View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19637_low_1 (Length: 518)

Name: NF19637_low_1
Description: NF19637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19637_low_1
NF19637_low_1
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (9-516)||(16743990-16744498)
chr3 (97-465)||(14842487-14842856)
chr3 (97-465)||(12030073-12030443)
chr3 (97-465)||(2049777-2050147)
chr3 (103-391)||(17912483-17912771)
chr3 (87-465)||(13838852-13839232)
chr3 (86-428)||(15858986-15859331)
chr3 (329-513)||(19231982-19232169)
chr3 (86-401)||(51158008-51158325)
chr3 (226-391)||(2449238-2449404)
chr3 (97-384)||(15936634-15936922)
chr3 (97-384)||(15938476-15938764)
chr3 (345-465)||(19260749-19260869)
chr3 (104-466)||(15614808-15615170)
chr3 (10-206)||(15468520-15468717)
chr3 (97-391)||(45860773-45861068)
chr3 (10-206)||(22275088-22275285)
chr3 (97-391)||(13954890-13955185)
chr3 (97-391)||(13975722-13976017)
chr3 (97-379)||(55316187-55316471)
chr3 (97-379)||(41270043-41270327)
chr3 (433-513)||(3992873-3992953)
chr3 (89-357)||(16821099-16821369)
chr3 (433-513)||(55513193-55513273)
chr3 (104-239)||(47984624-47984759)
chr3 (104-239)||(48003198-48003333)
chr3 (430-508)||(15857120-15857198)
chr3 (433-513)||(2844514-2844594)
chr3 (104-239)||(47993911-47994046)
chr3 (104-239)||(48012484-48012619)
chr3 (9-71)||(2449391-2449453)
chr3 (433-513)||(54037976-54038056)
chr3 (433-488)||(17955861-17955916)
chr3 (433-513)||(7854305-7854385)
chr3 (433-494)||(45581954-45582016)
chr3 (334-375)||(14080715-14080756)
chr3 (97-146)||(19231945-19231994)
chr3 (312-465)||(54651642-54651796)
chr3 (449-506)||(17191879-17191936)
chr3 (433-465)||(2449152-2449184)
chr3 (433-465)||(16261777-16261809)
chr3 (433-465)||(16933869-16933901)
chr3 (433-465)||(17912398-17912430)
chr3 (10-90)||(18969968-18970048)
chr3 (86-118)||(22144532-22144564)
chr3 (433-465)||(23492696-23492728)
chr3 (433-465)||(38168237-38168269)
chr3 (433-465)||(53771365-53771397)
chr3 (126-247)||(12264932-12265053)
chr3 (449-506)||(17205019-17205076)
chr3 (433-506)||(38810868-38810941)
chr3 (126-241)||(11329098-11329214)
chr3 (433-465)||(11986080-11986112)
chr3 (312-384)||(11986173-11986245)
chr3 (433-465)||(13954804-13954836)
chr3 (433-465)||(14285289-14285321)
chr3 (433-465)||(19947026-19947058)
chr3 (433-465)||(30153265-30153297)
chr3 (433-465)||(33342204-33342236)
chr3 (433-465)||(45861122-45861154)
chr3 (433-465)||(51961031-51961063)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (9-391)||(22907214-22907597)
chr8 (97-513)||(16404852-16405268)
chr8 (104-465)||(16193643-16194005)
chr8 (97-465)||(43373392-43373761)
chr8 (87-465)||(24928716-24929096)
chr8 (226-391)||(5238184-5238350)
chr8 (226-391)||(24661248-24661414)
chr8 (226-391)||(43685643-43685809)
chr8 (100-391)||(17345540-17345832)
chr8 (104-379)||(24548956-24549233)
chr8 (104-379)||(6774258-6774535)
chr8 (97-375)||(21844576-21844856)
chr8 (97-375)||(21851969-21852249)
chr8 (97-379)||(30120690-30120974)
chr8 (9-71)||(5238135-5238197)
chr8 (9-71)||(24661401-24661463)
chr8 (433-513)||(274766-274846)
chr8 (433-513)||(641003-641083)
chr8 (433-513)||(826809-826889)
chr8 (433-513)||(24716714-24716794)
chr8 (97-316)||(222754-222975)
chr8 (97-316)||(736377-736598)
chr8 (97-316)||(860272-860493)
chr8 (9-71)||(43685594-43685656)
chr8 (101-379)||(16674392-16674672)
chr8 (433-513)||(39115598-39115678)
chr8 (87-241)||(23837154-23837308)
chr8 (86-208)||(41246613-41246735)
chr8 (10-67)||(22321597-22321654)
chr8 (433-465)||(5238404-5238436)
chr8 (433-465)||(22907128-22907160)
chr8 (433-465)||(24385652-24385684)
chr8 (433-465)||(24661162-24661194)
chr8 (433-465)||(43685863-43685895)
chr8 (89-159)||(13662492-13662561)
chr8 (334-375)||(23149985-23150026)
chr8 (334-375)||(23226076-23226117)
chr8 (433-465)||(2545265-2545297)
chr8 (433-465)||(3431176-3431208)
chr8 (433-465)||(22886654-22886686)
chr8 (10-90)||(23217924-23218004)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (9-391)||(26680080-26680463)
chr4 (86-513)||(54118120-54118551)
chr4 (86-465)||(13246386-13246769)
chr4 (101-465)||(15675009-15675381)
chr4 (259-465)||(122020-122226)
chr4 (101-465)||(10104170-10104523)
chr4 (226-391)||(10488659-10488825)
chr4 (226-391)||(16327926-16328092)
chr4 (104-364)||(31115603-31115865)
chr4 (97-375)||(10644187-10644467)
chr4 (97-391)||(13048221-13048517)
chr4 (329-465)||(33240901-33241043)
chr4 (97-379)||(47357622-47357906)
chr4 (97-228)||(111362-111493)
chr4 (433-513)||(25119059-25119139)
chr4 (9-71)||(10488610-10488672)
chr4 (15-71)||(16328079-16328135)
chr4 (359-465)||(31132545-31132657)
chr4 (433-513)||(5682380-5682460)
chr4 (194-375)||(40885570-40885753)
chr4 (100-175)||(7849970-7850044)
chr4 (97-241)||(15044794-15044938)
chr4 (152-241)||(41166083-41166172)
chr4 (433-465)||(14952085-14952117)
chr4 (433-465)||(15135907-15135939)
chr4 (433-465)||(15272211-15272243)
chr4 (433-465)||(16327840-16327872)
chr4 (433-465)||(16609013-16609045)
chr4 (433-465)||(26680517-26680549)
chr4 (86-118)||(44055870-44055902)
chr4 (154-241)||(7185981-7186068)
chr4 (10-71)||(19559410-19559471)
chr4 (433-506)||(41165808-41165881)
chr4 (433-465)||(8045272-8045304)
chr4 (334-374)||(13809511-13809551)
chr4 (433-465)||(16523146-16523178)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (9-391)||(7292896-7293279)
chr7 (85-465)||(13036938-13037322)
chr7 (97-465)||(16211733-16212103)
chr7 (97-506)||(3059933-3060344)
chr7 (97-465)||(11580661-11581035)
chr7 (97-465)||(36052634-36053003)
chr7 (104-391)||(47481031-47481320)
chr7 (226-391)||(11516324-11516490)
chr7 (226-391)||(15441564-15441730)
chr7 (226-391)||(30262129-30262295)
chr7 (97-384)||(18253842-18254130)
chr7 (104-390)||(13320988-13321278)
chr7 (100-373)||(16478968-16479244)
chr7 (97-391)||(25292338-25292633)
chr7 (97-379)||(10989378-10989661)
chr7 (97-375)||(13572644-13572924)
chr7 (115-379)||(13911024-13911292)
chr7 (97-380)||(2437425-2437710)
chr7 (9-71)||(15441717-15441779)
chr7 (9-71)||(30262282-30262344)
chr7 (433-513)||(126738-126818)
chr7 (433-513)||(32493898-32493978)
chr7 (100-463)||(295893-296257)
chr7 (9-71)||(11516275-11516337)
chr7 (433-513)||(1936869-1936949)
chr7 (433-513)||(111121-111201)
chr7 (434-513)||(7283908-7283987)
chr7 (349-391)||(14113989-14114031)
chr7 (349-391)||(14423639-14423681)
chr7 (359-465)||(36024372-36024485)
chr7 (399-506)||(13377819-13377924)
chr7 (433-465)||(2029244-2029276)
chr7 (433-465)||(7293333-7293365)
chr7 (433-465)||(11516544-11516576)
chr7 (433-465)||(14113903-14113935)
chr7 (433-465)||(15441478-15441510)
chr7 (396-465)||(15709428-15709501)
chr7 (86-118)||(15822691-15822723)
chr7 (433-465)||(30262043-30262075)
chr7 (433-465)||(42056188-42056220)
chr7 (449-506)||(13389693-13389750)
chr7 (433-465)||(371417-371449)
chr7 (433-465)||(3049905-3049937)
chr7 (433-465)||(13321334-13321366)
chr7 (10-90)||(13351999-13352079)
chr7 (433-461)||(15516765-15516793)
chr7 (86-241)||(17224075-17224230)
chr7 (433-465)||(25124450-25124482)
chr7 (433-465)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (16-391)||(37066-37442)
scaffold0078 (433-513)||(41632-41712)
scaffold0078 (433-465)||(36980-37012)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (100-516)||(41394191-41394610)
chr1 (97-465)||(20931312-20931682)
chr1 (97-465)||(20445646-20446019)
chr1 (97-465)||(20913004-20913367)
chr1 (97-465)||(20531411-20531783)
chr1 (86-465)||(20893551-20893933)
chr1 (97-465)||(37844374-37844746)
chr1 (226-391)||(51452589-51452755)
chr1 (97-464)||(22227777-22228146)
chr1 (97-464)||(22232474-22232843)
chr1 (104-379)||(2116228-2116506)
chr1 (259-466)||(45051554-45051759)
chr1 (433-513)||(21860334-21860414)
chr1 (97-379)||(5072388-5072672)
chr1 (97-379)||(18601118-18601402)
chr1 (433-507)||(44034829-44034903)
chr1 (9-71)||(51452540-51452602)
chr1 (104-184)||(45051416-45051496)
chr1 (433-513)||(41218728-41218808)
chr1 (399-506)||(27675086-27675191)
chr1 (449-506)||(13376711-13376768)
chr1 (433-464)||(15861327-15861358)
chr1 (87-118)||(49967607-49967638)
chr1 (334-375)||(22143361-22143402)
chr1 (433-465)||(51452809-51452841)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (86-513)||(19794581-19795011)
chr2 (97-465)||(36982364-36982737)
chr2 (97-465)||(462706-463075)
chr2 (97-513)||(20627190-20627609)
chr2 (97-465)||(8891209-8891581)
chr2 (97-513)||(43642833-43643250)
chr2 (101-465)||(24341309-24341681)
chr2 (226-391)||(19689401-19689567)
chr2 (226-391)||(23820168-23820334)
chr2 (226-391)||(14906440-14906606)
chr2 (104-391)||(25265390-25265679)
chr2 (226-391)||(20015108-20015274)
chr2 (97-391)||(17396653-17396948)
chr2 (100-341)||(7507894-7508138)
chr2 (97-379)||(19886661-19886945)
chr2 (369-465)||(22863169-22863267)
chr2 (433-513)||(22284278-22284358)
chr2 (433-513)||(22275045-22275125)
chr2 (434-513)||(15633538-15633617)
chr2 (9-71)||(14906593-14906655)
chr2 (9-71)||(20015059-20015121)
chr2 (9-71)||(23820119-23820181)
chr2 (25-71)||(19689554-19689600)
chr2 (433-466)||(19689314-19689347)
chr2 (433-465)||(9652796-9652828)
chr2 (433-465)||(14906354-14906386)
chr2 (152-208)||(19669279-19669335)
chr2 (433-465)||(23820388-23820420)
chr2 (433-464)||(25213372-25213403)
chr2 (433-506)||(19666848-19666921)
chr2 (449-506)||(43646232-43646289)
chr2 (433-465)||(7507757-7507789)
chr2 (433-465)||(17396567-17396599)
chr2 (433-465)||(20015328-20015360)
chr2 (433-465)||(28031134-28031166)
chr2 (399-465)||(31146073-31146138)
chr2 (86-118)||(32465813-32465845)
chr2 (433-465)||(33128372-33128404)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (97-465)||(48565-48935)
scaffold0023 (101-357)||(36065-36323)
scaffold0023 (433-465)||(61122-61154)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (97-465)||(1091-1462)
scaffold0266 (97-465)||(3508-3877)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (86-465)||(23153403-23153786)
chr6 (104-464)||(14626045-14626407)
chr6 (97-391)||(35009439-35009735)
chr6 (100-391)||(1657748-1658040)
chr6 (100-391)||(15862443-15862734)
chr6 (104-466)||(1650020-1650382)
chr6 (97-379)||(25175531-25175815)
chr6 (97-379)||(27653983-27654267)
chr6 (396-465)||(23148266-23148335)
chr6 (433-513)||(19983144-19983224)
chr6 (433-513)||(35015009-35015089)
chr6 (97-379)||(16825752-16826038)
chr6 (100-233)||(27740808-27740941)
chr6 (433-513)||(18583640-18583720)
chr6 (86-240)||(18381821-18381975)
chr6 (308-391)||(27751605-27751688)
chr6 (194-391)||(29665937-29666137)
chr6 (433-465)||(18002395-18002427)
chr6 (433-465)||(23995247-23995279)
chr6 (433-465)||(26090059-26090091)
chr6 (433-464)||(4991396-4991427)
chr6 (111-217)||(22361926-22362032)
chr6 (435-465)||(15742120-15742150)
chr6 (10-71)||(15889853-15889914)
chr6 (334-375)||(16887792-16887833)
chr6 (449-506)||(21623506-21623563)
chr6 (86-115)||(32898745-32898774)
chr6 (334-375)||(33324898-33324939)
chr6 (334-375)||(35136013-35136054)
chr6 (433-465)||(1657661-1657693)
chr6 (433-465)||(15862789-15862821)
chr6 (433-465)||(18823283-18823315)
chr6 (433-465)||(18839138-18839170)
chr6 (126-241)||(25367374-25367490)
chr6 (433-465)||(27751742-27751774)
chr6 (433-465)||(32276659-32276691)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (97-462)||(19173-19543)
scaffold0195 (97-391)||(21257-21553)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (97-466)||(36836-37209)
scaffold0077 (434-513)||(15319-15398)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (97-465)||(23506932-23507302)
chr5 (86-465)||(27182471-27182854)
chr5 (105-465)||(18530988-18531355)
chr5 (101-465)||(22053753-22054125)
chr5 (226-391)||(20623066-20623232)
chr5 (226-391)||(21233528-21233694)
chr5 (229-391)||(37052844-37053007)
chr5 (226-391)||(16536294-16536460)
chr5 (100-391)||(34939248-34939540)
chr5 (226-389)||(25900408-25900571)
chr5 (97-379)||(22366481-22366765)
chr5 (97-379)||(25426596-25426880)
chr5 (97-376)||(18777995-18778276)
chr5 (97-379)||(12342-12626)
chr5 (97-379)||(19499867-19500151)
chr5 (97-379)||(21073595-21073879)
chr5 (116-379)||(4199985-4200251)
chr5 (97-376)||(43443398-43443679)
chr5 (97-375)||(27009809-27010089)
chr5 (87-206)||(17471768-17471887)
chr5 (9-71)||(20623017-20623079)
chr5 (9-71)||(21233681-21233743)
chr5 (259-379)||(29188284-29188404)
chr5 (104-178)||(29190478-29190552)
chr5 (9-71)||(25900558-25900620)
chr5 (9-71)||(37052792-37052854)
chr5 (9-71)||(16536245-16536307)
chr5 (434-508)||(11584374-11584448)
chr5 (108-241)||(19862186-19862319)
chr5 (97-241)||(23493885-23494029)
chr5 (433-465)||(16105967-16105999)
chr5 (433-465)||(20623286-20623318)
chr5 (433-465)||(21233442-21233474)
chr5 (433-465)||(25900320-25900352)
chr5 (433-465)||(37053061-37053093)
chr5 (334-375)||(21310709-21310750)
chr5 (334-375)||(23981516-23981557)
chr5 (433-465)||(108728-108760)
chr5 (433-465)||(9730278-9730310)
chr5 (433-465)||(16536514-16536546)
chr5 (312-384)||(32950879-32950951)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (86-465)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (97-465)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (97-465)||(128095-128464)
scaffold0008 (116-357)||(31697-31942)
scaffold0008 (90-118)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (97-465)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (97-465)||(247366-247738)
scaffold0012 (433-465)||(34075-34107)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (97-465)||(12083-12450)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (87-465)||(171863-172242)
scaffold0001 (87-465)||(177566-177945)
scaffold0001 (86-118)||(70882-70914)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (97-465)||(8846-9215)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (97-465)||(123087-123460)
scaffold0011 (86-118)||(255074-255106)
scaffold0011 (86-118)||(261680-261712)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (97-465)||(26340-26710)
scaffold0162 (104-391)||(8180-8466)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (97-455)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (101-465)||(8820-9192)
scaffold0025 (97-417)||(148688-149012)
scaffold0025 (365-465)||(146838-146938)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (87-465)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (259-463)||(51110-51314)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (97-384)||(48155-48443)
scaffold0049 (434-513)||(20493-20572)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (226-391)||(26892-27058)
scaffold0141 (226-384)||(22637-22796)
scaffold0141 (9-71)||(22588-22650)
scaffold0141 (9-71)||(26843-26905)
scaffold0141 (433-465)||(22857-22889)
scaffold0141 (433-465)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (226-391)||(1582-1748)
scaffold0124 (9-71)||(1735-1797)
scaffold0124 (433-465)||(1496-1528)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (259-465)||(89378-89586)
scaffold0028 (340-465)||(107708-107835)
scaffold0028 (126-208)||(79533-79616)
scaffold0028 (433-464)||(130880-130911)
scaffold0028 (334-375)||(79745-79786)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (104-391)||(41622-41911)
scaffold0125 (425-465)||(41957-41997)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (104-391)||(13480-13769)
scaffold0132 (433-513)||(42677-42754)
scaffold0132 (433-465)||(13824-13856)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (97-384)||(107715-108003)
scaffold0026 (97-375)||(64527-64812)
scaffold0026 (334-376)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (99-391)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (100-391)||(34460-34755)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (104-380)||(2936-3215)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (104-357)||(9371-9626)
scaffold0215 (104-357)||(16269-16524)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (86-228)||(9338-9480)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (259-384)||(5660-5785)
scaffold0772 (433-465)||(5846-5878)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (97-356)||(42965-43226)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (97-341)||(5254-5498)
scaffold0022 (334-374)||(102923-102963)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (97-341)||(3690-3936)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (97-375)||(3-283)
scaffold0116 (433-513)||(30417-30497)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (97-357)||(14083-14344)
scaffold0139 (97-380)||(21115-21399)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (433-513)||(80187-80267)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (97-219)||(48482-48603)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (432-513)||(166116-166197)
scaffold0016 (432-507)||(162036-162111)
scaffold0016 (433-506)||(116410-116483)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (259-379)||(13325-13445)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (433-513)||(31132-31212)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (97-219)||(26-147)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (433-507)||(5735-5809)
scaffold0686 (433-507)||(5941-6015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (432-513)||(304-385)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (259-379)||(1304-1424)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (434-513)||(1701-1780)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (434-513)||(19802-19881)
scaffold0122 (434-513)||(24106-24185)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (97-146)||(1815-1863)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (105-174)||(3183-3252)
scaffold0361 (308-391)||(3370-3453)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (126-341)||(54412-54630)
scaffold0066 (126-170)||(45007-45051)
scaffold0066 (433-465)||(45338-45370)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (434-504)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (434-508)||(6261-6335)
scaffold0310 (434-471)||(4-41)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (86-241)||(76984-77139)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (86-208)||(132420-132542)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (334-375)||(1546-1587)
scaffold0456 (334-375)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (334-375)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (266-384)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (334-375)||(70307-70348)
scaffold0058 (433-465)||(57392-57424)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (433-466)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (433-465)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (433-465)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (433-465)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (433-465)||(13285-13317)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (433-465)||(55904-55936)
scaffold0032 (433-465)||(108075-108107)
scaffold0032 (334-375)||(93773-93814)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (422-465)||(18015-18058)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (337-375)||(1348-1386)
scaffold0409 (337-375)||(9603-9641)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (433-498)||(1371-1436)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (10-71)||(1028-1089)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (86-115)||(7522-7551)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (334-375)||(22422-22463)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-71)||(45815-45876)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (86-115)||(38253-38282)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (449-506)||(35816-35873)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (152-208)||(2476-2532)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (334-374)||(10868-10908)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (433-465)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (433-465)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (433-465)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (433-465)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (433-465)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (433-465)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (433-465)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16744498 - 16743990
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 108  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744498 acatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 16744399  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16744398 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattg 16744299  T
Q  209 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  16744298 cacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaattta 16744199  T
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcataca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744198 accaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcataca 16744099  T
Q  408 acatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16744098 acatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctat 16743999  T
Q  508 gcttctcca 516  Q
    | |||||||    
T  16743998 gattctcca 16743990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
T  12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
T  2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
Q  103 caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||    
T  17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
Q  203 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839232
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 284  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
Q  285 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
Q  385 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858986
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
Q  384 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 428  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttacaaaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 329 - 513
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232169
Alignment:
Q  329 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 425  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  426 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 282  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
Q  283 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 382  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
Q  383 atcatccataatcaaaatt 401  Q
    || |||||||| |||||||    
T  51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 345 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  345 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 444  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  445 aagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 466
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615170
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 400  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 15615107  T
Q  401 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 466  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615108 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaac 108  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861068
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 45860871  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  45860872 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 45860971  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45860972 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaac 108  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975722
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13975919  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  13975918 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 13975819  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975818 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992953
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 357
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
Q  89 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctatt 188  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | |    
T  16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
Q  189 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 285  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
Q  286 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 239  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 239  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 430 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  430 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 508  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844594
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 239  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 239
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 239  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2449453 - 2449391
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2449453 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctcta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta 17955861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854385
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 494
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactagctctaacttca 494  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 146
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa 19231994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 465
Target Start/End: Original strand, 54651642 - 54651796
Alignment:
Q  312 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaaca 410  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||| || | |  |||||||||||    
T  54651642 acaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaaca 54651741  T
Q  411 tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |  |||| |  | ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  54651742 tgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttacctta 54651796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 17191879 - 17191936
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  17191879 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 90  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 225  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || ||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  12265053 ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 12264954  T
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaa 247  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  12264953 atttcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810868
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 224  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||| || |     
T  11329214 ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca 11329115  T
Q  225 caattcaactacaacat 241  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11329114 caattcaacaacaacat 11329098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11986245 - 11986173
Alignment:
Q  312 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986245 acaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22907597 - 22907214
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22907597 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaac 22907498  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907497 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 22907398  T
Q  209 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  22907397 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaattta 22907298  T
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907297 accaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404852
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 492  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
Q  493 cactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  16404872 cacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||    
T  16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 401  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
Q  402 catacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928716
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 284  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
Q  285 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
Q  385 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
T  24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
T  6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844576
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851969
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 5238135 - 5238197
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238135 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24661463 - 24661401
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661463 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaat 316  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaat 316  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaat 316  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 43685594 - 43685656
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685594 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674392
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac 16674574  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||    
T  16674573 atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac 16674474  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16674473 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||     
T  23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 208
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 41246711  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  41246712 acttaacaacaacaacatcaattg 41246735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 67  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
Q  89 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa 159  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa 13662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 90  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 26680080 - 26680463
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  26680080 acatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatttcaccaaaac 26680179  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680180 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 26680279  T
Q  209 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  26680280 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaattta 26680379  T
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680380 accaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 86 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118120
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
Q  384 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactact 481  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
Q  482 agctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  54118151 agctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 86 - 465
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
Q  384 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 101 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 298  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 396  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 259 - 465
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  459 tacctta 465  Q
    |||||||    
T  122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 298  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 396  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||   |    
T  10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 364
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
T  31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 364  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644467
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||  | |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048221
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||  |    
T  13048517 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca 13048419  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | |||||   ||| ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  13048418 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt 13048319  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048318 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 329 - 465
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
Q  329 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  427 ----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 228  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119059
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 10488610 - 10488672
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10488610 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16328135 - 16328079
Alignment:
Q  15 tcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16328135 tcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 359 - 465
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  453 cccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682380
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||| ||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  194 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 290  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  291 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 195  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||   ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
Q  196 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
Q  152 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
Q  154 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Original strand, 19559410 - 19559471
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19559410 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac 19559471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165808
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13809551 - 13809511
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13809551 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Original strand, 7292896 - 7293279
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaac 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7292896 acatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaac 7292995  T
Q  109 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292996 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 7293095  T
Q  209 cacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatcta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  7293096 cacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaattta 7293195  T
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7293196 accaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
Q  85 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 282  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
Q  283 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 382  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
Q  383 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    || |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 97 - 506
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
T  3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 393  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
Q  394 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 493  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
Q  494 actttggctccta 506  Q
    ||||| |||||||    
T  3060332 acttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
Q  395 ---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||    
T  36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
T  47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 300  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
Q  301 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 390
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt--aaaca 298  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||    
T  13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 390  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478968
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
Q  199 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 296  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
Q  297 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat 373  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||    
T  16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292338
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |   |||| ||| | || |||  |    
T  25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca 25292535  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |   | |||||| | |||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  25292534 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta 25292435  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292434 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572924
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911024
Alignment:
Q  115 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
T  13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
Q  215 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 310  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
T  13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
Q  311 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
T  13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 380
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437710
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 292  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
T  2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
Q  293 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 380  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
T  2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15441779 - 15441717
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441779 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 30262344 - 30262282
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262344 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493898
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295893
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
T  296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 295  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
Q  296 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 394  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || |||||||||||||||||| || ||| ||     
T  296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
Q  395 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 463  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 11516275 - 11516337
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516275 acatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936869
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111121
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283908
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 7283908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  349 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  349 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 465
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024485
Alignment:
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 452  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  453 -cccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||    
T  36024472 ccccccttacctta 36024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 506
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377924
Alignment:
Q  399 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcacttt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T
Q  499 ggctccta 506  Q
     |||||||    
T  13377917 agctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 465
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  396 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 90  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  13351999 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttac 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||   | ||||||    
T  17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
T  17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37442 - 37066
Alignment:
Q  16 caatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37442 caatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 37343  T
Q  116 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37342 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 37243  T
Q  216 atcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaaca 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37242 atcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaaca 37143  T
Q  315 atcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37142 atcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 100 - 516
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394610
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
Q  199 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 296  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
Q  297 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 396  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcact 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
Q  497 ttggctcctatgcttctcca 516  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  41394591 ttagctcctatgattctcca 41394610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531783
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 86 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
Q  384 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
T  37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 393  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
Q  394 tc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228146
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 393  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22228075  T
Q  394 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228076 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232843
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aa 393  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22232772  T
Q  394 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
     | |  ||||||||||||  ||||||  | ||| ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232773 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116506
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
Q  204 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 300  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
Q  301 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||| |||||    
T  2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 466
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051759
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccc 457  Q
    |||  || ||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  45051654 agtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaaccccc 45051750  T
Q  458 ttaccttaa 466  Q
    |||||||||    
T  45051751 ttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601118
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||    
T  18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 51452540 - 51452602
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452540 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218808
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 399 - 506
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675191
Alignment:
Q  399 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcacttt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T
Q  499 ggctccta 506  Q
     |||||||    
T  27675184 agctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 13376768 - 13376711
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13376768 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 118
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22143402 - 22143361
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22143402 ttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 86 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794581
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 282  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
Q  283 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 382  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
Q  383 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactac 480  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
Q  481 tagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | |    
T  462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 393  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
Q  394 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627190
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | |    
T  20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
T  20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 493  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
Q  494 actttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  20627209 acttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891581
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 97 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642833
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||    
T  43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 492  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
Q  493 cactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  43642853 cacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 101 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
T  24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 298  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 396  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396653
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca 17396850  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17396849 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 17396750  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396749 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
Q  199 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 341  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 369 - 465
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  369 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14906655 - 14906593
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906655 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 20015059 - 20015121
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015059 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 23820119 - 23820181
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23820119 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
Q  25 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689600 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
Q  152 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 464
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Original strand, 19666848 - 19666921
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  19666848 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 19666921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146073
Alignment:
Q  399 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttacctta 31146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 357
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
T  36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| |    
T  3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 86 - 465
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
Q  384 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626045
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 300  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
Q  301 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 400  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
Q  401 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626108 tcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650020
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 1650083  T
Q  401 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 466  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650082 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175815
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||    
T  25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 396 - 465
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  396 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983144
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015009
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825752
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||   || |||  |    
T  16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca 16825940  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||   | |  |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  16825939 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 16825840  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  16825839 gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |    
T  27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 233  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583720
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 240  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 391
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 391
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  194 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  292 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 389  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  390 at 391  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 464
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
Q  111 caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||||     
T  22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
Q  210 acaagaat 217  Q
    ||| ||||    
T  22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 435 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  435 gattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac 15889853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16887833 - 16887792
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16887833 ttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 33324898 - 33324939
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33324898 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35136054 - 35136013
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35136054 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 224  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  25367490 ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca 25367391  T
Q  225 caattcaactacaacat 241  Q
    ||||||||| |||||||    
T  25367390 caattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19543
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 462  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 97 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 466  Q
       |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15319
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||     
T  27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
Q  384 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
Q  105 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||    
T  18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
Q  205 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 399  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |    
T  18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
Q  400 ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 101 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 298  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 396  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  229 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  328 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
Q  200 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 297  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  || |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
Q  298 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18777995
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  |    
T  18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 376  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4199985
Alignment:
Q  116 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
Q  216 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 312  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
T  4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
Q  313 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 379  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
T  4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443398
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |    ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 376  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010089
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471768
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||      
T  17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcag 17471788  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaat 206  Q
    ||| ||  ||||||||||||    
T  17471787 ttaacaataacaacatcaat 17471768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 20623017 - 20623079
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623017 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21233743 - 21233681
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233743 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  359 agttggagcacgaatttagca 379  Q
    |||  |||||||||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25900620 - 25900558
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25900620 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 37052792 - 37052854
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37052792 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 16536245 - 16536307
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16536245 acatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 508  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
Q  108 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 206  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
Q  207 tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
    |||||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  19862285 tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 241
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 195  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 23493983  T
Q  196 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  23493984 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21310750 - 21310709
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21310750 ttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23981557 - 23981516
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  23981557 ttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 384
Target Start/End: Original strand, 32950879 - 32950951
Alignment:
Q  312 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950879 acaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 86 - 465
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
T  41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 283  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
T  41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
Q  284 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 383  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
Q  384 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |    
T  1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
T  1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
T  128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
Q  116 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
Q  216 atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 311  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
T  31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
Q  312 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 118
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
Q  90 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
T  6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
T  6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
Q  395 c--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
T  12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
Q  395 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12380 caaaatttcatacagcatttg-aaagttacaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172242
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 284  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
Q  285 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
Q  385 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177945
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 284  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
Q  285 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
Q  385 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
T  8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
Q  395 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
Q  395 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
T  8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 97 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
Q  395 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccc 455  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 101 - 465
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9192
Alignment:
Q  101 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| |||    
T  8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
Q  201 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 298  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
Q  299 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 396  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
T  9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
Q  397 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 417
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149012
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | |    
T  148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 394  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
Q  395 --caaaattcatacaacatttgaaa 417  Q
       ||||||||||||||||||||||    
T  148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 465
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  365 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  465 a 465  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 465
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272362
Alignment:
Q  87 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
Q  187 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 284  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
Q  285 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | |    
T  272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
Q  385 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 259 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51110
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatctcct 51115  T
Q  459 tacct 463  Q
    |||||    
T  51114 tacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20572
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 226 - 384
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 22588 - 22650
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22588 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 26843 - 26905
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26843 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  226 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  325 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1797 - 1735
Alignment:
Q  9 acatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1797 acatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  457 cttacctta 465  Q
    |||||||||    
T  89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 340 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  340 catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 437  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  438 tatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  79533 ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 464
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 79745 - 79786
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  79745 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||    
T  41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 300  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
Q  301 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 425 - 465
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  425 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 391
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 384
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
T  107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64527
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||     |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
Q  99 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |    
T  828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
Q  199 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 296  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
T  728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
Q  297 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
Q  100 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
Q  199 acatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 295  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
T  34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
Q  296 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 380
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
Q  204 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 300  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
Q  301 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 380  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
Q  104 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
Q  204 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 301  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
Q  302 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
Q  186 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 228  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 384
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  359 agttggagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 356
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 356  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
T  5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 341  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 102963 - 102923
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  102963 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 341
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 341  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 375
Target Start/End: Original strand, 3 - 283
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 293  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
Q  294 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30497
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatgattct 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| |  | |||  |    
T  14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 357  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21115
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  |    
T  21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 294  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
Q  295 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 380  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
T  21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80267
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 219
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatca 219  Q
     |||||||| || ||||||||||    
T  48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
Alignment:
Q  432 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 432 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  432 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 507  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116410
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13325
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13346  T
Q  359 agttggagcacgaatttagca 379  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  13345 actaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
Q  197 caacatcaattgcacaagaatca 219  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
T  48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 507  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 507  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 304
Alignment:
Q  432 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  259 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 358  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  359 agttggagcacgaatttagca 379  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1780
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19802
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24106
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 513  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct 24106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 146
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
Q  97 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa 1863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
Q  105 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 391
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
Q  308 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 391  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 341
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 225  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  54412 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 54511  T
Q  226 aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac 321  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  54512 atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac 54610  T
Q  322 acttattatcaattcatgca 341  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  54611 aattatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 170
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
Q  126 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  45007 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca 45051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcc 504  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 508  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  434 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 471  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||  | || |||    
T  77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 241  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 132444  T
Q  185 tattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  132443 acttaacaacaacaacatcaattg 132420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  266 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 363  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  364 gagcacgaatttagcaacaat 384  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 93814 - 93773
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  93814 ttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 465
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  422 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1348
Alignment:
Q  337 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1386 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9641 - 9603
Alignment:
Q  337 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9641 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1371
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcacttt 498  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| | |||||||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22422
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22463 ttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
Q  10 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 71  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 45815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
Q  86 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 506
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  449 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
Q  152 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 208  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Original strand, 10868 - 10908
Alignment:
Q  334 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  10868 ttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  433 atgattatgataaagactaacccccttacctta 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University