View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19655_low_1 (Length: 1024)

Name: NF19655_low_1
Description: NF19655
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19655_low_1
NF19655_low_1
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (13-820)||(33574525-33575331)
chr5 (13-823)||(15532200-15533009)
chr5 (13-821)||(15542384-15543191)
chr5 (13-724)||(26712439-26713150)
chr5 (13-724)||(26982177-26982888)
chr5 (28-824)||(14616428-14617221)
chr5 (28-823)||(34405301-34406094)
chr5 (28-824)||(22159196-22159993)
chr5 (151-826)||(7649939-7650611)
chr5 (159-473)||(11989166-11989480)
chr5 (580-821)||(11988864-11989108)
chr5 (718-823)||(26711464-26711567)
chr5 (718-823)||(26981201-26981304)
chr5 (302-407)||(23993447-23993552)
chr5 (450-509)||(13371932-13371991)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (13-823)||(22626312-22627121)
chr3 (13-823)||(11138570-11139378)
chr3 (13-823)||(39563510-39564314)
chr3 (156-656)||(13979070-13979565)
chr3 (155-752)||(35365957-35366549)
chr3 (157-519)||(47411772-47412125)
chr3 (28-175)||(1096863-1097009)
chr3 (468-637)||(46731386-46731555)
chr3 (28-131)||(31878360-31878463)
chr3 (713-761)||(20536397-20536445)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (13-823)||(13017189-13017998)
chr6 (19-823)||(22247002-22247802)
chr6 (27-823)||(22221175-22221967)
chr6 (28-823)||(14790071-14790864)
chr6 (35-752)||(14795106-14795821)
chr6 (28-826)||(1837926-1838723)
chr6 (28-656)||(32704421-32705046)
chr6 (28-673)||(19664815-19665457)
chr6 (152-698)||(20527286-20527832)
chr6 (154-692)||(16883254-16883791)
chr6 (24-481)||(32426817-32427271)
chr6 (477-712)||(30978321-30978557)
chr6 (28-399)||(15534541-15534912)
chr6 (209-616)||(12983586-12983994)
chr6 (227-616)||(12980699-12981089)
chr6 (152-623)||(7769588-7770070)
chr6 (443-752)||(15534923-15535230)
chr6 (391-513)||(15538036-15538158)
chr6 (28-233)||(15537736-15537940)
chr6 (24-138)||(32426634-32426748)
chr6 (562-655)||(27649087-27649180)
chr6 (581-752)||(15540574-15540744)
chr6 (283-349)||(15537971-15538037)
chr6 (562-637)||(32427286-32427362)
chr6 (626-692)||(11183966-11184032)
chr6 (302-343)||(2330478-2330519)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (13-823)||(31527826-31528635)
chr2 (13-813)||(31625984-31626784)
chr2 (30-815)||(40017432-40018216)
chr2 (28-823)||(13709524-13710315)
chr2 (227-752)||(16294550-16295073)
chr2 (171-823)||(23673345-23673995)
chr2 (24-824)||(36326369-36327172)
chr2 (28-622)||(32575887-32576478)
chr2 (362-423)||(8426783-8426844)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (13-823)||(12171419-12172218)
chr4 (28-752)||(647274-647996)
chr4 (28-752)||(650546-651269)
chr4 (28-673)||(26062841-26063486)
chr4 (152-631)||(26060163-26060641)
chr4 (152-823)||(2541461-2542128)
chr4 (566-627)||(11649429-11649490)
chr4 (434-469)||(6031606-6031641)
chr4 (302-343)||(13978982-13979023)
chr4 (302-343)||(56089543-56089584)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (13-823)||(23759609-23760417)
chr7 (13-815)||(11278929-11279728)
chr7 (15-825)||(33312442-33313241)
chr7 (13-815)||(294301-295098)
chr7 (124-815)||(46846320-46847007)
chr7 (145-815)||(36222317-36222984)
chr7 (35-823)||(17866353-17867139)
chr7 (28-823)||(6966600-6967393)
chr7 (28-715)||(17863202-17863887)
chr7 (28-823)||(24782858-24783654)
chr7 (152-689)||(23107566-23108100)
chr7 (152-625)||(36843135-36843607)
chr7 (152-642)||(9765373-9765867)
chr7 (155-752)||(3861977-3862562)
chr7 (152-350)||(23313673-23313871)
chr7 (434-700)||(23313382-23313648)
chr7 (28-298)||(35773054-35773324)
chr7 (302-471)||(2719269-2719438)
chr7 (434-469)||(27796692-27796727)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (320-823)||(9606-10109)
scaffold0440 (13-175)||(9446-9608)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (13-637)||(7177-7801)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (13-637)||(2128-2754)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (262-823)||(24185-24743)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (13-627)||(2799-3416)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (24-752)||(32505931-32506650)
chr1 (28-823)||(13492715-13493508)
chr1 (28-823)||(13495440-13496232)
chr1 (28-625)||(27282305-27282905)
chr1 (161-700)||(34065929-34066468)
chr1 (28-701)||(16190299-16190969)
chr1 (76-822)||(1936128-1936873)
chr1 (317-752)||(39545983-39546417)
chr1 (155-549)||(23990361-23990754)
chr1 (235-510)||(22104683-22104956)
chr1 (191-623)||(21152871-21153301)
chr1 (316-542)||(22453415-22453641)
chr1 (191-616)||(22456699-22457123)
chr1 (486-823)||(10764829-10765165)
chr1 (291-624)||(15297047-15297378)
chr1 (28-265)||(10759574-10759810)
chr1 (843-941)||(14484115-14484213)
chr1 (844-941)||(14505370-14505467)
chr1 (843-941)||(14469118-14469216)
chr1 (503-616)||(49147825-49147936)
chr1 (626-699)||(8435285-8435358)
chr1 (209-250)||(49147740-49147781)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (72-815)||(12575308-12576048)
chr8 (152-637)||(13096606-13097081)
chr8 (162-637)||(44007889-44008356)
chr8 (343-700)||(41778864-41779213)
chr8 (823-941)||(17029190-17029308)
chr8 (823-941)||(17559626-17559744)
chr8 (562-752)||(14418450-14418639)
chr8 (180-265)||(41779233-41779318)
chr8 (566-627)||(41836418-41836479)
chr8 (383-425)||(14418355-14418397)
chr8 (939-1005)||(17029100-17029166)
chr8 (939-1005)||(17559536-17559602)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (152-637)||(5995-6479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (28-465)||(1-437)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (562-752)||(79-268)
scaffold0363 (383-425)||(321-363)
[»] scaffold0400 (1 HSPs)
scaffold0400 (844-941)||(7793-7890)
[»] scaffold0365 (1 HSPs)
scaffold0365 (844-941)||(8437-8534)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (302-343)||(7086-7127)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 716; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 716; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 820
Target Start/End: Original strand, 33574525 - 33575331
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574525 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 33574624  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574625 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 33574724  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574725 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 33574824  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574825 aaattgaatgaccactaaccctaacttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 33574924  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33574925 agggattaacattcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaagagattgggt 33575024  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575025 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 33575124  T
Q  613 ccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattta 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33575125 ccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 33575224  T
Q  713 tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcca 812  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33575225 tacatcctttttaataataaaattgctaaatagaagttaaatacagtcctcgtgaaaacgaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttgcca 33575323  T
Q  813 aatttcta 820  Q
    ||||||||    
T  33575324 aatttcta 33575331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 672; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 15533009 - 15532200
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15533009 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatggatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 15532910  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532909 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 15532810  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532809 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 15532710  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532709 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 15532610  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532609 agggattaacgttcgt-taatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 15532511  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15532510 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaa 15532411  T
Q  613 ccatacttctctcaattttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15532410 ccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 15532311  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15532310 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcacatgcc 15532212  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  15532211 aaatatctatca 15532200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 670; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 15543191 - 15542384
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15543191 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 15543092  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15543091 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 15542992  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15542991 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 15542892  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542891 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 15542792  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542791 agggattaacgttcgt-taatacctccattggtttcgaattcacttaagagatcaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 15542693  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15542692 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaa 15542593  T
Q  613 ccatacttctctcaattttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15542592 ccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 15542493  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542492 atacatcctttttaataatgaaattgttaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcc 15542394  T
Q  812 aaatttctat 821  Q
    |||| |||||    
T  15542393 aaatatctat 15542384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 26713150 - 26712439
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713150 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 26713051  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713050 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 26712955  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712954 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 26712855  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26712854 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatga 26712755  T
Q  410 tatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 509  Q
     |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712754 catagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 26712655  T
Q  510 ggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggact 609  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26712654 ggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagact 26712556  T
Q  610 taaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataa 707  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26712555 taaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcactaatataa 26712457  T
Q  708 a-tttatacatccttttt 724  Q
    | |||| |||||||||||    
T  26712456 attttacacatccttttt 26712439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 26982888 - 26982177
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982888 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 26982789  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982788 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 26982693  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982692 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 26982593  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26982592 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatga 26982493  T
Q  410 tatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 509  Q
     |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982492 catagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 26982393  T
Q  510 ggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggact 609  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26982392 ggtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagact 26982294  T
Q  610 taaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataa 707  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26982293 taaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcactaatataa 26982195  T
Q  708 a-tttatacatccttttt 724  Q
    | |||| |||||||||||    
T  26982194 attttacacatccttttt 26982177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 14617221 - 14616428
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14617221 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaac 14617122  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |    
T  14617121 taatctctttctggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagttttaa 14617023  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  14617022 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaatactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 14616923  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  14616922 taaccatggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtttt 14616823  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
      ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14616822 gttaaaacctccaacggtttcgaattcactcaagagattaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaagagattgggtagaattactttgtta 14616723  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  14616722 atctgtcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctcta 14616624  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcggg-caccaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||     
T  14616623 atattcttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaacttcctagggtaatcaatataaattcatacatcctttttg 14616526  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatcat 824  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14616525 ataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgccaaatctctatcat 14616428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 34405301 - 34406094
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  34405301 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 34405400  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  34405401 taatctctttatggttcag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 34405499  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  34405500 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 34405599  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  34405600 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgagatagggattaacgttct 34405699  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34405700 tttaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 34405799  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  34405800 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggatttgaaggtcttaaccatacttctctcta 34405898  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| | | |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  34405899 atattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-acaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttg 34405996  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||  || |||| || ||| ||||| | | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  34405997 ataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtccttgtggatacgaactttattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 34406094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 28 - 824
Target Start/End: Original strand, 22159196 - 22159993
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  22159196 agatttggtgggagagcatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaac 22159295  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  22159296 taatctctttgtggttgagaa-tgagatgaatccgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 22159394  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||    
T  22159395 ttcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatacaaattgatgttagagattgaatgacca 22159494  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt- 425  Q
     |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22159495 ttaaccctggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaaactagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 22159594  T
Q  426 tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagt 525  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  22159595 tgt-taaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgt 22159693  T
Q  526 taatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 625  Q
    |||||  ||||  ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  22159694 taatctatcgttgaactagatagtcattgattg-aactaggagtgcgatttaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatatttctctc 22159792  T
Q  626 -aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgtta-ctaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatt--tatacatcctt 721  Q
     ||| |||| |||||||||| |||||||||||   |  |||||  |||   ||| |||  ||||||||| ||||| |  |  || ||  |||||||||||    
T  22159793 taatattcttaaaaccaatt-tttattgttttatttacgtttactttataaaaaccaatccaactgcctagggcaacctttgaatttaatatacatcctt 22159891  T
Q  722 tttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctat 821  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22159892 tttgacaaagaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaatttggtacacttgtcaaatatctat 22159990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 151 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 7650611 - 7649939
Alignment:
Q  151 gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatg 250  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||      || |||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  7650611 gagatgaatttgatgtaattttatgg-aaccctaatttgttgaact------aatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatg 7650519  T
Q  251 ccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 350  Q
      || ||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||    
T  7650518 ttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaataaccactaacc---gcttttgactcagaa 7650422  T
Q  351 ttaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttat---------gatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaa 441  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||         || |||||||||||| ||    ||| |||||||     
T  7650421 ctaggtaataagtttaacctaaaaaatcaagctagagatagatcattattaggttatttaggttatgacatagggattaaccttctattaaaacctccag 7650322  T
Q  442 tggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaac 541  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||  || | ||||    
T  7650321 cgatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtaaagagattgagtagaattaccttgttaatctatctttaaac 7650222  T
Q  542 taaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacc 640  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |    
T  7650221 tagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccatagaagaacttcgtaggattcaaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaagc 7650123  T
Q  641 aattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgct 739  Q
    || | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  7650122 aact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgtt 7650025  T
Q  740 aagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatcatta 826  Q
     ||||||| ||||  || ||||  | | | |||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7650024 gagtagaaattaacaacggtcctcgtgaatacgaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgtcaaatctctatcatta 7649939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 159 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11989480 - 11989166
Alignment:
Q  159 tctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgt 258  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||    
T  11989480 tctgatgtaattttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgctttttgt 11989381  T
Q  259 atgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaa 358  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||     
T  11989380 atgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttcgcttttgactctgatctaggtat 11989281  T
Q  359 taggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcactt 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11989280 taggtttaacctatgtaatcaagttagagatagatcattattaggttttaacatagagattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcactt 11989181  T
Q  459 aagagattaaggggt 473  Q
    |||||||||||||||    
T  11989180 aagagattaaggggt 11989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 580 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 11989108 - 11988864
Alignment:
Q  580 ataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaa 677  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  11989108 ataggagaactttggaggattcgaaggtcttaaccttacttctctctaattttct-aaaatcaatcttttatcgtttttaatctgtttatgttacaaaaa 11989010  T
Q  678 tcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatt--tatacatcctttttaataatgaaattgctaag--tagaagttaaatacagtccctgaggaaacga 773  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||  || ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || || |  | ||||||||    
T  11989009 tcaactcaactgcctaggggacc-attgaatttaatatacgtccttattactaatgaaattgctaagtatagaagttaagaacggttctcgtggaaacga 11988911  T
Q  774 attcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctat 821  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11988910 att-atttattacttcgattgaatttgattcacttgtcaaatatctat 11988864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 718 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 26711567 - 26711464
Alignment:
Q  718 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaattt 817  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  26711567 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttgccaaatat 26711470  T
Q  818 ctatca 823  Q
    ||||||    
T  26711469 ctatca 26711464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 718 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 26981304 - 26981201
Alignment:
Q  718 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaattt 817  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  26981304 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttgccaaatat 26981207  T
Q  818 ctatca 823  Q
    ||||||    
T  26981206 ctatca 26981201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23993552 - 23993447
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattatta 401  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | |||||  |||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  23993552 attgatcttagaacttgaatgaccactagccatgacttttgaatctgatctaggaaatatggttaacctaagaaattaagctagagatagacaattatta 23993453  T
Q  402 ggttat 407  Q
    ||||||    
T  23993452 ggttat 23993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 509
Target Start/End: Original strand, 13371932 - 13371991
Alignment:
Q  450 aattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 509  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13371932 aattcacttaagagattaagggattgtgactttaggggagagttctaagtcaagagattg 13371991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 708; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 708; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 22627121 - 22626312
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627121 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 22627022  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627021 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 22626922  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22626921 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 22626822  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagat-agatcattattaggttatgata 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22626821 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataagatcattattaggttatgata 22626722  T
Q  412 tagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggg 511  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22626721 tagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgga 22626622  T
Q  512 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggactta 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626621 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggactta 22626522  T
Q  612 accatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22626521 accatacttctctcaattttct-aaatccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 22626423  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626422 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcc 22626324  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  22626323 aaatatctatca 22626312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 656; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 11139378 - 11138570
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttt-cttatgttagttagcttatac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11139378 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttttcttatgttagttatcttatac 11139279  T
Q  112 tttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139278 tttagctttgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 11139179  T
Q  212 gaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcata 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11139178 gaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgataaactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcata 11139079  T
Q  312 gaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139078 gaaattgaatggccactaaccctggcttttaactctgaaatag-taataggtttaacctcagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 11138980  T
Q  412 tagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggg 511  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11138979 tagggattaacgttcgtttaatacctcctatggtttcgaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgga 11138880  T
Q  512 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggactta 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11138879 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggactta 11138780  T
Q  612 accatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11138779 accatacttctctcaattttct-gaatccaattctatattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 11138681  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138680 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcc 11138582  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  11138581 aaatatctatca 11138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 39564314 - 39563510
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564314 ggagcagagacttggagatatggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 39564215  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39564214 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacga-aaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatg 39564119  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564118 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 39564019  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39564018 aaattgaatgaccactaaccctgacttttaa-tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 39563920  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39563919 agggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 39563820  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39563819 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataaccattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaggacttaa 39563721  T
Q  613 ccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-t 709  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  39563720 ccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcactaatataaatt 39563622  T
Q  710 ttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttg 809  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39563621 ttacacatccttttttataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattactttgattgaatttggttcacttg 39563524  T
Q  810 ccaaatttctatca 823  Q
    |||||| |||||||    
T  39563523 ccaaatatctatca 39563510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 156 - 656
Target Start/End: Original strand, 13979070 - 13979565
Alignment:
Q  156 gaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcctta 255  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||  ||     
T  13979070 gaatctgaggtaatcttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttaaatgaaagtttagtcttttttcatattactttttgtttaatgttttt 13979169  T
Q  256 tgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 355  Q
     ||||   ||  || ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||    
T  13979170 cgtat---tatcatcgactactgaccctagctttatgaa-atgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccctgactttcgactctgaactagg 13979265  T
Q  356 taataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattca 455  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| || | |||||||||||    
T  13979266 taatagttttaacttaagtaatcaagttggagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcgaacgatttcgaattca 13979365  T
Q  456 cttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattga 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  13979366 cttaagagattaagaggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagggattggatagagttactaagttaatctgtcatgaaactaaataatcattgt 13979465  T
Q  556 ttgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtt 654  Q
    ||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  13979466 ttgaactt-ggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtt 13979563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 752
Target Start/End: Original strand, 35365957 - 35366549
Alignment:
Q  155 tgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgt-tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcct 253  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||       
T  35365957 tgaatctgatgtaactctatggaaacc-taatttgtatgaactctcttgaatattaatgaaagactagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttg 35366054  T
Q  254 tatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaatta 353  Q
    | | ||||||||  || ||||| || | ||||| |  ||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||    
T  35366055 ttt-tatgtttattattgactactagcactagcatcgtgaatgtgcaaattgatcttaaaacttgaatgaccactagccttggcttttgactctgatcta 35366153  T
Q  354 ggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaac-gtttgtgtaatacctccaatggtttcgaat 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||   | |||||||| |  ||| ||| ||||||||  || | ||||    
T  35366154 ggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattaggctatgactcatggattaacggactgt-taaaacctccaagagtcttgaat 35366252  T
Q  453 tcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcat 552  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    ||||||  ||||| ||| || || | |||    
T  35366253 tcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttctaggtcaagagattgagtagaattatcttgttaatttgtcgttaaattatatgaacat 35366352  T
Q  553 tgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca--attttctaaaaaccaattctttat 650  Q
    |||||| |||  || |||||||||  | ||| ||| | |  ||||||| ||||  |||||||||| || |||||  | ||||| |||||||| | ||||     
T  35366353 tgattgaatt--ggggtgcaaattaccgtagaagaacattagaggatttgaagatcttaaccatatttttctcattaatttct-aaaaccaact-tttac 35366448  T
Q  651 tgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagt 749  Q
     || ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||| |  || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35366449 cgtctttacacagtttatgttacaaataccaactcgactgcctagggcaac-ctaaaatttaatacatccttttt-ataatgaaattgctaagtagaagt 35366546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 519
Target Start/End: Original strand, 47411772 - 47412125
Alignment:
Q  157 aatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgt-tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcctta 255  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||   |     
T  47411772 aatctgatgtaattttatggaaacc-taatatgtatgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgtt 47411869  T
Q  256 tgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 355  Q
    ||||||||||  || ||||| || | ||| |||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||  ||||    
T  47411870 tgtatgtttattattgactactagcactaacttcttgaatatgaaaattgatcttagaacttgaatgatcactagtcctgccttttgactctgatctagg 47411969  T
Q  356 taataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaac-gtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattc 454  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| || |||   || ||||||| |  ||| ||| | ||| ||| ||  |||||||    
T  47411970 taataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattagattgtgactcagagattaacagactgt-taaaatctctaatagtcccgaattc 47412068  T
Q  455 acttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 519  Q
    ||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47412069 acttaagaga--------ttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaatta 47412125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1097009 - 1096863
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1097009 agatctggtgggcaaccatcacaactcatagtcaatcatccattacatgtatgaatcctttttcttatgttagttaacttatactttagctatgagtaac 1096910  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 175  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1096909 taattcctttgtggttaa-gcttgacatgaatctgatataattctatg 1096863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 637
Target Start/End: Original strand, 46731386 - 46731555
Alignment:
Q  468 aggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttagga 567  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  46731386 aggggttgttacttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatatgtcgttgaactagataatcattgattg-aattagga 46731484  T
Q  568 gtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 637  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  46731485 gtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccttacatctctctaattttctaaaa 46731555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31878463 - 31878360
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31878463 agatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttattttgtactttagctatgagtaac 31878364  T
Q  128 taat 131  Q
    ||||    
T  31878363 taat 31878360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 713 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 20536445 - 20536397
Alignment:
Q  713 tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcc 761  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536445 tacatcctttttaataatgaaatttctaagtagaagttaaatacagtcc 20536397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 684; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 684; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 13017998 - 13017189
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13017998 ggagcagagacttggagatctggttggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttgtgttagttagcttatacg 13017899  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13017898 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatg 13017799  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13017798 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 13017699  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017698 aaattgaatgaccactaaccctggctcttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatat 13017599  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017598 agggattaacgttcgt-taatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 13017500  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13017499 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcatatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaa 13017400  T
Q  613 ccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13017399 ccatacttctctcaattttctgaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 13017300  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017299 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatatagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcc 13017201  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  13017200 aaatatctatca 13017189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 823
Target Start/End: Original strand, 22247002 - 22247802
Alignment:
Q  19 gagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagct 118  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22247002 gagacttagagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgct 22247101  T
Q  119 atgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22247102 atgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtt 22247200  T
Q  219 tagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattg 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247201 tggtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattg 22247300  T
Q  319 aatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22247301 aatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggat 22247400  T
Q  419 taacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatt 518  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247401 taacgtttgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatt 22247500  T
Q  519 actaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatac 618  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22247501 actaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgc 22247600  T
Q  619 ttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatc 718  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  22247601 ttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatc 22247698  T
Q  719 ctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttc 818  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  | ||||||||||| | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  22247699 ctttttaataatgaaattgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt-tattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatttc 22247797  T
Q  819 tatca 823  Q
    |||||    
T  22247798 tatca 22247802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 622; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 823
Target Start/End: Original strand, 22221175 - 22221967
Alignment:
Q  27 gagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaa 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22221175 gagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgctatgagtaa 22221274  T
Q  127 ctaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttt 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221275 ctaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttagttttt 22221373  T
Q  227 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221374 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 22221473  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttt 426  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22221474 ctaaccctggcttttaaatctaaaaaaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgttt 22221573  T
Q  427 gtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 526  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221574 gtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 22221673  T
Q  527 aatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 626  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22221674 aatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctca 22221773  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaa 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22221774 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttttaa 22221871  T
Q  727 taatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  | ||||||||||| | ||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22221872 taatgaaattgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt-tattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatttctatca 22221967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 14790071 - 14790864
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  14790071 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 14790170  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  14790171 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 14790269  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  14790270 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 14790369  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  14790370 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 14790469  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14790470 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 14790569  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  14790570 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctcta 14790668  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  14790669 atattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttg 14790766  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| ||||| | | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  14790767 ataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaactttattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 14790864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 752
Target Start/End: Original strand, 14795106 - 14795821
Alignment:
Q  35 gtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattct 134  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||       
T  14795106 gtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctc 14795205  T
Q  135 tttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatat 234  Q
    ||  | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  14795206 ttcatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatat 14795304  T
Q  235 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 334  Q
    ||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  14795305 tactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccct 14795404  T
Q  335 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaata 434  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |    
T  14795405 ggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaa 14795504  T
Q  435 cctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtc 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  14795505 cctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtc 14795604  T
Q  535 gtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttct 633  Q
    || |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14795605 gttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattct 14795703  T
Q  634 aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatga 732  Q
     |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14795704 gaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaaga 14795801  T
Q  733 aattgctaagtagaagttaa 752  Q
    ||||||  ||||||| ||||    
T  14795802 aattgccgagtagaaattaa 14795821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 28 - 826
Target Start/End: Original strand, 1837926 - 1838723
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  1837926 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaaaccttatttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaac 1838025  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1838026 taatctctttgtggttgagac-tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 1838124  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  1838125 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgacca 1838224  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt- 425  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1838225 ctaaccctgacttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgtta 1838324  T
Q  426 tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagt 525  Q
    ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  1838325 tgt-taaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgt 1838423  T
Q  526 taatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 625  Q
    ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1838424 taatctgtcgttgaactaaataatcgttgattg-aactaggagtgcgaatt-acataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctc 1838521  T
Q  626 -aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgtta-ctaaatcaactcaactgcctcgg--gcaccaatataaatttatacatcctt 721  Q
     ||| |||| |||||||| | ||||||  ||||| |  |||||  |||   ||| |||  |||||| || ||    | ||||||||||||||||||||||    
T  1838522 taatattcttaaaaccaact-tttatt-cttttattacgtttactttataaaaaccaatccaactgtctaggaaaaatcaatataaatttatacatcctt 1838619  T
Q  722 tttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctat 821  Q
    ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||  || |||| || ||| |||||||  ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1838620 tttgataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtccttgtggatacgaatttatttattacttcgat-aattttggttcacttgccaaatctctat 1838718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 28 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 32705046 - 32704421
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  32705046 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 32704947  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  32704946 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 32704848  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
     ||| ||||| || |||||||||  || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  32704847 gtca-attactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 32704749  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  32704748 taaccctggcttttgactctgatctaagtaataagtttaacctaagtaatcaagatagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 32704649  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32704648 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaagagattgggtagaattactctgtta 32704549  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32704548 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctcta 32704450  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttt 656  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||    
T  32704449 atattctgaaaaccaact-tttattgtttt 32704421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 28 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 19665457 - 19664815
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19665457 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttatatatgagtaac 19665358  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  19665357 taatctctttgtggttgagac-tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 19665259  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||    
T  19665258 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatca 19665159  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttt 426  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19665158 ctaaccctgacttttaattctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagatagagatagatca-tattaggttatgacatagggattaacgttc 19665060  T
Q  427 gtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 526  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  19665059 tattaaaatctccaatgatttcgaattcacttaagagattaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaagatattgggtagagttactttgtt 19664960  T
Q  527 aatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc- 625  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  19664959 aatctgtcgtg-aactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacatctctct 19664862  T
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac 673  Q
    ||||||||  |||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19664861 aattttct-taaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttac 19664815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 152 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 20527832 - 20527286
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  20527832 agatgaatctgatgtaattttatgggaaccttaatgtgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctaatctttattcatattactttatatttaatgc 20527733  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     || ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20527732 tttttgtatgtttatcatcgactcctaaccctagctttatgaatatgcaaattgattttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgaac 20527633  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcga 450  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |    
T  20527632 taggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggattaacgttctgt-taaaacctccaacggtttcaa 20527534  T
Q  451 attcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatc 550  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||||||  || ||||||    
T  20527533 attcacttaagagattaa-gggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaaagttaatttgttaatctgtcgtgaagttagataatc 20527435  T
Q  551 attgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattcttta 649  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||    
T  20527434 attgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-ttta 20527337  T
Q  650 ttgtttttaatca-gtttatgttac-taaatcaactcaactgcctcgggca 698  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  20527336 ttgtttttatttatgtttacgttacaaaaatcaattcaactgcctagggca 20527286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 154 - 692
Target Start/End: Original strand, 16883254 - 16883791
Alignment:
Q  154 atgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcct 253  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||| |    
T  16883254 atgaatctgatgtaattttatgagaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatctttaatgctt 16883353  T
Q  254 tatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaatta 353  Q
    | ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  16883354 tttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctcacttttgactctgaacta 16883453  T
Q  354 ggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaat 452  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  16883454 ggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtgatg-catagggattaatgttctgt-taaaacctccaacggttttgaat 16883551  T
Q  453 tcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcat 552  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  16883552 tcacataagagattaaggggttgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgggtagggttattgtgttaatctttcgtgaacatagataatcat 16883651  T
Q  553 tgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttatt 651  Q
    || ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  16883652 tgtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacttcgaaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttatt 16883749  T
Q  652 gtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcct 692  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16883750 gtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcct 16883791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 24 - 481
Target Start/End: Original strand, 32426817 - 32427271
Alignment:
Q  24 ttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  32426817 ttggagatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggag 32426916  T
Q  124 taactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32426917 taactaattcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatataatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtt 32427015  T
Q  224 tttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 323  Q
    || ||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || ||| | ||||||| |||||| || |||||| || |||| |||| |||||||||    
T  32427016 ttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaccactaaccctggctttaggagtatgcaaatcgatcttagagattgaatga 32427115  T
Q  324 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 423  Q
    |||||||| |||| |||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  32427116 ccactaactctggattttga--ctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaatctagagatagatcattattatgttatgacatagggattaaca 32427213  T
Q  424 tt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcactt 481  Q
    || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32427214 ttctgt-taatacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 477 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 30978557 - 30978321
Alignment:
Q  477 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaatt 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978557 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatt 30978458  T
Q  577 gtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 675  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978457 accataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 30978358  T
Q  676 aatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattta 712  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978357 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 30978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 399
Target Start/End: Original strand, 15534541 - 15534912
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15534541 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatatatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaac 15534640  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15534641 taatctctttgtggttgagat-tgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 15534739  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| ||||||    
T  15534740 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatgttagagattgagtgacca 15534839  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattat 399  Q
    |||| | || |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534840 ctaaacttgacttttaactctgatcttggtaataggtttaacataagtaatcaagctagtgatagatcattat 15534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 209 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12983994 - 12983586
Alignment:
Q  209 aatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattg 305  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||  || || || | ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  12983994 aatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgctgtctgtatgtttattatattgagtactagcactagcgtttttgaatatgcaaactg 12983895  T
Q  306 atcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtt 405  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12983894 atcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggtt 12983795  T
Q  406 atgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaga 504  Q
    |||| | | |||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12983794 atgacacatggattaacggactgt-taaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaaga 12983696  T
Q  505 gattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaa 604  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |  |||| || || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12983695 gattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa--taggggtacagattttcataggagaacttcggaggattcgaa 12983598  T
Q  605 ggacttaaccat 616  Q
    || ||| |||||    
T  12983597 ggtcttgaccat 12983586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 12981089 - 12980699
Alignment:
Q  227 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  |||  ||||| || | ||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  12981089 attcatattaccttgtgtttaatgttgtctgtatgtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatga 12980990  T
Q  324 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 423  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||    
T  12980989 ccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaagtattaggttatgactcatggattaacg 12980890  T
Q  424 tt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattacta 522  Q
       ||| ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12980889 gactgt-taaaacctccaacaatttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattactt 12980791  T
Q  523 agttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 616  Q
     ||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12980790 tgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa--taggggtacaaattttcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 12980699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 7770070 - 7769588
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgt-tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatg 250  Q
    |||||||||||||||||| | |||   ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  7770070 agatgaatctgatgtaattccatgaatacc-taatttgtatgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttgtgtttaatg 7769973  T
Q  251 ccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc--atagaaattgaatgaccactaaccctg----gcttttaac 344  Q
     | |||||||||||| |||  |||| || | ||||| |  ||||| || | ||| |||  |||||| |||||||||||||| || ||    |||||| |     
T  7769972 acatatgtatgtttatgattaactactagcactagcatcttgaatgtgtaaatttatcttatagaacttgaatgaccactagccatgcatggcttttgaa 7769873  T
Q  345 tctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatg 443  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| |||||||| |    
T  7769872 tctgatctaggaaatatgtttaacctaagtaattaagttagagatagacaattattaggttatgatttagggattaacggactgt-taaaacctccaaag 7769774  T
Q  444 gtttcgaattca---cttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatt----ctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgt 536  Q
     |||||||||||   || ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  7769773 atttcgaattcatcactgaagagattaaggggttagcacttgcagagagaattatagctaggtcaaaagattgagtagaattactttgttaatatgtcgt 7769674  T
Q  537 gaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 623  Q
     ||||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7769673 taaactaaatgaacattgattgaattgagg-gtgcaaattaccatataagagcatcggaggattcgaaggtcttaaccatatttctc 7769588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 443 - 752
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535230
Alignment:
Q  443 ggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaact 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||  ||||    
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatctgtcgttgaact 15535022  T
Q  543 aaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacca 641  Q
    | |||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | | |||||| | |||||||    
T  15535023 agataatcattgattg-aattaggaatgcaaattaccataggaaaacttcggaggatttgaaggtcttaaccatacatcactttaattttgt-aaaacca 15535120  T
Q  642 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaa 741  Q
    |   ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  15535121 aacttttattgtttttaatctatttgttttacaaaatcaactcaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatccttttttataaagaaatggctga 15535219  T
Q  742 gtagaagttaa 752  Q
    |||||||||||    
T  15535220 gtagaagttaa 15535230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 391 - 513
Target Start/End: Original strand, 15538036 - 15538158
Alignment:
Q  391 gatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggag 489  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15538036 gatcattattaagttatgacatagggattaacgttctgt-taaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggag 15538134  T
Q  490 aattctaggtcaagagattgggta 513  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  15538135 aactctaggtcaagagattgggta 15538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 15537736 - 15537940
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    |||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  15537736 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatctaatacatgtatgactccttgtttttatgtgagttatcttgtacattagatatgagtaac 15537835  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  15537836 taatctctttgtggttgagac-tgagatgaatttgatgtaatcatatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaattttta 15537934  T
Q  228 ttcata 233  Q
    ||||||    
T  15537935 ttcata 15537940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 32426634 - 32426748
Alignment:
Q  24 ttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  32426634 ttggagatctggtgagcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggag 32426733  T
Q  124 taactaattcttttg 138  Q
    |||||||||||||||    
T  32426734 taactaattcttttg 32426748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 655
Target Start/End: Original strand, 27649087 - 27649180
Alignment:
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgttt 655  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  27649087 ttagaagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttcgctctaattttcttaaaaccaact-tttattgttt 27649180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 752
Target Start/End: Original strand, 15540574 - 15540744
Alignment:
Q  581 taggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatc 679  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||   || | ||||||||||||||||  ||||| |||  |||||    
T  15540574 taggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccataaatctctttaattttctaaaactaaact-tttattgtttttaatccctttattttagaaaatc 15540672  T
Q  680 aactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
    ||||||||||||| ||| | |  |  || || ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15540673 aactcaactgcctagggaaac-cttgaatttaatacatcctttttgatatagaaattgctgagtagaagttaa 15540744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 349
Target Start/End: Original strand, 15537971 - 15538037
Alignment:
Q  283 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctga 349  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15537971 tagttttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaacccttgcttttaactctga 15538037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 637
Target Start/End: Original strand, 32427286 - 32427362
Alignment:
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 637  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  32427286 ttaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcaaaggtcttaatcaaacatctctctaattttctaaaa 32427362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 626 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11184032 - 11183966
Alignment:
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcct 692  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11184032 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattacgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcct 11183966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Original strand, 2330478 - 2330519
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2330478 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 2330519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 684; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 684; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Original strand, 31527826 - 31528635
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31527826 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 31527925  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31527926 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 31528025  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31528026 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 31528125  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528126 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 31528225  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528226 agggattaacgttcgt-taatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 31528324  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31528325 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaa 31528424  T
Q  613 ccatacttctctcaattttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31528425 ccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 31528524  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528525 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcc 31528623  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  31528624 aaatatctatca 31528635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 813
Target Start/End: Original strand, 31625984 - 31626784
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625984 ggagcagatacttggagatctggtgggcaaccatcaaaactatgagtcaatcatcctttacatgtacgaatcatttttcttatgtgagttagcttatact 31626083  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  31626084 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatacata 31626183  T
Q  213 aaagtttagtttt--tattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcat 310  Q
        | || |  |  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31626184 ttgatgtaatcctactattcatattaccctgtgtttaatgttttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatacatattgattat 31626283  T
Q  311 agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgat 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31626284 agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttataac 31626383  T
Q  411 atagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgg 510  Q
    ||| |||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31626384 ataaggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgg 31626483  T
Q  511 gtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggactt 610  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31626484 gtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataataattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaatgactt 31626582  T
Q  611 aaccatacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa 708  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31626583 aaccattcttctctcagattttct-aaaaccaatcctttattatttttaattccttttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa 31626681  T
Q  709 -tttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcact 807  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31626682 ttttacacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcattgaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttggttcact 31626778  T
Q  808 tgccaa 813  Q
    | ||||    
T  31626779 taccaa 31626784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 815
Target Start/End: Original strand, 40017432 - 40018216
Alignment:
Q  30 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40017432 atctggtggacaaccatcaaaactcatagtcagtcatccattacatgtatgaatccttcttcctatgttagttagcttatactttaactatgagtaacta 40017531  T
Q  130 attcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 229  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40017532 attcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttatt 40017630  T
Q  230 catattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 329  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  40017631 catattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactgaccctatctttatgaatatgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactg 40017730  T
Q  330 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtg 429  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||  |     
T  40017731 accctggcttttgactttgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtcatgacatatgaattaacgttcttt 40017830  T
Q  430 taatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  40017831 taatacctccaacagtttcgaattcacttaagagaataa-gggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaagtactgagttaat 40017929  T
Q  530 ccgtcgtgaaac---taaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 626  Q
    | ||||| ||||   ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40017930 ctgtcgtaaaacttataaataatcattggttg-aattaggagtgcaaattaccataggagagtttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctca 40018028  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tttatacatccttttta 725  Q
    |||||    |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40018029 atttttcttaaaccagtctcttattgtttttaatccgtttatgttac-aaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattttatacatccttttta 40018127  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaat 815  Q
    ||||  ||||||| |||| |||||||||| || ||| || | |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40018128 ataaaaaaattgccaagtcgaagttaaatgcactccttgtgaaaacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttgccaaat 40018216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 13709524 - 13710315
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13709524 agatctggtgggcaaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatccttattcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 13709623  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| || |||| |    
T  13709624 taattctcttgtggttaattc-tgagatgaatctgatgtaatcctatgtgaaccctaatttgttgaacttcaa-gaatatcaatgaaagtctaattttaa 13709721  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  13709722 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgtaaattgatcttagagattgaatgaccac 13709821  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13709822 taaccctggattttgactctgacctaggtgataagtttaacccaagtaatcaagctagatatagatcattattaggttatgacatagggattaacgtttt 13709921  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
      ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  13709922 gttaaaacctccaacgatttcgaattcactaaagagattatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaagagatcgggtagaattactttgtta 13710021  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagc-ttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc- 625  Q
    ||| || ||  ||||| ||||||||||  |  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  13710022 atctgttgttgaactagataatcattgcct-aaattaggagtgcaaattatcataggagagctttcagatgatttgaaggtcttaaccatacttctctca 13710120  T
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tttatacatccttttt 724  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13710121 aattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaatccgtttatgttac-aactcaactcaacttcctcaggcatcaatataaattttatacatccttttt 13710218  T
Q  725 aataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13710219 aataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagttctcgtaaaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttggttcacttgccaaatatctatca 13710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 227 - 752
Target Start/End: Original strand, 16294550 - 16295073
Alignment:
Q  227 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294550 attcatattaccttgtgtttaatgctttgtgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 16294649  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttt 426  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16294650 ctaactctggcttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacg-tt 16294748  T
Q  427 gtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 526  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294749 ctttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 16294848  T
Q  527 aatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 626  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294849 aatctgtcgtgaaactaaataatcattgatt-aaactaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 16294947  T
Q  627 attttctaaaaaccaattcttta-ttgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tttatacatccttttt 724  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  16294948 attttctgaaaactaa-tctttatttgtttttaatcggtttatgatacaaaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattttatacatcc-tttc 16295045  T
Q  725 aataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  16295046 gataacgaaattgctgagtagaaattaa 16295073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 171 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 23673995 - 23673345
Alignment:
Q  171 ctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgata 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  ||     
T  23673995 ctatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatc 23673896  T
Q  271 gactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacct 370  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23673895 gactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactatccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacct 23673796  T
Q  371 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaag 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23673795 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgt-taaaacctccaactgtttcgaattcacttaagagattaag 23673697  T
Q  470 gggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagt 569  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23673696 gggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagt 23673598  T
Q  570 gcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttat 668  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  23673597 gcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacatctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttat 23673499  T
Q  669 gttactaaat--caactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgag 766  Q
     |||| ||||  |||  ||||||||| ||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||  || ||||  | |    
T  23673498 tttac-aaatgccaatccaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaaattaacaacggtcctcgtg 23673401  T
Q  767 gaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    || |||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23673400 gatacgaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgccaaatctctatca 23673345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 824
Target Start/End: Original strand, 36326369 - 36327172
Alignment:
Q  24 ttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatg----aatcctttttcttatgttagttagcttatactttagcta 119  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||    ||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  36326369 ttggagatctgatggccaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatcaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttatcta 36326468  T
Q  120 tgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagttt 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  36326469 tgagtaactaattcttttgtggttaa-gcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcatttgaatatcaatgaaagtct 36326567  T
Q  220 agtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattga 319  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||  ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  36326568 agttttaattcatattactttatgtttaatgctttttg--tgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattga 36326665  T
Q  320 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggatt 419  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  36326666 atgaccactaaccctggcttttgactttgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggctatgacacagggatt 36326765  T
Q  420 aacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttc----gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtag 514  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36326766 aacgttctgt-taatacctccaacagtttcaaattaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtag 36326864  T
Q  515 aattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaacc 614  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  36326865 aattactttgttaatctatcgttaaattagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaacc 36326963  T
Q  615 atacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt- 711  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || | |||   |||| ||| |||||  | | | |||||     
T  36326964 atacatctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttacaaataccaatctaacttcctagggca--actttgaattta 36327060  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  36327061 atacatcttttttgataaagaaattgcagagtagaagttaacaacggtcctcgtggatacgaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgcc 36327159  T
Q  812 aaatttctatcat 824  Q
    |||| ||||||||    
T  36327160 aaatatctatcat 36327172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 32576478 - 32575887
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||    
T  32576478 agatctagtgggagaccatcaaaactcacagtcagtcatccaatacttgtatgaatccttgtttttatgttagttatcttctactttagctatcaataac 32576379  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |  | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32576378 taatctctttgtggttgagactt-agatgaatatgatgtaatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtcttta 32576280  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    | |||||||| || |||| ||||| || || |||||||  || ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||    
T  32576279 tccatattactttttgtt-aatgctttttgcatgtttatcattgactactgatcctaactttatgaatatgcaaattgatcgtatagattgaatgatcac 32576181  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    | |||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||      
T  32576180 tgaccctgtcttttgactatgaactaggtaatatgtttaacctaaataatcaagctaaagatagatctttattaggttacgacatagggattaacgttct 32576081  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  32576080 tttaatacctccaacaatttcgaattcagtcaagagattaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttggtagagttactaagtta 32575981  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttct 622  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32575980 atctgtcgtgaaactaaataatcattttttg-aactaggagtgcaaattatcataggagagcttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttct 32575887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 423
Target Start/End: Original strand, 8426783 - 8426844
Alignment:
Q  362 gtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 423  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8426783 gtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatttagggattaacg 8426844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 653; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 653; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Original strand, 12171419 - 12172218
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12171419 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtaaatcatccgtcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttctact 12171518  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171519 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaatttctgagatgaatctgatgtaaccctattggaacccaaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 12171618  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171619 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 12171718  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171719 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaattcttaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 12171818  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12171819 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaagagattgggt 12171918  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12171919 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattaccataggcgagcttcggaagattccaaggacttaa 12172018  T
Q  613 ccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattta 712  Q
    ||||||           ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12172019 ccatac-----------ttctagaaaccaaatctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 12172107  T
Q  713 tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcca 812  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172108 tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgatcttttttattacttcgatcgaatttggttcacttgcca 12172207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 647996 - 647274
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  647996 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 647897  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  647896 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 647798  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||    
T  647797 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccac 647698  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  647697 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 647598  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  647597 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 647498  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  647497 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaagatcttaaccatacttctctcta 647399  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  647398 atattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttg 647301  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  647300 ataaagaaattgccgagtagaaattaa 647274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 28 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 651269 - 650546
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  651269 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatcccatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 651170  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccc-taatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttt 226  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||     
T  651169 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaacccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagtttta 651071  T
Q  227 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || |  |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||    
T  651070 attcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgtttcctaaccctaactttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggcca 650971  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttt 426  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  650970 ctaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 650871  T
Q  427 gtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 526  Q
     | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  650870 ttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtt 650771  T
Q  527 aatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc- 625  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  650770 aatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctct 650672  T
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttt 724  Q
    ||| || | |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  650671 aatattatgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatcaatataaatttatacatccttttt 650574  T
Q  725 aataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
     |||  ||||||||  ||||||| ||||    
T  650573 gatatagaaattgccgagtagaaattaa 650546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 28 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 26063486 - 26062841
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||  | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  26063486 agatttggtgggagatcatcacaacccatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaac 26063387  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    |||||  ||||| ||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  26063386 taatttctttgtggttga-gactgagatgaatctaatgtaatcatatgggaaccctgatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 26063288  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 326  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  26063287 ttcatattactttgtgtttaatgctttttgtattgtttatcatcgactaataaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgacca 26063188  T
Q  327 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt- 425  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||     
T  26063187 ctaaccctggcttttgactctgatctaggtaatagg-ttaacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatatggataaacgttc 26063089  T
Q  426 tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagt 525  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  26063088 tgt-taaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgt 26062990  T
Q  526 taatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 625  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  26062989 taatctgtcgttgaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacatctctc 26062891  T
Q  626 ---aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac 673  Q
       |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26062890 tctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttac 26062841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 152 - 631
Target Start/End: Original strand, 26060163 - 26060641
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    |||||||| |||| ||||  |||| ||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26060163 agatgaatatgatataattgtatgagaatcctagtttgttgaactcttttgaatatcaataaaagtctagattttattcatattactttatgtttaatgc 26060262  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     || ||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||      
T  26060263 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttcatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatgacttttgactctgatc 26060362  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaa 451  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    ||| |||||||| |||||||||    
T  26060363 taggtaatatgtttaacttaagtaatcaagctagagatagaccattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaa 26060462  T
Q  452 ttcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatca 551  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||| ||| |||||||    
T  26060463 ttcacttaagacattaaggggttgttatttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgggaagctagataatca 26060562  T
Q  552 ttgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatttt 631  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26060563 ttgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaatttt 26060641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 152 - 823
Target Start/End: Original strand, 2541461 - 2542128
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2541461 agatgaatctaatgtaatcttatgggaactctaatttgttgaattcctttcat-atcaataaaagtctagtttttattcatattatcttgtgtttaatga 2541559  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     ||  |||||||||  || |||||  |  |||||||| || | | ||||   ||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  2541560 ttttcgtatgtttattattgactacaagtcctagcttgataagtttgcaggctgatcttagaacttgattgaccactaacaccggcttttaactctgaac 2541659  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcga 450  Q
    |||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||| ||||||||| ||    
T  2541660 taggtggaatgtttaacctaagtaattaagctagagatagacaattattaggttatgatatagggattaacggactgt-taaaaccttcaatggttttga 2541758  T
Q  451 attcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatc 550  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| | || || | |||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  2541759 attcatttaagagattaatggattgttatttccgagaagaattttaggtcaagagattggataaaattactttgttaatctgtcgtttaactagataatc 2541858  T
Q  551 attgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttat 650  Q
    |||| ||| | | |||||| ||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||  |||||    
T  2541859 attgcttgaaat-aggagtacaaattaccataagagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacctcttt-aattttcaaaaaacctatattttat 2541956  T
Q  651 tgtttttaatcagtttatgttacta-aatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagt 749  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2541957 tgtttttaatccgtttatgttacaagaataaactcaactgcctagggcaccattg-aatttaatacatcctttttaataatgaaattgctcagtagaagt 2542055  T
Q  750 taaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  2542056 taaatacagtcctcgtggatacgaatt-atttattacttcgattgactttggtacacttgccaaatatctatca 2542128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 11649490 - 11649429
Alignment:
Q  566 gagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 627  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11649490 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 11649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 469
Target Start/End: Original strand, 6031606 - 6031641
Alignment:
Q  434 acctccaatggtttcgaattcacttaagagattaag 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6031606 acctctaatggtttcgaattcacttaagagattaag 6031641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Original strand, 13978982 - 13979023
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 343  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13978982 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 13979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56089584 - 56089543
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 343  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56089584 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 56089543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 652; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 23760417 - 23759609
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760417 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacttgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 23760318  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23760317 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatg 23760218  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23760217 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttagtaccttatgtacgtttatgatagactattaatcctagcgtcgtgaatatgcatattgatcatag 23760118  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760117 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactccgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 23760018  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23760017 agggattaacgttcgt-taatacctccaatggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaagagattgggt 23759919  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23759918 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaa 23759819  T
Q  613 ccatacttctctcaattttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23759818 ccatacttctctcgattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 23759719  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23759718 atacatcctttttaa-aatgaatttgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtagaaacgaact-ttttattacttcgattgaatttggttcacttgcc 23759621  T
Q  812 aaatttctatca 823  Q
    |||| |||||||    
T  23759620 aaatatctatca 23759609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 815
Target Start/End: Original strand, 11278929 - 11279728
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11278929 ggagcagagacttggagatctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcatttttcttatgttagttagcttatact 11279028  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11279029 ttacctatgagtaactaattcttttgtggttaattcgtgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatg 11279128  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11279129 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgcttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaacatgcatattgatcatag 11279228  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11279229 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 11279328  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11279329 agagattaacgttcat-taatacctccaacggtttcagattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaagagattgggt 11279427  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||  || |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11279428 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcatttattg-aactaggagtgcaaattaccagaggagaacttcgaaagattcgaaggacttaa 11279526  T
Q  613 ccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttatt-gtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tt 710  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11279527 ccatacttctctcaatcttctaaaaaccaa-tctttattcgtttttaatcagtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattt 11279625  T
Q  711 tatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11279626 tatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaaattaaatatagtccttgtggaaacaaat--ttttattacttcgattgaatttggttcacttgc 11279723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 825
Target Start/End: Original strand, 33312442 - 33313241
Alignment:
Q  15 agcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatacttt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  33312442 agcagagacttggagatatggtgggaaaccatcgaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttctta---------gcttatacttt 33312532  T
Q  115 agctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33312533 agctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactccattgaacattaatgaa 33312632  T
Q  215 agtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaa 314  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312633 aatttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaa 33312732  T
Q  315 attgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatag 414  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33312733 attgaatgaccactaaccctgacttttaactctgaactaggtaatatgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatat 33312832  T
Q  415 ggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtag 514  Q
    |||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33312833 ggattaacgttcttttaatacctccgccggtttcgaattcatttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaagattgggtag 33312932  T
Q  515 aattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaacc 614  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33312933 aattactaagttaattcgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggaaagcaaattaccataggagagcttcagaggattcgaaggacttaacc 33313031  T
Q  615 atacttctctca-attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-ttt 711  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33313032 atttttctctcagattttct-aaaaccaatcctttattatttttaattccgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttt 33313130  T
Q  712 atacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgcc 811  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||  |    
T  33313131 acacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtagaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttgtttcacttctc 33313227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 815
Target Start/End: Original strand, 294301 - 295098
Alignment:
Q  13 ggagcagagactt-ggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatac 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  294301 ggagcagagactttggagatctggtgagcaaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatctttcttcttatgttagttagcttatac 294400  T
Q  112 tttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  294401 tttagctatgagtaactaattctcttgtggttaat-cctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaat 294499  T
Q  212 gaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcata 311  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||  ||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  294500 gaaagtataattttaattcatattactttatgtttaatgcttattgtatgtttatcatgaactattaactctagttttatgaatatgcaaattgatctta 294599  T
Q  312 gaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  294600 gagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgaca 294699  T
Q  412 tagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggg 511  Q
    |||||||||||||||   ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  294700 tagggattaacgttttgttaaaacatccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaagagattggg 294799  T
Q  512 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggactta 611  Q
    || |||||||  ||||||| |||||  || || |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  294800 tataattactttgttaatctgtcgttgaattagataatcattgattgca-ttaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaagactta 294898  T
Q  612 accatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaattt 711  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  294899 accatacttctctcaattttct-aaaaccaatccttatttgcttttaaccagcttatgttac-aaaacaact--actgcctcgggcatcaatataaattt 294994  T
Q  712 a-tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgc 810  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  294995 attacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggacacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttgc 295093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 124 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 46847007 - 46846320
Alignment:
Q  124 taactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  46847007 taactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtc 46846908  T
Q  224 tttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46846907 tttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactattaaccctagctt---gaacatgcatattgatcatggaaattgaatga 46846811  T
Q  324 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 423  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846810 tcactaaccctgacttttaactctgaactaagtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagattattattaggttatgacatagggattaacg 46846711  T
Q  424 tttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaa 523  Q
     |  | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46846710 atcttttaaaacctccaacgttttcgaattcagttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattattag 46846611  T
Q  524 gttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 623  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846610 gttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatagaagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 46846512  T
Q  624 tcaattttctaaaaaccaattctttattg-tttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tttatacatcctt 721  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846511 tcaattttctaaaaaccaatcttttattgttttttagtcagtttataataagaattcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctt 46846412  T
Q  722 tttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaat 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||  |||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  46846411 tttaataatgaaattgctaagtagaaattaaatacagtcctcgtggaaac--atatttttattacttcgattgaatctgattcacttgccaaat 46846320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 36222984 - 36222317
Alignment:
Q  145 attcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatca------atgaaagtttagttttta-ttcatattac 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||      ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36222984 attcctgaggtgaatctgatgtaa-cctatgggaatcctaatttgttgaactc-tttgaatatcatattcaatgaaagtttagtctttaattcatattac 36222887  T
Q  238 cttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggc 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36222886 cttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactagccctagctttatgaacatgcatattgatcatggaaattgaatgaccactaaccctcgc 36222787  T
Q  338 ttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacct 437  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |  ||||| |    
T  36222786 ttttaactctgaactagctaatagatttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacg-ttcttaaatactt 36222688  T
Q  438 ccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtg 537  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||    
T  36222687 ccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaagagattaggtaaaattactaagttaatttgtagtg 36222593  T
Q  538 aaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaa 637  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36222592 aaactaaataatcattgattg-aactaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatcttctaaaa 36222494  T
Q  638 accaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaataatgaaatt 736  Q
    ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222493 accaatctttctttgtttttaatcagtttatgttagaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctttttaataatgaaatt 36222394  T
Q  737 gctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaat 815  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||  | || |||||||  |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  36222393 gctacgtagaaattaaatacaatcctcgtggtaacgaat--ttttattacttcaattgaatttggttcatttgccaaat 36222317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 17867139 - 17866353
Alignment:
Q  35 gtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattct 134  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||       
T  17867139 gtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctc 17867040  T
Q  135 tttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatat 234  Q
    ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  17867039 tttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatat 17866941  T
Q  235 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 334  Q
    ||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  17866940 tactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccct 17866841  T
Q  335 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaata 434  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |    
T  17866840 ggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaa 17866741  T
Q  435 cctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtc 534  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  17866740 cctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtc 17866641  T
Q  535 gtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttct 633  Q
    || |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  17866640 gttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtctaaaccatacttctctctaatattct 17866542  T
Q  634 aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatga 732  Q
     |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17866541 gaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaaga 17866444  T
Q  733 aattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    ||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| ||||| | | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  17866443 aattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaactttattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 17866353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 6966600 - 6967393
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  6966600 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 6966699  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  6966700 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 6966798  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  6966799 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatattcaaactgatcttagagattaaatgaccac 6966898  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  6966899 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 6966998  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6966999 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactttgtta 6967098  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    |||  |||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  6967099 atctatcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctcta 6967197  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  6967198 atattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttg 6967295  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| ||||| | | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  6967296 ataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaactttattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 6967393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 17863887 - 17863202
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  17863887 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 17863788  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  17863787 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 17863689  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  17863688 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 17863589  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  17863588 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 17863489  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17863488 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 17863389  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17863388 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctcta 17863290  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatac 715  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  17863289 atattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatcaatataaatttatac 17863202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 24782858 - 24783654
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24782858 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaac 24782957  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||  |||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  24782958 taatctttttgtggttaag-cttaagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccgtagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 24783056  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    | |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24783057 tccatattactttatgtttgatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 24783156  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaag---taatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgt 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24783157 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaataatcaagctagagatatatcattattaggttatgacatagggattaacgt 24783256  T
Q  425 t-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaa 523  Q
    | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  24783257 tctgt-taaaatctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtataattacttt 24783355  T
Q  524 gttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 623  Q
    |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24783356 gttaatctctcgttaaactagataatcattgattg-aattaggaatgaaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctc 24783454  T
Q  624 tc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctt 721  Q
    || ||| |||| |||||||| | |||||||||||   | |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||    
T  24783455 tctaatattcttaaaaccaact-tttattgttttatttaagtttatgttac-aaaacaactcaactgccttggacaatcaatataaatttatacatcctt 24783552  T
Q  722 tttaat-aatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttcta 820  Q
    ||| || || ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| || ||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  24783553 tttgataaaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacaaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgtcaaatctcta 24783651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 152 - 689
Target Start/End: Original strand, 23107566 - 23108100
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23107566 agatgaatttgatgtaatcttatagaaaccct---ttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttattcatattactttttgtttaatgc 23107662  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     || || |||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||     
T  23107663 tttttgcatgtttatcatcgactattaaccctaacgttatgaatatgcaaattgatagtagagattgaatgaccactgacccagacttttgactctgaac 23107762  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaa 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||   |||||||    
T  23107763 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcaaacaatttcgaa 23107862  T
Q  452 ttcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatca 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23107863 ttcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattatagctcaaggaattgggtagagttactaagttaatctgttgtgaaactaaataatca 23107962  T
Q  552 ttgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttat 650  Q
    ||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  23107963 ttgtttg-aactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggatgattcgaaggtcttaaccacatttctctctaattttct-aaaaccaatcttttat 23108060  T
Q  651 tgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactg 689  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23108061 tgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaactcaactg 23108100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 152 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 36843607 - 36843135
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36843607 agatgaatttgatgtaatcttgtgggaactctaatttgttgaactc-tttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgc 36843509  T
Q  252 cttatgtat-gtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 350  Q
     || | ||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  36843508 tttttatattgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaatcctggcttttgactctgat 36843409  T
Q  351 ttaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcg 449  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  36843408 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgt-taaaacctccaatggtttcg 36843310  T
Q  450 aattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||  ||||| |||||    
T  36843309 aattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttaatttgttaatctgtcgttgaactagataat 36843210  T
Q  550 cattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 625  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36843209 cattgattg-aagtaggagtgcgaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctc 36843135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 152 - 642
Target Start/End: Original strand, 9765373 - 9765867
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9765373 agatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctaatttgttgaacttctttgaatatgaataaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgc 9765472  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     || || |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||       
T  9765473 gttttgcatgtttaccatcgactattaaccctagctttatggatatgcaaattgatcg-----attgaatgaccactaaccctgacttttgactctggtc 9765567  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaa 451  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  9765568 taggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatgattattaggttatgacataaggactaatgttttgttaaaacctctaatggtttcgaa 9765667  T
Q  452 ttcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccg---------tcgtgaaact 542  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |         ||||||||||    
T  9765668 ttcacttaagagattaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgccgtgaaactcgtgaaact 9765767  T
Q  543 aaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacca 641  Q
    | |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9765768 agataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaacca 9765866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 155 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 3862562 - 3861977
Alignment:
Q  155 tgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcctt 254  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||    
T  3862562 tgaatctaatgtaatcttatgagaaccctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagtttttatttatatcatcttgtttttaatgcttt 3862463  T
Q  255 atgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattag 354  Q
     ||||||||||  || ||||| || |||       || ||| |||| | || || ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3862462 gtgtatgtttattattgactactagccc-------ataaatttgcagactggtcttagaacttaattgaccactaaccctggctttaaactctgaactag 3862370  T
Q  355 gtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattc 454  Q
    ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   |  ||| || |||||  |||| ||||||    
T  3862369 gtggtgtgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatatagggattaaaggacggttaaaacttccaacagttttgaattc 3862270  T
Q  455 acttaagagattaa----ggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatc 550  Q
    |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  3862269 acttaagacattaattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataatc 3862170  T
Q  551 attgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattcttta 649  Q
    |||  ||| ||| |||||||||        ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||    
T  3862169 atttcttgaatt-aggagtgca--------taggagaacttcgaaggattcgaaggtcttaatcatacttctctctaattttataaaa-ccaatctttta 3862080  T
Q  650 ttgtttttaatcagtttatgttac--taaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaa 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||| | ||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3862079 ttgtttttaatcagtttatgttacaaaaaatcaattgaactgcctagggcatc-attgaatttaatacatcc-ttttaataatgaaattgctaagtagaa 3861982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23313871 - 23313673
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  23313871 agatgaatccgatgtaatcttatgggaactctaatttgttaaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgc 23313772  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 350  Q
     || ||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23313771 tttttgtatgtttatcatcgactacaaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttggcttttgactctgaa 23313673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 434 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 23313648 - 23313382
Alignment:
Q  434 acctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 533  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||  ||    
T  23313648 acctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagagttacagtgttaatatgt 23313549  T
Q  534 cgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttc 632  Q
     ||||| ||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23313548 tgtgaacctagataatcattgtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaattttc 23313450  T
Q  633 taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctcgggcacc 700  Q
    | ||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23313449 t-aaaaccattcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactacctagggcacc 23313382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35773324 - 35773054
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  35773324 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtacgttagatatgagtaac 35773225  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| ||| |  | |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35773224 taatctgtttgtggttgagac-tgagatgaatcttatgtaatcctataagaactctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtttagttttta 35773126  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatg 298  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||  ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35773125 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcaactactaaccctaactttatgaatatg 35773054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 471
Target Start/End: Original strand, 2719269 - 2719438
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattatta 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | |||||  || |||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  2719269 attgatcatagaatttgaatgactactagccctagtgtttgaatctgatctaagtaatccgattaacttaattaattaagctagagatagacaattgtta 2719368  T
Q  402 ggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggg 471  Q
     |||||||| ||  |||||||| |     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2719369 agttatgatttatagattaacgatctataaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggg 2719438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 469
Target Start/End: Original strand, 27796692 - 27796727
Alignment:
Q  434 acctccaatggtttcgaattcacttaagagattaag 469  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27796692 acctccaacggtttcgaattcacttaagagattaag 27796727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 320 - 823
Target Start/End: Original strand, 9606 - 10109
Alignment:
Q  320 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggatt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9606 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaaagatagatcattattaggttatgatatagggatt 9705  T
Q  420 aacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 519  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 9805  T
Q  520 ctaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9806 ctaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 9905  T
Q  620 tctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcc 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9906 tctctcaattttctaaaaaccaattatttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggggaccaatataaatttatacatcc 10005  T
Q  720 tttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttct 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10006 tttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttattacttcgatcgaatttgattcacttgccaaatttct 10105  T
Q  820 atca 823  Q
    ||||    
T  10106 atca 10109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 9446 - 9608
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9446 ggagtagagacttagagatctagtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 9545  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 7801 - 7177
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7801 ggagcagagacttggagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctctacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 7702  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7701 ttagttatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatg 7602  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7601 aaagtttagtttttattcatattactttgagtttaatgctttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 7502  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7501 aatttgattgaccactaaccctggctttttactcagaactaggtaataggtttaacctaagtaataaagctagagatagatcattattaggttatgacat 7402  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  7401 agggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaagagattgaat 7302  T
Q  513 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaa 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  7301 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtacaaattaccataggagagtatcagaggattcgaaggacttaa 7203  T
Q  613 ccatacttctctca-attttctaaaa 637  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  7202 ccattcttctctcagattttctaaaa 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 637
Target Start/End: Original strand, 2128 - 2754
Alignment:
Q  13 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2128 ggagcagagacttggggatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttctcttatgttagttaacttatact 2227  T
Q  113 ttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2228 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctaagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacttcaatg 2327  T
Q  213 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 aaagtttagtctttattcatattactttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcatcaactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 2427  T
Q  313 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 412  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2428 aaaataaatgaccactaaccctggctttttactctgaactaggtaataggtttgacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 2527  T
Q  413 agggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 512  Q
    |||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2528 agggatcaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagatttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgagt 2627  T
Q  513 aga--attactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggactt 610  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2628 agaatattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaagttaccataggagagtatcagaggattcgaaggactt 2726  T
Q  611 aaccatacttctctca-attttctaaaa 637  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2727 aaccattcttctctcagattttctaaaa 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 262 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 24743 - 24185
Alignment:
Q  262 tttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaatag 361  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24743 tttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaatag 24644  T
Q  362 gtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaag 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24643 gtttaacctaagtaatcaagctagagatatatcattattaggttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatggtttcgaattcacataag 24544  T
Q  462 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtat 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24543 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtat 24444  T
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatc 661  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24443 ttaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatc 24344  T
Q  662 agtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcc 761  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24343 agttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttttaataatgaaattgttgagtagaagttaaatacagtcc 24246  T
Q  762 ctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
      | |||||| |||| | ||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24245 tcgtggaaacaaatt-tattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatttctatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 3416 - 2799
Alignment:
Q  13 ggagcagagac-ttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatac 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3416 ggagcagagaccttggagatctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatccttcttcttatgttagttagcttatac 3317  T
Q  112 tttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  3316 tttagctatgagtaactaattcttttgtggtta-ttcctgagatgaatcttatgtaatcttatggaaatcctaatttgttgaactcatttgaatttaaat 3218  T
Q  212 gaaagtttagtttttattcatattacct---tgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagcttt-atgaatatgcatattgat 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||  || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3217 gaaagtttagtctttactcatattacttctttgtgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttttatgaatatgcaaattgat 3118  T
Q  308 catagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttat 407  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3117 cacagaatttgaatgaacactaaccatggctttcaactctgaactaggtaatacgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattat 3018  T
Q  408 gatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagat 507  Q
    || | | |||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3017 gacacaaggattaacgttcttttaatacctccaatagttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagat 2918  T
Q  508 tgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaagga 607  Q
    | |||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2917 ttggtagaattactaccttaatctttcgtgaaactatataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggt 2819  T
Q  608 cttaaccatacttctctcaa 627  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2818 cttaacgatacttctctcaa 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 32506650 - 32505931
Alignment:
Q  24 ttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32506650 ttggagatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctatgag 32506551  T
Q  124 taactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactccttt--gaacatcaatgaaagtttag 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  32506550 taactaattcttttgtgattaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttttgaatatcaatgaaagtctag 32506452  T
Q  222 tttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaat 321  Q
    |||| |   ||||||| || |||||||||  || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  32506451 ttttaa---atattactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaat 32506355  T
Q  322 gaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaa 421  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32506354 gaccactaaccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagataggtcattattaggttatgacatagggattaa 32506255  T
Q  422 cgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattac 520  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506254 cgttctgt-taatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattac 32506156  T
Q  521 taagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatactt 620  Q
    |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32506155 tttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccacactt 32506057  T
Q  621 ctct-caattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcc 719  Q
    ||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |||      ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  32506056 ctctataatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaattcgtttatgttagaaaa------caactgcctcacgcatcaatataaatttatacatcc 32505964  T
Q  720 tttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
    ||||| |||| |||||||   ||||||||||||    
T  32505963 tttttgataaagaaattgtcgagtagaagttaa 32505931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 13492715 - 13493508
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| |||| || |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||  |||||||||     
T  13492715 agatttggtgggagaccaacacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttttcttgtactttatttatgagtaat 13492814  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| |||||  | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  13492815 taatctctttgtggttaaa-cttgagataaatttgatgtaatcttatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 13492913  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  13492914 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 13493013  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-t 426  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13493014 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 13493113  T
Q  427 gtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 526  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13493114 gt-taaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtt 13493212  T
Q  527 aatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc- 625  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13493213 aatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctct 13493311  T
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttt 724  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13493312 aatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatccttttt 13493409  T
Q  725 aataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
     |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| ||||| | | ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  13493410 gataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaactttattactacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 13493508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Original strand, 13495440 - 13496232
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| |||| || |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  13495440 agatttggtgggagaccaacacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttgtcttgtactttagttatgagtaac 13495539  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||||| |||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  13495540 taatctctttgtggttaaa-cttgagataaatatgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 13495638  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  13495639 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 13495738  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  13495739 taaccctagcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 13495838  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 527  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||    
T  13495839 gctaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaagagattggatataattactttctta 13495938  T
Q  528 atccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-a 626  Q
    ||| ||||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  13495939 atctgtcgttaaagtagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctcta 13496037  T
Q  627 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatccttttta 725  Q
    || |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||     
T  13496038 atattcttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaattcaactgcctaggacaatcaatataaatttatacatcctttttg 13496135  T
Q  726 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| |||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13496136 ataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaatttatttattacttcgatag-ttttggttcacttgtcaaatctctatca 13496232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 28 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 27282905 - 27282305
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttctt-----atgttagttagcttatactttagctatga 122  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||     |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  27282905 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatcttttttttttttttatgtgagttatcttgtactttagctatga 27282806  T
Q  123 gtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagt 222  Q
    |||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27282805 gtaactaatctctttgtggttaat-cctgagatgaatctgatataatcctatgggaaccctaatttgttgaacacctttgaatatcaatgaaagtctagt 27282707  T
Q  223 ttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatg 322  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| | || ||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  27282706 tttaattcatattactttatgtttaatcctttttgtatctttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatcttagagattgaatg 27282607  T
Q  323 accactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaac 422  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27282606 accactaaccctggattttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaac 27282507  T
Q  423 gtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattacta 522  Q
    |||  | ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27282506 gttcttttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactt 27282407  T
Q  523 agttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttct 622  Q
     ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  27282406 tgttaatcggtcgttgaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggagaattcgaaagtcttaaccatacttct 27282308  T
Q  623 ctc 625  Q
    |||    
T  27282307 ctc 27282305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 161 - 700
Target Start/End: Original strand, 34065929 - 34066468
Alignment:
Q  161 tgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtat 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||     
T  34065929 tgatgtaatcttatgggaatcctaatttgttgaacttttttgaatatcaatgaaaatctagttttaattcatattacgttatgtttaatgctttttgtac 34066028  T
Q  261 gtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaata 360  Q
    |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  34066029 gtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgacctaggtaata 34066128  T
Q  361 ggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcactta 459  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34066129 agtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttctgt-taaaacctccaacggtttcgaattcactta 34066227  T
Q  460 agagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||     
T  34066228 agagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgattg- 34066326  T
Q  560 atttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgttttta 658  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  34066327 aattaggagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgttttta 34066425  T
Q  659 atcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctcgggcacc 700  Q
    ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  34066426 attcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 34066468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 16190969 - 16190299
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  16190969 agatctggtgggcaaccatcaaaattcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttatcgtttactttagctataagtaac 16190870  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactccttt-----gaacatcaatgaaagtttagt 222  Q
    ||||   ||||| ||| | || | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||    
T  16190869 taatctatttgtggttgagtctt-agatgaatctgatgtaatcttataggaaccctaatttgttgaactcctttaatttgaatatcaatgaaagtctagt 16190771  T
Q  223 ttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatg 322  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  16190770 tttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccttagctttatgaatatgcaaattgatcctagagattggatg 16190671  T
Q  323 accactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaac 422  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        
T  16190670 accactaaccttggcttttaactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcaatattaggttatgacatagggat---- 16190575  T
Q  423 gtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagag----attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaga-at 517  Q
           ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||    
T  16190574 -------taaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggtatatat 16190482  T
Q  518 tactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccata 617  Q
    || |  ||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16190481 tattttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaagagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccata 16190383  T
Q  618 cttctc-tcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctcgggcacca 701  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||    
T  16190382 cttctctttaattttct-aaaaccaa-tctttattgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaactcaatttcctagggcacca 16190299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 76 - 822
Target Start/End: Original strand, 1936128 - 1936873
Alignment:
Q  76 gtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 175  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |  | | |||||||||| |||||||| ||||    
T  1936128 gtatgaatccttgtttctatggtagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctcatgtaatcttatg 1936226  T
Q  176 ggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagacta 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  || |||||    
T  1936227 ggaaccataatttgttgaactcctttgaatatcaatggaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgacta 1936326  T
Q  276 ttaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagta 375  Q
     |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||  | | |||   |||||||| ||||||||||||||    
T  1936327 ctaaccctaactttatgaatatgaaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccatggctttcgaatttgatccaggtaataagtttaacctaagta 1936426  T
Q  376 atcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttg 475  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  | ||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1936427 atcatgctagagatagatcattattaggttatgacatagggaataacattcttttaaaacctcaaacg-tttcaaattcacttaagagattaagggattg 1936525  T
Q  476 tcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaat 575  Q
    | |||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  1936526 ttacttgcggggagaactataaatcaagagatttggtagagttactttgttaatctttcgtgaagctagataatcattgattg-aactaggagtgcaaat 1936624  T
Q  576 tgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttac 673  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  1936625 taccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaaaattttaccgtttttaattcagtttatgatac 1936723  T
Q  674 ta-aatcaactcaactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaac 771  Q
     | ||||||||||||||||| || | ||| ||  || || ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||  |  |||  || |||||     
T  1936724 aacaatcaactcaactgcctaggtcaacccattgaatttaatacatcgttattactaatgaaattgccaagtagaagttaacaatggtcattgtggaaat 1936823  T
Q  772 gaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatc 822  Q
    |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1936824 gaatt-attcattacttcgattgaatttggttcacttgccaaatatctatc 1936873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 317 - 752
Target Start/End: Original strand, 39545983 - 39546417
Alignment:
Q  317 tgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatataggg 416  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39545983 tgaatgacaactaacaatggattttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacataggg 39546082  T
Q  417 attaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaa 516  Q
    |||||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39546083 attaacgttctattaaaacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagag 39546182  T
Q  517 ttactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 616  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39546183 ttactttgttaatctgtcgtgaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccat 39546281  T
Q  617 acttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttata 714  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||   |  ||||| |||||  ||| |||  ||||||||| ||||| ||||  || || |||    
T  39546282 acttctctctaatatttttaaaaccaact-tttattgttttatttgcgtttacgttacaaaaaccaatccaactgcctagggcaacaattgaatttaata 39546380  T
Q  715 catcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  39546381 catcc-tttcgataatgaaattgctgagtaaaagttaa 39546417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 155 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 23990754 - 23990361
Alignment:
Q  155 tgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgcctt 254  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||||| ||||| ||||  || | || ||||  ||    
T  23990754 tgaatctgatttaatcttatgggaacactaatttgttgaactcctctgaatatttaagaaagtctagttttaattcacattatattatcttcaatgtttt 23990655  T
Q  255 atgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc--at--agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 350  Q
     ||||||||||  || ||||| |||     |||||||||||||||| |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23990654 ttgtatgtttatcattgactactaa-----gctttatgaatatgcaaattgatctaattaagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgat 23990560  T
Q  351 ttaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcg 449  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  23990559 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgt-taaaacctccaacggtttcg 23990461  T
Q  450 aattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataat 549  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||    
T  23990460 aattcacttaagagtttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagtgattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataat 23990361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22104956 - 22104683
Alignment:
Q  235 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 334  Q
    ||||||||||||||||  || |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22104956 taccttgtgtttaatgttttgtgtaggtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaattct 22104857  T
Q  335 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaata 434  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||    
T  22104856 ggtttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacg-ttctttaata 22104758  T
Q  435 cctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgg 510  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22104757 cctccaacgattttgaattcacttaagagattaa-ggtctgtcacttacggggagaattctaggtcaagagattgg 22104683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 191 - 623
Target Start/End: Original strand, 21152871 - 21153301
Alignment:
Q  191 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagcttta 290  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||   | | |||||||| ||| ||||| || | ||||| |      
T  21152871 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttctgtttaatgttgtttatatgtttatgattgactactagcactagcatct 21152969  T
Q  291 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagata 390  Q
    ||||| || | ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21152970 tgaatgtgtaaattgaacttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctagggaatatatttaacctaagtaattaagctagagata 21153069  T
Q  391 gatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggaga 490  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||      ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21153070 gacagttattaggttatgatttagggattaacggactattaaaacctccaaaggtttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagaga 21153169  T
Q  491 attctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagct 590  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | || || |||||||||  |||   |||||     
T  21153170 attctaggtcaagagattgagtagaattactgtgttaatctgtcgttaaactaaatgaacattgattg-aattgggggtgcaaattaccatttaagagca 21153268  T
Q  591 tcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 623  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21153269 tcggaggattcgaaggtcttaaccatatttctc 21153301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 316 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22453641 - 22453415
Alignment:
Q  316 ttgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagg 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||   | |    
T  22453641 ttgaatgaccactagccctggcttttgactctgatttaggtaataggtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgactcatg 22453542  T
Q  416 gattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtag 514  Q
    ||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22453541 gattaacggactgt-taaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtag 22453443  T
Q  515 aattactaagttaatccgtcgtgaaact 542  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  22453442 aattactttgttaatctgtcgttaaact 22453415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 191 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 22457123 - 22456699
Alignment:
Q  191 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgata--gactattaaccctagc-t 287  Q
    |||||||| |||||  | |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||   | ||||||||||  |||  ||||| || | ||||| |    
T  22457123 tgaactcccttgaattttaatggaagtctagttttaattcatattacctt-tgttcaatgttgtttgtatgtttattatattgactactagcactagcgt 22457025  T
Q  288 ttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagag 387  Q
    || |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22457024 ttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgttttaggtaataggtttaacctaagtaattaagcaagag 22456925  T
Q  388 atagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggg 486  Q
    |||||  |||||||||||||||   | |||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  22456924 atagaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgt-taaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaagag-ttgtcacttgcgga 22456827  T
Q  487 gagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggag 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |  |||| || ||||||  ||||||||    
T  22456826 gagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttagtctgtcgttaaactagacgaacattgattgaa--taggggtacaaatttccataggag 22456729  T
Q  587 agcttcggaggattcgaaggacttaaccat 616  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22456728 aacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 22456699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 486 - 823
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10765165
Alignment:
Q  486 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcatagga 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||  |||||||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaagttaccatagga 10764927  T
Q  586 gagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactc 684  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  10764928 gaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactc 10765025  T
Q  685 aactgcctcgggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttgt 783  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||  | ||| ||||| | | ||      
T  10765026 aactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtcctcgtggatacgaactttattac 10765125  T
Q  784 tacttcgatcgaatttggttcacttgccaaatttctatca 823  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  10765126 tacttcgatagcttttggtacacttgccaaatatctatca 10765165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 291 - 624
Target Start/End: Original strand, 15297047 - 15297378
Alignment:
Q  291 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagata 390  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15297047 tgaatatgcaaattgatcttagaacttgaatgaccactagctctggcttttgaatctgatctaggtaatagttttaacctaagtaattaagttagagata 15297146  T
Q  391 gatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggag 489  Q
    ||  |||||||||||||||   | |||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||    
T  15297147 gaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgt-taaaacctccaacagtttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagag 15297245  T
Q  490 aattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| || |  |||||||| |||  || |||||||||  | | | ||| |    
T  15297246 aattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagatgaatattgattgaatt--ggggtgcaaattaccgtggaagaac 15297343  T
Q  590 ttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctct 624  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15297344 atcggaggattcgaaggtcttaatcatatttctct 15297378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 10759574 - 10759810
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  10759574 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 10759673  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  10759674 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 10759772  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgttta 265  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||    
T  10759773 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgttta 10759810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 843 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 14484213 - 14484115
Alignment:
Q  843 gaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgacatgcaatccttataatt 941  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14484213 gaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaacttgctccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgaaatgcaatccttataatt 14484115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 844 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 14505467 - 14505370
Alignment:
Q  844 aagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgacatgcaatccttataatt 941  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14505467 aagatgactttgatattgcaatctccttgcaaacttgctccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgaaatgcaatccttataatt 14505370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 843 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 14469216 - 14469118
Alignment:
Q  843 gaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgacatgcaatccttataatt 941  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14469216 gaagatgactttgatattgcgatctccttgcaaacttgctccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgaaatgcaatccttataatt 14469118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 616
Target Start/End: Original strand, 49147825 - 49147936
Alignment:
Q  503 gagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcg 602  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| ||  ||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  49147825 gagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagacgaacattgattgaat--aggggtacaaatttccataggagaacttcggaggattcg 49147922  T
Q  603 aaggacttaaccat 616  Q
    |||| ||| |||||    
T  49147923 aaggtcttgaccat 49147936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 626 - 699
Target Start/End: Original strand, 8435285 - 8435358
Alignment:
Q  626 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctcgggcac 699  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8435285 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattatgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctagggcac 8435358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Original strand, 49147740 - 49147781
Alignment:
Q  209 aatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatg 250  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49147740 aatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatg 49147781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 72 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 12576048 - 12575308
Alignment:
Q  72 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcc 171  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||   ||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||    
T  12576048 acatgtatgaatcattgtttttatgttagttatcttgtactttagcgatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctgatgtaatcc 12575950  T
Q  172 tatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatag 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||  ||      
T  12575949 tataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttcaacgctttttgtatctttatcatca 12575850  T
Q  272 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccta 371  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||    
T  12575849 acaactagccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgactactaaccttggcttttgactttgatcaaggtaataggtttaacata 12575750  T
Q  372 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgt-ttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaagg 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12575749 agtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatataaggattaacgtattgt-taaaacctccaatggtttctaattcacttaagagattaa-g 12575652  T
Q  471 ggttgtcacttgcggggagaattctagg-tcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagt 569  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | ||||||||    
T  12575651 ggttgttacttgcggggagaattctaggtttaagagattaggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagattatcattgcttg-aattaggagt 12575553  T
Q  570 gcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttat 668  Q
    |||||||  |||| || | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12575552 gcaaattaccataagaaaacttcggaggattcaatggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaatcaatttat 12575454  T
Q  669 gttac-taaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgagg 767  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||  | ||    
T  12575453 gttacaaaaatcaactcaactgcctagggcacc-attgaatttaatacatcctttttaataatgaacttgttgagtagaagttaacaacagtcctcgtgg 12575355  T
Q  768 aaacgaattcttttgttacttcgatcgaatttggttcacttgccaaat 815  Q
    | |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12575354 atacgaatt-atttattacttcgattgaatttggtacacttgccaaat 12575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 152 - 637
Target Start/End: Original strand, 13096606 - 13097081
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||          |||||||||    
T  13096606 agatgaacctgatgtaatcctatgggaaccctgatttattgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattgat----------gtttaatgc 13096695  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac-cctggc-ttttaactctga 349  Q
     || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13096696 ttt-tgtatgtttatcatcgactactatccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgatcactaactcctggccttttaactctga 13096794  T
Q  350 attaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttc 448  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||| | ||||||    
T  13096795 cctaggtaataagtttaagctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggatttacgttctgt-taaaacctcccacggtttc 13096893  T
Q  449 gaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataa 548  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  || |  ||||| ||||    
T  13096894 aaattcacttaagacattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagaattactttgttaatctttcattgaactagataa 13096993  T
Q  549 tcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 637  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13096994 tcattgctt-aaattaggagtgcaaatt-acataggataacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 13097081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 162 - 637
Target Start/End: Original strand, 44007889 - 44008356
Alignment:
Q  162 gatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatg 261  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| || | ||||    
T  44007889 gatgtaatcctatggtt-ccttaatttgttgaactcctttgaatttcaattaaagtttagtctttattcttattactctttgtttaatgcttttt-tatg 44007986  T
Q  262 tttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaatag 361  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| |||||||||     
T  44007987 tttatcatcgactattgaccctagctttatgaaaatgcaaattgaccgtagagattgaatgaacactgactctggcttttgattctgaactaggtaataa 44008086  T
Q  362 gtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaag 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||  | |||||||||||| | |||| |||||||||| |    
T  44008087 gtttaacctaactaatcaagctagaaatagatcattgttaggttacgacacagggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcaaattcacttatg 44008186  T
Q  462 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtat 561  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| ||||     |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |     
T  44008187 agattaaggagttgtcacttgc-gggagaattctaggtcgagggatttggtagagttac-----taatctatcgtgaaactaaataatcattgtttg-aa 44008279  T
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 637  Q
     |||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  44008280 ctaggagtgcagattaccaaaggcgagcttcggaggattcgaaggtcataaccataattctttctaattttctaaaa 44008356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 41779213 - 41778864
Alignment:
Q  343 actctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttgtgtaatacctccaat 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |     ||| |  |    |    
T  41779213 actctgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattgacataa---taacattt----t 41779121  T
Q  443 ggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaact 542  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||    
T  41779120 ggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacct 41779021  T
Q  543 aaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacca 641  Q
    | |||||||||| ||| | |||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||  ||| ||    
T  41779020 agataatcattgtttg-aattactagtgcaaattagcataggagaacttcggaagatttgaaggtcttaaccatacttctctttaatcttct--aaatca 41778924  T
Q  642 attctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctcgggcacc 700  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  41778923 atcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 41778864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 823 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 17029308 - 17029190
Alignment:
Q  823 attatgtacataattaactcgaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatg 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17029308 attatgtacataattaactcgaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaatttgggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatg 17029209  T
Q  923 acatgcaatccttataatt 941  Q
     ||||||||||||||||||    
T  17029208 ccatgcaatccttataatt 17029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 823 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 17559744 - 17559626
Alignment:
Q  823 attatgtacataattaactcgaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatg 922  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17559744 attatgtacataattaactcgaagatgactttgatattgcaatctccttgcaaatttgggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatg 17559645  T
Q  923 acatgcaatccttataatt 941  Q
     ||||||||||||||||||    
T  17559644 ccatgcaatccttataatt 17559626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 562 - 752
Target Start/End: Original strand, 14418450 - 14418639
Alignment:
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 660  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14418450 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 14418548  T
Q  661 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14418549 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 14418639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41779318 - 41779233
Alignment:
Q  180 ccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgttta 265  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  41779318 ccctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtttagtctttatccatgttactttatgtttaatgctttttgtatgttta 41779233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 41836479 - 41836418
Alignment:
Q  566 gagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 627  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41836479 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 41836418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 425
Target Start/End: Original strand, 14418355 - 14418397
Alignment:
Q  383 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14418355 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgtt 14418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 17029166 - 17029100
Alignment:
Q  939 attagtaggacaagcgaggcgttgatctaacatagcagtgaatgacataggatcactactcaggcct 1005  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  17029166 attagtaagaaaagcgaggtgttgatctaacatagcagtcaacgacatagcatcactagtcaggcct 17029100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 939 - 1005
Target Start/End: Complemental strand, 17559602 - 17559536
Alignment:
Q  939 attagtaggacaagcgaggcgttgatctaacatagcagtgaatgacataggatcactactcaggcct 1005  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  17559602 attagtaagaaaagcgaggtgttgatctaacatagcagtcaacgacatagcatcactagtcaggcct 17559536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 152 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 6479 - 5995
Alignment:
Q  152 agatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgc 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  6479 agatgaatctgatgtaatcttatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtc-agtgtttattcatgttactttatgtttaatgc 6381  T
Q  252 cttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 351  Q
     || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  6380 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgaac 6281  T
Q  352 taggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt-tgtgtaatacctccaatggtttcga 450  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  6280 taggtaataagtttaatctaagtaatcaacctagagatagatcattattaggttatgacatagggtttaacgttctgt-taaaacctccaatgattttga 6182  T
Q  451 attcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatc 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  6181 attcacttaagagattaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacctagataatc 6082  T
Q  551 attgattgtatttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 637  Q
    |||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6081 attgtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacctcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 437 - 1
Alignment:
Q  28 agatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 127  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  437 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 338  T
Q  128 taattcttttgtcgttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 227  Q
    ||||   ||  | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  337 taatctcttcatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 239  T
Q  228 ttcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttacgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 327  Q
    |||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||    
T  238 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgactac 139  T
Q  328 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtttg 427  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  138 taaccctggtttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 39  T
Q  428 tgtaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagat 465  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 68; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 562 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 79
Alignment:
Q  562 ttaggagtgcaaattgtcataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 660  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  268 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 170  T
Q  661 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctcgggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 752  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  169 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 321
Alignment:
Q  383 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  363 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgtt 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 844 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 7890 - 7793
Alignment:
Q  844 aagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgacatgcaatccttataatt 941  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7890 aagatgactttgacattacaatctccttgcaaacttgccccattgtagggcgatcatgtgttctctcacttaagcaatgaattgcaatccttaaaatt 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 844 - 941
Target Start/End: Complemental strand, 8534 - 8437
Alignment:
Q  844 aagatgactttgatattgcaatctccttgcaaattttggccattgtagggcgactatgtgggctctcagttaagcaatgacatgcaatccttataatt 941  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  8534 aagatgactttgacattacaatctccttgcaaacttgccccattgtagggcgatcatgtgttctctcacttaagcaatgaattgcaatccttaaaatt 8437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7127
Alignment:
Q  302 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7086 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University