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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1965_low_1 (Length: 813)

Name: NF1965_low_1
Description: NF1965
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1965_low_1
NF1965_low_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (19-774)||(38137043-38137802)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 708; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 708; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38137802 - 38137043
Alignment:
Q  19 attatgaagatcttaacatgtgcaagttgaaccttcagcttgcgactaagaatcgacaatggttgtttgttttcctcattattcacctaagtttactgcc 118  Q
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T  38137802 attatgaagatcttaacatgtgcaagttgaaccttcagcatgcgactaagaatcgacaatggttgtttgttttcctcattaagcacctaagtttactgcc 38137703  T
Q  119 gcttattaatgcgcatgaagcaaagactgaatgaaccaaccattttctgctttcatacttagaattcaacttgcgtgggttaagttatattttcaaactc 218  Q
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T  38137702 gcttattaatgcgcatgaagcaaagactgaatgaaccaaccattttctgctttcatacttagaattcaacttgcgtgggttaagttatattttcaaactc 38137603  T
Q  219 atgaaaagagggaaaataaaataaaaggtcaaaagtgtttttctccttatgtttgtttttgccgtaaaattatttaaaatgatttaaatgtagtgtaatt 318  Q
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T  38137602 atgaaaagagggaaaataaaataaaaggtcaaaagtgtttttctccttatgtttgtttttgccgtaaaattatttaaaatgatttaaatgtagtgtaatt 38137503  T
Q  319 tatatttaaatacactcatatatagattttagagtcgaaagttccacattcttattttaagttaaaattcagtttcatat------atttgttcaaaaaa 412  Q
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T  38137502 tatatttaaatacactcatata--gattttagagtcgaaagttccacattcttattttaagttaaaattcagtttcatatcttaatatttgttcaaaaaa 38137405  T
Q  413 caatatttcatatcttaatttattttggttactccaatgaaatcaattatacagtaatatagaacaccatatagctttatagtgtctaaattttcagctc 512  Q
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T  38137404 caatatttcatatcttaatttattttggttactccaatgaaatcaattatacagtaatatagaacaccatatagctttatagtgtctaaattttcagctc 38137305  T
Q  513 aaatcacgcacctaacttgttacacaagcattgttgacccatctatctaatacactagtttctgtaattcatgtctccaccaacttttccccaagggctt 612  Q
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T  38137304 aaatcacgcacctaacttgttacacaagcattgttgacccatctatctaatacactagtttctgtaattcatgtctccaccaacttttccccaagggctt 38137205  T
Q  613 cgtccaccactttaaaatccactaattagtcaatctcgtgaatcttttttgctacaaactcaagcagaattatatgaagacttacttactttttctttat 712  Q
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T  38137204 cgtccaccactttaaaatccactaattagtcaatctcgtgaatcttttttgctacaaactcaagcagaattatatgaagacttacttactttttctttat 38137105  T
Q  713 aaccaatatatccctatgtggaaccatgtagattaatcatctaggaaattgagatttattta 774  Q
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T  38137104 aaccaatatatccctatgtggaactatgtagattaatcatctaggaaattgagattcattta 38137043  T

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