View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19638_low_14 (Length: 254)

Name: NF19638_low_14
Description: NF19638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19638_low_14
NF19638_low_14
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (1-235)||(5852970-5853204)
chr8 (1-235)||(1484652-1484886)
chr8 (1-235)||(14409122-14409356)
chr8 (1-238)||(24485721-24485958)
chr8 (1-235)||(14824025-14824259)
chr8 (1-235)||(4542051-4542285)
chr8 (2-236)||(15202857-15203091)
chr8 (1-235)||(20045873-20046107)
chr8 (1-238)||(27472094-27472331)
chr8 (4-235)||(22002003-22002234)
chr8 (1-238)||(16412993-16413230)
chr8 (2-236)||(20403529-20403763)
chr8 (1-238)||(16401602-16401839)
chr8 (1-238)||(18677742-18677979)
chr8 (1-238)||(32121976-32122213)
chr8 (1-224)||(19936585-19936808)
chr8 (1-238)||(15070808-15071045)
chr8 (1-238)||(16198142-16198379)
chr8 (1-238)||(24048859-24049095)
chr8 (1-236)||(19896571-19896806)
chr8 (1-238)||(4483528-4483764)
chr8 (1-238)||(38549682-38549919)
chr8 (27-238)||(1326635-1326846)
chr8 (2-192)||(14397419-14397609)
chr8 (1-193)||(19896807-19896999)
chr8 (1-194)||(15202663-15202856)
chr8 (63-238)||(25657892-25658067)
chr8 (1-193)||(38549489-38549681)
chr8 (1-193)||(16401217-16401408)
chr8 (27-193)||(20403765-20403931)
chr8 (1-161)||(45290225-45290385)
chr8 (27-193)||(32122214-32122380)
chr8 (67-236)||(45290385-45290554)
chr8 (2-193)||(16401410-16401601)
chr8 (27-193)||(27471927-27472093)
chr8 (27-193)||(15071046-15071212)
chr8 (27-193)||(38549323-38549488)
chr8 (28-193)||(16412827-16412992)
chr8 (27-193)||(15202496-15202662)
chr8 (27-193)||(19897000-19897166)
chr8 (27-185)||(24049104-24049262)
chr8 (27-193)||(19936418-19936584)
chr8 (27-171)||(11361024-11361168)
chr8 (27-113)||(32810269-32810355)
chr8 (201-238)||(13425336-13425373)
chr8 (201-238)||(20982498-20982535)
chr8 (201-238)||(20982604-20982641)
chr8 (155-193)||(1484887-1484925)
chr8 (155-193)||(5852931-5852969)
chr8 (155-193)||(14409083-14409121)
chr8 (201-235)||(15203109-15203143)
chr8 (63-173)||(15319988-15320098)
chr8 (63-173)||(15500357-15500467)
chr8 (201-235)||(16401908-16401942)
chr8 (155-193)||(20045834-20045872)
chr8 (201-235)||(20403477-20403511)
chr8 (201-235)||(32810181-32810215)
chr8 (201-235)||(45290572-45290606)
chr8 (202-235)||(19936882-19936915)
chr8 (201-238)||(38549988-38550025)
chr8 (162-193)||(16401185-16401216)
chr8 (201-235)||(1326915-1326949)
chr8 (155-193)||(4483765-4483803)
chr8 (155-193)||(14824260-14824298)
chr8 (201-235)||(19896519-19896553)
chr8 (75-145)||(39364118-39364188)
chr8 (63-145)||(44477018-44477100)
chr8 (63-145)||(44480280-44480362)
chr8 (75-145)||(44522814-44522884)
chr8 (104-173)||(29759429-29759498)
chr8 (63-139)||(8728313-8728389)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (1-235)||(21922969-21923203)
chr1 (1-235)||(13989116-13989350)
chr1 (1-236)||(31612615-31612850)
chr1 (1-235)||(21841017-21841251)
chr1 (1-238)||(21474764-21475001)
chr1 (1-236)||(29298491-29298726)
chr1 (1-232)||(15859686-15859917)
chr1 (1-236)||(29776990-29777225)
chr1 (1-236)||(22122692-22122927)
chr1 (1-236)||(27161264-27161499)
chr1 (1-239)||(16362165-16362403)
chr1 (1-220)||(13227129-13227348)
chr1 (2-238)||(16274934-16275171)
chr1 (1-220)||(29535317-29535536)
chr1 (7-238)||(23593417-23593648)
chr1 (30-236)||(22050543-22050749)
chr1 (1-193)||(31612851-31613043)
chr1 (27-193)||(15859506-15859672)
chr1 (27-193)||(29298727-29298893)
chr1 (30-186)||(9044711-9044867)
chr1 (29-193)||(29777226-29777390)
chr1 (26-193)||(16401407-16401574)
chr1 (27-193)||(22122524-22122691)
chr1 (27-193)||(31613044-31613210)
chr1 (27-183)||(40129387-40129543)
chr1 (27-193)||(16274766-16274932)
chr1 (29-193)||(27161099-27161263)
chr1 (27-114)||(43543273-43543360)
chr1 (4-134)||(10812686-10812816)
chr1 (1-133)||(16401274-16401406)
chr1 (123-193)||(10812612-10812682)
chr1 (1-61)||(41372896-41372956)
chr1 (27-79)||(43630292-43630344)
chr1 (201-237)||(16275240-16275276)
chr1 (155-193)||(13989351-13989389)
chr1 (201-235)||(22050767-22050801)
chr1 (201-235)||(29776938-29776972)
chr1 (201-235)||(31612563-31612597)
chr1 (77-173)||(21650883-21650979)
chr1 (201-236)||(29298438-29298473)
chr1 (163-193)||(21474733-21474763)
chr1 (201-235)||(29298386-29298420)
chr1 (202-235)||(27161518-27161551)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-235)||(14948800-14949034)
chr7 (1-235)||(15376391-15376625)
chr7 (1-235)||(20384801-20385035)
chr7 (1-235)||(32125741-32125975)
chr7 (1-235)||(16410309-16410543)
chr7 (1-238)||(27217108-27217345)
chr7 (1-238)||(456569-456806)
chr7 (1-238)||(16232768-16233005)
chr7 (1-238)||(41523165-41523402)
chr7 (1-238)||(41525627-41525864)
chr7 (1-235)||(18627816-18628050)
chr7 (1-238)||(15081519-15081756)
chr7 (1-224)||(24702490-24702713)
chr7 (1-224)||(24704937-24705160)
chr7 (1-235)||(18640522-18640756)
chr7 (1-238)||(14269634-14269871)
chr7 (1-238)||(8940527-8940768)
chr7 (1-235)||(18430962-18431196)
chr7 (1-235)||(26355659-26355893)
chr7 (1-235)||(26358111-26358345)
chr7 (1-238)||(16213932-16214169)
chr7 (1-231)||(21189273-21189503)
chr7 (1-238)||(13869596-13869832)
chr7 (1-238)||(11303495-11303732)
chr7 (1-238)||(23664630-23664867)
chr7 (1-238)||(29796858-29797095)
chr7 (1-238)||(29800677-29800914)
chr7 (1-238)||(16108366-16108603)
chr7 (27-236)||(11972798-11973007)
chr7 (27-236)||(8468985-8469194)
chr7 (1-238)||(11392977-11393201)
chr7 (1-234)||(45847332-45847565)
chr7 (1-192)||(25926807-25926998)
chr7 (1-192)||(1856907-1857097)
chr7 (1-193)||(8940769-8940960)
chr7 (1-193)||(10501071-10501263)
chr7 (1-192)||(13918080-13918272)
chr7 (1-193)||(14269441-14269633)
chr7 (1-193)||(14156756-14156944)
chr7 (94-236)||(13841304-13841446)
chr7 (29-193)||(14269276-14269440)
chr7 (30-193)||(38897741-38897904)
chr7 (30-193)||(14156592-14156755)
chr7 (27-193)||(16214170-16214336)
chr7 (27-193)||(8940962-8941128)
chr7 (27-193)||(21189106-21189272)
chr7 (27-187)||(15081352-15081512)
chr7 (30-160)||(10500934-10501064)
chr7 (31-193)||(17985092-17985254)
chr7 (75-193)||(45847213-45847331)
chr7 (27-96)||(23461795-23461864)
chr7 (106-194)||(11310239-11310327)
chr7 (2-108)||(11310133-11310238)
chr7 (196-238)||(38897995-38898037)
chr7 (201-235)||(11972746-11972780)
chr7 (201-235)||(15081825-15081859)
chr7 (155-193)||(15376352-15376390)
chr7 (155-193)||(16410544-16410582)
chr7 (155-193)||(18628051-18628089)
chr7 (155-193)||(18640757-18640795)
chr7 (64-102)||(20110741-20110779)
chr7 (155-193)||(20384762-20384800)
chr7 (155-193)||(26355620-26355658)
chr7 (155-193)||(26358072-26358110)
chr7 (201-235)||(38898106-38898140)
chr7 (201-238)||(45847638-45847675)
chr7 (201-235)||(8940424-8940458)
chr7 (63-145)||(10896370-10896452)
chr7 (155-193)||(13869833-13869871)
chr7 (201-235)||(14269940-14269974)
chr7 (155-193)||(27217346-27217384)
chr7 (76-173)||(11286976-11287073)
chr7 (76-145)||(29004416-29004485)
chr7 (63-139)||(14188670-14188746)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (1-235)||(2290858-2291092)
chr6 (1-235)||(18334270-18334504)
chr6 (1-235)||(24422797-24423031)
chr6 (1-235)||(33862044-33862278)
chr6 (1-235)||(33864528-33864762)
chr6 (1-238)||(12742565-12742802)
chr6 (1-235)||(1540589-1540823)
chr6 (1-235)||(1598307-1598541)
chr6 (1-238)||(8055277-8055514)
chr6 (1-238)||(30676387-30676624)
chr6 (1-238)||(19847649-19847882)
chr6 (1-235)||(26924318-26924552)
chr6 (1-238)||(31630218-31630455)
chr6 (1-233)||(19858600-19858829)
chr6 (1-235)||(22782477-22782711)
chr6 (1-238)||(18914180-18914417)
chr6 (1-238)||(25688750-25688987)
chr6 (1-238)||(19005399-19005636)
chr6 (27-238)||(25535655-25535866)
chr6 (27-238)||(34963621-34963832)
chr6 (1-238)||(28289014-28289251)
chr6 (52-238)||(17377576-17377762)
chr6 (1-238)||(12942449-12942674)
chr6 (1-193)||(1598542-1598734)
chr6 (27-235)||(23992673-23992881)
chr6 (1-189)||(26924125-26924313)
chr6 (1-192)||(23415258-23415449)
chr6 (1-192)||(27557016-27557207)
chr6 (1-146)||(15892086-15892231)
chr6 (1-193)||(25688988-25689180)
chr6 (30-193)||(1871-2034)
chr6 (30-193)||(8830-8993)
chr6 (27-193)||(19005637-19005803)
chr6 (30-193)||(19847485-19847648)
chr6 (27-189)||(18914615-18914777)
chr6 (1-189)||(18914422-18914610)
chr6 (27-193)||(1598735-1598901)
chr6 (1-131)||(17883175-17883305)
chr6 (27-193)||(30676220-30676386)
chr6 (30-193)||(79-242)
chr6 (1-100)||(25737028-25737127)
chr6 (27-193)||(31630051-31630217)
chr6 (1-92)||(8994-9085)
chr6 (61-193)||(25689181-25689313)
chr6 (1-70)||(22981417-22981486)
chr6 (1-70)||(23806922-23806991)
chr6 (150-224)||(15875663-15875737)
chr6 (74-193)||(25737128-25737247)
chr6 (103-193)||(22981326-22981416)
chr6 (103-193)||(23806992-23807082)
chr6 (201-238)||(31630524-31630561)
chr6 (155-193)||(18334231-18334269)
chr6 (201-235)||(18914077-18914111)
chr6 (201-235)||(19005296-19005330)
chr6 (155-193)||(24423032-24423070)
chr6 (155-193)||(33864763-33864801)
chr6 (163-193)||(2290827-2290857)
chr6 (201-235)||(15875556-15875590)
chr6 (63-173)||(16240296-16240406)
chr6 (63-173)||(16556944-16557054)
chr6 (63-173)||(16633500-16633610)
chr6 (63-173)||(16650174-16650284)
chr6 (63-145)||(18455448-18455530)
chr6 (63-173)||(22593581-22593691)
chr6 (155-193)||(22782712-22782750)
chr6 (155-193)||(26924086-26924124)
chr6 (1-34)||(2035-2068)
chr6 (75-119)||(10905416-10905460)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-235)||(15118030-15118264)
chr4 (1-235)||(50222017-50222251)
chr4 (1-238)||(44615536-44615773)
chr4 (1-237)||(29267602-29267838)
chr4 (2-238)||(52872751-52872987)
chr4 (1-224)||(1837197-1837420)
chr4 (1-238)||(14970384-14970621)
chr4 (1-236)||(52312812-52313046)
chr4 (1-235)||(7640864-7641098)
chr4 (1-238)||(14746189-14746426)
chr4 (1-238)||(15534429-15534666)
chr4 (1-235)||(44772761-44772995)
chr4 (27-236)||(11958-12167)
chr4 (1-238)||(362428-362665)
chr4 (1-238)||(3515255-3515492)
chr4 (1-238)||(19617744-19617981)
chr4 (1-238)||(36038118-36038355)
chr4 (1-236)||(15495851-15496086)
chr4 (1-224)||(19857840-19858063)
chr4 (1-238)||(49547451-49547688)
chr4 (1-238)||(19242948-19243185)
chr4 (1-238)||(14048825-14049062)
chr4 (1-191)||(362668-362858)
chr4 (1-193)||(14745996-14746188)
chr4 (1-193)||(52313047-52313239)
chr4 (27-193)||(52872583-52872749)
chr4 (30-193)||(18214717-18214880)
chr4 (27-193)||(14970217-14970383)
chr4 (27-193)||(19858064-19858230)
chr4 (29-193)||(3515493-3515657)
chr4 (1-212)||(30147189-30147400)
chr4 (27-193)||(19617577-19617743)
chr4 (27-193)||(52313240-52313406)
chr4 (27-193)||(362859-363025)
chr4 (59-193)||(15495716-15495850)
chr4 (1-85)||(18214881-18214965)
chr4 (150-236)||(18214995-18215081)
chr4 (83-193)||(14185621-14185731)
chr4 (27-100)||(12778386-12778459)
chr4 (2-96)||(14185525-14185619)
chr4 (2-93)||(22725403-22725494)
chr4 (173-238)||(15355068-15355133)
chr4 (155-235)||(18239251-18239331)
chr4 (75-193)||(22725284-22725401)
chr4 (1-61)||(12033451-12033511)
chr4 (27-85)||(15489659-15489717)
chr4 (123-189)||(14745925-14745991)
chr4 (63-173)||(14951270-14951380)
chr4 (201-238)||(19857730-19857767)
chr4 (201-235)||(12185-12219)
chr4 (201-235)||(14746495-14746529)
chr4 (155-193)||(15117991-15118029)
chr4 (201-235)||(15355202-15355236)
chr4 (201-235)||(18215152-18215186)
chr4 (201-235)||(52312760-52312794)
chr4 (156-193)||(44772723-44772760)
chr4 (75-171)||(55377197-55377293)
chr4 (63-150)||(13046021-13046108)
chr4 (63-145)||(630279-630361)
chr4 (155-193)||(7640825-7640863)
chr4 (63-173)||(14995644-14995754)
chr4 (201-235)||(15496949-15496983)
chr4 (201-235)||(19618050-19618084)
chr4 (27-72)||(14745886-14745931)
chr4 (27-68)||(15355028-15355069)
chr4 (76-113)||(18218875-18218912)
chr4 (72-173)||(43281694-43281795)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (1-235)||(17463428-17463662)
chr3 (1-235)||(34159576-34159810)
chr3 (1-235)||(15977783-15978017)
chr3 (1-235)||(55476741-55476975)
chr3 (1-235)||(16453958-16454193)
chr3 (1-224)||(28848299-28848522)
chr3 (1-235)||(6468812-6469046)
chr3 (1-238)||(45606584-45606821)
chr3 (1-236)||(38961515-38961751)
chr3 (1-236)||(41124189-41124424)
chr3 (1-238)||(7781024-7781261)
chr3 (1-238)||(46822509-46822746)
chr3 (1-236)||(16282435-16282670)
chr3 (1-235)||(13153933-13154167)
chr3 (1-236)||(17444441-17444676)
chr3 (1-235)||(10247401-10247635)
chr3 (1-238)||(53301181-53301418)
chr3 (1-236)||(25237093-25237328)
chr3 (1-235)||(13151468-13151702)
chr3 (1-238)||(13436547-13436784)
chr3 (22-235)||(13544275-13544487)
chr3 (1-238)||(8499768-8500005)
chr3 (1-238)||(10557156-10557393)
chr3 (22-235)||(12567810-12568023)
chr3 (1-238)||(27165500-27165737)
chr3 (1-238)||(54521070-54521307)
chr3 (27-238)||(12119357-12119568)
chr3 (1-210)||(20629869-20630078)
chr3 (1-236)||(25229506-25229741)
chr3 (1-238)||(15412679-15412915)
chr3 (1-239)||(29544519-29544757)
chr3 (27-238)||(24513924-24514135)
chr3 (1-192)||(15465448-15465639)
chr3 (1-193)||(55318981-55319173)
chr3 (1-192)||(5223677-5223868)
chr3 (1-192)||(26054942-26055133)
chr3 (27-193)||(27165738-27165904)
chr3 (27-193)||(41124425-41124591)
chr3 (27-200)||(10379613-10379786)
chr3 (27-193)||(46822747-46822913)
chr3 (27-190)||(8500009-8500172)
chr3 (27-193)||(10557394-10557560)
chr3 (30-193)||(55318817-55318980)
chr3 (27-193)||(38961348-38961514)
chr3 (27-193)||(53301014-53301180)
chr3 (62-193)||(14567430-14567561)
chr3 (27-193)||(20629702-20629868)
chr3 (29-193)||(13937485-13937649)
chr3 (116-238)||(12305393-12305515)
chr3 (1-114)||(16358345-16358458)
chr3 (27-193)||(16282268-16282434)
chr3 (27-193)||(17444274-17444440)
chr3 (1-114)||(15007871-15007987)
chr3 (27-193)||(17393201-17393367)
chr3 (72-194)||(36528447-36528569)
chr3 (1-83)||(12305525-12305607)
chr3 (2-100)||(36528348-36528446)
chr3 (83-193)||(16358234-16358344)
chr3 (1-92)||(14567562-14567653)
chr3 (27-93)||(8899418-8899484)
chr3 (86-194)||(3264323-3264431)
chr3 (1-60)||(13937650-13937709)
chr3 (2-100)||(3264432-3264530)
chr3 (48-94)||(10555766-10555812)
chr3 (129-193)||(15007988-15008052)
chr3 (201-238)||(9707484-9707521)
chr3 (201-235)||(8899344-8899378)
chr3 (201-235)||(16282689-16282723)
chr3 (201-235)||(17444694-17444728)
chr3 (155-193)||(17463663-17463701)
chr3 (63-185)||(25058286-25058408)
chr3 (155-193)||(34159811-34159849)
chr3 (201-235)||(38961769-38961803)
chr3 (201-235)||(41124137-41124171)
chr3 (155-193)||(55476976-55477014)
chr3 (155-193)||(6468773-6468811)
chr3 (201-235)||(11913928-11913962)
chr3 (155-193)||(15412916-15412954)
chr3 (63-145)||(18889958-18890040)
chr3 (201-235)||(25237041-25237075)
chr3 (77-173)||(16934824-16934920)
chr3 (63-139)||(18893224-18893300)
[»] chr2 (87 HSPs)
chr2 (1-235)||(18809193-18809427)
chr2 (1-235)||(23711691-23711925)
chr2 (1-238)||(39682561-39682798)
chr2 (1-235)||(26505629-26505863)
chr2 (1-235)||(26508107-26508341)
chr2 (1-235)||(28577349-28577583)
chr2 (1-224)||(23135841-23136064)
chr2 (1-236)||(24368076-24368311)
chr2 (1-235)||(45027582-45027816)
chr2 (1-236)||(21154685-21154920)
chr2 (1-236)||(22105715-22105950)
chr2 (1-236)||(41523750-41523985)
chr2 (1-238)||(571645-571882)
chr2 (1-238)||(24918388-24918625)
chr2 (2-238)||(23706896-23707131)
chr2 (1-235)||(24897873-24898107)
chr2 (1-235)||(24905310-24905544)
chr2 (1-238)||(20261467-20261704)
chr2 (1-236)||(6726297-6726532)
chr2 (1-235)||(23709210-23709444)
chr2 (1-235)||(24900356-24900590)
chr2 (1-235)||(24902833-24903067)
chr2 (1-235)||(24907785-24908019)
chr2 (1-235)||(32039176-32039410)
chr2 (1-238)||(24642426-24642663)
chr2 (1-238)||(24671273-24671510)
chr2 (1-238)||(23131110-23131346)
chr2 (1-238)||(23133577-23133813)
chr2 (1-238)||(24681692-24681929)
chr2 (1-238)||(34402200-34402436)
chr2 (1-224)||(32214608-32214831)
chr2 (1-238)||(38967727-38967964)
chr2 (1-238)||(10684440-10684677)
chr2 (1-238)||(24529224-24529461)
chr2 (1-193)||(41523557-41523749)
chr2 (1-171)||(23931775-23931945)
chr2 (1-193)||(21154492-21154684)
chr2 (1-193)||(23709017-23709209)
chr2 (27-193)||(22105951-22106117)
chr2 (1-188)||(23706703-23706889)
chr2 (27-193)||(24529057-24529223)
chr2 (29-193)||(24918626-24918790)
chr2 (86-238)||(25616429-25616581)
chr2 (27-193)||(6726533-6726699)
chr2 (27-189)||(41523390-41523552)
chr2 (27-193)||(21154325-21154491)
chr2 (27-193)||(24368312-24368478)
chr2 (27-193)||(24681930-24682096)
chr2 (27-191)||(32214440-32214604)
chr2 (27-193)||(23706536-23706702)
chr2 (29-190)||(23931949-23932110)
chr2 (30-191)||(45027418-45027579)
chr2 (27-193)||(24671511-24671677)
chr2 (1-95)||(31345570-31345664)
chr2 (128-192)||(31345490-31345554)
chr2 (201-235)||(6726245-6726279)
chr2 (155-193)||(18809428-18809466)
chr2 (155-193)||(23131347-23131385)
chr2 (201-235)||(23707200-23707234)
chr2 (155-193)||(23711652-23711690)
chr2 (201-235)||(24368024-24368058)
chr2 (201-235)||(24642732-24642766)
chr2 (201-235)||(24681589-24681623)
chr2 (155-193)||(26505864-26505902)
chr2 (155-193)||(26508342-26508380)
chr2 (63-173)||(27261332-27261442)
chr2 (155-193)||(27920403-27920441)
chr2 (155-193)||(32039137-32039175)
chr2 (155-193)||(34402161-34402199)
chr2 (201-235)||(41524003-41524037)
chr2 (141-193)||(24642373-24642425)
chr2 (204-235)||(24671170-24671201)
chr2 (163-193)||(571883-571913)
chr2 (63-145)||(6483113-6483195)
chr2 (205-235)||(21154942-21154972)
chr2 (201-235)||(22105663-22105697)
chr2 (155-193)||(23133814-23133852)
chr2 (63-173)||(24686597-24686707)
chr2 (201-235)||(24918285-24918319)
chr2 (155-193)||(28577584-28577622)
chr2 (201-235)||(38967624-38967658)
chr2 (163-193)||(39682799-39682829)
chr2 (72-173)||(67339-67440)
chr2 (104-185)||(16900803-16900884)
chr2 (104-185)||(16994194-16994275)
chr2 (157-193)||(23708980-23709016)
chr2 (75-119)||(44584588-44584632)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-235)||(94661-94895)
scaffold0023 (1-238)||(17117-17354)
scaffold0023 (30-193)||(16953-17116)
scaffold0023 (155-193)||(94896-94934)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-235)||(10732618-10732852)
chr5 (1-235)||(20909262-20909496)
chr5 (1-238)||(2154309-2154546)
chr5 (1-238)||(17516841-17517078)
chr5 (1-235)||(42245043-42245277)
chr5 (1-236)||(20917524-20917759)
chr5 (1-236)||(32027695-32027930)
chr5 (1-235)||(264446-264680)
chr5 (1-235)||(39245386-39245620)
chr5 (1-238)||(20901598-20901835)
chr5 (1-236)||(29330233-29330467)
chr5 (1-235)||(29346230-29346464)
chr5 (1-235)||(29348703-29348937)
chr5 (1-235)||(29351176-29351410)
chr5 (1-238)||(23064761-23064998)
chr5 (1-238)||(37804580-37804817)
chr5 (1-238)||(38619684-38619920)
chr5 (1-238)||(39363632-39363868)
chr5 (1-193)||(295952-296144)
chr5 (1-193)||(32028318-32028510)
chr5 (1-193)||(32028124-32028317)
chr5 (1-193)||(17516648-17516840)
chr5 (27-193)||(17516481-17516647)
chr5 (27-193)||(20901431-20901597)
chr5 (1-193)||(32027931-32028123)
chr5 (63-238)||(9776606-9776781)
chr5 (30-193)||(2154145-2154308)
chr5 (27-193)||(29330468-29330634)
chr5 (27-193)||(295785-295951)
chr5 (27-193)||(20917357-20917523)
chr5 (29-193)||(32028511-32028675)
chr5 (201-238)||(20901904-20901941)
chr5 (155-193)||(264407-264445)
chr5 (155-193)||(20909497-20909535)
chr5 (201-235)||(20917830-20917864)
chr5 (63-173)||(22883903-22884013)
chr5 (75-173)||(27183180-27183278)
chr5 (201-235)||(29330181-29330215)
chr5 (201-235)||(32027643-32027677)
chr5 (155-193)||(39245621-39245659)
chr5 (155-193)||(39363869-39363907)
chr5 (201-236)||(20917777-20917812)
chr5 (63-145)||(19511781-19511863)
chr5 (155-193)||(23064999-23065037)
chr5 (63-161)||(43444008-43444106)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-235)||(6197-6431)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-235)||(134461-134695)
scaffold0028 (1-235)||(136930-137164)
scaffold0028 (1-235)||(139399-139633)
scaffold0028 (1-235)||(141868-142102)
scaffold0028 (1-235)||(144337-144571)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-238)||(38069-38306)
scaffold0134 (155-193)||(38307-38345)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-235)||(40650-40884)
scaffold0044 (63-185)||(37848-37969)
scaffold0044 (155-193)||(40885-40923)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (1-238)||(14195-14432)
scaffold0230 (4-238)||(23211-23445)
scaffold0230 (27-193)||(22881-23047)
scaffold0230 (1-71)||(23048-23118)
scaffold0230 (107-193)||(23121-23207)
scaffold0230 (27-77)||(20714-20764)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-235)||(9492-9726)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-238)||(20995-21233)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-238)||(13640-13877)
scaffold0444 (155-193)||(13878-13916)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-224)||(6713-6936)
scaffold0574 (27-193)||(6937-7103)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-238)||(3980-4217)
scaffold0741 (1-193)||(3787-3979)
scaffold0741 (1-189)||(3594-3782)
scaffold0741 (141-193)||(3541-3593)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-238)||(4942-5179)
scaffold0716 (27-193)||(5180-5346)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-238)||(11537-11774)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (1-223)||(43002-43224)
scaffold0040 (76-238)||(13379-13541)
scaffold0040 (27-193)||(43225-43391)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (1-238)||(837-1074)
scaffold0747 (44-193)||(1075-1224)
scaffold0747 (27-161)||(1227-1360)
scaffold0747 (201-235)||(734-768)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (5-238)||(6617-6850)
scaffold0317 (27-193)||(6446-6612)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-238)||(3271-3508)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-238)||(30267-30504)
scaffold0149 (26-193)||(30505-30672)
scaffold0149 (203-238)||(30161-30196)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (1-229)||(7996-8224)
scaffold0278 (1-193)||(8225-8417)
scaffold0278 (27-190)||(8421-8584)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (4-238)||(455-689)
scaffold1792 (27-193)||(853-1019)
scaffold1792 (1-71)||(782-852)
scaffold1792 (107-193)||(693-779)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (6-235)||(11022-11251)
scaffold0306 (2-238)||(15170-15396)
scaffold0306 (29-193)||(10852-11016)
scaffold0306 (27-193)||(15398-15563)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (1-238)||(10039-10276)
scaffold0043 (1-193)||(10277-10469)
scaffold0043 (30-193)||(10470-10633)
scaffold0043 (201-235)||(9936-9970)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-220)||(68227-68446)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (27-238)||(227-438)
scaffold0494 (201-238)||(507-544)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-192)||(31497-31688)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-204)||(501347-501549)
scaffold0001 (27-193)||(501550-501716)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-192)||(17947-18138)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-193)||(8311-8503)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-192)||(33465-33656)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (29-193)||(1740-1904)
scaffold1296 (1-100)||(1640-1739)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-192)||(19766-19957)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-192)||(39626-39817)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (64-238)||(53612-53786)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (1-193)||(7175-7367)
scaffold0711 (1-192)||(7368-7558)
scaffold0711 (1-62)||(7560-7621)
scaffold0711 (103-191)||(7084-7172)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (27-193)||(18423-18589)
scaffold0322 (1-71)||(18352-18422)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (83-238)||(1676-1831)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (27-238)||(38359-38570)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (103-238)||(57729-57864)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (1-193)||(36876-37068)
scaffold0151 (67-193)||(36749-36875)
scaffold0151 (1-42)||(37069-37110)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (116-235)||(11023-11142)
scaffold0454 (1-61)||(1-61)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (137-236)||(28091-28190)
scaffold0114 (201-235)||(28039-28073)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (24-100)||(75605-75681)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (27-185)||(113317-113475)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (189-238)||(10647-10696)
scaffold0513 (201-235)||(10765-10799)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (27-100)||(405-478)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (177-224)||(15030-15077)
scaffold0106 (201-235)||(15150-15184)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (63-173)||(6195-6305)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (63-173)||(8566-8676)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (63-173)||(30470-30580)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (29-107)||(103716-103794)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (63-173)||(18205-18315)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (63-173)||(725-835)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (63-173)||(28469-28579)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (201-238)||(9979-10016)
scaffold0145 (203-236)||(10034-10067)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (63-171)||(912-1020)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5852970 - 5853204
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852970 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 5853069  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853070 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 5853169  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5853170 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 5853204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1484886 - 1484652
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484886 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1484787  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484786 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 1484687  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1484686 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 1484652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14409122 - 14409356
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409122 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14409221  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409222 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 14409321  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14409322 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 14409356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 24485721 - 24485958
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24485721 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24485820  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485821 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24485920  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485921 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24485958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14824259 - 14824025
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824259 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14824160  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824159 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 14824060  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14824059 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt 14824025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4542051 - 4542285
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542051 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 4542150  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4542151 aaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgta 4542250  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4542251 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 4542285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 15202857 - 15203091
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15202857 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 15202956  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202957 aatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 15203056  T
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15203057 atgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttt 15203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20045873 - 20046107
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045873 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 20045972  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20045973 aaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaa 20046072  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20046073 tatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt 20046107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 27472094 - 27472331
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27472094 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtat 27472193  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472194 ggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 27472293  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472294 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 27472331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22002234 - 22002003
Alignment:
Q  4 tatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22002234 tatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaa 22002135  T
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatat 203  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22002134 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatat 22002035  T
Q  204 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22002034 gattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22002003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16412993 - 16413230
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16412993 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtat 16413092  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16413093 ggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaa 16413192  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413193 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 16413230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20403763 - 20403529
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20403763 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatt 20403664  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20403663 aatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaat 20403564  T
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20403563 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20403529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16401602 - 16401839
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401602 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16401701  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401702 tgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaa 16401801  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16401802 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 16401839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 18677742 - 18677979
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677742 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 18677841  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18677842 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 18677941  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18677942 tatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgt 18677979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32122213 - 32121976
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32122213 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtat 32122114  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122113 ggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 32122014  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32122013 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgt 32121976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19936585 - 19936808
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936585 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 19936684  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19936685 gaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtt 19936784  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19936785 tatgattgatgaattagtatatgt 19936808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15071045 - 15070808
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15071045 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 15070946  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  15070945 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgat 15070846  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070845 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 15070808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16198379 - 16198142
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198379 ttttatgaatttcaccacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16198280  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16198279 ggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 16198180  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198179 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 16198142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24049095 - 24048859
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24049095 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 24048996  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24048995 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaa 24048897  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048896 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24048859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19896806 - 19896571
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896806 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtat 19896707  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896706 gaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 19896607  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19896606 tgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgttt 19896571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4483764 - 4483528
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4483764 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 4483666  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  4483665 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgat 4483566  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4483565 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 4483528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 38549682 - 38549919
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38549682 ttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtat 38549781  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38549782 ggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaa 38549881  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549882 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 38549919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 1326635 - 1326846
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1326635 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttgg 1326734  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326735 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 1326834  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||| ||||||||    
T  1326835 gtacatgtttgt 1326846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 14397419 - 14397609
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14397419 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatg 14397518  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397519 aatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19896999 - 19896807
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896999 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 19896900  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896899 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 15202663 - 15202856
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202663 ttttatgaatttcagcacaacgttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15202762  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 194  Q
      |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202763 ggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658067
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 25658067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38549489 - 38549681
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38549489 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtat 38549588  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549589 ggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16401217 - 16401408
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401217 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16401315  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401316 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20403931 - 20403765
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20403931 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 20403832  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403831 tctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 45290225 - 45290385
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45290225 ttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 45290324  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttat 161  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  45290325 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 45290385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32122380 - 32122214
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32122380 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32122281  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122280 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290554
Alignment:
Q  67 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  167 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgttt 45290554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 16401410 - 16401601
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16401410 tttatgaatttcaatacaactttgtcagaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 16401509  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401510 gatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 27471927 - 27472093
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  27471927 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 27472026  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472027 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15071212 - 15071046
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15071212 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15071113  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071112 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 38549323 - 38549488
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  38549323 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38549422  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549423 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 16412827 - 16412992
Alignment:
Q  28 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggt 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16412827 cgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggt 16412926  T
Q  128 ttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
     |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412927 ctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 15202496 - 15202662
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  15202496 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttgg 15202595  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202596 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19897166 - 19897000
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  19897166 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 19897067  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897066 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24049262 - 24049104
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  24049262 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24049163  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049162 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 19936418 - 19936584
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||| ||| |||||||    
T  19936418 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttgg 19936517  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | || | | |||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936518 tctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11361168 - 11361024
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||    
T  11361168 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttgg 11361069  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  11361068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32810355 - 32810269
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagcttt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32810355 ccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttt 32810269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425373
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 13425373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982535
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 20982535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982641
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 20982641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1484925 - 1484887
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484925 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 5852931 - 5852969
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852931 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 14409083 - 14409121
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409083 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203143
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 15203143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401942
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 16401942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 20045834 - 20045872
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045834 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403477
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 20403477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810181
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 32810181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290606
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 45290606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 235
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936915
Alignment:
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 19936915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550025
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgt 38550025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 193
Target Start/End: Original strand, 16401185 - 16401216
Alignment:
Q  162 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401185 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326949
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt 1326949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4483803 - 4483765
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483803 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14824298 - 14824260
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824298 gagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896519
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt 19896519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44477100 - 44477018
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44477100 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44480362 - 44480280
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44480362 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 8728313 - 8728389
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  8728313 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaa 8728389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21922969 - 21923203
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922969 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 21923068  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923069 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 21923168  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21923169 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 21923203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13989350 - 13989116
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989350 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 13989251  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989250 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 13989151  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13989150 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 13989116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31612850 - 31612615
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612850 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 31612751  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31612750 gaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaa 31612651  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31612650 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 31612615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21841251 - 21841017
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841251 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 21841152  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  21841151 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaa 21841052  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841051 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 21841017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21474764 - 21475001
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474764 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 21474863  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21474864 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgat 21474963  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474964 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 21475001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29298726 - 29298491
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298726 ttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29298627  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29298626 gaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaa 29298527  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29298526 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29298491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 15859686 - 15859917
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15859686 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtat 15859785  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859786 ggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 15859885  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859886 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 15859917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29777225 - 29776990
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29777225 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtat 29777126  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777125 ggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 29777026  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29777025 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29776990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22122692 - 22122927
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22122692 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 22122791  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122792 ggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 22122891  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22122892 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 22122927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27161264 - 27161499
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161264 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 27161363  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27161364 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 27161463  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161464 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 27161499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16362403 - 16362165
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16362403 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16362304  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16362303 ggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttat 16362204  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362203 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtt 16362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13227348 - 13227129
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13227348 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtat 13227249  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13227248 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaa 13227149  T
Q  201 tatgattgatgaattagtat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13227148 tatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 16274934 - 16275171
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16274934 tttatgaattttagcacaactctgtccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 16275033  T
Q  102 aatgttagctttcgaa-tgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275034 gatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 16275133  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275134 tacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgt 16275171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29535536 - 29535317
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29535536 ttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtat 29535437  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29535436 ggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaa 29535337  T
Q  201 tatgattgatgaattagtat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29535336 tatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 238
Target Start/End: Original strand, 23593417 - 23593648
Alignment:
Q  7 gaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  23593417 gaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgt 23593516  T
Q  107 tagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgat 206  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23593517 tagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgat 23593616  T
Q  207 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593617 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 23593648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Original strand, 22050543 - 22050749
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||| |    
T  22050543 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtct 22050642  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 229  Q
     |  |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050643 aatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 22050742  T
Q  230 tatgttt 236  Q
    |||||||    
T  22050743 tatgttt 22050749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31613043 - 31612851
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31613043 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtat 31612944  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612943 ggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 15859506 - 15859672
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  15859506 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 15859605  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859606 tctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29298893 - 29298727
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  29298893 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgt 29298794  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298793 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 9044711 - 9044867
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  9044711 aatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtct 9044810  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcac 186  Q
     || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9044811 aacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29777390 - 29777226
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  29777390 gaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtc 29777291  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| | |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777290 tgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16401574 - 16401407
Alignment:
Q  26 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttg 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| | | || |||    
T  16401574 tccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattg 16401475  T
Q  126 gtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    || | || |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401474 gtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 22122524 - 22122691
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22122524 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 22122623  T
Q  126 gtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122624 gttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31613210 - 31613044
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||    
T  31613210 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttgg 31613111  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613110 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40129543 - 40129387
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  40129543 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttgg 40129444  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggt 183  Q
    | || | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40129443 tctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 16274766 - 16274932
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  | ||||    
T  16274766 ccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattgg 16274865  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274866 tctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161263
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||     
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 43543360 - 43543273
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43543360 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 43543273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 10812686 - 10812816
Alignment:
Q  4 tatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||        
T  10812686 tatgaatttcagcacaactttctccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattg 10812785  T
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgactt 134  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  10812786 tgttagctttccagtgcctttggtttgactt 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16401406 - 16401274
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| ||     
T  16401406 ttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggcatttagtgtaaacatgaaagttttagataa 16401307  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgact 133  Q
       ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16401306 ttgtgttagctttccaatggctttggtttgact 16401274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 193
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  123 ttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 41372956 - 41372896
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 61  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41372956 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 41372896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 43630292 - 43630344
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgt 79  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43630292 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275276
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16275276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13989389 - 13989351
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989389 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050801
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 22050801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776938
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 29776938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612563
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 31612563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  77 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298438
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29298438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Original strand, 21474733 - 21474763
Alignment:
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474733 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298386
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt 29298386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 235
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161551
Alignment:
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt 27161551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14948800 - 14949034
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948800 ttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14948899  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948900 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 14948999  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14949000 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 14949034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15376391 - 15376625
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376391 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15376490  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376491 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 15376590  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15376591 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 15376625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20384801 - 20385035
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384801 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 20384900  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384901 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 20385000  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20385001 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20385035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32125975 - 32125741
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125975 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 32125876  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125875 aaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 32125776  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32125775 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 32125741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16410543 - 16410309
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410543 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16410444  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410443 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 16410344  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16410343 tatgattgatgaattagtatatcaatgtatatgtt 16410309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27217345 - 27217108
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217345 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 27217246  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27217245 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 27217146  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217145 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 27217108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 456806 - 456569
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456806 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 456707  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  456706 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 456607  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456606 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 456569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16233005 - 16232768
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233005 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16232906  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16232905 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 16232806  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232805 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 16232768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41523402 - 41523165
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41523402 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtat 41523303  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41523302 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 41523203  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 41523165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41525864 - 41525627
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41525864 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtat 41525765  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41525764 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 41525665  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525664 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 41525627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18628050 - 18627816
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628050 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18627951  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18627950 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 18627851  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18627850 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtt 18627816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 15081519 - 15081756
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15081519 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 15081618  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15081619 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaa 15081718  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081719 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 15081756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24702713 - 24702490
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24702713 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtat 24702614  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702613 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24702514  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24702513 tatgattcatgaattagtatatgt 24702490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24705160 - 24704937
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24705160 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtat 24705061  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705060 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24704961  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24704960 tatgattcatgaattagtatatgt 24704937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18640756 - 18640522
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640756 ttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18640657  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640656 aaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 18640557  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18640556 tatgattgatgaattactatatgaatgtatatgtt 18640522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14269634 - 14269871
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269634 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14269733  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269734 ggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 14269833  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269834 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 14269871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8940768 - 8940527
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtag 96  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  8940768 ttttatgaatttaagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtag 8940669  T
Q  97 gtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 196  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940668 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 8940569  T
Q  197 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940568 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 8940527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18431196 - 18430962
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431196 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18431097  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18431096 gaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaa 18430997  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18430996 tctgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 18430962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26355659 - 26355893
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26355659 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtat 26355758  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26355759 gaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaa 26355858  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26355859 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt 26355893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26358111 - 26358345
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26358111 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtat 26358210  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26358211 gaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaa 26358310  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26358311 tatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt 26358345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16214169 - 16213932
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16214169 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtat 16214070  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214069 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 16213970  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213969 taagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 16213932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21189273 - 21189503
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189273 ttttatgaatttccgcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtat 21189372  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189373 gaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 21189472  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtata 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtata 21189503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13869832 - 13869596
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13869832 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 13869734  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13869733 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 13869634  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869633 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 13869596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11303732 - 11303495
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11303732 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 11303633  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11303632 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 11303533  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11303532 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 11303495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 23664630 - 23664867
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664630 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 23664729  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||      
T  23664730 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgtt 23664829  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23664830 gatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 23664867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29797095 - 29796858
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29797095 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtat 29796996  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  29796995 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtt 29796896  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29796895 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 29796858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29800914 - 29800677
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29800914 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtat 29800815  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  29800814 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtt 29800715  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29800714 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 29800677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16108366 - 16108603
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108366 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16108465  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||      
T  16108466 ggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtt 16108565  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16108566 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 16108603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11973007 - 11972798
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11973007 ccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 11972908  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11972907 tttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 11972808  T
Q  227 gtatatgttt 236  Q
    | ||||||||    
T  11972807 gcatatgttt 11972798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8469194 - 8468985
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  8469194 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttgg 8469095  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469094 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 8468995  T
Q  227 gtatatgttt 236  Q
    ||||||||||    
T  8468994 gtatatgttt 8468985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 11392977 - 11393201
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  11392977 ttttatgaatttcagcataactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaga-------------gtaaacacgaaagttgtaggtat 11393063  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  11393064 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgat 11393163  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 11393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 45847332 - 45847565
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45847332 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtat 45847431  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847432 ggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 45847531  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgt 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45847532 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgt 45847565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 25926807 - 25926998
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926807 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25926906  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      || ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926907 ggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1856907 - 1857097
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1856907 ttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacg-aagttgtaggtat 1857005  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
     ||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857006 gaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8940960 - 8940769
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8940960 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggtat 8940862  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940861 ggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10501071 - 10501263
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10501071 ttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 10501170  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501171 ggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 13918080 - 13918272
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13918080 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggta 13918179  T
Q  100 taaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
    | ||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918180 tgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 14269441 - 14269633
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269441 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14269540  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269541 ggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 14156756 - 14156944
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||    
T  14156756 ttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtat 14156851  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156852 gaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841304
Alignment:
Q  94 taggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  194 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 13841304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 14269276 - 14269440
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14269276 gaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 14269375  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269376 tgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 38897741 - 38897904
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38897741 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 38897840  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897841 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156755
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 14156691  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156692 gacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16214336 - 16214170
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16214336 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214237  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214236 tatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8941128 - 8940962
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  8941128 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8941029  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941028 tctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 21189106 - 21189272
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||    
T  21189106 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttgg 21189205  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189206 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 15081352 - 15081512
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15081352 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15081451  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaca 187  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15081452 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10501064
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 10501033  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagtta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10501034 gacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985254
Alignment:
Q  31 atttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttg 130  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||  |||| ||||  |||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  131 acttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | | ||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactg 174  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  175 cacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 23461795 - 23461864
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 96  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461795 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  106 ttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 194  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11310238 - 11310133
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  11310238 tttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaact-gtattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtata 11310140  T
Q  102 aatgtta 108  Q
     ||||||    
T  11310139 gatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 238
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898037
Alignment:
Q  196 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 38898037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972746
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11972746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081859
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 15081859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 15376352 - 15376390
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376352 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16410582 - 16410544
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410582 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18628089 - 18628051
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628089 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18640795 - 18640757
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640795 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110741
Alignment:
Q  64 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataa 20110741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 20384762 - 20384800
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384762 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 26355620 - 26355658
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355620 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 26358072 - 26358110
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358072 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898140
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 38898140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847675
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgt 45847675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940424
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt 8940424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Original strand, 10896370 - 10896452
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  10896370 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13869871 - 13869833
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869871 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14269974
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 14269974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27217384 - 27217346
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217384 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  76 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29004485 - 29004416
Alignment:
Q  76 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004485 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Original strand, 14188670 - 14188746
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  14188670 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa 14188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2290858 - 2291092
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2290858 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatat 2290957  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290958 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 2291057  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2291058 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 2291092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18334270 - 18334504
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334270 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18334369  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334370 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 18334469  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18334470 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 18334504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24423031 - 24422797
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423031 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24422932  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422931 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24422832  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24422831 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24422797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33862278 - 33862044
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862278 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 33862179  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862178 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 33862079  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33862078 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 33862044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33864762 - 33864528
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864762 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 33864663  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864662 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 33864563  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33864562 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 33864528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12742802 - 12742565
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742802 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12742703  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742702 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaa 12742603  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742602 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 12742565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1540589 - 1540823
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540589 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1540688  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540689 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 1540788  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1540789 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 1540823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1598541 - 1598307
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598541 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1598442  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598441 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 1598342  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598341 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 1598307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8055514 - 8055277
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055514 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 8055415  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  8055414 aaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgat 8055315  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055314 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 8055277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 30676387 - 30676624
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676387 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 30676486  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30676487 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaa 30676586  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676587 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 30676624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 19847649 - 19847882
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847649 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 19847748  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
        | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847749 ----gctagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 19847844  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847845 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 19847882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26924318 - 26924552
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924318 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 26924417  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26924418 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaa 26924517  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924518 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 26924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 31630218 - 31630455
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31630218 ttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtat 31630317  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  31630318 agacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaa 31630417  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630418 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 31630455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19858600 - 19858829
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858600 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 19858699  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19858700 gaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaa 19858796  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19858797 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg 19858829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22782711 - 22782477
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22782711 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtat 22782612  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22782611 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaa 22782512  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 22782477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18914417 - 18914180
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914417 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtat 18914318  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18914317 ggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 18914218  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914217 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 18914180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25688987 - 25688750
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688987 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtat 25688888  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25688887 ggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaa 25688788  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25688787 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgt 25688750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19005636 - 19005399
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19005636 ttttatgaatttcagcacatctttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtat 19005537  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19005536 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaa 19005437  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19005436 tatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgt 19005399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25535866 - 25535655
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  25535866 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 25535767  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535766 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 25535667  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  25535666 gtatatgtttgt 25535655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34963832 - 34963621
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  34963832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 34963733  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963732 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 34963633  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  34963632 gtatatgtttgt 34963621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 28289014 - 28289251
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28289014 ttttatgaattttagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 28289113  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  28289114 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 28289213  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28289214 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 28289251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 238
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377762
Alignment:
Q  52 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  152 ctagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgt 17377762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12942674 - 12942449
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  12942674 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta----- 12942580  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
           ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  12942579 -------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 12942487  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12942486 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 12942449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1598734 - 1598542
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1598734 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 1598635  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598634 ggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23992881 - 23992673
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||  |||||    
T  23992881 ccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttgg 23992782  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992781 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 23992682  T
Q  227 gtatatgtt 235  Q
    |||||||||    
T  23992681 gtatatgtt 23992673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 26924125 - 26924313
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26924125 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 26924224  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924225 aaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23415449 - 23415258
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23415449 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 23415350  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      ||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415349 ggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27557207 - 27557016
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27557207 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 27557108  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557107 ggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 15892086 - 15892231
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892086 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15892185  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 146  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892186 ggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25689180 - 25688988
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25689180 ttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 25689081  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689080 ggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2034
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8993
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19005803 - 19005637
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  19005803 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005704  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005703 tctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 19847485 - 19847648
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || || |    
T  19847485 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtct 19847584  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847585 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18914777 - 18914615
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  18914777 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttgg 18914678  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914677 tctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18914610 - 18914422
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914610 ttttatgaattttagcacaacttagaccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18914511  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
      | |||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914510 ggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1598901 - 1598735
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  1598901 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 1598802  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| | |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598801 tctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17883175 - 17883305
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17883175 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17883274  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttga 131  Q
      |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17883275 ggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 30676220 - 30676386
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||     
T  30676220 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgc 30676319  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676320 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 79 - 242
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| |    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtct 178  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  179 gacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25737127 - 25737028
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737127 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 31630051 - 31630217
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  31630051 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttgg 31630150  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630151 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9085
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8994 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25689313 - 25689181
Alignment:
Q  61 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  25689313 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 25689214  T
Q  161 tagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689213 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 22981417 - 22981486
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981417 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23806991 - 23806922
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 70  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23806991 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875663
Alignment:
Q  150 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 15875663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  74 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  174 gcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Original strand, 22981326 - 22981416
Alignment:
Q  103 atgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981326 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23807082 - 23806992
Alignment:
Q  103 atgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807082 atgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630561
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 31630561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 18334231 - 18334269
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334231 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914077
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 18914077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005296
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 19005296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24423070 - 24423032
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423070 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33864801 - 33864763
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864801 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Original strand, 2290827 - 2290857
Alignment:
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290827 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875556
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt 15875556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| ||  ||| |||||||     
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||| || || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||| || || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| || || || |||| |||||||     
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Original strand, 18455448 - 18455530
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||    
T  18455448 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 22593581 - 22593691
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||| ||||||||  | |||||||||||| ||||   || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  22593581 gaattgggtttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatg 22593680  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  22593681 atcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22782750 - 22782712
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782750 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 26924086 - 26924124
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924086 gagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 2035 - 2068
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaattt 34  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2035 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatg 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15118030 - 15118264
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118030 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15118129  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118130 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 15118229  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15118230 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 15118264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 50222017 - 50222251
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  50222017 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtat 50222116  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222117 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 50222216  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50222217 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 50222251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44615773 - 44615536
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44615773 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtat 44615674  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615673 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 44615574  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44615573 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgt 44615536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29267838 - 29267602
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267838 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29267739  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29267738 aaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaa 29267639  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267638 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 29267602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 52872751 - 52872987
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52872751 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 52872850  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 201  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872851 gatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 52872950  T
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872951 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 52872987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 1837197 - 1837420
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1837197 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 1837296  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837297 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 1837396  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1837397 tatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14970384 - 14970621
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970384 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 14970483  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14970484 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaa 14970583  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14970584 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgt 14970621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52313046 - 52312812
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313046 ttttatgaatttcagcacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 52312947  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312946 gaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaa 52312848  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52312847 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 52312812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 7640864 - 7641098
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640864 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 7640963  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7640964 aaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaa 7641063  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7641064 tatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt 7641098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14746189 - 14746426
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14746189 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtat 14746288  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14746289 gaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaa 14746388  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14746389 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgt 14746426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15534666 - 15534429
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534666 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15534567  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  15534566 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 15534467  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15534466 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 15534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 44772761 - 44772995
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772761 ttttatgaatttcagcacaacattgtccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 44772860  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44772861 gaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 44772960  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44772961 tatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtt 44772995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 11958 - 12167
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  11958 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttgg 12057  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12058 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 12157  T
Q  227 gtatatgttt 236  Q
    ||||||||||    
T  12158 gtatatgttt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 362665 - 362428
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362665 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 362566  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362565 ggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 362466  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362465 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 362428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3515492 - 3515255
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3515492 ttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 3515393  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515392 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 3515293  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3515292 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgt 3515255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 19617744 - 19617981
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19617744 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtat 19617843  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617844 ggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 19617943  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617944 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 19617981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36038355 - 36038118
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038355 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 36038256  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  36038255 ggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 36038156  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  36038155 tatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgt 36038118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 15495851 - 15496086
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15495851 ttttatgaatttcagcacaactttgtcctaatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 15495950  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15495951 ggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaa 15496050  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15496051 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 15496086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19858063 - 19857840
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858063 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 19857964  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857963 gtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 19857864  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19857863 tatgattgatgaattagtatatgt 19857840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 49547451 - 49547688
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49547451 ttttatgaatttcagcacaaatttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtat 49547550  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||       
T  49547551 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatt 49547650  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49547651 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 49547688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19243185 - 19242948
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19243185 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtat 19243086  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  19243085 gtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgat 19242986  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242985 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 19242948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14049062 - 14048825
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14049062 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtat 14048963  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||      
T  14048962 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtt 14048863  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14048862 tatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgt 14048825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 362858 - 362668
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  362858 ttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtat 362759  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 191  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362758 ggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 14745996 - 14746188
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14745996 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtat 14746095  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746096 ggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52313239 - 52313047
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52313239 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 52313140  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313139 ggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 52872583 - 52872749
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||    
T  52872583 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttgg 52872682  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872683 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 18214717 - 18214880
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  18214717 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 18214816  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214817 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 14970217 - 14970383
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  14970217 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970316  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970317 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19858230 - 19858064
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  19858230 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19858131  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858130 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3515657 - 3515493
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  3515657 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 3515558  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | || |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515557 tcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30147400 - 30147189
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30147400 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtat 30147301  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      || | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30147300 ggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaa 30147201  T
Q  201 tatgattgatga 212  Q
    ||||||||||||    
T  30147200 tatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 19617577 - 19617743
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  19617577 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19617676  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | | ||  ||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617677 tctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52313406 - 52313240
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  52313406 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 52313307  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313306 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 363025 - 362859
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  363025 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 362926  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362925 tctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 193
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  59 tacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  159 tatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 18214881 - 18214965
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214881 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 236
Target Start/End: Original strand, 18214995 - 18215081
Alignment:
Q  150 aactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214995 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 18215081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  83 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  183 tcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Original strand, 12778386 - 12778459
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778386 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 12778459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14185619 - 14185525
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 96  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14185619 tttaggaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtag 14185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 22725403 - 22725494
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 93  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22725403 tttatgaatttcagcacaacttttcccaaatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 238
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355133
Alignment:
Q  173 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgt 15355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 235
Target Start/End: Original strand, 18239251 - 18239331
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18239251 gagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt 18239331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactg 174  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  175 cacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 12033451 - 12033511
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 61  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12033451 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 12033511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 85
Target Start/End: Original strand, 15489659 - 15489717
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 85  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15489659 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  123 ttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14951380 - 14951270
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||     
T  14951380 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 14951281  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  14951280 atcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857730
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 19857730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12219
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 12219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746529
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 14746529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 15117991 - 15118029
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15117991 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355236
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 15355236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215186
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 18215186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312760
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 52312760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 193
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  156 agttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 171
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 13046021 - 13046108
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatata 150  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13046021 gaattggctttaggtgtaaacatgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttata 13046108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Original strand, 630279 - 630361
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  630279 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 7640825 - 7640863
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640825 gagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||  || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15496983
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt 15496983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618084
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt 19618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 72
Target Start/End: Original strand, 14745886 - 14745931
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 72  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14745886 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Original strand, 15355028 - 15355069
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  15355028 ccgaatttgaaatgaaaactggtatcgattgctacataattg 15355069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218912
Alignment:
Q  76 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagcttt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  72 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||  | |||||||||||| |||| |  |||||| ||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  172 ct 173  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17463662 - 17463428
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463662 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17463563  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463562 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 17463463  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17463462 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 17463428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34159810 - 34159576
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159810 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 34159711  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159710 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 34159611  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34159610 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 34159576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15978017 - 15977783
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15978017 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15977918  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977917 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 15977818  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15977817 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 15977783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55476975 - 55476741
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476975 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 55476876  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476875 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 55476776  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55476775 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 55476741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16453958 - 16454193
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453958 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16454057  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaa-ggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454058 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 16454157  T
Q  200 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16454158 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 16454193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28848299 - 28848522
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848299 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 28848398  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848399 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 28848498  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28848499 tatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6468812 - 6469046
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6468812 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtat 6468911  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468912 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 6469011  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6469012 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 6469046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 45606584 - 45606821
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606584 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 45606683  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  45606684 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgat 45606783  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606784 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 45606821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 38961515 - 38961751
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961515 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 38961614  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatg-ccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 199  Q
     ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961615 gaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 38961714  T
Q  200 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38961715 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 38961751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41124424 - 41124189
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124424 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 41124325  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124324 gaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 41124225  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41124224 tatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgttt 41124189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 7781024 - 7781261
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781024 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 7781123  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  7781124 aaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgat 7781223  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781224 tatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 7781261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 46822746 - 46822509
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822746 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 46822647  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822646 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 46822547  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822546 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 46822509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16282435 - 16282670
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282435 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16282534  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16282535 gaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 16282634  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16282635 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 16282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13153933 - 13154167
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13153933 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtat 13154032  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13154033 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 13154132  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13154133 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 13154167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17444441 - 17444676
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17444441 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17444540  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17444541 gaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 17444640  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17444641 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 17444676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10247401 - 10247635
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247401 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 10247500  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10247501 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 10247600  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  10247601 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt 10247635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 53301181 - 53301418
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301181 ttttatgaatttcagcacaactttgaccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 53301280  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  53301281 ggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 53301380  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301381 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 53301418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25237328 - 25237093
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25237328 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtat 25237229  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237228 gaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 25237129  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25237128 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 25237093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13151468 - 13151702
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13151468 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtat 13151567  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13151568 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 13151667  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13151668 tatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgtt 13151702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13436784 - 13436547
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13436784 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtat 13436685  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436684 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 13436585  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13436584 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgt 13436547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13544487 - 13544275
Alignment:
Q  22 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgcc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13544487 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 13544388  T
Q  122 gttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544387 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 13544289  T
Q  222 tgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||    
T  13544288 tgtatgtatatgtt 13544275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8500005 - 8499768
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8500005 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatat 8499906  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| | || |||||||||||||||||||||     
T  8499905 ggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgat 8499806  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499805 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 8499768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10557393 - 10557156
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557393 ttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 10557294  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10557293 ggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaa 10557194  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10557193 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgt 10557156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12568023 - 12567810
Alignment:
Q  22 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgcc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12568023 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 12567924  T
Q  122 gttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567923 gttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 12567824  T
Q  222 tgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||    
T  12567823 tgtatgtatatgtt 12567810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27165737 - 27165500
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27165737 ttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtat 27165638  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27165637 ggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 27165538  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165537 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 27165500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 54521307 - 54521070
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54521307 ttttatggatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtat 54521208  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  54521207 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 54521108  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54521107 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 54521070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 12119357 - 12119568
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  12119357 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 12119456  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 12119556  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  12119557 gtatatgtttgt 12119568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20629869 - 20630078
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20629869 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 20629968  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629969 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 20630068  T
Q  201 tatgattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  20630069 tatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25229741 - 25229506
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25229741 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtat 25229642  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  25229641 gaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaa 25229542  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25229541 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 25229506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15412915 - 15412679
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15412915 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 15412817  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  15412816 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgat 15412717  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412716 tatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 15412679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 29544519 - 29544757
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544519 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29544618  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  29544619 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtt 29544718  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtt 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  29544719 tatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgtt 29544757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24514135 - 24513924
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  24514135 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24514036  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514035 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24513936  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  24513935 gtatatgtttgt 24513924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15465639 - 15465448
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465639 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15465540  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465539 gaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 55318981 - 55319173
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55318981 ttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 55319080  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319081 ggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5223868 - 5223677
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5223868 ttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtat 5223769  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223768 ggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 26054942 - 26055133
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26054942 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 26055041  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055042 ggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27165904 - 27165738
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  27165904 ccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttgg 27165805  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165804 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41124591 - 41124425
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  41124591 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 41124492  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124491 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10379786 - 10379613
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  10379786 ccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 10379687  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379686 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46822913 - 46822747
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  46822913 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 46822814  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822813 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8500172 - 8500009
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8500172 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttgg 8500073  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 190  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500072 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10557560 - 10557394
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  10557560 ccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 10557461  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557460 tcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 55318817 - 55318980
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  55318817 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtat 55318916  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318917 gacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 38961348 - 38961514
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  38961348 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38961447  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961448 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 53301014 - 53301180
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  53301014 ccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 53301113  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301114 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 193
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  62 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  162 agtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 20629702 - 20629868
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  20629702 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 20629801  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| | |||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629802 tctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 13937485 - 13937649
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||     
T  13937485 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtc 13937584  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937585 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12305515 - 12305393
Alignment:
Q  116 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  12305515 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaatt 12305416  T
Q  216 agtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  12305415 aatatatgtatgtatatatttgt 12305393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 16358345 - 16358458
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  16358345 ttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatat 16358444  T
Q  101 aaatgttagctttc 114  Q
    | ||||||||||||    
T  16358445 agatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 16282268 - 16282434
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |    
T  16282268 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttag 16282367  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282368 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 17444274 - 17444440
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  17444274 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 17444373  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | | || ||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444374 tctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15007987 - 15007871
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa---ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagg 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15007987 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttatagg 15007888  T
Q  98 tataaatgttagctttc 114  Q
    |||  ||||||||||||    
T  15007887 tatggatgttagctttc 15007871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17393367 - 17393201
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||    
T  17393367 ccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttgg 17393268  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||   |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393267 tttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  72 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  172 ctgcacgtaggtcacagtgaata 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12305607 - 12305525
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 83  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305607 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 36528446 - 36528348
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36528446 tttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36528348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  83 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  183 tcacagtgaat 193  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 14567562 - 14567653
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 92  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567562 ttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8899484 - 8899418
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899484 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  86 gaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||| |||||| || ||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  186 cagtgaata 194  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 13937650 - 13937709
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 60  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937650 ttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 13937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 3264432 - 3264530
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3264432 tttatgaatttcagcacaacctttcctgaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtat 3264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  48 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707521
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 9707521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899344
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 8899344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282723
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 16282723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444728
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 17444728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17463701 - 17463663
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463701 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||  || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34159849 - 34159811
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159849 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961803
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 38961803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124137
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 41124137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55477014 - 55476976
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477014 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 6468773 - 6468811
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468773 gagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913962
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt 11913962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15412954 - 15412916
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412954 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18890040 - 18889958
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  18890040 gaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237041
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25237041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 173
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  77 tgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18893300 - 18893224
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaa 139  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  18893300 gaattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa 18893224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 87)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18809427 - 18809193
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809427 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 18809328  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809327 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 18809228  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18809227 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 18809193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23711691 - 23711925
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711691 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 23711790  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711791 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 23711890  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23711891 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 23711925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39682798 - 39682561
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682798 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 39682699  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39682698 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaa 39682599  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682598 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 39682561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26505863 - 26505629
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505863 ttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 26505764  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505763 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 26505664  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26505663 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 26505629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26508341 - 26508107
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508341 ttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 26508242  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508241 aaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 26508142  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26508141 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 26508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28577583 - 28577349
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577583 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 28577484  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577483 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 28577384  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28577383 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 28577349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23136064 - 23135841
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23136064 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 23135965  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135964 aaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 23135865  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23135864 tatgattgatgaattagtatatgt 23135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24368311 - 24368076
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368311 ttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24368212  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368211 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24368112  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24368111 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 24368076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 45027582 - 45027816
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027582 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 45027681  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45027682 gaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 45027781  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45027782 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 45027816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21154685 - 21154920
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21154685 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtat 21154784  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21154785 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaa 21154884  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21154885 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 21154920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22105950 - 22105715
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105950 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 22105851  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22105850 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaa 22105751  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22105750 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 22105715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 41523750 - 41523985
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523750 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 41523849  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41523850 gaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 41523949  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41523950 tatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgttt 41523985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 571882 - 571645
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571882 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 571783  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  571782 aaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 571683  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571682 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 571645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24918625 - 24918388
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24918625 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtat 24918526  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918525 ggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 24918426  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918425 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24918388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 23706896 - 23707131
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23706896 tttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 23706994  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 201  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706995 gatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 23707094  T
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707095 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 23707131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24897873 - 24898107
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24897873 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24897972  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24897973 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 24898072  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24898073 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24898107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24905310 - 24905544
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905310 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24905409  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24905410 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 24905509  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24905510 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24905544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20261704 - 20261467
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261704 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 20261605  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  20261604 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 20261505  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20261504 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 20261467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6726532 - 6726297
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726532 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 6726433  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6726432 gaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaa 6726333  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6726332 tatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgttt 6726297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23709210 - 23709444
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23709210 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 23709309  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23709310 gaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaa 23709409  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23709410 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 23709444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24900356 - 24900590
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900356 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24900455  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24900456 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 24900555  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24900556 tatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt 24900590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24902833 - 24903067
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24902833 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 24902932  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24902933 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 24903032  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24903033 tatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt 24903067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24907785 - 24908019
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24907785 ttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 24907884  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24907885 gaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgta 24907984  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24907985 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24908019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 32039176 - 32039410
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039176 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 32039275  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  32039276 aaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 32039375  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039376 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 32039410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 24642426 - 24642663
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24642426 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtat 24642525  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642526 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaa 24642625  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642626 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24642663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24671510 - 24671273
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24671510 ttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtat 24671411  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671410 ggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 24671311  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671310 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24671273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23131346 - 23131110
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23131346 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 23131248  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23131247 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 23131148  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23131147 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 23131110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23133813 - 23133577
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23133813 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 23133715  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23133714 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 23133615  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23133614 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 23133577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24681929 - 24681692
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24681929 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtat 24681830  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681829 ggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 24681730  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681729 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24681692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 34402200 - 34402436
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34402200 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 34402298  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34402299 ggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 34402398  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34402399 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 34402436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32214608 - 32214831
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32214608 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 32214707  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214708 ggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 32214807  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32214808 tatgattgatgaattagtatatgt 32214831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38967964 - 38967727
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38967964 ttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatat 38967865  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38967864 ggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaa 38967765  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967764 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 38967727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 10684440 - 10684677
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10684440 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtat 10684539  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  10684540 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtt 10684639  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10684640 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 10684677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 24529224 - 24529461
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529224 ttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 24529323  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24529324 ggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaa 24529423  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529424 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 24529461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 41523557 - 41523749
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41523557 ttttatgaatttcagcacaactttgtacgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtat 41523656  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523657 ggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23931945 - 23931775
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23931945 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtat 23931846  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23931845 tgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 21154492 - 21154684
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154492 ttttatgaatttcagcagaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 21154591  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154592 ggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 23709017 - 23709209
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23709017 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtat 23709116  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709117 ggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22106117 - 22105951
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22106117 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22106018  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106017 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 23706703 - 23706889
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23706703 ttttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttat 23706801  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacag 188  Q
      |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23706802 ggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 24529057 - 24529223
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  24529057 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24529156  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529157 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24918790 - 24918626
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||     
T  24918790 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtc 24918691  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918690 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616429
Alignment:
Q  86 gaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  186 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 25616429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6726699 - 6726533
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  6726699 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6726600  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726599 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Original strand, 41523390 - 41523552
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  41523390 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 41523489  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523490 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 21154325 - 21154491
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  21154325 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154424  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154425 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24368478 - 24368312
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  24368478 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24368379  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368378 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24682096 - 24681930
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||| |    
T  24682096 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttag 24681997  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681996 tctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 32214440 - 32214604
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  32214440 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgc 32214539  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 191  Q
    | |||| ||||||  ||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214540 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 23706536 - 23706702
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||    
T  23706536 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttgg 23706635  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||  |  ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706636 ttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23932110 - 23931949
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||     
T  23932110 gaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtc 23932011  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 190  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23932010 tgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Original strand, 45027418 - 45027579
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  45027418 aatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtct 45027517  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 191  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027518 gacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24671677 - 24671511
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||      
T  24671677 ccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccattta 24671578  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671577 tttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31345664 - 31345570
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345664 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  128 ttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726245
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 6726245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18809466 - 18809428
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809466 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23131385 - 23131347
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131385 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707234
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 23707234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 23711652 - 23711690
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711652 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24368024
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 24368024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642766
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 24642766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681589
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 24681589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26505902 - 26505864
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505902 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26508380 - 26508342
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508380 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27261442 - 27261332
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||     
T  27261442 gaattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatg 27261343  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  27261342 atcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 27920403 - 27920441
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920403 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 32039137 - 32039175
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039137 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 34402161 - 34402199
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402161 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524037
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 41524037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  141 gatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671170
Alignment:
Q  204 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 24671170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 571913 - 571883
Alignment:
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571913 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6483195 - 6483113
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483195 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 235
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21154972
Alignment:
Q  205 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 21154972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105663
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt 22105663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23133852 - 23133814
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133852 gagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | |||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| | |||||     
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918285
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt 24918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28577622 - 28577584
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28577622 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967624
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 38967624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39682829 - 39682799
Alignment:
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682829 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  72 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaatta 171  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||  | ||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  172 ct 173  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 193
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  157 gttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 119
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatg 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 94895 - 94661
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94895 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 94796  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94795 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 94696  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94695 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 94661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 17117 - 17354
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17117 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17216  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17217 ttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaa 17316  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17317 tatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgt 17354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 16953 - 17116
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  16953 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 17052  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||  |||||| | |||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17053 gatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 94934 - 94896
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94934 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10732618 - 10732852
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732618 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 10732717  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10732718 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaa 10732817  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10732818 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 10732852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20909496 - 20909262
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909496 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 20909397  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20909396 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 20909297  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20909296 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20909262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 2154309 - 2154546
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2154309 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtat 2154408  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154409 gaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 2154508  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154509 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 2154546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 17516841 - 17517078
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516841 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17516940  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516941 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 17517040  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517041 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 17517078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 42245043 - 42245277
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245043 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 42245142  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245143 aaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 42245242  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42245243 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 42245277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20917524 - 20917759
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917524 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 20917623  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20917624 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaa 20917723  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20917724 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20917759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32027930 - 32027695
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32027930 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtat 32027831  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32027830 gaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaa 32027731  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027730 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 32027695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 264446 - 264680
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  264446 ttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 264545  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  264546 aaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaa 264645  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  264646 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 264680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39245620 - 39245386
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39245620 ttttatgaatttgagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtat 39245521  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245520 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 39245421  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39245420 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 39245386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 20901598 - 20901835
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20901598 ttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 20901697  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20901698 ggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaa 20901797  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901798 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 20901835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29330467 - 29330233
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330467 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29330368  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29330367 gaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaa 29330269  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29330268 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29330233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29346464 - 29346230
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346464 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29346365  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29346364 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 29346265  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  29346264 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt 29346230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29348937 - 29348703
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348937 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29348838  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29348837 aaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 29348738  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  29348737 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt 29348703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29351410 - 29351176
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351410 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 29351311  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29351310 aaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 29351211  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  29351210 tatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt 29351176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23064998 - 23064761
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23064998 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtat 23064899  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  23064898 ggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttat 23064799  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064798 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 23064761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 37804580 - 37804817
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804580 ttttatgaatttcagcacaactttgtcataatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 37804679  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      
T  37804680 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 37804779  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37804780 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 37804817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38619920 - 38619684
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38619920 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 38619822  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  38619821 ggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 38619722  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619721 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 38619684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39363868 - 39363632
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39363868 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtat 39363770  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  39363769 ggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgat 39363670  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39363669 tatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 39363632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 295952 - 296144
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  295952 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtat 296051  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296052 ggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32028510 - 32028318
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32028510 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtat 32028411  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||  ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028410 atatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32028317 - 32028124
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028317 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 32028218  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttgg-tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028217 ggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17516648 - 17516840
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516648 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 17516747  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516748 ggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 17516481 - 17516647
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17516481 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 17516580  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516581 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 20901431 - 20901597
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  20901431 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttgg 20901530  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901531 tctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32028123 - 32027931
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||    
T  32028123 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttat 32028024  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32028023 ggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776606
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||     
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgt 9776606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 2154145 - 2154308
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |    
T  2154145 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtct 2154244  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154245 gacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29330634 - 29330468
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||    
T  29330634 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttgg 29330535  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330534 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 295785 - 295951
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||     
T  295785 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttga 295884  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295885 tctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 20917357 - 20917523
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  20917357 ccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctgg 20917456  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917457 tctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32028675 - 32028511
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||     
T  32028675 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtc 32028576  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028575 tgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901941
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 20901941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Original strand, 264407 - 264445
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264407 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20909535 - 20909497
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909535 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917864
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 20917864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||| | |||||||||| |  ||| ||||| || |||| |||||||     
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  75 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattact 173  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330181
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 29330181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027643
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 32027643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39245659 - 39245621
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245659 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39363907 - 39363869
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363907 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 236
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917812
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 20917812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19511863 - 19511781
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  19511863 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23065037 - 23064999
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23065037 gagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444106
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttat 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttat 43444106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6431 - 6197
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6431 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 6332  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6331 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 6232  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6231 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 6197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 134695 - 134461
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  134695 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 134596  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134595 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 134496  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  134495 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 134461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 137164 - 136930
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  137164 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 137065  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137064 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 136965  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  136964 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 136930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 139633 - 139399
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  139633 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 139534  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139533 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 139434  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  139433 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 139399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 142102 - 141868
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  142102 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 142003  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142002 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 141903  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  141902 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 141868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 144571 - 144337
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144571 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtat 144472  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144471 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 144372  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  144371 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 144337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38306 - 38069
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38306 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 38207  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  38206 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 38107  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 38069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38345 - 38307
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38345 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40884 - 40650
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40884 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatat 40785  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40784 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaa 40685  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40684 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 40650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||     
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  163 gtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40923 - 40885
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923 gagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14432 - 14195
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14432 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtat 14333  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14332 aaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaa 14233  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14232 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 14195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 23211 - 23445
Alignment:
Q  4 tatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23211 tatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataga 23310  T
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatat 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23311 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatat 23410  T
Q  204 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 23445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 22881 - 23047
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22881 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 22980  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22981 tctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 23048 - 23118
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23048 ttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  107 tagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 77
Target Start/End: Original strand, 20714 - 20764
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggt 77  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20714 ccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9726 - 9492
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9726 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 9627  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9626 gaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaa 9527  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9526 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21233 - 20995
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaat-gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggta 21134  T
Q  100 taaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21133 taaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattga 21034  T
Q  200 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033 ttatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 20995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13877 - 13640
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13877 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 13778  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13777 aaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgat 13678  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 13640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13916 - 13878
Alignment:
Q  155 gagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13916 gagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6936 - 6713
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6936 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 6837  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6836 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 6737  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6736 tatgattgatgaattagtatatgt 6713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7103 - 6937
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  7103 ccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 7004  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7003 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 3980 - 4217
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3980 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtat 4079  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4080 ggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaa 4179  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4180 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 3787 - 3979
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3787 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtat 3886  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3887 tgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3782
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3594 ttttatgaatttcaacacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtat 3693  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagt 189  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3694 ggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  141 gatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5179 - 4942
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5179 ttttatgaatttcagcacaactttggccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 5080  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5079 ggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaa 4980  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4979 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 4942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5346 - 5180
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||    
T  5346 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttgg 5247  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5246 tctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11774 - 11537
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11774 ttttatgaatttcagcacaactttgtcggaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtat 11675  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11674 ggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaa 11575  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11574 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 11537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 43002
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43224 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 43125  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43124 gaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaa 43025  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43024 tatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 238
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13541
Alignment:
Q  76 gtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgc 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  176 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgt 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43391 - 43225
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  43391 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 43292  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43291 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1074 - 837
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1074 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtat 975  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  974 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 875  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  874 tatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgt 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  44 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  144 ttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1227
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  1360 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc-tatgccgttgg 1262  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttat 161  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||| |||||||    
T  1261 tctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttat 1227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 734
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt 734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 238
Target Start/End: Original strand, 6617 - 6850
Alignment:
Q  5 atgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaat 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6617 atgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggat 6716  T
Q  105 gttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 204  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6717 gttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 6816  T
Q  205 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6612
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  6446 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 6545  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546 tctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3508 - 3271
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3508 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtat 3409  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  3408 ggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtt 3309  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3308 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30504 - 30267
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  30504 ttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtat 30405  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30404 ggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 30305  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 30267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30672 - 30505
Alignment:
Q  26 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  30672 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattg 30573  T
Q  126 gtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    || |||| |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572 gtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30161
Alignment:
Q  203 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgt 30161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8224 - 7996
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8224 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 8125  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8124 ggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 8025  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgta 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8024 tatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8225
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8417 ttttatgattttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatat 8318  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8317 ggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8584 - 8421
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||| || ||||    
T  8584 ccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattgg 8485  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 190  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8484 tatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 455
Alignment:
Q  4 tatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  689 tatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataga 590  T
Q  104 tgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatat 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  589 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatat 490  T
Q  204 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  489 gattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgt 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 853
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1019 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 920  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 852 - 782
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  852 ttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  107 tagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 235
Target Start/End: Original strand, 11022 - 11251
Alignment:
Q  6 tgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatg 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11022 tgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatg 11121  T
Q  106 ttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatga 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11122 ttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatga 11221  T
Q  206 ttgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11222 ttgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15396 - 15170
Alignment:
Q  2 tttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtata 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15396 tttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta----------cagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatg 15307  T
Q  102 aatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 201  Q
     |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15306 gatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaat 15207  T
Q  202 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15206 atgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgt 15170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Original strand, 10852 - 11016
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||     
T  10852 gaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtc 10951  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15563 - 15398
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||    
T  15563 ccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttgg 15465  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464 tctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10276 - 10039
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10276 ttttatgaatttcagcacaactttgactgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 10177  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  10176 ggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaa 10077  T
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10076 tatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgt 10039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10469 - 10277
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10469 ttttgtgaatttcagcacaactttatctgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtat 10370  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10369 ggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10470
Alignment:
Q  30 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggttt 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  10633 aatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtct 10534  T
Q  130 gacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    ||| |||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10533 gacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 68446 - 68227
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  68446 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtat 68347  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
      |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  68346 ggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaa 68247  T
Q  201 tatgattgatgaattagtat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  68246 tatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 227 - 438
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  227 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 326  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  327 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtat 426  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  427 gtatatgtttgt 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Original strand, 507 - 544
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31688 - 31497
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31688 ttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 31589  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31588 taatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 501549 - 501347
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  501549 ttttatgaatttcagcacaacattgtgcgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-at 501451  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501450 agatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 501351  T
Q  201 tatg 204  Q
    ||||    
T  501350 tatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 501716 - 501550
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  501716 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 501617  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||  |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501616 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18138 - 17947
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18138 ttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 18039  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18038 ggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8503 - 8311
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8503 ttttatgaatttcagcacagctttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtat 8404  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8403 ggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33656 - 33465
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33656 ttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 33557  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      ||||||| |||| |||| ||||||| |||| | |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33556 ggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1740
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtt 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  1904 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 1805  T
Q  129 tgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1739 - 1640
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1739 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 1640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19766 - 19957
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19766 ttttatgaatttcagcaaaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtat 19865  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19866 ggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39817 - 39626
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  39817 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttat 39718  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39717 ggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53786
Alignment:
Q  64 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatag 163  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||| |    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  164 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgt 53786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7175 - 7367
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7175 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 7274  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7275 aaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7558
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7368 ttttatgaatttcagcacaacattgttcgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 7466  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 192  Q
      |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7467 ggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 7560 - 7621
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7560 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 7084 - 7172
Alignment:
Q  103 atgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || | |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7084 atgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18589 - 18423
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||    
T  18589 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattgg 18490  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18489 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18422 - 18352
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18422 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggcattgattggtacagaaatggtc 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1676
Alignment:
Q  83 cacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtagg 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  183 tcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgt 1676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 38359 - 38570
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  38359 ccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38458  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||  ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38459 tttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 38558  T
Q  227 gtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||    
T  38559 gtatatgtttgt 38570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 57864 - 57729
Alignment:
Q  103 atgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaata 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  57864 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaata 57765  T
Q  203 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  57764 tgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgt 57729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 36876 - 37068
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36876 ttttatgaatttcagcacaactttatcaaaatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtat 36975  T
Q  101 aaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36976 ggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  67 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtca 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||  |||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  167 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 37069 - 37110
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaa 42  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37069 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 37110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 11023
Alignment:
Q  116 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  216 agtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatgtt 11023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 61 - 1
Alignment:
Q  1 ttttatgaatttcaggacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 61  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28091
Alignment:
Q  137 aaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28039
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 28039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 75605 - 75681
Alignment:
Q  24 tgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75605 tgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 75681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 113475 - 113317
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttgg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||    
T  113475 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttgg 113376  T
Q  127 tttgacttcaaaaggatttatataactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtca 185  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  113375 tttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10696
Alignment:
Q  189 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10799
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 10799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 405
Alignment:
Q  27 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  478 ccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtat 405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15077
Alignment:
Q  177 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 235
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15184
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 15184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||     
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||| || |||| |||||||     
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 103794 - 103716
Alignment:
Q  29 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgtt 107  Q
    |||||||||||||||||||  | || ||||  | ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  103794 gaatttgaaatgaaaactgacactgtttggcgcggaattagccttaggtgtaaacatgaaaattgtaggtataaatgtt 103716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | |||||||||| |||| | ||||| |||| || ||| ||||| || |||| |||||||     
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| |||| |||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||     
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  163 gtcaaattact 173  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9979
Alignment:
Q  201 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgt 9979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10034
Alignment:
Q  203 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 10034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 912
Alignment:
Q  63 gaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcgaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatataactagagttata 162  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||     
T  1020 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatg 921  T
Q  163 gtcaaatta 171  Q
     ||||||||    
T  920 atcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University