View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19633_low_21 (Length: 209)

Name: NF19633_low_21
Description: NF19633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19633_low_21
NF19633_low_21
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-209)||(66290-66498)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (1-209)||(53588-53796)
scaffold0031 (75-209)||(36041-36169)
scaffold0031 (56-122)||(36352-36419)
scaffold0031 (158-209)||(65838-65889)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (1-209)||(11312671-11312879)
chr7 (1-209)||(12318150-12318358)
chr7 (5-209)||(13635348-13635552)
chr7 (1-209)||(15605147-15605356)
chr7 (5-209)||(16583279-16583482)
chr7 (1-209)||(15580714-15580922)
chr7 (1-209)||(70640-70848)
chr7 (1-209)||(74749-74957)
chr7 (1-209)||(33130-33338)
chr7 (1-209)||(12714887-12715096)
chr7 (1-209)||(12718691-12718900)
chr7 (1-209)||(16114264-16114473)
chr7 (1-209)||(16117417-16117626)
chr7 (1-209)||(16907075-16907284)
chr7 (1-209)||(18283389-18283598)
chr7 (46-209)||(39722289-39722452)
chr7 (1-209)||(9593369-9593576)
chr7 (1-209)||(18279426-18279635)
chr7 (1-209)||(26292418-26292627)
chr7 (1-209)||(12704533-12704742)
chr7 (1-209)||(12723602-12723811)
chr7 (1-209)||(18933-19140)
chr7 (5-209)||(11987235-11987439)
chr7 (5-209)||(14429909-14430120)
chr7 (1-155)||(9644384-9644539)
chr7 (5-209)||(12321620-12321832)
chr7 (1-209)||(8917450-8917657)
chr7 (1-208)||(13149179-13149385)
chr7 (56-209)||(13918710-13918861)
chr7 (73-209)||(9751703-9751845)
chr7 (1-209)||(2760157-2760373)
chr7 (56-209)||(1859016-1859167)
chr7 (1-209)||(13461784-13461992)
chr7 (56-209)||(25927433-25927584)
chr7 (73-209)||(2832389-2832532)
chr7 (5-209)||(3271849-3272061)
chr7 (81-209)||(16457312-16457439)
chr7 (98-209)||(7519331-7519439)
chr7 (5-208)||(6801237-6801439)
chr7 (5-209)||(16724510-16724712)
chr7 (5-209)||(17701524-17701726)
chr7 (73-209)||(39267847-39267990)
chr7 (77-209)||(2530342-2530473)
chr7 (1-209)||(15728348-15728555)
chr7 (1-209)||(14216938-14217145)
chr7 (98-206)||(18425464-18425566)
chr7 (75-209)||(45169961-45170089)
chr7 (23-91)||(2530040-2530108)
chr7 (5-209)||(18556996-18557199)
chr7 (1-209)||(9446033-9446249)
chr7 (1-77)||(16438909-16438985)
chr7 (42-209)||(35151629-35151795)
chr7 (5-149)||(20569474-20569619)
chr7 (161-209)||(16275515-16275563)
chr7 (1-44)||(48593331-48593374)
chr7 (1-62)||(42205284-42205345)
chr7 (165-209)||(42204020-42204064)
chr7 (52-122)||(45170268-45170339)
chr7 (159-209)||(19649530-19649580)
chr7 (165-209)||(20569643-20569687)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (1-209)||(17804220-17804428)
chr6 (1-209)||(25767043-25767251)
chr6 (16-209)||(22429920-22430113)
chr6 (1-209)||(14472294-14472501)
chr6 (1-209)||(18955638-18955846)
chr6 (1-209)||(22862969-22863177)
chr6 (1-209)||(19870613-19870822)
chr6 (19-209)||(1644728-1644918)
chr6 (1-209)||(11566885-11567094)
chr6 (1-209)||(23395091-23395300)
chr6 (1-209)||(23989943-23990152)
chr6 (19-209)||(8243884-8244074)
chr6 (1-209)||(12706713-12706920)
chr6 (19-209)||(18917159-18917349)
chr6 (1-208)||(16741231-16741437)
chr6 (1-209)||(12618719-12618927)
chr6 (5-209)||(18907137-18907349)
chr6 (1-209)||(5616689-5616897)
chr6 (56-209)||(23414669-23414820)
chr6 (56-209)||(27556427-27556578)
chr6 (5-209)||(19662794-19662996)
chr6 (1-209)||(2685194-2685400)
chr6 (1-208)||(9482168-9482374)
chr6 (1-208)||(22592679-22592884)
chr6 (5-85)||(27415821-27415901)
chr6 (1-208)||(12496333-12496539)
chr6 (71-209)||(16523330-16523474)
chr6 (1-209)||(20907856-20908072)
chr6 (5-209)||(19790657-19790870)
chr6 (19-155)||(21834782-21834916)
chr6 (1-209)||(1587606-1587813)
chr6 (1-209)||(20803428-20803636)
chr6 (98-209)||(27325581-27325701)
chr6 (1-209)||(18180520-18180734)
chr6 (56-209)||(27416124-27416269)
chr6 (75-206)||(16624158-16624283)
chr6 (98-209)||(21766721-21766839)
chr6 (75-209)||(31477765-31477893)
chr6 (75-206)||(16760321-16760446)
chr6 (75-209)||(22949131-22949259)
chr6 (75-209)||(22953087-22953215)
chr6 (75-209)||(23871575-23871703)
chr6 (75-209)||(23875531-23875659)
chr6 (56-149)||(31478076-31478169)
chr6 (8-124)||(15894310-15894427)
chr6 (103-206)||(1644314-1644415)
chr6 (157-209)||(19848034-19848086)
chr6 (5-124)||(21739900-21740020)
chr6 (103-206)||(31478209-31478310)
chr6 (56-141)||(1644462-1644548)
chr6 (159-209)||(27553612-27553662)
chr6 (157-209)||(15041589-15041641)
chr6 (5-206)||(22408183-22408391)
chr6 (165-209)||(23657468-23657512)
chr6 (157-209)||(23992457-23992509)
chr6 (159-209)||(15894479-15894529)
chr6 (42-209)||(21702311-21702477)
chr6 (5-54)||(16523281-16523330)
chr6 (1-122)||(23657295-23657416)
chr6 (8-138)||(25642064-25642196)
chr6 (165-209)||(27567656-27567700)
chr6 (56-122)||(16760068-16760135)
chr6 (158-209)||(19873146-19873197)
chr6 (56-122)||(22948881-22948948)
chr6 (56-122)||(22952837-22952904)
chr6 (56-122)||(23871325-23871392)
chr6 (56-122)||(23875281-23875348)
chr6 (88-209)||(22074174-22074303)
chr6 (176-209)||(19863004-19863037)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (1-209)||(20461375-20461583)
chr3 (5-209)||(15482686-15482890)
chr3 (1-209)||(7793224-7793433)
chr3 (5-209)||(327043-327248)
chr3 (1-209)||(2897698-2897906)
chr3 (1-209)||(30065972-30066180)
chr3 (1-209)||(11854759-11854967)
chr3 (1-209)||(11070094-11070302)
chr3 (1-209)||(11165404-11165612)
chr3 (1-209)||(55022893-55023101)
chr3 (1-209)||(31097429-31097638)
chr3 (1-209)||(15617400-15617609)
chr3 (1-209)||(14499351-14499559)
chr3 (1-209)||(7109724-7109933)
chr3 (1-209)||(7113659-7113868)
chr3 (1-209)||(22336745-22336954)
chr3 (1-209)||(27409518-27409727)
chr3 (1-209)||(28949750-28949959)
chr3 (1-209)||(22321690-22321899)
chr3 (1-209)||(15849960-15850165)
chr3 (1-154)||(11300386-11300539)
chr3 (5-209)||(18383795-18384006)
chr3 (5-209)||(19725790-19726001)
chr3 (5-209)||(322618-322829)
chr3 (1-209)||(16797929-16798136)
chr3 (5-209)||(12496283-12496495)
chr3 (1-209)||(16808756-16808963)
chr3 (1-209)||(17241997-17242203)
chr3 (1-209)||(3402830-3403047)
chr3 (5-209)||(11298407-11298618)
chr3 (5-209)||(11862819-11863031)
chr3 (56-209)||(5223088-5223239)
chr3 (56-209)||(15464889-15465040)
chr3 (73-209)||(14665427-14665570)
chr3 (73-209)||(14668583-14668726)
chr3 (1-208)||(38814409-38814615)
chr3 (1-209)||(3389810-3390027)
chr3 (14-209)||(11851607-11851810)
chr3 (1-208)||(3833699-3833905)
chr3 (5-209)||(1982689-1982901)
chr3 (56-209)||(12339490-12339641)
chr3 (45-209)||(12037871-12038042)
chr3 (112-209)||(8489459-8489553)
chr3 (56-209)||(11300696-11300847)
chr3 (5-209)||(11595017-11595230)
chr3 (75-206)||(16750543-16750668)
chr3 (102-209)||(11854441-11854545)
chr3 (75-209)||(4111204-4111332)
chr3 (75-209)||(15964995-15965123)
chr3 (75-209)||(15968919-15969047)
chr3 (75-209)||(15972843-15972971)
chr3 (75-209)||(19775791-19775919)
chr3 (75-209)||(4107352-4107480)
chr3 (159-209)||(12172822-12172872)
chr3 (75-209)||(37439591-37439719)
chr3 (1-209)||(11557259-11557475)
chr3 (45-124)||(12172924-12173004)
chr3 (5-209)||(42325967-42326180)
chr3 (56-141)||(4589039-4589125)
chr3 (56-149)||(19775515-19775608)
chr3 (5-109)||(15060427-15060532)
chr3 (103-206)||(4589172-4589273)
chr3 (103-206)||(19775374-19775475)
chr3 (1-65)||(26190883-26190947)
chr3 (122-208)||(15941902-15941985)
chr3 (159-209)||(12511087-12511137)
chr3 (159-209)||(23053128-23053178)
chr3 (159-209)||(46822295-46822345)
chr3 (5-105)||(15051655-15051756)
chr3 (5-109)||(16909885-16909990)
chr3 (122-208)||(1598477-1598560)
chr3 (161-209)||(16696809-16696857)
chr3 (176-209)||(14878574-14878607)
chr3 (46-110)||(23052996-23053061)
chr3 (157-209)||(30029870-30029922)
chr3 (56-122)||(15964745-15964812)
chr3 (56-122)||(15968669-15968736)
chr3 (56-122)||(15972593-15972660)
chr3 (159-209)||(15051534-15051584)
chr3 (159-209)||(15060310-15060360)
chr3 (159-209)||(15878092-15878142)
chr3 (159-209)||(16909768-16909818)
chr3 (5-109)||(16369543-16369648)
chr3 (176-209)||(17525216-17525249)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-209)||(24735426-24735634)
chr2 (1-209)||(10101520-10101728)
chr2 (1-149)||(19688631-19688779)
chr2 (19-209)||(24649380-24649570)
chr2 (1-209)||(12901386-12901595)
chr2 (1-209)||(27379307-27379516)
chr2 (1-209)||(27383353-27383562)
chr2 (1-209)||(27601819-27602028)
chr2 (1-209)||(24628353-24628562)
chr2 (1-209)||(41530884-41531087)
chr2 (5-209)||(25963595-25963806)
chr2 (3-209)||(22811787-22812002)
chr2 (5-209)||(22461068-22461270)
chr2 (1-208)||(19928377-19928583)
chr2 (1-124)||(15477711-15477835)
chr2 (5-209)||(25961413-25961625)
chr2 (56-209)||(31344901-31345052)
chr2 (1-208)||(18855336-18855541)
chr2 (8-209)||(40428489-40428699)
chr2 (1-209)||(21327441-21327658)
chr2 (5-209)||(23187099-23187302)
chr2 (5-209)||(23598362-23598565)
chr2 (1-209)||(24716405-24716619)
chr2 (1-209)||(21318510-21318727)
chr2 (96-209)||(21916069-21916189)
chr2 (75-209)||(30344946-30345074)
chr2 (5-209)||(37524701-37524905)
chr2 (1-209)||(60840-61046)
chr2 (5-209)||(24174826-24175038)
chr2 (13-124)||(24673697-24673809)
chr2 (102-209)||(41666973-41667078)
chr2 (75-209)||(1283412-1283540)
chr2 (1-209)||(27263296-27263504)
chr2 (5-209)||(24655217-24655429)
chr2 (5-94)||(21918194-21918284)
chr2 (165-209)||(24869906-24869950)
chr2 (159-209)||(22799167-22799217)
chr2 (8-125)||(22758596-22758715)
chr2 (157-209)||(25616215-25616267)
chr2 (8-138)||(22740841-22740973)
chr2 (159-203)||(23019747-23019791)
chr2 (165-209)||(24673595-24673639)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-209)||(12927-13135)
scaffold0044 (1-209)||(19211-19419)
scaffold0044 (105-209)||(62284-62386)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-209)||(36133837-36134045)
chr4 (1-209)||(17810295-17810503)
chr4 (1-209)||(14757297-14757505)
chr4 (1-209)||(9556553-9556762)
chr4 (1-209)||(27534049-27534257)
chr4 (1-209)||(4561208-4561417)
chr4 (1-209)||(1951636-1951843)
chr4 (1-209)||(5756812-5757021)
chr4 (1-209)||(18222253-18222460)
chr4 (1-209)||(33742401-33742609)
chr4 (73-208)||(22634369-22634504)
chr4 (1-209)||(17152362-17152568)
chr4 (1-209)||(18228728-18228935)
chr4 (5-209)||(16487956-16488168)
chr4 (1-208)||(26243540-26243746)
chr4 (1-208)||(23139296-23139501)
chr4 (5-209)||(16356831-16357042)
chr4 (5-209)||(3412822-3413023)
chr4 (1-208)||(16243275-16243481)
chr4 (1-208)||(19757476-19757682)
chr4 (1-208)||(19782124-19782330)
chr4 (1-209)||(18236915-18237123)
chr4 (56-209)||(43256343-43256494)
chr4 (5-209)||(16348543-16348754)
chr4 (73-209)||(20157407-20157550)
chr4 (1-208)||(2014803-2015009)
chr4 (5-85)||(43256040-43256120)
chr4 (73-209)||(13812966-13813109)
chr4 (5-207)||(9530460-9530660)
chr4 (5-209)||(5338859-5339072)
chr4 (75-209)||(10712876-10713004)
chr4 (75-209)||(10926646-10926774)
chr4 (8-124)||(12570142-12570259)
chr4 (1-209)||(15353181-15353398)
chr4 (5-149)||(25555599-25555744)
chr4 (5-209)||(11250439-11250652)
chr4 (75-209)||(14954122-14954250)
chr4 (75-209)||(25689893-25690021)
chr4 (104-209)||(28569423-28569526)
chr4 (102-209)||(14708611-14708716)
chr4 (93-208)||(45938173-45938284)
chr4 (103-206)||(15224821-15224922)
chr4 (5-96)||(18602624-18602715)
chr4 (6-114)||(44675762-44675872)
chr4 (75-209)||(12487734-12487862)
chr4 (42-209)||(42997366-42997532)
chr4 (5-77)||(18609218-18609290)
chr4 (13-114)||(23843608-23843711)
chr4 (165-209)||(25555506-25555550)
chr4 (159-209)||(12570040-12570090)
chr4 (75-149)||(15224962-15225035)
chr4 (157-209)||(15093801-15093853)
chr4 (56-122)||(14954433-14954500)
chr4 (56-122)||(25689643-25689710)
chr4 (5-141)||(16351727-16351864)
chr4 (176-209)||(23843504-23843537)
chr4 (45-102)||(15125071-15125130)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-209)||(16080319-16080527)
chr1 (1-209)||(36819183-36819392)
chr1 (16-209)||(24782990-24783183)
chr1 (1-209)||(1010746-1010954)
chr1 (1-209)||(20228683-20228892)
chr1 (1-209)||(16375332-16375541)
chr1 (1-209)||(21407378-21407587)
chr1 (1-209)||(52639564-52639773)
chr1 (1-209)||(19211891-19212098)
chr1 (5-209)||(23819178-23819381)
chr1 (5-209)||(18181999-18182211)
chr1 (5-209)||(22449144-22449356)
chr1 (5-209)||(12646895-12647097)
chr1 (1-209)||(20138107-20138314)
chr1 (56-209)||(33797306-33797457)
chr1 (1-207)||(18882393-18882598)
chr1 (5-85)||(33797680-33797760)
chr1 (1-206)||(46975494-46975698)
chr1 (5-209)||(3472804-3473013)
chr1 (1-209)||(18393838-18394056)
chr1 (1-209)||(8761507-8761724)
chr1 (1-209)||(45310241-45310459)
chr1 (1-209)||(17678462-17678676)
chr1 (5-116)||(21022767-21022879)
chr1 (5-209)||(45489621-45489834)
chr1 (75-209)||(1925084-1925212)
chr1 (75-209)||(20924098-20924226)
chr1 (5-124)||(22831256-22831375)
chr1 (75-206)||(39244096-39244221)
chr1 (75-206)||(39247651-39247776)
chr1 (75-206)||(41388196-41388321)
chr1 (1-209)||(3704939-3705155)
chr1 (5-124)||(6151976-6152096)
chr1 (56-141)||(20229075-20229161)
chr1 (8-114)||(42865092-42865200)
chr1 (98-209)||(21788014-21788133)
chr1 (160-209)||(33050067-33050116)
chr1 (103-206)||(20229208-20229309)
chr1 (157-209)||(22468735-22468787)
chr1 (159-209)||(20135217-20135267)
chr1 (175-209)||(21313151-21313185)
chr1 (165-209)||(21022657-21022701)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-209)||(3750-3958)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-209)||(18507-18715)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (4-207)||(13365-13568)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-209)||(173315-173521)
scaffold0001 (1-209)||(422406-422622)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-209)||(2548-2755)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (1-209)||(65402-65611)
scaffold0029 (19-209)||(61505-61695)
scaffold0029 (1-209)||(80738-80943)
scaffold0029 (103-206)||(80321-80422)
scaffold0029 (77-149)||(80462-80533)
scaffold0029 (159-209)||(12789-12839)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (5-209)||(23535468-23535670)
chr5 (8-209)||(15236662-15236863)
chr5 (1-209)||(20295870-20296079)
chr5 (1-209)||(19472594-19472803)
chr5 (71-209)||(17410463-17410601)
chr5 (1-209)||(18774227-18774435)
chr5 (5-209)||(21366544-21366755)
chr5 (1-209)||(42805444-42805651)
chr5 (1-207)||(20232577-20232781)
chr5 (1-209)||(26742621-26742828)
chr5 (1-209)||(18784070-18784278)
chr5 (56-209)||(20911101-20911252)
chr5 (1-209)||(26666006-26666212)
chr5 (1-209)||(26937603-26937809)
chr5 (1-208)||(33409253-33409459)
chr5 (16-209)||(24532938-24533129)
chr5 (73-207)||(24767493-24767634)
chr5 (56-209)||(18355981-18356132)
chr5 (1-208)||(16674177-16674383)
chr5 (1-208)||(17718314-17718520)
chr5 (6-140)||(20910680-20910813)
chr5 (1-209)||(23451374-23451588)
chr5 (5-209)||(20805578-20805788)
chr5 (5-85)||(18356474-18356554)
chr5 (1-209)||(23458618-23458832)
chr5 (1-209)||(23462879-23463093)
chr5 (5-209)||(12028443-12028656)
chr5 (8-209)||(20767000-20767207)
chr5 (1-209)||(21340642-21340848)
chr5 (20-149)||(22757219-22757349)
chr5 (5-209)||(123184-123396)
chr5 (75-209)||(10753387-10753515)
chr5 (102-209)||(21885166-21885271)
chr5 (1-209)||(25229281-25229488)
chr5 (1-209)||(25293437-25293644)
chr5 (146-209)||(40723607-40723670)
chr5 (77-209)||(1858929-1859067)
chr5 (1-209)||(26172488-26172696)
chr5 (1-209)||(17919026-17919242)
chr5 (56-149)||(10753111-10753204)
chr5 (1-209)||(4036243-4036451)
chr5 (5-209)||(24221903-24222115)
chr5 (165-209)||(26680608-26680652)
chr5 (165-209)||(26952215-26952259)
chr5 (8-114)||(14079278-14079386)
chr5 (103-206)||(10752970-10753071)
chr5 (157-209)||(17517240-17517292)
chr5 (165-209)||(31342173-31342217)
chr5 (1-33)||(17410646-17410678)
chr5 (77-149)||(31342219-31342291)
chr5 (56-122)||(11220521-11220588)
chr5 (56-122)||(11228930-11228997)
chr5 (56-122)||(11230919-11230986)
chr5 (57-122)||(11226940-11227006)
chr5 (159-209)||(23201386-23201436)
chr5 (159-209)||(23512124-23512174)
chr5 (159-209)||(23572110-23572160)
chr5 (176-209)||(14079175-14079208)
chr5 (176-209)||(21873280-21873313)
chr5 (165-209)||(22757151-22757195)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-209)||(19892-20099)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-209)||(228252-228455)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-209)||(12445-12653)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (2-209)||(16231351-16231557)
chr8 (19-209)||(43251836-43252026)
chr8 (1-209)||(19278157-19278366)
chr8 (1-209)||(21972459-21972668)
chr8 (1-209)||(21976544-21976753)
chr8 (1-209)||(22044908-22045115)
chr8 (1-179)||(22111904-22112083)
chr8 (5-209)||(20465917-20466129)
chr8 (5-154)||(18619555-18619705)
chr8 (1-209)||(23834196-23834404)
chr8 (1-141)||(22028647-22028788)
chr8 (5-209)||(30643169-30643382)
chr8 (1-209)||(30308629-30308835)
chr8 (13-209)||(15602903-15603107)
chr8 (5-209)||(16410133-16410344)
chr8 (5-209)||(17926585-17926796)
chr8 (1-208)||(23846890-23847096)
chr8 (13-209)||(15611355-15611559)
chr8 (56-209)||(14398039-14398190)
chr8 (7-209)||(20856305-20856515)
chr8 (1-208)||(15538473-15538679)
chr8 (1-208)||(15531914-15532119)
chr8 (75-209)||(21387097-21387228)
chr8 (82-209)||(21383677-21383801)
chr8 (75-209)||(18862600-18862728)
chr8 (75-209)||(21827969-21828097)
chr8 (5-109)||(377414-377519)
chr8 (8-124)||(24755842-24755959)
chr8 (1-209)||(16861201-16861415)
chr8 (1-209)||(22010553-22010765)
chr8 (42-209)||(32605234-32605400)
chr8 (5-109)||(19259460-19259565)
chr8 (80-209)||(21410973-21411096)
chr8 (80-209)||(21805465-21805588)
chr8 (77-209)||(39094875-39095015)
chr8 (1-208)||(17828458-17828663)
chr8 (42-209)||(32598702-32598868)
chr8 (157-209)||(18678141-18678193)
chr8 (157-209)||(32121762-32121814)
chr8 (98-209)||(23776807-23776926)
chr8 (160-209)||(17055412-17055461)
chr8 (8-114)||(19983223-19983331)
chr8 (159-209)||(377297-377347)
chr8 (159-209)||(24755740-24755790)
chr8 (8-114)||(19899225-19899333)
chr8 (56-122)||(18862911-18862978)
chr8 (56-122)||(21828280-21828347)
chr8 (159-209)||(17353984-17354034)
chr8 (159-209)||(19259632-19259682)
chr8 (159-209)||(21162099-21162149)
chr8 (159-209)||(21168772-21168822)
chr8 (162-208)||(24445541-24445587)
chr8 (8-110)||(16184862-16184966)
chr8 (176-209)||(19983119-19983152)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (19-209)||(4994-5184)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-209)||(58593-58802)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-209)||(35817-36025)
scaffold0109 (1-209)||(6968-7175)
scaffold0109 (161-209)||(11336-11384)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (5-209)||(9544-9748)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-209)||(3405-3612)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-131)||(10459-10589)
scaffold0004 (158-209)||(69820-69871)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-209)||(18235-18442)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (1-209)||(4456-4672)
scaffold0676 (75-209)||(473-602)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-209)||(24843-25051)
scaffold0012 (75-209)||(189332-189460)
scaffold0012 (56-122)||(189643-189710)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (5-209)||(185-398)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (2-209)||(5612-5826)
scaffold0476 (2-209)||(6807-7021)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (5-209)||(419-631)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (1-159)||(1-160)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (5-209)||(42653-42860)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (5-209)||(1520-1731)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (1-209)||(6132-6339)
scaffold0546 (161-209)||(1923-1971)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-209)||(15113-15328)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (45-209)||(6227-6399)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (5-209)||(18534-18746)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (5-209)||(46605-46817)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (5-209)||(23240-23443)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (71-209)||(17056-17202)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-209)||(1364-1580)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (13-209)||(9539-9741)
scaffold0104 (13-209)||(1856-2059)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (5-209)||(1962-2175)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-208)||(9928-10134)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (1-208)||(63878-64084)
scaffold0042 (8-208)||(75762-75961)
scaffold0042 (8-124)||(34791-34908)
scaffold0042 (159-209)||(34960-35010)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (5-155)||(21447-21597)
scaffold0037 (77-141)||(80642-80706)
scaffold0037 (103-206)||(80754-80855)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-208)||(18379-18585)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (73-207)||(9990-10131)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (5-209)||(44107-44318)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (56-209)||(6704-6855)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (56-209)||(30908-31059)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (46-132)||(928-1014)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (73-207)||(2933-3074)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (13-209)||(923-1126)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (5-85)||(71460-71540)
scaffold0003 (1-208)||(139736-139941)
scaffold0003 (77-209)||(71092-71215)
scaffold0003 (5-208)||(413929-414140)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (56-209)||(20395-20546)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (56-209)||(207768-207931)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (5-209)||(6294-6505)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (5-152)||(19170-19317)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-209)||(5875-6082)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (83-209)||(73725-73857)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (3-209)||(35387-35602)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-208)||(9445-9651)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-208)||(36331-36536)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (5-209)||(8586-8799)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-146)||(4099-4245)
scaffold0184 (165-209)||(4273-4317)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (8-209)||(19613-19823)
scaffold0017 (8-209)||(15091-15301)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (2-209)||(315-520)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-209)||(30619-30833)
scaffold0008 (102-209)||(1900-2005)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (5-209)||(7497-7709)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-209)||(77045-77253)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (75-209)||(11456-11584)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (75-209)||(14042-14170)
scaffold0141 (56-122)||(14353-14420)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (8-149)||(192198-192340)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (5-209)||(392-580)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (5-109)||(6956-7061)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (8-85)||(15300-15376)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (19-124)||(13969-14075)
scaffold0056 (159-209)||(14127-14177)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (8-114)||(3872-3980)
scaffold0149 (8-114)||(8303-8411)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (45-124)||(2960-3040)
scaffold0158 (45-124)||(6626-6706)
scaffold0158 (160-209)||(2858-2907)
scaffold0158 (160-209)||(6524-6573)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (98-209)||(38451-38570)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (5-209)||(1818-2029)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (161-209)||(9358-9406)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (2-209)||(2311-2527)
scaffold0439 (2-209)||(10171-10387)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (102-209)||(8523-8628)
scaffold0111 (102-209)||(15667-15772)
scaffold0111 (45-125)||(32554-32636)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (112-209)||(4790-4895)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (102-209)||(16640-16745)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (75-190)||(439-548)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (161-207)||(15363-15409)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (75-209)||(32615-32743)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (8-125)||(15550-15669)
scaffold0297 (176-209)||(15737-15770)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (96-199)||(33583-33694)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (29-209)||(7173-7361)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (159-209)||(6121-6171)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (159-209)||(16389-16439)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (165-209)||(2194-2238)
scaffold0410 (77-149)||(11472-11544)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (8-140)||(174871-175005)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (159-209)||(21844-21894)
scaffold0210 (159-209)||(29736-29786)
scaffold0210 (5-61)||(21684-21740)
scaffold0210 (5-61)||(29576-29632)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (158-208)||(48500-48550)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (159-209)||(14690-14740)
scaffold0081 (159-209)||(23705-23755)
scaffold0081 (159-209)||(39129-39179)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (8-125)||(18334-18453)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 66290 - 66498
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66290 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 66389  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  66390 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 66489  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  66490 gttgcatga 66498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53796 - 53588
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53796 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 53697  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53696 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 53597  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  53596 gttgcatga 53588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 36041 - 36169
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  36041 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 36134  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36135 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 36169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 36352 - 36419
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36352 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 65838 - 65889
Alignment:
Q  158 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 65889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11312879 - 11312671
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312879 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 11312780  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11312779 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 11312680  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  11312679 gttgcatga 11312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12318358 - 12318150
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318358 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 12318259  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12318258 attacttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 12318159  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  12318158 gttgcatga 12318150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 13635348 - 13635552
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635348 ttaggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 13635447  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13635448 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 13635547  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  13635548 catga 13635552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15605147 - 15605356
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605147 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 15605246  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15605247 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 15605346  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |  |||||||    
T  15605347 aaatgcatga 15605356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16583482 - 16583279
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16583482 ttaggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattgcatta 16583384  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16583383 cttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttg 16583284  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  16583283 catga 16583279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15580922 - 15580714
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15580922 aactttaggttatagtgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgc 15580823  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15580822 attacttgaattattattgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaa 15580723  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  15580722 gttgcatga 15580714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 70640 - 70848
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  70640 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 70739  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  70740 attacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 70839  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  70840 gttgcatga 70848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 74749 - 74957
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  74749 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 74848  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  74849 attacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 74948  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  74949 gttgcatga 74957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33338 - 33130
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33338 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 33239  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33238 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactca 33139  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  33138 gttgcatga 33130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12715096 - 12714887
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12715096 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 12714997  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714996 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 12714897  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  12714896 agttacatga 12714887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12718900 - 12718691
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12718900 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 12718801  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718800 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 12718701  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  12718700 agttacatga 12718691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16114473 - 16114264
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16114473 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 16114374  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114373 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 16114274  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  16114273 agttacatga 16114264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16117626 - 16117417
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16117626 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 16117527  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117526 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 16117427  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  16117426 agttacatga 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16907075 - 16907284
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16907075 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 16907174  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907175 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 16907274  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  16907275 agttacatga 16907284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18283598 - 18283389
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18283598 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 18283499  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283498 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 18283399  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  18283398 agttacatga 18283389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722289
Alignment:
Q  46 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 145  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 39722353  T
Q  146 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722352 gttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39722289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9593576 - 9593369
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||    
T  9593576 aactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgc 9593477  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9593476 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 9593379  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  9593378 agttgcatga 9593369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18279635 - 18279426
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18279635 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 18279536  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279535 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 18279436  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  18279435 agttacatga 18279426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26292627 - 26292418
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26292627 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 26292528  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292527 cattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 26292428  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  26292427 agttgcatga 26292418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12704533 - 12704742
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12704533 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatg 12704632  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704633 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 12704732  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  12704733 agttacatga 12704742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12723811 - 12723602
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12723811 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 12723712  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723711 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaacta 12723612  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  12723611 agttacatga 12723602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18933 - 19140
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||     
T  18933 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgt 19032  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19033 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 19130  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  19131 agttgcatga 19140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11987439 - 11987235
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaa-gatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||| |||||||||||||    
T  11987439 ttaggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattgcatt 11987340  T
Q  104 -acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11987339 tacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 11987242  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  11987241 tgcatga 11987235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14430120 - 14429909
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14430120 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 14430021  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14430020 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaa 14429922  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  14429921 ctaagttgcatga 14429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9644539 - 9644384
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||    
T  9644539 aactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgc 9644440  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644439 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 12321620 - 12321832
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12321620 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 12321719  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321720 acttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 12321818  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||||    
T  12321819 actacgttgcatga 12321832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8917657 - 8917450
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||    
T  8917657 aactttgggtgctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 8917558  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  8917557 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaacta 8917460  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  8917459 agttgcatga 8917450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13149385 - 13149179
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  13149385 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 13149286  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  13149285 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 13149188  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  13149187 agttgcatg 13149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918861
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 13918861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751845
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 165  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  166 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 9751845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2760373 - 2760157
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||    
T  2760373 aactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 2760275  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2760274 cattacttgagatattattgaatgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgtta 2760175  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2760174 tttaactaagttgcatga 2760157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859167
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1859115 aagc--ttgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 1859167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13461992 - 13461784
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||    
T  13461992 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattgattg 13461893  T
Q  100 -cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  13461892 tttttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaact 13461795  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    || ||||||||    
T  13461794 aatttgcatga 13461784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927584
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatttttatt 25927531  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25927532 aag--tttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 25927584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832532
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||      ||||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 2832532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3272061 - 3271849
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3272061 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcatt 3271962  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3271961 acttgaa-tattattgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 3271864  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||||||    
T  3271863 aaccaagttgcatga 3271849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 16457312 - 16457439
Alignment:
Q  81 gtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 179  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16457312 gtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatga 16457439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 7519331 - 7519439
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7519331 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 7519427  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||    
T  7519428 taagttggatga 7519439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6801439 - 6801237
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-cat 102  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |    
T  6801439 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgccct 6801340  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  6801339 tacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgt 6801243  T
Q  203 tgcatg 208  Q
    ||||||    
T  6801242 tgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16724510 - 16724712
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgca-t 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  | |    
T  16724510 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 16724608  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16724609 tatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagt 16724705  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  16724706 tgcatga 16724712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 17701524 - 17701726
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgca-t 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  | |    
T  17701524 ttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 17701622  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17701623 tatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagt 17701719  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  17701720 tgcatga 17701726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267990
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 39267990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 2530342 - 2530473
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttga-tgtgatctgat 175  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||    
T  2530342 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgattatgatttgat 2530439  T
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2530440 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 2530473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15728555 - 15728348
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| ||||||  |     
T  15728555 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaata 15728457  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15728456 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 15728359  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  15728358 aagttgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14217145 - 14216938
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  14217145 aactgtaggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattgaaata 14217047  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14217046 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaact 14216949  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  14216948 aagttgcatga 14216938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18425566 - 18425464
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||  |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18425566 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaac 18425473  T
Q  198 taagttgca 206  Q
    |||||||||    
T  18425472 taagttgca 18425464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 45169961 - 45170089
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  45169961 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 45170054  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  45170055 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 45170089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  23 tatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattg 91  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18557199 - 18556996
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt-gcatt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||  |  ||| ||||   |||||| | |||    
T  18557199 ttaggtgctagtgagacctattaaagatattatctgagaactgtgaagcc-ttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatt 18557101  T
Q  104 -acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18557100 tacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 18557003  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  18557002 tgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9446033 - 9446249
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  9446033 aactttaggtagtaatgaaacatatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 9446132  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  9446133 cattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgtta 9446231  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9446232 tttaactaagttgcatga 9446249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16438909 - 16438985
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 77  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  16438909 aactttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattat 16438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35151795 - 35151629
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  35151795 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttgcttgaattattgttgaatgatgaagaagctattga 35151697  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
      |||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35151696 gtatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 35151629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Original strand, 20569474 - 20569619
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |  ||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  20569474 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 20569573  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  20569574 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 20569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275515
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 48593331 - 48593374
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa 44  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593331 aactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaa 48593374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 42205345 - 42205284
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaa 62  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42205345 aactttaggtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaa 42205284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42204064 - 42204020
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42204064 tgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatga 42204020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 45170268 - 45170339
Alignment:
Q  52 gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  45170268 gctattatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 45170339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649580
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19649580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 20569643 - 20569687
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20569643 tgtgatatgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 20569687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17804428 - 17804220
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804428 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 17804329  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17804328 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 17804229  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  17804228 gttgcatga 17804220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25767043 - 25767251
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25767043 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgattgc 25767142  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25767143 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaa 25767242  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  25767243 gttgcatga 25767251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22429920 - 22430113
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429920 tgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 22430019  T
Q  116 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22430020 attaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatga 22430113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14472501 - 14472294
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14472501 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 14472402  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14472401 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtta-ttaactaa 14472303  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  14472302 gttgcatga 14472294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18955638 - 18955846
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18955638 aactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgattgc 18955737  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18955738 attacttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaa 18955837  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  18955838 gttgcatga 18955846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22863177 - 22862969
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22863177 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 22863078  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22863077 attacttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 22862978  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  22862977 gttgcatga 22862969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19870822 - 19870613
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19870822 aactttaggtacatagtgtgacctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 19870723  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870722 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 19870623  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  19870622 agttacatga 19870613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1644918 - 1644728
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644918 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 1644819  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1644818 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatga 1644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11567094 - 11566885
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11567094 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 11566995  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566994 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 11566895  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  11566894 agttacatga 11566885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23395300 - 23395091
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23395300 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 23395201  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395200 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 23395101  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  23395100 agttacatga 23395091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23990152 - 23989943
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23990152 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 23990053  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990052 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 23989953  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  23989952 agttacatga 23989943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8244074 - 8243884
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8244074 gacctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 8243975  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8243974 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatga 8243884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12706920 - 12706713
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  12706920 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgc 12706821  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12706820 atttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 12706723  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  12706722 agttgcatga 12706713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 18917159 - 18917349
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18917159 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattatt 18917258  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917259 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18917349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16741437 - 16741231
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  16741437 aactttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgc 16741338  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  16741337 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaacta 16741240  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  16741239 agttgcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12618719 - 12618927
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12618719 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattg 12618818  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618819 cattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 12618917  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  12618918 agttacatga 12618927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18907349 - 18907137
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18907349 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcatt 18907250  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907249 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 18907151  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    |||||| |||||||    
T  18907150 actaagctgcatga 18907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5616689 - 5616897
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  5616689 aactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattg 5616788  T
Q  100 catt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5616789 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 5616886  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  5616887 aagttgcatga 5616897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414669
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 23414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556427
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 27556427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19662996 - 19662794
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  19662996 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 19662897  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  19662896 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 19662800  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  19662799 gcatga 19662794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2685194 - 2685400
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  2685194 aactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 2685293  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2685294 ccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 2685390  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  2685391 tgttgcatga 2685400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 9482168 - 9482374
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| ||||||||||    
T  9482168 aactttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgattgc 9482267  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  9482268 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaacta 9482365  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  9482366 agttgcatg 9482374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 22592679 - 22592884
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  22592679 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 22592777  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||| | | |||||||||||||    
T  22592778 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctacaaatgttatttaacta 22592875  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  22592876 agttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 27415821 - 27415901
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27415821 ttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12496539 - 12496333
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  12496539 aactttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattgattgc 12496440  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12496439 ctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgt---tgtgatctgattatgctgcaaatgttatttaact 12496343  T
Q  199 aagttgcatg 208  Q
    ||||||||||    
T  12496342 aagttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523474
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    ||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  164 atgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16523474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20907856 - 20908072
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgatt 98  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |    
T  20907856 aactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaat 20907954  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  20907955 gcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 20908053  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20908054 atttaactaagttgcatga 20908072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 19790657 - 19790870
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  19790657 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 19790756  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790757 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 19790856  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  19790857 actaagttgcatga 19790870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 21834782 - 21834916
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  21834782 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattat 21834879  T
Q  118 tgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834880 tgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1587606 - 1587813
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--att 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| |||||  ||     
T  1587606 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaata 1587704  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1587705 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 1587802  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  1587803 aagttgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20803428 - 20803636
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--att 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||     
T  20803428 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 20803527  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20803528 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 20803625  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||    
T  20803626 aagctgcatga 20803636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 27325581 - 27325701
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 188  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27325581 tgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattg 27325680  T
Q  189 ttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27325681 ttaattaactaagttgcatga 27325701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18180734 - 18180520
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||| || | || || ||||| | || |||||||||||| ||||| | ||    
T  18180734 aactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 18180636  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18180635 cattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 18180537  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18180536 ttaaccaagttgcatga 18180520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416269
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 27416222  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27416223 aagc--ttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 27416269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16624283 - 16624158
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||   ||||| |||  |||    
T  16624283 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaag--tttgatatgaattga 16624190  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16624189 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16624158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766721
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  190 tatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatga 21766721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 31477765 - 31477893
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  31477765 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 31477858  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  31477859 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 31477893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16760446 - 16760321
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  16760446 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 16760353  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  16760352 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgca 16760321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22949259 - 22949131
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  22949259 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 22949166  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  22949165 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 22949131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22953215 - 22953087
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  22953215 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 22953122  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  22953121 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 22953087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23871703 - 23871575
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  23871703 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 23871610  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23871609 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 23871575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23875659 - 23875531
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  23875659 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 23875566  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23875565 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 23875531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 15894310 - 15894427
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15894310 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15894409  T
Q  107 tgaattattattgaatga 124  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  15894410 tgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1644415 - 1644314
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1644415 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 1644318  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  1644317 tgca 1644314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848086
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 19848086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 21739900 - 21740020
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21739900 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcatt 21739999  T
Q  104 acttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  21740000 acttgaaatgttaatgaatga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Original strand, 31478209 - 31478310
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31478209 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 31478306  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  31478307 tgca 31478310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1644548 - 1644462
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1644548 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaa 1644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553662
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatga 27553662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041641
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatga 15041641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 22408183 - 22408391
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || | |||| |||||||||| |||| ||| | ||||||  || || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  22408183 ttaggtagtagtaagacttatttaagatgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 22408281  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||   ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22408282 acttgaaatattcttgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatactgcttttgttattta 22408380  T
Q  196 actaagttgca 206  Q
    || ||||||||    
T  22408381 accaagttgca 22408391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 23657468 - 23657512
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23657468 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 23657512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992457
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatga 23992457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894529
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 15894529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21702477 - 21702311
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | || |||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  21702477 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactttcttgaatttttgttgaatgatcaagaaactattga 21702379  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
      |||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21702378 gtatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatga 21702311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 16523281 - 16523330
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagct 54  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16523281 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagct 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 23657295 - 23657416
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||  || |||| | |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||   || ||||||||||||  |||| | |||    
T  23657295 aactttaggtagtaatatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaatgc 23657394  T
Q  101 attacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  23657395 attacttgatttattcttgaat 23657416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 25642064 - 25642196
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25642064 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 25642163  T
Q  106 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 138  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  25642164 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 27567656 - 27567700
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  27567656 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatga 27567700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16760135 - 16760068
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16760135 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 16760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19873146
Alignment:
Q  158 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19873146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948881
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952837
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22952837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871325
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875281
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 22074174 - 22074303
Alignment:
Q  88 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattat 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || |    
T  22074174 attgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaaatgttgctg-aaatgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgt 22074272  T
Q  179 gctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  22074273 gctgttattattatttaactatgatgcatga 22074303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19863004
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 19863004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20461375 - 20461583
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461375 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 20461474  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461475 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 20461574  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  20461575 gttgcatga 20461583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15482890 - 15482686
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482890 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 15482791  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15482790 cttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 15482691  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  15482690 catga 15482686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7793224 - 7793433
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7793224 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgattgc 7793323  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctg-attatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7793324 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaacta 7793423  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  7793424 agttgcatga 7793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 327043 - 327248
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327043 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 327142  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga-ttatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  327143 cttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagtt 327242  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  327243 gcatga 327248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2897698 - 2897906
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897698 aactttaggtaatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 2897797  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897798 attactggaattattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 2897897  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  2897898 gttgcatga 2897906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30066180 - 30065972
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30066180 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 30066081  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066080 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 30065981  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  30065980 gttgcatga 30065972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11854967 - 11854759
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854967 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 11854868  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11854867 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaa 11854768  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  11854767 gttgcatga 11854759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11070302 - 11070094
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11070302 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 11070203  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11070202 attacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 11070103  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  11070102 gttgcatga 11070094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11165404 - 11165612
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11165404 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 11165503  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165504 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 11165603  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    ||| |||||    
T  11165604 gttacatga 11165612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 55023101 - 55022893
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55023101 aactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 55023002  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55023001 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaa 55022902  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    ||| |||||    
T  55022901 gttacatga 55022893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 31097429 - 31097638
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||     
T  31097429 aactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattgattc 31097528  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31097529 cactacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaacta 31097628  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  31097629 tgttgcatga 31097638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15617609 - 15617400
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  15617609 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatta 15617510  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617509 cattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 15617410  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  15617409 agttgcatga 15617400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14499559 - 14499351
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14499559 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgc 14499460  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14499459 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaa 14499360  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  14499359 gttgcatga 14499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7109933 - 7109724
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7109933 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 7109834  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109833 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 7109734  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  7109733 agttacatga 7109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7113868 - 7113659
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7113868 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 7113769  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113768 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 7113669  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  7113668 agttacatga 7113659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22336954 - 22336745
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22336954 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 22336855  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336854 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 22336755  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  22336754 agttacatga 22336745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27409518 - 27409727
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27409518 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 27409617  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409618 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 27409717  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  27409718 agttacatga 27409727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28949959 - 28949750
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28949959 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 28949860  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949859 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 28949760  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  28949759 agttacatga 28949750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22321899 - 22321690
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321899 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 22321800  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321799 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 22321700  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  22321699 agttacatga 22321690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15849960 - 15850165
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15849960 aactttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgattgc 15850059  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15850060 ataacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaattgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaa 15850156  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  15850157 gttgcatga 15850165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 11300386 - 11300539
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300386 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 11300485  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11300486 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18383795 - 18384006
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18383795 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcatt 18383894  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383895 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 18383993  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  18383994 ctaagttgcatga 18384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 19725790 - 19726001
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| | ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19725790 ttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacatt 19725889  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-------aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725890 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 19725988  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  19725989 ctaagttgcatga 19726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 322829 - 322618
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  322829 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 322730  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  322729 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaa 322631  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  322630 ctaagttgcatga 322618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16797929 - 16798136
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||     
T  16797929 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 16798028  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||    
T  16798029 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaacta 16798126  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  16798127 tgttgcatga 16798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12496495 - 12496283
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  12496495 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 12496397  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12496396 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 12496298  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  12496297 aactaagttgcatga 12496283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16808756 - 16808963
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||     
T  16808756 aactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 16808855  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||    
T  16808856 atttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaacta 16808953  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
      ||||||||    
T  16808954 tattgcatga 16808963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17242203 - 17241997
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  17242203 aactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 17242104  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17242103 ccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 17242007  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  17242006 tgttgcatga 17241997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3402830 - 3403047
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  3402830 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 3402929  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3402930 cattccttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgtta 3403029  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3403030 tttaactaagttgcatga 3403047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11298407 - 11298618
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11298407 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 11298505  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11298506 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 11298604  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11298605 actaagttgcatga 11298618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11863031 - 11862819
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  11863031 ttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcatt 11862932  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgat------gtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862931 acttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttattta 11862833  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11862832 actaagttgcatga 11862819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223088
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 5223141  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5223140 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatga 5223088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464889
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 15464889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665427
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 14665427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668583
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 164  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttga 14668628  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668627 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14668583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38814615 - 38814409
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || ||||||     
T  38814615 aactttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgc 38814516  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  38814515 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 38814418  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  38814417 agttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3389810 - 3390027
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  3389810 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 3389909  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3389910 cattacttgatttattcttgaaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgtta 3390009  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3390010 tttaactaagttgcatga 3390027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11851810 - 11851607
Alignment:
Q  14 aatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatt 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11851810 aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11851711  T
Q  113 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11851710 attattgaatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttg 11851612  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  11851611 catga 11851607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3833905 - 3833699
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  3833905 aactttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 3833806  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  3833805 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 3833708  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  3833707 agttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 1982689 - 1982901
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  1982689 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 1982788  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    |||||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1982789 cttgaactatttttgaatgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 1982888  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  1982889 ctaagttgcatga 1982901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339490
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 12339543  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |  |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339542 aaac--ttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 12339490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038042
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 143  Q
    ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaat 12037969  T
Q  144 gaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||        ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatga 12038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489553
Alignment:
Q  112 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 8489553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 11300696 - 11300847
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  11300696 ttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 11300794  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || | ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11300795 aaac-gtt-atgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatga 11300847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11595017 - 11595230
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11595017 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11595116  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11595117 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 11595216  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11595217 actaagttgcatga 11595230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 16750543 - 16750668
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  16750543 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 16750636  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16750637 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16750668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854441
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  11854448 ttgcatga 11854441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 4111204 - 4111332
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  4111204 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 4111297  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  4111298 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 4111332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15965123 - 15964995
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15965123 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15965030  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15965029 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15964995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15969047 - 15968919
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15969047 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15968954  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15968953 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15968919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15972971 - 15972843
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  15972971 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 15972878  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15972877 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 15972843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19775919 - 19775791
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  19775919 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 19775826  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  19775825 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 19775791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 4107352 - 4107480
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  4107352 tatactgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 4107445  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  4107446 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 4107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172822
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12172822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 37439591 - 37439719
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  37439591 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 37439684  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  37439685 ttatgctacaattgttgttaaactaagttgcatga 37439719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11557259 - 11557475
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  11557259 aactttaggtagtaatgaaacctatttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 11557358  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| |   ||| |||| ||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  11557359 cattacttgaattattcttgaataaattagatgttgatgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 11557457  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11557458 tttaactaagttgcatga 11557475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12173004 - 12172924
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12173004 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325967
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa-gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||| || |||  || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtttttta 42325981  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  42325980 actaagttgcatga 42325967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15060532 - 15060427
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15060532 ttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 15060433  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  15060432 acttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Original strand, 4589172 - 4589273
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4589172 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 4589269  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  4589270 tgca 4589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19775475 - 19775374
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19775475 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 19775378  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  19775377 tgca 19775374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 26190883 - 26190947
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatg 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  26190883 aactttaggtagtaatgagacctatttaagatgttaactgaaaattgtgaacctattttgaaatg 26190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Original strand, 15941902 - 15941985
Alignment:
Q  122 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15941902 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511087
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 12511087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053178
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23053178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822295
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15051756 - 15051655
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15051756 ttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 15051657  T
Q  104 ac 105  Q
    ||    
T  15051656 ac 15051655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16909990 - 16909885
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||    
T  16909990 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattttatt 16909891  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  16909890 acttga 16909885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 208
Target Start/End: Original strand, 1598477 - 1598560
Alignment:
Q  122 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1598477 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaat-gttatttaactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696809
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878607
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 14878607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 23052996 - 23053061
Alignment:
Q  46 tgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23052996 tgtgaagctattatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaa 23053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30029922 - 30029870
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30029922 gctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964745
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15964745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968669
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972593
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15972593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051534
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15051534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060310
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15060310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878142
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15878142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16909818 - 16909768
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16909818 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatga 16909768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16369648 - 16369543
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||   |  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  16369648 ttaggtagtaatgtgatctatataagatgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcatt 16369549  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  16369548 acttga 16369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525249
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 17525249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24735634 - 24735426
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24735634 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatcgc 24735535  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24735534 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 24735435  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  24735434 gttgcatga 24735426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10101520 - 10101728
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10101520 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 10101619  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101620 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 10101719  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  10101720 gttgcatga 10101728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 19688631 - 19688779
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688631 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 19688730  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688731 attacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24649570 - 24649380
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649570 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 24649471  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649470 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 24649380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 12901386 - 12901595
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12901386 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 12901485  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901486 cattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaacta 12901585  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  12901586 agttgcatga 12901595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27379307 - 27379516
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27379307 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 27379406  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379407 cattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 27379506  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  27379507 agttgcatga 27379516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27383353 - 27383562
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27383353 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 27383452  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383453 cattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 27383552  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  27383553 agttgcatga 27383562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27602028 - 27601819
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27602028 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 27601929  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601928 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 27601829  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  27601828 agttacatga 27601819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24628353 - 24628562
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24628353 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 24628452  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628453 cattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 24628552  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  24628553 agttacatga 24628562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 41530884 - 41531087
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41530884 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 41530983  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||| || |||||    
T  41530984 cattacttgaattattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaacta 41531077  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  41531078 agttgcatga 41531087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25963595 - 25963806
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  25963595 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 25963693  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  25963694 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattga 25963792  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  25963793 actaagttgcatga 25963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 22811787 - 22812002
Alignment:
Q  3 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattga-ttgc 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  22811787 ctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgc 22811886  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22811887 attacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttat 22811985  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  22811986 ttaactaagttgcatga 22812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22461068 - 22461270
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  22461068 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 22461167  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  22461168 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 22461264  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  22461265 gcatga 22461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 19928377 - 19928583
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || || | |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  19928377 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattgattgt 19928476  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19928477 ctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 19928574  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  19928575 agttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15477835 - 15477711
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15477835 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 15477736  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15477735 cattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 25961413 - 25961625
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25961413 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 25961512  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961513 cttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaa 25961612  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  25961613 ctaagttgcatga 25961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31345052 - 31344901
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31345052 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 31344954  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31344953 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatga 31344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 18855336 - 18855541
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |  |||  |||  | |||||||    
T  18855336 aactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtgattgc 18855435  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  18855436 ctttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaacta 18855532  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  18855533 agttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40428699 - 40428489
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  40428699 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 40428600  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    ||| ||||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  40428599 tgatttattcttaaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaact 40428500  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  40428499 aagttgcatga 40428489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21327441 - 21327658
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21327441 aactttaagtagtagtgagacatatttaaaatgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattg 21327540  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  21327541 cattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttgtt 21327639  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21327640 atttaaccaagttgcatga 21327658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23187302 - 23187099
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | ||    
T  23187302 ttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattt 23187203  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23187202 acttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23187105  T
Q  204 gcatga 209  Q
     |||||    
T  23187104 ccatga 23187099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23598565 - 23598362
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | ||    
T  23598565 ttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtattt 23598466  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23598465 acttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagtt 23598368  T
Q  204 gcatga 209  Q
     |||||    
T  23598367 ccatga 23598362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24716405 - 24716619
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| | ||    
T  24716405 aactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 24716503  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24716504 cattactagacatattattgaatgattatgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 24716602  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  24716603 ttaaccaagttgcatga 24716619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21318510 - 21318727
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||| |||    |||||||||  |||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21318510 aactttaagtagtagtgagacatatttaagatgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattg 21318609  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  21318610 cattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttgtt 21318708  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21318709 atttaaccaagttgcatga 21318727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Original strand, 21916069 - 21916189
Alignment:
Q  96 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||    
T  21916069 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  188 gttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatga 21916189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 30344946 - 30345074
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  30344946 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 30345039  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  30345040 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 30345074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37524905 - 37524701
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||   ||||||||||  |||||| || || | ||||||||||||||||||       ||||||||    
T  37524905 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgattta-------attgcatt 37524814  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||| |         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37524813 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaa-tgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttattta 37524715  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    || |||||||||||    
T  37524714 accaagttgcatga 37524701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 61046 - 60840
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  61046 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 60948  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  60947 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgat-tgattatgctgcaattgttattaaact 60851  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  60850 aagttgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24175038 - 24174826
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24175038 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24174939  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24174938 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 24174840  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  24174839 actaagttgcatga 24174826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24673809 - 24673697
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  24673809 taatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaa 24673710  T
Q  112 tattattgaatga 124  Q
    | ||| |||||||    
T  24673709 tgttaatgaatga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666973
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  41666980 ttgcatga 41666973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1283540 - 1283412
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  1283540 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1283447  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  1283446 ttatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatga 1283412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27263504 - 27263296
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||| | | || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  27263504 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 27263406  T
Q  99 gcattacttgaatt-attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
       || |||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  27263405 tacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 27263308  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  27263307 taagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 24655217 - 24655429
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24655217 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24655316  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  24655317 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttattta 24655415  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  24655416 actaagttgcatga 24655429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 21918194 - 21918284
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 94  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21918194 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869906
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 24869906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 22799167 - 22799217
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799167 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 22799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 22758596 - 22758715
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22758596 ggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22758695  T
Q  106 ttgaattattattgaatgat 125  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  22758696 ttgaattatgaatgaatgat 22758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616215
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Original strand, 22740841 - 22740973
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22740841 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22740940  T
Q  106 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 138  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  22740941 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 23019747 - 23019791
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019747 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagtt 23019791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24673639 - 24673595
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24673639 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatga 24673595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 189; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13135 - 12927
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13135 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 13036  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13035 attacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaa 12936  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  12935 gttgcatga 12927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19419 - 19211
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19419 aactttcggtactaatgagatatatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 19320  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19319 attactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaa 19220  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  19219 gttgcatga 19211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62284
Alignment:
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  62288 catga 62284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 5e-98; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 36133837 - 36134045
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133837 aactttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 36133936  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36133937 attacttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 36134036  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  36134037 gttgcatga 36134045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17810503 - 17810295
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17810503 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 17810404  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810403 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 17810304  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  17810303 gttgcatga 17810295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 14757297 - 14757505
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14757297 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 14757396  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14757397 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaa 14757496  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  14757497 gttgcatga 14757505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9556762 - 9556553
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9556762 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 9556663  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556662 cattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 9556563  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  9556562 agttgcatga 9556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27534257 - 27534049
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27534257 aactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattgc 27534158  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27534157 attacttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaa 27534058  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  27534057 gttgcatga 27534049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 4561208 - 4561417
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4561208 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 4561307  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4561308 cattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaacta 4561407  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  4561408 agttgcatga 4561417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1951636 - 1951843
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||    
T  1951636 aactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgc 1951735  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1951736 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 1951833  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  1951834 agttgcatga 1951843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5756812 - 5757021
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5756812 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 5756911  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5756912 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaacta 5757011  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  5757012 agttacatga 5757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18222253 - 18222460
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||     
T  18222253 aactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgt 18222352  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18222353 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 18222450  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  18222451 agttgcatga 18222460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33742609 - 33742401
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33742609 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattg 33742510  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742509 cattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 33742411  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  33742410 agttacatga 33742401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 208
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634504
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 172  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  173 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17152362 - 17152568
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||     
T  17152362 aactttaggtgttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgt 17152461  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  17152462 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 17152558  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  17152559 agttgcatga 17152568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18228728 - 18228935
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||     
T  18228728 aactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgt 18228827  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18228828 ctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaacta 18228925  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  18228926 agttgcatga 18228935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16487956 - 16488168
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16487956 ttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 16488055  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488056 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttattta 16488154  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  16488155 actaagttgcatga 16488168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 26243540 - 26243746
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||||    
T  26243540 aactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgc 26243639  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  26243640 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 26243737  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  26243738 agttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23139501 - 23139296
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  23139501 aactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 23139402  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23139401 ccatacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 23139305  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  23139304 agttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16356831 - 16357042
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16356831 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16356929  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16356930 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16357028  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  16357029 actaagttgcatga 16357042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3413023 - 3412822
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  |||    
T  3413023 ttaggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatt 3412926  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
      |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3412925 tattgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagtt 3412828  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  3412827 gcatga 3412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16243275 - 16243481
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| |||||||||     
T  16243275 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattgattgc 16243374  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16243375 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 16243472  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  16243473 agttgcatg 16243481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 19757476 - 19757682
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  19757476 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 19757575  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19757576 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 19757673  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  19757674 agttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19782330 - 19782124
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  19782330 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 19782231  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19782230 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 19782133  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  19782132 agttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18237123 - 18236915
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18237123 aactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattg 18237024  T
Q  100 catt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18237023 tatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaact 18236926  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  18236925 aagttgcatga 18236915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256494
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 43256441  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43256442 aagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatga 43256494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16348543 - 16348754
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16348543 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16348641  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16348642 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16348740  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  16348741 actaagttgcatga 16348754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157550
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||   |||     | |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatga 20157550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2015009 - 2014803
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  ||||| |  |||  ||| ||||||||||    
T  2015009 aactttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattgattgc 2014910  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2014909 ctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 2014812  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  2014811 agttgcatg 2014803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 43256040 - 43256120
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43256040 ttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 209
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813109
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 13813109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9530660 - 9530460
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||  |  |||  ||| || |||||| | ||    
T  9530660 ttaggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtgattgccttt 9530561  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||| |||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  9530560 actcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaactaagtt 9530464  T
Q  204 gcat 207  Q
    ||||    
T  9530463 gcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 5338859 - 5339072
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5338859 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcatt 5338958  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  5338959 acttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttattt 5339057  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    ||||| | |||||||    
T  5339058 aactatgatgcatga 5339072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10713004 - 10712876
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10713004 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10712911  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10712910 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10712876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10926774 - 10926646
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10926774 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10926681  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10926680 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10926646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12570259 - 12570142
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12570259 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 12570160  T
Q  107 tgaattattattgaatga 124  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  12570159 tgaaatgttaatgaatga 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15353181 - 15353398
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  15353181 aactttaggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 15353280  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||    
T  15353281 cattacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctgtt 15353379  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15353380 atttaactaagttgcatga 15353398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25555744 - 25555599
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  25555744 ttaggtagtaatgaaacttatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 25555645  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  25555644 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 25555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11250439 - 11250652
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  11250439 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11250538  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    || ||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  11250539 acatgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttattta 11250638  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11250639 actaagttgcatga 11250652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 14954122 - 14954250
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  14954122 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14954215  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14954216 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 14954250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25690021 - 25689893
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  25690021 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattga 25689928  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  25689927 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 25689893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 209
Target Start/End: Original strand, 28569423 - 28569526
Alignment:
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28569423 acttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 28569520  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  28569521 gcatga 28569526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 14708611 - 14708716
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||  | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14708611 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 14708708  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  14708709 ttgcatga 14708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45938284 - 45938173
Alignment:
Q  93 ttgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  45938284 ttgattgccttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 45938189  T
Q  193 ttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45938188 ttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15224922 - 15224821
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15224922 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 15224825  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  15224824 tgca 15224821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 18602624 - 18602715
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 96  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  18602624 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 44675872 - 44675762
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  44675872 taggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcatt 44675773  T
Q  104 acttgaattat 114  Q
    |||||| ||||    
T  44675772 acttgagttat 44675762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12487862 - 12487734
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  |||    
T  12487862 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 12487769  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  12487768 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatga 12487734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Original strand, 42997366 - 42997532
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||  | ||||    
T  42997366 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 42997464  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  42997465 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 42997532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 18609218 - 18609290
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 77  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  18609218 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattat 18609290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23843711 - 23843608
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||     
T  23843711 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgag 23843612  T
Q  111 ttat 114  Q
    ||||    
T  23843611 ttat 23843608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555506
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 25555506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12570040
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 12570040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15225035 - 15224962
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  15225035 tataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgtt-aaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15093853 - 15093801
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15093853 gctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatga 15093801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954500
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689643
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 25689643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 16351727 - 16351864
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  |  ||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  16351727 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 16351826  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||    
T  16351827 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa 16351864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843504
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 23843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Original strand, 15125071 - 15125130
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15125071 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16080319 - 16080527
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080319 aactttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 16080418  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16080419 attacttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaa 16080518  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  16080519 gttgcatga 16080527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 36819183 - 36819392
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36819183 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgattgc 36819282  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36819283 atttcttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 36819382  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  36819383 agttgcatga 36819392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24782990 - 24783183
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatt 115  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24782990 tgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattatt 24783089  T
Q  116 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783090 attgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 24783183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1010954 - 1010746
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1010954 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 1010855  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010854 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 1010755  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  1010754 gttgcatga 1010746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20228683 - 20228892
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20228683 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 20228782  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20228783 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaacta 20228882  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  20228883 agttgcatga 20228892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16375332 - 16375541
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16375332 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 16375431  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375432 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 16375531  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  16375532 agttacatga 16375541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21407587 - 21407378
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21407587 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 21407488  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407487 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 21407388  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  21407387 agttacatga 21407378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52639773 - 52639564
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52639773 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 52639674  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639673 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaacta 52639574  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  52639573 agttacatga 52639564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19212098 - 19211891
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||     
T  19212098 aactttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgt 19211999  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19211998 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 19211901  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  19211900 agttgcatga 19211891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 23819178 - 23819381
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  23819178 ttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtcttt 23819277  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23819278 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagtt 23819375  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  23819376 gcatga 23819381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18181999 - 18182211
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  18181999 ttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcatt 18182098  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||        ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182099 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 18182197  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  18182198 actaagttgcatga 18182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22449144 - 22449356
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  22449144 ttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 22449243  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22449244 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaa 22449343  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  22449344 ctaagttgcatga 22449356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12647097 - 12646895
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  12647097 ttaggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgccctt 12646998  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  12646997 acttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgtt 12646901  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  12646900 gcatga 12646895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20138314 - 20138107
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||| ||||    
T  20138314 aactttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattggttgc 20138215  T
Q  101 atta-cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20138214 ctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 20138117  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  20138116 agttgcatga 20138107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797306
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 33797306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18882598 - 18882393
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||| |||||| |   ||  ||| || | |||||    
T  18882598 aactttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaataattgc 18882499  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  18882498 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaacta 18882401  T
Q  200 agttgcat 207  Q
    ||||||||    
T  18882400 agttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33797760 - 33797680
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797760 ttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46975698 - 46975494
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||  || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  46975698 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgt 46975599  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  46975598 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 46975501  T
Q  200 agttgca 206  Q
    |||||||    
T  46975500 agttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3473013
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | || ||    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaa-tgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaat 3472901  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttga------tgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |  ||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472902 tacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttg-aagtgatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 3473000  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  3473001 ctaagttgcatga 3473013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18393838 - 18394056
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  18393838 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 18393937  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat-gaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |        ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||    
T  18393938 cattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 18394037  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18394038 atttaactaagttgcatga 18394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 8761507 - 8761724
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8761507 aactttaggtagtagtgaaacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattg 8761606  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  8761607 cattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgtt 8761705  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  8761706 atttaactatgatgcatga 8761724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 45310241 - 45310459
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  45310241 aactttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 45310340  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |        ||||   || || |||||||||||||||||||| | |||    
T  45310341 cattgcttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgtt 45310440  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45310441 atttaactaagttgcatga 45310459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17678462 - 17678676
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||| || |||| || ||||| | || |||||| ||||| ||||| | ||    
T  17678462 aactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaatg 17678560  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17678561 cattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 17678659  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17678660 ttaaccaagttgcatga 17678676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 21022879 - 21022767
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21022879 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcatt 21022780  T
Q  104 acttgaattatta 116  Q
    ||||||| |||||    
T  21022779 acttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 45489621 - 45489834
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  45489621 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 45489720  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  45489721 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattattta 45489820  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  45489821 actaagttgcatga 45489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 1925084 - 1925212
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  1925084 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 1925177  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  1925178 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 1925212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 20924098 - 20924226
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  20924098 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 20924191  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20924192 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 20924226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Original strand, 22831256 - 22831375
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22831256 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatta 22831355  T
Q  105 cttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||| | ||| |||||||    
T  22831356 cttgaaatgttaatgaatga 22831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 39244096 - 39244221
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  |||    
T  39244096 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattga 39244189  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39244190 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39244221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 39247651 - 39247776
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  |||    
T  39247651 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattga 39247744  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39247745 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39247776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Original strand, 41388196 - 41388321
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||||  |||||  ||  |||    
T  41388196 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagc--ttgatacgaattga 41388289  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388290 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 41388321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3704939 - 3705155
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| |  ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  3704939 aactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 3705038  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| | ||| |         ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  3705039 cattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 3705137  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3705138 tttaactaagttgcatga 3705155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6152096 - 6151976
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6152096 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcatt 6151997  T
Q  104 acttgaattattattgaatga 124  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  6151996 acttgaaatgttagtgaatga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 42865092 - 42865200
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42865092 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 42865191  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  42865192 ttgagttat 42865200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 21788014 - 21788133
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 189  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  21788014 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggt 21788113  T
Q  190 tatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21788114 tatttaactaagttgcatga 21788133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 33050067 - 33050116
Alignment:
Q  160 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33050067 gttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 33050116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229309
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  20229306 tgca 20229309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 22468735 - 22468787
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468735 gctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135217
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatga 20135217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313151
Alignment:
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 21313151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21022701 - 21022657
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21022701 tgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 21022657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3750 - 3958
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3750 aactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 3849  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3850 attacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 3949  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  3950 gttgcatga 3958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18507 - 18715
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18507 aactttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 18606  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18607 attacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaa 18706  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  18707 gttgcatga 18715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 13365 - 13568
Alignment:
Q  4 tttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13365 tttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 13464  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  13465 actttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagtt 13564  T
Q  204 gcat 207  Q
    ||||    
T  13565 gcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 173521 - 173315
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  173521 aactttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgc 173422  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  173421 attacttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 173324  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  173323 gttgcatga 173315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 422406 - 422622
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgatt 98  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||| ||| |  ||||| | || ||||||||||||  || | | |    
T  422406 aactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaat 422504  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  422505 gcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgtt 422603  T
Q  191 atttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||    
T  422604 atttaactaagttgcatga 422622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2755
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  2548 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgg 2647  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2648 attacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaa 2746  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  2747 gttgcatga 2755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 65402 - 65611
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  65402 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 65501  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65502 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaacta 65601  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  65602 agttgcatga 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 61505 - 61695
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61505 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 61604  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61605 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 61695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 80943 - 80738
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  80943 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgc 80844  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  80843 attacttgaattattattgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaa 80747  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  80746 gttgcatga 80738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 80422 - 80321
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80422 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 80325  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  80324 tgca 80321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 80533 - 80462
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80533 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12789
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatga 12789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 23535468 - 23535670
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23535468 ttaggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattatac-gtgatttattgatagattgcatta 23535566  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535567 ctttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 23535665  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  23535666 catga 23535670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 15236662 - 15236863
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactt 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15236662 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattactt 15236761  T
Q  108 gaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15236762 gaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcat 15236861  T
Q  208 ga 209  Q
    ||    
T  15236862 ga 15236863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20296079 - 20295870
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20296079 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 20295980  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295979 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 20295880  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  20295879 agttacatga 20295870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19472594 - 19472803
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19472594 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 19472693  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472694 cattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 19472793  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  19472794 agttacatga 19472803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410463
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  171 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatga 17410463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18774435 - 18774227
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| |||||||||    
T  18774435 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattg 18774336  T
Q  100 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18774335 tatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 18774238  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    | |||||||||    
T  18774237 atgttgcatga 18774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 21366544 - 21366755
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21366544 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 21366643  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366644 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 21366742  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  21366743 ctaagttgcatga 21366755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42805651 - 42805444
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  42805651 aactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgatttt 42805552  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  42805551 atttacttgaattattattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacca 42805454  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  42805453 agttgcatga 42805444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20232781 - 20232577
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  20232781 aactttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 20232682  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20232681 ctttacttgaattattgttgattgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 20232585  T
Q  200 agttgcat 207  Q
     |||||||    
T  20232584 tgttgcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26742621 - 26742828
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| | |||||||     
T  26742621 aactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgt 26742720  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  26742721 atttactcgaattattattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagc--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 26742818  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  26742819 agttgcatga 26742828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18784278 - 18784070
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| |||||||||    
T  18784278 aactttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattg 18784179  T
Q  100 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18784178 tatttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 18784081  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    | |||||||||    
T  18784080 atgttgcatga 18784070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911252
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 20911199  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20911200 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20911252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26666006 - 26666212
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  26666006 aactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 26666105  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26666106 ccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 26666202  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  26666203 tgttgcatga 26666212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26937603 - 26937809
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  26937603 aactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgc 26937702  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26937703 ccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 26937799  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  26937800 tgttgcatga 26937809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33409459 - 33409253
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  33409459 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 33409360  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  33409359 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 33409262  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  33409261 agttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 24532938 - 24533129
Alignment:
Q  16 tgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattat 114  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  24532938 tgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattat 24533037  T
Q  115 tattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  24533038 tgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatga 24533129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767634
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355981
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 18356034  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18356033 aaac--ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 18355981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16674383 - 16674177
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| | ||||||| || |||| || ||| |  |||  ||| ||||||||||    
T  16674383 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattgattgc 16674284  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16674283 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 16674186  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  16674185 agttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17718314 - 17718520
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || | || |||||| |  |||  |||  ||||| ||     
T  17718314 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgatttc 17718413  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| | |   ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  17718414 ctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaacta 17718511  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  17718512 agttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 20910680 - 20910813
Alignment:
Q  6 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||    
T  20910680 taggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgatataatgtttta-tgcattac 20910778  T
Q  106 tt--gaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 140  Q
    ||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20910779 ttaagaattat--ttgaatgttcaagatgttgttgaa 20910813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23451588 - 23451374
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||| ||||||||  |||| | ||    
T  23451588 aactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatg 23451490  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23451489 cattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 23451391  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23451390 ttaaccaagttgcatga 23451374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20805788 - 20805578
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20805788 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 20805690  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |         ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20805689 acttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 20805592  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  20805591 actaagttgcatga 20805578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18356554 - 18356474
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18356554 ttagatactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23458832 - 23458618
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  23458832 aactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 23458734  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  23458733 cattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttat 23458635  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23458634 ttaaccaagttgcatga 23458618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23463093 - 23462879
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||    
T  23463093 aactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatg 23462995  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  23462994 cattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttat 23462896  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23462895 ttaaccaagttgcatga 23462879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 12028443 - 12028656
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  12028443 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 12028542  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12028543 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 12028642  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  12028643 actaagttgcatga 12028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20767000
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| | ||||||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||        ||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaact 20767011  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  20767010 aagttgcatga 20767000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21340642 - 21340848
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  || |||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||||    
T  21340642 aactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtgattgc 21340741  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || ||| |||||||| || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21340742 ctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 21340838  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  21340839 agttgcatga 21340848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22757349 - 22757219
Alignment:
Q  20 acctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22757349 acctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattatt 22757250  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757249 gaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 123184 - 123396
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    ||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||   || ||||||||||||  |||| | |||||||    
T  123184 ttaggtagtaatatgacctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcatta 123283  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  123284 cttgaattattcttgaataactttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaa 123383  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  123384 ctaagttgcatga 123396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10753515 - 10753387
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  10753515 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 10753422  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  10753421 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 10753387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 21885166 - 21885271
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21885166 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 21885263  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  21885264 ttgcatga 21885271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25229281 - 25229488
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  25229281 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaagtt-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 25229379  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25229380 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 25229477  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  25229478 aagttgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25293437 - 25293644
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  25293437 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaagtt-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 25293535  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25293536 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 25293633  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  25293634 aagttgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723670
Alignment:
Q  146 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 40723670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 1858929 - 1859067
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtga 169  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||    
T  1858929 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtga 1859027  T
Q  170 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1859028 tctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatga 1859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26172696 - 26172488
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-tt 98  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||| ||    
T  26172696 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaatt 26172598  T
Q  99 gca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
     || ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| || || ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26172597 acacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 26172500  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||| ||||    
T  26172499 taagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17919026 - 17919242
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| || || | ||||  ||||||  || ||||||| || |||||  || ||||||||||||  |||| | |||    
T  17919026 aactttaggtagtaaggaaacctatttaatatgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttgttgtaatgtgatttaaagattaaatgc 17919125  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17919126 attacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttat 17919225  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  17919226 ttaactaagttgcatga 17919242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4036451 - 4036243
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga--tt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| ||||||  |     
T  4036451 aactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaata 4036353  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagt-tgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
       || ||||||||||| |||||||||||||||   | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  4036352 tacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaac 4036255  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  4036254 taagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24222115 - 24221903
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  24222115 ttaggtagtaatgaaacctatttaagacgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 24222016  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24222015 acttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 24221917  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||||    
T  24221916 actaggttgcatga 24221903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680608
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26680608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952215
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga 26952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14079386 - 14079278
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14079386 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 14079287  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  14079286 ttgagttat 14079278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10753071 - 10752970
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10753071 tacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 10752974  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  10752973 tgca 10752970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517292
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 17517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342173
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 31342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 17410678 - 17410646
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagata 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410678 aactttaggtactaatgagacctatttaagata 17410646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31342291 - 31342219
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  31342291 taatgtgatttaacgattaattgcattacttgaattatccttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 31342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11220588 - 11220521
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11220588 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11228997 - 11228930
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11228997 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11228930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11230986 - 11230919
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11230986 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226940
Alignment:
Q  57 tatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11226940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201386
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 23201386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512124
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatga 23512124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23572110
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatga 23572110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079175
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 14079175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873280
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 21873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22757195 - 22757151
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22757195 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttacatga 22757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19892 - 20099
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19892 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 19991  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  19992 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaacta 20089  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  20090 agttgcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 228252 - 228455
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  228252 ttaggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgcattt 228351  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  228352 acttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagtt 228449  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  228450 gcatga 228455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12653 - 12445
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12653 aactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgc 12554  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12553 attacttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 12454  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    ||| |||||    
T  12453 gttacatga 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 16231351 - 16231557
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  16231351 actttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgca 16231450  T
Q  102 -ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16231451 tttacttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaa 16231548  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
    |||||||||    
T  16231549 gttgcatga 16231557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43252026 - 43251836
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43252026 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 43251927  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251926 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatga 43251836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19278157 - 19278366
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19278157 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 19278256  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278257 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 19278356  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  19278357 agttacatga 19278366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21972459 - 21972668
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21972459 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 21972558  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972559 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 21972658  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  21972659 agttacatga 21972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21976544 - 21976753
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21976544 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 21976643  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976644 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 21976743  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  21976744 agttacatga 21976753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22045115 - 22044908
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  22045115 aactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgc 22045016  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||    
T  22045015 atttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatcaaacta 22044918  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  22044917 agttgcatga 22044908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22112083 - 22111904
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22112083 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 22111984  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22111983 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 20465917 - 20466129
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20465917 ttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 20466016  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20466017 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttattta 20466115  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  20466116 actaagttgcatga 20466129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18619705 - 18619555
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-catt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  18619705 ttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtcttt 18619606  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619605 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23834404 - 23834196
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| || ||||||    
T  23834404 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactgattg 23834305  T
Q  100 ca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  23834304 tatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaact 23834207  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    | |||||||||    
T  23834206 atgttgcatga 23834196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22028788 - 22028647
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  22028788 aactttaagtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgc 22028689  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22028688 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 30643169 - 30643382
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30643169 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcat 30643268  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643269 tacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 30643367  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  30643368 aactaagttgcatga 30643382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30308629 - 30308835
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  30308629 aactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgt 30308728  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  30308729 attacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaa 30308826  T
Q  201 gttgcatga 209  Q
     ||||||||    
T  30308827 tttgcatga 30308835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 15602903 - 15603107
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15602903 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15603001  T
Q  111 ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15603002 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagt 15603100  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  15603101 tgcatga 15603107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16410133 - 16410344
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16410133 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16410231  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  16410232 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttc 16410330  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  16410331 actaagttgcatga 16410344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 17926585 - 17926796
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17926585 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 17926683  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  17926684 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttattta 17926782  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  17926783 actaagttgcatga 17926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 23846890 - 23847096
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  23846890 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 23846989  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||   |||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  23846990 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgt---tgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaact 23847086  T
Q  199 aagttgcatg 208  Q
    ||||||||||    
T  23847087 aagttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 15611355 - 15611559
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 110  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15611355 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15611453  T
Q  111 ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15611454 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagt 15611552  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  15611553 tgcatga 15611559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398190
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttg-aaatgaattgttatt 14398137  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14398138 aagc--tttatgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 14398190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20856305 - 20856515
Alignment:
Q  7 aggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20856305 aggtagtaatgtgacctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 20856404  T
Q  106 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    |||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20856405 ttgaattattcttgaataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaac 20856503  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  20856504 taagttgcatga 20856515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15538679 - 15538473
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| |||| |||||| | ||||||| || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||||||    
T  15538679 aactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgc 15538580  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  15538579 ctttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 15538482  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  15538481 agttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15532119 - 15531914
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| ||||| | |||| || || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||||||    
T  15532119 aactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgc 15532021  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532020 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 15531923  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  15531922 agttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387097
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||  | ||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttga 21387132  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21387131 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 21387097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383677
Alignment:
Q  82 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 181  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgtt 21383705  T
Q  182 gctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  21383704 gcaattgttatttaactaagttgcatga 21383677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 18862600 - 18862728
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  18862600 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 18862693  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  18862694 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 18862728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 21827969 - 21828097
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  21827969 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 21828062  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21828063 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21828097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 377519 - 377414
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  377519 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcatt 377420  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  377419 acttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24755959 - 24755842
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755959 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 24755860  T
Q  107 tgaattattattgaatga 124  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  24755859 tgaaatgttaatgaatga 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16861201 - 16861415
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||  ||| |||| | |||| | ||| || |||| || ||||| | || |||||||||||| ||||| | |     
T  16861201 aactttaggtagtagtgagacatatttaagaggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaata 16861299  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16861300 cattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaatataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttat 16861398  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||||    
T  16861399 ttaaccgagttgcatga 16861415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22010553 - 22010765
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| | | || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||    
T  22010553 aactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 22010651  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    |||||||   ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22010652 cattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttg----aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgtta 22010747  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22010748 tttaaccaagttgcatga 22010765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32605400 - 32605234
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32605400 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32605302  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32605301 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32605234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 19259460 - 19259565
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19259460 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 19259559  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  19259560 acttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21410973
Alignment:
Q  80 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 179  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21411003  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21411002 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21410973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805465
Alignment:
Q  80 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 179  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21805495  T
Q  180 ctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21805494 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 21805465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 39094875 - 39095015
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtg 168  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         ||||| ||||    
T  39094875 taatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatgttgttgtg 39094974  T
Q  169 atctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39094975 atctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatga 39095015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17828458 - 17828663
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt-gattg 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||| | ||||||  || |||| ||| || |  |||  ||| |||| |||||    
T  17828458 aactttaggtgctaacgagacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattg 17828557  T
Q  100 -cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     | |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  17828558 tctttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaact 17828653  T
Q  199 aagttgcatg 208  Q
    ||||||||||    
T  17828654 aagttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32598868 - 32598702
Alignment:
Q  42 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32598868 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32598770  T
Q  140 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
     ||||| ||| ||||   ||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32598769 gaatgatttgttatttgact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32598702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678193
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121762
Alignment:
Q  157 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 23776807 - 23776926
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 189  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||        ||| || |||||||||  ||||||||||| ||    
T  23776807 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagt 23776906  T
Q  190 tatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23776907 tatttaactaagttgcatga 23776926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 17055412 - 17055461
Alignment:
Q  160 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17055412 gttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 17055461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19983331 - 19983223
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19983331 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 19983232  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  19983231 ttgagttat 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 377297
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 377297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755740
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 24755740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19899333 - 19899225
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19899333 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattac 19899234  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  19899233 ttgagttat 19899225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862978
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 21828280 - 21828347
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21828280 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21828347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354034
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 17354034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259682
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatga 19259682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162149
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatga 21162149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21168822
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatga 21168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 208
Target Start/End: Original strand, 24445541 - 24445587
Alignment:
Q  162 tgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24445541 tgatgtgatttgattatgctgtaaatgttatttaactaagttgcatg 24445587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16184966 - 16184862
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  16184966 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgc 16184867  T
Q  106 ttgaa 110  Q
    |||||    
T  16184866 ttgaa 16184862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19983152 - 19983119
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983152 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 19983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5184
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 118  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 5093  T
Q  119 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5094 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 138; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 58593 - 58802
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  58593 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 58692  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58693 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaacta 58792  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    |||| |||||    
T  58793 agttacatga 58802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 35817 - 36025
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35817 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattg 35916  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35917 cattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg-aaattaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaacta 36015  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  36016 agttgcatga 36025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6968
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  7175 aactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgt 7076  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7075 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 6978  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  6977 tgttgcatga 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 11336 - 11384
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  11336 ttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 11384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 132; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 9544 - 9748
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9544 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcattt 9643  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||    
T  9644 acttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaactatgt 9741  T
Q  203 tgcatga 209  Q
    |||||||    
T  9742 tgcatga 9748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3405 - 3612
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||    
T  3405 aactttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgattgc 3504  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3505 atttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaacta 3602  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  3603 agttgcatga 3612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 10459 - 10589
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10459 aactttaagtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 10558  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10559 attacttgaattattattgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69820
Alignment:
Q  158 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 69820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18235 - 18442
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||| |||| |||||||||     
T  18235 aactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgattgt 18334  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18335 atttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaacta 18432  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
    ||||||||||    
T  18433 agttgcatga 18442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4456
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4672 aactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattg 4573  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4572 cattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgtta 4474  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4473 tttaactaagttgcatga 4456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 473
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  602 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 509  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaact-aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  508 ttatgctgctattgttatttaactaaagttgcatga 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24843 - 25051
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24843 aactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgc 24942  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatc-aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24943 atttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 25040  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
     ||||||||||    
T  25041 gagttgcatga 25051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 189332 - 189460
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  189332 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 189425  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  189426 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 189460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 189643 - 189710
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  189643 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 185
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  398 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcatt 299  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 199  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  198 actaagttgcatga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5826 - 5612
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5826 actttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgc 5728  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5727 attacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatt 5628  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  5627 taactaagttgcatga 5612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7021 - 6807
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  7021 actttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgc 6923  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6922 attacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatt 6823  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  6822 taactaagttgcatga 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 419
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  631 ttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 532  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  531 acttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 433  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  432 actaagttgcatga 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 160 - 1
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  160 aactttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgc 61  T
Q  101 a-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagct 159  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  60 atttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42653
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 42665  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  42664 taagttgcatga 42653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1731 - 1520
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1731 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 1632  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 1533  T
Q  197 ctaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||    
T  1532 ctaagttgcatga 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 6132 - 6339
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| |||||||||     
T  6132 aactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgt 6231  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6232 atttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaacta 6329  T
Q  200 agttgcatga 209  Q
     |||||||||    
T  6330 tgttgcatga 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1923
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  1971 ttgatgtgatttgataatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15328 - 15113
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15328 aactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattg 15229  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15228 cattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgttat 15130  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||    
T  15129 ttaactaagttgcatga 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6399
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6227 ctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttg-aaat 6325  T
Q  144 gaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||        ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6326 gaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 18534 - 18746
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18534 ttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccatt 18633  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18634 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 18732  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  18733 actaagttgcatga 18746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 46605 - 46817
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46605 ttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 46704  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  46705 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgta 46803  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  46804 actaagttgcatga 46817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23443 - 23240
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-tt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | ||    
T  23443 ttagttactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtattt 23344  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  23343 acttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaactatgtt 23246  T
Q  204 gcatga 209  Q
     |||||    
T  23245 tcatga 23240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17202
Alignment:
Q  71 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgtt 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||    
T  17056 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgtt 17155  T
Q  163 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17156 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatga 17202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1580
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||  || | ||||    
T  1364 aactttagttagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattg 1463  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  1464 cattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggtta 1562  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1563 tttaactaagttgcatga 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9539
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  9741 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 9643  T
Q  112 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata-------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9642 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttg 9544  T
Q  205 catga 209  Q
    |||||    
T  9543 catga 9539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1856
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  2059 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 1961  T
Q  112 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1960 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagtt 1862  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  1861 gcatga 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2175
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatg-aaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcat 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| ||||| ||||| | |||||    
T  1962 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcat 2061  T
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattt 194  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2062 tacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttg-aaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 2160  T
Q  195 aactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||    
T  2161 aactaagttgcatga 2175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10134 - 9928
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| |||||||||     
T  10134 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 10035  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  10034 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 9937  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  9936 agttgcatg 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 64084 - 63878
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||  ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||||    
T  64084 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgc 63985  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  63984 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 63887  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  63886 agttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 75961 - 75762
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatt-act 106  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||| |||||| || |||    
T  75961 ggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggatagattgcctttact 75862  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 206  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  75861 tgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgca 75764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 34791 - 34908
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  107 tgaattattattgaatga 124  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35010
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 35010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Original strand, 21447 - 21597
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21447 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtatt 21546  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21547 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 80642 - 80706
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 141  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80642 taatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 80706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 206
Target Start/End: Original strand, 80754 - 80855
Alignment:
Q  103 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80754 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 80851  T
Q  203 tgca 206  Q
    ||||    
T  80852 tgca 80855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18585 - 18379
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| || |||||||    
T  18585 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactgattgc 18486  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  18485 ctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaacta 18388  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  18387 agttgcatg 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10131
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44318 - 44107
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  44318 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 44220  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44219 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 44121  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  44120 actaagttgcatga 44107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6704
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 6704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30908
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 30961  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||  |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30960 aagc--ttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatga 30908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 132
Target Start/End: Original strand, 928 - 1014
Alignment:
Q  46 tgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaag 132  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2933
Alignment:
Q  73 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 164  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 923
Alignment:
Q  13 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 111  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||  |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||     
T  1126 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaa 1028  T
Q  112 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1027 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagtt 929  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  928 gcatga 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 71540 - 71460
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  71540 ttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 139941 - 139736
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||||    
T  139941 aactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtgattgc 139842  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || ||| ||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  139841 ctttactcgaattattgattattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaacta 139745  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  139744 agttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 71215 - 71092
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgatt 176  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||      |||||    
T  71215 taatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgat------tgatt 71125  T
Q  177 atgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  71124 atgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 71092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 413929 - 414140
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||| || || ||| |||||| |||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  413929 ttaggtagtaaagaaacatatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 414028  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  414029 acttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaac-gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 414127  T
Q  196 actaagttgcatg 208  Q
    |||||||||||||    
T  414128 actaagttgcatg 414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20546
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 154  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  155 aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207931
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttg-ttgaaaatgaattgatat 153  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  154 taag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |        |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 6294 - 6505
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| || |||| |||||| | | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  6294 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 6392  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6393 actcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttattta 6491  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    |||| |||||||||    
T  6492 actatgttgcatga 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 19170 - 19317
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19170 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcatt 19269  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata 152  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19270 acttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5875 - 6082
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--att 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||     
T  5875 aactttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattgaaata 5973  T
Q  99 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
       |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5974 tacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaact 6071  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  6072 aagttgcatga 6082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73857
Alignment:
Q  83 gatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgat 175  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| |||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 73857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 35387 - 35602
Alignment:
Q  3 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgca 101  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||    
T  35387 ctttatgtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 35486  T
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatt 193  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35487 ttacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatt 35586  T
Q  194 taactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  35587 taactaagttgcatga 35602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9651 - 9445
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | | ||||| || |||| |||||| |  |||  |||  |||||||||    
T  9651 aactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattgattgc 9552  T
Q  101 att-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || | |||| | ||||| |||| | |||||||||||||    
T  9551 ctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaacta 9454  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  9453 agttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36536 - 36331
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg- 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||     
T  36536 aactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattgattgc 36437  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaacta 199  Q
    ||||||   |||| || || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||    
T  36436 cattacccaaattgttgttaattgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaatta 36340  T
Q  200 agttgcatg 208  Q
    |||||||||    
T  36339 agttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8799 - 8586
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  8799 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 8700  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8699 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 8600  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  8599 actaagttgcatga 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 4099 - 4245
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||    
T  4099 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 4198  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 146  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4199 cattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4317
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4273 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19823
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19613 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 19712  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19713 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaact 19812  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  19813 aagttgcatga 19823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 15091 - 15301
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15091 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 15190  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 198  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15191 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaact 15290  T
Q  199 aagttgcatga 209  Q
    |||||||||||    
T  15291 aagttgcatga 15301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 520 - 315
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||| |           ||| | |||||    
T  520 actttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca-----------tgaataattgc 432  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa----ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||| ||| ||| |     |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  431 attactttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgtta 333  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||    
T  332 tttaactaagttgcatga 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 30619 - 30833
Alignment:
Q  1 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattg 99  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| | || |||| | |||||| | || |||||||||||| ||||| | ||    
T  30619 aactttaggtagttgtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 30717  T
Q  100 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| | ||| |        ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30718 cattacttgaaatattattgaatgataaagatgtagttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttat 30816  T
Q  193 ttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||||    
T  30817 ttaaccaagttgcatga 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1900
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  1907 ttgcatga 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7709 - 7497
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||  | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||| ||||||  || | | ||||||    
T  7709 ttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatgcatt 7610  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7609 acttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgttattta 7511  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  7510 actaagttgcatga 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 77045 - 77253
Alignment:
Q  1 aactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-tt 98  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||    
T  77045 aactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaatt 77143  T
Q  99 gca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 197  Q
      | ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  77144 atacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 77241  T
Q  198 taagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||    
T  77242 taagttgcatga 77253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11584
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  11456 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 11549  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  11550 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 14042 - 14170
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  14042 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 14135  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14136 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatga 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 14353 - 14420
Alignment:
Q  56 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 122  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14353 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 149
Target Start/End: Original strand, 192198 - 192340
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattact 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  192198 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 192297  T
Q  107 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192298 tgatttattcttgaattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 580 - 392
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatta 104  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||                
T  580 ttaggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga------------ 494  T
Q  105 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 204  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||| | || | |   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  493 -ttgaattattgttgaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttg 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 6956 - 7061
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6956 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcatt 7055  T
Q  104 acttga 109  Q
    ||||||    
T  7056 acttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 15300 - 15376
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 85  Q
    |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15300 ggtactaatgagacatattaaa-atgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Original strand, 13969 - 14075
Alignment:
Q  19 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 117  Q
    ||||||| || ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||     
T  13969 gacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaa 14068  T
Q  118 tgaatga 124  Q
    |||||||    
T  14069 tgaatga 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14177
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatga 14177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 3980 - 3872
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3980 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 3881  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  3880 ttgagttat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8411 - 8303
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8411 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 8312  T
Q  106 ttgaattat 114  Q
    |||| ||||    
T  8311 ttgagttat 8303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2960
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3040 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6706 - 6626
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 124  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6706 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2858
Alignment:
Q  160 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 2858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6524
Alignment:
Q  160 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatga 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 38451 - 38570
Alignment:
Q  98 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 189  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||         ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  38451 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgt 38550  T
Q  190 tatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38551 tatttaactaagttgcatga 38570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2029 - 1818
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2029 ttaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 1931  T
Q  104 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||        |||  |||   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1930 acttgaaatattattgaatgataacgatgttattg-aaatgaattgtggttatgaacttataatgttgttgtggtctgattatgctgcctttgttattta 1832  T
Q  196 actaagttgcatga 209  Q
    ||||||||||||||    
T  1831 actaagttgcatga 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9358
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 9358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2527
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |    
T  2311 actttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatac 2410  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  2411 attacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 2509  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2510 tttaactaaattgcatga 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 10171 - 10387
Alignment:
Q  2 actttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |    
T  10171 actttaggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatac 10270  T
Q  101 attacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 191  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  10271 attacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtta 10369  T
Q  192 tttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  10370 tttaactaaattgcatga 10387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8523
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8628 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 8531  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  8530 ttgcatga 8523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15772 - 15667
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15772 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 15675  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    ||||||||    
T  15674 ttgcatga 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32554
Alignment:
Q  45 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 125  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32636 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 209
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4895
Alignment:
Q  112 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4790 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagtt 4889  T
Q  204 gcatga 209  Q
    ||||||    
T  4890 gcatga 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16745
Alignment:
Q  102 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  202 ttgcatga 209  Q
    | ||||||    
T  16738 tcgcatga 16745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 439
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||    
T  548 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattga 455  T
Q  175 ttatgctgctattgtt 190  Q
    ||||||||| ||||||    
T  454 ttatgctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15363
Alignment:
Q  161 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 207  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcat 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 32615 - 32743
Alignment:
Q  75 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga 174  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  |||    
T  32615 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattga 32708  T
Q  175 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  32709 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatga 32743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 15550 - 15669
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15550 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattac 15649  T
Q  106 ttgaattattattgaatgat 125  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  15650 ttgaattatgaatgaatgat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15770
Alignment:
Q  176 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 15770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33694 - 33583
Alignment:
Q  96 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 186  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||    
T  33694 attgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttat 33596  T
Q  187 tgttatttaacta 199  Q
    |||||||||||||    
T  33595 tgttatttaacta 33583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7361
Alignment:
Q  29 agatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaa 128  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||    || ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||| |        
T  7173 agatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataacttt 7272  T
Q  129 gaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    || |||||||||||||||||| |        ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7273 gatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatga 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6121
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 16389 - 16439
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16389 tgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 16439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2194
Alignment:
Q  165 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga 2194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11544 - 11472
Alignment:
Q  77 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 149  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11544 taatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 175005 - 174871
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    ||| ||| | ||||| || || ||  |||||||||    
T  175005 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattac 174906  T
Q  106 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 140  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  174905 ttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaa 174871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 21844 - 21894
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 21894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29786
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatga 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 21684 - 21740
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 61  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  21684 ttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 21740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 29576 - 29632
Alignment:
Q  5 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 61  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  29576 ttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 29632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 48500 - 48550
Alignment:
Q  158 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 208  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48500 ctgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaacctagttgcatg 48550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14690
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 14690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23705
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 23705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 39129
Alignment:
Q  159 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 209  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatga 39129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 125
Target Start/End: Original strand, 18334 - 18453
Alignment:
Q  8 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 105  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||   | |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  18334 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattac 18433  T
Q  106 ttgaattattattgaatgat 125  Q
    |||| |||| | ||||||||    
T  18434 ttgagttatgaatgaatgat 18453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University