaaaatatgagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattct 9839421  T
Q  745 tgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-g 843  Q
    | |||| || |  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||||||||| |    
T  9839422 tatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaagtagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttagg 9839521  T
Q  844 tggtctaataacctttg-aaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9839522 tggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatatttatttgaacaattcaat 9839621  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  9839622 taggtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaa 9839698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 645 - 974
Target Start/End: Original strand, 17106537 - 17106868
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  17106537 aataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattc 17106636  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||| |||||||||||||||    
T  17106637 ttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttag 17106736  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17106737 gtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaat 17106836  T
Q  943 taggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  17106837 tctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtc 17106868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 724 - 989
Target Start/End: Original strand, 28111773 - 28112038
Alignment:
Q  724 ttggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggt 823  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         
T  28111773 ttggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 28111872  T
Q  824 tacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccat 922  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  28111873 tacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattcttcattcctagactaaccat 28111972  T
Q  923 gtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  28111973 gtttattagatcaattcaatttggtctaagtcg-aagctatggttagtagtcattcaatctcactaa 28112038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 678 - 989
Target Start/End: Original strand, 28107748 - 28108062
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| || |  ||||||  || |||||||||    
T  28107748 agagagagatgatatcaggtatttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacagctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaac 28107847  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataa---cctttgaaggtttaagcac 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||| ||    
T  28107848 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttacgtggtctaataatattctttgaaggtttaagtac 28107947  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  28107948 gttaacctaatatgactaataatcgattatccattccatgactaaccgtgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc-aaagctatgatcattagt 28108046  T
Q  974 cattcgttctcactaa 989  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  28108047 cattcattctctctaa 28108062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 497 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 32110016 - 32109691
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaa 595  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| |||||| |||    
T  32110016 caagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaaaaatatcgtacccacaaggactgtttttaatctccacaattctattacgttattacttaggatgtaaaaa 32109917  T
Q  596 ag-ttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtt 692  Q
    || || ||||  |||||| ||||| ||||||| | |||| |||| |||  | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  32109916 aggttattttgttttgccactaggaagttgatgggtttgattgcgtaaaagtaacgacagaaaataaagattggttttaagaataaaagagagatgagat 32109817  T
Q  693 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatc 792  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| || || ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32109816 caggtctttcgaatcatcaatgttcccctaatttgtatgctgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgataattaacaaaatagttctaatc 32109717  T
Q  793 aatcccttgagttaggaccctcttct 818  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  32109716 aatcccttgagttatgaccctcttct 32109691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 679 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 2846466 - 2846163
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||| ||||| ||||||    
T  2846466 gagatagatgagatcaagtctttcgaatcctctaagtccccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac 2846367  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt--aagcacg 874  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||| |||    
T  2846366 aaaatagccataatcaatcccttgacataggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacg 2846267  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  2846266 ttaacttaatatcacaaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtc 2846167  T
Q  975 attc 978  Q
    ||||    
T  2846166 attc 2846163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 645 - 968
Target Start/End: Complemental strand, 23008258 - 23007932
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| | | |||||||||||| |||  ||| || ||||||||  ||  ||||||||     
T  23008258 aataacataaaataaagatttgtttggaaaataagaagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattggtccacaacacctattc 23008159  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    ||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||    
T  23008158 ttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattccttag 23008059  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  23008058 gtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacagttcag 23007959  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  23007958 ttaggtctaagttgaaagttatggtca 23007932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 645 - 968
Target Start/End: Original strand, 23780106 - 23780432
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| | | |||||||||||| |||  ||| || ||||||||  ||  ||||||||     
T  23780106 aataacataaaataaagatttgtttggaaaataagaagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattggtccacaacacctattc 23780205  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta- 842  Q
    ||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||     
T  23780206 ttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattccttag 23780305  T
Q  843 gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  23780306 gtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacagttcag 23780405  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  23780406 ttaggtctaagttgaaagttatggtca 23780432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 11247960 - 11247582
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata---agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| | ||||   ||||||||||||| | || | ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  11247960 aataacagaaagtaaagatttgattagaaaatatagagagagagatgagatcagttttttcgaatcctctg-gttcccctaatttgtatactacacttat 11247862  T
Q  742 ta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcct 840  Q
    |  ||  ||| || || ||||||| | ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  11247861 ttcttacgaatgattctctagtttcatgatggttaacaaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactctcttatcagattacagccc-taattcct 11247763  T
Q  841 tag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaatt 938  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11247762 taggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaatt 11247663  T
Q  939 caattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  11247662 caattatgtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgtaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 11247582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 678 - 983
Target Start/End: Original strand, 13021213 - 13021522
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattg-tgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||    || |||||||||||||  ||||    
T  13021213 agagagagatgagagtaggtcttttgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaa 13021312  T
Q  777 c-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcac 873  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||| ||| |||||||  ||| |||| ||| ||| ||    
T  13021313 ctaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatattcttagaagatttgaagaac 13021412  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  13021413 attaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaacgatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatgatcagtagt 13021512  T
Q  974 cattcgttct 983  Q
    ||||| ||||    
T  13021513 cattcattct 13021522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 12988086 - 12988429
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattg-tgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||    || |||||||||||||  ||||||    
T  12988086 agagagatgtgactaggtcttttgaatcctctaagttcccgtaattggtacactgcacctattcctcatgaatatttctctagttttacgatgattaaca 12988185  T
Q  779 aa-atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
     | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||| || |||||||  ||| |||| ||| ||| |||     
T  12988186 tacatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaagaacgc 12988285  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12988286 taacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagttatggtcagtagtca 12988385  T
Q  976 ttcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12988386 ttcattctcacgaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 12988429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 758 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 5260017 - 5259793
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacc 856  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||   ||||| || ||||| ||||||||||  |    
T  5260017 ctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtctaatactc 5259921  T
Q  857 tttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcg 955  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5259920 tttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattacccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttg 5259821  T
Q  956 aaagctgtggtcagtagtcattcgttct 983  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5259820 aaagctatggtcagtagtcattcattct 5259793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 14097007 - 14097133
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14097007 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgca-t 14097105  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  14097106 tgagtcttttcacagaagttgacaagaa 14097133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 2846882 - 2847009
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  2846882 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaattgtgatctattgatgtttgcatt 2846981  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  2846982 tgagtcttttcaaagaagttgacaagaa 2847009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 758 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 28848925 - 28848694
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac 855  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||    |||||| |||||||||||||| || ||| |||      
T  28848925 ctagttttacgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctgatatt 28848826  T
Q  856 ctttgaaggttta-agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28848825 ctttgaaggttttgagaacgttaacctattatcacaaataaacgattatctattcctagactaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtctgagtt 28848726  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  28848725 gaaagctatgttcagcagtcattcattctcac 28848694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 2849649 - 2849776
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2849649 ttgtggaaataaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaatcttatggaataaacacgaagttttatgaattgtgatctactgatgtttgcact 2849748  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2849749 tgagtcttttcacagaagttgacaagaa 2849776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 823 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 24371293 - 24371094
Alignment:
Q  823 ttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacc 920  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||   ||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24371293 ttacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaacctattatcacaaataaacgattatccattcctagactaacc 24371194  T
Q  921 atgtttattagaac-aattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcacta-atcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
      ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24371193 cggtttatttgaacaaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcattatatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 24371094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 898 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31072246 - 31072125
Alignment:
Q  898 gattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatatt 996  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31072246 gattatccattcctagaccagccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 31072147  T
Q  997 cata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  31072146 tatatttgatcaggatataaaa 31072125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 332 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17514483 - 17514360
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  17514483 tgttgaatcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatagaataaacactaagttttataaatggtgatctacttatatttgcactt 17514384  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaa 455  Q
     ||||||||||  || ||||||||    
T  17514383 aagtcttttcaatgaagtagacaa 17514360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 330 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 792904 - 792799
Alignment:
Q  330 tttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  792904 tttgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaacctcatggaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcac 792805  T
Q  430 ttgagt 435  Q
    ||||||    
T  792804 ttgagt 792799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 872 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 2372289 - 2372201
Alignment:
Q  872 acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagc 960  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2372289 acgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagc 2372201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 680 - 818
Target Start/End: Original strand, 23842762 - 23842899
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || | || || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  23842762 agagagatgagatcagttctttcgaat-atctatgttcccctaattgttatattgcacttattcttataaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 23842860  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23842861 aatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttct 23842899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 824 - 978
Target Start/End: Original strand, 11192685 - 11192846
Alignment:
Q  824 tacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagac----ta 917  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    ||    
T  11192685 tacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccaatcctagactaatta 11192784  T
Q  918 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt-cgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  11192785 accctgtttatttgaacatttcaattaggtctaagtgtgaaacctatggtcagtagtcattc 11192846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22228143 - 22228040
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||    
T  22228143 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatgctaatctactgatgtttgccctt 22228044  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  22228043 gagt 22228040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 697 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 2372397 - 2372293
Alignment:
Q  697 tctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2372397 tctttcgaatcatctatgttcccctagttggtatactgcacatattcttatgaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 2372303  T
Q  797 ccttgagtta 806  Q
    ||||||||||    
T  2372302 ccttgagtta 2372293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 768 - 826
Target Start/End: Original strand, 23667721 - 23667779
Alignment:
Q  768 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttac 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667721 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttac 23667779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 651 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 23847962 - 23847792
Alignment:
Q  651 agaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatct---atgttcccctaattggtatactgcacctattattg 746  Q
    |||||||| ||||| | ||| | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  23847962 agaaaatatagatttggttagaaaataagaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcttttatattcccctaattggtatactgcacctatt-cta 23847864  T
Q  747 tgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 818  Q
    |||| || |  ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23847863 tgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcttaatcaatctcttgagttaggtctctcttct 23847792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 483 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2379586 - 2379531
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379586 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 2379531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 918 - 989
Target Start/End: Original strand, 26898071 - 26898142
Alignment:
Q  918 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  26898071 accatgtttattagaacaacttaattaggtctaattcgaaagctagggtcagtagtcattcgttgtcactaa 26898142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 538
Target Start/End: Original strand, 26942201 - 26942256
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26942201 tgatagaattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcc 26942256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 538
Target Start/End: Original strand, 1125500 - 1125558
Alignment:
Q  481 actgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125500 actgatagatattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 1125558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22920882 - 22920816
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22920882 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 22920816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9954311 - 9954239
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9954311 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 9954239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 30655806 - 30655734
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  30655806 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 30655734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2331635 - 2331556
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2331635 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaataaatattattccacaaggact-gtattaatctcaat 2331556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 562
Target Start/End: Original strand, 5737844 - 5737909
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcg-ttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  5737844 caagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtttccgcaaggact-gtgttaatctcaat 5737909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 930 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11188130 - 11188219
Alignment:
Q  930 agaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  11188130 agaacaattcaattctgtttaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 11188219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17696935 - 17696878
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17696935 tttggcaagtgtaccaccaactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 17696878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 3596555 - 3596626
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  3596555 ttttagcaagtttactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaagact-gtgttaatctcaat 3596626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 23381946 - 23382017
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  23381946 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 23382017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Original strand, 23384526 - 23384573
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23384526 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcc 23384573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17232208 - 17232142
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17232208 tgatagatatttgacaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatattgttccacaaggactg 17232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 11187973 - 11188045
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagt-aaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  11187973 ttttagcaagtgcactaaatactatcgaagtagtaaaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 11188045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 538
Target Start/End: Original strand, 11729112 - 11729153
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11729112 caagtgtactaaatactatcgaagtaataaaaatatcgttcc 11729153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 946 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23388327 - 23388400
Alignment:
Q  946 gtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  23388327 gtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 23388400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31123779 - 31123711
Alignment:
Q  494 tggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31123779 tggcaaatgtaccaaaaagtatcgaagtagtaataaatattgttccacaaggact-gtattaatctcaat 31123711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221924
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa 22221924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247759
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa 22247759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14795894 - 14795849
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14795894 actgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa 14795849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23619131 - 23619667
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23619131 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaact 23619230  T
Q  583 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23619231 taagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttt-aagaataagaga 23619329  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23619330 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaat 23619429  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23619430 agttctaatcaattcattgagttagaaccctcttctagggttgaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 23619529  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23619530 aatttcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgtt 23619629  T
Q  982 ctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23619630 ctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 23619667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 481 - 1014
Target Start/End: Complemental strand, 31285030 - 31284493
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgta 579  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31285030 actgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgta 31284931  T
Q  580 acttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31284930 aattaggatgtataaaggttcttttaatttgccactaggtagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttttaagaataag 31284831  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  31284830 agagagatgagtttaggtcattcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaacaa 31284731  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31284730 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacatcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggtttaagcacgttaa 31284631  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31284630 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattacaacaattcaattaggtctaagtcgaaggctatggtcagtagtcattc 31284531  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatata 1014  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  31284530 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatata 31284493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 8912003 - 8911463
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8912003 tgatagatttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaag 8911904  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| | ||||  | |||||| |||| |||||||||    
T  8911903 ttaggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattggtttggttgcataaaagtaatgatagaatttgaagattagttttaagaataag 8911804  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  8911803 agagata--agtttaggtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctatgatagttaacaa 8911706  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccc-taattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8911705 aatagtcctaataaatccctcgagtttagaccctcttctagggctacaaccccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgtt 8911606  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8911605 aacataatatcactaataaaggattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 8911506  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8911505 tcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 8911463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 492 - 1017
Target Start/End: Original strand, 44026865 - 44027396
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44026865 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaagttaggatgt 44026964  T
Q  591 ataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagc--aataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatg 688  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  44026965 ataaaagttcttttgatttgccactagacatttgattggtttgattgcataaaattaataacagaaattaaagattggttttaagaataagagagaaatg 44027064  T
Q  689 agtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcct 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44027065 agtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatataatgcacatattcttgtgaatgattaactagttctacgatagttaacaaaatagtcct 44027164  T
Q  789 aatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatc 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44027165 aatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaaacacgttaacctaatgtc 44027264  T
Q  888 actaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact 987  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||| |    
T  44027265 actaataaatgattattcattcctaacctaatcatgtttattagaaaaattcaattaagtctaagtcaaaaactatgatcagtaatcattcgttctcagt 44027364  T
Q  988 -aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  44027365 aaatcatatttatatttgatcatgatataaaa 44027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 483 - 1016
Target Start/End: Complemental strand, 33420010 - 33419473
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33420010 tgatagacgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgtttccacaaggactgattttaatctccataattcaattacgttgtaag 33419911  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||    
T  33419910 ttaggatgtataaaagttattttgaat-gccactaggcagttgattgttttgattgcataaaagtaacgacataaagtaaag-ttggttttaagaagaag 33419813  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  33419812 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaa 33419713  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33419712 aatattcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttatgtggtctaataacctttgaaggtttaagcatgttta 33419613  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33419612 tctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 33419513  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaa 1016  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  33419512 attctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaa 33419473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 661 - 1017
Target Start/End: Original strand, 10498158 - 10498517
Alignment:
Q  661 gattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcacta 760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  10498158 gattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtcccta 10498257  T
Q  761 gttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataaccttt 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10498258 gttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccttt 10498357  T
Q  860 gaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaag 959  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10498358 gaaggtttaagtacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattccaagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaag 10498457  T
Q  960 ctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10498458 ctatgatcagtagtcgttcgttctcactaaattatatttatatttgatcaggatataaaa 10498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 493 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 17931329 - 17930797
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgta 591  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||  | |||||| | | ||| ||||||    
T  17931329 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacaaggactgtttttaatcgcaacaattttagtacgttattaattaggatgta 17931230  T
Q  592 taaaagttc-ttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagca--ataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagagat 687  Q
     ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17931229 aaaaaggtcattttgatttgccactaggcagttgattggtttgattgcataaaaataatgacagaaaataaagattggttttaaagaacaagagagagat 17931130  T
Q  688 gagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcc 787  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||     
T  17931129 gagattaggtctttcgaatcatcgatgtttccgtaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtct 17931030  T
Q  788 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatat 886  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  17931029 taatcaatcccttgagttacgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttgatcttatat 17930930  T
Q  887 cactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17930929 cactaacaaacgattatccattcctatactaaccatgtttactagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcac 17930830  T
Q  987 t-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  17930829 taaatcatgtttatatttgatcaagatataaaa 17930797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 509 - 1017
Target Start/End: Original strand, 21279558 - 21280072
Alignment:
Q  509 atactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaat 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |  || ||||| |||||||| |||| ||    
T  21279558 atactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgtttttaatctcaattattcaactacgttattaaataggatgtgtaaaagttatttttat 21279657  T
Q  608 ttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaata---acagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcga 704  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  ||||||||||    
T  21279658 ttgccactaggcagtagattggttggattgcataa-aaataacgacagaaaataaagattggttttaagaatgagagagagatgtgatcgggtctttcga 21279756  T
Q  705 atcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagt 804  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21279757 atcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttacatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagt 21279856  T
Q  805 taggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattat 903  Q
    || ||| |||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21279857 taagactctcttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattat 21279956  T
Q  904 ccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-t 1001  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |    
T  21279957 ccattcctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatt 21280056  T
Q  1002 tgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||| |||||||||||    
T  21280057 tgattaggatataaaa 21280072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 13197213 - 13196673
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | |     
T  13197213 tgatagaagtttggtaagtgtaccaaaaattatcgaagtagtaaaa-tatcgttcccacgaagactgcttttaatctcaacaattctagtacgttattaa 13197115  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtt-taaagaataa 678  Q
     || ||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||  | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13197114 ataggatatataaaggttattttgatttgccactaggcagttgatttgtttgattccataaaagtaacaactgaaaataaagattggttgtaaagaataa 13197015  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  | |||||||||||    
T  13197014 gagatagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttctcttaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaaca 13196915  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13196914 aaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcgaactacaacccctaatttcttaggtagtctaataatctttgaaggtttgagcacgtta 13196815  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  13196814 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagttatggtcggtagtcatt 13196715  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  13196714 cgttctcactaaatcatgtttttatttgatcaggatataaaa 13196673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2560909 - 2560368
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  2560909 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaagaactggttttaatctcaataattcaattacgttattaa 2560810  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
      | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||  | ||  |  |||  ||||| | | ||| |||||||||    
T  2560809 aaaggatgtataaaggttcttttaatttgccactaggtagtagattgatttgattgcataaaagtaaagattgaatttaaagttggtttttaagaataag 2560710  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  2560709 agagaaatgaggtcaggtctttcaagtcatcgatgtttctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaa 2560610  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagtt-aggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtt 876  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||| | ||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2560609 aatagccataatcaatcacttgagtttaagactctcttctcagattaca-cccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggctttaagcacgtt 2560511  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2560510 aaactaatatcattaataaaggattatccattcctagactaaccatctgtattagaacaattcagttaggtctaagtcgaaaaccatggtcagtagtcat 2560411  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2560410 tcgttatcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2560368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 989
Target Start/End: Original strand, 12516226 - 12516727
Alignment:
Q  497 caagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtata 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    ||| | | | |  |||||||    
T  12516226 caagtgtaccaaaaactatcgaagttgtaaaataatatcgttcccacaaggactgtttttaatttcaataattcaaaggtgttattattcagaatgtata 12516325  T
Q  594 aaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtt-taaagaataagagagagatgag 690  Q
    || ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  12516326 aatgttattttgatttgtcactaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaacgacagaaaataaagattggttgtaaagaatgagagagagatgaa 12516425  T
Q  691 tttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtg-aaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtccta 789  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || |  |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12516426 atcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttttggaatggttttctagttccacgatagttaacaaaatagtccta 12516525  T
Q  790 atcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttagtgg-tctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatc 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  12516526 atcaatcccttgagttaggaccctcttcttagattacaatccctaattccttagttgatctaatattctttgaaggttttatgcactttaacataatatc 12516625  T
Q  888 actaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact 987  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12516626 actaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcagtagccattcgttctcact 12516725  T
Q  988 aa 989  Q
    ||    
T  12516726 aa 12516727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10664089 - 10663715
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10664089 aacagaatataaagatagttttggaaagaaaaagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattctt 10663990  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||| |    
T  10663989 atgaatgattctctagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggt 10663890  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 944  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10663889 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacattaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 10663790  T
Q  945 ggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  10663789 ggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaa 10663715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 14421904 - 14421560
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattg-tgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| || |   |||||  |||||||||||    
T  14421904 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttactgaatgattttttagttccacgatagttaa 14421805  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacg 874  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||    
T  14421804 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacg 14421705  T
Q  875 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14421704 ttaacctagtatcactaataaaggattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtc 14421605  T
Q  975 attcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  14421604 attcgttctcactaaatcatctttatatttgatcaggatataaaa 14421560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 16953970 - 16953592
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16953970 aataacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 16953871  T
Q  743 attgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta 842  Q
     || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  16953870 cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattcctta 16953771  T
Q  843 -gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
     | ||||||||||   | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16953770 ggcggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttataagaacaattca 16953671  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16953670 attctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 16953592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18824347 - 18824698
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || ||    ||||||  ||||    
T  18824347 aaagaaaaggagagagatgagatcaggtatttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacga 18824446  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  18824447 tagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggttta 18824546  T
Q  869 a-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18824547 aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 18824646  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18824647 agtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 18824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18825840 - 18826191
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || ||    ||||||  ||||    
T  18825840 aaagaaaaggagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacga 18825939  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  18825940 tagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggttta 18826039  T
Q  869 a-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18826040 aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtc 18826139  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18826140 agtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 18826191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 680 - 989
Target Start/End: Original strand, 25591442 - 25591752
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  25591442 agagagatgagatcaggtgtttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 25591541  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  25591542 aatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 25591641  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25591642 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattttgtctaagt-aaaagctatggtcagtagtcatt 25591740  T
Q  978 cgttctcactaa 989  Q
    | ||||||||||    
T  25591741 cattctcactaa 25591752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 679 - 978
Target Start/End: Original strand, 45155231 - 45155532
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||  ||||||||||||    
T  45155231 gagagagctgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagtttcgcgatagttaaca 45155330  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||    
T  45155331 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactaaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgtt 45155430  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45155431 aacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttaatagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 45155530  T
Q  977 tc 978  Q
    ||    
T  45155531 tc 45155532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 682 - 1017
Target Start/End: Original strand, 18721246 - 18721585
Alignment:
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||    
T  18721246 agagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa 18721345  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18721346 tagtcctaatcaatcccttgagttatgactctcttctcatactacagcccctaatttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaac 18721445  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  18721446 ctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattca 18721545  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  18721546 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcagtatataaaa 18721585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 36710598 - 36710940
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  36710598 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 36710697  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  36710698 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 36710797  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  36710798 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtccaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 36710897  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  36710898 tcgttctcactaaatcatgcttatatttgatcaggatataaaa 36710940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 22173850 - 22174227
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga-gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| | |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22173850 aataacaggaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactacacctattt 22173949  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
     | | ||  | || ||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||    
T  22173950 gtattaattattctctaattcaacgttagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttag 22174049  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22174050 gtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaatttaa 22174149  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  22174150 ttaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagcatataaaa 22174227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 25594620 - 25594961
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  25594620 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatcttcccctaattagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 25594719  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtta 877  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  25594720 aatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccataattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 25594819  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25594820 acctaatatcagtaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaaatcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 25594919  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  25594920 cattctcactaaatcatgtttatacttgatcagaatataaaa 25594961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 679 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 23643977 - 23643665
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||| || || ||||||  |||||||||||||    
T  23643977 gagagagatgatatcaggtcgttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacttctttgtatgaatgattctctagttccacgatagttaaca 23643878  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23643877 aaatagtcctaatcaatctcttgagttatgaccctcttctcagattacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagcacgtt 23643778  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23643777 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaacatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctagggtcagtagtcat 23643678  T
Q  977 tcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||||    
T  23643677 tcgttctcactaa 23643665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 43681834 - 43682174
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| || |  ||||||  || ||||||||||||    
T  43681834 gagagatgagactaggtctttcgagtcttcaaggttcccctaattggtatactacacttattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaa 43681933  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  43681934 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcatattacagtccctaattccgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaa 43682033  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  43682034 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacatttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattc 43682133  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43682134 gttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 43682174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 674 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5980270 - 5980616
Alignment:
Q  674 aataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagt 773  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || | || |  ||||||  || |||||    
T  5980270 aatatgagagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccttaattggtatactacacctattcttatggatgattttctagttccacaatagt 5980369  T
Q  774 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagca 872  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5980370 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccgtaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca 5980469  T
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtag 972  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5980470 cgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatatctagactaaacttgtttattagaacaagtcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtag 5980569  T
Q  973 tcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  5980570 tcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 5980616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 678 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 25231239 - 25230929
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  25231239 agagagagttgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 25231140  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt-agtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 875  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     || |||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| |||||| | ||    
T  25231139 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcctctaattccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagtatgt 25231040  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25231039 taacctaatatcactaataaacgattatccattcctaagctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttacggtcagtagtca 25230940  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  25230939 ttcattctcac 25230929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 677 - 986
Target Start/End: Original strand, 38248359 - 38248669
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| || || ||||||  ||||||| |||    
T  38248359 aagagagagatgcgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagctaa 38248458  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||    
T  38248459 caaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggacattcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttagtacgt 38248558  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38248559 taacctaatatcactaataaacgattatccaaacctagactatctatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgtaagctatggtcagtagtca 38248658  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  38248659 ttcattctcac 38248669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 12583167 - 12582824
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcat---ctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||| |    
T  12583167 agagagatgagaccaggtctttcgaatcatgatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttga 12583068  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12583067 caaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaaggtttaagaacgt 12582968  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12582967 taacctaatatcactaacaaacaattatctattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtca 12582868  T
Q  976 ttcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12582867 ttcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 12582824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5538700 - 5539077
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaata-agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  | |||| |  ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5538700 aataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactaggtcttttgaatcattgatgttccccaaattggtatactgcacctattc 5538799  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag 843  Q
    || |||| || || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||| |||    
T  5538800 ttatgaatgattctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattccgtag 5538899  T
Q  844 -tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaa 941  Q
     |||| || | | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5538900 gtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaa 5538999  T
Q  942 ttaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  5539000 ttttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcacttaatcatttttatatttgatcagtatataaaa 5539077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31577164 - 31577016
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31577164 tgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 31577065  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatc 480  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31577064 gagtcttttcatagaagtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatc 31577016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Original strand, 24267862 - 24268010
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24267862 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatatttgcactt 24267961  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatc 480  Q
    |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24267962 gagtattttaacataagtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatc 24268010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 483 - 628
Target Start/End: Original strand, 10498016 - 10498162
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10498016 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactcgttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 10498115  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattg 628  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10498116 ttaggatgtataaaagttcttttaatttgctgctaggcagttgattg 10498162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 645 - 867
Target Start/End: Original strand, 33883275 - 33883501
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt---aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33883275 aataacagaaaataaagatagttttggaaaagataaagagagaggtgagtttaagtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctat 33883374  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| |||||||||||||    
T  33883375 tcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattcctt 33883474  T
Q  842 a-gtggtctaataacctttgaaggttt 867  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  33883475 aggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24098110 - 24097960
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24098110 tgttgaaccaaaaatcttttcgatgaatgttttaatgataacaatctttatgaaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 24098011  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatcac 482  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24098010 gagtcttttcacaaaaatagacaagaagtaatatcaaaccagtagcatcac 24097960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 481 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 30785284 - 30784745
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttg 577  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||     
T  30785284 actgataaaagtttggcaagtgcaccaaaatttatcgaagtagtaaaataatatcgttcccacaaggattgtttttaatttcaataattcaatcacgtta 30785185  T
Q  578 taacttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgatt-gatttgtttgcat--aagcaa-taacagaaaataaagattggtttaaag 673  Q
    | | ||| ||||||||||  || | ||  |||||| |||||||||||||| | |||| ||  ||  || ||| ||||||||||||||||||| || | |     
T  30785184 ttaattaggatgtataaagtttatatttgtttgcc-ctaggcagttgatttggtttgattttatgaaatcaaataacagaaaataaagattgattaagaa 30785086  T
Q  674 aata---agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||   |||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||  ||| || || ||||||| ||||    
T  30785085 aatatgaagagagaggtgagatcaggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtatattgtacctatttcttacgaatgattctctagtttcacga 30784986  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||  |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | |||    || |||||| |||    
T  30784985 tagttaacaaaataaccctaatcaatccatggacgtaggaccctcttctcggattacagtctctaattccttaggtgatttaaagttctctgaaggtttt 30784886  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    | | ||||||||||||||||||            ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30784885 acgaacgttaacctaatatcac-----------aatccattcctagattattcatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtc 30784797  T
Q  968 agtagtcattcgttctcactaa-tcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | ||||||||| ||||||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  30784796 aatagtcattcattctcacgaattcatgtttatatttgatcaagatataaaa 30784745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 645 - 986
Target Start/End: Original strand, 5613645 - 5613998
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataag-agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta 743  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  ||| ||||     
T  5613645 aataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattc 5613743  T
Q  744 ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggt--tacagcccctaattcctt 841  Q
    || |||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||    
T  5613744 ttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattcctt 5613843  T
Q  842 a-gtggtctaata-acctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta-------ttag 931  Q
    | ||||| |||||    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||       || |    
T  5613844 aggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttg 5613943  T
Q  932 aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  5613944 aacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggtcagcagtcattcattctcac 5613998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 42714612 - 42714486
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42714612 tgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacgctaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 42714513  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||    
T  42714512 aagtcttttcagagaagtagacaagaa 42714486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 759 - 1015
Target Start/End: Complemental strand, 4868330 - 4868075
Alignment:
Q  759 tagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacct 857  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||| |||||||  ||    
T  4868330 tagtttcacgatggttaactaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggattacagttcataattccttaggtgatctaatattct 4868231  T
Q  858 ttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcga 956  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  4868230 ttgaaggttttaagaacgttcacctaatatcacaaataaaaaattatccattcctagactaa-----tttatttgaacaattcaattaggcctaagttga 4868136  T
Q  957 aagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa-tcatattcata-ttgatcaggatataa 1015  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||    
T  4868135 aagttatggtcaatagtcattcattctcacgaattcatctttatatttgatcaggatataa 4868075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 996603 - 996730
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  996603 ttgttgaaacaaaaatcttttttatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttatgaatagtgatctactgatgtttgcact 996702  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||||| | || ||||||||    
T  996703 taagtcttttcacaaaagttgacaagaa 996730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 12765579 - 12765705
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12765579 tgttgaaccaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaattttatggaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 12765678  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||    
T  12765679 aagtcttttcagagaagtagacaagaa 12765705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 483 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 23612493 - 23612362
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23612493 tgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatcatgttcccacaagggctggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 23612394  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccg 613  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23612393 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccg 23612362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 5253397 - 5253183
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  5253397 tgatagacgtttggtaagcgtatcaaattctatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggattgattttaatttcaataattcaattacgttgtaaa 5253298  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
     || |||||||||| ||| ||||  |||||  |||  |||| ||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5253297 atatgatgtataaa-gttattttgttttgctactaaacagtagattggtttgtttgcataaaagtaaagacagaaaataaagattggttttaagaataag 5253199  T
Q  680 agagagatgagtttag 695  Q
    ||||||||||||||||    
T  5253198 agagagatgagtttag 5253183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 333 - 444
Target Start/End: Original strand, 9417613 - 9417724
Alignment:
Q  333 gttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  9417613 gttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgaaatagacactaagttttataaatggtgatctacagatgtttgcactcg 9417712  T
Q  433 agtcttttcaca 444  Q
    ||||||||||||    
T  9417713 agtcttttcaca 9417724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 332 - 444
Target Start/End: Original strand, 15968653 - 15968765
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15968653 tgttgaaacaaaaatctctttggtgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacattaagttttatgaatagtgatctactgatgtttgcactt 15968752  T
Q  432 gagtcttttcaca 444  Q
     ||||||||||||    
T  15968753 aagtcttttcaca 15968765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 7835951 - 7836078
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7835951 ttgttgaaacaaaaatcttttttatgaatgatttaatgataacaacccttatggaataaacactaagttctatgaatggtgatctactcatgtttgcact 7836050  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||    
T  7836051 taagtcttttcaaagaagttgacaagaa 7836078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 20035873 - 20036000
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20035873 ttgttgaaccaaaaatctttctgacgattgttttaatgataacaaactttatagaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcact 20035972  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  20035973 taagtcttttcagagaagtagacaagaa 20036000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Original strand, 20025710 - 20025836
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20025710 tgttgaaccaaaaatctttctgacgattgttttaatgataacaaactttatagaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 20025809  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
     |||||||| | ||| |||||||||||    
T  20025810 aagtctttttagagaagtagacaagaa 20025836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Original strand, 7806528 - 7806637
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7806528 ttgttgaaacaaaaatcttttttatcaatgatttattgataacaactcttatgaaataaacactaagttctatgaatggtgatctactcatgtttgcact 7806627  T
Q  431 tgagtctttt 440  Q
    | ||||||||    
T  7806628 taagtctttt 7806637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 680 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 20887691 - 20887589
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  20887691 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 20887592  T
Q  780 aat 782  Q
    |||    
T  20887591 aat 20887589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 679 - 794
Target Start/End: Original strand, 14589583 - 14589698
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  ||||| |||||||    
T  14589583 gagagagatgagattaggtatttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatcgttaaca 14589682  T
Q  779 aaatagtcctaatcaa 794  Q
    |||||| |||||||||    
T  14589683 aaatagccctaatcaa 14589698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 680 - 742
Target Start/End: Original strand, 5584359 - 5584421
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5584359 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 5584421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11432359 - 11432257
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||   ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11432359 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatattt-aatgataacaaaccttgtggattaaatgataagttttatgaatgttgatctactaatgtttgcactt 11432261  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  11432260 gagt 11432257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 482 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16954129 - 16954048
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  16954129 ctgatagatattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 16954048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 18825664 - 18825735
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  18825664 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 18825735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10664303 - 10664224
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  10664303 tgatagatttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 10664224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 18824171 - 18824242
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  18824171 ttttggctagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 18824242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 429
Target Start/End: Original strand, 15543107 - 15543182
Alignment:
Q  354 atgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcac 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  15543107 atgaatgttttaatgataacaaatcttataaaatgaagactaagttttatgaatgatgatgtattgatgtttgcac 15543182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Original strand, 17012806 - 17012863
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17012806 tttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaacaaatatcgttccacaaggactg 17012863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17544395 - 17544338
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17544395 tttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaacaaatatcgttccacaaggactg 17544338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24435374 - 24435319
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24435374 ttggcaagtgtaccaa-tactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 24435319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24445420 - 24445365
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24445420 ttggcaagtgtaccaa-tactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 24445365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 545
Target Start/End: Original strand, 24903250 - 24903313
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaagga 545  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903250 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaagga 24903313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 548
Target Start/End: Original strand, 27863320 - 27863383
Alignment:
Q  486 tagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27863320 tagaatattggcaagtgtatcaaaaaatatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 27863383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 537
Target Start/End: Original strand, 5584213 - 5584254
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 537  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5584213 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc 5584254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 23597552 - 23597480
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  23597552 attttagcaagtatactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 23597480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 536
Target Start/End: Original strand, 22173700 - 22173753
Alignment:
Q  483 tgatagaatttt-ggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt 536  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22173700 tgatagaatttttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaattatcgtt 22173753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22654616 - 22654550
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22654616 tgatagatatttggcaagtgtatcaataactatcgaagtagtaataactatcgttccacaaggactg 22654550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 18721062 - 18721133
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  18721062 ttttagcaagtatactaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 18721133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 405
Target Start/End: Original strand, 13573859 - 13573906
Alignment:
Q  358 atgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatga 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  13573859 atgttttaatgataacaaaccttatagaataaacaccaaattttatga 13573906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Original strand, 25591255 - 25591302
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25591255 ttttagcaagtgtactaaatattatcgaagtggtaaaaatatcgttcc 25591302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20887889 - 20887817
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagt-aaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20887889 ttttagcaagtatactaaatactatcgaagtaataaaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 20887817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 29715 - 29184
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgtt-gtaa 580  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  29715 tgatagatttttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactagttttaatctcaataattcaattacgtttgt-- 29619  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataaga 680  Q
     ||    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29618 -tt----tgtataaaggttcttttaatttgccgctagacagttgattggtttgtttgcataagcaataacaaaaaataaagtttggttttaagaataaga 29524  T
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29523 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatttttatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaa 29424  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaac 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29423 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctcacgtggtctaataacttttgaaggtttaagcacgttaac 29324  T
Q  880 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcg 979  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  29323 ctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtctttcg 29224  T
Q  980 ttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29223 ttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 29184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19636 - 19114
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19636 tgatagatttttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaaa 19538  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  19537 ttaggatgtataaaggttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacaaaaaataacgtttgattttaagaataagag 19438  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  19437 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcacctcattggtatactgcacctattcttgtgaatgactccctagttttacgatagttaacaaaa 19338  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19337 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagagttacaacccctaattccttagatggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 19238  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||||| |               ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19237 taatatcactaataaaggtt---------------taagcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgt 19153  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19152 tctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 19114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 483 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 10764 - 10228
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10764 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaataatgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaactacgttgtaag 10665  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10664 ttaggatgtataaaagttcttttgatt-gccactaggcagttgattggtttgtttacataaa-attaacagaaattaaagattggttttaagaataagag 10567  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10566 agagatgagtctaggtatttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaa 10467  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacc 880  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10466 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccatcttctagggttacaacccctaatttcttaggcggactaataaccgttgaaggtttaagcacgttaacc 10367  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10366 taatatcactaataaaggattatccattccttgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgt 10267  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  10266 tctcactaaatcctgtttatatttgatcaggatataaaa 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 498 - 1017
Target Start/End: Original strand, 58460 - 58986
Alignment:
Q  498 aagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaa 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  58460 aagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccaaaaggactg-ttttaatctcaataattaaattacgttgtaagttaggacgtataaaa 58558  T
Q  597 gttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagttta 694  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  58559 gttattttgatttgccactaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaacaacaaaaagtaaagattgattttaagaataagagatagatgagttta 58658  T
Q  695 ggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  58659 gatctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 58758  T
Q  795 tcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaat 893  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58759 tcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttatgcagtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaat 58858  T
Q  894 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattag--aacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aat 990  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  58859 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaaaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaat 58958  T
Q  991 catattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  58959 catgtttatatttgatcaggatataaaa 58986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 614 - 692
Target Start/End: Original strand, 58315 - 58395
Alignment:
Q  614 ctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagtt 692  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | || || | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58315 ctaggcagttgattggtttgtttgcataaaagtaacaataaaaagtaaagattgattttaagaataagagagagatgagtt 58395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 538
Target Start/End: Original strand, 58411 - 58450
Alignment:
Q  499 agtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58411 agtgtaccaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcc 58450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 483 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 64218 - 63709
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  64218 tgatagacgtttggcaagtgtaccaaatactatcaaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaag 64119  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    | | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||  | ||  ||| ||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  64118 taaggatgtataaaagttattttgatttgccactaggcagttgattggtatgtttgcataaaagtaacgacaaaaagtaaggattgatttttagaataag 64019  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |  ||||||  || |||||||||||    
T  64018 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatcggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaa 63919  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  63918 aatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggttatagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggtttaagcacgttaa 63819  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  63818 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcattc 63720  T
Q  979 gttctcactaa 989  Q
    |||||||||||    
T  63719 gttctcactaa 63709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 491 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 62872 - 62336
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatc-----gttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaa 585  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      | |||| |||||| || |||||||||||    |||| | ||    | ||||    
T  62872 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatctatcattcccacgaggact-gtgttaatctcaatttagcaataaagtaaatatttaa 62774  T
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgc-ataa---gcaataacagaaaataaagattggttt--aaagaataag 679  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||     ||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||    
T  62773 gatgtataaaagttcttttgaattgccactaggcagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaagaaaaag 62674  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  62673 agaga---gagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 62577  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  62576 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 62477  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  62476 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 62377  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  62376 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 62336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-176; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 498 - 1017
Target Start/End: Original strand, 905463 - 905992
Alignment:
Q  498 aagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaa 596  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  905463 aagtgtatcaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactgattataatctcaataattcaattacgttgtaagttaggatgtataaaa 905562  T
Q  597 gttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagatgagttta 694  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  | | ||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||     
T  905563 gttattttgatttgacactaggcatttgattggtttgtttgcataaaagtaacgataaaaagtaaagttggttttaaagaataaaagagagatgagtttt 905662  T
Q  695 ggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 794  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  905663 ggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaa 905762  T
Q  795 tcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaaccta----atatcac 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  905763 tcccttgagttaggaccctcttctatggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatatatcac 905862  T
Q  890 taataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-a 988  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  905863 taataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaa 905962  T
Q  989 atcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  905963 atcatgtttatatttgatcaggatataaaa 905992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3796779 - 3797129
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3796779 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgcgaaagagtcactagttttacga 3796878  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttta 868  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3796879 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttta 3796978  T
Q  869 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3796979 agcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtca 3797078  T
Q  969 gtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3797079 gtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaa 3797129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 482 - 938
Target Start/End: Original strand, 27354705 - 27355165
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaa 580  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27354705 ctgatagaagtttggcaagtgcaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgatgattgtttttaatctcaataattcaattatgttgcaa 27354804  T
Q  581 cttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttta-aagaata 677  Q
      || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27354805 aataggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggcagttgattgatttgtttgcataaaagtaatgacagaaaataaagattggtttttaagaata 27354904  T
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  27354905 aaagagagatgagtttaggtctttcaaatcctcgatgttctcctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 27355004  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  27355005 aaaatagtcataaccaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactaca-accctaattccttaggtggtctattaatcttcgaaggtttaaacacgtt 27355103  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaatt 938  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27355104 aacctaatatcactaacaaacgattatctattcctacactaaccatgtttattagaacaatt 27355165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 645 - 1017
Target Start/End: Original strand, 29643146 - 29643524
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaaga---ttggtttaaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29643146 aataacagaaaataaagaaagttggttttaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaactagtatactgcacctat 29643245  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctt 841  Q
    | || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  29643246 tcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacaacctctaattcctt 29643345  T
Q  842 a-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 940  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29643346 aggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattca 29643445  T
Q  941 attaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  29643446 attaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttcacactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 29643524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 491 - 1017
Target Start/End: Original strand, 1950222 - 1950758
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatg 589  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||    |||| | ||    | ||||||||    
T  1950222 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggactg-tgttaatctcaatttagcaataaagtaaatatttaagatg 1950320  T
Q  590 tataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat---aagcaa-taacagaaaataaagattggttt---aaagaataagaga 682  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    ||| || ||||||||||||||||| | |||   |||  |||    |    
T  1950321 tataaaagttcttttgaattgccactaggcagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaaatatatataa 1950420  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  1950421 gagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaat 1950520  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacct 881  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1950521 agtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaacct 1950620  T
Q  882 aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgtt 981  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1950621 aatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatacaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcatt 1950720  T
Q  982 ctcact-aatcatattcatat-tgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1950721 ctcactaaatcatatttatatatgatcaggatataaaa 1950758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 680 - 1013
Target Start/End: Complemental strand, 2405670 - 2405334
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||||||||    
T  2405670 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttttcctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattccctagttctacgatagttaacaa 2405571  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  2405570 aatagtcctaatcaatcaattgagttaggaccctctcctagggttacatcccttaattccttaggtggtctaatatctgtcgaaggtttaagcacgttaa 2405471  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  2405470 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgttatggtcagtagtcattc 2405371  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatat 1013  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||    
T  2405370 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatat 2405334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 2794422 - 2794048
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2794422 aacagaatataaagatagttttggaaagaaaaagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattctt 2794323  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-t 844  Q
     |||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| |    
T  2794322 atgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 2794223  T
Q  845 ggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 944  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2794222 ggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatta 2794123  T
Q  945 ggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2794122 ggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 2794048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 511 - 1017
Target Start/End: Original strand, 672861 - 673376
Alignment:
Q  511 actatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaagatgtataaaagttcttttaattt 609  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |  || |||||||||| ||||||||  |||    
T  672861 actatcgaagtagtaaaa-tattgttcccacaaggattgtttttaatctcaacaattcaagtacgttattaaataggatgtataaaggttcttttgtttt 672959  T
Q  610 gccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaat 706  Q
    | | ||||||||||||||| |||| ||| ||||  | ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||    
T  672960 gtcactaggcagttgattggtttgattggataaaagtaacgacataaaataaagattggttttaaagaataagagagagatgagatcatgtatttcgaat 673059  T
Q  707 catctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa--tagtcctaatcaatcccttgagt 804  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || |  ||||||  ||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  673060 catctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtaaatgattttctagttccacgatagttaaaaaaaaatagtctcaatcaatcccttgagt 673159  T
Q  805 taggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggatta 902  Q
    ||  ||||||||||     |||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  673160 taataccctcttctcaaactacaacccctaattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtacgttaacataatatcactaataaacgatta 673259  T
Q  903 tccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata- 1000  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||     
T  673260 ttcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcaatagtcattcattctcactaaatcatgtttatat 673359  T
Q  1001 ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    || ||||||||||||||    
T  673360 tttatcaggatataaaa 673376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 45941577 - 45941236
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  45941577 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 45941478  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  45941477 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggacccttttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 45941378  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45941377 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 45941278  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45941277 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 21107254 - 21107594
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  21107254 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcacctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21107353  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21107354 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 21107453  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21107454 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattc 21107553  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  21107554 attctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 21107594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Original strand, 49498457 - 49498801
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |   |||||  |||||||||||    
T  49498457 aagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaa 49498556  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49498557 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgt 49498656  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc-taagtcgaaagctgtggtcagtagtc 974  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49498657 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcttaagtagaaagctatggtcagtagtc 49498756  T
Q  975 attcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||| || ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  49498757 attcattatcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 49498801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 20399024 - 20398673
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  20399024 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 20398925  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  20398924 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttta 20398825  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||    
T  20398824 aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcaaagtagaaagctatggtc 20398725  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  20398724 agtagtgattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 20398673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 23021876 - 23022227
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    ||||||  ||||    
T  23021876 aaagaataagatagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatattctagttccacga 23021975  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt- 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  23021976 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagaccacagcccctaattccttaggtgatcaaataatctttgaaggtttt 23022075  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  23022076 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 23022175  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  23022176 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 23022227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 45960707 - 45961048
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  45960707 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataatgcacctatttgtattaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 45960806  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtta 877  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  45960807 aatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtta 45960906  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45960907 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcatt 45961006  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  45961007 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 45961048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 648 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 28111251 - 28110876
Alignment:
Q  648 aacagaaaataaagattggttt--aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattatt 745  Q
    ||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28111251 aacagaatataaagatagttttggaaagaataagagagagatgagatcagatctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctt 28111152  T
Q  746 gtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gt 844  Q
     |||| || |  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||    
T  28111151 atgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggt 28111052  T
Q  845 ggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28111051 ggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctatactaaccctatttattagaacaattcaatt 28110952  T
Q  944 aggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  28110951 ctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 28110876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Original strand, 37183825 - 37184167
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  37183825 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 37183924  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaa-gcacgtt 876  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  37183925 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtt 37184024  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  37184025 aacctaatatcactaacaaacggttatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaggatcagtagtcat 37184124  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  37184125 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 37184167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 41058265 - 41058605
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  41058265 agagagaagagattaggtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatgctgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 41058364  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41058365 aatagtcataatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtagtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 41058464  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41058465 cctattatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 41058564  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  41058565 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 41058605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 683 - 1018
Target Start/End: Original strand, 6070919 - 6071258
Alignment:
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | || || |  ||| ||  |||||||||||||||||    
T  6070919 gagatgagatcaggtttttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctatttccacgatagttaacaaaat 6071018  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacc 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  6071019 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacc 6071118  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6071119 taatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgt 6071218  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaag 1018  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  6071219 tctcactaaatcatgtttatatttgatcagtatataaaag 6071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 680 - 989
Target Start/End: Original strand, 21018430 - 21018740
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |  |   |||||  ||||||||||||||    
T  21018430 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgaacctattcttatgaatggttttttagttccacgatagttaacaa 21018529  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21018530 aatagtcctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 21018629  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21018630 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 21018729  T
Q  979 gttctcactaa 989  Q
     ||||||||||    
T  21018730 attctcactaa 21018740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 31205000 - 31204658
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| ||  |||||||||||||    
T  31205000 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaaca 31204901  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaag-cacgtt 876  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||  ||||||    
T  31204900 aaatatccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacgtt 31204801  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31204800 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 31204701  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  31204700 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 31204658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 725 - 1017
Target Start/End: Original strand, 49853086 - 49853381
Alignment:
Q  725 tggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggtt 824  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     |    
T  49853086 tggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgacagttaacaaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaact 49853185  T
Q  825 acagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatg 923  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  49853186 acagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcaataacaaacgattatccattcctagactaaccctg 49853285  T
Q  924 tttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  49853286 tttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 49853381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 331 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26908591 - 26908440
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  26908591 ttgttgaaacaaaaatatttttgatggatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaagttttattaatggtgatctactgatgtttgcacg 26908492  T
Q  431 tgagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtagcatcac 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26908491 tgagtcttttcacagacgtagacaagaagtaataccaaaccagtaacatcac 26908440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 679 - 985
Target Start/End: Original strand, 34732322 - 34732630
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| || || ||||||| ||||| ||||||    
T  34732322 gagagatatgagatcagttctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcaattatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac 34732421  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||     |||| |||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  34732422 aaaatagcccta-tcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaagtacatcccctaatttgttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgt 34732520  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  34732521 taacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaactatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagttatggtcagtagtca 34732620  T
Q  976 ttcgttctca 985  Q
    ||| ||||||    
T  34732621 ttcattctca 34732630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 678 - 968
Target Start/End: Original strand, 27355648 - 27355941
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattat-tgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||    || ||||||| ||||| |||||    
T  27355648 agagagagatgaaactaggtctttcgaat-atctgagtttccctaattggtacactgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaa 27355746  T
Q  777 c-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcac 873  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||| ||||||||| |||| || |||||||   ||||||||||| ||| ||    
T  27355747 ctaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaagaac 27355846  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtca 968  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27355847 gttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtca 27355941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 680 - 872
Target Start/End: Original strand, 21111121 - 21111314
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  21111121 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21111220  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagca 872  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21111221 aatagtcttaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagca 21111314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 766 - 989
Target Start/End: Original strand, 21434524 - 21434750
Alignment:
Q  766 acgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaag 863  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| |||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||   |||||||    
T  21434524 acgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaag 21434623  T
Q  864 gttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctg 962  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  21434624 gttttaagaacgttaacctaatataacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtataagttgaaagcta 21434723  T
Q  963 tggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21434724 tggtcagtagtcattcattctcactaa 21434750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 678 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 7635810 - 7635498
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcaccta-ttattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||    || ||||||| |||||  ||||    
T  7635810 agagagagattagactaggtctttcgaattctctaaattcccataattggtacactgcacctacttcctatgaatatttctctagtttcacgatgattaa 7635711  T
Q  777 c-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcac 873  Q
    | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||| ||    
T  7635710 ctaaaataaccctaatcaataccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaac 7635611  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagt 973  Q
    ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | || ||| ||||    
T  7635610 gttaacctcttattacaaataaacgattatctattcctagactgaccctgtttatttgaacaattcaatcaggtctaagttgaaagttatgatcaatagt 7635511  T
Q  974 cattcgttctcac 986  Q
    ||||| |||||||    
T  7635510 cattcattctcac 7635498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 693 - 985
Target Start/End: Original strand, 27331752 - 27332040
Alignment:
Q  693 taggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattat-tgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaa 790  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||   | ||||    || ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  27331752 taggtctttcgaatcctctgagtttccctaattggtacaatgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaa 27331851  T
Q  791 tcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagca-cgttaacctaatatca 888  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||       |||||  |||||| |||| || |||||||   ||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27331852 taaatcccttgacttaggaacctcttct-------cagcc--taattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaacaacgttaacctaatatca 27331942  T
Q  889 ctaataaaggattatcca-ttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctca 985  Q
    | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  27331943 caaataaacgattattcaattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctca 27332040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 680 - 802
Target Start/End: Original strand, 21114461 - 21114583
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  21114461 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21114560  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttga 802  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  21114561 aatagtcttaatcaatcccttga 21114583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 35756797 - 35756687
Alignment:
Q  348 tttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagtcttttcacagac 447  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |     
T  35756797 ttttttatgaatgttttaatgataacaaaccttatggaataaacactaaattttatgaatggtgatctactaatgtttgcacttaagtcttttcacaaaa 35756698  T
Q  448 gtagacaagaa 458  Q
    || ||||||||    
T  35756697 gttgacaagaa 35756687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5383511 - 5383400
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5383511 tgttaaaacaaaaatctttttgataaatattttaatgataataaaccttatggaataaaca-taagttttatgaatggtgatctactgatttttgtactt 5383413  T
Q  432 gagtcttttcaca 444  Q
    |||||||||||||    
T  5383412 gagtcttttcaca 5383400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 49331743 - 49331847
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49331743 ttgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcact 49331842  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  49331843 tgagt 49331847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18063864 - 18063761
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18063864 tgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatgttgatctactgatgtttgcactt 18063765  T
Q  432 gagt 435  Q
    ||||    
T  18063764 gagt 18063761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 865 - 1017
Target Start/End: Original strand, 11668175 - 11668329
Alignment:
Q  865 tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtg 964  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11668175 tttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagagtaaccatatttatttgaaaaattcaattcggtctaagttgaaagctatg 11668274  T
Q  965 gtcagtagtcattcgttctcac-taatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  11668275 gtcagtagtcattaattctcacaaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaa 11668329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Original strand, 41206859 - 41206963
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  41206859 ttgttgaagcaaaaatctttttgataaatgttttaatgataacaaacctcgtggaataaataataagttttatgaatggtaatctactgatggttgcact 41206958  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  41206959 tgagt 41206963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 718 - 867
Target Start/End: Original strand, 11667001 - 11667152
Alignment:
Q  718 ccctaattggtatactgcacctatta-ttgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctctt 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  ||| || || ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11667001 ccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgaatctctaatttcacaatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggatcctctt 11667100  T
Q  817 ctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt 867  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  11667101 ctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaatattatttgaaggttt 11667152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25825110 - 25825006
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25825110 ttgttgaagaaaaaaactttttgatgaatggtttaatgataacaaaccttgtggaataaatgataagttttatgaatattgatctactgatgtttgcact 25825011  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  25825010 tgagt 25825006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Original strand, 3796595 - 3796674
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  3796595 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 3796674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 679 - 742
Target Start/End: Original strand, 27536493 - 27536556
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536493 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatt 27536556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 678 - 896
Target Start/End: Original strand, 13430918 - 13431140
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcaccta-ttattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| || || |  ||||    || ||||||||||||| |||||    
T  13430918 agagagagatgagatcagggctttcgaatcctctgagttcccctaattggtacactgcacttagttctcatgaatatttctctagttttacgatggttaa 13431017  T
Q  777 ca-aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcac 873  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||| | ||||||||||| |||  ||||||  ||||||||| |||| | ||    
T  13431018 cttaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttacgaac 13431117  T
Q  874 gttaacctaatatcactaataaa 896  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  13431118 gttaacttaatatcacaaataaa 13431140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 778 - 894
Target Start/End: Original strand, 16055629 - 16055747
Alignment:
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 875  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  16055629 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaatgt 16055728  T
Q  876 taacctaatatcactaata 894  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  16055729 taacctaatatcacaaata 16055747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 562
Target Start/End: Original strand, 45960519 - 45960592
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  45960519 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 45960592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 900 - 978
Target Start/End: Original strand, 34066626 - 34066704
Alignment:
Q  900 ttatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  34066626 ttatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatcaaattaggtataagttgtaagctatggttagtagtcattc 34066704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 31205186 - 31205114
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  31205186 attttggcaagtgtaccaaatactattgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 31205114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 645 - 894
Target Start/End: Original strand, 16060893 - 16061148
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggtttaaagaataa--gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcaccta-t 741  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || | |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||||||| |    
T  16060893 aataacagaaaataaagattgtttggaaaagtaatggagagagatgagactaggtctttcgaatcatttgattttccctaattggtacactgcacctatt 16060992  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcct 840  Q
    | |  ||||    || |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||    |||||  |||||||||||    
T  16060993 tctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctcttctcatattacaatccctaattcct 16061092  T
Q  841 ta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaata 894  Q
    || ||| |||||||  ||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16061093 taggtgatctaatatactttataggtttgaagaacattaacctaatatcacaaata 16061148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 894
Target Start/End: Original strand, 16056843 - 16056982
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataac 855  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||   ||||||||||||| ||| |||||||      
T  16056843 ctagttttacgatgattaactaaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccctaattccttaggtgatctaatata 16056942  T
Q  856 ctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaata 894  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  16056943 ctttaaaggtttgaataacgttaacctaatatcacaaata 16056982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20448175 - 20448109
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20448175 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 20448109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20533942 - 20533876
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20533942 gcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggact-gtgttaatctcaat 20533876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 42022803 - 42022657
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtca------ctagttttacgata 771  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||| |||||  |||| ||||||||||| || |||| || | |      ||||||  || |||    
T  42022803 agagagagatgagactagatctttcgaatcctctgagttcctctaatcagtatgctgcacctattcttatgaatgaataagaatttctagttccactata 42022704  T
Q  772 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 818  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42022703 gttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 42022657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 17902553 - 17902619
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17902553 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 17902619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 481 - 538
Target Start/End: Original strand, 23021685 - 23021743
Alignment:
Q  481 actgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23021685 actgatagatattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 23021743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 562
Target Start/End: Original strand, 27536297 - 27536378
Alignment:
Q  482 ctgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc-cacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  27536297 ctgatagatattttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcacacgaggact-gtgttaatctcaat 27536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28111405 - 28111333
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  28111405 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 28111333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 2794575 - 2794504
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  2794575 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 2794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 16838709 - 16838765
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16838709 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 16838765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Original strand, 16848639 - 16848695
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16848639 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 16848695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 20981713 - 20981649
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaagga 545  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20981713 ctgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaagga 20981649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Original strand, 24200009 - 24200075
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24200009 tgataaaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaagactg 24200075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 37183639 - 37183681
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatat 532  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37183639 attttggcaagtgtaccatatactatcgaagtagtaaaaatat 37183681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Original strand, 23441050 - 23441095
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23441050 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 23441095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 478 - 538
Target Start/End: Original strand, 49498263 - 49498324
Alignment:
Q  478 atcactgataga-attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49498263 atcactgatagatattttagcaagcgtactaaatactgtcgaagtagtaaaaatatcgttcc 49498324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33898677 - 33898621
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactg 548  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33898677 ttggcaagtctaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacaaggactg 33898621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13405313 - 13405222
Alignment:
Q  344 aatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  || || |||   |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  13405313 aatcatttttatgaatattttaatgataacaaacctcgtggaacaaatgataagttttatgaatggtgatctagtgatgcttgaacttgagt 13405222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 836
Target Start/End: Original strand, 30938602 - 30938681
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaat 836  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||| ||||||||    
T  30938602 ctagtttcacgatggttaactaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggatcctcttataagattacaacccctaat 30938681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 28918716 - 28918663
Alignment:
Q  496 gcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28918716 gcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatattgttccacaaggactg 28918663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 482 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 37642215 - 37642156
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccac 540  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37642215 ctgatagatatttgacaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccac 37642156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20964800 - 20964734
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20964800 tgatagatatttggaaagtgtaccaataactatcaaagtactaataaatatcgttccacaaggactg 20964734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 867
Target Start/End: Original strand, 34065203 - 34065313
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcc-ttagtggtctaataacc 856  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||    |||||| | ||||| || || ||| |||||||| |    
T  34065203 ctagtttcacgatggttaaccaaatagccctaatcaatctcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataatc 34065302  T
Q  857 tttgaaggttt 867  Q
    |||||||||||    
T  34065303 tttgaaggttt 34065313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 926 - 976
Target Start/End: Original strand, 37891150 - 37891200
Alignment:
Q  926 tattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37891150 tatttgaacaattcaattaagtctaagtcgtaagctagggtcagtagtcat 37891200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20399191 - 20399154
Alignment:
Q  501 tgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20399191 tgtactaaatactatggaagtagtaaaaatatcgttcc 20399154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 952 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 42022570 - 42022533
Alignment:
Q  952 gtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42022570 gtcgaaagatatggtcagtagtcattcgttctcactaa 42022533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 482 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 15769 - 15423
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769 ctgatagatttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 15670  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagag 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15669 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattggtttgtttgcataagtaataacagaaaataaagattcatttaaagaataagag 15570  T
Q  682 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaa 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15569 agagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttgtgaatgagtcgctagttttacgatagttaacaaaa 15470  T
Q  782 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacag 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15469 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacag 15423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 483 - 1011
Target Start/End: Original strand, 1837 - 2370
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1837 tgatagaagtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtggtaaaaatatcgttcccacaagaactgattttaatctcaataattcaattacgttgtaag 1936  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataag 679  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||  ||| ||| ||||| | | |||||||||||||    
T  1937 ttaggatgtttaaaagttgttttgatt-gccactaggcggttgattggtttgtttgcataaatgtaacgacataaagtaaagttggttttaaagaataag 2035  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||| ||  |||||| |||||||    
T  2036 agagatatgagcttaggtctttagaatcatctatgttctccgaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatacttaacaa 2135  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2136 aatagccctaatcaatcccttgagttgggactctcttctaggattacagcccgtaatttcttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcacgttaa 2235  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||    
T  2236 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctagggccagtagtaattc 2335  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggat 1011  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  2336 gttctcaataaatcatatttatatttgatcaggat 2370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 678 - 1017
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3315
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  2966 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttacc 3065  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  3066 aaaatagtcctaatcaatccattgagttaggaccctcttctagtgttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaagcatgtt 3165  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct-------gtggtcag 969  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||    
T  3166 aacctaatatcactaataaaggattatccattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcag 3265  T
Q  970 tagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  3266 tagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 686
Target Start/End: Original strand, 2851 - 2942
Alignment:
Q  598 ttcttttaatttgccgctaggcagttgattgattt-gtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagaga 686  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2851 ttcttttgatttgccactaggaagttgattgtttttgtttgcataaaagtaatgacagaaattaaagattggtttagagaataagagagaga 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 677 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 293185 - 292842
Alignment:
Q  677 aagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaa 776  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  |||||||||||    
T  293185 aagagagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 293086  T
Q  777 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgt 875  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  293085 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgt 292986  T
Q  876 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  292985 taacctagtatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatcgtcagtagtca 292886  T
Q  976 ttcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  292885 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 292842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 293366 - 293294
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  293366 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatattgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 293294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3741 - 4092
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  3741 aaagaataagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 3840  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  3841 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 3940  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  3941 aagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtc 4040  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  4041 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 3561 - 3633
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttc-cacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  3561 attttagcaagtgtactaaatactattgaagtaataaaaatatcgttctcacgaggact-gtgttaatctcaat 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 670 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 19565 - 19214
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||    
T  19565 aaagaatgagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacga 19466  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  19465 tagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggtttt 19366  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  19365 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 19266  T
Q  968 agtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19265 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 19214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19744 - 19672
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  19744 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 19672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 489 - 1017
Target Start/End: Original strand, 57357 - 57893
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaa--atatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaa 585  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||  | |||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||||||  | || | | |||     
T  57357 aatttaggcaagtgcaccaattactatagaagtaacaaaataagatcgttcccacaagaactg-tattaacttcaataattcaatagctttattatttag 57455  T
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa--gcaataacagaaaataaagattggttt-aaagaataagaga 682  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||  ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  57456 gatgtataaaagttattttgttttgctactaggcagttgattggtttgattgcataaaagtaacgaca-aaaataaggattggttttaaagaataagaga 57554  T
Q  683 gagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaat 782  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  57555 gagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcacataattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagtttcacgatagttaacaaaat 57654  T
Q  783 agtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacc 880  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||     |||| ||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||     
T  57655 agtcctaatctatccattgagttagggccctcttctcaaactacatcccctgattgcttaggtggtctaatactctttgaaggttttacgaacgttaact 57754  T
Q  881 taatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgt 980  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  57755 taatatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatttttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcat 57854  T
Q  981 tctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  57855 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 57893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 5361 - 5702
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||| ||||||||||||||    
T  5361 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 5460  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttg-aaggtttaagcacgtta 877  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  5461 aatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgtta 5560  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5561 gcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 5660  T
Q  978 cgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  5661 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaa 5702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 491 - 562
Target Start/End: Original strand, 5175 - 5246
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  5175 ttttagcaagtgcactaaataccatcgaagtagtaaaaatatcgttaccacgaggact-gtgttaatctcaat 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 198306 - 197966
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |  ||||||  ||||||||||||||    
T  198306 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 198207  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  198206 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactatagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 198107  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  198106 cctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactattcctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 198007  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  198006 attctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 197966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 177; Significance: 8e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8522
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| || |  ||| ||  ||||||||||||||    
T  8182 agagagataagatcaggtctttcgaatcatttatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctatttccacgatagttaacaa 8281  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8282 aatagtcctaatcgatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 8381  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8382 cctaatatcacaaacaaacgattatccattcctagactaaccaagtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 8481  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  8482 attctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 8522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 680 - 943
Target Start/End: Original strand, 1512 - 1775
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    |||||||| || | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || |  ||||||  || |||||||||||    
T  1512 agagagattagatcagatctttcgaatcatatattttccc-taattggtaaactgcacctattcttatgaatgattgtctagttacacaatagttaacaa 1610  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||     |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  1611 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaagtttaagcacgttaa 1710  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1711 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaataattcaatt 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 923 - 1017
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4283
Alignment:
Q  923 gtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  4187 gtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaa 4283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 176; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 670 - 967
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 1
Alignment:
Q  670 aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacga 769  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||    
T  300 aaagaatgagagagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacga 201  T
Q  770 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-ttt 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  200 tagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 101  T
Q  868 aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtc 967  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  100 aagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 483 - 444
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaa 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  483 attttggcaagtgtaccaaatactattgaagtagtaaaaa 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 489 - 742
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14344
Alignment:
Q  489 aattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaaga 587  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  14091 aattttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaaaaatatctatcccacaaggattggttttaatctcaataattcaattacgtcgtaaattagga 14189  T
Q  588 tgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataagagagagat 687  Q
    ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14190 tgtataaagattcttttaattttccactaggcagttgattggtttgtttgcataagcaataacagaaaataaagattggttttaagaataaaagagagat 14289  T
Q  688 gagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14290 gagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatt 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 726 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 1362 - 1099
Alignment:
Q  726 ggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggtta 825  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  |  ||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1362 ggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggtta 1263  T
Q  826 cagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgt 924  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 tagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgt 1163  T
Q  925 ttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 ttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaa 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 491 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 4
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatc-----gttccacaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaacttaa 585  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      | |||| |||||| || |||||||||||    |||| | ||    | ||||    
T  262 ttttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatctatcattcccacgaggact-gtgttaatctcaatttagcaataaagtaaatatttaa 164  T
Q  586 gatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgc-ataa---gcaataacagaaaataaagattggttt--aaagaataag 679  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||     ||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||    
T  163 gatgtataaaagttcttttgaattgccactaggcagttgattggtttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaagaaaaag 64  T
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 742  Q
    |||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63 agaga---gagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 3246 - 3586
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||    
T  3246 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccataattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaa 3345  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||| |    
T  3346 atagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttta 3445  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3446 cctaatatcactaacaaacgattatccattcctaggttaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattc 3545  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  3546 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 562
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3128
Alignment:
Q  490 attttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgtt-ccacaaggactggttttaatctcaat 562  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  3056 attttagcaagtgtactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcccacgaggact-gtgttaatctcaat 3128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 680 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 5511 - 5171
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| || |   |||||  ||||||||||||||    
T  5511 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattgatatagtgcacctattcttatgaatgattttttagttccacgatagttaacaa 5412  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5411 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagaacgttaa 5312  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5311 cctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccctatttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattc 5212  T
Q  979 gttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
     |||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  5211 attctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaa 5171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 712 - 1017
Target Start/End: Original strand, 67520 - 67828
Alignment:
Q  712 atgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67520 atgttcccctaattggtatactgcacctattgttatgattgattctctagtaccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 67619  T
Q  812 ctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcc 910  Q
    |||||||     |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  67620 ctcttcttaaactacaactcctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggtttaagcatgttaacttaatatcactaacaaacgattatatattcc 67719  T
Q  911 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcag 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  67720 tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcag 67819  T
Q  1009 gatataaaa 1017  Q
    |||||||||    
T  67820 gatataaaa 67828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 483 - 716
Target Start/End: Original strand, 65087 - 65322
Alignment:
Q  483 tgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgtaac 581  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  65087 tgatagaattttggcaagtgaaccaaatactatccaagtagtaaaaatatcgttcccacgatgactgtttttaatctcaatatttcaattgcgttgtaaa 65186  T
Q  582 ttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcataa---gcaataacagaaaataaagattggtttaaagaataa 678  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||     | |||||| |||||| | || || | ||||||||    
T  65187 ataggatgtataaaagttcttttgatttgccactaggaatttgattgattcgattgcataaaattaactaacag-aaataatg-tttgtgttaagaataa 65284  T
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtt 716  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  65285 gagagagatgagtttaggtctttggaatcgtcgatgtt 65322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 171; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 679 - 1017
Target Start/End: Complemental strand, 89930 - 89588
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | | || || |  ||||||  |||||||||||||    
T  89930 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacatattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaaca 89831  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||| |||||||||    
T  89830 aaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagcacgtt 89731  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  89730 aacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtcat 89631  T
Q  977 tcgttctcact-aatcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  89630 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaa 89588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 167; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 680 - 953
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 6
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  280 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 181  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  180 catagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacttcagtccctaattgcttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 81  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 953  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80 cctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattaggtctaagt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 162; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 679 - 1016
Target Start/End: Original strand, 25 - 366
Alignment:
Q  679 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaaca 778  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | || || |  ||| ||  |||||||||||||    
T  25 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaaca 124  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttagt-ggtctaataacctttgaaggttta-agcacgtt 876  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||  || |||||    
T  125 aaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggcggtctaataatctttcaaggtttttagaacgtt 224  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcat 976  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  225 aacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttatcagaacaattcaattatatctaagtcgaaagctagggtcagtagtcat 324  T
Q  977 tcgttctcactaa-tcatattcata-ttgatcaggatataaa 1016  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  325 tcgttctcactaattcatgtttatatttgatcaggatataaa 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 680 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27005
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || || ||||||  | ||||||||||||    
T  27268 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaa 27169  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27168 aatagtcctaatcaatccattgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaaggtttaagcacgttaa 27069  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaat 942  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27068 cctaatatcacgaacaaacgattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaat 27005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 149; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 680 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 248677 - 248413
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |  ||||||  |||| |||||||||    
T  248677 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgagtgattttctagttccacgacagttaacaa 248578  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||      |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  248577 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttcacaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaatcatgttaa 248478  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 943  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248477 cctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 248413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 92784 - 92739
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  92784 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 92739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 148; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 680 - 933
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 89
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  344 agagagacgagatcagatctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttttacgatagttaacaa 245  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgtta 877  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  244 aatagtcttaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 145  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaa 933  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  144 acctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgattagtagaa 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 483
Alignment:
Q  491 ttttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 538  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  530 ttttagcaagtgcactaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 148; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 481 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 4275 - 3992
Alignment:
Q  481 actgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaaatatcgttcc-acaaggactggttttaatctcaataattcaattacgttgta 579  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4275 actgatagatgtttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaaaattattgttcccacaaggactgattttaatctcaataattcaattatgttgta 4176  T
Q  580 acttaagatgtataaaagttcttttaatttgccgctaggcagttgattgatttgtttgcat--aagcaataacagaaaataaagattggtttaaagaata 677  Q
    | ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  ||| ||  ||| ||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  4175 agttaggatgtataaaagttattttgatttgccactaggaagttgatttgtttgtttgcataaaagtaacgacaaaaagtaaaggttgattttaagaata 4076  T
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagtt 763  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4075 --agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagtt 3992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 147; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 681 - 1017
Target Start/End: Original strand, 118410 - 118749
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaa 780  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  |||||||||||| || |||| || || ||||||| | |||||||||||||    
T  118410 gagagatgatatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccttaattggtccactgcacctattcttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaacaaa 118508  T
Q  781 atagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagca--cgtta 877  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  |||||||||||| | ||  |||||    
T  118509 atagcactaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcgggttacagtctataattccttagatgatctaatattctttgaaggtttta-catgcgtta 118607  T
Q  878 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcatt 977  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  118608 acctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcatt 118707  T
Q  978 cgttctcactaa-tcatattcata-ttgatcaggatataaaa 1017  Q
    | ||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||    
T  118708 cattctcacgaattcatgtttatatttgatcaggatataaaa 118749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 794
Target Start/End: Original strand, 99233 - 99312
Alignment:
Q  715 ttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 794  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| || |||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  99233 ttcctctaattggttcactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaacaaaatagccataatcaa 99312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 142; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 822 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 14256 - 14091
Alignment:
Q  822 gttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacc 920  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14256 gttacagcccctaattccttaggtgatctaataaccgtcgaaggtttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacc 14157  T
Q  921 atgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtcattcgttctcac 986  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14156 atgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcac 14091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 766 - 989
Target Start/End: Complemental strand, 19422 - 19204
Alignment:
Q  766 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaagg 864  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  19422 acgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatctttgaagg 19323  T
Q  865 -tttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgt 963  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  19322 ttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacca-------tagaacaattcaattaggtctcagtcgaaagttat 19230  T
Q  964 ggtcagtagtcattcgttctcactaa 989  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19229 ggtcagtagtcattcgttctcactaa 19204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 125; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 681 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 2659 - 2385
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgt------gaaggagtcactagttttacgatagtt 774  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |      ||| || |  ||||||  |||||||||    
T  2659 gagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttattcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 2560  T
Q  775 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataacctttgaaggttt-aagca 872  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  2559 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcatactacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagca 2460  T
Q  873 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagac--taaccatgtttattagaacaattcaattag 945  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2459 cgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactataaccatgtttattagaacaattcagttag 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 678 - 904
Target Start/End: Complemental strand, 241661 - 241434
Alignment:
Q  678 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaac 777  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||    
T  241661 agagagatatgagatcagatctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 241562  T
Q  778 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgtt 876  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     | ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  241561 aaaatagtcgtaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactgcaggccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaagcacatt 241462  T
Q  877 aacctaatatcactaataaaggattatc 904  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  241461 aacctagtatcactaacaaatgattatc 241434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 95; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 645 - 806
Target Start/End: Original strand, 7637 - 7801
Alignment:
Q  645 aataacagaaaataaagattggttt---aaagaataagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctat 741  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7637 aataacagaaaataaagatagttttgaaaaagaataggagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctat 7736  T
Q  742 tattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 806  Q
    | || |||| || |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7737 tcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 93; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 680 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 1
Alignment:
Q  680 agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaa 779  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||    
T  224 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactacac-tgttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 126  T
Q  780 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggtttaagcacgttaa 878  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||     |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  125 aatagtcctaatcagtcccttgacttaggaccctattctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtcaaataatctttgaaagtttaagcatgttaa 26  T
Q  879 cctaatatcactaataaaggattat 903  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  25 cctaatatcactaacaaacgattat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 90; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 694 - 854
Target Start/End: Original strand, 844 - 1005
Alignment:
Q  694 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaggagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatca 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  844 aggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatca 943  T
Q  794 atcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataa 854  Q
    |||||||| |||||||||||||| |     |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  944 atcccttgggttaggaccctcttttcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataa 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16696 - 16570
Alignment:
Q  332 tgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcactt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16696 tgttgaatcaaaaatctttttgatgaatgttttaataataacaaaccttatggaataaacactaaattttatgaatggtgatctactgatgtttgcactt 16597  T
Q  432 gagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
      ||||||||||| | || ||||||||    
T  16596 aggtcttttcacataagttgacaagaa 16570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 83; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 2900 - 3029
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaag--ttttatgaatggtgatttactgatgtttgca 428  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2900 ttgttgaaccaaaaatcattttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgaaataaacgctaagttttttatgaacggtgatctactgatgtttgca 2999  T
Q  429 cttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  3000 cttaagtcttttcagagaagtagacaagaa 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 80; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 758 - 978
Target Start/End: Original strand, 48443 - 48666
Alignment:
Q  758 ctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttag-tggtctaataac 855  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||| || || ||||      
T  48443 ctagtttcacgatggtcaactaaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagattacggtccctaattccttaggtgatccaatatt 48542  T
Q  856 ctttgaaggtttaa-gcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtc 954  Q
    |||||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||     
T  48543 ctttgaaggttttatgaatgttaacataatatcacaaataaacgattatccattcctaggctaaccttgtttacttgaacaattcaattaggtcaaagtt 48642  T
Q  955 gaaagctgtggtcagtagtcattc 978  Q
    | |||||  |||||||||||||||    
T  48643 gtaagctagggtcagtagtcattc 48666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 75; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 681 - 986
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9789
Alignment:
Q  681 gagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgt-gaaggagtcactagttttacgatagttaac-a 778  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    | |||    || ||| ||| ||||| |||||| |    
T  10099 gagagatgagactatgtcttttgaatcctctgagttcccctaattggtacactgcacctatttccttcgaatatttctctaatttcacgatggttaacca 10000  T
Q  779 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattcctta-gtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 876  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||| ||| | |||||   ||||||||||| ||| | |||    
T  9999 aaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattagagtccctaattccttatgtgttataatattatttgaaggttttaagaaagtt 9900  T
Q  877 aacct-aatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctgtggtcagtagtca 975  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||    
T  9899 aaccttaatatcacaaataaacaattaccaattcctagactaactctgtttattcgatcaattcaattaggtctaagttgaaagttatggtcaataatca 9800  T
Q  976 ttcgttctcac 986  Q
    ||| |||||||    
T  9799 ttcattctcac 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12161 - 12052
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12161 ttgttgaaacaaaaatcttttttatcaatgatttattgataacaactcttatgaaataaacactaagttctatgaatggtgatctactcatgtttgcact 12062  T
Q  431 tgagtctttt 440  Q
    | ||||||||    
T  12061 taagtctttt 12052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5170 - 5066
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5170 ttgttgaagcaaaaatctttttgatgaatgttataatgataacaaacctcgtggaatatatgataagttttatgaatggtgatctactgatgtttgcact 5071  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  5070 tgagt 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 427
Target Start/End: Original strand, 7803 - 7899
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgc 427  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7803 ttgttgaaccaaaaatctttctgacgattgttttaatgataacaaactttatagaataaacactaagttttatgaatggtgatctactgatgtttgc 7899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 651
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  755 ttgttgaagcaaaaatctttttgataaatgttttaatgataacaaacctcgtggaataaataataagttttatgaatggtaatctactgatggttgcact 656  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  655 tgagt 651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 331 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4064 - 3960
Alignment:
Q  331 ttgttgaaacaaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcact 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4064 ttgttgaagcaaaaatctttttgataaatgttttattgataacaaacctcgtggaataaataataagttttatgaatggtgatctactgatggttgcact 3965  T
Q  431 tgagt 435  Q
    |||||    
T  3964 tgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2603 - 2509
Alignment:
Q  341 aaaaatctttttgatgaatgttttaatgataacaaaccttatgtaataaacactaagttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagt 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2603 aaaaatcattttgatgaatgttttaatgataaaaaacctcgtggaataaataataagttttatgaatggtaatctactgatggttgcacttgagt 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 458
Target Start/End: Original strand, 2910 - 2971
Alignment:
Q  397 gttttatgaatggtgatttactgatgtttgcacttgagtcttttcacagacgtagacaagaa 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  2910 gttttatgaatggtgatatactgatgtttgcacttaagtctttccaaagaagtagacaagaa 2971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Original strand, 28433 - 28490
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28433 tttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 28490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 492 - 548
Target Start/End: Original strand, 26652 - 26709
Alignment:
Q  492 tttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26652 tttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 26709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27705 - 27649
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaaggactg 548  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27705 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgttccacaaggactg 27649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 493 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 1744 - 1691
Alignment:
Q  493 ttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa-aaatatcgttccacaagga 545  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1744 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaagaaatatcgttccacaagga 1691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 526
Target Start/End: Original strand, 24184 - 24228
Alignment:
Q  482 ctgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24184 ctgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa 24228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 31; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Original strand, 33727 - 33772
Alignment:
Q  480 cactgatagaattttggcaagtgtaccaaatactatcgaagtagtaa 526  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33727 cactgatagatatttggcaagtgtaccaaa-actatcgaagtagtaa 33772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University