View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19637_low_6 (Length: 238)

Name: NF19637_low_6
Description: NF19637
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19637_low_6
NF19637_low_6
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (9-238)||(22072913-22073142)
chr7 (9-238)||(16219611-16219835)
chr7 (13-231)||(811032-811248)
chr7 (9-231)||(47831807-47832027)
chr7 (24-238)||(16056343-16056554)
chr7 (9-238)||(67745-67971)
chr7 (13-238)||(18005650-18005873)
chr7 (13-231)||(44014182-44014395)
chr7 (24-238)||(12901338-12901551)
chr7 (9-179)||(34200786-34200951)
chr7 (12-132)||(3564363-3564482)
chr7 (9-179)||(11995983-11996148)
chr7 (9-179)||(16495402-16495567)
chr7 (9-179)||(28505254-28505419)
chr7 (9-179)||(15754843-15755008)
chr7 (12-132)||(48273392-48273511)
chr7 (9-133)||(2280117-2280238)
chr7 (9-132)||(13647325-13647447)
chr7 (9-129)||(38227481-38227599)
chr7 (9-129)||(12698831-12698951)
chr7 (12-129)||(18456415-18456530)
chr7 (12-132)||(456321-456439)
chr7 (12-132)||(11972496-11972614)
chr7 (12-132)||(14949166-14949284)
chr7 (12-132)||(15376757-15376875)
chr7 (12-132)||(16232520-16232638)
chr7 (12-132)||(16410059-16410177)
chr7 (12-132)||(18640272-18640390)
chr7 (12-132)||(20385167-20385285)
chr7 (12-132)||(21189639-21189757)
chr7 (16-132)||(24275175-24275289)
chr7 (12-132)||(32125491-32125609)
chr7 (12-132)||(41522917-41523035)
chr7 (12-132)||(41525379-41525497)
chr7 (13-132)||(11393331-11393448)
chr7 (9-132)||(18430709-18430830)
chr7 (9-129)||(9509189-9509308)
chr7 (9-129)||(16386249-16386369)
chr7 (28-231)||(20220090-20220290)
chr7 (12-132)||(24702238-24702356)
chr7 (12-132)||(27216860-27216978)
chr7 (12-132)||(44116509-44116627)
chr7 (12-125)||(16213684-16213795)
chr7 (12-172)||(17061919-17062077)
chr7 (24-189)||(1867937-1868101)
chr7 (12-132)||(3386333-3386451)
chr7 (31-189)||(12255733-12255892)
chr7 (24-191)||(14044761-14044928)
chr7 (24-191)||(14354791-14354958)
chr7 (12-121)||(13869346-13869453)
chr7 (9-129)||(26211995-26212115)
chr7 (9-129)||(10589039-10589158)
chr7 (12-132)||(13831373-13831491)
chr7 (24-132)||(15144037-15144143)
chr7 (12-132)||(24704688-24704803)
chr7 (9-189)||(19486686-19486865)
chr7 (16-132)||(38898420-38898535)
chr7 (32-189)||(15008441-15008597)
chr7 (11-110)||(40443393-40443490)
chr7 (181-231)||(16324175-16324225)
chr7 (12-62)||(20110556-20110606)
chr7 (9-79)||(27847881-27847951)
chr7 (27-133)||(10063816-10063921)
chr7 (154-214)||(9389615-9389675)
chr7 (95-238)||(15113028-15113170)
chr7 (15-78)||(18154894-18154956)
chr7 (37-138)||(14036282-14036384)
chr7 (37-138)||(14346312-14346414)
chr7 (13-62)||(14932802-14932851)
chr7 (13-62)||(15356237-15356286)
chr7 (13-62)||(15360351-15360400)
chr7 (12-62)||(26356106-26356156)
chr7 (12-62)||(26358558-26358608)
chr7 (35-81)||(48991206-48991252)
chr7 (10-62)||(2832509-2832561)
chr7 (28-132)||(12756715-12756817)
chr7 (95-179)||(15116565-15116648)
chr7 (13-78)||(12187019-12187083)
chr7 (13-78)||(17138113-17138177)
chr7 (13-62)||(19649557-19649606)
chr7 (30-78)||(9177718-9177766)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (9-238)||(38855146-38855372)
chr8 (9-231)||(6520368-6520587)
chr8 (13-231)||(21285601-21285817)
chr8 (9-225)||(23760751-23760962)
chr8 (24-225)||(983312-983512)
chr8 (23-231)||(21673718-21673924)
chr8 (9-179)||(5866230-5866395)
chr8 (9-179)||(21490995-21491160)
chr8 (28-231)||(37116366-37116569)
chr8 (9-133)||(16092340-16092463)
chr8 (9-179)||(17140916-17141081)
chr8 (28-238)||(20498581-20498790)
chr8 (28-231)||(17266893-17267096)
chr8 (9-129)||(18818411-18818530)
chr8 (10-129)||(28649046-28649164)
chr8 (9-129)||(7372778-7372897)
chr8 (13-189)||(26355643-26355815)
chr8 (6-123)||(6759255-6759371)
chr8 (12-132)||(14409488-14409606)
chr8 (9-129)||(21919002-21919121)
chr8 (28-225)||(24353039-24353235)
chr8 (9-123)||(23406379-23406492)
chr8 (9-179)||(21249384-21249550)
chr8 (9-179)||(21255222-21255388)
chr8 (12-132)||(1484402-1484520)
chr8 (12-132)||(5853336-5853454)
chr8 (12-132)||(15203275-15203393)
chr8 (16-132)||(16413360-16413474)
chr8 (12-132)||(20403227-20403345)
chr8 (9-129)||(20536208-20536327)
chr8 (9-129)||(21923930-21924049)
chr8 (12-132)||(22001753-22001871)
chr8 (9-129)||(22626736-22626854)
chr8 (12-132)||(20046239-20046357)
chr8 (9-133)||(22875065-22875187)
chr8 (12-132)||(41598188-41598306)
chr8 (28-179)||(17439458-17439609)
chr8 (12-132)||(4483281-4483398)
chr8 (12-132)||(4542417-4542535)
chr8 (9-179)||(17612062-17612231)
chr8 (9-87)||(18879275-18879352)
chr8 (12-133)||(26219717-26219835)
chr8 (9-110)||(31971257-31971356)
chr8 (27-189)||(13508027-13508188)
chr8 (92-231)||(22364745-22364882)
chr8 (9-110)||(16199666-16199765)
chr8 (9-129)||(21395984-21396101)
chr8 (9-129)||(21790477-21790594)
chr8 (12-132)||(19896265-19896386)
chr8 (12-133)||(26225291-26225409)
chr8 (16-117)||(45290754-45290853)
chr8 (27-189)||(13597559-13597720)
chr8 (6-121)||(19937061-19937174)
chr8 (9-129)||(21389454-21389571)
chr8 (9-129)||(21778780-21778897)
chr8 (10-132)||(26223917-26224037)
chr8 (9-110)||(45131019-45131117)
chr8 (12-132)||(14823774-14823891)
chr8 (25-121)||(15070571-15070665)
chr8 (12-132)||(25484319-25484430)
chr8 (11-129)||(18678104-18678221)
chr8 (28-81)||(19154936-19154989)
chr8 (28-132)||(19801426-19801527)
chr8 (10-78)||(23648554-23648621)
chr8 (11-129)||(32121734-32121851)
chr8 (92-138)||(40492844-40492890)
chr8 (96-179)||(18862430-18862512)
chr8 (96-179)||(21383896-21383978)
chr8 (96-179)||(21387316-21387398)
chr8 (96-179)||(21411189-21411271)
chr8 (96-179)||(21805681-21805763)
chr8 (96-179)||(21827799-21827881)
chr8 (95-191)||(14103165-14103260)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (9-238)||(21329391-21329618)
chr5 (9-238)||(21502049-21502277)
chr5 (9-238)||(26011929-26012154)
chr5 (28-238)||(20026834-20027043)
chr5 (13-189)||(21565546-21565720)
chr5 (13-178)||(22959489-22959649)
chr5 (9-179)||(19660791-19660956)
chr5 (9-189)||(19668898-19669073)
chr5 (28-231)||(22178120-22178323)
chr5 (9-129)||(21729066-21729185)
chr5 (9-129)||(21808391-21808510)
chr5 (9-132)||(9077952-9078074)
chr5 (28-178)||(22144068-22144217)
chr5 (9-118)||(21997547-21997655)
chr5 (12-133)||(22412187-22412306)
chr5 (12-129)||(24529223-24529339)
chr5 (12-132)||(264812-264930)
chr5 (12-132)||(10732984-10733102)
chr5 (12-132)||(20909012-20909130)
chr5 (9-129)||(24493569-24493687)
chr5 (9-129)||(25421532-25421651)
chr5 (12-132)||(39363384-39363502)
chr5 (9-131)||(1096467-1096588)
chr5 (9-129)||(8286844-8286964)
chr5 (9-129)||(13025311-13025429)
chr5 (9-129)||(13095495-13095613)
chr5 (9-129)||(23390498-23390617)
chr5 (12-132)||(29329934-29330052)
chr5 (12-132)||(42245409-42245527)
chr5 (12-132)||(36154827-36154942)
chr5 (9-108)||(36314577-36314675)
chr5 (12-132)||(20902053-20902172)
chr5 (12-121)||(39245136-39245243)
chr5 (12-132)||(2154658-2154776)
chr5 (12-132)||(11581243-11581361)
chr5 (9-129)||(25431395-25431513)
chr5 (12-132)||(29345980-29346098)
chr5 (12-121)||(10775731-10775838)
chr5 (12-132)||(29348453-29348571)
chr5 (12-132)||(29350926-29351044)
chr5 (15-121)||(18319089-18319193)
chr5 (9-129)||(22075018-22075138)
chr5 (12-121)||(31061068-31061175)
chr5 (12-121)||(38619434-38619541)
chr5 (12-132)||(32027393-32027511)
chr5 (12-96)||(20918028-20918110)
chr5 (13-121)||(23064512-23064618)
chr5 (9-189)||(40725853-40726032)
chr5 (9-80)||(21293020-21293090)
chr5 (62-166)||(29448055-29448159)
chr5 (28-132)||(37723922-37724023)
chr5 (12-62)||(20806854-20806904)
chr5 (15-121)||(24067110-24067214)
chr5 (13-62)||(26704075-26704124)
chr5 (13-62)||(26973808-26973857)
chr5 (19-109)||(18418590-18418678)
chr5 (11-62)||(17517269-17517320)
chr5 (25-79)||(26732884-26732937)
chr5 (76-133)||(20766118-20766174)
chr5 (118-179)||(21741486-21741545)
chr5 (96-179)||(10753603-10753685)
chr5 (96-179)||(21871525-21871607)
chr5 (13-96)||(21873254-21873336)
chr5 (96-179)||(21875805-21875887)
chr5 (96-179)||(22120149-22120231)
chr5 (28-79)||(26740697-26740747)
chr5 (148-179)||(36314685-36314716)
chr5 (28-78)||(15796438-15796487)
chr5 (13-78)||(22032323-22032387)
chr5 (62-129)||(18356367-18356432)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (9-231)||(6024-6244)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (9-238)||(23019408-23019633)
chr6 (24-238)||(19668386-19668599)
chr6 (24-189)||(25644335-25644500)
chr6 (9-179)||(28496427-28496592)
chr6 (9-179)||(29808838-29809003)
chr6 (24-180)||(9098465-9098620)
chr6 (13-238)||(19652199-19652420)
chr6 (9-179)||(1561303-1561468)
chr6 (9-108)||(27333241-27333339)
chr6 (9-108)||(27393981-27394079)
chr6 (9-132)||(29060540-29060662)
chr6 (9-133)||(20109140-20109261)
chr6 (10-132)||(30676754-30676874)
chr6 (12-172)||(22782227-22782385)
chr6 (9-129)||(16496244-16496363)
chr6 (9-129)||(17287798-17287917)
chr6 (10-137)||(18409821-18409947)
chr6 (9-132)||(25629354-25629476)
chr6 (12-132)||(12742317-12742435)
chr6 (12-132)||(18334636-18334754)
chr6 (12-132)||(19005046-19005164)
chr6 (12-132)||(19858963-19859081)
chr6 (12-132)||(24422547-24422665)
chr6 (12-132)||(25656629-25656747)
chr6 (12-132)||(33861794-33861912)
chr6 (12-132)||(33864278-33864396)
chr6 (9-132)||(20593773-20593895)
chr6 (9-123)||(20076700-20076812)
chr6 (9-231)||(22080640-22080846)
chr6 (12-132)||(2291224-2291342)
chr6 (12-132)||(8055029-8055147)
chr6 (12-132)||(25754809-25754927)
chr6 (12-132)||(26924684-26924802)
chr6 (9-132)||(19303540-19303661)
chr6 (10-132)||(34963371-34963491)
chr6 (12-132)||(1540955-1541073)
chr6 (12-132)||(1595549-1595667)
chr6 (9-129)||(20360962-20361081)
chr6 (12-132)||(20556936-20557054)
chr6 (12-132)||(25688502-25688620)
chr6 (9-110)||(20638304-20638404)
chr6 (9-129)||(22780229-22780348)
chr6 (15-121)||(16448582-16448686)
chr6 (9-189)||(8227453-8227632)
chr6 (12-132)||(3852061-3852179)
chr6 (28-231)||(23076749-23076952)
chr6 (9-71)||(25714417-25714478)
chr6 (9-81)||(16920679-16920751)
chr6 (28-132)||(18456735-18456837)
chr6 (28-132)||(18461895-18461997)
chr6 (9-81)||(35245586-35245658)
chr6 (23-113)||(4185839-4185928)
chr6 (9-77)||(22831503-22831571)
chr6 (28-231)||(35008167-35008370)
chr6 (179-238)||(27333179-27333238)
chr6 (179-238)||(27393919-27393978)
chr6 (23-113)||(4186381-4186470)
chr6 (28-110)||(18821866-18821946)
chr6 (28-72)||(11185524-11185568)
chr6 (11-62)||(19848063-19848114)
chr6 (153-231)||(28103799-28103877)
chr6 (92-191)||(18696570-18696667)
chr6 (61-189)||(18706356-18706483)
chr6 (11-62)||(23992429-23992480)
chr6 (30-81)||(33443068-33443118)
chr6 (6-50)||(19008799-19008843)
chr6 (96-179)||(22949384-22949466)
chr6 (96-179)||(22953340-22953422)
chr6 (96-179)||(23871828-23871910)
chr6 (96-179)||(23875784-23875866)
chr6 (96-179)||(27325388-27325470)
chr6 (13-62)||(18907111-18907160)
chr6 (13-62)||(19862978-19863027)
chr6 (13-62)||(19873120-19873169)
chr6 (13-78)||(21766695-21766759)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (9-238)||(32538-32762)
scaffold0034 (28-110)||(51904-51985)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (9-238)||(15470927-15471150)
chr3 (9-231)||(14234487-14234709)
chr3 (13-238)||(16097332-16097555)
chr3 (13-230)||(12174164-12174376)
chr3 (13-238)||(16103784-16104006)
chr3 (9-179)||(13210283-13210448)
chr3 (9-129)||(18438534-18438653)
chr3 (12-133)||(27165250-27165370)
chr3 (28-238)||(37251061-37251270)
chr3 (9-131)||(14972854-14972975)
chr3 (28-189)||(52523669-52523831)
chr3 (9-129)||(12399209-12399328)
chr3 (12-120)||(53301562-53301669)
chr3 (23-166)||(32307691-32307830)
chr3 (28-231)||(22110252-22110454)
chr3 (27-133)||(42386428-42386533)
chr3 (9-129)||(23083363-23083482)
chr3 (12-132)||(29172627-29172745)
chr3 (9-132)||(25476384-25476506)
chr3 (12-129)||(24153211-24153326)
chr3 (12-133)||(36166598-36166716)
chr3 (12-132)||(6469178-6469296)
chr3 (12-132)||(9707651-9707769)
chr3 (12-132)||(17463178-17463296)
chr3 (12-132)||(17672626-17672744)
chr3 (9-129)||(20698437-20698556)
chr3 (9-129)||(26686887-26687006)
chr3 (12-132)||(28848655-28848773)
chr3 (12-132)||(34159326-34159444)
chr3 (12-132)||(45606951-45607069)
chr3 (12-132)||(55476491-55476609)
chr3 (12-127)||(55500942-55501055)
chr3 (9-110)||(11424781-11424880)
chr3 (12-132)||(7781391-7781509)
chr3 (12-132)||(8899094-8899212)
chr3 (9-129)||(13442274-13442393)
chr3 (12-132)||(16454325-16454443)
chr3 (9-129)||(17487856-17487975)
chr3 (9-129)||(17499338-17499457)
chr3 (12-132)||(38961935-38962053)
chr3 (13-113)||(49668094-49668193)
chr3 (28-172)||(43925977-43926121)
chr3 (12-132)||(13151834-13151953)
chr3 (12-132)||(13154299-13154418)
chr3 (11-132)||(13544024-13544143)
chr3 (13-113)||(9512924-9513023)
chr3 (13-113)||(9520899-9520998)
chr3 (12-132)||(10247767-10247885)
chr3 (16-132)||(12567564-12567678)
chr3 (12-132)||(15977515-15977633)
chr3 (12-132)||(17446699-17446816)
chr3 (12-132)||(40213720-40213838)
chr3 (9-172)||(43550482-43550644)
chr3 (9-129)||(43840932-43841051)
chr3 (23-129)||(14572603-14572707)
chr3 (14-132)||(16282855-16282971)
chr3 (12-74)||(28194693-28194755)
chr3 (12-121)||(12119780-12119887)
chr3 (12-121)||(15412429-15412536)
chr3 (12-133)||(21618449-21618567)
chr3 (9-189)||(24340665-24340844)
chr3 (14-132)||(41123892-41124005)
chr3 (12-132)||(50242822-50242940)
chr3 (27-133)||(23274705-23274810)
chr3 (12-121)||(8499518-8499625)
chr3 (9-189)||(37642207-37642386)
chr3 (12-133)||(10556985-10557105)
chr3 (12-113)||(44494809-44494908)
chr3 (28-132)||(53070697-53070799)
chr3 (12-71)||(17737236-17737294)
chr3 (23-129)||(14576835-14576939)
chr3 (12-62)||(45577950-45578000)
chr3 (118-214)||(1465329-1465423)
chr3 (28-137)||(12377940-12378050)
chr3 (71-189)||(2051141-2051260)
chr3 (9-189)||(22147467-22147646)
chr3 (28-132)||(606324-606428)
chr3 (23-166)||(1644642-1644780)
chr3 (11-62)||(46822267-46822318)
chr3 (119-238)||(49389524-49389642)
chr3 (11-62)||(12511059-12511110)
chr3 (13-78)||(856140-856204)
chr3 (13-78)||(23077530-23077594)
chr3 (10-62)||(14665398-14665450)
chr3 (10-62)||(14668554-14668606)
chr3 (96-179)||(14501207-14501290)
chr3 (96-179)||(19776007-19776089)
chr3 (96-179)||(37439421-37439503)
chr3 (30-80)||(13919350-13919399)
chr3 (169-231)||(43927291-43927353)
chr3 (13-62)||(15878119-15878168)
chr3 (13-61)||(26196500-26196548)
chr3 (10-62)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (24-238)||(10542-10754)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (9-238)||(39706183-39706409)
chr4 (24-238)||(12288103-12288316)
chr4 (9-179)||(15551817-15551982)
chr4 (24-189)||(52243136-52243302)
chr4 (28-238)||(13744-13953)
chr4 (28-231)||(53082052-53082254)
chr4 (12-133)||(54798752-54798872)
chr4 (9-129)||(7798774-7798893)
chr4 (9-129)||(52873369-52873488)
chr4 (24-189)||(43198495-43198661)
chr4 (13-166)||(12774011-12774160)
chr4 (12-133)||(14280316-14280435)
chr4 (12-132)||(16377522-16377639)
chr4 (9-129)||(7088877-7088996)
chr4 (9-129)||(12902757-12902876)
chr4 (12-132)||(18215318-18215436)
chr4 (12-132)||(44928923-44929042)
chr4 (28-231)||(46640356-46640558)
chr4 (12-132)||(12351-12469)
chr4 (9-129)||(7893703-7893822)
chr4 (12-132)||(15118396-15118514)
chr4 (12-132)||(44773131-44773249)
chr4 (12-132)||(52312510-52312628)
chr4 (6-132)||(19242693-19242817)
chr4 (10-132)||(19618216-19618336)
chr4 (12-132)||(1837553-1837671)
chr4 (12-132)||(3515007-3515125)
chr4 (9-129)||(16270238-16270356)
chr4 (12-132)||(18239463-18239581)
chr4 (12-132)||(44615288-44615406)
chr4 (12-132)||(50222383-50222501)
chr4 (12-132)||(51463912-51464030)
chr4 (13-189)||(8846360-8846550)
chr4 (14-132)||(14038653-14038770)
chr4 (9-102)||(3096293-3096385)
chr4 (12-125)||(23803316-23803427)
chr4 (9-129)||(6899891-6900009)
chr4 (9-129)||(16239972-16240090)
chr4 (9-129)||(44052829-44052948)
chr4 (47-179)||(16596686-16596813)
chr4 (11-129)||(22636437-22636554)
chr4 (12-133)||(8574867-8574985)
chr4 (16-121)||(15355380-15355483)
chr4 (16-129)||(23374361-23374473)
chr4 (12-132)||(44102214-44102332)
chr4 (10-132)||(14970751-14970871)
chr4 (9-81)||(17046487-17046559)
chr4 (28-110)||(6190481-6190563)
chr4 (118-214)||(15099457-15099551)
chr4 (118-214)||(15190424-15190518)
chr4 (12-71)||(7641286-7641344)
chr4 (12-71)||(12610950-12611008)
chr4 (9-110)||(14053323-14053422)
chr4 (9-121)||(15367690-15367800)
chr4 (9-121)||(15370018-15370128)
chr4 (9-121)||(15371202-15371312)
chr4 (9-121)||(15373483-15373593)
chr4 (9-121)||(15402703-15402813)
chr4 (9-121)||(16223532-16223642)
chr4 (28-132)||(21815629-21815731)
chr4 (90-136)||(15464926-15464972)
chr4 (15-121)||(20149832-20149936)
chr4 (11-132)||(22353835-22353955)
chr4 (96-179)||(630728-630810)
chr4 (96-179)||(3331970-3332052)
chr4 (96-179)||(13812763-13812845)
chr4 (96-179)||(14953915-14953997)
chr4 (96-179)||(25690146-25690228)
chr4 (10-62)||(20157527-20157579)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (9-231)||(936-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (9-238)||(6611-6838)
scaffold0333 (9-238)||(13991-14218)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (9-231)||(12942-13159)
scaffold0138 (92-226)||(18143-18276)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (9-231)||(6535-6755)
scaffold0621 (24-238)||(8481-8696)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (9-236)||(12766-12991)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (13-238)||(22921763-22921986)
chr1 (28-238)||(21861463-21861672)
chr1 (28-225)||(21896162-21896358)
chr1 (9-189)||(33681010-33681185)
chr1 (9-189)||(22237630-22237805)
chr1 (25-179)||(20918620-20918769)
chr1 (10-132)||(50210212-50210333)
chr1 (28-238)||(50614009-50614219)
chr1 (28-238)||(50621837-50622047)
chr1 (9-179)||(14295507-14295672)
chr1 (13-189)||(20248283-20248454)
chr1 (12-129)||(34509783-34509899)
chr1 (28-238)||(16368180-16368388)
chr1 (23-166)||(21754059-21754198)
chr1 (28-231)||(50686630-50686833)
chr1 (28-189)||(35261023-35261180)
chr1 (9-172)||(45574846-45575008)
chr1 (28-231)||(41049936-41050138)
chr1 (24-238)||(52927876-52928076)
chr1 (12-132)||(13988866-13988984)
chr1 (12-132)||(21923335-21923453)
chr1 (12-132)||(23593779-23593897)
chr1 (24-188)||(16758664-16758828)
chr1 (12-131)||(31612313-31612430)
chr1 (11-132)||(21840766-21840885)
chr1 (12-132)||(21475131-21475249)
chr1 (9-129)||(27250731-27250850)
chr1 (12-132)||(29298137-29298254)
chr1 (12-132)||(433012-433128)
chr1 (12-124)||(22123119-22123230)
chr1 (9-129)||(22532269-22532388)
chr1 (12-132)||(29776688-29776806)
chr1 (9-112)||(20847173-20847275)
chr1 (9-129)||(21026680-21026799)
chr1 (10-132)||(16361915-16362035)
chr1 (12-172)||(21707167-21707325)
chr1 (12-172)||(21711709-21711867)
chr1 (9-121)||(13212917-13213027)
chr1 (10-78)||(20454606-20454673)
chr1 (6-121)||(15860064-15860177)
chr1 (6-121)||(21342090-21342203)
chr1 (28-190)||(16093825-16093987)
chr1 (12-121)||(16275419-16275526)
chr1 (12-121)||(21346961-21347068)
chr1 (9-85)||(38801433-38801508)
chr1 (10-129)||(22468698-22468816)
chr1 (118-231)||(35981589-35981700)
chr1 (118-214)||(49261448-49261542)
chr1 (62-179)||(22130863-22130975)
chr1 (117-214)||(20636956-20637051)
chr1 (13-230)||(21161720-21161932)
chr1 (15-121)||(40389157-40389261)
chr1 (13-62)||(21714546-21714595)
chr1 (10-129)||(20135188-20135306)
chr1 (30-179)||(26064959-26065107)
chr1 (85-179)||(51130639-51130729)
chr1 (10-62)||(24783160-24783212)
chr1 (96-179)||(1924914-1924996)
chr1 (96-179)||(20923928-20924010)
chr1 (95-132)||(12271639-12271676)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-238)||(19268-19491)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (13-238)||(100378-100601)
scaffold0023 (13-230)||(40076-40291)
scaffold0023 (12-132)||(94411-94529)
scaffold0023 (12-132)||(44454-44573)
scaffold0023 (16-132)||(17484-17598)
scaffold0023 (9-82)||(119875-119948)
scaffold0023 (13-86)||(101503-101576)
scaffold0023 (13-62)||(38547-38596)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (13-238)||(25175854-25176077)
chr2 (14-238)||(28405981-28406204)
chr2 (28-238)||(7626-7835)
chr2 (13-177)||(7679589-7679750)
chr2 (24-238)||(18786796-18787009)
chr2 (12-132)||(22105412-22105531)
chr2 (12-129)||(298816-298933)
chr2 (9-189)||(23708561-23708738)
chr2 (28-238)||(23791292-23791502)
chr2 (9-129)||(23060513-23060632)
chr2 (9-179)||(23071905-23072070)
chr2 (28-231)||(23207296-23207498)
chr2 (12-132)||(6725995-6726113)
chr2 (9-133)||(22337115-22337238)
chr2 (9-129)||(23076442-23076561)
chr2 (12-132)||(571397-571515)
chr2 (12-132)||(18808943-18809061)
chr2 (12-132)||(23130862-23130980)
chr2 (12-132)||(23133329-23133447)
chr2 (12-132)||(23135590-23135708)
chr2 (12-132)||(23709576-23709694)
chr2 (12-132)||(23712057-23712175)
chr2 (12-132)||(26505379-26505497)
chr2 (12-132)||(26507857-26507975)
chr2 (12-132)||(34402566-34402684)
chr2 (12-132)||(39682313-39682431)
chr2 (28-231)||(25108906-25109109)
chr2 (10-132)||(32214965-32215085)
chr2 (12-132)||(24367774-24367892)
chr2 (12-132)||(28577099-28577217)
chr2 (9-179)||(19671830-19671998)
chr2 (9-127)||(22731238-22731355)
chr2 (9-110)||(38136-38235)
chr2 (15-132)||(21155104-21155219)
chr2 (12-132)||(24898239-24898358)
chr2 (12-132)||(24900722-24900841)
chr2 (12-132)||(24903199-24903318)
chr2 (12-132)||(24905676-24905795)
chr2 (12-132)||(24908151-24908270)
chr2 (12-132)||(32039542-32039660)
chr2 (9-87)||(23285865-23285942)
chr2 (14-132)||(43137301-43137417)
chr2 (9-129)||(23660023-23660141)
chr2 (12-132)||(45029898-45030016)
chr2 (9-129)||(20309108-20309225)
chr2 (28-179)||(20520145-20520295)
chr2 (9-129)||(22738182-22738300)
chr2 (9-132)||(23103396-23103516)
chr2 (12-132)||(24529573-24529691)
chr2 (9-88)||(8946657-8946735)
chr2 (28-189)||(22413078-22413240)
chr2 (10-131)||(22134208-22134326)
chr2 (12-132)||(38967374-38967493)
chr2 (9-73)||(23040247-23040310)
chr2 (9-129)||(23654388-23654507)
chr2 (28-110)||(32451949-32452031)
chr2 (15-71)||(24643054-24643109)
chr2 (28-189)||(24697548-24697709)
chr2 (28-138)||(23004767-23004878)
chr2 (95-238)||(22459455-22459598)
chr2 (16-129)||(25616192-25616304)
chr2 (30-80)||(23287384-23287433)
chr2 (30-79)||(26392403-26392451)
chr2 (96-179)||(1283666-1283748)
chr2 (96-179)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-231)||(5657-5863)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (89-238)||(8094-8242)
scaffold0556 (23-238)||(6826-7036)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (13-238)||(2539-2762)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (13-231)||(1086-1302)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (24-238)||(10435-10647)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (23-238)||(129919-130132)
scaffold0010 (28-136)||(60710-60818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (13-231)||(14598-14814)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (27-238)||(62216-62422)
scaffold0028 (12-132)||(136680-136798)
scaffold0028 (12-132)||(139149-139267)
scaffold0028 (12-132)||(144087-144205)
scaffold0028 (12-132)||(134211-134329)
scaffold0028 (12-132)||(141618-141736)
scaffold0028 (13-116)||(132662-132765)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (24-222)||(7983-8180)
scaffold0218 (56-177)||(29238-29354)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (24-189)||(22613-22776)
scaffold0037 (12-132)||(82072-82190)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (13-238)||(160688-160910)
scaffold0001 (16-132)||(501088-501202)
scaffold0001 (12-121)||(85635-85742)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (13-189)||(45735-45909)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (13-189)||(133-307)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (28-238)||(136261-136471)
scaffold0021 (28-238)||(144969-145179)
scaffold0021 (10-132)||(174767-174886)
scaffold0021 (9-79)||(121766-121835)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (28-226)||(6188-6386)
scaffold0420 (28-75)||(13793-13840)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (12-179)||(15664-15826)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (9-179)||(11292-11457)
scaffold0046 (9-179)||(1997-2162)
scaffold0046 (9-129)||(28414-28533)
scaffold0046 (9-65)||(4552-4608)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-238)||(12587-12795)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (10-132)||(3185-3306)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (28-231)||(128870-129072)
scaffold0022 (32-231)||(78345-78542)
scaffold0022 (12-133)||(116430-116548)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (13-238)||(2698-2923)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (9-179)||(1025-1190)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (32-231)||(38339-38538)
scaffold0139 (13-62)||(19980-20029)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (12-133)||(44705-44825)
scaffold0122 (16-132)||(26064-26179)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (12-133)||(38700-38820)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (67-238)||(2112-2281)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (9-133)||(3149-3271)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (24-136)||(27744-27855)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (9-145)||(15763-15898)
scaffold0020 (13-62)||(178898-178947)
scaffold0020 (200-238)||(15726-15764)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (24-231)||(103539-103737)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (10-132)||(17214-17337)
scaffold0056 (28-132)||(79328-79430)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (24-136)||(16095-16206)
scaffold0357 (28-134)||(13147-13252)
scaffold0357 (28-80)||(2680-2732)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (28-238)||(53442-53651)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-133)||(39479-39599)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (28-231)||(19785-19987)
scaffold0080 (9-129)||(39913-40031)
scaffold0080 (96-179)||(48939-49021)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-133)||(75213-75333)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (28-231)||(97024-97227)
scaffold0006 (28-231)||(106302-106505)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (28-133)||(1051-1155)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-129)||(4849-4968)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (9-179)||(34123-34288)
scaffold0175 (59-129)||(13141-13211)
scaffold0175 (9-62)||(273-326)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (9-129)||(51913-52032)
scaffold0011 (9-129)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (9-132)||(16113-16235)
scaffold0120 (9-129)||(32959-33077)
scaffold0120 (9-129)||(45928-46046)
scaffold0120 (9-71)||(17389-17450)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (24-179)||(25121-25275)
scaffold0123 (92-189)||(620-715)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (12-129)||(22886-23001)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (12-132)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-132)||(20747-20865)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (9-129)||(13211-13330)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-132)||(37821-37939)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (12-132)||(158494-158612)
scaffold0003 (12-132)||(339949-340065)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (9-136)||(8479-8605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (9-132)||(16599-16721)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (11-132)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (12-132)||(4694-4812)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (9-129)||(3470-3589)
scaffold0292 (9-129)||(343-461)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (12-132)||(13947-14065)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (9-129)||(32942-33060)
scaffold0145 (7-132)||(9744-9867)
scaffold0145 (9-129)||(38761-38879)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (12-132)||(16784-16902)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (9-129)||(1851-1970)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (9-129)||(8535-8650)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (9-113)||(23901-24001)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-132)||(11286-11406)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (9-189)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (9-189)||(38198-38377)
scaffold0124 (96-179)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (9-129)||(1050-1169)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (30-238)||(7952-8161)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (9-133)||(4508-4630)
scaffold0228 (9-133)||(12090-12212)
scaffold0228 (9-133)||(22042-22164)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (12-132)||(40400-40518)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (9-133)||(25896-26018)
scaffold0026 (9-133)||(39858-39980)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (59-231)||(54-226)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (9-129)||(6123-6245)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (13-116)||(32102-32205)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (10-132)||(12293-12413)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (9-129)||(10427-10544)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (12-121)||(4214-4321)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (11-132)||(9241-9360)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (12-132)||(29931-30050)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-222)||(267679-267872)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (9-101)||(4712-4803)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (27-129)||(24304-24406)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (9-79)||(1289-1359)
scaffold0106 (9-81)||(7266-7338)
scaffold0106 (12-78)||(15291-15356)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (28-226)||(569-765)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (15-132)||(4300-4415)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (9-112)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (9-189)||(17969-18148)
scaffold0247 (12-121)||(2184-2291)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (12-132)||(106-224)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (9-129)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-129)||(20910-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-81)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (9-88)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (9-80)||(32067-32137)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (28-223)||(1706-1900)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (12-132)||(12064-12176)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-110)||(15485-15584)
scaffold0114 (13-78)||(7295-7359)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (12-132)||(161133-161252)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (30-129)||(4545-4643)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (13-86)||(28813-28887)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (15-121)||(1336-1440)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (9-79)||(46995-47065)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (9-110)||(11464-11564)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (9-81)||(1098-1170)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (28-132)||(20423-20524)
scaffold0031 (9-129)||(128751-128869)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-75)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (9-76)||(4888-4954)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (28-113)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (67-189)||(225465-225585)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (13-62)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (13-62)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (73-132)||(3529-3588)
scaffold0327 (13-63)||(289-339)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (28-71)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (13-62)||(29558-29607)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (85-179)||(2398-2488)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (96-179)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (91-133)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (30-80)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (13-78)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (13-62)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (13-78)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (13-62)||(21871-21920)
scaffold0210 (13-62)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (13-62)||(69794-69843)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (95-191)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073142
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 22073112  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22073113 ttactgaaacaacaacatcaagacaaacaa 22073142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219611
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggc 16219641  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16219640 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 16219611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811032
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttac 811051  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  811050 tgaaactacaacagcaaga 811032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47832027
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggc 47832004  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  47832005 ttactgaaacaacaacaacaaga 47832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056554
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16056441 acatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaa 16056539  T
Q  224 cagcaagacaaacaa 238  Q
    || ||||| ||||||    
T  16056540 catcaagataaacaa 16056554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67971
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 67843  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 207  Q
     |||| || |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatctcaat-atcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 67940  T
Q  208 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67941 ctcactgaaacaacaacagcaagataaacaa 67971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005873
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggctta 18005846  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18005847 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 18005873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014395
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | ||   | |||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  44014281 gcaa---atcaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggctta 44014375  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44014376 ctgaaacaacaacagcaaga 44014395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901551
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 222  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12901438 aacatcacaa-catcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaaca 12901535  T
Q  223 acagcaagacaaacaa 238  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  12901536 acaacaagataaacaa 12901551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200951
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564363
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 3564384  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3564383 tgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11995983
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatt 11996050  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996049 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495567
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505254
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
      || ||| ||| |||   |||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505320 ggatataaatcagcaa---ctcaattatcaaac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754843
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15754843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273511
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 48273490  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  48273491 tgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280117
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647447
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227599
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38227578  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38227579 aaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12698951
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatat 12698929  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  12698930 caattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456415
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 18456433  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  18456432 tgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456439
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 456418  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456419 tgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972614
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 11972593  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11972594 tgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949166
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14949187  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14949186 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376757
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15376778  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15376777 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232638
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16232617  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16232618 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410177
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16410156  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16410157 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640390
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18640369  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18640370 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385167
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20385188  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20385187 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189639
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21189660  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21189659 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275289
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24275272  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24275273 agtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125609
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32125588  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32125589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523035
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41523014  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41523015 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525497
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41525476  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41525477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393331
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11393351  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    | ||||||||||| ||||||    
T  11393350 gcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430830
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatc 18430806  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  18430807 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509308
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatc 9509287  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  9509288 aattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386249
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || ||||  ||| ||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220090
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
     |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaaca 20220096  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  20220095 gtaaga 20220090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702356
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 24702335  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24702336 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27216978
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 27216957  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  27216958 tgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116627
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 44116606  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44116607 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213795
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16213781  T
Q  112 tgtaagtcaacaac 125  Q
    |  |||||||||||    
T  16213782 tccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061919
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    || |||||| |||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867937
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1868003 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386451
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaa 3386430  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3386431 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255733
Alignment:
Q  31 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  130 caaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    |||||| ||| | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255792 caaacattcatatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044928
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14044858  T
Q  122 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044859 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354958
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||| |||  | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaa-cagctcctgatataacaatatc-aatacaaatcaa 14354888  T
Q  122 -caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
     ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354889 tcaacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13869443  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  13869444 tgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212115
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatat 26212093  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  26212094 caattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589158
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaa 13831470  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13831471 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15144037
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacat-ctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaaca 15144046  T
Q  124 acatctcaa 132  Q
    |||||||||    
T  15144045 acatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704803
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||   | || || |||| |||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaa---aacaagacataataatatcaaa 24704782  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24704783 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24704803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486686
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898420
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38898438  T
Q  116 agtcaa-caacatctcaa 132  Q
    |||||| |||||||||||    
T  38898437 agtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008441
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  130 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008499 caaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443490
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324225
Alignment:
Q  181 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 16324225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110606
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847881
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063816
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  127 tctcaaa 133  Q
    |||||||    
T  10063822 tctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389615
Alignment:
Q  154 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactg 9389615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113170
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  195 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaa 15113170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154894
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggcag 18154894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 14036282 - 14036384
Alignment:
Q  37 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14036282 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14036379  T
Q  134 catca 138  Q
    |||||    
T  14036380 catca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 14346312 - 14346414
Alignment:
Q  37 actcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  14346312 actcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaa 14346409  T
Q  134 catca 138  Q
    |||||    
T  14346410 catca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932802
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356237
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360351
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26356106
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26356106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358558
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaa 26358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 81
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991252
Alignment:
Q  35 cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756715
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataac-aacagcaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgt 12756720  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  12756719 ctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116648
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacatta 15116648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649557
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9177766 - 9177718
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9177766 tagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855146
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 38855176  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38855175 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 38855146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520587
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6520564  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6520565 ttactgaaacaacaacagcaaga 6520587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285817
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttac 21285798  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21285799 tgaaacaacaacaacaaga 21285817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760751
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||     
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcatcatgatataacaatatt 23760867  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 207  Q
     |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  23760866 gaattcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcagg 23760769  T
Q  208 cttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23760768 cttactgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983312
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 983414  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  983413 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaac 983316  T
Q  222 aaca 225  Q
    ||||    
T  983315 aaca 983312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673924
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||||||| ||| || || || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  21673817 aacatctcaaatatc-aatat-aatttatttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaac 21673914  T
Q  222 aacagcaaga 231  Q
    |||| |||||    
T  21673915 aacaacaaga 21673924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866230
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 5866230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491160
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatt 21491093  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491094 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21491160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116569
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaaca 37116563  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  37116564 gtaaga 37116569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092340
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16092365  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16092364 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141081
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 17141081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498790
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| |||||     
T  20498680 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacat 20498778  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||    
T  20498779 caagataaacaa 20498790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266893
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||||||||||| | || || || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266996 tctcaaacatcatatat-aattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacag 17266898  T
Q  227 caaga 231  Q
     ||||    
T  17266897 taaga 17266893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818411
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18818432  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  18818431 aattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28649046
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 28649066  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28649065 aatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7372897
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7372876  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7372877 aattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355643
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaat 26355717  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    | || ||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26355716 gcaa-tcaacaacatctcagccatc-aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759371
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataat 6759353  T
Q  106 atcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6759354 atcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409488
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14409509  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14409508 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21919002
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21919023  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21919022 aattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353235
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||  | |  || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353137 atctcaaacatcgtata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406492
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23406477  T
Q  109 aaatgtaagtcaaca 123  Q
    || || |||||||||    
T  23406478 aattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249550
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21249482  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249483 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255388
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatat 21255320  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    | ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255321 cgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484520
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 1484499  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1484500 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853336
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 5853357  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5853356 tgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203275
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15203296  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  15203295 tgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413360
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403345
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20403324  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20403325 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536327
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20536306  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20536307 aattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923930
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | ||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatc 21923951  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  21923950 aattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001871
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22001850  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22001851 tgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626854
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22626833  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||||||||||||    
T  22626834 aaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046239
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 20046260  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20046259 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875187
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 22875162  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875163 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598306
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 41598285  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  41598286 tgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439458
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439510 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483398
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4483377  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4483378 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542417
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 4542438  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4542437 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612062
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879275
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219835
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-tagtatgacataataatatcaaa 26219813  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  26219814 tgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971356
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 31971354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508027
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  127 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364882
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  192 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 22364882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199666
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395984
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790477
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896386
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatc 19896362  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896363 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225291
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acaatatacaaaa-cagtatgacataataatatcaaa 26225313  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  26225312 tacaagtcaacaacatctcaaa 26225291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290754
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 45290756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597559
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  127 tctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    || |||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataag 19937077  T
Q  106 atcaaatgtaagtcaa 121  Q
    |||||||| |||||||    
T  19937076 atcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389454
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778780
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224037
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataac-aacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatca 26224014  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26224015 aatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45131019
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatc 45131021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823891
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14823870  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14823871 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484319
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataac-aacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25484340  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25484339 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25484319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678104
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 18678123  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatct 129  Q
     || || ||||||||||||    
T  18678122 ttgcaattcaacaacatct 18678104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154936
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801426
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgt 19801431  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  19801430 ctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648621
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaac-aatagcaacataggcag 23648621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121851
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| ||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaa 32121832  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatct 129  Q
     || || ||||||||||||    
T  32121833 ttgcaattcaacaacatct 32121851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329391
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatc 21329520  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 21329421  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21329420 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 21329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502049
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 207  Q
     |||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcagg 21502080  T
Q  208 cttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21502079 cttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 21502049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011929
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatc 26012058  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggc 26011959  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26011958 ttactgaaacaacaataacaagataaacaa 26011929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026834
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaa-cagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20026944 atcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactaca 20026847  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
     ||||| ||||||    
T  20026846 acaagataaacaa 20026834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565720
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    | |||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 21565720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959489
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaat 22959551  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 178  Q
    | || |||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959550 gcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660791
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatc 19660858  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||| ||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660857 gaatataaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 19660791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669073
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatc 19668996  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19668997 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178120
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22178224 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaaca 22178126  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  22178125 gtaaga 22178120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729066
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21729087  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21729086 aattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808391
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 21808412  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21808411 aattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078074
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 9078050  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  9078051 aagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144217
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 178  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 21997557  T
Q  109 aaatgtaagt 118  Q
    ||||| ||||    
T  21997556 aaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412306
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 22412284  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  22412285 tgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529339
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaa 24529321  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  24529322 tgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264812
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 264833  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  264832 tgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732984
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10733005  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10733004 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909130
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20909109  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20909110 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493687
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 24493666  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  24493667 aaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421651
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25421630  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  25421631 aattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363502
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39363481  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39363482 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096588
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatc 1096565  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctca 131  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  1096566 aaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286844
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 8286866  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||| || || ||| ||||||||    
T  8286865 caattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025429
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13025408  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13025409 aaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095613
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatc 13095592  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13095593 aaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390498
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23390519  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23390518 aattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330052
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29330031  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29330032 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245409
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 42245430  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  42245429 tgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154827
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 36154848  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36154847 tgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20902075  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  20902074 gtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245243
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39245233  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  39245234 tgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 2154679  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2154678 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581243
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 11581264  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||| ||| ||||||    
T  11581263 tgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431513
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 25431492  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  25431493 aattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346098
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29346077  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29346078 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775731
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaa 10775741  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  10775740 tgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348571
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29348550  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29348551 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351044
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa-gaacagcatcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29351023  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29351024 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319089
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 18319096  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  18319095 aagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075138
Alignment:
Q  9 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatat 22075116  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  22075117 caattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31061165  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  31061166 tgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38619531  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  38619532 tgcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027511
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32027490  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  32027491 tccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918028
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 20918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaat 23064609  T
Q  113 gtaagtcaa 121  Q
    | |||||||    
T  23064610 gcaagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726032
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatc 40725951  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21293020
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  62 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 159  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  160 tatacaa 166  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724023
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  37724019 ctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806854
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||     
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 24067207  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  24067208 aagtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704124
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973857
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  19 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517269
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 17517269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  76 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873336
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga 96  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcagcataggcaggatacaacatcagcatga 21873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  148 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 15796438 - 15796487
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15796438 cttagaccgactcatgcagctta-atcaataataaacagcaacataggcag 15796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 129
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  62 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6024
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 6146  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggc 6047  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  6046 ttactgaaacaataacagcaaga 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019633
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 23019504  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggc 23019603  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23019604 ttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668599
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19668485 caacatcac-aacatcatacgt-aattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaac 19668582  T
Q  222 aacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||| ||||||    
T  19668583 aacagcaagataaacaa 19668599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644500
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  124 acatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496427
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28496427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808838
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 29808838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098465
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaa 180  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098520 aacttcac-aacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652420
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatctcaaacatc-aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 19652394  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||    
T  19652395 tggaacaataacagcaagataaacaa 19652420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561468
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     |||| || |||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060662
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29060638  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  29060639 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109261
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20109261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676754
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 30676777  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  30676776 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782385
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22782324  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782325 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496363
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 16496342  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  16496343 aattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287798
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatc 17287819  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  17287818 aattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409821
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatca 18409849  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 137  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409848 aatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629354
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatc 25629378  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25629377 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742435
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12742414  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12742415 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334636
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18334657  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18334656 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005164
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19005143  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19005144 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858963
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 19858984  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  19858983 tgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422665
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24422644  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24422645 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656747
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25656726  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||| || ||| ||||||    
T  25656727 tgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861912
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33861891  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33861892 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864396
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 33864375  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  33864376 tgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20593895
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 20593871  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  20593872 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076812
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatc 20076797  T
Q  109 aaatgtaagtcaaca 123  Q
    ||||| || ||||||    
T  20076798 aaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080640
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa-------------cataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatc 22080761  T
Q  109 aaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcag 206  Q
     |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||    
T  22080760 gaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacatttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttag 22080665  T
Q  207 gcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  22080664 gcttactgaaacaacaagagcaaga 22080640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291224
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2291245  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  2291244 tgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055147
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8055126  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8055127 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754927
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 25754906  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  25754907 tgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924684
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 26924705  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26924704 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303540
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 19303564  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  19303563 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963491
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 34963468  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  34963469 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540955
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaa 1540976  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1540975 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595667
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 1595646  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  1595647 tgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360962
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatc 20360983  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20360982 aattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556936
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaa 20556957  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20556956 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688620
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaac 25688599  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  25688600 tgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638304
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20638306  T
Q  109 aa 110  Q
    ||    
T  20638305 aa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780229
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatc 22780250  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  22780249 aattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448582
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 16448589  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  16448588 aagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227453
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852061
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaa 3852082  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3852081 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076952
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23076849 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacag 23076947  T
Q  227 caaga 231  Q
     ||||    
T  23076948 taaga 23076952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920679
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456837
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18456832  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  18456833 ctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18461997
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 18461992  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  18461993 ctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245658
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185839
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831571
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 77  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008370
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| ||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaaca 35008266  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
     || |||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||    
T  35008267 acttaaacatcatatat-aattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacag 35008365  T
Q  227 caaga 231  Q
     ||||    
T  35008366 taaga 35008370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333179
Alignment:
Q  179 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaa 27333179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393919
Alignment:
Q  179 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaa 27393919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186470
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821866
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185568
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19848063
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103799
Alignment:
Q  153 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  61 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 158  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  159 atatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992480
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaa 23992480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443118
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtat 33443118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 50  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907160
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873169
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32762
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatc 32634  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggc 32732  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32733 ttactgaaacaataacaacaagataaacaa 32762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51904
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa 51904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471150
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggc 15471120  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15471121 ttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 15471150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234709
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggc 14234684  T
Q  209 ttactga--aacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||||  |||||||||| |||||    
T  14234685 ttactgaacaacaacaacaacaaga 14234709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097555
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 16097529  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  16097530 tggaacaacaacagcaagataaacaa 16097555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174164
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12174278  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggctta 211  Q
    | ||   ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||    
T  12174277 gcaa---aacaacaactcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtctta 12174183  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaag 230  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12174182 ctggaacaacaacagcaag 12174164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16104006
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || |||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttac 16103980  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    || |||||||||||||||| ||||||    
T  16103981 tggaacaacaacagcaagataaacaa 16104006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210283
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     |||| || |||||||   || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438653
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 18438632  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  18438633 aaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165370
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251061
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37251171 atctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaaca 37251074  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
    | |||| ||||||    
T  37251073 gtaagataaacaa 37251061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14972975
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14972952  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctca 131  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  14972953 aaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523669
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  126 atctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399328
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 12399307  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  12399308 aaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301562
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  112 tgtaagtca 120  Q
    || ||||||    
T  53301570 tgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307830
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 166  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32307789 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110252
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||| ||||| | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110355 atctcaa-catcatatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 22110258  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  22110257 gtaaga 22110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386533
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaaca 42386526  T
Q  127 tctcaaa 133  Q
    |||||||    
T  42386527 tctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083363
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 23083384  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23083383 aattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172627
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 29172648  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29172647 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476384
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 25476408  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25476407 aaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153211
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 24153229  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  24153228 tgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166716
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 36166694  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  36166695 tgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6469199  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6469198 tgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707651
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 9707672  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |  ||||||||||| ||||||    
T  9707671 tacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463296
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17463275  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17463276 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17672723  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  17672724 tgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698437
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatc 20698458  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  20698457 aattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687006
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26686985  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  26686986 aattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848655
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 28848676  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  28848675 tgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159444
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34159423  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34159424 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606951
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 45606972  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45606971 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476609
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55476588  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  55476589 tgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 55501039  T
Q  112 tgtaagtcaacaacat 127  Q
    || |||||||||||||    
T  55501040 tgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424781
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781391
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 7781412  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  7781411 tgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899212
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 8899191  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8899192 tgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442393
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13442372  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13442373 aattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454325
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 16454346  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16454345 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17487975
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17487954  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17487955 aattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499457
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17499436  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  17499437 aattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961935
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 38961956  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38961955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668094
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 49668095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 172
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926121
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    ||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926076 atctcaaacatcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151834
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13151856  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13151855 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154299
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13154321  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13154320 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544143
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 13544121  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  13544122 atgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513023
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9513022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520998
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 9520997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247767
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 10247788  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10247787 tgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567678
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 12567661  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12567662 agtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 15977612  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15977613 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446699
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17446720  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  17446719 tgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213720
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| || || || ||||| |||| |||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaa 40213741  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  40213740 tgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550482
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  | ||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841051
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 43841030  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  43841031 aattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572707
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  123 aacatct 129  Q
    |||||||    
T  14572701 aacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282855
Alignment:
Q  14 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatg 16282874  T
Q  114 taagtcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  16282873 caagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12119790  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  12119789 tgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15412526  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  15412527 tgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618567
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 21618545  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21618546 tgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340665
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124005
Alignment:
Q  14 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa----caacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 41123986  T
Q  114 taagtcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  41123987 caagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242940
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50242919  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  50242920 tgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274810
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  127 tctcaaa 133  Q
    |||||||    
T  23274804 tctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 8499615  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  8499616 tgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642207
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaa 10557082  T
Q  112 tgtaagtcaa-caacatctcaaa 133  Q
    || ||| ||| ||||||||||||    
T  10557083 tgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaa 44494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070697
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-acagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 53070702  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  53070701 ctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737294
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 17737294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576835
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtat-aaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 14576842  T
Q  123 aacatct 129  Q
    |||||||    
T  14576841 aacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577950
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465329
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactg 1465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378050
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-tagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 12378038  T
Q  126 atctcaaacatc 137  Q
    | || |||||||    
T  12378039 aacttaaacatc 12378050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  71 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 167  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  168 tatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaa 606332  T
Q  125 catctcaa 132  Q
    ||||||||    
T  606331 catctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644642
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaac 1644684  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 166  Q
    || |||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  1644683 aatatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822318
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389524
Alignment:
Q  119 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 218  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  219 aacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaa 49389524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511110
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaa 12511110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataac-aatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665450
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927353
Alignment:
Q  169 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 43927353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878119
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 61  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30029893
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaa 30029893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10754
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 223  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10641 acatctcaaacatcgaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaa 10739  T
Q  224 cagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||| ||||||    
T  10740 cagcaagataaacaa 10754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706183
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaacatc-aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggc 39706213  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39706212 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 39706183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288103
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12288217 caacatcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 12288120  T
Q  222 aacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12288119 aacagcaagataaacaa 12288103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551982
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatc 15551915  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     || |||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551916 gaaggtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243136
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  122 caacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13744
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  128 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  13854 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 13756  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
     |||| ||||||    
T  13755 aaagataaacaa 13744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082052
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 53082058  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  53082057 gtaaga 53082052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798752
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 54798774  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  54798773 tgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798893
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7798872  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  7798873 aattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873369
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52873390  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52873389 aattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198495
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  123 aacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    || |||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774160
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 166  Q
      || |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  12774110 acaa-tcaacaacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280435
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 14280413  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  14280414 tgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377522
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaa 16377543  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16377542 tgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7088996
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7088975  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  7088976 aattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902876
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12902855  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || ||||| ||| ||||||||    
T  12902856 aattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215318
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18215339  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18215338 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928923
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaa 44928944  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||| ||||||||||    
T  44928943 tgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640356
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46640459 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataaca 46640362  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  46640361 gtaaga 46640356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12351
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 12372  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12371 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893822
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 7893801  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  7893802 aattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118396
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15118417  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15118416 tgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773131
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44773152  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44773151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312628
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 52312607  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52312608 tgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242817
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataat 19242790  T
Q  106 atcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242791 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618216
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatca 19618239  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  19618238 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837553
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaa 1837574  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  1837573 tgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515125
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaa 3515104  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  3515105 tgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270238
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16270259  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  16270258 aaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239463
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcagcaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18239484  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18239483 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615406
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 44615385  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  44615386 tgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222383
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 50222404  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  50222403 tgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463912
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 51463933  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  51463932 tgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846550
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgata-------------- 98  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |                  
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgagataacaatatcgaat 8846458  T
Q  99 --taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8846459 gctaacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 8846550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038770
Alignment:
Q  14 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| |||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatg 14038751  T
Q  114 taagtcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||||||||||||||    
T  14038752 caagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096385
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 102  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803316
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23803330  T
Q  112 tgtaagtcaacaac 125  Q
    || || ||||||||    
T  23803329 tgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900009
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatc 6899988  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6899989 aaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239972
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataac-aatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 16239993  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16239992 aaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44052948
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596813
Alignment:
Q  47 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  147 ctcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16596813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636554
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22636535  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatct 129  Q
     || || ||| ||||||||    
T  22636536 ttgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574867
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 8574889  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  8574888 tgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355380
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15355386  T
Q  116 agtcaa 121  Q
    ||||||    
T  15355385 agtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374361
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || |    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 23374375  T
Q  116 agtcaacaacatct 129  Q
    | ||||||||||||    
T  23374374 attcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102332
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44102311  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  44102312 tgcaagtaaacaacgtctcaa 44102332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970751
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 14970774  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  14970773 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046559
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099551
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15099551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190518
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactg 15190518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641286
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 7641286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611008
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053323
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367800
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15367787  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  15367788 aaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15370115  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  15370116 aaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15371299  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  15371300 aaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15373580  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  15373581 aaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402813
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15402800  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  15402801 aaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16223629  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
     |||| |||||||    
T  16223630 taatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815629
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-actgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgt 21815634  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  21815633 ctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  90 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 20149929  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  20149930 aagtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353955
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  || |  | || ||||| |||||||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataac-aacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaa 22353933  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
     |  || |||||||| ||||||    
T  22353934 ttacaattcaacaacgtctcaa 22353955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157527
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaa 20157527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 936
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggc 959  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  958 ttactgaaacaacaacaacaaga 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6838
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 6709  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||| | || |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  6710 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 6808  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6809 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 6838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14218
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 14089  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||| | || |||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14090 gaatgcaagttatcatcattataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagc 14188  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14189 ttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 14218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13159
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatc 13037  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggc 13136  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13137 ttactgaaacaacaacagcaaga 13159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18143
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  192 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacag 18143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6755
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcagg 207  Q
     |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcagg 6731  T
Q  208 cttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6732 cttactgaaacaacaacagcaaga 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8696
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  124 acatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaa 220  Q
    |||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| |||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaa 8678  T
Q  221 caacagcaagacaaacaa 238  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8679 catcagcaagataaacaa 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12991
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatc 12864  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggc 208  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggc 12963  T
Q  209 ttactgaaacaacaacagcaagacaaac 236  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12964 ttactggaacaacaacagcaagataaac 12991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921763
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aaca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 22921790  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22921789 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 22921763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861463
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatag 21861475  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||    
T  21861474 caagataaacaa 21861463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896162
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaaca 21896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681185
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 33681105  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
     |||| |||||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33681106 gaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 33681185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237805
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacat 22237805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918769
Alignment:
Q  25 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  125 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    |   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 c---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210212
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 50210235  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  50210234 aatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614009
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50614120 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50614022  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
    | |||||||||||    
T  50614021 gtaagacaaacaa 50614009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621837
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  ||||||     
T  50621948 atctcaaacatcttttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacg 50621850  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
    | |||||||||||    
T  50621849 gtaagacaaacaa 50621837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295507
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    | || |||||||   || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaa---cttaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34509899
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaa 34509881  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  34509882 tgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368180
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||| ||||||    || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16368289 tctc-aacatcgtttat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacag 16368192  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
     |||| ||||||    
T  16368191 taagataaacaa 16368180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754198
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 166  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21754157 aacatctcaattatc-aacataatc-catttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686833
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaat-agttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaac 50686728  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50686729 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcggatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 50686827  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  50686828 gtaaga 50686833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261023
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  128 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    |||||||| ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574846
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||  |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-taacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049936
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 41050040  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41050039 atctcaa-catcatatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 41049942  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  41049941 gtaaga 41049936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927876
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||               
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat----------- 52927989  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 223  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  52927988 -catctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 52927891  T
Q  224 cagcaagacaaacaa 238  Q
     ||||||| ||||||    
T  52927890 tagcaagataaacaa 52927876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13988984
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13988963  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13988964 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923335
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21923356  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21923355 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593779
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23593800  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23593799 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758828
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 188  Q
    ||||||| |||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758763 caacatcacaacattcatatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612430
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 31612410  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctca 131  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31612411 tgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840885
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 21840863  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  21840864 atgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475131
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 21475152  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  21475151 tgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250731
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27250752  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  27250751 aattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298254
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaa 29298233  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29298234 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433128
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| |||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaa 433107  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  433108 tgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123119
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  112 tgtaagtcaacaa 124  Q
    || ||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532388
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22532367  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
     | || || ||||||||||||    
T  22532368 cattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776806
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaa 29776785  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29776786 tgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatc 20847177  T
Q  109 aaat 112  Q
    ||||    
T  20847176 aaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026799
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatc 21026778  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21026779 aattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362035
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatca 16362012  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16362013 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707325
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21707264  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21707265 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21707325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 172
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711867
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||| |||||  ||||||| | || |||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaa 21711806  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 172  Q
    || ||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  21711807 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaa-tcatgtaatgcctatacaattatat 21711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 13212930  T
Q  109 aaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||| |||||||    
T  13212929 aaatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 15860080  T
Q  106 atcaaatgtaagtcaa 121  Q
    || ||||| |||||||    
T  15860079 attaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  6 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataat 21342187  T
Q  106 atcaaatgtaagtcaa 121  Q
    |||||||| |||||||    
T  21342188 atcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093825
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtc-aacaa 124  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaa 16093890  T
Q  125 catctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 190  Q
    |||||||||||||| |  | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093889 catctcaaacatcataggt-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275419
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 16275429  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  16275428 tgcaagtcaa 16275419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347068
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 21347058  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  21347059 tgcaagtcaa 21347068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801433
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 85  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468698
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataac-aatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatca 22468718  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22468717 attgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981589
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 217  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  218 caacaacagcaaga 231  Q
      |||||| |||||    
T  35981602 tgacaacatcaaga 35981589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261542
Alignment:
Q  118 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactg 49261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  62 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  162 tacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637051
Alignment:
Q  117 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 214  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactg 20637051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161932
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca-aaacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaat 21161817  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | || ||| |||| ||   | |||| |||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| ||    
T  21161818 gcaattcatcaacttc-atatcatc-aacataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcac 21161914  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaag 230  Q
    || |||| ||||||||||    
T  21161915 tggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataac-aacagcgacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 40389254  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  40389255 aagtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714595
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135306
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||  | ||| | || ||||| |||| |||||||    
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaac-aatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatca 20135286  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatct 129  Q
      || || ||||||||||||    
T  20135287 tgtgcaattcaacaacatct 20135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065107
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatc 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  129 tcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||| |||| | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065058 tcaaagatcatatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  85 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 132
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19491
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggtta 19464  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19465 ctgaaacaacaacatcaagataaacaa 19491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100601
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatat-taacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggctta 100574  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  100575 ctgaaacaacaacaacaagataaacaa 100601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40076
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggctta 40095  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaag 230  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40094 ctgaaacaacaacatcaag 40076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94529
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 94508  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  94509 tgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44573
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaa 44551  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  44552 atgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17484
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119948
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 82  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 86  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38547
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25176077
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 25176050  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25176051 ctgaaacaacaacagcaagataaacaa 25176077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406204
Alignment:
Q  14 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  114 taagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttac 212  Q
     || |||||||||||||||| |||||   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatatcaa--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttac 28406178  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  28406179 taaaacaacaacagcaagataaacaa 28406204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7626
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    ||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7736 ctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaa 7638  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
    || || ||||||    
T  7637 catgataaacaa 7626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679750
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aat 7679686  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 177  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaacatcaaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786796
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaa 18786911  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    |||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  18786910 caacgtcacaa-catcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaac 18786813  T
Q  222 aacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||| || ||||||    
T  18786812 aacagcatgataaacaa 18786796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105531
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22105510  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22105511 tgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298816
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708561
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    || || || ||| | |||||||||||| ||||| || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791502
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23791391 atctcaaacattatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 23791489  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
     ||||| ||||||    
T  23791490 acaagataaacaa 23791502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060632
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 23060611  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  23060612 aattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071905
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 23071972  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071971 gaatataaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207498
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||| ||| | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23207395 atctcaa-cattataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaaca 23207492  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  23207493 gtaaga 23207498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726113
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 6726092  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6726093 tgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337238
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatc 22337213  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337214 aaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076561
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23076540  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||| ||||    
T  23076541 aattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571515
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 571494  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  571495 tgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809061
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 18809040  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  18809041 tgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23130980
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23130959  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23130960 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133447
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23133426  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23133427 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135708
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23135687  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23135688 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709576
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23709597  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23709596 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712057
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 23712078  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23712077 tgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505497
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26505476  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26505477 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26507975
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 26507954  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  26507955 tgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402566
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 34402587  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34402586 tgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682431
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 39682410  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  39682411 tgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109109
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || |||||||     
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaat 25109004  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25109005 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 25109103  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  25109104 gtaaga 25109109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214965
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 32214988  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  32214987 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367892
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24367871  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  24367872 tgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577217
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 28577196  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||| ||||||| ||||||    
T  28577197 tgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19671998
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     || | |||| |||||||||||||   ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatctcaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731238
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22731257  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    || || || ||| ||||||    
T  22731256 aattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38136
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155104
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 21155122  T
Q  115 aagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21155121 aagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898239
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24898261  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24898260 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900722
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24900744  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24900743 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903199
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24903221  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24903220 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905676
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24905698  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24905697 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908151
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24908173  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  24908172 atgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039542
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 32039563  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  32039562 tgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23285942
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137417
Alignment:
Q  14 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 43137398  T
Q  114 taagtcaacaacatctcaa 132  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  43137399 caagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660141
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatc 23660120  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  23660121 aaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029898
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 45029919  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45029918 tgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309225
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||  || ||| ||||||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520145
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||||| | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520197 atctcaaacatcatatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738182
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatc 22738203  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22738202 aattgcaattcatcaacatct 22738182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103396
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatc 23103420  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||  || ||| |||||||||||    
T  23103419 aaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529573
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 24529594  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||| |||||| ||||||    
T  24529593 tgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946735
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413078
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaaca 22413142  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413141 acatctc-aacatcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134208
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||     
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcg 22134229  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctca 131  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  22134228 aatgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967493
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  || ||| |||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaa 38967471  T
Q  112 tgtaagtcaa-caacatctcaa 132  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  38967472 tgcaagtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacata 73  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654388
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| ||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatc 23654409  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  23654408 aattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451949
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697548
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||| |||||||||    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 24697611  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697610 atctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 138
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004878
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaa-tagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23004865  T
Q  126 atctcaaacatca 138  Q
    |||||||||||||    
T  23004866 atctcaaacatca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459455
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 193  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatat-aactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  194 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaa 22459455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 129
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616304
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||  | ||||| || |||| |||||||| || |    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattac-aatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgca 25616290  T
Q  116 agtcaacaacatct 129  Q
    | ||||||||||||    
T  25616291 attcaacaacatct 25616304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5863
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaac 5853  T
Q  222 aacagcaaga 231  Q
    |||| |||||    
T  5854 aacaacaaga 5863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8242
Alignment:
Q  89 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  189 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaa 8242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 6826 - 7036
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 222  Q
    ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  6925 aa---ctcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 7020  T
Q  223 acagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||| ||||||    
T  7021 acagcaagataaacaa 7036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2539
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatg-taaatcatcatgttataacaatattgaat 2664  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  2663 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggctta 2566  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2565 ctgaaacaacatcagcaagataaacaa 2539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1302
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 1184  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
      | |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| |||||    
T  1185 acaggtcatcaacatttcaaacatcaaacat-aattcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttac 1283  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    || |||||||||| |||||    
T  1284 tggaacaacaacaacaaga 1302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10435
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 223  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||||||    
T  10548 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaa 10450  T
Q  224 cagcaagacaaacaa 238  Q
    || ||||| ||||||    
T  10449 caacaagataaacaa 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130132
Alignment:
Q  23 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||    
T  130018 aacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaaca 130116  T
Q  223 acagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||||| ||||||    
T  130117 acagcaagataaacaa 130132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60710
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaac 60721  T
Q  126 atctcaaacat 136  Q
    |||||||||||    
T  60720 atctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14598
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggctta 211  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggctta 14618  T
Q  212 ctgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14617 ctgaaacaacaacagcaaga 14598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62422
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatg-aaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattat-acaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatc-aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaaca 62409  T
Q  226 gcaagacaaacaa 238  Q
    |||||| ||||||    
T  62410 gcaagataaacaa 62422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136798
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 136777  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  136778 tgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139267
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 139246  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  139247 tgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144205
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 144184  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  144185 tgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134329
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 134308  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  134309 tgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141736
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaa 141715  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  141716 tgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132765
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaat 132761  T
Q  113 gtaa 116  Q
    ||||    
T  132762 gtaa 132765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 7983
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaac 221  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8081 caacatcacaa-catcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaac 7984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29238
Alignment:
Q  56 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  156 tgtatatacaattatataacat 177  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29259 tgtatatacaattatataacat 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22613
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  124 acatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22677 acatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 22613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82190
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 82169  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  82170 tgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160910
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttac 212  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| |||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatatcaaacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttac 160884  T
Q  213 tgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||    
T  160885 cgaaacaacaacaacaagataaacaa 160910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501202
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 501185  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||||||| ||||||    
T  501186 agtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85635
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 85645  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  85644 tgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45735
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaattatcaaacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 133 - 307
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136261
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 224  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136372 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 136275  T
Q  225 agcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||| ||||||    
T  136274 agcaagataaacaa 136261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 144969
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt-agattatacaattcaggcttactgaaacaacaac 224  Q
    ||| ||  ||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145080 atcacat-catcgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaac 144983  T
Q  225 agcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||| ||||||    
T  144982 agcaagataaacaa 144969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174886
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||  || |||||||||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6188
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 atctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 6189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15826
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11457
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2162
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 28512  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  28513 aattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4608
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 65  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12795
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  128 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||||| | | | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatat-aattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacag 12783  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||    
T  12784 caagataaacaa 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3185
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 3208  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3207 aatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128870
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaaca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  127 tctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  128973 tctcaaacatcatatat-aattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacag 128875  T
Q  227 caaga 231  Q
     ||||    
T  128874 taaga 128870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 231
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78542
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  130 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 229  Q
    ||| ||||    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  78443 caa-catcgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 78540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116548
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaa 116526  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116527 tgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2698
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  113 gtaagtcaacaacatctcaaacatca----aa--cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattca 205  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    ||  ||||||   |||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatatcagcttaattcataaa---atgt-atatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatca 2731  T
Q  206 ggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2730 ggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 2698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1025
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| |||||||   |||||  |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaa---ctcaattatcagac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 231
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38538
Alignment:
Q  32 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  130 caaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa 229  Q
    ||||||||| | || || |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38438 caaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaa 38536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44705
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44727  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  44726 tgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26064
Alignment:
Q  16 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 26081  T
Q  116 agtcaacaacatctcaa 132  Q
    | |||||||| ||||||    
T  26080 attcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38700
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    || |||||| ||| ||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2112
Alignment:
Q  67 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 166  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  167 ttatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3149
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 3174  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  3173 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27744
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  124 acatctcaaacat 136  Q
    |||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15763
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatc 15800  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 145  Q
     |||| |||||| || ||||  | |||||||||||||    
T  15799 gaatgcaagtcatcatcatcatatacatcaaacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178947
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15726
Alignment:
Q  200 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 15726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103539
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaac 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aac 103641  T
Q  123 aacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 222  Q
    ||||      |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  103640 aaca------acatcatacataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaaca 103548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17214
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc--aaaaccagcatgatataacaatat 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||| |||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatat 17239  T
Q  108 caaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  17238 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgt 79333  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  79332 ctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16095
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  124 acatctcaaacat 136  Q
    |||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13252
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  128 ctcaaac 134  Q
    || ||||    
T  13246 ctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53442
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  128 ctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    |||||| | ||| | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||     
T  53552 ctcaaatattcatatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacat 53454  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
     |||| ||||||    
T  53453 aaagataaacaa 53442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39599
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 39576  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  39577 atgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19785
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||| | ||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19888 atctc-agcatcataaat-aactcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaaca 19791  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  19790 gtaaga 19785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40031
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 40010  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  40011 aaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75213
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 75236  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  75235 atgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97227
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  97123 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 97221  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  97222 gtaaga 97227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106505
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  106401 atctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaaca 106499  T
Q  226 gcaaga 231  Q
    | ||||    
T  106500 gtaaga 106505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 133
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1155
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  128 ctcaaa 133  Q
    ||||||    
T  1150 ctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 4849 - 4968
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 4947  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  4948 aaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34288
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatc 34221  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
     ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34222 gaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 129
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  59 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 273 - 326
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52032
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatc 52011  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  52012 aattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167980
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 168001  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  168000 aattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16235
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatc 16211  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16212 aaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32959
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 32980  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  32979 aattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46046
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 46025  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  46026 aattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25275
Alignment:
Q  24 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  122 caacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25219 caacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  92 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23001
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 22983  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |||||||||||||||    
T  22984 tgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13510
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13489  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  13490 tgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20865
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 20844  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  20845 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13330
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13309  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  13310 aattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37939
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 37918  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37919 tgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158494
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 158515  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  158514 tgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339949
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaa 339969  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  339968 t-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8605
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 8577  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 136  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  8578 aattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16599
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatc 16623  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16622 aaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10891
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 10869  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  10870 atgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4812
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 4791  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4792 tgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3589
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 3568  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  3569 aattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 343 - 461
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatc 440  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || |||||||||||||||    
T  441 aattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14065
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 14044  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  14045 tgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33060
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 33039  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  33040 aaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  7 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataata 9841  T
Q  107 tcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||    
T  9842 tcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38879
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 38858  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| || | ||||||||||    
T  38859 aaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16902
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 16881  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16882 tgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1970
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1949  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1950 aattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8535
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatc 8556  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  8555 aattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23901
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 23906  T
Q  109 aaatg 113  Q
     ||||    
T  23905 gaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11406
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 11383  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  11384 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11643
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
      | |||||| ||||||||||||||  |||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1050
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 1071  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  1070 aattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7952
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  128 ctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacag 226  Q
    || |||||| || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||    
T  8062 cttaaacattcatatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcag 7964  T
Q  227 caagacaaacaa 238  Q
    ||||| ||||||    
T  7963 caagataaacaa 7952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4630
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 4605  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4606 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12212
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 12187  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  12188 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22164
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatc 22139  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22140 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40518
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaa 40497  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40498 tgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26018
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 25993  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25994 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39980
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-tatcatgacataataatatc 39955  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  39956 aaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Original strand, 54 - 226
Alignment:
Q  59 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  157 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 231  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaaga 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6123
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaata 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  107 tcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    |||| || || ||| ||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32205
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 112  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  113 gtaa 116  Q
    ||||    
T  32202 gtaa 32205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12293
Alignment:
Q  10 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| |||||||| | || |||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatca 12316  T
Q  110 aatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  12315 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10427
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || |  || ||||||||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4321
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac-gacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaa 4311  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  4312 tgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9360
Alignment:
Q  11 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaa 9338  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||| ||||||||||| ||||||    
T  9339 atgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30050
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 30028  T
Q  111 atgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  30029 gtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267872
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaaca 222  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || |||||||||||||||||||    
T  267778 atctc-aacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaaca 267872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4803
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 101  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24304
Alignment:
Q  27 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  126 atct 129  Q
    ||||    
T  24307 atct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1359
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7338
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Original strand, 569 - 765
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaac 666  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 225  Q
    ||| | ||||||| | || || |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  667 atc-ccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||     
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 4397  T
Q  115 aagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || |||||||| ||||||    
T  4398 aaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16382
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  109 aaat 112  Q
    ||||    
T  16379 aaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17969
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| ||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 189  Q
     || | |||| |||||||||||||| | ||| | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 2194  T
Q  112 tgtaagtcaa 121  Q
    || |||||||    
T  2193 tgcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 106 - 224
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 203  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  204 tgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2071
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatc 2050  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  2051 aattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21030
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    || || || ||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51654
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13575
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 88  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32137
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1706
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 1802  T
Q  126 atctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaa 223  Q
    ||||| ||||||| | || || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1801 atctc-aacatcatatat-aatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactggaacaacaa 1706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12176
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-------aaacagcaacaca-gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaa 12155  T
Q  112 tgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  12156 tgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15485
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatc 15487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161133
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaa 161155  T
Q  112 tgtaagtcaa-caacatctcaa 132  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  161154 tgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4643
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-aacagcaacataggcagtatgcaaa 86  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  15 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 1343  T
Q  115 aagtcaa 121  Q
    |||||||    
T  1342 aagtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47065
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 79  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11464
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 11466  T
Q  109 aa 110  Q
    ||    
T  11465 aa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 1098
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 81  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20423
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 20428  T
Q  128 ctcaa 132  Q
    |||||    
T  20427 ctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128869
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |   |  |   |||| |||||||| |||| ||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa-agcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatc 128848  T
Q  109 aaatgtaagtcaacaacatct 129  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  128849 aaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5183
Alignment:
Q  12 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 75  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  9 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggc 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2780
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 189
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  67 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  166 attatataacattaacaacaacat 189  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23892
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  73 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 132  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Original strand, 289 - 339
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 71
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  28 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29607
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaa 29607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2398
Alignment:
Q  85 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  96 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 179  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 133
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  91 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 133  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  30 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataac-aatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 159 - 208
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 78  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataac-aatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21871
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29763
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69843
Alignment:
Q  13 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 62  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  95 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 191  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University